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gi|40055                      :     GCA--C----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--C--AG-CATTTAAC----TGATCC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40056                      :      CA--G-----T----C-----G---AATAT--CA-AA----A----T----A---AA--A-A-----------TA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTGCTAAAGCTA
gi|40057                      :           ----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----C---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---GGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TTTAATCGGGCCA
gi|40058                      :                            ---GACAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAAAA--AG-C---TGTT----T-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40059                      :                                ATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AC--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TTTAATCTGGCTA
gi|40060                      :                                 TGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---GTGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40061                      :                                        -AG----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40062                      :                                                                  -A-----------AA--A--AG-C---TGTC----A-ATTC---ATGCT-TTA-TTTTATCAGGCTA





Alignments
lowQualScore                  :        00 1111  1111 11111 000     11  0  0000 0000 1111 000  11 0 22222222222  22 00  0 000    1111 0    000     0   0             
lowQualScore                  :        .. ....  .... ..... ...     ..  .  .... .... .... ...  .. . ...........  .. ..  . ...    .... .    ...     .   .             
lowQualScore                  :        66 0000  0000 11111 888     22  4  9999 9999 3333 888  99 9 66666666666  77 66  9 777    3333 4    777     4   4             
consensus                     : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
Reference ( family-324 )      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39969                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39970                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39971                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39972                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAG--CCGAA----A----A----A---AT--A-T-----------AA--A--AT-G---TGTC----C-ATTC---ACGTA-TTA-TTTAATCAGGCTA
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gi|39974                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-AATC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39975                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39976                      : GACAGCA--A----GC----T-----G---AATAT--GC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------CA--A--AA-C---TGTT----C-ATCT---ACGAC-TTA-TTTAATCAGGCT
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gi|39979                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACG
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gi|39981                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--ACA-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCT
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gi|39983                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---TCGCC-TTA--TTAATCAGGCTA
gi|39984                      : GACAGCA--G----GT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39985                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GAAAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAACCAGGCTA
gi|39986                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39987                      : GACAACA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AGAC---TGTC----C-ATTC---ATCCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39988                      : GACGGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-GTTC---ACGCC-TAA-TTTAATCAGGCTA
gi|39989                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----T-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCGGGCTA
gi|39990                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----AATAAT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACTCT-TCA-TTTAATTAGGCTA
gi|39991                      : GACGGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-ATTC---AAGCC-TTA-TTTAATCAGGCT
gi|39992                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---AATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTT---ATGCC-TTA-CTTAATCAGGCTA
gi|39993                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|39994                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|39995                      : GACAACA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AT----A----T----A---ATTAA-A-----------AA--A--AT-C---TGTCT---C-ATTC---CCACC-TTA-TTTAATGAGATTA
gi|39996                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----A----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-T---TGCC----C-ACTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39997                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AT-C---TGTC----C-GTTC---ATGCT-TTA-TTTAATCAGGC
gi|39998                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-CC----A----T----A---AC--A-A-----------AC--A--AT-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTCAATCAGGCTA
gi|39999                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---TATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AG--A--AG-C---TATC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40000                      : GAAAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-A---TGTT----C-ATTC---ACGCC-CTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40001                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----T---AC--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTA---ACGCC-TTA-CTTAATCAGGCTA
gi|40002                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TCATATGAGGCTA
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gi|40004                      : GACAGCA--G----AT----CTAATTG---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-CAA-TTTAATCAGGCT
gi|40005                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGCC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40006                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|40007                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--A--C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
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gi|40014                      : GGCAGCA--T----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-A---TGTCAGTCC-ATTC---ACGCC-TTA-TTCAATCAGGCTA
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gi|40016                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--GC-C---TTAT----A-ATTC---ACGCC-TTG-TTTAATCAGACTA
gi|40017                      : GACAGCA--C----AT----T-----G---GATAG--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCG---ATGTC-TTA-TTTAATCAGGCCA
gi|40018                      : GACAGCA--GGTACAT----T-----G---GAT----CC-AA----A----T----A---ATC-A-A-----------GA--AGCAG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40019                      : GACAGCA--C----AT----C-----A---GATAT--TC-AA----A----T----A---AT--G-G-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---CTGCC-TTA-TTTAATCAG
gi|40020                      : GACAGTA--G----AT----C-----A---GATATATCC-AA----A----T----T---AA--A-G-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACATT-GTA-TTTCATTAGGCCA
gi|40021                      : GACAACA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----TATTAA---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---CATC----C-ATTCTGAATGCC-TTA-TTTAACCAGGCTA
gi|40022                      : GACAGCA--A----AC----C-----G---GGTAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-AACC---ACACC-AAA-TTTAATCAGGCTA
gi|40023                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----A----A---AT--T-T-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTAAATTA
gi|40024                      : GACAGCA--G----AT-----------------AT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--AA-T---TGTC----C-ATTC---ATGTC-TTA-TTTAATCAGG
gi|40025                      : GACAACA--G----AT----C-----G---AATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTGCTTTCATCA
gi|40026                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---TTTT----C-ATCC---ATGCC-TT------ATCAGGTTA
gi|40027                      : GACAACA--A----AT----C-----G---GATGT--CA-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-C---TGTG----C-ATTA---ACACC-TTA-TTTA
gi|40028                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----A---GT--A-A-----------AA--A--AG-T---TGTC----A-GTCC---ACGAC-TTA-TTAGAGCAGACTA
gi|40029                      : GAGAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG--------C----C-GTTT---ACGCC-TTC-TTGAATCAGGCCA
gi|40030                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--TC-AA----C----C----G---AT--A-A-----------AA--A--AACC---TGTC----T-GTTC---ACGCCTTTT-TTTAATCAGGTTA
gi|40031                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---TATAT--CC-AA----A----A----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ATGGC-TTA-TT
gi|40032                      : GAGAGCA--T----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--A--------TC----C-GTTT---ACGCC-TTC-TTGAATCAGGCTA
gi|40033                      : GACATCA--G----AT----C-----G---GACTT--CC-AA----A----T----A---GT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-TTCC---ACGCC-GGA-TTCAACCAGGCTA
gi|40034                      : GACAGCA--C----AA----C-----A---GACAT--CC-AA----A----T----G---AT--A-A-----------AG--A--AG-T---TGTC----C-TTCC---GTGTC-TTA-CTTAATTAGGC
gi|40035                      : GACAGCA--T----GC----C-----A---GAAGT--CC-AA----A----C----A---AT--A-A-----------AA--A--A--C---TGTC----C-ACAC---ACGCC-TTA-TTTAATC
gi|40036                      : GACAGCA--G----AT----A-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT----A-----------AA--A--AG-C---TGTT----C-ATTC---
gi|40037                      : GACAACA--A----AT----C-----G---AATGT--CA-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-C---TGTG----C-ATAA---ACACC-TTA-TTTA
gi|40038                      : GACATCA--A----AT----T-----A---AATAA--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TA--T--AT-C---AGTC----C-ATCC---ATGCC-TTA-TTTAATTGGG
gi|40039                      : GACAGCA--C----AT----A-----G---CATAT--CC-AA----A----TT---A---AT--ACA-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---AAGCC-TTA--TTAATC
gi|40040                      : GACAGCG--C----AT----C-----G---CATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-ACA---------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---AAACC-TTA-TTT
gi|40041                      : GAGAGCA--A----AT----T-----G---AATAT--CT-AATTATA----T----A---ATG-A-A-----------AA--A--AA-C---TTCC----C-ATCC---ACGCC-TTA-ATTAATCAGTCT
gi|40042                      :  ACAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTT----C-ATCC---ACAAC-TTA-TTTAATCAGGATA
gi|40043                      :  ACAGTA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-C-----------AA--A--AA-C----GTC----C-ATTC---ACCCC-TTT-TTTAATCAGGCTA
gi|40044                      :  ACAGCA--G----AT----C-----A---AATAT--CA-AA----AAAAAG----A---AG--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---AAGTC-TTA--TTAATAACGCTA
gi|40045                      :   CAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CA-AC----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACCCC-TTA-TTTAATCAGGC
gi|40046                      :   CAGCA--T----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----C----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCT-TTA-TTCAACCAGGCTA
gi|40047                      :   CAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CT-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TCATATCAGGCCA
gi|40048                      :   CAGCA--G----AG----C-----C---GATATATCC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCT---ACATC-TTA-TTTATTCAGGCTA
gi|40049                      :   CAACATGG----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----G---AT--A-A-----------AA--A---T-C---TGTC----C-ATCC---ATACC-TTA-TTTATTCAAGTTA
gi|40050                      :   CAATA--A----AT----C-----G---GATAT--CA-AA----T----T----A---AT--A-A-----------AA--G--AG-C---TAT-----C-ATCC---ATGCC-TTA-TATAATCGTGCT
gi|40051                      :    AGCA--C----GT----C-----A---GATGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-ATTATAAATTAAAA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ATGCA-TTG-TTTTATTAGGCTA
gi|40052                      :    AGCA--T----GT----C-----A---TATAT--AG-AA----A----T----A---AT--G-G-----------AA--A--GT-T---TGCC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTAAATTATGCTA
gi|40053                      :    AGCA--G----AA----C-----A---GGCAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--GT-C---TATT----C-ATTC---ACCTC-TTA-CTTAATGAG
gi|40054                      :     GCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-GA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40055                      :     GCA--C----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--C--AG-CATTTAAC----TGATCC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40056                      :      CA--G-----T----C-----G---AATAT--CA-AA----A----T----A---AA--A-A-----------TA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTGCTAAAGCTA
gi|40057                      :           ----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----C---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---GGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TTTAATCGGGCCA
gi|40058                      :                            ---GACAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAAAA--AG-C---TGTT----T-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40059                      :                                ATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AC--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TTTAATCTGGCTA
gi|40060                      :                                 TGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---GTGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40061                      :                                        -AG----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40062                      :                                                                  -A-----------AA--A--AG-C---TGTC----A-ATTC---ATGCT-TTA-TTTTATCAGGCTA





Alignments
lowQualScore                  :        00 1111  1111 11111 000     11  0  0000 0000 1111 000  11 0 22222222222  22 00  0 000    1111 0    000     0   0             
lowQualScore                  :        .. ....  .... ..... ...     ..  .  .... .... .... ...  .. . ...........  .. ..  . ...    .... .    ...     .   .             
lowQualScore                  :        66 0000  0000 11111 888     22  4  9999 9999 3333 888  99 9 66666666666  77 66  9 777    3333 4    777     4   4             
consensus                     : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
Reference ( family-324 )      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39969                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39970                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39971                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39972                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAG--CCGAA----A----A----A---AT--A-T-----------AA--A--AT-G---TGTC----C-ATTC---ACGTA-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39973                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---TCGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39974                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-AATC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39975                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39976                      : GACAGCA--A----GC----T-----G---AATAT--GC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------CA--A--AA-C---TGTT----C-ATCT---ACGAC-TTA-TTTAATCAGGCT
gi|39977                      : GACAGCA--G----AT----T-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TGTAATCAGGCTA
gi|39978                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACG
gi|39979                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACG
gi|39980                      : GACAGCA--A----GT----T-----G---AATAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA--A---G-C---TATT----C-ATTT---TTGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39981                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--ACA-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCT
gi|39982                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39983                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---TCGCC-TTA--TTAATCAGGCTA
gi|39984                      : GACAGCA--G----GT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39985                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GAAAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAACCAGGCTA
gi|39986                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39987                      : GACAACA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AGAC---TGTC----C-ATTC---ATCCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39988                      : GACGGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-GTTC---ACGCC-TAA-TTTAATCAGGCTA
gi|39989                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----T-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCGGGCTA
gi|39990                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----AATAAT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACTCT-TCA-TTTAATTAGGCTA
gi|39991                      : GACGGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-ATTC---AAGCC-TTA-TTTAATCAGGCT
gi|39992                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---AATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTT---ATGCC-TTA-CTTAATCAGGCTA
gi|39993                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|39994                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|39995                      : GACAACA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AT----A----T----A---ATTAA-A-----------AA--A--AT-C---TGTCT---C-ATTC---CCACC-TTA-TTTAATGAGATTA
gi|39996                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----A----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-T---TGCC----C-ACTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39997                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AT-C---TGTC----C-GTTC---ATGCT-TTA-TTTAATCAGGC
gi|39998                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-CC----A----T----A---AC--A-A-----------AC--A--AT-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTCAATCAGGCTA
gi|39999                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---TATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AG--A--AG-C---TATC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40000                      : GAAAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-A---TGTT----C-ATTC---ACGCC-CTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40001                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----T---AC--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTA---ACGCC-TTA-CTTAATCAGGCTA
gi|40002                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TCATATGAGGCTA
gi|40003                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-ATA-TTTAATCAAGCTA
gi|40004                      : GACAGCA--G----AT----CTAATTG---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-CAA-TTTAATCAGGCT
gi|40005                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGCC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40006                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|40007                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--A--C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|40008                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA---------T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
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gi|40011                      : GACAGCA--G----ATGATCC-----GTGGGATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TG--A--AG-T---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40012                      : GACAACA--G----AT----C-----------------C-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40013                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACCTC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40014                      : GGCAGCA--T----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-A---TGTCAGTCC-ATTC---ACGCC-TTA-TTCAATCAGGCTA
gi|40015                      : GGCAGCA--C----AT----C-----G---GATAT--TC-AA----A----T----A---ATG-A-A-----------AA--G--AG-A---TGTC----C-ATCC---A---C-TTA-TTTATTCAGGCTA
gi|40016                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--GC-C---TTAT----A-ATTC---ACGCC-TTG-TTTAATCAGACTA
gi|40017                      : GACAGCA--C----AT----T-----G---GATAG--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCG---ATGTC-TTA-TTTAATCAGGCCA
gi|40018                      : GACAGCA--GGTACAT----T-----G---GAT----CC-AA----A----T----A---ATC-A-A-----------GA--AGCAG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40019                      : GACAGCA--C----AT----C-----A---GATAT--TC-AA----A----T----A---AT--G-G-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---CTGCC-TTA-TTTAATCAG
gi|40020                      : GACAGTA--G----AT----C-----A---GATATATCC-AA----A----T----T---AA--A-G-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACATT-GTA-TTTCATTAGGCCA
gi|40021                      : GACAACA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----TATTAA---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---CATC----C-ATTCTGAATGCC-TTA-TTTAACCAGGCTA
gi|40022                      : GACAGCA--A----AC----C-----G---GGTAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-AACC---ACACC-AAA-TTTAATCAGGCTA
gi|40023                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----A----A---AT--T-T-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTAAATTA
gi|40024                      : GACAGCA--G----AT-----------------AT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--AA-T---TGTC----C-ATTC---ATGTC-TTA-TTTAATCAGG
gi|40025                      : GACAACA--G----AT----C-----G---AATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTGCTTTCATCA
gi|40026                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---TTTT----C-ATCC---ATGCC-TT------ATCAGGTTA
gi|40027                      : GACAACA--A----AT----C-----G---GATGT--CA-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-C---TGTG----C-ATTA---ACACC-TTA-TTTA
gi|40028                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----A---GT--A-A-----------AA--A--AG-T---TGTC----A-GTCC---ACGAC-TTA-TTAGAGCAGACTA
gi|40029                      : GAGAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG--------C----C-GTTT---ACGCC-TTC-TTGAATCAGGCCA
gi|40030                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--TC-AA----C----C----G---AT--A-A-----------AA--A--AACC---TGTC----T-GTTC---ACGCCTTTT-TTTAATCAGGTTA
gi|40031                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---TATAT--CC-AA----A----A----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ATGGC-TTA-TT
gi|40032                      : GAGAGCA--T----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--A--------TC----C-GTTT---ACGCC-TTC-TTGAATCAGGCTA
gi|40033                      : GACATCA--G----AT----C-----G---GACTT--CC-AA----A----T----A---GT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-TTCC---ACGCC-GGA-TTCAACCAGGCTA
gi|40034                      : GACAGCA--C----AA----C-----A---GACAT--CC-AA----A----T----G---AT--A-A-----------AG--A--AG-T---TGTC----C-TTCC---GTGTC-TTA-CTTAATTAGGC
gi|40035                      : GACAGCA--T----GC----C-----A---GAAGT--CC-AA----A----C----A---AT--A-A-----------AA--A--A--C---TGTC----C-ACAC---ACGCC-TTA-TTTAATC
gi|40036                      : GACAGCA--G----AT----A-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT----A-----------AA--A--AG-C---TGTT----C-ATTC---
gi|40037                      : GACAACA--A----AT----C-----G---AATGT--CA-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-C---TGTG----C-ATAA---ACACC-TTA-TTTA
gi|40038                      : GACATCA--A----AT----T-----A---AATAA--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TA--T--AT-C---AGTC----C-ATCC---ATGCC-TTA-TTTAATTGGG
gi|40039                      : GACAGCA--C----AT----A-----G---CATAT--CC-AA----A----TT---A---AT--ACA-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---AAGCC-TTA--TTAATC
gi|40040                      : GACAGCG--C----AT----C-----G---CATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-ACA---------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---AAACC-TTA-TTT
gi|40041                      : GAGAGCA--A----AT----T-----G---AATAT--CT-AATTATA----T----A---ATG-A-A-----------AA--A--AA-C---TTCC----C-ATCC---ACGCC-TTA-ATTAATCAGTCT
gi|40042                      :  ACAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTT----C-ATCC---ACAAC-TTA-TTTAATCAGGATA
gi|40043                      :  ACAGTA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-C-----------AA--A--AA-C----GTC----C-ATTC---ACCCC-TTT-TTTAATCAGGCTA
gi|40044                      :  ACAGCA--G----AT----C-----A---AATAT--CA-AA----AAAAAG----A---AG--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---AAGTC-TTA--TTAATAACGCTA
gi|40045                      :   CAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CA-AC----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACCCC-TTA-TTTAATCAGGC
gi|40046                      :   CAGCA--T----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----C----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCT-TTA-TTCAACCAGGCTA
gi|40047                      :   CAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CT-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TCATATCAGGCCA
gi|40048                      :   CAGCA--G----AG----C-----C---GATATATCC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCT---ACATC-TTA-TTTATTCAGGCTA
gi|40049                      :   CAACATGG----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----G---AT--A-A-----------AA--A---T-C---TGTC----C-ATCC---ATACC-TTA-TTTATTCAAGTTA
gi|40050                      :   CAATA--A----AT----C-----G---GATAT--CA-AA----T----T----A---AT--A-A-----------AA--G--AG-C---TAT-----C-ATCC---ATGCC-TTA-TATAATCGTGCT
gi|40051                      :    AGCA--C----GT----C-----A---GATGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-ATTATAAATTAAAA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ATGCA-TTG-TTTTATTAGGCTA
gi|40052                      :    AGCA--T----GT----C-----A---TATAT--AG-AA----A----T----A---AT--G-G-----------AA--A--GT-T---TGCC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTAAATTATGCTA
gi|40053                      :    AGCA--G----AA----C-----A---GGCAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--GT-C---TATT----C-ATTC---ACCTC-TTA-CTTAATGAG
gi|40054                      :     GCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-GA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40055                      :     GCA--C----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--C--AG-CATTTAAC----TGATCC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40056                      :      CA--G-----T----C-----G---AATAT--CA-AA----A----T----A---AA--A-A-----------TA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTGCTAAAGCTA
gi|40057                      :           ----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----C---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---GGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TTTAATCGGGCCA
gi|40058                      :                            ---GACAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAAAA--AG-C---TGTT----T-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40059                      :                                ATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AC--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TTTAATCTGGCTA
gi|40060                      :                                 TGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---GTGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40061                      :                                        -AG----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40062                      :                                                                  -A-----------AA--A--AG-C---TGTC----A-ATTC---ATGCT-TTA-TTTTATCAGGCTA


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blockSeqs                     :                      .             .                .         C    .            A               .   
blockSeqs                     :                      .             .                .         G    .            A               .   
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blockSeqs                     :                                                     .         .    .            .               .   
blockSeqs                     :                                                                    .            .               .   


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
finalCons                     : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA





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lowQualScore                  :        66 0000  0000 11111 888     22  4  9999 9999 3333 888  99 9 66666666666  77 66  9 777    3333 4    777     4   4             
consensus                     : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
Reference ( family-324 )      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39969                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39970                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39971                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39972                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAG--CCGAA----A----A----A---AT--A-T-----------AA--A--AT-G---TGTC----C-ATTC---ACGTA-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39973                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---TCGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39974                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-AATC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39975                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39976                      : GACAGCA--A----GC----T-----G---AATAT--GC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------CA--A--AA-C---TGTT----C-ATCT---ACGAC-TTA-TTTAATCAGGCT
gi|39977                      : GACAGCA--G----AT----T-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TGTAATCAGGCTA
gi|39978                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACG
gi|39979                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACG
gi|39980                      : GACAGCA--A----GT----T-----G---AATAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA--A---G-C---TATT----C-ATTT---TTGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
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gi|39982                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39983                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---TCGCC-TTA--TTAATCAGGCTA
gi|39984                      : GACAGCA--G----GT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39985                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GAAAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAACCAGGCTA
gi|39986                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----T---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39987                      : GACAACA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AGAC---TGTC----C-ATTC---ATCCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39988                      : GACGGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-GTTC---ACGCC-TAA-TTTAATCAGGCTA
gi|39989                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----T-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCGGGCTA
gi|39990                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----A----T----AATAAT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACTCT-TCA-TTTAATTAGGCTA
gi|39991                      : GACGGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-ATTC---AAGCC-TTA-TTTAATCAGGCT
gi|39992                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---AATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTT---ATGCC-TTA-CTTAATCAGGCTA
gi|39993                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|39994                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|39995                      : GACAACA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AT----A----T----A---ATTAA-A-----------AA--A--AT-C---TGTCT---C-ATTC---CCACC-TTA-TTTAATGAGATTA
gi|39996                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----A----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-T---TGCC----C-ACTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|39997                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AT-C---TGTC----C-GTTC---ATGCT-TTA-TTTAATCAGGC
gi|39998                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CA-CC----A----T----A---AC--A-A-----------AC--A--AT-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTCAATCAGGCTA
gi|39999                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---TATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AG--A--AG-C---TATC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40000                      : GAAAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-A---TGTT----C-ATTC---ACGCC-CTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40001                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----T---AC--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATTA---ACGCC-TTA-CTTAATCAGGCTA
gi|40002                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TCATATGAGGCTA
gi|40003                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-ATA-TTTAATCAAGCTA
gi|40004                      : GACAGCA--G----AT----CTAATTG---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-CAA-TTTAATCAGGCT
gi|40005                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGCC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40006                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|40007                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--A--C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|40008                      : GACAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-AA---------T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TCATATCAGGCTA
gi|40009                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------A-------G-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40010                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AA-A---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TT
gi|40011                      : GACAGCA--G----ATGATCC-----GTGGGATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TG--A--AG-T---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40012                      : GACAACA--G----AT----C-----------------C-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAA-A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40013                      : GACAGCA--G----AA----A-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACCTC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40014                      : GGCAGCA--T----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-A---TGTCAGTCC-ATTC---ACGCC-TTA-TTCAATCAGGCTA
gi|40015                      : GGCAGCA--C----AT----C-----G---GATAT--TC-AA----A----T----A---ATG-A-A-----------AA--G--AG-A---TGTC----C-ATCC---A---C-TTA-TTTATTCAGGCTA
gi|40016                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--GC-C---TTAT----A-ATTC---ACGCC-TTG-TTTAATCAGACTA
gi|40017                      : GACAGCA--C----AT----T-----G---GATAG--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCG---ATGTC-TTA-TTTAATCAGGCCA
gi|40018                      : GACAGCA--GGTACAT----T-----G---GAT----CC-AA----A----T----A---ATC-A-A-----------GA--AGCAG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40019                      : GACAGCA--C----AT----C-----A---GATAT--TC-AA----A----T----A---AT--G-G-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---CTGCC-TTA-TTTAATCAG
gi|40020                      : GACAGTA--G----AT----C-----A---GATATATCC-AA----A----T----T---AA--A-G-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACATT-GTA-TTTCATTAGGCCA
gi|40021                      : GACAACA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----TATTAA---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---CATC----C-ATTCTGAATGCC-TTA-TTTAACCAGGCTA
gi|40022                      : GACAGCA--A----AC----C-----G---GGTAT--CC-AA----G----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-AACC---ACACC-AAA-TTTAATCAGGCTA
gi|40023                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----A----A---AT--T-T-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTAAATTA
gi|40024                      : GACAGCA--G----AT-----------------AT--CC-AA----A----T----A---AC--A-A-----------AA--A--AA-T---TGTC----C-ATTC---ATGTC-TTA-TTTAATCAGG
gi|40025                      : GACAACA--G----AT----C-----G---AATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AA-C---TGTC----C-ATCC---ACGCC-TTGCTTTCATCA
gi|40026                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-T---TTTT----C-ATCC---ATGCC-TT------ATCAGGTTA
gi|40027                      : GACAACA--A----AT----C-----G---GATGT--CA-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-C---TGTG----C-ATTA---ACACC-TTA-TTTA
gi|40028                      : GACAGCA--G----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----A---GT--A-A-----------AA--A--AG-T---TGTC----A-GTCC---ACGAC-TTA-TTAGAGCAGACTA
gi|40029                      : GAGAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG--------C----C-GTTT---ACGCC-TTC-TTGAATCAGGCCA
gi|40030                      : GACAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--TC-AA----C----C----G---AT--A-A-----------AA--A--AACC---TGTC----T-GTTC---ACGCCTTTT-TTTAATCAGGTTA
gi|40031                      : GACAGCA--G----AT----T-----G---TATAT--CC-AA----A----A----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ATGGC-TTA-TT
gi|40032                      : GAGAGCA--T----AT----C-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--A--------TC----C-GTTT---ACGCC-TTC-TTGAATCAGGCTA
gi|40033                      : GACATCA--G----AT----C-----G---GACTT--CC-AA----A----T----A---GT--A-A-----------AA-----AG-C---TGTC----C-TTCC---ACGCC-GGA-TTCAACCAGGCTA
gi|40034                      : GACAGCA--C----AA----C-----A---GACAT--CC-AA----A----T----G---AT--A-A-----------AG--A--AG-T---TGTC----C-TTCC---GTGTC-TTA-CTTAATTAGGC
gi|40035                      : GACAGCA--T----GC----C-----A---GAAGT--CC-AA----A----C----A---AT--A-A-----------AA--A--A--C---TGTC----C-ACAC---ACGCC-TTA-TTTAATC
gi|40036                      : GACAGCA--G----AT----A-----A---GATAT--CA-AA----A----T----A---AT----A-----------AA--A--AG-C---TGTT----C-ATTC---
gi|40037                      : GACAACA--A----AT----C-----G---AATGT--CA-AA----A----T----A---AT--T-A-----------AA--A--AG-C---TGTG----C-ATAA---ACACC-TTA-TTTA
gi|40038                      : GACATCA--A----AT----T-----A---AATAA--CA-AA----A----T----A---AT--A-A-----------TA--T--AT-C---AGTC----C-ATCC---ATGCC-TTA-TTTAATTGGG
gi|40039                      : GACAGCA--C----AT----A-----G---CATAT--CC-AA----A----TT---A---AT--ACA-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---AAGCC-TTA--TTAATC
gi|40040                      : GACAGCG--C----AT----C-----G---CATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-ACA---------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---AAACC-TTA-TTT
gi|40041                      : GAGAGCA--A----AT----T-----G---AATAT--CT-AATTATA----T----A---ATG-A-A-----------AA--A--AA-C---TTCC----C-ATCC---ACGCC-TTA-ATTAATCAGTCT
gi|40042                      :  ACAGCA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTT----C-ATCC---ACAAC-TTA-TTTAATCAGGATA
gi|40043                      :  ACAGTA--G----AT----T-----G---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-C-----------AA--A--AA-C----GTC----C-ATTC---ACCCC-TTT-TTTAATCAGGCTA
gi|40044                      :  ACAGCA--G----AT----C-----A---AATAT--CA-AA----AAAAAG----A---AG--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---AAGTC-TTA--TTAATAACGCTA
gi|40045                      :   CAGCA--G----AT----C-----G---GATAT--CA-AC----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACCCC-TTA-TTTAATCAGGC
gi|40046                      :   CAGCA--T----AT----C-----A---GATAT--CA-AA----C----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCT-TTA-TTCAACCAGGCTA
gi|40047                      :   CAGCA--G----AT----C-----A---GATAT--CT-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TCATATCAGGCCA
gi|40048                      :   CAGCA--G----AG----C-----C---GATATATCC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATCT---ACATC-TTA-TTTATTCAGGCTA
gi|40049                      :   CAACATGG----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----G---AT--A-A-----------AA--A---T-C---TGTC----C-ATCC---ATACC-TTA-TTTATTCAAGTTA
gi|40050                      :   CAATA--A----AT----C-----G---GATAT--CA-AA----T----T----A---AT--A-A-----------AA--G--AG-C---TAT-----C-ATCC---ATGCC-TTA-TATAATCGTGCT
gi|40051                      :    AGCA--C----GT----C-----A---GATGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-ATTATAAATTAAAA--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ATGCA-TTG-TTTTATTAGGCTA
gi|40052                      :    AGCA--T----GT----C-----A---TATAT--AG-AA----A----T----A---AT--G-G-----------AA--A--GT-T---TGCC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTAAATTATGCTA
gi|40053                      :    AGCA--G----AA----C-----A---GGCAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--GT-C---TATT----C-ATTC---ACCTC-TTA-CTTAATGAG
gi|40054                      :     GCA--G----AT----C-----A---GATAT--CC-GA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40055                      :     GCA--C----AT----C-----A---GATAT--CC-AA----A----T----A---AT--G-A-----------AA--C--AG-CATTTAAC----TGATCC---ACACC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40056                      :      CA--G-----T----C-----G---AATAT--CA-AA----A----T----A---AA--A-A-----------TA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACACC-TTA-TTTGCTAAAGCTA
gi|40057                      :           ----AT----C-----T---GATAT--CC-AA----A----T----C---AT--G-A-----------AA--A--AG-C---GGTC----C-ATCC---GCGCC-TTA-TTTAATCGGGCCA
gi|40058                      :                            ---GACAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AAAAA--AG-C---TGTT----T-ATTC---ACGTC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40059                      :                                ATAT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AC--A--AG-C---TGTC----C-ATCC---ACACC-TTA-TTTAATCTGGCTA
gi|40060                      :                                 TGT--CC-AA----A----T----A---AT--A-A-----------AA--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---GTGCC-TTA-TTTAATCAGGCTA
gi|40061                      :                                        -AG----A----T----A---AT--A-A-----------AG--A--AG-C---TGTC----C-ATTC---ACGCC-TTA-TTTAATCAAGCTA
gi|40062                      :                                                                  -A-----------AA--A--AG-C---TGTC----A-ATTC---ATGCT-TTA-TTTTATCAGGCTA