lowQualScore                  :                                   0 0   555555555555555555   0        00  8888   8888888 0  222  22222                  11        111111        4    111         0            4444  0 0    2           0      1   555555 2222 1       11111          
lowQualScore                  :                                   . .   ..................   .        ..  ....   ....... .  ...  .....                  ..        ......        .    ...         .            ....  . .    .           .      .   ...... .... .       .....          
lowQualScore                  :                                   7 7   000000000000000000   7        99  0000   7777777 7  333  88888                  66        666666        3    888         5            2222  5 5    1           5      1   888888 6666 2       66666          
consensus                     :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
Reference ( gi|21196 )        :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21200                      :                     AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21203                      :                     AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCACT-AAAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21199                      :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTT-CAAC---CATGTTGTT-AAAAAAGCTAGC----TT-A-TCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----T-TGTACAC-----TCACTACA
gi|21205                      :                     AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGCCGCT-GTAAAAGCTATC----CT-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21207                      :                     AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTG-ACC------T----A-TGTATAT-----TCACTACACT
gi|21212                      :                     AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21211                      :                     AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTT-CAGT---CATGTCGCT-ATAAAAGTTAGC----TT-A-ACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAC-----AAACTACACT
gi|21201                      :                     AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCTCT-TTAAAAGCTAGC----TT-A-AAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACG------T----A-TGTACAT-----TCACTACA
gi|21214                      :                     AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CGTGCCACT-GTAAAAGCTACC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGT
gi|21202                      :                     AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---TATGTTGCT-GTAAAAGCTAGT----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTT-ACC------T----A-TGAAAAT-----TGACTACA
gi|21198                      :                     AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTT-CAAC---CGTGTTGCT-GTAAAAACTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21213                      :                     AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTT-CAAC---AATGTCGCT-AATAAAGCTAGC----TT-A-ACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACA
gi|21208                      :                     AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTT-CAAC---CATGTCGCT-AT-AAAGCTATC----TT-A-ACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTG-ACT------C----A-TGTGCAT-----TCACTGCAt
gi|21217                      :                     AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAT---GGTGTTGCT-GTTAAAGCTAGC----TT-T-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTG-ACA------T----T-TGTACAT-----TCACTACAgtg
gi|21215                      :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCT-CAAT---CATGTCGCT-GTAAAAGCTAAC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGCACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21192                      :                     AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ACAAAAACTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TATACTT-----TCACTACACT
gi|21210                      :                     AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CAT-------------GCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TATACAT-----TCACTACACT
gi|21209                      :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---TACCACACT-ATAATAGCTAGC----TT-A-ACA--------TGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACAACACT
gi|21197                      :                     AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGCTAGC-----------------------TG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21206                      :                     AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTT-CAAC---CATGCCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21185                      :                     AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21184                      :                     AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21191                      :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGACGCT-ATAACAGCTAGC----TT-A-ACA--------TGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTAAACaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186                      :                     AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGT----TT-A-ACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCATTTCATTatt
gi|21204                      :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAACTAGC----TT-A-ACAT-CGAGG---------------CC------T----A-TGTTCAT-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21218                      :                     AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGGTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT------------------TGTACAT-----TCACTACA
gi|21219                      :                     AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT--A------ATGTCGCT-GCAAAAGCTAGC----TC-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGG-ACC------T----A-TGCACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21187                      :                     AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTT-TAAC---TACATTGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21222                      :                     AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAACAGATAGC----TC-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACT------G----A-TGTACAT-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21216                      :                     AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTT-CAAC---CATGCCGCT-GGAAAAGCTAGC----TC-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTATAt
gi|21189                      :                     AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG--AAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACA
gi|21220                      :                     AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTT-CAAC---AATGTCGCT-ATAAAACCTAGC----TT-A-ACAG-TGAGACTGTTG-TAATTG-ATC------TA---A-TA-ACTT-----TCACTGCAtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21231                      :                     AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTT-CAAC---CATGTTGCT-AT-TAATCTAGC----TC-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTG-GCT------T----G-TGTACAT-----CCACTACAt
gi|21221                      : gtaacttctgacaccatcaaAGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-AC
gi|21223                      :                     AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGC-------------------AAGGCTGTTG-TAAGTG-ATC------T----G-TGTACAC-----TCAGTACACT
gi|21224                      :                     AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CATC---CATATCGCT-ATAAAAG
gi|21226                      :                     AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGCTA
gi|21195                      :                     AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTG---------------------------------CTT--AAC---CATGTCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTG-ACCTA----T----A-TGTACAC-----TCACTACACT
gi|21229                      :                     AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTA
gi|21188                      :                     AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTG---------------------------------CTT--AAC---CATGTCACT-GTAAAAGCTAGC----TT-C-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTG-ACCTA----T----A-TGTACAC-----TCACTACACT
gi|21227                      :                     AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCT-CAAC---CA
gi|21193                      :                     AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGC----------------------------------T-TAAC---CATGTCGCT-GTAAATGCTAGC----TT-A-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTA-ACCTA----T----A-TGTACAC-----TTACTACACTcagggctg
gi|21194                      :                     AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GT
gi|21228                      :                     AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--AC----CC--------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACT
gi|21190                      :                     AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGC----------------------------------T-TAAC---CATGTTGCT-GTAAAAGCTAGC----CT-C-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTG-ACC------TAA--A-TGTACAC-----TCACT
gi|21225                      :                     AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21230                      :                      GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAGGCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCGCTACA
gi|21232                      :                      GTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATA-CAGT---CATATCGCT-ATTGAATCTGGC----TC-A-ACAG-CATGGCTGTTG-AATGTG-ATCTACTGGT----A-TGCACAT-----TCACTACATTtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21235                      :                         ACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-GTAAATGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TTACTACACTcgacat
gi|21236                      :                         ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTT-CAGC---CATGTTACT-ATAAAAGCTACC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTG-ACC------T----A-TATACATTTAAATTACTACA
gi|21233                      :                          CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGt
gi|21238                      :                          tacCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CGTGCCACT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACAgctg
gi|21239                      :                             CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACGT-----TCACTACA
gi|21237                      :                             CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCACT-ATTGAAGCTAGC----AC-A-ACAG-TGTGACTGTT--TCAGTG-ACC------T----A-TGCATAT-----TCACTGCA
gi|21234                      :                            tCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACAT-CAAC---AATGTACCT-GTAAAAGCTACT----TC-A-TCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTG-ACC------TATACA-TGTACAC-----TCACTACACT
gi|21240                      :                         aatatGGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTT-CAAC---CATATCACT-CTAAAAGATACC----TC-A-ACAT-GGAG---GTTG-TAAGTG-ACCTACCAGT----A-TGTTCAT-----TCACTACACT
gi|21241                      :                                   -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATT-CAAC---CATATCGCT-GTTAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-------------------TGTACAT-----TCACTACA
gi|21242                      :                                        A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTT-CAAC---CATGCCACT-ATAAAAGCTAAC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTT-AGC------T----A-TGTACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243                      :                                        A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGT----TT-A-ACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTA
gi|21244                      :                                                           aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCTCT-ATAAAAGCTAAC----TT-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCT-ACC------T----A-TGTACAT-----TCATTACA
gi|21247                      :                                                                                                  -----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---AACGACGCT-ATAATAGTTAGC----TT-A-ACA--------TGTTG-AAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTATACT
gi|21246                      :                                                                                                        CGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTT-CAAC---AATGTCGCT-ATCAAAGCTAGC----TT-A-ACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACAACA
gi|21248                      :                                                                                                        acTTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTT-TAAC---CATGTCGCT-ATAAAAACTAGC----TT-A-ACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249                      :                                                                                                           TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTT-CAAC---CATGTCCCT-CTGGAAACTAGC----TC-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------C----A-TGTGCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250                      :                                                                                                             CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGCTAGC----TC-A-ACAG-TGAG
gi|21245                      :                                                                                                                   TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTT-TAAC---CATCTCACT-ATAAAAGCT
gi|21185                      :                                                                                                        taacctgtacaatgtcg--TACA-TTG------GT-CACTTACAACAGTCTTGTTGTT-A----AGCTAGCT---TT-T-ACAG-CGATGTAGTTA--AAGTG-
gi|21184                      :                                          agtaacatcggtcacccatccaagtactaacactcccctaacactgtacatcgttgctcaacttccaatacagccagtg--TACA-TTG------GT-CACTTACAACAGTCTTGTTGTT-A----AGCTAGCT---TT-T-ACAG-CGATGTAGTTA--AAGTG-cattcactacattaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186                      :                                          agtaacatcggtcacccatccaagtactaacactcccctaacactgtacatcgttgctcaacttccaatacagccagtg--TACA-TTG------GT-CACTTACAAC---AGTCTTGCT-GTTAAA-CTAGC----TT-TTACAG-CGATGTAGTTG--AAGTG-cattcactacattaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21251                      :                                             agtaacatcggtcacccatccaagtactaacactcccctaacactgtacatcgttgctcaacttccaatacagtcagtgACAGCCA------GC---CCT-GAAC---CATGTGGCT-TTAAAAGCTAGC----TT-A-CCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTACAT-----TCACTACAcattcatttcattgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21252                      :                                                                                                                                 CA------ATGCATTT-TAAC---CATAGTGCT-ATAAAAGCTAGC----TC-A-GCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTC-CCT------T----A-TGAACAT-----TCACTACAtcg
gi|21241                      :                                                                                                                                   ------GTACACTTACAAC---AGCCTCGCT-GTTAA-GCTAGC----TTTA-ACAG-CGA
gi|21235                      :                                                                         cccatccaagtactaaccctgtacttcgttgcttaacttccaatacagtcagtttaattcaaccataCACTTACAAC---AGCCTCGCT-GTTAA-GCTAGCA---TT-T-ACAG-CGACATGGTTG--AAGTGCACC------G----ACTGTAattcactacagcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21199                      :                                                                                       acagcggtcacccatccaagtactagccctgtactttgttgcttaacttccaaCACTTACAAC---AACCTCGCTGATAA--GCTAGCTTTTTT-A-ACAA-CATGGTTG-----AAGTG-acctatgtacatttactacact
gi|21213                      :                                                                        agtgacagcggtcacccatccaagtactaaccccgaacttcgttgcttaacttccaatacagtcagagCACTTACAAC---AACCTCGCC-GTTAA-GCTAGCT---TT-A-TTAG-CGACATTGTTG--AAGTG-acctttgtacactcactaca
gi|21246                      :                                                                         agttacagcggtcatcaatccaagtacaaacccgtacttcgttgcttaacttccagtaaagtcagtgCACTTACAAC---AGCCTCGAT-GTTAA-GCTAGCT---TT-G-ATAG-CGACATTGTTG--AAGTGTACC------G----ACTGTAacctatgtacattcactacat
gi|21256                      :                                                                                                                                  accgctgcttaacttccaaC---CATGTCACT-GTTAAACCTAGC----TT-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATG-ACC------T----A-TGTACacctatgtacattcacaaca
gi|21254                      :                                                                                                                                                     C---CACATCGCT-GTAAAAACTAGG----TT-A-ACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTAGTT-----TCATTA-ACTtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21255                      :                                                                                                                                                     C---CACATCGCT-GTAAAAACTACC----TT-A-ACAA-TGAGGCTGTTG-T---TG-ATT------T----A-TGTAGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21253                      :                                                                                                                                                          ATGTCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTG-ATC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACTatt
gi|21217                      :                                                                                                                                                     cattttatTCGCT-GTAAA-GCTAGCT---TT-A-ACAG-CAACACCATTG--AAGTG-
gi|21259                      :                                                                                         agtgacagccgtcactcatccaagtactaaccccgtacttagttgcttaatttccaatacagtcagtgTTGCT-TTAAAATCTAGC----TG-A-ACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGCACAT-----TCACAACggctgttgtaattgacatttgtacattcactacaatgctattgaat
gi|21257                      :                                                                                                                                                             TTGCT-GGAAAAACTAGC----TT-A-AAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTAGTT-----TCACTACA
gi|21258                      :                                                                                                                                                            aTCGCT-G-AAAAACTAGC----TT-T-ACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTAGTT-----TCACTA
gi|21260                      :                                                                                                                                                              aGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21261                      :                                                                                                                                                                CT-ATGAAAGCTAGT----TC-A-ACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTG-ACA------T----A-TGTATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262                      :                                                                                                                                                                    TAAAAG---G-----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTTCAT-----TCACTACA
15 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT






Alignments
lowQualScore                  :                                  0 0   444444444444444444   0        00  7777   8888888 0  222  22222                  11       5555555                                        2           0         555555 2222    0    11111          
lowQualScore                  :                                  . .   ..................   .        ..  ....   ....... .  ...  .....                  ..       .......                                        .           .         ...... ....    .    .....          
lowQualScore                  :                                  7 7   999999999999999999   7        99  9999   5555555 7  333  77777                  66       3333333                                        3           6         999999 1111    6    55555          
consensus                     :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
Reference ( family-326 )      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21184                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21185                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCATTTCATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21187                      :                    AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTTTAACTACATTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21188                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCACTGTAAAAGCTAGCTTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21189                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG--AAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21190                      :                    AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTTGCTGTAAAAGCTAGCCTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACC------TAA--ATGT-ACAC-----TCACTtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21191                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTTCAACCATGACGCTATAACAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTAAAC
gi|21192                      :                    AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTACAAAAACTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACTT-----TCACTACACTatt
gi|21193                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTAACCTA----T----ATGT-ACAC-----TTACTACACT
gi|21194                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGT
gi|21195                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21196                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21197                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGC-----------------TG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21198                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTTCAACCGTGTTGCTGTAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21199                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTTCAACCATGTTGTTAAAAAAGCTAGCTTATCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----TTGT-ACAC-----TCACTACA
gi|21200                      :                    AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21201                      :                    AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTTTAAAAGCTAGCTTAAAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTGACG------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21202                      :                    AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTATGTTGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTACC------T----ATGA-AAAT-----TGACTACA
gi|21203                      :                    AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTAAAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21204                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAACTAGCTTAACAT-CGAGG--------------CC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
gi|21205                      :                    AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGTAAAAGCTATCCTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21206                      :                    AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTTCAACCATGCCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21207                      :                    AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATGT-ATAT-----TCACTACACT
gi|21208                      :                    AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTTCAACCATGTCGCTAT-AAAGCTATCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACT------C----ATGT-GCAT-----TCACTGCA
gi|21209                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACCACACTATAATAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACACTgtg
gi|21210                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTTCAACCAT------------GCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21211                      :                    AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTTCAGTCATGTCGCTATAAAAGTTAGCTTAACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAC-----AAACTACACT
gi|21212                      :                    AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21213                      :                    AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTTCAACAATGTCGCTAATAAAGCTAGCTTAACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21214                      :                    AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-t
gi|21215                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCTCAATCATGTCGCTGTAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACTACA
gi|21216                      :                    AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGGAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATA
gi|21217                      :                    AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAATGGTGTTGCTGTTAAAGCTAGCTTTACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTGACA------T----TTGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21218                      :                    AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGGTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT----------------TGT-ACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21219                      :                    AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT-A---ATGTCGCTGCAAAAGCTAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGGACC------T----ATGC-ACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21220                      :                    AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATAAAACCTAGCTTAACAG-TGAGACTGTTG-TAATTGATC------T----A-ATAACTT-----TCACTGCA
gi|21221                      :                    AGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACt
gi|21222                      :                    AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTTCAACCATGTCGCTATAACAGATAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACT------G----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21223                      :                    AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTTCAACCATGTTGCTATAAAAGC-------------AAGGCTGTTG-TAAGTGATC------T----GTGT-ACAC-----TCAGTACACTt
gi|21224                      :                    AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCATCCATATCGCTATAAAAG
gi|21225                      :                    AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21226                      :                    AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTA
gi|21227                      :                    AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCTCAACCA
gi|21228                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--A-----CCC-------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTcagggctg
gi|21229                      :                    AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTA
gi|21230                      :                     GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAGGCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCGCTACA
gi|21231                      :                    AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTTCAACCATGTTGCTAT-TAATCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTGGCT------T----GTGT-ACAT-----CCACTACAtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21232                      : gtaacttctgacaccatcaaGTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATACAGTCATATCGCTATTGAATCTGGCTCAACAG-CATGGCTGTTG-AATGTGATCTACTGGT----ATGC-ACAT-----TCACTACATT
gi|21233                      :                         CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATG--GCTGcgacat
gi|21234                      :                         tacCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACATCAACAATGTACCTGTAAAAGCTACTTCATCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTGACC------TATACATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21235                      :                   aatatACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TTACTACACT
gi|21236                      :                        ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTTCAGCCATGTTACTATAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATAT-ACATTTAAATTACTACA
gi|21237                      :                            CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTATTGAAGCTAGCACAACAG-TGTGACTGTT--TCAGTGACC------T----ATGC-ATAT-----TCACTGCAt
gi|21238                      :                           tCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21239                      :                            CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACGT-----TCACTACA
gi|21240                      :                             GGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTTCAACCATATCACTCTAAAAGATACCTCAACAT-GGAG---GTTG-TAAGTGACCTACCAGT----ATGT-TCAT-----TCACTACACT
gi|21241                      :                                  -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATTCAACCATATCGCTGTTAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-----------------TGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21242                      :                                       A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTTCAACCATGCCACTATAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTAGC------T----ATGT-ACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243                      :                                       A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGTTTAACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTA
gi|21244                      :                                                          aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTATAAAAGCTAACTTAACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCTACC------T----ATGT-ACAT-----TCATTACA
gi|21245                      :                                                                                                                  TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTTTAACCATCTCACTATAAAAGCT
gi|21246                      :                                                                                      taacctgtacaatgtcgCGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATCAAAGCTAGCTTAACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACA
gi|21247                      :                                                                                               ac-----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACAACGACGCTATAATAGTTAGCTTAACA--------TGTTG-AAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATACT
gi|21248                      :                                                                                                         TTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTTTAACCATGTCGCTATAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249                      :                                                                                                          TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTTCAACCATGTCCCTCTGGAAACTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------C----ATGT-GCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250                      :                                                                                                            CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAG
gi|21251                      :                                                                                                                           ACAGCCA------GC---CCTGAACCATGTGGCTTTAAAAGCTAGCTTACCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21252                      :                                                                                                                                         TGCATTTTAACCATAGTGCTATAAAAGCTAGCTCAGCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTCCCT------T----ATGA-ACAT-----TCACTACAtcg
gi|21253                      :                                                                                                                                                  caaATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21254                      :                                                                                                                                           cattttatCCACATCGCTGTAAAAACTAGGTTAACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCATTA-ACT
gi|21255                      :                                                                                                                                                   CCACATCGCTGTAAAAACTACCTTAACAA-TGAGGCTGTTG-T---TGATT------T----ATGT-AGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21256                      :                                                                                                                                                   CCATGTCACTGTTAAACCTAGCTTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACatt
gi|21257                      :                                                                                                                                                        TTGCTGGAAAAACTAGCTTAAAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTACAtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21258                      :                                                                                                                                                       aTCGCTG-AAAAACTAGCTTTACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTA
gi|21259                      :                                                                                                                                                       aTTGCTTTAAAATCTAGCTGAACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACAAC
gi|21260                      :                                                                                                                                                          GCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21261                      :                                                                                                                                                           CTATGAAAGCTAGTTCAACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTGACA------T----ATGT-ATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262                      :                                                                                                                                                             GTAAAAG---G-TTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT






Alignments
lowQualScore                  :                                  0 0   444444444444444444   0        00  7777   8888888 0  222  22222                  11        111111                                        2           0         555555 2222    0    11111          
lowQualScore                  :                                  . .   ..................   .        ..  ....   ....... .  ...  .....                  ..        ......                                        .           .         ...... ....    .    .....          
lowQualScore                  :                                  7 7   999999999999999999   7        99  9999   5555555 7  333  77777                  66        777777                                        3           6         999999 1111    6    55555          
consensus                     :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
Reference ( family-326 )      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21184                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21185                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCATTTCATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21187                      :                    AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTTTAACTACATTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21188                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCACTGTAAAAGCTAGCTTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21189                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG--AAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21190                      :                    AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTTGCTGTAAAAGCTAGCCTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACC------TAA--ATGT-ACAC-----TCACTtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21191                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTTCAACCATGACGCTATAACAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTAAAC
gi|21192                      :                    AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTACAAAAACTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACTT-----TCACTACACTatt
gi|21193                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTAACCTA----T----ATGT-ACAC-----TTACTACACT
gi|21194                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGT
gi|21195                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21196                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21197                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGC-----------------TG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21198                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTTCAACCGTGTTGCTGTAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21199                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTTCAACCATGTTGTTAAAAAAGCTAGCTTATCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----TTGT-ACAC-----TCACTACA
gi|21200                      :                    AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21201                      :                    AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTTTAAAAGCTAGCTTAAAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTGACG------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21202                      :                    AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTATGTTGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTACC------T----ATGA-AAAT-----TGACTACA
gi|21203                      :                    AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTAAAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21204                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAACTAGCTTAACAT-CGAGG--------------CC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
gi|21205                      :                    AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGTAAAAGCTATCCTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21206                      :                    AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTTCAACCATGCCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21207                      :                    AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATGT-ATAT-----TCACTACACT
gi|21208                      :                    AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTTCAACCATGTCGCTAT-AAAGCTATCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACT------C----ATGT-GCAT-----TCACTGCA
gi|21209                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACCACACTATAATAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACACTgtg
gi|21210                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTTCAACCAT------------GCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21211                      :                    AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTTCAGTCATGTCGCTATAAAAGTTAGCTTAACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAC-----AAACTACACT
gi|21212                      :                    AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21213                      :                    AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTTCAACAATGTCGCTAATAAAGCTAGCTTAACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21214                      :                    AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-t
gi|21215                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCTCAATCATGTCGCTGTAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACTACA
gi|21216                      :                    AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGGAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATA
gi|21217                      :                    AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAATGGTGTTGCTGTTAAAGCTAGCTTTACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTGACA------T----TTGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21218                      :                    AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGGTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT----------------TGT-ACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21219                      :                    AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT-A---ATGTCGCTGCAAAAGCTAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGGACC------T----ATGC-ACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21220                      :                    AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATAAAACCTAGCTTAACAG-TGAGACTGTTG-TAATTGATC------T----A-ATAACTT-----TCACTGCA
gi|21221                      :                    AGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACt
gi|21222                      :                    AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTTCAACCATGTCGCTATAACAGATAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACT------G----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21223                      :                    AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTTCAACCATGTTGCTATAAAAGC-------------AAGGCTGTTG-TAAGTGATC------T----GTGT-ACAC-----TCAGTACACTt
gi|21224                      :                    AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCATCCATATCGCTATAAAAG
gi|21225                      :                    AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21226                      :                    AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTA
gi|21227                      :                    AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCTCAACCA
gi|21228                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--AC----CC--------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTcagggctg
gi|21229                      :                    AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTA
gi|21230                      :                     GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAGGCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCGCTACA
gi|21231                      :                    AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTTCAACCATGTTGCTAT-TAATCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTGGCT------T----GTGT-ACAT-----CCACTACAtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21232                      : gtaacttctgacaccatcaaGTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATACAGTCATATCGCTATTGAATCTGGCTCAACAG-CATGGCTGTTG-AATGTGATCTACTGGT----ATGC-ACAT-----TCACTACATT
gi|21233                      :                         CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATG--GCTGcgacat
gi|21234                      :                         tacCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACATCAACAATGTACCTGTAAAAGCTACTTCATCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTGACC------TATACATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21235                      :                   aatatACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TTACTACACT
gi|21236                      :                        ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTTCAGCCATGTTACTATAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATAT-ACATTTAAATTACTACA
gi|21237                      :                            CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTATTGAAGCTAGCACAACAG-TGTGACTGTT--TCAGTGACC------T----ATGC-ATAT-----TCACTGCAt
gi|21238                      :                           tCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21239                      :                            CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACGT-----TCACTACA
gi|21240                      :                             GGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTTCAACCATATCACTCTAAAAGATACCTCAACAT-GGAG---GTTG-TAAGTGACCTACCAGT----ATGT-TCAT-----TCACTACACT
gi|21241                      :                                  -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATTCAACCATATCGCTGTTAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-----------------TGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21242                      :                                       A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTTCAACCATGCCACTATAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTAGC------T----ATGT-ACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243                      :                                       A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGTTTAACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTA
gi|21244                      :                                                          aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTATAAAAGCTAACTTAACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCTACC------T----ATGT-ACAT-----TCATTACA
gi|21245                      :                                                                                                                  TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTTTAACCATCTCACTATAAAAGCT
gi|21246                      :                                                                                      taacctgtacaatgtcgCGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATCAAAGCTAGCTTAACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACA
gi|21247                      :                                                                                               ac-----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACAACGACGCTATAATAGTTAGCTTAACA--------TGTTG-AAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATACT
gi|21248                      :                                                                                                         TTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTTTAACCATGTCGCTATAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249                      :                                                                                                          TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTTCAACCATGTCCCTCTGGAAACTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------C----ATGT-GCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250                      :                                                                                                            CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAG
gi|21251                      :                                                                                                                           ACAGCCA------GC---CCTGAACCATGTGGCTTTAAAAGCTAGCTTACCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21252                      :                                                                                                                                CA------ATGCATTTTAACCATAGTGCTATAAAAGCTAGCTCAGCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTCCCT------T----ATGA-ACAT-----TCACTACAtcg
gi|21253                      :                                                                                                                                                     ATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21254                      :                                                                                                                                           cattttatCCACATCGCTGTAAAAACTAGGTTAACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCATTA-ACT
gi|21255                      :                                                                                                                                                   CCACATCGCTGTAAAAACTACCTTAACAA-TGAGGCTGTTG-T---TGATT------T----ATGT-AGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21256                      :                                                                                                                                                   CCATGTCACTGTTAAACCTAGCTTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACatt
gi|21257                      :                                                                                                                                                        TTGCTGGAAAAACTAGCTTAAAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTACAtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21258                      :                                                                                                                                                       aTCGCTG-AAAAACTAGCTTTACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTA
gi|21259                      :                                                                                                                                                       aTTGCTTTAAAATCTAGCTGAACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACAAC
gi|21260                      :                                                                                                                                                          GCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21261                      :                                                                                                                                                           CTATGAAAGCTAGTTCAACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTGACA------T----ATGT-ATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262                      :                                                                                                                                                             GTAAAAG---G-TTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA


blockSeqs                     :                                        TCCAAGTACTAACCCCCA                ACTC   TAACACT    ACA  GTAGA                  CT        CCTGAT                                        A                     TACTGG ATAC         TTAAA
blockSeqs                     :                                        .                                 ACTC   TAACACT    ACA  ACA                    CT        .                                             A                     TACCAG AA           .    
blockSeqs                     :                                        .                                 ACTC   TAACACT    .    .                      .         .                                             A                     TA     .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 ACT    .          .    .                      .         .                                             A                     TA     .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 ACT    .          .    .                      .         .                                             .                     TA     .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                        .                                 .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                          .      .          .    .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                 .                      .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                        .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                        .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                        .         .                                             .                     .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                        .         .                                             .                     .      .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                        .         .                                             .                     .      .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .                                             .                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .                                             .                                              


blockSeqCons                  :                                                                          ****   *******
originalCons                  :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
finalCons                     :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT






Alignments
lowQualScore                  :                                  0 0   444444444444444444   0        00  7777   8888888 0  222  22222                  11        111111                                        2           0         555555 2222    0    11111          
lowQualScore                  :                                  . .   ..................   .        ..  ....   ....... .  ...  .....                  ..        ......                                        .           .         ...... ....    .    .....          
lowQualScore                  :                                  7 7   999999999999999999   7        99  9999   5555555 7  333  77777                  66        777777                                        3           6         999999 1111    6    55555          
consensus                     :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
Reference ( family-326 )      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21184                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21185                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCATTTCATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21187                      :                    AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTTTAACTACATTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21188                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCACTGTAAAAGCTAGCTTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21189                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG--AAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21190                      :                    AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTTGCTGTAAAAGCTAGCCTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACC------TAA--ATGT-ACAC-----TCACTtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21191                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTTCAACCATGACGCTATAACAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTAAAC
gi|21192                      :                    AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTACAAAAACTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACTT-----TCACTACACTatt
gi|21193                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTAACCTA----T----ATGT-ACAC-----TTACTACACT
gi|21194                      :                    AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGT
gi|21195                      :                    AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21196                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21197                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGC-----------------TG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21198                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTTCAACCGTGTTGCTGTAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21199                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTTCAACCATGTTGTTAAAAAAGCTAGCTTATCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----TTGT-ACAC-----TCACTACA
gi|21200                      :                    AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21201                      :                    AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTTTAAAAGCTAGCTTAAAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTGACG------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21202                      :                    AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTATGTTGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTACC------T----ATGA-AAAT-----TGACTACA
gi|21203                      :                    AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTAAAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21204                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAACTAGCTTAACAT-CGAGG--------------CC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
gi|21205                      :                    AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGTAAAAGCTATCCTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21206                      :                    AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTTCAACCATGCCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21207                      :                    AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATGT-ATAT-----TCACTACACT
gi|21208                      :                    AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTTCAACCATGTCGCTAT-AAAGCTATCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACT------C----ATGT-GCAT-----TCACTGCA
gi|21209                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACCACACTATAATAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACACTgtg
gi|21210                      :                    AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTTCAACCAT------------GCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21211                      :                    AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTTCAGTCATGTCGCTATAAAAGTTAGCTTAACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAC-----AAACTACACT
gi|21212                      :                    AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21213                      :                    AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTTCAACAATGTCGCTAATAAAGCTAGCTTAACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21214                      :                    AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-t
gi|21215                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCTCAATCATGTCGCTGTAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACTACA
gi|21216                      :                    AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGGAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATA
gi|21217                      :                    AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAATGGTGTTGCTGTTAAAGCTAGCTTTACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTGACA------T----TTGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21218                      :                    AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGGTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT----------------TGT-ACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21219                      :                    AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT-A---ATGTCGCTGCAAAAGCTAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGGACC------T----ATGC-ACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21220                      :                    AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATAAAACCTAGCTTAACAG-TGAGACTGTTG-TAATTGATC------T----A-ATAACTT-----TCACTGCA
gi|21221                      :                    AGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACt
gi|21222                      :                    AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTTCAACCATGTCGCTATAACAGATAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACT------G----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21223                      :                    AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTTCAACCATGTTGCTATAAAAGC-------------AAGGCTGTTG-TAAGTGATC------T----GTGT-ACAC-----TCAGTACACTt
gi|21224                      :                    AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCATCCATATCGCTATAAAAG
gi|21225                      :                    AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21226                      :                    AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTA
gi|21227                      :                    AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCTCAACCA
gi|21228                      :                    AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--AC----CC--------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTcagggctg
gi|21229                      :                    AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTA
gi|21230                      :                     GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAGGCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCGCTACA
gi|21231                      :                    AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTTCAACCATGTTGCTAT-TAATCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTGGCT------T----GTGT-ACAT-----CCACTACAtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21232                      : gtaacttctgacaccatcaaGTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATACAGTCATATCGCTATTGAATCTGGCTCAACAG-CATGGCTGTTG-AATGTGATCTACTGGT----ATGC-ACAT-----TCACTACATT
gi|21233                      :                         CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATG--GCTGcgacat
gi|21234                      :                         tacCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACATCAACAATGTACCTGTAAAAGCTACTTCATCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTGACC------TATACATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21235                      :                   aatatACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TTACTACACT
gi|21236                      :                        ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTTCAGCCATGTTACTATAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATAT-ACATTTAAATTACTACA
gi|21237                      :                            CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTATTGAAGCTAGCACAACAG-TGTGACTGTT--TCAGTGACC------T----ATGC-ATAT-----TCACTGCAt
gi|21238                      :                           tCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21239                      :                            CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACGT-----TCACTACA
gi|21240                      :                             GGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTTCAACCATATCACTCTAAAAGATACCTCAACAT-GGAG---GTTG-TAAGTGACCTACCAGT----ATGT-TCAT-----TCACTACACT
gi|21241                      :                                  -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATTCAACCATATCGCTGTTAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-----------------TGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21242                      :                                       A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTTCAACCATGCCACTATAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTAGC------T----ATGT-ACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243                      :                                       A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGTTTAACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTA
gi|21244                      :                                                          aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTATAAAAGCTAACTTAACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCTACC------T----ATGT-ACAT-----TCATTACA
gi|21245                      :                                                                                                                  TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTTTAACCATCTCACTATAAAAGCT
gi|21246                      :                                                                                      taacctgtacaatgtcgCGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATCAAAGCTAGCTTAACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACA
gi|21247                      :                                                                                               ac-----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACAACGACGCTATAATAGTTAGCTTAACA--------TGTTG-AAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATACT
gi|21248                      :                                                                                                         TTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTTTAACCATGTCGCTATAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249                      :                                                                                                          TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTTCAACCATGTCCCTCTGGAAACTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------C----ATGT-GCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250                      :                                                                                                            CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAG
gi|21251                      :                                                                                                                           ACAGCCA------GC---CCTGAACCATGTGGCTTTAAAAGCTAGCTTACCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21252                      :                                                                                                                                CA------ATGCATTTTAACCATAGTGCTATAAAAGCTAGCTCAGCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTCCCT------T----ATGA-ACAT-----TCACTACAtcg
gi|21253                      :                                                                                                                                                     ATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21254                      :                                                                                                                                           cattttatCCACATCGCTGTAAAAACTAGGTTAACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCATTA-ACT
gi|21255                      :                                                                                                                                                   CCACATCGCTGTAAAAACTACCTTAACAA-TGAGGCTGTTG-T---TGATT------T----ATGT-AGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21256                      :                                                                                                                                                   CCATGTCACTGTTAAACCTAGCTTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACatt
gi|21257                      :                                                                                                                                                        TTGCTGGAAAAACTAGCTTAAAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTACAtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21258                      :                                                                                                                                                       aTCGCTG-AAAAACTAGCTTTACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTA
gi|21259                      :                                                                                                                                                       aTTGCTTTAAAATCTAGCTGAACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACAAC
gi|21260                      :                                                                                                                                                          GCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21261                      :                                                                                                                                                           CTATGAAAGCTAGTTCAACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTGACA------T----ATGT-ATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262                      :                                                                                                                                                             GTAAAAG---G-TTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT