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gi|5555 : atgttttgtatgttctataactaatttatatcgaaataacacggcaaattagccttga--------A--------ACC--------GTAGATAACCAATGATGTGTC---GTCTATTG--TATA------ATAGGTGTTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGTTATAATTGATAAATTGTTGAC-CAA--AAT-A-AGTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--G--------TAAAA--CATT-TATATTAACTGCATGGTTTATATTCATT-TG-A-A-A-GAAA---A-TTT--ATTTTT-ATCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TAAAAAA-A---GA-GTATATCCGAA---TGAACG-AGTGCACTCAGTAGCGCA--C-GAAAA----GCT----CT-G---T-TATCAGT-TTT-CT---TACTGTGTCTAGCGTATA--------CA------------------G--CGCT-T--CTGAGTGCACTCAG---C-GT-----AT-C-TGAGT------GCATTC-A-----G---C-GTGT-----C-TG-AGTG-----------------------------------CA-CT-C-GAT--CTATTTCATGCGTTCAGGAGT---GCGT---TTAT--T-AT-TCAAA---ATCCAGCG--T-TTGCT-TA-CGGTCCATGTC-CGC-TCCGTCTGC-----------GCTC--AAT--CT-GCGCTCCGTTCGCGCTCCGTCTGCGCT-A------------------CGC-----------------TTA---CGCTCTG----AGT----GCACTC--CGTTTGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA------GCGGTTTAGG-GTCTGTA
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gi|5533 : aaatcgaaataaagtatatgttttgcatgttctataactaatctatatcgaaataacacggcaagtagtgaattcatattacatcttttcgaattgttatttacacaatatatataattatttatatttttgttgcgcaaaccaaaccatgtttaaacatgcaactaaatgagccttgaaaccgtagctaaccattgatgtgtcgtctattgtataataggtattttaaacatagttgtattgatcagctaaatattaaaatttatgctataattgataaattgcttaccaaaataagttttatcatgcgttttacaataaaacatttatataaacttcattgtttatatttatgtgaaagaatacttcttttttatctcaattttaagtatcgaatttacgatcaaataatgaaaaaaG-AGTGCACTCAGTAGCGCagcgtatctgagtgcattcagtgtgtctgagtgcactcgatctatttcatgcgttcaggagtgcgttaattattcaaaatccagcgttcgcgaacggtcaaggtccgctccgtcagcgctcaatctgcgctccgttcgcgctccgtctgcgctccgctcgcgctccgcttacgctctgagtgcactccgtttgcgtgcaattggggtacttgagcggtttagggtctgta
gi|5557 : aaatcgaaataaagtacatgttttgtatgttatataactaatttatatcgaaataacacggcaaattacatcttttcgaattgttatttacacaatatataattatttatatttttgttgcgcaaaccaaatcatgcttaaacatgcaactaaattagccttgaaaccgtagatagccattgatgtgtcgtctattgtataataggtattttaaacattgtattgatcagctaaatattgatatttatgtaataattgataaattgttgaccaaaataagttttatcaagcgttttacagtaaaacatttatattaactaaatggtttatatttatgtgaaagaaaatttattttttatctcgattttaagtatcgacttcacgataaaataataaaaaaagagtatatccgaatgaacgagtgcactcagtagcacacgaatagttctgttatcagttatcttactgtgtctagcgtatacaG-AGTGCACTCAGATGCGCA----GTATA------------T-G--------CAGTATACGCTAGACACTGTA---AG-ATA-AC-TGATAACAGAACT-----ATTCGT--G--CGCT-A--CTGAGTGCACTC-G---T-TC-----AT-T-CGGAT------ACACTC-agcgtatctgagtgcattcagcgtgtctgagtgcactcgatctatttcatgcgttcaggagtgcgtttattattcaaaatccagcgtttgcttacggtccatgtccgctccgtcagcgctcaatctgcgctccgttcgcgctccgtctgcgctgcgcttgcgctccgcttacgctctgagtgcactccgtttgcgtgcaattggggtacttgagcggtttagggtctgta
gi|5561 : ttgtttgatcagctaaatattgatatttatgttataattgataaagtgttgaccaaaataagtttcatcatgcgttttacaataaaacatttatataaactacatggtttatatttatgtaaaaaaaaatgtctttgttatctcgattttaagtatcgacttcacgatcaaataataaaaaaCAGTAGCACA--C-GAATA----GTT----CT-G---T-TATCAGT-TAT-CT---TACTGTGTCTAGCGTATAC-TG----CA----T-----ATAC-T--G--CGCA-T-------------------------------C-TGAGT------GCACTC-A-----G---C-GTAT-----C-TG-AGTGC---ATTC-AG---C---ATGT-C-TGAG----TGCA-CT-C-GAT--CTATTTCATGCGTTCAGGAGT---GCGT---TTAT--T-AT-TCAAA---ATCCAGCG--T-TTGCT-TT-CGGTCCAGGTC-CGC-TCCGTCAGC-----------GCTC--AAT--CT-GCGCTCCGTTCGCGCTCCGTCTGCGCT-ACGA-TTGCGCTC------AGC-----------------TTA---CGCTCTG----AGT----GCATTC--CGTTTGCG-AGC-AATT--G--GGGTACTTGA------GCGGTTTAGG-GTCTGTAagcgtatctgagtgcattcagcgtgtctgagtgtactcgatctatttcatgcgttcaggagtgcgtttattattcaaaatccagcgtttgcttacggtccaggtccgttccgtcagcgctcaatctgcgctccgttcgcgctccgtctgcgctacgctcgcgctccgcttacgctctgagtgcactccgtttgcgtgcaattggggtacttgagcggtttagggtctgta
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gi|5553 : tgtatgttctataactaatttataccgaaatagcaaggcaaatagtgaattcattacatcttttcgcattgttatttacataatatatatttttgttgcgcaaaccaaatcatatttaaaaatcggccttgaaactgtagataaccattgataagtcgtctattgaatatatatattgtaggtattttaaacatattatattgattagctaaatatttatatttattctataattgaccaattgttgaccaaaattagttttatcatgcgttataccataaacatttatatatactatattaatgtaataagaaaatttcttttttatcccgattttgattatcgacttcactctcaaataatgaaaaaagagtgtacccgaatgaacgagttcactcagtagcgaacaaatagttttgttatcagttatcttactgtgtctagcgtatgttgcatgtactgcgcatTAGCGAATGC-TG----AA----TTTTGAATAA-TTAA--CGCA-CTCCTGA----AC-CAA---T-GTTATAGAT-C--AAGT------GCATGC-A-----GACAC-G--------C-TG-AGTGC---ACTC-AG---T---TTTG-C-TGAG----TGCA-TT-C-acggtccaggtccaatccgtcagcgctaaatctgtgctcaatctgcacttcgttcccgttccgtcagcgctacgctcgcactctgcttacgctgtaagtgcactccgtttgcgtgtaattggggtacttgagcggtttaaggtctgta
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gi|5599 : attatttatattttagttgcgcaaataaatcatgtttaaatatgcaactgaattggccttgagaccgtagttaaccattgatgcattgtctgttgtataataggtcttttaaacatattatatttattagctaaatattgacatttatgatatcattgaaaaattgttcaccaaaattagtttaataatgtattataccaaagaaaatttaaatatactatatggtttattattatgtgaaaagaaaattttgtttttatcttcattttgactaacgacttaaccctaaaataacgaaaaagacagtgtatcc--CTGAGTGCACTC--------C-----AT-C-TGCTT------GCATTT-G-----G---G-GTAT-----T-TG-AGAGG---ATTA-GG---------GT-C-TGcgtgtctgcatgcacttgatctataacattggttcaggagtgcgttaattattcaaaattcagcattcgctaactgtccaggtccagtccatcagcactcaatctgcgctccgtacacattttgtttaagctcacagtgcactccgtttgcgtgcatttgctgtacttgagcagattagggtctgta
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gi|5563 : aaatcgaaataaagtatatgttctgtatgttctataactaatttatatcgaaatagcaaggcatatagtgaattcatatttcatcttttctaattgttatttacagtatatatagagttttttatatttagttgcgtaaataaatatgcaactgaatttgccttgagaccatagttaaccattgatgcttcgtctgttgtataataggtcttttaaacatattgattagctaaatattgatcttttttatataattgaaaaattgttgaccaaaattaggtttgtaatgcgttaaaccaaagaaaatttaaatatgctacatggtttataattatgtgaaaagaaactttcgtttttatctcgattctgaactcaattaacgaaaaagagtgtatccgaatgaacgagtgcactcagtagcgcacgaatagttatcttactgtgtctagcgtatattgcatatactgcgTGAGTGCACTGAG-----AC-----ATGC-TGAGT------GTACTC-A-----G---atctataacatgcgttcaggagtgcgttaattgtttaaaattcagcgttcgctaacggtccaggtccgctccgtcagcactcaatctgcactccattcgttaacgtttcgtttacgctctgagtgaactccgtttgcgtgcatttggggt
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gi|5551 : tggtactagttatattactgtgtctagtgtatattgcatAGTGCACTCAG-------------------AGT------GCACTC-A-----G-----ATACA----C-TA-AGTGC---ACTC-Agacttatttcatgcgttcaagagtgagtttattattcaaaatccagcgctcgcttacggtcccggtccg
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gi|5555 : atgttttgtatgttctataactaatttatatcgaaataacacggcaaattagccttgaTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACTGCAAAT
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gi|5556 : ttttgtatgttctataactaatttatatcgaaataacactgcaaattagccttgaGTGTTTAAAACAAAAT-GTATTGATTTTTAACCTGTAAGTTAAAC---GATATTCTGATTATAATATAACTGCCAAATTGATGACTAAATG-A-ACAGCTTTATAATTCATT-------TGTAT--A--C--------CGAAATGCACTAATGAATACTGCATTGTTAATAATTA-GT-G------GAAAT-ATTGT--TTTCGTTTAATCTCGA---TTTGTATTATCGACATAACTCTCCT-------ATAA-CGAAAGA-ACAAGA-GTGTATCCGAATGAACAAGTGCACTCGCAAGCGCACTCACGTGCGCACAAA-----------AT---TTATCTAACTGCATGTAGCGCA---------TACTGCACTTTT---------TC-----------GTGCAATCAG-------------ATACA------CTGAGTGCACTCAATATATATC-TACCGTTCATTAGTGAGTTAATTATT---CAAAACCAAGCGTTT-GCTCA-TGGTCCAGGTC-------------------------------------CGCTCCGT--TCGGGCTCTGTTCACCCTCCGATTGCGCTCC------GTTTA-----------CGCTC----TG----AGT----TCACTC--CCTT---TGCG-TGC-ATTA--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAAGGTTTGTA
gi|5557 : TTGT-TTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGTTATAATTGATAAAGTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTCATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTATATTTATGT-A-A-A-AAAAA--ATGTC--TTT--GTTA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-T-AAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTCA-----GTA-------GCGCACGAATAGTT-CTGTTATCAGTTATCTTACAGTGTCTAGCGTATACTGCATATACTGCGCATCTGAGT--------------------GCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGTACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGTTTATTATT---CAAAATCCAGCGTTT-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGTTCCGTCAG----C-----------GCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTCTGCGCTACGCTCGCGCTCC------GCTTA-----------CGCTC----TG----AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5558 : GCTAAATATTGATATT-----TATGTTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAC-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTGTATTT
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gi|5561 : CA-----GTA-------GCACACGAATAGTT-CTGTTATCAGTTATCTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATATACTGCGCATCTGAGT--------------------GCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCATGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGTTTATTATT---CAAAATCCAGCGTTT-GCTTT-CGGTCCAGGTCCGCTCCGTCAG----C-----------GCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTCTGCGCTACGATTGCGCTCA------GCTTA-----------CGCTC----TG----AGT----GCATTC--CGTT---TGCG-AGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5562 : TGGTACTAGTTATATTACTGTGTCTAGTGTATATTGCAT
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gi|5564 : gtgctcttttcatgccagaatacacgaaCACTCCGTTTG----C-----------GCTCAGTTTGTACTCCGT--TCGCGCTCAGTTTGTGCTCCGTTTGCACTCC------GTTTA-----------CGactccgtttacg
gi|5565 : gtgctcttttcatgccagaatacacgaatctgtttcctctgatccgctcaagtaccccataattgGTTTGCACTCCGT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTTAGTTCGCGCTCC------GTTCG-----------CGCTC----CG----
gi|5566 : G-TGC-AATTATG--GGGCACTTGA--GCGGtttgcg
gi|5566 : CACTCCGTTTC----C-----------GCTCAGTTTGCACTTCGT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTTAGTTCGCGCTCC------GTTTG-----------CGtccgtttccgctcagtttgcacttcgttcgcgctccgttcgcgcttagttcgcgctccgtttgcgtgca
gi|5567 : ccgctcaagtgccccataattgG-TGC-AATT--ATTGGGTACTTGA--GCGGtgca
gi|5567 : CACTCCATTTG----C-----------GCTCAGTTTGCACTCCTT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTTAGATCGCTCTCC------GTTCG-----------CGtccatttgcgctcagtttgcactcctttcgcgctccgttcgcgcttagatcgctctccgttcgcg
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gi|5576 : CACTCCGTTTG----C-----------GCTCAGTTTGCACTCCGT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTTAGTTCGCGCTCC------GTTCG-----------CGCTC----CG----TTC----GCGCTC--CGTT---TGCG-TGC-A
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gi|5550 : GCAAATAGTGAATTCATGTTACATCTTTTCGAATTGTTATATATATACATTTTATTACATTTTTT------------AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAATCATG-CTTAAA---CATGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------GTAGATAACCATTGATGTGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----CATGCTATAATTGATAAATTGGTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGAAA--ATTAC--TTT--TTTA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ACAA-TGAAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTTAGTAGCGCACGAATGGTT-CTGT-TATCAGTTATTTTACTGTGTCTGGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATC--AGAG-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTGTTCAAAATCCAGCGTTT-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCT-----------TCA----G---TGCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCACTCCATCTGCGCTACACTCGCGCTCC------GCTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTAAGGGTCTGTA
gi|5551 : TAT-T-TACATTATATAT-A-A------------------AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAATCATG-TTTAA-----------CTAAAT------TGGCCTTGAA--------ACC--------GTAGATAACCATTGATGCGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGT-TTTTAAACTTTATTATATTGATG-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGATATAATTGACAAATT---------------A--GTTTTAGCATGCATT-------A-TAC--C--A---------AAAA--CATTTATA----CTACATGGTTTATATTTATGTTA-A-A-AGAAA--ATTTCC-TTT--TTTA-TCTCAA---TTTTGGTTATTGACTTCAAGCTCAA-------ATAA-TGAAGAA-A---GT-GTGTATCTGAATGAACGAATGCACTCAGTAGCGCACAAATAGTT-TAGT-AATCAGTTATCTTACTGTGTCTAGCATATAGTACATAT-ACTGCACATTTGA--G-----------------TGCACTTAGTGTATCTGAGTGCAC--------TCTGAGTGCACTTGATCTATTTCATG-CGTTTAGGAGTATGTTTATTATTATTTAAAATCCAGCGTTC-G-TTACCGGTCCAGGTCCACTCCA-----------TCA----G---CGTTTAATCTGTGC----T--TTGCGCTCCATT
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gi|5553 : ataaagtatatgttttgtatgttctataactaatttatatcgaaataacacggcaaattagccttgaATT-ATTTATATTTTAGTTGCGCAAAT-AAATCATG-TTTAAA---TATGCAACTGAAT------T--------GGCCTTGAGACC--------GTAGTTAACCATTGATGCATT---GTCTGTTG------TATA--ATAGGTCTTTTAAACAT-ATTATATTTATT-----------AGCTAAATATTGACATT-----TATGATATCATTGAAAAATTGTTCACCAAAAT-T-A--GTTTAATAATGTATT-------A-TAC--C--A--------AAGAA--AATTTAAATATACTATATGGTTTATTATTATGT-GAA-A-AGAAA--ATTTT--GTT--TTTA-TCTTCA---TTTTGACTAACGACTTAACCCTAAA-------ATAA-CGAAAAAGA---CA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACAAAT--------------AGTTATCTTAATGTGTCTAGCGTATATTGCATAT-ACTGTGCACCTGA--A-----------------TGCACTCAGCAAAACTGAGTGCACTCAGCGTGTCTGCATGCACTTGATCTATAACATT-GGTTCAGGAGTGCGT---TAATTATTCAAAATTCAGCATTC-GCTAA-CTGTCCAGGTCCAGTCCA-----------TCA----G---CACTCAATCTGCGCTCCGT--ACACATTTTGTT-----TAAGCTCAC-----------------------------------------------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-ATTT--G--CTGTACTTGA--GCAGATTAGGGTCTGTA
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gi|5555 : atgttttgtatgttctataactaatttatatcgaaataacacggcaaattagccttgaTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACTGCAAAT
gi|5555 : --------A--------ACC--------GTAGATAACCAATGATGTGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTGTTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGTTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--G--------TAAAA--CATTTATATTAACTGCATGGTTTATATTCATTT-G-A-A-AGAAA--ATTTA--TTT--TT-A-TCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TAAAAAA-A---GA-GTATATCCGAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACGAAAAGCT-CTGT-TATCAGTTTTCTTACTGTGTCTAGCGTATAC--------A--GCGCTTCTGAGTG-------------------CACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTATTCAAAATCCAGCGTTT-GCTTA-CGGTCCATGTCCGCTCCG-----------TCT----G---CGCTCAATCTGCGCTCCGT-------------TCGCGCTCCGTCTGCGCTAC------GCTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTAtagccttgaaaccgtagataaccaatgatgtgtcgtctattgtataataggtgttttaaacattattgtattgatcagctaaatattgatatttatgttataattgataaattgttgaccaaaataagttttatcatgcgttttacagtaaaacatttatattaactgcatggtttatattcatttgaaagaaaatttatttttatctcgattttaagtatcgacttcacgatcaaataataaaaaaagagtatatccgaatgaacgagtgcactcagtagcgcacgaaaagctctgttatcagttttcttactgtgtctagcgtatacagcgcttctgagtgcactcagcgtatctgagtgcattcagcgtgtctgagtgcactcgatctatttcatgcgttcaggagtgcgtttattattcaaaatccagcgtttgcttacggtccatgtccgctccgtctgcgctcaatctgcgctccgttcgcgctccgtctgcgctacgcttacgctctgagtgcactccgtttgcgtgcaattggggtacttgagcggtttagggtctgta
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gi|5562 : TGG-TACTAGTTATATTACTGTGTCTAGTGTATATTGCAT
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gi|5608 : G-TGC-AATTATG--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5609 : G-TGC-AATTATG--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5610 : G-TGC-AATTATG--GGGCACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5611 : G-TGC-AATTATG--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTATA
gi|5612 : G-TGC-AATTATG--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5613 : G-TGC-AATT--ATTGGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5614 : T--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
blockSeqs : A A T TACATTTTATTATATTTTTTAA T T AAT A GAGCCT AGCCTTGAA TTGAAATT T ATC AATATA TT A TTTAACCTGTA CTGAT T CAC CA ACACCAAT CA CC AAACAAAAC TG A T A T C TG AA CG A ATA G CTCTCGT A G CAA A A A T GTGCACTCAGTGTATCTGAGTG C TTA T T C TCAGCGCTAAA CGTCA ATC AC GCTTAT CGCTCCGATTA CGTT TTCGCGCTTA GCTA AAA AT TT AC
blockSeqs : . . . TACATTTTATTACATTTTTAA . . . A . AGCCTTGAA . T . . . A . . C A . TG C . T . A . T . C T C . . . G . . . . . . . . GAGTG . . . T . . A . AC . . CGTT TTTCC TC . AT TT .
blockSeqs : . . . TACATTTTATTACATTTTTAA . . . A . AGCCTTGAA . T . . . A . . C A . T . . T . A . A . C . . . . . G . . . . . . . . GTGTA . . . T . . A . AC . . CGTT A . . AT . .
blockSeqs : . . . TACATTTTATTACATTTTTAA . . . A . AGCCTTGAA . T . . . A . . C A . T . . T . A . . . C . . . . . G . . . . . . . . CGTG . . . T . . A . AC . . CATT A . . AT . .
blockSeqs : . . . TACATTTTATTACATTTTTAA . . . A . GGCCTTGAA . T . . . A . . C A . T . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . TGTG . . . T . . A . AC . . CGTT A . . AT . .
blockSeqs : . . . CATTTTTTAA . . . A . GGCCTTGAA . T . . . A . . T A . T . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTA . . . T . . A . AC . . CGTT A . . AT . .
blockSeqs : . . . TAGAG . . . A . GGCCTTGAA . T . . . A . . C A . T . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . A . . A . CC . . CGTT A . . AT . .
blockSeqs : . . . TAAT . . . A . AGCCTTGAA . T . . . A . . T A . T . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . T . . A . AC . . . A . . AT . .
blockSeqs : . . . TAAA . . . A . GACCTTGAA . T . . . A . . T A . T . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . T . . A . GC . . . A . . AT . .
blockSeqs : . . . TAA . . . A . TGCCTTGAG . T . . . A . . C A . T . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . T . . A . AC . . . A . . AT . .
blockSeqs : . . . TAA . . . A . GGCCTTGAA . T . . . A . . G A . T . . T . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AC . . . A . . AT . .
blockSeqs : . . . TAA . . . G . GGCCTTGAA . C . . . A . . A T . T . . T . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AC . . . A . . AT . .
blockSeqs : . . . AAT . . . G . GGCCTTGAG . T . . . G . . A T . A . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AC . . . A . . AT . .
blockSeqs : . . . AAT . . . A . TGAA . C . . . C . . T T . A . . A . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . T . . A . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . TAA . . . G . GAA . C . . . A . . G A . A . . T . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . T . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . AAT . . . T . A . C . . . A . . A T . T . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . AAA . . . A . A . C . . . G . . A T . A . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . AAA . . . G . A . A . . . C . . A T . A . . A . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . AG . . . G . A . C . . . G . . A T . A . . T . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AA . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . G . A . A . . . G . . C A . A . . T . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . A . . T . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . A . G . T . . . G . . C T . A . . T . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . T . . A . CC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . A . A . C . . . . . . A A . A . . A . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . T . . A . CC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . T . . . . . . T A . T . . T . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . GTG . . . T . . T . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : A . C . . . . . . A T . A . . T . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . A . . A . AT . . . A . . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . . T A . T . . C . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . ATG . . . T . . T . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . . T A . A . . T . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . T . . T . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . A A . T . . T . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . C . . A . AC . . . A . . . . .
blockSeqs : . . T A . T . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTG . . . T . . T . CA . . . A . . . . .
blockSeqs : . T A . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . GTG . . . T . . A . CC . . . T . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . T . . A . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . TG . . . T . . T . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . T . TA . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . TA . . . T . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . T . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . T . . . . .
blockSeqs : . T . CA . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . CC . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . CA . . . C . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . A . . . . .
blockSeqs : . T . CC . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . CA . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . GC . . . . . . . .
blockSeqs : . T . CC . . . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . . . .
blockSeqs : . T . CA . . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . . . .
blockSeqs : . T . CA . . . . .
blockSeqs : . T . TA . . .
blockSeqs : . T . CA . . .
blockSeqs : . T . TA . . .
blockSeqs : . T . TA . . .
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blockSeqs : . . . C . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : AAATCGAAATAAAGTACATGTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTGTTAT-T-TACACAATATAT-ATA------------------AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAATCATG-CTTAAA---CGTGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------GTAGATAACCATTGATGCGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGNTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGAAA--ATTTC--TTT--TTTA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TGAAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CTGT-TATCAGTTATCTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATCTGAGTG-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTATTCAAAATCCAGCGTTC-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCG-----------TCT----G---CGCTCAGTCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTNCGTTCGCGCTCC------GTTCG-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
finalCons : AAATCGAAATAAAGTACATGTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTGTTAT-T-TACACAATATAT-ATA------------------AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAATCATG-CTTAAA---CGTGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------GTAGATAACCATTGATGCGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGNTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGAAA--ATTTC--TTT--TTTA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TGAAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CTGT-TATCAGTTATCTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATCTGAGTG-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTATTCAAAATCCAGCGTTC-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCG-----------TCT----G---CGCTCAGTCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTNCGTTCGCGCTCC------GTTCG-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
Alignments
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Reference ( family-331 ) : AAATCGAAATAAAGTACATGTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTGTTAT-T-TACACAATATAT-ATA------------------AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAATCATG-CTTAAA---CGTGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------GTAGATAACCATTGATGCGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGNTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGAAA--ATTTC--TTT--TTTA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TGAAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CTGT-TATCAGTTATCTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATCTGAGTG-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTATTCAAAATCCAGCGTTC-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCG-----------TCT----G---CGCTCAGTCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTTCGCGCTNCGTTCGCGCTCC------GTTCG-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5523 : AAATCGAAATAAAGTACATGTTTTGTGTATTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGACAAATA
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gi|5525 : AAATCAAAATAAAGTACATGTATTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTGTTAT-T-TACACAATATAT-ATA------------------A-TT-ATTTATATATTTGTTGCGCAAACCAAATCATG-CTTAAA---CATGCAACTAAAT------T--------AGCCTTGAAACC--------GTAGATAACCATTGATGTATC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TCTGTTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAACTACATGGTTTATATTAATGT-G-A-A-AGAAA--ATTTT--TTT--CTTA-TCTCGA---CTTTACGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TG-AAAA-A---GA-GTGTATCCAAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CTGT-TATCAGTTATCTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATCTGA--G-----------------TACACTCAACGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CATTCAGGAGTGCGT---TTATTATTCAAAATCCTGCGTTT-GCTTA-CGGTCCAGGTCTGTTCCG-----------TCA----G---CGCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTCTGCGCTACGCTCACGCTCC------GCTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCA-TGC-ATTT--G--GGGTACTTAA--GCAGTTTAGGGTCTGTA
gi|5526 : AAATCGAAATAAAGTACATGTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTATTAT-T-TACACAATATAT-ATACATTTTATTATATTTTTTAATT-ATTTATATTTTTGTTGTGCAAACCAAATCATG-CTTAAA---CATGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------ATAGATAACCGTTGATGTGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGCTATAATTGATAAATTGTTGACCAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--TATTTATATAAACTGCATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGGAA--A-------TT--TTTA-TCTCTA---TTTTAAGTATCGACTTCACGATCAA-------ATAA-TGAAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACGACTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CTGT-TATCAGTTATTTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATCTGA--G-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTATTCAAAATCCAGCGTTT-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCG-----------TCA----G---CGCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTCTGCGCTACGCTCGCGCTCC------GCTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-AATT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|5527 : AAATCGAAATAAAGTAAATGTATTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTGTTAT-T-TACACAATATAT-ATACATTTTATTACATTTTT-AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAAACATG-CTTAAA---CATGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------GTAGATAACCGTTGATGTGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGCTATAATTGATAAATTGTTGACAAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAAATACATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGAAA--TTTTC--TTT--TTAA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGATTTCACGATCAA-------ATGA-TGAAAAA-G---GA-GTGTATCCGAATGAACGAGTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CTGT-TATCAGTTTTCTTACTGTGTCTAGCGTATACTGCATAT-ACTGCGCATCTGA--G-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CATTCAGGAGTGCGT---TTATTATTAAAAATTCAGCGTTT-GTTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCG-----------TCA----G---CGCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTCTGCGCTACGCTCGCGCTCC------GCTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-ATTT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
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gi|5529 : AAATCGAAATAAAGTAAATGTATTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATAGTGAATTCATATTACATCTTTTCGAATTGTTAT-T-TACACAATATAT-ATACATTTTATTACATTTTT-AATT-ATTTATATTTTTGTTGCGCAAACCAAAACATG-CTTAAA---CATGCAACTAAAT------T--------A--------ACC--------GTAGATAACCGTTGATGTGTC---GTCTATTG------TATA--ATAGGTATTTTAAACATTATTGTATTGATC-----------AGCTAAATATTGATATT-----TATGCTATAATTGATAAATTGTTGACAAAAAT-A-A--GTTTTATCATGCGTT-------T-TAC--A--A--------TAAAA--CATTTATATAAAATACATGGTTTATATTTATGT-G-A-A-AGAAA--TTTTC--TTT--TTAA-TCTCGA---TTTTAAGTATCGATTTCACGATCAA-------ATGA-TGAAAAA-A---GA-GTGTATCCGAATGAACAAGTGCACTCAGTAGCGCACGAATAGTT-CAGT-TATCAGTTATCATACTGTGTCTAGCGGATACTGCACAT-ACTGCGCATCTGA--G-----------------TGCACTCAGCGTATCTGAGTGCATTCAGCGTGTCTGAGTGCACTCGATCTATTTCATG-CGTTCAGGAGTGCGT---TTATTATTAAAAATTCAGCGTTT-GCTTA-CGGTCCAGGTCCGCTCCG-----------TCA----G---CGCTCAATCTGCGCTCCGT--TCGCGCTCCGTCTGCGCTACGCTCGCGCTCC------GCTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----GCACTC--CGTT---TGCG-TGC-ATTT--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAGGGTCTGTA
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gi|5552 : ATAAAGTATATGTTTTGTATGTTCTATAACTAATTTATATCGAAATAACACGGCAAATt
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gi|5556 : ttttgtatgttctataactaatttatatcgaaataacactgcaaattagccttgaGTGTTTAAAACAAAAT-GTATTGATTTTTAACCTGTAAGTTAAAC---GATATTCTGATTATAATATAACTGCCAAATTGATGACTAAATG-A-ACAGCTTTATAATTCATT-------TGTAT--A--C--------CGAAATGCACTAATGAATACTGCATTGTTAATAATTA-GT-G------GAAAT-ATTGT--TTTCGTTTAATCTCGA---TTTGTATTATCGACATAACTCTCCT-------ATAA-CGAAAGA-ACAAGA-GTGTATCCGAATGAACAAGTGCACTCGCAAGCGCACTCAC-GTG-C-GCACAAAATTTATCTAACTGCATGTAGCGCATACTGC-----ACTT----TTT---CG-----------------TGCAATCAG-------------ATACA------CTGAGTGCACTCAATATATATC-TACCGTTCATTAGTGAGT---TAATTATTCAAAACCAAGCGTTT-GCTCA-TGGTCCAGGTC----------------------------------------CGCTCCGT--TCGGGCTCTGTTCACCCTCCGATTGCGCTCC------GTTTA-----------CGCTC----TG---------AGT----TCACTC--CCTT---TGCG-TGC-ATTA--G--GGGTACTTGA--GCGGTTTAAGGTTTGTA
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