lowQualScore                  :                  111    111                                    111111111111           11                                                                111                                        11                          1                                                               111111111           1111111111111                                                                                  1111111111111111                        
lowQualScore                  :      222      1  888    777    1         1 1      2   44444 1  222222222222   3   1   66 1   555555555   1 1      11 1 1  222 1  555    1 99 11  1 11 0 555    0    11  1               1  1   1   88    1   33       22  3    4  1    7 33 1    1        1 0  1            111   555555555 11 666666666 2222 2    1111111111111  111 222     3 5555        1 1   1        1 11 5555555  99999999 1  33   666     7777777777777777       33      22       
lowQualScore                  :      ...      .  ...    ...    .         . .      .   ..... .  ............   .   .   .. .   .........   . .      .. . .  ... .  ...    . .. ..  . .. . ...    .    ..  .               .  .   .   ..    .   ..       ..  .    .  .    . .. .    .        . .  .            ...   ......... .. ......... .... .    .............  ... ...     . ....        . .   .        . .. .......  ........ .  ..   ...     ................       ..      ..       
lowQualScore                  :      333      3  333    000    2         2 2      4   00000 1  555555555555   5   2   99 4   777777777   4 3      88 3 3  333 3  888    2 11 77  2 77 2 444    6    99  4               4  6   8   99    5   55       99  9    4  5    8 77 7    5        0 4  1            888   555555555 44 888888888 2222 1    2222222222222  888 000     9 6666        1 1   1        1 55 3333333  33333333 2  33   666     8888888888888888       77      44       
consensus                     : AAATA---CACACA-AAACCCCTGA--TAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT-----A-A-A-CAAA-ATA-TGGCGG-AGT---------ACC-T-CAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TN-T--CT-A--GGCC--TGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATA-CACA-CAC--CACCTACT-CANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTC---GCA---------G--T---------A----C-TGGG----N----N---TG---A--AACTCGATT-G-AGATTCGC-T-TTTTAATACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-GTCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
Reference ( gi|140051 )       : AAATA---CACACA-AAGTACCTGT--TAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT-----A-A-A-CAAA-ATA-TGGAAG-AGT---------ACC-T-CAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TG-T--CT-A--GACA--TGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATT-CACA-CAC--CACCTACC-CAAATTTTCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTC---GTA---------G--T---------A----C-TGGG----A----G---TG---A--AACTCGATT-A-AGATTCAC-T-TTTTAATACATC-T--T-------AT------AAT-TTA-GTCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGTGTG--TGTGTTT
gi|140052                     : AACTA---CACACA-AAGTCCCTGA--TAAT-GCACCATTG-C-TCATTT-ACA----TT-TT-----T-A-A-CAAA-ATA-TGGCAG-AGT---------ACC-T-CAGAGA--C-C-CC---A-TC---AAAA-TG-T--CC-A--TACC--TGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATA-CACA-CAC--CACATACC-CAAATGTGTA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTC---GTA---------G--A---------A----C-TGGG----A----G---TG---A--AACTCGATT-A-TGATTCAC-T-CTTTAATACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-GTCT--TTAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGCGTG--TGTGT
gi|140053                     : AAATA---CACACA-AAGCCCCTGA--TAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-AAAA---TT-TT-----A-A-A--ATA-A-A-TGGCAG-AGT---------ACC-T-CAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TG-T--CT-ACTGAGAACTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGA-CCACTGCCATA-CACA-CAC--CACCTATC-CAAATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-TTCC-GCGTCTAGGTTC---GTA---------G--T---------A----T-TGGA----A----G---TG---A--AACTCGATT-A-ATATTCAC-T-TTTTAATACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-GTCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTTTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140054                     : AAATA---CACACA-AAGGCACTGA--TAAT-GCACCATTG-T-TCATTT-GCA----TT-TT-----A-A-A-CAAA-ATA-TGGCAG-AAT---------ACC-T-CAAAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TG-T--CT-G--AACC--TGCA------------------AGCTAGG-CCACTGCTAT---ACA-CTT--CACCTACC-CAAATTTTCA-GGAATGGTG-GGGG-TCAATCTC-CTCT-ACGTCTTGACTC---GTA---------G--T---------T----C-TGGG----A----G---TG---A--TACTCGATT-A-AGATTCAC-T-TTTTAATACATC-T--G-------AT------AAT-TTA-GTCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140055                     : AAACA---CACACA-CAGCCCCTCT--TAAAAGAGTTATTG-G-TCATTT-ACA----TT-T------A-A-A--AAA-A-A-TGACAG-AGT---------ACC-T-CAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAAA-T--T--CT-A--GACT--AGCAGTTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGCCATA-CACG-CAT--CATCTACC-CAACTTTACC-TGAGAGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTC---GTA---------G--A---------A----C-TGGG----A----G---TG---A--AACTCTATT-A-AGATTCACTT-TTTTATTACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-ATCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTCTTGCGTG--TGTG
gi|140057                     : AAATA---CACACA-TAATCACTGG--TAAT-ACACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TTTTT--A-A-A----A-TTA-TGGCGG-ACT---------ACC-C-GAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-CG-T--CT-A--GACC--TGCAGGTTT--ACATTTGACCAAGCTAGG-CCAA----A---CACA-CAC--CACCTACT-CACATTTGCA-GGAG-GGTG-GGA--ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGCTC---ATA---------G--T---------A----C-TGGG----G----A---TGCAAA--AACTCGATT-G-AGATTCAC-A-TTTTAATCAATT-T--T-------AT------GGT-CCA-GTGT-----GT-G-T-----GTG----TGTGTGTG-TGTGTG--CGTGT
gi|140058                     : AAATA---TACACA-AAGCCCCTGA--TAAT-GCACCATTG-G-ACATTT-ACA----TT-TC-----A-A-A-ACAA-ATA-TGG-----------------C-------AGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TT-T--CT-A--GACC--TGCAGGTTT--TT-TTTGACCAAGCTAGG-CCATTGTCATA-CAAA-CAC--CACCTACC-AAAATTTGCA-TGAGTGATG-GGGG-AGACTCTC-CTAT-TCGTGTTGGCTC---GTA---------T--T---------A----C-TAGG----A----T---TG---A--AAC-----------------------------ATC-T--T-------AT------AAT-TAA-GTCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGTATG--TGTGTTTgcgt
gi|140059                     : AAATA---CACATGTAACCAC-TGA--CAAT-GCA----------------ACA----TT-TA-----A-A-G-CAAT-ATA-TGGCGG-AGT---------ACC-C-CATAGC--C-A-CA---T-TC---ATAA-TG-T--CT-A--GGCC--GGCAGGTTT--AT-TTTGGCCAGACAAGG-TCACTGCCATA-CACA-CAC--CACCTACT-CACATTTGCA-GGAAGGGTG-GTGG-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGTTC---GTA---------G--T---------A----C--AGG----A----T---TG---G--AACTCGATC-G-AGATTCAA-T-ATTTTATACATC-T--T-------AT------GGT-TTA-GACT--TAGGT-T-T-----CTG----TGTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140061                     : AAATA---CACACA-AATCCCCTGA--TAAT-GCATCATTG-G-TAATTTTAAA----TT--------A-A-A-AAAA-A-A-TAGCGG-TGT---------ACC-C-CATAGC--T-C-CA---A-TC---AACA-T--T--AT-T--GGCT--TGCATGTTT--TC-TTTTACCAAGCTAGG-CCCGTGTCATT-CACA-CAC--CACCTAAT-CACATTTGCA-GTAG----G-GGTA-ATACTCTC-CACT-AGGTTTTAGCTC---GTT---------G--T---------A----C-TGGG----A----G---TG---A--AACTCGATT-G-AGGTTAAG-T-TTTTAATACATCGTAAT-------ATGATA--AAT-TTA-GTC---TAAGC-T-T-----TG-----TGTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140056                     : AAATA---CACTCA-AAGCCCCTGA--TAAT-GGACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT-----T-A-A-AAAA-ATA-T
gi|140066                     : AAATA---CACACA-AAAC-CCTGA--TAAT-GAACCATAT-G-TCAT---ACA----GT-TT-----A-A-AACAAT-ATA-TGGTGA-AGT---------ACC-C-CAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TT-T--CT-A--GGCC--TGCAGGTTT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGCCA---CACA-CA----ATCTGCT-CATATTTGCA-GGA-TTAT-------ACACCCTC-CCCttccagacctgtaagtttactttgacctagttaggacactgttatacacaccaccaccttcccactttacagacgtgtagagagacactctcctctacgtcttggctcgtagtactggaagtgaaactcgattcaaattcaccttttaatacatcttatagtttagacttaagtttcttgtgtgtctgcgtgtgtgttt
gi|140065                     : AAATA---CACACA-AAA-ACCCATAATAAT-GCACCATTG-G-TCA--T-ACA----GT-TTA----A-A-A-CAAT-ATA-TTGCGG-AGT---------ACC-C-CAGTGC--C-CTCC---A-TC---AGAA-TG-T--CT-T--GACC--TGCAGGTCT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGTCATA-CACA-CAT--CACCTACT-CTCATTTACA-
gi|140068                     : AAATA---CACACA-AAGTACCTGA--TAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----------------------AA-ATA-TGGAAG-AGT---------ACC-T-CAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAAA-TT-T--CT-A--GACC--TGTAatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgaccccctaagtcttgacttgcagtgcatggtgtactgggattgatactcgttgcagaataacttttaatctaagtagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gi|140067                     : AAATA---CACACA-AAACCCCTGA--TAAT-GCACGATTC-G-TAAT---ACA----GT-TT-----A-A-AACAAT-ATA-TGGCGG-AGT---------ACC-C-CAGAAC--C-C-CC---A-TCG--AAAA-TT-T--TT-A--GGCC--TG------------------CAAGCTAGA-CCCCTGCCATA-CACA-CAC--CACCTACT-CACATTTGCA-GGA
gi|140064                     : AAATA---CACACA-AAACCCCTGA--TAAT-GCACCATTG-A-TCATTC-ACA----TT-TTA----A-A-A-CAAATATA-TAGTAA-AGT---------ACC-T-CAGAGC--T-C-CC---A-TC---AAAA-TT-T--CT-A--G
gi|140063                     : AAATA---CACACA-AAACCCCTGA--TTAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TTTA---A-A-A-CAAATATA-TAGTGG-ATT---------ACC-T-CAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TT-T--CC-A--GGCC--TG
gi|140070                     : AAATA---CACACA-AAACCCCTGA--TAAT-GGACCATTG-G-TTATTT-CCA----TT-TTA----A-A-A-CAAATATA-TAGTGG-AGT---------ATC-T-CAGAGC--C-A-CC---A-TC---AAAA-TGAT--CC-A--GAC
gi|140069                     : AAGTA---CACACA-AAACACCTGA--TAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACACACTTT-TT-----A-A----AAA-ATC-TGG----------------CCC-T-AAGA-T--C-G-CC---G-TA---AACA-CT-T--CT-A--GGCC--TGCACTTTT--AA-ATTTACCAAGCTACA-CCATTGct
gi|140072                     : AAATA---TACACA-AAACCCTTGA--AAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-GCA----TT-TT-----A-A-A-C-AA-ATC-TGGGAG-AGG---------ACCAT-CAGA----C-C-CC---A-CC---
gi|140075                     : AAATA---CACACA-AAAACCCTGA--GAAT-GCACCATTA-G-CCATTT-ACA----TT-TTTA---A-A-A-CAAA-ATA-TGGGGGAAGA---------ACC-T-
gi|140073                     : AAATA---GACACA-AAACCCTTGA--GATT-GCACTATTG-G-GCAATT-ACA----TT-TT-----C-A-A-ATAA-ATC-TGGTGG-AGG---------ACC-T-CCGGAC--A-C-CC---A-TA---ACAA-TG-T--CT-A--GGCA--TGTACTTTT--A
gi|140071                     : AAGTA---CACACA-TAATCCCTGA--GAAT-GCACCATTG-G-CCATTT-TCA-----T-TT-----A-A----AAA-ATG-T----------------------C-CAAAGC--CAC-CC---ACTCT--AAAACTT-T--CT-A--GGCC--TGCACTTTTAAAC-TTT--TCAAGCTACG-CCCCTG
gi|140074                     : AGATA---CACACA-AACCCACTGA--GAAT-GCACCAGTG-G-CCAGTT-ACA----TT-TTTGGATA-A-A-CCTG-GTGGTGGGGG-GGGGGGGGGGGGACC-TTCATA-CAAT-C-CC---G-TA---AAAA-TG-T--CG-A--GGGC--TGCATTTTT--AA-ATTGACCAAGCTATG-CCACTG-TATTATGTA-CAC--C-CTTGTT-CAAATt
gi|140076                     : AAATA---AACACA-AAATCCCTGA--TAAA-GCACCATCG-G-TCATTA-ACA----TT-TT-----A-A-A-AAAA-CTA-gtaca
gi|140062                     : AAATA---CACACA-AAATTCCTGA--TGAT-GCACCATTG-GTTCCTTT-ACA-------TT-----A------AAA-ATA-TGcagc
gi|140077                     : AAATA---CATACA-AAATCTCTGA--GAAT-GCACAATTG-T-CTATTT-ACA----TT-TT-----A---------------------AGT---------ACC-C-C----C--T-C-CCCAAA-TCCGTAAAA-TA-T--AT-A--AGCC--TGCACTTTT--AA-ATTTACCAAACTA
gi|140078                     : AAATA---CATGTA-AAACTCCTGA--AAAT-GCACCATTG-A-CCATTT-ATA-----T-TT-----A-A-A-AAAA-
gi|140079                     : AAATATTGCACACA-AAACTCCTGA--TATT-GCAC-ATTT-G-CCATTT-ACA-----T-TT-----A------AAA-ATA-T
gi|140080                     :  AACA---CACATA-AAACCCCTGA--GAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACA----TTATT-----A-A-A-CAAcattgcag
gi|140081                     :   ATA---CACACA-AAGCACATGA--TAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT-----AGA-A-AAAA-ATA-TGGCAG-AGC---------ACC-T-CAGAGC--C-T-CT---A-CC---AAAA-TG-T--GT-A--GACC--AGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGTCATA-CACA-TAC--CACTAACC-CAAATTTGCT-GTAGTGTAG-AGGG-ACA--CTC-CTCT-ACGTCTTGGCTC---GTA---------G--T---------A----C-TAGA----A----G---TG---A--AACTCGATT-A-AGATTCAC---TTTTAATACATG-T--T-------AT------AGT-TTA-GTCT--TAAGT-G-T-----CTGAG--TGTGTGT
gi|140082                     :   ATA---CACACA-AAATCCCTGA--TATT-GCACT-TTGAG-CCAACT-ACA----TT-TT-----T-A-A-AAAA-ATC-TGG
gi|140060                     :             CA-AACT-CCTGA--TAAT-GCACCATTG-A-TCATTT-ACT----TT-TT-----T-A-A--AAA-ACT-TGGTGG-AGT---------ACC-C-CAGAGC--C-C-CT---A-TC---AACA-TT-T--CT-A--GGCC--TGCAGGTTT--AC-TTTGACCGAGCTAGG-CCTCTGTCATA-CACA-CACATTACCTACT-CACATTTGCA-GTAGAGGTGTGGGG-ACAATCTC-CACT-ACGTCTGGACTC---GTA---------G--T---------A----C-TGGG----A----G---TG---A--AACTCG
gi|140083                     :     aaattacacttgcGCACCTGA--TAAT-GCACCATTG-G-TTATTT-ACA----TT-TT-----A-ATA-AAAA-AAA-TGGCAG-AGC---------ACC-T-CAGAGC--C-C-CC---A-CC---AAAA-TT-T--CT-A--GACC--TGCAGGTTT--AT-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATA-CACA-TAC--CACCTACC-CAAATTTGCA-GGAGTGTAA-AGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTC---GTA---------G--T---------A----C-TGGA----A----G---TG---A--AACTCGATT-A-AGATTCAC-T-TTTTAATACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-GCCT--CAA---------------------GTGAC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140084                     :                          --TAAT-GCACCATTG-G-TCATTTTACA----TT-TG-----A-A-A-ATAT-ATA-TGGATG-AGT---------ACC-A-AATAAC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TG-T--CT-A--CGCC--TGCATATTT--AC-TTTGGCCAAGCTAGG-CCCCTGTCATA-TACA-CAT--TACCTACT-CACATTTGCA-ATAG----G-GGGA-ATAATCTC-CAAT-ACGTCTAGACTC---GTT---------T--T---------A----C-TGGG----A----A---TG---A--AACTCAATT-G-AGATTCAC-T-TTTTGATGCATA-T--TA------ATATGGTAAAT-TTA-GTC---TAGGT-T-T-----GTTGTG-TGTGTGTC-TGTGTC--TGTGT
gi|140085                     :                                                      a----TT-TT-----A-A-A-GAAA-----TGGCAG-AAT---------ACC-T-CAGAGC--T-C-TT---A-TC---AAA--TT-T--CT-A--GACC--TGCAG-TTT--AC-CTTGACCAAGTTAGG-CCACTGTCATA-CACA-CAC--TACCTACC-CAAATTCGCA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTC--------------TGGCTC---GTA---------G--T---------A----C-TGGA----C----G---TA---A--AACTCGATT-A-AAATT-AT-TATTTTAATACATC-T--TTTGTTACAT------AGT-TTA-ATCT--TAAGT-T-T-----CT-----TGCGTGTC-TGTGTGTTTGTGTTT
gi|140086                     :                                                           tT-TT-----A-A-A-TATA--TA-TGGCGG-AGT---------ACC-T-CAGAGC--C-C-AC---A-TTT--AAAA-TT-T--CT-A--GGCC--TGCAAGTTT--AT-ACTGACCAAAATAGG-CCGCTGCCAT---ACA-CAC--CTTCTTCT-CACATTTGCA-G---TTATG-GGGTTACACTCTC-CACT-ACGTCTTGGCTC---GTA---------G--A---------A----C-TGGT----A----G---TG---A--AACTCGATT-G-AGGTTCAC-T-TTTTAATACATC-T--T-------GT------GGT-TT----------AAT-T-T-----TT-----TGTGAGTC-TGTGT
gi|140087                     :                                                                                                            -CAG-GC--C-C-TC---A-TC---AAA--TT-T--CT-C--GGCC--TGCAGGTTT--AC-TTTGATAAAGCTAGA-CCTCTGCCATA-CACA-CAC--CACCTACT-CACATTTGCA-GGA
gi|140088                     :                                                                                                            -CAGA-C--C-C-CC---A-TC---AAAA-TT-T--CT-A--GGCC--TGCAGGTTT--AC-TTTGATTTAGCTAGA--CATTGCCGCA-CAAA-CAC--TGTCTACT-CACATTTACA-GGA
gi|140089                     :                                                                                                            -CAG-GC--C-C-CC---A-TC---AAAA-TT-T--TTTA--GGCC--TGCATGTTT--AC-TTTGATCAAGCTAGA-------------CACA-CAC--CACCTACT-CACATTTGCA-GGA
gi|140056                     :                                                                                                                                  ---AAAA-TA-TTTCC-A--GACC--TGTAAGTTT--AC-TTTGACCTAGTTAGG-ACACTGTTATA-CACACCAC--CACCTTCC-C-ACTTTACA-GACGTGTAG-AGAG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTC---GTA---------G--T---------A----C-TGGA----A----G---TG---A--AACTCGATT-C-AAATTCAC-C-TTTTAATACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-GACT--TAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140090                     :                                                                              aaatacactcaaagcccctgataatggaccattggtcatttacatttttaaa---AAAA-T--T--CT-A--GGCC--TACAGGTTT--TC-TTCCACCAAGCTAGG-TCCCTGTCAAA-TACA-CAC--CACCTACT-CAAATTTGCA-GGAG-GGTG-GAGA-AATTTACC-CGTT-GCGTCATGGCTC---GTT---------G--A---------A----C-TGGG----A----A---TG---A--AACTCTATT-G-AGTTTCAC-C-TTTTATTACATC-T--T--------T------GGT-TTA-GTCT--T-AGT-A-T-----AT-----AGTG-----TGTGTG--TATGTTT
gi|140091                     :                                                                                                                               tta---AAAA-TA-T--TT-A--GGCC--TGTAGATTT--AC-TTCGACCAAGCTAGGTCCA-TGTCATA-CACA-CAC--CACCTACT-CAAATTTGCA-AGAGGGGTG-GGGG-AAACTCTC-CTC
gi|140092                     :                                                                                                                                            -T--CT-A--GCCC--TGCAGGTTT--AC-TTCGACCAAACTAGG-TCCCTATTAT---ACA-CAC--CACCTAC------TTTGCA-GGAGGGGTG-GGGG-ACACTCTC-CGTT-ACGTATTGGCTC---GTT---------G--A---------A----C-TTGG----A----A---TG---A--AACTCGATT-G-AGGTTCAC-C-TTTTAATACATT-T--A-------AT------GGT-TTA-GTCT--TAAATATAT-----AT-----TGTGTGTG-TATGTgattgagattcaccttttaatacatcttatggtttagtcttatgtatattgtgtgtttgtatgtttcttt
gi|140093                     :                                                                                                                                                                                CAAGCTAGG-CCGCTGCCATA-CACG-CAC--CACCTAAT-CACATTTGCAGGGGGTGGGG-GGGG-GCACCCTT-CACA-ACGTCTTGGCTC---GCA---------G--T---------A----C-TGGtt
gi|140094                     :                                                                                                                                                                                                     -CACA-CACA-CACCTACT-CACACTTGTT-GAAG--G-G-GGAA-ACACTCTC-TCCT-ATGTCTTGGCTT---GTG---------C--T---------A----A-AGGA----A----G---TG---A--AACTTGGTT-G-AGGTTCAT-T-CTTAAATACATC-T--T-------AT------AGT-TTA-GTCCAAGAAGT-T-T-----GTGGAAGTGTGTTTC-T
gi|140095                     :                                                                                                                                                                                                                cacaTACCTCAAATTTGCA-CGAGTGTTG-GGGG-ACACTCTC-GTCT-ACGTCTTGGCTC---GTA---------G--T---------A----C-TGGA----A----G---TG---A--AACTCGATT-A-AGATTCAC-T-TTTTAACACATT-T--T-------AT------AGT-TTA-GTCT--TACGT-T-T-----CT-----TGTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140096                     :                                                                                                                                                                                                                                            G-GGTA-ACACTCTC-CACT-ACCTCTTGACTA---GTA---------G--T---------A----C-TGAG----A----G---TG---A--AACTTTATT-A-ATGTTCAC-T-TTCTA----ATC-C--T-------AT--------T-CT--GTC---TAAGA-T-A-----CT-----TG
gi|140098                     :                                                                                                                                                                                                                                                 a-ACACTCTC-CCCTCACATCTAGACTC---GCA---------G--T---------A----CGTAGGTAACA----GGTATG---A--AACCCGGTG-G-AGGTTCAC-T-TTTTAATACAAT-T--T-------AT------AGTGTTT-GTT-------T-T-T-----TT-----TGTTTGT
gi|140099                     :                                                                                                                                                                                                                                                  -ACACCCTTTCTC--ACATTTTGGCCC---GCA---------G--T---------G----TATGAG----GTTATG---TT---ATGAACCCAATGGA-AGAT-CAT-T-TTTTAGTACATC-T--T-------AT------AGT-TTT-TTCT--TGAGT-
gi|140097                     :                                                                                                                                                                                                                                                  -ACACTCTC-CCCT-ACGTTTCCACTC---ACATTGCATGGTG--T---------A----C-TGGA----T----T---TG---A--AACTCT-TT-G-ATATTTAC-T-TTTAAACACATC-T--G-------AG------TGT-TTT-GTCT--T
gi|140106                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGTCTTGACTC---GCAGT-------G--T---------A----C-TGGG----T----T---TG---A--TACTCGTTG-G-AGATTCGC---TTTTATTACATC-T--C-------AG------TGT-GTGTGTGTG-TGTGT-G-T-----GTG----TGTGTGTG-TGTGTG--TGTGTTT
gi|140102                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGTCTTGACTC---GCA---------G--TGA-------A----C-TGGG----T----T---TG---C--TACTCGTTG-G-AGATTCGC-T-TTTGAATACATC-T--
gi|140110                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGCCTTGACTC---GCA---------G--TGT-------A----C-TGGG----T----T---TG---A--TACTCGTTG-G-AGATTCGC-T-TTCAAATACATC-aagtgtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtg
gi|140108                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGTCTTGACTC---GCG---------G--TGA-------A----C-TGGG----T----T---TG---A--AACTC-ATTGG-AGATTCGC-T-TTTAAATA
gi|140100                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-GCGTTTTGACTC---GCA---------G--TGT-------A----C-TAGG----T----T---TG---A--TACTCGTTG-G-AGATTCGC-T-TTTAAATACATC----------------------------------TAAGT-G-T------G-----TGTGTGTA-TGTGCG--TGCGT
gi|140105                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGCCTTGACTC---GCA---------G--TGA-------A----C-TGGG----T----T---TG---A--TA-TCGTTG-G-AGATTCAT-T-TTTAAATACATC-T--g
gi|140101                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGTCTTGACTC---GCA---------GCGT---------A----C-TAGG----T----T---TG---A--TACTCGTTG-G-AGATTCGC-T-TATAAATACATT-T--
gi|140103                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACGTCTTGACCC---GCA---------G--TGT-------A----C-TGGG----T----T---TG---C--TACTCGTTG-A-AGATTCGC-T-TTTGAATACAT--T--T-------A-------AGT-GTACGT-------GTGT-G-----CA-----TGCGTG---CGCGTG--TGTGTTT
gi|140107                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CCCT-ACGTCTTGACTC---GCA---------G--TGT-------A----C-TGGG----T----T---TG---A--TACTCG-TT-AGATATACGC-T-TTTAAATACATC----------------------------------TAAGT-G-C-----GG-----TGTGCGTG-CGTGCG--TGTGT
gi|140104                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT-ACATCTTGTCTC---GCA---------G--TGT-------A----C-TAGG----T----T---TG---A--TACACGTTG-G-AGATTCGC-T-TTTAAATACATC-------------T------AAG-TGT-GCC-----AG----------CG-----TGCGTGCG-TGTGTG--TGTGaggtgcgtgtgtg
gi|140109                     :                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CTTT--CGTCTTGACTCTCAGT----------G--T---------A----C-TAGG----T----T---TG---A--TACTCGTTG-G-AGATTCGC-T-TTTAAATACATC-------------T------AAG-TTT-GT-------GTGT-G-----C-------GTGCGTC-CGTGCG--TGCGTcgtgcgtg
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                                                                          C-CCCT-AAGTCTTGACTT---GCA---------G--TGCATGGTGTA----C-TGGG----A----T---TG---A--TACTCGTTG-C-AGAATAAC---TTTTAAT-C----------------T------AA--GTA-GTGT-----GT-G-T-----GTG----TGTGTGTG-TGTGTG--TGTGTgcgtgcgtg
gi|140111                     :                                            aaatacacacaaaaacccataataatgcaccattggtcatacagtttaaaacaatatattgcggagtaccccagtgccctccatcagaatgtcttgacctgcaggtctactttggtcaagctagacccctgtcatacacacatcacctactctcatttacaatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgacC-CTC--ACGTCTTGACTT---GTA---------G--T---------ATAAAC-TGGG----T----T---TG---A--TACACGTTG-G-AGATTCGC-T-TTTAAATACATC-T--gtgt
gi|140112                     :                                                                                                                                                                                                                                                               T-ACGTCTTGACTC---GCA---------G--TGT-------A----C-TGGG----T----T---TG---A--TACTCGTTG-G-AGATTCGC-T-TTTGAATACATC----------------------------------TAAGT-G-TGCGCGCG-----TGTGTGTG-TGTGTG--TGTGTaagtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtg
gi|140113                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                  A---------G--T---------A----C-TGGG----A----G---TG---A--AACTCTTTT-A-AGATTCAC-T-TTTTATTACATC-T--T-------AT------AGG-TTA-ATCT--CAAGT-T-T-----CT-----TGTGTGTgtgtgt
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTCGATT-G-AGATTCAC-C-TTTTAATACATC-T--T-------AT------GGT-TTA-GTCT--TATGT-A-T-----AT-----TGTGTGTT-TGTATG--TTTCTTTgtctgc





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111111111                                                                                                                       11111                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   1 222   11          1       1         1 1      2   6666  1  66 1 1 99   3  11     9999999999999 1      2       11 1 1  222 1  555   1 1 44   1 2222        0    11  1               1  1   0        1   33          1       1    7 33 1    1        1 0  1               444444444 11 999999999 2222 44444444    22  444444 0     4 0 2 1     1 1    3        55555555555555555555  2222 1  55555  8888888     444    55555 11      66      22       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   . ...   ..          .       .         . .      .   ....  .  .. . . ..   .  ..     ............. .      .       .. . .  ... .  ...   . . ..   . ....        .    ..  .               .  .   .        .   ..          .       .    . .. .    .        . .  .               ......... .. ......... .... ........    ..  ...... .     . . . .     . .    .        ....................  .... .  .....  .......     ...    ..... ..      ..      ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   2 222   77          2       2         2 2      4   7777  1  44 1 1 88   4  66     8888888888888 4      8       88 3 3  333 2  666   2 2 66   2 5555        2    88  4               4  3   1        4   44          5       4    0 88 7    5        0 1  0               000000000 44 111111111 1111 66666666    00  777777 3     2 1 1 0     5 0    3        88888888888888888888  4444 1  88888  5555555     444    00000 77      00      00       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
Reference ( family-407 )      :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140051                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGTACC-TGTTAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGA------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-A----GACATGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATTCACA-CAC--CACCTACCCAAATTTTCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AA----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGTGTG--TGTGTTT
gi|140052                     :                                                                                                                                                                                                               AACT-A---CAC--ACAAAGTCCC-TGATAAT-GCACCATTG-C-TCATTT-ACA----TT-TT--T-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------AG-AGTACC-TCAGAGA--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCC-A----TACCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATACACA-CAC--CACATACCCAAATGTGTA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTA-T-GATTCAC-TCTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TTAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGT
gi|140053                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGCCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-AAAA---TT-TT--A-A-A--ATA-A---ATGGC------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-ACTGAGAACTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGA-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTATCCAAATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-TTCC-GCGTCTAGGTTCGTA---------G--T---------A----T--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-TATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTTTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140054                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGGCAC-TGATAAT-GCACCATTG-T-TCATTT-GCA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------AG-AATACC-TCAAAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-G----AACCTGCA------------------AGCTAGG-CCACTGCTATACACT-T----CACCTACCCAAATTTTCA-GGAATGGTG-GGGG-TCAATCTC-CTCT-ACGTCTTGACTCGTA---------G--T---------T----C--------TGGGAGTG------ATACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---G-------A-T----AA----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140055                     :                                                                                                                                                                                                               AAAC-A---CAC--ACACAGCCCC-TCTTAAAAGAGTTATTG-G-TCATTT-ACA----TT-T---A-A-A--AAA-A---ATGAC------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAA-A-T--TCT-A----GACTAGCAGTTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGCCATACACG-CAT--CATCTACCCAACTTTACC-TGAGAGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCTATTA-A-GATTCACTTTTTTATTACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-AT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTCTTGCGTG--TGTG
gi|140056                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--TCAAAGCCCC-TGATAAT-GGACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--T-A-A-AAAA-AT--AT
gi|140056                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AAATA-T-TTCC-A----GACCTGTAAGTTT--AC-TTTGACCTAGTTAGG-ACACTGTTATACACACCAC--CACCTTCCCAC-TTTACA-GACGTGTAG-AGAG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTC-A-AATTCAC-CTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GA---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTTttccagacctgtaagtttactttgacctagttaggacactgttatacacaccaccaccttcccactttacagacgtgtagagagacactctcctctacgtcttggctcgtagtactggaagtgaaactcgattcaaattcaccttttaatacatcttatagtttagacttaagtttcttgtgtgtctgcgtgtgtgttt
gi|140057                     :                                                                                                                                                          aaatacactcaaagcccctgataatggaccattggtcatttacatttttaaaaAAAT-A---CAC--ACATAATCAC-TGGTAAT-ACACCATTG-G-TCATTT-ACATTT-TT-TT--A------AAA-TT--ATGGC------------GG-ACTACC-CGAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-C-GTCT-A----GACCTGCAGGTTT--ACATTTGACCAAGCTAGG-CCA-----A-ACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGAG-GGT--GGGA-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGCTCATA---------G--T---------A----C--------TGGGGATGCAA---AAACTCGATTG-A-GATTCAC-ATTTTAATCAATT-T---T-------A-T----GG----T-CC---A-GT---GTG-TGTGT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGCGTG--TGCGT
gi|140058                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---TAC--ACAAAGCCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-ACATTT-ACA----TT-TC--A-A-A-ACAA-AT--ATGGC--------------------------AGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGCAGGTTT--TT-TTTGACCAAGCTAGG-CCATTGTCATACAAA-CAC--CACCTACCAAAATTTGCA-TGAGTGATG-GGGG-AGACTCTC-CTAT-TCGTGTTGGCTCGTA---------T--T---------A----C--------TAGGATTG------AA----------------------------ACATC-T---T-------A-T----AA----T-TA---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGTATG--TGTGTTT
gi|140059                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ATGTAACCAC-TGACAAT-GCA----------------ACA----TT-TA--A-A-G-CAAT-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-CCATAGC--C-A-CA---T-TC---ATA-A-T-GTCT-A----GGCCGGCAGGTTT--AT-TTTGGCCAGACAAGG-TCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGAAGGGTG-GTGG-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGTTCGTA---------G--T---------A----C---------AGGATTG------GAACTCGATCG-A-GATTCAA-TATTTTATACATC-T---T-------A-T----GG----T-TT---A-GA---CT--TAGGT---TTCTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140060                     :                                                                                                                                                                                                               AAATTA---CACTTGCCAAACTCC-TGATAAT-GCACCATTG-A-TCATTT-ACT----TT-TT--T-A-A--AAA-AC--TTGGT------------GG-AGTACC-CCAGAGC--C-C-CT---A-TC---AAC-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCGAGCTAGG-CCTCTGTCATACACA-CACATTACCTACTCACATTTGCA-GTAGAGGTGTGGGG-ACAATCTC-CACT-ACGTCTGGACTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCG
gi|140061                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAATCCCC-TGATAAT-GCATCATTG-G-TAATTTTAAA----TT-----A-A-A-AAAA-A---ATAGC------------GG-TGTACC-CCATAGC--T-C-CA---A-TC---AAC-A-T--TAT-T----GGCTTGCATGTTT--TC-TTTTACCAAGCTAGG-CCCGTGTCATTCACA-CAC--CACCTAATCACATTTGCA-GTAG----G-GGTA-ATACTCTC-CACT-AGGTTTTAGCTCGTT---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTG-A-GGTTAAG-TTTTTAATACATCGTAA-T-------A-TGATAAA----T-TT---A-GT---C---TAAGC---TTTG-----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140062                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAATTCC-TGATGAT-GCACCATTG-GTTCCTTT-ACA-------TT--A------AAA-AT--ATG
gi|140063                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATTAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TTTAA-A-A-CAAATAT--ATAGT------------GG-ATTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCC-A----GGCCTG
gi|140064                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-A-TCATTC-ACA----TT-TTA-A-A-A-CAAATAT--ATAGT------------AA-AGTACC-TCAGAGC--T-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----G
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAAACCCATAATAAT-GCACCATTG-G-TCA--T-ACA----GT-TTA-A-A-A-CAAT-AT--ATTGC------------GG-AGTACC-CCAGTGC--C-CTCC---A-TC---AGA-A-T-GTCT-T----GACCTGCAGGTCT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGTCATACACA-CAT--CACCTACTCTCATTTACA-
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-CCCT-AAGTCTTGACTTGCA---------G--TGCATGGTGTA----C--------TGGGATTG------ATACTCG-TTGCA-GAATAAC-TTTT----A-ATC-T---A-------AGT----AG----T-GT-----GT---GT-----GT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGTatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgaccccctaagtcttgacttgcagtgcatggtgtactgggattgatactcgttgcagaataacttttaatctaagtagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gi|140066                     : aaatacacacaaaaacccataataatgcaccattggtcatacagtttaaaacaatatattgcggagtaccccagtgccctccatcagaatgtcttgacctgcaggtctactttggtcaagctagacccctgtcatacacacatcacctactctcatttacaatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgacAAAT-A---CAC--ACAAAACCC--TGATAAT-GAACCATAT-G-TCAT---ACA----GT-TT--A-A-AACAAT-AT--ATGGT------------GA-AGTACC-CCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGCCACACACA-------ATCTGCTCATATTTGCA-GGA-TTAT-------ACACCCTC-CCC
gi|140067                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACGATTC-G-TAAT---ACA----GT-TT--A-A-AACAAT-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-CCAGAAC--C-C-CC---A-TCG--AAA-A-T-TTTT-A----GGCCTG------------------CAAGCTAGA-CCCCTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140068                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGTACC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA-------------------AA-AT--ATGGA------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGTA
gi|140069                     :                                                                                                                                                                                                               AAGT-A---CAC--ACAAAACACC-TGATAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACACACTTT-TT--A-A----AAA-AT--CTGGC-------------------CC-TAAGA-T--C-G-CC---G-TA---AAC-A-C-TTCT-A----GGCCTGCACTTTT--AA-ATTTACCAAGCTACA-CCATTG
gi|140070                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GGACCATTG-G-TTATTT-CCA----TT-TTA-A-A-A-CAAATAT--ATAGT------------GG-AGTATC-TCAGAGC--C-A-CC---A-TC---AAA-A-TGATCC-A----GACCT
gi|140071                     :                                                                                                                                                                                                               AAGT-A---CAC--ACATAATCCC-TGAGAAT-GCACCATTG-G-CCATTT-TCA----TT-T----------AAA-AA--ATGTC-----------------------CAAAGC--CAC-CC---ACTCT--AAA-ACT-TTCT-A----GGCCTGCACTTTTAAAC-TTT--TCAAGCTACG-CCCCTG
gi|140072                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---TAC--ACAAAACCCT-TGAAAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-GCA----TT-TT--A-A-A-C-AA-AT--CTGGG------------AG-AGGACCATCAGA----C-C-CC---A-CC---t
gi|140073                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---GAC--ACAAAACCCT-TGAGATT-GCACTATTG-G-GCAATT-ACA----TT-TT--C-A-A-ATAA-AT--CTGGT------------GG-AGGACC-TCCGGAC--A-C-CC---A-TA---ACA-A-T-GTCT-A----GGCATGTACTTTT--A
gi|140074                     :                                                                                                                                                                                                               AGAT-A---CAC--ACAAACCCAC-TGAGAAT-GCACCAGTG-G-CCAGTT-ACAT---TT-TT--G-G-A-TAAA-CCTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGG-GGGACCTTCATA-CAAT-C-CC---G-TA---AAA-A-T-GTCG-A----GGGCTGCATTTTT--AA-ATTGACCAAGCTATG-CCACTGTATTATGTA-CAC--C-CTTGTTCAAATGTACA-
gi|140075                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAAACCC-TGAGAAT-GCACCATTA-G-CCATTT-ACA----TT-TTTAA-A-A-CAAA-AT--ATGGG------------GGAAGAACC-T
gi|140076                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---AAC--ACAAAATCCC-TGATAAA-GCACCATCG-G-TCATTA-ACA----TT-TT--A-A-A-AAAA-CT--ACAGC------------
gi|140077                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAT--ACAAAATCTC-TGAGAAT-GCACAATTG-T-CTATTT-ACA----TT-TT--A----------------------------------AGTACC-CC----C--T-C-CCCAAA-TCCGTAAA-A-T-ATAT-A----AGCCTGCACTTTT--AA-ATTTACCAAACTA
gi|140078                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAT--GTAAAACTCC-TGAAAAT-GCACCATTG-A-CCATTT-ATA-----T-TT--A-A-A-AAAA-
gi|140079                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-ATTGCAC--ACAAAACTCC-TGATATT-GCA-CATTT-G-CCATTT-ACA-----T-TT--A------AAA-AT--AT
gi|140080                     :                                                                                                                                                                                                                AAC-A---CAC--ATAAAACCCC-TGAGAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACA----TTATT--A-A-A-CAAcattgcag
gi|140081                     :                                                                                                                                                                                                                 AT-A---CAC--ACAAAGCACA-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--AGA-A-AAAA-AT--ATGGC------------AG-AGCACC-TCAGAGC--C-T-CT---A-CC---AAA-A-T-GTGT-A----GACCAGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGTCATACACA-TAC--CACTAACCCAAATTTGCT-GTAGTGTAG-AGGG-ACA--CTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TAGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC--TTTTAATACATG-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---GTCTGAG--T--GTGTGT
gi|140082                     :                                                                                                                                                                                                                 AT-A---CAC--ACAAAATCCC-TGATATT-GCACT-TTGAG-CCAACT-ACA----TT-TT--T-A-A-AAAA-AT--CTGG
gi|140083                     :                                                                                                                                                                                                                                     CC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TTATTT-ACA----TT-TT--A-ATA-AAAA-AA--ATGGC------------AG-AGCACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-CC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGCAGGTTT--AT-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATACACA-TAC--CACCTACCCAAATTTGCA-GGAGTGTAA-AGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GC---CT--CAAGT-------------------GAC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140084                     :                                                                                                                                                                                                                                       gcaATAAT-GCACCATTG-G-TCATTTTACA----TT-TG--A-A-A-ATAT-AT--ATGGA------------TG-AGTACC-AAATAAC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-A----CGCCTGCATATTT--AC-TTTGGCCAAGCTAGG-CCCCTGTCATATACA-CAT--TACCTACTCACATTTGCA-ATAG----G-GGGA-ATAATCTC-CAAT-ACGTCTAGACTCGTT---------T--T---------A----C--------TGGGAATG------AAACTCAATTG-A-GATTCAC-TTTTTGATGCATA-TTAAT-------A-T----GGTAAAT-TT---A-GT---C---TAGGT---TTGTTGTG-T--GTGTGTC-TGTGTC--TGTGT
gi|140085                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      ----TT-TT--A-A-A-GAAA------TGGC------------AG-AATACC-TCAGAGC--T-C-TT---A-TC---AAA---T-TTCT-A----GACCTGCAG-TTT--AC-CTTGACCAAGTTAGG-CCACTGTCATACACA-CAC--TACCTACCCAAATTCGCA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCT--------------GGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGACGTA------AAACTCGATTA-A-AATTATT-ATTTTAATACATC-T---TTTGTTACA-T----AG----T-TT---A-AT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GCGTGTC-TGTGTGTTTGTGTTT
gi|140086                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          tT-TT--A-A-A-TATA--T--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-AC---A-TTT--AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAAGTTT--AT-ACTGACCAAAATAGG-CCGCTGCCATACACA-C----CTTCTTCTCACATTTGCA-G---TTATG-GGGTTACACTCTC-CACT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGTAGTG------AAACTCGATTG-A-GGTTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------G-T----GG----T-TT----------------AAT---TTTT-----T--GTGAGTC-TGTGT
gi|140087                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAG-GC--C-C-TC---A-TC---AAA---T-TTCT-C----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGATAAAGCTAGA-CCTCTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140088                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGA-C--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGATTTAGCTAGA--CATTGCCGCACAAA-CAC--TGTCTACTCACATTTACA-GGA
gi|140089                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAG-GC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTTTTA----GGCCTGCATGTTT--AC-TTTGATCAAGCTAG------------ACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140090                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TT---AAA-A-A-TTCT-A----GGCCTACAGGTTT--TC-TTCCACCAAGCTAGG-TCCCTGTCAAATACA-CAC--CACCTACTCAAATTTGCA-GGAG-GGTG-GAGA-AATTTACC-CGTT-GCGTCATGGCTCGTT---------G--A---------A----C--------TGGGAATG------AAACTCTATTG-A-GTTTCAC-CTTTTATTACATC-T---T---------T----GG----T-TT---A-GT---CT--T-AGT---ATAT-----A--GTGTGT-----GTG--TATGTTT
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AAA-A-T-ATTT-A----GGCCTGTAGATTT--AC-TTCGACCAAGCTAGGTCCA-TGTCATACACA-CAC--CACCTACTCAAATTTGCA-AGAGGGGTG-GGGG-AAACTCTC-CTC
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTCGATTG-A-GATTCAC-CTTTTAATACATC-T---T-------A-T----GG----T-TT---A-GT---CT--TATGT---ATAT-----T--GTGTGTT-TGTATG--TTTCTTTgattgagattcaccttttaatacatcttatggtttagtcttatgtatattgtgtgtttgtatgtttcttt
gi|140092                     :                                                                                                                                                                                                                                                            aaaatatttaggcctgtagatttacttcgaccaagctaggtccatgtcatacacacaccacctactcaaatttgcaagaggggtgggggaaactctcTCT-A----GCCCTGCAGGTTT--AC-TTCGACCAAACTAGG-TCCCTATTATACACA-C----CACCTACT-----TTGCA-GGAGGGGTG-GGGG-ACACTCTC-CGTT-ACGTATTGGCTCGTT---------G--A---------A----C--------TTGGAATG------AAACTCGATTG-A-GGTTCAC-CTTTTAATACATT-T---A-------A-T----GG----T-TT---A-GT---CT--TAAAT---ATAT-----A--TTGTGT-----GTG--TATGTTT
gi|140093                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAGCTAGG-CCGCTGCCATACACG-CAC--CACCTAATCACATTTGCAGGGGGTGGGG-GGGG-GCACCCTT-CACA-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGG
gi|140094                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACACACA-CACA-CACCTACTCACACTTGTT-GAAG-G--G-GGAA-ACACTCTC-TCCT-ATGTCTTGGCTTGTG---------C--T---------A----A--------AGGAAGTG------AAACTTGGTTG-A-GGTTCAT-TCTTAAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CCAAGAAGT---TTGTGGAAGT--GTGTTTC-T
gi|140095                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTCAAATTTGCA-CGAGTGTTG-GGGG-ACACTCTC-GTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAACACATT-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TACGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140096                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacG-GGTA-ACACTCTC-CACT-ACCTCTTGACTAGTA---------G--T---------A----C--------TGAGAGTG------AAACTTTATTA-A-TGTTCAC-TTTCTA----ATC-C---T-------A-T----------T-CT-----GT---C---TAAGA---TACT-----T--G
gi|140097                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-ACACTCTC-CCCT-ACGTTTCCACTCACATTGCATGGTG--T---------A----C--------TGGATTTG------AAACTCT-TTG-A-TATTTAC-TTTTAAACACATC-T---G-------A-G----TG----T-TT---T-GT---CT--T
gi|140098                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACACTCTC-CCCTCACATCTAGACTCGCA---------G--T---------A----CGTAGGTAACAGGTATG------AAACCCGGTGG-A-GGTTCAC-TTTTTAATACAAT-T---T-------A-T----AG----TGTT---T-GT---T-------T---TTTT-----T--GTTTGT
gi|140099                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACACCCTTTCTC--ACATTTTGGCCCGCA---------G--T---------G----TA-------TGAGGTTATGTTATGAACCCAATGG-A-AGATCAT-TTTTTAGTACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---T-TT---CT--TGAGT---
gi|140100                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-GCGTTTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC--------------------------------------------TAAGT---GTGTG----T--GTGTATG-TGCGTG--CGTG
gi|140101                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------GCGT---------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTATAAATACATT-T---
gi|140102                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------CTACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTGAATACATC--------------------------------------------TAAGTG--TGCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140103                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACCCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------CTACTCG-TTG-AAGATTCGC-TTTTGAATACAT--T---T-------A------AG----T-GT---ACGT----------GTG--TGCA-----T--GCGTG---CGCGTG--TGTGTTT
gi|140104                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACATCTTGTCTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACACGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-GTGCCA-G----CG--TGCG----TGCG-----T--GTGTGTG-TGCGTG--CGTG
gi|140105                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGCCTTGACTCGCA---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------ATA-TCGTTGG-A-GATTCAT-TTTTAAATACATC-T---
gi|140106                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTT-ATTACATC-T---C-------A-------G----T--------GT----------GT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140107                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CCCT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTAG-A-TATACGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-GC---G-GTGTGCG--TGCG----TGCG-----T--GTGTAGG-TGCGTG--TGTGgtgtgtgtgtgttt
gi|140108                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCG---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------AAACTC-ATTGGA-GATTCGC-TTTTAAATA
gi|140109                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT--CGTCTTGACTCTCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-TT-----GT---GTG-TGCGTGCGTCCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140110                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGCCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTCAAATACATC-
gi|140111                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-CTC--ACGTCTTGACTTGTA---------G--T---------ATAAAC--------TGGGTTTG------ATACACGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC--------------------------------------------TAAG----TGCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140112                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTGAATACATC-----T-------A------AG----T--------GTG--CG--CGCGT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140113                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCTTTTA-A-GATTCAC-TTTTTATTACATC-T---T-------A-T----AG----G-TT---A-AT---CT--CAAGT---TTCT-----TGTGTGTGTC-TGC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111111111                                                                                                                       11111                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   1 222   11          1       1         1 1      2   6666  1  66 1 1 99   3  11     9999999999999 1      2       11 1 1  222 1  555   1 1 44   1 2222        0    11  1               1  1   0        1   33          1       1    7 33 1    1        1 0  1               444444444 11 999999999 2222 44444444    22  444444 0     4 0 2 1     1 1    3        55555555555555555555  2222 1  55555  8888888     444    55555 11      66      22       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   . ...   ..          .       .         . .      .   ....  .  .. . . ..   .  ..     ............. .      .       .. . .  ... .  ...   . . ..   . ....        .    ..  .               .  .   .        .   ..          .       .    . .. .    .        . .  .               ......... .. ......... .... ........    ..  ...... .     . . . .     . .    .        ....................  .... .  .....  .......     ...    ..... ..      ..      ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   2 222   77          2       2         2 2      4   7777  1  44 1 1 88   4  66     8888888888888 4      8       88 3 3  333 2  666   2 2 66   2 5555        2    88  4               4  3   1        4   44          5       4    0 88 7    5        0 1  0               000000000 44 111111111 1111 66666666    00  777777 3     2 1 1 0     5 0    3        88888888888888888888  4444 1  88888  5555555     444    00000 77      00      00       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
Reference ( family-407 )      :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140051                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGTACC-TGTTAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGA------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-A----GACATGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATTCACA-CAC--CACCTACCCAAATTTTCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AA----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGTGTG--TGTGTTT
gi|140052                     :                                                                                                                                                                                                               AACT-A---CAC--ACAAAGTCCC-TGATAAT-GCACCATTG-C-TCATTT-ACA----TT-TT--T-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------AG-AGTACC-TCAGAGA--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCC-A----TACCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATACACA-CAC--CACATACCCAAATGTGTA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTA-T-GATTCAC-TCTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TTAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGT
gi|140053                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGCCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-AAAA---TT-TT--A-A-A--ATA-A---ATGGC------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-ACTGAGAACTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGA-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTATCCAAATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-TTCC-GCGTCTAGGTTCGTA---------G--T---------A----T--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-TATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTTTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140054                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGGCAC-TGATAAT-GCACCATTG-T-TCATTT-GCA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------AG-AATACC-TCAAAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-G----AACCTGCA------------------AGCTAGG-CCACTGCTATACACT-T----CACCTACCCAAATTTTCA-GGAATGGTG-GGGG-TCAATCTC-CTCT-ACGTCTTGACTCGTA---------G--T---------T----C--------TGGGAGTG------ATACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---G-------A-T----AA----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140055                     :                                                                                                                                                                                                               AAAC-A---CAC--ACACAGCCCC-TCTTAAAAGAGTTATTG-G-TCATTT-ACA----TT-T---A-A-A--AAA-A---ATGAC------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAA-A-T--TCT-A----GACTAGCAGTTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGCCATACACG-CAT--CATCTACCCAACTTTACC-TGAGAGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCTATTA-A-GATTCACTTTTTTATTACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-AT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTCTTGCGTG--TGTG
gi|140056                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--TCAAAGCCCC-TGATAAT-GGACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--T-A-A-AAAA-AT--AT
gi|140056                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AAATA-T-TTCC-A----GACCTGTAAGTTT--AC-TTTGACCTAGTTAGG-ACACTGTTATACACACCAC--CACCTTCCCAC-TTTACA-GACGTGTAG-AGAG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTC-A-AATTCAC-CTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GA---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTTttccagacctgtaagtttactttgacctagttaggacactgttatacacaccaccaccttcccactttacagacgtgtagagagacactctcctctacgtcttggctcgtagtactggaagtgaaactcgattcaaattcaccttttaatacatcttatagtttagacttaagtttcttgtgtgtctgcgtgtgtgttt
gi|140057                     :                                                                                                                                                          aaatacactcaaagcccctgataatggaccattggtcatttacatttttaaaaAAAT-A---CAC--ACATAATCAC-TGGTAAT-ACACCATTG-G-TCATTT-ACATTT-TT-TT--A------AAA-TT--ATGGC------------GG-ACTACC-CGAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-C-GTCT-A----GACCTGCAGGTTT--ACATTTGACCAAGCTAGG-CCA-----A-ACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGAG-GGT--GGGA-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGCTCATA---------G--T---------A----C--------TGGGGATGCAA---AAACTCGATTG-A-GATTCAC-ATTTTAATCAATT-T---T-------A-T----GG----T-CC---A-GT---GTG-TGTGT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGCGTG--TGCGT
gi|140058                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---TAC--ACAAAGCCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-ACATTT-ACA----TT-TC--A-A-A-ACAA-AT--ATGGC--------------------------AGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGCAGGTTT--TT-TTTGACCAAGCTAGG-CCATTGTCATACAAA-CAC--CACCTACCAAAATTTGCA-TGAGTGATG-GGGG-AGACTCTC-CTAT-TCGTGTTGGCTCGTA---------T--T---------A----C--------TAGGATTG------AA----------------------------ACATC-T---T-------A-T----AA----T-TA---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGTATG--TGTGTTT
gi|140059                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ATGTAACCAC-TGACAAT-GCA----------------ACA----TT-TA--A-A-G-CAAT-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-CCATAGC--C-A-CA---T-TC---ATA-A-T-GTCT-A----GGCCGGCAGGTTT--AT-TTTGGCCAGACAAGG-TCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGAAGGGTG-GTGG-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGTTCGTA---------G--T---------A----C---------AGGATTG------GAACTCGATCG-A-GATTCAA-TATTTTATACATC-T---T-------A-T----GG----T-TT---A-GA---CT--TAGGT---TTCTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140060                     :                                                                                                                                                                                                               AAATTA---CACTTGCCAAACTCC-TGATAAT-GCACCATTG-A-TCATTT-ACT----TT-TT--T-A-A--AAA-AC--TTGGT------------GG-AGTACC-CCAGAGC--C-C-CT---A-TC---AAC-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCGAGCTAGG-CCTCTGTCATACACA-CACATTACCTACTCACATTTGCA-GTAGAGGTGTGGGG-ACAATCTC-CACT-ACGTCTGGACTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCG
gi|140061                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAATCCCC-TGATAAT-GCATCATTG-G-TAATTTTAAA----TT-----A-A-A-AAAA-A---ATAGC------------GG-TGTACC-CCATAGC--T-C-CA---A-TC---AAC-A-T--TAT-T----GGCTTGCATGTTT--TC-TTTTACCAAGCTAGG-CCCGTGTCATTCACA-CAC--CACCTAATCACATTTGCA-GTAG----G-GGTA-ATACTCTC-CACT-AGGTTTTAGCTCGTT---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTG-A-GGTTAAG-TTTTTAATACATCGTAA-T-------A-TGATAAA----T-TT---A-GT---C---TAAGC---TTTG-----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140062                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAATTCC-TGATGAT-GCACCATTG-GTTCCTTT-ACA-------TT--A------AAA-AT--ATG
gi|140063                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATTAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TTTAA-A-A-CAAATAT--ATAGT------------GG-ATTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCC-A----GGCCTG
gi|140064                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-A-TCATTC-ACA----TT-TTA-A-A-A-CAAATAT--ATAGT------------AA-AGTACC-TCAGAGC--T-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----G
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAAACCCATAATAAT-GCACCATTG-G-TCA--T-ACA----GT-TTA-A-A-A-CAAT-AT--ATTGC------------GG-AGTACC-CCAGTGC--C-CTCC---A-TC---AGA-A-T-GTCT-T----GACCTGCAGGTCT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGTCATACACA-CAT--CACCTACTCTCATTTACA-
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-CCCT-AAGTCTTGACTTGCA---------G--TGCATGGTGTA----C--------TGGGATTG------ATACTCG-TTGCA-GAATAAC-TTTT----A-ATC-T---A-------AGT----AG----T-GT-----GT---GT-----GT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGTatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgaccccctaagtcttgacttgcagtgcatggtgtactgggattgatactcgttgcagaataacttttaatctaagtagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gi|140066                     : aaatacacacaaaaacccataataatgcaccattggtcatacagtttaaaacaatatattgcggagtaccccagtgccctccatcagaatgtcttgacctgcaggtctactttggtcaagctagacccctgtcatacacacatcacctactctcatttacaatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgacAAAT-A---CAC--ACAAAACCC--TGATAAT-GAACCATAT-G-TCAT---ACA----GT-TT--A-A-AACAAT-AT--ATGGT------------GA-AGTACC-CCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGCCACACACA-------ATCTGCTCATATTTGCA-GGA-TTAT-------ACACCCTC-CCC
gi|140067                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACGATTC-G-TAAT---ACA----GT-TT--A-A-AACAAT-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-CCAGAAC--C-C-CC---A-TCG--AAA-A-T-TTTT-A----GGCCTG------------------CAAGCTAGA-CCCCTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140068                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGTACC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA-------------------AA-AT--ATGGA------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGTA
gi|140069                     :                                                                                                                                                                                                               AAGT-A---CAC--ACAAAACACC-TGATAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACACACTTT-TT--A-A----AAA-AT--CTGGC-------------------CC-TAAGA-T--C-G-CC---G-TA---AAC-A-C-TTCT-A----GGCCTGCACTTTT--AA-ATTTACCAAGCTACA-CCATTG
gi|140070                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GGACCATTG-G-TTATTT-CCA----TT-TTA-A-A-A-CAAATAT--ATAGT------------GG-AGTATC-TCAGAGC--C-A-CC---A-TC---AAA-A-TGATCC-A----GACCT
gi|140071                     :                                                                                                                                                                                                               AAGT-A---CAC--ACATAATCCC-TGAGAAT-GCACCATTG-G-CCATTT-TCA----TT-T----------AAA-AA--ATGTC-----------------------CAAAGC--CAC-CC---ACTCT--AAA-ACT-TTCT-A----GGCCTGCACTTTTAAAC-TTT--TCAAGCTACG-CCCCTG
gi|140072                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---TAC--ACAAAACCCT-TGAAAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-GCA----TT-TT--A-A-A-C-AA-AT--CTGGG------------AG-AGGACCATCAGA----C-C-CC---A-CC---t
gi|140073                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---GAC--ACAAAACCCT-TGAGATT-GCACTATTG-G-GCAATT-ACA----TT-TT--C-A-A-ATAA-AT--CTGGT------------GG-AGGACC-TCCGGAC--A-C-CC---A-TA---ACA-A-T-GTCT-A----GGCATGTACTTTT--A
gi|140074                     :                                                                                                                                                                                                               AGAT-A---CAC--ACAAACCCAC-TGAGAAT-GCACCAGTG-G-CCAGTT-ACAT---TT-TT--G-G-A-TAAA-CCTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGG-GGGACCTTCATA-CAAT-C-CC---G-TA---AAA-A-T-GTCG-A----GGGCTGCATTTTT--AA-ATTGACCAAGCTATG-CCACTGTATTATGTA-CAC--C-CTTGTTCAAATGTACA-
gi|140075                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAAACCC-TGAGAAT-GCACCATTA-G-CCATTT-ACA----TT-TTTAA-A-A-CAAA-AT--ATGGG------------GGAAGAACC-T
gi|140076                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---AAC--ACAAAATCCC-TGATAAA-GCACCATCG-G-TCATTA-ACA----TT-TT--A-A-A-AAAA-CT--ACAGC------------
gi|140077                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAT--ACAAAATCTC-TGAGAAT-GCACAATTG-T-CTATTT-ACA----TT-TT--A----------------------------------AGTACC-CC----C--T-C-CCCAAA-TCCGTAAA-A-T-ATAT-A----AGCCTGCACTTTT--AA-ATTTACCAAACTA
gi|140078                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAT--GTAAAACTCC-TGAAAAT-GCACCATTG-A-CCATTT-ATA-----T-TT--A-A-A-AAAA-
gi|140079                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-ATTGCAC--ACAAAACTCC-TGATATT-GCA-CATTT-G-CCATTT-ACA-----T-TT--A------AAA-AT--AT
gi|140080                     :                                                                                                                                                                                                                AAC-A---CAC--ATAAAACCCC-TGAGAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACA----TTATT--A-A-A-CAAcattgcag
gi|140081                     :                                                                                                                                                                                                                 AT-A---CAC--ACAAAGCACA-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--AGA-A-AAAA-AT--ATGGC------------AG-AGCACC-TCAGAGC--C-T-CT---A-CC---AAA-A-T-GTGT-A----GACCAGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGTCATACACA-TAC--CACTAACCCAAATTTGCT-GTAGTGTAG-AGGG-ACA--CTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TAGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC--TTTTAATACATG-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---GTCTGAG--T--GTGTGT
gi|140082                     :                                                                                                                                                                                                                 AT-A---CAC--ACAAAATCCC-TGATATT-GCACT-TTGAG-CCAACT-ACA----TT-TT--T-A-A-AAAA-AT--CTGG
gi|140083                     :                                                                                                                                                                                                                                     CC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TTATTT-ACA----TT-TT--A-ATA-AAAA-AA--ATGGC------------AG-AGCACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-CC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGCAGGTTT--AT-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATACACA-TAC--CACCTACCCAAATTTGCA-GGAGTGTAA-AGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GC---CT--CAAGT-------------------GAC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140084                     :                                                                                                                                                                                                                                       gcaATAAT-GCACCATTG-G-TCATTTTACA----TT-TG--A-A-A-ATAT-AT--ATGGA------------TG-AGTACC-AAATAAC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-A----CGCCTGCATATTT--AC-TTTGGCCAAGCTAGG-CCCCTGTCATATACA-CAT--TACCTACTCACATTTGCA-ATAG----G-GGGA-ATAATCTC-CAAT-ACGTCTAGACTCGTT---------T--T---------A----C--------TGGGAATG------AAACTCAATTG-A-GATTCAC-TTTTTGATGCATA-TTAAT-------A-T----GGTAAAT-TT---A-GT---C---TAGGT---TTGTTGTG-T--GTGTGTC-TGTGTC--TGTGT
gi|140085                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      ----TT-TT--A-A-A-GAAA------TGGC------------AG-AATACC-TCAGAGC--T-C-TT---A-TC---AAA---T-TTCT-A----GACCTGCAG-TTT--AC-CTTGACCAAGTTAGG-CCACTGTCATACACA-CAC--TACCTACCCAAATTCGCA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCT--------------GGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGACGTA------AAACTCGATTA-A-AATTATT-ATTTTAATACATC-T---TTTGTTACA-T----AG----T-TT---A-AT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GCGTGTC-TGTGTGTTTGTGTTT
gi|140086                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          tT-TT--A-A-A-TATA--T--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-AC---A-TTT--AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAAGTTT--AT-ACTGACCAAAATAGG-CCGCTGCCATACACA-C----CTTCTTCTCACATTTGCA-G---TTATG-GGGTTACACTCTC-CACT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGTAGTG------AAACTCGATTG-A-GGTTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------G-T----GG----T-TT----------------AAT---TTTT-----T--GTGAGTC-TGTGT
gi|140087                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAG-GC--C-C-TC---A-TC---AAA---T-TTCT-C----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGATAAAGCTAGA-CCTCTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140088                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGA-C--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGATTTAGCTAGA--CATTGCCGCACAAA-CAC--TGTCTACTCACATTTACA-GGA
gi|140089                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAG-GC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTTTTA----GGCCTGCATGTTT--AC-TTTGATCAAGCTAG------------ACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140090                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TT---AAA-A-A-TTCT-A----GGCCTACAGGTTT--TC-TTCCACCAAGCTAGG-TCCCTGTCAAATACA-CAC--CACCTACTCAAATTTGCA-GGAG-GGTG-GAGA-AATTTACC-CGTT-GCGTCATGGCTCGTT---------G--A---------A----C--------TGGGAATG------AAACTCTATTG-A-GTTTCAC-CTTTTATTACATC-T---T---------T----GG----T-TT---A-GT---CT--T-AGT---ATAT-----A--GTGTGT-----GTG--TATGTTT
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AAA-A-T-ATTT-A----GGCCTGTAGATTT--AC-TTCGACCAAGCTAGGTCCA-TGTCATACACA-CAC--CACCTACTCAAATTTGCA-AGAGGGGTG-GGGG-AAACTCTC-CTC
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTCGATTG-A-GATTCAC-CTTTTAATACATC-T---T-------A-T----GG----T-TT---A-GT---CT--TATGT---ATAT-----T--GTGTGTT-TGTATG--TTTCTTTgattgagattcaccttttaatacatcttatggtttagtcttatgtatattgtgtgtttgtatgtttcttt
gi|140092                     :                                                                                                                                                                                                                                                            aaaatatttaggcctgtagatttacttcgaccaagctaggtccatgtcatacacacaccacctactcaaatttgcaagaggggtgggggaaactctcTCT-A----GCCCTGCAGGTTT--AC-TTCGACCAAACTAGG-TCCCTATTATACACA-C----CACCTACT-----TTGCA-GGAGGGGTG-GGGG-ACACTCTC-CGTT-ACGTATTGGCTCGTT---------G--A---------A----C--------TTGGAATG------AAACTCGATTG-A-GGTTCAC-CTTTTAATACATT-T---A-------A-T----GG----T-TT---A-GT---CT--TAAAT---ATAT-----A--TTGTGT-----GTG--TATGTTT
gi|140093                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAGCTAGG-CCGCTGCCATACACG-CAC--CACCTAATCACATTTGCAGGGGGTGGGG-GGGG-GCACCCTT-CACA-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGG
gi|140094                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACACACA-CACA-CACCTACTCACACTTGTT-GAAG-G--G-GGAA-ACACTCTC-TCCT-ATGTCTTGGCTTGTG---------C--T---------A----A--------AGGAAGTG------AAACTTGGTTG-A-GGTTCAT-TCTTAAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CCAAGAAGT---TTGTGGAAGT--GTGTTTC-T
gi|140095                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTCAAATTTGCA-CGAGTGTTG-GGGG-ACACTCTC-GTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAACACATT-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TACGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140096                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacG-GGTA-ACACTCTC-CACT-ACCTCTTGACTAGTA---------G--T---------A----C--------TGAGAGTG------AAACTTTATTA-A-TGTTCAC-TTTCTA----ATC-C---T-------A-T----------T-CT-----GT---C---TAAGA---TACT-----T--G
gi|140097                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-ACACTCTC-CCCT-ACGTTTCCACTCACATTGCATGGTG--T---------A----C--------TGGATTTG------AAACTCT-TTG-A-TATTTAC-TTTTAAACACATC-T---G-------A-G----TG----T-TT---T-GT---CT--T
gi|140098                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACACTCTC-CCCTCACATCTAGACTCGCA---------G--T---------A----CGTAGGTAACAGGTATG------AAACCCGGTGG-A-GGTTCAC-TTTTTAATACAAT-T---T-------A-T----AG----TGTT---T-GT---T-------T---TTTT-----T--GTTTGT
gi|140099                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACACCCTTTCTC--ACATTTTGGCCCGCA---------G--T---------G----TA-------TGAGGTTATGTTATGAACCCAATGG-A-AGATCAT-TTTTTAGTACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---T-TT---CT--TGAGT---
gi|140100                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-GCGTTTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC--------------------------------------------TAAGT---GTGTG----T--GTGTATG-TGCGTG--CGTG
gi|140101                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------GCGT---------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTATAAATACATT-T---
gi|140102                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------CTACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTGAATACATC--------------------------------------------TAAGTG--TGCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140103                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACCCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------CTACTCG-TTG-AAGATTCGC-TTTTGAATACAT--T---T-------A------AG----T-GT---ACGT----------GTG--TGCA-----T--GCGTG---CGCGTG--TGTGTTT
gi|140104                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACATCTTGTCTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACACGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-GTGCCA-G----CG--TGCG----TGCG-----T--GTGTGTG-TGCGTG--CGTG
gi|140105                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGCCTTGACTCGCA---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------ATA-TCGTTGG-A-GATTCAT-TTTTAAATACATC-T---
gi|140106                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTT-ATTACATC-T---C-------A-------G----T--------GT----------GT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140107                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CCCT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTAG-A-TATACGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-GC---G-GTGTGCG--TGCG----TGCG-----T--GTGTAGG-TGCGTG--TGTGgtgtgtgtgtgttt
gi|140108                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCG---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------AAACTC-ATTGGA-GATTCGC-TTTTAAATA
gi|140109                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT--CGTCTTGACTCTCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-TT-----GT---GTG-TGCGTGCGTCCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140110                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGCCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTCAAATACATC-
gi|140111                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-CTC--ACGTCTTGACTTGTA---------G--T---------ATAAAC--------TGGGTTTG------ATACACGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC--------------------------------------------TAAG----TGCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140112                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTGAATACATC-----T-------A------AG----T--------GTG--CG--CGCGT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140113                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCTTTTA-A-GATTCAC-TTTTTATTACATC-T---T-------A-T----AG----G-TT---A-AT---CT--CAAGT---TTCT-----TGTGTGTGTC-TGC


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   T TTG   TT          A       A         A T      T   CACT  A  TA G T AC   T  TG     GGGGGGGGGGGGG A      A       AA A T  CAA C  CGT   T C GA   T CTGA             AA  A               T  A            C   AT          A       G    T TA T    T        T    C               TTGCATGGT CG GCATGGTGT TAAA GTAGGTAA    AG  TGTTAT       A   C A     A T    T        GTAATATGATA           TAAA G  GCCA   GTGCG       GCG    GGAAG GT      CT      TT
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      T   TTT   .  TA . . AC   T  .      A             .      T       .  . .  .   .  G     . . G    . .                .   .               .  A            .   A           A       .    T GT .    .        .    .               .         .  GT        .    A           AG  CAA          A   G .     A .    T        TTTTGTTACAT           .    .  AC     CCAA        G      TGTG  .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   A     .  A  . . C    T  .      A             .      .       .  . .  .   .  T     . . G    . .                .   .               .  A            .   .           A       .    T GT .    .        .    .               .         .  GA        .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAATAT               .    .  A      GTG         G      GAG   .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   T     .  A  . . C    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  T     . . G    . .                .   .               .  A            .   .           A       .    A GT .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TAAGT                 .    .  A      GTG         .      G     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  A  . . A    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  A            .   .           C       .    T TA .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      GCG         .      G     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  A            .   .           C       .    T GT .    .        .    .               .         .  GA        .    .           GA  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      G     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  A            .   .           A       .    G AT .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AT  .            A   . .     A .    T        TGAT                  .    .  A      CT          .      G     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  A            .   .           C       .    A GT .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AT  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      G     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  T            .   .           C       .    T GT .    .        .    .               .         .  GA        .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      G     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  C            .   .           C       .    T AT .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  C            .   .           C       .    T TA .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AT  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  C            .   .           T       .    T TA .    .        .    .               .         .  GT        .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  C            .   .           C       .    T TA .    .        .    .               .         .  .         .    .           AG  .            A   . .     T .    T        TTAT                  .    .  A      GT          .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  A            .   .           A       .    G AT .    .        .    .               .         .  .         .    .           AA  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . T    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  C            .   .           A       .    G GT .    .        .    .               .         .  .         .    .           CG  .            A   . .     A .    T        TTGT                  .    .  A      CT          .      .     .       T       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  A            .   .           A       .    T GT .    .        .    .               .         .  .         .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  A            .   .           C       .    T GT .    .        .    .               .         .  .         .    .           AA  .            G   . .     A .    A        TAAT                  .    .  A      CT          .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  A            .   .           A       .    . GG .    .        .    .               .         .  .         .    .           AA  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . C    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  C            .   .           C       .    . TT .    .        .    .               .         .  .         .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . A    . .                .   .               .  A            .   .           C       .    . .  .    .        .    .               .         .  .         .    .           AG  .            G   . .     A .    A        CTAT                  .    .  A      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  G            .   .           C       .    . .  .    .        .    .               .         .  .         .    .           AG  .            A   . .     A .    T        TGAG                  .    .  T      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      T             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  T            .   .           C       .    . .  .    .        .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     A .    T        TTAT                  .    .  T      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . A    .  .      A             .      .       .  . .  .   .  .     . . G    . .                .   .               .  A            .   .           A       .         .    .        .    .               .         .  .         .    .           TA  .            T   . .     A .    A        TTAT                  .    .  T      CG          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . G    .  .      G             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  C            .   .           A       .              .        .    .               .         .  .         .    .           GT  .            T   . .     G .    A        TTAT                  .    .  G      CT          .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . T    .  .      .             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  A            .   .           C       .              .        .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    G        TTT                   .    .  A      C           .      .     .       G       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .      .             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  C            .   .           C       .              .        .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    G        TTA                   .    .  .      C           .      .     .       C       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .      .             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  G            .   .           A       .                       .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    A        TCA                   .    .  .      C           .      .     .       .         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .      .             .      .       .  . .  .   .  .     . . T    . .                .   .               .  .                            .       .                       .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    A        TA                    .    .  .      T           .      .     .       .         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .                                   .  . .  .   .  .     . . T    . .                .                                                                                   .    .               .         .  .         .    .           TT  .            A   . .     A .    A        TA                    .    .  .      .           .      .     .       .         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .                                   .  . .  .   .  .     . . A    . .                                                                                                    .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    A        TA                    .    .  .      .           .      .     .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   . .     .           .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .                                               .  .     . . .    . .                                                                                                    .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    A        TA                    .    .  .      .           .      .     .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                       .       .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .                                                  .     . . .    . .                                                                                                    .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    A        .                     .    .  .      .           .      .     .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                               .         . .      .   .     .  .  . . .    .  .                                                  .              . .                                                                                                    .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    A        .                     .    .  .      .           .                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      .     .  .  . . .    .                                                                                                                                                                           .    .               .         .  .         .    .           TT  .            T   . .     G .    G        .                     .    .  .      .                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .  .  . . .                                                                                                                                                                                .    .               .         .  .         .    .           TT  .            .   . .     G .    T                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .    .               .         .  .         .    .           TT  .            .   . .     G .    .                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .    .               .         .  .         .    .           TT  .            .   . .     A .    .                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .    .               .         .  .         .    .           AG  .            .   . .     . .    .                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .                    .         .  .         .    .                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                               
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111111111                                                                                                                       11111                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   1 222   11          1       1         1 1      2   6666  1  66 1 1 99   3  11     9999999999999 1      2       11 1 1  222 1  555   1 1 44   1 2222        0    11  1               1  1   0        1   33          1       1    7 33 1    1        1 0  1               444444444 11 999999999 2222 44444444    22  444444 0     4 0 2 1     1 1    3        55555555555555555555  2222 1  55555  8888888     444    55555 11      66      22       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   . ...   ..          .       .         . .      .   ....  .  .. . . ..   .  ..     ............. .      .       .. . .  ... .  ...   . . ..   . ....        .    ..  .               .  .   .        .   ..          .       .    . .. .    .        . .  .               ......... .. ......... .... ........    ..  ...... .     . . . .     . .    .        ....................  .... .  .....  .......     ...    ..... ..      ..      ..       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                   2 222   77          2       2         2 2      4   7777  1  44 1 1 88   4  66     8888888888888 4      8       88 3 3  333 2  666   2 2 66   2 5555        2    88  4               4  3   1        4   44          5       4    0 88 7    5        0 1  0               000000000 44 111111111 1111 66666666    00  777777 3     2 1 1 0     5 0    3        88888888888888888888  4444 1  88888  5555555     444    00000 77      00      00       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
Reference ( family-407 )      :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-NTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCANATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGGGNNTG------AAACTCGATTG-A-GATTCGC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140051                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGTACC-TGTTAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGA------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-A----GACATGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGCCATTCACA-CAC--CACCTACCCAAATTTTCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AA----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGTGTG--TGTGTTT
gi|140052                     :                                                                                                                                                                                                               AACT-A---CAC--ACAAAGTCCC-TGATAAT-GCACCATTG-C-TCATTT-ACA----TT-TT--T-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------AG-AGTACC-TCAGAGA--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCC-A----TACCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATACACA-CAC--CACATACCCAAATGTGTA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTA-T-GATTCAC-TCTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TTAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGT
gi|140053                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGCCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-AAAA---TT-TT--A-A-A--ATA-A---ATGGC------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-ACTGAGAACTGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGA-CCACTGCCATACACA-CAC--CACCTATCCAAATTTGCA-GGAGTGGTG-GGGG-ACACTCTC-TTCC-GCGTCTAGGTTCGTA---------G--T---------A----T--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-TATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTTTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140054                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGGCAC-TGATAAT-GCACCATTG-T-TCATTT-GCA----TT-TT--A-A-A-CAAA-AT--ATGGC------------AG-AATACC-TCAAAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-G----AACCTGCA------------------AGCTAGG-CCACTGCTATACACT-T----CACCTACCCAAATTTTCA-GGAATGGTG-GGGG-TCAATCTC-CTCT-ACGTCTTGACTCGTA---------G--T---------T----C--------TGGGAGTG------ATACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---G-------A-T----AA----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140055                     :                                                                                                                                                                                                               AAAC-A---CAC--ACACAGCCCC-TCTTAAAAGAGTTATTG-G-TCATTT-ACA----TT-T---A-A-A--AAA-A---ATGAC------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAA-A-T--TCT-A----GACTAGCAGTTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGCCATACACG-CAT--CATCTACCCAACTTTACC-TGAGAGGTG-GGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCTATTA-A-GATTCACTTTTTTATTACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-AT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTCTTGCGTG--TGTG
gi|140056                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--TCAAAGCCCC-TGATAAT-GGACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--T-A-A-AAAA-AT--AT
gi|140056                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AAATA-T-TTCC-A----GACCTGTAAGTTT--AC-TTTGACCTAGTTAGG-ACACTGTTATACACACCAC--CACCTTCCCAC-TTTACA-GACGTGTAG-AGAG-ACACTCTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTC-A-AATTCAC-CTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GA---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTTttccagacctgtaagtttactttgacctagttaggacactgttatacacaccaccaccttcccactttacagacgtgtagagagacactctcctctacgtcttggctcgtagtactggaagtgaaactcgattcaaattcaccttttaatacatcttatagtttagacttaagtttcttgtgtgtctgcgtgtgtgttt
gi|140057                     :                                                                                                                                                          aaatacactcaaagcccctgataatggaccattggtcatttacatttttaaaaAAAT-A---CAC--ACATAATCAC-TGGTAAT-ACACCATTG-G-TCATTT-ACATTT-TT-TT--A------AAA-TT--ATGGC------------GG-ACTACC-CGAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-C-GTCT-A----GACCTGCAGGTTT--ACATTTGACCAAGCTAGG-CCA-----A-ACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGAG-GGT--GGGA-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGCTCATA---------G--T---------A----C--------TGGGGATGCAA---AAACTCGATTG-A-GATTCAC-ATTTTAATCAATT-T---T-------A-T----GG----T-CC---A-GT---GTG-TGTGT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGCGTG--TGCGT
gi|140058                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---TAC--ACAAAGCCCC-TGATAAT-GCACCATTG-G-ACATTT-ACA----TT-TC--A-A-A-ACAA-AT--ATGGC--------------------------AGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGCAGGTTT--TT-TTTGACCAAGCTAGG-CCATTGTCATACAAA-CAC--CACCTACCAAAATTTGCA-TGAGTGATG-GGGG-AGACTCTC-CTAT-TCGTGTTGGCTCGTA---------T--T---------A----C--------TAGGATTG------AA----------------------------ACATC-T---T-------A-T----AA----T-TA---A-GT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGTATG--TGTGTTT
gi|140059                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ATGTAACCAC-TGACAAT-GCA----------------ACA----TT-TA--A-A-G-CAAT-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-CCATAGC--C-A-CA---T-TC---ATA-A-T-GTCT-A----GGCCGGCAGGTTT--AT-TTTGGCCAGACAAGG-TCACTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGAAGGGTG-GTGG-ACACTCTC-CGCT-ACGTCTTGGTTCGTA---------G--T---------A----C---------AGGATTG------GAACTCGATCG-A-GATTCAA-TATTTTATACATC-T---T-------A-T----GG----T-TT---A-GA---CT--TAGGT---TTCTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140060                     :                                                                                                                                                                                                               AAATTA---CACTTGCCAAACTCC-TGATAAT-GCACCATTG-A-TCATTT-ACT----TT-TT--T-A-A--AAA-AC--TTGGT------------GG-AGTACC-CCAGAGC--C-C-CT---A-TC---AAC-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGACCGAGCTAGG-CCTCTGTCATACACA-CACATTACCTACTCACATTTGCA-GTAGAGGTGTGGGG-ACAATCTC-CACT-ACGTCTGGACTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCG
gi|140061                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAATCCCC-TGATAAT-GCATCATTG-G-TAATTTTAAA----TT-----A-A-A-AAAA-A---ATAGC------------GG-TGTACC-CCATAGC--T-C-CA---A-TC---AAC-A-T--TAT-T----GGCTTGCATGTTT--TC-TTTTACCAAGCTAGG-CCCGTGTCATTCACA-CAC--CACCTAATCACATTTGCA-GTAG----G-GGTA-ATACTCTC-CACT-AGGTTTTAGCTCGTT---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCGATTG-A-GGTTAAG-TTTTTAATACATCGTAA-T-------A-TGATAAA----T-TT---A-GT---C---TAAGC---TTTG-----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140062                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAATTCC-TGATGAT-GCACCATTG-GTTCCTTT-ACA-------TT--A------AAA-AT--ATG
gi|140063                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATTAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TTTAA-A-A-CAAATAT--ATAGT------------GG-ATTACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCC-A----GGCCTG
gi|140064                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACCATTG-A-TCATTC-ACA----TT-TTA-A-A-A-CAAATAT--ATAGT------------AA-AGTACC-TCAGAGC--T-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----G
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAAACCCATAATAAT-GCACCATTG-G-TCA--T-ACA----GT-TTA-A-A-A-CAAT-AT--ATTGC------------GG-AGTACC-CCAGTGC--C-CTCC---A-TC---AGA-A-T-GTCT-T----GACCTGCAGGTCT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGTCATACACA-CAT--CACCTACTCTCATTTACA-
gi|140065                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-CCCT-AAGTCTTGACTTGCA---------G--TGCATGGTGTA----C--------TGGGATTG------ATACTCG-TTGCA-GAATAAC-TTTT----A-ATC-T---A-------AGT----AG----T-GT-----GT---GT-----GT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGTatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgaccccctaagtcttgacttgcagtgcatggtgtactgggattgatactcgttgcagaataacttttaatctaagtagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gi|140066                     : aaatacacacaaaaacccataataatgcaccattggtcatacagtttaaaacaatatattgcggagtaccccagtgccctccatcagaatgtcttgacctgcaggtctactttggtcaagctagacccctgtcatacacacatcacctactctcatttacaatatcatacccccaccgtaaaactcaccagaatgcattatttgacAAAT-A---CAC--ACAAAACCC--TGATAAT-GAACCATAT-G-TCAT---ACA----GT-TT--A-A-AACAAT-AT--ATGGT------------GA-AGTACC-CCAGAGC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGGTCAAGCTAGA-CCCCTGCCACACACA-------ATCTGCTCATATTTGCA-GGA-TTAT-------ACACCCTC-CCC
gi|140067                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GCACGATTC-G-TAAT---ACA----GT-TT--A-A-AACAAT-AT--ATGGC------------GG-AGTACC-CCAGAAC--C-C-CC---A-TCG--AAA-A-T-TTTT-A----GGCCTG------------------CAAGCTAGA-CCCCTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140068                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAGTACC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA-------------------AA-AT--ATGGA------------AG-AGTACC-TCAGAGC--C-T-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGTA
gi|140069                     :                                                                                                                                                                                                               AAGT-A---CAC--ACAAAACACC-TGATAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACACACTTT-TT--A-A----AAA-AT--CTGGC-------------------CC-TAAGA-T--C-G-CC---G-TA---AAC-A-C-TTCT-A----GGCCTGCACTTTT--AA-ATTTACCAAGCTACA-CCATTG
gi|140070                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAACCCC-TGATAAT-GGACCATTG-G-TTATTT-CCA----TT-TTA-A-A-A-CAAATAT--ATAGT------------GG-AGTATC-TCAGAGC--C-A-CC---A-TC---AAA-A-TGATCC-A----GACCT
gi|140071                     :                                                                                                                                                                                                               AAGT-A---CAC--ACATAATCCC-TGAGAAT-GCACCATTG-G-CCATTT-TCA----TT-T----------AAA-AA--ATGTC-----------------------CAAAGC--CAC-CC---ACTCT--AAA-ACT-TTCT-A----GGCCTGCACTTTTAAAC-TTT--TCAAGCTACG-CCCCTG
gi|140072                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---TAC--ACAAAACCCT-TGAAAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-GCA----TT-TT--A-A-A-C-AA-AT--CTGGG------------AG-AGGACCATCAGA----C-C-CC---A-CC---t
gi|140073                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---GAC--ACAAAACCCT-TGAGATT-GCACTATTG-G-GCAATT-ACA----TT-TT--C-A-A-ATAA-AT--CTGGT------------GG-AGGACC-TCCGGAC--A-C-CC---A-TA---ACA-A-T-GTCT-A----GGCATGTACTTTT--A
gi|140074                     :                                                                                                                                                                                                               AGAT-A---CAC--ACAAACCCAC-TGAGAAT-GCACCAGTG-G-CCAGTT-ACAT---TT-TT--G-G-A-TAAA-CCTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGG-GGGACCTTCATA-CAAT-C-CC---G-TA---AAA-A-T-GTCG-A----GGGCTGCATTTTT--AA-ATTGACCAAGCTATG-CCACTGTATTATGTA-CAC--C-CTTGTTCAAATGTACA-
gi|140075                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAC--ACAAAAACCC-TGAGAAT-GCACCATTA-G-CCATTT-ACA----TT-TTTAA-A-A-CAAA-AT--ATGGG------------GGAAGAACC-T
gi|140076                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---AAC--ACAAAATCCC-TGATAAA-GCACCATCG-G-TCATTA-ACA----TT-TT--A-A-A-AAAA-CT--ACAGC------------
gi|140077                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAT--ACAAAATCTC-TGAGAAT-GCACAATTG-T-CTATTT-ACA----TT-TT--A----------------------------------AGTACC-CC----C--T-C-CCCAAA-TCCGTAAA-A-T-ATAT-A----AGCCTGCACTTTT--AA-ATTTACCAAACTA
gi|140078                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-A---CAT--GTAAAACTCC-TGAAAAT-GCACCATTG-A-CCATTT-ATA-----T-TT--A-A-A-AAAA-
gi|140079                     :                                                                                                                                                                                                               AAAT-ATTGCAC--ACAAAACTCC-TGATATT-GCA-CATTT-G-CCATTT-ACA-----T-TT--A------AAA-AT--AT
gi|140080                     :                                                                                                                                                                                                                AAC-A---CAC--ATAAAACCCC-TGAGAAT-ACACCATTG-G-CCATTT-ACA----TTATT--A-A-A-CAAcattgcag
gi|140081                     :                                                                                                                                                                                                                 AT-A---CAC--ACAAAGCACA-TGATAAT-GCACCATTG-G-TCATTT-ACA----TT-TT--AGA-A-AAAA-AT--ATGGC------------AG-AGCACC-TCAGAGC--C-T-CT---A-CC---AAA-A-T-GTGT-A----GACCAGCAGGTTT--AC-TTTGACCAAGCTAGG-TCACTGTCATACACA-TAC--CACTAACCCAAATTTGCT-GTAGTGTAG-AGGG-ACA--CTC-CTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TAGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC--TTTTAATACATG-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TAAGT---GTCTGAG--T--GTGTGT
gi|140082                     :                                                                                                                                                                                                                 AT-A---CAC--ACAAAATCCC-TGATATT-GCACT-TTGAG-CCAACT-ACA----TT-TT--T-A-A-AAAA-AT--CTGG
gi|140083                     :                                                                                                                                                                                                                                     CC-TGATAAT-GCACCATTG-G-TTATTT-ACA----TT-TT--A-ATA-AAAA-AA--ATGGC------------AG-AGCACC-TCAGAGC--C-C-CC---A-CC---AAA-A-T-TTCT-A----GACCTGCAGGTTT--AT-TTTGACCAAGCTAGG-CCACTGTCATACACA-TAC--CACCTACCCAAATTTGCA-GGAGTGTAA-AGGG-ACACTCTC-CTCT-GCGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GC---CT--CAAGT-------------------GAC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140084                     :                                                                                                                                                                                                                                       gcaATAAT-GCACCATTG-G-TCATTTTACA----TT-TG--A-A-A-ATAT-AT--ATGGA------------TG-AGTACC-AAATAAC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-GTCT-A----CGCCTGCATATTT--AC-TTTGGCCAAGCTAGG-CCCCTGTCATATACA-CAT--TACCTACTCACATTTGCA-ATAG----G-GGGA-ATAATCTC-CAAT-ACGTCTAGACTCGTT---------T--T---------A----C--------TGGGAATG------AAACTCAATTG-A-GATTCAC-TTTTTGATGCATA-TTAAT-------A-T----GGTAAAT-TT---A-GT---C---TAGGT---TTGTTGTG-T--GTGTGTC-TGTGTC--TGTGT
gi|140085                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      ----TT-TT--A-A-A-GAAA------TGGC------------AG-AATACC-TCAGAGC--T-C-TT---A-TC---AAA---T-TTCT-A----GACCTGCAG-TTT--AC-CTTGACCAAGTTAGG-CCACTGTCATACACA-CAC--TACCTACCCAAATTCGCA-GGAGTGTAG-AGGG-ACACTCT--------------GGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGACGTA------AAACTCGATTA-A-AATTATT-ATTTTAATACATC-T---TTTGTTACA-T----AG----T-TT---A-AT---CT--TAAGT---TTCT-----T--GCGTGTC-TGTGTGTTTGTGTTT
gi|140086                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          tT-TT--A-A-A-TATA--T--ATGGC------------GG-AGTACC-TCAGAGC--C-C-AC---A-TTT--AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAAGTTT--AT-ACTGACCAAAATAGG-CCGCTGCCATACACA-C----CTTCTTCTCACATTTGCA-G---TTATG-GGGTTACACTCTC-CACT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--A---------A----C--------TGGTAGTG------AAACTCGATTG-A-GGTTCAC-TTTTTAATACATC-T---T-------G-T----GG----T-TT----------------AAT---TTTT-----T--GTGAGTC-TGTGT
gi|140087                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAG-GC--C-C-TC---A-TC---AAA---T-TTCT-C----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGATAAAGCTAGA-CCTCTGCCATACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140088                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGA-C--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTCT-A----GGCCTGCAGGTTT--AC-TTTGATTTAGCTAGA--CATTGCCGCACAAA-CAC--TGTCTACTCACATTTACA-GGA
gi|140089                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAG-GC--C-C-CC---A-TC---AAA-A-T-TTTTTA----GGCCTGCATGTTT--AC-TTTGATCAAGCTAG------------ACACA-CAC--CACCTACTCACATTTGCA-GGA
gi|140090                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TT---AAA-A-A-TTCT-A----GGCCTACAGGTTT--TC-TTCCACCAAGCTAGG-TCCCTGTCAAATACA-CAC--CACCTACTCAAATTTGCA-GGAG-GGTG-GAGA-AATTTACC-CGTT-GCGTCATGGCTCGTT---------G--A---------A----C--------TGGGAATG------AAACTCTATTG-A-GTTTCAC-CTTTTATTACATC-T---T---------T----GG----T-TT---A-GT---CT--T-AGT---ATAT-----A--GTGTGT-----GTG--TATGTTT
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AAA-A-T-ATTT-A----GGCCTGTAGATTT--AC-TTCGACCAAGCTAGGTCCA-TGTCATACACA-CAC--CACCTACTCAAATTTGCA-AGAGGGGTG-GGGG-AAACTCTC-CTC
gi|140091                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTCGATTG-A-GATTCAC-CTTTTAATACATC-T---T-------A-T----GG----T-TT---A-GT---CT--TATGT---ATAT-----T--GTGTGTT-TGTATG--TTTCTTTgattgagattcaccttttaatacatcttatggtttagtcttatgtatattgtgtgtttgtatgtttcttt
gi|140092                     :                                                                                                                                                                                                                                                            aaaatatttaggcctgtagatttacttcgaccaagctaggtccatgtcatacacacaccacctactcaaatttgcaagaggggtgggggaaactctcTCT-A----GCCCTGCAGGTTT--AC-TTCGACCAAACTAGG-TCCCTATTATACACA-C----CACCTACT-----TTGCA-GGAGGGGTG-GGGG-ACACTCTC-CGTT-ACGTATTGGCTCGTT---------G--A---------A----C--------TTGGAATG------AAACTCGATTG-A-GGTTCAC-CTTTTAATACATT-T---A-------A-T----GG----T-TT---A-GT---CT--TAAAT---ATAT-----A--TTGTGT-----GTG--TATGTTT
gi|140093                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAGCTAGG-CCGCTGCCATACACG-CAC--CACCTAATCACATTTGCAGGGGGTGGGG-GGGG-GCACCCTT-CACA-ACGTCTTGGCTCGCA---------G--T---------A----C--------TGG
gi|140094                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACACACA-CACA-CACCTACTCACACTTGTT-GAAG-G--G-GGAA-ACACTCTC-TCCT-ATGTCTTGGCTTGTG---------C--T---------A----A--------AGGAAGTG------AAACTTGGTTG-A-GGTTCAT-TCTTAAATACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CCAAGAAGT---TTGTGGAAGT--GTGTTTC-T
gi|140095                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTCAAATTTGCA-CGAGTGTTG-GGGG-ACACTCTC-GTCT-ACGTCTTGGCTCGTA---------G--T---------A----C--------TGGAAGTG------AAACTCGATTA-A-GATTCAC-TTTTTAACACATT-T---T-------A-T----AG----T-TT---A-GT---CT--TACGT---TTCT-----T--GTGTGTC-TGCGTG--TGTGTTT
gi|140096                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacG-GGTA-ACACTCTC-CACT-ACCTCTTGACTAGTA---------G--T---------A----C--------TGAGAGTG------AAACTTTATTA-A-TGTTCAC-TTTCTA----ATC-C---T-------A-T----------T-CT-----GT---C---TAAGA---TACT-----T--G
gi|140097                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-ACACTCTC-CCCT-ACGTTTCCACTCACATTGCATGGTG--T---------A----C--------TGGATTTG------AAACTCT-TTG-A-TATTTAC-TTTTAAACACATC-T---G-------A-G----TG----T-TT---T-GT---CT--T
gi|140098                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACACTCTC-CCCTCACATCTAGACTCGCA---------G--T---------A----CGTAGGTAACAGGTATG------AAACCCGGTGG-A-GGTTCAC-TTTTTAATACAAT-T---T-------A-T----AG----TGTT---T-GT---T-------T---TTTT-----T--GTTTGT
gi|140099                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -ACACCCTTTCTC--ACATTTTGGCCCGCA---------G--T---------G----TA-------TGAGGTTATGTTATGAACCCAATGG-A-AGATCAT-TTTTTAGTACATC-T---T-------A-T----AG----T-TT---T-TT---CT--TGAGT---
gi|140100                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-GCGTTTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC--------------------------------------------TAAGT---GTGTG----T--GTGTATG-TGCGTG--CGTG
gi|140101                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------GCGT---------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTATAAATACATT-T---
gi|140102                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------CTACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTGAATACATC--------------------------------------------TAAGTG--TGCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140103                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACCCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------CTACTCG-TTG-AAGATTCGC-TTTTGAATACAT--T---T-------A------AG----T-GT---ACGT----------GTG--TGCA-----T--GCGTG---CGCGTG--TGTGTTT
gi|140104                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACATCTTGTCTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACACGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-GTGCCA-G----CG--TGCG----TGCG-----T--GTGTGTG-TGCGTG--CGTG
gi|140105                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGCCTTGACTCGCA---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------ATA-TCGTTGG-A-GATTCAT-TTTTAAATACATC-T---
gi|140106                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTT-ATTACATC-T---C-------A-------G----T--------GT----------GT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140107                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CCCT-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTAG-A-TATACGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-GC---G-GTGTGCG--TGCG----TGCG-----T--GTGTAGG-TGCGTG--TGTGgtgtgtgtgtgttt
gi|140108                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGTCTTGACTCGCG---------G--TGA-------A----C--------TGGGTTTG------AAACTC-ATTGGA-GATTCGC-TTTTAAATA
gi|140109                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT--CGTCTTGACTCTCA---------G--TGT-------A----C--------TAGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC-----T-------A------AG----T-TT-----GT---GTG-TGCGTGCGTCCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140110                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TC-CTTT-ACGCCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTCAAATACATC-
gi|140111                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-CTC--ACGTCTTGACTTGTA---------G--T---------ATAAAC--------TGGGTTTG------ATACACGTTGG-A-GATTCGC-TTTTAAATACATC--------------------------------------------TAAG----TGCG-----T--GCGTGCG-TGCGTG--CGTG
gi|140112                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-ACGTCTTGACTCGCA---------G--TGT-------A----C--------TGGGTTTG------ATACTCGTTGG-A-GATTCGC-TTTTGAATACATC-----T-------A------AG----T--------GTG--CG--CGCGT---GTGTG----T--GTGTGTG-TGTGTG--TGTGT
gi|140113                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A---------G--T---------A----C--------TGGGAGTG------AAACTCTTTTA-A-GATTCAC-TTTTTATTACATC-T---T-------A-T----AG----G-TT---A-AT---CT--CAAGT---TTCT-----TGTGTGTGTC-TGC