lowQualScore                  :        1                                                                                                 1111111111111111111111                     1111111111                                                         222222222222222                                11111                   11111         
lowQualScore                  :        6    5   222     111  4444444444      11 333333333333333 0     1111 2222222 11  33333333  2222    8888888888888888888888     2222 33 2 1 333 8888888888   00  88888   0 0  00 1 111 111 11 11111    4444444 1 1 222222222222222   00   0       2222222222      11111          888      77777         
lowQualScore                  :        .    .   ...     ...  ..........      .. ............... .     .... ....... ..  ........  ....    ......................     .... .. . . ... ..........   ..  .....   . .  .. . ... ... .. .....    ....... . . ...............   ..   .       ..........      .....          ...      .....         
lowQualScore                  :        9    6   777     000  6666666666      33 555555555555555 5     7777 3333333 33  55555555  1111    7777777777777777777777     3333 44 7 6 666 7777777777   77  66666   5 5  77 1 000 000 55 44444    2222222 1 1 666666666666666   88   6       5555555555      99999          111      00000         
consensus                     :      GAAGAGATATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACATC----------TCAAGT----AAACAACCAATA--ACATCAA----CAGACAATA
Reference ( gi|136467 )       :      GATGAGACATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTGC-T-G-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--A--T----TGA--CA---T-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------C-T---A--ATT--CAG-TAACATC----------TCAAGT----GAACAACCAATG--ACATCAT----CAGACAATA
gi|136468                     :      GAAGAGATTTA---AAAAT---GC----------AAAACT--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTAC-T-T-----G----------GCAAT----G--A-A-A---A--A--G----TGA--CG---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GAAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACATC----------TCTAAT----AAACAACCAACA--GCATCAT----CAGACAATA
gi|136466                     :      GAAGAGATATA---AAAAC---AC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-AT--A--A--G----TGA--TT---C-CAA-T-GC--A-G---C---A--G-----TTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAA-TAACGTT----------TCAAAT----AAACAACCAATA--GCATCAA----CGGACAATA
gi|136470                     :      GAAGAGATATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GA--------AG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-ATA---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----TTAC-------C-ATA------T-T------ATT--CAG-CAACATC----------TCAAGT----A---AACCAATA--ACCAAAT-----AGACAATA
gi|136469                     :      GAAGAGCTATG---GAAAC---GT----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTAA-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--A--A----T-A--TA---C-CAA-C-GC--AGG---G---G--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---C--ATT--CA--TGACGCC----------TCAAGT----AAACAACCAATA--ACATTAA----CAGACAATA
gi|136471                     :      GAAGAGATATG---AAAAC---GT----------AACACG--T---------------G-GTTTA----G-------A--GGTATATAGGAG----ACTTG---------------------AAAAT----G--A-A-A---A--AA-G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTGC-------T-A-A------A-A---T--ATT--CAG-AAACATC----------TCAAGT----TAACAACCAATA--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136473                     :      GAAGGGATATG---AAAAC---AC----------AACACA--ATACGTATTCTCGTATG-GTTTA----G-------A--AG--------GG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---AG-A--T----TGA--CA---C-CAG-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------C-T---T--ATT--CAG-TATCCTC----------TCAACT----AAACAACCAGTA--ACA
gi|136472                     :      GAAGATATATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG--------GG----ACTTAT-T-T-----T----------GAAAC----A--A-A-----------------GA--CA---T-CAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTTC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CTG-TATCATC----------TCAAGA----AAACAAACAATA--ACACCAA----CAGACAAT
gi|136474                     :      GAAGAGATACG---AAACG---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA--------------------------------CTTG---------------------GAAAT----G--A-A-A---G----------TGG--CA---C-CAC-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACATC----------TCAAGT----AAACAACCAATA--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136479                     :      GAAGAGATATG---AAAAC---GA----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACATGC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--T--G----AGA--AA---C-CGA-T-GC--A-A---G---C--G-----GTAC-------A-A-A------A-T---A--GTT--CAG-TAACA------------TCAAGT----AAACAACCAACA--ATATTA
gi|136485                     :      GAGGAGATATA---AAAAT---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------G--GG--------GG----GCAGGG-T-G-----GGGCTTATATTGAAAT----G--A-A-A---AC-A--G----TGA--CA---T-CAA-T-TC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACAAC----------CCAAGT----ATACAACCAATA--AAATac
gi|136475                     :      GAAGAGATATG---AAAAC---GC----------AACACC--C---------------A-GTTTG----G-------A--GG--------GG----ACTCAT-C-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--G--GG---CAA--CA---C-AAA-T-GC--A-G---T---T--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--GAG-TAACAGC----------TCGAGT----TAAAAAACAATA--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136478                     :      GAAGATATATG---AAAAC---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTAC-T-T-----C----------AAAAT----AT-A-A-A---A--A--G----TGA--CG---C-CAA-T-AC--A-G---G---G--G-----GTAC-------A-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAGCATC----------TCAAAT----ATACAA
gi|136482                     :      GAAGAGATTTT---AAAAT---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG--------AG----ACTTAC-T-G-----G-----------AAAT----G--A-A-A---AT-A--G----TGA--CA---C-TAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA-------C-G-A------A-T---T--ATT--CAG-TAAAATC----------TCAATT----AAACATCCAATA--ACATCAA----CAGACATTA
gi|136481                     :      GAAGAGATTTT---AAAAT---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG--------AG----ACTTAC-T-G-----G-----------AAAT----G--A-A-A---AT-A--G----TGA--CA---C-TAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA-------C-G-A------A-T---T--ATT--CAG-TAAAATC----------TCAATT----AAACATCCAATA--ACATCAA----CAGACATTA
gi|136483                     :      GAAGAGATATG---AAAAC---AC----------AACACA--G---------------G-GT----------------------------------ACTTG----------------------AAATTGAAA--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-CAGC--A-G---G---A--T-----GCAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CTG-TAACATC----------TCAAGT----AAACAGCCAATA--ACATCAA----CATACAAT
gi|136480                     :      GAAGAGATTTT---AAAAT---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG--------AG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---AT-A--G----TGA--CA---C-TAA-T-TT--A-G---GTCTA--------GTAA-------A-G-A------A-T---T--ATT--CAG-TAAAATC----------TCAATT----AAACATCCAATA--GCATCAA----CAGACATTA
gi|136490                     :      GAAGAGATGTG---AAAAC---GC----------AACACA--A---------------G-CTCCA------------A--GG--------GG----ACT--A-T-T-----G----------GAAAT----G--ATA-A---T--A--T----TGA--CA---T-TTA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC-------C----------CTT---ATTATT--TTG-TAGTAAG----------TCAAGT----AAACAACAAATA--ACATCAA----CGGACAATA
gi|136488                     :      GAAGATATATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--------------------TT-----------G----------GAAAT----G--A-A-AG--A--A--A----GGAATCA---TCCAA-T-GA--A-T---G---A--G-----GTAA-------C-A-C------A-T---T--ATT--CAG-CAACATC----------TCGAGTTAACTAACAACTAATG--ATATCAA----CAAACAACA
gi|136494                     :      GAAGAGATATG---AAACT---GC----------AATACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--GG--------G------CTTAT-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---A-CAA-T-CC--A-A---G---A--A-----GTTC-------C-A--------------A--ATT-------------------------------------AACCAATG--ATATCAA----CAGACACTA
gi|136492                     :      GAAGATATATC---AAAAC---G--------------A-A--G---------------G-GTTTA----A-------A--GG---------------CTTTT-T-G-----G-----------AATT----G--A-A-ACAAA--A--G----TGA--CA---C-GCA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACATC----------TCAAGattactgcaatggatatata
gi|136496                     :         GAGATATG---GAAAC---AC----------AGCACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--AG--------AG----ACTTACAT-GTACTTG----------TAAAT----G--A-A-G---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACAAC----------TCGAGT----TAACAACCAGTA--ACATCAA----CAGACAATAatagcaaggcaataa
gi|136495                     :       aaGAGATATG---AAAAC---GC----------AACACA--A---------------G-GTTTA----G-------A--GA--------GG----ACTTGC-T-C-----G----------GAAAT----A--AGA-A---A--A--C----TGA--CA---C-CAA-T--C--A-G---A---A--A-----GTAA-------T-ATA------T-T------ATT--CAG-TAACATC----------TCAAAT----AAGCAAACAATA--ATATCAA----CAGACAGTA
gi|136511                     :       aaGAAATAGG---AAAAC---AC----------AACACA--G---------------G-GTTCA----G-------A--GG--------GG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----GC-A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-AC--A-G---G---A--T-----GTAC-------T-A-A------A-T---T--ACT--CAG-AAACATC----------TCAAGT----AAACAACCAATA--A----------CAGACAATA
gi|136498                     :        aGAGACATG---AAAAC---GC----------AACACA--T---------------G-GTTGA----G-------A--GT--------GG----ATTTAC-T-T-----G----------GGCAT----G--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-TG--A-A---G---A--G-----GTAC-------T-A-A------A-T---T--AGT--CAG-TAACTTC----------TTAAGT----AAACAAATAATG--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136497                     :       aaGAGATATG---AAAAC---AT----------AACACACAG---------------G-GTTTT----G-------A--GG--------GA----A-TTAC-T-T-----T----------GATAT----G--A-A-A---A--A--G----TGT--CA---C-CAA-A-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------C-T---T--ATT--CTA-TAACATC----------TCAAGT----ACCCAACCAATA--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136512                     :       aaGATATATG---AAAAC---AC----------AACACA--T---------------G-GCTTA----A-------A--GG--------GA----ACTTAC-T-T-----A----------GAAAT----G--A-A-A---AT-A--G----TGA--CA---C-CA----------G---G---A--G-----ATAC-------C-A-AA-----T-T---A--AT---CTG-TAACATC----------TCAAGT----AGACAACCAACA--ACATCAA----AAGACAATA
gi|136499                     :        aGAAATATG---AAAAT---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ATTCAC-T-T-----G----------GAAAT----G--AGG-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GCAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAAC
gi|136502                     :       aaGAGATATG---ATAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GT--------GG----ACATAT-T-G-----G----------AAATT----A--A-A-A---A--A--T----TGG--CA---C-CAA-T-AT--A-C---A---A--A-----GTGCT------T-A-A------T-T---A--G-T--CGG-AAACATC----------TCAAGT----AAACAATGAATA--GCATCGA----CAGACAATA
gi|136500                     :       aaGAGATATG---AAAAC---GC----------AACTCC--G---------------G-GTAAA----G-------A--GG--------AG----ACTTAT-A-T-----T----------GAATT----A--C-A-A---A--A--G----TGA--CGACTC-CAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-G---T--ATT--TAG-TAACCTC----------TCAAGT----AACCAACCAATC--ACATCAA----CAGA-AATA
gi|136505                     :       aaGAGATATG---AAAAC---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------AAGGG--------GG----ACTTAA-T-T-----G----------AAAAT----A--A-A-A---A--A--TG---TAA--CA---C-CTA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC-----------A------C-TTACG--AGT--CCG-TAACATC----------T---GT----AAACAA
gi|136507                     :       aaGAGATATG---GTAAT---GC----------AACACA--G---------------G-AATTA----G-------A---------------------TGC----------------------------------------------------GA--CA---T-CAA-T-GC--A-G---G---A--T-----GTAC-------C-A-A------A-A---T--ATT--CAG-TAACATC----------ACAAGT----AAATGACCAATA--ACATCAA----CAGACTATA
gi|136510                     :       aaGAGATATG---AAAAC---GC----------AACACT--G---------------G-ACTTA----C-------A--GG--------TGTAT-ATTTGC--------------------GGATT----G--A-A-A---AC-A--G----TGA--CA---G-AAA-T-AT--C-A---A---A--G-----GTGC-------C-A-A------A-T---A--ATT--AAG-TAATATC----------TCAAAT----AAACAGCCAATA--ACA
gi|136503                     :       aaGAGATATG---AAAAC---GC----------AA---A--T---------------G-ACT---------------------------------ACTT---T-G-----------------AACT----G--A-A-A---A--AA-G----TGA--TA---C-CAT-T-AC--G-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACATC----------TCAAGT----AAACAACCAATA--ATACTAA----CAGAaaacaagtggcaat
gi|136514                     :       aaGAGATATATT-AAAAC---GC----------TCCTCA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GA--------AG----ATTT-C----------------------ATT----G--T-A-A---A--G--T----TG---CA---C-CAA-T-GA--A-C---G---A--G-----GTAC-------T-A-A------A-T---T--ATT--CA-----CATC----------TCAAGT----AAACAACCAATA--ACACCAA----CATGCACTA
gi|136516                     :        aGAGATATG---TAAAG---AC----------AACAAA--G---------------G-GTTTA----GTGAAACAAT-GG--------GG----ACTTTT-T-G-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--AATTG---TGA--CA---C-CAA-G-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--TTT--CAT-TAA
gi|136517                     :         GAGATATG---AAAAC---ACGGGAAGAC--AACACA--G---------------G-GTTTA----GT------G--GG--------GG----ACTTGT-T-T-----G----------GAAAT----G--T-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-
gi|136508                     :         GAAATATG---AAAAT---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--AG--------GG----ACTTGC-T-
gi|136476                     :        aaAGATATG---AAAAC---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------AA----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----A--A-A-A---A--A--TA---TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAG-------C-A-A------A-T---T--ATT--CCG-TAACATC----------TCtg
gi|136518                     :      gaacAGATATG---AAAAC---GT------------------------------------GTTTA----G-------G--GG--------GG----ATTTTG-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-AT--A--A--A----TGA--CT---C-CAA-T-AC--A-G---G-------------TAC-------T-A-A------A-T---C--ATT--CAG-TAACATC----------TCAGGT----AAACAAACAATA--ACATCATTCAACAGACAATAcaaata
gi|136519                     :          AGATATGTT-AAAAT---GC----------AACGCA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GA--------G-----ATTTAT-T-T-----G----------GAATT----G--A-A-A---T-----T----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC-------A-A-A------G-T------ATT--CAG-TAACATT----------TCAAGT----AAACAA--AATA--ACAACA
gi|136486                     :          AGATATG---AAAAC---GC----------AACACG--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG--------GG----TCTTAC-T-T-----T----------AAAAT----A--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-TAA-C-GC--A-A---T---A----------AC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACAGC----------TCAAGA----AAACAACC-----------------CAGACAATAaaag
gi|136521                     :      gaaaAGATATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GG--------GG----TCTTAC-T-C-----G----------GAAAT----A--A-A-A---C--A--G----AGA--CA---A-CAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--TA
gi|136520                     :          AGATAAG---AAAAC---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTT----G-------A--GG--------GG----AATTAC-T-C-----G----------GAAATA---A--A-A-A---A--A--G----TAA--CA---A-AAA-T-GC--T-G---G---G--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---C--ATT--CAGTTAACATC----------
gi|136506                     :          AGATATG---AAAAC---TC----------AACACT--T---------------G-GTTTA----A-------A--GG---------------CTTA---------------------GAGAT----A--A-A-A---A--A--G----TGA--CA------------C--A-G---G---A--G-----GTTC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAT-TGACATC----------TCAAGT----AAACAACCAGTA--TTATCAA----CATACAAactagacaa
gi|136523                     :       aaaAGATACG---AAAAC------------------ACA--G---------------G-GTTTA--------------------------------TTTG---------------------GAAAT----G--A-A-A---A--A--A----TGG--CA---A-CAA-T-AT--ATG---A---A--GTACATGTAC-------C-A-A------G-T---T--ATT--TAG-TAACATC----------CAAAGT-----AACAACAAATA--ACACCAA----CAGACA
gi|136522                     :          AGATATG---AAAAC---GT----------AACACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--AG--------GG----ATTTAA-T-T-----A----------GAAAT----GA-A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-TTA-T-GC--T-GTCTG---A--G-----GTTC-------CAA-A------T-T---A--CTT--TAG-
gi|136515                     :          AGATATGTATAAAA----GC----------AAGAGT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------AG----A--TAC-A-T-----G----------AAAAT----A--A-A-AG--A--A--A----TAA--CA---C-CAA-T-AC--A-T---G---T--G-----TAAC-------A-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAAC-TT----------TAAAGT----AAATAACGGATA--GCATCAA----CAAACAA
gi|136524                     :        aaAGACACG---AAAAC---AC----------GACACA--A---------------GAGTTTA----G-------A--AG--------GG----ACCTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---
gi|136501                     :           GATGTG---AAAAT---GC----------ACCACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG--------GG----A--------------------------AAAT----GG-A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC-------C-A-A------------A--ATTATCAG-TAACATA----------TCAAGT----AAACAACCAATA--ACATCAA----CATATAAT
gi|136525                     :       aagcGATATG---AAAAC---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------G--GG--------GG----ACTTAC-C-T-----G----------GAAAA----G--ATT-A---A--A--G----TGA--TA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC-------C-A-A------C-T---T--ACT--CAG-CAACAT-----------TCAA
gi|136504                     :           GATATG---AAAAT---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----A---------------------------AAT----A--A-A-A---AGAA--C----TGA--CA---C-CAG-T-GC--A-G---G---A--G-----CCAC-------C-A-G------T-T---T--ATT--CAG-AAACATC----------TCAAGT-----AATAAACCATT--ACCTCAA----CTTACAACAtaa
gi|136493                     :       aagcGATATG---AAAAC---AC----------AACACA--G---------------A-GTTGA----G-------T--TG--------GT----ACTTGT-T-A-----C----------AAAAT----A--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAC-G-GC--A-A---G---A--G-----ATAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAT-TAACATT----------TTAAG--------------AT---ACATCAA----CACACAATA
gi|136527                     :      gaagtGAAATG---AAAAC---AC----------ATCACA--G---------------G---TTA----A-------A--GG--------GGTGGAGTTTGC-T-T-----G----------GAAAT----GTTA-A-A---A--G--T----C-A--CA---C-CAA-T-AC--A-G---G---A--A-----ATAC-------A-A-A------C-T---
gi|136528                     :            ATATG---AAAAC---GC----------AACACA--G---------------G-GCTTA----G-------T--GG--------AG----ACTTGC-T-T-----G----------AAAAT----G--A-A-A---A--T--A----TGA--CA---T-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC-------T-A-G------A-T---T--ATT--CCG-AAACATC----------TCAAAT----AAACAGCCAATA--CCATCAA----CAGACAACAt
gi|136491                     :            ATATG---AAAAC---GT----------AACACA--G---------------G-GTTCT----G-------A--GG--------GG----ACTCG---------------------GAAAT----G--A-A-A---A--T--G----TGA--CA---C-AAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------C-T---T--ATT--CAG-TAACGTC----------TTAAGT----
gi|136529                     :      gaaagtATATG---AAAAT---AA----------AACACA------------------G-GTTTAG---G-------A--GG--------AG----AATTAC-C-T-----G----------GACAT----G--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAATT-GC--A-G---G---A--A-----GTACATGTA--C-A-AAAGCATT-C---A--GTA--CAG-TAACACC----------TCAA-T----AAACAACCAATA--ACATTAA----AAGAAAATA
gi|136530                     :            ATATA---AAAAC---GT----------CGCATA--G---------------G-GTTTATAAAA-------A--GG--------AA----GCTTAT-TTG-----G----------GAAAT----G--A-A-A---A--A--TG---TGC--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GAAC-------C-A-A------A-T---T--AGT--CAG-TAACATCAATAGTAGCATCAA-T-----AACAACCAATA--A
gi|136484                     :              ATG---AAAACAACGT----------AAGAAA--G---------------G-GGTTA----G-------A--AG--------CG----ATTTGC-T-T-----T----------GAAAT----G--A-A-A---A--A--T----AGA--CG---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATTC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAACATC----------TCTAGT----AAACAAACAGTA--ACATC
gi|136531                     : gaagagatctggaACG---AAAAC---AC----------AGCGCA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTCC-T-T-----G----------Gtaca
gi|136513                     :              tTG---AAAAC---GC----------AACAGA--G---------------G-GTTTA----C-------A--GG--------GG----AAGTAT-C-T-----G----------GAAAT---------A-A---A--A--C----T------------AA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CTA-TGACATT----------TCAATT----AAACAACCAATA--ACATCAA----CAGTCAATA
gi|136487                     :     agatatatacTG---ATAGT---GC----------AACACT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTC-------------------------------------------------------A--TA---C-TAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A--------T-T---ATTATT--CAG-TAACATC----------TCAAGT----AAACAACCAATAACACATCAA----CAGACAATA
gi|136532                     :      gaagaattcTG---AAAAC---TT----------AACACA--G---------------G-CTTTG----G-------A--AG--------GG----ACTTGC-A-T-----G----------GAAAT----T--ACA-A---A--A--A----TCA--CA---C-AAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTACATGTATTA-A-A------T-T---A--ATT--CTC-TAACAGC----------TGAAGT----AAACAACTATTAC-ACATCAA----TAGACGATA
gi|136489                     :               TG---AAAAT---GC----------TACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTAT-T-T-----T----------GAAAT----G--G-A-A---A--A--------G-----------AA-T-GT---------------G-----ACAC-------C----------------A--ATC--CAG-TAACATC----------TTGAGT----AAATGACTAATA--ACATCAA----CAGA
gi|136526                     :      gaagtgatcTA---AAAAC---AT----------AAC---------------------G-ATTTA----G-------A--GG--------AA----ACTTGC-T-T-----T----------GAAAT----A--A-A-A---A--A--G----TGA--CA---C-CAA-T-TC--A-G---G---T--T-----GTAA-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TTAC----------------AAT----AAACAGTCAATA--CCATGGA----CAGACAACA
gi|136533                     :             gatG---AAAAC---GCGTATCTATGGAGCAAA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GAAAGAGA--GG----ACTTAC-T-G-----G----------GAAAC----A--A-A-A---A--G--G----AGA--CA-----CAA-A-GC--A-G---G---A--G-----ATAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CTG-TTACATC----------TTAAGT----AAACAACCAATA--ACATCAA----CATATAATA
gi|136534                     :                G---AAAA----GA----------AACACA--A---------------G-ATT-A----G-------G--AG--------AG----ATTTAC-T-T-----G----------AAAATT---A--A-A-A---A--A--A----TGA--CA------AA-C-ACCTA-G---G---T--G-----G-AC-------A-A-A------T-T---T--ATT--CAG-------------------------------CGACCAATA--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136477                     :                 ---AAAAC---AC----------AACA----G---------------G-GTTTA----C-------A--GG--------GG----ACTTACCT-G-----A----------AAAAT----G--A-A-A---A--AA-G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----CTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-GTACATC----------TCAAGT----AAACAACCAGTT--ACATCAG----TAGACAATA
gi|136535                     :            gaatatatataaC---GC----------AAC-----------------------GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTGC-T-T-----G----------AATAT----G--A-AGA---A--A--TAAAACGA---A---C-CGA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTACT------T-A-A------A-T------ATT--CAG-CAACACC----------TCAAAT----AAACAAACAAGA--ACGTCAA----CA
gi|136536                     :                         ---GC----------AATACTT-G---------------G-GTTTA----G-------A--GG--------GG----ACTTTT-T-T-----G----------AATAC----G--A-A-AG--A--A--G----TGA--CA---C-TTA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAG-------C-A-A------C-C---A--ATT--TAC-TAATATC----------TAAAGC----AGACAACAAATA--ATACCAA----CAGACAGTA
gi|136537                     :                             C----------AACACT--T---------------A-GTTTA----G-------A--GG--------CA----ACTTAC-T-T-----G----------GAAGT----G--A-A-A---A--G--T----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAG-TAA--------------------------ACAACCAATA--ACATCAG----CAGACAATA
gi|136538                     :                                           ACT--G---------------G-GTATA----G-------A--AT--------GG----ACTTTC-T-T-----G----------TAAAT----G--A-A-A---AT-A--G----TGA--CA---C-AAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------CAA-A------C-T------ATT--CAG-TTAAGTT----------TTAAGT-----AACATCCAATA--ACATCAA----CA
gi|136539                     :                                            CA--G---------------G-GTTTC----G-------A--TA--------GG----ACTTAC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-AGA---A--A--G----TGA--CG---C-CTA-T-AC--G-A---A---A--G-----ATGA-------A-A-A------T-T---A---TT--CAG-AAACATC----------TCAAAT----AGACAACCAGTA--ACATCAA----CATAC
gi|136509                     :                                                                 -GTTTA----G-------A--GG--------TA----ACTTAC-T-A-----G----------GAAAT----GA-A-A-A---A--A--G----TGA--CC---C-CAA-T-GA--A-G---G---A--G-----GTG--------C-A-A------------A--ATT--CAT-TAACATT----------TCAAGT----AAACAACCA
gi|136540                     :                                                                          aagagataatgaaG--------AG----ACTTCC-T-T-----G----------GAAAT----G--A-A-A---AGCA--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--CAA-TAACATC----------TTAAGT----AAACCACTAATT--ACATCCA----CAGACACTA
gi|136542                     :                                                                                                                      ----------GAAA--------A-A-A---A--A--A----TGA--TA---C-CAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GAAC-------A-A-A------A-T---T--ATC--CAG-TAACATC----------ACAAGTTAA-TAACAACCAATA--ACATCAA----CAAACAAT
gi|136543                     :                                                                                                                                          --A-A-A---A--C--G----TGA--CA---C-CAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC-------T-T-A------A-T---A---TT--CGG-TAACATC----------CCAAGT----AAACAAGCAATA--ACATCAA----CAGACAATA
gi|136541                     :                                                                                                                                          --A-A-A---A--A--A----TGA--CA---C-CAA-T-CC--A-G---G---A--G-----GTAC-------C-A-A------A-T---G--ATC--CAG-TGACACC----------CCAAAT----TAACATTCAATA--A
gi|136544                     :                                                                                                                                                                                        acatactttga-----GTAC-------C-A-A------A-T---T--ATT--TAG-TTACATC----------TCAAGT----AGACAACCAATA--ACATTAA----CATACAATA





Alignments
lowQualScore                  :         11111 0 111 222    0 111  4444444444      11 333333333333333 0     1111 2222222 11  333333  1111  2222222222    111111   0 0   1 1 2 2 11 333 66 444 111   11 00 111    0 0  00 1 000 000 11 11111    222222 1  1   0 0 000 11111   0        0    1  33333333     0      11   1111  0    111    0   
lowQualScore                  :         ..... . ... ...    . ...  ..........      .. ............... .     .... ....... ..  ......  ....  ..........    ......   . .   . . . . .. ... .. ... ...   .. .. ...    . .  .. . ... ... .. .....    ...... .  .   . . ... .....   .        .    .  ........     .      ..   ....  .    ...    .   
lowQualScore                  :         55555 6 000 666    6 000  4444444444      33 444444444444444 5     1111 8888888 33  111111  6666  3333333333    555555   5 5   1 1 6 6 88 000 66 000 555   55 77 555    5 5  77 1 999 999 55 33333    999999 1  1   5 5 999 44444   5        6    1  99999999     6      55   4444  7    222    8   
consensus                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
Reference ( family-358 )      : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136466                     : GAAGAGAT-----A-T---A---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--AT--A--A---G---TGA--T--T---CCAA-T-GC--A-G---C---A--G-----TTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAA-TAACGTTT-CAAA-TA--------AACAA-CCAATA--GCA----TC-AACG---GACA-ATA
gi|136467                     : GATGAGAC-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTGC------TGG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---T---TGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTA-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TG--------AACAA-CCAATG--ACA----TC-ATCA---GACA-ATA
gi|136468                     : GAAGAGAT-----T-T---A---AAAA-T---GC----------AAAACT--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-CAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--G---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GAAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CTAA-TA--------AACAA-CCAACA--GCA----TC-ATCA---GACA-ATA
gi|136469                     : GAAGAGCT-----A-T---G---GAAA-C---GT----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAA------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---A---T-A--T--A---CCAA-C-GC--AGG---G---G--G-----GTAC------C-AA-ATC-A-T---T-----CA--TGACGCCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TT-AACA---GACA-ATA
gi|136470                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GA------AG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-AT-A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----TTAC------C-AT-ATT-A-T---T-----CAG-CAACATCT-CAAG-TA-----------AA-CCAATA--AC------CAAATA---GACA-ATA
gi|136471                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACG--T---------------G-GTTTA----G-------A--GGTATATAGG----AG------------AC------TTG-A-AAA-T-G-A-A--A---AA-A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTGC------T-AA-AAT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TT--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136472                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG------GG----AC----------TTAT------TTT-G-AAA-C-A-A-A------------------GA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TATCATCT-CAAG-AA--------AACAA-ACAATA--ACA----CC-AACA---GACA-AT
gi|136473                     : GAAGGGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--ATACGTATTCTCGTATG-GTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AG-A---T---TGA--C--A---CCAG-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CAG-TATCCTCT-CAAC-TA--------AACAA-CCAGTA--ACA----
gi|136474                     : GAAGAGAT-----A-C---G---AAAC-G---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA--------------------------------------------C------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A----------G---TGG--C--A---CCAC-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136475                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACC--C---------------A-GTTTG----G-------A--GG------GG----AC----------TCAT------CTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--G---GG--CAA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---T---T--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----GAG-TAACAGCT-CGAG-TT--------AAAAA-ACAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136476                     : GAACAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------AA----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-A-A-A--A---A--AT--A---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAG------C-AA-ATT-A-T---T-----CCG-TAACATCTCCAAA-TA--------
gi|136477                     : GAATATAT-----A-T---A---AAAAAC---AC----------AACA----G---------------G-GTTTA----C-------A--GG------GG----AC----------TTAC------CTG-A-AAAAT-G-A-A--A---AA-A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----CTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-GTACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAGTT--ACA----TC-AGTA---GACA-ATA
gi|136478                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTC-A-AAA-T-ATA-A--A---A--A---G---TGA--C--G---CCAA-T-AC--A-G---G---G--G-----GTAC------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAGCATCT-CAAA-TA--------TACAA-
gi|136479                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GA----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------ATGC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--T---G---AGA--A--A---CCGA-T-GC--A-A---G---C--G-----GTAC------A-AA-ATA-G-T---T-----CAG-TAACA--T-CAAG-TA--------AACAA-CCAACA--ATA----TT-AAC
gi|136480                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TT--A-G---GTCTA--------GTAA------A-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--GCA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136481                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------T-G-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA------C-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136482                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------T-G-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA------C-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136483                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GT----------------------------------------------AC------TTG-A-AAT-T-G-A-A--A---A--AAAAG---TGA--C--A---CCAA-CAGC--A-G---G---A--T-----GCAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAG-CCAATA--ACA----TC-AACA---TACA-AT
gi|136484                     : GAAGAGATCTGGAA-T---G---AAAA-CAACGT----------AAGAAA--G---------------G-GGTTA----G-------A--AG------CG----AT----------TTGC------TTT-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---T---AGA--C--G---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CTAG-TA--------AACAA-ACAGTA--ACA----TC-TACA---
gi|136485                     : GAGGAGAT-----A-T---A---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------G--GG------GG----GCAGGGTGGGGCTTAT------ATT-G-AAA-T-G-A-A--A---AC-A---G---TGA--C--A---TCAA-T-TC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAACC-CAAG-TA--------TACAA-CCAATA--AAA----T
gi|136486                     : GAAAAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACG--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------GG----TC----------TTAC------TTT-A-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CTAA-C-GC--A-A---T---A----------AC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAGCT-CAAG-AA--------AACAA-CC------------------CA---GACA-ATA
gi|136487                     : GAAGAATT-----C-T---G---ATAG-T---GC----------AACACT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TCAT------------------------------------------------A---CTAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-ATTATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATAACACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136488                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--------------------------------------TTG-G-AAA-T-G-A-AAGA---A--A---G----GAATC--AT--CCAA-T-GA--A-T---G---A--G-----GTAA------C-AC-ATT-A-T---T-----CAG-CAACATCT-CGAGTTAACT-----AACAA-CTAATG--ATA----TC-AACA---AACA-ACA
gi|136489                     : GAAGTGAT-----C-T---G---AAAA-T---GC----------TACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAT------TTT-G-AAA-T-G-G-A--A---A--A---G-----------------AA-T-GT---------------G-----ACAC------C-AA-------T---C-----CAG-TAACATCT-TGAG-TA--------AATGA-CTAATA--ACA----TC-AACA---GA
gi|136490                     : GAAGAGAT-----G-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--A---------------G-CTCCA------------A--GG------GG----AC----------T-A-------TTG-G-AAA-T-G-A-T--A---AT-A---T---TGA--C--A---TTTA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC------C-CTTATT-A-T---T-----TTG-TAGTAAGT-CAAG-TA--------AACAA-CAAATA--ACA----TC-AACG---GACA-ATA
gi|136491                     : GAAAGTAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACA--G---------------G-GTTCT----G-------A--GG------GG----AC----------TC----------G-G-AAA-T-G-A-A--A---A--T---G---TGA--C--A---CAAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CAG-TAACGTCT-TAAG-T
gi|136492                     : GAAGATAT-----A-T---C---AAAA-C---G--------------A-A--G---------------G-GTTTA----A-------A--GG-------------C----------TT-T------TTG-G-AAT-T-G-A-A--ACAAA--A---G---TGA--C--A---CGCA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-AT--------AGCAAGGCAATA--A
gi|136493                     : GAAGTGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------A-GTTGA----G-------T--TG------GT----AC----------TTGT------TAC-A-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAC-G-GC--A-A---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAT-TAACATTT-TAAG--------------------AT---ACA----TC-AACA---CACA-ATA
gi|136494                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAC-T---GC----------AATACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--GG------G------C----------TTAT------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---ACAA-T-CC--A-A---G---A--A-----GTTC------C-AA-ATT-A-A---C-----CAA-TGATATC----AA-CA--------GAC-A-CTAATT--ACT----GC-AATG---GATATATA
gi|136495                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--A---------------G-GTTTA----G-------A--GA------GG----AC----------TTGC------TCG-G-AAA-T-A-AGA--A---A--A---C---TGA--C--A---CCAA-T--C--A-G---A---A--A-----GTAA------T-AT-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAA-TA--------AGCAA-ACAATA--ATA----TC-AACA---GACA-GTA
gi|136496                     :  AAGAGAT-----A-T---G---GAAA-C---AC----------AGCACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--AG------AG----AC----------TTACATGTACTTG-T-AAA-T-G-A-A--G---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAACT-CGAG-TT--------AACAA-CCAGTA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136497                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AT----------AACACACAG---------------G-GTTTT----G-------A--GG------GA----A-----------TTAC------TTT-G-ATA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGT--C--A---CCAA-A-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CTA-TAACATCT-CAAG-TA--------CCCAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136498                     :  AAGAGAC-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTGA----G-------A--GT------GG----AT----------TTAC------TTG-G-GCA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-TG--A-A---G---A--G-----GTAC------T-AA-ATT-A-G---T-----CAG-TAACTTCT-TAAG-TA--------AACAA-ATAATG--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136499                     :  AAGAAAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG------GG----AT----------TCAC------TTG-G-AAA-T-G-AGG--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GCAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAC
gi|136500                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACTCC--G---------------G-GTAAA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAT------ATT-G-AAT-T-A-C-A--A---A--A---G---TGA--C--GACTCCAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC------C-AA-AGT-A-T---T-----TAG-TAACCTCT-CAAG-TA--------ACCAA-CCAATC--ACA----TC-AACA---GA-A-ATA
gi|136501                     :  AAGCGAT-----G-T---G---AAAA-T---GC----------ACCACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG------GG----A---------------------------AAA-T-GGA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC------CAAA-ATT-A-----T-----CAG-TAACATAT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---TATA-AT
gi|136502                     :  AAGAGAT-----A-T---G---ATAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GT------GG----AC----------ATA-------TTG-G-AAATT-A-A-A--A---A--A---T---TGG--C--A---CCAA-T-AT--A-C---A---A--A-----GTGC------T-TA-ATT-A-G---T-----CGG-AAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-TGAATA--GCA----TC-GACA---GACA-ATA
gi|136503                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AA------------------------AT---------------------------G----AC----------T-AC------TTT-G-AAC-T-G-A-A--A---A--AA--G---TGA--T--A---CCAT-T-AC--G-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ATA----CT-AACA---GA
gi|136504                     :  AAGCGAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----A----------------------------AA-T---A-A--A---A--A---GAACTGA--C--A---CCAG-T-GC--A-G---G---A--G-----CCAC------C-AG-TTT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TA--------ATAAA-CC-ATT--ACC----TC-AACT---TACA-ACA
gi|136505                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------AAGGG------GG----AC----------TTAA------TTG-A-AAA-T-A-A-A--A---A--AT--G---TAA--C--A---CCTA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC---------A-CTT-A-CGAGT-----CCG-TAACATCT----G-TA--------AACAA-
gi|136506                     :  AAAAGAT-----A-T---G---AAAA-C---TC----------AACACT--T---------------G-GTTTA----A-------A--GG---------------------------C------TTA-G-AGA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---C----------A-G---G---A--G-----GTTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAT-TGACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAGTA--TTA----TC-AACA---TACA-A
gi|136507                     :  AAGAGAT-----A-T---G---GTAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-AATTA----G-------A------------------------------------------------T-G---------------------CGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--T-----GTAC------C-AA-AAT-A-T---T-----CAG-TAACATCA-CAAG-TA--------AATGA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACT-ATA
gi|136508                     :  AAGAAAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------TTGC------TTG-
gi|136509                     :  AAGAGAT-----AAT---G---AA---------------------------------------------GTTTA----G-------A--GG------TA----AC----------TTAC------TAG-G-AAA-T-GAA-A--A---A--A---G---TGA--C--C---CCAA-T-GA--A-G---G---A--G-----GTG-------C-AA-A---A-T---T-----CAT-TAACATTT-CAAG-TA--------AACAA-CCA
gi|136510                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACT--G---------------G-ACTTA----C-------A--GG------TGT---A------------TAT------TTGCG-GAT-T-G-A-A--A---AC-A---G---TGA--C--A---GAAA-T-AT--C-A---A---A--G-----GTGC------C-AA-ATA-A-T---T-----AAG-TAATATCT-CAAA-TA--------AACAG-CCAATA--ACA-----A-AACAAGTGGCA-AT
gi|136511                     :   AGAAAT-----A-G---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTCA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-GCA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-AC--A-G---G---A--T-----GTAC------T-AA-ATT-A-C---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAAT-------------AACA---GACA-ATA
gi|136512                     :   AGATAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--T---------------G-GCTTA----A-------A--GG------GA----AC----------TTAC------TTA-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CCA----------G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-A---T-----CTG-TAACATCT-CAAG-TA--------GACAA-CCAACA--ACA----TC-AAAA---GACA-ATA
gi|136513                     :   AGATAT-----A-TACTG---AAAA-C---GC----------AACAGA--G---------------G-GTTTA----C-------A--GG------GG----AA----------GTAT------CTG-G-AAA-T-A-A-A--A--------------------------CTAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTA-TGACATTT-CAAT-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GTCA-ATA
gi|136514                     :   AGAGAT-----A-T---ATT-AAAA-C---GC----------TCCTCA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GA------AG----AT----------TTCA------TTG-------T--------A---A--A---G---TTG--C--A---CCAA-T-GA--A-C---G---A--G-----GTAC------T-AA-ATT-A-T---T-----CA-----CATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----CC-AACA---TGCA-CTA
gi|136515                     :   AAAGAT-----A-T---GTATAAAA-----GC----------AAGAGT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------AG----A------------TAC------ATG-A-AAA-T-A-A-A--AG--A--A---A---TAA--C--A---CCAA-T-AC--A-T---G---T--G-----TAAC------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAC-TTT-AAAG-TA--------AATAA-CGGATA--GCA----TC-AACA---AACA-A
gi|136516                     :    GAGAT-----A-T---G---TAAA-G---AC----------AACAAA--G---------------G-GTTTA----GTGAAACAAT-GG------GG----AC----------TTTT------TGG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--AATTG---TGA--C--A---CCAA-G-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-T-T---T-----CAT-TAA
gi|136517                     :    GAGAT-----A-T---G---AAAA-C---ACGGGAAGAC--AACACA--G---------------G-GTTTA----GT------G--GG------GG----AC----------TTGT------TTG-G-AAA-T-G-T-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-
gi|136518                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT------------------------------------GTTTA----G-------G--GG------GG----AT----------TTTG------TTG-G-AAA-T-G-A-A--AT--A--A---A---TGA--C--T---CCAA-T-AC--A-G---G-------------TAC------T-AA-ATC-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAGG-TA--------AACAA-ACAATA--ACATCATTC-AACA---GACA-ATA
gi|136519                     :     AGAT-----A-T---GTT-AAAA-T---GC----------AACGCA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GA------G-----AT----------TTAT------TTG-G-AAT-T-G-A-A--A---T------T---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC--------AA-AGT-A-T---T-----CAG-TAACATTT-CAAG-TA--------AACAA---AATA--ACA----AC-AAAA---
gi|136520                     :     AGAT-----A-A---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTT----G-------A--GG------GG----AA----------TTAC------TCG-G-AAA-TAA-A-A--A---A--A---G---TAA--C--A---AAAA-T-GC--T-G---G---G--G-----GTAC------C-AA-ATC-A-T---T-----CAGTTAACATC----AC-TA--------GACAA-
gi|136521                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GG------GG----TC----------TTAC------TCG-G-AAA-T-A-A-A--A---C--A---G---AGA--C--A---ACAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----TA
gi|136522                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--AG------GG----AT----------TTAA------TTA-G-AAA-T-GAA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CTTA-T-GC--T-GTCTG---A--G-----GTTC------C-AA-ATT-ACT---T-----TAG-
gi|136523                     :     AGAT-----A-C---G---AAAA-C------------------ACA--G---------------G-GTTTA--------------------------------------------T------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---A---TGG--C--A---ACAA-T-AT--ATG---A---A--GTACATGTAC------C-AA-GTT-A-T---T-----TAG-TAACATCC-AAAG-T---------AACAA-CAAATA--ACA----CC-AACA---GACA-
gi|136524                     :     AGAC-----A-C---G---AAAA-C---AC----------GACACA--A---------------GAGTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------CTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---
gi|136525                     :      GAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------G--GG------GG----AC----------TTAC------CTG-G-AAA-A-G-ATT--A---A--A---G---TGA--T--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------C-AA-CTT-A-C---T-----CAG-CAACAT-T-CAA--TA--------A
gi|136526                     :      GAT-------T---A---AAAA-C---AT----------AAC---------------------G-ATTTA----G-------A--GG------AA----AC----------TTGC------TTT-G-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-TC--A-G---G---T--T-----GTAA------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TTAC-------AA-TA--------AACAG-TCAATA--CCA----TG-GACA---GACA-ACA
gi|136527                     :      GAA-----A-T---G---AAAA-C---AC----------ATCACA--G---------------G---TTA----A-------A--GG------GGTGGAGT----------TTGC------TTG-G-AAA-T-G-TTA--A---A--A---G---TCA--C--A---CCAA-T-AC--A-G---G---A--A-----ATAC------A-AA-CTT-
gi|136528                     :       AT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GCTTA----G-------T--GG------AG----AC----------TTGC------TTG-A-AAA-T-G-A-A--A---A--T---A---TGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC------T-AG-ATT-A-T---T-----CCG-AAACATCT-CAAA-TA--------AACAG-CCAATA--CCA----TC-AACA---GACA-ACA
gi|136529                     :       AT-----A-T---G---AAAA-T---AA----------AACACA--G---------------G--TTTA----GG------A--GG------AG----AA----------TTAC------CTG-G-ACA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAATT-GC--A-G---G---A--A-----GTACATGTA-CAAA-AGC-A-T---TCAGTACAG-TAACACCT-CAA--TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TT-AAAA---GAAA-ATA
gi|136530                     :       AT-----A-T---A---AAAA-C---GT----------CGCATA--G---------------G-GTTTATAAAA-------A--GG------AA----GC----------TTAT------TTG-GGAAA-T-G-A-A--A---A--AT--G---TGC--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GAAC------C-AA-ATT-A-G---T-----CAG-TAACATCA-ATAG-TAGCATCAATAACAA-CCAATA--A
gi|136531                     :        T-----A-C---G---AAAA-C---AC----------AGCGCA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTCC------TTG-G-
gi|136532                     :               -T---G---AAAA-C---TT----------AACACA--G---------------G-CTTTG----G-------A--AG------GG----AC----------TTGC------ATG-G-AAA-T-T-ACA--A---A--A---A---TCA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTACATGTATT-AA-ATTAA-T---T-----CTC-TAACAGCT-GAAG-TA--------AACAA-CTATTAC-ACA----TC-AATA---GACG-ATA
gi|136533                     :                 ---G---AAAA-C---GCGTATCTATGGAGCAAA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GAAAGAGAGG----AC----------TTAC------TGG-G-AAA-C-A-A-A--A---A--G---G---AGA--C--A---CAAA---GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TTACATCT-TAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---TATA-ATA
gi|136534                     :                 ---G---AAAA-----GA----------AACACA--A---------------G-ATT-A----G-------G--AG------AG----AT----------TTAC------TTG-A-AAA-TTA-A-A--A---A--A---A---TGA--C--A-----AA-C-ACCTA-G---G---T--G-----G-AC------A-AA-TTT-A-T---T-----CAG---------------------------CGA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136535                     :                            -C---GC----------AAC-----------------------GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTGC------TTG-A-ATA-T-G-A-A--G---A--A---A---TAAAACGAA---CCGA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------T-TA-AAT-A-T---T-----CAG-CAACACCT-CAAA-TA--------AACAA-ACAAGA--ACG----TC-AACA---
gi|136536                     :                              ---GC----------AATACTT-G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTTT------TTG-A-ATA-C-G-A-A--AG--A--A---G---TGA--C--A---CTTA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAG------C-AA-CCA-A-T---T-----TAC-TAATATCT-AAAG-CA--------GACAA-CAAATA--ATA----CC-AACA---GACA-GTA
gi|136537                     :                                  C----------AACACT--T---------------A-GTTTA----G-------A--GG------CA----AC----------TTAC------TTG-G-AAG-T-G-A-A--A---A--G---T---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----C--------------AG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AGCA---GACA-ATA
gi|136538                     :                                                ACT--G---------------G-GTATA----G-------A--AT------GG----AC----------TTTC------TTG-T-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ACT-A-T---T-----CAG-TTAAGTTT-TAAG-T---------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---
gi|136539                     :                                                 CA--G---------------G-GTTTC----G-------A--TA------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-AG-A---A--A---G---TGA--C--G---CCTA-T-AC--G-A---A---A--G-----ATG-------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAA-TA--------GACAA-CCAGTA--ACA----TC-AACA---TAC
gi|136540                     :                                                                                            G------AG----AC----------TTCC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AGCA---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAA-TAACATCT-TAAG-TA--------AACCA-CTAATT--ACA----TC-CACA---GACA-CTA
gi|136541                     :                                                                                                     ----AC----------ATAC------TTT-G-AAA----------A---A--A---A---TGA--C--A---CCAA-T-CC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATG-A-T---C-----CAG-TGACACCC-CAAA-TT--------AACAT-TCAATA--A
gi|136542                     :                                                                                                                                  -G-AAA-----A-A--A---A--A---A---TGA--T--A---CCAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GAAC------A-AA-ATT-A-T---C-----CAG-TAACATCA-CAAGTTAAT------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---AACA-AT
gi|136543                     :                                                                                                                                            -A-A--A---A--C---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------T-TA-AT--A-T---T-----CGG-TAACATCC-CAAG-TA--------AACAA-GCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136544                     :                                                                                                                                                                                                      -----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----TAG-TTACATCT-CAAG-TA--------GACAA-CCAATA--ACA----TT-AACA---TACA-ATA





Alignments
lowQualScore                  :         11111 0 111 222    0 111  4444444444      11 333333333333333 0     1111 2222222 11  333333  1111  2222222222    111111   0 0   1 1 2 2 11 333 66 444 111   11 00 111    0 0  00 1 000 000 11 11111    222222 1  1   0 0 000 11111   0        0    1  33333333     0      11   1111  0    111    0   
lowQualScore                  :         ..... . ... ...    . ...  ..........      .. ............... .     .... ....... ..  ......  ....  ..........    ......   . .   . . . . .. ... .. ... ...   .. .. ...    . .  .. . ... ... .. .....    ...... .  .   . . ... .....   .        .    .  ........     .      ..   ....  .    ...    .   
lowQualScore                  :         55555 6 000 666    6 000  4444444444      33 444444444444444 5     1111 8888888 33  111111  6666  3333333333    555555   5 5   1 1 6 6 88 000 66 000 555   55 77 555    5 5  77 1 999 999 55 33333    999999 1  1   5 5 999 44444   5        6    1  99999999     6      55   4444  7    222    8   
consensus                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
Reference ( family-358 )      : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136466                     : GAAGAGAT-----A-T---A---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--AT--A--A---G---TGA--T--T---CCAA-T-GC--A-G---C---A--G-----TTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAA-TAACGTTT-CAAA-TA--------AACAA-CCAATA--GCA----TC-AACG---GACA-ATA
gi|136467                     : GATGAGAC-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTGC------TGG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---T---TGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTA-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TG--------AACAA-CCAATG--ACA----TC-ATCA---GACA-ATA
gi|136468                     : GAAGAGAT-----T-T---A---AAAA-T---GC----------AAAACT--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-CAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--G---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GAAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CTAA-TA--------AACAA-CCAACA--GCA----TC-ATCA---GACA-ATA
gi|136469                     : GAAGAGCT-----A-T---G---GAAA-C---GT----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAA------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---A---T-A--T--A---CCAA-C-GC--AGG---G---G--G-----GTAC------C-AA-ATC-A-T---T-----CA--TGACGCCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TT-AACA---GACA-ATA
gi|136470                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GA------AG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-AT-A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----TTAC------C-AT-ATT-A-T---T-----CAG-CAACATCT-CAAG-TA-----------AA-CCAATA--AC------CAAATA---GACA-ATA
gi|136471                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACG--T---------------G-GTTTA----G-------A--GGTATATAGG----AG------------AC------TTG-A-AAA-T-G-A-A--A---AA-A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTGC------T-AA-AAT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TT--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136472                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG------GG----AC----------TTAT------TTT-G-AAA-C-A-A-A------------------GA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TATCATCT-CAAG-AA--------AACAA-ACAATA--ACA----CC-AACA---GACA-AT
gi|136473                     : GAAGGGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--ATACGTATTCTCGTATG-GTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AG-A---T---TGA--C--A---CCAG-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CAG-TATCCTCT-CAAC-TA--------AACAA-CCAGTA--ACA----
gi|136474                     : GAAGAGAT-----A-C---G---AAAC-G---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA--------------------------------------------C------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A----------G---TGG--C--A---CCAC-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136475                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACC--C---------------A-GTTTG----G-------A--GG------GG----AC----------TCAT------CTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--G---GG--CAA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---T---T--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----GAG-TAACAGCT-CGAG-TT--------AAAAA-ACAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136476                     : GAACAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------AA----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-A-A-A--A---A--AT--A---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAG------C-AA-ATT-A-T---T-----CCG-TAACATCTCCAAA-TA--------
gi|136477                     : GAATATAT-----A-T---A---AAAAAC---AC----------AACA----G---------------G-GTTTA----C-------A--GG------GG----AC----------TTAC------CTG-A-AAAAT-G-A-A--A---AA-A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----CTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-GTACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAGTT--ACA----TC-AGTA---GACA-ATA
gi|136478                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTC-A-AAA-T-ATA-A--A---A--A---G---TGA--C--G---CCAA-T-AC--A-G---G---G--G-----GTAC------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAGCATCT-CAAA-TA--------TACAA-
gi|136479                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GA----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------ATGC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--T---G---AGA--A--A---CCGA-T-GC--A-A---G---C--G-----GTAC------A-AA-ATA-G-T---T-----CAG-TAACA--T-CAAG-TA--------AACAA-CCAACA--ATA----TT-AAC
gi|136480                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TT--A-G---GTCTA--------GTAA------A-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--GCA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136481                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------T-G-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA------C-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136482                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------T-G-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA------C-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136483                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GT----------------------------------------------AC------TTG-A-AAT-T-G-A-A--A---A--AAAAG---TGA--C--A---CCAA-CAGC--A-G---G---A--T-----GCAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAG-CCAATA--ACA----TC-AACA---TACA-AT
gi|136484                     : GAAGAGATCTGGAA-T---G---AAAA-CAACGT----------AAGAAA--G---------------G-GGTTA----G-------A--AG------CG----AT----------TTGC------TTT-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---T---AGA--C--G---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CTAG-TA--------AACAA-ACAGTA--ACA----TC-TACA---
gi|136485                     : GAGGAGAT-----A-T---A---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------G--GG------GG----GCAGGGTGGGGCTTAT------ATT-G-AAA-T-G-A-A--A---AC-A---G---TGA--C--A---TCAA-T-TC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAACC-CAAG-TA--------TACAA-CCAATA--AAA----T
gi|136486                     : GAAAAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACG--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------GG----TC----------TTAC------TTT-A-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CTAA-C-GC--A-A---T---A----------AC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAGCT-CAAG-AA--------AACAA-CC------------------CA---GACA-ATA
gi|136487                     : GAAGAATT-----C-T---G---ATAG-T---GC----------AACACT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TCAT------------------------------------------------A---CTAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-ATTATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATAACACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136488                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--------------------------------------TTG-G-AAA-T-G-A-AAGA---A--A---G----GAATC--AT--CCAA-T-GA--A-T---G---A--G-----GTAA------C-AC-ATT-A-T---T-----CAG-CAACATCT-CGAGTTAACT-----AACAA-CTAATG--ATA----TC-AACA---AACA-ACA
gi|136489                     : GAAGTGAT-----C-T---G---AAAA-T---GC----------TACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAT------TTT-G-AAA-T-G-G-A--A---A--A---G-----------------AA-T-GT---------------G-----ACAC------C-AA-------T---C-----CAG-TAACATCT-TGAG-TA--------AATGA-CTAATA--ACA----TC-AACA---GA
gi|136490                     : GAAGAGAT-----G-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--A---------------G-CTCCA------------A--GG------GG----AC----------T-A-------TTG-G-AAA-T-G-A-T--A---AT-A---T---TGA--C--A---TTTA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC------C-CTTATT-A-T---T-----TTG-TAGTAAGT-CAAG-TA--------AACAA-CAAATA--ACA----TC-AACG---GACA-ATA
gi|136491                     : GAAAGTAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACA--G---------------G-GTTCT----G-------A--GG------GG----AC----------TC----------G-G-AAA-T-G-A-A--A---A--T---G---TGA--C--A---CAAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CAG-TAACGTCT-TAAG-T
gi|136492                     : GAAGATAT-----A-T---C---AAAA-C---G--------------A-A--G---------------G-GTTTA----A-------A--GG-------------C----------TT-T------TTG-G-AAT-T-G-A-A--ACAAA--A---G---TGA--C--A---CGCA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-AT--------AGCAAGGCAATA--A
gi|136493                     : GAAGTGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------A-GTTGA----G-------T--TG------GT----AC----------TTGT------TAC-A-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAC-G-GC--A-A---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAT-TAACATTT-TAAG--------------------AT---ACA----TC-AACA---CACA-ATA
gi|136494                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAC-T---GC----------AATACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--GG------G------C----------TTAT------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---ACAA-T-CC--A-A---G---A--A-----GTTC------C-AA-ATT-A-A---C-----CAA-TGATATC----AA-CA--------GAC-A-CTAATT--ACT----GC-AATG---GATATATA
gi|136495                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--A---------------G-GTTTA----G-------A--GA------GG----AC----------TTGC------TCG-G-AAA-T-A-AGA--A---A--A---C---TGA--C--A---CCAA-T--C--A-G---A---A--A-----GTAA------T-AT-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAA-TA--------AGCAA-ACAATA--ATA----TC-AACA---GACA-GTA
gi|136496                     :  AAGAGAT-----A-T---G---GAAA-C---AC----------AGCACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--AG------AG----AC----------TTACATGTACTTG-T-AAA-T-G-A-A--G---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAACT-CGAG-TT--------AACAA-CCAGTA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136497                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AT----------AACACACAG---------------G-GTTTT----G-------A--GG------GA----A-----------TTAC------TTT-G-ATA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGT--C--A---CCAA-A-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CTA-TAACATCT-CAAG-TA--------CCCAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136498                     :  AAGAGAC-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTGA----G-------A--GT------GG----AT----------TTAC------TTG-G-GCA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-TG--A-A---G---A--G-----GTAC------T-AA-ATT-A-G---T-----CAG-TAACTTCT-TAAG-TA--------AACAA-ATAATG--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136499                     :  AAGAAAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG------GG----AT----------TCAC------TTG-G-AAA-T-G-AGG--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GCAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAC
gi|136500                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACTCC--G---------------G-GTAAA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAT------ATT-G-AAT-T-A-C-A--A---A--A---G---TGA--C--GACTCCAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC------C-AA-AGT-A-T---T-----TAG-TAACCTCT-CAAG-TA--------ACCAA-CCAATC--ACA----TC-AACA---GA-A-ATA
gi|136501                     :  AAGCGAT-----G-T---G---AAAA-T---GC----------ACCACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG------GG----A---------------------------AAA-T-GGA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC------CAAA-ATT-A-----T-----CAG-TAACATAT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---TATA-AT
gi|136502                     :  AAGAGAT-----A-T---G---ATAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GT------GG----AC----------ATA-------TTG-G-AAATT-A-A-A--A---A--A---T---TGG--C--A---CCAA-T-AT--A-C---A---A--A-----GTGC------T-TA-ATT-A-G---T-----CGG-AAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-TGAATA--GCA----TC-GACA---GACA-ATA
gi|136503                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AA------------------------AT---------------------------G----AC----------T-AC------TTT-G-AAC-T-G-A-A--A---A--AA--G---TGA--T--A---CCAT-T-AC--G-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ATA----CT-AACA---GA
gi|136504                     :  AAGCGAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----A----------------------------AA-T---A-A--A---A--A---GAACTGA--C--A---CCAG-T-GC--A-G---G---A--G-----CCAC------C-AG-TTT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TA--------ATAAA-CC-ATT--ACC----TC-AACT---TACA-ACA
gi|136505                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------AAGGG------GG----AC----------TTAA------TTG-A-AAA-T-A-A-A--A---A--AT--G---TAA--C--A---CCTA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC---------A-CTT-A-CGAGT-----CCG-TAACATCT----G-TA--------AACAA-
gi|136506                     :  AAAAGAT-----A-T---G---AAAA-C---TC----------AACACT--T---------------G-GTTTA----A-------A--GG---------------------------C------TTA-G-AGA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---C----------A-G---G---A--G-----GTTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAT-TGACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAGTA--TTA----TC-AACA---TACA-A
gi|136507                     :  AAGAGAT-----A-T---G---GTAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-AATTA----G-------A------------------------------------------------T-G---------------------CGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--T-----GTAC------C-AA-AAT-A-T---T-----CAG-TAACATCA-CAAG-TA--------AATGA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACT-ATA
gi|136508                     :  AAGAAAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------TTGC------TTG-
gi|136509                     :  AAGAGAT-----AAT---G---AA---------------------------------------------GTTTA----G-------A--GG------TA----AC----------TTAC------TAG-G-AAA-T-GAA-A--A---A--A---G---TGA--C--C---CCAA-T-GA--A-G---G---A--G-----GTG-------C-AA-A---A-T---T-----CAT-TAACATTT-CAAG-TA--------AACAA-CCA
gi|136510                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACT--G---------------G-ACTTA----C-------A--GG------TGT---A------------TAT------TTGCG-GAT-T-G-A-A--A---AC-A---G---TGA--C--A---GAAA-T-AT--C-A---A---A--G-----GTGC------C-AA-ATA-A-T---T-----AAG-TAATATCT-CAAA-TA--------AACAG-CCAATA--ACA-----A-AACAAGTGGCA-AT
gi|136511                     :   AGAAAT-----A-G---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTCA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-GCA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-AC--A-G---G---A--T-----GTAC------T-AA-ATT-A-C---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAAT-------------AACA---GACA-ATA
gi|136512                     :   AGATAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--T---------------G-GCTTA----A-------A--GG------GA----AC----------TTAC------TTA-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CCA----------G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-A---T-----CTG-TAACATCT-CAAG-TA--------GACAA-CCAACA--ACA----TC-AAAA---GACA-ATA
gi|136513                     :   AGATAT-----A-TACTG---AAAA-C---GC----------AACAGA--G---------------G-GTTTA----C-------A--GG------GG----AA----------GTAT------CTG-G-AAA-T-A-A-A--A--------------------------CTAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTA-TGACATTT-CAAT-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GTCA-ATA
gi|136514                     :   AGAGAT-----A-T---ATT-AAAA-C---GC----------TCCTCA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GA------AG----AT----------TTCA------TTG-------T--------A---A--A---G---TTG--C--A---CCAA-T-GA--A-C---G---A--G-----GTAC------T-AA-ATT-A-T---T-----CA-----CATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----CC-AACA---TGCA-CTA
gi|136515                     :   AAAGAT-----A-T---GTATAAAA-----GC----------AAGAGT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------AG----A------------TAC------ATG-A-AAA-T-A-A-A--AG--A--A---A---TAA--C--A---CCAA-T-AC--A-T---G---T--G-----TAAC------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAC-TTT-AAAG-TA--------AATAA-CGGATA--GCA----TC-AACA---AACA-A
gi|136516                     :    GAGAT-----A-T---G---TAAA-G---AC----------AACAAA--G---------------G-GTTTA----GTGAAACAAT-GG------GG----AC----------TTTT------TGG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--AATTG---TGA--C--A---CCAA-G-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-T-T---T-----CAT-TAA
gi|136517                     :    GAGAT-----A-T---G---AAAA-C---ACGGGAAGAC--AACACA--G---------------G-GTTTA----GT------G--GG------GG----AC----------TTGT------TTG-G-AAA-T-G-T-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-
gi|136518                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT------------------------------------GTTTA----G-------G--GG------GG----AT----------TTTG------TTG-G-AAA-T-G-A-A--AT--A--A---A---TGA--C--T---CCAA-T-AC--A-G---G-------------TAC------T-AA-ATC-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAGG-TA--------AACAA-ACAATA--ACATCATTC-AACA---GACA-ATA
gi|136519                     :     AGAT-----A-T---GTT-AAAA-T---GC----------AACGCA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GA------G-----AT----------TTAT------TTG-G-AAT-T-G-A-A--A---T------T---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC--------AA-AGT-A-T---T-----CAG-TAACATTT-CAAG-TA--------AACAA---AATA--ACA----AC-AAAA---
gi|136520                     :     AGAT-----A-A---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTT----G-------A--GG------GG----AA----------TTAC------TCG-G-AAA-TAA-A-A--A---A--A---G---TAA--C--A---AAAA-T-GC--T-G---G---G--G-----GTAC------C-AA-ATC-A-T---T-----CAGTTAACATC----AC-TA--------GACAA-
gi|136521                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GG------GG----TC----------TTAC------TCG-G-AAA-T-A-A-A--A---C--A---G---AGA--C--A---ACAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----TA
gi|136522                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--AG------GG----AT----------TTAA------TTA-G-AAA-T-GAA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CTTA-T-GC--T-GTCTG---A--G-----GTTC------C-AA-ATT-ACT---T-----TAG-
gi|136523                     :     AGAT-----A-C---G---AAAA-C------------------ACA--G---------------G-GTTTA--------------------------------------------T------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---A---TGG--C--A---ACAA-T-AT--ATG---A---A--GTACATGTAC------C-AA-GTT-A-T---T-----TAG-TAACATCC-AAAG-T---------AACAA-CAAATA--ACA----CC-AACA---GACA-
gi|136524                     :     AGAC-----A-C---G---AAAA-C---AC----------GACACA--A---------------GAGTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------CTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---
gi|136525                     :      GAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------G--GG------GG----AC----------TTAC------CTG-G-AAA-A-G-ATT--A---A--A---G---TGA--T--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------C-AA-CTT-A-C---T-----CAG-CAACAT-T-CAA--TA--------A
gi|136526                     :      GAT-------T---A---AAAA-C---AT----------AAC---------------------G-ATTTA----G-------A--GG------AA----AC----------TTGC------TTT-G-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-TC--A-G---G---T--T-----GTAA------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TTAC-------AA-TA--------AACAG-TCAATA--CCA----TG-GACA---GACA-ACA
gi|136527                     :      GAA-----A-T---G---AAAA-C---AC----------ATCACA--G---------------G---TTA----A-------A--GG------GGTGGAGT----------TTGC------TTG-G-AAA-T-G-TTA--A---A--A---G---TCA--C--A---CCAA-T-AC--A-G---G---A--A-----ATAC------A-AA-CTT-
gi|136528                     :       AT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GCTTA----G-------T--GG------AG----AC----------TTGC------TTG-A-AAA-T-G-A-A--A---A--T---A---TGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC------T-AG-ATT-A-T---T-----CCG-AAACATCT-CAAA-TA--------AACAG-CCAATA--CCA----TC-AACA---GACA-ACA
gi|136529                     :       AT-----A-T---G---AAAA-T---AA----------AACACA--G---------------G--TTTA----GG------A--GG------AG----AA----------TTAC------CTG-G-ACA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAATT-GC--A-G---G---A--A-----GTACATGTA-CAAA-AGC-A-T---TCAGTACAG-TAACACCT-CAA--TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TT-AAAA---GAAA-ATA
gi|136530                     :       AT-----A-T---A---AAAA-C---GT----------CGCATA--G---------------G-GTTTATAAAA-------A--GG------AA----GC----------TTAT------TTG-GGAAA-T-G-A-A--A---A--AT--G---TGC--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GAAC------C-AA-ATT-A-G---T-----CAG-TAACATCA-ATAG-TAGCATCAATAACAA-CCAATA--A
gi|136531                     :        T-----A-C---G---AAAA-C---AC----------AGCGCA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTCC------TTG-G-
gi|136532                     :               -T---G---AAAA-C---TT----------AACACA--G---------------G-CTTTG----G-------A--AG------GG----AC----------TTGC------ATG-G-AAA-T-T-ACA--A---A--A---A---TCA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTACATGTATT-AA-ATTAA-T---T-----CTC-TAACAGCT-GAAG-TA--------AACAA-CTATTAC-ACA----TC-AATA---GACG-ATA
gi|136533                     :                 ---G---AAAA-C---GCGTATCTATGGAGCAAA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GAAAGAGAGG----AC----------TTAC------TGG-G-AAA-C-A-A-A--A---A--G---G---AGA--C--A---CAAA---GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TTACATCT-TAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---TATA-ATA
gi|136534                     :                 ---G---AAAA-----GA----------AACACA--A---------------G-ATT-A----G-------G--AG------AG----AT----------TTAC------TTG-A-AAA-TTA-A-A--A---A--A---A---TGA--C--A-----AA-C-ACCTA-G---G---T--G-----G-AC------A-AA-TTT-A-T---T-----CAG---------------------------CGA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136535                     :                            -C---GC----------AAC-----------------------GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTGC------TTG-A-ATA-T-G-A-A--G---A--A---A---TAAAACGAA---CCGA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------T-TA-AAT-A-T---T-----CAG-CAACACCT-CAAA-TA--------AACAA-ACAAGA--ACG----TC-AACA---
gi|136536                     :                              ---GC----------AATACTT-G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTTT------TTG-A-ATA-C-G-A-A--AG--A--A---G---TGA--C--A---CTTA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAG------C-AA-CCA-A-T---T-----TAC-TAATATCT-AAAG-CA--------GACAA-CAAATA--ATA----CC-AACA---GACA-GTA
gi|136537                     :                                  C----------AACACT--T---------------A-GTTTA----G-------A--GG------CA----AC----------TTAC------TTG-G-AAG-T-G-A-A--A---A--G---T---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----C--------------AG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AGCA---GACA-ATA
gi|136538                     :                                                ACT--G---------------G-GTATA----G-------A--AT------GG----AC----------TTTC------TTG-T-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ACT-A-T---T-----CAG-TTAAGTTT-TAAG-T---------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---
gi|136539                     :                                                 CA--G---------------G-GTTTC----G-------A--TA------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-AG-A---A--A---G---TGA--C--G---CCTA-T-AC--G-A---A---A--G-----ATG-------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAA-TA--------GACAA-CCAGTA--ACA----TC-AACA---TAC
gi|136540                     :                                                                                            G------AG----AC----------TTCC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AGCA---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAA-TAACATCT-TAAG-TA--------AACCA-CTAATT--ACA----TC-CACA---GACA-CTA
gi|136541                     :                                                                                                     ----AC----------ATAC------TTT-G-AAA----------A---A--A---A---TGA--C--A---CCAA-T-CC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATG-A-T---C-----CAG-TGACACCC-CAAA-TT--------AACAT-TCAATA--A
gi|136542                     :                                                                                                                                  -G-AAA-----A-A--A---A--A---A---TGA--T--A---CCAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GAAC------A-AA-ATT-A-T---C-----CAG-TAACATCA-CAAGTTAAT------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---AACA-AT
gi|136543                     :                                                                                                                                            -A-A--A---A--C---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------T-TA-AT--A-T---T-----CGG-TAACATCC-CAAG-TA--------AACAA-GCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136544                     :                                                                                                                                                                                                      -----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----TAG-TTACATCT-CAAG-TA--------GACAA-CCAATA--ACA----TT-AACA---TACA-ATA


blockSeqs                     :         CTGGA   ACT TAT           GTATCTATGG      CA TACGTATTCTCGTAT       TAAA TGAAACA AG  TATATA  TGGA  AGGGTGGGGC    ATGTAC         A A T G AG CAA GC AAA AAC   AT    ACT            G         CT TACAT    ATGTAT A  T           CAGTA                 T  GCATCAAT            AC   TCAT       AGT
blockSeqs                     :         .       .   TT            GGGAAGAC        T  .                     .    T       T   AAGAGA  T     .             .              T T G G T  G   A  ATT G     AA    T              T         CT .        ATGTA  A  T           .                     T  ACT                 C    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   TT            .               .  .                     .    G       .   .       .     .             .              . . A T G  T   G  T   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  AT                  .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . C T .  G   A  A   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . A C .  .   T  T   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   T  T   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   T  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   C  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   T  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   C  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   T  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   T  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .          .  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .             
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .             
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .    .             
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .                  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .                  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                   .                  
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                                      
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                                      
blockSeqs                     :         .       .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                                      
blockSeqs                     :                 .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                                      
blockSeqs                     :                 .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                                      
blockSeqs                     :                 .   .             .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .  .                                      
blockSeqs                     :                                   .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                     .                                         
blockSeqs                     :                                   .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                                                               
blockSeqs                     :                                   .               .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                                                               
blockSeqs                     :                                                   .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                                                               
blockSeqs                     :                                                   .  .                     .    .       .   .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .         .  .        .      .  .           .                                                               
blockSeqs                     :                                                                                             .       .     .             .              . . . . .  .   .  .   .     .     .              .            .        .      .  .                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                     .     .             .                  . . .  .                                                                                                                                                 


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                   ***
originalCons                  : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
finalCons                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA





Alignments
lowQualScore                  :         11111 0 111 222    0 111  4444444444      11 333333333333333 0     1111 2222222 11  333333  1111  2222222222    111111   0 0   1 1 2 2 11 333 66 444 111   11 00 111    0 0  00 1 000 000 11 11111    222222 1  1   0 0 000 11111   0        0    1  33333333     0      11   1111  0    111    0   
lowQualScore                  :         ..... . ... ...    . ...  ..........      .. ............... .     .... ....... ..  ......  ....  ..........    ......   . .   . . . . .. ... .. ... ...   .. .. ...    . .  .. . ... ... .. .....    ...... .  .   . . ... .....   .        .    .  ........     .      ..   ....  .    ...    .   
lowQualScore                  :         55555 6 000 666    6 000  4444444444      33 444444444444444 5     1111 8888888 33  111111  6666  3333333333    555555   5 5   1 1 6 6 88 000 66 000 555   55 77 555    5 5  77 1 999 999 55 33333    999999 1  1   5 5 999 44444   5        6    1  99999999     6      55   4444  7    222    8   
consensus                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
Reference ( family-358 )      : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136466                     : GAAGAGAT-----A-T---A---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--AT--A--A---G---TGA--T--T---CCAA-T-GC--A-G---C---A--G-----TTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAA-TAACGTTT-CAAA-TA--------AACAA-CCAATA--GCA----TC-AACG---GACA-ATA
gi|136467                     : GATGAGAC-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTGC------TGG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---T---TGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTA-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TG--------AACAA-CCAATG--ACA----TC-ATCA---GACA-ATA
gi|136468                     : GAAGAGAT-----T-T---A---AAAA-T---GC----------AAAACT--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-CAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--G---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GAAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CTAA-TA--------AACAA-CCAACA--GCA----TC-ATCA---GACA-ATA
gi|136469                     : GAAGAGCT-----A-T---G---GAAA-C---GT----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAA------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---A---T-A--T--A---CCAA-C-GC--AGG---G---G--G-----GTAC------C-AA-ATC-A-T---T-----CA--TGACGCCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TT-AACA---GACA-ATA
gi|136470                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GA------AG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-AT-A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----TTAC------C-AT-ATT-A-T---T-----CAG-CAACATCT-CAAG-TA-----------AA-CCAATA--AC------CAAATA---GACA-ATA
gi|136471                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACG--T---------------G-GTTTA----G-------A--GGTATATAGG----AG------------AC------TTG-A-AAA-T-G-A-A--A---AA-A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTGC------T-AA-AAT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TT--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136472                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG------GG----AC----------TTAT------TTT-G-AAA-C-A-A-A------------------GA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TATCATCT-CAAG-AA--------AACAA-ACAATA--ACA----CC-AACA---GACA-AT
gi|136473                     : GAAGGGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--ATACGTATTCTCGTATG-GTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AG-A---T---TGA--C--A---CCAG-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CAG-TATCCTCT-CAAC-TA--------AACAA-CCAGTA--ACA----
gi|136474                     : GAAGAGAT-----A-C---G---AAAC-G---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA--------------------------------------------C------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A----------G---TGG--C--A---CCAC-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136475                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACC--C---------------A-GTTTG----G-------A--GG------GG----AC----------TCAT------CTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--G---GG--CAA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---T---T--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----GAG-TAACAGCT-CGAG-TT--------AAAAA-ACAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136476                     : GAACAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------AA----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-A-A-A--A---A--AT--A---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAG------C-AA-ATT-A-T---T-----CCG-TAACATCTCCAAA-TA--------
gi|136477                     : GAATATAT-----A-T---A---AAAAAC---AC----------AACA----G---------------G-GTTTA----C-------A--GG------GG----AC----------TTAC------CTG-A-AAAAT-G-A-A--A---AA-A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----CTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-GTACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAGTT--ACA----TC-AGTA---GACA-ATA
gi|136478                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTC-A-AAA-T-ATA-A--A---A--A---G---TGA--C--G---CCAA-T-AC--A-G---G---G--G-----GTAC------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAGCATCT-CAAA-TA--------TACAA-
gi|136479                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GA----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------ATGC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--T---G---AGA--A--A---CCGA-T-GC--A-A---G---C--G-----GTAC------A-AA-ATA-G-T---T-----CAG-TAACA--T-CAAG-TA--------AACAA-CCAACA--ATA----TT-AAC
gi|136480                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TT--A-G---GTCTA--------GTAA------A-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--GCA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136481                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------T-G-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA------C-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136482                     : GAAGAGAT-----T-T---T---AAAA-T---GC----------AACAAA--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAC------T-G-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CTAA-T-TA--A-G---G---TCTG-----GTAA------C-GA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAAATCT-CAAT-TA--------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-TTA
gi|136483                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GT----------------------------------------------AC------TTG-A-AAT-T-G-A-A--A---A--AAAAG---TGA--C--A---CCAA-CAGC--A-G---G---A--T-----GCAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAG-CCAATA--ACA----TC-AACA---TACA-AT
gi|136484                     : GAAGAGATCTGGAA-T---G---AAAA-CAACGT----------AAGAAA--G---------------G-GGTTA----G-------A--AG------CG----AT----------TTGC------TTT-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---T---AGA--C--G---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CTAG-TA--------AACAA-ACAGTA--ACA----TC-TACA---
gi|136485                     : GAGGAGAT-----A-T---A---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTAA----G-------G--GG------GG----GCAGGGTGGGGCTTAT------ATT-G-AAA-T-G-A-A--A---AC-A---G---TGA--C--A---TCAA-T-TC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAACC-CAAG-TA--------TACAA-CCAATA--AAA----T
gi|136486                     : GAAAAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACG--G---------------C-GTTTA----G-------A--GG------GG----TC----------TTAC------TTT-A-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CTAA-C-GC--A-A---T---A----------AC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAGCT-CAAG-AA--------AACAA-CC------------------CA---GACA-ATA
gi|136487                     : GAAGAATT-----C-T---G---ATAG-T---GC----------AACACT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TCAT------------------------------------------------A---CTAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-ATTATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATAACACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136488                     : GAAGATAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--------------------------------------TTG-G-AAA-T-G-A-AAGA---A--A---G----GAATC--AT--CCAA-T-GA--A-T---G---A--G-----GTAA------C-AC-ATT-A-T---T-----CAG-CAACATCT-CGAGTTAACT-----AACAA-CTAATG--ATA----TC-AACA---AACA-ACA
gi|136489                     : GAAGTGAT-----C-T---G---AAAA-T---GC----------TACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAT------TTT-G-AAA-T-G-G-A--A---A--A---G-----------------AA-T-GT---------------G-----ACAC------C-AA-------T---C-----CAG-TAACATCT-TGAG-TA--------AATGA-CTAATA--ACA----TC-AACA---GA
gi|136490                     : GAAGAGAT-----G-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--A---------------G-CTCCA------------A--GG------GG----AC----------T-A-------TTG-G-AAA-T-G-A-T--A---AT-A---T---TGA--C--A---TTTA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC------C-CTTATT-A-T---T-----TTG-TAGTAAGT-CAAG-TA--------AACAA-CAAATA--ACA----TC-AACG---GACA-ATA
gi|136491                     : GAAAGTAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACA--G---------------G-GTTCT----G-------A--GG------GG----AC----------TC----------G-G-AAA-T-G-A-A--A---A--T---G---TGA--C--A---CAAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CAG-TAACGTCT-TAAG-T
gi|136492                     : GAAGATAT-----A-T---C---AAAA-C---G--------------A-A--G---------------G-GTTTA----A-------A--GG-------------C----------TT-T------TTG-G-AAT-T-G-A-A--ACAAA--A---G---TGA--C--A---CGCA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-AT--------AGCAAGGCAATA--A
gi|136493                     : GAAGTGAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------A-GTTGA----G-------T--TG------GT----AC----------TTGT------TAC-A-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAC-G-GC--A-A---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAT-TAACATTT-TAAG--------------------AT---ACA----TC-AACA---CACA-ATA
gi|136494                     : GAAGAGAT-----A-T---G---AAAC-T---GC----------AATACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--GG------G------C----------TTAT------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---ACAA-T-CC--A-A---G---A--A-----GTTC------C-AA-ATT-A-A---C-----CAA-TGATATC----AA-CA--------GAC-A-CTAATT--ACT----GC-AATG---GATATATA
gi|136495                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--A---------------G-GTTTA----G-------A--GA------GG----AC----------TTGC------TCG-G-AAA-T-A-AGA--A---A--A---C---TGA--C--A---CCAA-T--C--A-G---A---A--A-----GTAA------T-AT-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAA-TA--------AGCAA-ACAATA--ATA----TC-AACA---GACA-GTA
gi|136496                     :  AAGAGAT-----A-T---G---GAAA-C---AC----------AGCACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--AG------AG----AC----------TTACATGTACTTG-T-AAA-T-G-A-A--G---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACAACT-CGAG-TT--------AACAA-CCAGTA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136497                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---AT----------AACACACAG---------------G-GTTTT----G-------A--GG------GA----A-----------TTAC------TTT-G-ATA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGT--C--A---CCAA-A-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-CTT-A-T---T-----CTA-TAACATCT-CAAG-TA--------CCCAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136498                     :  AAGAGAC-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTGA----G-------A--GT------GG----AT----------TTAC------TTG-G-GCA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-TG--A-A---G---A--G-----GTAC------T-AA-ATT-A-G---T-----CAG-TAACTTCT-TAAG-TA--------AACAA-ATAATG--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136499                     :  AAGAAAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------T-GTTTA----G-------A--GG------GG----AT----------TCAC------TTG-G-AAA-T-G-AGG--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GCAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAC
gi|136500                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACTCC--G---------------G-GTAAA----G-------A--GG------AG----AC----------TTAT------ATT-G-AAT-T-A-C-A--A---A--A---G---TGA--C--GACTCCAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC------C-AA-AGT-A-T---T-----TAG-TAACCTCT-CAAG-TA--------ACCAA-CCAATC--ACA----TC-AACA---GA-A-ATA
gi|136501                     :  AAGCGAT-----G-T---G---AAAA-T---GC----------ACCACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GG------GG----A---------------------------AAA-T-GGA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAC------CAAA-ATT-A-----T-----CAG-TAACATAT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---TATA-AT
gi|136502                     :  AAGAGAT-----A-T---G---ATAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------T--GT------GG----AC----------ATA-------TTG-G-AAATT-A-A-A--A---A--A---T---TGG--C--A---CCAA-T-AT--A-C---A---A--A-----GTGC------T-TA-ATT-A-G---T-----CGG-AAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-TGAATA--GCA----TC-GACA---GACA-ATA
gi|136503                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AA------------------------AT---------------------------G----AC----------T-AC------TTT-G-AAC-T-G-A-A--A---A--AA--G---TGA--T--A---CCAT-T-AC--G-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ATA----CT-AACA---GA
gi|136504                     :  AAGCGAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----A----------------------------AA-T---A-A--A---A--A---GAACTGA--C--A---CCAG-T-GC--A-G---G---A--G-----CCAC------C-AG-TTT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TA--------ATAAA-CC-ATT--ACC----TC-AACT---TACA-ACA
gi|136505                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------AAGGG------GG----AC----------TTAA------TTG-A-AAA-T-A-A-A--A---A--AT--G---TAA--C--A---CCTA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC---------A-CTT-A-CGAGT-----CCG-TAACATCT----G-TA--------AACAA-
gi|136506                     :  AAAAGAT-----A-T---G---AAAA-C---TC----------AACACT--T---------------G-GTTTA----A-------A--GG---------------------------C------TTA-G-AGA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---C----------A-G---G---A--G-----GTTC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAT-TGACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAGTA--TTA----TC-AACA---TACA-A
gi|136507                     :  AAGAGAT-----A-T---G---GTAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-AATTA----G-------A------------------------------------------------T-G---------------------CGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--T-----GTAC------C-AA-AAT-A-T---T-----CAG-TAACATCA-CAAG-TA--------AATGA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACT-ATA
gi|136508                     :  AAGAAAT-----A-T---G---AAAA-T---GC----------AACACA--G---------------G-GTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------TTGC------TTG-
gi|136509                     :  AAGAGAT-----AAT---G---AA---------------------------------------------GTTTA----G-------A--GG------TA----AC----------TTAC------TAG-G-AAA-T-GAA-A--A---A--A---G---TGA--C--C---CCAA-T-GA--A-G---G---A--G-----GTG-------C-AA-A---A-T---T-----CAT-TAACATTT-CAAG-TA--------AACAA-CCA
gi|136510                     :  AAGAGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACT--G---------------G-ACTTA----C-------A--GG------TGT---A------------TAT------TTGCG-GAT-T-G-A-A--A---AC-A---G---TGA--C--A---GAAA-T-AT--C-A---A---A--G-----GTGC------C-AA-ATA-A-T---T-----AAG-TAATATCT-CAAA-TA--------AACAG-CCAATA--ACA-----A-AACAAGTGGCA-AT
gi|136511                     :   AGAAAT-----A-G---G---AAAA-C---AC----------AACACA--G---------------G-GTTCA----G-------A--GG------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-GCA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-AC--A-G---G---A--T-----GTAC------T-AA-ATT-A-C---T-----CAG-AAACATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAAT-------------AACA---GACA-ATA
gi|136512                     :   AGATAT-----A-T---G---AAAA-C---AC----------AACACA--T---------------G-GCTTA----A-------A--GG------GA----AC----------TTAC------TTA-G-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CCA----------G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-A---T-----CTG-TAACATCT-CAAG-TA--------GACAA-CCAACA--ACA----TC-AAAA---GACA-ATA
gi|136513                     :   AGATAT-----A-TACTG---AAAA-C---GC----------AACAGA--G---------------G-GTTTA----C-------A--GG------GG----AA----------GTAT------CTG-G-AAA-T-A-A-A--A--------------------------CTAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTA-TGACATTT-CAAT-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GTCA-ATA
gi|136514                     :   AGAGAT-----A-T---ATT-AAAA-C---GC----------TCCTCA--G---------------G-GTTTA----G-------A--GA------AG----AT----------TTCA------TTG-------T--------A---A--A---G---TTG--C--A---CCAA-T-GA--A-C---G---A--G-----GTAC------T-AA-ATT-A-T---T-----CA-----CATCT-CAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----CC-AACA---TGCA-CTA
gi|136515                     :   AAAGAT-----A-T---GTATAAAA-----GC----------AAGAGT--G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------AG----A------------TAC------ATG-A-AAA-T-A-A-A--AG--A--A---A---TAA--C--A---CCAA-T-AC--A-T---G---T--G-----TAAC------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TAAC-TTT-AAAG-TA--------AATAA-CGGATA--GCA----TC-AACA---AACA-A
gi|136516                     :    GAGAT-----A-T---G---TAAA-G---AC----------AACAAA--G---------------G-GTTTA----GTGAAACAAT-GG------GG----AC----------TTTT------TGG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--AATTG---TGA--C--A---CCAA-G-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-T-T---T-----CAT-TAA
gi|136517                     :    GAGAT-----A-T---G---AAAA-C---ACGGGAAGAC--AACACA--G---------------G-GTTTA----GT------G--GG------GG----AC----------TTGT------TTG-G-AAA-T-G-T-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-
gi|136518                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT------------------------------------GTTTA----G-------G--GG------GG----AT----------TTTG------TTG-G-AAA-T-G-A-A--AT--A--A---A---TGA--C--T---CCAA-T-AC--A-G---G-------------TAC------T-AA-ATC-A-T---T-----CAG-TAACATCT-CAGG-TA--------AACAA-ACAATA--ACATCATTC-AACA---GACA-ATA
gi|136519                     :     AGAT-----A-T---GTT-AAAA-T---GC----------AACGCA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GA------G-----AT----------TTAT------TTG-G-AAT-T-G-A-A--A---T------T---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC--------AA-AGT-A-T---T-----CAG-TAACATTT-CAAG-TA--------AACAA---AATA--ACA----AC-AAAA---
gi|136520                     :     AGAT-----A-A---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTT----G-------A--GG------GG----AA----------TTAC------TCG-G-AAA-TAA-A-A--A---A--A---G---TAA--C--A---AAAA-T-GC--T-G---G---G--G-----GTAC------C-AA-ATC-A-T---T-----CAGTTAACATC----AC-TA--------GACAA-
gi|136521                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-ATTTA----A-------A--GG------GG----TC----------TTAC------TCG-G-AAA-T-A-A-A--A---C--A---G---AGA--C--A---ACAC-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----TA
gi|136522                     :     AGAT-----A-T---G---AAAA-C---GT----------AACACA--G---------------G-GTTTA----T-------A--AG------GG----AT----------TTAA------TTA-G-AAA-T-GAA-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CTTA-T-GC--T-GTCTG---A--G-----GTTC------C-AA-ATT-ACT---T-----TAG-
gi|136523                     :     AGAT-----A-C---G---AAAA-C------------------ACA--G---------------G-GTTTA--------------------------------------------T------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---A--A---A---TGG--C--A---ACAA-T-AT--ATG---A---A--GTACATGTAC------C-AA-GTT-A-T---T-----TAG-TAACATCC-AAAG-T---------AACAA-CAAATA--ACA----CC-AACA---GACA-
gi|136524                     :     AGAC-----A-C---G---AAAA-C---AC----------GACACA--A---------------GAGTTTA----G-------A--AG------GG----AC----------CTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---
gi|136525                     :      GAT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--T---------------G-GTTTA----G-------G--GG------GG----AC----------TTAC------CTG-G-AAA-A-G-ATT--A---A--A---G---TGA--T--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------C-AA-CTT-A-C---T-----CAG-CAACAT-T-CAA--TA--------A
gi|136526                     :      GAT-------T---A---AAAA-C---AT----------AAC---------------------G-ATTTA----G-------A--GG------AA----AC----------TTGC------TTT-G-AAA-T-A-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAA-T-TC--A-G---G---T--T-----GTAA------C-AA-ATT-A-T---T-----CAG-TTAC-------AA-TA--------AACAG-TCAATA--CCA----TG-GACA---GACA-ACA
gi|136527                     :      GAA-----A-T---G---AAAA-C---AC----------ATCACA--G---------------G---TTA----A-------A--GG------GGTGGAGT----------TTGC------TTG-G-AAA-T-G-TTA--A---A--A---G---TCA--C--A---CCAA-T-AC--A-G---G---A--A-----ATAC------A-AA-CTT-
gi|136528                     :       AT-----A-T---G---AAAA-C---GC----------AACACA--G---------------G-GCTTA----G-------T--GG------AG----AC----------TTGC------TTG-A-AAA-T-G-A-A--A---A--T---A---TGA--C--A---TCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTTC------T-AG-ATT-A-T---T-----CCG-AAACATCT-CAAA-TA--------AACAG-CCAATA--CCA----TC-AACA---GACA-ACA
gi|136529                     :       AT-----A-T---G---AAAA-T---AA----------AACACA--G---------------G--TTTA----GG------A--GG------AG----AA----------TTAC------CTG-G-ACA-T-G-A-A--A---A--A---G---TGA--C--A---CCAATT-GC--A-G---G---A--A-----GTACATGTA-CAAA-AGC-A-T---TCAGTACAG-TAACACCT-CAA--TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TT-AAAA---GAAA-ATA
gi|136530                     :       AT-----A-T---A---AAAA-C---GT----------CGCATA--G---------------G-GTTTATAAAA-------A--GG------AA----GC----------TTAT------TTG-GGAAA-T-G-A-A--A---A--AT--G---TGC--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--A-----GAAC------C-AA-ATT-A-G---T-----CAG-TAACATCA-ATAG-TAGCATCAATAACAA-CCAATA--A
gi|136531                     :        T-----A-C---G---AAAA-C---AC----------AGCGCA--G---------------G-ATTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTCC------TTG-G-
gi|136532                     :               -T---G---AAAA-C---TT----------AACACA--G---------------G-CTTTG----G-------A--AG------GG----AC----------TTGC------ATG-G-AAA-T-T-ACA--A---A--A---A---TCA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTACATGTATT-AA-ATTAA-T---T-----CTC-TAACAGCT-GAAG-TA--------AACAA-CTATTAC-ACA----TC-AATA---GACG-ATA
gi|136533                     :                 ---G---AAAA-C---GCGTATCTATGGAGCAAA--G---------------G-GTTAA----G-------A--GAAAGAGAGG----AC----------TTAC------TGG-G-AAA-C-A-A-A--A---A--G---G---AGA--C--A---CAAA---GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CTG-TTACATCT-TAAG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---TATA-ATA
gi|136534                     :                 ---G---AAAA-----GA----------AACACA--A---------------G-ATT-A----G-------G--AG------AG----AT----------TTAC------TTG-A-AAA-TTA-A-A--A---A--A---A---TGA--C--A-----AA-C-ACCTA-G---G---T--G-----G-AC------A-AA-TTT-A-T---T-----CAG---------------------------CGA-CCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136535                     :                            -C---GC----------AAC-----------------------GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTGC------TTG-A-ATA-T-G-A-A--G---A--A---A---TAAAACGAA---CCGA-T-GC--A-G---G---A--A-----GTAC------T-TA-AAT-A-T---T-----CAG-CAACACCT-CAAA-TA--------AACAA-ACAAGA--ACG----TC-AACA---
gi|136536                     :                              ---GC----------AATACTT-G---------------G-GTTTA----G-------A--GG------GG----AC----------TTTT------TTG-A-ATA-C-G-A-A--AG--A--A---G---TGA--C--A---CTTA-T-GC--A-G---A---A--G-----GTAG------C-AA-CCA-A-T---T-----TAC-TAATATCT-AAAG-CA--------GACAA-CAAATA--ATA----CC-AACA---GACA-GTA
gi|136537                     :                                  C----------AACACT--T---------------A-GTTTA----G-------A--GG------CA----AC----------TTAC------TTG-G-AAG-T-G-A-A--A---A--G---T---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----C--------------AG-TA--------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AGCA---GACA-ATA
gi|136538                     :                                                ACT--G---------------G-GTATA----G-------A--AT------GG----AC----------TTTC------TTG-T-AAA-T-G-A-A--A---AT-A---G---TGA--C--A---CAAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ACT-A-T---T-----CAG-TTAAGTTT-TAAG-T---------AACAT-CCAATA--ACA----TC-AACA---
gi|136539                     :                                                 CA--G---------------G-GTTTC----G-------A--TA------GG----AC----------TTAC------TTG-G-AAA-T-G-A-AG-A---A--A---G---TGA--C--G---CCTA-T-AC--G-A---A---A--G-----ATG-------A-AA-ATT-A-T---T-----CAG-AAACATCT-CAAA-TA--------GACAA-CCAGTA--ACA----TC-AACA---TAC
gi|136540                     :                                                                                            G------AG----AC----------TTCC------TTG-G-AAA-T-G-A-A--A---AGCA---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----ATAC------C-AA-ATT-A-T---T-----CAA-TAACATCT-TAAG-TA--------AACCA-CTAATT--ACA----TC-CACA---GACA-CTA
gi|136541                     :                                                                                                     ----AC----------ATAC------TTT-G-AAA----------A---A--A---A---TGA--C--A---CCAA-T-CC--A-G---G---A--G-----GTAC------C-AA-ATG-A-T---C-----CAG-TGACACCC-CAAA-TT--------AACAT-TCAATA--A
gi|136542                     :                                                                                                                                  -G-AAA-----A-A--A---A--A---A---TGA--T--A---CCAA-T-GC--A-T---G---A--G-----GAAC------A-AA-ATT-A-T---C-----CAG-TAACATCA-CAAGTTAAT------AACAA-CCAATA--ACA----TC-AACA---AACA-AT
gi|136543                     :                                                                                                                                            -A-A--A---A--C---G---TGA--C--A---CCAA-T-GC--A-G---G---A--G-----GTAC------T-TA-AT--A-T---T-----CGG-TAACATCC-CAAG-TA--------AACAA-GCAATA--ACA----TC-AACA---GACA-ATA
gi|136544                     :                                                                                                                                                                                                      -----GTAC------C-AA-ATT-A-T---T-----TAG-TTACATCT-CAAG-TA--------GACAA-CCAATA--ACA----TT-AACA---TACA-ATA