lowQualScore : 6 0 0 0 6 0 222 1 0
lowQualScore : . . . . . . ... . .
lowQualScore : 0 7 6 6 4 6 777 3 6
consensus : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( gi|43066 ) : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067 : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43069 : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070 : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071 : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072 : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43068 : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43073 : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074 : GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075 : GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076 : GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077 : GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078 : CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43081 : AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082 : AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083 : AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43085 : AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084 : AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43079 : AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43087 : aAAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43086 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43089 : AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43088 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43080 : AAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090 : AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43092 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093 : AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43096 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43094 : AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43097 : AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43099 : AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100 : AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103 : AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43113 : AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43105 : AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43104 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43114 : AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43106 : AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43109 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43108 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43110 : AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43115 : AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43117 : AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43091 : AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116 : AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43118 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43098 : AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43119 : AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120 : AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43107 : AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43121 : AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43095 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43122 : A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123 : -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124 : -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125 : TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126 : TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127 : CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 222 1 0
lowQualScore : . . . . ... . .
lowQualScore : 7 6 6 6 666 3 6
consensus : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( family-406 ) : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43066 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067 : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43068 : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43069 : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070 : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071 : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072 : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43073 : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074 : GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075 : GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076 : GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077 : GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078 : CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43079 : AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43080 : aAAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43081 : AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082 : AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083 : AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084 : AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43085 : AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43086 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43087 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43088 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43089 : AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090 : AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43091 : AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43092 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093 : AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43094 : AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43095 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43096 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43097 : AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43098 : AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43099 : AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100 : AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103 : AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43104 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43105 : AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43106 : AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43107 : AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43108 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43109 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43110 : AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43113 : AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43114 : AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43115 : AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116 : AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43117 : AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43118 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43119 : AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120 : AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43121 : AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43122 : A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123 : -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124 : -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125 : TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126 : TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127 : CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 222 1 0
lowQualScore : . . . . ... . .
lowQualScore : 7 6 6 6 666 3 6
consensus : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( family-406 ) : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43066 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067 : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43068 : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43069 : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070 : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071 : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072 : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43073 : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074 : GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075 : GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076 : GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077 : GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078 : CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43079 : AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43080 : aAAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43081 : AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082 : AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083 : AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084 : AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43085 : AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43086 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43087 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43088 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43089 : AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090 : AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43091 : AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43092 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093 : AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43094 : AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43095 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43096 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43097 : AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43098 : AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43099 : AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100 : AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103 : AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43104 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43105 : AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43106 : AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43107 : AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43108 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43109 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43110 : AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43113 : AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43114 : AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43115 : AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116 : AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43117 : AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43118 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43119 : AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120 : AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43121 : AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43122 : A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123 : -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124 : -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125 : TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126 : TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127 : CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
blockSeqs : ATG A
blockSeqs : AA A
blockSeqs : A .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
finalCons : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 222 1 0
lowQualScore : . . . . ... . .
lowQualScore : 7 6 6 6 666 3 6
consensus : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( family-406 ) : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43066 : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067 : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43068 : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43069 : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070 : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071 : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072 : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43073 : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074 : GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075 : GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076 : GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077 : GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078 : CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43079 : AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43080 : aAAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43081 : AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082 : AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083 : AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084 : AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43085 : AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43086 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43087 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43088 : AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43089 : AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090 : AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43091 : AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43092 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093 : AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43094 : AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43095 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43096 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43097 : AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43098 : AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43099 : AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100 : AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102 : AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103 : AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43104 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43105 : AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43106 : AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43107 : AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43108 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43109 : AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43110 : AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43113 : AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43114 : AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43115 : AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116 : AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43117 : AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43118 : AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43119 : AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120 : AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43121 : AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43122 : A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123 : -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124 : -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125 : TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126 : TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127 : CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT