lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 66 0 00 0 11 11 00 1 2222222222 44444 11 0 111111111 0 11 111111 33 22222
lowQualScore : . .. . .. . .. .. .. . .......... ..... .. . ......... . .. ...... .. .....
lowQualScore : 3 88 6 77 5 66 11 66 5 5555555555 11111 11 4 888888888 5 55 333333 00 11111
consensus : ATATG-TTGN-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCACC-----CGAAATTTAGACAA
Reference ( gi|71892 ) : ATATG-TTGT-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--ATA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71875 : ATATG-TTGG-T-TAGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--ATA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71876 : aaaATGTG-TTGA-T-TGGTTAAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--CC-A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCACC-----CGAAATTTAGACAA
gi|71877 : aaaATATG-TTGG-T-TGGTTCATGAGGAG--GTGCG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCAAC-----CGAAATTTAGACAA
gi|71878 : aaaATATG-TTGG-G-TGGTTCATGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--T------AA--TCGGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71835 : aatATATG-TTGT-T-TTGTTCAGGAA-----TTGTC-TTTC--C--A--ATA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCACC-----GGGAATTTTGACAA
gi|71829 : aaaaATATT-TTGA-T-TGGTTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C--A--A---------------------GAA--A-A---------CT-CC--A------AA--TATGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71825 : aaaaATATG-TTGG-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----GTAA--A-A---------TG-CC--A------AG--TGTACAACT-----TGAAATTTAATCAA
gi|71826 : aaagATATG-ATGG-T-CGGTTCAGAAGTAG--TTATG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTACCACC-----CGAAATTTAAACAA
gi|71828 : aaaaATATG-TTGG-T-TGGTTCAGGAGAAG--TGGTG-TTTC--C--A--AGA-----------TA-----AGAA--T-T---------TA-CC--A------AA--TGTGCCACC-----TAAAATTTAGACAA
gi|71832 : aaaaATATGCTTGT-T--GATTTAGGAGG-----TGTG-TTTC--C--A--TGC----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71830 : aacaATATG-GTAG-T-TGGTTCAGAAGGAA--TAATA-TTTC--C--A--AGA----------TT------ATAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCGCC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71831 : aaaaATATG-TTGG-T-TGGTTCAGGATGAG--TTGCA-TTTC--C--A--AGA----------TTTGAAA-AAAA--A-A---------CGCCC--A------AAATTGTGTCACC-----CGGAATTTAGGCAA
gi|71827 : aaaaATATC-TTGT-T-TGGTTCAGAAGTAG--TTGGG-TTTC--A--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TGTACCATT-----CGAAATTTATACAA
gi|71834 : aaaaACATGCTTGT-T--GGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTA--C--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC---------AT--TATGCCACC-----CG-AATTTAAACA
gi|71886 : aagaATATG-TGAG-T-TGGTTCCGGAGGAGAGTTGTG-TTTC--C--A--AGG----------TTT-----ATAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCGCC-----TGAACGGCAGACAA
gi|71891 : aaATTTG-TTGG-T-TGGTTCAGGGGGAA--TTATG-TTGG--C--A--AAA----------TTTG----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGTCACA-----AGAAATTCAGGCAA
gi|71845 : aATCTG-TAGA-T-TGGTTCAGGAGAAG--TTTTG-TTTG--C--A--AAC----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-TC--A------AA--TGTGTCAGG-----TAGAATTTAGACAA
gi|71838 : aaagATCTG-TTGG-T-TGTTTCAGGAGGAG--ATCTG-TTTT--C--A--AGA----------TTTAATTAAGCA--A-A---------AG-CC--A------AA--TTTGCCACC-----TGGAGTATAGACAA
gi|71846 : aaaaATATG-TTGT-T-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71879 : aaaaACATG-TTGG-T-TGATTCAGCTGGAG--TTGTA-TTTT--C--A--AGA----------TCT------------------------G-CA--A------AA--CGTGCCACC-----CGAAATTTAGACAA
gi|71893 : aaaACATG-TTAA-T-TGATTTAGGAGAAG--TTGTG-TTTG--C--A--AAA----------TTC-----AGAA--A-A---------CG-AC--AACATTTAA--TACAACACC-----TGAAATTCTGACAA
gi|71847 : ATATG-TTGT-T-TGATTCTGGAGAAG--TTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CT--A------
gi|71837 : aaaaATATG-TTGG-C-TGGTTCAGG----------TG-ATTC--C--T--AGA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACTACC-----CGAAATTTAGAAAA
gi|71844 : aaaaATATG-TTGG-T-TGGCTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--AAGATG----------TTT-----------A-A---------TG-CC--A--------------CC-CC-----GAAAGTTTAGACAA
gi|71887 : aaataATATA-TTGT-T-TGGTTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71851 : aaATATG-TTGT-T-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71850 : aaaaATATG-TTGT-T-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71849 : aaaaATATG-TTAG-T-TGATTAAGGAGAAG--TTGTG-TTT-----------A------------------AAAG--A-A---------TG-TG--A------AA--TGTGCCACT-----CGAAATTTAAACAA
gi|71855 : aaaaATATG-TTGT-T-TGATTTTGGGGGAG--TTATG-TATC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71856 : aaaaATATG-TTGT-T-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--TGA----------ATT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71858 : aaaaATATG-TTGA-T-TAATTTAGAAG-----TTGTA-ATTTAAC--A--AT-----------TTT------GAA--A-A---------CT-AC--A------AA--TATGCCACC-----TGAAACTTAGATAA
gi|71854 : aaaaATCTA-TTGA-TATGGTTCAGGATGAG--TT----TTTT--T--A--AGA----------TT------AAAA--A-T---------GG-AC--A------AA--TGTGCCACCCCTCCTGAAATTTAGACAA
gi|71859 : aaaaATATG-TT-T-T-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------
gi|71881 : aaaaACATG-TTGG-A-TGCTTCCGGAGAGG--TTGTG-TTTG--C--A--AAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CA-CC--A------AC--TG---CACC-----CGAAAT
gi|71860 : aatATTTG-TTGT-T-TGATTCTGGAGGAG--TTGTG-TTAC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------
gi|71867 : aaaaATATG-TTGG-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTG-------------------------------------GAA--ACA---------C--CC--A------AA--TGTGCGACC-----CGACCTTTATACAA
gi|71853 : aaacATATG-CTAA-T-TGGTCTAAAAGGAG--TTGTG-TTAC--C--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--T
gi|71863 : aaaaATATG-TTGT-T-TGATTCTGGAGAAT--GTGTA-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71862 : aaaaATATG-TTGG-T-TTGTTTGGTTGGAG--TT-----TTCG-C--A--ATG----------T-------AGAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGCTCCATC-----GAAGATTTAGACAA
gi|71890 : aaaaATATG-TTGT-T-TGTTTCTGGAGGA----TGTGAGTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71868 : aaATGTG-TTGT-T-TGATTCTGGAGGAT--GTGTA-TTTA--C--A--TAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71865 : aaaaATATG-TTG------ATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71871 : aaaaATCTG-TTGG-T-TGGTTTAGGAGA-----TGTA-TTTG--C--A--AAA----------TTTG----AGAATAA-A---------T------A------TA--TGTGCCTCC-----AGAAATGTACACA
gi|71874 : aaaaATCTA-TTGG-T-TGGTTCAGGAGGAA--TAGTG-ATACT-C--A--AAA----------TTT-----AGAC--A-A---------C
gi|71870 : aaaaATATG-TAGG-A-TGGTTCAGGATAAG--TTGTA-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----
gi|71833 : aaaaTATA-TTAG-T-TGGTTCAGGAGTAG--TTGTG-TTTC--C--G--AGA----------AAT-----TGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCACA-----TGAAATTTAGGCA
gi|71841 : aaagcTATG-TTTA-T-TGGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T--A--ATA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACATT-----CGAAATTTAAATAA
gi|71894 : aaaatTATG-TTGG-T-TAGTTCATTAGGAG--TTGTG-TGT------A--AAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCACC-----CAAAATTTGGACAA
gi|71866 : TATG-TTTA-T-TGCTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T--A--ATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGTGGCATT-----CGAAATTAAAATAA
gi|71857 : aaaatTATG-TTGT-T-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71861 : aaaatTATG-TTGT-T-TGATTCTGGAGGAT--GCGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71852 : aaaatTATG-TTGG-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTA-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----A
gi|71873 : aaaacTATG-TTGT-T-TAATTCTGGAGGAT--GAGTG-TTTC--C--A--TGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CT--A------
gi|71839 : aaaatATG-TTGA-T-TAGTCCAGGAGG-------TG-TTTC--A--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCACT-----CGAAATTAAAACAA
gi|71843 : aaaagaATG-TTGG-T-TATTTCATGGGG-G--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----GGGA--A-A---------TG-TCA-A------AA--CGTGTCACA-----CAAAATTTAGACAA
gi|71864 : aaaagtcATG-TTGG-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--CATA--AT-----------TTT-----GGA
gi|71896 : aaaaaaTG-TTGA-C-GGATTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCAAC-----CAAACATTAGACAAcacatgta
gi|71848 : TG-TTGG-T-TGGCTCAGACTGAG--TTGTG-TTTT--C--T--AGA----------TTA-----GGAA--A-A---------CC-ACAAA------AA--TGTGCCACC-----CGAAATTTAAAC
gi|71880 : aacaatTG-ATGG-T-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C------T----------------------------------------CC--A------AA--GGCGCCACC-----TGAAATTAAGACAA
gi|71888 : aaagcgTG-TTGT-T-TGGTTTAGGA---G--TTGTG-TTTG--C--A--AAT----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGCTA
gi|71840 : aaaccTG-TCGG-T-TAGTTGAAAAGGTG--TTG-G-TTTG--G--A--AAA----------TTG-----AGTA--G-A---------CG-CC--A------AA--AGTGCCACC-----CTAAACTTAAACAA
gi|71836 : aaaattc-TTGT-T-TGGTGTAGGAGGAG--TGTTT-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----AAAAG-A-A---------CA-CC--A------AA--TGTGCCACC-----TGAAGTTTAGACAA
gi|71842 : aaaaaaaaa-TTGT-T-TGATTCAAGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--GAA----------TGA-----AGAA--C-A---------TG-CC--A------AA--TGTGGCACC-----TGAAATCAAGATAA
gi|71895 : aagaattttTGT-T-TGTTGCAGGAGGAG--TTGTG-TATG--C--A--GAA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CCA-A------AA--TGTGCCACC-----CGAGATCTAGACA
gi|71882 : tgTGT-T-TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T--T--ATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACATT-----CGAAATTTAAATAA
gi|71872 : aaaataaTGT-T-TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T--T--ATA----------TTT-----GAAA--A-AAAAAAACAACG-TC--A------AA--TGTGACATT-----TGAAATTTAG
gi|71883 : aaaattaTGTGT-TGGTTCAGGAAGAG--TTGTA-TATG--C--A--AAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CG--A------AT--TGTGCCATA-----TGAAGT
gi|71869 : aaactatatcagT-T-TGGTT--GGAG-AG--TTGTG-TTT---G--A--ATAT---------TTT-----AGAG--A-A---------CG-AC--A------AA--TGTACCAAC-----CGCAATGTCGACAA
gi|71897 : aaaaatct-TGGT-CAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--A--A--ATA----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-CC--A------AA--TGTACCACA-----TGGAATTTAGACAA
gi|71889 : tggaGTTAAGGAGAAG--TTGGG-TTTG--C--A--AAAATTGAAAACGTTT------GAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCACCG----TG-AATTTAGACAA
gi|71899 : aaacatccgctgataaGTTCAGGGGGAG--ATGTG-TTTG--C--A--TAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TCTGCC
gi|71898 : GTTCTGGAGGAG--TTGTG-TTTT--C--A--TGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71901 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCATC-----TGAAATTTAGACA
gi|71900 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCATC-----TGAAATTTAGACA
gi|71902 : CAGGTGGGG--TTGTC-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCATC--------AATT
gi|71903 : AAGAG--TTGTG-TTTC--T--A--AGA----------TTA-----TGAA--A-A---------CG-CC--G------AA--TATGCTTCC-----CGAAATTTATATAA
gi|71904 : GAG--TTGTG-TTTT--C--A--AGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCATC-----TGAAATATAGACA
gi|71905 : AG--TTGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCACC-----CGAAATTTAGACAA
gi|71908 : AG--TTGTG-TTTC--C--A--AAA----------TAT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCACC-----TGAAATATAGACA
gi|71907 : AG--TTGTG-TTTG--C--A--AAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------CA--TGTACCACC-----CGAAATTTAGACAA
gi|71906 : AG--TTGTG-TTTC--C--A--AAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AC--GGTGTCACC-----CGGAATTTGGACAA
gi|71909 : TGTG-TTTC--C--A--AGA----------TTT-----G--A--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGTCGCC-----CGTGATATAGACA
gi|71910 : TG-TTTT--C--A--AGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TTTGCCACC-----TGAAAATATGACAA
gi|71885 : --A--ATG----------TT-------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCACC-----TGCAATTTAGACAA
gi|71884 : aaattaggctggtttgttcaggg--A--ATG----------TT-------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCACC-----TGCAATTTAGACAA
gi|71912 : aaattaggctggtttgttcagggA----------TCT-----GGAA--A-G---------CA-CC--A------AA--TGTGCCGCC-----CGAAATTTAGACAA
gi|71916 : gT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71913 : T-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------AA--TGTGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71911 : T-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AAA-TGTGCCACC-----TGAAATTTAGATAA
gi|71917 : gttttaacaaaacT-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71914 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCACC-----TGAAATTTAGACAA
gi|71915 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTACCACC-----TGAAATTTAGACAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 00 0 11 0 3333333333 44444 11 0 111111111 0 11 111111 33 0 111111 0
lowQualScore : . . .. . .. . .......... ..... .. . ......... . .. ...... .. . ...... .
lowQualScore : 0 5 77 5 66 5 1111111111 00000 11 4 888888888 4 55 333333 00 6 666666 6
consensus : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
Reference ( family-330 ) : ATATGTTGNT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71825 : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GTAA--A-A---------TG-CC--A------AG--TGTACAA-CTT-----GAAA-TTTAATCAA
gi|71826 : aaagATATGATGGT-CGGTTCAGAAGTAG--TTATG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAAACAA
gi|71827 : aaaaATATCTTGTT-TGGTTCAGAAGTAG--TTGGG-TTTC--A-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TGTACCA-TTC-----GAAA-TTTATACAA
gi|71828 : aaaaATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGAAG--TGGTG-TTTC--C-AAGA-----------TA-----AGAA--T-T---------TA-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----AAAA-TTTAGACAA
gi|71829 : aaaaATATTTTGAT-TGGTTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C-A---------------------AGAA--A-A---------CT-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71830 : aaaaATATGGTAGT-TGGTTCAGAAGGAA--TAATA-TTTC--C-AAGA----------TT------ATAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCG-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71831 : aaaaATATGTTGGT-TGGTTCAGGATGAG--TTGCA-TTTC--C-AAGA----------TTTGAAA-AAAA--A-A---------CGCCC--A------AAATTGTGTCA-CCC-----GGAA-TTTAGGCAA
gi|71832 : aaaaATATGCTTGT-TGATTTAGGAGG-----TGTG-TTTC--C-ATGC----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71833 : aacaTATATTAGT-TGGTTCAGGAGTAG--TTGTG-TTTC--C-GAGA----------AAT-----TGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CAT-----GAAA-TTTAGGCA
gi|71834 : aaagcACATGCTTGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTA--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC---------AT--TATGCCA-CCC-----G-AA-TTTAAACA
gi|71835 : aagaATATGTTGTT-TTGTTCAGGAA-----TTGTC-TTTC--C-AATA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCG-----GGAA-TTTTGACAA
gi|71836 : aaaaTTGTT-TGGTGTAGGAGGAG--TGTTT-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AAAAG-A-A---------CA-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAG-TTTAGACAA
gi|71837 : aaaaaaaaaATATGTTGGC-TGGTTCAGG----------TG-ATTC--C-TAGA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACTA-CCC-----GAAA-TTTAGAAAA
gi|71838 : aaaaATCTGTTGGT-TGTTTCAGGAGGAG--ATCTG-TTTT--C-AAGA----------TTTAATTAAGCA--A-A---------AG-CC--A------AA--TTTGCCA-CCT-----GGAG-TATAGACAA
gi|71839 : aaaaATGTTGAT-TAGTCCAGGAGG-------TG-TTTC--A-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CTC-----GAAA-TTAAAACAA
gi|71840 : aaaagaTGTCGGT-TAGTTGAAAAGGTG--TTG-G-TTTG--G-AAAA----------TTG-----AGTA--G-A---------CG-CC--A------AA--AGTGCCA-CCC-----TAAA-CTTAAACAA
gi|71841 : aaaattcTATGTTTAT-TGGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-AATA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACA-TTC-----GAAA-TTTAAATAA
gi|71842 : aaaatTTGTT-TGATTCAAGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AGAA----------TGA-----AGAA--C-A---------TG-CC--A------AA--TGTGGCA-CCT-----GAAA-TCAAGATAA
gi|71843 : aagaattttATGTTGGT-TATTTCATGGGG-G--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGGA--A-A---------TG-TCA-A------AA--CGTGTCA-CAC-----AAAA-TTTAGACAA
gi|71844 : aaaagtcATATGTTGGT-TGGCTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGATG--------TTT-----A------------------------------------ATGCCACCCC-----GAAAGTTTAGACAA
gi|71845 : aaataATCTGTAGAT-TGGTTCAGGAGAAG--TTTTG-TTTG--C-AAAC----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-TC--A------AA--TGTGTCA-GGT-----AGAA-TTTAGACAA
gi|71846 : aaagATATGTTGTT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71847 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGAAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CT--A------
gi|71848 : aaaaTGTTGGT-TGGCTCAGACTGAG--TTGTG-TTTT--C-TAGA----------TTA-----GGAA--A-A---------CC-ACAAA------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAAAC
gi|71849 : aacaatATATGTTAGT-TGATTAAGGAGAAG--TTGTG-TTTA--A-AAGA--------------------------A---------TG-TG--A------AA--TGTGCCA-CTC-----GAAA-TTTAAACAA
gi|71850 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71851 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71852 : aaaaTATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTA-TTTC--C-AAGA----------TTT-----A
gi|71853 : aaaacATATGCTAAT-TGGTCTAAAAGGAG--TTGTG-TTAC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--T
gi|71854 : aaaaATCTATTGATATGGTTCAGGATGAG--TT----TTTT--T-AAGA----------TT------AAAA--A-T---------GG-AC--A------AA--TGTGCCA-CCCCTCCTGAAA-TTTAGACAA
gi|71855 : aaaaATATGTTGTT-TGATTTTGGGGGAG--TTATG-TATC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71856 : aaaaATATGTTGTT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------ATT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71857 : aaaaTATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71858 : aaaatATATGTTGAT-TAATTTAGAAG-----TTGTA-ATTT--A-ACAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CT-AC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GAAA-CTTAGATAA
gi|71859 : aaaaATATGTT-TT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------
gi|71860 : aaaaATTTGTTGTT-TGATTCTGGAGGAG--TTGTG-TTAC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------
gi|71861 : aaaaTATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GCGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71862 : aaaatATATGTTGGT-TTGTTTGGTTGGAG--TT-----TTCG-C-AA------------TGT-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGCTCCA-TCG-----AAGA-TTTAGACAA
gi|71863 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGAAT--GTGTA-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71864 : aaaaATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATAA----------TTT-----
gi|71865 : aaaaaaATATGTTGAT-T----CTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------tggacacatgta
gi|71866 : aaaaTATGTTTAT-TGCTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-AATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGTGGCA-TTC-----GAAA-TTAAAATAA
gi|71867 : aaaatATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTG----------------------------------GAA--ACA---------C--CC--A------AA--TGTGCGA-CCC-----GACC-TTTATACAA
gi|71868 : aaacATGTGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTA-TTTA--C-ATAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71869 : aaaaT-TGGTT--GGAG-AG--TTGTG-TTT---G-AATAT---------TTT-----AGAG--A-A---------CG-AC--A------AA--TGTACCA-ACC-----GCAA-TGTCGACAA
gi|71870 : aaaaatcttATATGTAGGA-TGGTTCAGGATAAG--TTGTA-TTTC--C-AAGA----------TTT-----
gi|71871 : aaaaATCTGTTGGT-TGGTTTAGGAGA-----TGTA-TTTG--C-AAAA----------TTTG----AGAATAA-A---------T------A------TA--TGTGCCT-CCA-----GAAA-TGTACACA
gi|71872 : aaaaTGTT-TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-TATA----------TTT-----GAAA--A-AAAAAAACAACG-TC--A------AA--TGTGACA-TTT-----GAAA-TTTAG
gi|71873 : aaaattaTATGTTGTT-TAATTCTGGAGGAT--GAGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CT--A------
gi|71874 : aaaatATCTATTGGT-TGGTTCAGGAGGAA--TAGTG-ATACT-C-AAAA----------TTT-----AGAC--A-A---------C
gi|71875 : aaaaATATGTTGGT-TAGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AATA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71876 : aaaATGTGTTGAT-TGGTTAAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--CCAAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71877 : aaaATATGTTGGT-TGGTTCATGAGGAG--GTGCG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCA-ACC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71878 : aaaATATGTTGGG-TGGTTCATGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--T------AA--TCGGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71879 : aatACATGTTGGT-TGATTCAGCTGGAG--TTGTA-TTTT--C-AAGA----------TCT------------------------G-CA--A------AA--CGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71880 : aaaTGATGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C---------------T----------------------------CC--A------AA--GGCGCCA-CCT-----GAAA-TTAAGACAA
gi|71881 : aaagcgACATGTTGGA-TGCTTCCGGAGAGG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CA-CC--A------AC--TG---CA-CCC-----GAAA-T
gi|71882 : aatTGTT-TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-TATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACA-TTC-----GAAA-TTTAAATAA
gi|71883 : aaaataaT-TGGTTCAGGAAGAG--TTGTA-TATG--C-AAAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CG--A------AT--TGTGCCA-TAT-----GAAG-T
gi|71884 : aaactatatcagtgtgTAGGCTGGT-TTGTTCAGG--GAA--T---G-TT-----------------------------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GCAA-TTTAGACAA
gi|71885 : aaatTAGGCTGGT-TTGTTCAGG--GAA--T---G-TT-----------------------------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GCAA-TTTAGACAA
gi|71886 : aaatATATGTGAGT-TGGTTCCGGAGGAGAGTTGTG-TTTC--C-AAGG----------TTT-----ATAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCG-CCT-----GAAC-GGCAGACAA
gi|71887 : aaATATATTGTT-TGGTTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71888 : aaTGTTGTT-TGGTTTAGGA---G--TTGTG-TTTG--C-AAAT----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGCTA-
gi|71889 : aaaccGCTGAT-AAGTTAAGGAGAAG--TTGGG-TTTG--C-AAAAATTGAAAACGTTT------GAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCG-----TGAA-TTTAGACAA
gi|71890 : aaacatccATATGTTGTT-TGTTTCTGGAGGA----TGTGAGTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71891 : aaATTTGTTGGT-TGGTTCAGGGGGAA--TTATG-TTGG--C-AAAA----------TTTG----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGTCA-CAA-----GAAA-TTCAGGCAA
gi|71892 : aATATGTTGTT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AATA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71893 : ACATGTTAAT-TGATTTAGGAGAAG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTC-----AGAA--A-A---------CG-AC--AACATTTAA--TACAACA-CCT-----GAAA-TTCTGACAA
gi|71894 : TATGTTGGT-TAGTTCATTAGGAG--TTGTG-TGT-----AAAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-CCC-----AAAA-TTTGGACAA
gi|71895 : TGTT-TGTTGCAGGAGGAG--TTGTG-TATG--C-AGAA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CCA-A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAGA-TCTAGACA
gi|71896 : tgTGTTGAC-GGATTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-ACC-----AAAC-ATTAGACAA
gi|71897 : TGGA-TGGT-CAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--A-AATA----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-CC--A------AA--TGTACCA-CAT-----GGAA-TTTAGACAA
gi|71898 : GTTCTGGAGGAG--TTGTG-TTTT--C-ATGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71899 : GTTCAGGGGGAG--ATGTG-TTTG--C-ATAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TCTGCC
gi|71900 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TTTAGACA
gi|71901 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TTTAGACA
gi|71902 : CAGGTGGGG--TTGTC-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-TC--------AA-TT
gi|71903 : AAGAG--TTGTG-TTTC--T-AAGA----------TTA-----TGAA--A-A---------CG-CC--G------AA--TATGCTT-CCC-----GAAA-TTTATATAA
gi|71904 : GAG--TTGTG-TTTT--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TATAGACA
gi|71905 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71906 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AC--GGTGTCA-CCC-----GGAA-TTTGGACAA
gi|71907 : AG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------CA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71908 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAAA----------TAT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TATAGACA
gi|71909 : TGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----G--A--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGTCG-CCC-----GTGA-TATAGACA
gi|71910 : TG-TTTT--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TTTGCCA-CCT-----GAAA-ATATGACAA
gi|71911 : G-TTTTAAC-AAAA----------CT------AGAA--A-A---------CG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGATAA
gi|71912 : GA----------TCT-----GGAA--A-G---------CA-CC--A------AA--TGTGCCG-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71913 : T-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71914 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71915 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTACCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71916 : T-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71917 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 00 0 11 0 3333333333 44444 11 0 111111111 0 11 111111 33 0 111111 0
lowQualScore : . . .. . .. . .......... ..... .. . ......... . .. ...... .. . ...... .
lowQualScore : 0 5 77 5 66 5 1111111111 00000 11 4 888888888 4 55 333333 00 6 666666 6
consensus : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
Reference ( family-330 ) : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71825 : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GTAA--A-A---------TG-CC--A------AG--TGTACAA-CTT-----GAAA-TTTAATCAA
gi|71826 : aaagATATGATGGT-CGGTTCAGAAGTAG--TTATG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAAACAA
gi|71827 : aaaaATATCTTGTT-TGGTTCAGAAGTAG--TTGGG-TTTC--A-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TGTACCA-TTC-----GAAA-TTTATACAA
gi|71828 : aaaaATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGAAG--TGGTG-TTTC--C-AAGA-----------TA-----AGAA--T-T---------TA-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----AAAA-TTTAGACAA
gi|71829 : aaaaATATTTTGAT-TGGTTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C-A---------------------AGAA--A-A---------CT-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71830 : aaaaATATGGTAGT-TGGTTCAGAAGGAA--TAATA-TTTC--C-AAGA----------TT------ATAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCG-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71831 : aaaaATATGTTGGT-TGGTTCAGGATGAG--TTGCA-TTTC--C-AAGA----------TTTGAAA-AAAA--A-A---------CGCCC--A------AAATTGTGTCA-CCC-----GGAA-TTTAGGCAA
gi|71832 : aaaaATATGCTTGT-TGATTTAGGAGG-----TGTG-TTTC--C-ATGC----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71833 : aacaTATATTAGT-TGGTTCAGGAGTAG--TTGTG-TTTC--C-GAGA----------AAT-----TGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CAT-----GAAA-TTTAGGCA
gi|71834 : aaagcACATGCTTGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTA--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC---------AT--TATGCCA-CCC-----G-AA-TTTAAACA
gi|71835 : aagaATATGTTGTT-TTGTTCAGGAA-----TTGTC-TTTC--C-AATA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCG-----GGAA-TTTTGACAA
gi|71836 : aaaaTTGTT-TGGTGTAGGAGGAG--TGTTT-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AAAAG-A-A---------CA-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAG-TTTAGACAA
gi|71837 : aaaaaaaaaATATGTTGGC-TGGTTCAGG----------TG-ATTC--C-TAGA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACTA-CCC-----GAAA-TTTAGAAAA
gi|71838 : aaaaATCTGTTGGT-TGTTTCAGGAGGAG--ATCTG-TTTT--C-AAGA----------TTTAATTAAGCA--A-A---------AG-CC--A------AA--TTTGCCA-CCT-----GGAG-TATAGACAA
gi|71839 : aaaaATGTTGAT-TAGTCCAGGAGG-------TG-TTTC--A-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CTC-----GAAA-TTAAAACAA
gi|71840 : aaaagaTGTCGGT-TAGTTGAAAAGGTG--TTG-G-TTTG--G-AAAA----------TTG-----AGTA--G-A---------CG-CC--A------AA--AGTGCCA-CCC-----TAAA-CTTAAACAA
gi|71841 : aaaattcTATGTTTAT-TGGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-AATA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACA-TTC-----GAAA-TTTAAATAA
gi|71842 : aaaatTTGTT-TGATTCAAGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AGAA----------TGA-----AGAA--C-A---------TG-CC--A------AA--TGTGGCA-CCT-----GAAA-TCAAGATAA
gi|71843 : aagaattttATGTTGGT-TATTTCATGGGG-G--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGGA--A-A---------TG-TCA-A------AA--CGTGTCA-CAC-----AAAA-TTTAGACAA
gi|71844 : aaaagtcATATGTTGGT-TGGCTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGATG--------TTT-----A------------------------------------ATGCCACCCC-----GAAAGTTTAGACAA
gi|71845 : aaataATCTGTAGAT-TGGTTCAGGAGAAG--TTTTG-TTTG--C-AAAC----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-TC--A------AA--TGTGTCA-GGT-----AGAA-TTTAGACAA
gi|71846 : aaagATATGTTGTT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71847 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGAAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CT--A------
gi|71848 : aaaaTGTTGGT-TGGCTCAGACTGAG--TTGTG-TTTT--C-TAGA----------TTA-----GGAA--A-A---------CC-ACAAA------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAAAC
gi|71849 : aacaatATATGTTAGT-TGATTAAGGAGAAG--TTGTG-TTTA--A-AAG-------------------------A-A---------TG-TG--A------AA--TGTGCCA-CTC-----GAAA-TTTAAACAA
gi|71850 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71851 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71852 : aaaaTATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTA-TTTC--C-AAGA----------TTT-----A
gi|71853 : aaaacATATGCTAAT-TGGTCTAAAAGGAG--TTGTG-TTAC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--T
gi|71854 : aaaaATCTATTGATATGGTTCAGGATGAG--TT----TTTT--T-AAGA----------TT------AAAA--A-T---------GG-AC--A------AA--TGTGCCA-CCCCTCCTGAAA-TTTAGACAA
gi|71855 : aaaaATATGTTGTT-TGATTTTGGGGGAG--TTATG-TATC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71856 : aaaaATATGTTGTT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------ATT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71857 : aaaaTATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71858 : aaaatATATGTTGAT-TAATTTAGAAG-----TTGTA-ATTT--A-ACAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CT-AC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GAAA-CTTAGATAA
gi|71859 : aaaaATATGTTT-T-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------
gi|71860 : aaaaATTTGTTGTT-TGATTCTGGAGGAG--TTGTG-TTAC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------
gi|71861 : aaaaTATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GCGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71862 : aaaatATATGTTGGT-TTGTTTGGTTGGAG--TT-----TTCG-C-AA------------TGT-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGCTCCA-TCG-----AAGA-TTTAGACAA
gi|71863 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGAAT--GTGTA-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71864 : aaaaATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATAA----------TTT-----
gi|71865 : aaaaaaGT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------tggacacatgta
gi|71866 : aaaaatatTATGTTTAT-TGCTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-AATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGTGGCA-TTC-----GAAA-TTAAAATAA
gi|71867 : aaaatATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTG----------------------------------GAA--ACA---------C--CC--A------AA--TGTGCGA-CCC-----GACC-TTTATACAA
gi|71868 : aaacATGTGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTA-TTTA--C-ATAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71869 : aaaaT-TGGTT--GGAG-AG--TTGTG-TTT---G-AATAT---------TTT-----AGAG--A-A---------CG-AC--A------AA--TGTACCA-ACC-----GCAA-TGTCGACAA
gi|71870 : aaaaatcttATATGTAGGA-TGGTTCAGGATAAG--TTGTA-TTTC--C-AAGA----------TTT-----
gi|71871 : aaaaATCTGTTGGT-TGGTTTAGGAGA-----TGTA-TTTG--C-AAAA----------TTTG----AGAATAA-A---------T------A------TA--TGTGCCT-CCA-----GAAA-TGTACACA
gi|71872 : aaaaTATGTT----TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-TATA----------TTT-----GAAA--A-AAAAAAACAACG-TC--A------AA--TGTGACA-TTT-----GAAA-TTTAG
gi|71873 : aaaatTATGTTGTT-TAATTCTGGAGGAT--GAGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CT--A------
gi|71874 : aaaatATCTATTGGT-TGGTTCAGGAGGAA--TAGTG-ATACT-C-AAAA----------TTT-----AGAC--A-A---------C
gi|71875 : aaaaATATGTTGGT-TAGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AATA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71876 : aaaATGTGTTGAT-TGGTTAAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--CCAAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71877 : aaaATATGTTGGT-TGGTTCATGAGGAG--GTGCG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCA-ACC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71878 : aaaATATGTTGGG-TGGTTCATGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--T------AA--TCGGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71879 : aatACATGTTGGT-TGATTCAGCTGGAG--TTGTA-TTTT--C-AAGA----------TCT------------------------G-CA--A------AA--CGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71880 : aaaTGATGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C---------------T----------------------------CC--A------AA--GGCGCCA-CCT-----GAAA-TTAAGACAA
gi|71881 : aaagcgACATGTTGGA-TGCTTCCGGAGAGG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CA-CC--A------AC--TG---CA-CCC-----GAAA-T
gi|71882 : aatTGTT-TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-TATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACA-TTC-----GAAA-TTTAAATAA
gi|71883 : aaaataaGT-TGGTTCAGGAAGAG--TTGTA-TATG--C-AAAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CG--A------AT--TGTGCCA-TAT-----GAAG-T
gi|71884 : aaactatatcagtgtTAGGCTGGT-TTGTTCAGG--GAA--T---G-TT-----------------------------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GCAA-TTTAGACAA
gi|71885 : aaatTAGGCTGGT-TTGTTCAGG--GAA--T---G-TT-----------------------------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GCAA-TTTAGACAA
gi|71886 : aaatATATGTGAGT-TGGTTCCGGAGGAGAGTTGTG-TTTC--C-AAGG----------TTT-----ATAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCG-CCT-----GAAC-GGCAGACAA
gi|71887 : aaATATATTGTT-TGGTTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71888 : aaTGTTGTT-TGGTTTAGGA---G--TTGTG-TTTG--C-AAAT----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGCTA-
gi|71889 : aaaccGCTGAT-AAGTTAAGGAGAAG--TTGGG-TTTG--C-AAAAATTGAAAACGTTT------GAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCG-----TGAA-TTTAGACAA
gi|71890 : aaacatccATATGTTGTT-TGTTTCTGGAGGA----TGTGAGTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71891 : aaATTTGTTGGT-TGGTTCAGGGGGAA--TTATG-TTGG--C-AAAA----------TTTG----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGTCA-CAA-----GAAA-TTCAGGCAA
gi|71892 : aATATGTTGTT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AATA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71893 : ACATGTTAAT-TGATTTAGGAGAAG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTC-----AGAA--A-A---------CG-AC--AACATTTAA--TACAACA-CCT-----GAAA-TTCTGACAA
gi|71894 : TATGTTGGT-TAGTTCATTAGGAG--TTGTG-TGT-----AAAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-CCC-----AAAA-TTTGGACAA
gi|71895 : TGTGTTTGT-TG---CAGGAGGAG--TTGTG-TATG--C-AGAA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CCA-A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAGA-TCTAGACA
gi|71896 : TGTTGAC-GGATTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-ACC-----AAAC-ATTAGACAA
gi|71897 : TGGA-TGGT-CAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--A-AATA----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-CC--A------AA--TGTACCA-CAT-----GGAA-TTTAGACAA
gi|71898 : GTTCTGGAGGAG--TTGTG-TTTT--C-ATGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71899 : GTTCAGGGGGAG--ATGTG-TTTG--C-ATAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TCTGCC
gi|71900 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TTTAGACA
gi|71901 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TTTAGACA
gi|71902 : CAGGTGGGG--TTGTC-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-TC--------AA-TT
gi|71903 : AAGAG--TTGTG-TTTC--T-AAGA----------TTA-----TGAA--A-A---------CG-CC--G------AA--TATGCTT-CCC-----GAAA-TTTATATAA
gi|71904 : GAG--TTGTG-TTTT--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TATAGACA
gi|71905 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71906 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AC--GGTGTCA-CCC-----GGAA-TTTGGACAA
gi|71907 : AG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------CA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71908 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAAA----------TAT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TATAGACA
gi|71909 : TGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----G--A--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGTCG-CCC-----GTGA-TATAGACA
gi|71910 : TG-TTTT--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TTTGCCA-CCT-----GAAA-ATATGACAA
gi|71911 : G-TTTTAAC-AAAA----------CT------AGAA--A-A---------CG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGATAA
gi|71912 : GA----------TCT-----GGAA--A-G---------CA-CC--A------AA--TGTGCCG-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71913 : T-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71914 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71915 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTACCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71916 : T-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71917 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
blockSeqs : G AA ATTGAAAACG AATTA TA AAAAAACAA AA ACATTT AT CCTCCT
blockSeqs : T G TG GAAA G . A . A C
blockSeqs : G T T GA . . A . A C
blockSeqs : A . . GA . . . . A T
blockSeqs : G . . G . . . . A T
blockSeqs : G . . G . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . . . . . . G
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . G
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . G
blockSeqs : G . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . C
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
finalCons : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 00 0 11 0 3333333333 44444 11 0 111111111 0 11 111111 33 0 111111 0
lowQualScore : . . .. . .. . .......... ..... .. . ......... . .. ...... .. . ...... .
lowQualScore : 0 5 77 5 66 5 1111111111 00000 11 4 888888888 4 55 333333 00 6 666666 6
consensus : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
Reference ( family-330 ) : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71825 : ATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GTAA--A-A---------TG-CC--A------AG--TGTACAA-CTT-----GAAA-TTTAATCAA
gi|71826 : aaagATATGATGGT-CGGTTCAGAAGTAG--TTATG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAAACAA
gi|71827 : aaaaATATCTTGTT-TGGTTCAGAAGTAG--TTGGG-TTTC--A-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TGTACCA-TTC-----GAAA-TTTATACAA
gi|71828 : aaaaATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGAAG--TGGTG-TTTC--C-AAGA-----------TA-----AGAA--T-T---------TA-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----AAAA-TTTAGACAA
gi|71829 : aaaaATATTTTGAT-TGGTTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C-A---------------------AGAA--A-A---------CT-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71830 : aaaaATATGGTAGT-TGGTTCAGAAGGAA--TAATA-TTTC--C-AAGA----------TT------ATAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCG-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71831 : aaaaATATGTTGGT-TGGTTCAGGATGAG--TTGCA-TTTC--C-AAGA----------TTTGAAA-AAAA--A-A---------CGCCC--A------AAATTGTGTCA-CCC-----GGAA-TTTAGGCAA
gi|71832 : aaaaATATGCTTGT-TGATTTAGGAGG-----TGTG-TTTC--C-ATGC----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71833 : aacaTATATTAGT-TGGTTCAGGAGTAG--TTGTG-TTTC--C-GAGA----------AAT-----TGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CAT-----GAAA-TTTAGGCA
gi|71834 : aaagcACATGCTTGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTA--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC---------AT--TATGCCA-CCC-----G-AA-TTTAAACA
gi|71835 : aagaATATGTTGTT-TTGTTCAGGAA-----TTGTC-TTTC--C-AATA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCG-----GGAA-TTTTGACAA
gi|71836 : aaaaTTGTT-TGGTGTAGGAGGAG--TGTTT-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AAAAG-A-A---------CA-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAG-TTTAGACAA
gi|71837 : aaaaaaaaaATATGTTGGC-TGGTTCAGG----------TG-ATTC--C-TAGA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACTA-CCC-----GAAA-TTTAGAAAA
gi|71838 : aaaaATCTGTTGGT-TGTTTCAGGAGGAG--ATCTG-TTTT--C-AAGA----------TTTAATTAAGCA--A-A---------AG-CC--A------AA--TTTGCCA-CCT-----GGAG-TATAGACAA
gi|71839 : aaaaATGTTGAT-TAGTCCAGGAGG-------TG-TTTC--A-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CTC-----GAAA-TTAAAACAA
gi|71840 : aaaagaTGTCGGT-TAGTTGAAAAGGTG--TTG-G-TTTG--G-AAAA----------TTG-----AGTA--G-A---------CG-CC--A------AA--AGTGCCA-CCC-----TAAA-CTTAAACAA
gi|71841 : aaaattcTATGTTTAT-TGGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-AATA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACA-TTC-----GAAA-TTTAAATAA
gi|71842 : aaaatTTGTT-TGATTCAAGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AGAA----------TGA-----AGAA--C-A---------TG-CC--A------AA--TGTGGCA-CCT-----GAAA-TCAAGATAA
gi|71843 : aagaattttATGTTGGT-TATTTCATGGGG-G--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGGA--A-A---------TG-TCA-A------AA--CGTGTCA-CAC-----AAAA-TTTAGACAA
gi|71844 : aaaagtcATATGTTGGT-TGGCTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGATG--------TTT-----A------------------------------------ATGCCACCCC-----GAAAGTTTAGACAA
gi|71845 : aaataATCTGTAGAT-TGGTTCAGGAGAAG--TTTTG-TTTG--C-AAAC----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-TC--A------AA--TGTGTCA-GGT-----AGAA-TTTAGACAA
gi|71846 : aaagATATGTTGTT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71847 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGAAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CT--A------
gi|71848 : aaaaTGTTGGT-TGGCTCAGACTGAG--TTGTG-TTTT--C-TAGA----------TTA-----GGAA--A-A---------CC-ACAAA------AA--TGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAAAC
gi|71849 : aacaatATATGTTAGT-TGATTAAGGAGAAG--TTGTG-TTTA--A-AAG-------------------------A-A---------TG-TG--A------AA--TGTGCCA-CTC-----GAAA-TTTAAACAA
gi|71850 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71851 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71852 : aaaaTATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTA-TTTC--C-AAGA----------TTT-----A
gi|71853 : aaaacATATGCTAAT-TGGTCTAAAAGGAG--TTGTG-TTAC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--T
gi|71854 : aaaaATCTATTGATATGGTTCAGGATGAG--TT----TTTT--T-AAGA----------TT------AAAA--A-T---------GG-AC--A------AA--TGTGCCA-CCCCTCCTGAAA-TTTAGACAA
gi|71855 : aaaaATATGTTGTT-TGATTTTGGGGGAG--TTATG-TATC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71856 : aaaaATATGTTGTT-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------ATT-----AGAA--A-A---------CA-CC--A------
gi|71857 : aaaaTATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71858 : aaaatATATGTTGAT-TAATTTAGAAG-----TTGTA-ATTT--A-ACAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CT-AC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GAAA-CTTAGATAA
gi|71859 : aaaaATATGTTT-T-TAATTTTGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------
gi|71860 : aaaaATTTGTTGTT-TGATTCTGGAGGAG--TTGTG-TTAC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------
gi|71861 : aaaaTATGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GCGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71862 : aaaatATATGTTGGT-TTGTTTGGTTGGAG--TT-----TTCG-C-AA------------TGT-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGCTCCA-TCG-----AAGA-TTTAGACAA
gi|71863 : aaaaATATGTTGTT-TGATTCTGGAGAAT--GTGTA-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71864 : aaaaATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-ATAA----------TTT-----
gi|71865 : aaaaaaGT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------tggacacatgta
gi|71866 : aaaaatatTATGTTTAT-TGCTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-AATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------AG-CC--A------AA--TGTGGCA-TTC-----GAAA-TTAAAATAA
gi|71867 : aaaatATATGTTGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTG----------------------------------GAA--ACA---------C--CC--A------AA--TGTGCGA-CCC-----GACC-TTTATACAA
gi|71868 : aaacATGTGTTGTT-TGATTCTGGAGGAT--GTGTA-TTTA--C-ATAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71869 : aaaaT-TGGTT--GGAG-AG--TTGTG-TTT---G-AATAT---------TTT-----AGAG--A-A---------CG-AC--A------AA--TGTACCA-ACC-----GCAA-TGTCGACAA
gi|71870 : aaaaatcttATATGTAGGA-TGGTTCAGGATAAG--TTGTA-TTTC--C-AAGA----------TTT-----
gi|71871 : aaaaATCTGTTGGT-TGGTTTAGGAGA-----TGTA-TTTG--C-AAAA----------TTTG----AGAATAA-A---------T------A------TA--TGTGCCT-CCA-----GAAA-TGTACACA
gi|71872 : aaaaTATGTT----TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-TATA----------TTT-----GAAA--A-AAAAAAACAACG-TC--A------AA--TGTGACA-TTT-----GAAA-TTTAG
gi|71873 : aaaatTATGTTGTT-TAATTCTGGAGGAT--GAGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CT--A------
gi|71874 : aaaatATCTATTGGT-TGGTTCAGGAGGAA--TAGTG-ATACT-C-AAAA----------TTT-----AGAC--A-A---------C
gi|71875 : aaaaATATGTTGGT-TAGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AATA----------TTT-----GGTA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71876 : aaaATGTGTTGAT-TGGTTAAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--CCAAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71877 : aaaATATGTTGGT-TGGTTCATGAGGAG--GTGCG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCA-ACC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71878 : aaaATATGTTGGG-TGGTTCATGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--T------AA--TCGGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71879 : aatACATGTTGGT-TGATTCAGCTGGAG--TTGTA-TTTT--C-AAGA----------TCT------------------------G-CA--A------AA--CGTGCCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71880 : aaaTGATGGT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C---------------T----------------------------CC--A------AA--GGCGCCA-CCT-----GAAA-TTAAGACAA
gi|71881 : aaagcgACATGTTGGA-TGCTTCCGGAGAGG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTT-----TGAA--A-A---------CA-CC--A------AC--TG---CA-CCC-----GAAA-T
gi|71882 : aatTGTT-TAGTCCAGGAAGAG--TTGT---TTC--T-TATA----------TTTGA---AAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGACA-TTC-----GAAA-TTTAAATAA
gi|71883 : aaaataaGT-TGGTTCAGGAAGAG--TTGTA-TATG--C-AAAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CG--A------AT--TGTGCCA-TAT-----GAAG-T
gi|71884 : aaactatatcagtgtTAGGCTGGT-TTGTTCAGG--GAA--T---G-TT-----------------------------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GCAA-TTTAGACAA
gi|71885 : aaatTAGGCTGGT-TTGTTCAGG--GAA--T---G-TT-----------------------------GAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TATGCCA-CCT-----GCAA-TTTAGACAA
gi|71886 : aaatATATGTGAGT-TGGTTCCGGAGGAGAGTTGTG-TTTC--C-AAGG----------TTT-----ATAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCG-CCT-----GAAC-GGCAGACAA
gi|71887 : aaATATATTGTT-TGGTTCTGGAGGAT--GTGTG-TTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71888 : aaTGTTGTT-TGGTTTAGGA---G--TTGTG-TTTG--C-AAAT----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGCTA-
gi|71889 : aaaccGCTGAT-AAGTTAAGGAGAAG--TTGGG-TTTG--C-AAAAATTGAAAACGTTT------GAA--A-C---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCG-----TGAA-TTTAGACAA
gi|71890 : aaacatccATATGTTGTT-TGTTTCTGGAGGA----TGTGAGTTC--C-ATGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71891 : aaATTTGTTGGT-TGGTTCAGGGGGAA--TTATG-TTGG--C-AAAA----------TTTG----GGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGTCA-CAA-----GAAA-TTCAGGCAA
gi|71892 : aATATGTTGTT-TGGTTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AATA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71893 : ACATGTTAAT-TGATTTAGGAGAAG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTC-----AGAA--A-A---------CG-AC--AACATTTAA--TACAACA-CCT-----GAAA-TTCTGACAA
gi|71894 : TATGTTGGT-TAGTTCATTAGGAG--TTGTG-TGT-----AAAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-CCC-----AAAA-TTTGGACAA
gi|71895 : TGTGTTTGT-TG---CAGGAGGAG--TTGTG-TATG--C-AGAA----------TTT-----GGAA--A-A---------TG-CCA-A------AA--TGTGCCA-CCC-----GAGA-TCTAGACA
gi|71896 : TGTTGAC-GGATTCAGGAGGAG--TAGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-ACC-----AAAC-ATTAGACAA
gi|71897 : TGGA-TGGT-CAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--A-AATA----------TTT-----GGAA--A-A---------CA-CC--A------AA--TGTACCA-CAT-----GGAA-TTTAGACAA
gi|71898 : GTTCTGGAGGAG--TTGTG-TTTT--C-ATGA----------TTT-----AAAA--A-A---------CG-CC--A------
gi|71899 : GTTCAGGGGGAG--ATGTG-TTTG--C-ATAA----------TTT-----GAAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TCTGCC
gi|71900 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TTTAGACA
gi|71901 : TTCAGGAGGAG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CA--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TTTAGACA
gi|71902 : CAGGTGGGG--TTGTC-TTTC--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-TC--------AA-TT
gi|71903 : AAGAG--TTGTG-TTTC--T-AAGA----------TTA-----TGAA--A-A---------CG-CC--G------AA--TATGCTT-CCC-----GAAA-TTTATATAA
gi|71904 : GAG--TTGTG-TTTT--C-AAGA----------TTA-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-TCT-----GAAA-TATAGACA
gi|71905 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGTCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71906 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAAA----------TTT-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AC--GGTGTCA-CCC-----GGAA-TTTGGACAA
gi|71907 : AG--TTGTG-TTTG--C-AAAA----------TTT-----GGAA--A-A---------CG-CC--A------CA--TGTACCA-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71908 : AG--TTGTG-TTTC--C-AAAA----------TAT-----AGAA--A-A---------TG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TATAGACA
gi|71909 : TGTG-TTTC--C-AAGA----------TTT-----G--A--A-A---------CG-CT--A------AA--TGTGTCG-CCC-----GTGA-TATAGACA
gi|71910 : TG-TTTT--C-AAGA----------TTT-----AGAA--A-A---------TG-CA--A------AA--TTTGCCA-CCT-----GAAA-ATATGACAA
gi|71911 : G-TTTTAAC-AAAA----------CT------AGAA--A-A---------CG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGATAA
gi|71912 : GA----------TCT-----GGAA--A-G---------CA-CC--A------AA--TGTGCCG-CCC-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71913 : T-----AGAA--A-A---------TG-TC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71914 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71915 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTACCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71916 : T-----AGAA--A-A---------CG-CC--A------AA--TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA
gi|71917 : T-----AGAA--A-A---------AG-CC--A------AAA-TGTGCCA-CCT-----GAAA-TTTAGACAA