lowQualScore                  :     00       0  111    0 0   2222222 1  1 11111 0   1111 111 111  0         0      1111   22 00      555555555        444444      111111        1111     11     
lowQualScore                  :     ..       .  ...    . .   ....... .  . ..... .   .... ... ...  .         .      ....   .. ..      .........        ......      ......        ....     ..     
lowQualScore                  :     99       7  222    7 7   1111111 6  3 66666 6   4444 111 111  6         6      3333   44 88      000000000        000000      999999        4444     00     
consensus                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
Reference ( gi|111923 )       : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111924                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--GATTAT---------CAGATATT------ACACTA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111925                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----G-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CTA-AC--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111926                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCAT-A-----A-TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCCAA----CCA-AT--AATTGT---------CGGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111927                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTTA----CCA-AT--TATTAT---------CAGATATC------ACAATA------ATACTTCA----TACCC--AGTT
gi|111928                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCTT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGTTCATG-TTTTAA----CCA-AT--ACTTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111929                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-T-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AATTAT---------TACATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AG
gi|111930                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAT-------GCGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AATTAT---------TAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATTC--AG
gi|111931                     : TTTA--GCAAACT-AG---AAAA-T-AAA-------ACAT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCA-GT--AATTTT---------AAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111932                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAAA-T-AAT-------GCAT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCA-AT--AATTAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACATCA----TATCC--AG
gi|111933                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-A-----A-CAC----T---G---CC-AAGATAATG-TTCTAA----ATG-AT--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATAC--AGTTG
gi|111934                     : TTTA--GCAAACT-CA---AAAA-A-AAA-------GTGC-A-----A-CAC----T---G---TA-AAGATCATG-TTCTAA----CTA-AT--AACTAT---------CAGATATT------ACATTA------ATACTTCA----AATCC--AGCTG
gi|111935                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-A-----A-CAC----C---A---TT-AAGAACCTG-GTCTAA----CCA-AT--AAATAT---------CAGATATT------ACAACA------ATACATTA----TATCC--AGTT
gi|111937                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GATT-A-----A-CAC----T---G---TT-AGGATTATG-TTCTAA----CCA-TT--TAGTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--AAT
gi|111936                     : TTTG--GTTAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGC-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCATGT---ATTAT---------CAGATATT------ACAA-A------ATATTTCA----TATCC--AG
gi|111939                     : TTTA--GCAAACT-GGTGGAAAA-T-AAA-------TCGT-A-----A-CAT----T---G---TT-AAGATCATG-TCCTAA----CCA-AG--AAATAT---------TAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--ATTT
gi|111938                     : TTTA--GCAAACT-TG---AAAA-T-AAA-------GTGTTA-----A-CAC----T---A---TT-AAGATCCTA-TTCTAA----CCA-TT--AATTAC---------CTGATATT------TCAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111940                     : TTTA--GTAAACT-GG---GAAA-T-AAA-------G----------A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT---ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------GTATTTCA----AATCC--AGT
gi|111942                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-T-AAA-------GTGC-A-----G-CAC----T---G---TT-AAGATAATG-TTCTAA----CAA-TT--AATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTACA----TATCCTGAGTT
gi|111941                     : TTTA--GCAAATG-GG---AAAA-T-ATT-------CTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGTTCATT-TTCTAA----CCA-TT--AATTAT---------CAAATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATTC--AGT
gi|111943                     : TTTA--GTGAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GAAT-A-----A-CTC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-TT--AATGAT---------CAGATATT------ACAATA------ATGCTTCT----TATC
gi|111944                     : TTTA--GCGAGGT-GG---AAAA-T-GAA-------GCAT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATGATG-TTCTAG----CCA-TT--AATTAC---------CAGATATT------ATAATA------ATATTTCA----AATCC--AGT
gi|111945                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-A-AAA-------GCGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTAA----CTA-AT--AATTAT---------C-GAT------------ATA------ACATTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111946                     : TCTG--GCAAACA-AG---AAAA-T-AAA-------GTAT-G-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCGTG-TTCTAA----CCA-TC--AATTAT---------CAGAAAAT------ACAGTA------ATACTTCA----TATCC--
gi|111948                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AAT-------GCAT-A-----A-CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AAATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111947                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AAT-------GCAT-A-----A-CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AAATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111949                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGC-A-----C-AAC----T---G---TT-AAGATACTA-TTCTAA----CAA-AA--GGTTAC---------CAGATATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111950                     : TTCA--GCAAACT-GG---AAAA---AAA-------GCAT-A-----A-CAC----A---G---TT-AAAATCATG-TTTGAA----TCA-AA--AATTTT---------GAGATATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111951                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAT----T---G---GT-AAGATAATG-TTCTAG----CCA-TT--AATTAT---------CATATATA------ATGATA------ATACTTTT----TATC
gi|111952                     : TTTA--GCTAAGT-GG---AAAG-T-ATA-------GCGT-A-----A-CAC----T---G---TG-AATATCATG-TTTTAA----CCA-AT--AAATAT---------CAGATATT------ACAATG------ATACTTCA----TA
gi|111953                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CA-AT--GATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111954                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-A-----A-CAT----T---G---TT-CAGTTCATG-TTCTAA----CCA-TT--ATTTAG---------CAGATATTTAGCA-ACAATC------ATATTTGA----TATCC--AGT
gi|111955                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CA-AT--GATTAT---------CAGATTTT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111956                     : TTTA--GAAAACA-GG---AAAA-T-AAA-------GCAT-A-----A-CAC----T---G---TT-------------CTAA----CGA-AT--ACTAAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111957                     : TTTA--GCAAACA-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-T-----T-CAC----T---G---TT-AAGATAAGG-TTCTAA----ACA-AT--AATTAT---------CATATCTT------ACAAT-------ATAAT-------TATCC--AGTTG
gi|111958                     : TTTAAGGCAAACT-GT---AAAA-T-AAA-------GCAT-A-----A-AAC----T---G---TT-----TTATG-TTCTAA----C-A-ATTTAAT-AT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AAT
gi|111959                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-T-----A-CAC----TTAAGAACTT-AAGATCATG-TTCT------C------------T---------CAGATATT------ACAAAA------ATACTTCA----TATCC--ATTT
gi|111960                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAA--------------GCAT-T-----A-CAC----C---G---TT-AAGGTCATG-TTTTAA----CC-------ATT---------------TATG------ACAACA------AAACATCA----TATCC--ATTT
gi|111961                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-ACA-------GCAT-T-----A-GAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAATTATCCA-AT--
gi|111962                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TC-AAGGTCATC-TTCTAA----CCA-AT--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATATGTCA----TATCC--AGTTG
gi|111963                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------TTGT-A-----A-CAA----A---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--ACTTTA---------CAGATATT------TAAATA------ATACTTCATAATTATCC--AGTTG
gi|111964                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCTT-A-----A-ATC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTTAA----TCA-AT--AATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--AGTTG
gi|111965                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCTT-A-----A-CTC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTAAA----TCA-AT--AATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--ATTTG
gi|111966                     :  TTA--GGAAACT-GG---AAAA-T-TAA-------TCTT-A-----A-CACCAACT---G---TT-ATGATCATG-TTCTAA----CCT-AT--AATTAT---------CAGATGTT------ACAATACATGTTATACTTCA----TGTCC--AGTTG
gi|111967                     :  TTG--GCGAACTTAA---AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---T---TT-AAGATCATG-ATCTGA----CCA-TT--AATTAT---------CAGAT-TTAGCTAAACAATA------CTATTTCA----TATCT--
gi|111968                     :  TTA--GTGAA--------AAAA-T-AAA-------GTGT-A-----A-CAC----T---G---TT-TGGATAATG-TTCTAA----TAA-TT--AATTAT---------CAGGTATG------ACAA
gi|111969                     :   TA--GCAAACT-CG---AAAA-T-AAA-------GTGTTA-----A-TAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAA----CTA-AT--TATTAT---------CAGTTATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--TGTTG
gi|111970                     :   TA--GCAAACA-GG---AAAA-TTAAA-------GCTT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AATGAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACTTT-----TATCC--
gi|111972                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-T-----A-CAA----T---G---TTAAAAATCATG-TTCT-A----CCA-TT--TATTAT---------CAGATATT------ACAGTA------ATACCTCA----TAT
gi|111973                     :   TA--GCAAATT-GG---AAAT-T-AAT-------GCAC-A-----A-CAC----T---A---CT-AAGCTCATA-TTGTAA----CCA-CT--AATTAT---------CAGACATT------ACAACA------ATATTTCT----TATCC--AGT
gi|111971                     :   TA--GGAAACT-GG---AAGA-T-AAT-------GCTT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAAATTTTG-TTCTAA----CCT-TT--AATTAT---------CAGATATT------GCACTA------ATACTTCA----TAT
gi|111974                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAA-------ACCT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAA----CCA-TT--AATTAT---------CAGATATT------A
gi|111975                     :   TA--GTAAACT-GA---AAAA-T-AAAAAATAATGTAT-A-----T-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----TCA-TT--TATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATAGTT
gi|111976                     :    A--GCAAACA-GG---AAAAAT-GAA-------GTAC-ATCAAAATCAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AT--AATTAT---------CAGACATT------ACAGTA------AAACCTTA----TATCC--AGTT
gi|111977                     :    A--GCAGACT-TG---AAAA-T-AAA-------GCAT-A-----A-TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CAA-TT--AATTAT---------CAGATATT------AC---A------ATGTTTGA----TATAC--AGT
gi|111978                     :    A--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAA-------ACCT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAG----CCA-TT--AATTAT---------CAGATATT------A
gi|111979                     :     --GCAAACT-GG---AAAA-T-AAA-------GTGT-G-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAG----CCA-TT--AATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATATTTCA----CACCC--AGT
gi|111980                     :     --GCAATCT-GG---AAAA-T-AAA-------ATGT-T-----A-CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----GCA-TT--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ACATTTCA----TATCC--AGT
gi|111981                     :     --GCAAACT-TG---AAA--T-GAT-------GAGT-A-----A-CAC----C--------T-----TCATG-TTCTAA----CCA-TT--AATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTCCA----TA
gi|111982                     :          AACT-GG---AAAA-T-AAA-------GCGT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTTA----CCA-TT--AATTAT---------CGGGTATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGT
gi|111983                     :            CC-GG---AAAA-T-AAA-------GAGT-A-----A-CAG----T-------TT-AAGATCATG-TGCTTA----CCA-TT--ACTTAT---------CAGATATT------A----A------GTACTTTA----TATCC--AGT
gi|111984                     :                              -------GTTT-A-----A-CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCA-AT--GATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCT----TATCC--CGTTG
gi|111985                     :                                        T-A-----A-CTC----T---C---TT-AAGAGCATG-TTCTAA----CCA-TG--AATTAT---------CTGATATT------CTAATA------GTACTACA----TATCC--ATTT
gi|111986                     :                                                              ---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCA-AC--AATTAT---------CTGATATT------ACAATA------ATATTTT-----TATCC--AATTG
gi|111987                     :                                                                      GATGATGGTTCTAA----CTA-AC--AATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TGTCC--AGTT
gi|111988                     :                                                                                 TAA----TCA-AT--AATTAT---------CAGATATTA-----ACAAAA------ATACTTCA----CATCC--AGTTG





Alignments
lowQualScore                  :     00       0  111    0 0    00   222  2222222   1111 111 111  0         0      1111   1 00 0     444444444        333333      111111        1111     11     
lowQualScore                  :     ..       .  ...    . .    ..   ...  .......   .... ... ...  .         .      ....   . .. .     .........        ......      ......        ....     ..     
lowQualScore                  :     99       7  111    7 7    99   444  7777777   3333 111 111  6         6      3333   4 88 6     999999999        999999      999999        4444     00     
consensus                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
Reference ( family-396 )      : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111923                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111924                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACACTA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111925                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AG-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CTAAC--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111926                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCCAA----CCAAT--A-ATTGT---------CGGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111927                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTTA----CCAAT--T-ATTAT---------CAGATATC------ACAATA------ATACTTCA----TACCC--AGTT
gi|111928                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGTTCATG-TTTTAA----CCAAT--A-CTTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111929                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------TACATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AG
gi|111930                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AATG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------TAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATTC--AG
gi|111931                     : TTTA--GCAAACT-AG---AAAA-T-AAAA--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAGT--A-ATTTT---------AAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111932                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAAA-T-AATG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACATCA----TATCC--AG
gi|111933                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---CC-AAGATAATG-TTCTAA----ATGAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATAC--AGTTG
gi|111934                     : TTTA--GCAAACT-CA---AAAA-A-AAAG--TGC---AA-------CAC----T---G---TA-AAGATCATG-TTCTAA----CTAAT--A-ACTAT---------CAGATATT------ACATTA------ATACTTCA----AATCC--AGCTG
gi|111935                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----C---A---TT-AAGAACCTG-GTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------CAGATATT------ACAACA------ATACATTA----TATCC--AGTT
gi|111936                     : TTTG--GTTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGC---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CC-AT--GTATTAT---------CAGATATT------ACAA-A------ATATTTCA----TATCC--AG
gi|111937                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--ATT---AA-------CAC----T---G---TT-AGGATTATG-TTCTAA----CCATT--T-AGTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--AAT
gi|111938                     : TTTA--GCAAACT-TG---AAAA-T-AAAG--TGTT--AA-------CAC----T---A---TT-AAGATCCTA-TTCTAA----CCATT--A-ATTAC---------CTGATATT------TCAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111939                     : TTTA--GCAAACT-GGTGGAAAA-T-AAAT--CGT---AA-------CAT----T---G---TT-AAGATCATG-TCCTAA----CCAAG--A-AATAT---------TAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--ATTT
gi|111940                     : TTTA--GTAAACT-GG---GAAA-T-AAAG---------A-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT----ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------GTATTTCA----AATCC--AGT
gi|111941                     : TTTA--GCAAATG-GG---AAAA-T-ATTC--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGTTCATT-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAAATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATTC--AGT
gi|111942                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-T-AAAG--TGC---AG-------CAC----T---G---TT-AAGATAATG-TTCTAA----CAATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTACA----TATCCTGAGTT
gi|111943                     : TTTA--GTGAACT-GG---AAAA-T-AAAG--AAT---AA-------CTC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCATT--A-ATGAT---------CAGATATT------ACAATA------ATGCTTCT----TATC
gi|111944                     : TTTA--GCGAGGT-GG---AAAA-T-GAAG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATGATG-TTCTAG----CCATT--A-ATTAC---------CAGATATT------ATAATA------ATATTTCA----AATCC--AGT
gi|111945                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-A-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTAA----CTAAT--A-ATTAT---------C-GAT------------ATA------ACATTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111946                     : TCTG--GCAAACA-AG---AAAA-T-AAAG--TAT---GA-------CAC----T---G---TT-AAGATCGTG-TTCTAA----CCATC--A-ATTAT---------CAGAAAAT------ACAGTA------ATACTTCA----TATCC--
gi|111947                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AATG--CAT---AA-------CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111948                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AATG--CAT---AA-------CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111949                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGC---AC-------AAC----T---G---TT-AAGATACTA-TTCTAA----CAAAA--G-GTTAC---------CAGATATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111950                     : TTCA--GCAAACT-GG---AAAA---AAAG--CAT---AA-------CAC----A---G---TT-AAAATCATG-TTTGAA----TCAAA--A-ATTTT---------GAGATATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111951                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAT----T---G---GT-AAGATAATG-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CATATATA------ATGATA------ATACTTTT----TATC
gi|111952                     : TTTA--GCTAAGT-GG---AAAG-T-ATAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TG-AATATCATG-TTTTAA----CCAAT--A-AATAT---------CAGATATT------ACAATG------ATACTTCA----TA
gi|111953                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111954                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAT----T---G---TT-CAGTTCATG-TTCTAA----CCATT--A-TTTAG---------CAGATATTTAGCA-ACAATC------ATATTTGA----TATCC--AGT
gi|111955                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CAAT--G-ATTAT---------CAGATTTT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111956                     : TTTA--GAAAACA-GG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-------------CTAA----CGAAT--A-CTAAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111957                     : TTTA--GCAAACA-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TT-------CAC----T---G---TT-AAGATAAGG-TTCTAA----ACAAT--A-ATTAT---------CATATCTT------ACAAT-------ATAAT-------TATCC--AGTTG
gi|111958                     : TTTAAGGCAAACT-GT---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------AAC----T---G---TT-----TTATG-TTCTAA----C-AATTTA-AT-AT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AAT
gi|111959                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAC----TTAAGAACTT-AAGATCATG-TTCT------C------------T---------CAGATATT------ACAAAA------ATACTTCA----TATCC--ATTT
gi|111960                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAA-------G--CAT---TA-------CAC----C---G---TT-AAGGTCATG-TTTTAA----CC-------ATT---------------TATG------ACAACA------AAACATCA----TATCC--ATTT
gi|111961                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-ACAG--CAT---TA-------GAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAATTATCCAAT--
gi|111962                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TC-AAGGTCATC-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATATGTCA----TATCC--AGTTG
gi|111963                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAT--TGT---AA-------CAA----A---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-CTTTA---------CAGATATT------TAAATA------ATACTTCATAATTATCC--AGTTG
gi|111964                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------ATC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTTAA----TCAAT--A-ATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--AGTTG
gi|111965                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------CTC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTAAA----TCAAT--A-ATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--ATTTG
gi|111966                     :  TTA--GGAAACT-GG---AAAA-T-TAAT--CTT---AA-------CACCAACT---G---TT-ATGATCATG-TTCTAA----CCTAT--A-ATTAT---------CAGATGTT------ACAATACATGTTATACTTCA----TGTCC--AGTTG
gi|111967                     :  TTG--GCGAACTTAA---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---T---TT-AAGATCATG-ATCTGA----CCATT--A-ATTAT---------CAGAT-TTAGCTAAACAATA------CTATTTCA----TATCT--
gi|111968                     :  TTA--GTGAA--------AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-TGGATAATG-TTCTAA----TAATT--A-ATTAT---------CAGGTATG------ACAA
gi|111969                     :   TA--GCAAACT-CG---AAAA-T-AAAG--TGTT--AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAA----CTAAT--T-ATTAT---------CAGTTATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--TGTTG
gi|111970                     :   TA--GCAAACA-GG---AAAA-TTAAAG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATGAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACTTT-----TATCC--
gi|111971                     :   TA--GGAAACT-GG---AAGA-T-AATG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATTTTG-TTCTAA----CCTTT--A-ATTAT---------CAGATATT------GCACTA------ATACTTCA----TAT
gi|111972                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAA----T---G---TTAAAAATCATG-TTCT-A----CCATT--T-ATTAT---------CAGATATT------ACAGTA------ATACCTCA----TAT
gi|111973                     :   TA--GCAAATT-GG---AAAT-T-AATG--CAC---AA-------CAC----T---A---CT-AAGCTCATA-TTGTAA----CCACT--A-ATTAT---------CAGACATT------ACAACA------ATATTTCT----TATCC--AGT
gi|111974                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAAA--CCT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------A
gi|111975                     :   TA--GTAAACT-GA---AAAA-T-AAAA--AAT---AATGTATATCAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----TCATT--T-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATAGTT
gi|111976                     :    A--GCAAACA-GG---AAAAAT-GAAGTACATCAAAAT------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGACATT------ACAGTA------AAACCTTA----TATCC--AGTT
gi|111977                     :    A--GCAGACT-TG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CAATT--A-ATTAT---------CAGATATT------AC---A------ATGTTTGA----TATAC--AGT
gi|111978                     :    A--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAAA--CCT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------A
gi|111979                     :     --GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---GA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATATTTCA----CACCC--AGT
gi|111980                     :     --GCAATCT-GG---AAAA-T-AAAA--TGT---TA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----GCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ACATTTCA----TATCC--AGT
gi|111981                     :     --GCAAACT-TG---AAA--T-GATG--AGT---AA-------CAC----C--------T-----TCATG-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTCCA----TA
gi|111982                     :          AACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTTA----CCATT--A-ATTAT---------CGGGTATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGT
gi|111983                     :            CC-GG---AAAA-T-AAAG--AGT---AA-------CAG----T-------TT-AAGATCATG-TGCTTA----CCATT--A-CTTAT---------CAGATATT------A----A------GTACTTTA----TATCC--AGT
gi|111984                     :                                   T---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCT----TATCC--CGTTG
gi|111985                     :                                gttT---AA-------CTC----T---C---TT-AAGAGCATG-TTCTAA----CCATG--A-ATTAT---------CTGATATT------CTAATA------GTACTACA----TATCC--ATTT
gi|111986                     :                                                            ---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAC--A-ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------ATATTTT-----TATCC--AATTG
gi|111987                     :                                                                    GATGATGGTTCTAA----CTAAC--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TGTCC--AGTT
gi|111988                     :                                                                               TAA----TCAAT--A-ATTAT---------CAGATATTA-----ACAAAA------ATACTTCA----CATCC--AGTTG





Alignments
lowQualScore                  :     00       0  111    0 0    00   222  2222222   1111 111 111  0         0      1111   1 00 0     444444444        333333      111111        1111     11     
lowQualScore                  :     ..       .  ...    . .    ..   ...  .......   .... ... ...  .         .      ....   . .. .     .........        ......      ......        ....     ..     
lowQualScore                  :     99       7  111    7 7    99   444  7777777   3333 111 111  6         6      3333   4 88 6     999999999        999999      999999        4444     00     
consensus                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
Reference ( family-396 )      : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111923                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111924                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACACTA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111925                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AG-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CTAAC--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111926                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCCAA----CCAAT--A-ATTGT---------CGGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111927                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTTA----CCAAT--T-ATTAT---------CAGATATC------ACAATA------ATACTTCA----TACCC--AGTT
gi|111928                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGTTCATG-TTTTAA----CCAAT--A-CTTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111929                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------TACATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AG
gi|111930                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AATG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------TAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATTC--AG
gi|111931                     : TTTA--GCAAACT-AG---AAAA-T-AAAA--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAGT--A-ATTTT---------AAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111932                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAAA-T-AATG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACATCA----TATCC--AG
gi|111933                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---CC-AAGATAATG-TTCTAA----ATGAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATAC--AGTTG
gi|111934                     : TTTA--GCAAACT-CA---AAAA-A-AAAG--TGC---AA-------CAC----T---G---TA-AAGATCATG-TTCTAA----CTAAT--A-ACTAT---------CAGATATT------ACATTA------ATACTTCA----AATCC--AGCTG
gi|111935                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----C---A---TT-AAGAACCTG-GTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------CAGATATT------ACAACA------ATACATTA----TATCC--AGTT
gi|111936                     : TTTG--GTTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGC---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CC-AT--GTATTAT---------CAGATATT------ACAA-A------ATATTTCA----TATCC--AG
gi|111937                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--ATT---AA-------CAC----T---G---TT-AGGATTATG-TTCTAA----CCATT--T-AGTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--AAT
gi|111938                     : TTTA--GCAAACT-TG---AAAA-T-AAAG--TGTT--AA-------CAC----T---A---TT-AAGATCCTA-TTCTAA----CCATT--A-ATTAC---------CTGATATT------TCAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111939                     : TTTA--GCAAACT-GGTGGAAAA-T-AAAT--CGT---AA-------CAT----T---G---TT-AAGATCATG-TCCTAA----CCAAG--A-AATAT---------TAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--ATTT
gi|111940                     : TTTA--GTAAACT-GG---GAAA-T-AAAG---------A-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT----ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------GTATTTCA----AATCC--AGT
gi|111941                     : TTTA--GCAAATG-GG---AAAA-T-ATTC--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGTTCATT-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAAATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATTC--AGT
gi|111942                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-T-AAAG--TGC---AG-------CAC----T---G---TT-AAGATAATG-TTCTAA----CAATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTACA----TATCCTGAGTT
gi|111943                     : TTTA--GTGAACT-GG---AAAA-T-AAAG--AAT---AA-------CTC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCATT--A-ATGAT---------CAGATATT------ACAATA------ATGCTTCT----TATC
gi|111944                     : TTTA--GCGAGGT-GG---AAAA-T-GAAG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATGATG-TTCTAG----CCATT--A-ATTAC---------CAGATATT------ATAATA------ATATTTCA----AATCC--AGT
gi|111945                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-A-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTAA----CTAAT--A-ATTAT---------C-GAT------------ATA------ACATTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111946                     : TCTG--GCAAACA-AG---AAAA-T-AAAG--TAT---GA-------CAC----T---G---TT-AAGATCGTG-TTCTAA----CCATC--A-ATTAT---------CAGAAAAT------ACAGTA------ATACTTCA----TATCC--
gi|111947                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AATG--CAT---AA-------CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111948                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AATG--CAT---AA-------CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111949                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGC---AC-------AAC----T---G---TT-AAGATACTA-TTCTAA----CAAAA--G-GTTAC---------CAGATATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111950                     : TTCA--GCAAACT-GG---AAAA---AAAG--CAT---AA-------CAC----A---G---TT-AAAATCATG-TTTGAA----TCAAA--A-ATTTT---------GAGATATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111951                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAT----T---G---GT-AAGATAATG-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CATATATA------ATGATA------ATACTTTT----TATC
gi|111952                     : TTTA--GCTAAGT-GG---AAAG-T-ATAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TG-AATATCATG-TTTTAA----CCAAT--A-AATAT---------CAGATATT------ACAATG------ATACTTCA----TA
gi|111953                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111954                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAT----T---G---TT-CAGTTCATG-TTCTAA----CCATT--A-TTTAG---------CAGATATTTAGCA-ACAATC------ATATTTGA----TATCC--AGT
gi|111955                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CAAT--G-ATTAT---------CAGATTTT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111956                     : TTTA--GAAAACA-GG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-------------CTAA----CGAAT--A-CTAAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111957                     : TTTA--GCAAACA-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TT-------CAC----T---G---TT-AAGATAAGG-TTCTAA----ACAAT--A-ATTAT---------CATATCTT------ACAAT-------ATAAT-------TATCC--AGTTG
gi|111958                     : TTTAAGGCAAACT-GT---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------AAC----T---G---TT-----TTATG-TTCTAA----C-AATTTA-AT-AT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AAT
gi|111959                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAC----TTAAGAACTT-AAGATCATG-TTCT------C------------T---------CAGATATT------ACAAAA------ATACTTCA----TATCC--ATTT
gi|111960                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAA-------G--CAT---TA-------CAC----C---G---TT-AAGGTCATG-TTTTAA----CC-------ATT---------------TATG------ACAACA------AAACATCA----TATCC--ATTT
gi|111961                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-ACAG--CAT---TA-------GAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAATTATCCAAT--
gi|111962                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TC-AAGGTCATC-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATATGTCA----TATCC--AGTTG
gi|111963                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAT--TGT---AA-------CAA----A---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-CTTTA---------CAGATATT------TAAATA------ATACTTCATAATTATCC--AGTTG
gi|111964                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------ATC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTTAA----TCAAT--A-ATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--AGTTG
gi|111965                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------CTC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTAAA----TCAAT--A-ATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--ATTTG
gi|111966                     :  TTA--GGAAACT-GG---AAAA-T-TAAT--CTT---AA-------CACCAACT---G---TT-ATGATCATG-TTCTAA----CCTAT--A-ATTAT---------CAGATGTT------ACAATACATGTTATACTTCA----TGTCC--AGTTG
gi|111967                     :  TTG--GCGAACTTAA---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---T---TT-AAGATCATG-ATCTGA----CCATT--A-ATTAT---------CAGAT-TTAGCTAAACAATA------CTATTTCA----TATCT--
gi|111968                     :  TTA--GTGAA--------AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-TGGATAATG-TTCTAA----TAATT--A-ATTAT---------CAGGTATG------ACAA
gi|111969                     :   TA--GCAAACT-CG---AAAA-T-AAAG--TGTT--AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAA----CTAAT--T-ATTAT---------CAGTTATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--TGTTG
gi|111970                     :   TA--GCAAACA-GG---AAAA-TTAAAG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATGAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACTTT-----TATCC--
gi|111971                     :   TA--GGAAACT-GG---AAGA-T-AATG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATTTTG-TTCTAA----CCTTT--A-ATTAT---------CAGATATT------GCACTA------ATACTTCA----TAT
gi|111972                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAA----T---G---TTAAAAATCATG-TTCT-A----CCATT--T-ATTAT---------CAGATATT------ACAGTA------ATACCTCA----TAT
gi|111973                     :   TA--GCAAATT-GG---AAAT-T-AATG--CAC---AA-------CAC----T---A---CT-AAGCTCATA-TTGTAA----CCACT--A-ATTAT---------CAGACATT------ACAACA------ATATTTCT----TATCC--AGT
gi|111974                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAAA--CCT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------A
gi|111975                     :   TA--GTAAACT-GA---AAAA-T-AAAA--AAT---AATGTATATCAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----TCATT--T-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATAGTT
gi|111976                     :    A--GCAAACA-GG---AAAAAT-GAAGTACATCAAAAT------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGACATT------ACAGTA------AAACCTTA----TATCC--AGTT
gi|111977                     :    A--GCAGACT-TG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CAATT--A-ATTAT---------CAGATATT------AC---A------ATGTTTGA----TATAC--AGT
gi|111978                     :    A--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAAA--CCT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------A
gi|111979                     :     --GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---GA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATATTTCA----CACCC--AGT
gi|111980                     :     --GCAATCT-GG---AAAA-T-AAAA--TGT---TA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----GCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ACATTTCA----TATCC--AGT
gi|111981                     :     --GCAAACT-TG---AAA--T-GATG--AGT---AA-------CAC----C--------T-----TCATG-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTCCA----TA
gi|111982                     :          AACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTTA----CCATT--A-ATTAT---------CGGGTATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGT
gi|111983                     :            CC-GG---AAAA-T-AAAG--AGT---AA-------CAG----T-------TT-AAGATCATG-TGCTTA----CCATT--A-CTTAT---------CAGATATT------A----A------GTACTTTA----TATCC--AGT
gi|111984                     :                                   T---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCT----TATCC--CGTTG
gi|111985                     :                                gttT---AA-------CTC----T---C---TT-AAGAGCATG-TTCTAA----CCATG--A-ATTAT---------CTGATATT------CTAATA------GTACTACA----TATCC--ATTT
gi|111986                     :                                                            ---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAC--A-ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------ATATTTT-----TATCC--AATTG
gi|111987                     :                                                                    GATGATGGTTCTAA----CTAAC--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TGTCC--AGTT
gi|111988                     :                                                                               TAA----TCAAT--A-ATTAT---------CAGATATTA-----ACAAAA------ATACTTCA----CATCC--AGTTG


blockSeqs                     :                 TGG                CAA  TGTATAT   CAAC TAA AAC                   TTAT   A          CAGATATTC        AGCTAA      CATGTT        TAAT     TG
blockSeqs                     :                 .                  T    T         .    .   .                     .      A          CAGATATTC        TAGCA       .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  T    .         .    .   .                     .      A          .                A           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      G          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      C          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .        . 
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .          
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .          
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .          
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .          
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .             .          
blockSeqs                     :                 .                  .    .         .    .   .                     .      T          .                .           .             .          
blockSeqs                     :                                    .    .         .    .   .                     .      A          .                .           .                        
blockSeqs                     :                                    .    .         .    .   .                     .      A          .                .                                    
blockSeqs                     :                                                            .                     .      A          .                .                                    
blockSeqs                     :                                                                                  .      .          .                .                                    
blockSeqs                     :                                                                                  .      .                                                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
finalCons                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG





Alignments
lowQualScore                  :     00       0  111    0 0    00   222  2222222   1111 111 111  0         0      1111   1 00 0     444444444        333333      111111        1111     11     
lowQualScore                  :     ..       .  ...    . .    ..   ...  .......   .... ... ...  .         .      ....   . .. .     .........        ......      ......        ....     ..     
lowQualScore                  :     99       7  111    7 7    99   444  7777777   3333 111 111  6         6      3333   4 88 6     999999999        999999      999999        4444     00     
consensus                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
Reference ( family-396 )      : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111923                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111924                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACACTA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111925                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AG-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CTAAC--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111926                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCCAA----CCAAT--A-ATTGT---------CGGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111927                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTTA----CCAAT--T-ATTAT---------CAGATATC------ACAATA------ATACTTCA----TACCC--AGTT
gi|111928                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGTTCATG-TTTTAA----CCAAT--A-CTTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111929                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------TACATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AG
gi|111930                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AATG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------TAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATTC--AG
gi|111931                     : TTTA--GCAAACT-AG---AAAA-T-AAAA--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAGT--A-ATTTT---------AAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111932                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAAA-T-AATG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACATCA----TATCC--AG
gi|111933                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---CC-AAGATAATG-TTCTAA----ATGAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------AAACTTCA----TATAC--AGTTG
gi|111934                     : TTTA--GCAAACT-CA---AAAA-A-AAAG--TGC---AA-------CAC----T---G---TA-AAGATCATG-TTCTAA----CTAAT--A-ACTAT---------CAGATATT------ACATTA------ATACTTCA----AATCC--AGCTG
gi|111935                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----C---A---TT-AAGAACCTG-GTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------CAGATATT------ACAACA------ATACATTA----TATCC--AGTT
gi|111936                     : TTTG--GTTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGC---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CC-AT--GTATTAT---------CAGATATT------ACAA-A------ATATTTCA----TATCC--AG
gi|111937                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--ATT---AA-------CAC----T---G---TT-AGGATTATG-TTCTAA----CCATT--T-AGTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--AAT
gi|111938                     : TTTA--GCAAACT-TG---AAAA-T-AAAG--TGTT--AA-------CAC----T---A---TT-AAGATCCTA-TTCTAA----CCATT--A-ATTAC---------CTGATATT------TCAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111939                     : TTTA--GCAAACT-GGTGGAAAA-T-AAAT--CGT---AA-------CAT----T---G---TT-AAGATCATG-TCCTAA----CCAAG--A-AATAT---------TAGATATT------ACAATA------ATAATTCA----TATCC--ATTT
gi|111940                     : TTTA--GTAAACT-GG---GAAA-T-AAAG---------A-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT----ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------GTATTTCA----AATCC--AGT
gi|111941                     : TTTA--GCAAATG-GG---AAAA-T-ATTC--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGTTCATT-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAAATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATTC--AGT
gi|111942                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-T-AAAG--TGC---AG-------CAC----T---G---TT-AAGATAATG-TTCTAA----CAATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTACA----TATCCTGAGTT
gi|111943                     : TTTA--GTGAACT-GG---AAAA-T-AAAG--AAT---AA-------CTC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCATT--A-ATGAT---------CAGATATT------ACAATA------ATGCTTCT----TATC
gi|111944                     : TTTA--GCGAGGT-GG---AAAA-T-GAAG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATGATG-TTCTAG----CCATT--A-ATTAC---------CAGATATT------ATAATA------ATATTTCA----AATCC--AGT
gi|111945                     : TTTA--CCAAACT-GG---GAAA-A-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTAA----CTAAT--A-ATTAT---------C-GAT------------ATA------ACATTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111946                     : TCTG--GCAAACA-AG---AAAA-T-AAAG--TAT---GA-------CAC----T---G---TT-AAGATCGTG-TTCTAA----CCATC--A-ATTAT---------CAGAAAAT------ACAGTA------ATACTTCA----TATCC--
gi|111947                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AATG--CAT---AA-------CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111948                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-A-AATG--CAT---AA-------CAA----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-AATAT---------C--ATATT------ACAATA------ATAATTCG----T-TCT--AGTTG
gi|111949                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGC---AC-------AAC----T---G---TT-AAGATACTA-TTCTAA----CAAAA--G-GTTAC---------CAGATATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111950                     : TTCA--GCAAACT-GG---AAAA---AAAG--CAT---AA-------CAC----A---G---TT-AAAATCATG-TTTGAA----TCAAA--A-ATTTT---------GAGATATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--AGT
gi|111951                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAT----T---G---GT-AAGATAATG-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CATATATA------ATGATA------ATACTTTT----TATC
gi|111952                     : TTTA--GCTAAGT-GG---AAAG-T-ATAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TG-AATATCATG-TTTTAA----CCAAT--A-AATAT---------CAGATATT------ACAATG------ATACTTCA----TA
gi|111953                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111954                     : TTTA--GCAAATT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAT----T---G---TT-CAGTTCATG-TTCTAA----CCATT--A-TTTAG---------CAGATATTTAGCA-ACAATC------ATATTTGA----TATCC--AGT
gi|111955                     : TTTA--GCTAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-GAGAT----------------CAAT--G-ATTAT---------CAGATTTT------ACAAAA------AAACTTCA----TATCC--AGTT
gi|111956                     : TTTA--GAAAACA-GG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------CAC----T---G---TT-------------CTAA----CGAAT--A-CTAAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AGTTG
gi|111957                     : TTTA--GCAAACA-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TT-------CAC----T---G---TT-AAGATAAGG-TTCTAA----ACAAT--A-ATTAT---------CATATCTT------ACAAT-------ATAAT-------TATCC--AGTTG
gi|111958                     : TTTAAGGCAAACT-GT---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------AAC----T---G---TT-----TTATG-TTCTAA----C-AATTTA-AT-AT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TATCC--AAT
gi|111959                     : TTTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAC----TTAAGAACTT-AAGATCATG-TTCT------C------------T---------CAGATATT------ACAAAA------ATACTTCA----TATCC--ATTT
gi|111960                     : TTTA--GCAAACT-GA---AAA-------G--CAT---TA-------CAC----C---G---TT-AAGGTCATG-TTTTAA----CC-------ATT---------------TATG------ACAACA------AAACATCA----TATCC--ATTT
gi|111961                     : TTAA--GCAAACT-GG---AAAA-T-ACAG--CAT---TA-------GAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAATTATCCAAT--
gi|111962                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TC-AAGGTCATC-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATATGTCA----TATCC--AGTTG
gi|111963                     :  TTA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAT--TGT---AA-------CAA----A---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-CTTTA---------CAGATATT------TAAATA------ATACTTCATAATTATCC--AGTTG
gi|111964                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------ATC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTTAA----TCAAT--A-ATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--AGTTG
gi|111965                     :  TTA--ACAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CTT---AA-------CTC----T---G---TT-AAGATAATG-TTTAAA----TCAAT--A-ATTATCAGATATTCCAGATATT------ACAACA------ATACTCCA----TATCC--ATTTG
gi|111966                     :  TTA--GGAAACT-GG---AAAA-T-TAAT--CTT---AA-------CACCAACT---G---TT-ATGATCATG-TTCTAA----CCTAT--A-ATTAT---------CAGATGTT------ACAATACATGTTATACTTCA----TGTCC--AGTTG
gi|111967                     :  TTG--GCGAACTTAA---AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---T---TT-AAGATCATG-ATCTGA----CCATT--A-ATTAT---------CAGAT-TTAGCTAAACAATA------CTATTTCA----TATCT--
gi|111968                     :  TTA--GTGAA--------AAAA-T-AAAG--TGT---AA-------CAC----T---G---TT-TGGATAATG-TTCTAA----TAATT--A-ATTAT---------CAGGTATG------ACAA
gi|111969                     :   TA--GCAAACT-CG---AAAA-T-AAAG--TGTT--AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAA----CTAAT--T-ATTAT---------CAGTTATT------ACAATA------ATATTTCA----TATCC--TGTTG
gi|111970                     :   TA--GCAAACA-GG---AAAA-TTAAAG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATGAT---------CAAATATT------ACAGTA------ATACTTT-----TATCC--
gi|111971                     :   TA--GGAAACT-GG---AAGA-T-AATG--CTT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATTTTG-TTCTAA----CCTTT--A-ATTAT---------CAGATATT------GCACTA------ATACTTCA----TAT
gi|111972                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---TA-------CAA----T---G---TTAAAAATCATG-TTCT-A----CCATT--T-ATTAT---------CAGATATT------ACAGTA------ATACCTCA----TAT
gi|111973                     :   TA--GCAAATT-GG---AAAT-T-AATG--CAC---AA-------CAC----T---A---CT-AAGCTCATA-TTGTAA----CCACT--A-ATTAT---------CAGACATT------ACAACA------ATATTTCT----TATCC--AGT
gi|111974                     :   TA--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAAA--CCT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------A
gi|111975                     :   TA--GTAAACT-GA---AAAA-T-AAAA--AAT---AATGTATATCAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----TCATT--T-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATAGTT
gi|111976                     :    A--GCAAACA-GG---AAAAAT-GAAGTACATCAAAAT------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAT--A-ATTAT---------CAGACATT------ACAGTA------AAACCTTA----TATCC--AGTT
gi|111977                     :    A--GCAGACT-TG---AAAA-T-AAAG--CAT---AA-------TAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CAATT--A-ATTAT---------CAGATATT------AC---A------ATGTTTGA----TATAC--AGT
gi|111978                     :    A--GCAAACT-GG---AAAA-T-TAAA--CCT---AA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATT-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------A
gi|111979                     :     --GCAAACT-GG---AAAA-T-AAAG--TGT---GA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATA-TTCTAG----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAAAA------ATATTTCA----CACCC--AGT
gi|111980                     :     --GCAATCT-GG---AAAA-T-AAAA--TGT---TA-------CAC----T---G---TT-AAAATCATG-TTCTAA----GCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ACATTTCA----TATCC--AGT
gi|111981                     :     --GCAAACT-TG---AAA--T-GATG--AGT---AA-------CAC----C--------T-----TCATG-TTCTAA----CCATT--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAACA------ATATTCCA----TA
gi|111982                     :          AACT-GG---AAAA-T-AAAG--CGT---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATTATG-TTCTTA----CCATT--A-ATTAT---------CGGGTATT------ACAATA------CTTTTTCA----TATCC--AGT
gi|111983                     :            CC-GG---AAAA-T-AAAG--AGT---AA-------CAG----T-------TT-AAGATCATG-TGCTTA----CCATT--A-CTTAT---------CAGATATT------A----A------GTACTTTA----TATCC--AGT
gi|111984                     :                                   T---AA-------CAC----T---G---TT-AAGATCATG-TTTTAA----CCAAT--G-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCT----TATCC--CGTTG
gi|111985                     :                                gttT---AA-------CTC----T---C---TT-AAGAGCATG-TTCTAA----CCATG--A-ATTAT---------CTGATATT------CTAATA------GTACTACA----TATCC--ATTT
gi|111986                     :                                                            ---TT-AAGATCATG-TTCTAA----CCAAC--A-ATTAT---------CTGATATT------ACAATA------ATATTTT-----TATCC--AATTG
gi|111987                     :                                                                    GATGATGGTTCTAA----CTAAC--A-ATTAT---------CAGATATT------ACAATA------ATACTTCA----TGTCC--AGTT
gi|111988                     :                                                                               TAA----TCAAT--A-ATTAT---------CAGATATTA-----ACAAAA------ATACTTCA----CATCC--AGTTG