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Reference ( gi|93445 ) : TCTGATACTTTGGTG--C-----AG--CTCGGAGTTTCG-AGTT-T-G--G----TGTGCTGCAGG-ACTAGTT-TTATT-T---ATT---TA----AAACAGAGTCCTGGG-CAT----TTG-T-T-T-G-G----T-GTGCTGC--AGG-AC-T--A--GTT-T-TATT-T---A-T--T---TA----AA---A---CAGAGTCCT------GGGC---------A-------------------T----TT---G-----------------TT-T-G-G-G---CA--------TTT---GT-TGG------GA-----G---TGCTG--CAGAA---C----TA--GTTTT---------------------A-TTT---A--T-TAAA-A-ACAGAGTTCTGGGCA
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gi|93438 : TCTGATACTTTGGTG--C-----AG--CTCGGAGTTTCG-AGTT-T-G--G----TGTGCTGCAGG-ACTAGTT-TTATT-T---ATT---TA----AAACAGAGTCCTGGG-CAT----TTG-T-T-T-agtgtt
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gi|93453 : acagacctggacatttgtttcat----TGTTTTGCATA-ACTTGTT-TTATT-T---AAT---TA----AAACACAGTCCTGGG-CAT----TTG-T-T-TCA-G----T-GTGCAAC--AGG-AC-T--T--GTT-T-TATT-T---A-G--T---TA----AA---A---CACAGACCT------GGGT---------A-------------------T----TT---G-----------------TT-T---------CA--------------GT-----------------G---TGCTG--CAGAA---CTTGTTATTGTTAT---------------------A-TTT---AGTT-TATA-C-ACAGA--CCTGGGCAtttgttt
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|93441 ): GTCAGTCTGGCGTGACAACTCGAGGGAGACGGAGCTGTAAGAAGATTTTGATTAATAATTAATTATTATTTTGCAAGACAGTACTGGGACATTGGACCGAGTGTCACAAGTGAATGAGAGAATGAGGGATTTTCAGAAGTGCAGTTTTAAGCTCAAAG
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Reference ( family-355 ) : TCTGAGANTTTGGNGC-----AGCTCGGNGTNTCGAGTTACGGAGTGCTGCAGGA--CTAGTT-----T-TATTT------ANTTAAAACACAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-T-G-G----T-GTGCTG---C--AGG-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TTAGT-T----AAAACAN-AGTCCTGGGCAT-TT---G-TT-T--G---CAT--TTGT---GAG----TGCTGCA----GGA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TAT----TTA----AAACANAGTCCTGGGCA
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gi|93442 : tagttactaaattgtcatgcagactctcattgaatttgattaaggatgttaatgcaatggaatcgcataatctcgaacatcattatgtggtcgtacagcagtaagaaggtccgattgaagtcatgtgactaggccatgtgacttatgctatataagcagcagaccgttagtattctgggtcagtctggtgttacaactcgacggagaaggagctgaaagaagaccctgcataattagttaattattattagttggtaatacaggctgggactttggaccgaggtcacaagtgaacaagggattctcagaagtgcagttttgaactcaagagttgcataaccctctgaaacttgtgaacagtgctccgggtcgtagtctgttgggtgccattgtttgtctcagacaggtgttgggacaggtttggaacattgctgcaggactagttttatttagttaaaacagagtcctgggcaagtgtttgagacgtaagTGCTGCAGGA--CTAGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGAG-CA----A----GTG--------T-T-T-G-A--------GACG---T--AAG-TC----T---G--A-----T---AC--T------TTGGT---------GCAG-----CTCGGAGT--------TT-C--G---AGT--TTG----GAG----CGCCGCA----AGA----CTTGTT-T-TA-----------------TT-TAT----TTA----AAACAGAGTCCTGGGCA
gi|93442 : aaaaaagccttgtatagaaatctataattctattaatcaattattattattatttggtaatacaggctgggactttgaaccgaggtcacaagtgaacgagggattctcagaagtgcagttttgaactcacagttgcagaaccctctgaaacttgtgaacagtgctccgggtcgtagtctgttgtgtgccattgtctcagacaggtgctgggacaggtttgaaacatTCTGATACTTTGGTGC-----AGCTCGGAGTTTCGAGTT-TGGAGCGCCGCAAGA--CTTGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-T-tttgttt
gi|93443 : aaaaaagccttgtatagaaatctataattctattaatcaattattattattatttggtaatacaggctgggactttgaaccgaggtcacaagtgaacgagggattctcagaagtgcagttttgaactcacagttgcagaaccctctgaaacttgtgaacagtgctccgggtcgtagtctgttgtgtgccattgtctcagacaggtgctgggacaggtttgaaacattgctgcaggactagttttatttatttaaaacagagtcctgagcaagtgtttgagacgtaagTGCTGCAGGA--CAAGTT-----T-AATTT------ATTTAAAACACAGTCCTGGG-CAAGGGT----TTGAGTATAAGT-T-T-G-AGACTT-GAG-TG---C--AG---C----TCGGG--GTTT--C---GAG-T------TTATT-T----A---------TTCTGGGCAT-TT---G-TT--------CA----------GAG----TGGTGCA----GAA----CTAGTT-T-TA-----------------CT-TA------TA----AAACACAATTCTGGGCA
gi|93444 : gcataacagatctaataccttgattaatttttatgttggcaacacagtacgggaattttggacgaattgtcataagtgaatgagaggttctcagaagtgcagttgttacccagagttgcagaaccctctgaaacttgtgaacagtgcgcagggtcgttgtctgttgggtaccattgtttgtcccagacaggtgttggaacaggtttgaaacatTGCTGCAGGA--CTAGTT-----A-TATTA------AGGTAAAACACAGTTCCGGG-AA--------------------------A-G----G-GT--TG-------AG-AC----TCA-A--TTTT--T---AGACT------TTAGT---------GCAA----CTCGAG---------G-TT-T--C---GAG--TTGA---GAG----TGCTGCA----GGA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TA------TA----AAACACAGTTCCGGGttgttgttt
gi|93444 : gtcgcagagcacgctgaaacttgtggacagtgcctcgggttgcattctgttgtgtgccattagttgtttcaataggtgttgaagcaagttcgtaacatAGACTTTAGTGC-----AACTCGAGGTTTCGAGTTG-AGAGTGCTGCAGGA--CTAGTT-----T-TATTT------A--TAAAACACAGTTCCGGG-
gi|93445 : gtcgcagagcacgctgaaacttgtggacagtgcctcgggttgcattctgttgtgtgccattagttgtttcaataggtgttgaagcaagttcgtaacattgctgcaggactagttatattaaggtaaaacacagttccgggaaagggttgagactcaatttttTCTGATACTTTGGTGC-----AGCTCGGAGTTTCGAGTT-TGGTGTGCTGCAGGA--CTAGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-T-G-G----T-GTGCTG---C--AGG-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TTATT-T----AAAACAG-AGTCCTGGGCAT-TT---G-TT-TGGG---CAT--TTGTTGGGAG----TGCTGCA----GAA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TAT----TAA----AAACAGAGTTCTGGGCA
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gi|93447 : -----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCTTGGG-CA----T----TCG--------T-T-T-G-G----A-GTGCTG---C--AGA-AC----T---A--GTTT--T---A---A------TTATT-T----AAAACAA-AGTTCTGGGCATAGT---G-TTGT--G---Cagtgtt
gi|93448 : -----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-T-G-G----A-GTGCTG---C--AGA-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TTATT-T----AAAACAG-AGTTCTGGGCATAGT---G-TTGT--G---Cgaaacgtttgtttgaaacgttagttcgaaacctttataatttggt
gi|93449 : TTTGGTGC-----AGATACGAGTTTCGAGTT-TGGAATGCTGCAGAA--CTAGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-T-G-G----T-GTGCTG---C--AGG-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TTATT-T----AAAACAG-AGTCCTGGGCAT-TT---G-TT-TGGG---CAT--TTGTTGGGAG----TGCCGCA----GAA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TAT----TTA----AAACAGAGTTCTGGGCAgaaacgtttgtttgaaacgttagttcgaaacctttataatttggt
gi|93450 : CAANN--NNNNNN-----N-NATTT------A--TAAAACACAGTTCCGGG-AA--------------------------A-G----G-GT--TG-------AG-AC----TCA-A--GTTT--G---AGATT------TTAGTGT----AGCTCGA-AGTTTCGAG--------------------------TTGA---GAG----TGCTGCA----GGA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TA------TA----AAACACAGTTCTGGGTAtagtgttgttt
gi|93450 : gggaaagggttgagattTTTGAGATTTTAGTGT-----AGCTCGAAGTTTCGAGTTG-AGAGTGCTGCAGGA--CTAGTT-----T-TATTT------A--TAAAACACAGTTCTGGG-TA----TGG--TTG--------T-T-T-tggttgttt
gi|93451 : gggaaagggttgagattcaannnnnnnnnnatttataaaacacagttccgggaaagggttgagactcaagAC-AGACCTGGACAT-TT---G-TT-T------CAT--T--------G----TGCTGCA----GGA----CTAGTT-A-TA-----------------TT-TAG----ATA----AA--ATAGTCCTGGGCA
gi|93451 : GTGCTGCAGGA--CTAGTT-----A-TATTT------AGATAAAATA--GTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-TCA-G----T-GTGCTG---C--AGG-CC----T---A--GTGG--T---A---T------TTAGT-T----AAAACAC-AGAGCTGGGCAT-TT---G-TT-T------CA-----GT-----G----TGCTGCA----GAA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TAA----TTA----AAACACAGACCTGGGTAtttgtttcagtgtgctgcaggcctagtggtatttagttaaaacacagagctgggcatttgtttcagtgtgctgcagaactagttttatttaattaaaacacagacctgggtatttgttt
gi|93452 : acagacctggacatttgtttcattGGAGCGCCGCAAGA--CTTGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-T-G-G----A-GTGCTG---C--AGA-AC----T---A--GTTT--T---A---T----------T-T----AAAACAC-AGTACTGGGCAT-tttgttt
gi|93453 : gtttTGCATAA--CTTGTT-----T-TATTT------AATTAAAACACAGTCCTGGG-CA----T----TTG--------T-T-TCA-G----T-GTGCAA---C--AGG-AC----T---T--GTTT--T---A---T------TTAGT-T----AAAACAC-AGACCTGGGTAT-TT---G-TT-T------CA-----GT-----G----TGCTGCA----GAA----CTTGTTAT-TG-----------------TTATAT----TTAGTTTATACACAGACCTGGGCA
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gi|93457 : TGCTGCAGGA--CTAGTT-----T-TATTT------AGTTAAAACAAAGCCCTGAG-CA----A----GTG--------T-T-T----------------------AAG-ACG---T---AA-GTCTGAT---AC--T------TTGGT-G----CAGATACGAGT-----------------TT-C--G---AGT--TTG----GAA----TGCTGCA----GAA----CTAGTT-T-TA-----------------TT-TAT----TTA----AAACAGAGTCCTGGGCAt
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gi|93458 : TGCCGCAGAA--CTAGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTTCTGGG-CA----TAGTGTTG--------T-T-T-G-tagtgttgtttgtttgaaacgttagttcgaaacctt
gi|93459 : TGCTGCTGGA--CTAGTT-----T-TATTT------AGTTAAAACACAGACCTGAG-CA----C----GTG--------T-T-CCA-G----T-GTGCTG---C--AGA-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TTAGT-T----AAAACAC-ATACCTGGATAT-TT---G-TG-T------CA-----GT-----G----TGCTGCA----GGA----CAAGTT-T-TA-----------------TT-TAG----TTA----AAACACAATCCTGGGTAtttgaaacgttagttcgaaacctt
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|93441 ): GTCAGTCTGGCGTGACAACTCGAGGGAGACGGAGCTGTAAGAAGATTTTGATTAATAATTAATTATTATTTTGCAAGACAGTACTGGGACATTGGACCGAGTGTCACAAGTGAATGAGAGAATGAGGGATTTTCAGAAGTGCAGTTTTAAGCTCAAAG
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Reference ( family-355 ) : TTTGAGAATTTGGAGC-----AGCTCAGNGTGTCGACTTACAGAGTGCTGCAGGACTAGTT-----T-TATTT------AGTTAAAACACAGTCCTGGGCA----T----TTG--------T-T-T-G------GT-GTGCTGC--AGG-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TT--AGTT----AAAACAC-AGNCC--TGGGCAT-TT---G--TTT---C-A---GT---GAGTGCTGCAGGAC----TA--GTTT-TATTTAGTTAAAACACAGTCCTGGGCA
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gi|93442 : tagttactaaattgtcatgcagactctcattgaatttgattaaggatgttaatgcaatggaatcgcataatctcgaacatcattatgtggtcgtacagcagtaagaaggtccgattgaagtcatgtgactaggccatgtgacttatgctatataagcagcagaccgttagtattctgggtcagtctggtgttacaactcgacggagaaggagctgaaagaagaccctgcataattagttaattattattagttggtaatacaggctgggactttggaccgaggtcacaagtgaacaagggattctcagaagtgcagttttgaactcaagagttgcataaccctctgaaacttgtgaacagtgctccgggtcgtagtctgttgggtgccattgtttgtctcagacaggtgttgggacaggtttggaacatTGCTGCAGGACTAGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGAGCA----A----GTG--------T-T-T-G------A----GACGT--AAG-TC----T---G--A-----T---AC--T------TT--GGT----------GC-AGCTC---GGA---------G--TTT---CGA---GTTTGGAGCGCCGCAAGAC----TT--GTTT-TATTTATTTAAAACAGAGTCCTGGGCAtgtg
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gi|93444 : gcataacagatctaataccttgattaatttttatgttggcaacacagtacgggaattttggacgaattgtcataagtgaatgagaggttctcagaagtgcagttgttacccagagttgcagaaccctctgaaacttgtgaacagtgcgcagggtcgttgtctgttgggtaccattgtttgtcccagacaggtgttggaacaggtttgaaacatTGCTGCAGGACTAGTT-----A-TATTA------AGGTAAAACACAGTTCCGGGAA--------------------------A------GG-GT--TG----AG-AC----TCA-A--TTTT--T---AGACT------TT--AGT----------GC-AACTC---GAG---------G--TTT---CGA---GTTGAGAGTGCTGCAGGAC----TA--GTTT-TATTTA--TAAAACACAGTTCCGGGttgttgttt
gi|93445 : gtcgcagagcacgctgaaacttgtggacagtgcctcgggttgcattctgttgtgtgccattagttgtttcaataggtgttgaagcaagttcgtaacatTCTGATACTTTGGTGC-----AGCTCGGAGTTTCGAGTT-TGGTGTGCTGCAGGACTAGTT-----T-TATTT------ATTTAAAACAGAGTCCTGGGCA----T----TTG--------T-T-T-G------GT-GTGCTGC--AGG-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TT--ATTT----AAAACAG-AGTCC--TGGGCAT-TT---G--TTTGGGC-ATTTGTTGGGAGTGCTGCAGAAC----TA--GTTT-TATTTATTAAAAACAGAGTTCTGGGCA
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gi|93507 : gtccgatactaaag--------T-T-C-A------GT-GTGCTGC--AGG-AC----T---A--GTTT--T---A---T------TT--AGTT----AAAACAC-AGACC--TGGGCAT-TT---G--TTT---
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gi|93509 : gtttggaacat--------T-T-C-A------GT-GTGCTGC--AGT-AC----T---T--GTTT--T---A---T------TT--AGTT----AAAACAC-AGACC--TGGGTAT-TT---G--TTT---
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Unaligned ( gi|93441 ): GTCAGTCTGGCGTGACAACTCGAGGGAGACGGAGCTGTAAGAAGATTTTGATTAATAATTAATTATTATTTTGCAAGACAGTACTGGGACATTGGACCGAGTGTCACAAGTGAATGAGAGAATGAGGGATTTTCAGAAGTGCAGTTTTAAGCTCAAAG