lowQualScore : 1 0 0 00 00 11 0 222222222 5 0 00 55 0 11111 0 0000 00 0 11 0 3
lowQualScore : . . . .. .. .. . ......... . . .. .. . ..... . .... .. . .. . .
lowQualScore : 5 4 4 66 66 55 4 222222222 7 4 66 11 4 00000 4 9999 66 4 22 9 5
consensus : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
Reference ( gi|26512 ) : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26513 : ATG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26514 : ACG-ACAACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26515 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTA--ACC-TAA-AAA
gi|26516 : ACA-ACGACAGATAA-AA-GGTAA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26517 : ACG-ACGACGGAGAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGTT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26519 : ACA-ATGACAGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26518 : ACG-ACGACGAACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26521 : ACG-ATGACGGACAA-A--GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26520 : ACA-ACAACGGACAA-AA-GGTGA--C--TG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26522 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AACGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----T-ACAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26523 : ACG-ACGACGGACAA-AA-TGCTA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-AAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AA
gi|26524 : ACG-ACGACGGACAG-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----G-TAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26525 : ACG-ACGACAAACAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGC---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26526 : ACG-ATGACGGACAA-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GCGA-----C-AATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26528 : ACA-ACAACAGACAA-AA-GGCGA--TATTG--CA-AAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26527 : ACGCACGACGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGCT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAA-
gi|26529 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GTCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-CATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26530 : ACG-ACGACAGACAA-AA-GGCAA--T--CG--CA-AAACGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----T-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26531 : ACG-GTGATGGACAA-AA-ATCAA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26532 : ATG-ACAACAGACAA-AA-GGTGA--T--CA--CAGAAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26534 : ACA-ACGACGGATAA-AA-TGCTA--T--CT--CG-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26535 : ACG-ACAACGGACAG-AA-GGCAA--T--CG--CA-AATGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26536 : ACGCACTACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GATG--ACC-TCA-AA
gi|26538 : ACG-ATGGCGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAATT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-CAA
gi|26537 : ATG-ACAATGGATAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26539 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CA--CA-GGTG--AC
gi|26540 : ATG-ACAATGGACAA-AA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--A-GAGA-----C---AGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26541 : ACA-ACGACGGACAA-AA-AGCAA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-CAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26542 : ACG-ACAACAGA-AA-AA-GGCAA--T--CG--CA-TAAAGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CC--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26533 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GGCGA--C--TG--CA-AAGGGT---------C-A-C--T--T-GATA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26543 : ACA-ACGATGGACCA-AA-GACGA--T--CG--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGCG--ACCTTAA-AAA
gi|26544 : ACA-ACTACGGACAA-A--GGCAA--T--CG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-TAA
gi|26545 : ACG-ACGACATATAA-A--GACGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26547 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26546 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26548 : ACGCACGATGAACAA-AA-GGTAA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAC-AAA
gi|26549 : ACA-ACAACAGACAA-A--GGTGA--T--CG--CA-AAGGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CAGGGTG--ACC-TA
gi|26550 : ATG-ACGACAGACAA-AA-GGAAA--T--TG--TA-AAAGGT---------T-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGTG--ACCTTAA-AAA
gi|26552 : ACT-ATGGTGGACAA-TA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-TAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26551 : ACG-ACAAC--AAAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAAGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--AC
gi|26553 : ACG-ACGTCAGACAA-AA-TACAA--T--CA--CA-AAAGGT---------CAC-T--T--T-TAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC--AA-AA
gi|26554 : ACG-CTGACAAACAA-AT-GGTGACAT--TG--TA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26555 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GACGA--T--CA--CA-AAGGGT---------C-T-C--A--C-GAGA-----C-TTTCT----CT--CA-GATG--ATC-CAA-AAA
gi|26556 : ACG-ACGACATACAA-AA-AGCGA--T--AG--CA-AA-GGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----C
gi|26557 : ACG-GGGACTGACAA-AT-GGCAA--C--CA--CA-AATTGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAATAAA
gi|26558 : ATG-ACGACGGTCAA-AA-GGCGT--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAG
gi|26559 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--C--C------------------------------------A-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-AAA
gi|26560 : ACA-ACGATGGACGT-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAAA-----C-TTTGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-
gi|26561 : CG-ATGACTGACAA-AAAGGTGA--T--TG--CA-AAAGGTACCTCGAGACAC-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26562 : G-ACTACGGACAA-AA-GACGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-T
gi|26564 : G-ACAACGGACAA-AA-GGCAA--T--CA--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-
gi|26565 : G-ACGAAAGACAA-AA-GATGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--TAAAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAATAAA
gi|26567 : G-ACGCAGGACGG-AC-GACGA--C--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26569 : G-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--C--AATGGT---------G-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGT---ACC-T
gi|26571 : G-ACGACGGACAC-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGA----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26572 : G-ACGACGGACAC-GA-GGCAA--A--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-AAAGG----CTCACA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26573 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26570 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26575 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26574 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26576 : G-ACGACGGACGA-AA-AGTGA--T--CA--GA-ATAGCT---------C-A-C--T--T-GAGC-----C-TAAGG----TT--CA-GGTG--AGC-TAA-
gi|26577 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--TTGT-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26566 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--T--T-TGG-----------------CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26578 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-CATT--T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26568 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-----TTCTGCT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26580 : G-ATGACGGACAA-AG-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTTCA-------C-C-T--T--T-GAAA-----C-GTCGG----CT--CA-AGTG--AAC-T
gi|26579 : G-ACGATGGACGA-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26581 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--C--T-GCGAGCTTTC----GG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26563 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----CTTCAG-----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26582 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------TAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26583 : -ACAACGTACAA-AT-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26585 : -ACAATGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGG----------C-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26584 : -ACGATAGACAA-AA-GGTTA--T--AT--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26586 : -ATGAGGGACAA-AA-TGCAA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-A-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26587 : -ACGACAGACAA-A--GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GATT--ACC--AA-AAA
gi|26588 : -ACAATGGA-AA-AA-AGTGA--T--CG--CA-GATGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26589 : -ACTACGGACAA-AA-AGCGA--T--GG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-A--------CC--CA--ATG--ACC-TAA-AAA
gi|26590 : -ACGTCGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-ATAGGT---------C-CAC--T-------------------T----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26591 : -ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGT-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26592 : CGACAGATAA-A--GGCCA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26593 : CGACAGATAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAGGT----CT--CA-G
gi|26594 : CAACGGAAAC-GA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAGA-----C-TAAGT----CT--CA-GGT
gi|26595 : GACGCACAACAA-CG-GA---------CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26596 : GACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GA
gi|26598 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26597 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26599 : ACGGACGC-AT-GATGA-----CGGACA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----T-AAAGT----CA--CA-GATG--ACC-TAA-AA
gi|26600 : GACAA-AA-TGCGA--T--CG--CA-AAACGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26601 : ACAA-AA-GGCGA--T--TA--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26602 : AA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GTTG--ACC-TAA-AAA
gi|26603 : A-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26604 : --CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26605 : -AAAGGT---------C-C-C--A----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-CAA-AA
gi|26606 : AAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26514 : AGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-TTTGT----CT--CA-AGGG--ACC-T
gi|26529 : acgacaacggacaaaaggcgatcgcaaaAGGT---------C-A-C--C--T-GAGA-----C-ATGGT----CT--CA-AGGG--ACC-Taagaa
gi|26552 : acgatgagggacaaaagtcgatcgcaaaAGGT---------C-A-C--C--T-GAAA-----C-TTAGT----CT--CA-GG-G--ACC-Taaaaa
gi|26560 : actatggtggacaataggcgattgcaaaAGGT---------C-A-C--C--A-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-TGTG--ACC-Taaaa
Alignments
lowQualScore : 1 0 0 00 00 11 0 222222222 5 0 00 55 0 11111 0 0000 00 0 11 0 3
lowQualScore : . . . .. .. .. . ......... . . .. .. . ..... . .... .. . .. . .
lowQualScore : 5 4 4 66 66 55 4 333333333 9 4 66 22 4 11111 4 9999 66 4 22 9 4
consensus : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
Reference ( family-321 ) : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26512 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26513 : ATG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26514 : ACG-ACAACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26515 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTA--ACC-TAA-AAA
gi|26516 : ACA-ACGACAGATAA-AA-GGTAA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26517 : ACG-ACGACGGAGAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGTT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26518 : ACG-ACGACGAACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26519 : ACA-ATGACAGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26520 : ACA-ACAACGGACAA-AA-GGTGA--C--TG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26521 : ACG-ATGACGGACAA-A--GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26522 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AACGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----T-ACAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26523 : ACG-ACGACGGACAA-AA-TGCTA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-AAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AA
gi|26524 : ACG-ACGACGGACAG-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----G-TAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26525 : ACG-ACGACAAACAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGC---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26526 : ACG-ATGACGGACAA-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GCGA-----C-AATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26527 : ACGCACGACGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGCT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAA-
gi|26528 : ACA-ACAACAGACAA-AA-GGCGA--TATTG--CA-AAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26529 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GTCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-CATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26530 : ACG-ACGACAGACAA-AA-GGCAA--T--CG--CA-AAACGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----T-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26531 : ACG-GTGATGGACAA-AA-ATCAA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26532 : ATG-ACAACAGACAA-AA-GGTGA--T--CA--CAGAAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26533 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GGCGA--C--TG--CA-AAGGGT---------C-A-C--T--T-GATA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26534 : ACA-ACGACGGATAA-AA-TGCTA--T--CT--CG-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26535 : ACG-ACAACGGACAG-AA-GGCAA--T--CG--CA-AATGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26536 : ACGCACTACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GATG--ACC-TCA-AA
gi|26537 : ATG-ACAATGGATAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26538 : ACG-ATGGCGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAATT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-CAA
gi|26539 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CA--CA-GGTG--AC
gi|26540 : ATG-ACAATGGACAA-AA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--A-GAGA-----C---AGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26541 : ACA-ACGACGGACAA-AA-AGCAA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-CAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26542 : ACG-ACAACAGA-AA-AA-GGCAA--T--CG--CA-TAAAGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CC--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26543 : ACA-ACGATGGACCA-AA-GACGA--T--CG--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGCG--ACCTTAA-AAA
gi|26544 : ACA-ACTACGGACAA-A--GGCAA--T--CG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-TAA
gi|26545 : ACG-ACGACATATAA-A--GACGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26546 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26547 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26548 : ACGCACGATGAACAA-AA-GGTAA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAC-AAA
gi|26549 : ACA-ACAACAGACAA-A--GGTGA--T--CG--CA-AAGGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CAGGGTG--ACC-TA
gi|26550 : ATG-ACGACAGACAA-AA-GGAAA--T--TG--TA-AAAGGT---------T-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGTG--ACCTTAA-AAA
gi|26551 : ACG-ACAAC--AAAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAAGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--AC
gi|26552 : ACT-ATGGTGGACAA-TA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-TAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26553 : ACG-ACGTCAGACAA-AA-TACAA--T--CA--CA-AAAGGT---------CAC-T--T--T-TAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC--AA-AA
gi|26554 : ACG-CTGACAAACAA-AT-GGTGACAT--TG--TA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26555 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GACGA--T--CA--CA-AAGGGT---------C-T-C--A--C-GAGA-----C-TTTCT----CT--CA-GATG--ATC-CAA-AAA
gi|26556 : ACG-ACGACATACAA-AA-AGCGA--T--AG--CA-AA-GGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----C
gi|26557 : ACG-GGGACTGACAA-AT-GGCAA--C--CA--CA-AATTGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAATAAA
gi|26558 : ATG-ACGACGGTCAA-AA-GGCGT--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAG
gi|26559 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--C--C------------------------------------A-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-AAA
gi|26560 : ACA-ACGATGGACGT-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAAA-----C-TTTGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-
gi|26561 : CG-ATGACTGACAA-AAAGGTGA--T--TG--CA-AAAGGTACCTCGAGACAC-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26562 : G-ACTACGGACAA-AA-GACGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-T
gi|26563 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----CTTCAG-----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26564 : G-ACAACGGACAA-AA-GGCAA--T--CA--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-
gi|26565 : G-ACGAAAGACAA-AA-GATGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--TAAAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAATAAA
gi|26566 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--T--T-TGG-----------------CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26567 : G-ACGCAGGACGG-AC-GACGA--C--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26568 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-----TTCTGCT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26569 : G-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--C--AATGGT---------G-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGT---ACC-T
gi|26570 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26571 : G-ACGACGGACAC-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGA----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26572 : G-ACGACGGACAC-GA-GGCAA--A--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-AAAGG----CTCACA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26573 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26574 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26575 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26576 : G-ACGACGGACGA-AA-AGTGA--T--CA--GA-ATAGCT---------C-A-C--T--T-GAGC-----C-TAAGG----TT--CA-GGTG--AGC-TAA-
gi|26577 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--TTGT-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26578 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-CATT--T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26579 : G-ACGATGGACGA-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26580 : G-ATGACGGACAA-AG-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTTCA-------C-C-T--T--T-GAAA-----C-GTCGG----CT--CA-AGTG--AAC-T
gi|26581 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--C--T-GCGAGCTTTC----GG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26582 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------TAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26583 : -ACAACGTACAA-AT-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26584 : -ACGATAGACAA-AA-GGTTA--T--AT--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26585 : -ACAATGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGG----------C-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26586 : -ATGAGGGACAA-AA-TGCAA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-A-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26587 : -ACGACAGACAA-A--GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GATT--ACC--AA-AAA
gi|26588 : -ACAATGGA-AA-AA-AGTGA--T--CG--CA-GATGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26589 : -ACTACGGACAA-AA-AGCGA--T--GG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-A--------CC--CA--ATG--ACC-TAA-AAA
gi|26590 : -ACGTCGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-ATAGGT---------C-CAC--T-------------------T----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26591 : -ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGT-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26592 : CGACAGATAA-A--GGCCA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26593 : CGACAGATAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAGGT----CT--CA-G
gi|26594 : CAACGGAAAC-GA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAGA-----C-TAAGT----CT--CA-GGT
gi|26595 : GACGCACAACAA-CG-GA---------CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26596 : GACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GA
gi|26597 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26598 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26599 : ACGGACGC-AT-GATGA-----CGGACA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----T-AAAGT----CA--CA-GATG--ACC-TAA-AA
gi|26600 : GACAA-AA-TGCGA--T--CG--CA-AAACGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26601 : ACAA-AA-GGCGA--T--TA--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26602 : AA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GTTG--ACC-TAA-AAA
gi|26603 : A-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26604 : --CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26605 : -AAAGGT---------C-C-C--A----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-CAA-AA
gi|26606 : AAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 0 00 00 11 0 222222222 5 0 00 55 0 11111 0 0000 00 0 11 0 3
lowQualScore : . . . .. .. .. . ......... . . .. .. . ..... . .... .. . .. . .
lowQualScore : 5 4 4 66 66 55 4 333333333 9 4 66 22 4 11111 4 9999 66 4 22 9 4
consensus : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
Reference ( family-321 ) : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26512 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26513 : ATG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26514 : ACG-ACAACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26515 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTA--ACC-TAA-AAA
gi|26516 : ACA-ACGACAGATAA-AA-GGTAA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26517 : ACG-ACGACGGAGAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGTT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26518 : ACG-ACGACGAACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26519 : ACA-ATGACAGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26520 : ACA-ACAACGGACAA-AA-GGTGA--C--TG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26521 : ACG-ATGACGGACAA-A--GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26522 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AACGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----T-ACAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26523 : ACG-ACGACGGACAA-AA-TGCTA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-AAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AA
gi|26524 : ACG-ACGACGGACAG-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----G-TAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26525 : ACG-ACGACAAACAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGC---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26526 : ACG-ATGACGGACAA-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GCGA-----C-AATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26527 : ACGCACGACGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGCT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAA-
gi|26528 : ACA-ACAACAGACAA-AA-GGCGA--TATTG--CA-AAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26529 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GTCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-CATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26530 : ACG-ACGACAGACAA-AA-GGCAA--T--CG--CA-AAACGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----T-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26531 : ACG-GTGATGGACAA-AA-ATCAA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26532 : ATG-ACAACAGACAA-AA-GGTGA--T--CA--CAGAAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26533 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GGCGA--C--TG--CA-AAGGGT---------C-A-C--T--T-GATA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26534 : ACA-ACGACGGATAA-AA-TGCTA--T--CT--CG-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26535 : ACG-ACAACGGACAG-AA-GGCAA--T--CG--CA-AATGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26536 : ACGCACTACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GATG--ACC-TCA-AA
gi|26537 : ATG-ACAATGGATAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26538 : ACG-ATGGCGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAATT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-CAA
gi|26539 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CA--CA-GGTG--AC
gi|26540 : ATG-ACAATGGACAA-AA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--A-GAGA-----C---AGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26541 : ACA-ACGACGGACAA-AA-AGCAA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-CAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26542 : ACG-ACAACAGA-AA-AA-GGCAA--T--CG--CA-TAAAGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CC--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26543 : ACA-ACGATGGACCA-AA-GACGA--T--CG--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGCG--ACCTTAA-AAA
gi|26544 : ACA-ACTACGGACAA-A--GGCAA--T--CG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-TAA
gi|26545 : ACG-ACGACATATAA-A--GACGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26546 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26547 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26548 : ACGCACGATGAACAA-AA-GGTAA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAC-AAA
gi|26549 : ACA-ACAACAGACAA-A--GGTGA--T--CG--CA-AAGGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CAGGGTG--ACC-TA
gi|26550 : ATG-ACGACAGACAA-AA-GGAAA--T--TG--TA-AAAGGT---------T-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGTG--ACCTTAA-AAA
gi|26551 : ACG-ACAAC--AAAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAAGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--AC
gi|26552 : ACT-ATGGTGGACAA-TA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-TAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26553 : ACG-ACGTCAGACAA-AA-TACAA--T--CA--CA-AAAGGT---------CAC-T--T--T-TAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC--AA-AA
gi|26554 : ACG-CTGACAAACAA-AT-GGTGACAT--TG--TA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26555 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GACGA--T--CA--CA-AAGGGT---------C-T-C--A--C-GAGA-----C-TTTCT----CT--CA-GATG--ATC-CAA-AAA
gi|26556 : ACG-ACGACATACAA-AA-AGCGA--T--AG--CA-AA-GGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----C
gi|26557 : ACG-GGGACTGACAA-AT-GGCAA--C--CA--CA-AATTGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAATAAA
gi|26558 : ATG-ACGACGGTCAA-AA-GGCGT--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAG
gi|26559 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--C--C------------------------------------A-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-AAA
gi|26560 : ACA-ACGATGGACGT-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAAA-----C-TTTGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-
gi|26561 : CG-ATGACTGACAA-AAAGGTGA--T--TG--CA-AAAGGTACCTCGAGACAC-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26562 : G-ACTACGGACAA-AA-GACGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-T
gi|26563 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----CTTCAG-----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26564 : G-ACAACGGACAA-AA-GGCAA--T--CA--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-
gi|26565 : G-ACGAAAGACAA-AA-GATGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--TAAAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAATAAA
gi|26566 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--T--T-TGG-----------------CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26567 : G-ACGCAGGACGG-AC-GACGA--C--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26568 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-----TTCTGCT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26569 : G-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--C--AATGGT---------G-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGT---ACC-T
gi|26570 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26571 : G-ACGACGGACAC-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGA----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26572 : G-ACGACGGACAC-GA-GGCAA--A--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-AAAGG----CTCACA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26573 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26574 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26575 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26576 : G-ACGACGGACGA-AA-AGTGA--T--CA--GA-ATAGCT---------C-A-C--T--T-GAGC-----C-TAAGG----TT--CA-GGTG--AGC-TAA-
gi|26577 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--TTGT-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26578 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-CATT--T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26579 : G-ACGATGGACGA-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26580 : G-ATGACGGACAA-AG-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTTCA-------C-C-T--T--T-GAAA-----C-GTCGG----CT--CA-AGTG--AAC-T
gi|26581 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--C--T-GCGAGCTTTC----GG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26582 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------TAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26583 : -ACAACGTACAA-AT-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26584 : -ACGATAGACAA-AA-GGTTA--T--AT--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26585 : -ACAATGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGG----------C-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26586 : -ATGAGGGACAA-AA-TGCAA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-A-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26587 : -ACGACAGACAA-A--GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GATT--ACC--AA-AAA
gi|26588 : -ACAATGGA-AA-AA-AGTGA--T--CG--CA-GATGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26589 : -ACTACGGACAA-AA-AGCGA--T--GG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-A--------CC--CA--ATG--ACC-TAA-AAA
gi|26590 : -ACGTCGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-ATAGGT---------C-CAC--T-------------------T----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26591 : -ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGT-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26592 : CGACAGATAA-A--GGCCA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26593 : CGACAGATAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAGGT----CT--CA-G
gi|26594 : CAACGGAAAC-GA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAGA-----C-TAAGT----CT--CA-GGT
gi|26595 : GACGCACAACAA-CG-GA---------CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26596 : GACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GA
gi|26597 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26598 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26599 : ACGGACGC-AT-GATGA-----CGGACA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----T-AAAGT----CA--CA-GATG--ACC-TAA-AA
gi|26600 : GACAA-AA-TGCGA--T--CG--CA-AAACGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26601 : ACAA-AA-GGCGA--T--TA--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26602 : AA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GTTG--ACC-TAA-AAA
gi|26603 : A-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26604 : --CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26605 : -AAAGGT---------C-C-C--A----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-CAA-AA
gi|26606 : AAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
blockSeqs : C GA ACCTCGAGA A TG GCTTT AA T
blockSeqs : C A CA A G . AA T
blockSeqs : C A . A G . . T
blockSeqs : . . . A G . . T
blockSeqs : . . . A G . . T
blockSeqs : . . . A G . . T
blockSeqs : . . . A G . . T
blockSeqs : . . . A G . . .
blockSeqs : . . . A G . . .
blockSeqs : . . . A G . . .
blockSeqs : . . . A G . . .
blockSeqs : . . . A G . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
finalCons : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
Alignments
lowQualScore : 1 0 0 00 00 11 0 222222222 5 0 00 55 0 11111 0 0000 00 0 11 0 3
lowQualScore : . . . .. .. .. . ......... . . .. .. . ..... . .... .. . .. . .
lowQualScore : 5 4 4 66 66 55 4 333333333 9 4 66 22 4 11111 4 9999 66 4 22 9 4
consensus : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
Reference ( family-321 ) : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26512 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26513 : ATG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26514 : ACG-ACAACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAA-GAA
gi|26515 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTA--ACC-TAA-AAA
gi|26516 : ACA-ACGACAGATAA-AA-GGTAA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26517 : ACG-ACGACGGAGAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGTT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26518 : ACG-ACGACGAACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26519 : ACA-ATGACAGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26520 : ACA-ACAACGGACAA-AA-GGTGA--C--TG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26521 : ACG-ATGACGGACAA-A--GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26522 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AACGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----T-ACAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26523 : ACG-ACGACGGACAA-AA-TGCTA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-AAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AA
gi|26524 : ACG-ACGACGGACAG-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----G-TAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26525 : ACG-ACGACAAACAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGC---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26526 : ACG-ATGACGGACAA-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GCGA-----C-AATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26527 : ACGCACGACGGACAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGCT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAA-
gi|26528 : ACA-ACAACAGACAA-AA-GGCGA--TATTG--CA-AAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26529 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GTCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-CATGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26530 : ACG-ACGACAGACAA-AA-GGCAA--T--CG--CA-AAACGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----T-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26531 : ACG-GTGATGGACAA-AA-ATCAA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26532 : ATG-ACAACAGACAA-AA-GGTGA--T--CA--CAGAAAGGT---------C-T-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26533 : ACG-ATGAGGGACAA-AA-GGCGA--C--TG--CA-AAGGGT---------C-A-C--T--T-GATA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26534 : ACA-ACGACGGATAA-AA-TGCTA--T--CT--CG-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26535 : ACG-ACAACGGACAG-AA-GGCAA--T--CG--CA-AATGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26536 : ACGCACTACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GATG--ACC-TCA-AA
gi|26537 : ATG-ACAATGGATAA-AA-GGCAA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26538 : ACG-ATGGCGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAATT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-CAA
gi|26539 : ACG-ACGATGGACAA-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CA--CA-GGTG--AC
gi|26540 : ATG-ACAATGGACAA-AA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--A-GAGA-----C---AGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26541 : ACA-ACGACGGACAA-AA-AGCAA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-CAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26542 : ACG-ACAACAGA-AA-AA-GGCAA--T--CG--CA-TAAAGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CC--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26543 : ACA-ACGATGGACCA-AA-GACGA--T--CG--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGCG--ACCTTAA-AAA
gi|26544 : ACA-ACTACGGACAA-A--GGCAA--T--CG--CA-AAAGAT---------C-C-C--T--C-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-TAA
gi|26545 : ACG-ACGACATATAA-A--GACGA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26546 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26547 : ACG-ACGATGGTCAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAATGT---------C-C-C--T--T-GTGA-----C-AAAGC----CT--CA-GGTGAAACC-TA
gi|26548 : ACGCACGATGAACAA-AA-GGTAA--T--CA--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-AGTG--ACC-TAC-AAA
gi|26549 : ACA-ACAACAGACAA-A--GGTGA--T--CG--CA-AAGGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CAGGGTG--ACC-TA
gi|26550 : ATG-ACGACAGACAA-AA-GGAAA--T--TG--TA-AAAGGT---------T-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGTG--ACCTTAA-AAA
gi|26551 : ACG-ACAAC--AAAA-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAAGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--AC
gi|26552 : ACT-ATGGTGGACAA-TA-GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-TAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26553 : ACG-ACGTCAGACAA-AA-TACAA--T--CA--CA-AAAGGT---------CAC-T--T--T-TAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC--AA-AA
gi|26554 : ACG-CTGACAAACAA-AT-GGTGACAT--TG--TA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAAA-----C-AAAAT----CT--CA-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26555 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GACGA--T--CA--CA-AAGGGT---------C-T-C--A--C-GAGA-----C-TTTCT----CT--CA-GATG--ATC-CAA-AAA
gi|26556 : ACG-ACGACATACAA-AA-AGCGA--T--AG--CA-AA-GGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----C
gi|26557 : ACG-GGGACTGACAA-AT-GGCAA--C--CA--CA-AATTGT---------C-C-C--T----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAATAAA
gi|26558 : ATG-ACGACGGTCAA-AA-GGCGT--T--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAG
gi|26559 : ACG-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--C--C------------------------------------A-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-AAA
gi|26560 : ACA-ACGATGGACGT-AA-GGGGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAAA-----C-TTTGT----CT--CT-GGTG--ACC-TAA-
gi|26561 : CG-ATGACTGACAA-AAAGGTGA--T--TG--CA-AAAGGTACCTCGAGACAC-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26562 : G-ACTACGGACAA-AA-GACGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GGTG--ACC-T
gi|26563 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----CTTCAG-----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26564 : G-ACAACGGACAA-AA-GGCAA--T--CA--CA-ATAGAT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GATG--ACC-TAA-
gi|26565 : G-ACGAAAGACAA-AA-GATGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--TAAAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ATC-TAATAAA
gi|26566 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--T--T-TGG-----------------CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26567 : G-ACGCAGGACGG-AC-GACGA--C--CA--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--TA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26568 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-----TTCTGCT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26569 : G-ACGACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--C--AATGGT---------G-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--AA-GGT---ACC-T
gi|26570 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26571 : G-ACGACGGACAC-AA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGA----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26572 : G-ACGACGGACAC-GA-GGCAA--A--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-AAAGG----CTCACA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26573 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26574 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26575 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26576 : G-ACGACGGACGA-AA-AGTGA--T--CA--GA-ATAGCT---------C-A-C--T--T-GAGC-----C-TAAGG----TT--CA-GGTG--AGC-TAA-
gi|26577 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--TTGT-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26578 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-CATT--T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26579 : G-ACGATGGACGA-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26580 : G-ATGACGGACAA-AG-GGCGA--T--CA--CA-AAAGTTCA-------C-C-T--T--T-GAAA-----C-GTCGG----CT--CA-AGTG--AAC-T
gi|26581 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------C-A-C--C--T-GCGAGCTTTC----GG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26582 : G-ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------TAC-C--TG-T-GAGC-----C-TTCGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26583 : -ACAACGTACAA-AT-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26584 : -ACGATAGACAA-AA-GGTTA--T--AT--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-ATAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26585 : -ACAATGGACAA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGG----------C-C-C--T--T-GAGA-----A-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACA-TAA-AAA
gi|26586 : -ATGAGGGACAA-AA-TGCAA--T--TG--CA-AAAGAT---------C-A-C--T--T-GAAA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-
gi|26587 : -ACGACAGACAA-A--GGCGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----TT--CA-GATT--ACC--AA-AAA
gi|26588 : -ACAATGGA-AA-AA-AGTGA--T--CG--CA-GATGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26589 : -ACTACGGACAA-AA-AGCGA--T--GG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-A--------CC--CA--ATG--ACC-TAA-AAA
gi|26590 : -ACGTCGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-ATAGGT---------C-CAC--T-------------------T----TT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26591 : -ACGACGGACAC-CA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGCT---------CAC-C--TG-T-GAGT-----C-TTTGG----CT--CA-GGTG--AGC-TAA-AAA
gi|26592 : CGACAGATAA-A--GGCCA--T--CG--CA-AAAGGT---------T-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TTA-AAA
gi|26593 : CGACAGATAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAGGT----CT--CA-G
gi|26594 : CAACGGAAAC-GA-GGCGA--T--CA--CA-AAAGGT---------C-A-C--A--T-GAGA-----C-TAAGT----CT--CA-GGT
gi|26595 : GACGCACAACAA-CG-GA---------CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26596 : GACGGACAA-AA-GGCGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GA
gi|26597 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26598 : ACGGACGC-AT-GATGA--T--GGA-CA-AAAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26599 : ACGGACGC-AT-GATGA-----CGGACA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-CAGA-----T-AAAGT----CA--CA-GATG--ACC-TAA-AA
gi|26600 : GACAA-AA-TGCGA--T--CG--CA-AAACGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AA
gi|26601 : ACAA-AA-GGCGA--T--TA--CA-AAAGGT---------C-C-T--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26602 : AA-AA-GGTGA--T--TG--CA-AAAGGT---------C-A-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GTTG--ACC-TAA-AAA
gi|26603 : A-AA-GGTGA--T--CG--CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CG-GGTG--ACC-TAATAAA
gi|26604 : --CA-AAAGGT---------C-C-C--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-TAA-AAA
gi|26605 : -AAAGGT---------C-C-C--A----GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-GGTG--ACC-CAA-AA
gi|26606 : AAGGT---------C-C-A--T--T-GAGA-----C-AAAGT----CT--CA-TGTG--ACC-TAA-AAA