lowQualScore : 33333 11 1 11 11111111 1111111 1111111 1111 1 222222222
lowQualScore : 55555 3 00 1 5555555 0 4 44 1 3 11 444 22 8888888888888 444444 4 222 1 99999999 1 1 77777777 1 2222 1 4 88888888 88888 2222 555 777 22222 22222 44 3333333 1 333333 55555555555 3 11 111 22 3 0000000 22222 4 44 11 22222 1111111 9999 3 2 3 1 2 11 1111 666666666 0 0
lowQualScore : ..... . .. . ....... . . .. . . .. ... .. ............. ...... . ... . ........ . . ........ . .... . . ........ ..... .... ... ... ..... ..... .. ....... . ...... ........... . .. ... .. . ....... ..... . .. .. ..... ....... .... . . . . . .. .... ......... . .
lowQualScore : 77777 5 66 6 0000000 5 7 99 5 1 55 222 11 5555555555555 333333 0 555 4 11111111 2 2 99999999 2 5555 1 6 99999999 66666 4444 777 666 77777 77777 77 5555555 1 000000 00000000000 2 44 888 44 1 0000000 66666 2 33 44 55555 1111111 6666 0 0 9 0 5 77 6666 111111111 7 7
consensus : CTGGAATGACAT-TGTCA-TGCAGACATTGATG-ACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAAAATG-ATTGTTAT-TN-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------GATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
Reference ( gi|75257 ) : CTGGAATGACAT-TGTCA-TGCAGACATTGATG-CCGTGTCATCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAAAATG-ATTGTTAT-TA-TT---CAC--AT-------------ATT------TGTCT---GTCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------TA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------TATG--TTC-T-TGCATAA-AT-ATTGATTTTATT-A--A-ATTA--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75256 : CTGGAATGACAT-TGTCA-TGCATACATTGATG-CCATGTCCTGAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAAAATG-ATTGTTAT-TA-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AA-T----C-A-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------TATG--TAC-T-TGCGTAA-AT-ATAGATTTTATT-T--A-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75258 : CTGGAATGATAT-TGTCA-TGCAGACATTGATG-CCGAGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAAAATG-ATTGTTAT-TA-TT---CACATAT-------------ATT------TTTCT---GCCAACATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACAAGAA----CATAATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACAAC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AA-ACACC-------AGTAT-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------TTTG--CAC-T-TGCATAA-AT-ACAGATTTTATC-A--A-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAA-CCCTCGTAT
gi|75260 : CTGGAATGACAC-TGCCA-TGCAGACATTGATG-ATGTGTCCTCAACAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-AAGAAAATG-ATTGTTAT-TT-TTT--CAC--AT-------------ATT------TGTCT---GTCGA-ATT--------ATTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AT-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACGATAA----CATTATAACTG---ACATAA---GAAA-----TGT-----ACT--AAA-------AT-AC------CGTA-----------C-TGC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------GATAC-----T-TAAGTTTTG-AAAA--AT-----ATAGC------GATG--TAC-T-TGCATCA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-GCAAACTTC-TGAATAACACCTCGTAT
gi|75259 : CTGGAATGACAC-TGTCA-TGCAGACAGTGATG-CCGTGTCCCAAATAATA-------TATGATTTA-----AGTGTTAC-AGGAAAATG-GC----AT-TA-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCGA-ATT--------GTTCAACATT-T-GGGCTGCGGCAC-T-------AA-T----C-A-TAT--------A-----TATATGTTGCTATGGATACCATAA----CAATATTACTG---ACACAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------TGTA-----------C-ATC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------CATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------TATG--CAC-T-TGCATAA-AT-AAAGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCCAACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75263 : CTGGAATGACAA-T-----TACAGACATTGATG-ACGTGTCAATAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGCTTTAC-AGGAAAATG-ATTGTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT-------------------------ACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------GA-T----C-A-GGT--------A-----TGTACGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAC-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGGG-AAAA--TT-----ATAGC------GATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCA-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTCGTAT
gi|75261 : CTGGAATGACAT-----A-TGGAGACATTGTTG-ACGTGTATTTAATAATA-------TATAATTCAACGCGAGTTTTAA-AGGGAAATG-ATTGTTAT-AT-TT---CAC--AT-------------ATT------TAACT---GTCGG-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GATG------A--AT-------------AATAC-----T-TAAGTTATG-AAAA--AT-----ATAGCGAT---CATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ATAGATTTTATT-A--A-ATTT--------ATCC-ACGAACTTC-TGGATAATCCCACGTA
gi|75262 : CTGAAATGAC------CAATGCAGACATTGATG-ATGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-ATGGAAATC-ATTTCTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCAA-ATT--------GTTCATCATT-TTGAGCTGCGGCAC-TAAACATTTA-T----T-A-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACCATAA----CATTACTATTA---ACATAA---GAAA-----TGC-----ACT--AAA-------AT-AC------TGTA-----------C-GTC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------ATTAC-----T-TAAGCTGTG-CAAA--AT-----ATAGC------GATG--TAT-T-TGCATGA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ATGAATTTC-TGGATGACCCCTCATA
gi|75264 : CTGGAATGACA-----CA-GGCAGACATTGATG-ACGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCCCTGCGAGTGTTAC-TGGAAAATG-ATTGTTATATT-TT---TAC--AT-------------ATG------TATCA---GTCTA-AAT--------AATCAACATT-TTGAGCTGCCGCAC-T-------AT-T----C-C-TGT--------A-----TGAATGTTTCTATGGATACCATAC----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--TATGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-------TAAGTTGTG-AAAA--AT-----AAAGC------GATG--TAT-T-TGCATAA-AT-ATTGATTTTATA-A--A-ATGT--------GTCT-ATGAAGTCC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75267 : CTGGAATGACAT-TGTCG-TGCAGACATTGATG-C-------TCAATAATG-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAAAATG-ATTGTTAT-TA-TT---CAC--AT-------------ATT------TGTCT---GTCGA-ATT--------GTTTAACATT-TTGAACTGCGGCAT-T-------TA-T----C-A-AGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACAG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------TGTA-----------C-ATC--G---------A--AG-ACACC-------AATAT-----T-TAAGTTGTG-AAAACTATATTTGATAACCCCTCGTATG--TACTT-TGCA-AA-ATAACTAATTTTA
gi|75265 : CTGGAATGA------TCAATGTAGACATTGATG-ACATGTCATCAATAATA-------CATGATTTACAGCTCGTTTTAC-AGGGAAATC-A--GTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ACT------TATCT---TTCAA-ATT--------GTTCAATACT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AA-C----C-A-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACC---A----CATTATCATTA---ACATGA---GAAT-----TGC-----ACT--AAA-------AT-AA------TGTT-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----C-TGAGCTGTGTTAAA--AT-----AAAGT------GATG--TAC-T-TGCATGA-AT-ATGAATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ATGAACTTC-TAGATAATCCCTTGTAT
gi|75266 : CTGGAATGACCT-----A-TGCAGACATTGACG-ACATGTCCTCAATAATACAATGTATATGATTTACCGTGAGTTTTACAGGGAATATA-ATTATCAT-TA-TTTTCCA---AT-------------ATT------TATCT---GTCAA-ACT--------GTTCAACACT-TTGAGCTGCAGCAC-T-----------------A-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGGAACTATAA----CATTATATCTA---ACATAA---GAAA-----TTA-----ACT--AAA-------AT-AA------TGTA-----------C-ATC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------AATCC-----T-TAAGTTGTG-CAAA--AT-----ATAGC------GATG--TAC-A-TGCATGA-AT-ATGGAATTTATT-A--C-ATTT--------GTCC-ATGAACTTC-TGAATAACCATTCATAT
gi|75268 : CTGGAATG-----CGT-A-TGTAGACGTCGATG-ACGTTTCTTCAATAATA-------TATGATTGACCTCGAATTTAAC-AGGGAAACG-ATTGTTAT-TT-TT---TAC--AT-------------ACT------TATCT---GTCAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGTTGCGACAG-T-------AA-C----C-A-TTT--------A-----TGCATGCTGCTATGTATACCATAA----CATTATTACCG---ACATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------AT-AC------TGTATACACTAAAACT-ATC--GATGA---CAATTAT-ATAAC-------AACAC-----T-T----------GAA--AT-----ATAGC------GATG--CAC-T-TACATGA-TT-ATGGATTTTAT-------------------GT-------ACTTT-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75269 : CTAAAATAACGTATG-----GTAGACATTGTTG-TTG--------A-AATA--------ACGATTTCCCATGAATTTTAC-GTAGACACA-TTTGTAAT-TT-TT---C-C--AT-------------AGC------TACCA---ATCAA-AAT--------GT----CACT-----GTTGCGGCTC-T--------A-C----CTA-TGT--------A-----TGCATGTTATAAATGATACCATAA----CAATATTACTG---ACGTAA----AAA-----TAC-----CGT--AAA-------AT-GC------TGAA-----------T-ATC--AATAA----GA--AT---ATC-------AAT
gi|75270 : CTGGAACGGCCT-T-----TGCATACATTGATG-ACGTGTCCTCAATAAT--------T---ATTTACCGCAAGTTTTAC-----AAGTG-ATTG
gi|75271 : TGGAATGACA-----CA-TGCAGACGTTGATG-ACGTGTT-TCAATAATA-------TATGCTTCACCGCCAGTGTTGC-AGGAAAGGG-ATTGTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCGA-ATT--------GTCCAACATT-TGGAGCTGCGGGAC-T-------AA-T----C-C-TGT--------A-----TCCATGTTGCTATGGATACCATAA----CAGTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------AC-GC------TGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ACAGC------TATT--TAC-T-TGCATAA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ATGAATTTC-TAGACAACCCCTTGTA
gi|75272 : TGGAATGACA-----CA-TGCAGCTATTGATG-ACGTGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCACCGCGAATGTTAC-AGGATAATG-ATTGTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC---------TA-T----C-CTTGT--------A-----TATATGTTTCTATCGGTACCATAA----CATTATTACTA---ACATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATT--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-GAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGA------GATG--TAC-T-TGCATAA-AA-ATAAATTTTATT-A--A-ATGT--------GTCT-GTGAACATC-TGGATAACCCGTAGTAT
gi|75274 : TGGACTGACAT-----A-TGCAGACGTTGATG-ACGTGTCTTCAATAATA-------TATGATTCACCGCGGGTTTTAC-AGGGAAATG------TAT--A-TT---CAT--AT-------------ATT------TATCT---GTCGA-ATT--------GTGCTACATT-TTGAACTGCGGCAC-T-------AA-T----C-A-TGTTTGTATGTA-----TGTATGTTACTATCGATACCATAA----CAGTATTACTG---ATATAA---CAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CATA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACA-------AATAC-----T-TATGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------TATG--TAC-T-TAAATAA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75273 : TGGAATGACA-----CA-TACAGACATTGATG-ACATGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCTGCGTGAATGTAAC-AGGAAAATG-ATTGTTTT-T--TT---CTC--AT-------------ATT------TATCT---GTGAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAACTTCAGCAC-T-------AA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------TGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAA--AA-----ATAGC------AATG--TAC-T-TCCATAA-AT-ATGAATTTTATT-A--A-TTTT--------GTCC-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTTATAT
gi|75275 : GGAATGAAA-----CA-TGCAGACATTGATG-ATGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCACCGCAAGTGTTAC-AGGTAAATG-ATTGTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------AAT------TATCT---GTGAA-ATT--------GTTCAACCTT-TTGAGCTGTGGCAC-T-------AT-T----C-T-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATTCCATAA----CATTATTACTG---TCATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------TGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------AATG--TAC-T-TGCGTAA-AT-ATGGATTGTATT-A--A-ATTT--------GTCT-GCGAATTTC-TGGATAACCCCTCATAT
gi|75276 : GAATGACAT-TGTCA-TGCAGACATTGATG-CCGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAT-GGGAAAATG-ATTGTTAT-TA-TT---CAC--AT-------------ATT------TGTCT---GTCGC-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCTGCAT-T-------TA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------T-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------GATG--CAT-T-TGCAT---AT-A--GATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75277 : GAATGACA-----CA-TACAGACGTTGATGACCA-GTCCTCAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGTGTTAC-AGGAAAATG-ATTGTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ATT------TATAT---GTCAC-TTT--------GTTCTACATT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------TA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---ACTTAT---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------AGGA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-AAACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------GATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-AATT--------GTCC-ATGAACTTC-TTGATGACCCCTCGTAT
gi|75265 : TCA-TGTAT-TATTGATG-ACATGTCATCAAT
gi|75278 : ctggaatgatcaatgtagacA-TGTAGACAT-GATG----TGATATTAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTCTTAC-AGGGAAATC-ATTGTTAT-TT-TT---CAC--AT-------------ATT------TATCT---GTCAG-ATT--------GTTCAACAAT-TTGAGCTGCGGCAC-T-------AA-C----C-A-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAtttacagctcgttttacagggaaatcagttatttttcacatacttatctttcaaattgttcaatactttgagctgcggcactaaccatgtatgcatgttgctatggagaccacattatcattaacatgagaattgcactaaaataatgttcatcgatgacaaatacaccaatacctgagctgtgttaaaataaagtgatgtacttgcatgaatatgaattttattaaatttgtccatgaacttctagataatcccttgtat
gi|75279 : AGACATTAATG-ACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGGGAAT----T-GAAGAAATATATTTTTAA-TAATT---AAC--AT-------------ATA------TAAAT----TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC-T----------T----C-A-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTCA-TAATGGTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TT-AC------T-TA-----------CTATA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAAT--TT-----ATTCT------TATG--AACGTGTGCACAA-TA-ATT--TTTTATT-A--C-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75281 : AGACGTTAATG-ACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGA-AGAAATAT--ATTTTTAA-TAATT---AAC--AT-------------GTA------TAAAT----TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC-T----------T----C-A-TGTGC------A-----TGTACATTACTATGGTTACTATAA----CTTTA-TAATGGTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TT-AC------T-TA-----------CTATA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-CAAGTTATG-TAAT--TT-----ATACT------TATGAATGT-G-TGCACAA-TA-ATT--TTTTATA-A--C-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75280 : AGACGTTAATG-ACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGT-AGAAATAT--ATTTTTAA-TAATT---AAC--AT-------------GTA------TAAAT----TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAACTGCGGCAC-T----------T----C-A-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTTA-TAATGGTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TT-AC------T-TA-----------CTATA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAAT--TT-----ACACT------TATG--AACGTGTGCACAA-TA-ATT--TTTTATA-A--C-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75282 : TG-CCATGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTTTTAC-AGAGAAATG-ATTGTTAT-TT-TT---TAC--AT-------------ATT------AATCT---GTCGA-ACT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCAGCAC-T-------AA-T----C-A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---ATATAA---GAAA-----TAT-----ATT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GTTGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGAG-AAAA--AT-----ATAGC------GATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ATGGATTTTATT-G--A-ATTT--------GTCC-ACAAACTTC-TGGATTACCCCTGGTAT
gi|75283 : AC-AGGGAAACG-ATTGTTATATA-TC---C-C--ATTATTATTTGTCAAATTCAGAGATGTCTCTGGTCAA-ATT--------GTATAGTATT-TTAAGCTGCGGCAC-T-------AA-C----C-C-TAT--------A-----TGCATGTTGCTATGGCTACCATAAAATTTATTATTACTG---ATAAAC---GGAA-----TAC-----ACT--AAA-------AT-AA------TGTA-----------C-ATT--GATGA---CAA--AT-ACAGC-------AATAC-----T-TATGATGTG-CAAA--AT-----ATAGC------GATG--CAC-T-AGCATAA-AT-ATGGATGTTATC-A--A-TTTT--------GTCC-ACGAACATC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75284 : gatttttgT------TACCT---GTCAA-ATT--------ATTCAACATT-TTAAGCTTTAGCAC-T-------TA-A----C-T-TGA--------A-----TGCATGTTGCTAAAGATAAAATAA----CATAATAACTG---AAGTAA---GAAA-----TGT-----AGT--GAT-------AT-TC------TGCA-----------T-ATC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AAAAC-----T-GAAGTTGTG--CCA--AT-----ATAGT------GATG--TAC-T-TGCATGA-AT-GTGGA
gi|75285 : T---GTCGG-ATTAATTTGAAGTTTTGCATTATTCA--TGCCGCAC-T-------AA-C----A-A-TGA--------A-----TGCATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATCACTG---ACGTAA---GATA-----TGA-----ACT--AAA-------GT-AA------TGTT-----------A-ATC--AATGG---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-CAAGTTTTG-CAAA--AT-----ATAGC------GATA--TAC-T-TGAATAA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATTT--------GTCC-ATGAATTTC-TGGATAACTTCTTGTAT
gi|75286 : A-ATT--------ATTCAATATT-TTGAGCTGCAGT-T-T-------TACC----C-A-TGT--------A-----TGTCTGTTGCTATGGATACTATAA----AATTTTTAGTG---AT-TAA---CATA-----CATGTTGCAAT--AAA-------AT-AC------TGGA-----------T-ATT--GATGA---GAA--AT-TCATC-------AGTACATGTGC-TAAGATGAG-CAGA--AC-----A-A---------ATG--GAA-T-TGCATGA-AT-GTGGATTTAATT-A--G-ATTT--------ATCC-AAAATATTT-TGGAAAA
gi|75290 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCACAT-------TA-CTGTAC-A-TG---------A-----TGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---TTATATTGTGTAT-----TTT-----ATTTAAAATTTGTATAC-AA------CTTA-----------C-ACT--GA-GA---TTA--A--------------AATAC-----TATAAACTG----AAA--AT-----AT---------TACA----C-A-TATATAAGAT-GTAGTTTTTATT-------TTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75288 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----------A-T----C-ACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---TTATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTA-----------T-A------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAA--AT-----AT---------TACA----C-A-TATATAAGAT-GTAGTTTTTATT-------TTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75287 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----------A-T----C-ACTGT--------ACATGGTGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---TTATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTA-----------T-A------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAA--AT-----AT---------TACA----C-A-TATATAAGAT-GTAGTTTTTATT-------TTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75289 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----------A-T----C-ACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---TTATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTA-----------T-A------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAA--AT-----AT---------TACA----C-A-TATATAAGAT-GTAGTTTTTATT-------TTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75291 : CATT-TTAAGCTGCAGCAC-T-------AA-T----C-A-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CATA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGT------TATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ATAGATTATATT-A--A-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75293 : -A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATAGATATCATAA----CATTATAACTG---ACATAA---GAAAATTTATAT-----ACT--AAA-------AT-AC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAA--TT-----ATAGC------GATG--TAC-T-TGCATAA-AT-ACGGATTTAATT-A--A-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACTCTTCGTAT
gi|75292 : TATATATACCATAA----CATTATTACTG---GCATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------AC-AC------CGTA-----------C-ATC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTTAT-AAAA--AT-----ATAGC------AATG--TAC-T-TGCATAA-GT-ATGGATTTTATC-A--A-ATTC--------GTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75294 : taagcgtctgnnnnnnnnnnGACACCATAA----CATTATTACTG---ACATAA-----AA-----TAT-----ACT--TGT-------AA-AC------TGTA-----------T-ATC--GGTGA---CAA--TT-ACACC-------ACTGC-----T----GTCGTG-CAAA--AT-----ATAGC------GATG--GAC-T-TGCATAA-AT-ATGGATTTTAAT-A--A-ATTT--------GTTC-ATGAATTTC-TGAATAACCCCTCGT
gi|75295 : ACTG---GCATAA---GAAA-----TGC-----AGT--AAA-------AT-ACAGTAGATGTA-----------T-ATC--GATGAATGCAAT-GT-ACATC-------AATAC-----T-GAAGTGTTG-CAAA--AA-----ATGGC------AAAG--TAT-C-TGCATAA-AT-AT
gi|75296 : -AC------CTTA-----------C-ATTTTGATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TGAGTTGTG-AAAA--AT-----ATAGC------AATG------------TAC-AT-ATGGATTTTATA-A--AGATT---------GTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTATgaat
gi|75297 : A---CGA--AT-ACACC-------AAATC-----T-TAAGCTGTG-CAAA--AT-----ATAGC------AATG--TAC-T-TGCATGA-AT-ATGGATTTTATT-A--A-ATGT--------GTCC-ATGAACCTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75298 : AA--AT-----ATAGC------GATG--TAC-T-CTCTTAA-TT-ATGAATTTTATT-A--A-TTT---------GTCC-ACGAACTTC-TCGATAACCCCTCGTA
gi|75299 : --AT-----GCAGA------CATG--TAC-T-TCCTTAA-AT-ATGGATTTTATTTA--A-ATTT--------GTCC-ACGAAATTCATGG-TAACCCTTTGTAT
gi|75301 : ATGA-AT-ATAGATTTTATT-A--A-ATTA--------GTCG-ACAAACTTC-TGAACAACCCCTAGTA
gi|75312 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTCC-ACGAACTTT-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75307 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTTC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75305 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75304 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75308 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTCC--CGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75310 : ATTATATG-A--T-ATTT--------GTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75303 : ATGTTATG-A--G-GTTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTTGTA
gi|75302 : ATATTATG-A--G-ATTT--------ATCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCATCGTAT
gi|75306 : ATTATATG-A--T-ATTT--------GTCC-ACGATCTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75314 : ATTTTATT-T--G-GTTT--------GTCC-ACAAACTTC-TAGATAACTCCTCGTA
gi|75309 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTCC-ACAAACTTC-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75311 : ATATTATG-A--G-ATTT--------GTAC-ACAAACTTC-TGGACAACCCCTCGTAT
gi|75313 : ATTTTATA-A--G-ATTT--------GTCC-ACAAGCTTC-AGGATAACCCATCGTAT
gi|75315 : TTATG-A--G-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TAGATAACCCCTCATAT
gi|75316 : TATG-A--G-ATTT--------GTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCTTCGTA
gi|75300 : TATT-ATGA-GTTT--------GTCC-ATGAACTTC-TGGATAACTCCTCGTAT
Alignments
lowQualScore : 333333
lowQualScore : 1 555555 1 1 4444444 0 1 44 222 1 1 55 1 444444 22 1 1 88888888 1 11 444444444 111 3 88888888 88888 2222 333 111 777 22222 22222 44 3333333 1 222222 3 44444444444 11 111 22 3 9999999 22222 4 33 111 44444444444444 11 1 11 1 3 0 11 999999 4 0 0
lowQualScore : . ...... . . ....... . . .. ... . . .. . ...... .. . . ........ . .. ......... ... . ........ ..... .... ... ... ... ..... ..... .. ....... . ...... . ........... .. ... .. . ....... ..... . .. ... .............. .. . .. . . . .. ...... . . .
lowQualScore : 8 666666 7 0 8888888 1 0 33 666 4 5 44 5 333333 00 4 3 88888888 1 55 000000000 999 2 44444444 11111 3333 777 888 444 66666 66666 66 4444444 0 999999 1 99999999999 44 888 44 0 8888888 66666 1 99 888 44444444444444 33 0 33 9 7 9 00 111111 4 7 7
consensus : CTGGAATGA-CAT-TG-CA-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
Reference ( family-412 ) : CTGGAATGA-CAT-TGTCA-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TN-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75256 : CTGGAATGA-CAT-TGTCA-TGCATACATTGATGCCATGTCCTGAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----TA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75257 : CTGGAATGA-CAT-TGTCA-TGCAGACATTGATGCCGTGTCATCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-TT-CACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TTC-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75258 : CTGGAATGA-TAT-TGTCA-TGCAGACATTGATGCCGAGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-TT-CACAT------ATATTTTTCTG-CCAACATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACAAGAA----CATAATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACAAC------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AA-ACACC-------AGTAT-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---TTG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-ACAGA--TTTTAT-C----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAA-CCCTCGTAT
gi|75259 : CTGGAATGA-CAC-TGTCA-TGCAGACAGTGATGCCGTGTCCCAAATAATA-------TATGATTTA-----AGTGTTAC-AGGAA---AATG-GC----AT-TA-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-T-GGGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TATATGTTGCTATGGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CACAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------CATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-AAAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCCAACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75260 : CTGGAATGA-CAC-TGCCA-TGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAACAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-AAGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TTTCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------ATTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACGATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAA-----TGT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-T-----------GC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------GATAC-----T-TAAGTTTTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--C-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-GCAAACTTC-TGAATAACACCTCGTAT
gi|75261 : CTGGAATGA-CAT-----A-TGGAGACATTGTTGACGTGTATTTAATAATA-------TATAATTCAACGCGAGTTTTAA-AGGGA---AATG-ATTGTTAT-AT-TT-CACAT------AT--TTAACTG-TCGG-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATG------A--AT-------------AATAC-----T-TAAGTTATG-AAAAATATA---G---------CGATCATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAATCCCACGTA
gi|75262 : CTGAAATGA-C------CAATGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-ATGGA---AATC-ATTTCTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCATCATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAAACATTTAT---TA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACCATAA----CATTACTATTA---A---CATAA---GAAA-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAC-G-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------ATTAC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATGACCCCTCATA
gi|75263 : CTGGAATGA-CAA-T-----TACAGACATTGATGACGTGTCAATAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGCTTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATCT-----------------------ACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TGA-------T---CA-GGT--------A-----TGTACGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAC-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGGG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCA-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTCGTAT
gi|75264 : CTGGAATGA-CA-----CA-GGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCCCTGCGAGTGTTAC-TGGAA---AATG-ATTGTTATATT-TT-TACAT------AT--GTATCAG-TCTA-AAT--------AATCAACATT-TTGAGCTGCCGCAC--TAT-------T---CC-TGT--------A-----TGAATGTTTCTATGGATACCATAC----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--TATGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-------TAAGTTGTG-AAAAATAAA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-A----AA-ATGTGTCT-ATGAAGTCC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75265 : CTGGAATGATCA------A-TGTAGACATTGATGACATGTCATCAATAATA-------CATGATTTACAGCTCGTTTTAC-AGGGA---AATC-A--GTTAT-TT-TT-CACAT------AC--TTATCTT-TCAA-ATT--------GTTCAATACT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACC---A----CATTATCATTA---A---CATGA---GAAT-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTTC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----C-TGAGCTGTGTTAAAATAAA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TAGATAATCCCTTGTAT
gi|75266 : CTGGAATGA-CCT-----A-TGCAGACATTGACGACATGTCCTCAATAATACAATGTATATGATTTACCGTGAGTTTTACAGGGAATATAATT-ATCATTAT-TT-TC-CA-AT------AT--TTATCTG-TCAA-ACT--------GTTCAACACT-TTGAGCTGCAGCAC--TA---------------TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGGAACTATAA----CATTATATCTA---A---CATAA---GAAA-----TTA-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------AATCC-----T-TAAGTTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-ATGCAT--G-A-AT-ATGGA--ATTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGAATAACCATTCATAT
gi|75267 : CTGGAATGA-CAT-TGTCG-TGCAGACATTGATG-------CTCAATAATG-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-TT-CACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTTAACATT-TTGAACTGCGGCAT--TTA-------T---CA-AGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACAG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--G---------A--AG-ACACC-------AATAT-----T-TAAGTTGTG-AAAACTATATTTGATAACCCCTCGT--ATG--TACTTTGCA---A-A-ATAACTAA--TTTTA
gi|75268 : CTGGAATG------CGT-A-TGTAGACGTCGATGACGTTTCTTCAATAATA-------TATGATTGACCTCGAATTTAAC-AGGGA---AACG-ATTGTTAT-TT-TT-TACAT------AC--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGTTGCGACAG--TAA-------C---CA-TTT--------A-----TGCATGCTGCTATGTATACCATAA----CATTATTACCG---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAT-ACACTAAAACTATC--GATGA---CAATTAT-ATAAC-------AACAC-----T-TGA----------AATATA---G---------CG---ATG--CAC-TTACAT--G-A-TT-ATGGA--TTTTAT-------------GT-------ACTTT-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75269 : CTAAAATAA-CGTATG-----GTAGACATTGTTG--------TTGA-AATA--------ACGATTTCCCATGAATTTTAC-GTAGA---CACA-TTTGTAAT-TT-TT-C-CAT------AG--CTACCAA-TCAA-AAT--------GT----CACT-----GTTGCGGCTC--TAC-------C---TA-TGT--------A-----TGCATGTTATAAATGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CGTAA----AAA-----TAC-----CGT--AAA-------ATG-C------TGAAT-A-----------TC--AATAA----GA--AT---ATC-------AAT
gi|75270 : CTGGAACGG-CCT-T-----TGCATACATTGATGACGTGTCCTCAATAAT--------T---ATTTACCGCAAGTTTTAC-----A---AGTG-ATTG
gi|75271 : TGGAATGA-CA-----CA-TGCAGACGTTGATGACGTGTT-TCAATAATA-------TATGCTTCACCGCCAGTGTTGC-AGGAA---AGGG-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTCCAACATT-TGGAGCTGCGGGAC--TAA-------T---CC-TGT--------A-----TCCATGTTGCTATGGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACG-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATACA---G---------CT---ATT--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TAGACAACCCCTTGTA
gi|75272 : TGGAATGA-CA-----CA-TGCAGCTATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCACCGCGAATGTTAC-AGGAT---AATG-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------C---CT-TGT--------A-----TATATGTTTCTATCGGTACCATAA----CATTATTACTA---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-GAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------AG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AA-ATAAA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCT-GTGAACATC-TGGATAACCCGTAGTAT
gi|75273 : TGGAATGA-CA-----CA-TACAGACATTGATGACATGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCTGCGTGAATGTAAC-AGGAA---AATG-ATTGTT-T-TT-TT-CTCAT------AT--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAACTTCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAAAAATA---G---------CA---ATG--TAC-TTCCAT--A-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-TTTTGTCC-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTTATAT
gi|75274 : TGGACTGA-CAT-----A-TGCAGACGTTGATGACGTGTCTTCAATAATA-------TATGATTCACCGCGGGTTTTAC-AGGGA---AATG------TAT--A-TT-CATAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTGCTACATT-TTGAACTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGTTTGTATGTA-----TGTATGTTACTATCGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---TATAA---CAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACA-------AATAC-----T-TATGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTAAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75275 : GGAATGA-AA-----CA-TGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCACCGCAAGTGTTAC-AGGTA---AATG-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AA--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACCTT-TTGAGCTGTGGCAC--TAT-------T---CT-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATTCCATAA----CATTATTACTG---T---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATGGA--TTGTAT-T----AA-ATTTGTCT-GCGAATTTC-TGGATAACCCCTCATAT
gi|75276 : GAATGA-CAT-TGTCA-TGCAGACATTGATGCCGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAT-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-TT-CACAT------AT--TTGTCTG-TCGC-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCTGCAT--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--CAT-TTGC--------AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75277 : GAATGA-CA-----CA-TACAGACGTTGATGACCAGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGTGTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATATG-TCAC-TTT--------GTTCTACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CTTAT---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------AGGAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-AAACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-AATTGTCC-ATGAACTTC-TTGATGACCCCTCGTAT
gi|75278 : A-TGTAGACAT----GATGTGATATTAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTCTTAC-AGGGA---AATC-ATTGTTAT-TT-TT-CACAT------AT--TTATCTG-TCAG-ATT--------GTTCAACAAT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGA
gi|75279 : AGACATTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGGGAATT-----GAAGA---AATATATTTTTAA-TAATT-AACAT------AT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTCA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTATT---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---ATTTTTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75280 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGT-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAATT-AACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAACTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTTAT-AATG---GTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTACA---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75281 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGA-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAATT-AACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACATTACTATGGTTACTATAA----CTTTA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-CAAGTTATG-TAATTTATA---C---------TT---ATGAATGT-GTGCAC----A-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75282 : TGCCATGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTTTTAC-AGAGA---AATG-ATTGTTAT-TT-TT-TACAT------AT--TAATCTG-TCGA-ACT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---TATAA---GAAA-----TAT-----ATT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GTTGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGAG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----GA-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATTACCCCTGGTAT
gi|75283 : -ATTATTAT-TT-GT-CAAATTCAGAGAT--GTCTCTGGTCAA-ATT--------GTATAGTATT-TTAAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CC-TAT--------A-----TGCATGTTGCTATGGCTACCATAAAATTTATTATTACTG---A---TAAAC---GGAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACAGC-------AATAC-----T-TATGATGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--CAC-TAGCAT--A-A-AT-ATGGA--TGTTAT-C----AA-TTTTGTCC-ACGAACATC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75284 : gatttttgacagggaaacgattgttatatatccc--TTACCTG-TCAA-ATT--------ATTCAACATT-TTAAGCTTTAGCAC--TTA-------A---CT-TGA--------A-----TGCATGTTGCTAAAGATAAAATAA----CATAATAACTG---A---AGTAA---GAAA-----TGT-----AGT--GAT-------ATT-C------TGCAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AAAAC-----T-GAAGTTGTG--CCAATATA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--
gi|75285 : TG-TCGG-ATTAATTTGAAGTTTTGCATTATTCA--TGCCGCAC--TAA-------C---AA-TGA--------A-----TGCATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATCACTG---A---CGTAA---GATA-----TGA-----ACT--AAA-------GTA-A------TGTTA-A-----------TC--AATGG---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-CAAGTTTTG-CAAAATATA---G---------CG---ATA--TAC-TTGAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATAACTTCTTGTAT
gi|75286 : A-ATT--------ATTCAATATT-TTGAGCTGCAGTTT--TAC-------C---CA-TGT--------A-----TGTCTGTTGCTATGGATACTATAA----AATTTTTAGTG---A---T-TAA---CATA-----CATGTTGCAAT--AAA-------ATA-C------TGGAT-A-----------TT--GATGA---GAA--AT-TCATC-------AGTACATGTGC-TAAGATGAG-CAGAACA----------------A---ATG--GAA-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--TTTAAT-T----AG-ATTTATCC-AAAATATTT-TGGAAAA
gi|75287 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGGTGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75288 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75289 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75290 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCACATTAC-------TGTACA-TG---------A-----TGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTTAAAATTTGTATACA-A------CTTAC-A-----------CT--GA-GA---TTA--A--------------AATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75291 : CATT-TTAAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------TT---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTATAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75292 : --TAA-------G---CG-TCT--------G-----NNNNNNNNNNTATATATACCATAA----CATTATTACTG---G---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTTAT-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-GT-ATGGA--TTTTAT-C----AA-ATTCGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75293 : A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATAGATATCATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAAATTTATAT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ACGGA--TTTAAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACTCTTCGTAT
gi|75294 : GACACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA-----AA-----TAT-----ACT--TGT-------AAA-C------TGTAT-A-----------TC--GGTGA---CAA--TT-ACACC-------ACTGC-----T----GTCGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--GAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAA-T----AA-ATTTGTTC-ATGAATTTC-TGAATAACCCCTCGT
gi|75295 : ACTG---G---CATAA---GAAA-----TGC-----AGT--AAA-------ATA-CAGTAGATGTAT-A-----------TC--GATGAATGCAAT-GT-ACATC-------AATAC-----T-GAAGTGTTG-CAAAAAATG---G---------CA---AAG--TAT-CTGCAT--A-A-AT-ATGAA--T
gi|75296 : A-C------CTTAC-A-----------TTTTGATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TGAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-------------AT-ATGGA--TTTTAT-A----AA-GATTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75297 : A---CGA--AT-ACACC-------AAATC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCC-ATGAACCTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75298 : AAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TCTCTT--A-A-TT-ATGAA--TTTTAT-T----AA--TTTGTCC-ACGAACTTC-TCGATAACCCCTCGTA
gi|75299 : ---ATG--TAC-TTCCTT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-TT---AA-ATTTGTCC-ACGAAATTCATGG-TAACCCTTTGTAT
gi|75300 : atgcagac--TAC-TTGC-TCGA-A-AC-A---A--TATTAT------GA-GTTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACTCCTCGTAT
gi|75301 : AT--G-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCG-ACAAACTTC-TGAACAACCCCTAGTA
gi|75302 : A--TATTAT-G----AG-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCATCGTAT
gi|75303 : A--TGTTAT-G----AG-GTTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTTGTA
gi|75304 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75305 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75306 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACGATCTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75307 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTTC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75308 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC--CGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75309 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75310 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75311 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTAC-ACAAACTTC-TGGACAACCCCTCGTAT
gi|75312 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTT-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75313 : A--TTTTAT-A----AG-ATTTGTCC-ACAAGCTTC-AGGATAACCCATCGTAT
gi|75314 : A--TTTTAT-T----TG-GTTTGTCC-ACAAACTTC-TAGATAACTCCTCGTA
gi|75315 : TTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TAGATAACCCCTCATAT
gi|75316 : TAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCTTCGTA
Alignments
lowQualScore : 3333333
lowQualScore : 1 9999999 1 1 4444444 0 1 44 222 1 1 4 1 444444 22 1 1 88888888 1 11 444444444 111 3 88888888 88888 2222 333 111 777 22222 22222 44 3333333 1 222222 3 44444444444 11 111 22 3 9999999 22222 4 33 111 44444444444444 11 1 11 1 3 0 11 999999 4 0 0
lowQualScore : . ....... . . ....... . . .. ... . . . . ...... .. . . ........ . .. ......... ... . ........ ..... .... ... ... ... ..... ..... .. ....... . ...... . ........... .. ... .. . ....... ..... . .. ... .............. .. . .. . . . .. ...... . . .
lowQualScore : 8 7777777 7 0 8888888 1 0 33 666 4 5 4 5 333333 00 4 3 88888888 1 55 000000000 999 2 44444444 11111 3333 777 888 444 66666 66666 66 4444444 0 999999 1 99999999999 44 888 44 0 8888888 66666 1 99 888 44444444444444 33 0 33 9 7 9 00 111111 4 7 7
consensus : CTGGAATGA-CAT-TG-C-A-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
Reference ( family-412 ) : CTGGAATGA-CAT-TG-C-A-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75256 : CTGGAATGA-CAT-TGTC-A-TGCATACATTGATGCCATGTCCTGAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----TA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75257 : CTGGAATGA-CAT-TGTC-A-TGCAGACATTGATGCCGTGTCATCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TTC-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75258 : CTGGAATGA-TAT-TGTC-A-TGCAGACATTGATGCCGAGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------ATATTTTTCTG-CCAACATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACAAGAA----CATAATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACAAC------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AA-ACACC-------AGTAT-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---TTG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-ACAGA--TTTTAT-C----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAA-CCCTCGTAT
gi|75259 : CTGGAATGA-CAC-TGTC-A-TGCAGACAGTGATGCCGTGTCCCAAATAATA-------TATGATTTA-----AGTGTTAC-AGGAA---AATG-GC----AT-TA-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-T-GGGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TATATGTTGCTATGGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CACAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------CATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-AAAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCCAACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75260 : CTGGAATGA-CAC-TG-CCA-TGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAACAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-AAGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TTTCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------ATTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACGATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAA-----TGT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-T-----------GC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------GATAC-----T-TAAGTTTTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--C-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-GCAAACTTC-TGAATAACACCTCGTAT
gi|75261 : CTGGAATGA-CAT------A-TGGAGACATTGTTGACGTGTATTTAATAATA-------TATAATTCAACGCGAGTTTTAA-AGGGA---AATG-ATTGTTAT-AT-T-TCACAT------AT--TTAACTG-TCGG-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATG------A--AT-------------AATAC-----T-TAAGTTATG-AAAAATATA---G---------CGATCATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAATCCCACGTA
gi|75262 : CTGAAATGA-C------C-AATGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-ATGGA---AATC-ATTTCTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCATCATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAAACATTTAT---TA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACCATAA----CATTACTATTA---A---CATAA---GAAA-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAC-G-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------ATTAC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATGACCCCTCATA
gi|75263 : CTGGAATGA-CAA-T------TACAGACATTGATGACGTGTCAATAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGCTTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCT-----------------------ACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TGA-------T---CA-GGT--------A-----TGTACGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAC-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGGG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCA-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTCGTAT
gi|75264 : CTGGAATGA-CA-----C-A-GGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCCCTGCGAGTGTTAC-TGGAA---AATG-ATTGTTATATT-T-TTACAT------AT--GTATCAG-TCTA-AAT--------AATCAACATT-TTGAGCTGCCGCAC--TAT-------T---CC-TGT--------A-----TGAATGTTTCTATGGATACCATAC----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--TATGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-------TAAGTTGTG-AAAAATAAA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-A----AA-ATGTGTCT-ATGAAGTCC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75265 : CTGGAATGATCA-------A-TGTAGACATTGATGACATGTCATCAATAATA-------CATGATTTACAGCTCGTTTTAC-AGGGA---AATC-A--GTTAT-TT-T-TCACAT------AC--TTATCTT-TCAA-ATT--------GTTCAATACT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACC---A----CATTATCATTA---A---CATGA---GAAT-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTTC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----C-TGAGCTGTGTTAAAATAAA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TAGATAATCCCTTGTAT
gi|75266 : CTGGAATGA-CCT------A-TGCAGACATTGACGACATGTCCTCAATAATACAATGTATATGATTTACCGTGAGTTTTACAGGGAATATAATT-ATCATTAT-TT-T-CCA-AT------AT--TTATCTG-TCAA-ACT--------GTTCAACACT-TTGAGCTGCAGCAC--TA---------------TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGGAACTATAA----CATTATATCTA---A---CATAA---GAAA-----TTA-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------AATCC-----T-TAAGTTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-ATGCAT--G-A-AT-ATGGA--ATTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGAATAACCATTCATAT
gi|75267 : CTGGAATGA-CAT-TGTC-G-TGCAGACATTGATG-------CTCAATAATG-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTTAACATT-TTGAACTGCGGCAT--TTA-------T---CA-AGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACAG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--G---------A--AG-ACACC-------AATAT-----T-TAAGTTGTG-AAAACTATATTTGATAACCCCTCGT--ATG--TACTTTGCA---A-A-ATAACTAA--TTTTA
gi|75268 : CTGGAATG------CG-T-A-TGTAGACGTCGATGACGTTTCTTCAATAATA-------TATGATTGACCTCGAATTTAAC-AGGGA---AACG-ATTGTTAT-TT-T-TTACAT------AC--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGTTGCGACAG--TAA-------C---CA-TTT--------A-----TGCATGCTGCTATGTATACCATAA----CATTATTACCG---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAT-ACACTAAAACTATC--GATGA---CAATTAT-ATAAC-------AACAC-----T-TGA----------AATATA---G---------CG---ATG--CAC-TTACAT--G-A-TT-ATGGA--TTTTAT-------------GT-------ACTTT-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75269 : CTAAAATAA-CGTATG------GTAGACATTGTTG--------TTGA-AATA--------ACGATTTCCCATGAATTTTAC-GTAGA---CACA-TTTGTAAT-TT-T-TC-CAT------AG--CTACCAA-TCAA-AAT--------GT----CACT-----GTTGCGGCTC--TAC-------C---TA-TGT--------A-----TGCATGTTATAAATGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CGTAA----AAA-----TAC-----CGT--AAA-------ATG-C------TGAAT-A-----------TC--AATAA----GA--AT---ATC-------AAT
gi|75270 : CTGGAACGG-CCT-T------TGCATACATTGATGACGTGTCCTCAATAAT--------T---ATTTACCGCAAGTTTTAC-----A---AGTG-ATTG
gi|75271 : TGGAATGA-CA-----C-A-TGCAGACGTTGATGACGTGTT-TCAATAATA-------TATGCTTCACCGCCAGTGTTGC-AGGAA---AGGG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTCCAACATT-TGGAGCTGCGGGAC--TAA-------T---CC-TGT--------A-----TCCATGTTGCTATGGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACG-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATACA---G---------CT---ATT--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TAGACAACCCCTTGTA
gi|75272 : TGGAATGA-CA-----C-A-TGCAGCTATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCACCGCGAATGTTAC-AGGAT---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------C---CT-TGT--------A-----TATATGTTTCTATCGGTACCATAA----CATTATTACTA---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-GAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------AG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AA-ATAAA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCT-GTGAACATC-TGGATAACCCGTAGTAT
gi|75273 : TGGAATGA-CA-----C-A-TACAGACATTGATGACATGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCTGCGTGAATGTAAC-AGGAA---AATG-ATTGTT-T-TT-T-TCTCAT------AT--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAACTTCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAAAAATA---G---------CA---ATG--TAC-TTCCAT--A-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-TTTTGTCC-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTTATAT
gi|75274 : TGGACTGA-CAT------A-TGCAGACGTTGATGACGTGTCTTCAATAATA-------TATGATTCACCGCGGGTTTTAC-AGGGA---AATG------TAT-AT-T--CATAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTGCTACATT-TTGAACTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGTTTGTATGTA-----TGTATGTTACTATCGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---TATAA---CAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACA-------AATAC-----T-TATGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTAAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75275 : GGAATGA-AA-----C-A-TGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCACCGCAAGTGTTAC-AGGTA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AA--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACCTT-TTGAGCTGTGGCAC--TAT-------T---CT-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATTCCATAA----CATTATTACTG---T---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATGGA--TTGTAT-T----AA-ATTTGTCT-GCGAATTTC-TGGATAACCCCTCATAT
gi|75276 : GAATGA-CAT-TGTC-A-TGCAGACATTGATGCCGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAT-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGC-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCTGCAT--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--CAT-TTGC--------AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75277 : GAATGA-CA-----C-A-TACAGACGTTGATGACCAGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGTGTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATATG-TCAC-TTT--------GTTCTACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CTTAT---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------AGGAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-AAACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-AATTGTCC-ATGAACTTC-TTGATGACCCCTCGTAT
gi|75278 : -A-TGTAGACAT----GATGTGATATTAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTCTTAC-AGGGA---AATC-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCAG-ATT--------GTTCAACAAT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGA
gi|75279 : AGACATTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGGGAATT-----GAAGA---AATATATTTTTAA-TAAT-TAACAT------AT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTCA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTATT---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---ATTTTTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75280 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGT-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAAT-TAACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAACTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTTAT-AATG---GTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTACA---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75281 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGA-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAAT-TAACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACATTACTATGGTTACTATAA----CTTTA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-CAAGTTATG-TAATTTATA---C---------TT---ATGAATGT-GTGCAC----A-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75282 : TGCCATGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTTTTAC-AGAGA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TTACAT------AT--TAATCTG-TCGA-ACT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---TATAA---GAAA-----TAT-----ATT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GTTGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGAG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----GA-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATTACCCCTGGTAT
gi|75283 : -ATTATTAT-TT-G-TCAAATTCAGAGAT--GTCTCTGGTCAA-ATT--------GTATAGTATT-TTAAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CC-TAT--------A-----TGCATGTTGCTATGGCTACCATAAAATTTATTATTACTG---A---TAAAC---GGAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACAGC-------AATAC-----T-TATGATGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--CAC-TAGCAT--A-A-AT-ATGGA--TGTTAT-C----AA-TTTTGTCC-ACGAACATC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75284 : gatttttgacagggaaacgattgttatatatccc--TTACCTG-TCAA-ATT--------ATTCAACATT-TTAAGCTTTAGCAC--TTA-------A---CT-TGA--------A-----TGCATGTTGCTAAAGATAAAATAA----CATAATAACTG---A---AGTAA---GAAA-----TGT-----AGT--GAT-------ATT-C------TGCAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AAAAC-----T-GAAGTTGTG--CCAATATA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--
gi|75285 : TG-TCGG-ATTAATTTGAAGTTTTGCATTATTCA--TGCCGCAC--TAA-------C---AA-TGA--------A-----TGCATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATCACTG---A---CGTAA---GATA-----TGA-----ACT--AAA-------GTA-A------TGTTA-A-----------TC--AATGG---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-CAAGTTTTG-CAAAATATA---G---------CG---ATA--TAC-TTGAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATAACTTCTTGTAT
gi|75286 : A-ATT--------ATTCAATATT-TTGAGCTGCAGTTT--TAC-------C---CA-TGT--------A-----TGTCTGTTGCTATGGATACTATAA----AATTTTTAGTG---A---T-TAA---CATA-----CATGTTGCAAT--AAA-------ATA-C------TGGAT-A-----------TT--GATGA---GAA--AT-TCATC-------AGTACATGTGC-TAAGATGAG-CAGAACA----------------A---ATG--GAA-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--TTTAAT-T----AG-ATTTATCC-AAAATATTT-TGGAAAA
gi|75287 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGGTGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75288 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75289 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75290 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCACATTAC-------TGTACA-TG---------A-----TGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTTAAAATTTGTATACA-A------CTTAC-A-----------CT--GA-GA---TTA--A--------------AATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75291 : CATT-TTAAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------TT---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTATAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75292 : --TAA-------G---CG-TCT--------G-----NNNNNNNNNNTATATATACCATAA----CATTATTACTG---G---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTTAT-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-GT-ATGGA--TTTTAT-C----AA-ATTCGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75293 : A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATAGATATCATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAAATTTATAT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ACGGA--TTTAAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACTCTTCGTAT
gi|75294 : GACACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA-----AA-----TAT-----ACT--TGT-------AAA-C------TGTAT-A-----------TC--GGTGA---CAA--TT-ACACC-------ACTGC-----T----GTCGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--GAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAA-T----AA-ATTTGTTC-ATGAATTTC-TGAATAACCCCTCGT
gi|75295 : ACTG---G---CATAA---GAAA-----TGC-----AGT--AAA-------ATA-CAGTAGATGTAT-A-----------TC--GATGAATGCAAT-GT-ACATC-------AATAC-----T-GAAGTGTTG-CAAAAAATG---G---------CA---AAG--TAT-CTGCAT--A-A-AT-ATGAA--T
gi|75296 : A-C------CTTAC-A-----------TTTTGATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TGAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-------------AT-ATGGA--TTTTAT-A----AA-GATTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75297 : A---CGA--AT-ACACC-------AAATC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCC-ATGAACCTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75298 : AAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TCTCTT--A-A-TT-ATGAA--TTTTAT-T----AA--TTTGTCC-ACGAACTTC-TCGATAACCCCTCGTA
gi|75299 : ---ATG--TAC-TTCCTT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-TT---AA-ATTTGTCC-ACGAAATTCATGG-TAACCCTTTGTAT
gi|75300 : atgcagac--TAC-TTGC-TCGA-A-AC-A---A--TATTAT------GA-GTTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACTCCTCGTAT
gi|75301 : AT--G-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCG-ACAAACTTC-TGAACAACCCCTAGTA
gi|75302 : A--TATTAT-G----AG-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCATCGTAT
gi|75303 : A--TGTTAT-G----AG-GTTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTTGTA
gi|75304 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75305 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75306 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACGATCTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75307 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTTC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75308 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC--CGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75309 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75310 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75311 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTAC-ACAAACTTC-TGGACAACCCCTCGTAT
gi|75312 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTT-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75313 : A--TTTTAT-A----AG-ATTTGTCC-ACAAGCTTC-AGGATAACCCATCGTAT
gi|75314 : A--TTTTAT-T----TG-GTTTGTCC-ACAAACTTC-TAGATAACTCCTCGTA
gi|75315 : TTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TAGATAACCCCTCATAT
gi|75316 : TAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCTTCGTA
Alignments
lowQualScore : 3333333
lowQualScore : 1 9999999 1 1 4444444 0 1 44 222 1 1 4 1 444444 22 1 1 88888888 1 11 444444444 111 3 88888888 88888 2222 333 111 777 22222 22222 44 3333333 1 222222 3 44444444444 11 111 22 3 9999999 22222 4 33 111 44444444444444 11 1 11 1 3 0 11 999999 4 0 0
lowQualScore : . ....... . . ....... . . .. ... . . . . ...... .. . . ........ . .. ......... ... . ........ ..... .... ... ... ... ..... ..... .. ....... . ...... . ........... .. ... .. . ....... ..... . .. ... .............. .. . .. . . . .. ...... . . .
lowQualScore : 8 7777777 7 0 8888888 1 0 33 666 4 5 4 5 333333 00 4 3 88888888 1 55 000000000 999 2 44444444 11111 3333 777 888 444 66666 66666 66 4444444 0 999999 1 99999999999 44 888 44 0 8888888 66666 1 99 888 44444444444444 33 0 33 9 7 9 00 111111 4 7 7
consensus : CTGGAATGA-CAT-TG-C-A-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
Reference ( family-412 ) : CTGGAATGA-CAT-TG-C-A-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75256 : CTGGAATGA-CAT-TGTC-A-TGCATACATTGATGCCATGTCCTGAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----TA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75257 : CTGGAATGA-CAT-TGTC-A-TGCAGACATTGATGCCGTGTCATCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TTC-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75258 : CTGGAATGA-TAT-TGTC-A-TGCAGACATTGATGCCGAGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------ATATTTTTCTG-CCAACATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACAAGAA----CATAATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACAAC------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AA-ACACC-------AGTAT-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---TTG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-ACAGA--TTTTAT-C----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAA-CCCTCGTAT
gi|75259 : CTGGAATGA-CAC-TGTC-A-TGCAGACAGTGATGCCGTGTCCCAAATAATA-------TATGATTTA-----AGTGTTAC-AGGAA---AATG-GC----AT-TA-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-T-GGGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TATATGTTGCTATGGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CACAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------CATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-AAAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCCAACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75260 : CTGGAATGA-CAC-TG-CCA-TGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAACAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-AAGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TTTCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------ATTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACGATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAA-----TGT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-T-----------GC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------GATAC-----T-TAAGTTTTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--C-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-GCAAACTTC-TGAATAACACCTCGTAT
gi|75261 : CTGGAATGA-CAT------A-TGGAGACATTGTTGACGTGTATTTAATAATA-------TATAATTCAACGCGAGTTTTAA-AGGGA---AATG-ATTGTTAT-AT-T-TCACAT------AT--TTAACTG-TCGG-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATG------A--AT-------------AATAC-----T-TAAGTTATG-AAAAATATA---G---------CGATCATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAATCCCACGTA
gi|75262 : CTGAAATGA-C------C-AATGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-ATGGA---AATC-ATTTCTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCATCATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAAACATTTAT---TA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACCATAA----CATTACTATTA---A---CATAA---GAAA-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAC-G-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------ATTAC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATGACCCCTCATA
gi|75263 : CTGGAATGA-CAA-T------TACAGACATTGATGACGTGTCAATAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGCTTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCT-----------------------ACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TGA-------T---CA-GGT--------A-----TGTACGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAC-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGGG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCA-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTCGTAT
gi|75264 : CTGGAATGA-CA-----C-A-GGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCCCTGCGAGTGTTAC-TGGAA---AATG-ATTGTTATATT-T-TTACAT------AT--GTATCAG-TCTA-AAT--------AATCAACATT-TTGAGCTGCCGCAC--TAT-------T---CC-TGT--------A-----TGAATGTTTCTATGGATACCATAC----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--TATGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-------TAAGTTGTG-AAAAATAAA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-A----AA-ATGTGTCT-ATGAAGTCC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75265 : CTGGAATGATCA-------A-TGTAGACATTGATGACATGTCATCAATAATA-------CATGATTTACAGCTCGTTTTAC-AGGGA---AATC-A--GTTAT-TT-T-TCACAT------AC--TTATCTT-TCAA-ATT--------GTTCAATACT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACC---A----CATTATCATTA---A---CATGA---GAAT-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTTC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----C-TGAGCTGTGTTAAAATAAA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TAGATAATCCCTTGTAT
gi|75266 : CTGGAATGA-CCT------A-TGCAGACATTGACGACATGTCCTCAATAATACAATGTATATGATTTACCGTGAGTTTTACAGGGAATATAATT-ATCATTAT-TT-T-CCA-AT------AT--TTATCTG-TCAA-ACT--------GTTCAACACT-TTGAGCTGCAGCAC--TA---------------TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGGAACTATAA----CATTATATCTA---A---CATAA---GAAA-----TTA-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------AATCC-----T-TAAGTTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-ATGCAT--G-A-AT-ATGGA--ATTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGAATAACCATTCATAT
gi|75267 : CTGGAATGA-CAT-TGTC-G-TGCAGACATTGATG-------CTCAATAATG-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTTAACATT-TTGAACTGCGGCAT--TTA-------T---CA-AGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACAG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--G---------A--AG-ACACC-------AATAT-----T-TAAGTTGTG-AAAACTATATTTGATAACCCCTCGT--ATG--TACTTTGCA---A-A-ATAACTAA--TTTTA
gi|75268 : CTGGAATG------CG-T-A-TGTAGACGTCGATGACGTTTCTTCAATAATA-------TATGATTGACCTCGAATTTAAC-AGGGA---AACG-ATTGTTAT-TT-T-TTACAT------AC--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGTTGCGACAG--TAA-------C---CA-TTT--------A-----TGCATGCTGCTATGTATACCATAA----CATTATTACCG---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAT-ACACTAAAACTATC--GATGA---CAATTAT-ATAAC-------AACAC-----T-TGA----------AATATA---G---------CG---ATG--CAC-TTACAT--G-A-TT-ATGGA--TTTTAT-------------GT-------ACTTT-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75269 : CTAAAATAA-CGTATG------GTAGACATTGTTG--------TTGA-AATA--------ACGATTTCCCATGAATTTTAC-GTAGA---CACA-TTTGTAAT-TT-T-TC-CAT------AG--CTACCAA-TCAA-AAT--------GT----CACT-----GTTGCGGCTC--TAC-------C---TA-TGT--------A-----TGCATGTTATAAATGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CGTAA----AAA-----TAC-----CGT--AAA-------ATG-C------TGAAT-A-----------TC--AATAA----GA--AT---ATC-------AAT
gi|75270 : CTGGAACGG-CCT-T------TGCATACATTGATGACGTGTCCTCAATAAT--------T---ATTTACCGCAAGTTTTAC-----A---AGTG-ATTG
gi|75271 : TGGAATGA-CA-----C-A-TGCAGACGTTGATGACGTGTT-TCAATAATA-------TATGCTTCACCGCCAGTGTTGC-AGGAA---AGGG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTCCAACATT-TGGAGCTGCGGGAC--TAA-------T---CC-TGT--------A-----TCCATGTTGCTATGGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACG-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATACA---G---------CT---ATT--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TAGACAACCCCTTGTA
gi|75272 : TGGAATGA-CA-----C-A-TGCAGCTATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCACCGCGAATGTTAC-AGGAT---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------C---CT-TGT--------A-----TATATGTTTCTATCGGTACCATAA----CATTATTACTA---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-GAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------AG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AA-ATAAA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCT-GTGAACATC-TGGATAACCCGTAGTAT
gi|75273 : TGGAATGA-CA-----C-A-TACAGACATTGATGACATGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCTGCGTGAATGTAAC-AGGAA---AATG-ATTGTT-T-TT-T-TCTCAT------AT--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAACTTCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAAAAATA---G---------CA---ATG--TAC-TTCCAT--A-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-TTTTGTCC-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTTATAT
gi|75274 : TGGACTGA-CAT------A-TGCAGACGTTGATGACGTGTCTTCAATAATA-------TATGATTCACCGCGGGTTTTAC-AGGGA---AATG------TAT-AT-T--CATAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTGCTACATT-TTGAACTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGTTTGTATGTA-----TGTATGTTACTATCGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---TATAA---CAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACA-------AATAC-----T-TATGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTAAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75275 : GGAATGA-AA-----C-A-TGCAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCACCGCAAGTGTTAC-AGGTA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AA--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACCTT-TTGAGCTGTGGCAC--TAT-------T---CT-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATTCCATAA----CATTATTACTG---T---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATGGA--TTGTAT-T----AA-ATTTGTCT-GCGAATTTC-TGGATAACCCCTCATAT
gi|75276 : GAATGA-CAT-TGTC-A-TGCAGACATTGATGCCGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAT-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGC-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCTGCAT--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--CAT-TTGC--------AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75277 : GAATGA-CA-----C-A-TACAGACGTTGATGACCAGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGTGTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATATG-TCAC-TTT--------GTTCTACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CTTAT---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------AGGAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-AAACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-AATTGTCC-ATGAACTTC-TTGATGACCCCTCGTAT
gi|75278 : -A-TGTAGACAT----GATGTGATATTAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTCTTAC-AGGGA---AATC-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCAG-ATT--------GTTCAACAAT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGA
gi|75279 : AGACATTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGGGAATT-----GAAGA---AATATATTTTTAA-TAAT-TAACAT------AT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTCA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTATT---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---ATTTTTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75280 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGT-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAAT-TAACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAACTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTTAT-AATG---GTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTACA---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75281 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGA-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAAT-TAACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACATTACTATGGTTACTATAA----CTTTA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-CAAGTTATG-TAATTTATA---C---------TT---ATGAATGT-GTGCAC----A-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75282 : TGCCATGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTTTTAC-AGAGA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TTACAT------AT--TAATCTG-TCGA-ACT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---TATAA---GAAA-----TAT-----ATT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GTTGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGAG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----GA-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATTACCCCTGGTAT
gi|75283 : -ATTATTAT-TT-G-TCAAATTCAGAGAT--GTCTCTGGTCAA-ATT--------GTATAGTATT-TTAAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CC-TAT--------A-----TGCATGTTGCTATGGCTACCATAAAATTTATTATTACTG---A---TAAAC---GGAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACAGC-------AATAC-----T-TATGATGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--CAC-TAGCAT--A-A-AT-ATGGA--TGTTAT-C----AA-TTTTGTCC-ACGAACATC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75284 : gatttttgacagggaaacgattgttatatatccc--TTACCTG-TCAA-ATT--------ATTCAACATT-TTAAGCTTTAGCAC--TTA-------A---CT-TGA--------A-----TGCATGTTGCTAAAGATAAAATAA----CATAATAACTG---A---AGTAA---GAAA-----TGT-----AGT--GAT-------ATT-C------TGCAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AAAAC-----T-GAAGTTGTG--CCAATATA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--
gi|75285 : TG-TCGG-ATTAATTTGAAGTTTTGCATTATTCA--TGCCGCAC--TAA-------C---AA-TGA--------A-----TGCATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATCACTG---A---CGTAA---GATA-----TGA-----ACT--AAA-------GTA-A------TGTTA-A-----------TC--AATGG---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-CAAGTTTTG-CAAAATATA---G---------CG---ATA--TAC-TTGAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATAACTTCTTGTAT
gi|75286 : A-ATT--------ATTCAATATT-TTGAGCTGCAGTTT--TAC-------C---CA-TGT--------A-----TGTCTGTTGCTATGGATACTATAA----AATTTTTAGTG---A---T-TAA---CATA-----CATGTTGCAAT--AAA-------ATA-C------TGGAT-A-----------TT--GATGA---GAA--AT-TCATC-------AGTACATGTGC-TAAGATGAG-CAGAACA----------------A---ATG--GAA-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--TTTAAT-T----AG-ATTTATCC-AAAATATTT-TGGAAAA
gi|75287 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGGTGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75288 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75289 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75290 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCACATTAC-------TGTACA-TG---------A-----TGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTTAAAATTTGTATACA-A------CTTAC-A-----------CT--GA-GA---TTA--A--------------AATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75291 : CATT-TTAAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------TT---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTATAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75292 : --TAA-------G---CG-TCT--------G-----NNNNNNNNNNTATATATACCATAA----CATTATTACTG---G---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTTAT-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-GT-ATGGA--TTTTAT-C----AA-ATTCGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75293 : A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATAGATATCATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAAATTTATAT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ACGGA--TTTAAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACTCTTCGTAT
gi|75294 : GACACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA-----AA-----TAT-----ACT--TGT-------AAA-C------TGTAT-A-----------TC--GGTGA---CAA--TT-ACACC-------ACTGC-----T----GTCGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--GAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAA-T----AA-ATTTGTTC-ATGAATTTC-TGAATAACCCCTCGT
gi|75295 : ACTG---G---CATAA---GAAA-----TGC-----AGT--AAA-------ATA-CAGTAGATGTAT-A-----------TC--GATGAATGCAAT-GT-ACATC-------AATAC-----T-GAAGTGTTG-CAAAAAATG---G---------CA---AAG--TAT-CTGCAT--A-A-AT-ATGAA--T
gi|75296 : A-C------CTTAC-A-----------TTTTGATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TGAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-------------AT-ATGGA--TTTTAT-A----AA-GATTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75297 : A---CGA--AT-ACACC-------AAATC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCC-ATGAACCTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75298 : AAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TCTCTT--A-A-TT-ATGAA--TTTTAT-T----AA--TTTGTCC-ACGAACTTC-TCGATAACCCCTCGTA
gi|75299 : ---ATG--TAC-TTCCTT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-TT---AA-ATTTGTCC-ACGAAATTCATGG-TAACCCTTTGTAT
gi|75300 : atgcagac--TAC-TTGC-TCGA-A-AC-A---A--TATTAT------GA-GTTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACTCCTCGTAT
gi|75301 : AT--G-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCG-ACAAACTTC-TGAACAACCCCTAGTA
gi|75302 : A--TATTAT-G----AG-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCATCGTAT
gi|75303 : A--TGTTAT-G----AG-GTTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTTGTA
gi|75304 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75305 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75306 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACGATCTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75307 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTTC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75308 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC--CGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75309 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75310 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75311 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTAC-ACAAACTTC-TGGACAACCCCTCGTAT
gi|75312 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTT-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75313 : A--TTTTAT-A----AG-ATTTGTCC-ACAAGCTTC-AGGATAACCCATCGTAT
gi|75314 : A--TTTTAT-T----TG-GTTTGTCC-ACAAACTTC-TAGATAACTCCTCGTA
gi|75315 : TTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TAGATAACCCCTCATAT
gi|75316 : TAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCTTCGTA
blockSeqs : T TTGTC A A CAATGTA G AG TAT T A A T TCAGAG AT G C AATTTGAA A AT AAACATTTA GTA C TTGTATGT CATGG AATT GTT TTG TGT ATTTA GTTGC TA TTTGTAT A AGTAGA T CACTAAAACTA TT ATG TT T GAGATTG ATGTG A TT TTT ATAACCCCTCGT AA CG C G TTTAT C
blockSeqs : . TTGTC . C . G G . . . A . . . . . T . . TA . C GC CATGA . GTT . TGT . . T . . . T . . . T T GAGATTG . A A . CGATC . . C G TTTAT C
blockSeqs : . CTGTC . C . G G . . . A . . . . . T . . AA . C GC CATGA . . . TGT . . T . . . T . . . . T GAGATTG . A A . CT . . . G TTTAT C
blockSeqs : . CTGCC . C . T A . . . . . . . . . T . . AA . . GC . . . . TGT . . T . . . . . . . . . . . A A . CT . . . G TTTAT C
blockSeqs : . TTGTC . T . T A . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CT . . . . AT C
blockSeqs : . TTGTC . C . T A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . AT C
blockSeqs : . TATG . A . T A . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CG . . . . TT .
blockSeqs : . CGT . C . G A . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . T .
blockSeqs : . AT . A . T T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . C .
blockSeqs : . TT . C . T A . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TG . . . . T .
blockSeqs : . T . C . G G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . T .
blockSeqs : . C . T . T A . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . T .
blockSeqs : . C . C . T G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CT . . . . T .
blockSeqs : . T . C . T A . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AG . . . . T .
blockSeqs : . C . C . G A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CA . . . . A .
blockSeqs : . C . T . G A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CT . . . . T .
blockSeqs : . C . C . G A . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CA . . . . T .
blockSeqs : . T . C . T A . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . T .
blockSeqs : . C . C . G G . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . CG . . . . T .
blockSeqs : . C . A . G A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TT . . . . T .
blockSeqs : . . . G . G A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TT . . . . T .
blockSeqs : . G . C G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TT . . . . T .
blockSeqs : G . T A . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CG . . . . T .
blockSeqs : C . A A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CG . . . . T .
blockSeqs : . . A A . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TG . . . . T .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TT . . . . C .
blockSeqs : . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CA . . . . T .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CG . . . . T .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CG . . . . T .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CA . . . . C .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CA . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . G .
blockSeqs : . . . . G .
blockSeqs : . . . G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : G .
blockSeqs : G .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TTC****
originalCons : CTGGAATGA-CAT-TG-C-A-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
finalCons : CTGGAATGA-CATTC----A-TGCAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
Alignments
lowQualScore : 3333
lowQualScore : 1 8888 1 1 1 4444444 0 1 44 222 1 1 4 1 444444 22 1 1 88888888 1 11 444444444 111 3 88888888 88888 2222 333 111 777 22222 22222 44 3333333 1 222222 3 44444444444 11 111 22 3 9999999 22222 4 33 111 44444444444444 11 1 11 1 3 0 11 999999 4 0 0
lowQualScore : . .... . . . ....... . . .. ... . . . . ...... .. . . ........ . .. ......... ... . ........ ..... .... ... ... ... ..... ..... .. ....... . ...... . ........... .. ... .. . ....... ..... . .. ... .............. .. . .. . . . .. ...... . . .
lowQualScore : 8 6666 7 7 0 8888888 1 0 33 666 4 5 4 5 333333 00 4 3 88888888 1 55 000000000 999 2 44444444 11111 3333 777 888 444 66666 66666 66 4444444 0 999999 1 99999999999 44 888 44 0 8888888 66666 1 99 888 44444444444444 33 0 33 9 7 9 00 111111 4 7 7
consensus : CTGGAATGA-CATT--CA-TG-CAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
Reference ( family-412 ) : CTGGAATGA-CATT--CA-TG-CAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTNTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75256 : CTGGAATGA-CATTGTCA-TG-CATACATTGATGCCATGTCCTGAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----TA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75257 : CTGGAATGA-CATTGTCA-TG-CAGACATTGATGCCGTGTCATCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TTC-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75258 : CTGGAATGA-TATTGTCA-TG-CAGACATTGATGCCGAGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------ATATTTTTCTG-CCAACATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACAAGAA----CATAATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACAAC------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AA-ACACC-------AGTAT-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---TTG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-ACAGA--TTTTAT-C----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAA-CCCTCGTAT
gi|75259 : CTGGAATGA-CACTGTCA-TG-CAGACAGTGATGCCGTGTCCCAAATAATA-------TATGATTTA-----AGTGTTAC-AGGAA---AATG-GC----AT-TA-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-T-GGGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TATATGTTGCTATGGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CACAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------CATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--CAC-TTGCAT--A-A-AT-AAAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCCAACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75260 : CTGGAATGA-CACTGCCA-TG-CAGACATTGATGATGTGTCCTCAACAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-AAGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-TTTCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------ATTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACGATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAA-----TGT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-T-----------GC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------GATAC-----T-TAAGTTTTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--C-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-GCAAACTTC-TGAATAACACCTCGTAT
gi|75261 : CTGGAATGA-CAT----A-TG-GAGACATTGTTGACGTGTATTTAATAATA-------TATAATTCAACGCGAGTTTTAA-AGGGA---AATG-ATTGTTAT-AT-T-TCACAT------AT--TTAACTG-TCGG-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATG------A--AT-------------AATAC-----T-TAAGTTATG-AAAAATATA---G---------CGATCATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAATCCCACGTA
gi|75262 : CTGAAATGA-C-----CAATG-CAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCGCGAGTTTTAC-ATGGA---AATC-ATTTCTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCATCATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAAACATTTAT---TA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACCATAA----CATTACTATTA---A---CATAA---GAAA-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAC-G-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------ATTAC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATGACCCCTCATA
gi|75263 : CTGGAATGA-CAAT--TA----CAGACATTGATGACGTGTCAATAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGCTTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCT-----------------------ACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TGA-------T---CA-GGT--------A-----TGTACGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAC-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGGG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCA-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTCGTAT
gi|75264 : CTGGAATGA-CA----CA-GG-CAGACATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCCCTGCGAGTGTTAC-TGGAA---AATG-ATTGTTATATT-T-TTACAT------AT--GTATCAG-TCTA-AAT--------AATCAACATT-TTGAGCTGCCGCAC--TAT-------T---CC-TGT--------A-----TGAATGTTTCTATGGATACCATAC----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--TATGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-------TAAGTTGTG-AAAAATAAA---G---------CG---ATG--TAT-TTGCAT--A-A-AT-ATTGA--TTTTAT-A----AA-ATGTGTCT-ATGAAGTCC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75265 : CTGGAATGATCA-----A-TG-TAGACATTGATGACATGTCATCAATAATA-------CATGATTTACAGCTCGTTTTAC-AGGGA---AATC-A--GTTAT-TT-T-TCACAT------AC--TTATCTT-TCAA-ATT--------GTTCAATACT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGAGACC---A----CATTATCATTA---A---CATGA---GAAT-----TGC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTTC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----C-TGAGCTGTGTTAAAATAAA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TAGATAATCCCTTGTAT
gi|75266 : CTGGAATGA-CCT----A-TG-CAGACATTGACGACATGTCCTCAATAATACAATGTATATGATTTACCGTGAGTTTTACAGGGAATATAATT-ATCATTAT-TT-T-CCA-AT------AT--TTATCTG-TCAA-ACT--------GTTCAACACT-TTGAGCTGCAGCAC--TA---------------TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGGAACTATAA----CATTATATCTA---A---CATAA---GAAA-----TTA-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TC--AATGA---CAA--AT-ACACC-------AATCC-----T-TAAGTTGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-ATGCAT--G-A-AT-ATGGA--ATTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGAATAACCATTCATAT
gi|75267 : CTGGAATGA-CATTGTCG-TG-CAGACATTGATG-------CTCAATAATG-------TATGATTTACCGCGAGTGTTAC-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGA-ATT--------GTTTAACATT-TTGAACTGCGGCAT--TTA-------T---CA-AGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACAG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--G---------A--AG-ACACC-------AATAT-----T-TAAGTTGTG-AAAACTATATTTGATAACCCCTCGT--ATG--TACTTTGCA---A-A-ATAACTAA--TTTTA
gi|75268 : CTGGAATG--CGT----A-TG-TAGACGTCGATGACGTTTCTTCAATAATA-------TATGATTGACCTCGAATTTAAC-AGGGA---AACG-ATTGTTAT-TT-T-TTACAT------AC--TTATCTG-TCAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGTTGCGACAG--TAA-------C---CA-TTT--------A-----TGCATGCTGCTATGTATACCATAA----CATTATTACCG---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-C------TGTAT-ACACTAAAACTATC--GATGA---CAATTAT-ATAAC-------AACAC-----T-TGA----------AATATA---G---------CG---ATG--CAC-TTACAT--G-A-TT-ATGGA--TTTTAT-------------GT-------ACTTT-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75269 : CTAAAATAA-CGT----A-TGGTAGACATTGTTG--------TTGA-AATA--------ACGATTTCCCATGAATTTTAC-GTAGA---CACA-TTTGTAAT-TT-T-TC-CAT------AG--CTACCAA-TCAA-AAT--------GT----CACT-----GTTGCGGCTC--TAC-------C---TA-TGT--------A-----TGCATGTTATAAATGATACCATAA----CAATATTACTG---A---CGTAA----AAA-----TAC-----CGT--AAA-------ATG-C------TGAAT-A-----------TC--AATAA----GA--AT---ATC-------AAT
gi|75270 : CTGGAACGG-CCTT-----TG-CATACATTGATGACGTGTCCTCAATAAT--------T---ATTTACCGCAAGTTTTAC-----A---AGTG-ATTG
gi|75271 : TGGAATGA-CA----CA-TG-CAGACGTTGATGACGTGTT-TCAATAATA-------TATGCTTCACCGCCAGTGTTGC-AGGAA---AGGG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTCCAACATT-TGGAGCTGCGGGAC--TAA-------T---CC-TGT--------A-----TCCATGTTGCTATGGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--ATA-------ACG-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATACA---G---------CT---ATT--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TAGACAACCCCTTGTA
gi|75272 : TGGAATGA-CA----CA-TG-CAGCTATTGATGACGTGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCACCGCGAATGTTAC-AGGAT---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TAT-------C---CT-TGT--------A-----TATATGTTTCTATCGGTACCATAA----CATTATTACTA---A---CATAA---GAAA-----TAC-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-GAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------AG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AA-ATAAA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCT-GTGAACATC-TGGATAACCCGTAGTAT
gi|75273 : TGGAATGA-CA----CA-TA-CAGACATTGATGACATGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCTGCGTGAATGTAAC-AGGAA---AATG-ATTGTT-T-TT-T-TCTCAT------AT--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACATT-TTGAACTTCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGAATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAAAAATA---G---------CA---ATG--TAC-TTCCAT--A-A-AT-ATGAA--TTTTAT-T----AA-TTTTGTCC-ATGAACTTC-TTGATAACCCCTTATAT
gi|75274 : TGGACTGA-CAT----A-TG-CAGACGTTGATGACGTGTCTTCAATAATA-------TATGATTCACCGCGGGTTTTAC-AGGGA---AATG------TAT-AT-T--CATAT------AT--TTATCTG-TCGA-ATT--------GTGCTACATT-TTGAACTGCGGCAC--TAA-------T---CA-TGTTTGTATGTA-----TGTATGTTACTATCGATACCATAA----CAGTATTACTG---A---TATAA---CAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACA-------AATAC-----T-TATGTTGTG-AAAAATATA---G---------CT---ATG--TAC-TTAAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75275 : GGAATGA-AA----CA-TG-CAGACATTGATGATGTGTCCTCAATAATA-------TATACTTCACCGCAAGTGTTAC-AGGTA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AA--TTATCTG-TGAA-ATT--------GTTCAACCTT-TTGAGCTGTGGCAC--TAT-------T---CT-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATTCCATAA----CATTATTACTG---T---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------TGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCGT--A-A-AT-ATGGA--TTGTAT-T----AA-ATTTGTCT-GCGAATTTC-TGGATAACCCCTCATAT
gi|75276 : GAATGA-CATTGTCA-TG-CAGACATTGATGCCGTGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACTGCGAGTGTTAT-GGGAA---AATG-ATTGTTAT-TA-T-TCACAT------AT--TTGTCTG-TCGC-ATT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCTGCAT--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--CAT-TTGC--------AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75277 : GAATGA-CA----CA-TA-CAGACGTTGATGACCAGTCCTCAATAATA-------TATGCTTCATCGCGAGTGTTAC-AGGAA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATATG-TCAC-TTT--------GTTCTACATT-TTGAGCTGCGGCAC--TTA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTTCTATGGATACCACAA----CATTATTACTG---A---CTTAT---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------AGGAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-AAACC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-AATTGTCC-ATGAACTTC-TTGATGACCCCTCGTAT
gi|75278 : A-TG-TAGACAT----GATGTGATATTAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTCTTAC-AGGGA---AATC-ATTGTTAT-TT-T-TCACAT------AT--TTATCTG-TCAG-ATT--------GTTCAACAAT-TTGAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CA-TGT--------A-----TGCATGTTGCTATGGA
gi|75279 : AGACATTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGGGAATT-----GAAGA---AATATATTTTTAA-TAAT-TAACAT------AT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTCA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTATT---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---ATTTTTTAT-T----AC-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75280 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGT-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAAT-TAACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAACTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACGTTACTATGGTTACTATAA----CTTTAT-AATG---GTTGCAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-TAAGTTATG-TAATTTACA---C---------TT---ATG--AAC-GTGTGC--ACA-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75281 : AGACGTTAATGACGTTGCGTCAAACATG-------TATGTTTTCCCGCG-GAATTGA-AGAAA---TAT--ATTTTTAA-TAAT-TAACAT------GT--ATAAAT--TTGA-GTTT-------ATTAAAAAAA-TTGAGCTGCGGCAC--T---------T---CA-TGTGC------A-----TGTACATTACTATGGTTACTATAA----CTTTA-TAATGGTTG---CAT-----GAAA-----AAC-----AAT--AAA-------TTA-C------T-TACTA-----------TA--GATTT---GTA--AT-ACATA-------AATGT-----T-CAAGTTATG-TAATTTATA---C---------TT---ATGAATGT-GTGCAC----A-AT-A---A--TTTTTTAT----AACATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75282 : TGCCATGTCCTCAATAATA-------TATGATTTACCACGAGTTTTAC-AGAGA---AATG-ATTGTTAT-TT-T-TTACAT------AT--TAATCTG-TCGA-ACT--------GTTCAACATT-TTGAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---TATAA---GAAA-----TAT-----ATT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GTTGA---AAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTGAG-AAAAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----GA-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATTACCCCTGGTAT
gi|75283 : -ATTATTAT-TT-G-TCAAATTCAGAGAT--GTCTCTGGTCAA-ATT--------GTATAGTATT-TTAAGCTGCGGCAC--TAA-------C---CC-TAT--------A-----TGCATGTTGCTATGGCTACCATAAAATTTATTATTACTG---A---TAAAC---GGAA-----TAC-----ACT--AAA-------ATA-A------TGTAC-A-----------TT--GATGA---CAA--AT-ACAGC-------AATAC-----T-TATGATGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--CAC-TAGCAT--A-A-AT-ATGGA--TGTTAT-C----AA-TTTTGTCC-ACGAACATC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75284 : gatttttgacagggaaacgattgttatatatccc--TTACCTG-TCAA-ATT--------ATTCAACATT-TTAAGCTTTAGCAC--TTA-------A---CT-TGA--------A-----TGCATGTTGCTAAAGATAAAATAA----CATAATAACTG---A---AGTAA---GAAA-----TGT-----AGT--GAT-------ATT-C------TGCAT-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AAAAC-----T-GAAGTTGTG--CCAATATA---G---------TG---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--
gi|75285 : TG-TCGG-ATTAATTTGAAGTTTTGCATTATTCA--TGCCGCAC--TAA-------C---AA-TGA--------A-----TGCATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATCACTG---A---CGTAA---GATA-----TGA-----ACT--AAA-------GTA-A------TGTTA-A-----------TC--AATGG---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-CAAGTTTTG-CAAAATATA---G---------CG---ATA--TAC-TTGAAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATTTGTCC-ATGAATTTC-TGGATAACTTCTTGTAT
gi|75286 : A-ATT--------ATTCAATATT-TTGAGCTGCAGTTT--TAC-------C---CA-TGT--------A-----TGTCTGTTGCTATGGATACTATAA----AATTTTTAGTG---A---T-TAA---CATA-----CATGTTGCAAT--AAA-------ATA-C------TGGAT-A-----------TT--GATGA---GAA--AT-TCATC-------AGTACATGTGC-TAAGATGAG-CAGAACA----------------A---ATG--GAA-TTGCAT--G-A-AT-GTGGA--TTTAAT-T----AG-ATTTATCC-AAAATATTT-TGGAAAA
gi|75287 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGGTGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75288 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75289 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCAC----A-------T---CACTGT--------ACATGATGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTT-AAA-------AT--T------TGTAT-A-----------------------CAA--CTTACACTGAGATTGAATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75290 : TTCAAAATT---GACCTGCGGCACATTAC-------TGTACA-TG---------A-----TGTATATCGA-ATGTATG---TAA-----ATTATT--TG---T---TATATTGTGTAT-----TTT-----ATTTAAAATTTGTATACA-A------CTTAC-A-----------CT--GA-GA---TTA--A--------------AATAC-----TATAAACTG----AAAATAT--------------------TA--CAC-ATATAT--A-AGAT-GTAGT--TTTTAT-TTTATAGCATGTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75291 : CATT-TTAAGCTGCAGCAC--TAA-------T---CA-TAT--------A-----TGTATGTTGCTATGGATACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CATAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACATC-------AATAC-----T-TAAGTTGTG-AAAAATATA---G---------TT---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ATAGA--TTATAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75292 : --TAA-------G---CG-TCT--------G-----NNNNNNNNNNTATATATACCATAA----CATTATTACTG---G---CATAA---GAAA-----TAT-----ACT--AAA-------ACA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTTTAT-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-GT-ATGGA--TTTTAT-C----AA-ATTCGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75293 : A-TGT--------A-----TGTATGTTGCTATAGATATCATAA----CATTATAACTG---A---CATAA---GAAAATTTATAT-----ACT--AAA-------ATA-C------CGTAC-A-----------TC--GATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TAAGTCGTG-AAAATTATA---G---------CG---ATG--TAC-TTGCAT--A-A-AT-ACGGA--TTTAAT-T----AA-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACTCTTCGTAT
gi|75294 : GACACCATAA----CATTATTACTG---A---CATAA-----AA-----TAT-----ACT--TGT-------AAA-C------TGTAT-A-----------TC--GGTGA---CAA--TT-ACACC-------ACTGC-----T----GTCGTG-CAAAATATA---G---------CG---ATG--GAC-TTGCAT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAA-T----AA-ATTTGTTC-ATGAATTTC-TGAATAACCCCTCGT
gi|75295 : ACTG---G---CATAA---GAAA-----TGC-----AGT--AAA-------ATA-CAGTAGATGTAT-A-----------TC--GATGAATGCAAT-GT-ACATC-------AATAC-----T-GAAGTGTTG-CAAAAAATG---G---------CA---AAG--TAT-CTGCAT--A-A-AT-ATGAA--T
gi|75296 : A-C------CTTAC-A-----------TTTTGATGA---CAA--AT-ACACC-------AATAC-----T-TGAGTTGTG-AAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-------------AT-ATGGA--TTTTAT-A----AA-GATTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75297 : A---CGA--AT-ACACC-------AAATC-----T-TAAGCTGTG-CAAAATATA---G---------CA---ATG--TAC-TTGCAT--G-A-AT-ATGGA--TTTTAT-T----AA-ATGTGTCC-ATGAACCTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75298 : AAATATA---G---------CG---ATG--TAC-TCTCTT--A-A-TT-ATGAA--TTTTAT-T----AA--TTTGTCC-ACGAACTTC-TCGATAACCCCTCGTA
gi|75299 : ---ATG--TAC-TTCCTT--A-A-AT-ATGGA--TTTTAT-TT---AA-ATTTGTCC-ACGAAATTCATGG-TAACCCTTTGTAT
gi|75300 : atgcagac--TAC-TTGC-TCGA-A-AC-A---A--TATTAT------GA-GTTTGTCC-ATGAACTTC-TGGATAACTCCTCGTAT
gi|75301 : AT--G-A-AT-ATAGA--TTTTAT-T----AA-ATTAGTCG-ACAAACTTC-TGAACAACCCCTAGTA
gi|75302 : A--TATTAT-G----AG-ATTTATCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCATCGTAT
gi|75303 : A--TGTTAT-G----AG-GTTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTTGTA
gi|75304 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-AAGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75305 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75306 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACGATCTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75307 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTTC-ACGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75308 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC--CGAACTTC-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75309 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TTGATAACCCCTCGTA
gi|75310 : A--TTATAT-G----AT-ATTTGTCC-ACAAACTTC-TGGATAACCCCTCGTA
gi|75311 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTAC-ACAAACTTC-TGGACAACCCCTCGTAT
gi|75312 : A--TATTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTT-TGGATAACCCCTCGTAT
gi|75313 : A--TTTTAT-A----AG-ATTTGTCC-ACAAGCTTC-AGGATAACCCATCGTAT
gi|75314 : A--TTTTAT-T----TG-GTTTGTCC-ACAAACTTC-TAGATAACTCCTCGTA
gi|75315 : TTAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TAGATAACCCCTCATAT
gi|75316 : TAT-G----AG-ATTTGTCC-ACGAACTTC-TGGATAACCCTTCGTA