lowQualScore : 0 0 555555555555555555 0 00 8888 8888888 0 222 22222 11 111111 4 111 0 4444 0 0 2 0 1 555555 2222 1 11111
lowQualScore : . . .................. . .. .... ....... . ... ..... .. ...... . ... . .... . . . . . ...... .... . .....
lowQualScore : 7 7 000000000000000000 7 99 0000 7777777 7 333 88888 66 666666 3 888 5 2222 5 5 1 5 1 888888 6666 2 66666
consensus : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
Reference ( gi|21196 ) : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21200 : AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21203 : AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCACT-AAAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21199 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTT-CAAC---CATGTTGTT-AAAAAAGCTAGC----TT-A-TCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----T-TGTACAC-----TCACTACA
gi|21205 : AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGCCGCT-GTAAAAGCTATC----CT-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21207 : AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTG-ACC------T----A-TGTATAT-----TCACTACACT
gi|21212 : AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACT
gi|21211 : AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTT-CAGT---CATGTCGCT-ATAAAAGTTAGC----TT-A-ACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAC-----AAACTACACT
gi|21201 : AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCTCT-TTAAAAGCTAGC----TT-A-AAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACG------T----A-TGTACAT-----TCACTACA
gi|21214 : AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CGTGCCACT-GTAAAAGCTACC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGT
gi|21202 : AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---TATGTTGCT-GTAAAAGCTAGT----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTT-ACC------T----A-TGAAAAT-----TGACTACA
gi|21198 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTT-CAAC---CGTGTTGCT-GTAAAAACTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21213 : AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTT-CAAC---AATGTCGCT-AATAAAGCTAGC----TT-A-ACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACA
gi|21208 : AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTT-CAAC---CATGTCGCT-AT-AAAGCTATC----TT-A-ACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTG-ACT------C----A-TGTGCAT-----TCACTGCAt
gi|21217 : AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAT---GGTGTTGCT-GTTAAAGCTAGC----TT-T-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTG-ACA------T----T-TGTACAT-----TCACTACAgtg
gi|21215 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCT-CAAT---CATGTCGCT-GTAAAAGCTAAC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGCACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21192 : AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ACAAAAACTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TATACTT-----TCACTACACT
gi|21210 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CAT-------------GCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TATACAT-----TCACTACACT
gi|21209 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---TACCACACT-ATAATAGCTAGC----TT-A-ACA--------TGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACAACACT
gi|21197 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGCTAGC-----------------------TG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21206 : AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTT-CAAC---CATGCCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21185 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21184 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21191 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGACGCT-ATAACAGCTAGC----TT-A-ACA--------TGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTAAACaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGT----TT-A-ACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCATTTCATTatt
gi|21204 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAACTAGC----TT-A-ACAT-CGAGG---------------CC------T----A-TGTTCAT-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21218 : AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGGTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT------------------TGTACAT-----TCACTACA
gi|21219 : AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT--A------ATGTCGCT-GCAAAAGCTAGC----TC-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGG-ACC------T----A-TGCACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21187 : AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTT-TAAC---TACATTGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21222 : AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAACAGATAGC----TC-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACT------G----A-TGTACAT-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21216 : AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTT-CAAC---CATGCCGCT-GGAAAAGCTAGC----TC-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTATAt
gi|21189 : AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG--AAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACA
gi|21220 : AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTT-CAAC---AATGTCGCT-ATAAAACCTAGC----TT-A-ACAG-TGAGACTGTTG-TAATTG-ATC------TA---A-TA-ACTT-----TCACTGCAtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21231 : AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTT-CAAC---CATGTTGCT-AT-TAATCTAGC----TC-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTG-GCT------T----G-TGTACAT-----CCACTACAt
gi|21221 : gtaacttctgacaccatcaaAGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-AC
gi|21223 : AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGC-------------------AAGGCTGTTG-TAAGTG-ATC------T----G-TGTACAC-----TCAGTACACT
gi|21224 : AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CATC---CATATCGCT-ATAAAAG
gi|21226 : AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGCTA
gi|21195 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTG---------------------------------CTT--AAC---CATGTCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTG-ACCTA----T----A-TGTACAC-----TCACTACACT
gi|21229 : AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTA
gi|21188 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTG---------------------------------CTT--AAC---CATGTCACT-GTAAAAGCTAGC----TT-C-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTG-ACCTA----T----A-TGTACAC-----TCACTACACT
gi|21227 : AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCT-CAAC---CA
gi|21193 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGC----------------------------------T-TAAC---CATGTCGCT-GTAAATGCTAGC----TT-A-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTA-ACCTA----T----A-TGTACAC-----TTACTACACTcagggctg
gi|21194 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GT
gi|21228 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--AC----CC--------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACT
gi|21190 : AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGC----------------------------------T-TAAC---CATGTTGCT-GTAAAAGCTAGC----CT-C-ACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTG-ACC------TAA--A-TGTACAC-----TCACT
gi|21225 : AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21230 : GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTT-TAAC---TACATCGCT-GTAAAGGCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCGCTACA
gi|21232 : GTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATA-CAGT---CATATCGCT-ATTGAATCTGGC----TC-A-ACAG-CATGGCTGTTG-AATGTG-ATCTACTGGT----A-TGCACAT-----TCACTACATTtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21235 : ACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-GTAAATGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TTACTACACTcgacat
gi|21236 : ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTT-CAGC---CATGTTACT-ATAAAAGCTACC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTG-ACC------T----A-TATACATTTAAATTACTACA
gi|21233 : CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGt
gi|21238 : tacCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CGTGCCACT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTACAgctg
gi|21239 : CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACGT-----TCACTACA
gi|21237 : CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCACT-ATTGAAGCTAGC----AC-A-ACAG-TGTGACTGTT--TCAGTG-ACC------T----A-TGCATAT-----TCACTGCA
gi|21234 : tCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACAT-CAAC---AATGTACCT-GTAAAAGCTACT----TC-A-TCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTG-ACC------TATACA-TGTACAC-----TCACTACACT
gi|21240 : aatatGGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTT-CAAC---CATATCACT-CTAAAAGATACC----TC-A-ACAT-GGAG---GTTG-TAAGTG-ACCTACCAGT----A-TGTTCAT-----TCACTACACT
gi|21241 : -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATT-CAAC---CATATCGCT-GTTAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-------------------TGTACAT-----TCACTACA
gi|21242 : A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTT-CAAC---CATGCCACT-ATAAAAGCTAAC----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTT-AGC------T----A-TGTACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243 : A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTT-CAAC---CATGTCGCT-ATAAAAGCTAGT----TT-A-ACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTA
gi|21244 : aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---CATGTCTCT-ATAAAAGCTAAC----TT-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCT-ACC------T----A-TGTACAT-----TCATTACA
gi|21247 : -----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTT-CAAC---AACGACGCT-ATAATAGTTAGC----TT-A-ACA--------TGTTG-AAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACTATACT
gi|21246 : CGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTT-CAAC---AATGTCGCT-ATCAAAGCTAGC----TT-A-ACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTACAT-----TCACAACA
gi|21248 : acTTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTT-TAAC---CATGTCGCT-ATAAAAACTAGC----TT-A-ACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249 : TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTT-CAAC---CATGTCCCT-CTGGAAACTAGC----TC-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------C----A-TGTGCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250 : CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTT-CAAC---CATGTTGCT-ATAAAAGCTAGC----TC-A-ACAG-TGAG
gi|21245 : TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTT-TAAC---CATCTCACT-ATAAAAGCT
gi|21185 : taacctgtacaatgtcg--TACA-TTG------GT-CACTTACAACAGTCTTGTTGTT-A----AGCTAGCT---TT-T-ACAG-CGATGTAGTTA--AAGTG-
gi|21184 : agtaacatcggtcacccatccaagtactaacactcccctaacactgtacatcgttgctcaacttccaatacagccagtg--TACA-TTG------GT-CACTTACAACAGTCTTGTTGTT-A----AGCTAGCT---TT-T-ACAG-CGATGTAGTTA--AAGTG-cattcactacattaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186 : agtaacatcggtcacccatccaagtactaacactcccctaacactgtacatcgttgctcaacttccaatacagccagtg--TACA-TTG------GT-CACTTACAAC---AGTCTTGCT-GTTAAA-CTAGC----TT-TTACAG-CGATGTAGTTG--AAGTG-cattcactacattaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21251 : agtaacatcggtcacccatccaagtactaacactcccctaacactgtacatcgttgctcaacttccaatacagtcagtgACAGCCA------GC---CCT-GAAC---CATGTGGCT-TTAAAAGCTAGC----TT-A-CCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTACAT-----TCACTACAcattcatttcattgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21252 : CA------ATGCATTT-TAAC---CATAGTGCT-ATAAAAGCTAGC----TC-A-GCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTC-CCT------T----A-TGAACAT-----TCACTACAtcg
gi|21241 : ------GTACACTTACAAC---AGCCTCGCT-GTTAA-GCTAGC----TTTA-ACAG-CGA
gi|21235 : cccatccaagtactaaccctgtacttcgttgcttaacttccaatacagtcagtttaattcaaccataCACTTACAAC---AGCCTCGCT-GTTAA-GCTAGCA---TT-T-ACAG-CGACATGGTTG--AAGTGCACC------G----ACTGTAattcactacagcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21199 : acagcggtcacccatccaagtactagccctgtactttgttgcttaacttccaaCACTTACAAC---AACCTCGCTGATAA--GCTAGCTTTTTT-A-ACAA-CATGGTTG-----AAGTG-acctatgtacatttactacact
gi|21213 : agtgacagcggtcacccatccaagtactaaccccgaacttcgttgcttaacttccaatacagtcagagCACTTACAAC---AACCTCGCC-GTTAA-GCTAGCT---TT-A-TTAG-CGACATTGTTG--AAGTG-acctttgtacactcactaca
gi|21246 : agttacagcggtcatcaatccaagtacaaacccgtacttcgttgcttaacttccagtaaagtcagtgCACTTACAAC---AGCCTCGAT-GTTAA-GCTAGCT---TT-G-ATAG-CGACATTGTTG--AAGTGTACC------G----ACTGTAacctatgtacattcactacat
gi|21256 : accgctgcttaacttccaaC---CATGTCACT-GTTAAACCTAGC----TT-A-ACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATG-ACC------T----A-TGTACacctatgtacattcacaaca
gi|21254 : C---CACATCGCT-GTAAAAACTAGG----TT-A-ACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTAGTT-----TCATTA-ACTtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21255 : C---CACATCGCT-GTAAAAACTACC----TT-A-ACAA-TGAGGCTGTTG-T---TG-ATT------T----A-TGTAGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21253 : ATGTCGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTG-ATC------T----A-TGTACAT-----TCACTACACTatt
gi|21217 : cattttatTCGCT-GTAAA-GCTAGCT---TT-A-ACAG-CAACACCATTG--AAGTG-
gi|21259 : agtgacagccgtcactcatccaagtactaaccccgtacttagttgcttaatttccaatacagtcagtgTTGCT-TTAAAATCTAGC----TG-A-ACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGCACAT-----TCACAACggctgttgtaattgacatttgtacattcactacaatgctattgaat
gi|21257 : TTGCT-GGAAAAACTAGC----TT-A-AAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTAGTT-----TCACTACA
gi|21258 : aTCGCT-G-AAAAACTAGC----TT-T-ACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTG-ATC------T----A-TGTAGTT-----TCACTA
gi|21260 : aGCT-GTAAAAGCTAGC----TT-A-ACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTG-ACC------A----A-TGTACAT-----TCACTACATT
gi|21261 : CT-ATGAAAGCTAGT----TC-A-ACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTG-ACA------T----A-TGTATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262 : TAAAAG---G-----TT-A-ACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTG-ACC------T----A-TGTTCAT-----TCACTACA
15 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT
Alignments
lowQualScore : 0 0 444444444444444444 0 00 7777 8888888 0 222 22222 11 5555555 2 0 555555 2222 0 11111
lowQualScore : . . .................. . .. .... ....... . ... ..... .. ....... . . ...... .... . .....
lowQualScore : 7 7 999999999999999999 7 99 9999 5555555 7 333 77777 66 3333333 3 6 999999 1111 6 55555
consensus : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
Reference ( family-326 ) : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21184 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21185 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCATTTCATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21187 : AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTTTAACTACATTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21188 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCACTGTAAAAGCTAGCTTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21189 : AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG--AAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21190 : AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTTGCTGTAAAAGCTAGCCTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACC------TAA--ATGT-ACAC-----TCACTtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21191 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTTCAACCATGACGCTATAACAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTAAAC
gi|21192 : AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTACAAAAACTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACTT-----TCACTACACTatt
gi|21193 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTAACCTA----T----ATGT-ACAC-----TTACTACACT
gi|21194 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGT
gi|21195 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21196 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21197 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGC-----------------TG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21198 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTTCAACCGTGTTGCTGTAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21199 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTTCAACCATGTTGTTAAAAAAGCTAGCTTATCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----TTGT-ACAC-----TCACTACA
gi|21200 : AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21201 : AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTTTAAAAGCTAGCTTAAAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTGACG------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21202 : AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTATGTTGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTACC------T----ATGA-AAAT-----TGACTACA
gi|21203 : AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTAAAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21204 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAACTAGCTTAACAT-CGAGG--------------CC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
gi|21205 : AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGTAAAAGCTATCCTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21206 : AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTTCAACCATGCCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21207 : AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATGT-ATAT-----TCACTACACT
gi|21208 : AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTTCAACCATGTCGCTAT-AAAGCTATCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACT------C----ATGT-GCAT-----TCACTGCA
gi|21209 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACCACACTATAATAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACACTgtg
gi|21210 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTTCAACCAT------------GCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21211 : AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTTCAGTCATGTCGCTATAAAAGTTAGCTTAACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAC-----AAACTACACT
gi|21212 : AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21213 : AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTTCAACAATGTCGCTAATAAAGCTAGCTTAACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21214 : AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-t
gi|21215 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCTCAATCATGTCGCTGTAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACTACA
gi|21216 : AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGGAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATA
gi|21217 : AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAATGGTGTTGCTGTTAAAGCTAGCTTTACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTGACA------T----TTGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21218 : AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGGTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT----------------TGT-ACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21219 : AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT-A---ATGTCGCTGCAAAAGCTAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGGACC------T----ATGC-ACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21220 : AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATAAAACCTAGCTTAACAG-TGAGACTGTTG-TAATTGATC------T----A-ATAACTT-----TCACTGCA
gi|21221 : AGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACt
gi|21222 : AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTTCAACCATGTCGCTATAACAGATAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACT------G----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21223 : AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTTCAACCATGTTGCTATAAAAGC-------------AAGGCTGTTG-TAAGTGATC------T----GTGT-ACAC-----TCAGTACACTt
gi|21224 : AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCATCCATATCGCTATAAAAG
gi|21225 : AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21226 : AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTA
gi|21227 : AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCTCAACCA
gi|21228 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--A-----CCC-------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTcagggctg
gi|21229 : AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTA
gi|21230 : GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAGGCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCGCTACA
gi|21231 : AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTTCAACCATGTTGCTAT-TAATCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTGGCT------T----GTGT-ACAT-----CCACTACAtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21232 : gtaacttctgacaccatcaaGTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATACAGTCATATCGCTATTGAATCTGGCTCAACAG-CATGGCTGTTG-AATGTGATCTACTGGT----ATGC-ACAT-----TCACTACATT
gi|21233 : CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATG--GCTGcgacat
gi|21234 : tacCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACATCAACAATGTACCTGTAAAAGCTACTTCATCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTGACC------TATACATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21235 : aatatACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TTACTACACT
gi|21236 : ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTTCAGCCATGTTACTATAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATAT-ACATTTAAATTACTACA
gi|21237 : CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTATTGAAGCTAGCACAACAG-TGTGACTGTT--TCAGTGACC------T----ATGC-ATAT-----TCACTGCAt
gi|21238 : tCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21239 : CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACGT-----TCACTACA
gi|21240 : GGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTTCAACCATATCACTCTAAAAGATACCTCAACAT-GGAG---GTTG-TAAGTGACCTACCAGT----ATGT-TCAT-----TCACTACACT
gi|21241 : -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATTCAACCATATCGCTGTTAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-----------------TGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21242 : A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTTCAACCATGCCACTATAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTAGC------T----ATGT-ACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243 : A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGTTTAACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTA
gi|21244 : aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTATAAAAGCTAACTTAACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCTACC------T----ATGT-ACAT-----TCATTACA
gi|21245 : TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTTTAACCATCTCACTATAAAAGCT
gi|21246 : taacctgtacaatgtcgCGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATCAAAGCTAGCTTAACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACA
gi|21247 : ac-----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACAACGACGCTATAATAGTTAGCTTAACA--------TGTTG-AAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATACT
gi|21248 : TTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTTTAACCATGTCGCTATAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249 : TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTTCAACCATGTCCCTCTGGAAACTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------C----ATGT-GCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250 : CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAG
gi|21251 : ACAGCCA------GC---CCTGAACCATGTGGCTTTAAAAGCTAGCTTACCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21252 : TGCATTTTAACCATAGTGCTATAAAAGCTAGCTCAGCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTCCCT------T----ATGA-ACAT-----TCACTACAtcg
gi|21253 : caaATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21254 : cattttatCCACATCGCTGTAAAAACTAGGTTAACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCATTA-ACT
gi|21255 : CCACATCGCTGTAAAAACTACCTTAACAA-TGAGGCTGTTG-T---TGATT------T----ATGT-AGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21256 : CCATGTCACTGTTAAACCTAGCTTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACatt
gi|21257 : TTGCTGGAAAAACTAGCTTAAAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTACAtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21258 : aTCGCTG-AAAAACTAGCTTTACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTA
gi|21259 : aTTGCTTTAAAATCTAGCTGAACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACAAC
gi|21260 : GCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21261 : CTATGAAAGCTAGTTCAACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTGACA------T----ATGT-ATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262 : GTAAAAG---G-TTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT
Alignments
lowQualScore : 0 0 444444444444444444 0 00 7777 8888888 0 222 22222 11 111111 2 0 555555 2222 0 11111
lowQualScore : . . .................. . .. .... ....... . ... ..... .. ...... . . ...... .... . .....
lowQualScore : 7 7 999999999999999999 7 99 9999 5555555 7 333 77777 66 777777 3 6 999999 1111 6 55555
consensus : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
Reference ( family-326 ) : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21184 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21185 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCATTTCATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21187 : AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTTTAACTACATTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21188 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCACTGTAAAAGCTAGCTTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21189 : AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG--AAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21190 : AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTTGCTGTAAAAGCTAGCCTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACC------TAA--ATGT-ACAC-----TCACTtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21191 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTTCAACCATGACGCTATAACAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTAAAC
gi|21192 : AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTACAAAAACTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACTT-----TCACTACACTatt
gi|21193 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTAACCTA----T----ATGT-ACAC-----TTACTACACT
gi|21194 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGT
gi|21195 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21196 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21197 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGC-----------------TG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21198 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTTCAACCGTGTTGCTGTAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21199 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTTCAACCATGTTGTTAAAAAAGCTAGCTTATCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----TTGT-ACAC-----TCACTACA
gi|21200 : AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21201 : AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTTTAAAAGCTAGCTTAAAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTGACG------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21202 : AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTATGTTGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTACC------T----ATGA-AAAT-----TGACTACA
gi|21203 : AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTAAAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21204 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAACTAGCTTAACAT-CGAGG--------------CC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
gi|21205 : AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGTAAAAGCTATCCTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21206 : AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTTCAACCATGCCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21207 : AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATGT-ATAT-----TCACTACACT
gi|21208 : AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTTCAACCATGTCGCTAT-AAAGCTATCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACT------C----ATGT-GCAT-----TCACTGCA
gi|21209 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACCACACTATAATAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACACTgtg
gi|21210 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTTCAACCAT------------GCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21211 : AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTTCAGTCATGTCGCTATAAAAGTTAGCTTAACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAC-----AAACTACACT
gi|21212 : AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21213 : AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTTCAACAATGTCGCTAATAAAGCTAGCTTAACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21214 : AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-t
gi|21215 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCTCAATCATGTCGCTGTAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACTACA
gi|21216 : AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGGAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATA
gi|21217 : AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAATGGTGTTGCTGTTAAAGCTAGCTTTACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTGACA------T----TTGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21218 : AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGGTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT----------------TGT-ACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21219 : AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT-A---ATGTCGCTGCAAAAGCTAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGGACC------T----ATGC-ACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21220 : AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATAAAACCTAGCTTAACAG-TGAGACTGTTG-TAATTGATC------T----A-ATAACTT-----TCACTGCA
gi|21221 : AGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACt
gi|21222 : AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTTCAACCATGTCGCTATAACAGATAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACT------G----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21223 : AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTTCAACCATGTTGCTATAAAAGC-------------AAGGCTGTTG-TAAGTGATC------T----GTGT-ACAC-----TCAGTACACTt
gi|21224 : AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCATCCATATCGCTATAAAAG
gi|21225 : AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21226 : AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTA
gi|21227 : AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCTCAACCA
gi|21228 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--AC----CC--------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTcagggctg
gi|21229 : AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTA
gi|21230 : GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAGGCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCGCTACA
gi|21231 : AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTTCAACCATGTTGCTAT-TAATCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTGGCT------T----GTGT-ACAT-----CCACTACAtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21232 : gtaacttctgacaccatcaaGTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATACAGTCATATCGCTATTGAATCTGGCTCAACAG-CATGGCTGTTG-AATGTGATCTACTGGT----ATGC-ACAT-----TCACTACATT
gi|21233 : CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATG--GCTGcgacat
gi|21234 : tacCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACATCAACAATGTACCTGTAAAAGCTACTTCATCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTGACC------TATACATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21235 : aatatACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TTACTACACT
gi|21236 : ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTTCAGCCATGTTACTATAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATAT-ACATTTAAATTACTACA
gi|21237 : CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTATTGAAGCTAGCACAACAG-TGTGACTGTT--TCAGTGACC------T----ATGC-ATAT-----TCACTGCAt
gi|21238 : tCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21239 : CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACGT-----TCACTACA
gi|21240 : GGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTTCAACCATATCACTCTAAAAGATACCTCAACAT-GGAG---GTTG-TAAGTGACCTACCAGT----ATGT-TCAT-----TCACTACACT
gi|21241 : -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATTCAACCATATCGCTGTTAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-----------------TGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21242 : A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTTCAACCATGCCACTATAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTAGC------T----ATGT-ACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243 : A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGTTTAACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTA
gi|21244 : aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTATAAAAGCTAACTTAACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCTACC------T----ATGT-ACAT-----TCATTACA
gi|21245 : TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTTTAACCATCTCACTATAAAAGCT
gi|21246 : taacctgtacaatgtcgCGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATCAAAGCTAGCTTAACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACA
gi|21247 : ac-----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACAACGACGCTATAATAGTTAGCTTAACA--------TGTTG-AAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATACT
gi|21248 : TTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTTTAACCATGTCGCTATAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249 : TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTTCAACCATGTCCCTCTGGAAACTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------C----ATGT-GCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250 : CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAG
gi|21251 : ACAGCCA------GC---CCTGAACCATGTGGCTTTAAAAGCTAGCTTACCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21252 : CA------ATGCATTTTAACCATAGTGCTATAAAAGCTAGCTCAGCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTCCCT------T----ATGA-ACAT-----TCACTACAtcg
gi|21253 : ATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21254 : cattttatCCACATCGCTGTAAAAACTAGGTTAACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCATTA-ACT
gi|21255 : CCACATCGCTGTAAAAACTACCTTAACAA-TGAGGCTGTTG-T---TGATT------T----ATGT-AGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21256 : CCATGTCACTGTTAAACCTAGCTTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACatt
gi|21257 : TTGCTGGAAAAACTAGCTTAAAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTACAtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21258 : aTCGCTG-AAAAACTAGCTTTACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTA
gi|21259 : aTTGCTTTAAAATCTAGCTGAACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACAAC
gi|21260 : GCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21261 : CTATGAAAGCTAGTTCAACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTGACA------T----ATGT-ATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262 : GTAAAAG---G-TTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
blockSeqs : TCCAAGTACTAACCCCCA ACTC TAACACT ACA GTAGA CT CCTGAT A TACTGG ATAC TTAAA
blockSeqs : . ACTC TAACACT ACA ACA CT . A TACCAG AA .
blockSeqs : . ACTC TAACACT . . . . A TA . .
blockSeqs : . ACT . . . . . A TA . .
blockSeqs : . ACT . . . . . . TA . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : **** *******
originalCons : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
finalCons : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT
Alignments
lowQualScore : 0 0 444444444444444444 0 00 7777 8888888 0 222 22222 11 111111 2 0 555555 2222 0 11111
lowQualScore : . . .................. . .. .... ....... . ... ..... .. ...... . . ...... .... . .....
lowQualScore : 7 7 999999999999999999 7 99 9999 5555555 7 333 77777 66 777777 3 6 999999 1111 6 55555
consensus : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
Reference ( family-326 ) : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21184 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21185 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGCCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21186 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCATTTCATTaggtatggtattcaatttcctgaacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgata
gi|21187 : AGTAACATCGCTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACTCCCCTAACACTG-TA---CA-----TCGCTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTACACTTTAACTACATTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21188 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCACTGTAAAAGCTAGCTTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACTgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacatgtttgattgtttcatcagcaatgttggtgatata
gi|21189 : AGTAACATCGGTCA-C-TTA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTACA--TCGTTGCTCAACTTCGAA--AACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG--AAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21190 : AGTGACATCGGTGA-A-CCA------------------TCC-AAGTGCTT--AT----CTT-------G-TT---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTTGCTGTAAAAGCTAGCCTCACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACC------TAA--ATGT-ACAC-----TCACTtcgggtatggtattcattttcctgcacaattggcaatatttacaaaaagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21191 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AT----TCT-------G-TA---AT-----TTATTGCTCAACTTCCAA--TGCAGTCA------GTGCACTTCAACCATGACGCTATAACAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTAAAC
gi|21192 : AGTGACAACAGTCA-C-CCA------------------TCCTAA-----A--AC----TCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAACTTACAGTAA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTACAAAAACTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACTT-----TCACTACACTatt
gi|21193 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-CA---CA-----ACGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTAACCTA----T----ATGT-ACAC-----TTACTACACT
gi|21194 : AGTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--ACACT-CCC-------C-TAACACTGTAGATCGTTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTTAACTACATCGCTGT
gi|21195 : AGTGACATCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACAT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAAC----------------------------------CATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAGAAAAGACTGTTG-TTAGTGACCTA----T----ATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21196 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21197 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ACATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGC-----------------TG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21198 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCATCCAAGTACTAACCCCCATCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCC------GTACACTTCAACCGTGTTGCTGTAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21199 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-AA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGCACTTCAACCATGTTGTTAAAAAAGCTAGCTTATCAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----TTGT-ACAC-----TCACTACA
gi|21200 : AGTGACTGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---AT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTGTTAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21201 : AGTGACCACGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAATGTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTTTAAAAGCTAGCTTAAAAG-GGAGGCTGTTG-TAAGTGACG------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21202 : AGTGACTGCGTTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CTT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTATGTTGCTGTAAAAGCTAGTTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTACC------T----ATGA-AAAT-----TGACTACA
gi|21203 : AGTGACAGCGGTTA-C-CTA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------T-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTAAAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACTtatatgata
gi|21204 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTACTAAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAACTAGCTTAACAT-CGAGG--------------CC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
gi|21205 : AGTGACAGCGGTCA-T-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-AT---CT-----TCCTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGTAAAAGCTATCCTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21206 : AGTGACAGCGGTCATC-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TT---CT-----TCGTT----------------ACAGTCT------GTACACTTCAACCATGCCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21207 : AGTGACCACGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CC--------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTTAA--TACGGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAA-AGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATGT-ATAT-----TCACTACACT
gi|21208 : AGTGACCACGGTCA-C-CGA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--AACAGTCA------ACGCTCTTCAACCATGTCGCTAT-AAAGCTATCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACT------C----ATGT-GCAT-----TCACTGCA
gi|21209 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCATTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACTACCACACTATAATAGCTAGCTTAACA--------TGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACACTgtg
gi|21210 : AGTGACAGCAGTCA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTTCAACTTACAGTCA------GTGCACTTCAACCAT------------GCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATAT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21211 : AGTGACAGCCGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GAGTACTTCAGTCATGTCGCTATAAAAGTTAGCTTAACAG-CGAGATTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAC-----AAACTACACT
gi|21212 : AGTGACAGCGATCA-C-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGAGACTTAACTTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-AGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21213 : AGTTACAGCGGTCA-T-CAA------------------TCC-AAGTAC-A--AA----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAG--TAAAGTCA------GTGCACTTCAACAATGTCGCTAATAAAGCTAGCTTAACGG-CGAGGTTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21214 : AGTGACCGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-t
gi|21215 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AA---------------------------A---CT-----TCGTTGTTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACCTCAATCATGTCGCTGTAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACTACA
gi|21216 : AGTGACAGCAGCCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----ACA-------G-TA---CT-----T-------------CCAA--TACAGTTA------GTGCACTTCAACCATGCCGCTGGAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TGAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATA
gi|21217 : AGTGACAGCCGTCA-C-TCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TAGTTGCTTAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAATGGTGTTGCTGTTAAAGCTAGCTTTACAG-CGAGGCTGTTG-TAATTGACA------T----TTGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21218 : AGTGACAGTGGTGA-A-CCA------------------TCT-GAGTACTA--AC----CCT-------T-TA---CT-----TTATTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGGTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TATGT----------------TGT-ACAT-----TCACTACAatgctattgaat
gi|21219 : AGTGACAGCATTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----ATGTTGCTTAACTTTCAG--TACAGTTA------TTGCACTT-A---ATGTCGCTGCAAAAGCTAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGGGACC------T----ATGC-ACAT-----TCTCTATAatagg
gi|21220 : AGTGACAGCGGTCA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----TCC-------G-TA---CT-----ATGTTGATTAATTTCCAA--CACTATTG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATAAAACCTAGCTTAACAG-TGAGACTGTTG-TAATTGATC------T----A-ATAACTT-----TCACTGCA
gi|21221 : AGTGACCGCAGTCG-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTGTAAAAGCTAGCTTAACt
gi|21222 : AGTGACAGTGGTCA-C-CCA------------------TCA-AAGTACTA--AC----CC--------A-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCTA--TACTATCGCCTGATATACTCTTCAACCATGTCGCTATAACAGATAGCTCAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACT------G----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21223 : AGTGACAGTGGTCA-CACTA-------------------CC-AAATACTA--AC----CT--------G-TA---CT-----TTGTT-CTTAACTTCCAA--TACTATCG------GTACGCTTCAACCATGTTGCTATAAAAGC-------------AAGGCTGTTG-TAAGTGATC------T----GTGT-ACAC-----TCAGTACACTt
gi|21224 : AGTGACCGCGATCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACGA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCTTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCATCCATATCGCTATAAAAG
gi|21225 : AGTGACAACGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGAACTA--A------CT-------GATA---CT-----TTGATGCTTAGCTTTCGA--TAAAGTCG------GTGC
gi|21226 : AGTGACAGCGGTTA-C-CCA------------------TCC-GAGTACTGTCAC----CCT-------A-TA---CT-----TTGATGCTTTACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTA
gi|21227 : AGTGACAGCAGTAA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTAATGAACTTCCAA--AACAGTCA------GTGCACCTCAACCA
gi|21228 : AGTGACAGCGGTCA-C-CCA------------------TTC-AAGTACTA--AC----CC--------G-TA---TT-----GCGTTGCTTAAATTCCAA--TACAGTTA------GTGCACTcagggctg
gi|21229 : AGTGATAACGGTCA-C-AAA------------------TCC-AC-TACTT--AC----CCC-------A-TA---CT-----TCATTGCTTAACTAATGA--CACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTA
gi|21230 : GTAACATCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----ACT-------G-TA---CA-----TCGCTGCTCAACTTCCAA--TACAGTCA------TTGCACTTTAACTACATCGCTGTAAAGGCTAGCTTAACAG-CAAGGCTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCGCTACA
gi|21231 : AGTGA--ACAGTCA-G-CCA------------------TTT-TAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCAAA--TACAGTAG------GTGTACTTCAACCATGTTGCTAT-TAATCTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAATTGGCT------T----GTGT-ACAT-----CCACTACAtcgggaatggtattcaatttcctgcataattgtcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattgtttcatcggcaatgttgatgatata
gi|21232 : gtaacttctgacaccatcaaGTGACAACGGTTA-C-CCA------------------TGC-AAGTACTA--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTTGACTTCCGA--TACATTCG------GTGCTATACAGTCATATCGCTATTGAATCTGGCTCAACAG-CATGGCTGTTG-AATGTGATCTACTGGT----ATGC-ACAT-----TCACTACATT
gi|21233 : CAGCGGTCG-C-CCA------------------TTA-AAGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCCTTACTAAATTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATG--GCTGcgacat
gi|21234 : tacCGGTTA-A-CCA------------------TCC-AAGTACTT--AC----CTT-------G-TA---CA-----TCGTTGCTTAACTTTCAA--TATAGTCA------GTGCACATCAACAATGTACCTGTAAAAGCTACTTCATCAG-AAAGAC--TTG-TGCGTGACC------TATACATGT-ACAC-----TCACTACACT
gi|21235 : aatatACAGCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--GC----CCT-------G-TA---CT-----TTGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTGCACTTCAACCATGTCGCTGTAAATGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TTACTACACT
gi|21236 : ACAGTAGTCA-C-CCA------------------TCC-AAACTCTT--AA----CCC-------A-TA---CT-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACTATCA------GTACACTTCAGCCATGTTACTATAAAAGCTACCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-CAAGTGACC------T----ATAT-ACATTTAAATTACTACA
gi|21237 : CGGTCA-----A------------------TCC-ATGTACTA---C----CAC-------A-TA---TA-----ACATTGCTTAACTTCCAG--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCACTATTGAAGCTAGCACAACAG-TGTGACTGTT--TCAGTGACC------T----ATGC-ATAT-----TCACTGCAt
gi|21238 : tCGGTCA-C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCGTGCCACTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAAGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21239 : CGGTCA-C-CCA------------------TCC-ATGTTCTA--AC----CCC-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAGCTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACGT-----TCACTACA
gi|21240 : GGTCA-C-TCA------------------TTT-AAGTATTA--AC----------------------T-----TTGTTGCTAAACTTCCAA--TACCACTG------TTGGACTTCAACCATATCACTCTAAAAGATACCTCAACAT-GGAG---GTTG-TAAGTGACCTACCAGT----ATGT-TCAT-----TCACTACACT
gi|21241 : -C-CCA------------------TCC-AAGTACTA--AC----CCT-------G-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCA------GTTTAATTCAACCATATCGCTGTTAAAGCTAGCTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAG-----------------TGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21242 : A------------------TCC-AAGTACCA--AC----ACC-------T-TA---CT-----TCGTTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCT------GTGTGCTTCAACCATGCCACTATAAAAGCTAACTTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTTAGC------T----ATGT-ACAT-----TCACTTCACTgcagtaattgtatttcagatttcct
gi|21243 : A------------------CCC-TAGTACTA--AC----TTC-------G-TA---CT-----TCATTGCTTAACTTCCAA--CACTATCG------GTACACTTCAACCATGTCGCTATAAAAGCTAGTTTAACAG-CCAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTA
gi|21244 : aagtagctaCTA--AC----CCT-------G-TT---TT-----TCGTTGCTTAACTTGCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACCATGTCTCTATAAAAGCTAACTTAACAG-TGAGGCTGTTG-AAAGCTACC------T----ATGT-ACAT-----TCATTACA
gi|21245 : TTCCAG--TA--GTCA------GTGCACTTTAACCATCTCACTATAAAAGCT
gi|21246 : taacctgtacaatgtcgCGCTGCTTAACTTCCAA--TACAGTCG------GTACACTTCAACAATGTCGCTATCAAAGCTAGCTTAACAT-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACAACA
gi|21247 : ac-----TCATTGCTGAACTTCCAA--TACAGTCA------GTGCACTTCAACAACGACGCTATAATAGTTAGCTTAACA--------TGTTG-AAAGTGACC------T----ATGT-ACAT-----TCACTATACT
gi|21248 : TTGCTTTACTTCCAA--TACTATCG------GTACACTTTAACCATGTCGCTATAAAAACTAGCTTAACAG-CAAGTCTGTTG-T
gi|21249 : TGCTCAACTTCCAG--TACAGTTG------GTGCTCTTCAACCATGTCCCTCTGGAAACTAGCTCAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------C----ATGT-GCAT-----TCACTACACTtcgctacaatttcatcaccaca
gi|21250 : CTAAACTTCCAA--TACAGTTG------GTGCACTTCAACCATGTTGCTATAAAAGCTAGCTCAACAG-TGAG
gi|21251 : ACAGCCA------GC---CCTGAACCATGTGGCTTTAAAAGCTAGCTTACCAG-CGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACA
gi|21252 : CA------ATGCATTTTAACCATAGTGCTATAAAAGCTAGCTCAGCAC-CGGAACTGTTG-TAAGTCCCT------T----ATGA-ACAT-----TCACTACAtcg
gi|21253 : ATGTCGCTGTAAAAGCTAGCTTAACAA-CGAGACTGTTG-TAAGTGATC------T----ATGT-ACAT-----TCACTACACT
gi|21254 : cattttatCCACATCGCTGTAAAAACTAGGTTAACAA-TGAGACTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCATTA-ACT
gi|21255 : CCACATCGCTGTAAAAACTACCTTAACAA-TGAGGCTGTTG-T---TGATT------T----ATGT-AGTT-----TCACTAgtggacctatgtccaaatcgctgaaaaactagctttacaa
gi|21256 : CCATGTCACTGTTAAACCTAGCTTAACAG-TGAGGCTGTTG-TAAATGACC------T----ATGT-ACatt
gi|21257 : TTGCTGGAAAAACTAGCTTAAAAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTACAtacacatgctatattgtaaacgtatgcgcattcga
gi|21258 : aTCGCTG-AAAAACTAGCTTTACAA-TGAGGCTGTTG-TTAGTGATC------T----ATGT-AGTT-----TCACTA
gi|21259 : aTTGCTTTAAAATCTAGCTGAACAA-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGC-ACAT-----TCACAAC
gi|21260 : GCTGTAAAAGCTAGCTTAACAG-CAAGACTGTTG-TAAGTGACC------A----ATGT-ACAT-----TCACTACATT
gi|21261 : CTATGAAAGCTAGTTCAACAG-CAAGGATGTTG-TAAGTGACA------T----ATGT-ATAG-----TCACTACAgggtatggtattcaatttcctgcacaattggcaatatttacaaatagtatccacgtggttgattttcatcggcaatgttggtgatata
gi|21262 : GTAAAAG---G-TTAACAG-CGAGGCTGTTG-TAAGTGACC------T----ATGT-TCAT-----TCACTACA
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21276 ): TCAACTTCCTGCACAATTGGAAATATTTACAAATAGTATCCATGTGGT
Unaligned ( gi|21268 ): GTATTTCAACTTACTGCACAATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21269 ): GTATTTCGACTTCCAGCACAATTGGCAATATTACAAATAGTATCCACGTGATCATTG
Unaligned ( gi|21270 ): GCATTACAACTTCCTGCACAATTGGCAATATTTACAAATAGTTATCGCGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21265 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21266 ): GTATTTCAACTTCCTACACAATTGGTAATATTTACAAAAAGTATCCACGT
Unaligned ( gi|21271 ): GTATTTCAACTTCATACACTATTGGCAATATTTACAAACAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21272 ): GTATTTTAACTTCCTGTATAAATGTCAATATTTACAAATAGTACCCACGTGGTCATTGAATGCATTGAATGTT
Unaligned ( gi|21267 ): GTATTTCAACTTCCTGCATAATATAAATTGGCAATATTTACAAAAAGTATCCACATGGTCATTG
Unaligned ( gi|21263 ): GATATGCGTATTTCAACTTTCTGCACAATTAGTAATATTTACAAATAGTTTTTACGTGTCATTGAATG
Unaligned ( gi|21264 ): TAGTATTCATCTTCTTGCACAGTAGGCATTATTTACAACTAGTATGCATATGGTTATTG
Unaligned ( gi|21274 ): TTCAAATTCCTTTACAAATGTCAATATATACAAACAGTATCCACGTGGTCATTG
Unaligned ( gi|21273 ): GTATTTCAACTTTGTGCACAGTTGGTGATATTTACAAACATATCCACTTGGTCAAT
Unaligned ( gi|21277 ): CGCAATTGGCAATATTCACAAACAGTATCCACGGGGT
Unaligned ( gi|21275 ): TTCATCTTCCTGCACAAATATCAATATTTAAAAAAAGTATCCACATGTTT