lowQualScore                  :                                                         0 3             22222222222      6     0       
lowQualScore                  :                                                         . .             ...........      .     .       
lowQualScore                  :                                                         6 6             77777777777      5     6       
consensus                     :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
Reference ( gi|45195 )        :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCA-CATAGCA
gi|45197                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45196                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCCATG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45193                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCG-CATAGCA
gi|45198                      :                           TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45194                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACCTAGCATCATG-CGGGTCTCGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45205                      :                           TCTAGGTTCGGTCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCA-CATAGCA
gi|45202                      :                           TCCATGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATATTTCA-CATAGCA
gi|45200                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-TGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAACA
gi|45203                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-AGAGTCTGGTCTAGG-----------TGCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45204                      :                           TCTAGGTTCAATCCTTCACATAGCAACATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45206                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATAATG-CTGGTCTGGTCCTGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45207                      :                           TCTAGGTTCGATCATTCACATAGCATCATG-C-GGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45201                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CGGGTCTAGTCTACG-----------TTCGAACCTTCA-CATAGCA
gi|45209                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCGCAAATTATCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45208                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGTATA-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CTTAGCA
gi|45245                      :                           TCTAGGTTCAATCCTTCACAGAGCATCATG-CTGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45211                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCC-CAAAGCA
gi|45199                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCACATAACATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CA
gi|45213                      :                           TCTAGGTCCGATCCTTCACATAATATCATG-CTGGTATGGTCTAAG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45214                      :                           TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATCATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTA-CATAGCA
gi|45210                      :                           TCTAAGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-GTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTA-TATAGCA
gi|45215                      :                           TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGGTCCTTCA-CATAG
gi|45220                      :                           TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGT-----------TTCGATACTTCA-CAAAGCA
gi|45216                      :                           TCTAGGTTCGGTCTTTTACAAAGTATTATG-CGGATCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45217                      :                           TCTAGGTTTGATATTTCACATAGCAGCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45218                      :                           TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATTATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTA-CATAGCA
gi|45219                      :                           TCTAGGTTCGATCATTCACATATCAGCATG-CTGGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45244                      :                           TTTAGATTCGATCCTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTTGTCTAGT-----------TACGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45246                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTTACAAAGTATCATG-CGGGTCTGGTCTAGGTCTACTTTAGATTCGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45221                      :                           TCAAGGTTAGATCATTCACATAGTATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45247                      :                           TCTAAGTTCGGTCCTTCACATAGCATCATA-CTGGTCTGGTCTAAA-----------TTCGATCCTTCA-CATGGTA
gi|45248                      :                           TCTAAATTCGATCCTTCACATGGTATCATG-CTGATTTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCA-CATAGCA
gi|45228                      :                           TCTAGGTCCAATCTTTCACATAGCAGCACG-CAGGTCTGGTCTATG-----------TTCGATACTTCA-CATAGCA
gi|45222                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTCGCATAGCATCAAG-CTGGTCTGGTCTGGG-----------TTTGATCCTTCA-TATACCA
gi|45249                      :                           TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTGTTCTAGG-----------TTCAATCCTTCA-CAGAGCA
gi|45224                      :                           TCTAGATTCGATCTTCCACATAGCAGCATG-TAAGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCA-CATAGCA
gi|45225                      :                           TCTAGGTTTGAACTTTCACATGGCATAACG-CAGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45226                      :                           TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTATGTCCTTCA-CATAGCA
gi|45227                      :                           TCTATGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CAGATATGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CAGAGCA
gi|45212                      :                           TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGCATCATGATGGTTTTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTCA-CATAGCA
gi|45223                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTATCAAAGCAGCATG-CGGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CCTAGCA
gi|45229                      :                           TCTATGTTCGATACTTCACATAGCATCATG-CAGGTCTGGTCAAGG-----------TTAGATCATTCA-CATAGTA
gi|45230                      :                           TCTAGGTTCGATATTTCACATAGCATTATG-CAAGTCTGGTGTAGG-----------TTCAATCCTT-A-CATAGCA
gi|45231                      :                           TCTAGGTTATGTCCTTCACATAGCATCATG-CTTGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCA-CATATCA
gi|45232                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACAGAGCATCATG-CTATTTTGGTCTAGG-----------TCCGATCCTTCA-CATA
gi|45239                      :                           TCTAGGTGCGATCCTTCACATAGCATCATA-CGGGTCTGATCTAGG-----------TTCGA
gi|45233                      :                           TCTATGTTTGATCCTTCTCAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTATG-----------TTCGATCCTTCA-CTTAGCA
gi|45235                      :                           TCAAGGTTCGATCTTTCACCTAGCAGCACG-CGGCTCTGGTCTAGA-----------TTCGATCTTCCA-CATAGCA
gi|45234                      :                           TCTAGGTTCGATCCTTTATATAGCATCATA-CGGGTACGGTCTAGG-----------TTCGGTCTTTTA-CAAAGTA
gi|45236                      :                           TCTAGTTTCGATACTTCACAAAGCATCGTG-CATGTCTGGTCTAGG-----------TCCAATCTTTCA-CATAGCA
gi|45238                      :                           TCTAGGTTCGATCTTTCACAATGCATAATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCG-CA
gi|45241                      :                           TCTGGGTTTGATCCTTCATATACCATCATG-CTGGTCTGGTCTTAG-----------TTCGATATTCCA-CATAGC
gi|45240                      :                           TCTACGTTCGAACCTTCACATAGCATCATG-TTGGTACGGTCAAGG-----------TTCGATCTTTCA-CCTAGCA
gi|45242                      :                           TCTAGGTTTGATCCTTCCCAAAGCATCATG-CTGGTCTGCTCTAGG-----------TTCGA-TCTTTATCAAAGCA
gi|45252                      :                           TCTAGGTTTGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------
gi|45251                      :                           TCTA--TTCGATCCTTCACAAAGCATCATA-CGGATACGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTA-CAAAGTA
gi|45250                      :                           TCTAGGTTCCATCTTTCAAATAGCAGTATG-CGGACCTTGCCTAAG-----------TTCGATCCTTCA-TATAGCA
gi|45237                      :                           TCTAAGTTCAATCTTTCACATAGTATCATG-TGGATCTTGTCTATG-----------TTTGATCCTTCT-CAAAGTA
gi|45261                      :                           TCTAGGTTCCATCTTTCAAATAGCA
gi|45243                      :  ttcacataacatcatgctggtctggTCTTAGTTCGATATTCCACATAGCTGCATG-GGGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCCTTCT-TATAGCA
gi|45260                      :                           TCTAAGTTCAATCTTTCACATAGTA
gi|45253                      : cctgcacaaagtatcatgcgagtctggCTAAGTTCGATCCTTCATATAGCATCATG-CAGGTCTGGT-TAGG-----------CTAGATCCTTCA-AATAACA
gi|45254                      :                             TAGGTTCAATCCTT-ACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCAATCCTTCA-CATAGCA
gi|45256                      :                             TAGGTTCGATATTTCACATAACATCATG-CGGGCCTGGTCTAAG-----------TTCGGTCCTTCA-CATAGCA
gi|45258                      :                             TAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTAGACTGGTGTAGG-----------TTCGATATTTCA-CATAACA
gi|45255                      :                             TAGGTTCGATCCTTCTTATAGCATCATG-TTAGTATGGTCTAGG-----------TTTGATATTTCA-CATAGCA
gi|45257                      :                             TAGGCTAGATCCTTCAAATAACATCGTG-CGGGTATTGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCA-CATAG
gi|45259                      :                               GGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGAACTTTCA-CATGGCA
gi|45260                      :                                       CCTGCACAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTAAG-----------TTCAATCTTTCA-CATAGTA
gi|45261                      :                                         TTCACATAACATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCCATCTTTCA-AATAGCA
gi|45199                      :                                                                   TCTAGG-----------TTCGATCCTTCA-CATAACA
gi|45239                      :                                                                   TCTAGG-----------TGCGATCCTTCA-CATAGCAtcatgcgggtcttgtctaggttcgatctttcaca
gi|45252                      :                                                                   TCTAGG-----------TTTGATCCTTCA-CATAGCAtcatacgggtctgatctaggttcga





Alignments
lowQualScore                  :                               0 3             22222222222                   
lowQualScore                  :                               . .             ...........                   
lowQualScore                  :                               6 4             88888888888                   
consensus                     : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
Reference ( family-391 )      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45193                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCGCATAGCA
gi|45194                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACCTAGCATCATG-CGGGTCTCGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45195                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCACATAGCA
gi|45196                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCCATG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45197                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45198                      : TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45199                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAACATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACA
gi|45200                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-TGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAACA
gi|45201                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CGGGTCTAGTCTACG-----------TTCGAACCTTCACATAGCA
gi|45202                      : TCCATGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATATTTCACATAGCA
gi|45203                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-AGAGTCTGGTCTAGG-----------TGCGATCCTTCACATAGCA
gi|45204                      : TCTAGGTTCAATCCTTCACATAGCAACATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45205                      : TCTAGGTTCGGTCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCACATAGCA
gi|45206                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATAATG-CTGGTCTGGTCCTGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45207                      : TCTAGGTTCGATCATTCACATAGCATCATG-C-GGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45208                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGTATA-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACTTAGCA
gi|45209                      : TCTAGGTTCGATCCTTCGCAAATTATCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45210                      : TCTAAGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-GTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTATATAGCA
gi|45211                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCCCAAAGCA
gi|45212                      : TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGCATCATGATGGTTTTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45213                      : TCTAGGTCCGATCCTTCACATAATATCATG-CTGGTATGGTCTAAG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45214                      : TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATCATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTACATAGCA
gi|45215                      : TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGGTCCTTCACATAG
gi|45216                      : TCTAGGTTCGGTCTTTTACAAAGTATTATG-CGGATCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45217                      : TCTAGGTTTGATATTTCACATAGCAGCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCACATAGCA
gi|45218                      : TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATTATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTACATAGCA
gi|45219                      : TCTAGGTTCGATCATTCACATATCAGCATG-CTGGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45220                      : TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGT-----------TTCGATACTTCACAAAGCA
gi|45221                      : TCAAGGTTAGATCATTCACATAGTATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45222                      : TCTAGGTTCGATCCTTCGCATAGCATCAAG-CTGGTCTGGTCTGGG-----------TTTGATCCTTCATATACCA
gi|45223                      : TCTAGGTTCGATCTTTATCAAAGCAGCATG-CGGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACCTAGCA
gi|45224                      : TCTAGATTCGATCTTCCACATAGCAGCATG-TAAGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCACATAGCA
gi|45225                      : TCTAGGTTTGAACTTTCACATGGCATAACG-CAGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45226                      : TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTATGTCCTTCACATAGCA
gi|45227                      : TCTATGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CAGATATGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACAGAGCA
gi|45228                      : TCTAGGTCCAATCTTTCACATAGCAGCACG-CAGGTCTGGTCTATG-----------TTCGATACTTCACATAGCA
gi|45229                      : TCTATGTTCGATACTTCACATAGCATCATG-CAGGTCTGGTCAAGG-----------TTAGATCATTCACATAGTA
gi|45230                      : TCTAGGTTCGATATTTCACATAGCATTATG-CAAGTCTGGTGTAGG-----------TTCAATCCTT-ACATAGCA
gi|45231                      : TCTAGGTTATGTCCTTCACATAGCATCATG-CTTGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCACATATCA
gi|45232                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACAGAGCATCATG-CTATTTTGGTCTAGG-----------TCCGATCCTTCACATA
gi|45233                      : TCTATGTTTGATCCTTCTCAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTATG-----------TTCGATCCTTCACTTAGCA
gi|45234                      : TCTAGGTTCGATCCTTTATATAGCATCATA-CGGGTACGGTCTAGG-----------TTCGGTCTTTTACAAAGTA
gi|45235                      : TCAAGGTTCGATCTTTCACCTAGCAGCACG-CGGCTCTGGTCTAGA-----------TTCGATCTTCCACATAGCA
gi|45236                      : TCTAGTTTCGATACTTCACAAAGCATCGTG-CATGTCTGGTCTAGG-----------TCCAATCTTTCACATAGCA
gi|45237                      : TCTAAGTTCAATCTTTCACATAGTATCATG-TGGATCTTGTCTATG-----------TTTGATCCTTCTCAAAGTA
gi|45238                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACAATGCATAATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCGCA
gi|45239                      : TCTAGGTGCGATCCTTCACATAGCATCATA-CGGGTCTGATCTAGG-----------TTCGA
gi|45240                      : TCTACGTTCGAACCTTCACATAGCATCATG-TTGGTACGGTCAAGG-----------TTCGATCTTTCACCTAGCA
gi|45241                      : TCTGGGTTTGATCCTTCATATACCATCATG-CTGGTCTGGTCTTAG-----------TTCGATATTCCACATAGC
gi|45242                      : TCTAGGTTTGATCCTTCCCAAAGCATCATG-CTGGTCTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTATCAAAGCA
gi|45243                      : TCTTAGTTCGATATTCCACATAGCTGCATG-GGGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCCTTCTTATAGCA
gi|45244                      : TTTAGATTCGATCCTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTTGTCTAGT-----------TACGATCCTTCACATAGCA
gi|45245                      : TCTAGGTTCAATCCTTCACAGAGCATCATG-CTGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45246                      : TCTAGGTTCGATCCTTTACAAAGTATCATG-CGGGTCTGGTCTAGGTCTACTTTAGATTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45247                      : TCTAAGTTCGGTCCTTCACATAGCATCATA-CTGGTCTGGTCTAAA-----------TTCGATCCTTCACATGGTA
gi|45248                      : TCTAAATTCGATCCTTCACATGGTATCATG-CTGATTTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCACATAGCA
gi|45249                      : TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTGTTCTAGG-----------TTCAATCCTTCACAGAGCA
gi|45250                      : TCTAGGTTCCATCTTTCAAATAGCAGTATG-CGGACCTTGCCTAAG-----------TTCGATCCTTCATATAGCA
gi|45251                      : TCTA--TTCGATCCTTCACAAAGCATCATA-CGGATACGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTACAAAGTA
gi|45252                      : TCTAGGTTTGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------
gi|45253                      :  CTAAGTTCGATCCTTCATATAGCATCATG-CAGGTCTGGT-TAGG-----------CTAGATCCTTCAAATAACA
gi|45254                      :   TAGGTTCAATCCTT-ACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCAATCCTTCACATAGCA
gi|45255                      :   TAGGTTCGATCCTTCTTATAGCATCATG-TTAGTATGGTCTAGG-----------TTTGATATTTCACATAGCA
gi|45256                      :   TAGGTTCGATATTTCACATAACATCATG-CGGGCCTGGTCTAAG-----------TTCGGTCCTTCACATAGCA
gi|45257                      :   TAGGCTAGATCCTTCAAATAACATCGTG-CGGGTATTGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCACATAG
gi|45258                      :   TAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTAGACTGGTGTAGG-----------TTCGATATTTCACATAACA
gi|45259                      :     GGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGAACTTTCACATGGCA
gi|45260                      :             CCTGCACAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTAAG-----------TTCAATCTTTCACATAGTA
gi|45261                      :               TTCACATAACATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCCATCTTTCAAATAGCA





Alignments
lowQualScore                  :                               0 3             22222222222                   
lowQualScore                  :                               . .             ...........                   
lowQualScore                  :                               6 4             88888888888                   
consensus                     : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
Reference ( family-391 )      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45193                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCGCATAGCA
gi|45194                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACCTAGCATCATG-CGGGTCTCGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45195                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCACATAGCA
gi|45196                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCCATG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45197                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45198                      : TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45199                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAACATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACA
gi|45200                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-TGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAACA
gi|45201                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CGGGTCTAGTCTACG-----------TTCGAACCTTCACATAGCA
gi|45202                      : TCCATGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATATTTCACATAGCA
gi|45203                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-AGAGTCTGGTCTAGG-----------TGCGATCCTTCACATAGCA
gi|45204                      : TCTAGGTTCAATCCTTCACATAGCAACATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45205                      : TCTAGGTTCGGTCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCACATAGCA
gi|45206                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATAATG-CTGGTCTGGTCCTGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45207                      : TCTAGGTTCGATCATTCACATAGCATCATG-C-GGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45208                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGTATA-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACTTAGCA
gi|45209                      : TCTAGGTTCGATCCTTCGCAAATTATCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45210                      : TCTAAGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-GTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTATATAGCA
gi|45211                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCCCAAAGCA
gi|45212                      : TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGCATCATGATGGTTTTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45213                      : TCTAGGTCCGATCCTTCACATAATATCATG-CTGGTATGGTCTAAG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45214                      : TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATCATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTACATAGCA
gi|45215                      : TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGGTCCTTCACATAG
gi|45216                      : TCTAGGTTCGGTCTTTTACAAAGTATTATG-CGGATCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45217                      : TCTAGGTTTGATATTTCACATAGCAGCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCACATAGCA
gi|45218                      : TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATTATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTACATAGCA
gi|45219                      : TCTAGGTTCGATCATTCACATATCAGCATG-CTGGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45220                      : TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGT-----------TTCGATACTTCACAAAGCA
gi|45221                      : TCAAGGTTAGATCATTCACATAGTATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45222                      : TCTAGGTTCGATCCTTCGCATAGCATCAAG-CTGGTCTGGTCTGGG-----------TTTGATCCTTCATATACCA
gi|45223                      : TCTAGGTTCGATCTTTATCAAAGCAGCATG-CGGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACCTAGCA
gi|45224                      : TCTAGATTCGATCTTCCACATAGCAGCATG-TAAGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCACATAGCA
gi|45225                      : TCTAGGTTTGAACTTTCACATGGCATAACG-CAGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45226                      : TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTATGTCCTTCACATAGCA
gi|45227                      : TCTATGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CAGATATGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACAGAGCA
gi|45228                      : TCTAGGTCCAATCTTTCACATAGCAGCACG-CAGGTCTGGTCTATG-----------TTCGATACTTCACATAGCA
gi|45229                      : TCTATGTTCGATACTTCACATAGCATCATG-CAGGTCTGGTCAAGG-----------TTAGATCATTCACATAGTA
gi|45230                      : TCTAGGTTCGATATTTCACATAGCATTATG-CAAGTCTGGTGTAGG-----------TTCAATCCTT-ACATAGCA
gi|45231                      : TCTAGGTTATGTCCTTCACATAGCATCATG-CTTGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCACATATCA
gi|45232                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACAGAGCATCATG-CTATTTTGGTCTAGG-----------TCCGATCCTTCACATA
gi|45233                      : TCTATGTTTGATCCTTCTCAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTATG-----------TTCGATCCTTCACTTAGCA
gi|45234                      : TCTAGGTTCGATCCTTTATATAGCATCATA-CGGGTACGGTCTAGG-----------TTCGGTCTTTTACAAAGTA
gi|45235                      : TCAAGGTTCGATCTTTCACCTAGCAGCACG-CGGCTCTGGTCTAGA-----------TTCGATCTTCCACATAGCA
gi|45236                      : TCTAGTTTCGATACTTCACAAAGCATCGTG-CATGTCTGGTCTAGG-----------TCCAATCTTTCACATAGCA
gi|45237                      : TCTAAGTTCAATCTTTCACATAGTATCATG-TGGATCTTGTCTATG-----------TTTGATCCTTCTCAAAGTA
gi|45238                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACAATGCATAATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCGCA
gi|45239                      : TCTAGGTGCGATCCTTCACATAGCATCATA-CGGGTCTGATCTAGG-----------TTCGA
gi|45240                      : TCTACGTTCGAACCTTCACATAGCATCATG-TTGGTACGGTCAAGG-----------TTCGATCTTTCACCTAGCA
gi|45241                      : TCTGGGTTTGATCCTTCATATACCATCATG-CTGGTCTGGTCTTAG-----------TTCGATATTCCACATAGC
gi|45242                      : TCTAGGTTTGATCCTTCCCAAAGCATCATG-CTGGTCTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTATCAAAGCA
gi|45243                      : TCTTAGTTCGATATTCCACATAGCTGCATG-GGGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCCTTCTTATAGCA
gi|45244                      : TTTAGATTCGATCCTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTTGTCTAGT-----------TACGATCCTTCACATAGCA
gi|45245                      : TCTAGGTTCAATCCTTCACAGAGCATCATG-CTGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45246                      : TCTAGGTTCGATCCTTTACAAAGTATCATG-CGGGTCTGGTCTAGGTCTACTTTAGATTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45247                      : TCTAAGTTCGGTCCTTCACATAGCATCATA-CTGGTCTGGTCTAAA-----------TTCGATCCTTCACATGGTA
gi|45248                      : TCTAAATTCGATCCTTCACATGGTATCATG-CTGATTTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCACATAGCA
gi|45249                      : TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTGTTCTAGG-----------TTCAATCCTTCACAGAGCA
gi|45250                      : TCTAGGTTCCATCTTTCAAATAGCAGTATG-CGGACCTTGCCTAAG-----------TTCGATCCTTCATATAGCA
gi|45251                      : TCTA--TTCGATCCTTCACAAAGCATCATA-CGGATACGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTACAAAGTA
gi|45252                      : TCTAGGTTTGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------
gi|45253                      :  CTAAGTTCGATCCTTCATATAGCATCATG-CAGGTCTGGT-TAGG-----------CTAGATCCTTCAAATAACA
gi|45254                      :   TAGGTTCAATCCTT-ACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCAATCCTTCACATAGCA
gi|45255                      :   TAGGTTCGATCCTTCTTATAGCATCATG-TTAGTATGGTCTAGG-----------TTTGATATTTCACATAGCA
gi|45256                      :   TAGGTTCGATATTTCACATAACATCATG-CGGGCCTGGTCTAAG-----------TTCGGTCCTTCACATAGCA
gi|45257                      :   TAGGCTAGATCCTTCAAATAACATCGTG-CGGGTATTGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCACATAG
gi|45258                      :   TAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTAGACTGGTGTAGG-----------TTCGATATTTCACATAACA
gi|45259                      :     GGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGAACTTTCACATGGCA
gi|45260                      :             CCTGCACAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTAAG-----------TTCAATCTTTCACATAGTA
gi|45261                      :               TTCACATAACATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCCATCTTTCAAATAGCA


blockSeqs                     :                                 G             TCTACTTTAGA
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 A             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 G             .          
blockSeqs                     :                                 T             .          
blockSeqs                     :                                 .             .          


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
finalCons                     : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA





Alignments
lowQualScore                  :                               0 3             22222222222                   
lowQualScore                  :                               . .             ...........                   
lowQualScore                  :                               6 4             88888888888                   
consensus                     : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
Reference ( family-391 )      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45193                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCGCATAGCA
gi|45194                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACCTAGCATCATG-CGGGTCTCGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45195                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCACATAGCA
gi|45196                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCCATG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45197                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45198                      : TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45199                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAACATCATG-CGGGTCTTGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACA
gi|45200                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGCATG-TGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAACA
gi|45201                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CGGGTCTAGTCTACG-----------TTCGAACCTTCACATAGCA
gi|45202                      : TCCATGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATATTTCACATAGCA
gi|45203                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-AGAGTCTGGTCTAGG-----------TGCGATCCTTCACATAGCA
gi|45204                      : TCTAGGTTCAATCCTTCACATAGCAACATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45205                      : TCTAGGTTCGGTCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATTCTTCACATAGCA
gi|45206                      : TCTAGGTTCGATCCTTCACATAGCATAATG-CTGGTCTGGTCCTGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45207                      : TCTAGGTTCGATCATTCACATAGCATCATG-C-GGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45208                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCAGTATA-CGGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACTTAGCA
gi|45209                      : TCTAGGTTCGATCCTTCGCAAATTATCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45210                      : TCTAAGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-GTGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTATATAGCA
gi|45211                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCCCAAAGCA
gi|45212                      : TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGCATCATGATGGTTTTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45213                      : TCTAGGTCCGATCCTTCACATAATATCATG-CTGGTATGGTCTAAG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45214                      : TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATCATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTACATAGCA
gi|45215                      : TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGGTCCTTCACATAG
gi|45216                      : TCTAGGTTCGGTCTTTTACAAAGTATTATG-CGGATCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45217                      : TCTAGGTTTGATATTTCACATAGCAGCATG-CGGGTTTGGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCACATAGCA
gi|45218                      : TCTAGGTTCGATTCTTCACATAGCATTATG-TTGGTCTGGTTTAGT-----------TTCGATCCTTTACATAGCA
gi|45219                      : TCTAGGTTCGATCATTCACATATCAGCATG-CTGGTCTGGTTTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45220                      : TTTAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGT-----------TTCGATACTTCACAAAGCA
gi|45221                      : TCAAGGTTAGATCATTCACATAGTATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45222                      : TCTAGGTTCGATCCTTCGCATAGCATCAAG-CTGGTCTGGTCTGGG-----------TTTGATCCTTCATATACCA
gi|45223                      : TCTAGGTTCGATCTTTATCAAAGCAGCATG-CGGGTCTAGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCACCTAGCA
gi|45224                      : TCTAGATTCGATCTTCCACATAGCAGCATG-TAAGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCACATAGCA
gi|45225                      : TCTAGGTTTGAACTTTCACATGGCATAACG-CAGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45226                      : TTTAGTTTCGATCCTTTACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTATGTCCTTCACATAGCA
gi|45227                      : TCTATGTTCGATCCTTCACTTAGCATCATG-CAGATATGGTCTAGG-----------TTCGATCTTTCACAGAGCA
gi|45228                      : TCTAGGTCCAATCTTTCACATAGCAGCACG-CAGGTCTGGTCTATG-----------TTCGATACTTCACATAGCA
gi|45229                      : TCTATGTTCGATACTTCACATAGCATCATG-CAGGTCTGGTCAAGG-----------TTAGATCATTCACATAGTA
gi|45230                      : TCTAGGTTCGATATTTCACATAGCATTATG-CAAGTCTGGTGTAGG-----------TTCAATCCTT-ACATAGCA
gi|45231                      : TCTAGGTTATGTCCTTCACATAGCATCATG-CTTGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCATTCACATATCA
gi|45232                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACAGAGCATCATG-CTATTTTGGTCTAGG-----------TCCGATCCTTCACATA
gi|45233                      : TCTATGTTTGATCCTTCTCAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTATG-----------TTCGATCCTTCACTTAGCA
gi|45234                      : TCTAGGTTCGATCCTTTATATAGCATCATA-CGGGTACGGTCTAGG-----------TTCGGTCTTTTACAAAGTA
gi|45235                      : TCAAGGTTCGATCTTTCACCTAGCAGCACG-CGGCTCTGGTCTAGA-----------TTCGATCTTCCACATAGCA
gi|45236                      : TCTAGTTTCGATACTTCACAAAGCATCGTG-CATGTCTGGTCTAGG-----------TCCAATCTTTCACATAGCA
gi|45237                      : TCTAAGTTCAATCTTTCACATAGTATCATG-TGGATCTTGTCTATG-----------TTTGATCCTTCTCAAAGTA
gi|45238                      : TCTAGGTTCGATCTTTCACAATGCATAATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTCGCA
gi|45239                      : TCTAGGTGCGATCCTTCACATAGCATCATA-CGGGTCTGATCTAGG-----------TTCGA
gi|45240                      : TCTACGTTCGAACCTTCACATAGCATCATG-TTGGTACGGTCAAGG-----------TTCGATCTTTCACCTAGCA
gi|45241                      : TCTGGGTTTGATCCTTCATATACCATCATG-CTGGTCTGGTCTTAG-----------TTCGATATTCCACATAGC
gi|45242                      : TCTAGGTTTGATCCTTCCCAAAGCATCATG-CTGGTCTGCTCTAGG-----------TTCGATCTTTATCAAAGCA
gi|45243                      : TCTTAGTTCGATATTCCACATAGCTGCATG-GGGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCCTTCTTATAGCA
gi|45244                      : TTTAGATTCGATCCTTCACATAGCAGCATG-CGGGTCTTGTCTAGT-----------TACGATCCTTCACATAGCA
gi|45245                      : TCTAGGTTCAATCCTTCACAGAGCATCATG-CTGGTCTGGTATAGG-----------TTCGATCTTTCACATAGCA
gi|45246                      : TCTAGGTTCGATCCTTTACAAAGTATCATG-CGGGTCTGGTCTAGGTCTACTTTAGATTCGATCCTTCACATAGCA
gi|45247                      : TCTAAGTTCGGTCCTTCACATAGCATCATA-CTGGTCTGGTCTAAA-----------TTCGATCCTTCACATGGTA
gi|45248                      : TCTAAATTCGATCCTTCACATGGTATCATG-CTGATTTGGTCTAGG-----------TTTGATCCTTCACATAGCA
gi|45249                      : TCTAGGTTAGATCCTTCACATAGAATCATG-CTGGTCTGTTCTAGG-----------TTCAATCCTTCACAGAGCA
gi|45250                      : TCTAGGTTCCATCTTTCAAATAGCAGTATG-CGGACCTTGCCTAAG-----------TTCGATCCTTCATATAGCA
gi|45251                      : TCTA--TTCGATCCTTCACAAAGCATCATA-CGGATACGGTCTAGG-----------TTCGATCCTTTACAAAGTA
gi|45252                      : TCTAGGTTTGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------
gi|45253                      :  CTAAGTTCGATCCTTCATATAGCATCATG-CAGGTCTGGT-TAGG-----------CTAGATCCTTCAAATAACA
gi|45254                      :   TAGGTTCAATCCTT-ACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCAATCCTTCACATAGCA
gi|45255                      :   TAGGTTCGATCCTTCTTATAGCATCATG-TTAGTATGGTCTAGG-----------TTTGATATTTCACATAGCA
gi|45256                      :   TAGGTTCGATATTTCACATAACATCATG-CGGGCCTGGTCTAAG-----------TTCGGTCCTTCACATAGCA
gi|45257                      :   TAGGCTAGATCCTTCAAATAACATCGTG-CGGGTATTGTCTAGG-----------TTAGATCCTTCACATAG
gi|45258                      :   TAGGTTCGATCTTTCACATAGCATCATG-CTAGACTGGTGTAGG-----------TTCGATATTTCACATAACA
gi|45259                      :     GGTTCGATCCTTCACATAGCATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTTGAACTTTCACATGGCA
gi|45260                      :             CCTGCACAAAGTATCATG-CGAGTCTGGTCTAAG-----------TTCAATCTTTCACATAGTA
gi|45261                      :               TTCACATAACATCATG-CTGGTCTGGTCTAGG-----------TTCCATCTTTCAAATAGCA