lowQualScore : 2222222222 11111 11111111 1 11111 11 11 22222222 111 3
lowQualScore : 2222 111 0000000000 222222 111 111 1 111 2 22 2222 333333333 111 99 2 1 444 77 1 1 7777 0 1 0 555 44444 888888 333 22 2 1 66666666 3333 22 1 333 1 0 1 11 22 777777 33 0 1 1 5 1 1 0 3 22222 1 22 00000000 3333 2222 444444 3 1 0 66666 22 99 44444 3 33 7777777 1 4444 11 444 1 55555 11 1 2 2 0 77 333 1 22 11 1 9999999999999999 11 55 11 1 55 4 4 1 1 1 44 1 2 2222 0 1 3 33333 2 2 1 2 1 1 1 44 44 22 3 55555555 22 1 777 1 11 4444 0 3 3333 2 55 3
lowQualScore : .... ... .......... ...... ... ... . ... . .. .... ......... ... .. . . ... .. . . .... . . . ... ..... ...... ... .. . . ........ .... .. . ... . . . .. .. ...... .. . . . . . . . . ..... . .. ........ .... .... ...... . . . ..... .. .. ..... . .. ....... . .... .. ... . ..... .. . . . . .. ... . .. .. . ................ .. .. .. . .. . . . . . .. . . .... . . . ..... . . . . . . . .. .. .. . ........ .. . ... . .. .... . . .... . .. .
lowQualScore : 2222 888 8888888888 999999 888 888 0 777 9 66 0000 888888888 777 44 0 1 111 66 2 2 0000 3 4 4 000 55555 222222 777 99 0 7 66666666 7777 33 7 000 5 6 6 88 22 444444 55 9 7 7 8 7 7 2 3 00000 2 77 11111111 9999 4444 888888 1 7 0 00000 22 22 66666 2 55 3333333 8 3333 88 444 2 44444 77 2 8 4 4 44 333 2 99 77 2 2222222222222222 77 22 77 2 00 0 0 2 2 2 22 2 6 7777 2 9 6 99999 9 9 4 7 5 4 4 11 11 77 1 77777777 44 7 000 4 99 2222 8 1 3333 5 55 2
consensus : ATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTA--TCG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CNCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATN------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--TA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTNAGCGCG-CTAC-A-ATTC--G-TAC----GAAGACGNGTATGCAANAC-C--T-G-AC-ATTTCCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--GTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
Reference ( gi|112211 ) : ATTATTA----TTATT---AT---------AAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTA--TTG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--CA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--AGT-GTTTTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTT--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112175 : ATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATAA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TG---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGTGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTTGACGT-TA-GTA--TTG------TGGGAGAG-ATGAG-GTT-TTCCAAAC-AG-ATGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--CA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTCATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--ACT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTT--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112176 : attattattataATTATAA----TTATA---AT---------AAT------TATTA---TTATAATTATTATTG-TTATTATTATTATTATG---AT-TA--T----TG---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-AAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TT-GTA--TTG------TGGGAGAG-ATGAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--CA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TG--T---TT------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTT--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112178 : attattattATTATAA----TTATA---AT---------AAT------TATTA---TTAT---AATTATTA-TTGTTATTATTATTATTGTGAT-TA--T----TG---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-------------------------------------------GT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TT-GTA--TTG------TGGAGGAG-ATGAG-GTT-TTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--CA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTT--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112179 : attattattATTATTA----TTATT---AT---------AAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TATGATTATTGTT---AT--T-TA-CAAGTCTATA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTA--TTG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GACGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--CA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTT--G-TAC----GAAG
gi|112180 : attATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATA---A---G--T----CA---------TT---AT--T-TA-CAAGTTTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTATTTTT------TGGGGGAG-ATTAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--TA-T-ATTAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACC---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTC--G-
gi|112182 : attattattattattttattattATTATTA----TAATT---AT---------AAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TTGTTAT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGC-TTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTA--TTG------TGGGAG
gi|112184 : attattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---A---T-TA-TAA--TTACA-----TC-A--C-ACTGTTGT-TA
gi|112195 : attataattatcATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATCA-TTATTGTTAATATTATT---AT-TA--C----TA---------TT---AT--T-TA-CAAAACTAAA---T-TT-ATTT-AGCACTGT-T
gi|112210 : attatcttcataattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---A---T-TA-TAAG-CTA
gi|112205 : tATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTATTTTTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---ATTAT-TATCAAAT------GTT-TT-AT-C-ATCATTAT-T-----ATTA-----GTTTT
gi|112187 : ttATTATTA----TTATT---AT---------CAT------TATTA---TTAT---TATTATTG-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---ATTAT-TA------TTACA-----TT-A--C-AATGTT
gi|112186 : attattATTATTA----TTATT---AT---------CAT------TATTA---TTAT---TATTATTG-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---ATTAT-TA------TTACA-----TT-A--C-AATGTTtcacttt
gi|112185 : attattattATTATTA----TTATT---AT---------CAT------TATTA---TTAT---TATTATTG-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---ATTAT-TA------TTACA-----TT-A--C-AATGTTtcac
gi|112206 : attattattattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---CATTATTA-TTATTATAATTGTCATT---AT-TA--T----TA---------TT---ATCAT-TA-TTATTAT-CA-GTA-TT-AT-C-AGTATTGT-TA
gi|112194 : ttATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---CATTATTA-TTATTATAATTGTCATT---AT-TA--T----TA---------TT---ATCAT-TA-TTATTAT-CA-GTA-TT-AT-C-AGTATTGT-TAtcatcattattattataattgttattattattattatta
gi|112183 : ATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTAATTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T----CAAATCT
gi|112188 : attattattattATTATTA----TTATT---ATTNNNNNNN-NNN------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-TA--------AC--GTT-TT-A----AATGTTAT-T-G---ATAA-----
gi|112203 : attattattattattATCATCA----TCATC---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATCATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--TATG-TAAATA-ACA-AC---T-A----AGCAATGTATGG---ACAA-----ATT
gi|112208 : atcatcatcatcATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AN--N-NN-NNNNNNTA
gi|112200 : tcattattaatATTATTA----TTATTTTCAT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTT-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---GTCAT-TA-CTATTGT-CA-TTT-TT-AT-T-ATTGTTGT-T
gi|112209 : attataatcATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-TG-CA--TTTGCA---T-TT-A--
gi|112196 : attattATTATTA----TTATT---ATTNNNNNNNNNNT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-TA-TATATTTATA-
gi|112199 : attattattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--TATA-C
gi|112202 : attactattattATTATTAAGAATTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTGTTA-TTATTATTATTATTATT---GT-TA--T----CA---------TT---AT--T-AA-CAA----ACATACTATT-A----AACTTTGA-TAG---ATA-------TTATTATCATGAGT---TTTATCATTATT-
gi|112201 : attattattactATTATTA----TTATT---AN---------NNNNNNNNNTATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T------AGT------GTT-TT----T-ATTATTAT-TATT--ATAATTATTGTTATT------AGT---TT--TTATTACT-
gi|112192 : attattattattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-
gi|112191 : attattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-at
gi|112190 : attattattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-
gi|112189 : attattattattATTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-
gi|112204 : attattattattTTGTTG----TTGTT---GT---------TGT------TGTTG---TTGT---TGTTGTTG-TTGTTGTTGTTGTTGTT---GT-TA--TAGGTCA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--T-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTA--TTG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAACAAGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--TA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AAGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-AT-T-TT-TT--T---TGATTTTTG-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTC--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAAAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--ACG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTACTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTCGTATTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112193 : ttgttgttgttgTTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---A---T-TA-TGAA---AC---CT-TG-A--C-ATCGATAT-TAATTTATAA-----ATTTAC------AAT---TT----ATAATT-A-ATGGTAATGAACGCCATTTTACT--------GTTTTAT-ATATCTACGTACGGCCT
gi|112207 : attattgttgtttttTTATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---A-----TA-CCAATTTA-A------T-A--T-AGCATTAT-T
gi|112198 : ttatttatTTGTTG----TTGTT---GT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---A---T-TA-CATGTAT-CA------T-A--CTATTATTGT-T-----ATTA-----GTGTTT------AGTTCCTT--TTATTATT-A-
gi|112181 : attgttgttgttgATTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATC---AT--AGGT----CA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTTT-----AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAGTTTAGACGT-TA-GTA--TTGAGGGGGTGGGGGGGGATGAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATT------TGA--AAGAT-T--AATG------CGAG-AAGTA-TAGC---GC--GTT-CGA--TA-T---------TA--G----GACAGACA----AGGAGGTAATGTTTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGAAGAATTTTA-CAA-----A--T-TTGTC--T---TG------
gi|112212 : attattattattattatnnnnnnnnnnATTA----TTATT---AT---------TAT------CATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---A---T-TA-CATGTCCAttaaacagtttatgtttca
gi|112197 : TTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---GT-TG--T----CA---------TT---TC--T-TA-CTTGT-TGCC-CCT-TTCA--C-AGC-TT-T-T-----ATAA-----TGGCTT------AAT---TT--TTTTTA---A-A--------AACAT----TTATTGG--A-
gi|112214 : attattattattattattattattnnnnnnnnnnTA----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------T
gi|112213 : A----TTATT---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---ATACA--T----CA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTAAA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACAT-TT-GTA--TTG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CACCAAAG-AG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGTGCATATG------TGA--AAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGG--TA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CATGTAC-ACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TT------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTC--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTGTTGTGCCTGCGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATTagccatcacagctaattttgggcgtcaattatctgagtgtataatctttcgtgatactctatactc
gi|112177 : ---AT---------TAT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---ATACA--T----CA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTAAA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACAT-TT-GTA--TTG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CACCAAAG-AG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGTGCATATG------TGA--AAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGG--TA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CATGTAC-ACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TT------G-A--A--TA--AGT-GTTGTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTC--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTGTTGTGCCTGCGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112174 : AT------TATTA---TTAT---TATTATTA-TTATTATTATTATTATT---AT-TA--T----TA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAA-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGT-TA-GTA--TTG------TGGGGGAG-ATGAG-GTT-CTCCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATA------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CGA--CA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TG------G-A--A--TA--AGT-GTTTTTTCAGCGTG-CTAC-A-ATTT--G-TAC----GAAGACGAGTATGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCCTGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAA-AC-GG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112215 : ATTATTATTAGT---ATAGA--T----CA---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-------------------AG---ATAA-----GTTTTA------AGG---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGA----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGAACAGCATTAAAAATTTCGACGT-TT-GTA--TTG------TAGGGGTG-GTGAA-GAT-CACCAAAG-AG-AAGTGTGT-T----GAGGGCAAT-AGTGCATATG------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGC---CC--GTT-CGG--TA-T-GATAA--ATA--G----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CATGTAC-ATAGTAGAGAATTTT--CAG---T----T-TT-TT--T-------------A--A--CA--AGT-GTTGTTTCAACGTA-CTAC-A-ATTC--G-TACTTGTGTAGA--AGTAT------T-T--T-G-AT-GTT---TTG-------GT-AA-----------G--AT--T-TTT----------ATTT------------AACTGGTGCTTAAA-AGC----ATTGATAGAA-AC-GGCTCGTCTTGTTTCAGTAGGTAGATT
gi|112216 : ATTGTTATT---AT--AGGT----CG---------TT---AT--T-TA-CAAGTCTACA-GCT-TT-A--C-AGCGTTGT-TAG---ATAG-----GTTTTT------AGT---TT--TCGTTATTAA-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAATTTCGACGT-TT-GTA--TTG------TG
gi|112217 : CT-CT-C--C-AGCATTGA-TAG---ATAA-----GTTGTT------AGT---TT--TCGTTATT-T-A--------AACGC----TTACTCG--A-GAG---TAT-GTATTTGTGGACAGCACTAAAAATGTCGACGT-TA-GTA--TTG------TGAGGGAG-ATGAA-ATT-CACAAAAG-GG-AAGTGAGT-T----GAGGGTAAC-AGTGCATATG------TGA--GAGAT-T--GATG------CGAG-AAGTG-TAGG---GC--GTT-CGG--TA-T-GATAA--ATA--G----TACAGACG----AGGAGGTAATGATTTATACT---TTCAATTGC---TCCG--CATGTTC-ATAGTGGAGAATTTT--CGA---T-A--T-TT-TTG-T---TT------T-A--A--TA--AAT-GTTCTTTCAGTGTG-CTAC-A-ATTC--G-TAC----AAAGACGAGTAGGCAAGAC-C--T-G-AC-ATTTTCTTGTGCATGTGT-AAAAGTGTTTT--G--ATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-A---AGCTGGTGCTTAAA-
gi|112218 : TT-AGA--------AACGA----TTGCTAGCCA-TAA---TAA-ATATTTGC--ACAGTTTCAAAATTATTGTTAT-TT-GTT--TCA------TGGGGAAG-CAAAGCGTTGCT---ATGTAA-AATTTTATAT----AAAGATA-------C-TGTA------GGG--GAGATAT--GGTA------TTAA-AAGTT-CTTC---GC--GTC-TGT--C--T-G-TGA--GTAAGG----GACAGGTG----TGAAAGTAGTGGTATGTATC---TGCCATAGT---TTCA--CATCGGC-A--GTGCAGAGATTCGATAA---T-A--T-TT-TT--T---TA------A-A--AAATA--GGT-GGTGATTAAGAGTG-CTAC-A-TTTA--G-TGC----GAAGTTTTGCATG-AAGATGC--T-G-GG-CTCTTCTGGAGTCGGTAT-AAAAGTATTTTTGG--AC--T-TTCACT--AAG---TTTCT--GTT-T---AAATAGAGTTTGAA-CGA----ATTGA
gi|112220 : -A--------AACGA----TTAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACAT-TA-TTG--TCA------TAAGAGAG-TTGTG-GTT-CACCAAAA-AG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGTACATAAC------TCA--CTGAC-A--GATG------CCAG-GAGTGGTAA----GC--GTT--GA--TGCT-GGTAA--AGG--T----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CATGTAC-ACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-TT--A---AG------A-A--A--TA--GAT-GTTGCTTAAGTGCA-CTAC-A-ACTC--G-TTC----GGAGGCGGGCATGCAATAA-T--T-G-GC-ATTTCCTTGTACCTATGT-AATAGAATTTA--G--ATACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAA-GA-GGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112221 : -A--------AACGA----TTAGTAG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACAT-TA-TTG--TCA------TAAGAGAG-TTGTG-GTT-CACCAAAA-AG-GAGTATAT-T----TAAAGAAAC-CGTACATAAC------TCA--CTGAC-A--GATG------TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--GA--TGCT-GGTAA--AGG--T----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTTTTTG---TCCA--CATGTAC-ACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-TT--A---AG------A-A--A--TA--GAT-GTTGTTTAAATGCA-CTAC-A-ACTC--G-TTC----GGAGGCGGGCATGCAATAA-T--T-G-GC-ATTTCCTTGTACCTATGT-AAAAGAATTTA--G--GTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACT-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAA-GA-GGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112222 : -A--------AACGA----TTAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACAT-TA-TTG--TCA------TAAGAGAG-TTGTG-GTT-CACCAAAA-AG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGTACATAAC------TCA--CTGAC-A--GATG------TCAG-GAGTGGTA-T---AC--GTT--GA--TGCT-GGTAA--AGG--T----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CATGTAC-ACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-TT--A---AG------A-A--A--TA--GAT-GTTGCTTAAGTGCA-CTAC-A-ACTC--G-TTC----GGAGACGGGCATGCAATAA-T--T-G-GC-ATTTCCTTGTACCTATGT-AATAGAATTTA--G--GTA-TGTTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAA-GA-GGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112223 : -A--------AACGA----TTAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACAT-TA-TTG--TCA------TAAGAGAG-TTGTG-GTT-CACCAAAA-AG-AATTATAT-T----TAAAGAAAC-TGTACATAAC------TCA--CTGAC-A--GATG------TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--GA--TGCT-GGTAA--AGG--T----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CATGTAC-ACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-TT--A---AG------A-G--A--TA--GAT-GTTGCTTAAGTGCA-CTAC-A-ACTC--G-TTC----GGAGGCGGGCATGCAATAA-T--T-G-GC-ATTTCCTTGTACCTATGT-AATAGAATTTA--G--GTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAA-GA-GGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112219 : -A--------AACGA----TTAGTGG--ATGAA----AT-GTATATGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACAT-TA-TTG--TCA------TACAG-AG-TTGCG-GTT-CACCAAAA-AG-AAGTTTAT-T----TAAAGAAAC-TGTACATAAC------TCA--CTGAC-A--GATG------TCAG-GAGTGGTA-T---GT--GTT--GA--TGCT-GATAA--AGG--T----GACAATTG----AGAAAGAAGTGCGCTGAACT---TTCTATTTG---TCCT--CATGTAC-ACAGAAGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-TT--A---AG------A-A--A--TA--GAT-GTTGCTTAAGTGCA-CAAC-A-ACTC--G-TTA----GGCGACGGGCATGCAATAA-T--T-G-AC-ATTTCCTTGTACCTTTGT-TAAAGAATTTA--G--GTACT-TTTGGT--TCGTTACTTTTGAATT-T---A-----TGTTTAAA-AAC----ATTCAGAGAA-GA-GACTTGCCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112224 : ----TTTCTCG--A-CAA---GATGAT-TTTTTGGACAGTTTCGAAAATAGTAATGTCTATGTC--TTA------TGTAAGAT-TTGAG---T-TGCCAAAC-AATAAAT-TAT-T----TACAGACAC-AGCGTATA-A------TG-----GAT-TACGTTT------CCAC-AA----TAGCTCGGC--G---CGA---A-T-AATAAC-ATA--G----AACGGACATTTCAGAAAGAAATGATACGTACT---TTCGATACC---TCCA--CAAGTAC-AAAGGAGAGATTCAA--CAA---T-G--T-TT-TT--TA--TG------T-A--A--TA--GAT-TTTGGTTTAGAGAA-CTAC-A-ATTA--G-TAC----GT---TGTGTGTGCAGTAT-T--T-GTGC--TTTCCTTTTTCCCGAAT-AATAGTATTTT--G--GTA-C-TTTAGTTTATG---TCGTG--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-
gi|112225 : G--A-TAA---CAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATAGTTTAACAT-TA-TTG--TCA------TAAGAGAT-TTGCG-GTT-CACCAAAA-AG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGTACATAAC------TCACTGACAT-----ATG------TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--GATGCT-T-G-TAA--AGG--T----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAACTATACT---TTCTATTTG---TCCA--CATGTAC-ACAGAGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-TT--A---AG------A-A--A--TA--GAT-GTTGCTTAAGTGCA-CTAC-A-ACTT--G-TTC----GGAGGCAGGAAT-CAATAA-T--T-G-GC-ATTTCCTTGTAGCTATGT-AAAAGAATGTT--A--GTACT-TTTGGT--TAG----TTAT--ATT-CG--AGTTTATGTTTAAA-AGC----ACTCAGAGAA-
gi|112226 : AT-GTAATTGTGAACTGCATCAAAAAGATTAAC----A-GTA--TTGCCG---TAAGCGAG-AAGTG-GTC-CGCCGAAA-AG-AAGCATCT-TTTAAGAGGAT-----GTACATAAC------TGA--CTGGC-T--AGTG------TCAG-CAGTG-TTAC---GC--GTT--GC--CT-TTGATAG--AGT--T----GACACTTG----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATTTC---ACCG--CATATAC-GCAGAGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-TT--T---TA------A-A--A--AC--AG--ATTT----AGTAAG-CTAC-A-GTTT--G-TAT----GAAGACGAGCATGTAAAAT-T--T-G-AC-ATTTCCTTGTACCTGTGT-AGAAGAACTTT---------T-TATCAT--A------TTAC--ATTCT---AAATGGTGCTTAAATATT----ATTAA-AGAA-GT-AGCTTGTCTAGTTTCAAGTGGAAGATT
gi|112227 : AT-GTATTTGTGGACTGCTTCAAATATTTTAACAT-TA-TTT--TCA------TAAGAAAG-TTGCG-GTT-CGCCAAAA-AG-AAGTATAT-T----TAAAG--AC-GCTGTACATAACTCATTGA--CAG-T-T--G-TC------AGAGTAAGTA-T------GT--GTT-GAA--GT-T-GGTAA--AGG--T----GACAATTG----TGAAGGAAGTGAGCTGTGCT---CTCCATTTG---ACCA--CATATAC-ACAGAGGGGAATCTA--CGA---T-G-----T-GT--A---AG------A-A--A--TA--GAT-GTTGCTTAAGAGCA-CTAC-A-GCTC--G-TTT----GAAGGCGAATATGCAGTAG-T--T-G-AC-ATTTCCTTGTAACTATGT-AAAATAATTTT--G--GTACT-TTTGGT--------TCCTT--ACT-TTCAAGTTGGTGTTTGAA-AGC----ACTCAGAGAAGAA-GC-TTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112228 : AT-GTATTTGTGAACTG-TATCAAAAT------GT-T---TA--ACG------TAAGAGAA-AAGTG-GCT-CGCCGAAA-AG-AAGTATCTATAAA-GAGGAT-----GTACATAAC------TGA--CTGGC-T--AGTG------TCAG-CAGTG-TTAC---GT--GTT--GC--CT-TTGATAG--AGT--T----GACACTTT----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATT-----TCAAGGTATATAC-CCAGAGGAGAATTTT--CAA---T------TT-TT--T---AA------A-A--A--CA--GAT-GTTGCTTTAGT-------T-A-GTTT--T-TAC----GAAGACGAGCATGTTAAAT-T--T-G-AC-ATTTCCTTGTTCCTGTGT-AGAAGAACTTT--G--GTA-T-TTT--T--A--------TT--ATT-T---AAC
gi|112229 : T-CTCCAAAG-AG-AAGAATAT--------GGGTAGT-AATTCGCAGA------TGG--GGTGG-T--AATGATCTTTCGAG-TACTG-T-TC---ATTAGTTGCGA--TA-T-GA--G--ATG---------CA-ATGC---AGTAGAAAATGTTCTGCATC---TTCAATTTT---GCCA--CATATAC-AAAGAGGGGAA---A--CAA---TCA--TGTT-TT--C---TG------GAA--A--CA--GGT-CATTGTTAAGTGCA-CTGC-A-TTTA--G-TTC----GGAGACGTGTATGTAGAAC-T--T-G-AA-GTGTTCTTGTTCCAAAGA-GAAAATACTTT--G--
gi|112230 : --GTT-CGA-----T-GATTGTTATA--GTTTTGACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CATGTGC-ACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----TT--T---TG------G-AATA--TA--AAT-GTTGGTTAAGTGAA-CTAC-A-ATTTA-G-T-C----GTAGACGGGTATG
gi|112231 : ATAC--AAA--G----AACAAATG----AAGAGGTAATGATCTGTGTT---TTCTATTAA---TCCA--CATGCAC-AAAGTG--GGCTGTT--CAT---T-AAGT-TT-TTAGTGTATG------G-A--AGCTA--A--------TTAAG-ATGACTAC-A-GTAT--GCTAT-----AAGGCGAATGTGTTGGAT-C--T-GTGCTAATCTCT--TCCCTGCAT-AATAGTGTTTTTGG--A-G-TAATCGGT---CG--GTTGCT--ATT-G---AGTTTATTCTTAAA-AACTGTAATTGA
gi|112232 : AA--ATA--GTCT-G-CACATG----AATAAATAATGATATGTGTC---CTCAATTTC---ACCA--CAAAGAC-AATTTGGA---CTTG--CAAC--T-A--T-GT-TT--T---TATT----G-A--A--TA--AAT-GTTGATTCAAGTTA-CTGC-A-ATTT--G-TAC----GAAGTCGTGTATGATATAT-T--TGG-GC-AGTTCGGT-TTCCTGTAT-AATAATGATTT--GGAACC-T-TTTG
gi|112233 : --G----GACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CATGTGC-ACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----TT--T---TG------G-A--ATGTA--AAT-GTTGGTTAAGTGAA-CTAC-A-ATTTA-G-T-C----ATAGACGGATATG
gi|112234 : ----AAGAAATAGTGAGTTGCATT---TTCAGTCTCAATTCCA--CAATCAC-ACAGAGAGGAATTTCG-TAA-----A--T-GA-TT--T---AA------A-A--A--TA--AGTCGTTATTTAAGT-CG-CTAC-ACATGT----TAC----GCAAACGTGCATGTAAGAC-C----G-AC-A
gi|112235 : GAGGTAGTTA---GTACT---TTTAATTGC---TCCA--AATATAC-ATATTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TA-TT--A----G------A-A--A--CA--AAT-TTTGTTTAAGTGTA-CTAC-A-ATTC--G-TGT----GTAGACGAATATGCAAGAC-C--T-G-AC-ACTTTCCTGTGCATTTGTAAAAAGGGTTTT--G--GTG-T-TTTGTT--GAT--ATTTGC--ATT-T---ACATTATGCTTAAA-GGG----AATGATAGAG-TCTGT-TTGTTTTGTTTCGATTGGATGATT
gi|112236 : AGATAATGTTTCGCATC---TTCAATTGT---TCCG--CAAGCAC-ATAAAGGCATATCTA--TTA---T-A--T-TT-TA--T---TT------G-A--A--TACAGGT-GTTCTTTGATGTTG-CGAC-A-GTGT--G-TCC----AAAGACGTGTGTTGAGAAC-T--T-G-TA-ATTTTCTGTTACCTGTAT-AATAGTATTTT--G--GGA-T-TTT
gi|112237 : TAATGATATGTGTC---TTCAATTTC---ACCA--AAAAGAC-AATTTGGA---CTTA--CAACTAT-G--T-TT-TT--C---TT------G-A--A--TA--AAT-GTTGATTCAAGTTA-CTGC-A-ATTT--G-TAC----GAAGTCGTGTATGATATAT-T--TGG-GC-AGTTCGGT-TTCCTGTAT-AACAATGATTT--GGAACC-T-TTTG
gi|112238 : ---TCCA--CAAGTACCATGG-GGAGATTCAA--CAA---T-A--T-TT-TT--A---TG------A-A--A--TA--GGT-GTTGGTTTAGGGAA-CTACAA-ATTTTGG-TAT----GTAATCGTGCGTGCAGTAT-TTGT-G-CC-CTCCTATT-TCCCCGAGT-AGTAGTATTTT--G--GTA-C-TTTACT--TAT--ATCGCA--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-AGT----AGCCATAGAA-
Alignments
lowQualScore : 11111 11 22222222 111
lowQualScore : 1111 555555555 222222 111 888888888888 111 0 555555 1111 66 1 1 0 6666 777777 1 1 5555 1 1 333 1 555555 555 22 1 1 66666666 3333 1 22 1 222 1 0 0 22 444444 1 0 22 0 1 1 1 3 11111 22 22 666666 3333 44444 222 2 1 9 4 222 22 66 1 11 1 1 1 5555 1 4444 1 444 0 44444 11 1 0 0 88 333 1 22 11 1 1 9999999999999999 22 33 2 1 2 3 555 1 222 33 1 2 2222 1 2 22 2 4 11 1 2 1 0 2 9 3 00000000 22 1 666 0 1 4444 0 2 11 1
lowQualScore : .... ......... ...... ... ............ ... . ...... .... .. . . . .... ...... . . .... . . ... . ...... ... .. . . ........ .... . .. . ... . . . .. ...... . . .. . . . . . ..... .. .. ...... .... ..... ... . . . . ... .. .. . .. . . . .... . .... . ... . ..... .. . . . .. ... . .. .. . . ................ .. .. . . . . ... . ... .. . . .... . . .. . . .. . . . . . . . ........ .. . ... . . .... . . .. .
lowQualScore : 9999 000000000 444444 444 111111111111 444 8 444444 7777 55 6 1 9 4444 333333 2 2 6666 3 4 000 8 888888 555 88 9 6 00000000 4444 6 22 6 999 5 2 9 11 444444 5 2 33 5 7 0 6 2 11111 77 22 777777 4444 22222 888 6 6 6 9 888 11 66 5 99 5 4 4 3333 4 2222 3 222 9 77777 66 2 6 6 88 222 2 88 44 2 2 3333333333333333 88 22 4 2 4 3 777 2 111 88 2 2 7777 5 3 77 8 1 99 4 0 4 2 9 6 2 00000000 33 7 222 9 7 0000 3 4 99 0
consensus : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
Reference ( family-398 ) : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
gi|112174 : AT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TT-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112175 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATAA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGTGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTTGACGTTAGTA--TT------GT-GGGAGAGAT--GAG-GTTTTCCAAACAG-ATGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTCATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAACT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112176 : attattattataATTATTA----TAAT---------TATAATAATTAT---T------------ATTA---TAATTATTATTG-TTATTATTATTATTATGAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-AAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-GGGAGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-G--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112177 : attattAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTATA-----CAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TAAA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACATTTGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--AAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CAT-GTACACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTGT-TGTGCCTGCGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112178 : A----TTAT---------TAT------TAT---TATAATTATAATAATTA---TTATTATAATTA-TTATTGTTATTATTATTATTGTGATTAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT----------------------------------------GT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-GGAGGAGAT--GAG-GTTTTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112179 : ATTATAA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATGAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TATA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GACGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAG
gi|112180 : attattattattA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATT----TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112180 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATAA--------GT----CATTAT--T-TA-CAAGT-T--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTATTTT------TT-GGGGGAGAT--TAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TAT-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACC---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-attattattattattataagtcattatttacaagtttacagctttacagcgttgttagataagtttttagttttcgttattaaaacgcttactcgagagtatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgttagtattttttgggggagattaggttctccaaagagaagtgtgtgaagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcgagaagtgtagcgcgttcgatatattaaataggacagacgaggaggtaatgatttgtaccttcaattgctccacatgtacatagtggagaattttcaatatttttttggaataagtgttgtttcagcgtgctacaattcg
gi|112181 : attattattattattttattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATCATAG--------------GT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAGTTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAGTTTAGACGTTAGTA--TTGAGGGGGTGGGGGGGGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TT--TGA--AAGAT--T--AATG---CGAG-AAGTA-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--T--------TAG----GACAGACA----AGGAGGTAATGTTTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGAAGAATTTTA-CAA-----A--T-TTGT-C--T---TGTT----A-A--A--C-AGT-TTATG-TTTCA
gi|112182 : attattattattattatnnnnnnnnnnattattATTATAA----TTAT---------AAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGC-TT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGAG
gi|112183 : attattattattAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAA--T-TA-
gi|112183 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTAATTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T----CAAAT-C--Tttattattattattattattattattcaaatct
gi|112184 : attattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TAA---T--TACA--------TC-A--C-ACTGTT-GT-TA
gi|112185 : attataattatcATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATCATTA-TTATTATTATTATTGTTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112185 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-attattattattattattattacattacaatgtt
gi|112186 : attattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TCATTATTATTA-TTATTATTGTTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112186 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-attattattattattacattacaatgtttcac
gi|112187 : attATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-tcac
gi|112188 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---TNNNNNNNNNNT-ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-----------AC--GT---T-TT-A----AATGTT-AT-T-G---ATAAtcacttt
gi|112189 : attattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112190 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112191 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112192 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112193 : TTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TGAA------AC---C---T-TG-A--C-ATCGAT-AT-TAATTTATAAA-TTTAC------AAT---TT----ATAATT-A-ATGGTAATGAACGCCATTT-TACT--------GTTTTAT-ATATCTACGTACGGCCTattattattat
gi|112194 : attattgttgtttttATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATCATTATTA-TTATTATAATTGTCATTAT------TAT----TATTATCAT-TA-TTATT-A--T-CA-GT---A-TT-AT-C-AGTATT-GT-TA
gi|112195 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATCA-TTATTGTTAATATTATTAT------TAC----TATTAT--T-TA-CAAAA-C--TAAA------T-TT-ATTT-AGCACT-GT-T
gi|112197 : attatcttcataattTTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTGT------TGT----CATTTC--T-TA-CTTGT----TGCC-CC---T-TTCA--C-AGC-TT--T-T-----ATAAT-GGCTT------AAT---TT--TTTTTA---A-A--------AACAT----T-TATTGG--A-
gi|112198 : attattattattattattattattnnnnnnnnnnTTGTTG----TTGT---------TGT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-CATGT-A--T-CA---------T-A--CTATTATT-GT-T-----ATTAG-TGTTT------AGTTCCTT--TTATTATT-A-
gi|112199 : attgttgttgttgATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--TATA-C
gi|112200 : attactattattATTATTA----TTAT---------TTT------CAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTTTTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112201 : attataatcATTATTA----TTANNNNNNNNNNTAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TAGTGT--T-Tgtcattactattgtcatttttattattgttgtt
gi|112201 : attattattattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTAGTGTTTTTAT------TAT----TATTAT--T-ttattattattattataattattgttattagtttttattact
gi|112201 : attattattattattattattattattannnnnnnnnntattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTAGTGTTTTTA-TTATTATTATTATAATTAT------TGT----TATTAG--T-Tataattattgttattagtttttattact
gi|112202 : attattattattattattattattattannnnnnnnnntattattattattattattattATTATTAAGAATTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTGTTA-TTATTATTATTATTATTGT------TAT----CATTAT--T-AA-CAA-------ACATAC---TATT-A----AACTTT-GA-TAG---ATA---TTATTATCATGAGT---TTTATCATTATT-tttattact
gi|112203 : attattattactATCATCA----TCAT---------CAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATCATTATTAT------TAT----TATTAT--TATG-TAAAT-A---ACA-AC------T-A----AGCAAT-GTATGG---ACAAA-TT
gi|112204 : atcatcatcatcTTGTTG----TTGT---------TGT------TGT---T------------GTTG---TTGTTGTTGTTG-TTGTTGTTGTTGTTGTTGT------TATAGGTCATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--T-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAACAAGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AAGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-AT-T-TT-T-T--T---TGATTTTTG-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAAAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--ACG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTACTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTATTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112205 : ttgttgttgttgATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTATTTTTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TATCAAAT---------GT---T-TT-AT-C-ATCATT-AT-T-----ATTAG-TTTT
gi|112206 : ttATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATCATTATTA-TTATTATAATTGTCATTAT------TAT----TATTATCAT-TA-TTATT-A--T-CA-GT---A-TT-AT-C-AGTATT-GT-TA
gi|112206 : ttATTATTA----TAAT---------TGT------CAT---T------------ATTA---TTATTATCATTA-TTATTATCAGTATTATCAG------TAT----TGTTAT--tcatcattattattataattgttattattattattatta
gi|112206 : ttattattattattattattattattatcattattATTATTA----TTAT---------TAT------CAT---T------------ATTA---TTATCAGTATTA-TCAGTATTGTTATCATCAT------TAT----TATTAT--catcattattattataattgttattattattattatta
gi|112206 : ttattattattattattattattattatcattattattattataattgtcATTATTA----TTATCAG------TAT------TATCAGT------------ATTG---TTATCATCATTA-TTATTATAATTGTTATTAT------TAT----TATTAT--T-aattgttattattattattatta
gi|112207 : ttattattattattattattattattatcattattattattataattgtcattattattattatcTTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA-----TA-CCAAT-T--TA-A---------T-A--T-AGCATT-AT-Ta
gi|112208 : ttatttatATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAN--N-NN-NNNNN-N--TA
gi|112209 : tcattattaatATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TG-CA--T-T--TGCA------T-TT-A--
gi|112210 : attattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TAAG--C--TA
gi|112211 : tATTATTA----TTAT---------TAT------AAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TT-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112212 : ATTA----TTAT---------TAT------TAT---C------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-CATGT-C--CA
gi|112213 : A----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTATA-----CAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TAAA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACATTTGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--AAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CAT-GTACACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTGT-TGTGCCTGCGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112214 : TAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT---------AGC-CATCACA-GCTAAT-TT-T--G-GGCGTCAAT-TAT---CTGAG-TGTAT------AATC--TT--TCGTGAT--------------ACTC----TATACTC
gi|112215 : ATTATTATTAGTATA-----GAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T--------------------AG---ATAAG-TTTTA------AGG---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGA----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGAACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-AGGGGTGGT--GAA-GATCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGCAAT-AGT--GCATA--TG--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---CC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTAGAGAATTTT--CAG---T------TT-T-T--T---T---------A--A--CAAGT-GT-TG-TTT----------CA-A-----C-G-TAC---------------TACAA---------------TTC----GTACTTGTGT-AGAAGTA-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AACTGGTGCTTAAA-AGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTCTTGTTTCAGTAGGTAGATT
gi|112216 : ATTGTTATTATA-----GGT----CGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAGG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATTAA-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-G
gi|112217 : C---T-CT-C--C-AGCATT-GA-TAG---ATAAG-TTGTT------AGT---TT--TCGTTATT-T-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-GTATTTGTGGACAGCACTAAAAATGTCGACGTTAGTA--TT------GT-GAGGGAGAT--GAA-ATTCACAAAAGGG-AAGTGAGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGG---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----TACAGACG----AGGAGGTAATGATTTATACT---TTCAATTGC---TCCG--CAT-GTTCATAGTGGAGAATTTT--CGA---T-A--T-TT-T-TG-T---TT------T-A--A--TAAAT-GT-TC-TTTCAGTGTGCTACA-A---TTC-G-TACA----AAGACGAGTAGGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCATGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-A---AGCTGGTGCTTAAA-
gi|112218 : TT-AGA--------AACGA----T-TGCTAGCCA-TAA---TAA-ATATTTGC--ACAGTTTCAAAATTATTGTTATTTGTT--TC------AT-GGGGAAGCA--AAGCGTT-GCTATGTAA-AATTTTATAT----AAAGATA---------C-TG--TA--GGG--GAGATA-T--GGTA---TTAA-AAGTT-CTTC---GC--GTC-TGTCTG--TGAGTAA-G--G----GACAGGTG----TGAAAGTAGTGGTATGTATC---TGCCATAGT---TTCA--CATCG---GCAGTGCAGAGATTCGATAA---T-A--T-TT-T-T--T---TA------A-A--AAATAGGT-GG-TG-ATTAAGAGTGCTACA-T---TTA-G-TGCG----AAGTTTTGCATG-AAGATGCT-G-GG--CTCTTCT-GGAGTCGGTAT-AAAAGTATTTTTGGAC-T-TTCACT--AAG---TTTCT--GTT-T---AAATAGAGTTTGAA-CGA----ATTGA
gi|112219 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--ATGAA----AT-GTATATGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-ACAG-AGTT--GCG-GTTCACCAAAAAG-AAGTTTAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GT--GTT--G-ATGC-TGA-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGCGCTGAACT---TTCTATTTG---TCCT--CAT-GTACACAGAAGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACAACA-A---CTC-G-TTAG----GCGACGGGCATGCAATAA-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTACCTTTGT-TAAAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--TCGTTACTTTTGAATT-T---A-----TGTTTAAA-AAC----ATTCAGAGAAGAGACTTGCCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112220 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---CCAG-GAGTGGTAA----GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGATACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112221 : -A--------AACGA----T-TAGTAG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-GAGTATAT-T----TAAAGAAAC-CGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTTTTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-TTTAAATGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AAAAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACT-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112222 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---AC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGACGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGGTA-TGTTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112223 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AATTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-G--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112224 : ----T-TTCTCG--A-CAA---GATGAT-TTTTTGGACAGTTTCGAAAATAGTAATGTCTATG--TC------TT-ATGTAAGATTTGAG---TTGCCAAACAATAAAT-TAT-T----TACAGACAC-AGC--GTATA---A--TG-----GAT--TACGTTT---CCAC-AA----TAGCTCGGC--G---CG-A-A--TAA-TAACATAG----AACGGACATTTCAGAAAGAAATGATACGTACT---TTCGATACC---TCCA--CAA-GTACAAAGGAGAGATTCAA--CAA---T-G--T-TT-T-T--TA--TG------T-A--A--TAGAT-TT-TG-GTTTAGAGAACTACA-A---TTA-G-TACG----T---TGTGTGTGCAGTAT-TT-GTGC---TTTCCT-TTTTCCCGAAT-AATAGTA-TTTTGGTA-C-TTTAGTTTATG---TCGTG--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-
gi|112225 : G--A-TAA---CAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATAGTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGATTT--GCG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCACTGACAT------ATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGCTTG--TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAACTATACT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGAGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTT-G-TTCG----GAGGCAGGAAT-CAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTAGCTATGT-AAAAGAA-TGTTAGTACT-TTTGGT--TAG----TTAT--ATT-CG--AGTTTATGTTTAAA-AGC----ACTCAGAGAA
gi|112226 : AT-GTAATTGTGAACTGCATCAAAAAGATTAACAGTATTG--CC------GT-AAGCGAGAA--GTG-GTCCGCCGAAAAG-AAGCATCT-TTTAAGAGGAT-----GT--ACATA--AC--TGA--CTGGC--T--AGTG---TCAG-CAGTG-TTAC---GC--GTT-GC-CTT--TGA-TAG-AGTT----GACACTTG----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATTTC---ACCG--CAT-ATACGCAGAGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TA------A-A--A--ACAG------A-TTT-AGTAAGCTACA-G---TTT-G-TATG----AAGACGAGCATGTAAAAT-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTACCTGTGT-AGAAGAA-CTTT-----T-TATCAT--A------TTAC--ATTCT---AAATGGTGCTTAAATATT----ATTAA-AGAAGTAGCTTGTCTAGTTTCAAGTGGAAGATT
gi|112227 : AT-GTATTTGTGGACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTT--TC------AT-AAGAAAGTT--GCG-GTTCGCCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGACGC-TGT--ACATAACTCATTGA--CAG-T--T--G-TC---AGAGTAAGTA-T------GT--GTT-GA-AGT--TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----TGAAGGAAGTGAGCTGTGCT---CTCCATTTG---ACCA--CAT-ATACACAGAGGGGAATCTA--CGA---T-G--T-GT-A-A-------G------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGAGCACTACA-G---CTC-G-TTTG----AAGGCGAATATGCAGTAG-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTAACTATGT-AAAATAA-TTTTGGTACT-TTTGGT--------TCCTT--ACT-TTCAAGTTGGTGTTTGAA-AGC----ACTCAGAGAAGAAGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112228 : AT-GTATTTGTGAACTG-TATCAAAAT------GTT--TA--AC------GT-AAGAGAAAA--GTG-GCTCGCCGAAAAG-AAGTATCTATAAA-GAGGAT-----GT--ACATA--AC--TGA--CTGGC--T--AGTG---TCAG-CAGTG-TTAC---GT--GTT-GC-CTT--TGA-TAG-AGTT----GACACTTT----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATT-----TCAAGGTAT-ATACCCAGAGGAGAATTTT--CAA---T------TT-T-T--T---AA------A-A--A--CAGAT-GT-TG-CTTTAGT------TA-G---TTT-T-TACG----AAGACGAGCATGTTAAAT-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTTCCTGTGT-AGAAGAA-CTTTGGTA-T-TTT--T--A--------TT--ATT-T---AAC
gi|112229 : TCTCCAAAGAG-AAGAATAT--------GGGTAGT-AATTCGCAGA--TG---GG--GTGGTAAT--GATCTTTCGAG-TACTG-T-TC---ATTAGTTGCG-ATA--TGA---G-ATG-------CA-ATGC---AGTAGAAAATGTTCTGCATC---TTCAATTTT---GCCA--CAT-ATACAAAGAGGGGAA---A--CAA---TCA--TGTT-T-T--C---TG------GAA--A--CAGGTCAT-TG--TTAAGTGCACTGCA-T---TTA-G-TTCG----GAGACGTGTATGTAGAAC-TT-G-AA--GTGTTCT-TGTTCCAAAGA-GAAAATA-CTTTG
gi|112230 : --GTT-CG-ATGATTGT-TA---TAGTTTTGACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CAT-GTGCACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----T-T--T---TG------G-AATA--TAAAT-GT-TG-GTTAAGTGAACTACA-A---TTTAG-T-CG----TAGACGGGTATG
gi|112231 : A-TAC-AAAG----AACAAATG----AAGAGGTAATGATCTGTGTT---TTCTATTAA---TCCA--CAT-GCACAAAGTG--GGCTGTT--CAT---T-AAGT-TT-T-TAGTGTATG------G-A--A--------GC-TA-ATTAAGATGACTACA---------G-TATGCTATAAGGCGAATGTGTTGGAT-CT-GTGCTAATCTCTT-C---CCTGCAT-AATAGTGTTTTTGGAG-TAATCGGT---CG--GTTGCT--ATT-G---AGTTTATTCTTAAA-AACTGTAATTGA
gi|112232 : AA-ATAGTCT-G-CACATG----AATAAATAATGATATGTGTC---CTCAATTTC---ACCA--CAA-AGACAATTTGGA---CTTG--CAAC--T-A--T-GT-T-T--T---TATT----G-A--A--TAAAT-GT-TGATTCAAGT-TACTGCA-A---TTT-G-TACG----AAGTCGTGTATGATATAT-TTGG-GC--AGTTCGG-T-TTCCTGTAT-AATAATG-ATTTGG
gi|112233 : G----GACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CAT-GTGCACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----T-T--T---TG------G-A--ATGTAAAT-GT-TG-GTTAAGTGAACTACA-A---TTTAG-T-CA----TAGACGGATATGaaccttttg
gi|112234 : ----AAGAAATAGTGAGTTGCATT---TTCAGTCTCAATTCCA--CAA-TCACACAGAGAGGAATTTCG-TAA-----A--T-GA-T-T--T---AA------A-A--A--TAAGTCGT-TA-TTTAAGT-CGCTACACA---T---GTTACG----CAAACGTGCATGTAAGAC-C--G-AC--A
gi|112235 : GAGGTAGTTA---GTACT---TTTAATTGC---TCCA--AAT-ATACATATTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TA-T-T--A----G------A-A--A--CAAAT-TT-TG-TTTAAGTGTACTACA-A---TTC-G-TGTG----TAGACGAATATGCAAGAC-CT-G-AC--ACTTTCC-TGTGCATTTGTAAAAAGGG-TTTTGGTG-T-TTTGTT--GAT--ATTTGC--ATT-T---ACATTATGCTTAAA-GGG----AATGATAGAGTCTGTTTGTTTTGTTTCGATTGGATGATT
gi|112236 : AGATAATGTTTCGCATC---TTCAATTGT---TCCG--CAA-GCACATAAAGGCATATCTA--TTA---T-A--T-TT-TAT--T---TG------A-AT-A--CAGGT-GT-TC-TTTGATGTTGCGACA-G---TGT-G-TCCA----AAGACGTGTGTTGAGAAC-TT-G-TA--ATTTTCT-GTTACCTGTAT-AATAGTA-TTTTGGGA-T-TTT
gi|112237 : TAATGATATGTGTC---TTCAATTTC---ACCA--AAA-AGACAATTTGGA---CTTA--CAACTAT-G--T-TT-T-T--C---TT------G-A--A--TAAAT-GT-TGATTCAAGT-TACTGCA-A---TTT-G-TACG----AAGTCGTGTATGATATAT-TTGG-GC--AGTTCGG-T-TTCCTGTAT-AACAATG-ATTTGG
gi|112238 : ---TCCA--CAA-GTAC-CA-TGGGGAGATTCAACAA---T-A--T-TT-T-T--A---TG------A-A--A--TAGGT-GT-TG-GTTTAGGGAACTACA-AATTTTG-G-TATG----TAATCGTGCGTGCAGTAT-TT-GTGC---CCTCCTATTTCCCCGAGT-AGTAGTA-TTTTGGTA-C-TTTACT--TAT--ATCGCA--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-AGT----AGCCATAGAAaaccttttg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|112196 ): ATTATTATTATTATTATTATTATTATTNNNNNNNNNNTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATATATTTATA
Alignments
lowQualScore : 11111 11 22222222 111
lowQualScore : 1111 555555555 222222 111 888888888888 111 0 555555 1111 66 1 1 0 6666 777777 1 1 5555 1 1 333 1 555555 555 22 1 1 66666666 3333 1 22 1 222 1 0 0 22 444444 1 0 22 0 1 1 1 3 11111 22 22 666666 3333 44444 222 2 1 9 4 222 22 66 1 11 1 1 1 5555 1 4444 1 444 0 44444 11 1 0 0 88 333 1 22 11 1 1 9999999999999999 22 33 2 1 2 3 555 1 222 33 1 2 2222 1 2 22 2 4 11 1 2 1 0 2 9 3 00000000 22 1 666 0 1 4444 0 2 11 1
lowQualScore : .... ......... ...... ... ............ ... . ...... .... .. . . . .... ...... . . .... . . ... . ...... ... .. . . ........ .... . .. . ... . . . .. ...... . . .. . . . . . ..... .. .. ...... .... ..... ... . . . . ... .. .. . .. . . . .... . .... . ... . ..... .. . . . .. ... . .. .. . . ................ .. .. . . . . ... . ... .. . . .... . . .. . . .. . . . . . . . ........ .. . ... . . .... . . .. .
lowQualScore : 9999 000000000 444444 444 111111111111 444 8 444444 7777 55 6 1 9 4444 333333 2 2 6666 3 4 000 8 888888 555 88 9 6 00000000 4444 6 22 6 999 5 2 9 11 444444 5 2 33 5 7 0 6 2 11111 77 22 777777 4444 22222 888 6 6 6 9 888 11 66 5 99 5 4 4 3333 4 2222 3 222 9 77777 66 2 6 6 88 222 2 88 44 2 2 3333333333333333 88 22 4 2 4 3 777 2 111 88 2 2 7777 5 3 77 8 1 99 4 0 4 2 9 6 2 00000000 33 7 222 9 7 0000 3 4 99 0
consensus : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
Reference ( family-398 ) : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
gi|112174 : AT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TT-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112175 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATAA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGTGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTTGACGTTAGTA--TT------GT-GGGAGAGAT--GAG-GTTTTCCAAACAG-ATGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTCATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAACT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112176 : attattattataATTATTA----TAAT---------TATAATAATTAT---T------------ATTA---TAATTATTATTG-TTATTATTATTATTATGAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-AAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-GGGAGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-G--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112177 : attattAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTATA-----CAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TAAA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACATTTGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--AAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CAT-GTACACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTGT-TGTGCCTGCGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112178 : A----TTAT---------TAT------TAT---TATAATTATAATAATTA---TTATTATAATTA-TTATTGTTATTATTATTATTGTGATTAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT----------------------------------------GT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-GGAGGAGAT--GAG-GTTTTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112179 : ATTATAA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATGAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TATA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GACGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAG
gi|112180 : attattattattA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATT----TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112180 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATAA--------GT----CATTAT--T-TA-CAAGT-T--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTATTTT------TT-GGGGGAGAT--TAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TAT-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACC---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-attattattattattataagtcattatttacaagtttacagctttacagcgttgttagataagtttttagttttcgttattaaaacgcttactcgagagtatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgttagtattttttgggggagattaggttctccaaagagaagtgtgtgaagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcgagaagtgtagcgcgttcgatatattaaataggacagacgaggaggtaatgatttgtaccttcaattgctccacatgtacatagtggagaattttcaatatttttttggaataagtgttgtttcagcgtgctacaattcg
gi|112181 : attattattattattttattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATCATAG--------------GT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAGTTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAGTTTAGACGTTAGTA--TTGAGGGGGTGGGGGGGGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TT--TGA--AAGAT--T--AATG---CGAG-AAGTA-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--T--------TAG----GACAGACA----AGGAGGTAATGTTTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGAAGAATTTTA-CAA-----A--T-TTGT-C--T---TGTT----A-A--A--C-AGT-TTATG-TTTCA
gi|112182 : attattattattattatnnnnnnnnnnattattATTATAA----TTAT---------AAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGC-TT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGAG
gi|112183 : attattattattAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAA--T-TA-
gi|112183 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTAATTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T----CAAAT-C--Tttattattattattattattattattcaaatct
gi|112184 : attattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TAA---T--TACA--------TC-A--C-ACTGTT-GT-TA
gi|112185 : attataattatcATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATCATTA-TTATTATTATTATTGTTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112185 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-attattattattattattattacattacaatgtt
gi|112186 : attattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TCATTATTATTA-TTATTATTGTTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112186 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-attattattattattacattacaatgtttcac
gi|112187 : attATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-tcac
gi|112188 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---TNNNNNNNNNNT-ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-----------AC--GT---T-TT-A----AATGTT-AT-T-G---ATAAtcacttt
gi|112189 : attattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112190 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112191 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112192 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112193 : TTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TGAA------AC---C---T-TG-A--C-ATCGAT-AT-TAATTTATAAA-TTTAC------AAT---TT----ATAATT-A-ATGGTAATGAACGCCATTT-TACT--------GTTTTAT-ATATCTACGTACGGCCTattattattat
gi|112194 : attattgttgtttttATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATCATTATTA-TTATTATAATTGTCATTAT------TAT----TATTATCAT-TA-TTATT-A--T-CA-GT---A-TT-AT-C-AGTATT-GT-TA
gi|112195 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATCA-TTATTGTTAATATTATTAT------TAC----TATTAT--T-TA-CAAAA-C--TAAA------T-TT-ATTT-AGCACT-GT-T
gi|112197 : attatcttcataattTTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTGT------TGT----CATTTC--T-TA-CTTGT----TGCC-CC---T-TTCA--C-AGC-TT--T-T-----ATAAT-GGCTT------AAT---TT--TTTTTA---A-A--------AACAT----T-TATTGG--A-
gi|112198 : attattattattattattattattnnnnnnnnnnTTGTTG----TTGT---------TGT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-CATGT-A--T-CA---------T-A--CTATTATT-GT-T-----ATTAG-TGTTT------AGTTCCTT--TTATTATT-A-
gi|112199 : attgttgttgttgATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--TATA-C
gi|112200 : attactattattATTATTA----TTAT---------TTT------CAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTTTTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112201 : attataatcATTATTA----TTANNNNNNNNNNTAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TAGTGT--T-Tgtcattactattgtcatttttattattgttgtt
gi|112201 : attattattattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTAGTGTTTTTAT------TAT----TATTAT--T-ttattattattattataattattgttattagtttttattact
gi|112201 : attattattattattattattattattannnnnnnnnntattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTAGTGTTTTTA-TTATTATTATTATAATTAT------TGT----TATTAG--T-Tataattattgttattagtttttattact
gi|112202 : attattattattattattattattattannnnnnnnnntattattattattattattattATTATTAAGAATTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTGTTA-TTATTATTATTATTATTGT------TAT----CATTAT--T-AA-CAA-------ACATAC---TATT-A----AACTTT-GA-TAG---ATA---TTATTATCATGAGT---TTTATCATTATT-tttattact
gi|112203 : attattattactATCATCA----TCAT---------CAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATCATTATTAT------TAT----TATTAT--TATG-TAAAT-A---ACA-AC------T-A----AGCAAT-GTATGG---ACAAA-TT
gi|112204 : atcatcatcatcTTGTTG----TTGT---------TGT------TGT---T------------GTTG---TTGTTGTTGTTG-TTGTTGTTGTTGTTGTTGT------TATAGGTCATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--T-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAACAAGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AAGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-AT-T-TT-T-T--T---TGATTTTTG-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAAAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--ACG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTACTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTATTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112205 : ttgttgttgttgATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTATTTTTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TATCAAAT---------GT---T-TT-AT-C-ATCATT-AT-T-----ATTAG-TTTT
gi|112206 : ttATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATCATTATTA-TTATTATAATTGTCATTAT------TAT----TATTATCAT-TA-TTATT-A--T-CA-GT---A-TT-AT-C-AGTATT-GT-TA
gi|112206 : ttATTATTA----TAAT---------TGT------CAT---T------------ATTA---TTATTATCATTA-TTATTATCAGTATTATCAG------TAT----TGTTAT--tcatcattattattataattgttattattattattatta
gi|112206 : ttattattattattattattattattatcattattATTATTA----TTAT---------TAT------CAT---T------------ATTA---TTATCAGTATTA-TCAGTATTGTTATCATCAT------TAT----TATTAT--catcattattattataattgttattattattattatta
gi|112206 : ttattattattattattattattattatcattattattattataattgtcATTATTA----TTATCAG------TAT------TATCAGT------------ATTG---TTATCATCATTA-TTATTATAATTGTTATTAT------TAT----TATTAT--T-aattgttattattattattatta
gi|112207 : ttattattattattattattattattatcattattattattataattgtcattattattattatcTTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA-----TA-CCAAT-T--TA-A---------T-A--T-AGCATT-AT-Ta
gi|112208 : ttatttatATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAN--N-NN-NNNNN-N--TA
gi|112209 : tcattattaatATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TG-CA--T-T--TGCA------T-TT-A--
gi|112210 : attattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TAAG--C--TA
gi|112211 : tATTATTA----TTAT---------TAT------AAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TT-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112212 : ATTA----TTAT---------TAT------TAT---C------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-CATGT-C--CA
gi|112213 : A----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTATA-----CAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TAAA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACATTTGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--AAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CAT-GTACACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTGT-TGTGCCTGCGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112214 : TAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT---------AGC-CATCACA-GCTAAT-TT-T--G-GGCGTCAAT-TAT---CTGAG-TGTAT------AATC--TT--TCGTGAT--------------ACTC----TATACTC
gi|112215 : ATTATTATTAGTATA-----GAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T--------------------AG---ATAAG-TTTTA------AGG---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGA----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGAACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-AGGGGTGGT--GAA-GATCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGCAAT-AGT--GCATA--TG--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---CC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTAGAGAATTTT--CAG---T------TT-T-T--T---T---------A--A--CAAGT-GT-TG-TTT----------CA-A-----C-G-TAC---------------TACAA---------------TTC----GTACTTGTGT-AGAAGTA-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AACTGGTGCTTAAA-AGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTCTTGTTTCAGTAGGTAGATT
gi|112216 : ATTGTTATTATA-----GGT----CGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAGG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATTAA-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-G
gi|112217 : C---T-CT-C--C-AGCATT-GA-TAG---ATAAG-TTGTT------AGT---TT--TCGTTATT-T-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-GTATTTGTGGACAGCACTAAAAATGTCGACGTTAGTA--TT------GT-GAGGGAGAT--GAA-ATTCACAAAAGGG-AAGTGAGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGG---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----TACAGACG----AGGAGGTAATGATTTATACT---TTCAATTGC---TCCG--CAT-GTTCATAGTGGAGAATTTT--CGA---T-A--T-TT-T-TG-T---TT------T-A--A--TAAAT-GT-TC-TTTCAGTGTGCTACA-A---TTC-G-TACA----AAGACGAGTAGGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCATGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-A---AGCTGGTGCTTAAA-
gi|112218 : TT-AGA--------AACGA----T-TGCTAGCCA-TAA---TAA-ATATTTGC--ACAGTTTCAAAATTATTGTTATTTGTT--TC------AT-GGGGAAGCA--AAGCGTT-GCTATGTAA-AATTTTATAT----AAAGATA---------C-TG--TA--GGG--GAGATA-T--GGTA---TTAA-AAGTT-CTTC---GC--GTC-TGTCTG--TGAGTAA-G--G----GACAGGTG----TGAAAGTAGTGGTATGTATC---TGCCATAGT---TTCA--CATCG---GCAGTGCAGAGATTCGATAA---T-A--T-TT-T-T--T---TA------A-A--AAATAGGT-GG-TG-ATTAAGAGTGCTACA-T---TTA-G-TGCG----AAGTTTTGCATG-AAGATGCT-G-GG--CTCTTCT-GGAGTCGGTAT-AAAAGTATTTTTGGAC-T-TTCACT--AAG---TTTCT--GTT-T---AAATAGAGTTTGAA-CGA----ATTGA
gi|112219 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--ATGAA----AT-GTATATGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-ACAG-AGTT--GCG-GTTCACCAAAAAG-AAGTTTAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GT--GTT--G-ATGC-TGA-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGCGCTGAACT---TTCTATTTG---TCCT--CAT-GTACACAGAAGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACAACA-A---CTC-G-TTAG----GCGACGGGCATGCAATAA-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTACCTTTGT-TAAAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--TCGTTACTTTTGAATT-T---A-----TGTTTAAA-AAC----ATTCAGAGAAGAGACTTGCCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112220 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---CCAG-GAGTGGTAA----GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGATACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112221 : -A--------AACGA----T-TAGTAG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-GAGTATAT-T----TAAAGAAAC-CGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTTTTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-TTTAAATGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AAAAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACT-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112222 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---AC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGACGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGGTA-TGTTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112223 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AATTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-G--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112224 : ----T-TTCTCG--A-CAA---GATGAT-TTTTTGGACAGTTTCGAAAATAGTAATGTCTATG--TC------TT-ATGTAAGATTTGAG---TTGCCAAACAATAAAT-TAT-T----TACAGACAC-AGC--GTATA---A--TG-----GAT--TACGTTT---CCAC-AA----TAGCTCGGC--G---CG-A-A--TAA-TAACATAG----AACGGACATTTCAGAAAGAAATGATACGTACT---TTCGATACC---TCCA--CAA-GTACAAAGGAGAGATTCAA--CAA---T-G--T-TT-T-T--TA--TG------T-A--A--TAGAT-TT-TG-GTTTAGAGAACTACA-A---TTA-G-TACG----T---TGTGTGTGCAGTAT-TT-GTGC---TTTCCT-TTTTCCCGAAT-AATAGTA-TTTTGGTA-C-TTTAGTTTATG---TCGTG--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-
gi|112225 : G--A-TAA---CAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATAGTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGATTT--GCG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCACTGACAT------ATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGCTTG--TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAACTATACT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGAGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTT-G-TTCG----GAGGCAGGAAT-CAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTAGCTATGT-AAAAGAA-TGTTAGTACT-TTTGGT--TAG----TTAT--ATT-CG--AGTTTATGTTTAAA-AGC----ACTCAGAGAA
gi|112226 : AT-GTAATTGTGAACTGCATCAAAAAGATTAACAGTATTG--CC------GT-AAGCGAGAA--GTG-GTCCGCCGAAAAG-AAGCATCT-TTTAAGAGGAT-----GT--ACATA--AC--TGA--CTGGC--T--AGTG---TCAG-CAGTG-TTAC---GC--GTT-GC-CTT--TGA-TAG-AGTT----GACACTTG----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATTTC---ACCG--CAT-ATACGCAGAGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TA------A-A--A--ACAG------A-TTT-AGTAAGCTACA-G---TTT-G-TATG----AAGACGAGCATGTAAAAT-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTACCTGTGT-AGAAGAA-CTTT-----T-TATCAT--A------TTAC--ATTCT---AAATGGTGCTTAAATATT----ATTAA-AGAAGTAGCTTGTCTAGTTTCAAGTGGAAGATT
gi|112227 : AT-GTATTTGTGGACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTT--TC------AT-AAGAAAGTT--GCG-GTTCGCCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGACGC-TGT--ACATAACTCATTGA--CAG-T--T--G-TC---AGAGTAAGTA-T------GT--GTT-GA-AGT--TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----TGAAGGAAGTGAGCTGTGCT---CTCCATTTG---ACCA--CAT-ATACACAGAGGGGAATCTA--CGA---T-G--T-GT-A-A-------G------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGAGCACTACA-G---CTC-G-TTTG----AAGGCGAATATGCAGTAG-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTAACTATGT-AAAATAA-TTTTGGTACT-TTTGGT--------TCCTT--ACT-TTCAAGTTGGTGTTTGAA-AGC----ACTCAGAGAAGAAGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112228 : AT-GTATTTGTGAACTG-TATCAAAAT------GTT--TA--AC------GT-AAGAGAAAA--GTG-GCTCGCCGAAAAG-AAGTATCTATAAA-GAGGAT-----GT--ACATA--AC--TGA--CTGGC--T--AGTG---TCAG-CAGTG-TTAC---GT--GTT-GC-CTT--TGA-TAG-AGTT----GACACTTT----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATT-----TCAAGGTAT-ATACCCAGAGGAGAATTTT--CAA---T------TT-T-T--T---AA------A-A--A--CAGAT-GT-TG-CTTTAGT------TA-G---TTT-T-TACG----AAGACGAGCATGTTAAAT-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTTCCTGTGT-AGAAGAA-CTTTGGTA-T-TTT--T--A--------TT--ATT-T---AAC
gi|112229 : TCTCCAAAGAG-AAGAATAT--------GGGTAGT-AATTCGCAGA--TG---GG--GTGGTAAT--GATCTTTCGAG-TACTG-T-TC---ATTAGTTGCG-ATA--TGA---G-ATG-------CA-ATGC---AGTAGAAAATGTTCTGCATC---TTCAATTTT---GCCA--CAT-ATACAAAGAGGGGAA---A--CAA---TCA--TGTT-T-T--C---TG------GAA--A--CAGGTCAT-TG--TTAAGTGCACTGCA-T---TTA-G-TTCG----GAGACGTGTATGTAGAAC-TT-G-AA--GTGTTCT-TGTTCCAAAGA-GAAAATA-CTTTG
gi|112230 : --GTT-CG-ATGATTGT-TA---TAGTTTTGACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CAT-GTGCACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----T-T--T---TG------G-AATA--TAAAT-GT-TG-GTTAAGTGAACTACA-A---TTTAG-T-CG----TAGACGGGTATG
gi|112231 : A-TAC-AAAG----AACAAATG----AAGAGGTAATGATCTGTGTT---TTCTATTAA---TCCA--CAT-GCACAAAGTG--GGCTGTT--CAT---T-AAGT-TT-T-TAGTGTATG------G-A--A--------GC-TA-ATTAAGATGACTACA---------G-TATGCTATAAGGCGAATGTGTTGGAT-CT-GTGCTAATCTCTT-C---CCTGCAT-AATAGTGTTTTTGGAG-TAATCGGT---CG--GTTGCT--ATT-G---AGTTTATTCTTAAA-AACTGTAATTGA
gi|112232 : AA-ATAGTCT-G-CACATG----AATAAATAATGATATGTGTC---CTCAATTTC---ACCA--CAA-AGACAATTTGGA---CTTG--CAAC--T-A--T-GT-T-T--T---TATT----G-A--A--TAAAT-GT-TGATTCAAGT-TACTGCA-A---TTT-G-TACG----AAGTCGTGTATGATATAT-TTGG-GC--AGTTCGG-T-TTCCTGTAT-AATAATG-ATTTGG
gi|112233 : G----GACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CAT-GTGCACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----T-T--T---TG------G-A--ATGTAAAT-GT-TG-GTTAAGTGAACTACA-A---TTTAG-T-CA----TAGACGGATATGaaccttttg
gi|112234 : ----AAGAAATAGTGAGTTGCATT---TTCAGTCTCAATTCCA--CAA-TCACACAGAGAGGAATTTCG-TAA-----A--T-GA-T-T--T---AA------A-A--A--TAAGTCGT-TA-TTTAAGT-CGCTACACA---T---GTTACG----CAAACGTGCATGTAAGAC-C--G-AC--A
gi|112235 : GAGGTAGTTA---GTACT---TTTAATTGC---TCCA--AAT-ATACATATTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TA-T-T--A----G------A-A--A--CAAAT-TT-TG-TTTAAGTGTACTACA-A---TTC-G-TGTG----TAGACGAATATGCAAGAC-CT-G-AC--ACTTTCC-TGTGCATTTGTAAAAAGGG-TTTTGGTG-T-TTTGTT--GAT--ATTTGC--ATT-T---ACATTATGCTTAAA-GGG----AATGATAGAGTCTGTTTGTTTTGTTTCGATTGGATGATT
gi|112236 : AGATAATGTTTCGCATC---TTCAATTGT---TCCG--CAA-GCACATAAAGGCATATCTA--TTA---T-A--T-TT-TAT--T---TG------A-AT-A--CAGGT-GT-TC-TTTGATGTTGCGACA-G---TGT-G-TCCA----AAGACGTGTGTTGAGAAC-TT-G-TA--ATTTTCT-GTTACCTGTAT-AATAGTA-TTTTGGGA-T-TTT
gi|112237 : TAATGATATGTGTC---TTCAATTTC---ACCA--AAA-AGACAATTTGGA---CTTA--CAACTAT-G--T-TT-T-T--C---TT------G-A--A--TAAAT-GT-TGATTCAAGT-TACTGCA-A---TTT-G-TACG----AAGTCGTGTATGATATAT-TTGG-GC--AGTTCGG-T-TTCCTGTAT-AACAATG-ATTTGG
gi|112238 : ---TCCA--CAA-GTAC-CA-TGGGGAGATTCAACAA---T-A--T-TT-T-T--A---TG------A-A--A--TAGGT-GT-TG-GTTTAGGGAACTACA-AATTTTG-G-TATG----TAATCGTGCGTGCAGTAT-TT-GTGC---CCTCCTATTTCCCCGAGT-AGTAGTA-TTTTGGTA-C-TTTACT--TAT--ATCGCA--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-AGT----AGCCATAGAAaaccttttg
blockSeqs : AGAA NNNNNNNNN AATAAT CAG ATAATTATAATA TTT TGTGAT AGGT TA A T CAT GCTAA A C TTT A A TTT T ATCATG TCC TA A G TGGTAATG CATT A CC T TTT G TT GAGGGG G TT C T T A TTAAG AA TC ACTCAT CTGA TAC TTT A T G G TCG TA GC T CT G C T TTTT A TTTC T GTC TCAAT GG C GA CTA C AG GT G A TTGATTTTTG AT AA C A A C CGT C ATT TA T A CTAT A G TG G T TA A G A T C G TCGTTA GA C TCG T TGTA T TA T
blockSeqs : . CAG . . NNNNNNNNNNT . A . TA A . AT TAC . . TC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T . A AAAG A . TA GA AAT . A . G G . . C . AT . . T TCT A C T GTC GC . . AA C . T T . . AGTGTATGG T TG C . A C CGT . . TA . A . A G C G T . . G . T C A TTATG . . TCG . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . A . TA . . AT GC . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G A . TA GA AT . G . G G . . C . C . . T . A . T . GC . . AA . . . T . . TTGTTA . . . . . C CGT . . T . A . A G C . T . . G . . C . AAGA . . TCG . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . A . CA . . AT GC . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G A . TG AA T . A . G G . . C . C . . T . A . T . GT . . AA . . . T . . TTATTG . . . . . C CGT . . T . A . A G C . . . . G . . C . AAGA . . TCG . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . A . TA . . C GC . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G A . TA GA T . A . G G . . C . C . . T . A . T . GC . . A . . . T . . GTTTT . . . . . C CGT . . C . A . A A C . . . . G . . C . AAGA . . TCA . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . . . CA . . C GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G A . TA GA T . G . G G . . C . C . . T . A . T . GC . . G . . . T . . TATGT . . . . . C CGT . . T . A . A G C . . . . G . . C . AAGA . . G . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A A . TA GA T . G . . G . . C . C . . T . A . T . GC . . . . . . T . . CTGGA . . . . . C CGT . . T . A . A G C . . . . G . . . . ACGA . . . . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G A . TT AA T . G . . G . . C . . . . T . A . T . GC . . . . . . T . . TTGG . . . . . C CGT . . C . A . A G C . . . . A . . . . AAGA . . . . . T TA T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A A . TA GA T . G . . G . . C . . . . T . A . T . GC . . . . . . T . . TTTG . . . . . C CGT . . C . A . T G C . . . . G . . . . AAGA . . . . . G GT G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G A . TA GA T . G . . G . . C . . . . T . A . T . GC . . . . . . T . . TTTG . . . . . C TGT . . T . A . G T A . . . . G . . . . AAGA . . . . . G GT G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G A . TG AA T . G . . G . . C . . . . T . A . T . GT . . . . . . T . . TTGG . . . . . C AGT . . C . G . G T A . . . . A . . . . AAGA . . . . . G GT G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G A . TG GA T . G . . G . . C . . . . T . A . T . GC . . . . . . T . . TTGG . . . . . A TGC . . C . T . G T A . . . . A . . . . GATA . . . . . G GT G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C CC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A T . TG GA T . T . . T . . C . . . . G . G . T . GC . . . . . . T . . TTGG . . . . . A TGC . . C . T . G T A . . . . A . . . . TATA . . . . . G GT G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T AC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T T . TA GA T . C . . A . . T . . . . G . T . G . GT . . . . . . T . . TTGG . . . . . A TGC . . A . T . G T A . . . . A . . . . AAG . . . . . G GT A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T C . AC CT T . C . . G . . C . . . . G . T . G . TG . . . . . . G . . TTTG . . . . . A TGC . . C . T . T T T . . . . A . . . . TAG . . . . . G GT G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T T . AC CT A . C . . A . . G . . . . G . T . G . TG . . . . . . G . . TTAA . . . . . A TGC . . C . T . G T A . . . . T . . . . CGG . . . . . T TT A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A GT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T T . AC CT A . C . . A . . G . . . . G . T . G . TG . . . . . . G . . AAGA . . . . . A AGA . . C . A . A A T . . . . A . . . . A . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T A . AC CT A . C . . T . . G . . . . T . T . G . TG . . . . . . G . . AAGA . . . . . T TGC . . C . T . A T G . . . . A . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C GC . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T T . AC CT A . C . . . . . C . . . . G . A . T . TG . . . . . . G . . AAGA . . . . . A TAA . . C . A . A A T . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A GC . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T T . AC CT A . C . . . . . . . . . . G . T . A . CC . . . . . . T . . AAGA . . . . . A AGC . . A . T . T A C . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T GC . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T A . AC CA T . C . . . . . . . . . . G . T . G . TG . . . . . . G . . AAGA . . . . . T TGC . . T . A . G G T . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . N C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AC CT T . G . . . . . . . . . . G . T . G . TC . . . . . . T . . AAGA . . . . . A TGA . . T . T . A T T . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TG GT T . C . . . . . . . . . . T . T . G . TG . . . . . . G . . TTAA . . . . . A ATG . . C . A . T G C . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . T . A . T . TT . . . . . . T . . TAAA . . . . . A TGA . . T . A . G G C . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . A . T . T . GA . . . . . . T . . TTGG . . . . . A TGT . . A . A . T A C . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . A . T . AA . . . . . . G . . TTGG . . . . . A GTT . . T . G . A T T . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . G . TC . . . . . . G . . TAAA . . . . . A GGA . . C . C . T T T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . T . GA . . . . . . T . . TTGA . . . . . A TT . . T . A . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . GC . . . . . . T . . CTTG . . . . . G TC . . T . A . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . T . . ATGA . . . . . A TT . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . T . . AGA . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
finalCons : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|112196 ): ATTATTATTATTATTATTATTATTATTNNNNNNNNNNTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATATATTTATA
Alignments
lowQualScore : 11111 11 22222222 111
lowQualScore : 1111 555555555 222222 111 888888888888 111 0 555555 1111 66 1 1 0 6666 777777 1 1 5555 1 1 333 1 555555 555 22 1 1 66666666 3333 1 22 1 222 1 0 0 22 444444 1 0 22 0 1 1 1 3 11111 22 22 666666 3333 44444 222 2 1 9 4 222 22 66 1 11 1 1 1 5555 1 4444 1 444 0 44444 11 1 0 0 88 333 1 22 11 1 1 9999999999999999 22 33 2 1 2 3 555 1 222 33 1 2 2222 1 2 22 2 4 11 1 2 1 0 2 9 3 00000000 22 1 666 0 1 4444 0 2 11 1
lowQualScore : .... ......... ...... ... ............ ... . ...... .... .. . . . .... ...... . . .... . . ... . ...... ... .. . . ........ .... . .. . ... . . . .. ...... . . .. . . . . . ..... .. .. ...... .... ..... ... . . . . ... .. .. . .. . . . .... . .... . ... . ..... .. . . . .. ... . .. .. . . ................ .. .. . . . . ... . ... .. . . .... . . .. . . .. . . . . . . . ........ .. . ... . . .... . . .. .
lowQualScore : 9999 000000000 444444 444 111111111111 444 8 444444 7777 55 6 1 9 4444 333333 2 2 6666 3 4 000 8 888888 555 88 9 6 00000000 4444 6 22 6 999 5 2 9 11 444444 5 2 33 5 7 0 6 2 11111 77 22 777777 4444 22222 888 6 6 6 9 888 11 66 5 99 5 4 4 3333 4 2222 3 222 9 77777 66 2 6 6 88 222 2 88 44 2 2 3333333333333333 88 22 4 2 4 3 777 2 111 88 2 2 7777 5 3 77 8 1 99 4 0 4 2 9 6 2 00000000 33 7 222 9 7 0000 3 4 99 0
consensus : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
Reference ( family-398 ) : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TC------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCNCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TN--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACACAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTNAGCGCGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGNGTATGCAANAC-CT-G-AC--ATTTCCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGGTG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAGCGGCTTGTCTTGTTTCAATNGGNAGATT
gi|112174 : AT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TT-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112175 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATAA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGTGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTTGACGTTAGTA--TT------GT-GGGAGAGAT--GAG-GTTTTCCAAACAG-ATGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTCATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAACT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112176 : attattattataATTATTA----TAAT---------TATAATAATTAT---T------------ATTA---TAATTATTATTG-TTATTATTATTATTATGAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-AAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-GGGAGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-G--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112177 : attattAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTATA-----CAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TAAA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACATTTGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--AAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CAT-GTACACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTGT-TGTGCCTGCGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112178 : A----TTAT---------TAT------TAT---TATAATTATAATAATTA---TTATTATAATTA-TTATTGTTATTATTATTATTGTGATTAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT----------------------------------------GT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-GGAGGAGAT--GAG-GTTTTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112179 : ATTATAA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATGAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TATA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GACGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CAAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAG
gi|112180 : attattattattA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATT----TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112180 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATAA--------GT----CATTAT--T-TA-CAAGT-T--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTATTTT------TT-GGGGGAGAT--TAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TAT-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACC---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-attattattattattataagtcattatttacaagtttacagctttacagcgttgttagataagtttttagttttcgttattaaaacgcttactcgagagtatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgttagtattttttgggggagattaggttctccaaagagaagtgtgtgaagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcgagaagtgtagcgcgttcgatatattaaataggacagacgaggaggtaatgatttgtaccttcaattgctccacatgtacatagtggagaattttcaatatttttttggaataagtgttgtttcagcgtgctacaattcg
gi|112181 : attattattattattttattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATCATAG--------------GT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAGTTTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAGTTTAGACGTTAGTA--TTGAGGGGGTGGGGGGGGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TT--TGA--AAGAT--T--AATG---CGAG-AAGTA-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--T--------TAG----GACAGACA----AGGAGGTAATGTTTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGAAGAATTTTA-CAA-----A--T-TTGT-C--T---TGTT----A-A--A--C-AGT-TTATG-TTTCA
gi|112182 : attattattattattatnnnnnnnnnnattattATTATAA----TTAT---------AAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGC-TT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGAG
gi|112183 : attattattattAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAA--T-TA-
gi|112183 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTAATTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T----CAAAT-C--Tttattattattattattattattattcaaatct
gi|112184 : attattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TAA---T--TACA--------TC-A--C-ACTGTT-GT-TA
gi|112185 : attataattatcATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATCATTA-TTATTATTATTATTGTTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112185 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-attattattattattattattacattacaatgtt
gi|112186 : attattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TCATTATTATTA-TTATTATTGTTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112186 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-attattattattattacattacaatgtttcac
gi|112187 : attATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATCA---TTATTATTATTA-TTATTGTTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TA-TTATTAT--TACA--------TT-A--C-AATGTT-tcac
gi|112188 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---TNNNNNNNNNNT-ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-----------AC--GT---T-TT-A----AATGTT-AT-T-G---ATAAtcacttt
gi|112189 : attattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112190 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112191 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112192 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-attattattatt
gi|112193 : TTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TGAA------AC---C---T-TG-A--C-ATCGAT-AT-TAATTTATAAA-TTTAC------AAT---TT----ATAATT-A-ATGGTAATGAACGCCATTT-TACT--------GTTTTAT-ATATCTACGTACGGCCTattattattat
gi|112194 : attattgttgtttttATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATCATTATTA-TTATTATAATTGTCATTAT------TAT----TATTATCAT-TA-TTATT-A--T-CA-GT---A-TT-AT-C-AGTATT-GT-TA
gi|112195 : ATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATCA-TTATTGTTAATATTATTAT------TAC----TATTAT--T-TA-CAAAA-C--TAAA------T-TT-ATTT-AGCACT-GT-T
gi|112197 : attatcttcataattTTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTGT------TGT----CATTTC--T-TA-CTTGT----TGCC-CC---T-TTCA--C-AGC-TT--T-T-----ATAAT-GGCTT------AAT---TT--TTTTTA---A-A--------AACAT----T-TATTGG--A-
gi|112198 : attattattattattattattattnnnnnnnnnnTTGTTG----TTGT---------TGT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-CATGT-A--T-CA---------T-A--CTATTATT-GT-T-----ATTAG-TGTTT------AGTTCCTT--TTATTATT-A-
gi|112199 : attgttgttgttgATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--TATA-C
gi|112200 : attactattattATTATTA----TTAT---------TTT------CAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTTTTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-
gi|112201 : attataatcATTATTA----TTANNNNNNNNNNTAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TAGTGT--T-Tgtcattactattgtcatttttattattgttgtt
gi|112201 : attattattattattattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTAGTGTTTTTAT------TAT----TATTAT--T-ttattattattattataattattgttattagtttttattact
gi|112201 : attattattattattattattattattannnnnnnnnntattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTAGTGTTTTTA-TTATTATTATTATAATTAT------TGT----TATTAG--T-Tataattattgttattagtttttattact
gi|112202 : attattattattattattattattattannnnnnnnnntattattattattattattattATTATTAAGAATTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTGTTA-TTATTATTATTATTATTGT------TAT----CATTAT--T-AA-CAA-------ACATAC---TATT-A----AACTTT-GA-TAG---ATA---TTATTATCATGAGT---TTTATCATTATT-tttattact
gi|112203 : attattattactATCATCA----TCAT---------CAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATCATTATTAT------TAT----TATTAT--TATG-TAAAT-A---ACA-AC------T-A----AGCAAT-GTATGG---ACAAA-TT
gi|112204 : atcatcatcatcTTGTTG----TTGT---------TGT------TGT---T------------GTTG---TTGTTGTTGTTG-TTGTTGTTGTTGTTGTTGT------TATAGGTCATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--T-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-G----AAGGGTAACAAGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ATA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AAGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-AT-T-TT-T-T--T---TGATTTTTG-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAAAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--ACG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTACTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTATTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112205 : ttgttgttgttgATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTATTTTTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTATTAT-TATCAAAT---------GT---T-TT-AT-C-ATCATT-AT-T-----ATTAG-TTTT
gi|112206 : ttATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATCATTATTA-TTATTATAATTGTCATTAT------TAT----TATTATCAT-TA-TTATT-A--T-CA-GT---A-TT-AT-C-AGTATT-GT-TA
gi|112206 : ttATTATTA----TAAT---------TGT------CAT---T------------ATTA---TTATTATCATTA-TTATTATCAGTATTATCAG------TAT----TGTTAT--tcatcattattattataattgttattattattattatta
gi|112206 : ttattattattattattattattattatcattattATTATTA----TTAT---------TAT------CAT---T------------ATTA---TTATCAGTATTA-TCAGTATTGTTATCATCAT------TAT----TATTAT--catcattattattataattgttattattattattatta
gi|112206 : ttattattattattattattattattatcattattattattataattgtcATTATTA----TTATCAG------TAT------TATCAGT------------ATTG---TTATCATCATTA-TTATTATAATTGTTATTAT------TAT----TATTAT--T-aattgttattattattattatta
gi|112207 : ttattattattattattattattattatcattattattattataattgtcattattattattatcTTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA-----TA-CCAAT-T--TA-A---------T-A--T-AGCATT-AT-Ta
gi|112208 : ttatttatATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAN--N-NN-NNNNN-N--TA
gi|112209 : tcattattaatATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TG-CA--T-T--TGCA------T-TT-A--
gi|112210 : attattATTATTA----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-TAAG--C--TA
gi|112211 : tATTATTA----TTAT---------TAT------AAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCTTTAAAAATTTCGACGTTAGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCTCCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TA--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-ACA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TG------G-A--A--TAAGT-GT-TT-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTT-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCCTGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGG-TTGTCTTGTTTCAATAGGTAGATT
gi|112212 : ATTA----TTAT---------TAT------TAT---C------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTA---T-TA-CATGT-C--CA
gi|112213 : A----TTAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTATA-----CAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TAAA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAAG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGATAGCATTAACAATTTCGACATTTGTA--TT------GT-GGGGGAGAT--GAG-GTTCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T-----AGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--AAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----ATGAGGTAATGATTCGTACT---TTCAATTGT---TCCA--CAT-GTACACAGTGGGGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TT------G-A--A--TAAGT-GT-TG-TTTCAGCGTGCTACA-A---TTC-G-TACG----AAGACGAGTATGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTGT-TGTGCCTGCGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AGCTGGTGCTTAAA-GGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTTTTGTTTAAATAGGTAGATT
gi|112214 : TAT---------TAT------TAT---T------------ATTA---TTATTATTATTA-TTATTATTATTATTATTAT------TAT----TATTAT---------AGC-CATCACA-GCTAAT-TT-T--G-GGCGTCAAT-TAT---CTGAG-TGTAT------AATC--TT--TCGTGAT--------------ACTC----TATACTC
gi|112215 : ATTATTATTAGTATA-----GAT----CATTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T--------------------AG---ATAAG-TTTTA------AGG---TT--TCGTTATT-A-A--------AACGA----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGAACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-AGGGGTGGT--GAA-GATCACCAAAGAG-AAGTGTGT-T----GAGGGCAAT-AGT--GCATA--TG--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGC---CC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----GACAGACG----AGGAGGTAATGATTTGTACT---TTCAATTGC---TCCA--CAT-GTACATAGTAGAGAATTTT--CAG---T------TT-T-T--T---T---------A--A--CAAGT-GT-TG-TTT----------CA-A-----C-G-TAC---------------TACAA---------------TTC----GTACTTGTGT-AGAAGTA-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-T---AACTGGTGCTTAAA-AGC----ATTGATAGAAACGGCTCGTCTTGTTTCAGTAGGTAGATT
gi|112216 : ATTGTTATTATA-----GGT----CGTTAT--T-TA-CAAGT-C--TACA-GC---T-TT-A--C-AGCGTT-GT-TAG---ATAGG-TTTTT------AGT---TT--TCGTTATTAA-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-ATATTTGTGGACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTA--TT------GT-G
gi|112217 : C---T-CT-C--C-AGCATT-GA-TAG---ATAAG-TTGTT------AGT---TT--TCGTTATT-T-A--------AACGC----T-TACTCG--A-GAG---TAT-GTATTTGTGGACAGCACTAAAAATGTCGACGTTAGTA--TT------GT-GAGGGAGAT--GAA-ATTCACAAAAGGG-AAGTGAGT-T----GAGGGTAAC-AGT--GCATA--TG--TGA--GAGAT--T--GATG---CGAG-AAGTG-TAGG---GC--GTT-CG-GTA--TGA-TAA-ATAG----TACAGACG----AGGAGGTAATGATTTATACT---TTCAATTGC---TCCG--CAT-GTTCATAGTGGAGAATTTT--CGA---T-A--T-TT-T-TG-T---TT------T-A--A--TAAAT-GT-TC-TTTCAGTGTGCTACA-A---TTC-G-TACA----AAGACGAGTAGGCAAGAC-CT-G-AC--ATTTTCT-TGTGCATGTGT-AAAAGTG-TTTTGATG-T-TTTGGT--AAG--ATTTTT--ATT-A---AGCTGGTGCTTAAA-
gi|112218 : TT-AGA--------AACGA----T-TGCTAGCCA-TAA---TAA-ATATTTGC--ACAGTTTCAAAATTATTGTTATTTGTT--TC------AT-GGGGAAGCA--AAGCGTT-GCTATGTAA-AATTTTATAT----AAAGATA---------C-TG--TA--GGG--GAGATA-T--GGTA---TTAA-AAGTT-CTTC---GC--GTC-TGTCTG--TGAGTAA-G--G----GACAGGTG----TGAAAGTAGTGGTATGTATC---TGCCATAGT---TTCA--CATCG---GCAGTGCAGAGATTCGATAA---T-A--T-TT-T-T--T---TA------A-A--AAATAGGT-GG-TG-ATTAAGAGTGCTACA-T---TTA-G-TGCG----AAGTTTTGCATG-AAGATGCT-G-GG--CTCTTCT-GGAGTCGGTAT-AAAAGTATTTTTGGAC-T-TTCACT--AAG---TTTCT--GTT-T---AAATAGAGTTTGAA-CGA----ATTGA
gi|112219 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--ATGAA----AT-GTATATGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-ACAG-AGTT--GCG-GTTCACCAAAAAG-AAGTTTAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GT--GTT--G-ATGC-TGA-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGCGCTGAACT---TTCTATTTG---TCCT--CAT-GTACACAGAAGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACAACA-A---CTC-G-TTAG----GCGACGGGCATGCAATAA-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTACCTTTGT-TAAAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--TCGTTACTTTTGAATT-T---A-----TGTTTAAA-AAC----ATTCAGAGAAGAGACTTGCCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112220 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---CCAG-GAGTGGTAA----GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGATACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112221 : -A--------AACGA----T-TAGTAG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-GAGTATAT-T----TAAAGAAAC-CGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTTTTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-TTTAAATGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AAAAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACT-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112222 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---AC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGACGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGGTA-TGTTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112223 : -A--------AACGA----T-TAGTGG--A-TAA---AAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGAGTT--GTG-GTTCACCAAAAAG-AATTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCA--CTGAC--A--GATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGC-TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAGCTGTGCT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGGGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-G--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTC-G-TTCG----GAGGCGGGCATGCAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTACCTATGT-AATAGAA-TTTAGGTACT-TTTGGT--------TCGTT--ACC-TTCGAGTTTATGTTTAAA-AGC----ATTCAGAGAAGAGGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112224 : ----T-TTCTCG--A-CAA---GATGAT-TTTTTGGACAGTTTCGAAAATAGTAATGTCTATG--TC------TT-ATGTAAGATTTGAG---TTGCCAAACAATAAAT-TAT-T----TACAGACAC-AGC--GTATA---A--TG-----GAT--TACGTTT---CCAC-AA----TAGCTCGGC--G---CG-A-A--TAA-TAACATAG----AACGGACATTTCAGAAAGAAATGATACGTACT---TTCGATACC---TCCA--CAA-GTACAAAGGAGAGATTCAA--CAA---T-G--T-TT-T-T--TA--TG------T-A--A--TAGAT-TT-TG-GTTTAGAGAACTACA-A---TTA-G-TACG----T---TGTGTGTGCAGTAT-TT-GTGC---TTTCCT-TTTTCCCGAAT-AATAGTA-TTTTGGTA-C-TTTAGTTTATG---TCGTG--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-
gi|112225 : G--A-TAA---CAT-GTATTTGTGAACTGCTTCAAATAGTTTAACATTATTG--TC------AT-AAGAGATTT--GCG-GTTCACCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGAAAC-TGT--ACATA--AC--TCACTGACAT------ATG---TCAG-GAGTGGTA-T---GC--GTT--G-ATGCTTG--TAA-AGGT----GACAATTG----AGAAAGAAGTGAACTATACT---TTCTATTTG---TCCA--CAT-GTACACAGAGGGGAGTCTT--CAA---T-G--T-GT-T-T--A---AG------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGTGCACTACA-A---CTT-G-TTCG----GAGGCAGGAAT-CAATAA-TT-G-GC--ATTTCCT-TGTAGCTATGT-AAAAGAA-TGTTAGTACT-TTTGGT--TAG----TTAT--ATT-CG--AGTTTATGTTTAAA-AGC----ACTCAGAGAA
gi|112226 : AT-GTAATTGTGAACTGCATCAAAAAGATTAACAGTATTG--CC------GT-AAGCGAGAA--GTG-GTCCGCCGAAAAG-AAGCATCT-TTTAAGAGGAT-----GT--ACATA--AC--TGA--CTGGC--T--AGTG---TCAG-CAGTG-TTAC---GC--GTT-GC-CTT--TGA-TAG-AGTT----GACACTTG----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATTTC---ACCG--CAT-ATACGCAGAGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TT-T-T--T---TA------A-A--A--ACAG------A-TTT-AGTAAGCTACA-G---TTT-G-TATG----AAGACGAGCATGTAAAAT-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTACCTGTGT-AGAAGAA-CTTT-----T-TATCAT--A------TTAC--ATTCT---AAATGGTGCTTAAATATT----ATTAA-AGAAGTAGCTTGTCTAGTTTCAAGTGGAAGATT
gi|112227 : AT-GTATTTGTGGACTGCTTCAAATATTTTAACATTATTT--TC------AT-AAGAAAGTT--GCG-GTTCGCCAAAAAG-AAGTATAT-T----TAAAGACGC-TGT--ACATAACTCATTGA--CAG-T--T--G-TC---AGAGTAAGTA-T------GT--GTT-GA-AGT--TGG-TAA-AGGT----GACAATTG----TGAAGGAAGTGAGCTGTGCT---CTCCATTTG---ACCA--CAT-ATACACAGAGGGGAATCTA--CGA---T-G--T-GT-A-A-------G------A-A--A--TAGAT-GT-TG-CTTAAGAGCACTACA-G---CTC-G-TTTG----AAGGCGAATATGCAGTAG-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTAACTATGT-AAAATAA-TTTTGGTACT-TTTGGT--------TCCTT--ACT-TTCAAGTTGGTGTTTGAA-AGC----ACTCAGAGAAGAAGCTTGTCTTGTTTCAAGTGGGAGA
gi|112228 : AT-GTATTTGTGAACTG-TATCAAAAT------GTT--TA--AC------GT-AAGAGAAAA--GTG-GCTCGCCGAAAAG-AAGTATCTATAAA-GAGGAT-----GT--ACATA--AC--TGA--CTGGC--T--AGTG---TCAG-CAGTG-TTAC---GT--GTT-GC-CTT--TGA-TAG-AGTT----GACACTTT----AGGAAGTAATGAGCTGTACT---TTCTATT-----TCAAGGTAT-ATACCCAGAGGAGAATTTT--CAA---T------TT-T-T--T---AA------A-A--A--CAGAT-GT-TG-CTTTAGT------TA-G---TTT-T-TACG----AAGACGAGCATGTTAAAT-TT-G-AC--ATTTCCT-TGTTCCTGTGT-AGAAGAA-CTTTGGTA-T-TTT--T--A--------TT--ATT-T---AAC
gi|112229 : TCTCCAAAGAG-AAGAATAT--------GGGTAGT-AATTCGCAGA--TG---GG--GTGGTAAT--GATCTTTCGAG-TACTG-T-TC---ATTAGTTGCG-ATA--TGA---G-ATG-------CA-ATGC---AGTAGAAAATGTTCTGCATC---TTCAATTTT---GCCA--CAT-ATACAAAGAGGGGAA---A--CAA---TCA--TGTT-T-T--C---TG------GAA--A--CAGGTCAT-TG--TTAAGTGCACTGCA-T---TTA-G-TTCG----GAGACGTGTATGTAGAAC-TT-G-AA--GTGTTCT-TGTTCCAAAGA-GAAAATA-CTTTG
gi|112230 : --GTT-CG-ATGATTGT-TA---TAGTTTTGACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CAT-GTGCACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----T-T--T---TG------G-AATA--TAAAT-GT-TG-GTTAAGTGAACTACA-A---TTTAG-T-CG----TAGACGGGTATG
gi|112231 : A-TAC-AAAG----AACAAATG----AAGAGGTAATGATCTGTGTT---TTCTATTAA---TCCA--CAT-GCACAAAGTG--GGCTGTT--CAT---T-AAGT-TT-T-TAGTGTATG------G-A--A--------GC-TA-ATTAAGATGACTACA---------G-TATGCTATAAGGCGAATGTGTTGGAT-CT-GTGCTAATCTCTT-C---CCTGCAT-AATAGTGTTTTTGGAG-TAATCGGT---CG--GTTGCT--ATT-G---AGTTTATTCTTAAA-AACTGTAATTGA
gi|112232 : AA-ATAGTCT-G-CACATG----AATAAATAATGATATGTGTC---CTCAATTTC---ACCA--CAA-AGACAATTTGGA---CTTG--CAAC--T-A--T-GT-T-T--T---TATT----G-A--A--TAAAT-GT-TGATTCAAGT-TACTGCA-A---TTT-G-TACG----AAGTCGTGTATGATATAT-TTGG-GC--AGTTCGG-T-TTCCTGTAT-AATAATG-ATTTGG
gi|112233 : G----GACAGTTG----AGTAAGAAATG--TT-TACTGTCTTCGAGTGA---ACGG--CAT-GTGCACA-TGG-GACTTTCAACAA---T-A--T----T-T--T---TG------G-A--ATGTAAAT-GT-TG-GTTAAGTGAACTACA-A---TTTAG-T-CA----TAGACGGATATGaaccttttg
gi|112234 : ----AAGAAATAGTGAGTTGCATT---TTCAGTCTCAATTCCA--CAA-TCACACAGAGAGGAATTTCG-TAA-----A--T-GA-T-T--T---AA------A-A--A--TAAGTCGT-TA-TTTAAGT-CGCTACACA---T---GTTACG----CAAACGTGCATGTAAGAC-C--G-AC--A
gi|112235 : GAGGTAGTTA---GTACT---TTTAATTGC---TCCA--AAT-ATACATATTGGAGAATTTT--CAA---T-A--T-TA-T-T--A----G------A-A--A--CAAAT-TT-TG-TTTAAGTGTACTACA-A---TTC-G-TGTG----TAGACGAATATGCAAGAC-CT-G-AC--ACTTTCC-TGTGCATTTGTAAAAAGGG-TTTTGGTG-T-TTTGTT--GAT--ATTTGC--ATT-T---ACATTATGCTTAAA-GGG----AATGATAGAGTCTGTTTGTTTTGTTTCGATTGGATGATT
gi|112236 : AGATAATGTTTCGCATC---TTCAATTGT---TCCG--CAA-GCACATAAAGGCATATCTA--TTA---T-A--T-TT-TAT--T---TG------A-AT-A--CAGGT-GT-TC-TTTGATGTTGCGACA-G---TGT-G-TCCA----AAGACGTGTGTTGAGAAC-TT-G-TA--ATTTTCT-GTTACCTGTAT-AATAGTA-TTTTGGGA-T-TTT
gi|112237 : TAATGATATGTGTC---TTCAATTTC---ACCA--AAA-AGACAATTTGGA---CTTA--CAACTAT-G--T-TT-T-T--C---TT------G-A--A--TAAAT-GT-TGATTCAAGT-TACTGCA-A---TTT-G-TACG----AAGTCGTGTATGATATAT-TTGG-GC--AGTTCGG-T-TTCCTGTAT-AACAATG-ATTTGG
gi|112238 : ---TCCA--CAA-GTAC-CA-TGGGGAGATTCAACAA---T-A--T-TT-T-T--A---TG------A-A--A--TAGGT-GT-TG-GTTTAGGGAACTACA-AATTTTG-G-TATG----TAATCGTGCGTGCAGTAT-TT-GTGC---CCTCCTATTTCCCCGAGT-AGTAGTA-TTTTGGTA-C-TTTACT--TAT--ATCGCA--GTT-A---AGATGTTGCTTAAA-AGT----AGCCATAGAAaaccttttg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|112196 ): ATTATTATTATTATTATTATTATTATTNNNNNNNNNNTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATATATTTATA