lowQualScore : 111 00 11111 0 1111 44444 00 00 6666 1111 1111 00 0
lowQualScore : ... .. ..... . .... ..... .. .. .... .... .... .. .
lowQualScore : 111 77 33333 5 1111 11111 77 77 6666 1111 2222 88 6
consensus : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-G--CGG----A----CG--GAC-GGAC
Reference ( gi|136336 ) : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTGC-C--CGG----A----CA--GAC-GGAC
gi|136339 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----CA--GAC-GGAC
gi|136338 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----CG--GAC-GGACa
gi|136337 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----CG--GAC-GGAC
gi|136346 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----CA--GAT-GGAC
gi|136343 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTG--C--CAG----A----CA--GAC-GGAC
gi|136350 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----CA--GAC-GGAC
gi|136333 : TAACC---CTAAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTGT-A--CGG----A----CG--GAC-GGACa
gi|136357 : TAACT---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----CA--GAC-GGAC
gi|136347 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AGCTACCCATT-----TG--T--GTGC-C--CGG----A----AG--GAC-GGAC
gi|136362 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACAACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----CA--GAC-AGa
gi|136352 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----CG--GAC-GGA
gi|136354 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----CG--GAC-AGAC
gi|136344 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCATT-----TG--T--GTGG-A--CGG----A----CAGGGAC-GGAC
gi|136332 : TAACC---CTAAACC--C-----TC-GACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGT-G--CGG----A----CG--GAC-GAAC
gi|136356 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----CG--AAC-AGACa
gi|136355 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTTTTAAAATTACCCATT-----TG--T--GTGC-C--CGG----A----CG--GAC-a
gi|136360 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACATTT----AACTACACATT-----TG--T--GTGC-C--CGG----A----AG--GAC-TGAcaaca
gi|136375 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----CA--GAC-GCAC
gi|136349 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GTCATTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-A--CGG----A----CA--GAC-GGA
gi|136366 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----AG--GAC-GG
gi|136365 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CAG----A----AG--GAC-GGAC
gi|136367 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCAC-C--CGG----A----CG--GAC-GGAC
gi|136348 : TAACC---CTAAAAC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-A--CAG----A----CA--GAG-AGAC
gi|136342 : TAACC---CTAAACC--A-----TT-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTGT-A--CGG----A----CG--GAT-GGACa
gi|136334 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGTGC--GGG----G----CG--GAC-GAAC
gi|136364 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--TGG----A----TG--GAC-AGACa
gi|136351 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-A--CGG----A----CA--AGC-GGa
gi|136341 : TAAGC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCATT-----CG--T--GTGC-A--CAG----A----TG--GAC-GGACtacggaca
gi|136371 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--CGG----A----AG--GAC-GGACa
gi|136381 : TAATC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--A--TTGC-C--CGG---------TA--GAC-GG
gi|136335 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CA--T--GTAT-G--CGG----A----CG--AAC-GAAC
gi|136353 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GGCACTT----AACTACCCATT-----CT--T--GTGC-A--CGT----G----CA--GAC-GGACa
gi|136372 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--CCGC-C--TGG----A----TG--GAT-GGACgggc
gi|136368 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACTCTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-A--CGG----G----CA--AAC-GGa
gi|136373 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCTGT-----CG--T--GTGC-C--CGG----G----tacggac
gi|136345 : TAACG---CTAAACC--C-----TA-GATACTT----CACTACCCATT-----GG--T--GTGT-G--CGG----A----CG--GAC-GAAC
gi|136361 : TAACC---CTAAAGC--C-----TA-GACACTT----AAATACCAATT-----TG--T--GTGT-G--CTG----A----CA--GAC-AGGC
gi|136340 : TAACC---CTAAACT--C-----CA-GACACTC----AACTGCCCATT-----CG--A--GTGT-G--CGG----A----CG--GAC-GAACa
gi|136370 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----CA--T--GTGT-T----G----A----CA--AAC-AGAa
gi|136359 : TAACC---CAAAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAGT-----TG--T--GTGT-G--CAG----A----CG--CAT-GGA
gi|136382 : TAACCTAGCTTAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCATC-----AT--T--GTGC-A--TGG----A----CA--GAC-GAAC
gi|136376 : TAACC---CTAAACT--C-----TA-GATACTT----ACATATCCATTTG---TG--T--GTGT-G--TGG----A----CA--GAC-AGACa
gi|136358 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCATT-----TA--T--GTGT-G--CAA----A----TG--GAT-GAAC
gi|136379 : TAACC---CAACACC--C-----GA-AACACTT----AACGACCCATT-----CG--T--ATGC-A--GGG----A----CA--GAC-AGACa
gi|136369 : TAACC---CGTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--GTGT-G--CAG----A----a
gi|136374 : TGACC---CTAAACC--C-----TA-GCCACAA----AACTACACATT-----TG--T--GTGT-A--CGG----A----CG--GAC-gaa
gi|136386 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--
gi|136387 : TAACC---CTAAACC--G-----TA-GACACTT----AACTACCAATT-----TG--T--TTG
gi|136377 : TAACC---CTAAACC--C-----CA-GCCACTT----AATTGGCCATTGA---TG--T--GTG-----CGG----A----CT--GACTGGA
gi|136383 : TAACC---CTCACTC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTATT-----TG--T--GTGT-G--TGG----T----CA--GAC-
gi|136378 : TAACC---TTAAATC--C-----TA-GACACTT----AAATACACATTGGTTGTG--T--GTGC-TGGTGG----A----CA--GAC-
gi|136363 : TAACC---CTAAACC--G-----TT-GACACTT----AACTAACCATT-----CA--T--GTGT-G--CGG----G----CG--Ga
gi|136385 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GAAACTT----AAACACCCACG-----TG--T--GTGttgaaca
gi|136384 : TAGCC---TTAAACC--C-----TA-ACCACAT----AACTACCCATT-----TG--T--ATGtg
gi|136380 : TAACT---CTAAATC--T-----TA-GCCACTT----AATTAACCATT-----CG--T--ATAT-G--CGA----A----CG--AGC-GAACtatgtatgtacgtatggacggaca
gi|136388 : AACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CA--T--GTAC-A--CGG----A----CG--GAC-Ga
gi|136390 : AAAC---CTAAACC--CGGTTATAAGACACTT----AAATATCTATTGA---TG--T--GTG-----CGT----A----CA--GAC-GGA
gi|136389 : AACA---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAATCA---TG--T--GTG
gi|136391 : ACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----CG--GAC-GGACgatgg
gi|136392 : ACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCTGTT-----CG--T--GTGC-A--CGG----A----CA--GAC-GGAC
gi|136393 : ACC---CTTAACC--C-----CA-GACACTT----AAATACCCATT-----TG--T--GTGT-G--AGG----T----CT--GAC-AGAC
gi|136394 : ACC---CTTAACC--T-----TA-GACACTT----AAATACCTATT-----CA--T--ATGT-G--TGG----A----CA--GAC-AAACa
gi|136395 : C---CTAAACC--C-----TC-GCCACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTGT-G--CGG----ATGGTCA--AAC-GGGCa
gi|136396 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCATT-----TGGAC--ATG-----CGG----A----CA--GAC-AGAC
gi|136398 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCATT-----CG--G--ACAT-T--CGG----A----TA--GAC-AGACa
gi|136397 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCATT-----CG--G--ACAT-T--CGG----A----TA--GAC-AGACa
gi|136400 : AAACCGTC-----CA-AACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--TTGC-A--CGG----A----a
gi|136399 : AAATA--C-----TA-ACCTCTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGA-G--CGGATGTA----CG--GAC-GGACg
gi|136401 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-A--CGG----A----CG--GAC-GGACa
gi|136403 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTGC-C--CGG----A----AG--GAC-AGAC
gi|136405 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--TTGC-C--CGG----A----AG--GAC-GGAC
gi|136406 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCATT-----TG--T--GTGC-A--CGG----A----CA--CAA-GGAC
gi|136404 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCATT-----CG--TAGGTG-----CGG----A----CA--GAC-tgac
gi|136407 : AACC--C-----AA-TACACT-----AACTACCCATT-----CG--T--GTGC-A--TGG----A----CG--GAC-GGACcaaca
gi|136402 : AACC--C-----TA-GACAATT----AACTTCCCATT-----CG--T--GTGT-G--AGG----A----CG--GAC-GAACa
gi|136408 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCC-TT-----CG--T--GTGT-G--CGG----
gi|136409 : AACC--C-----TA------------AACTACCCATT-----CG--T--GTGT-T--TGG----A----CG--GAC-GAAC
gi|136410 : CC--C-----AA-CACAATT----AACAACCCATT-----CG--T--GTGT-G--CGG----A----TA--AAC-GGACa
gi|136411 : A-GCCACTT----AACTACCCATG-----TG--T--GTGT-G--CAG----A----CA--AAC-AGAC
Alignments
lowQualScore : 111 00 11111 0 1111 000 222222222 44444 0 2222 1111 1111 2222 0
lowQualScore : ... .. ..... . .... ... ......... ..... . .... .... .... .... .
lowQualScore : 000 77 33333 5 1111 999 888888888 99999 5 2222 1111 9999 3333 6
consensus : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
Reference ( family-357 ) : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136332 : TAACC---CTAAACC--C-----TC-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136333 : TAACC---CTAAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AC-GGACa
gi|136334 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----GCGGG----G----C----GG----AC-GAAC
gi|136335 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CATGTAT----GC-GG----A----C----GA----AC-GAACa
gi|136336 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGACa
gi|136337 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136338 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136339 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136340 : TAACC---CTAAACT--C-----CA-GACACTC----AACTGCCCAT---T--------CGAGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAACa
gi|136341 : TAAGC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------CGTGTGC----AC-AG----A----T----GG----AC-GGACa
gi|136342 : TAACC---CTAAACC--A-----TT-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AT-GGACa
gi|136343 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC-----C-AG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136344 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------TGTGTGG----AC-GG----A----CAG--GG----AC-GGAC
gi|136345 : TAACG---CTAAACC--C-----TA-GATACTT----CACTACCCAT---T--------GGTGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136346 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AT-GGAC
gi|136347 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AGCTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGAC
gi|136348 : TAACC---CTAAAAC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-AG----A----C----AG----AG-AGACa
gi|136349 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GTCATTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----AG----AC-GGAa
gi|136350 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136351 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----ACAAGC----GGT---AC-GGACa
gi|136352 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAa
gi|136353 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GGCACTT----AACTACCCAT---T--------CTTGTGCACGTGC-AG----A----C----GG----AC-GGGC
gi|136354 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GG----AC-AGAC
gi|136355 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTTTTAAAATTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-
gi|136356 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GA----AC-AGACcaaca
gi|136357 : TAACT---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGACa
gi|136358 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAT---T--------TATGTGT----GC-AA----A----T----GG----AT-GAAC
gi|136359 : TAACC---CAAAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAG---T--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----GC----AT-GGAa
gi|136360 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACATTT----AACTACACAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-TGA
gi|136361 : TAACC---CTAAAGC--C-----TA-GACACTT----AAATACCAAT---T--------TGTGTGT----GC-TG----A----C----AG----AC-AGGC
gi|136362 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACAACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-AGa
gi|136363 : TAACC---CTAAACC--G-----TT-GACACTT----AACTAACCAT---T--------CATGTGT----GC-GG----G----C----GG----
gi|136364 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CT-GG----A----T----GG----AC-AGACttgaaca
gi|136365 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-AG----A----A----GG----AC-GGACa
gi|136366 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GG
gi|136367 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCAC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136368 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACTCTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GGGCAAA----C----GGT---AC-GGAC
gi|136369 : TAACC---CGTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----GA----
gi|136370 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------CATGTG
gi|136371 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGACttgacaaacaga
gi|136372 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CT-GG----A----T----GG----AT-GGAC
gi|136373 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCTG---T--------CGTGTGC----CC-GG----G----C----a
gi|136374 : TGACC---CTAAACC--C-----TA-GCCACAA----AACTACACAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AC-
gi|136375 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GCAC
gi|136376 : TAACC---CTAAACT--C-----TA-GATACTT----ACATATCCAT---TTG------TGTGTGT----GT-GG----A----C----AG----AC-AGAC
gi|136377 : TAACC---CTAAACC--C-----CA-GCCACTT----AATTGGCCAT---T--------GATGTGT----GC-GG----A----C----TG----ACTGGA
gi|136378 : TAACC---TTAAATC--C-----TA-GACACTT----AAATACACATTGGT--------TGTGTGT----GC-TG----G----T----GG----AC-AGAC
gi|136379 : TAACC---CAACACC--C-----GA-AACACTT----AACGACCCAT---T--------CGTATGC----AG-GG----A----C----AG----AC-AGACa
gi|136380 : TAACT---CTAAATC--T-----TA-GCCACTT----AATTAACCAT---T--------CGTATAT----GC-GA----A----C----GA----GC-GAACa
gi|136381 : TAATC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGATTGC----CC-GG---------T----AG----AC-GGa
gi|136382 : TAACCTAGCTTAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---C--------ATTGTGC----AT-GG----A----C----AG----AC-GAAC
gi|136383 : TAACC---CTCACTC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAT---T--------TGTGTGT----GT-GG----T----C----AG----AC-a
gi|136384 : TAGCC---TTAAACC--C-----TA-ACCACAT----AACTACCCAT---TTGTATGTATGTATGT----AC-GT----A----T----GG----AC-GGAC
gi|136385 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GAAACTT----AAACACCCA-------------CGTGTGT----GT-Ga
gi|136386 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGT
gi|136387 : TAACC---CTAAACC--G-----TA-GACACTT----AACTACCAAT---T--------TGTTTG
gi|136388 : AACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CATGTAC----AC-GG----A----C----GG----AC-G
gi|136389 : AACA---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAA---T--------CATGT------GT-GG----A----T----GG----
gi|136390 : AAAC---CTAAACC--CGGTTATAAGACACTT----AAATATCTAT---T--------GATGTGT----GC-GT----A----C----AG----AC-GGA
gi|136391 : ACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136392 : ACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCTGT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136393 : ACC---CTTAACC--C-----CA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTGTGT----GA-GG----T----C----TG----AC-AGAC
gi|136394 : ACC---CTTAACC--T-----TA-GACACTT----AAATACCTAT---T--------CATATGT----GT-GG----A----C----AG----AC-AAACa
gi|136395 : C---CTAAACC--C-----TC-GCCACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----GC-GG----A----T----GGTCAAAC-GGGCa
gi|136396 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------TGGACAT----GC-GG----A----C----AG----AC-AGAC
gi|136397 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------CGGACAT----TC-GG----A----T----AG----AC-AGACa
gi|136398 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------CGGACAT----TC-GG----A----T----AG----AC-AGACa
gi|136399 : AAATA--C-----TA-ACCTCTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGA----GC-GGATGTA----C----GG----AC-GGACa
gi|136400 : AAACCGTC-----CA-AACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTTTGC----AC-GG----A----C----Ga
gi|136401 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136402 : AACC--C-----TA-GACAATT----AACTTCCCAT---T--------CGTGTGT----GA-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136403 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-AGAC
gi|136404 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------CGTAGGT----GC-GG----A----C----AG----AC-
gi|136405 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGACcaaca
gi|136406 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----AC-GG----A----CACAAGG----AC-TGAC
gi|136407 : AACC--C-----AA-TACACT-----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AT-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136408 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCC-T---T--------CGTGTGT----GC-GG----a
gi|136409 : AACC--C-----TA------------AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----TT-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136410 : CC--C-----AA-CACAATT----AACAACCCAT---T--------CGTGTGT----GC-GG----A----T----AA----AC-GGACa
gi|136411 : A-GCCACTT----AACTACCCAT---G--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----AA----AC-AGAC
Alignments
lowQualScore : 111 00 11111 0 1111 000 222222222 44444 0 2222 1111 1111 2222 0
lowQualScore : ... .. ..... . .... ... ......... ..... . .... .... .... .... .
lowQualScore : 000 77 33333 5 1111 999 888888888 99999 5 2222 1111 9999 3333 6
consensus : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
Reference ( family-357 ) : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136332 : TAACC---CTAAACC--C-----TC-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136333 : TAACC---CTAAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AC-GGACa
gi|136334 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----GCGGG----G----C----GG----AC-GAAC
gi|136335 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CATGTAT----GC-GG----A----C----GA----AC-GAACa
gi|136336 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGACa
gi|136337 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136338 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136339 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136340 : TAACC---CTAAACT--C-----CA-GACACTC----AACTGCCCAT---T--------CGAGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAACa
gi|136341 : TAAGC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------CGTGTGC----AC-AG----A----T----GG----AC-GGACa
gi|136342 : TAACC---CTAAACC--A-----TT-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AT-GGACa
gi|136343 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC-----C-AG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136344 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------TGTGTGG----AC-GG----A----CAG--GG----AC-GGAC
gi|136345 : TAACG---CTAAACC--C-----TA-GATACTT----CACTACCCAT---T--------GGTGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136346 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AT-GGAC
gi|136347 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AGCTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGAC
gi|136348 : TAACC---CTAAAAC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-AG----A----C----AG----AG-AGACa
gi|136349 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GTCATTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----AG----AC-GGAa
gi|136350 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136351 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----ACAAGC----GGT---AC-GGACa
gi|136352 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAa
gi|136353 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GGCACTT----AACTACCCAT---T--------CTTGTGCACGTGC-AG----A----C----GG----AC-GGGC
gi|136354 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GG----AC-AGAC
gi|136355 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTTTTAAAATTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-
gi|136356 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GA----AC-AGACcaaca
gi|136357 : TAACT---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGACa
gi|136358 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAT---T--------TATGTGT----GC-AA----A----T----GG----AT-GAAC
gi|136359 : TAACC---CAAAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAG---T--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----GC----AT-GGAa
gi|136360 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACATTT----AACTACACAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-TGA
gi|136361 : TAACC---CTAAAGC--C-----TA-GACACTT----AAATACCAAT---T--------TGTGTGT----GC-TG----A----C----AG----AC-AGGC
gi|136362 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACAACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-AGa
gi|136363 : TAACC---CTAAACC--G-----TT-GACACTT----AACTAACCAT---T--------CATGTGT----GC-GG----G----C----GG----
gi|136364 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CT-GG----A----T----GG----AC-AGACttgaaca
gi|136365 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-AG----A----A----GG----AC-GGACa
gi|136366 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GG
gi|136367 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCAC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136368 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACTCTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GGGCAAA----C----GGT---AC-GGAC
gi|136369 : TAACC---CGTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----GA----
gi|136370 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------CATGTG
gi|136371 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGACttgacaaacaga
gi|136372 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CT-GG----A----T----GG----AT-GGAC
gi|136373 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCTG---T--------CGTGTGC----CC-GG----G----C----a
gi|136374 : TGACC---CTAAACC--C-----TA-GCCACAA----AACTACACAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AC-
gi|136375 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GCAC
gi|136376 : TAACC---CTAAACT--C-----TA-GATACTT----ACATATCCAT---TTG------TGTGTGT----GT-GG----A----C----AG----AC-AGAC
gi|136377 : TAACC---CTAAACC--C-----CA-GCCACTT----AATTGGCCAT---T--------GATGTGT----GC-GG----A----C----TG----ACTGGA
gi|136378 : TAACC---TTAAATC--C-----TA-GACACTT----AAATACACATTGGT--------TGTGTGT----GC-TG----G----T----GG----AC-AGAC
gi|136379 : TAACC---CAACACC--C-----GA-AACACTT----AACGACCCAT---T--------CGTATGC----AG-GG----A----C----AG----AC-AGACa
gi|136380 : TAACT---CTAAATC--T-----TA-GCCACTT----AATTAACCAT---T--------CGTATAT----GC-GA----A----C----GA----GC-GAACa
gi|136381 : TAATC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGATTGC----CC-GG---------T----AG----AC-GGa
gi|136382 : TAACCTAGCTTAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---C--------ATTGTGC----AT-GG----A----C----AG----AC-GAAC
gi|136383 : TAACC---CTCACTC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAT---T--------TGTGTGT----GT-GG----T----C----AG----AC-a
gi|136384 : TAGCC---TTAAACC--C-----TA-ACCACAT----AACTACCCAT---TTGTATGTATGTATGT----AC-GT----A----T----GG----AC-GGAC
gi|136385 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GAAACTT----AAACACCCA-------------CGTGTGT----GT-Ga
gi|136386 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGT
gi|136387 : TAACC---CTAAACC--G-----TA-GACACTT----AACTACCAAT---T--------TGTTTG
gi|136388 : AACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CATGTAC----AC-GG----A----C----GG----AC-G
gi|136389 : AACA---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAA---T--------CATGT------GT-GG----A----T----GG----
gi|136390 : AAAC---CTAAACC--CGGTTATAAGACACTT----AAATATCTAT---T--------GATGTGT----GC-GT----A----C----AG----AC-GGA
gi|136391 : ACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136392 : ACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCTGT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136393 : ACC---CTTAACC--C-----CA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTGTGT----GA-GG----T----C----TG----AC-AGAC
gi|136394 : ACC---CTTAACC--T-----TA-GACACTT----AAATACCTAT---T--------CATATGT----GT-GG----A----C----AG----AC-AAACa
gi|136395 : C---CTAAACC--C-----TC-GCCACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----GC-GG----A----T----GGTCAAAC-GGGCa
gi|136396 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------TGGACAT----GC-GG----A----C----AG----AC-AGAC
gi|136397 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------CGGACAT----TC-GG----A----T----AG----AC-AGACa
gi|136398 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------CGGACAT----TC-GG----A----T----AG----AC-AGACa
gi|136399 : AAATA--C-----TA-ACCTCTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGA----GC-GGATGTA----C----GG----AC-GGACa
gi|136400 : AAACCGTC-----CA-AACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTTTGC----AC-GG----A----C----Ga
gi|136401 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136402 : AACC--C-----TA-GACAATT----AACTTCCCAT---T--------CGTGTGT----GA-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136403 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-AGAC
gi|136404 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------CGTAGGT----GC-GG----A----C----AG----AC-
gi|136405 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGACcaaca
gi|136406 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----AC-GG----A----CACAAGG----AC-TGAC
gi|136407 : AACC--C-----AA-TACACT-----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AT-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136408 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCC-T---T--------CGTGTGT----GC-GG----a
gi|136409 : AACC--C-----TA------------AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----TT-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136410 : CC--C-----AA-CACAATT----AACAACCCAT---T--------CGTGTGT----GC-GG----A----T----AA----AC-GGACa
gi|136411 : A-GCCACTT----AACTACCCAT---G--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----AA----AC-AGAC
blockSeqs : TAG GGTTA TTAA TGTATGTAT ACGTG GCAA CAAG ACAA TCAA
blockSeqs : . . . TGT A ATGT . AG T
blockSeqs : . . . T G . . . T
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . C C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . G C . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . C C . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . T T . . . .
blockSeqs : . . . C T . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . .
blockSeqs : . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . C G . . . .
blockSeqs : . . C C . . . .
blockSeqs : . . C G . . . .
blockSeqs : . . C C . . . .
blockSeqs : . . C A . . . .
blockSeqs : . . T A . . . .
blockSeqs : . . C G . . . .
blockSeqs : . . T T . . .
blockSeqs : . . T G . . .
blockSeqs : . . C G .
blockSeqs : . . C .
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . T
blockSeqCons :
originalCons : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
finalCons : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
Alignments
lowQualScore : 111 00 11111 0 1111 000 222222222 44444 0 2222 1111 1111 2222 0
lowQualScore : ... .. ..... . .... ... ......... ..... . .... .... .... .... .
lowQualScore : 000 77 33333 5 1111 999 888888888 99999 5 2222 1111 9999 3333 6
consensus : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
Reference ( family-357 ) : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----GC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136332 : TAACC---CTAAACC--C-----TC-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136333 : TAACC---CTAAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AC-GGACa
gi|136334 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----GCGGG----G----C----GG----AC-GAAC
gi|136335 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CATGTAT----GC-GG----A----C----GA----AC-GAACa
gi|136336 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGACa
gi|136337 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136338 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136339 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136340 : TAACC---CTAAACT--C-----CA-GACACTC----AACTGCCCAT---T--------CGAGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAACa
gi|136341 : TAAGC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------CGTGTGC----AC-AG----A----T----GG----AC-GGACa
gi|136342 : TAACC---CTAAACC--A-----TT-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AT-GGACa
gi|136343 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC-----C-AG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136344 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------TGTGTGG----AC-GG----A----CAG--GG----AC-GGAC
gi|136345 : TAACG---CTAAACC--C-----TA-GATACTT----CACTACCCAT---T--------GGTGTGT----GC-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136346 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AT-GGAC
gi|136347 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AGCTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGAC
gi|136348 : TAACC---CTAAAAC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-AG----A----C----AG----AG-AGACa
gi|136349 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GTCATTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----AG----AC-GGAa
gi|136350 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136351 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----ACAAGC----GGT---AC-GGACa
gi|136352 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAa
gi|136353 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GGCACTT----AACTACCCAT---T--------CTTGTGCACGTGC-AG----A----C----GG----AC-GGGC
gi|136354 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GG----AC-AGAC
gi|136355 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTTTTAAAATTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-
gi|136356 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----GA----AC-AGACcaaca
gi|136357 : TAACT---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GGACa
gi|136358 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAT---T--------TATGTGT----GC-AA----A----T----GG----AT-GAAC
gi|136359 : TAACC---CAAAACC--C-----TA-GCCACTT----AACTACCCAG---T--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----GC----AT-GGAa
gi|136360 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACATTT----AACTACACAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-TGA
gi|136361 : TAACC---CTAAAGC--C-----TA-GACACTT----AAATACCAAT---T--------TGTGTGT----GC-TG----A----C----AG----AC-AGGC
gi|136362 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACAACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----AG----AC-AGa
gi|136363 : TAACC---CTAAACC--G-----TT-GACACTT----AACTAACCAT---T--------CATGTGT----GC-GG----G----C----GG----
gi|136364 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CT-GG----A----T----GG----AC-AGACttgaaca
gi|136365 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-AG----A----A----GG----AC-GGACa
gi|136366 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GG
gi|136367 : TAACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCAC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136368 : TAACA---CTAAATC--C-----TA-GACTCTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GGGCAAA----C----GGT---AC-GGAC
gi|136369 : TAACC---CGTAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----GA----
gi|136370 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------CATGTG
gi|136371 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGACttgacaaacaga
gi|136372 : TAACC---CTAAACC--A-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CT-GG----A----T----GG----AT-GGAC
gi|136373 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCTG---T--------CGTGTGC----CC-GG----G----C----a
gi|136374 : TGACC---CTAAACC--C-----TA-GCCACAA----AACTACACAT---T--------TGTGTGT----AC-GG----A----C----GG----AC-
gi|136375 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACAT----AAATACCCAT---T--------TGTCCGC----CC-GG----A----C----AG----AC-GCAC
gi|136376 : TAACC---CTAAACT--C-----TA-GATACTT----ACATATCCAT---TTG------TGTGTGT----GT-GG----A----C----AG----AC-AGAC
gi|136377 : TAACC---CTAAACC--C-----CA-GCCACTT----AATTGGCCAT---T--------GATGTGT----GC-GG----A----C----TG----ACTGGA
gi|136378 : TAACC---TTAAATC--C-----TA-GACACTT----AAATACACATTGGT--------TGTGTGT----GC-TG----G----T----GG----AC-AGAC
gi|136379 : TAACC---CAACACC--C-----GA-AACACTT----AACGACCCAT---T--------CGTATGC----AG-GG----A----C----AG----AC-AGACa
gi|136380 : TAACT---CTAAATC--T-----TA-GCCACTT----AATTAACCAT---T--------CGTATAT----GC-GA----A----C----GA----GC-GAACa
gi|136381 : TAATC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGATTGC----CC-GG---------T----AG----AC-GGa
gi|136382 : TAACCTAGCTTAACC--T-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---C--------ATTGTGC----AT-GG----A----C----AG----AC-GAAC
gi|136383 : TAACC---CTCACTC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAT---T--------TGTGTGT----GT-GG----T----C----AG----AC-a
gi|136384 : TAGCC---TTAAACC--C-----TA-ACCACAT----AACTACCCAT---TTGTATGTATGTATGT----AC-GT----A----T----GG----AC-GGAC
gi|136385 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GAAACTT----AAACACCCA-------------CGTGTGT----GT-Ga
gi|136386 : TAACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGT
gi|136387 : TAACC---CTAAACC--G-----TA-GACACTT----AACTACCAAT---T--------TGTTTG
gi|136388 : AACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CATGTAC----AC-GG----A----C----GG----AC-G
gi|136389 : AACA---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AAATACCTAA---T--------CATGT------GT-GG----A----T----GG----
gi|136390 : AAAC---CTAAACC--CGGTTATAAGACACTT----AAATATCTAT---T--------GATGTGT----GC-GT----A----C----AG----AC-GGA
gi|136391 : ACC---CTAAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136392 : ACC---CTTAACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCTGT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----AG----AC-GGAC
gi|136393 : ACC---CTTAACC--C-----CA-GACACTT----AAATACCCAT---T--------TGTGTGT----GA-GG----T----C----TG----AC-AGAC
gi|136394 : ACC---CTTAACC--T-----TA-GACACTT----AAATACCTAT---T--------CATATGT----GT-GG----A----C----AG----AC-AAACa
gi|136395 : C---CTAAACC--C-----TC-GCCACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGT----GC-GG----A----T----GGTCAAAC-GGGCa
gi|136396 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------TGGACAT----GC-GG----A----C----AG----AC-AGAC
gi|136397 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------CGGACAT----TC-GG----A----T----AG----AC-AGACa
gi|136398 : C---CTAAACC--A-----TA-GGCATTT----AAATACCCAT---T--------CGGACAT----TC-GG----A----T----AG----AC-AGACa
gi|136399 : AAATA--C-----TA-ACCTCTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGA----GC-GGATGTA----C----GG----AC-GGACa
gi|136400 : AAACCGTC-----CA-AACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTTTGC----AC-GG----A----C----Ga
gi|136401 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AC-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136402 : AACC--C-----TA-GACAATT----AACTTCCCAT---T--------CGTGTGT----GA-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136403 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-AGAC
gi|136404 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACTCAT---T--------CGTAGGT----GC-GG----A----C----AG----AC-
gi|136405 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTTTGC----CC-GG----A----A----GG----AC-GGACcaaca
gi|136406 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCCAT---T--------TGTGTGC----AC-GG----A----CACAAGG----AC-TGAC
gi|136407 : AACC--C-----AA-TACACT-----AACTACCCAT---T--------CGTGTGC----AT-GG----A----C----GG----AC-GGAC
gi|136408 : AACC--C-----TA-GACACTT----AACTACCC-T---T--------CGTGTGT----GC-GG----a
gi|136409 : AACC--C-----TA------------AACTACCCAT---T--------CGTGTGT----TT-GG----A----C----GG----AC-GAAC
gi|136410 : CC--C-----AA-CACAATT----AACAACCCAT---T--------CGTGTGT----GC-GG----A----T----AA----AC-GGACa
gi|136411 : A-GCCACTT----AACTACCCAT---G--------TGTGTGT----GC-AG----A----C----AA----AC-AGAC