lowQualScore                  :                888888888888888888888888                                 111111111                     3333333333333333333                1111                                            222222222222222222                                                   11                                              11111111    11    
lowQualScore                  :     4          333333333333333333333333  555 3      11 22  0    888   0 666666666    888 11111  11 11 6666666666666666666  11 11         0000 00   00  1 3333 111       00 1  1  22 2222 999999999999999999 0  0   0   2222  777777777777  44444444444   22   55   0   5555    1111         1111     111   0  55555555    44    
lowQualScore                  :     .          ........................  ... .      .. ..  .    ...   . .........    ... .....  .. .. ...................  .. ..         .... ..   ..  . .... ...       .. .  .  .. .... .................. .  .   .   ....  ............  ...........   ..   ..   .   ....    ....         ....     ...   .  ........    ..    
lowQualScore                  :     0          444444444444444444444444  999 9      22 00  8    555   8 666666666    111 99999  00 00 2222222222222222222  00 00         9999 99   99  2 7777 777       88 8  2  11 6666 888888888888888888 6  6   6   1111  000000000000  77777777777   77   77   6   2222    2222         3333     999   6  33333333    11    
consensus                     : TTAC-GGGATTCGAA-TCTGGTCGA--ACTCGG----AGAT-C-GNCCGAGC--G--AC-AATC--CGCA-G-------A-TATAA--C-----CA--C--T-----G--C--G---CTA-TG--T--AGGAATATANC--A--AGA--TCGGCG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--N-AA---NC-T-----T-AA-CCG-CTT----AC-C---------CGGA----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCCG----GAAATTTCC----GGACG---TTT-AC---G--N-ATAT-AACTA
Reference ( gi|93206 )        : TTAC-GGGATTCGAAATCTGGTCGA--ACTCGGGGCCAGAT-T-GACCGAGC--G--AC-AATC--TGCA-G-------T-TATAG--C-----CA--C--T-----A--T--A---ATT-TG--T--AGGAATATATT--A--AGA--TCGGTG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--G-AA---TA-T-----T-AA-CCG-CTT----AC-C---------TGGA----------TTT--AAT-AGAT-GATA---CCCG----GAAATTTCC----GGACG---TTT-AC---A--T-ATAT-TACTA
gi|93207                      : TTAC-GGGATTCGAAATCTGGTCGA--ACCCGGGGCCAGAT-T-GACCGAGC--G--AC-AATC--TGCA-G-------T-TATAG--C-----CA--C--T-----A--T--A---ATT-TG--T--AGGAATATATT--A--AGA--TCGGTG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--A-AA---TA-T-----T-AA-CCG-CTT----AC-C---------TGGA----------TTT--AAT-AGAT-GATA---CCCG----GAAATTTCC----GGACG---ATT-AC---A--T-ATAT-TACTA
gi|93211                      : TTAC-AGGATTCGAA--C------A--ACTTG------GAT-C-GACTGAGC--G--AC-TTTC--CGCA-GGTATCACT-TATGG--C-----CA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--T--AAGGATATATC--A--AGA--TCAAGA--G---TATAAAT--C-TT-AG--T----T--G-AA---AC-T-----T-CA-CCG-CTT----AC-C---------GGGA----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCTG----GAAATTTCT----GGACA---TTT-ACGA-A--T-ATA
gi|93205                      : TTAC-GGGATTCGAA-------------CTCGGT------T-C-GACTTAGT--G--AC-AGTT--CTCA-G-------A-TATAA--T-----CA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--T--AGGAATATATC--A--GGA--TCGGGG--A---TATAAAA--C-TT-AG--T----T--G-AA---AC-T-----T-AA-CAG-CTT----AC-C---------TGGA----------TTA--AAT-TGAT-GATG---CCCG----GAAAATATC----GGACG---TTTAAC---G--G-ATAT-AACTAa
gi|93216                      : TTAC-GGGTTTCGAA--CTGG-----------------GAT-C-GACCGAACTTG--AC-AATT--CGCA-G-------A-TATTA--T-----CA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--T--GGAGATATATC--A--AGA--TCAATA--G---TATAAAA--C-AA-AG--T----T--G-AA----A-CA----T-AA-CCG-TTT----AC-C---------TGGA----------TGT--TAT-CGAT-GGTG---CCAT----GAAATTTCCGCCGGGATG---TTT-AC---A--
gi|93215                      : TTAC-GGGATTCAAACTCTGATCGA---------------------CCGAGT--G--AT-AATG--CGCA-GAAAA---C-AACAC--C-----CA--T--T-----A--G--T---CTG-TG--T--ATAAATATATC--A--AGA--ATGGCT--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--A-AA---AG-T-----A-AA-CCA-CTT----GC-A---------CGGA----------TTT--AAT-TGAC-GATG---CCCT----AAAATTTTC----GGACG---TTT-AT---T--G-ATAT-AACTAg
gi|93217                      : TCAC-GGGATTCGAA-CCTGG------------------AT-C-GTTTGAGC--C--AT-AATT--AATA-G-------T-TCAAA--T-----CA--C--T-----G--TTCA---AT---G--C--AGGAATATAAC--A--AGA--TCCGTA--G---TATTAAC--C-TA-AA--T----T-----A---TACT-----T-AA-ACG-TTT----AC-T---------CGGG----------TTT--AAT-CGAT-GATA---CCCG----GAAATTTCC----GAACC---TTT-ACTG-A--T-ATA
gi|93210                      : TTAC-GGGATTCAAA-------------CTC------AGAT-C-GACTCAGT--G--AC-AATC--GACA-G-------A-TAAAA--C-----TA--C--T-----A--T--G---TTA-TG--T--AGGA-TATATC--A--TGA--TTAGCA--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--G-AA---AG-T-----A-AA-CCG-TTT----TC-T---------CGGA----------TTT--AAC-CAAC-AATG---CCCA----GAAGTTT-C----AGTTT---TTT-AC---A--G-ATAT-AACTAact
gi|93214                      : TTAC-GGGATACGAAA--------------CAGG-----AT-T-GCCTGAGT--C--AT-AATC--AATA-G-------A-TATAA--C-----CC--C--T-----G--T--G---CCA-TG--C--AGGAATATAAC--A--TGA--TCTGTT--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----TTTA-AA---CT-T-----T-A--CTA-CTT----AC-C---------TGGG----------TTT--AAT-CAAT-GACG---CCTG----GAAATTTCC----AAATG---TTT-AC---A--
gi|93238                      : TTACCGAGATTCGAACTCTAATCG----CTCG-----------------AGC--G--AC-GATC--CGAA-G-------A-TCTAA--C-----AACTC--T-----A--T--G---A---TG--C--AG--ACATAGT--AATAGA--TGTTTA--G---TAT---T--CTTATAG--T----T--G---------T-----T-AA-CCG-ATA----AC-C---------ga
gi|93241                      :   AC-GGGATTTGAACTCGGATCGACAATTC----CCAGATCT-AAC--------------ATC--TGC----------------G--C-----TA-------------------------TG--T--AGAAATATAAC--A--AGA--TCGGTC--G---TATAAAC--C-TG-AA--T----T---------TA---------AA-CCG-CTT----AC-C---------TGAG----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCCG----TAATGTTTC----GAACG---TTT-AC---ccggctgttgtcatttttaatctatgactcacggaaaatagaaattttacggatttagc
gi|93220                      :            CGAGATTTG----A--ACTCA-----AGAT-T-TCCCTAGC--G--AC-AATC--CACA-G-------A-TATGA--C-----AA--C--T-----G--C--G---CTA-TG--T--A-----ACA----A--AGA--TCGTCC--C---TATAAAT--C-TC-AA--T----T--T-AA---AC-T-----T-AA-CTG-TTT----AC-T---------CGGG----------TTT--AAT-CGAT-GATC---CCCG----G-AATTTCC----GTACG---TTT-AC---G--C-ATAT-AACggacaaaac
gi|93209                      :                   tcaTCGA--ACTT------AGAT-C-GATCGAGC--G--AC-AATC--CACA-G-------A-TATAA--T-----TA--C--T-----G--T--C---TTA-TA--C--AGGAATATATC--A--AGT--TCGACG--G---TAAAAAT--C-TA-AG--T----T--G-AA----A-T-----TAAA-CCGCCTT----TC-C---------CGAA----------TTA--AAT-CGAT-GATG---CGCA----GAAATTTCC----AGACG---TTT-AC---G--G-ATAC-T
gi|93213                      :             ttgcgggatTCGA--ACTCGG------AT-C-GCCCTAGC--G--AT-TATC--CACA-G-------A-TATGA--C-----CA--C--T-----ACGT--A---ATT--------GAGAATATAAC--A--CGA--TTAGCA--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----TT-A-AA---CA-T-------AA-CCG-ACT----AC-C---------CGG-----------TTT--AAT-CGCT-GATA---TCAG----GAAATTTCC----GGACG---TTT-AG---G--G-ATAT-AACCAaacta
gi|93212                      :             tcatgggatTCAA--ACTTGG------AT-C-GACTGAGT--G--AC-AATC--GACA-G-------A-AAAAA--C-----CA--T--T-----A--T--G---CTA-TG--T--AGGA-TATATC--A--TGA--TTGGCA--A---TATAAAT--C-TA-AG--TAAGTT--G-AA---GC-T-----T-AA-CCA-TTT----TC-C---------TGGA----------TTT--AAT-CAAC-AATG---CCCA----GAAATTTCA----GTATA---TTT-AC---A--G-ATAT-AATTA
gi|93219                      :             ttatgggttTCGA--ACTCGG------AT-A-AACCGAGT--A--AC-AGTC--CACA-T-------TACATAA--C-----CA--C--T-----A--T--G---TCA-TG--T--AGGAATACATC--A--ATA--TCGACG--G---TATAAAC--C-TA-AG--T----T--G-A---------------------------------------------------------TT--AAT-CGAT-GATG---CCCA----GAAATTTCC----GGACG---TTT-AC---G--G-ATAT-AATTA
gi|93223                      :             ttatgagatTCGA--TCTCGG------AT-C-GACCGAGC--G--AC-AATC--CGCA-G-------A-TCTAA--C-----CA--T--T-----A--T--G---CTT-TG--T--ACAAATATAAC--A--AGA--TTGCCG--G---TTTGAAA--T-GA-TG--T----T--G-AA---AC-T-----T-AA-TTG-TTC----AC-T---------T-GA----------TGT--AAT-CGAT-GATG---CCCG----AAATTTTCC----GGACA---TT
gi|93245                      :             ttaaaggatTTGA--ACTCGG------AT-C-GCCCGGGC--G--AC-TATT--AGCT-G-------A-TACAA--C-----CT--C--T-----GC-T--A-------TG--T--AGGAATATAAC--A--CGA--TCAACG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--T-AA---AC-T-----T-AA-CCG-CTT----AC-C---------CAAG----------ATT--AAT-CTGC-GATG---CATG----GACATTTTC----GGGCG---TTT-AC---A--G-ATAT-AACTA
gi|93250                      :                 gggatTCGA--AC------CCAGAT-C-GGCCTAT------AT-AATC--CATA-G-------A-TGTCA--T-----CA--C--T-----A--C--G---CCA-TG--C--AGAAATATAAC--A--AGA--TCTGTC--G---TATAAAT--T-TA-AG--T----TT-A-AA---T--T-----T-AA-CCA-CTT----AC-T---------CGGG----------TGT--AAT-CGGC-GATG---AACG----GAAATTTCC----GAACG---TTT-AC---G--T-ATAT-AACT
gi|93222                      :                    atTCGA--ACTAGG----AAA----GGCCGAGC--G--AT-AACT--CGCA-G-------G-TATAA--C-----CA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--T--GTGAATATATC--A--ATT--TCGGCG--G---TATAAAG--C-T------T----T-------------------------G-CTT----AC-C---------TGAA----------TTT--AAT-CGAT-GATG---TCCT----GACTTTTCT----GCTCG---TTT-AC---G--G-ATAT-AACTA
gi|93221                      :             ttacaggatTCGA--ACTTGT------AT-C-AACCAAGT--G--TC-AATT--CAAA-G-------A-TATGA--A-----TA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--T--AAGGAAAAAT-------GA--TCGGAG--G---TATGA-T--C-TA-AG--T----T--------------------AA-TCG-TTT----AC-T---------GGGA----------TTT--AAG-CGAT-GATG---CCCG----GAAATTTTC----GGACG---TTT-ACTG-A--T-ATA
gi|93252                      :             tcacaggatTCGA--ACTCG-------AT-TCGCCCGAGC--G--AT-AATC--CACATA-------T-T-TAA--CTTCTGCG--C--T-----A--T--A-----------T--ATGAATATAAC--A--AGA--TCGGCA--G---TATCAAT--C-T------T---------AA---C--T-----T-AA-TCG-CTT----TC-C------------A----------TTTA-AAT-CGAT-GATG---CCCG----AAAATTTCT----GAACG---TTT-a
gi|93247                      :                     tTCGA--ACTTGG------AT-C-GCCCGAGC--G--AC-AATT--CGGA-A-------A-GGTAA--C-----CG--G--T-----G--CGCA---AT---G--T--AGGGCTATAAC--A--AAA--TCGG----G---TA-AAAC-----A-AG--T----T--T-AA---AC-T-----T-CA-CCG-CTT----GC-T---------CGG-----------TTT--AAT-CGAC-GATG---CTCG----GATATTTGC----GGACG---TTT-AC---tcggata
gi|93228                      :                  ggatTCGA--ACTC------AAAT-C-AACCGAGT--TT-AC-AACT--TGGA-G-------G-TTTAA--C-----AA--C--T-----C--C--G---CCA-TG--T--ACGA-TATAAT--A--AGA--TATGTA--G---TATGAGT--C-TA-AA--C----T------------------T-AA-CCA-CTT----AT-C---------CGGA----------CTG--TGT-CGAT-GACT---TCCG----GAAATTTCA----GAACG---TTT-ACTG-A--T-ATAggttataatt
gi|93231                      :              ttacggatTCGA--ACTCGG------AT-C-GCCCGAGC--G--AC-AATT--CGTT-G-------A-TCTA---C-----CA--C--T-----G--C--G---CTG-TA--T--AGGAATATAAC--A--AGA--TCGTCG--G---TATAa
gi|93246                      :             tcaccggatTCGA--ACTCG------GAT-T-GCCCAAGT--C--AT-AATC--CACA-G-------A-TATAA--C-----CA--C--T-----G--A--G---ATA-TG--T--GGGAATTTA
gi|93218                      :                   gagatGG--ACTCGAACCCGGAT-C-GCCTGAAT--C--AT-AATA--GACA-G-------A-TAAAA--T-----CA--C--T-----G--T--G---CCA-TG--C--AGGAATATATTTCA--AGT--TCTTCT--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--T-AA---AC-T-----T-AA-CCT-CTT----GC-T---------TCGG----------TTT--AAT-CAAT-GATG---CCAG----AAAATTTCT----AAATG---TTT-ACCA-A--T-ATA
gi|93225                      :                   tcacaGA--ACTCGG------AT-C-GACAGAGC--G--AC-ACTC--CACA-A-------A-TTTAT--C-----CA--C--T-----A--T--G---ATA-TG--A--AGAAATATATT--G--AGA--TCGGCG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--A-AA---a
gi|93244                      :             ttacgagatgaGA--A-TCGAAGCCGAAT-C-GCCCGAGT--C--AT-CATC--CATA-G-------A-TATAA--C-----CT--C--TTCGCCA--T--A-----------C--AGGAATATAAC--A--AGA--TCATTC--G---TATAAAT--G-TA-AC--T----T--T-AA---AC-T-----T-AA-actttaaatcgtcgataaccgga
gi|93251                      :                      cagA--ACTCGG------AT-C-GACCGAAC--A--AC-ACTC--TACA-T-------A-TGTAA--G-----CA--C--T-----G--T--T---TTA-TG--T--AGGACTATATC--A--AGA--TCTATG--G---TATAACT--T-TA-AA--C----T--G-AA---AT-T-----T-AG-CCG-TTTTC--AC-C---------GAGT----------TTT----T---AT-GATG---CCCA----GAAATATCC----GGATG---TTT-AC---G--G-ATAT-AACT
gi|93229                      :                     tttaA--ATTCGAGCCTGGAT-T-GCCCGAGT--C--AT-AATC----CA-T-------T-TACAAAAC-----CA--C--T-----A--T-----------G--C--AGGAATATAAC--A--AGA--TCGATC--G---TATAAAT--A-AA-AAGTT----T--A-AA---CA-T-------AG-CCG-ATT----AT-T---------CGGG----------TTT--AAT-ATAT-GATG---CCAA----GAAATTTCC----G
gi|93227                      :                              tcacgaCCAGAT-C-G-CCG-GT--GTCAT-AATC--CATA-G-------A-TATGA--C-----CA--C--T-----G--C--A---CCA-TG--T--CAGAATATCAC--A--AGA--TTGACC--T---TATAAAT--A-TA-AGA-T----C--A-AA---T--T-----T-AA-CTG-CTT----ACTC---------AAGA----------CTT--AAT-CGAT-GATG---CTTG----GAAAT
gi|93208                      :                      tcacgggttttgaacCAGAT-C-GACCGAGC--A--AC-AATC--CACA-G-------A-TATAA--C-----CA--C--T-----G--C-------TC-TA--T--A----TGTATT--A--AGA--TTGGTG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--A-AA---AC-T-----T-AA-CTG-CTT----AC-C---------CAAA----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCAG----GAAATTTCC----AGATGAT-TTT-GG---A--T-ATA---ACTA
gi|93239                      :                     ttaaaggatttgaactCAGAT-C-AACTGAGT--G--AC-AATC--GGCA-G----------AAAA--C-----TA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--T--AGGA-TATATC--A--TGA--TTAGCA--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--A-AA---GC-T-----A-AA-CTG-TTT----TC-T---------CTGA----------TTT--AAC-CAAC-AATG---CACA----GAAATTTCA----GTACG---TTT-AC---A--G-ATAT-AACTA
gi|93232                      :                      tacaagattcaaacaCAGAT-T-AACCAAGT--G--GC-AATC--TGTA-G-------A-TATAA--C-----TA--A--T-----C--T--A---CTA-TA--T--AGGAATATATC--A--AGA--TCAGTC--A---TAT-AAT--C-TA-A
gi|93249                      :                     ttattggattggaactCGGAC-C-GTCTGTGT--G--AC-AATC--AGCA-G-------C-TTTAT--C-----CA--C--T-----G--C--G---CTA-TA--T--AGGAATAT--T--A--C-A--T-GGTG--G---AGTGTAT--C-----G--T----T--ATGA---TA-T-----T--------TTT----AA-A---------TTGAAT--------TTT--AAT-CGAT-GATA---CCCG----GAAATTTCC----GAACG---TTT-
gi|93248                      :                               gattcaCGGAC-C-GTCTGTGT--G--AC-AATC--AGCA-G-------C-TTTAT--C-----CA--C--T-----G--C--G---CTA-TA--T--AGGAATAT--T--A--C-A--T-GGTG--G---AGTGTAT--C-----G--T----T--ATGA---TA-T-----T--------TTT----AA-A---------TTGAAT--------TTT--AAT-CGAT-GATA---CCCG----GAAATTTCC----GAACG---TTT-gaagaca
gi|93235                      :                               gattcaCAGAT-C-GCCCGAAC--G--ATTAATC---GCA-G-------C-TCGAA--C-----CA--T--T-----G--C--ACCAATC-AG--T--A-----ATATT--A--GAAAGTCAGTG-------ATAGGT--C-TT-A--------T--G-TA---TA-TAAACCT-AA-CAG-CTC----AA-C---------TGAACTGTCGCACATTTGCAAT-CGAT-AATG---CCCG----GACATTTCT----GAACG---TTT-AC---T--T-ATAT-gaagaca
gi|93237                      :                     tttcggggtaaaaactCAGAT-C-GCTTGAGC--G--AC-AATT--CACA-G-------T-TCTAA--C-----CA--C--T-----G--T--a
gi|93255                      :                      tcacggattttgaattAAAT-T-GACCAAGC--A--TC-AACT--CGCG-G-------A-TATAA--C-----CA--C--T-----A--T--G---TTA-TA--T--AGGAATATATC--C--AGA--TTGGCA--G---TATAAAT--CTTA-AG--T----T--GAAA---CA-C-----C--A-TCA-CTA----AC-C---------AGGA----------TTT--AAT----T-GATG---CCCA----GTAATTGCC----GGACG---TTT-AT---A--G-ATAT-AACTAgc
gi|93224                      :                                       GAT-A-GCCCGAGT--C--AT-AATCCATATA-G-------A-TGTTA--C-----CA--C--T-----G--T--GCC-ATT-C------AGGAATTAAAC--A--AGA--TCCGAC--A---TATAAAC--C-TA-AG--T----T--T-AA---TC-T-----T-AG-CAG-CTT----AC-T---------CAGG----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCAA----GAAATTTCT----GTATG---TGT-AC---A--G-ATAT-
gi|93257                      :                       tcacaggattcaaacctgT-C-GACCGAGC--G--AT-AATC--CGCA-A-------A-TATAA--C-----AT--C--T-----A--T-----------G--C--AGGAATATGCC--G--AGA--TCG-CG--T---TATAAAT--C-TT-TG--T----T--G-AA---AC-T-----T-AC-CCG-CTT----TC-C---------CGGA----------TTT--AAT-CGAT-GATT---CTCG----GGAAATTCC----GGa
gi|93256                      :                                         T-C-GACAGAGC--G--TC-CATC--CGCA-G-------A-TATAA--C-----CA--T--A-----G--T--G---CTA-TG--T--CGAAATATATC--A--TGA--TCGGCA--G---TAT---------------------------------------------CG-TTT----AC-C---------GAGA----------TTA--AAT-CGAT-GATG---CCCG----GAAATTTCT----GGACG---TTT-AC---G--G-ATAC-AACTA
gi|93258                      :                                                 GAGC--C--AT-AATC--CAC--G-------A-TGTAA--C-----CA--C--T-----G--T--G---CCG-TG--C--AGGAATAAAGC--A--TGA--ACGTCG--G---TATAAGT--T-TC-AT--T----T--T-CA---AC-T-----T-AA-CAG-CTT----AC-T---------CGGG----------TGT--AAT-CGGT-GATG---CCCG----CAGAATTCC----AAACG---TTT-AC---G--T-ATAT-CACT
gi|93259                      :                                                  AGC--G--AC-AATC--AGCA-G-------T-TCTAAC-C-----CA--C--T-----G--C--G-----T-TGCAT--AGAAATATTCC--A--AAG--TGGATG--G---CA-AAAT----TA-TG--T----T---------TA-TAAACCT-AA-CCG-CTC----CC-CAGGCTGTCGTGTAT---------TTT--AAT-CGCT-GATG---CTCT----GAAATTTTC----GAACG---TCT-ACGG-A--T-ATA
gi|93260                      :                                                    C--G--AC-ATTT--CGCA-G-------A-TATAA--C-----CA--C--T-----A--T--G---CTA-TG--A--AGGAATATATC--A--AGA--TCTGTG--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--G-AA---AC-T-----T-AA-CTG-CTT----AC-C---------CGGA----------TTT--AAT-CAGT-GATA---CCTG----GAAATTTTC----GGACG---CTT-gc
gi|93253                      :                                                    C--G--AC-AATC--CTCA-G-------A-TCTAA--C-----CA--C--T-----A--C--G---GTT-TG--T--GGGAATTTAAC--A--ACA--GCGGTG--G---AAGAAAT--TATA-AC--T----T--TTAA---TA-A-------AA-TCG-CTT----AC-C---------CGGG----------TCT--AAT-CAAT-GATT---CCCG----GAAATTTCC----CGACT---CTT-AC---gtggatggaatta
gi|93243                      :                                tcaaactctgatctctcagcC--G--AC-ACTC--CGAA-G-------T-TCTAT--C-----CA--AAAT-----A--C--A---AC---A--T--AGGAATATCCC--A--TGA--TC--TA--A---TGTATGT--T-TA-AA----------A-AAATGTA-T-----T---------TT----AA-T---------TGCA----------TTTA-AAT-CGAT-GATA---TCCG----AAAATTTCG----GAACG---TTT-ACGG-A--T-ATAggttataac
gi|93233                      :                             acgagagttgaatcccgatcacctgta--AT-AATC--TATA-T-------A-TATGA--C-----TA--C--T-----A--C--G---CCA-TG--A--AGGAATATCCC--A--ACA--TCGGCC--G---TTTAAAT--C-TA-AAC-T----T--A-AA---CG-------T-AA-CC----------C-A---------TG------------TTT--AAT-CG-T-AATT---TCCG----AAAgc
gi|93269                      :                                   ttacgcaggattcaaactaggatcgctcggatcGCC-G-------C-TA-AG--C-----CA--C--T-----A--------------------AGGAACAAATA--C--AAA--TTGGTG--G---TATAAAT--C-GG-AG--T----T--G-AA---AA-T-----A-AT-CCT-CTT----AC-A---------CGAA----------TTT--AAT-CTAT-GATG---CCTG----GAAATTTAC----GGACA---TTT-AC---A--C-ATGT-AACTA
gi|93267                      :                                                                              ata-TATAA--C-----CA--T--T-----G--T--AGGAATA-TA--TCAAGGAATATATC--A--AGA--ACTGCG--G---TATAAAT--A-TA-AG--T----T--T-AA---AC-T-----T-AA-CAG-ATT----AC-C---------CGAA----------ATT--AAT-CAGT-GATA---CCCG----GAAATTTCC----TGACG---TTT-AC---A--G-AAAT-AACTA
gi|93268                      :                                                                                 -TATAA--C-----CA--C--T-----A--T--G---CTA-AG--G--AGGAATATATC--A--TG---T--GTA--G---TATAAAT--C-TA-AG--T----T--G-AA--------------AA-CC--CTC----TC-C---------CGGA----------TTT--AAT-TGAT-GATG---CCCG----GAAATTTTC----GGACG---TTA-ACG--A--C-ATA---ACTA
gi|93226                      :                                                                                 -TATAA--C-----CA--C--T-----T--C--G---CCA-TG--C--AGGAATAAAAC--A--AGA--TTGGTC--G---TATAAAT--C-TA-AC--T----T--------------------AA-CGG-CAT----ACTC---------CGGA----------TT---AAT-TGAC-GATG---CCCG----GAAATTTCC----GAATG---TTA-AC---GATT-ATATATACTA
gi|93264                      :                                   tcacaggattcaatcctggattgcctgagtcaaaatataaccactatacatg--C-----CA--C--T-----G--C--A---CCA-TG--T--AGGAATATCAA--A--AGA--CCGGAC--G---TATAATT--C-TA-AT--T----T--T-AA---AC-T-----C-AA-CCA-CTT----ACTC---------TGG-----------TTT--ATT-TGAT-GATG---CCTG----GAAATTTCC----GAACG---TTT-AC---G--G-ATA
gi|93263                      :                                                                                                       atttga--T--A---ACTATG--C--AGGAATGTAAA--A--AGA--TCAGTG--G---AATAAAT--C-TA-AA--T----T--T-TA---TC-T-----C-AA-CTG-CTA----AC-A---------AGAG----------CTT--AAT-aaact
gi|93270                      :                                                                                                   aataggtatgaccagaataagt-TG--T--AGCAATATAAC--A--AAT--CCTGCC--G---TATTAAT--C-TA-AC--T----T--T-AA---TC-T-----T-AA-CCA-CTT----TC-T---------CGGA----------ATT--AAC-CGAT-GATG---CCTG----AAAATTTTC----GAACA---TGT-AC---G--G-ATAT-AACT
gi|93230                      :                                                                                                               cattgcgcta-TG--C--AGGAATAAAAC--A--GTA--ACGTTT--G---TATAAAT--C-TT-AA--T----T------------T-----T-AA-TCG-TTT----AC-T---------GGGG----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCCT----GATATTCAC----TAACG---TTT-AC---G--G-ATA
gi|93265                      :                                                                tcacgtgaatagaatctgggtcgcccgaatcataatcaatagatgttattactgcaccgG--C--AGAAATATATA--A--AGA--TCAGTGTTA---TATATAT--A-TA-AG--T----T--G-AA---AC-C-----T-AA-CCG-TTT----TT-C---------CGGA----------TTT--AAT-TGAT-AATG---GCCA----GAATGATCC----GGGCG---TTC-AC---A--aaact
gi|93261                      :                                                                                                                   atataaatattatgttagATATAAC--A--ATA--TCTGAC--G---TATAACT--C-TA-AC--T----T--T-AA---AC-T-----C-AA-CCG-CAT----AC-A---------TGTG----------TTT--AAT-CGAT-TATA---CCCG----GAAATTACC----GAACG---TTT-AC---G--C-ATAactacgatat
gi|93266                      :                                                                                                            atcaatagatataacctctacccctATGTACT--A--ACA--TCTTTG--AGTTTGTAGAC--C-TA-TG--TCTTAT--A-AA---AA-A-----T-AA-CCG-ATT----AC-C---------CGGG----------TTT--AGTGAGATTAATATTGCCCG----GAAATTTCT----TCACA---TTT-AC---A--G-ATGT-AACaac
gi|93262                      :                                                                                                               atataattgtcatgaaatgttgATATAAC--A--ATA--TC--TG--AC--TTTAAAT-----A-AC--T----T--T-AA---AC-T-----C-AA-CCG-TAT----AC-A---------CGTG----------TTT--AAT-CGAT-TATA---CCCG----GAAATTACA----GAACG---TTT-GC---G--C-ATAT-
gi|93272                      :                                                                                                             atcaatagatataacctcgaccacccatATA--A--AGA--TCAGCA--G---TATAGAT--C-TA-AC--T----T--------------------AA-CCT-CAT----AT-C---------CGAA----------TTT--AAT-CGAT-GATG---ACTG----GAAATATCA----AGACG---TAT-AC---a
gi|93273                      :                                                                                                                                            --A--AGA--TCTGCC--T---TATACAT--C-AA-AG--T----T------------T-----G-AA-CT---TT----GT-C----------GGG----------TTT--AAT-CGAA-AATG---CCCGAAAGGAAATTTCC----GAACG---TTT-A
gi|93254                      :                                                                                                                                                   A--TCAGCC--A---TATAAAT--C-TTTAG--T----T--T-AA---CC-T-----T-TA-TCA-CAT----AC-T---------CAGG----------TTA--AAT-CAAT-GATG---GCTG----GAAATTTCC----CCACA---TTT-AC---tggatgataac
gi|93274                      :                                                                                                                 gagttcagtggccagagttataatccaaagatatgaccactatgct---TATAAATATC-TT-AT--T----T--T-AA---GC-T-----T-AA-CCG-CAT----AC-G---------CGGG----------TTT--AAT-CGAT-GAGG---CCCG----GAAATTTCC----AGACG----TT-ACCGGA--T-ATA
gi|93271                      :                                                                                                                                                               ---TATAAAA--C-TA-AT--T----TT-A-AA---T--T-----T-AA-CCG-CTT----AC-C---------CGGG----------CT----GT-CGAA-TTTA---CTCC----GAAATTTCT----GAACG---TTT-AC---ac
gi|93275                      :                                                                                                                                  gaatattacaagatcagcggtataattagttacagtAAT--C-TA-CG--T----T--T-TA---AG-T-----T-AA-CCG-CTT----AC-T---------CGGT----------TTT--TAT-CGAT-GATG---TCCG----GAAATTTCC----GAACG---TTT-AC---A--G-ATAT-AACTggatgta
gi|93276                      :                                                                                                                                                                       AT--C-TT-AC--T----T--G-AA---AA-T-----T-AAACCG-CTT----AC-G---------CGGG----------TTA--AAT-GGAT-GAT----CCCG----GAAACTTCA----CGAGG---TTT-ACGG-A--T-ATA
gi|93277                      :                                                                                                                                                                         --C-TA-TG--C----T--G-AA---AC-T-----T-AA-CCG-CTT----AT-C---------CGAG----------TTT--AAT--------------CTG----GAAATGTCC----GGAAG---TTT-AC---
gi|93278                      :                                                                                                                                                                                 G--T----T--G-AA---AC-T-----C-AA-CCG-GTTGTAAAC-C---------CGGA----------TT---AAT-CGAT-GATA---TCCG----GAAATGTTC----AAACG---TTT-TC---G--A-ATAT-ggattaaacta
gi|93281                      :                                                                                                                                                                                                     -T-----T-AA-CCA-CTT----AC-C---------TGGA----------TTA--AAT-CGAT-GATG---CCAG----GAAATTTCT----GGACG---TTT-AC---G--G-ATAT-AACTAga
gi|93280                      :                                                                                                                                                                                                     -T-----T-AA-CCG-CTT----AC-C---------CGGG----------TGT--AAT-CGAT-GCTG---TCCA----GAAATTTCC----GGACG---ATT-TC---G--G-ATAT-AACT
gi|93279                      :                                                                                                                                                                                                   at-T-----T-AA-CTT-ATT----AC-T---------CGGG----------TTT--AAT-CGAT-GCTA---CTCG----GTAATTTCC----GAATGAGATT-------A--T-ATAC-T
gi|93282                      :                                                                                                                                                                                                                                       aacGGA----------TTT--AAT-CGAT-GATG---CCGG----GAAATTTCC----GGACG---TTT-A----A--TGATAT-AACTA
gi|93283                      :                                                                                                                                                                                                                                           cA----------TTTTAAAT-CGAT-GATA---TCCG----GAAATTTCC----GAACG---TTT-A
gi|93285                      :                                                                                                                                                                                                                                             ----------TTT--AAT-CGAT-GATG---TCCG----GAAATTTCT----GAACG---TTT-ACGG-A--T-ATAtggataca
gi|93284                      :                                                                                                                                                                                                                                             ----------TTT--CAT-CGAT-GATG---CCCG----GAAGTTTCC----GAACG---TTT-AC---
gi|93286                      :                                                                                                                                                                                                                                             ----------TTT--AAT-CAAC-AATG---CCTG----GAAATTTCC----GAATG---TTT-AC---A--G-ATAgattata
gi|93287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-GATG---CCCA----GAAATTTTC----GAACG---TTG-ACGG-A--T-ATA
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|93234 ): TCACGTGATTCCAAATCGGATCGCCATAGTCATAATCTATAACTGTAACCTATGCGCCATGCAGGAATATAAGAAGTCGGTCCATGTAAATTTAACTTTCAGCTTTCAAAACCTCATACTCTGGTTTCATCAATGATGATTGGAATTTTATATAAATACATGGATACAACTA
Unaligned ( gi|93242 ): ACAGGACTCGAACCAGGATCGCTGGAATCATTATCCAAATAAATATAACCACTACGTCATGTAGAAATATCTCAAAATCGGACGTTTAAATCAAG
Unaligned ( gi|93236 ): TCACGGGATTTAAACCCGGATCTCATACTCCATAGATATTACCACTGCGTTATGAAGGAATATAACAAGTTCAGTAGTATGAAT
Unaligned ( gi|93240 ): TACGTGATTCGAACCCGGATCGCATGGGCGACAATCGGCGGATGTATTCATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                               33333333333333333333333                                                                                                                                                                                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                               77777777777777777777777 0  1      11 0  0      11  11 0   0    3333333 111   0   111    0 00         222  00     0  88888888888    1111  333333333333  2222 1  1 111 3333 4444  3   2222  0   0  00 1111  1  0  777777777777777777777   22 11111 0             1111         1111        0   222  0  00 0    
lowQualScore                  :                                               ....................... .  .      .. .  .      ..  .. .   .    ....... ...   .   ...    . ..         ...  ..     .  ...........    ....  ............  .... .  . ... .... ....  .   ....  .   .  .. ....  .  .  .....................   .. ..... .             ....         ....        .   ...  .  .. .    
lowQualScore                  :                                               11111111111111111111111 8  8      00 7  7      00  00 7   6    2222222 777   7   111    6 99         777  88     6  00000000000    3333  000000000000  0000 8  2 999 1111 3333  8   0000  6   6  88 2222  2  6  666666666666666666666   11 44444 5             2222         2222        6   555  7  99 7    
consensus                     :                                 TTACGGGATTCGAA-CCTGGTCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AATCCG--CA--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--N-AAACTT----AA-CCG-CT--T----AC-CC-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACG--GAT-AT--A-ACTA
Reference ( family-347 )      :                                 TTACGGGATTCGAA-TCTGGTCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AATCCG--CA--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--N-AANCTT----AA-CCG-CT--T----AC-CC-GG---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACG--NAT-AT--A-ACTA
gi|93205                      :                                 TTACGGGATTCGAA-----------CTCGG----T--T-CGACTTAGT--G-AC-AGTTCT--CA--G-ATA-TAAT-------C---ACTATGC---TATG-T--AGGAATATAT--CA--GGATC-GG-------GG--ATAT----AA------------AA----C-TT-A-G-T----T--G-AAACTT----AA-CAG-CT--T----AC-CT-GG---------A-----------TTA--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAAATATC----GGACGTTTAACG--GAT-AT--A-ACTA
gi|93206                      :                                 TTACGGGATTCGAAATCTGGTCGAACTCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AATCTG--CA--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--G-AATATT----AA-CCG-CT--T----AC-CT-GG---------A-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACA--TAT-AT--T-ACTA
gi|93207                      :                                 TTACGGGATTCGAAATCTGGTCGAACCCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AATCTG--CA--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--A-AATATT----AA-CCG-CT--T----AC-CT-GG---------A-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGATT-ACA--TAT-AT--T-ACTA
gi|93208                      :                                                     TTGAACTC------AGAT-CGACCGAGC--A-AC-AATCCA--CA--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCTC---TAT---------ATGTAT--TA--AGATT-GG-------TG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--A-AAACTT----AA-CTG-CT--T----AC-CC-AA---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCC----AGATGATT-TTG--GAT-AT--A-ACTA
gi|93209                      :                        ttaaaggatTTGCGGGATTCGAA-CTT----------------AGAT-CGATCGAGC--G-AC-AATCCA--CA--G-ATA-TAAT-------T---ACTGTCT---TATA-C--AGGAATATAT--CA--AGTTC-GA-------CG--GTAA----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--G-AAATTA----AA-CCGCCT--T----TC-CC-GA---------A-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCGCA----GAAATTTCC----AGACGTTT-ACG--GAT-ACTAA-ACTA
gi|93210                      :                                 TTACGGGATTCAAA-----------CTC------AGAT-CGACTCAGT--G-AC-AATCGA--CA--G-ATA-AAAC-------T---ACTATGT---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--G-AAAGTA----AA-CCG-TT--T----TC-TC-GG---------A-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCCCA----GAAGTTT-C----AGTTTTTT-ACA--GAT-AT--A-ACTA
gi|93211                      :                                 TTACAGGATTCGAA-C-------AACTTGG----A--T-CGACTGAGC--G-AC-TTTCCG--CA--G-GTA-TCACTTATGGCC---ACTATGC---TATG-T--AAGGATATAT--CA--AGATC-AA-------GA--GTAT----AA------------AT----C-TT-A-G-T----T--G-AAACTT----CA-CCG-CT--T----AC-CG-GG---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCTG----GAAATTTCT----GGACATTT-ACG--AAT-AT--A-A
gi|93212                      :                                                     TCAAACTTGG----A--T-CGACTGAGT--G-AC-AATCGA--CA--G-AAA-AAAC-------C---ATTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-GG-------CA--ATAT----AA------------AT----C-TA-A-G-TAAGTT--G-AAGCTT----AA-CCA-TT--T----TC-CT-GG---------A-----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCCA----GAAATTTCA----GTATATTT-ACA--GAT-AT--A-ATTA
gi|93213                      :                                            ttatgggttTCGAACTCGG----A--T-CGCCCTAGC--G-AT-TATCCA--CA--G-ATA-TGAC-------C---ACTACGT---AAT--T--GAGAATATAA--CA--CGATT-AG-------CA--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--T-AAACAT----AA-CCG-AC--T----AC-CC-GG---------------------TTT--A-----A-TCGCTGATATCAG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AGG--GAT-AT--A-ACCA
gi|93214                      :                        tcatgggatTTACGGGATACGAA----------AC---A----GGAT-TGCCTGAGT--C-AT-AATCAA--TA--G-ATA-TAAC-------C---CCTGTGC---CATG-C--AGGAATATAA--CA--TGATC-TG-------TT--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-GTT----T--T-AAACTT----TA-CTA-CT--T----AC-CT-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCAATGACGCCTG----GAAATTTCC----AAATGTTT-ACA--G
gi|93215                      :                                 TTACGGGATTCAAACTCTG-----------------AT-CGACCGAGT--G-AT-AATGCG--CA--G-AAAACAACACC----C---ATTAGTC---TGTG-T--ATAAATATAT--CA--AGAAT-GG-------CT--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--A-AAAGTA----AA-CCA-CT--T----GC-AC-GG---------A-----------TTT--A-----A-TTGACGATGCCCT----AAAATTTTC----GGACGTTT-ATT--GAT-AT--A-ACTA
gi|93216                      :                                 TTACGGGTTTCGAA--CTGG---------------GAT-CGACCGAACTTG-AC-AATTCG--CA--G-ATA-TTAT-------C---ACTATGC---TATG-T--GGAGATATAT--CA--AGATC-AA-------TA--GTAT----AA------------AA----C-AA-A-G-T----T--G-AAACAT----AA-CCG-TT--T----AC-CT-GG---------A-----------TGT--T-----A-TCGATGGTGCCAT----GAAATTTCCGCCGGGATGTTT-AC
gi|93217                      :                                 TCACGGGATTCGAA-CCTGG----------------AT-CGTTTGAGC--C-AT-AATTAA--TA--G-TTC-AAAT-------C---ACTGTTC---AATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-CG-------TA--GTAT----TA------------AC----C-TA-A-A-T----T--A-TA-CTT----AA-ACG-TT--T----AC-TC-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACCTTT-ACT--GAT-AT--A-ACTag
gi|93218                      :                                                     TCGAACCCGG----A--T-CGCCTGAAT--C-AT-AATAGA--CA--G-ATA-AAAT-------C---ACTGTGC---CATG-C--AGGAATATATTTCA--AGTTC-TT-------CT--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--T-AAACTT----AA-CCT-CT--T----GC-TT-CG---------G-----------TTT--A-----A-TCAATGATGCCAG----AAAATTTCT----AAATGTTT-ACC--AAT-AT--A-A
gi|93219                      :                                            tcacaggacTCGAACTCGG----ATA---AACCGAGT--A-AC-AGTCCA--CA--TTACA-TAAC-------C---ACTATGT---CATG-T--AGGAATACAT--CA--ATATC-GA-------CG--GTAT----AA------------AC----C-TA-A-G-T----T--G-A-------------------------------------------------------TT--A-----A-TCGATGATGCCCA----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACG--GAT-AT--A-ATTA
gi|93220                      :                                            ttatgagatTTGAACTCA-----AGAT-TTCCCTAGC--G-AC-AATCCA--CA--G-ATA-TGAC-------A---ACTGCGC---TATG-T--A-------AC--AA--AGATC-GT-------CC--CTAT----AA------------AT----C-TC-A-A-T----T--T-AAACTT----AA-CTG-TT--T----AC-TC-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGATCCCCG----G-AATTTCC----GTACGTTT-ACG--CAT-AT--A-AC
gi|93221                      :                                            tcacgagatTCGAACTTGT----A--T-CAACCAAGT--G-TC-AATTCA--AA--G-ATA-TGAA-------T---ACTATGC---TATG-T--AAGGA---AA--AA--TGATC-GG-------AG--GTAT----GA-------------T----C-TA-A-G-T----T--------------AA-TCG-TT--T----AC-TG-GG---------A-----------TTT--A-----A-GCGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTT-ACT--GAT-AT--A-A
gi|93222                      :                                            tcacaggatTCGAACTAGG----AAA---GGCCGAGC--G-AT-AACTCG--CA--G-GTA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-T--GTGAATATAT--CA--ATTTC-GG-------CG--GTAT----AA------------AG----C-T--------------------TT---------G-CT--T----AC-CT-GA---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCT----GACTTTTCT----GCTCGTTT-ACG--GAT-AT--A-ACTA
gi|93223                      :                                            ttacaggatTCGATCTCGG----A--T-CGACCGAGC--G-AC-AATCCG--CA--G-ATC-TAAC-------C---ATTATGC---TTTG-T--ACAAATATAA--CA--AGATT-GC-------CG--GTTT----GA------------AA----T-GA-T-G-T----T--G-AAACTT----AA-TTG-TT--C----AC-TT--G---------A-----------TGT--A-----A-TCGATGATGCCCG----AAATTTTCC----GGACATT
gi|93224                      :                        ttaaaggatTCACAGGATTCAAA-CCTGG----------------AT-AGCCCGAGT--C-AT-AATCCA--TATAG-ATG-TTAC-------C---ACTGTGC---CATT-C--AGGAATTAAA--CA--AGATC-CG-------AC--ATAT----AA------------AC----C-TA-A-G-T----T--T-AATCTT----AG-CAG-CT--T----AC-TC-AG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAA----GAAATTTCT----GTATGTGT-ACA--GAT-AT--A-
gi|93225                      :                                                       GAACTCGG----A--T-CGACAGAGC--G-AC-ACTCCA--CA--A-ATT-TATC-------C---ACTATGA---TATG-A--AGAAATATAT--TG--AGATC-GG-------CG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--A-AAACTTTA--AA-TCG-TCGAT----AA-CC-GG---------A-----------
gi|93226                      :                                                                                            ttacgagatgaTA-TAAC-------C---ACTTCGC---CATG-C--AGGAATAAAA--CA--AGATT-GG-------TC--GTAT----AA------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CGG-CA--T----ACTCC-GG---------A------------TT--A-----A-TTGACGATGCCCG----GAAATTTCC----GAATGTTA-ACGATTAT-AT--ATACTA
gi|93227                      : tcacaggattcaatcctggattgcctgagtcaaaatataaccactatacatgTTGAACCC------AGAT-CGCCGGTGT--C-AT-AATCCA--TA--G-ATA-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--CAGAATATCA--CA--AGATT-GA-------CC--TTAT----AA------------AT----A-TA-A-G-A----T--C-AAATTT----AA-CTG-CT--T----AC-TCAAG---------A-----------CTT--A-----A-TCGATGATGCTTG----GAAAT
gi|93228                      :                                            tcacgggttTCGAACTC------AAAT-CAACCGAGT--TTAC-AACTTG--GA--G-GTT-TAAC-------A---ACTCCGC---CATG-T--ACGA-TATAA--TA--AGATA-TG-------TA--GTAT----GA------------GT----C-TA-A---------------ACTT----AA-CCA-CT--T----AT-CC-GG---------A-----------CTG--T-----G-TCGATGACTTCCG----GAAATTTCA----GAACGTTT-ACT--GAT-AT--A-A
gi|93229                      :                         ttacggatTCACGAAATTCGAG-CCTGG----------------AT-TGCCCGAGT--C-AT-AATCCA--TT--T-ACA-AAAC-------C---ACT--------ATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-GA-------TC--GTAT----AA------------AT----A-AA-AAG-T----T--T-AAACAT----AG-CCG-AT--T----AT-TC-GG---------G-----------TTT--A-----A-TATATGATGCCAA----GAAATTTCC----G
gi|93230                      :                                                                    GGT-CGCCCGAAT--C-AT-AATCAA--TA--G-ATG-TTAT-------T---ACTGCAC---CGTG-C--AGGAATAAAA--CA--GTAAC-GT-------TT--GTAT----AA------------AT----C-T--------------T-AATTTT----AA-TCG-TT--T----AC-TG-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCT----GATATTCAC----TAACGTTT-ACG--GAT-AA--A-ACT
gi|93231                      :                                   tcacgtgaatagaatctgTCGAACTCGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AATTCG--TT--G-ATC-TA-C-------C---ACTGCGC---TGTA-T--AGGAATATAA--CA--AGATC-GT-------CG--GTAT----A
gi|93232                      :                                              tcaccggatGAACTC------AGAT-TAACCAAGT--G-GC-AATCTG--TA--G-ATA-TAAC-------T---AATCTAC---TATA-T--AGGAATATAT--CA--AGATC-AG-------TC--ATAT-----A------------AT----C-TA-A-
gi|93233                      :                                          ttattggattgTCAAACTAGG----A--T-CGCTCGGAT--C-AT-AATCTA--TA--T-ATA-TGAC-------T---ACTACGC---CATG-A--AGGAATATCC--CA--ACATC-GG-------CC--GTTT----AA------------AT----C-TA-A-A-C----T--T-AAACGT----A---------------AC-CC-AT---------G-----------TTT--A-----A-TCG-TAATTTCCG----AAA
gi|93234                      :                                          ttacgcaggatTCCAAATCGG----A--T-CGCCATAGT--C-AT-AATCTA--TA--A-CTG-TAAC-------C---TATGCGC---CATG-C--AGGAATATAA--GA--AG-TC-GGT------CC--ATGT----AA------------AT----T-TA-A-C-T----T--T-CAGCTTTCAAAA-CCT-CA--T----AC-TC-TG---------G-----------TTT--C-----A-TCAATGATGATTG----GAATTTTAT----ATAAATAC-ATG--GAT-AC--A-ACTA
gi|93235                      :                                               tcacgtgatAACTC------AGAT-CGCCCGAAC--G-ATTAATC-G--CA--G-CTC-GAAC-------C---ATTGCAC---CAAT-C--AGTAATATTA--GA--AAGTC-AG-------TG----AT----AG------------GT----C-TT-ATG-TA---T--ATAAACCT----AA-CAG-CT--C----AA-CT-GA---------ACTGTCGCACA-TTTGCA-----A-TCGATAATGCCCG----GACATTTCT----GAACGTTT-ACT--TAT-AT--A-
gi|93236                      :                                                                              tttcggggtaaaTCCA--TA--G-ATA-TTAC-------C---ACTGCGT---TATG-A--AGGAATATAA--CA--AGTTC-AG-------TA--GTAT----GA------------AT----
gi|93237                      :                         tcacgggatttaaacccggatctcatacTTGAATTC------AGAT-CGCTTGAGC--G-AC-AATTCA--CA--G-TTC-TAAC-------C---ACTGTGC---
gi|93238                      :                                            tcacggattTCGAACTCTA----A--T-CGCTCGAGC--G-AC-GATCCG--AA--G-ATC-TAAC-------A---ACT---C---TATGAT--GCAGACATAG--TAATAGATG-TT-------TA--GTAT-------------------T----CTTATA-G-T----T--G-----TT----AA-CCG-AT--A----AC-CC-CG---------GCTGTTGTCATTTTT--A-----A-TCTATGACTCACG----GAAAAT--A----GAAATTTT-ACG--GAT-TT--A-GC
gi|93239                      :                                           ttaccgagatTCAAACAC------AGAT-CAACTGAGT--G-AC-AATCGG--CA--G-A-A--AAC-------T---ACTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--A-AAGCTA----AA-CTG-TT--T----TC-TC-TG---------A-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCACA----GAAATTTCA----GTACGTTT-ACA--GAT-AT--A-ACTA
gi|93240                      :                                             tacaagatTCGAACCCGG----A--T-CGCATGGGC--G-AC-AATCGG--CG--G-ATG-TA
gi|93241                      :                                             tacgtgatTTGAACTCGG----A--T-CG-----------AC-AATTCC--CA--G-ATC-TAAC-------A---TCTGCGC---TATG-T--AGAAATATAA--CA--AGATC-GG-------TC--GTAT----AA------------AC----C-TG-A-A-T----T--T-A---------AA-CCG-CT--T----AC-CT-GA---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----TAATGTTTC----GAACGTTT-ACG--GAC-AA--A-ACttcattat
gi|93242                      :                                              acgggatTCGAAC-CAG-----GAT-CGCTGGAAT--C-AT-TATCCAAATA--A-ATA-TAAC-------C---ACTACGT---CATG-T--AGAAATATCT--CA--AAATC-GG-------AC--GTTT----AA------------AT----C--A-A-G-
gi|93243                      :                                                             acaggacGAT-CACCTGTAC--G-AC-ACTCCG--AA--G-TTC-TATC-------C---AAAATAC---AACA-T--AGGAATATCC--CA--TGATC-TA-------AT--GTATGTTTAA------------A--------A-A-A-A----T--G-TATTTT----AA-TTG-C-------------------------A-----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----AAAATTTCG----GAACGTTT-ACG--GAT-AT--A-GC
gi|93244                      :                                     acgagagttgaatcccTCGAAGCCGA----A--T-CGCCCGAGT--C-AT-CATCCA--TA--G-ATA-TAAC-------C---TCTTCGC---CATA-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-AT-------TC--GTAT----AA------------AT----G-TA-A-C-T----T--T-AAACTT----AA-
gi|93245                      :                                               caggaaTTGAACTCGG----A--T-CGCCCGGGC--G-AC-TATTAG--CT--G-ATA-CAAC-------C---TCTGC-----TATG-T--AGGAATATAA--CA--CGATC-AA-------CG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--T-AAACTT----AA-CCG-CT--T----AC-CC-AA---------G-----------ATT--A-----A-TCTGCGATGCATG----GACATTTTC----GGGCGTTT-ACA--GAT-AT--A-ACTA
gi|93246                      :                                                gggatTCGAACTCGG----A--T-TGCCCAAGT--C-AT-AATCCA--CA--G-ATA-TAAC-------C---ACTGAGA---TATG-T--GGGAATTTA
gi|93247                      :                                                gagatTCGAACTTGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AATTCG--GA--A-AGG-TAAC-------C---GGTGCGC---AATG-T--AGGGCTATAA--CA--AAATC-G---------G--GTA-----AA------------A-------CA-A-G-T----T--T-AAACTT----CA-CCG-CT--T----GC-TC-GG---------------------TTT--A-----A-TCGACGATGCTCG----GATATTTGC----GGACGTTT-ACG--GTT-AT--A-ATT
gi|93248                      :                                                                ggatGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AATCAG--CA--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTAT----GA--------------------TA-T-T-T----T--T-AAATTG----AA-T-----------------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-
gi|93249                      :                                                            gattcacgGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AATCAG--CA--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTAT----GA--------------------TA-T-T-T----T--T-AAATTG----AA-T-----------------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-gaagaca
gi|93250                      :                                             gattcacgTCGAACCC------AGAT-CGGCCTAT-----AT-AATCCA--TA--G-ATG-TCAT-------C---ACTACGC---CATG-C--AGAAATATAA--CA--AGATC-TG-------TC--GTAT----AA------------AT----T-TA-A-G-T----T--T-AAATTT----AA-CCA-CT--T----AC-TC-GG---------G-----------TGT--A-----A-TCGGCGATGAACG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACG--TAT-AT--A-ACTgaagaca
gi|93251                      :                                                      atAACTCGG----A--T-CGACCGAAC--A-AC-ACTCTA--CA--T-ATG-TAAG-------C---ACTGTTT---TATG-T--AGGACTATAT--CA--AGATC-TA-------TG--GTAT----AA------------CT----T-TA-A-A-C----T--G-AAATTT----AG-CCG-TT--T----TCACC-GA---------G-----------TTT----------TT-ATGATGCCCA----GAAATATCC----GGATGTTT-ACG--GAT-AT--A-ACT
gi|93252                      :                                                 tttaTCGAACTCG-------ATTCGCCCGAGC--G-AT-AATCCA--CA--T-ATT-TAAC-------T---TCTGCGC---TATA-T--ATGAATATAA--CA--AGATC-GG-------CA--GTAT----CA------------AT----C-T------T----------AACTT----AA-TCG-CT--T----TC-C-------------A-----------TTTA-A-----A-TCGATGATGCCCG----AAAATTTCT----GAACGTTT-TCG--GAT-A
gi|93253                      :                                                    tTCAAACTCTG----A--T-CTCTCAGCC--G-AC-AATCCT--CA--G-ATC-TAAC-------C---ACTACGG---TTTG-T--GGGAATTTAA--CA--ACAGC-GG-------TG--GAAG----AA------------AT----TATA-A-C-T----T--T-TAATAA----AA-TCG-CT--T----AC-CC-GG---------G-----------TCT--A-----A-TCAATGATTCCCG----GAAATTTCC----CGACTCTT-ACG--GTT-AT--A-AC
gi|93254                      :                                                                         GCCAGAGT--T-AT-AATCCA--AA--G-ATA-TGAC-------C---ACTATGC---TAT-------------------------C-AG-------CC--ATAT----AA------------AT----C-TTTA-G-T----T--T-AACCTT----TA-TCA-CA--T----AC-TC-AG---------G-----------TTA--A-----A-TCAATGATGGCTG----GAAATTTCC----CCACATTT-AC
gi|93255                      :                                                     gagttcagtg----AAAT-TGACCAAGC--A-TC-AACTCG--CG--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGT---TATA-T--AGGAATATAT--CC--AGATT-GG-------CA--GTAT----AA------------AT----CTTA-A-G-T----T--G-AAACAC----CA-TCA-CT--A----AC-CA-GG---------A-----------TTT--A-----A-T---TGATGCCCA----GTAATTGCC----GGACGTTT-ATA--GAT-AT--A-ACTA
gi|93256                      :                                                                      T-CGACAGAGC--G-TC-CATCCG--CA--G-ATA-TAAC-------C---ATAGTGC---TATG-T--CGAAATATAT--CA--TGATC-GG-------CA--GTAT---------------------------------------------------------CG-TT--T----AC-CG-AG---------A-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACG--GAT-AC--A-ACTA
gi|93257                      :                                                                      T-CGACCGAGC--G-AT-AATCCG--CA--A-ATA-TAAC-----------AT----C---TATG-C--AGGAATATGC--CG--AGATC-G--------CG--TTAT----AA------------AT----C-TT-T-G-T----T--G-AAACTT----AC-CCG-CT--T----TC-CC-GG---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATTCTCG----GGAAATTCC----GG
gi|93258                      :                                                                             GAGC--C-AT-AATCCA--C---G-ATG-TAAC-------C---ACTGTGC---CGTG-C--AGGAATAAAG--CA--TGAAC-GT-------CG--GTAT----AA------------GT----T-TC-A-T-T----T--T-CAACTT----AA-CAG-CT--T----AC-TC-GG---------G-----------TGT--A-----A-TCGGTGATGCCCG----CAGAATTCC----AAACGTTT-ACG--TAT-AT--C-ACT
gi|93259                      :                                                                              AGC--G-AC-AATCAG--CA--G-TTC-TAAC-------CC--ACTGCGT---TGCA-T--AGAAATATTC--CA--AAGTG-GA-------TG--GCA-----AA------------AT------TA-T-G-T----TTAT-AAACCT----AA-CCG-CT--C----CC-CA-GGCTGTCGTGTAT----------TTT--A-----A-TCGCTGATGCTCT----GAAATTTTC----GAACGTCT-ACG--GAT-AT--A-GC
gi|93260                      :                                                                                C--G-AC-ATTTCG--CA--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-A--AGGAATATAT--CA--AGATC-TG-------TG--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--G-AAACTT----AA-CTG-CT--T----AC-CC-GG---------A-----------TTT--A-----A-TCAGTGATACCTG----GAAATTTTC----GGACGCTT-GTG--GAT-GG--A-ATTA
gi|93261                      :                                                                                         ATCAA--TA--G-ATA-TAAC-------C---TCTAC-C---CCT---------ATATAA--CA--ATATC-TG-------AC--GTAT----AA------------CT----C-TA-A-C-T----T--T-AAACTC----AA-CCG-CA--T----AC-AT-GT---------G-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACC----GAACGTTT-ACG--CAT-A---A-AC
gi|93262                      :                                                                                         ATCAA--TA--G-ATA-TAAC-------CTCGACCAC-C---CAT---------ATATAA--CA--ATATCTGA-------C----TTT----AA------------AT-------A-A-C-T----T--T-AAACTC----AA-CCG-TA--T----AC-AC-GT---------G-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACA----GAACGTTT-GCG--CAT-AT--A-
gi|93263                      :                                                                                                                               C---TATG-C--AGGAATGTAA--AA--AGATC-AG-------TG--GAAT----AA------------AT----C-TA-A-A-T----T--T-TATCTC----AA-CTG-CT--A----AC-AA-GA---------G-----------CTT--A-----A-T
gi|93264                      :                                                                            aataggtatgaccagaataagttaa-ATT-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--AGGAATATCA--AA--AGACC-GG-------AC--GTAT----AA------------TT----C-TA-A-T-T----T--T-AAACTC----AA-CCA-CT--T----AC-TC-TG---------G-----------TTT--A-----T-TTGATGATGCCTG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACG--GAT-AA--A-ACT
gi|93265                      :                                                                                                     -ATA-TAAA-------T---ATTATGT---TAGG-C--AGAAATATAT--AA--AGATC-AG-------TGTTATAT----AT------------AT----A-TA-A-G-T----T--G-AAACCT----AA-CCG-TT--T----TT-CC-GG---------A-----------TTT--A-----A-TTGATAATGGCCA----GAATGATCC----GGGCGTTC-AC
gi|93266                      :                                                                                                                                                                               TGT----AG------------AC----C-TA-T-G-TCTTAT--A-AAAAAT----AA-CCG-AT--T----AC-CC-GG---------G-----------TTT--AGTGAGA-TTAATATTGCCCG----GAAATTTCT----TCACATTT-ACA--GAT-GT--A-ACaactacgatat
gi|93267                      :                                                            atataattgtcatgaaatgttgatgtactaacatctttgagttTA-TAAC-------C---ATTGTAGGAATATA-TCAAGGAATATAT--CA--AGAAC-TG-------CG--GTAT----AA------------AT----A-TA-A-G-T----T--T-AAACTT----AA-CAG-AT--T----AC-CC-GA---------A-----------ATT--A-----A-TCAGTGATACCCG----GAAATTTCC----TGACGTTT-ACA--GAA-AT--A-ACTA
gi|93268                      :                                                                                                       TA-TAAC-------C---ACTATGC---TAAG-G--AGGAATATAT--CA--TG-T---G-------TA--GTAT----AA------------AT----C-TA-A-G-T----T--G-AA--------AA-CC--CT--C----TC-CC-GG---------A-----------TTT--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTA-ACG---AC-AT--A-ACTA
gi|93269                      :                                                                                                        A-TAGC-------C---GCTAAGC---CACT-A--AGGAACAAATA-CA--A-ATT-GG-------TG--GTAT----AA------------AT----C-GG-A-G-T----T--G-AAAATA----AT-CCT-CT--T----AC-AC-GA---------A-----------TTT--A-----A-TCTATGATGCCTG----GAAATTTAC----GGACATTT-ACA--CAT-GT--A-ACTA
gi|93270                      :                                                                                                              -------C---ATTGCGC---TATG-T--AGCAATATAA--CA--AATCC-TG-------CC--GTAT----TA------------AT----C-TA-A-C-T----T--T-AATCTT----AA-CCA-CT--T----TC-TC-GG---------A-----------ATT--A-----A-CCGATGATGCCTG----AAAATTTTC----GAACATGT-ACG--GAT-AT--A-ACT
gi|93271                      :                                                                                                                                             GAATATTA--CA--AGATC-AG-------CG--GTAT----AATTAGTTACAGTTATAAAAC-TA-A-T-T----T--T-AAATTT----AA-CCG-CT--T----AC-CC-GG---------G-----------CT---------G-TCGAATTTACTCC----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACG--GAT-GT--A-
gi|93272                      :                                                                                                                                                        A--AGATC-AG-------CA--GTAT----AG------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CCT-CA--T----AT-CC-GA---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATGACTG----GAAATATCA----AGACGTAT-AC
gi|93273                      :                                                                                                                                                     ataA--AGATC-TG-------CC--TTAT----AC------------AT----C-AA-A-G-T----T--T-GAACTT--------TG-T------------C-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGAAAATGCCCGAAAGGAAATTTCC----GAACGTTT-ATG--GATGAT--A-AC
gi|93274                      :                                                                                                                                                                               TAT----AA------------ATAT--C-TT-A-T-T----T--T-AAGCTT----AA-CCG-CA--T----AC-GC-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGAGGCCCG----GAAATTTCC----AGACGTTA-CCG--GAT-AT--A-AC
gi|93275                      :                                                                                                                                                                                       A------------AT----C-TA-C-G-T----T--T-TAAGTT----AA-CCG-CT--T----AC-TC-GG---------T-----------TTT--T-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACA--GAT-AT--A-ACT
gi|93276                      :                                                                                                                                                                                        ------------AT----C-TT-A-C-T----T--G-AAAATT----AAACCG-CT--T----AC-GC-GG---------G-----------TTA--A-----A-TGGATGAT-CCCG----GAAACTTCA----CGAGGTTT-ACG--GAT-AT--A-
gi|93277                      :                                                                                                                                                                                                      ----C-TA-T-G-C----T--G-AAACTT----AA-CCG-CT--T----AT-CC-GA---------G-----------TTT--A-----A-T---------CTG----GAAATGTCC----GGAAGTTT-ACG--GAT-TA--A-ACTA
gi|93278                      :                                                                                                                                                                                                                -G-T----T--G-AAACTC----AA-CCG-GT--TGTAAAC-CC-GG---------A-----------TT---A-----A-TCGATGATATCCG----GAAATGTTC----AAACGTTT-TCG--AAT-AT--G-A
gi|93279                      :                                                                                                                                                                                                                              AACTT----AA-CTT-AT--T----AC-TC-GG---------G-----------TTT--A-----A-TCGATGCTACTCG----GTAATTTCC----GAATG
gi|93280                      :                                                                                                                                                                                                                                 TT----AA-CCG-CT--T----AC-CC-GG---------G-----------TGT--A-----A-TCGATGCTGTCCA----GAAATTTCC----GGACGATT-TCG--GAT-AT--A-ACTagattatatacta
gi|93281                      :                                                                                                                                                                                                                               atTT----AA-CCA-CT--T----AC-CT-GG---------A-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACG--GAT-AT--A-ACTA
gi|93282                      :                                                                                                                                                                                                                                                           C-GG---------A-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCGG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AAT--GAT-AT--A-ACTA
gi|93283                      :                                                                                                                                                                                                                                                               ---------A-----------TTTTAA-----A-TCGATGATATCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ATG--GAT-AC--A-
gi|93284                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         -----------TTT--C-----A-TCGATGATGCCCG----GAAGTTTCC----GAACGTTT-ACG--ATT-AT--A-
gi|93285                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         -----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACG--GAT-AT--A-
gi|93286                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         -----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCTG----GAAATTTCC----GAATGTTT-ACA--GAT-A
gi|93287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGATGCCCA----GAAATTTTC----GAACGTTG-ACG--GAT-AT--A-





Alignments
lowQualScore                  :                               3333333333333333333333                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                  33         4 1111111111111111111111 0  2      1111  0   1111   00 11111 00 0   0    3333333 111   0   111    0 00         222  00     0  88888888888      333333333333  2222 1  1 111 3333 44 00     2222  0   0 111 00 1111  0  0   77777777777   11 11111 1             1111         1111        0    00  0  00 0    
lowQualScore                  :                  ..         . ...................... .  .      ....  .   ....   .. ..... .. .   .    ....... ...   .   ...    . ..         ...  ..     .  ...........      ............  .... .  . ... .... .. ..     ....  .   . ... .. ....  .  .   ...........   .. ..... .             ....         ....        .    ..  .  .. .    
lowQualScore                  :                  11         4 9999999999999999999999 8  3      3333  7   5555   99 77777 99 7   6    2222222 777   7   111    6 99         777  88     6  00000000000      000000000000  0000 8  2 555 1111 66 88     0000  6   6 000 88 2222  6  6   66666666666   33 44444 1             2222         2222        6    99  7  99 7    
consensus                     :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
Reference ( family-347 )      :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93205                      :             TTACG--GGATTCGAA-CTCGG-T----------------T-CGACTTAGT--G-AC-AGT----TCT--C-----A--G-ATA-TAAT-------C---ACTATGC---TATG-T--AGGAATATAT--CA--GGATC-GG-------GG--ATATAA------------AA----C-TT-A-G-T----TG-A--AACTT----AA-CAG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTA--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAAATATC----GGACGTTTAACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93206                      :             TTACG--GGATTCGAAATCTGG-TCGAACTCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AAT----CTG--C-----A--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--ATATT----AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACAT--AT-AT--T-ACTA
gi|93207                      :             TTACG--GGATTCGAAATCTGG-TCGAACCCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AAT----CTG--C-----A--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--ATATT----AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGATT-ACAT--AT-AT--T-ACTA
gi|93208                      :                                   -TTGAACTC------AGAT-CGACCGAGC--A-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCTC---TAT---------ATGTAT--TA--AGATT-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AACTT----AA-CTG-C---T--T----AC-CC-AAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCC----AGATGATT-TTGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93209                      :    ttaaaggatTTGCG--GGATTCGAA-CTT-----------------AGAT-CGATCGAGC--G-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAT-------T---ACTGTCT---TATA-C--AGGAATATAT--CA--AGTTC-GA-------CG--GTAAAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AATTA----AA-CCGCC---T--T----TC-CC-GAA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCGCA----GAAATTTCC----AGACGTTT-ACGG--AT-ACTAA-ACTA
gi|93210                      :             TTACG--GGATTCAAA-C-----------TC------AGAT-CGACTCAGT--G-AC-AAT----CGA--C-----A--G-ATA-AAAC-------T---ACTATGT---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AAGTA----AA-CCG-T---T--T----TC-TC-GGA-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCCCA----GAAGTTT-C----AGTTTTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93211                      :             TTACA--GGATTCGAA-C--------AACTTGG----A--T-CGACTGAGC--G-AC-TTT----CCG--C-----A--G-GTA-TCACTTATGGCC---ACTATGC---TATG-T--AAGGATATAT--CA--AGATC-AA-------GA--GTATAA------------AT----C-TT-A-G-T----TG-A--AACTT----CA-CCG-C---T--T----AC-CG-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCTG----GAAATTTCT----GGACATTT-ACGA--AT-AT--A-A
gi|93212                      :                                   -TCAAACTTGG----A--T-CGACTGAGT--G-AC-AAT----CGA--C-----A--G-AAA-AAAC-------C---ATTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-GG-------CA--ATATAA------------AT----C-TA-A-G-TAAGTTG-A--AGCTT----AA-CCA-T---T--T----TC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCCA----GAAATTTCA----GTATATTT-ACAG--AT-AT--A-ATTA
gi|93213                      :                          ttatgggtt-TCGAACTCGG----A--T-CGCCCTAGC--G-AT-TAT----CCA--C-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTACGT---AAT--T--GAGAATATAA--CA--CGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACAT----AA-CCG-A---C--T----AC-CC-GG------------TTT--A-----A-TCGCTGATATCAG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AGGG--AT-AT--A-ACCA
gi|93214                      :    tcatgggatTTACG--GGATACGAA-ACAGG-----------------AT-TGCCTGAGT--C-AT-AAT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---CCTGTGC---CATG-C--AGGAATATAA--CA--TGATC-TG-------TT--GTATAA------------AT----C-TA-A-GTT----TT-A--AACTT----TA-CTA-C---T--T----AC-CT-GGG-----------TTT--A-----A-TCAATGACGCCTG----GAAATTTCC----AAATGTTT-ACAG--A
gi|93215                      :             TTACG--GGATTCAAA-CT---------CT--------GAT-CGACCGAGT--G-AT-AAT----GCG--C-----A--G-AAAACAACACC----C---ATTAGTC---TGTG-T--ATAAATATAT--CA--AGAAT-GG-------CT--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AAGTA----AA-CCA-C---T--T----GC-AC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGACGATGCCCT----AAAATTTTC----GGACGTTT-ATTG--AT-AT--A-ACTA
gi|93216                      :             TTACG--GGTTTCGAA-C-TGG----------------GAT-CGACCGAACTTG-AC-AAT----TCG--C-----A--G-ATA-TTAT-------C---ACTATGC---TATG-T--GGAGATATAT--CA--AGATC-AA-------TA--GTATAA------------AA----C-AA-A-G-T----TG-A--AACAT----AA-CCG-T---T--T----AC-CT-GGA-----------TGT--T-----A-TCGATGGTGCCAT----GAAATTTCCGCCGGGATGTTT-ACAG--
gi|93217                      :             TCACG--GGATTCGAA-CCTGG-----------------AT-CGTTTGAGC--C-AT-AAT----TAA--T-----A--G-TTC-AAAT-------C---ACTGTTC---AATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-CG-------TA--GTATTA------------AC----C-TA-A-A-T----T--A--TACTT----AA-ACG-T---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACCTTT-ACTG--AT-AT--A-ACT
gi|93218                      :                                   -TCGAACCCGG----A--T-CGCCTGAAT--C-AT-AAT----AGA--C-----A--G-ATA-AAAT-------C---ACTGTGC---CATG-C--AGGAATATATTTCA--AGTTC-TT-------CT--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CCT-C---T--T----GC-TT-CGG-----------TTT--A-----A-TCAATGATGCCAG----AAAATTTCT----AAATGTTT-ACCA--AT-AT--A-A
gi|93219                      :                          tcacaggac-TCGAACTCGG----ATA---AACCGAGT--A-AC-AGT----CCA--C-----A--TTACA-TAAC-------C---ACTATGT---CATG-T--AGGAATACAT--CA--ATATC-GA-------CG--GTATAA------------AC----C-TA-A-G-T----TG-A---------------------------------------------------TT--A-----A-TCGATGATGCCCA----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ATTA
gi|93220                      :                          ttatgagat-TTGAACTCA-----AGAT-TTCCCTAGC--G-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TGAC-------A---ACTGCGC---TATG-T--A-------AC--AA--AGATC-GT-------CC--CTATAA------------AT----C-TC-A-A-T----TT-A--AACTT----AA-CTG-T---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATCCCCG----G-AATTTCC----GTACGTTT-ACGC--AT-AT--A-AC
gi|93221                      :    tcacgagatTCACA--GGATTCGAA-CTTG--------T---------AT-CAACCAAGT--G-TC-AAT----TCA--A-----A--G-ATA-TGAA-------T---ACTATGC---TATG-T--AAGGA---AA--AA--TGATC-GG-------AG--GTATGA-------------T----C-TA-A-G-T----T--------------AA-TCG-T---T--T----AC-TG-GGA-----------TTT--A-----A-GCGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTT-ACTG--AT-AT--A-A
gi|93222                      :                                   -TCGAACTAGG----AAA---GGCCGAGC--G-AT-AAC----TCG--C-----A--G-GTA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-T--GTGAATATAT--CA--ATTTC-GG-------CG--GTATAA------------AG----C-T--------------------TT---------G-C---T--T----AC-CT-GAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCT----GACTTTTCT----GCTCGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93223                      :                          ttacaggat-TCGATCTCGG----A--T-CGACCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATC-TAAC-------C---ATTATGC---TTTG-T--ACAAATATAA--CA--AGATT-GC-------CG--GTTTGA------------AA----T-GA-T-G-T----TG-A--AACTT----AA-TTG-T---T--C----AC-TT--GA-----------TGT--A-----A-TCGATGATGCCCG----AAATTTTCC----GGACATT
gi|93224                      :    ttaaaggatTCACA--GGATTCAAA-CCTGG-----------------AT-AGCCCGAGT--C-AT-AAT----CCA--T-----ATAG-ATG-TTAC-------C---ACTGTGC---CATT-C--AGGAATTAAA--CA--AGATC-CG-------AC--ATATAA------------AC----C-TA-A-G-T----TT-A--ATCTT----AG-CAG-C---T--T----AC-TC-AGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAA----GAAATTTCT----GTATGTGT-ACAG--AT-AT--A-
gi|93225                      :                                      GAACTCGG----A--T-CGACAGAGC--G-AC-ACT----CCA--C-----A--A-ATT-TATC-------C---ACTATGA---TATG-A--AGAAATATAT--TG--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AACTTTA--AA-TCG-T---CGAT----AA-CC-GG
gi|93226                      :  ttacgagatgaTCACA--GGATTCAAT-CCTGG-----------------AT-TGCCTGAGT--C-AA-AATATAACCA--CTATACA--T-GTA-TAAC-------C---ACTTCGC---CATG-C--AGGAATAAAA--CA--AGATT-GG-------TC--GTATAA------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CGG-C---A--T----AC-TC-CGG-----------ATT--A-----A-TTGACGATGCCCG----GAAATTTCC----GAATGTTA-ACGATTAT-AT--ATACTAa
gi|93227                      :                                   -TTGAACCC------AGAT-CGCCGGTGT--C-AT-AAT----CCA--T-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--CAGAATATCA--CA--AGATT-GA-------CC--TTATAA------------AT----A-TA-A-G-A----TC-A--AATTT----AA-CTG-C---T--T----AC-TCAAGA-----------CTT--A-----A-TCGATGATGCTTG----GAAAT
gi|93228                      :                          tcacgggtt-TCGAACTC------AAAT-CAACCGAGT--TTAC-AAC----TTG--G-----A--G-GTT-TAAC-------A---ACTCCGC---CATG-T--ACGA-TATAA--TA--AGATA-TG-------TA--GTATGA------------GT----C-TA-A---------------ACTT----AA-CCA-C---T--T----AT-CC-GGA-----------CTG--T-----G-TCGATGACTTCCG----GAAATTTCA----GAACGTTT-ACTG--AT-AT--A-A
gi|93229                      :     ttacggatTCACG--AAATTCGAG-CCTGG-----------------AT-TGCCCGAGT--C-AT-AAT----CCA--T-----T--T-ACA-AAAC-------C---ACT--------ATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-GA-------TC--GTATAA------------AT----A-AA-AAG-T----TT-A--AACAT----AG-CCG-A---T--T----AT-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TATATGATGCCAA----GAAATTTCC----
gi|93230                      :                                                   GGT-CGCCCGAAT--C-AT-AAT----CAA--T-----A--G-ATG-TTAT-------T---ACTGCAC---CGTG-C--AGGAATAAAA--CA--GTAAC-GT-------TT--GTATAA------------AT----C-TT-A-A-T----T--------TT----AA-TCG-T---T--T----AC-TG-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCT----GATATTCAC----TAACGTTT-ACGG--AT-AA--A-ACT
gi|93231                      :                 tcacgtgaatagaatctg-TCGAACTCGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AAT----TCG--T-----T--G-ATC-TA-C-------C---ACTGCGC---TGTA-T--AGGAATATAA--CA--AGATC-GT-------CG--GTATA
gi|93232                      :                             tcaccggatGAACTC------AGAT-TAACCAAGT--G-GC-AAT----CTG--T-----A--G-ATA-TAAC-------T---AATCTAC---TATA-T--AGGAATATAT--CA--AGATC-AG-------TC--ATAT-A------------AT----C-TA-A-
gi|93233                      :  ttattggattgTTACGCAGGATTCAAA-CTAGGATCG--CTCGG----A--T-C------------AT-AAT----CTA--T-----A--T-ATA-TGAC-------T---ACTACGC---CATG-A--AGGAATATCC--CA--ACATC-GG-------CC--GTTTAA------------AT----C-TA-A-A-C----TT-A--AACGT----A------------------AC-CC-ATG-----------TTT--A-----A-TCG-TAATTTCCG----AAA
gi|93234                      :                                   -TCCAAATCGG----A--T-CGCCATAGT--C-AT-AAT----CTA--T-----A--A-CTG-TAAC-------C---TATGCGC---CATG-C--AGGAATATAA--GA--AG-TC-GGT------CC--ATGTAA------------AT----T-TA-A-C-T----TT-C--AGCTTTCAAAA-CCT-C---A--T----AC-TC-TGG-----------TTT--C-----A-TCAATGATGATTG----GAATTTTAT----ATAAATAC-ATGG--AT-AC--A-ACTA
gi|93235                      :                              tcacgtgatAACTC------AGAT-CGCCCGAAC--G-ATTAAT----C-G--C-----A--G-CTC-GAAC-------C---ATTGCAC---CAAT-C--AGTAATATTA--GA--AAGTC-AG-------TG----ATAG------------GT----C-TT-ATG-TA---TATA--AACCT----AA-CAG-C---T--C----AA-CT-GAACTGTCGCACA-TTTGCA-----A-TCGATAATGCCCG----GACATTTCT----GAACGTTT-ACTT--AT-AT--A-
gi|93236                      : tttcggggtaaaTCACG--GGATTTAAA-CCCGG----ATCTC------------------------AT-ACT----CCA--T-----A--G-ATA-TTAC-------C---ACTGCGT---TATG-A--AGGAATATAA--CA--AGTTC-AG-------TA--GTATGA------------AT----
gi|93237                      :                                   -TTGAATTC------AGAT-CGCTTGAGC--G-AC-AAT----TCA--C-----A--G-TTC-TAAC-------C---ACTGTGC---
gi|93238                      :                          tcacggatt-TCGAACTCTA----A--T-CGCTCGAGC--G-AC-GAT----CCG--A-----A--G-ATC-TAAC-------A---ACT---C---TATGAT--GCAGACATAG--TAATAGATG-TT-------TA--GTAT---------------T----CTTATA-G-T----TG-------TT----AA-CCG-A---T--A----AC-CC-CGGCTGTTGTCATTTTT--A-----A-TCTATGACTCACG----GAAAAT--A----GAAATTTT-ACGG--AT-TT--A-GC
gi|93239                      :                         ttaccgagat-TCAAACAC------AGAT-CAACTGAGT--G-AC-AAT----CGG--C-----A--G-A-A--AAC-------T---ACTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AGCTA----AA-CTG-T---T--T----TC-TC-TGA-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCACA----GAAATTTCA----GTACGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93240                      :      tacaagatTACG--TGATTCGAA-CCCGG-----------------AT-CGCATGGGC--G-AC-AAT----CGG--C-----G--G-ATG-TA
gi|93241                      :                                   -TTGAACTCGG----A--T-CG-----------AC-AAT----TCC--C-----A--G-ATC-TAAC-------A---TCTGCGC---TATG-T--AGAAATATAA--CA--AGATC-GG-------TC--GTATAA------------AC----C-TG-A-A-T----TT-A-----------AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GAG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----TAATGTTTC----GAACGTTT-ACGG--AC-AA--A-ACttcattat
gi|93242                      :        acgggatACA--GGACTCGAA-CCAGGATCG--CT-GG----A-AT-CATT-------------AT----CCAAAT-----A--A-ATA-TAAC-------C---ACTACGT---CATG-T--AGAAATATCT--CA--AAATC-GG-------AC--GTTTAA------------AT----C--A-A-G-
gi|93243                      :                                                   GAT-CACCTGTAC--G-AC-ACT----CCG--A-----A--G-TTC-TATC-------C---AAAATAC---AACA-T--AGGAATATCC--CA--TGATC-----------------TAA-------------T----G-TA-T-G-T----TT-A--AAA------AA-ATG-TATTT--T----AA-TT-GCA-----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----AAAATTTCG----GAACGTTT-ACGG--AT-AT--A-GC
gi|93244                      :                   acgagagttgaatccc-TCGAAGCCGA----A--T-CGCCCGAGT--C-AT-CAT----CCA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---TCTTCGC---CATA-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-AT-------TC--GTATAA------------AT----G-TA-A-C-T----TT-A--AACTT----AA-
gi|93245                      :                             caggaa-TTGAACTCGG----A--T-CGCCCGGGC--G-AC-TAT----TAG--C-----T--G-ATA-CAAC-------C---TCTGC-----TATG-T--AGGAATATAA--CA--CGATC-AA-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-AAG-----------ATT--A-----A-TCTGCGATGCATG----GACATTTTC----GGGCGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93246                      :                              gggat-TCGAACTCGG----A--T-TGCCCAAGT--C-AT-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGAGA---TATG-T--GGGAATTTA
gi|93247                      :                              gagat-TCGAACTTGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AAT----TCG--G-----A--A-AGG-TAAC-------C---GGTGCGC---AATG-T--AGGGCTATAA--CA--AAATC-G---------G--GTA-AA------------A-------CA-A-G-T----TT-A--AACTT----CA-CCG-C---T--T----GC-TC--GG-----------TTT--A-----A-TCGACGATGCTCG----GATATTTGC----GGACGTTT-ACGG--TT-AT--A-ATT
gi|93248                      :                                               ggatGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTATGA--------------------TA-T-T-T----TT-A--AATTG----AA-T-----------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-
gi|93249                      :                                           gattcacgGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTATGA--------------------TA-T-T-T----TT-A--AATTG----AA-T-----------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-gaagaca
gi|93250                      :                           gattcacg-TCGAACCC------AGAT-CGGCCTAT-----AT-AAT----CCA--T-----A--G-ATG-TCAT-------C---ACTACGC---CATG-C--AGAAATATAA--CA--AGATC-TG-------TC--GTATAA------------AT----T-TA-A-G-T----TT-A--AATTT----AA-CCA-C---T--T----AC-TC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGGCGATGAACG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACGT--AT-AT--A-ACTgaagaca
gi|93251                      :                                     atAACTCGG----A--T-CGACCGAAC--A-AC-ACT----CTA--C-----A--T-ATG-TAAG-------C---ACTGTTT---TATG-T--AGGACTATAT--CA--AGATC-TA-------TG--GTATAA------------CT----T-TA-A-A-C----TG-A--AATTT----AG-CCG-T---T--T----TCACC-GAG-----------TTT----------TT-ATGATGCCCA----GAAATATCC----GGATGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACT
gi|93252                      :                               ttta-TCGAACTCG-------ATTCGCCCGAGC--G-AT-AAT----CCA--C-----A--T-ATT-TAAC-------T---TCTGCGC---TATA-T--ATGAATATAA--CA--AGATC-GG-------CA--GTATCA------------AT----C-T------T----------AACTT----AA-TCG-C---T--T----TC-C----A-----------TTTA-A-----A-TCGATGATGCCCG----AAAATTTCT----GAACGTTT-TCGG--AT-A
gi|93253                      :                                  t-TCAAACTCTG----A--T-CTCTCAGCC--G-AC-AAT----CCT--C-----A--G-ATC-TAAC-------C---ACTACGG---TTTG-T--GGGAATTTAA--CA--ACAGC-GG-------TG--GAAGAA------------AT----TATA-A-C-T----TT-T--AATAA----AA-TCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TCT--A-----A-TCAATGATTCCCG----GAAATTTCC----CGACTCTT-ACGG--TT-AT--A-AC
gi|93254                      :                                                        GCCAGAGT--T-AT-AAT----CCA--A-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTATGC---TAT-------------------------C-AG-------CC--ATATAA------------AT----C-TTTA-G-T----TT-A--ACCTT----TA-TCA-C---A--T----AC-TC-AGG-----------TTA--A-----A-TCAATGATGGCTG----GAAATTTCC----CCACATTT-AC
gi|93255                      :                                    gagttcagtg----AAAT-TGACCAAGC--A-TC-AAC----TCG--C-----G--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGT---TATA-T--AGGAATATAT--CC--AGATT-GG-------CA--GTATAA------------AT----CTTA-A-G-T----TG-A--AACAC----CA-TCA-C---T--A----AC-CA-GGA-----------TTT--A-----A-T---TGATGCCCA----GTAATTGCC----GGACGTTT-ATAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93256                      :                                                     T-CGACAGAGC--G-TC-CAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ATAGTGC---TATG-T--CGAAATATAT--CA--TGATC-GG-------CA--GTAT-----------------------------------------------------CG-T---T--T----AC-CG-AGA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACGG--AT-AC--A-ACTA
gi|93257                      :                                                     T-CGACCGAGC--G-AT-AAT----CCG--C-----A--A-ATA-TAAC-----------AT----C---TATG-C--AGGAATATGC--CG--AGATC-G--------CG--TTATAA------------AT----C-TT-T-G-T----TG-A--AACTT----AC-CCG-C---T--T----TC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATTCTCG----GGAAATTCC----GG
gi|93258                      :                                                            GAGC--C-AT-AAT----CCA--C--------G-ATG-TAAC-------C---ACTGTGC---CGTG-C--AGGAATAAAG--CA--TGAAC-GT-------CG--GTATAA------------GT----T-TC-A-T-T----TT-C--AACTT----AA-CAG-C---T--T----AC-TC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGGTGATGCCCG----CAGAATTCC----AAACGTTT-ACGT--AT-AT--C-ACT
gi|93259                      :                                                             AGC--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-TTC-TAAC-------CC--ACTGCGT---TGCA-T--AGAAATATTC--CA--AAGTG-GA-------TG--GCA-AA------------AT------TA-T-G-T----TT-ATAAACCT----AA-CCG-C---T--C-----C-CC-AGGCTGTCGTGTATTTT--A-----A-TCGCTGATGCTCT----GAAATTTTC----GAACGTCT-ACGG--AT-AT--A-GC
gi|93260                      :                                                               C--G-AC-ATT----TCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-A--AGGAATATAT--CA--AGATC-TG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AACTT----AA-CTG-C---T--T----AC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TCAGTGATACCTG----GAAATTTTC----GGACGCTT-GTGG--AT-GG--A-ATTA
gi|93261                      :                                                                        AT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---TCTAC-C---CCT---------ATATAA--CA--ATATC-TG-------AC--GTATAA------------CT----C-TA-A-C-T----TT-A--AACTC----AA-CCG-C---A--T----AC-AT-GTG-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACC----GAACGTTT-ACGC--AT-A---A-AC
gi|93262                      :                                                                        AT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------CTCGACCAC-C---CAT---------ATATAA--CA--ATATCTGA-------C----TTTAA------------AT-------A-A-C-T----TT-A--AACTC----AA-CCG-T---A--T----AC-AC-GTG-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACA----GAACGTTT-GCGC--AT-AT--A-
gi|93263                      :                                                                                                                       C---TATG-C--AGGAATGTAA--AA--AGATC-AG-------TG--GAATAA------------AT----C-TA-A-A-T----TT-T--ATCTC----AA-CTG-C---T--A----AC-AA-GAG-----------CTT--A-----A-T
gi|93264                      :                                                                    aataggtatgaccagaataagttaa-ATT-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--AGGAATATCA--AA--AGACC-GG-------AC--GTATAA------------TT----C-TA-A-T-T----TT-A--AACTC----AA-CCA-C---T--T----AC-TC-TGG-----------TTT--A-----T-TTGATGATGCCTG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACGG--AT-AA--A-ACT
gi|93265                      :                                                                                             -ATA-TAAA-------T---ATTATGT---TAGG-C--AGAAATATAT--AA--AGATC-AG-------TGTTATATAT------------AT----A-TA-A-G-T----TG-A--AACCT----AA-CCG-T---T--T----TT-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGATAATGGCCA----GAATGATCC----GGGCGTTC-AC
gi|93266                      :                                                                                                                                                                       TGTAG------------AC----C-TA-T-G-TCTTATA-A--AAAAT----AA-CCG-A---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--AGTGAGA-TTAATATTGCCCG----GAAATTTCT----TCACATTT-ACAG--AT-GT--A-ACaactacgatat
gi|93267                      :                                                    atataattgtcatgaaatgttgatgtactaacatctttgagttTA-TAAC-------C---ATTGTAGGAATATA-TCAAGGAATATAT--CA--AGAAC-TG-------CG--GTATAA------------AT----A-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CAG-A---T--T----AC-CC-GAA-----------ATT--A-----A-TCAGTGATACCCG----GAAATTTCC----TGACGTTT-ACAG--AA-AT--A-ACTA
gi|93268                      :                                                                                               TA-TAAC-------C---ACTATGC---TAAG-G--AGGAATATAT--CA--TG-T---G-------TA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AA--------A-CC--C---T--C----TC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTA-AC-G--AC-AT--A-ACTA
gi|93269                      :                                                                                                A-TAGC-------C---GCTAAGC---CACT-A--AGGAACAAATA-CA--A-ATT-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-GG-A-G-T----TG-A--AAATA----AT-CCT-C---T--T----AC-AC-GAA-----------TTT--A-----A-TCTATGATGCCTG----GAAATTTAC----GGACATTT-ACAC--AT-GT--A-ACTA
gi|93270                      :                                                                                                      -------C---ATTGCGC---TATG-T--AGCAATATAA--CA--AATCC-TG-------CC--GTATTA------------AT----C-TA-A-C-T----TT-A--ATCTT----AA-CCA-C---T--T----TC-TC-GGA-----------ATT--A-----A-CCGATGATGCCTG----AAAATTTTC----GAACATGT-ACGG--AT-AT--A-ACT
gi|93271                      :                                                                                                                                     GAATATTA--CA--AGATC-AG-------CG--GTATAATTAGTTACAGTTATAAAAC-TA-A-T-T----TT-A--AATTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------CT---------G-TCGAATTTACTCC----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACGG--AT-GT--A-
gi|93272                      :                                                                                                                                                A--AGATC-AG-------CA--GTATAG------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CCT-C---A--T----AT-CC-GAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGACTG----GAAATATCA----AGACGTAT-AC
gi|93273                      :                                                                                                                                             ataA--AGATC-TG-------CC--TTATAC------------AT----C-AA-A-G-T----TT-G--AACTT--------TG-T---------------C-GGG-----------TTT--A-----A-TCGAAAATGCCCGAAAGGAAATTTCC----GAACGTTT-ATGG--ATGAT--A-AC
gi|93274                      :                                                                                                                                                                       TATAA------------ATAT--C-TT-A-T-T----TT-A--AGCTT----AA-CCG-C---A--T----AC-GC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGAGGCCCG----GAAATTTCC----AGACGTTA-CCGG--AT-AT--A-AC
gi|93275                      :                                                                                                                                                                           A------------AT----C-TA-C-G-T----TT-T--AAGTT----AA-CCG-C---T--T----AC-TC-GGT-----------TTT--T-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACT
gi|93276                      :                                                                                                                                                                            ------------AT----C-TT-A-C-T----TG-A--AAATT----AAACCG-C---T--T----AC-GC-GGG-----------TTA--A-----A-TGGATGAT-CCCG----GAAACTTCA----CGAGGTTT-ACGG--AT-AT--A-
gi|93277                      :                                                                                                                                                                                          ----C-TA-T-G-C----TG-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AT-CC-GAG-----------TTT--A-----A-T---------CTG----GAAATGTCC----GGAAGTTT-ACGG--AT-TA--A-ACTA
gi|93278                      :                                                                                                                                                                                                    -G-T----TG-A--AACTC----AA-CCG-G---T--TGTAAAC-CC-GGA-----------TT---A-----A-TCGATGATATCCG----GAAATGTTC----AAACGTTT-TCGA--AT-AT--G-A
gi|93279                      :                                                                                                                                                                                                                --AACTT----AA-CTT-A---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGCTACTCG----GTAATTTCC----GAATG
gi|93280                      :                                                                                                                                                                                                                   ATTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGATGCTGTCCA----GAAATTTCC----GGACGATT-TCGG--AT-AT--A-ACTagattatatacta
gi|93281                      :                                                                                                                                                                                                                     TT----AA-CCA-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93282                      :                                                                                                                                                                                                                                                  C-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCGG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AATG--AT-AT--A-ACTA
gi|93283                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ATGG--AT-AC--A-
gi|93284                      :                                                                                                                                                                                                                                                     at-----------TTT--C-----A-TCGATGATGCCCG----GAAGTTTCC----GAACGTTT-ACGA--TT-AT--A-
gi|93285                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACGG--AT-AT--A-
gi|93286                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCTG----GAAATTTCC----GAATGTTT-ACAG--AT-A
gi|93287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGATGCCCA----GAAATTTTC----GAACGTTG-ACGG--AT-AT--A-





Alignments
lowQualScore                  :                               3333333333333333333333                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                  33         4 1111111111111111111111 0  2      1111  0   1111   00 11111 00 0   0    3333333 111   0   111    0 00         222  00     0  88888888888      333333333333  2222 1  1 111 3333 44 00     2222  0   0 111 00 1111  0  0   77777777777   11 11111 1             1111         1111        0    00  0  00 0    
lowQualScore                  :                  ..         . ...................... .  .      ....  .   ....   .. ..... .. .   .    ....... ...   .   ...    . ..         ...  ..     .  ...........      ............  .... .  . ... .... .. ..     ....  .   . ... .. ....  .  .   ...........   .. ..... .             ....         ....        .    ..  .  .. .    
lowQualScore                  :                  11         4 9999999999999999999999 8  3      3333  7   5555   99 77777 99 7   6    2222222 777   7   111    6 99         777  88     6  00000000000      000000000000  0000 8  2 555 1111 66 88     0000  6   6 000 88 2222  6  6   66666666666   33 44444 1             2222         2222        6    99  7  99 7    
consensus                     :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
Reference ( family-347 )      :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93205                      :             TTACG--GGATTCGAA-CTCGG-T----------------T-CGACTTAGT--G-AC-AGT----TCT--C-----A--G-ATA-TAAT-------C---ACTATGC---TATG-T--AGGAATATAT--CA--GGATC-GG-------GG--ATATAA------------AA----C-TT-A-G-T----TG-A--AACTT----AA-CAG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTA--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAAATATC----GGACGTTTAACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93206                      :             TTACG--GGATTCGAAATCTGG-TCGAACTCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AAT----CTG--C-----A--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--ATATT----AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACAT--AT-AT--T-ACTA
gi|93207                      :             TTACG--GGATTCGAAATCTGG-TCGAACCCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AAT----CTG--C-----A--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--ATATT----AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGATT-ACAT--AT-AT--T-ACTA
gi|93208                      :                                   -TTGAACTC------AGAT-CGACCGAGC--A-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCTC---TAT---------ATGTAT--TA--AGATT-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AACTT----AA-CTG-C---T--T----AC-CC-AAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCC----AGATGATT-TTGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93209                      :    ttaaaggatTTGCG--GGATTCGAA-CTT-----------------AGAT-CGATCGAGC--G-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAT-------T---ACTGTCT---TATA-C--AGGAATATAT--CA--AGTTC-GA-------CG--GTAAAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AATTA----AA-CCGCC---T--T----TC-CC-GAA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCGCA----GAAATTTCC----AGACGTTT-ACGG--AT-ACTAA-ACTA
gi|93210                      :             TTACG--GGATTCAAA-C-----------TC------AGAT-CGACTCAGT--G-AC-AAT----CGA--C-----A--G-ATA-AAAC-------T---ACTATGT---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AAGTA----AA-CCG-T---T--T----TC-TC-GGA-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCCCA----GAAGTTT-C----AGTTTTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93211                      :             TTACA--GGATTCGAA-C--------AACTTGG----A--T-CGACTGAGC--G-AC-TTT----CCG--C-----A--G-GTA-TCACTTATGGCC---ACTATGC---TATG-T--AAGGATATAT--CA--AGATC-AA-------GA--GTATAA------------AT----C-TT-A-G-T----TG-A--AACTT----CA-CCG-C---T--T----AC-CG-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCTG----GAAATTTCT----GGACATTT-ACGA--AT-AT--A-A
gi|93212                      :                                   -TCAAACTTGG----A--T-CGACTGAGT--G-AC-AAT----CGA--C-----A--G-AAA-AAAC-------C---ATTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-GG-------CA--ATATAA------------AT----C-TA-A-G-TAAGTTG-A--AGCTT----AA-CCA-T---T--T----TC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCCA----GAAATTTCA----GTATATTT-ACAG--AT-AT--A-ATTA
gi|93213                      :                          ttatgggtt-TCGAACTCGG----A--T-CGCCCTAGC--G-AT-TAT----CCA--C-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTACGT---AAT--T--GAGAATATAA--CA--CGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACAT----AA-CCG-A---C--T----AC-CC-GG------------TTT--A-----A-TCGCTGATATCAG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AGGG--AT-AT--A-ACCA
gi|93214                      :    tcatgggatTTACG--GGATACGAA-ACAGG-----------------AT-TGCCTGAGT--C-AT-AAT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---CCTGTGC---CATG-C--AGGAATATAA--CA--TGATC-TG-------TT--GTATAA------------AT----C-TA-A-GTT----TT-A--AACTT----TA-CTA-C---T--T----AC-CT-GGG-----------TTT--A-----A-TCAATGACGCCTG----GAAATTTCC----AAATGTTT-ACAG--A
gi|93215                      :             TTACG--GGATTCAAA-CT---------CT--------GAT-CGACCGAGT--G-AT-AAT----GCG--C-----A--G-AAAACAACACC----C---ATTAGTC---TGTG-T--ATAAATATAT--CA--AGAAT-GG-------CT--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AAGTA----AA-CCA-C---T--T----GC-AC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGACGATGCCCT----AAAATTTTC----GGACGTTT-ATTG--AT-AT--A-ACTA
gi|93216                      :             TTACG--GGTTTCGAA-C-TGG----------------GAT-CGACCGAACTTG-AC-AAT----TCG--C-----A--G-ATA-TTAT-------C---ACTATGC---TATG-T--GGAGATATAT--CA--AGATC-AA-------TA--GTATAA------------AA----C-AA-A-G-T----TG-A--AACAT----AA-CCG-T---T--T----AC-CT-GGA-----------TGT--T-----A-TCGATGGTGCCAT----GAAATTTCCGCCGGGATGTTT-ACAG--
gi|93217                      :             TCACG--GGATTCGAA-CCTGG-----------------AT-CGTTTGAGC--C-AT-AAT----TAA--T-----A--G-TTC-AAAT-------C---ACTGTTC---AATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-CG-------TA--GTATTA------------AC----C-TA-A-A-T----T--A--TACTT----AA-ACG-T---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACCTTT-ACTG--AT-AT--A-ACT
gi|93218                      :                                   -TCGAACCCGG----A--T-CGCCTGAAT--C-AT-AAT----AGA--C-----A--G-ATA-AAAT-------C---ACTGTGC---CATG-C--AGGAATATATTTCA--AGTTC-TT-------CT--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CCT-C---T--T----GC-TT-CGG-----------TTT--A-----A-TCAATGATGCCAG----AAAATTTCT----AAATGTTT-ACCA--AT-AT--A-A
gi|93219                      :                          tcacaggac-TCGAACTCGG----ATA---AACCGAGT--A-AC-AGT----CCA--C-----A--TTACA-TAAC-------C---ACTATGT---CATG-T--AGGAATACAT--CA--ATATC-GA-------CG--GTATAA------------AC----C-TA-A-G-T----TG-A---------------------------------------------------TT--A-----A-TCGATGATGCCCA----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ATTA
gi|93220                      :                          ttatgagat-TTGAACTCA-----AGAT-TTCCCTAGC--G-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TGAC-------A---ACTGCGC---TATG-T--A-------AC--AA--AGATC-GT-------CC--CTATAA------------AT----C-TC-A-A-T----TT-A--AACTT----AA-CTG-T---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATCCCCG----G-AATTTCC----GTACGTTT-ACGC--AT-AT--A-AC
gi|93221                      :    tcacgagatTCACA--GGATTCGAA-CTTG--------T---------AT-CAACCAAGT--G-TC-AAT----TCA--A-----A--G-ATA-TGAA-------T---ACTATGC---TATG-T--AAGGA---AA--AA--TGATC-GG-------AG--GTATGA-------------T----C-TA-A-G-T----T--------------AA-TCG-T---T--T----AC-TG-GGA-----------TTT--A-----A-GCGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTT-ACTG--AT-AT--A-A
gi|93222                      :                                   -TCGAACTAGG----AAA---GGCCGAGC--G-AT-AAC----TCG--C-----A--G-GTA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-T--GTGAATATAT--CA--ATTTC-GG-------CG--GTATAA------------AG----C-T--------------------TT---------G-C---T--T----AC-CT-GAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCT----GACTTTTCT----GCTCGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93223                      :                          ttacaggat-TCGATCTCGG----A--T-CGACCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATC-TAAC-------C---ATTATGC---TTTG-T--ACAAATATAA--CA--AGATT-GC-------CG--GTTTGA------------AA----T-GA-T-G-T----TG-A--AACTT----AA-TTG-T---T--C----AC-TT--GA-----------TGT--A-----A-TCGATGATGCCCG----AAATTTTCC----GGACATT
gi|93224                      :    ttaaaggatTCACA--GGATTCAAA-CCTGG-----------------AT-AGCCCGAGT--C-AT-AAT----CCA--T-----ATAG-ATG-TTAC-------C---ACTGTGC---CATT-C--AGGAATTAAA--CA--AGATC-CG-------AC--ATATAA------------AC----C-TA-A-G-T----TT-A--ATCTT----AG-CAG-C---T--T----AC-TC-AGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAA----GAAATTTCT----GTATGTGT-ACAG--AT-AT--A-
gi|93225                      :                                      GAACTCGG----A--T-CGACAGAGC--G-AC-ACT----CCA--C-----A--A-ATT-TATC-------C---ACTATGA---TATG-A--AGAAATATAT--TG--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AACTTTA--AA-TCG-T---CGAT----AA-CC-GG
gi|93226                      :  ttacgagatgaTCACA--GGATTCAAT-CCTGG-----------------AT-TGCCTGAGT--C-AA-AATATAACCA--CTATACA--T-GTA-TAAC-------C---ACTTCGC---CATG-C--AGGAATAAAA--CA--AGATT-GG-------TC--GTATAA------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CGG-C---A--T----AC-TC-CGG-----------ATT--A-----A-TTGACGATGCCCG----GAAATTTCC----GAATGTTA-ACGATTAT-AT--ATACTAa
gi|93227                      :                                   -TTGAACCC------AGAT-CGCCGGTGT--C-AT-AAT----CCA--T-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--CAGAATATCA--CA--AGATT-GA-------CC--TTATAA------------AT----A-TA-A-G-A----TC-A--AATTT----AA-CTG-C---T--T----AC-TCAAGA-----------CTT--A-----A-TCGATGATGCTTG----GAAAT
gi|93228                      :                          tcacgggtt-TCGAACTC------AAAT-CAACCGAGT--TTAC-AAC----TTG--G-----A--G-GTT-TAAC-------A---ACTCCGC---CATG-T--ACGA-TATAA--TA--AGATA-TG-------TA--GTATGA------------GT----C-TA-A---------------ACTT----AA-CCA-C---T--T----AT-CC-GGA-----------CTG--T-----G-TCGATGACTTCCG----GAAATTTCA----GAACGTTT-ACTG--AT-AT--A-A
gi|93229                      :     ttacggatTCACG--AAATTCGAG-CCTGG-----------------AT-TGCCCGAGT--C-AT-AAT----CCA--T-----T--T-ACA-AAAC-------C---ACT--------ATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-GA-------TC--GTATAA------------AT----A-AA-AAG-T----TT-A--AACAT----AG-CCG-A---T--T----AT-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TATATGATGCCAA----GAAATTTCC----
gi|93230                      :                                                   GGT-CGCCCGAAT--C-AT-AAT----CAA--T-----A--G-ATG-TTAT-------T---ACTGCAC---CGTG-C--AGGAATAAAA--CA--GTAAC-GT-------TT--GTATAA------------AT----C-TT-A-A-T----T--------TT----AA-TCG-T---T--T----AC-TG-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCT----GATATTCAC----TAACGTTT-ACGG--AT-AA--A-ACT
gi|93231                      :                 tcacgtgaatagaatctg-TCGAACTCGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AAT----TCG--T-----T--G-ATC-TA-C-------C---ACTGCGC---TGTA-T--AGGAATATAA--CA--AGATC-GT-------CG--GTATA
gi|93232                      :                             tcaccggatGAACTC------AGAT-TAACCAAGT--G-GC-AAT----CTG--T-----A--G-ATA-TAAC-------T---AATCTAC---TATA-T--AGGAATATAT--CA--AGATC-AG-------TC--ATAT-A------------AT----C-TA-A-
gi|93233                      :  ttattggattgTTACGCAGGATTCAAA-CTAGGATCG--CTCGG----A--T-C------------AT-AAT----CTA--T-----A--T-ATA-TGAC-------T---ACTACGC---CATG-A--AGGAATATCC--CA--ACATC-GG-------CC--GTTTAA------------AT----C-TA-A-A-C----TT-A--AACGT----A------------------AC-CC-ATG-----------TTT--A-----A-TCG-TAATTTCCG----AAA
gi|93234                      :                                   -TCCAAATCGG----A--T-CGCCATAGT--C-AT-AAT----CTA--T-----A--A-CTG-TAAC-------C---TATGCGC---CATG-C--AGGAATATAA--GA--AG-TC-GGT------CC--ATGTAA------------AT----T-TA-A-C-T----TT-C--AGCTTTCAAAA-CCT-C---A--T----AC-TC-TGG-----------TTT--C-----A-TCAATGATGATTG----GAATTTTAT----ATAAATAC-ATGG--AT-AC--A-ACTA
gi|93235                      :                              tcacgtgatAACTC------AGAT-CGCCCGAAC--G-ATTAAT----C-G--C-----A--G-CTC-GAAC-------C---ATTGCAC---CAAT-C--AGTAATATTA--GA--AAGTC-AG-------TG----ATAG------------GT----C-TT-ATG-TA---TATA--AACCT----AA-CAG-C---T--C----AA-CT-GAACTGTCGCACA-TTTGCA-----A-TCGATAATGCCCG----GACATTTCT----GAACGTTT-ACTT--AT-AT--A-
gi|93236                      : tttcggggtaaaTCACG--GGATTTAAA-CCCGG----ATCTC------------------------AT-ACT----CCA--T-----A--G-ATA-TTAC-------C---ACTGCGT---TATG-A--AGGAATATAA--CA--AGTTC-AG-------TA--GTATGA------------AT----
gi|93237                      :                                   -TTGAATTC------AGAT-CGCTTGAGC--G-AC-AAT----TCA--C-----A--G-TTC-TAAC-------C---ACTGTGC---
gi|93238                      :                          tcacggatt-TCGAACTCTA----A--T-CGCTCGAGC--G-AC-GAT----CCG--A-----A--G-ATC-TAAC-------A---ACT---C---TATGAT--GCAGACATAG--TAATAGATG-TT-------TA--GTAT---------------T----CTTATA-G-T----TG-------TT----AA-CCG-A---T--A----AC-CC-CGGCTGTTGTCATTTTT--A-----A-TCTATGACTCACG----GAAAAT--A----GAAATTTT-ACGG--AT-TT--A-GC
gi|93239                      :                         ttaccgagat-TCAAACAC------AGAT-CAACTGAGT--G-AC-AAT----CGG--C-----A--G-A-A--AAC-------T---ACTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AGCTA----AA-CTG-T---T--T----TC-TC-TGA-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCACA----GAAATTTCA----GTACGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93240                      :      tacaagatTACG--TGATTCGAA-CCCGG-----------------AT-CGCATGGGC--G-AC-AAT----CGG--C-----G--G-ATG-TA
gi|93241                      :                                   -TTGAACTCGG----A--T-CG-----------AC-AAT----TCC--C-----A--G-ATC-TAAC-------A---TCTGCGC---TATG-T--AGAAATATAA--CA--AGATC-GG-------TC--GTATAA------------AC----C-TG-A-A-T----TT-A-----------AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GAG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----TAATGTTTC----GAACGTTT-ACGG--AC-AA--A-ACttcattat
gi|93242                      :        acgggatACA--GGACTCGAA-CCAGGATCG--CT-GG----A-AT-CATT-------------AT----CCAAAT-----A--A-ATA-TAAC-------C---ACTACGT---CATG-T--AGAAATATCT--CA--AAATC-GG-------AC--GTTTAA------------AT----C--A-A-G-
gi|93243                      :                                                   GAT-CACCTGTAC--G-AC-ACT----CCG--A-----A--G-TTC-TATC-------C---AAAATAC---AACA-T--AGGAATATCC--CA--TGATC-----------------TAA-------------T----G-TA-T-G-T----TT-A--AAA------AA-ATG-TATTT--T----AA-TT-GCA-----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----AAAATTTCG----GAACGTTT-ACGG--AT-AT--A-GC
gi|93244                      :                   acgagagttgaatccc-TCGAAGCCGA----A--T-CGCCCGAGT--C-AT-CAT----CCA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---TCTTCGC---CATA-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-AT-------TC--GTATAA------------AT----G-TA-A-C-T----TT-A--AACTT----AA-
gi|93245                      :                             caggaa-TTGAACTCGG----A--T-CGCCCGGGC--G-AC-TAT----TAG--C-----T--G-ATA-CAAC-------C---TCTGC-----TATG-T--AGGAATATAA--CA--CGATC-AA-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-AAG-----------ATT--A-----A-TCTGCGATGCATG----GACATTTTC----GGGCGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93246                      :                              gggat-TCGAACTCGG----A--T-TGCCCAAGT--C-AT-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGAGA---TATG-T--GGGAATTTA
gi|93247                      :                              gagat-TCGAACTTGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AAT----TCG--G-----A--A-AGG-TAAC-------C---GGTGCGC---AATG-T--AGGGCTATAA--CA--AAATC-G---------G--GTA-AA------------A-------CA-A-G-T----TT-A--AACTT----CA-CCG-C---T--T----GC-TC--GG-----------TTT--A-----A-TCGACGATGCTCG----GATATTTGC----GGACGTTT-ACGG--TT-AT--A-ATT
gi|93248                      :                                               ggatGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTATGA--------------------TA-T-T-T----TT-A--AATTG----AA-T-----------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-
gi|93249                      :                                           gattcacgGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTATGA--------------------TA-T-T-T----TT-A--AATTG----AA-T-----------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-gaagaca
gi|93250                      :                           gattcacg-TCGAACCC------AGAT-CGGCCTAT-----AT-AAT----CCA--T-----A--G-ATG-TCAT-------C---ACTACGC---CATG-C--AGAAATATAA--CA--AGATC-TG-------TC--GTATAA------------AT----T-TA-A-G-T----TT-A--AATTT----AA-CCA-C---T--T----AC-TC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGGCGATGAACG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACGT--AT-AT--A-ACTgaagaca
gi|93251                      :                                     atAACTCGG----A--T-CGACCGAAC--A-AC-ACT----CTA--C-----A--T-ATG-TAAG-------C---ACTGTTT---TATG-T--AGGACTATAT--CA--AGATC-TA-------TG--GTATAA------------CT----T-TA-A-A-C----TG-A--AATTT----AG-CCG-T---T--T----TCACC-GAG-----------TTT----------TT-ATGATGCCCA----GAAATATCC----GGATGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACT
gi|93252                      :                               ttta-TCGAACTCG-------ATTCGCCCGAGC--G-AT-AAT----CCA--C-----A--T-ATT-TAAC-------T---TCTGCGC---TATA-T--ATGAATATAA--CA--AGATC-GG-------CA--GTATCA------------AT----C-T------T----------AACTT----AA-TCG-C---T--T----TC-C----A-----------TTTA-A-----A-TCGATGATGCCCG----AAAATTTCT----GAACGTTT-TCGG--AT-A
gi|93253                      :                                  t-TCAAACTCTG----A--T-CTCTCAGCC--G-AC-AAT----CCT--C-----A--G-ATC-TAAC-------C---ACTACGG---TTTG-T--GGGAATTTAA--CA--ACAGC-GG-------TG--GAAGAA------------AT----TATA-A-C-T----TT-T--AATAA----AA-TCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TCT--A-----A-TCAATGATTCCCG----GAAATTTCC----CGACTCTT-ACGG--TT-AT--A-AC
gi|93254                      :                                                        GCCAGAGT--T-AT-AAT----CCA--A-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTATGC---TAT-------------------------C-AG-------CC--ATATAA------------AT----C-TTTA-G-T----TT-A--ACCTT----TA-TCA-C---A--T----AC-TC-AGG-----------TTA--A-----A-TCAATGATGGCTG----GAAATTTCC----CCACATTT-AC
gi|93255                      :                                    gagttcagtg----AAAT-TGACCAAGC--A-TC-AAC----TCG--C-----G--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGT---TATA-T--AGGAATATAT--CC--AGATT-GG-------CA--GTATAA------------AT----CTTA-A-G-T----TG-A--AACAC----CA-TCA-C---T--A----AC-CA-GGA-----------TTT--A-----A-T---TGATGCCCA----GTAATTGCC----GGACGTTT-ATAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93256                      :                                                     T-CGACAGAGC--G-TC-CAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ATAGTGC---TATG-T--CGAAATATAT--CA--TGATC-GG-------CA--GTAT-----------------------------------------------------CG-T---T--T----AC-CG-AGA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACGG--AT-AC--A-ACTA
gi|93257                      :                                                     T-CGACCGAGC--G-AT-AAT----CCG--C-----A--A-ATA-TAAC-----------AT----C---TATG-C--AGGAATATGC--CG--AGATC-G--------CG--TTATAA------------AT----C-TT-T-G-T----TG-A--AACTT----AC-CCG-C---T--T----TC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATTCTCG----GGAAATTCC----GG
gi|93258                      :                                                            GAGC--C-AT-AAT----CCA--C--------G-ATG-TAAC-------C---ACTGTGC---CGTG-C--AGGAATAAAG--CA--TGAAC-GT-------CG--GTATAA------------GT----T-TC-A-T-T----TT-C--AACTT----AA-CAG-C---T--T----AC-TC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGGTGATGCCCG----CAGAATTCC----AAACGTTT-ACGT--AT-AT--C-ACT
gi|93259                      :                                                             AGC--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-TTC-TAAC-------CC--ACTGCGT---TGCA-T--AGAAATATTC--CA--AAGTG-GA-------TG--GCA-AA------------AT------TA-T-G-T----TT-ATAAACCT----AA-CCG-C---T--C-----C-CC-AGGCTGTCGTGTATTTT--A-----A-TCGCTGATGCTCT----GAAATTTTC----GAACGTCT-ACGG--AT-AT--A-GC
gi|93260                      :                                                               C--G-AC-ATT----TCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-A--AGGAATATAT--CA--AGATC-TG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AACTT----AA-CTG-C---T--T----AC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TCAGTGATACCTG----GAAATTTTC----GGACGCTT-GTGG--AT-GG--A-ATTA
gi|93261                      :                                                                        AT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---TCTAC-C---CCT---------ATATAA--CA--ATATC-TG-------AC--GTATAA------------CT----C-TA-A-C-T----TT-A--AACTC----AA-CCG-C---A--T----AC-AT-GTG-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACC----GAACGTTT-ACGC--AT-A---A-AC
gi|93262                      :                                                                        AT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------CTCGACCAC-C---CAT---------ATATAA--CA--ATATCTGA-------C----TTTAA------------AT-------A-A-C-T----TT-A--AACTC----AA-CCG-T---A--T----AC-AC-GTG-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACA----GAACGTTT-GCGC--AT-AT--A-
gi|93263                      :                                                                                                                       C---TATG-C--AGGAATGTAA--AA--AGATC-AG-------TG--GAATAA------------AT----C-TA-A-A-T----TT-T--ATCTC----AA-CTG-C---T--A----AC-AA-GAG-----------CTT--A-----A-T
gi|93264                      :                                                                    aataggtatgaccagaataagttaa-ATT-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--AGGAATATCA--AA--AGACC-GG-------AC--GTATAA------------TT----C-TA-A-T-T----TT-A--AACTC----AA-CCA-C---T--T----AC-TC-TGG-----------TTT--A-----T-TTGATGATGCCTG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACGG--AT-AA--A-ACT
gi|93265                      :                                                                                             -ATA-TAAA-------T---ATTATGT---TAGG-C--AGAAATATAT--AA--AGATC-AG-------TGTTATATAT------------AT----A-TA-A-G-T----TG-A--AACCT----AA-CCG-T---T--T----TT-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGATAATGGCCA----GAATGATCC----GGGCGTTC-AC
gi|93266                      :                                                                                                                                                                       TGTAG------------AC----C-TA-T-G-TCTTATA-A--AAAAT----AA-CCG-A---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--AGTGAGA-TTAATATTGCCCG----GAAATTTCT----TCACATTT-ACAG--AT-GT--A-ACaactacgatat
gi|93267                      :                                                    atataattgtcatgaaatgttgatgtactaacatctttgagttTA-TAAC-------C---ATTGTAGGAATATA-TCAAGGAATATAT--CA--AGAAC-TG-------CG--GTATAA------------AT----A-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CAG-A---T--T----AC-CC-GAA-----------ATT--A-----A-TCAGTGATACCCG----GAAATTTCC----TGACGTTT-ACAG--AA-AT--A-ACTA
gi|93268                      :                                                                                               TA-TAAC-------C---ACTATGC---TAAG-G--AGGAATATAT--CA--TG-T---G-------TA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AA--------A-CC--C---T--C----TC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTA-AC-G--AC-AT--A-ACTA
gi|93269                      :                                                                                                A-TAGC-------C---GCTAAGC---CACT-A--AGGAACAAATA-CA--A-ATT-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-GG-A-G-T----TG-A--AAATA----AT-CCT-C---T--T----AC-AC-GAA-----------TTT--A-----A-TCTATGATGCCTG----GAAATTTAC----GGACATTT-ACAC--AT-GT--A-ACTA
gi|93270                      :                                                                                                      -------C---ATTGCGC---TATG-T--AGCAATATAA--CA--AATCC-TG-------CC--GTATTA------------AT----C-TA-A-C-T----TT-A--ATCTT----AA-CCA-C---T--T----TC-TC-GGA-----------ATT--A-----A-CCGATGATGCCTG----AAAATTTTC----GAACATGT-ACGG--AT-AT--A-ACT
gi|93271                      :                                                                                                                                     GAATATTA--CA--AGATC-AG-------CG--GTATAATTAGTTACAGTTATAAAAC-TA-A-T-T----TT-A--AATTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------CT---------G-TCGAATTTACTCC----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACGG--AT-GT--A-
gi|93272                      :                                                                                                                                                A--AGATC-AG-------CA--GTATAG------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CCT-C---A--T----AT-CC-GAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGACTG----GAAATATCA----AGACGTAT-AC
gi|93273                      :                                                                                                                                             ataA--AGATC-TG-------CC--TTATAC------------AT----C-AA-A-G-T----TT-G--AACTT--------TG-T---------------C-GGG-----------TTT--A-----A-TCGAAAATGCCCGAAAGGAAATTTCC----GAACGTTT-ATGG--ATGAT--A-AC
gi|93274                      :                                                                                                                                                                       TATAA------------ATAT--C-TT-A-T-T----TT-A--AGCTT----AA-CCG-C---A--T----AC-GC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGAGGCCCG----GAAATTTCC----AGACGTTA-CCGG--AT-AT--A-AC
gi|93275                      :                                                                                                                                                                           A------------AT----C-TA-C-G-T----TT-T--AAGTT----AA-CCG-C---T--T----AC-TC-GGT-----------TTT--T-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACT
gi|93276                      :                                                                                                                                                                            ------------AT----C-TT-A-C-T----TG-A--AAATT----AAACCG-C---T--T----AC-GC-GGG-----------TTA--A-----A-TGGATGAT-CCCG----GAAACTTCA----CGAGGTTT-ACGG--AT-AT--A-
gi|93277                      :                                                                                                                                                                                          ----C-TA-T-G-C----TG-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AT-CC-GAG-----------TTT--A-----A-T---------CTG----GAAATGTCC----GGAAGTTT-ACGG--AT-TA--A-ACTA
gi|93278                      :                                                                                                                                                                                                    -G-T----TG-A--AACTC----AA-CCG-G---T--TGTAAAC-CC-GGA-----------TT---A-----A-TCGATGATATCCG----GAAATGTTC----AAACGTTT-TCGA--AT-AT--G-A
gi|93279                      :                                                                                                                                                                                                                --AACTT----AA-CTT-A---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGCTACTCG----GTAATTTCC----GAATG
gi|93280                      :                                                                                                                                                                                                                   ATTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGATGCTGTCCA----GAAATTTCC----GGACGATT-TCGG--AT-AT--A-ACTagattatatacta
gi|93281                      :                                                                                                                                                                                                                     TT----AA-CCA-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93282                      :                                                                                                                                                                                                                                                  C-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCGG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AATG--AT-AT--A-ACTA
gi|93283                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ATGG--AT-AC--A-
gi|93284                      :                                                                                                                                                                                                                                                     at-----------TTT--C-----A-TCGATGATGCCCG----GAAGTTTCC----GAACGTTT-ACGA--TT-AT--A-
gi|93285                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACGG--AT-AT--A-
gi|93286                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCTG----GAAATTTCC----GAATGTTT-ACAG--AT-A
gi|93287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGATGCCCA----GAAATTTTC----GAACGTTG-ACGG--AT-AT--A-


blockSeqs                     :                  CA         A CTGGTCGAACTCGGGGCCAGA     A      TTG       ATAA      TATAC             TTATGGC TCG       GAA                 TTT            AGTGTATCG        TTAGTTACAGTT  AAAA T  T GT  AAGT AT        TCAA        ATT    GTAA         CTGTTGTCATT   GC GTGAG A             AAAG         GCCG
blockSeqs                     :                  .          A CTGGTCGAACCCGGGGCCAGA     A      TT        .         .                 ACC     C         .                   TA             AGTGTATCG        .             AT   A  T AG  CTTA G         TA          .      .            CTGTCGTGTAT   A  .     A             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . TAGGATCGCTCGGA            A      G         .         .                 .       .         .                   T              TGTT             .             .    T  . TG  A    A         .           .      .            CTGTCGCACA    .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CAGGATCGCTGGAA            A      G         .         .                 .       .         .                   T              TCC              .             .    .  . G   .    A         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CCGGATCTC                 A      A         .         .                 .       .         .                   T              TG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . AACTTGGA                  A      G         .         .                 .       .         .                   T              TG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . TTAGA                     A      G         .         .                 .       .         .                   T              TG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . TCAGA                     C      G         .         .                 .       .         .                   T              CG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CAGGA                     C      G         .         .                 .       .         .                   T              CA               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . TCTGA                     A      G         .         .                 .       .         .                   A              GA               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . TGGGA                     A      C         .         .                 .       .         .                   A              CA               .             .    .  . G   .    A         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CTGGA                     T      G         .         .                 .       .         .                   T              CA               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . TTGTA                     C      C         .         .                 .       .         .                   T              TT               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CTGGA                     A      C         .         .                 .       .         .                   A              CT               .             .    .  . A   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CTGGA                     C      A         .         .                 .       .         .                   T              TA               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CTGGA                     A      G         .         .                 .       .         .                   C              TA               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                  .          . CCGGA                     G      G         .         .                 .       .         .                   A              CT               .             .    .  . A   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      G         .         .                 .       .         .                   T              CG               .             .    .  . G   .    A         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              CC               .             .    .  . G   .    C         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      C         .         .                 .       .         .                   A              AG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   T              CG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      C         .         .                 .       .         .                   A              CG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      C         .         .                 .       .         .                   A              AC               .             .    .  . A   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      C         .         .                 .       .         .                   A              CG               .             .    .  . A   .    A         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      C         .         .                 .       .         .                   A              TC               .             .    .  . C   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              CC               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      G         .         .                 .       .         .                   A              TA               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      C         .         .                 .       .         .                   T              TC               .             .    .  . A   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   C              TT               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              CG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              TC               .             .    .  . C   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      G         .         .                 .       .         .                   A              CC               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   G              TG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         T      G         .         .                 .       .         .                   T              TA               .             .    .  . T   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      C         .         .                 .       .         .                   A              TA               .             .    .  . T   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   T              CA               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      C         .         .                 .       .         .                   C              TC               .             .    .  . A   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              AC               .             .    .  . C   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              TC               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         T      G         .         .                 .       .         .                   A              CG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         T      A         .         .                 .       .         .                   A              TC               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         G      G         .         .                 .       .         .                   A              TG               .             .    .  . T   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      G         .         .                 .       .         .                   A              CA               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      T         .         .                 .       .         .                   T              TG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      A         .         .                 .       .         .                   A              CC               .             .    .  . C   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         C      G         .         .                 .       .         .                   A              CA               .             .    .  . C   .    A         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      G         .         .                 .       .         .                   T              CA               .             .    .  . A   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      C         .         .                 .       .         .                   T              CG               .             .    .  . T   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         A      G         .         .                 .       .         .                   C              CG               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         .      G         .         .                 .       .         .                   G              TG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         .      .         .         .                 .       .         .                   C              TG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                         .      .         .         .                 .       .         .                   T              AC               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                .         .         .                 .       .         .                   A              TG               .             .    .  . G   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                .         .         .                 .       .         .                   A              AC               .             .    .  . C   .    T         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                .         .         .                 .       .         .                   A              CG               .             .    .  . T   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                          .         .                 .       .         .                   A              TA               .             .    .  . G   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                          .         .                 .       .         .                   T              TG               .             .    .  . T   .    G         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                      .       .         .                   T              CC               .             .    .  . G   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                      .       .         .                   T              CG               .             .    .  . C   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                      .       .         .                   A              CA               .             .    .  . G   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                      .       .         .                   A              CC               .             .    .  . G   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                      .       .         .                   .              G                .             .    .  . .   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .                                  C                .             .    .  . .   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .                .             .    .  . .   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .             .    .  . .   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .             .    .  . .   .    .         .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .             .    .  . .                  .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                          .                            .           .      .            .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .                               .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .             .  .     .             .            .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .             .  .     .             .                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .             .  .     .             .                


blockSeqCons                  :             
originalCons                  :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
finalCons                     :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA





Alignments
lowQualScore                  :                               3333333333333333333333                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                  33         4 1111111111111111111111 0  2      1111  0   1111   00 11111 00 0   0    3333333 111   0   111    0 00         222  00     0  88888888888      333333333333  2222 1  1 111 3333 44 00     2222  0   0 111 00 1111  0  0   77777777777   11 11111 1             1111         1111        0    00  0  00 0    
lowQualScore                  :                  ..         . ...................... .  .      ....  .   ....   .. ..... .. .   .    ....... ...   .   ...    . ..         ...  ..     .  ...........      ............  .... .  . ... .... .. ..     ....  .   . ... .. ....  .  .   ...........   .. ..... .             ....         ....        .    ..  .  .. .    
lowQualScore                  :                  11         4 9999999999999999999999 8  3      3333  7   5555   99 77777 99 7   6    2222222 777   7   111    6 99         777  88     6  00000000000      000000000000  0000 8  2 555 1111 66 88     0000  6   6 000 88 2222  6  6   66666666666   33 44444 1             2222         2222        6    99  7  99 7    
consensus                     :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
Reference ( family-347 )      :             TTACG--GGATTCGAA-CCTGG-TCGAACTCGG----AGAT-CGNCCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCGC---TATG-T--AGGAATATAN--CA--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TN-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93205                      :             TTACG--GGATTCGAA-CTCGG-T----------------T-CGACTTAGT--G-AC-AGT----TCT--C-----A--G-ATA-TAAT-------C---ACTATGC---TATG-T--AGGAATATAT--CA--GGATC-GG-------GG--ATATAA------------AA----C-TT-A-G-T----TG-A--AACTT----AA-CAG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTA--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAAATATC----GGACGTTTAACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93206                      :             TTACG--GGATTCGAAATCTGG-TCGAACTCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AAT----CTG--C-----A--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--ATATT----AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACAT--AT-AT--T-ACTA
gi|93207                      :             TTACG--GGATTCGAAATCTGG-TCGAACCCGGGGCCAGAT-TGACCGAGC--G-AC-AAT----CTG--C-----A--G-TTA-TAGC-------C---ACTATAA---TTTG-T--AGGAATATAT--TA--AGATC-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--ATATT----AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TAGATGATACCCG----GAAATTTCC----GGACGATT-ACAT--AT-AT--T-ACTA
gi|93208                      :                                   -TTGAACTC------AGAT-CGACCGAGC--A-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGCTC---TAT---------ATGTAT--TA--AGATT-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AACTT----AA-CTG-C---T--T----AC-CC-AAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCC----AGATGATT-TTGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93209                      :    ttaaaggatTTGCG--GGATTCGAA-CTT-----------------AGAT-CGATCGAGC--G-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAT-------T---ACTGTCT---TATA-C--AGGAATATAT--CA--AGTTC-GA-------CG--GTAAAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AATTA----AA-CCGCC---T--T----TC-CC-GAA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCGCA----GAAATTTCC----AGACGTTT-ACGG--AT-ACTAA-ACTA
gi|93210                      :             TTACG--GGATTCAAA-C-----------TC------AGAT-CGACTCAGT--G-AC-AAT----CGA--C-----A--G-ATA-AAAC-------T---ACTATGT---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AAGTA----AA-CCG-T---T--T----TC-TC-GGA-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCCCA----GAAGTTT-C----AGTTTTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93211                      :             TTACA--GGATTCGAA-C--------AACTTGG----A--T-CGACTGAGC--G-AC-TTT----CCG--C-----A--G-GTA-TCACTTATGGCC---ACTATGC---TATG-T--AAGGATATAT--CA--AGATC-AA-------GA--GTATAA------------AT----C-TT-A-G-T----TG-A--AACTT----CA-CCG-C---T--T----AC-CG-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCTG----GAAATTTCT----GGACATTT-ACGA--AT-AT--A-A
gi|93212                      :                                   -TCAAACTTGG----A--T-CGACTGAGT--G-AC-AAT----CGA--C-----A--G-AAA-AAAC-------C---ATTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-GG-------CA--ATATAA------------AT----C-TA-A-G-TAAGTTG-A--AGCTT----AA-CCA-T---T--T----TC-CT-GGA-----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCCA----GAAATTTCA----GTATATTT-ACAG--AT-AT--A-ATTA
gi|93213                      :                          ttatgggtt-TCGAACTCGG----A--T-CGCCCTAGC--G-AT-TAT----CCA--C-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTACGT---AAT--T--GAGAATATAA--CA--CGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACAT----AA-CCG-A---C--T----AC-CC-GG------------TTT--A-----A-TCGCTGATATCAG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AGGG--AT-AT--A-ACCA
gi|93214                      :    tcatgggatTTACG--GGATACGAA-ACAGG-----------------AT-TGCCTGAGT--C-AT-AAT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---CCTGTGC---CATG-C--AGGAATATAA--CA--TGATC-TG-------TT--GTATAA------------AT----C-TA-A-GTT----TT-A--AACTT----TA-CTA-C---T--T----AC-CT-GGG-----------TTT--A-----A-TCAATGACGCCTG----GAAATTTCC----AAATGTTT-ACAG--A
gi|93215                      :             TTACG--GGATTCAAA-CT---------CT--------GAT-CGACCGAGT--G-AT-AAT----GCG--C-----A--G-AAAACAACACC----C---ATTAGTC---TGTG-T--ATAAATATAT--CA--AGAAT-GG-------CT--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AAGTA----AA-CCA-C---T--T----GC-AC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGACGATGCCCT----AAAATTTTC----GGACGTTT-ATTG--AT-AT--A-ACTA
gi|93216                      :             TTACG--GGTTTCGAA-C-TGG----------------GAT-CGACCGAACTTG-AC-AAT----TCG--C-----A--G-ATA-TTAT-------C---ACTATGC---TATG-T--GGAGATATAT--CA--AGATC-AA-------TA--GTATAA------------AA----C-AA-A-G-T----TG-A--AACAT----AA-CCG-T---T--T----AC-CT-GGA-----------TGT--T-----A-TCGATGGTGCCAT----GAAATTTCCGCCGGGATGTTT-ACAG--
gi|93217                      :             TCACG--GGATTCGAA-CCTGG-----------------AT-CGTTTGAGC--C-AT-AAT----TAA--T-----A--G-TTC-AAAT-------C---ACTGTTC---AATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-CG-------TA--GTATTA------------AC----C-TA-A-A-T----T--A--TACTT----AA-ACG-T---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACCTTT-ACTG--AT-AT--A-ACT
gi|93218                      :                                   -TCGAACCCGG----A--T-CGCCTGAAT--C-AT-AAT----AGA--C-----A--G-ATA-AAAT-------C---ACTGTGC---CATG-C--AGGAATATATTTCA--AGTTC-TT-------CT--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CCT-C---T--T----GC-TT-CGG-----------TTT--A-----A-TCAATGATGCCAG----AAAATTTCT----AAATGTTT-ACCA--AT-AT--A-A
gi|93219                      :                          tcacaggac-TCGAACTCGG----ATA---AACCGAGT--A-AC-AGT----CCA--C-----A--TTACA-TAAC-------C---ACTATGT---CATG-T--AGGAATACAT--CA--ATATC-GA-------CG--GTATAA------------AC----C-TA-A-G-T----TG-A---------------------------------------------------TT--A-----A-TCGATGATGCCCA----GAAATTTCC----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ATTA
gi|93220                      :                          ttatgagat-TTGAACTCA-----AGAT-TTCCCTAGC--G-AC-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TGAC-------A---ACTGCGC---TATG-T--A-------AC--AA--AGATC-GT-------CC--CTATAA------------AT----C-TC-A-A-T----TT-A--AACTT----AA-CTG-T---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATCCCCG----G-AATTTCC----GTACGTTT-ACGC--AT-AT--A-AC
gi|93221                      :    tcacgagatTCACA--GGATTCGAA-CTTG--------T---------AT-CAACCAAGT--G-TC-AAT----TCA--A-----A--G-ATA-TGAA-------T---ACTATGC---TATG-T--AAGGA---AA--AA--TGATC-GG-------AG--GTATGA-------------T----C-TA-A-G-T----T--------------AA-TCG-T---T--T----AC-TG-GGA-----------TTT--A-----A-GCGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTT-ACTG--AT-AT--A-A
gi|93222                      :                                   -TCGAACTAGG----AAA---GGCCGAGC--G-AT-AAC----TCG--C-----A--G-GTA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-T--GTGAATATAT--CA--ATTTC-GG-------CG--GTATAA------------AG----C-T--------------------TT---------G-C---T--T----AC-CT-GAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCT----GACTTTTCT----GCTCGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93223                      :                          ttacaggat-TCGATCTCGG----A--T-CGACCGAGC--G-AC-AAT----CCG--C-----A--G-ATC-TAAC-------C---ATTATGC---TTTG-T--ACAAATATAA--CA--AGATT-GC-------CG--GTTTGA------------AA----T-GA-T-G-T----TG-A--AACTT----AA-TTG-T---T--C----AC-TT--GA-----------TGT--A-----A-TCGATGATGCCCG----AAATTTTCC----GGACATT
gi|93224                      :    ttaaaggatTCACA--GGATTCAAA-CCTGG-----------------AT-AGCCCGAGT--C-AT-AAT----CCA--T-----ATAG-ATG-TTAC-------C---ACTGTGC---CATT-C--AGGAATTAAA--CA--AGATC-CG-------AC--ATATAA------------AC----C-TA-A-G-T----TT-A--ATCTT----AG-CAG-C---T--T----AC-TC-AGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCAA----GAAATTTCT----GTATGTGT-ACAG--AT-AT--A-
gi|93225                      :                                      GAACTCGG----A--T-CGACAGAGC--G-AC-ACT----CCA--C-----A--A-ATT-TATC-------C---ACTATGA---TATG-A--AGAAATATAT--TG--AGATC-GG-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AACTTTA--AA-TCG-T---CGAT----AA-CC-GG
gi|93226                      :  ttacgagatgaTCACA--GGATTCAAT-CCTGG-----------------AT-TGCCTGAGT--C-AA-AATATAACCA--CTATACA--T-GTA-TAAC-------C---ACTTCGC---CATG-C--AGGAATAAAA--CA--AGATT-GG-------TC--GTATAA------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CGG-C---A--T----AC-TC-CGG-----------ATT--A-----A-TTGACGATGCCCG----GAAATTTCC----GAATGTTA-ACGATTAT-AT--ATACTAa
gi|93227                      :                                   -TTGAACCC------AGAT-CGCCGGTGT--C-AT-AAT----CCA--T-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--CAGAATATCA--CA--AGATT-GA-------CC--TTATAA------------AT----A-TA-A-G-A----TC-A--AATTT----AA-CTG-C---T--T----AC-TCAAGA-----------CTT--A-----A-TCGATGATGCTTG----GAAAT
gi|93228                      :                          tcacgggtt-TCGAACTC------AAAT-CAACCGAGT--TTAC-AAC----TTG--G-----A--G-GTT-TAAC-------A---ACTCCGC---CATG-T--ACGA-TATAA--TA--AGATA-TG-------TA--GTATGA------------GT----C-TA-A---------------ACTT----AA-CCA-C---T--T----AT-CC-GGA-----------CTG--T-----G-TCGATGACTTCCG----GAAATTTCA----GAACGTTT-ACTG--AT-AT--A-A
gi|93229                      :     ttacggatTCACG--AAATTCGAG-CCTGG-----------------AT-TGCCCGAGT--C-AT-AAT----CCA--T-----T--T-ACA-AAAC-------C---ACT--------ATG-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-GA-------TC--GTATAA------------AT----A-AA-AAG-T----TT-A--AACAT----AG-CCG-A---T--T----AT-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TATATGATGCCAA----GAAATTTCC----
gi|93230                      :                                                   GGT-CGCCCGAAT--C-AT-AAT----CAA--T-----A--G-ATG-TTAT-------T---ACTGCAC---CGTG-C--AGGAATAAAA--CA--GTAAC-GT-------TT--GTATAA------------AT----C-TT-A-A-T----T--------TT----AA-TCG-T---T--T----AC-TG-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCT----GATATTCAC----TAACGTTT-ACGG--AT-AA--A-ACT
gi|93231                      :                 tcacgtgaatagaatctg-TCGAACTCGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AAT----TCG--T-----T--G-ATC-TA-C-------C---ACTGCGC---TGTA-T--AGGAATATAA--CA--AGATC-GT-------CG--GTATA
gi|93232                      :                             tcaccggatGAACTC------AGAT-TAACCAAGT--G-GC-AAT----CTG--T-----A--G-ATA-TAAC-------T---AATCTAC---TATA-T--AGGAATATAT--CA--AGATC-AG-------TC--ATAT-A------------AT----C-TA-A-
gi|93233                      :  ttattggattgTTACGCAGGATTCAAA-CTAGGATCG--CTCGG----A--T-C------------AT-AAT----CTA--T-----A--T-ATA-TGAC-------T---ACTACGC---CATG-A--AGGAATATCC--CA--ACATC-GG-------CC--GTTTAA------------AT----C-TA-A-A-C----TT-A--AACGT----A------------------AC-CC-ATG-----------TTT--A-----A-TCG-TAATTTCCG----AAA
gi|93234                      :                                   -TCCAAATCGG----A--T-CGCCATAGT--C-AT-AAT----CTA--T-----A--A-CTG-TAAC-------C---TATGCGC---CATG-C--AGGAATATAA--GA--AG-TC-GGT------CC--ATGTAA------------AT----T-TA-A-C-T----TT-C--AGCTTTCAAAA-CCT-C---A--T----AC-TC-TGG-----------TTT--C-----A-TCAATGATGATTG----GAATTTTAT----ATAAATAC-ATGG--AT-AC--A-ACTA
gi|93235                      :                              tcacgtgatAACTC------AGAT-CGCCCGAAC--G-ATTAAT----C-G--C-----A--G-CTC-GAAC-------C---ATTGCAC---CAAT-C--AGTAATATTA--GA--AAGTC-AG-------TG----ATAG------------GT----C-TT-ATG-TA---TATA--AACCT----AA-CAG-C---T--C----AA-CT-GAACTGTCGCACA-TTTGCA-----A-TCGATAATGCCCG----GACATTTCT----GAACGTTT-ACTT--AT-AT--A-
gi|93236                      : tttcggggtaaaTCACG--GGATTTAAA-CCCGG----ATCTC------------------------AT-ACT----CCA--T-----A--G-ATA-TTAC-------C---ACTGCGT---TATG-A--AGGAATATAA--CA--AGTTC-AG-------TA--GTATGA------------AT----
gi|93237                      :                                   -TTGAATTC------AGAT-CGCTTGAGC--G-AC-AAT----TCA--C-----A--G-TTC-TAAC-------C---ACTGTGC---
gi|93238                      :                          tcacggatt-TCGAACTCTA----A--T-CGCTCGAGC--G-AC-GAT----CCG--A-----A--G-ATC-TAAC-------A---ACT---C---TATGAT--GCAGACATAG--TAATAGATG-TT-------TA--GTAT---------------T----CTTATA-G-T----TG-------TT----AA-CCG-A---T--A----AC-CC-CGGCTGTTGTCATTTTT--A-----A-TCTATGACTCACG----GAAAAT--A----GAAATTTT-ACGG--AT-TT--A-GC
gi|93239                      :                         ttaccgagat-TCAAACAC------AGAT-CAACTGAGT--G-AC-AAT----CGG--C-----A--G-A-A--AAC-------T---ACTATGC---TATG-T--AGGA-TATAT--CA--TGATT-AG-------CA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TA-A--AGCTA----AA-CTG-T---T--T----TC-TC-TGA-----------TTT--A-----A-CCAACAATGCACA----GAAATTTCA----GTACGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93240                      :      tacaagatTACG--TGATTCGAA-CCCGG-----------------AT-CGCATGGGC--G-AC-AAT----CGG--C-----G--G-ATG-TA
gi|93241                      :                                   -TTGAACTCGG----A--T-CG-----------AC-AAT----TCC--C-----A--G-ATC-TAAC-------A---TCTGCGC---TATG-T--AGAAATATAA--CA--AGATC-GG-------TC--GTATAA------------AC----C-TG-A-A-T----TT-A-----------AA-CCG-C---T--T----AC-CT-GAG-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCCG----TAATGTTTC----GAACGTTT-ACGG--AC-AA--A-ACttcattat
gi|93242                      :        acgggatACA--GGACTCGAA-CCAGGATCG--CT-GG----A-AT-CATT-------------AT----CCAAAT-----A--A-ATA-TAAC-------C---ACTACGT---CATG-T--AGAAATATCT--CA--AAATC-GG-------AC--GTTTAA------------AT----C--A-A-G-
gi|93243                      :                                                   GAT-CACCTGTAC--G-AC-ACT----CCG--A-----A--G-TTC-TATC-------C---AAAATAC---AACA-T--AGGAATATCC--CA--TGATC-----------------TAA-------------T----G-TA-T-G-T----TT-A--AAA------AA-ATG-TATTT--T----AA-TT-GCA-----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----AAAATTTCG----GAACGTTT-ACGG--AT-AT--A-GC
gi|93244                      :                   acgagagttgaatccc-TCGAAGCCGA----A--T-CGCCCGAGT--C-AT-CAT----CCA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---TCTTCGC---CATA-C--AGGAATATAA--CA--AGATC-AT-------TC--GTATAA------------AT----G-TA-A-C-T----TT-A--AACTT----AA-
gi|93245                      :                             caggaa-TTGAACTCGG----A--T-CGCCCGGGC--G-AC-TAT----TAG--C-----T--G-ATA-CAAC-------C---TCTGC-----TATG-T--AGGAATATAA--CA--CGATC-AA-------CG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-AAG-----------ATT--A-----A-TCTGCGATGCATG----GACATTTTC----GGGCGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93246                      :                              gggat-TCGAACTCGG----A--T-TGCCCAAGT--C-AT-AAT----CCA--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTGAGA---TATG-T--GGGAATTTA
gi|93247                      :                              gagat-TCGAACTTGG----A--T-CGCCCGAGC--G-AC-AAT----TCG--G-----A--A-AGG-TAAC-------C---GGTGCGC---AATG-T--AGGGCTATAA--CA--AAATC-G---------G--GTA-AA------------A-------CA-A-G-T----TT-A--AACTT----CA-CCG-C---T--T----GC-TC--GG-----------TTT--A-----A-TCGACGATGCTCG----GATATTTGC----GGACGTTT-ACGG--TT-AT--A-ATT
gi|93248                      :                                               ggatGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTATGA--------------------TA-T-T-T----TT-A--AATTG----AA-T-----------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-
gi|93249                      :                                           gattcacgGAC-CGTCTGTGT--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-CTT-TATC-------C---ACTGCGC---TATA-T--AGGAATATTA--CA--TGGT--GGAGTGTATCG--TTATGA--------------------TA-T-T-T----TT-A--AATTG----AA-T-----------------------------------TTT--A-----A-TCGATGATACCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-gaagaca
gi|93250                      :                           gattcacg-TCGAACCC------AGAT-CGGCCTAT-----AT-AAT----CCA--T-----A--G-ATG-TCAT-------C---ACTACGC---CATG-C--AGAAATATAA--CA--AGATC-TG-------TC--GTATAA------------AT----T-TA-A-G-T----TT-A--AATTT----AA-CCA-C---T--T----AC-TC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGGCGATGAACG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACGT--AT-AT--A-ACTgaagaca
gi|93251                      :                                     atAACTCGG----A--T-CGACCGAAC--A-AC-ACT----CTA--C-----A--T-ATG-TAAG-------C---ACTGTTT---TATG-T--AGGACTATAT--CA--AGATC-TA-------TG--GTATAA------------CT----T-TA-A-A-C----TG-A--AATTT----AG-CCG-T---T--T----TCACC-GAG-----------TTT----------TT-ATGATGCCCA----GAAATATCC----GGATGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACT
gi|93252                      :                               ttta-TCGAACTCG-------ATTCGCCCGAGC--G-AT-AAT----CCA--C-----A--T-ATT-TAAC-------T---TCTGCGC---TATA-T--ATGAATATAA--CA--AGATC-GG-------CA--GTATCA------------AT----C-T------T----------AACTT----AA-TCG-C---T--T----TC-C----A-----------TTTA-A-----A-TCGATGATGCCCG----AAAATTTCT----GAACGTTT-TCGG--AT-A
gi|93253                      :                                  t-TCAAACTCTG----A--T-CTCTCAGCC--G-AC-AAT----CCT--C-----A--G-ATC-TAAC-------C---ACTACGG---TTTG-T--GGGAATTTAA--CA--ACAGC-GG-------TG--GAAGAA------------AT----TATA-A-C-T----TT-T--AATAA----AA-TCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TCT--A-----A-TCAATGATTCCCG----GAAATTTCC----CGACTCTT-ACGG--TT-AT--A-AC
gi|93254                      :                                                        GCCAGAGT--T-AT-AAT----CCA--A-----A--G-ATA-TGAC-------C---ACTATGC---TAT-------------------------C-AG-------CC--ATATAA------------AT----C-TTTA-G-T----TT-A--ACCTT----TA-TCA-C---A--T----AC-TC-AGG-----------TTA--A-----A-TCAATGATGGCTG----GAAATTTCC----CCACATTT-AC
gi|93255                      :                                    gagttcagtg----AAAT-TGACCAAGC--A-TC-AAC----TCG--C-----G--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGT---TATA-T--AGGAATATAT--CC--AGATT-GG-------CA--GTATAA------------AT----CTTA-A-G-T----TG-A--AACAC----CA-TCA-C---T--A----AC-CA-GGA-----------TTT--A-----A-T---TGATGCCCA----GTAATTGCC----GGACGTTT-ATAG--AT-AT--A-ACTA
gi|93256                      :                                                     T-CGACAGAGC--G-TC-CAT----CCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ATAGTGC---TATG-T--CGAAATATAT--CA--TGATC-GG-------CA--GTAT-----------------------------------------------------CG-T---T--T----AC-CG-AGA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCCG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACGG--AT-AC--A-ACTA
gi|93257                      :                                                     T-CGACCGAGC--G-AT-AAT----CCG--C-----A--A-ATA-TAAC-----------AT----C---TATG-C--AGGAATATGC--CG--AGATC-G--------CG--TTATAA------------AT----C-TT-T-G-T----TG-A--AACTT----AC-CCG-C---T--T----TC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATTCTCG----GGAAATTCC----GG
gi|93258                      :                                                            GAGC--C-AT-AAT----CCA--C--------G-ATG-TAAC-------C---ACTGTGC---CGTG-C--AGGAATAAAG--CA--TGAAC-GT-------CG--GTATAA------------GT----T-TC-A-T-T----TT-C--AACTT----AA-CAG-C---T--T----AC-TC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGGTGATGCCCG----CAGAATTCC----AAACGTTT-ACGT--AT-AT--C-ACT
gi|93259                      :                                                             AGC--G-AC-AAT----CAG--C-----A--G-TTC-TAAC-------CC--ACTGCGT---TGCA-T--AGAAATATTC--CA--AAGTG-GA-------TG--GCA-AA------------AT------TA-T-G-T----TT-ATAAACCT----AA-CCG-C---T--C-----C-CC-AGGCTGTCGTGTATTTT--A-----A-TCGCTGATGCTCT----GAAATTTTC----GAACGTCT-ACGG--AT-AT--A-GC
gi|93260                      :                                                               C--G-AC-ATT----TCG--C-----A--G-ATA-TAAC-------C---ACTATGC---TATG-A--AGGAATATAT--CA--AGATC-TG-------TG--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AACTT----AA-CTG-C---T--T----AC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TCAGTGATACCTG----GAAATTTTC----GGACGCTT-GTGG--AT-GG--A-ATTA
gi|93261                      :                                                                        AT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------C---TCTAC-C---CCT---------ATATAA--CA--ATATC-TG-------AC--GTATAA------------CT----C-TA-A-C-T----TT-A--AACTC----AA-CCG-C---A--T----AC-AT-GTG-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACC----GAACGTTT-ACGC--AT-A---A-AC
gi|93262                      :                                                                        AT----CAA--T-----A--G-ATA-TAAC-------CTCGACCAC-C---CAT---------ATATAA--CA--ATATCTGA-------C----TTTAA------------AT-------A-A-C-T----TT-A--AACTC----AA-CCG-T---A--T----AC-AC-GTG-----------TTT--A-----A-TCGATTATACCCG----GAAATTACA----GAACGTTT-GCGC--AT-AT--A-
gi|93263                      :                                                                                                                       C---TATG-C--AGGAATGTAA--AA--AGATC-AG-------TG--GAATAA------------AT----C-TA-A-A-T----TT-T--ATCTC----AA-CTG-C---T--A----AC-AA-GAG-----------CTT--A-----A-T
gi|93264                      :                                                                    aataggtatgaccagaataagttaa-ATT-TGAC-------C---ACTGCAC---CATG-T--AGGAATATCA--AA--AGACC-GG-------AC--GTATAA------------TT----C-TA-A-T-T----TT-A--AACTC----AA-CCA-C---T--T----AC-TC-TGG-----------TTT--A-----T-TTGATGATGCCTG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACGG--AT-AA--A-ACT
gi|93265                      :                                                                                             -ATA-TAAA-------T---ATTATGT---TAGG-C--AGAAATATAT--AA--AGATC-AG-------TGTTATATAT------------AT----A-TA-A-G-T----TG-A--AACCT----AA-CCG-T---T--T----TT-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGATAATGGCCA----GAATGATCC----GGGCGTTC-AC
gi|93266                      :                                                                                                                                                                       TGTAG------------AC----C-TA-T-G-TCTTATA-A--AAAAT----AA-CCG-A---T--T----AC-CC-GGG-----------TTT--AGTGAGA-TTAATATTGCCCG----GAAATTTCT----TCACATTT-ACAG--AT-GT--A-ACaactacgatat
gi|93267                      :                                                    atataattgtcatgaaatgttgatgtactaacatctttgagttTA-TAAC-------C---ATTGTAGGAATATA-TCAAGGAATATAT--CA--AGAAC-TG-------CG--GTATAA------------AT----A-TA-A-G-T----TT-A--AACTT----AA-CAG-A---T--T----AC-CC-GAA-----------ATT--A-----A-TCAGTGATACCCG----GAAATTTCC----TGACGTTT-ACAG--AA-AT--A-ACTA
gi|93268                      :                                                                                               TA-TAAC-------C---ACTATGC---TAAG-G--AGGAATATAT--CA--TG-T---G-------TA--GTATAA------------AT----C-TA-A-G-T----TG-A--AA--------A-CC--C---T--C----TC-CC-GGA-----------TTT--A-----A-TTGATGATGCCCG----GAAATTTTC----GGACGTTA-AC-G--AC-AT--A-ACTA
gi|93269                      :                                                                                                A-TAGC-------C---GCTAAGC---CACT-A--AGGAACAAATA-CA--A-ATT-GG-------TG--GTATAA------------AT----C-GG-A-G-T----TG-A--AAATA----AT-CCT-C---T--T----AC-AC-GAA-----------TTT--A-----A-TCTATGATGCCTG----GAAATTTAC----GGACATTT-ACAC--AT-GT--A-ACTA
gi|93270                      :                                                                                                      -------C---ATTGCGC---TATG-T--AGCAATATAA--CA--AATCC-TG-------CC--GTATTA------------AT----C-TA-A-C-T----TT-A--ATCTT----AA-CCA-C---T--T----TC-TC-GGA-----------ATT--A-----A-CCGATGATGCCTG----AAAATTTTC----GAACATGT-ACGG--AT-AT--A-ACT
gi|93271                      :                                                                                                                                     GAATATTA--CA--AGATC-AG-------CG--GTATAATTAGTTACAGTTATAAAAC-TA-A-T-T----TT-A--AATTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------CT---------G-TCGAATTTACTCC----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACGG--AT-GT--A-
gi|93272                      :                                                                                                                                                A--AGATC-AG-------CA--GTATAG------------AT----C-TA-A----------------CTT----AA-CCT-C---A--T----AT-CC-GAA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGACTG----GAAATATCA----AGACGTAT-AC
gi|93273                      :                                                                                                                                             ataA--AGATC-TG-------CC--TTATAC------------AT----C-AA-A-G-T----TT-G--AACTT--------TG-T---------------C-GGG-----------TTT--A-----A-TCGAAAATGCCCGAAAGGAAATTTCC----GAACGTTT-ATGG--ATGAT--A-AC
gi|93274                      :                                                                                                                                                                       TATAA------------ATAT--C-TT-A-T-T----TT-A--AGCTT----AA-CCG-C---A--T----AC-GC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGAGGCCCG----GAAATTTCC----AGACGTTA-CCGG--AT-AT--A-AC
gi|93275                      :                                                                                                                                                                           A------------AT----C-TA-C-G-T----TT-T--AAGTT----AA-CCG-C---T--T----AC-TC-GGT-----------TTT--T-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ACAG--AT-AT--A-ACT
gi|93276                      :                                                                                                                                                                            ------------AT----C-TT-A-C-T----TG-A--AAATT----AAACCG-C---T--T----AC-GC-GGG-----------TTA--A-----A-TGGATGAT-CCCG----GAAACTTCA----CGAGGTTT-ACGG--AT-AT--A-
gi|93277                      :                                                                                                                                                                                          ----C-TA-T-G-C----TG-A--AACTT----AA-CCG-C---T--T----AT-CC-GAG-----------TTT--A-----A-T---------CTG----GAAATGTCC----GGAAGTTT-ACGG--AT-TA--A-ACTA
gi|93278                      :                                                                                                                                                                                                    -G-T----TG-A--AACTC----AA-CCG-G---T--TGTAAAC-CC-GGA-----------TT---A-----A-TCGATGATATCCG----GAAATGTTC----AAACGTTT-TCGA--AT-AT--G-A
gi|93279                      :                                                                                                                                                                                                                --AACTT----AA-CTT-A---T--T----AC-TC-GGG-----------TTT--A-----A-TCGATGCTACTCG----GTAATTTCC----GAATG
gi|93280                      :                                                                                                                                                                                                                   ATTT----AA-CCG-C---T--T----AC-CC-GGG-----------TGT--A-----A-TCGATGCTGTCCA----GAAATTTCC----GGACGATT-TCGG--AT-AT--A-ACTagattatatacta
gi|93281                      :                                                                                                                                                                                                                     TT----AA-CCA-C---T--T----AC-CT-GGA-----------TTA--A-----A-TCGATGATGCCAG----GAAATTTCT----GGACGTTT-ACGG--AT-AT--A-ACTA
gi|93282                      :                                                                                                                                                                                                                                                  C-GGA-----------TTT--A-----A-TCGATGATGCCGG----GAAATTTCC----GGACGTTT-AATG--AT-AT--A-ACTA
gi|93283                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----AATCGATGATATCCG----GAAATTTCC----GAACGTTT-ATGG--AT-AC--A-
gi|93284                      :                                                                                                                                                                                                                                                     at-----------TTT--C-----A-TCGATGATGCCCG----GAAGTTTCC----GAACGTTT-ACGA--TT-AT--A-
gi|93285                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----A-TCGATGATGTCCG----GAAATTTCT----GAACGTTT-ACGG--AT-AT--A-
gi|93286                      :                                                                                                                                                                                                                                                       -----------TTT--A-----A-TCAACAATGCCTG----GAAATTTCC----GAATGTTT-ACAG--AT-A
gi|93287                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGATGCCCA----GAAATTTTC----GAACGTTG-ACGG--AT-AT--A-