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Reference ( gi|41949 )        :          ATATTTT-ATTTC--TG--TT----T-AT--A---TA---------T--------A-C-----A-G-AAACGGGGTTGGG-CCACAA-GT---TTTTC-CAAC----AT-TAG-ATT-CGG---------CCCTCCCC----------------C--------TAC-A---------GTTT-------AACAAATAA------C-----A-----AG--TA-----C------GGCAAC-----------------TGT-AAACAA--AT---AA--AAATA-AATA-TGAAGGAGA-----AAAAGACAGAATTGT--AA---GAGAGTGAGAGCAGATAGAA
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Unaligned ( gi|42025 ): ACAAATTAGCGTGGCAGTTGTCGAACAAATGAATTCGAAAGAAAAAAATGAAAAAAATGTAAGACTCTAAGAGCTGTAAAAG






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gi|41962                      :                      ATATTTT-ATTTC--TA--TA----TA-T--ATAATACATGTAT--------AT-----A-G-AAACAGGGTTGGG-TCACAC-GTTCTTCCAAC----ATTAG-ATT-CCG---------CCCTCCCA----------------C--------TACA---------GTTT-------AAC------------AAATAA------C-----A-----
gi|41963                      :                      ATATTTT-ATTTC--TA--T-----------ACA---------T--------ACTTT--A-G-AAATTAGGTTGGG-CCACAA-GGTATTCCAAC----ATTCA-TTT-CGG---------ACCTCTCC----------------tat
gi|41964                      :                      ATATTTT-ATTTCA-TA--AT----TT-T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41965                      :                      ATATTTT-ATTTCA-TAA-TT----TT-T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------G-AT-------AAC------------A
gi|41966                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-T--ATA---------T---------C-----ATG-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-TGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------GTTT-------AAT------------AAta
gi|41967                      :                      ACATTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAATTGGGTAGGG-CCACAA-GGTTTTCCAAC----ATTAA-ATT-CGA---------CCCTCTCcacatatt
gi|41968                      :                      ATATTTC-ATTTT--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAATTGGGTTGGG-CCACAA-ATTCTTCCAAC-------AA-ATT-CGG---------CCCTC
gi|41969                      :                      ATAGTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------GC-----A-G-AAAAAGAGTGTGG-CCACAA-GCTCTCCCAGT----ATTAG-ATT-TAG---------A--------------------------------TA-A---------GTTA-------AAC------------AAAAAAACAAAAC-----ATATACAG--TG-----T------GGCA-GT-----------------TGT-AAACAA-------ATTAAATGAAAT----A-AATA-TGA-AAGAGAAAAA-CACA-TAATAGT--A-----AGAATATGATCTTAGAGAA
gi|41970                      :                      ATAGTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------GC-----A-G-AAAAAGAGTGTGG-CCACAA-GCTCTCCCAGT----ATTAG-ATT-TAG---------A--------------------------------TA-A---------GTTA-------AAC------------AAAAAAACAAAAC-----ATATACAG--TG-----T------GGCA-GT-----------------TGT-AAACAA-------ATTAAATGAAAT----A-AATA-TGA-AAGAGAAAAA-CACA-TAATAGT--A-----AGAATATGATCTTAGAGAAaa
gi|41971                      :                      ATATTTT-ATTTCA-TA--AT----TT-T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTGGG-CCATAA-GTTTTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGA---------CCCTTCCC----------------T--------TACA---------aa
gi|41972                      :                      ACATTTC-ATTTC---A--T------A-A--ATT---------T--------AC-----ATG-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-ATTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTTCCC----------------T--------TACA---------
gi|41973                      :                      ATATTTT-ATTGC---A--TT----GA-T--AAT---------T--------GC-----A-G-CAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTCTCATC----ATTAG-TTA-CGG---------CCTTTCCC----------------C--------TAAA---------ATAT-------AAC------------AAATAA------
gi|41974                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTTG-GTT-CGG---------CCCGTCCC----------------C--------T
gi|41975                      :                      ATATTTT-ATTTC--AA--------------ATA---------T--------TT-----T-G-AAATGGAGTTTGG-CCACAA-GTTATTCTTAC-----TTTG-ATT-CGA---------CCCTCCCC----------------T--------CACA---------A-GT-------AAC------------AAAT
gi|41976                      :                      ATACTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAATTGGGTTGGG-CAACAA-GGTCTTCCAACCGTGATTAA-ATT-CGG---------CCGTCttatagtgtatgtaacagaacaaatt
gi|41977                      :                      ATATTTTTGTTTCA-TAA-TT----TT-T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TAtttttcgaacaa
gi|41978                      :                      ATATTTT-ATTTCA-TAA-TT----TT-T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTTGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTGCCC----------------C--------CACA---------
gi|41979                      :                      ATATTTT-ATTTCA-TAATTT----TA-C--ATG---------T--------A------------ATTGGGTTGGG-CCACAA-GTACTGCCAAC----ATTAG-ATT-CAG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41980                      :                      ATATTCT-ATATC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----G-G-AAATTGGGTTGGG-TCACAA-AT-CTTCCAAC----ATTAA-TTT-CGG---------CCTTC
gi|41981                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41982                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41983                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41984                      :                      ATAGTTA-AATTT--TA--TT----TAAT--ATA---------T---------C-----ATG-AAATGGGGTCGGG-CCACAA-GTTTTGCCAAC----ATTAG-ATC-CGG---------CCCTTCCC----------------
gi|41985                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-CTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCC----------------T--------TACA---------
gi|41986                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------TTTT-------TACAATGTTTACATTAAATAT------C-----A-----AA---A-----T------GACATGT-----------------TTT--AACAATTTTTTCTT--AAC-CAAT----A-ACT--TGAGAATAGAAAAA-GTTAGGAAAGGA--AA---GAAAGTAAGAa
gi|41987                      :                      ATATTTT-ATTTCAATAA-TT----TA-T--------------------------------G-AAATGGGATCGGT-CCACAC-GTTCTGACAAC----ATTAG-ATC-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41988                      :                                                                                  -G-AAATGGGATTAGG-CTACAA-GTTCTTCAAAC-----TTAG-ATT-CGG---------CCCTCCCC----------------C--------TACA---------
gi|41989                      : atattttataccaagtactttATATTTT-ATTTC--AA--CG----T-----------------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCT----------------C--------TACA---------a
gi|41990                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGA-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-ATT-CGA---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41991                      :                      ATATTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--ATA---------T--------AT-----A-G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTT
gi|41992                      :                      ATATTTT-ATTTCATCA--TT----T--T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTGGG-TCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-AGG---------CCATTTCC----------------C--------TAa
gi|41993                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-T--ATA---------T---------C-----GTG-AAATGGGGTCGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATCAG-ATT-AGG---------CCCTTCGC----------------C--------TACA---------
gi|41994                      :                      ATATTTT-ATTAC--TT--TT----TA-T--ATA---------C--------ATGTAGTA-G-CAAAAGGGTTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CTCTTCCC----------------
gi|41995                      :                      ATATTTT-ATTTC--AA--AT----TA-T--TT----------------------------G-AAATGGGGTGGGG-CCACAC-GTTCTTAGAAC-----TTAG-ATT-CGG---------CCGTCCCC----------------C--------TACA---------A-GT-------AAC------------AAATaacaacaa
gi|41996                      :                      ATATTTT-ATGTCATCA--TT----T--T--ACT---------T-----------------G-AAATAGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATAAG-ACT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------ttatagtgtgtaacaaaacaaat
gi|41997                      :                      ATATTTT-ATCTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAATTGTTTTGG--CCACAA-GGTCTTCCAAT----ATAAA-ATT-CGG---------CCCTTTCC----------------
gi|41998                      :                      ATATTTT-ATTGC---A--TA----TA-T--AAT---------T--------GT-----A-A-CAATGGGGTTGGG-CCACAC-GTTCTCACAAC----ATTAG-TAA-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TTAA---------ATAT-------TAC------------AAATAA------gtgggacagatgagtgt
gi|41999                      :                      ACATTTT-ATTTC-------------A----ACA---------T--------A----------AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCACC----ATTAA-GTT-CGG---------TCGTCCTC----------------T--------T
gi|42000                      :              atattctaaTATTTT-ATTTC---A---------A-T--AGA---------T---------C-----ATG-AAATGGGAACGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------caa
gi|42001                      :                       TATTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAA-ATGGTTGGG-CCACAA-AATCTTC---C----ATTAA-ATT-CGG---------CTCTCTCC----------------G--------TGC----------GT-----------C------------AAAT--------------G-----AG--T-------------GTTA-AA-----------------TAT-GAACAAT------AT--AC--AAATGCAGA-AA-A-TGG-AG
gi|42002                      :                      ATGTTTT-ATTTC--AA--------------ATA---------T--------TT-----T-G-AAACGGGGTTGAG-CCACAA-GTTATTCCAAC-----TTAG-ATT-CGG----------CCTCCCCACTTCAAGTAACAAATT--------TACA---------GTGTATAACAGAAC------------AAATTA------C-----A-----TGTTTA-----T-------GCA-AA-----------------TAT-AAACAACT-----AT--AA--ACAT----ACAAGAGTGA-AAGA-AAAAA-AATA-G-GTGGTGAAA---GAGAGAGAGAG-AGAGAGAataa
gi|42003                      :               attttaaacATCTT-GTTTC--TA--TT-----A-T--AAA---------C--------AC-----A-A-CAATGGGGTTGGG-CAACAA-GTTCTTTCAAC----ATTTG-ATT-CAGTTCCATTCCCCCTCCCC----------------C--------Tgaga
gi|42004                      :                         TTTT-ATTGC---A--TT----TA-T--AAT---------T--------GC-----A-G-CAATGGGGTTGGG-TCACAA-TTTCTCACAAC----ATTAG-TAA-CGG---------CACTCCCC----------------C--------TA
gi|42005                      :                               tTTT--TA--TT----TA----ACA---------T-----------------G-AAATGGAGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CAG---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|42006                      :                       aATTTT-ATTACG-TAA-TT----CA-T--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCACAA-GTTCTAGCAAC----ATT-T-ATTACAG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----
gi|42007                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-TT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CTACAA-GTTCTAGCAAC----ATTAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42008                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-TT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCATAA-GTTCTAGCAAC----ATAAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42009                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-CT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCACAA-GCTCTAGCAAC----ATTAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42010                      :                                                                                          GGGTTGGA-TCACAA-GTTCTAGCAAC----GTTAG-TTG-CGG---------CACTCCCC----------------T--------T-CA---------ATAT--------AC------------AAAGAA------C-----ATT---AG--AA-----CCAAGATGGCA-ATTATACCGTTCAACAGGATGT-AAACAA-------AC--AATCAAAT----A-AAT----A-AAGAGATAAG-TAAA-AAAAAGT--AA------AGTAGGAGGTAAGAAAAt
gi|42011                      :                     attgtattgcataattcacatagcaaac-T--ATA------------------AC-----A-ATAAAAGGGTTTGAA-CCACAA-GTTATGTCAAC----ATTAT-AAT-CGT---------TCCTTTCC----------------aga
gi|42013                      :                                                                                        tcGGGTTGGG-CCACAA-GTTATT-CAAC----ATTAA-AAT-TGG---------CCCTTCCaacaaaattgaacgatattatgtatcgta
gi|42014                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCCC----------------taacaacaaag
gi|42015                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTGGG-CCACAA-GTTA-TCCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCaacaacaaa
gi|42016                      :                                                                                  tagcaaaaGAGTTGGG-CCACAA-GGTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CAG---------CCCTTCCC----------------acaacaa
gi|42017                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTTGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCCaacaacatatt
gi|42018                      :                                                                                  tagcaaaaGGATTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------TCCTTCCC----------------aaacaacatatt
gi|42019                      :                                                                    tagcaaaa-----A-G-CAACAGGGTTGGG-CCACAA-GTTATACCAAC----ATTAT-ATT-CAG---------CCCTCCCTAA--------------C---------AAA---------ATTT----------------------AAATAA------C-----A-----aacacaaaaatattaa
gi|42020                      :                                                                                  -G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAG----ATTAG-GTT-CGG---------TCCGTCCC----------------C--------TACA---------tatt
gi|42021                      :                                                                                  -G-AAATGGGGTTGGC-GCACAA-GTTCTTTCAAC----ATAAGTAT---GG---------CCTGTCCT----------------C--------TACA---------
gi|42022                      :                                                                                      AACGAGGTTGGG-CCACAA-GTTA-TCCAAC----ATTAA-AAT-CAG---------CCCTTCCC----------------
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gi|41987                      :                      ATATTTT-ATTTCAATAA-TT----TA-T--------------------------------G-AAATGGGATCGGT-CCACAC-GTTCTGACAAC----ATTAG-ATC-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41988                      :                                                                                  -G-AAATGGGATTAGG-CTACAA-GTTCTTCAAAC-----TTAG-ATT-CGG---------CCCTCCCC----------------C--------TACA---------
gi|41989                      : atattttataccaagtactttATATTTT-ATTTC--AA--CG----T-----------------------------------G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CGG---------CCCGTCCT----------------C--------TACA---------a
gi|41990                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-C--AT----------------------------G-AAATGGGGTTGGA-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-ATT-CGA---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|41991                      :                      ATATTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--ATA---------T--------AT-----A-G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTT
gi|41992                      :                      ATATTTT-ATTTCATCA--TT----T--T--ACA---------T-----------------G-AAATGGGGTTGGG-TCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-AGG---------CCATTTCC----------------C--------TAa
gi|41993                      :                      ATATTTT-ATTTC---A---------A-T--ATA---------T---------C-----GTG-AAATGGGGTCGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATCAG-ATT-AGG---------CCCTTCGC----------------C--------TACA---------
gi|41994                      :                      ATATTTT-ATTAC--TT--TT----TA-T--ATA---------C--------ATGTAGTA-G-CAAAAGGGTTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CTCTTCCC----------------
gi|41995                      :                      ATATTTT-ATTTC--AA--AT----TA-T--TT----------------------------G-AAATGGGGTGGGG-CCACAC-GTTCTTAGAAC-----TTAG-ATT-CGG---------CCGTCCCC----------------C--------TACA---------A-GT-------AAC------------AAATaacaacaa
gi|41996                      :                      ATATTTT-ATGTCATCA--TT----T--T--ACT---------T-----------------G-AAATAGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATAAG-ACT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------ttatagtgtgtaacaaaacaaat
gi|41997                      :                      ATATTTT-ATCTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAATTGTTTTGG--CCACAA-GGTCTTCCAAT----ATAAA-ATT-CGG---------CCCTTTCC----------------
gi|41998                      :                      ATATTTT-ATTGC---A--TA----TA-T--AAT---------T--------GT-----A-A-CAATGGGGTTGGG-CCACAC-GTTCTCACAAC----ATTAG-TAA-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TTAA---------ATAT-------TAC------------AAATAA------gtgggacagatgagtgt
gi|41999                      :                      ACATTTT-ATTTC-------------A----ACA---------T--------A----------AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCACC----ATTAA-GTT-CGG---------TCGTCCTC----------------T--------T
gi|42000                      :              atattctaaTATTTT-ATTTC---A---------A-T--AGA---------T---------C-----ATG-AAATGGGAACGGG-CCACAA-GTTCTGCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTTCCC----------------C--------TACA---------caa
gi|42001                      :                       TATTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAA-ATGGTTGGG-CCACAA-AATCTTC---C----ATTAA-ATT-CGG---------CTCTCTCC----------------G--------TGC----------GT-----------C------------AAAT--------------G-----AG--T-------------GTTA-AA-----------------TAT-GAACAAT------AT--AC--AAATGCAGA-AA-A-TGG-AG
gi|42002                      :                      ATGTTTT-ATTTC--AA--------------ATA---------T--------TT-----T-G-AAACGGGGTTGAG-CCACAA-GTTATTCCAAC-----TTAG-ATT-CGG----------CCTCCCCACTTCAAGTAACAAATT--------TACA---------GTGTATAACAGAAC------------AAATTA------C-----A-----TGTTTA-----T-------GCA-AA-----------------TAT-AAACAACT-----AT--AA--ACAT----ACAAGAGTGA-AAGA-AAAAA-AATA-G-GTGGTGAAA---GAGAGAGAGAG-AGAGAGAataa
gi|42003                      :               attttaaacATCTT-GTTTC--TA--TT-----A-T--AAA---------C--------AC-----A-A-CAATGGGGTTGGG-CAACAA-GTTCTTTCAAC----ATTTG-ATT-CAGTTCCATTCCCCCTCCCC----------------C--------Tgaga
gi|42004                      :                         TTTT-ATTGC---A--TT----TA-T--AAT---------T--------GC-----A-G-CAATGGGGTTGGG-TCACAA-TTTCTCACAAC----ATTAG-TAA-CGG---------CACTCCCC----------------C--------TA
gi|42005                      :                               tTTT--TA--TT----TA----ACA---------T-----------------G-AAATGGAGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CAG---------CCCGTCCC----------------C--------TACA---------
gi|42006                      :                       aATTTT-ATTACG-TAA-TT----CA-T--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCACAA-GTTCTAGCAAC----ATT-T-ATTACAG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----
gi|42007                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-TT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CTACAA-GTTCTAGCAAC----ATTAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42008                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-TT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCATAA-GTTCTAGCAAC----ATAAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42009                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-CT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCACAA-GCTCTAGCAAC----ATTAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTCA---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42010                      :                                                                                          GGGTTGGA-TCACAA-GTTCTAGCAAC----GTTAG-TTG-CGG---------CACTCCCC----------------T--------T-CA---------ATAT--------AC------------AAAGAA------C-----ATT---AG--AA-----CCAAGATGGCA-ATTATACCGTTCAACAGGATGT-AAACAA-------AC--AATCAAAT----A-AAT----A-AAGAGATAAG-TAAA-AAAAAGT--AA------AGTAGGAGGTAAGAAAAt
gi|42011                      :                     attgtattgcataattcacatagcaaac-T--ATA------------------AC-----A-ATAAAAGGGTTTGAA-CCACAA-GTTATGTCAAC----ATTAT-AAT-CGT---------TCCTTTCC----------------aga
gi|42013                      :                                                                                        tcGGGTTGGG-CCACAA-GTTATT-CAAC----ATTAA-AAT-TGG---------CCCTTCCaacaaaattgaacgatattatgtatcgta
gi|42014                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCCC----------------taacaacaaag
gi|42015                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTGGG-CCACAA-GTTA-TCCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCaacaacaaa
gi|42016                      :                                                                                  tagcaaaaGAGTTGGG-CCACAA-GGTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CAG---------CCCTTCCC----------------acaacaa
gi|42017                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTTGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCCaacaacatatt
gi|42018                      :                                                                                  tagcaaaaGGATTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------TCCTTCCC----------------aaacaacatatt
gi|42019                      :                                                                    tagcaaaa-----A-G-CAACAGGGTTGGG-CCACAA-GTTATACCAAC----ATTAT-ATT-CAG---------CCCTCCCTAA--------------C---------AAA---------ATTT----------------------AAATAA------C-----A-----aacacaaaaatattaa
gi|42020                      :                                                                                  -G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAG----ATTAG-GTT-CGG---------TCCGTCCC----------------C--------TACA---------tatt
gi|42021                      :                                                                                  -G-AAATGGGGTTGGC-GCACAA-GTTCTTTCAAC----ATAAGTAT---GG---------CCTGTCCT----------------C--------TACA---------
gi|42022                      :                                                                                      AACGAGGTTGGG-CCACAA-GTTA-TCCAAC----ATTAA-AAT-CAG---------CCCTTCCC----------------
gi|42023                      :                                                                                         GGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTCCTT----------------C--------TACA---------GTTT-------AAC------------AAAAAA------T-----A-----AG--TA-----C------GGCA-GT-----------------TGT-AAACAA-------AC--AA--ACAT----A-AATA-TGA-AGGAAATAAA-GACA-GACTTGT--AA---GAGAATGAGAGCAGAGAAAAaacaataaa
gi|42024                      :                                                                                          GGGTTGGG-CTACGA-GTTATTACAAC----ATTAG-TTA-CAG---------GCCTCCCC----------------T--------TACA---------
gi|42025                      :                                                                                                                                                                                                         AC------------AAATTA-------------------G--CG-----T------GGCA-GT-----------------TGT----CGA-------AC--AA--A--T----G-AATT-CGA-AAGAAAAAAATGAAA-AAAATGT--AA---GACTCTAAGAGCT


blockSeqs                     :                             T     TATATATATAATACATGTATATA                                                     T     CGTG             TTCCATTCC        ACTTCAAGTAACAAAT CCCCCCTC    CCCCCCTTTATTTA         AATGTTTACATT      ACAAAA ATATA TTAGAACCAAGAT              T  TATACCGTTCAACAGGA   CA     TTTTTTCTTAAC       GCAGA    AG   G          TGAA GGA AA  GA AAGTA           T
blockSeqs                     :                             T     TATTTATATATGTGTGTATACA                                                      T     .                .                AA               .           GTGTATAACAGA           .                 ACAAAA .     TATTGAGTGT                 .  .                   A      ATTAAATG           AC       T    .          GAT  GT  AA  .  AG              T
blockSeqs                     :                             .     TATTGATATATTTATATATA                                                        T     .                .                .                .           GTCTT                  .                 .      .     TATTGAGTGT                 .  .                   A      ATTAAATG           A        T    .          GAT  GT  TG  .  AG              C
blockSeqs                     :                             .     TTTTTATATACATGTAGTA                                                         T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     AATTGAGTGT                 .  .                   A      CTATAA             A        T    .          GAC  TA  TC  .  AG              A
blockSeqs                     :                             .     ATAATTTTACATGTA                                                             T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     TATAGAGTAC                 .  .                   A      ACAATC             A        A    .          GAC  GA  TT  .  AG              A
blockSeqs                     :                             .     TATTTAATATATCAT                                                             T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     TATAGAAAAC                 .  .                   A      TATAC              A        A    .          AAC  GA  TT  .  AG              A
blockSeqs                     :                             .     GTAATTCATATAGCA                                                             T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     TATACAGTGT                 .  .                   A      ATAA               A        A    .          CAC  GA  TG  .  AG              T
blockSeqs                     :                             .     ATAATTCACATAGCA                                                             T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     TATACAGTGT                 .  .                   A      ATAA               C        A    .          CAC  TA  TA  .  AG              A
blockSeqs                     :                             .     ATAATTCACATAGCA                                                             T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     TGTTTAT                    .  .                   A      ATAA               A        A    .          GTT  TA  TA  .  AG              T
blockSeqs                     :                             .     ATAACTCACATAGCA                                                             G     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     AATAC                      .  .                   G      ATAA               A        A    .          AAT  AA  AG  .  AG              T
blockSeqs                     :                             .     TATTTATATATACA                                                              T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     AGTAC                      .  .                   A      ACAA               A        A    .          TAA  GA  TG  .  A               A
blockSeqs                     :                             .     TGTTTATATATACA                                                              T     .                .                .                .           GTTAA                  .                 .      .     AGTAT                      .  .                   A      ACAA               A        A    .          GAC  AA  AA  .  .               T
blockSeqs                     :                             .     TATTTATATATACA                                                              T     .                .                .                .           GTTAA                  .                 .      .     AGTAC                      .  .                   A      ATA                A        A    .          AC   G   TT  .  .               A
blockSeqs                     :                             .     TATTTATATGTACA                                                              T     .                .                .                .           ATATA                  .                 .      .     AGTAC                      .  .                   .      ATG                A        A    .          G    G   AT  .  .               T
blockSeqs                     :                             .     TATTCATATATATA                                                              T     .                .                .                .           TTTTT                  .                 .      .     AAAT                       .  .                   .      AC                 A        T    .          .    .   T   .  .                
blockSeqs                     :                             .     TATTTATATATACA                                                              T     .                .                .                .           ATATT                  .                 .      .     GCGT                       .  .                   .      AT                 G        .    .                                           
blockSeqs                     :                             .     TTTTTATATATACA                                                              T     .                .                .                .           GTTTA                  .                 .      .     TAC                        .  .                   .      AC                 .        .    .                                           
blockSeqs                     :                             .     TATTTATATATATA                                                              T     .                .                .                .           GATA                   .                 .      .     TAC                        .  .                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTGATAATTTA                                                               T     .                .                .                .           AGTA                   .                 .      .     AGT                        .  .                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTGATAATTTA                                                               T     .                .                .                .           AGTA                   .                 .      .                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                             .     TATTGATAATTTA                                                               G     .                .                .                .           ATAT                   .                 .      .                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                             .     TATCTATAACACG                                                               G     .                .                .                .           ATAT                   .                 .      .                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                             .     TGTTTATAATATA                                                               G     .                .                .                .           ATAT                   .                 .      .                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATA                                                               T     .                .                .                .           ATAT                   .                 .      .                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                             .     TATACATACTTTA                                                               T     .                .                .                .           ATAT                   .                 .      .                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                             .     ATAATTTTTACAT                                                               C     .                .                .                .           ATTT                   .                 .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATA                                                               C     .                .                .                .           GT                     .                 .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATA                                                               G     .                .                .                .           A                      .                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATGCA                                                               G     .                .                .                .           A                      .                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATGCA                                                               C     .                .                .                .           A                      .                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                             .     ATTGATAATTGCA                                                               T     .                .                .                .                                  .                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATA                                                               T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATAATTTTTACAT                                                               T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATAATTTTTACAT                                                               G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATG                                                               G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATA                                                               G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATATATAATTGTA                                                               T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTTATAATATA                                                               T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTATAAACACA                                                               T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATTTATAATTGCA                                                               T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATAATTTTACAT                                                                G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATAATTTTACAT                                                                T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATAAATTTACAT                                                                T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATCATTTTACAT                                                                G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     ATCATTTTACTT                                                                T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AATATATCTT                                                                  T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AATATATCAT                                                                  T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AATAATTTAT                                                                  G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AATATATCGT                                                                  G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AATAGATCAT                                                                  T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     TATTTAACAT                                                                  G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AGATATTTT                                                                   T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AGATATTTT                                                                   C     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AAATATTTT                                                                   T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AAATTATTT                                                                   G     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AAATATTTT                                                                   T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AACATA                                                                      T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AACAT                                                                       T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AACAT                                                                       C     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AACAT                                                                       T     .                .                .                .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                             .     AACAT                                                                       A     .                .                .                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                             .     AACAT                                                                       A     .                .                .                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                             .     AACAT                                                                       A     .                .                .                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                             .     AACGT                                                                       A     .                .                .                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                   AACAT                                                                       A     .                .                .                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                               G     .                .                .                                                                                                                                                                                                                        
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gi|42001                      :                       TATTTT-ATTTC--TA--TT----TA-T--A-A---------T--------AT-----A-G-AAA-ATGGTTGGG-CCACAA-AATCTTC---C----ATTAA-ATT-CGG---------CTCTCTCC----------------G--------TGC-----------GT-----------C------------AAAT--------------G-----AG--T-------------GTTA-AA-----------------TAT-GAACAAT------AT--AC--AAATGCAGA-AA-A-TGG-AG
gi|42002                      :                      ATGTTTT-ATTTC--AA--------------ATA---------T--------TT-----T-G-AAACGGGGTTGAG-CCACAA-GTTATTCCAAC-----TTAG-ATT-CGG----------CCTCCCCACTTCAAGTAACAAATT--------TAC-A---------GTGTATAACAGAAC------------AAATTA------C-----A-----TGTTTA-----T-------GCA-AA-----------------TAT-AAACAACT-----AT--AA--ACAT----ACAAGAGTGA-AAGA-AAAAA-AATA-G-GTGGTGAAA---GAGAGAGAGAG-AGAGAGAataa
gi|42003                      :               attttaaacATCTT-GTTTC--TA--TT-----A-T--AAA---------C--------AC-----A-A-CAATGGGGTTGGG-CAACAA-GTTCTTTCAAC----ATTTG-ATT-CAGTTCCATTCCCCCTCCCC----------------C--------Tgaga
gi|42004                      :                         TTTT-ATTGC---A--TT----TA-T--AAT---------T--------GC-----A-G-CAATGGGGTTGGG-TCACAA-TTTCTCACAAC----ATTAG-TAA-CGG---------CACTCCCC----------------C--------TA
gi|42005                      :                               tTTT--TA--TT----TA----ACA---------T-----------------G-AAATGGAGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAC----ATTAG-GTT-CAG---------CCCGTCCC----------------C--------TAC-A---------
gi|42006                      :                       aATTTT-ATTACG-TAA-TT----CA-T--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCACAA-GTTCTAGCAAC----ATT-T-ATTACAG---------CCCTCCCC----------------T--------TTC-A---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----
gi|42007                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-TT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CTACAA-GTTCTAGCAAC----ATTAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTC-A---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42008                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-TT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCATAA-GTTCTAGCAAC----ATAAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTC-A---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42009                      :                        ATTTT-ATTGCA-TAA-CT----CA-C--ATA------------------GC-----A----AACGGG-TTGGG-CCACAA-GCTCTAGCAAC----ATTAG-TTA-CGG---------CCCTCCCC----------------T--------TTC-A---------ATAT--------AC------------AAATAA------C-----A-----t
gi|42010                      :                                                                                          GGGTTGGA-TCACAA-GTTCTAGCAAC----GTTAG-TTG-CGG---------CACTCCCC----------------T--------T-C-A---------ATAT--------AC------------AAAGAA------C-----ATT---AG--AA-----CCAAGATGGCA-ATTATACCGTTCAACAGGATGT-AAACAA-------AC--AATCAAAT----A-AAT----A-AAGAGATAAG-TAAA-AAAAAGT--AA------AGTAGGAGGTAAGAAAAt
gi|42011                      :                     attgtattgcataattcacatagcaaac-T--ATA------------------AC-----A-ATAAAAGGGTTTGAA-CCACAA-GTTATGTCAAC----ATTAT-AAT-CGT---------TCCTTTCC----------------aga
gi|42013                      :                                                                                        tcGGGTTGGG-CCACAA-GTTATT-CAAC----ATTAA-AAT-TGG---------CCCTTCCaacaaaattgaacgatattatgtatcgta
gi|42014                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCCC----------------taacaacaaag
gi|42015                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTGGG-CCACAA-GTTA-TCCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCaacaacaaa
gi|42016                      :                                                                                  tagcaaaaGAGTTGGG-CCACAA-GGTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CAG---------CCCTTCCC----------------acaacaa
gi|42017                      :                                                                                  tagcaaaaGGGTTTGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------CCCTTCCaacaacatatt
gi|42018                      :                                                                                  tagcaaaaGGATTGGG-CCACAA-GTTAT-CCAAC----ATTAA-AAT-CGG---------TCCTTCCC----------------aaacaacatatt
gi|42019                      :                                                                    tagcaaaa-----A-G-CAACAGGGTTGGG-CCACAA-GTTATACCAAC----ATTAT-ATT-CAG---------CCCTCCCTAA--------------C---------AA-A---------ATTT----------------------AAATAA------C-----A-----aacacaaaaatattaa
gi|42020                      :                                                                                  -G-AAATGGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTTCAAG----ATTAG-GTT-CGG---------TCCGTCCC----------------C--------TAC-A---------tatt
gi|42021                      :                                                                                  -G-AAATGGGGTTGGC-GCACAA-GTTCTTTCAAC----ATAAGTAT---GG---------CCTGTCCT----------------C--------TAC-A---------
gi|42022                      :                                                                                      AACGAGGTTGGG-CCACAA-GTTA-TCCAAC----ATTAA-AAT-CAG---------CCCTTCCC----------------
gi|42023                      :                                                                                         GGGGTTGGG-CCACAA-GTTCTTCCAAC----ATTAG-ATT-CGG---------CCCTCCTT----------------C--------TAC-A---------GTTT-------AAC------------AAAAAA------T-----A-----AG--TA-----C------GGCA-GT-----------------TGT-AAACAA-------AC--AA--ACAT----A-AATA-TGA-AGGAAATAAA-GACA-GACTTGT--AA---GAGAATGAGAGCAGAGAAAAaacaataaa
gi|42024                      :                                                                                          GGGTTGGG-CTACGA-GTTATTACAAC----ATTAG-TTA-CAG---------GCCTCCCC----------------T--------TAC-A---------
gi|42025                      :                                                                                                                                                                                                          AC------------AAATTA-------------------G--CG-----T------GGCA-GT-----------------TGT----CGA-------AC--AA--A--T----G-AATT-CGA-AAGAAAAAAATGAAA-AAAATGT--AA---GACTCTAAGAGCT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|42012 ): TTAACAAAAGGGTTGAGTCACAAGTAAATTAACATATAAATTATCCCTTCCCCTACAACAAA