lowQualScore                  :                    6        0          0        0      6       0  222 1  0   
lowQualScore                  :                    .        .          .        .      .       .  ... .  .   
lowQualScore                  :                    0        7          6        6      4       6  777 3  6   
consensus                     : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( gi|43066 )        : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43069                      : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070                      : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071                      : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072                      : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43068                      : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43073                      : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074                      :  GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075                      :  GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076                      :  GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077                      :                     GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078                      :                      CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43081                      :                          AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082                      :                          AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083                      :                          AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43085                      :                          AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084                      :                          AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43079                      :                          AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43087                      :                         aAAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43086                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43089                      :                          AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43088                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43080                      :                          AAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090                      :                           AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43092                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093                      :                           AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43096                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43094                      :                           AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43097                      :                           AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43099                      :                           AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103                      :                           AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43113                      :                           AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43105                      :                           AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43104                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43114                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43106                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43109                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43108                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43110                      :                           AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43115                      :                           AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43117                      :                           AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43091                      :                           AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116                      :                           AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43118                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43098                      :                           AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43119                      :                           AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120                      :                           AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43107                      :                           AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43121                      :                           AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43095                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43122                      :                            A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123                      :                             -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124                      :                             -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125                      :                               TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126                      :                               TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127                      :                                CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT





Alignments
lowQualScore                  :                             0          0        0              0  222 1  0   
lowQualScore                  :                             .          .        .              .  ... .  .   
lowQualScore                  :                             7          6        6              6  666 3  6   
consensus                     : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( family-406 )      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43066                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43068                      : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43069                      : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070                      : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071                      : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072                      : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43073                      : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074                      :  GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075                      :  GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076                      :  GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077                      :                     GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078                      :                      CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43079                      :                          AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43080                      :                         aAAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43081                      :                          AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082                      :                          AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083                      :                          AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084                      :                          AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43085                      :                          AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43086                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43087                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43088                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43089                      :                          AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090                      :                           AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43091                      :                           AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43092                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093                      :                           AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43094                      :                           AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43095                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43096                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43097                      :                           AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43098                      :                           AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43099                      :                           AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103                      :                           AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43104                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43105                      :                           AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43106                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43107                      :                           AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43108                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43109                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43110                      :                           AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43113                      :                           AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43114                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43115                      :                           AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116                      :                           AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43117                      :                           AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43118                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43119                      :                           AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120                      :                           AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43121                      :                           AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43122                      :                            A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123                      :                             -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124                      :                             -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125                      :                               TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126                      :                               TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127                      :                                CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT





Alignments
lowQualScore                  :                             0          0        0              0  222 1  0   
lowQualScore                  :                             .          .        .              .  ... .  .   
lowQualScore                  :                             7          6        6              6  666 3  6   
consensus                     : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( family-406 )      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43066                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43068                      : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43069                      : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070                      : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071                      : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072                      : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43073                      : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074                      :  GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075                      :  GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076                      :  GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077                      :                     GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078                      :                      CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43079                      :                          AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43080                      :                         aAAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43081                      :                          AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082                      :                          AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083                      :                          AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084                      :                          AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43085                      :                          AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43086                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43087                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43088                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43089                      :                          AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090                      :                           AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43091                      :                           AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43092                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093                      :                           AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43094                      :                           AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43095                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43096                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43097                      :                           AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43098                      :                           AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43099                      :                           AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103                      :                           AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43104                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43105                      :                           AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43106                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43107                      :                           AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43108                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43109                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43110                      :                           AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43113                      :                           AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43114                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43115                      :                           AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116                      :                           AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43117                      :                           AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43118                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43119                      :                           AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120                      :                           AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43121                      :                           AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43122                      :                            A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123                      :                             -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124                      :                             -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125                      :                               TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126                      :                               TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127                      :                                CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT


blockSeqs                     :                                                                   ATG A
blockSeqs                     :                                                                   AA  A
blockSeqs                     :                                                                   A   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .
blockSeqs                     :                                                                   .   .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
finalCons                     : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT





Alignments
lowQualScore                  :                             0          0        0              0  222 1  0   
lowQualScore                  :                             .          .        .              .  ... .  .   
lowQualScore                  :                             7          6        6              6  666 3  6   
consensus                     : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
Reference ( family-406 )      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43065                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGGGCAGAAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43066                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTCGAGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGCGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43067                      : GGGGTCTTGGTTGGGCTTGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TTT
gi|43068                      : GGGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGAAAA-TTTCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-AT-TTT
gi|43069                      : GGGATCTTGGTTGGACTAGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---TATT-TTT
gi|43070                      : GGGGTCTTGAT-GGGCTCGGGCAGGAAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGACAGTGATGTAA-AC---T-TTATTT
gi|43071                      : GGGATTTTGGTTGAGCTCGGGCAGGTAA-GTCCATTGGA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43072                      : GGGGTCTCGGTTGGACTCAGGCAGGAAA-GTTCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATTTAA-AC---TATT-TTT
gi|43073                      : GGGGCCTTGGTTGGGCTCTGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTC-A-GGTCATTGATGAAA-AC---T-TT-TTT
gi|43074                      :  GGGTCTTGGTTGGACTCGGGCAGGGAA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTTAGTTATATAA-AC---C-TT-TTT
gi|43075                      :  GAGTCTTGGTTGGGCTCAGGCAGGAAA-GTCCATTTAA-TAGGTCAT-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43076                      :  GGGTCTTGGTTGGGGTCGGGCAGGAAA-GTGGATTAAA-TAGGTTAA-AGTCAGTGGTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43077                      :                     GCAG-AAA-CTC-ATTAAA-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43078                      :                      CAAAAAATGTCCATTGTG-TTGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43079                      :                          AGA-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTTG-AT---T-TT-TTT
gi|43080                      :                         aAAA-G--CATGAAAGTAGGTCAA-GGTCAGTTATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43081                      :                          AAA-ATCCATTTAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43082                      :                          AAT-GTCGATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43083                      :                          AAA-GTCCACAAAG-TAGATCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43084                      :                          AAA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGATGGTA-AC---T-TT-T
gi|43085                      :                          AAA-GTTCAGTAAG-TATGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43086                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTAAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-GTT
gi|43087                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-AT-TT
gi|43088                      :                          AAT-GTCCATTAAG-TAGGTCAT-GGTCAGTTATGTAA-AT---T-TT-TTT
gi|43089                      :                          AAA-GTCCATTAAA-AAGGTCAT-GGTTAAAGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43090                      :                           AA-GTACATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43091                      :                           AA-ATCTATTACG-TAGGTCAA-GGTCAGTGAAGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43092                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGTTGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43093                      :                           AA-GTCAATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT
gi|43094                      :                           AA-GTCCATTAAA-AAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-CT-TTT
gi|43095                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGAATTAA-AC---T-TT-TT
gi|43096                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-TGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43097                      :                           AA-GTTCATTAAG-CAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43098                      :                           AA-GTCCATTTAA-TAGATCAA-GGTAAGTGATATAA-AC---T-GT-TTT
gi|43099                      :                           AA-ATCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTCA-AC---T-TT-TTT
gi|43100                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGATAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-T
gi|43101                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-TCATGT-TT-TT
gi|43102                      :                           AA-ATCTATTAAG-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43103                      :                           AA-GCCCATTAAG-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTGA-AC---G-TT-TT
gi|43104                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGTCAGTAGTGTCA-AC---T-TT-TT
gi|43105                      :                           AA-GTCATTTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TA-TTT
gi|43106                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AT---A-TT-TTT
gi|43107                      :                           AA-GTCCATTATG-AAGGCCA--GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43108                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAA-GGTCAGTGTTGTAACAT---T-TT-TTT
gi|43109                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAAGTCAT-GGCCAGTGATGTTA-AC---T-TT-TTT
gi|43110                      :                           AA-GTCCATTGAA-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGTTA-ACA--T-TT-TTT
gi|43111                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAC-TGTCAGTGATGTTA-AT---T-TT-TTT
gi|43112                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTCAA-AGACAGTGATGAAC-AC---T-TT-TTT
gi|43113                      :                           AA-GTCCTTTTAA-TAGGTCAA-GGTCAGAGATATAA-AC---T-TT-TTT
gi|43114                      :                           AA-GTCCATTAAG-TAGATCAA-GGTCAGGGACGTAA-AC---A-TT-TTT
gi|43115                      :                           AA-GTCCATTAAG-TACTTCTA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43116                      :                           AA-ATCTATTGAA-TAGGTCAA-AGTCAGTGATGTTA-AC---T-TT-T
gi|43117                      :                           AA-GTCCAATAAA-TATGTCAA-GGTCAGTAATGTAA-ACAA-T-TT-TT
gi|43118                      :                           AA-GTCCATTAAA-TAGGTTAA-GGTGAATGATGTAA-AC---A-TT-
gi|43119                      :                           AA-ATTTATTCAA-TAGGCCAA-AGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TT
gi|43120                      :                           AA-ATCCATTAAG-TATGTCAA-GGACAGTGATATAA-AT---T-TT-TTT
gi|43121                      :                           AA-GTCCA--AGA--AGTTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43122                      :                            A-ATCCATGAAG-TAGGTCAA-GGTTAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43123                      :                             -GCCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGT-A-AC---T-TT-TT
gi|43124                      :                             -GTCCATTAAG-TAGGTCAC-GGTCAGTGATGT---AC---C-TT-TTT
gi|43125                      :                               TCCATTAAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43126                      :                               TTCATTAAT-TAAGTCAAAGGTCAGTGATGTAA-AC---T-TT-TTT
gi|43127                      :                                CCATTCAA-TAGGTCAA-GGTCAGTGATGTAA-AC---C-TT-TTT