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lowQualScore                  :          . .. . ....  .   .. .         .........    ........ .. .     ..    ..      .   . . ..     .    ....  ... .       .        ..  ...     .     .   ...  .     . .   ..... . .. .       ..  ...       .  .            .      
lowQualScore                  :          4 11 7 5555  7   99 3         888888888    33333333 88 4     88    66      0   6 2 33     6    2222  000 7       6        88  000     6     6   555  6     4 5   11111 5 11 5       66  888       5  5            1      
consensus                     :     AAAAT-A-CG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--ANAACGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--AAAAT-CGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
Reference ( gi|34236 )        :     AAAAT-A-TG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-CAGGTC-GTAACG------GT--AGAACGA--CAAA-TGCCACAGCCC-C-T--AAAAT-CGAA----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34240                      :     AAAAT-A-CG-A----TT-TTT----ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--AGAAC-----AAA-TGCCACAGCCC-C-T--AAAAT-CGAA----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTAATT--TA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACC
gi|34242                      :     AAAATTA-AG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------CT--ATAACAA--CAAA--GTCACAACCC-C-T--AAAAT-CTAA----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---GTAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTT-TT-AAGTTATTGCATGGAAATC
gi|34251                      :     AAAAT-G-TG-A----TT-TT---C-ACAAATGAA-AGGGGC-GTAACT------GT--AGAACGA--CAAA-TGACATAACCC-C-T--TAAAT-CAAA----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---TTAAA-CATTGAATC---AA-AATTT-C-AGA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACGGAAAaa
gi|34235                      :     AAAAT-A-CA-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--ATAACAA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--TACTT-CAAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTAA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTTCACGGAAAgcaa
gi|34245                      :     AAAAT-A-TG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-GTAACT------CT--AGAACGA--CCAA-TGCCACAAGCC-T-T--CAAAT-CCAA----CT---TAGCCCGAG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-TATTGTATC---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---AGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGCAAAacca
gi|34239                      :     AAAAT-A-CA-A----TTGTTT--C-ACAAATGAA-AGGGGC-ATAACT------CT--AGAACGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--AAAAT-CGAG----CT---TAGCTTGTG-TTTTATCA--AT---ATCAA-CATTGTATT---AC-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TATGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCgca
gi|34256                      :     AAATT-A-TG-G----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ACAATT------CT--ACAATGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--GAAAT-CGAA----CT---TAGCCCGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT---AG-AATAT-C-AAA-----A-T--A-TTTGCTT--CA---GGCATTC-TT-AAAGTATTGCAC-GAAACaa
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gi|34258                      :     AAATT-A-TG-A----CT-TTT--C-ACAAATCAA-AGGGGC-ACAATT------CT--ACAACGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--GAAAT-CGAA----CT---AAATCTGT---TATGTCT--TT---ATAA--CATTGTATT---AG-AATTT-T-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACGGAAACC
gi|34262                      :     AAAAT-A-CA-A----TT-TTT--C-ACAAATTAC-TGGGGC-ATAACT------GT--AGAAAAA--CAAA-TGCCACAACCC-CAT--AAAAT-CAAA----CT---TAGCCTGTG-TTT-------------------ATTGTATT---AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-GT-AAGTTATTGCAaa
gi|34269                      :     AAAAT-A-CG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGAGGA-ATAACT------GT--AGTTCGA--CAAA-TGCCACAACCG-C-T--AAAAT-TGAA----CT---TGGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---AT----------ATT---AA-AATCT-C---A-----A-G--A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT--AGTTATTGCTAGGAAACCtgtataccaa
gi|34244                      :     AAAAT-A-CA-A----AT-TTT--C-ACACATTTA-AGGGGC-ACAACT------CT--ACAATGA--CAAA-AGTAACAACCC-CCT--AAAAT-CAAA----CT---TAACCTGTA-TTTTGTTA--TT---ATGAA-TATTGTACA---AC-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34263                      :     AAAAT-A-CA-A----AT-TTT--C-AAAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--AGAACGA--CAAT-TGCCGCAACCCGT-T--AAAAG-TGAA----CT---TAGCCTATG-CTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATC---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGTGTAC-TT-A
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gi|34249                      :     AAAAT-A-TG-A----TT-TTT--TTACAAATTGA-C-------T----------GT--AGAACGA--CAAA-AGCCACAATGC-T-T--CAAAT-CAAA----CT---TAGCCAGCG-TTTTGTC--------ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----G-G--A-----A--------------TC-TT-ATGTTATTGCATGGAAACCaa
gi|34275                      :     AAAAT-A-CG-GGT--TT-TTT--A-AAAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--GGAACGA--CAAA-TGCCACAATCC-C-T--AAAAT-CGAA----CT---TATCCTGTG-CTTTTTTT--TC---CT--G-CTTTTTATT---GG-GGTT----AAT-----A-G--A-CCTGATT--CA---GGaa
gi|34241                      :     AAAAT-A-CG-A----TT-TCTGTC-AAAAATTAAACAGG-C-ATAACT------GT--AGAACAA--CAAA-TGCCGCAACCC-C-T--TAAAT-CGAA----CA---TAGCC
gi|34264                      :     AAAAT-A-TG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA--AGGGT-GTTACAGTTTCTGT--AGAATGA--CACA-AGTCATAACCT-A-T--AAAAT-TGAA----C----------------TTGTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT---CA-AATTT-
gi|34276                      :     AAAAT-A-TG-A----TT-TTT--TTACAAA------AGG--------G------G-------CGA--CCAA-GGCCCCAATGC-C-T--TAAAT-AGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTC---TT---ATAAA-CATTGTAAT---AA-A---C-C-AAA-----A-
gi|34250                      :     AAAAT-A-TG-A----TA-TTT--G-GCAAATTAA-AGGGGC-ATTACT------CT--ACAACAA--CAAA-TTCCACAA-CC-C-T--AAAAT-CGAA----CT---T
gi|34237                      :      AAA--A-TG-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GC--AAGATGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--AAAAT-TAAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATAATATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCAATC-GT-AAGTTATTGCATGGAAATC
gi|34279                      :      AAATGA-CG-A----TA-TTT--C-ACAAATTAA-AGGAGC-ACAACT------CT--ACAACGC--CAAA-AGTCACAACCC-A-A--AAAAA-CGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAAATACTA-GT-A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCATGGAAAaa
gi|34278                      :      AATT-A-CA-A----TT-TTT--C-AAAAATAAA-AAGGGC-ACAACT------CT--ACAACG----------CCACAATCC-T-G--AAAAT-CAAT----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AG-AATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GTCA-------AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34273                      :      AAAT-C-T--A----TT-TTA--A-ATAAACTAA-ATGGGA-ATAACT------GT--AGAAAGA--CTGA-TGCTTCATCCA-C-T--AAAAT-CTAA----CT---TATCCTATG-TTTTATCA--T----ATAAA-CGTTGTATT---AA-AAGTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-TAGTTGTTGCACGGAAACCaa
gi|34277                      : aaaatAATT-A-CA-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGAGGC-ACAACT------CT--ACCACCC--CAAA-AGTCAAACCCC-C-CA-AAAAT-CAAA----CT---TATCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATTAA-CATTGTATT---AG-AATTT-C---------A-G--A-TTTGATG--CA---GGCATTCTTT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34280                      :      AAAT-A-CG-A----TT-TTT----ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--AATATGA--CAAA-TGCCACAACaa
gi|34281                      :       AAT-A-CA-T----TT-TTT--C-ACAAACTAAATAGG-C-ATAACT------AT--AGAAAAA---AAA-TGCCTCAACCC-C-T--AAAAT-CGAA----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TA---ATAGA-CACTGTATG---AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGAATTC-TT-AAGGTATTGCAGGGAAA
gi|34282                      :        AT-A-GG-A----CT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGG-GTAACT------CA--AGAACGA--CAAA-TGCCACAACTC---T--AAAAT-CGAA----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATCATTGTACGGAAACCacccaa
gi|34283                      :        AT-A-CG-A----TT-TTC--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------GG--AGAACGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--AAAAT-CGAA----CT---TAGCCTGTG-TT--------TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTTATT--TA---GGCATTT-AA-AAGTTCTTaa
gi|34274                      :        AT-A-TG-A----AT-TTT--C-GCAAGCTAA-ATGATC-ATAGCT------GT--ATAAAGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--AAAAT-CGAA----GT---TGGCCTGTG-TTTTATCT--GT---ATAAA-CAGTGTTTA---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTa
gi|34284                      :  aaaatatT-A-CA-A----TT-TTT--C-TCAAATTAA--AGG--------G------GC--ACAAC---------T-CTACAACAC-T-G--AAAAT-CCAA----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TC---ATTAA-CATTGTATT---AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34289                      :          -A-CG-A----TT-TTT--C-ATAAATCAA-AGAGGC-ACAACT------CT--ACAATGG--CAAA-AGTCACAACCT-T-A--AAAAT-CGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTAATTGTCCGGAAACCaa
gi|34291                      :          -A-CG-A----TT-TTT--C-ACTTATTAA-AGGGGC-ATAACT------CT--ATAACGC--CAAA-AGTCAGAACCC-T-G--AAAAT-CGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--GT---GTAaa
gi|34293                      :               -A----TT-TTT--C-ACAAATCAA-AGGGGC-ATAACT------GT--AGAACAA--CAAAATTCAACAACCC-C-T--TAAAT-CGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTCATTA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34287                      :               -A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-ATGGGC-ACAACT------CC--ACAATGT--CAAA-----A-AACCT-C-G--AAAAT-CAAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTACT---AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCCCGGAAACCaa
gi|34294                      :            aca-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-CTGGGT-ATATCT------GT--AAAACAA--CAAT-TGCCACAGTCC-C-T--TAAAT-CAAA----CT---TAGTGTGTG-TTTTGTCA--TT---AGAAA-CATTGTATA---AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CC---GACATTC-AT-GAACTATTGCACAGAAACaa
gi|34285                      :               -A----TT-TTT--T-TCAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------CC--ACAATGC--CAAA-AGTCACAATCC-T-G--AAAAT-TGAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGAT----A---GGCATTC-TT-AAGCTATTGCAAGGAAACC
gi|34292                      :           tact-A----TT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ACAACC------CA--ACAATGC--CAAA-AGTCACCACCC-C-C--TAAAT-CAAA----CT---AAGCTTGTG-TTTTGTAA--TT---ACAAA-CATTGCATT---AG-AATTT-C---A-----A-G--A-TTTCATT--TA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACAGAAACCaa
gi|34268                      :                a----TT-TTT--C-ACAAATTAA--AGG------------------------GA--CA--------CAACTC-T-A--AAAAT-CAAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-GTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AATCTATTTCATGGAAACCaa
gi|34290                      :       aaattacact----TT-TTT--C-ACTAATTAA-AGGGGC-ACAAC--------T------CTA--C-AA-TGCCA------------AAAAT-CAAA----CT---AAACCTGTA-TTTaa
gi|34286                      :                  acatT-TTT--C-ACAAATTAA-AGGGGC-ATAACT------CT--ACAACGC--CAGA-------AG------T--ATA------------------GCCTGTA-TATTGTCA--TT---ATAAA-CATTATATA---CG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---GGCATTC-TT-CAGTTATTGCGTGGAAACC
gi|34296                      :                    tacataT--T-ACAAATTAA--AGGTCCACAACT------CT--ACAACCT--CAAA-AGTCACCACCC-A----AAAAT-CGAA----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AG-AATTT-C-AAA-----C-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTTATTGCATGGAAACCaa
gi|34297                      :                              -ACAAGCTAA-AGGGGC-AAAACT------GT--AGAACGA--CAAA-TGCCACAACTC-C-T--AAAAT-CGAA----CT---AAGCTTGTG-TTCAATCA--TT---GTAAA-CATTGAATT---AC-AATTT-A-AAA-----A-A--G-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTACACGGGAACCaa
gi|34298                      :                                CATATTAA-AGGGT--ATAACT------GT--AGAACGA--CAAC-TGCCATAATCC-C-T--AATAT-CGAA----CT---TAGCCTGTGTTTTTGACA--TC---ATAAA-CA-TGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34299                      :                                   ATTAA-AGGGGC-ATAACT------GT--AGAACGA--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--TAAAT-CAAA----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATTGTTTT---AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGAATTT-GT-AAGTTATTGCACAGAAAC
gi|34295                      :                                                  AACT------GT--AGAACGA--CAAA-TGTCATAACCC-T-T--AAAAT-CGCA-----T---TAGCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATAAA-TATTATATT---AA-ATTTT-C-AAA-----A---------GATT--CA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACTGAAGC
gi|34300                      :                               ttgcacggaaatcaaaacaAACT------GT--AGTATGA--CCAA-TGCCACAACCC-T-T--AAAAT-CAAA----CT---AAACGTGTG-TTTGGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA---AA-AAAAT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATT--TT-AAGTTATTGCGT-GAAAC
gi|34301                      :                                                             T--ACAACGT--CAAA-AGTCACAACCC-C-A--AAATT-CGAA----CT---TAGTCTGTA-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACGGAAACCacaa
gi|34288                      :                                                                      A--CAAA-TGCCACAACCC-C-T--AAACT-CGAA----CT---TATCCTGTG-TTTTGTCA--TTTATATAAA-CATTGTACT---AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGTTT--CT---GGCATTC-AT-AAGCTATTGCACGGAAACCaa
gi|34302                      :                         acaatttttcaggcattcttaagttattgcatggaaaaaaacaaaa--CAAA-AGTCACAACCC-C-G--AAAAT-CGAA----CT---TAGTCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-CATTGTATC---AA-AATGT-C-AAA-----A-G--G-TTTT-TT--TATATGGCATTC-CT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34304                      :                                                                                  ACAAACC-T-G--AAAAT-CGAA----CT---TAGCCTGT---TTTGTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT---AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-aa
gi|34305                      :                                                                                      CCC-C-TCCAAAATATGAA----AT---TAGCCTGTG-TTTTGTTG--TT---ATAAA-CACCGTTTT---AA-AGTTT-C-AAA-----A-A--A--TTGATT--CA---GACATTC-TT-
gi|34303                      :                                                                                          a-T--AAATT-TGAA----CT---TAGTAAGTA-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT---AA-AGTTT-CAAAA-----A-G--ATTTTTTTT--CA---GGCATTT-TTGAAGTTATTGCACAGA
gi|34307                      :                                                                                    acataccaa--AGAAT-CGAAGTCCCC---TTAC-TGTG-TTTTGTCC--TC---TTAAT-TAT---AT-------AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTT--CA---G--ATTA-TT-AAGTTATTGCACTGAAACC
gi|34306                      :                                                                                             --AAAAT--GAA----CT---TGATCTGTA-TTCCATCA--TT---ATTAA-CATTGTCTT---AA-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTTTGTA---GGCAAAC-TT-TTGTTGTTGAAAGGAAACCaa
gi|34308                      :                                                                                                       AA----CT---TAGCATGTA-TTTTGTCA--TT---ATTAA-TATTGTATT---AA-AA--------A-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACAGAAATCa
gi|34309                      :                                                                                                                         aG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CAT---ATT---AA-AATTT-G-AAA-----A-T--A-GTTGATT--CT---GGCATT--TT-AATCTGTTGCATGGAAACCaa
gi|34310                      :                                                                                                                             TTTTTCAAATT---ATAAA-CATTGTATT---AG-AATTT-A-AAA-----C-A--A-TTTGA-----------------TT-GAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34311                      :                                                                                                                                            TAAA--ATTGTATT---AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAAaa
gi|34312                      :                                                                                                                                                        TC---AA-CATTT-C-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCTCCGAAACC
gi|34313                      :                                                                                                                                                                 ATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---ATCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34315                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACC
gi|34323                      :                                                                                                                                                                  TTTAC-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34314                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-CT-AAGTTAATGCACGGAAACaa
gi|34320                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACAGTC-TT-AAGTTATTGCACAAAAAaaa
gi|34317                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAAGAAAC
gi|34327                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CG---GGCATTC-TT-AAGTTTTTGCATGGAAACC
gi|34326                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGAAAATC
gi|34325                      :                                                                                                                                                                  TTT-T-AAA-----ATG--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTGCACGGAAATCaa
gi|34321                      :                                                                                                                                                                  TTC-C-AAA-----A-G--A-TT-GATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACACAAAaa
gi|34322                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--TA---GACATTC-TT-AAGTTAATGCACAGA
gi|34318                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTAATT--CA---GTCATTT-AT-AAATTATTGCACGGAAATC
gi|34316                      :                                                                                                                                                                  TTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-GT-AAGTTATTACATGGAAATC
gi|34324                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----G-T--A-TTTAATT--GA---GGAAGTC-TT-AAGTTATTACACGGAAAC
gi|34319                      :                                                                                                                                                                  TTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGTTT--CA---GTCATTC-TT-ATGTTATTTCATGGAACCC
gi|34328                      :                                                                                                                                                                   TT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGTAACC
gi|34329                      :                                                                                                                                                                     -C-ACA-----A-A--A-TTTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAATC





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lowQualScore                  :                                         . ...  . ..  .   .. .  ..           .  . .  ... .. .  .     ..    ..      .    . . ..     .    .....  ...         .        ..  ...     .         .  .     . .   ..... . .. .       ..  ...       .  .                   
lowQualScore                  :                                         3 111  7 99  7   99 9  99           6  6 8  111 88 0  8     88    11      6    6 1 55     6    44444  555         6        88  000     6         5  5     4 4   11111 4 11 4       66  888       5  5                   
consensus                     :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
Reference ( family-319 )      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34235                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTATAACAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TACTT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTAA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTTCACGGAAA
gi|34236                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAACAGG-TC-GTAA---C--GGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-GCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCacca
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gi|34264                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGGTGTTACAGTTTC--TGTAGAATGA--CACA-AGTCATA-ACCT-A-T--AAAAT-TGAA-----CT---T-------------GTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-CA-AATTT-
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gi|34269                      :                          aaattacactAAAAT-A---CG-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGAG-GA-ATAA---C--TGTAGTTCGA--CAAA-TGCCACA-ACCG-C-T--AAAAT-TGAA-----CT---TGGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---A----------TATT-AA-AATCT-C---A-----A-G--A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT--AGTTATTGCTAGGAAACCaa
gi|34270                      :                                    AAATT-A---CG-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGC--CAA---GTCACA-ACCC-T-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTG-----------------------------G-TTTGATT--CA---GGCATTG-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34271                      :                                    AAAAT-A---TATA--TT-TTC--C-AC--GAATTAAAGGG-GC-ACAG---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCACA-ACCC-C-T--AAACT-AGAA-----CT---TAGCCTG------TGTCA--TT---ATTAA-TGTTGTGTT-AA-AATTT-T-AAA-----A-T--A-TTTGGGT--AA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCAGGGAAAC
gi|34272                      :                                    AAAAT-AA--CG-A--CT-TTT--C-AC--AAATTAT-GTG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC---T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTGCATGGGTACCtaa
gi|34273                      :                                    AAAAT-AAATCT-A--TT-TTA--A-AT--AAACTAAATGG-GA-ATAA---C--TGTAGAAAGA--CTGA-TGCTTCA-TCCA-C-T--AAAAT-CTAA-----CT---TATCCTATG-TTTTATCA--T----ATAAA-CGTTGTATT-AA-AAGTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-TAGTTGTTGCACGGAAACCaa
gi|34274                      :                                       AT-A---TG-A--AT-TTT--C-GC--AAGCTAAATGA-TC-ATAG---C--TGTATAAAGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----GT---TGGCCTGTG-TTTTATCT--GT---ATAAA-CAGTGTTTA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TT
gi|34275                      :                             aaaatatAAAAT-A---CG-GGTTT-TTT--A-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTGGAACGA--CAAA-TGCCACA-ATCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-CTTTTTTT--TC---CT--G-CTTTTTATT-GG-GGTT----AAT-----A-G--A-CCTGATT--CA---GG
gi|34276                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-TTT--TTAC--AAA----AGGG-GC-------------------GA--CCAA-GGCCCCA-ATGC-C-T--TAAAT-AGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTC---TT---ATAAA-CATTGTAAT-AA-A---C-C-AAA-----A-
gi|34277                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACCACCC--CAAA-AGTCA-A-ACCC-C-CCAAAAAT-CAAA-----CT---TATCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C---------A-G--A-TTTGATG--CA---GGCATTCTTT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34278                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-TTT--C-AA--AAATAAAAAGG-GC-ACAA---C--TCTACAACG----------CCACA-ATCC-T-G--AAAAT-CAAT-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GTCA-------AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34279                      :                                     AAATGA---CG-A--TA-TTT--C-AC--AAATTAAAGGA-GC-ACAA---C--TCTACAACGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-A-A--AAAAA-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAAATACTA-GT-A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCATGGAAAaa
gi|34280                      :                                     AAAT-A---CG-A--TT-TTT----AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAATATGA--CAAA-TGCCACA-AC
gi|34281                      :                                      AAT-A---CA-T--TT-TTT--C-AC--AAACTAAATAG-GC-ATAA---C--TATAGAAAAA---AAA-TGCCTCA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TA---ATAGA-CACTGTATG-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGAATTC-TT-AAGGTATTGCAGGGAAA
gi|34282                      :                                       AT-A---GG-A--CT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GG-GTAA---C--TCAAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC---T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATCATTGTACGGAAACCacccaa
gi|34283                      :                                       AT-A---CG-A--TT-TTC--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGGAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TT--------TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTTATT--TA---GGCATTT-AA-AAGTTCTTaa
gi|34284                      :                                        T-A---CA-A--TT-TTT--C-TC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAAC-A--C----TG----------------AAAAT-CCAA-----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TC---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCa
gi|34285                      :                                        T-A---CT-A--TT-TTT--T-TC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCCACAATGC--CAAA-AGTCACA-ATCC-T-G--AAAAT-TGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGAT----A---GGCATTC-TT-AAGCTATTGCAAGGAAACCaa
gi|34286                      :                                                     T-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTACAACG----------CCA--------------------GAA-----GTA--TAGCCTGTA-TATTGTCA--TT---ATAAA-CATTATATA-CG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---GGCATTC-TT-CAGTTATTGCGTGGAAACCaa
gi|34287                      :                                   tacata-A---CA-A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAATGG-GC-ACAA---C--TCCACAATGT--CAAA-----A-A-ACCT-C-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCCCGGAAACCaa
gi|34288                      :                                                                                                                                                                                                                 --A-TTT--TT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34288                      :                                                                                           acaACAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAACT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-TTTTGTCA--TTTATATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGTTT--CT---GGCATTC-AT-AAGCTATTGCACGGAAACCaaaacaaaaacaaatgccacaacccctaaactcgaacttatcctgtgttttgtcatttatataaacattgtactagaatttgaaaagatttgtttctggcattcataagctattgcacggaaacc
gi|34289                      : acaatttttcaggcattcttaagttattgcatggaaaaaa-A---CG-A--TT-TTT--C-AT--AAATCAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACAATGG--CAAA-AGTCACA-ACCT-T-A--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTAATTGTCCGGAAACC
gi|34290                      :                                                  --TT-TTT--C-AC--TAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTAC---------AA-TGCCA-------------AAAAT-CAAA-----CT---AAACCTGTA-TTTaa
gi|34291                      :                                     acat-A---CG-A--TT-TTT--C-AC--TTATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTATAACGC--CAAA-AGTCAGA-ACCC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--GT---GTA
gi|34292                      :                                                -A--TT-TTT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--CCAACAATGC--CAAA-AGTCACC-ACCC-C-C--TAAAT-CAAA-----CT---AAGCTTGTG-TTTTGTAA--TT---ACAAA-CATTGCATT-AG-AATTT-C---A-----A-G--A-TTTCATT--TA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACAGAAACC
gi|34293                      :                                               a-A--TT-TTT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACAA--CAAAATTCAACA-ACCC-C-T--TAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTCATTA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34294                      :                                                -A--TT-TTT--C-AC--AAATTAACTGG-GT-ATAT---C--TGTAAAACAA--CAAT-TGCCACA-GTCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGTGTGTG-TTTTGTCA--TT---AGAAA-CATTGTATA-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CC---GACATTC-AT-GAACTATTGCACAGAAACaa
gi|34295                      :                                                      -TTG--C-ACGGAAATCAAAA----C-A-AA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCATA-ACCC-T-T--AAAAT-CGCA------T---TAGCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATAAA-TATTATATT-AA-ATTTT-C-AAA-----A---------GATT--CA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACTGAAGC
gi|34296                      :                                                         T--T-AC--AAATTAAAGGT-CC-ACAA---C--TCTACAACCT--CAAA-AGTCACC-ACCC-A----AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----C-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTTATTGCATGGAAACC
gi|34297                      :                                                             -AC--AAGCTAAAGGG-GC-AAAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---AAGCTTGTG-TTCAATCA--TT---GTAAA-CATTGAATT-AC-AATTT-A-AAA-----A-A--G-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTACACGGGAACCaa
gi|34298                      :                                                               C--ATATTAAAGGG--T-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAC-TGCCATA-ATCC-C-T--AATAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTGTTTTTGACA--TC---ATAAA-CA-TGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34299                      :                                                                    ATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATTGTTTT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGAATTT-GT-AAGTTATTGCACAGAAAC
gi|34300                      :                                                                                   AA---C--TGTAGTATGA--CCAA-TGCCACA-ACCC-T-T--AAAAT-CAAA-----CT---AAACGTGTG-TTTGGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AAAAT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATT--TT-AAGTTATTGCGTGAAA
gi|34301                      :                                                                                             TACAACGT--CAAA-AGTCACA-ACCC-C-A--AAATT-CGAA-----CT---TAGTCTGTA-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACGGAAACCcacaa
gi|34302                      :                                                                                                     --CAAA-AGTCACA-ACCC-C-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATGT-C-AAA-----A-G--G-TTTT-TT--TATATGGCATTC-CT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34303                      :                                                                                                                ACATACCA-A-T--AAATT-TGAA-----CT---TAGTAAGTA-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AGTTT-CAAAA-----A-G--ATTTTTTTT--CA---GGCATTT-TTGAAGTTATTGCACAGAaa
gi|34304                      :                                                                                                                ACA-AACC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGT---TTTGTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-
gi|34305                      :                                                                                                                   -ACCC-C-TCCAAAATATGAA-----AT---TAGCCTGTG-TTTTGTTG--TT---ATAAA-CACCGTTTT-AA-AGTTT-C-AAA-----A-A--A--TTGATT--CA---GACATTC-TT-
gi|34306                      :                                                                                                                            --AAAAT--GAA-----CT---TGATCTGTA-TTCCATCA--TT---ATTAA-CATTGTCTT-AA-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTTTGTA---GGCAAAC-TT-TTGTTGTTGAAAGGAAACC
gi|34307                      :                                                                                                                            --AGAAT-CGAAGTCCCCT---TA--CTGTG-TTTTGTCC--TC---TTAA----TTATAT-----AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTT--CA---G--ATTA-TT-AAGTTATTGCACTGAAACCa
gi|34308                      :                                                                                                                                      AA-----CT---TAGCATGTA-TTTTGTCA--TT---ATTAA-TATTGTATT-AA-AA--------A-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACAGAAATCaa
gi|34309                      :                                                                                                                                                         aG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CAT---ATT-AA-AATTT-G-AAA-----A-T--A-GTTGATT--CT---GGCATT--TT-AATCTGTTGCATGGAAACCaa
gi|34310                      :                                                                                                                                                             TTTTTCAAATT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-A-AAA-----C-A--A-TTTGA-----------------TT-GAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34311                      :                                                                                                                                                                            TAAA--ATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAAaa
gi|34312                      :                                                                                                                                                                                        TC-AA-CATTT-C-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCTCCGAAACC
gi|34313                      :                                                                                                                                                                                               ATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---ATCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34314                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-CT-AAGTTAATGCACGGAAAC
gi|34315                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACCaaa
gi|34316                      :                                                                                                                                                                                                TTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-GT-AAGTTATTACATGGAAATCaa
gi|34317                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAAGAAAC
gi|34318                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTAATT--CA---GTCATTT-AT-AAATTATTGCACGGAAATC
gi|34319                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGTTT--CA---GTCATTC-TT-ATGTTATTTCATGGAACCC
gi|34320                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACAGTC-TT-AAGTTATTGCACAAAAA
gi|34321                      :                                                                                                                                                                                                TTC-C-AAA-----A-G--A-TT-GATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACACAAA
gi|34322                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--TA---GACATTC-TT-AAGTTAATGCACAGA
gi|34323                      :                                                                                                                                                                                                TTTAC-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34324                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----G-T--A-TTTAATT--GA---GGAAGTC-TT-AAGTTATTACACGGAAACaa
gi|34325                      :                                                                                                                                                                                                TTT-T-AAA-----ATG--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTGCACGGAAATC
gi|34326                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGAAAATCaa
gi|34327                      :                                                                                                                                                                                                TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CG---GGCATTC-TT-AAGTTTTTGCATGGAAACCaa
gi|34328                      :                                                                                                                                                                                                 TT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGTAACC
gi|34329                      :                                                                                                                                                                                                   -C-ACA-----A-A--A-TTTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAATC





Alignments
lowQualScore                  :                                         2 222  0 00  0 0  00 1  00           0  0 2  111 00 2  1     00    22      0    0 1 11     0    11111  111         0        00  111     0         0  0     0 0   11111 0 11 0       00  000       0  0                   
lowQualScore                  :                                         . ...  . ..  . .  .. .  ..           .  . .  ... .. .  .     ..    ..      .    . . ..     .    .....  ...         .        ..  ...     .         .  .     . .   ..... . .. .       ..  ...       .  .                   
lowQualScore                  :                                         3 111  7 99  7 7  99 3  99           6  6 5  111 88 0  8     88    11      6    6 1 55     6    44444  555         6        88  000     6         5  5     4 4   11111 4 11 4       66  888       5  5                   
consensus                     :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
Reference ( family-319 )      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34235                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTATAACAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TACTT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTAA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTTCACGGAAA
gi|34236                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAACAGG-TC-GTAA---C--GGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-GCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCacca
gi|34237                      :                                    AAAAT------G-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGCAAGATGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-TAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATAATATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCAATC-GT-AAGTTATTGCATGGAAATC
gi|34238                      :                                    AAATT-A---CG-A--CT-T-TT--C-AC--AATTTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCGACAACGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-TA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTACTGCATGGAAACCaa
gi|34239                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TTGT-TT--C-AC--AAATGAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAG-----CT---TAGCTTGTG-TTTTATCA--AT---ATCAA-CATTGTATT-AC-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TATGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
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gi|34241                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-CTGTC-AA--AAATTAAACAG-GC-ATAA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCGCA-ACCC-C-T--TAAAT-CGAA-----CA---TAGCC
gi|34242                      :                                    AAAATTA---AG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTATAACAA--CAAA--GTCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CTAA-----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---GTAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTT-TT-AAGTTATTGCATGGAAATC
gi|34243                      :                                    AAAATTA---CG-C--TT-T-TT--C-AC--CAATTAAAAGG-GC-ATAA---C--TCTATAGCAA--TAAA-AGTTACA-ACCT-C-T--AAAA-----------CT---TAGCCTGTG-TTATGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAC-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTACATGGAAACCaa
gi|34244                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AC--ACATTTAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGA--CAAA-AGTAACA-ACCC-CCT--AAAAT-CAAA-----CT---TAACCTGTA-TTTTGTTA--TT---ATGAA-TATTGTACA-AC-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34245                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-GTAA---C--TCTAGAACGA--CCAA-TGCCACA-AGCC-T-T--CAAAT-CCAA-----CT---TAGCCCGAG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-TATTGTATC-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---AGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGCAAA
gi|34246                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--T-CC--AAATTAAAGGG-GC-ATAT---C--TGTAGTATGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-T-T--AAAAT-CGAG-----CT---TAACCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAA---ATTGTATT-AC-AATTT-A-GAA-----A-G--A-TTTGATT--CG---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGCAACCgca
gi|34247                      :                                    AAAAT-A---CG-A--GT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GT-ACAA---C--TATAGAACAA--AAAA-TGCCACA-ACCC-C-G--AAAAT-CTAA-----CTAAATAGCCTATG-CTTTGTCA--TT---ATAAG-TATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAGGAA
gi|34248                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCACA-ACCC---T--AAAAT-CTAA-----GT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATA--AT---GGTTTTT-TT-AAGGTATTGCACGGAAAC
gi|34249                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-TTTT--T-AC--AAATT------------GA---C--TGTAGAACGA--CAAA-AGCCACA-ATGC-T-T--CAAAT-CAAA-----CT---TAGCCAGCG-TTTTGTC--------ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----G-G--A-----A--------------TC-TT-ATGTTATTGCATGGAAACCta
gi|34250                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TA-T-TT--G-GC--AAATTAAAGGG-GC-ATTA---C--TCTACAACAA--CAAA-TTCCACA-A-CC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---Taa
gi|34251                      :                                    AAAAT-G---TG-A--TT-T-T---C-AC--AAATGAAAGGG-GC-GTAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGACATA-ACCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---TTAAA-CATTGAATC-AA-AATTT-C-AGA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACGGAAA
gi|34252                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAGTTAAAGGG-GC-ATGA---T--TGTATTATGA--CAAA-TGTCACG-ATTC-T-T--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-TA-AATTT-C-GAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---AATATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACgcaa
gi|34253                      :                                    AAAAT-A----G-A--TT-T-TT--C-AC--AAATAAAAGGG-AC-ATAA---AAGTGTAGAATGA--CAAA-TGCCATA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---AAGCCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-TATTGTAAT-GA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-AA-AACTTTTTGCACGGAAACCtaa
gi|34254                      :                                    AAATT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-G----AAAAT-CGAA-----CT---TTACCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTGAT----A---GGCATT--------------CACGGAAACC
gi|34255                      :                                    AAAAG-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTATTATGA--CAAA-TGCCACA-ACAC-T-T--AAACT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTTTTTA-AA-AATTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-TG-AAGTTATTGCATGGAAACCaa
gi|34256                      :                                    AAATT-A---TG-G--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---T--TCTACAATGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--GAAAT-CGAA-----CT---TAGCCCGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT-AG-AATAT-C-AAA-----A-T--A-TTTGCTT--CA---GGCATTC-TT-AAAGTATTGCACGAAAaa
gi|34257                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TC--C-AC--AATTTAAAGGT-GA-A-AA---C--AGTAGAACGA--CAAG-TGCTATA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----TT---CAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AACTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATA--TA---GGCATTC-TT-AAATAATTGCAAGGAAATCctaa
gi|34258                      :                                    AAATT-A---TG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ACAA---T--TCTACAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--GAAAT-CGAA-----CT---AAATC--TG-TTATGTCT--TT---AT-AA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACGGAAACCaa
gi|34259                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AATTTAAAGAT-GA-A-AA---C--AGTATAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CC---CAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AAATT-C-CAA-----A-G--A-TATGATA--TA---GGCATTC-TT-AAATAATTGCAAAGAAATCaa
gi|34260                      :                                         -A---CG-A--TT-T-TT--TTAC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTGCAACGC--CGAA-AGTCACA-TCCC-C-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAATCTGT---TACGTCA--CT---ATAAA-CATTGTATT-AGCAATTT-T--AA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTAGTGCACGGATACCaa
gi|34261                      :                            aaactataAAAGT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-A-AA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCACA-TCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TATTTTCA--CT---ATAAACCATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACaa
gi|34262                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTACTGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-CAT--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTT-------------------ATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-GT-AAGTTATTGCATGTATACC
gi|34263                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAT-TGCCGCA-ACCCGT-T--AAAAG-TGAA-----CT---TAGCCTATG-CTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGTGTAC-TT-Aaa
gi|34264                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGGTGTTACAGTTTC--TGTAGAATGA--CACA-AGTCATA-ACCT-A-T--AAAAT-TGAA-----CT---T-------------GTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-CA-AATTT-
gi|34265                      :                                    AAAAA-A---TT-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAA-GGG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTACATGG
gi|34266                      :                                    AAAAA-A---TT-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAA-GGG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTACATGGgtatcaa
gi|34267                      :                                    AAAGT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AAATTAACGGG-AC-TTAA---C--TGTAGAACGAGACAAA-TGCAACA-ACCC-T-T--TAAAT-CGAA-----CT---CATCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATTAAA-AATTT----AA-----A-GCTA-TTTGATT--CG---GGCATAC-TT-AAGTTATTGCACGGAgtatcaa
gi|34268                      :                                                  --TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-AC-ACAA---C--TCTA-------------------------------AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-GTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AATCTATTTCATGGAAACC
gi|34269                      :                          aaattacactAAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGAG-GA-ATAA---C--TGTAGTTCGA--CAAA-TGCCACA-ACCG-C-T--AAAAT-TGAA-----CT---TGGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---A----------TATT-AA-AATCT-C---A-----A-G--A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT--AGTTATTGCTAGGAAACCaa
gi|34270                      :                                    AAATT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGC--CAA---GTCACA-ACCC-T-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTG-----------------------------G-TTTGATT--CA---GGCATTG-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34271                      :                                    AAAAT-A---TATA--TT-T-TC--C-AC--GAATTAAAGGG-GC-ACAG---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCACA-ACCC-C-T--AAACT-AGAA-----CT---TAGCCTG------TGTCA--TT---ATTAA-TGTTGTGTT-AA-AATTT-T-AAA-----A-T--A-TTTGGGT--AA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCAGGGAAAC
gi|34272                      :                                    AAAAT-AA--CG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAT-GTG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC---T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTGCATGGGTACCtaa
gi|34273                      :                                    AAAAT-AAATCT-A--TT-T-TA--A-AT--AAACTAAATGG-GA-ATAA---C--TGTAGAAAGA--CTGA-TGCTTCA-TCCA-C-T--AAAAT-CTAA-----CT---TATCCTATG-TTTTATCA--T----ATAAA-CGTTGTATT-AA-AAGTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-TAGTTGTTGCACGGAAACCaa
gi|34274                      :                                       AT-A---TG-A--AT-T-TT--C-GC--AAGCTAAATGA-TC-ATAG---C--TGTATAAAGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----GT---TGGCCTGTG-TTTTATCT--GT---ATAAA-CAGTGTTTA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TT
gi|34275                      :                             aaaatatAAAAT-A---CG-GGTTT-T-TT--A-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTGGAACGA--CAAA-TGCCACA-ATCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-CTTTTTTT--TC---CT--G-CTTTTTATT-GG-GGTT----AAT-----A-G--A-CCTGATT--CA---GG
gi|34276                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--TTAC--AAA----AGGG-GC-------------------GA--CCAA-GGCCCCA-ATGC-C-T--TAAAT-AGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTC---TT---ATAAA-CATTGTAAT-AA-A---C-C-AAA-----A-
gi|34277                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACCACCC--CAAA-AGTCA-A-ACCC-C-CCAAAAAT-CAAA-----CT---TATCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C---------A-G--A-TTTGATG--CA---GGCATTCTTT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34278                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AA--AAATAAAAAGG-GC-ACAA---C--TCTACAACG----------CCACA-ATCC-T-G--AAAAT-CAAT-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GTCA-------AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34279                      :                                     AAATGA---CG-A--TA-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGA-GC-ACAA---C--TCTACAACGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-A-A--AAAAA-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAAATACTA-GT-A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCATGGAAAaa
gi|34280                      :                                     AAAT-A---CG-A--TT-T-TT----AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAATATGA--CAAA-TGCCACA-AC
gi|34281                      :                                      AAT-A---CA-T--TT-T-TT--C-AC--AAACTAAATAG-GC-ATAA---C--TATAGAAAAA---AAA-TGCCTCA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TA---ATAGA-CACTGTATG-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGAATTC-TT-AAGGTATTGCAGGGAAA
gi|34282                      :                                       AT-A---GG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GG-GTAA---C--TCAAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC---T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATCATTGTACGGAAACCacccaa
gi|34283                      :                                       AT-A---CG-A--TT-T-TC--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGGAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TT--------TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTTATT--TA---GGCATTT-AA-AAGTTCTTaa
gi|34284                      :                                        T-A---CA-A--TT-T-TT--C-TC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAAC-A--C----TG----------------AAAAT-CCAA-----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TC---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCa
gi|34285                      :                                        T-A---CT-A--TT-T-TT--T-TC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCCACAATGC--CAAA-AGTCACA-ATCC-T-G--AAAAT-TGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGAT----A---GGCATTC-TT-AAGCTATTGCAAGGAAACCaa
gi|34286                      :                                                     T-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTACAACG----------CCA--------------------GAA-----GTA--TAGCCTGTA-TATTGTCA--TT---ATAAA-CATTATATA-CG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---GGCATTC-TT-CAGTTATTGCGTGGAAACCaa
gi|34287                      :                                   tacata-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAATGG-GC-ACAA---C--TCCACAATGT--CAAA-----A-A-ACCT-C-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCCCGGAAACCaa
gi|34288                      :                                                                                                                                                                                                                  --A-TTT--TT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34288                      :                                                                                            acaACAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAACT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-TTTTGTCA--TTTATATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGTTT--CT---GGCATTC-AT-AAGCTATTGCACGGAAACCaaaacaaaaacaaatgccacaacccctaaactcgaacttatcctgtgttttgtcatttatataaacattgtactagaatttgaaaagatttgtttctggcattcataagctattgcacggaaacc
gi|34289                      : acaatttttcaggcattcttaagttattgcatggaaaaaa-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AAATCAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACAATGG--CAAA-AGTCACA-ACCT-T-A--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTAATTGTCCGGAAACC
gi|34290                      :                                                  --TT-T-TT--C-AC--TAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTAC---------AA-TGCCA-------------AAAAT-CAAA-----CT---AAACCTGTA-TTTaa
gi|34291                      :                                     acat-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--TTATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTATAACGC--CAAA-AGTCAGA-ACCC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--GT---GTA
gi|34292                      :                                                -A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--CCAACAATGC--CAAA-AGTCACC-ACCC-C-C--TAAAT-CAAA-----CT---AAGCTTGTG-TTTTGTAA--TT---ACAAA-CATTGCATT-AG-AATTT-C---A-----A-G--A-TTTCATT--TA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACAGAAACC
gi|34293                      :                                               a-A--TT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACAA--CAAAATTCAACA-ACCC-C-T--TAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTCATTA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34294                      :                                                -A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAACTGG-GT-ATAT---C--TGTAAAACAA--CAAT-TGCCACA-GTCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGTGTGTG-TTTTGTCA--TT---AGAAA-CATTGTATA-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CC---GACATTC-AT-GAACTATTGCACAGAAACaa
gi|34295                      :                                                      -T-TG--C-ACGGAAATCAAAA----C-A-AA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCATA-ACCC-T-T--AAAAT-CGCA------T---TAGCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATAAA-TATTATATT-AA-ATTTT-C-AAA-----A---------GATT--CA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACTGAAGC
gi|34296                      :                                                          T--T-AC--AAATTAAAGGT-CC-ACAA---C--TCTACAACCT--CAAA-AGTCACC-ACCC-A----AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----C-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTTATTGCATGGAAACC
gi|34297                      :                                                              -AC--AAGCTAAAGGG-GC-AAAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---AAGCTTGTG-TTCAATCA--TT---GTAAA-CATTGAATT-AC-AATTT-A-AAA-----A-A--G-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTACACGGGAACCaa
gi|34298                      :                                                                C--ATATTAAAGGG--T-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAC-TGCCATA-ATCC-C-T--AATAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTGTTTTTGACA--TC---ATAAA-CA-TGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34299                      :                                                                     ATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATTGTTTT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGAATTT-GT-AAGTTATTGCACAGAAAC
gi|34300                      :                                                                                    AA---C--TGTAGTATGA--CCAA-TGCCACA-ACCC-T-T--AAAAT-CAAA-----CT---AAACGTGTG-TTTGGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AAAAT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATT--TT-AAGTTATTGCGTGAAA
gi|34301                      :                                                                                              TACAACGT--CAAA-AGTCACA-ACCC-C-A--AAATT-CGAA-----CT---TAGTCTGTA-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACGGAAACCcacaa
gi|34302                      :                                                                                                      --CAAA-AGTCACA-ACCC-C-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATGT-C-AAA-----A-G--G-TTTT-TT--TATATGGCATTC-CT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34303                      :                                                                                                                 ACATACCA-A-T--AAATT-TGAA-----CT---TAGTAAGTA-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AGTTT-CAAAA-----A-G--ATTTTTTTT--CA---GGCATTT-TTGAAGTTATTGCACAGAaa
gi|34304                      :                                                                                                                 ACA-AACC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGT---TTTGTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-
gi|34305                      :                                                                                                                    -ACCC-C-TCCAAAATATGAA-----AT---TAGCCTGTG-TTTTGTTG--TT---ATAAA-CACCGTTTT-AA-AGTTT-C-AAA-----A-A--A--TTGATT--CA---GACATTC-TT-
gi|34306                      :                                                                                                                             --AAAAT--GAA-----CT---TGATCTGTA-TTCCATCA--TT---ATTAA-CATTGTCTT-AA-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTTTGTA---GGCAAAC-TT-TTGTTGTTGAAAGGAAACC
gi|34307                      :                                                                                                                             --AGAAT-CGAAGTCCCCT---TA--CTGTG-TTTTGTCC--TC---TTAA----TTATAT-----AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTT--CA---G--ATTA-TT-AAGTTATTGCACTGAAACCa
gi|34308                      :                                                                                                                                       AA-----CT---TAGCATGTA-TTTTGTCA--TT---ATTAA-TATTGTATT-AA-AA--------A-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACAGAAATCaa
gi|34309                      :                                                                                                                                                          aG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CAT---ATT-AA-AATTT-G-AAA-----A-T--A-GTTGATT--CT---GGCATT--TT-AATCTGTTGCATGGAAACCaa
gi|34310                      :                                                                                                                                                              TTTTTCAAATT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-A-AAA-----C-A--A-TTTGA-----------------TT-GAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34311                      :                                                                                                                                                                             TAAA--ATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAAaa
gi|34312                      :                                                                                                                                                                                         TC-AA-CATTT-C-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCTCCGAAACC
gi|34313                      :                                                                                                                                                                                                ATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---ATCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34314                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-CT-AAGTTAATGCACGGAAAC
gi|34315                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACCaaa
gi|34316                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-GT-AAGTTATTACATGGAAATCaa
gi|34317                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAAGAAAC
gi|34318                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTAATT--CA---GTCATTT-AT-AAATTATTGCACGGAAATC
gi|34319                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGTTT--CA---GTCATTC-TT-ATGTTATTTCATGGAACCC
gi|34320                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACAGTC-TT-AAGTTATTGCACAAAAA
gi|34321                      :                                                                                                                                                                                                 TTC-C-AAA-----A-G--A-TT-GATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACACAAA
gi|34322                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--TA---GACATTC-TT-AAGTTAATGCACAGA
gi|34323                      :                                                                                                                                                                                                 TTTAC-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
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gi|34325                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-T-AAA-----ATG--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTGCACGGAAATC
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gi|34327                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CG---GGCATTC-TT-AAGTTTTTGCATGGAAACCaa
gi|34328                      :                                                                                                                                                                                                  TT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGTAACC
gi|34329                      :                                                                                                                                                                                                    -C-ACA-----A-A--A-TTTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAATC





Alignments
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lowQualScore                  :                                         . ...  . ..  . .  .. .  ..           .  . .  ... .. .  .     ..    ..      .    . . ..     .    .....  ...         .        ..  ...     .         .  .     . .   ..... . .. .       ..  ...       .  .                   
lowQualScore                  :                                         3 111  7 99  7 7  99 3  99           6  6 5  111 88 0  8     88    11      6    6 1 55     6    44444  555         6        88  000     6         5  5     4 4   11111 4 11 4       66  888       5  5                   
consensus                     :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
Reference ( family-319 )      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34235                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTATAACAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TACTT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTAA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTTCACGGAAA
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gi|34261                      :                            aaactataAAAGT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-A-AA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCACA-TCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TATTTTCA--CT---ATAAACCATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACaa
gi|34262                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTACTGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-CAT--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTT-------------------ATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-GT-AAGTTATTGCATGTATACC
gi|34263                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAT-TGCCGCA-ACCCGT-T--AAAAG-TGAA-----CT---TAGCCTATG-CTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGTGTAC-TT-Aaa
gi|34264                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGGTGTTACAGTTTC--TGTAGAATGA--CACA-AGTCATA-ACCT-A-T--AAAAT-TGAA-----CT---T-------------GTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-CA-AATTT-
gi|34265                      :                                    AAAAA-A---TT-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAA-GGG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTACATGG
gi|34266                      :                                    AAAAA-A---TT-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAA-GGG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTACATGGgtatcaa
gi|34267                      :                                    AAAGT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AAATTAACGGG-AC-TTAA---C--TGTAGAACGAGACAAA-TGCAACA-ACCC-T-T--TAAAT-CGAA-----CT---CATCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATTAAA-AATTT----AA-----A-GCTA-TTTGATT--CG---GGCATAC-TT-AAGTTATTGCACGGAgtatcaa
gi|34268                      :                                                  --TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-AC-ACAA---C--TCTA-------------------------------AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-GTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AATCTATTTCATGGAAACC
gi|34269                      :                          aaattacactAAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGAG-GA-ATAA---C--TGTAGTTCGA--CAAA-TGCCACA-ACCG-C-T--AAAAT-TGAA-----CT---TGGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---A----------TATT-AA-AATCT-C---A-----A-G--A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT--AGTTATTGCTAGGAAACCaa
gi|34270                      :                                    AAATT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGC--CAA---GTCACA-ACCC-T-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTG-----------------------------G-TTTGATT--CA---GGCATTG-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34271                      :                                    AAAAT-A---TATA--TT-T-TC--C-AC--GAATTAAAGGG-GC-ACAG---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCACA-ACCC-C-T--AAACT-AGAA-----CT---TAGCCTG------TGTCA--TT---ATTAA-TGTTGTGTT-AA-AATTT-T-AAA-----A-T--A-TTTGGGT--AA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCAGGGAAAC
gi|34272                      :                                    AAAAT-AA--CG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAT-GTG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC---T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTGCATGGGTACCtaa
gi|34273                      :                                    AAAAT-AAATCT-A--TT-T-TA--A-AT--AAACTAAATGG-GA-ATAA---C--TGTAGAAAGA--CTGA-TGCTTCA-TCCA-C-T--AAAAT-CTAA-----CT---TATCCTATG-TTTTATCA--T----ATAAA-CGTTGTATT-AA-AAGTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-TAGTTGTTGCACGGAAACCaa
gi|34274                      :                                       AT-A---TG-A--AT-T-TT--C-GC--AAGCTAAATGA-TC-ATAG---C--TGTATAAAGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----GT---TGGCCTGTG-TTTTATCT--GT---ATAAA-CAGTGTTTA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TT
gi|34275                      :                             aaaatatAAAAT-A---CG-GGTTT-T-TT--A-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTGGAACGA--CAAA-TGCCACA-ATCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-CTTTTTTT--TC---CT--G-CTTTTTATT-GG-GGTT----AAT-----A-G--A-CCTGATT--CA---GG
gi|34276                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--TTAC--AAA----AGGG-GC-------------------GA--CCAA-GGCCCCA-ATGC-C-T--TAAAT-AGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTC---TT---ATAAA-CATTGTAAT-AA-A---C-C-AAA-----A-
gi|34277                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACCACCC--CAAA-AGTCA-A-ACCC-C-CCAAAAAT-CAAA-----CT---TATCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C---------A-G--A-TTTGATG--CA---GGCATTCTTT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34278                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AA--AAATAAAAAGG-GC-ACAA---C--TCTACAACG----------CCACA-ATCC-T-G--AAAAT-CAAT-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GTCA-------AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34279                      :                                     AAATGA---CG-A--TA-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGA-GC-ACAA---C--TCTACAACGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-A-A--AAAAA-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAAATACTA-GT-A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCATGGAAAaa
gi|34280                      :                                     AAAT-A---CG-A--TT-T-TT----AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAATATGA--CAAA-TGCCACA-AC
gi|34281                      :                                      AAT-A---CA-T--TT-T-TT--C-AC--AAACTAAATAG-GC-ATAA---C--TATAGAAAAA---AAA-TGCCTCA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TA---ATAGA-CACTGTATG-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGAATTC-TT-AAGGTATTGCAGGGAAA
gi|34282                      :                                       AT-A---GG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GG-GTAA---C--TCAAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC---T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATCATTGTACGGAAACCacccaa
gi|34283                      :                                       AT-A---CG-A--TT-T-TC--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGGAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TT--------TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTTATT--TA---GGCATTT-AA-AAGTTCTTaa
gi|34284                      :                                        T-A---CA-A--TT-T-TT--C-TC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAAC-A--C----TG----------------AAAAT-CCAA-----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TC---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCa
gi|34285                      :                                        T-A---CT-A--TT-T-TT--T-TC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCCACAATGC--CAAA-AGTCACA-ATCC-T-G--AAAAT-TGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGAT----A---GGCATTC-TT-AAGCTATTGCAAGGAAACCaa
gi|34286                      :                                                     T-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTACAACG----------CCA--------------------GAA-----GTA--TAGCCTGTA-TATTGTCA--TT---ATAAA-CATTATATA-CG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---GGCATTC-TT-CAGTTATTGCGTGGAAACCaa
gi|34287                      :                                   tacata-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAATGG-GC-ACAA---C--TCCACAATGT--CAAA-----A-A-ACCT-C-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCCCGGAAACCaa
gi|34288                      :                                                                                                                                                                                                                  --A-TTT--TT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34288                      :                                                                                            acaACAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAACT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-TTTTGTCA--TTTATATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGTTT--CT---GGCATTC-AT-AAGCTATTGCACGGAAACCaaaacaaaaacaaatgccacaacccctaaactcgaacttatcctgtgttttgtcatttatataaacattgtactagaatttgaaaagatttgtttctggcattcataagctattgcacggaaacc
gi|34289                      : acaatttttcaggcattcttaagttattgcatggaaaaaa-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AAATCAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACAATGG--CAAA-AGTCACA-ACCT-T-A--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTAATTGTCCGGAAACC
gi|34290                      :                                                  --TT-T-TT--C-AC--TAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTAC---------AA-TGCCA-------------AAAAT-CAAA-----CT---AAACCTGTA-TTTaa
gi|34291                      :                                     acat-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--TTATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTATAACGC--CAAA-AGTCAGA-ACCC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--GT---GTA
gi|34292                      :                                                -A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--CCAACAATGC--CAAA-AGTCACC-ACCC-C-C--TAAAT-CAAA-----CT---AAGCTTGTG-TTTTGTAA--TT---ACAAA-CATTGCATT-AG-AATTT-C---A-----A-G--A-TTTCATT--TA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACAGAAACC
gi|34293                      :                                               a-A--TT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACAA--CAAAATTCAACA-ACCC-C-T--TAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTCATTA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34294                      :                                                -A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAACTGG-GT-ATAT---C--TGTAAAACAA--CAAT-TGCCACA-GTCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGTGTGTG-TTTTGTCA--TT---AGAAA-CATTGTATA-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CC---GACATTC-AT-GAACTATTGCACAGAAACaa
gi|34295                      :                                                      -T-TG--C-ACGGAAATCAAAA----C-A-AA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCATA-ACCC-T-T--AAAAT-CGCA------T---TAGCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATAAA-TATTATATT-AA-ATTTT-C-AAA-----A---------GATT--CA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACTGAAGC
gi|34296                      :                                                          T--T-AC--AAATTAAAGGT-CC-ACAA---C--TCTACAACCT--CAAA-AGTCACC-ACCC-A----AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----C-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTTATTGCATGGAAACC
gi|34297                      :                                                              -AC--AAGCTAAAGGG-GC-AAAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---AAGCTTGTG-TTCAATCA--TT---GTAAA-CATTGAATT-AC-AATTT-A-AAA-----A-A--G-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTACACGGGAACCaa
gi|34298                      :                                                                C--ATATTAAAGGG--T-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAC-TGCCATA-ATCC-C-T--AATAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTGTTTTTGACA--TC---ATAAA-CA-TGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34299                      :                                                                     ATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATTGTTTT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGAATTT-GT-AAGTTATTGCACAGAAAC
gi|34300                      :                                                                                    AA---C--TGTAGTATGA--CCAA-TGCCACA-ACCC-T-T--AAAAT-CAAA-----CT---AAACGTGTG-TTTGGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AAAAT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATT--TT-AAGTTATTGCGTGAAA
gi|34301                      :                                                                                              TACAACGT--CAAA-AGTCACA-ACCC-C-A--AAATT-CGAA-----CT---TAGTCTGTA-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACGGAAACCcacaa
gi|34302                      :                                                                                                      --CAAA-AGTCACA-ACCC-C-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATGT-C-AAA-----A-G--G-TTTT-TT--TATATGGCATTC-CT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34303                      :                                                                                                                 ACATACCA-A-T--AAATT-TGAA-----CT---TAGTAAGTA-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AGTTT-CAAAA-----A-G--ATTTTTTTT--CA---GGCATTT-TTGAAGTTATTGCACAGAaa
gi|34304                      :                                                                                                                 ACA-AACC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGT---TTTGTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-
gi|34305                      :                                                                                                                    -ACCC-C-TCCAAAATATGAA-----AT---TAGCCTGTG-TTTTGTTG--TT---ATAAA-CACCGTTTT-AA-AGTTT-C-AAA-----A-A--A--TTGATT--CA---GACATTC-TT-
gi|34306                      :                                                                                                                             --AAAAT--GAA-----CT---TGATCTGTA-TTCCATCA--TT---ATTAA-CATTGTCTT-AA-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTTTGTA---GGCAAAC-TT-TTGTTGTTGAAAGGAAACC
gi|34307                      :                                                                                                                             --AGAAT-CGAAGTCCCCT---TA--CTGTG-TTTTGTCC--TC---TTAA----TTATAT-----AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTT--CA---G--ATTA-TT-AAGTTATTGCACTGAAACCa
gi|34308                      :                                                                                                                                       AA-----CT---TAGCATGTA-TTTTGTCA--TT---ATTAA-TATTGTATT-AA-AA--------A-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACAGAAATCaa
gi|34309                      :                                                                                                                                                          aG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CAT---ATT-AA-AATTT-G-AAA-----A-T--A-GTTGATT--CT---GGCATT--TT-AATCTGTTGCATGGAAACCaa
gi|34310                      :                                                                                                                                                              TTTTTCAAATT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-A-AAA-----C-A--A-TTTGA-----------------TT-GAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34311                      :                                                                                                                                                                             TAAA--ATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAAaa
gi|34312                      :                                                                                                                                                                                         TC-AA-CATTT-C-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCTCCGAAACC
gi|34313                      :                                                                                                                                                                                                ATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---ATCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34314                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-CT-AAGTTAATGCACGGAAAC
gi|34315                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACCaaa
gi|34316                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-GT-AAGTTATTACATGGAAATCaa
gi|34317                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAAGAAAC
gi|34318                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTAATT--CA---GTCATTT-AT-AAATTATTGCACGGAAATC
gi|34319                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGTTT--CA---GTCATTC-TT-ATGTTATTTCATGGAACCC
gi|34320                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACAGTC-TT-AAGTTATTGCACAAAAA
gi|34321                      :                                                                                                                                                                                                 TTC-C-AAA-----A-G--A-TT-GATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACACAAA
gi|34322                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--TA---GACATTC-TT-AAGTTAATGCACAGA
gi|34323                      :                                                                                                                                                                                                 TTTAC-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34324                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----G-T--A-TTTAATT--GA---GGAAGTC-TT-AAGTTATTACACGGAAACaa
gi|34325                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-T-AAA-----ATG--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTGCACGGAAATC
gi|34326                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGAAAATCaa
gi|34327                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CG---GGCATTC-TT-AAGTTTTTGCATGGAAACCaa
gi|34328                      :                                                                                                                                                                                                  TT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGTAACC
gi|34329                      :                                                                                                                                                                                                    -C-ACA-----A-A--A-TTTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAATC


blockSeqs                     :                                         T AAT                T                    T  TTT    G  G           AT             C CA          GTCCC  AAA                                                       ATACT   CT
blockSeqs                     :                                         T A                  T                    T  .      G  A           T              A CC          .      A                                                         .       T 
blockSeqs                     :                                         G .                  .                    C  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  G           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  T           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      A  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  G           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  T           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  T           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  G           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           G              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      G  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  A           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      A  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      G  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    C  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                         . .                  .                    T  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    T  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    C  .      C  T           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    A  .      C  C           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    T  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    T  .      G  A           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    .  .      G  G           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    .  .      C  C           T              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    .  .      G  G           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                              .                    .  .      G  G           A              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                   .  .      G  G           .              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                   .  .      G  G           .              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                      .      .  C           .              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                .           .              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                .           .              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                            .              . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                           . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                           . .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .           .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                         .      .                                                         .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .       . 


blockSeqCons                  :                                    
originalCons                  :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
finalCons                     :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC





Alignments
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lowQualScore                  :                                         . ...  . ..  . .  .. .  ..           .  . .  ... .. .  .     ..    ..      .    . . ..     .    .....  ...         .        ..  ...     .         .  .     . .   ..... . .. .       ..  ...       .  .                   
lowQualScore                  :                                         3 111  7 99  7 7  99 3  99           6  6 5  111 88 0  8     88    11      6    6 1 55     6    44444  555         6        88  000     6         5  5     4 4   11111 4 11 4       66  888       5  5                   
consensus                     :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
Reference ( family-319 )      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTANAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34235                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTATAACAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TACTT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTAA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATGC-TT-AAGTTATTTCACGGAAA
gi|34236                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAACAGG-TC-GTAA---C--GGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-GCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCacca
gi|34237                      :                                    AAAAT------G-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGCAAGATGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-TAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATAATATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCAATC-GT-AAGTTATTGCATGGAAATC
gi|34238                      :                                    AAATT-A---CG-A--CT-T-TT--C-AC--AATTTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCGACAACGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-TA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTACTGCATGGAAACCaa
gi|34239                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TTGT-TT--C-AC--AAATGAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAG-----CT---TAGCTTGTG-TTTTATCA--AT---ATCAA-CATTGTATT-AC-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TATGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34240                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT----AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAAC-----AAA-TGCCACA-GCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTAATT--TA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACCaa
gi|34241                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-CTGTC-AA--AAATTAAACAG-GC-ATAA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCGCA-ACCC-C-T--TAAAT-CGAA-----CA---TAGCC
gi|34242                      :                                    AAAATTA---AG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTATAACAA--CAAA--GTCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CTAA-----CT---TTGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---GTAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGCATTT-TT-AAGTTATTGCATGGAAATC
gi|34243                      :                                    AAAATTA---CG-C--TT-T-TT--C-AC--CAATTAAAAGG-GC-ATAA---C--TCTATAGCAA--TAAA-AGTTACA-ACCT-C-T--AAAA-----------CT---TAGCCTGTG-TTATGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAC-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTACATGGAAACCaa
gi|34244                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AC--ACATTTAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGA--CAAA-AGTAACA-ACCC-CCT--AAAAT-CAAA-----CT---TAACCTGTA-TTTTGTTA--TT---ATGAA-TATTGTACA-AC-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34245                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-GTAA---C--TCTAGAACGA--CCAA-TGCCACA-AGCC-T-T--CAAAT-CCAA-----CT---TAGCCCGAG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-TATTGTATC-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---AGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGCAAA
gi|34246                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--T-CC--AAATTAAAGGG-GC-ATAT---C--TGTAGTATGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-T-T--AAAAT-CGAG-----CT---TAACCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAA---ATTGTATT-AC-AATTT-A-GAA-----A-G--A-TTTGATT--CG---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGCAACCgca
gi|34247                      :                                    AAAAT-A---CG-A--GT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GT-ACAA---C--TATAGAACAA--AAAA-TGCCACA-ACCC-C-G--AAAAT-CTAA-----CTAAATAGCCTATG-CTTTGTCA--TT---ATAAG-TATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAGGAA
gi|34248                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ACAA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCACA-ACCC---T--AAAAT-CTAA-----GT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATA--AT---GGTTTTT-TT-AAGGTATTGCACGGAAAC
gi|34249                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-TTTT--T-AC--AAATT------------GA---C--TGTAGAACGA--CAAA-AGCCACA-ATGC-T-T--CAAAT-CAAA-----CT---TAGCCAGCG-TTTTGTC--------ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----G-G--A-----A--------------TC-TT-ATGTTATTGCATGGAAACCta
gi|34250                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TA-T-TT--G-GC--AAATTAAAGGG-GC-ATTA---C--TCTACAACAA--CAAA-TTCCACA-A-CC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---Taa
gi|34251                      :                                    AAAAT-G---TG-A--TT-T-T---C-AC--AAATGAAAGGG-GC-GTAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGACATA-ACCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---TTAAA-CATTGAATC-AA-AATTT-C-AGA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACGGAAA
gi|34252                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAGTTAAAGGG-GC-ATGA---T--TGTATTATGA--CAAA-TGTCACG-ATTC-T-T--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-TA-AATTT-C-GAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---AATATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACgcaa
gi|34253                      :                                    AAAAT-A----G-A--TT-T-TT--C-AC--AAATAAAAGGG-AC-ATAA---AAGTGTAGAATGA--CAAA-TGCCATA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---AAGCCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-TATTGTAAT-GA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-AA-AACTTTTTGCACGGAAACCtaa
gi|34254                      :                                    AAATT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-G----AAAAT-CGAA-----CT---TTACCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTGAT----A---GGCATT--------------CACGGAAACC
gi|34255                      :                                    AAAAG-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTATTATGA--CAAA-TGCCACA-ACAC-T-T--AAACT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTTTTTA-AA-AATTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-TG-AAGTTATTGCATGGAAACCaa
gi|34256                      :                                    AAATT-A---TG-G--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---T--TCTACAATGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--GAAAT-CGAA-----CT---TAGCCCGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGAATT-AG-AATAT-C-AAA-----A-T--A-TTTGCTT--CA---GGCATTC-TT-AAAGTATTGCACGAAAaa
gi|34257                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TC--C-AC--AATTTAAAGGT-GA-A-AA---C--AGTAGAACGA--CAAG-TGCTATA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----TT---CAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AACTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATA--TA---GGCATTC-TT-AAATAATTGCAAGGAAATCctaa
gi|34258                      :                                    AAATT-A---TG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ACAA---T--TCTACAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--GAAAT-CGAA-----CT---AAATC--TG-TTATGTCT--TT---AT-AA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACGGAAACCaa
gi|34259                      :                                    AAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AATTTAAAGAT-GA-A-AA---C--AGTATAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CC---CAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AAATT-C-CAA-----A-G--A-TATGATA--TA---GGCATTC-TT-AAATAATTGCAAAGAAATCaa
gi|34260                      :                                         -A---CG-A--TT-T-TT--TTAC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTGCAACGC--CGAA-AGTCACA-TCCC-C-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAATCTGT---TACGTCA--CT---ATAAA-CATTGTATT-AGCAATTT-T--AA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTAGTGCACGGATACCaa
gi|34261                      :                            aaactataAAAGT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-A-AA---C--TGTAGAACAA--CAAA-TGCCACA-TCCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TATTTTCA--CT---ATAAACCATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACaa
gi|34262                      :                                    AAAAT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTACTGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-CAT--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTT-------------------ATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-GT-AAGTTATTGCATGTATACC
gi|34263                      :                                    AAAAT-A---CA-A--AT-T-TT--C-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAT-TGCCGCA-ACCCGT-T--AAAAG-TGAA-----CT---TAGCCTATG-CTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGTGTAC-TT-Aaa
gi|34264                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGGTGTTACAGTTTC--TGTAGAATGA--CACA-AGTCATA-ACCT-A-T--AAAAT-TGAA-----CT---T-------------GTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-CA-AATTT-
gi|34265                      :                                    AAAAA-A---TT-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAA-GGG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTACATGG
gi|34266                      :                                    AAAAA-A---TT-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAA-GGG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTACATGGgtatcaa
gi|34267                      :                                    AAAGT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AAATTAACGGG-AC-TTAA---C--TGTAGAACGAGACAAA-TGCAACA-ACCC-T-T--TAAAT-CGAA-----CT---CATCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATTAAA-AATTT----AA-----A-GCTA-TTTGATT--CG---GGCATAC-TT-AAGTTATTGCACGGAgtatcaa
gi|34268                      :                                                  --TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-AC-ACAA---C--TCTA-------------------------------AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-GTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AATCTATTTCATGGAAACC
gi|34269                      :                          aaattacactAAAAT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGAG-GA-ATAA---C--TGTAGTTCGA--CAAA-TGCCACA-ACCG-C-T--AAAAT-TGAA-----CT---TGGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---A----------TATT-AA-AATCT-C---A-----A-G--A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT--AGTTATTGCTAGGAAACCaa
gi|34270                      :                                    AAATT-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAATGC--CAA---GTCACA-ACCC-T-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTG-----------------------------G-TTTGATT--CA---GGCATTG-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34271                      :                                    AAAAT-A---TATA--TT-T-TC--C-AC--GAATTAAAGGG-GC-ACAG---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCACA-ACCC-C-T--AAACT-AGAA-----CT---TAGCCTG------TGTCA--TT---ATTAA-TGTTGTGTT-AA-AATTT-T-AAA-----A-T--A-TTTGGGT--AA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCAGGGAAAC
gi|34272                      :                                    AAAAT-AA--CG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAT-GTG-GC-ACAA---C--TCTATAAAGA--AAAA-AGCCACA-ACCC---T--AAAAT-CAAA-----CA---T------TG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-T-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TC-AAGTTACTGCATGGGTACCtaa
gi|34273                      :                                    AAAAT-AAATCT-A--TT-T-TA--A-AT--AAACTAAATGG-GA-ATAA---C--TGTAGAAAGA--CTGA-TGCTTCA-TCCA-C-T--AAAAT-CTAA-----CT---TATCCTATG-TTTTATCA--T----ATAAA-CGTTGTATT-AA-AAGTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-TAGTTGTTGCACGGAAACCaa
gi|34274                      :                                       AT-A---TG-A--AT-T-TT--C-GC--AAGCTAAATGA-TC-ATAG---C--TGTATAAAGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----GT---TGGCCTGTG-TTTTATCT--GT---ATAAA-CAGTGTTTA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TT
gi|34275                      :                             aaaatatAAAAT-A---CG-GGTTT-T-TT--A-AA--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTGGAACGA--CAAA-TGCCACA-ATCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-CTTTTTTT--TC---CT--G-CTTTTTATT-GG-GGTT----AAT-----A-G--A-CCTGATT--CA---GG
gi|34276                      :                                    AAAAT-A---TG-A--TT-T-TT--TTAC--AAA----AGGG-GC-------------------GA--CCAA-GGCCCCA-ATGC-C-T--TAAAT-AGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTC---TT---ATAAA-CATTGTAAT-AA-A---C-C-AAA-----A-
gi|34277                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACCACCC--CAAA-AGTCA-A-ACCC-C-CCAAAAAT-CAAA-----CT---TATCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C---------A-G--A-TTTGATG--CA---GGCATTCTTT-AAGTTATTGCACAGAAACC
gi|34278                      :                                     AATT-A---CA-A--TT-T-TT--C-AA--AAATAAAAAGG-GC-ACAA---C--TCTACAACG----------CCACA-ATCC-T-G--AAAAT-CAAT-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GTCA-------AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34279                      :                                     AAATGA---CG-A--TA-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGA-GC-ACAA---C--TCTACAACGC--CAAA-AGTCACA-ACCC-A-A--AAAAA-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAAATACTA-GT-A-TTTGATT--AA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCATGGAAAaa
gi|34280                      :                                     AAAT-A---CG-A--TT-T-TT----AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAATATGA--CAAA-TGCCACA-AC
gi|34281                      :                                      AAT-A---CA-T--TT-T-TT--C-AC--AAACTAAATAG-GC-ATAA---C--TATAGAAAAA---AAA-TGCCTCA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CA---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TA---ATAGA-CACTGTATG-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGAATTC-TT-AAGGTATTGCAGGGAAA
gi|34282                      :                                       AT-A---GG-A--CT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GG-GTAA---C--TCAAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC---T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATCATTGTACGGAAACCacccaa
gi|34283                      :                                       AT-A---CG-A--TT-T-TC--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGGAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TT--------TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-C--A-TTTTATT--TA---GGCATTT-AA-AAGTTCTTaa
gi|34284                      :                                        T-A---CA-A--TT-T-TT--C-TC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTACAAC-A--C----TG----------------AAAAT-CCAA-----CA---TAGCTTGTG-TTTTGTCA--TC---ATTAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCa
gi|34285                      :                                        T-A---CT-A--TT-T-TT--T-TC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCCACAATGC--CAAA-AGTCACA-ATCC-T-G--AAAAT-TGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGAT----A---GGCATTC-TT-AAGCTATTGCAAGGAAACCaa
gi|34286                      :                                                     T-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTACAACG----------CCA--------------------GAA-----GTA--TAGCCTGTA-TATTGTCA--TT---ATAAA-CATTATATA-CG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTTATT--CA---GGCATTC-TT-CAGTTATTGCGTGGAAACCaa
gi|34287                      :                                   tacata-A---CA-A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAATGG-GC-ACAA---C--TCCACAATGT--CAAA-----A-A-ACCT-C-G--AAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCCCGGAAACCaa
gi|34288                      :                                                                                                                                                                                                                  --A-TTT--TT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34288                      :                                                                                            acaACAAAAA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--AAACT-CGAA-----CT---TATCCTGTG-TTTTGTCA--TTTATATAAA-CATTGTACT-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGTTT--CT---GGCATTC-AT-AAGCTATTGCACGGAAACCaaaacaaaaacaaatgccacaacccctaaactcgaacttatcctgtgttttgtcatttatataaacattgtactagaatttgaaaagatttgtttctggcattcataagctattgcacggaaacc
gi|34289                      : acaatttttcaggcattcttaagttattgcatggaaaaaa-A---CG-A--TT-T-TT--C-AT--AAATCAAAGAG-GC-ACAA---C--TCTACAATGG--CAAA-AGTCACA-ACCT-T-A--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTAATTGTCCGGAAACC
gi|34290                      :                                                  --TT-T-TT--C-AC--TAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--TCTAC---------AA-TGCCA-------------AAAAT-CAAA-----CT---AAACCTGTA-TTTaa
gi|34291                      :                                     acat-A---CG-A--TT-T-TT--C-AC--TTATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TCTATAACGC--CAAA-AGTCAGA-ACCC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--GT---GTA
gi|34292                      :                                                -A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAAAGGG-GC-ACAA---C--CCAACAATGC--CAAA-AGTCACC-ACCC-C-C--TAAAT-CAAA-----CT---AAGCTTGTG-TTTTGTAA--TT---ACAAA-CATTGCATT-AG-AATTT-C---A-----A-G--A-TTTCATT--TA---GGCATTC-TT-AAATTATTTCACAGAAACC
gi|34293                      :                                               a-A--TT-T-TT--C-AC--AAATCAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACAA--CAAAATTCAACA-ACCC-C-T--TAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTCATTA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACATTC-TT-AAGTTATTGCACAGAAACCaa
gi|34294                      :                                                -A--TT-T-TT--C-AC--AAATTAACTGG-GT-ATAT---C--TGTAAAACAA--CAAT-TGCCACA-GTCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGTGTGTG-TTTTGTCA--TT---AGAAA-CATTGTATA-AG-AATTT-G-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CC---GACATTC-AT-GAACTATTGCACAGAAACaa
gi|34295                      :                                                      -T-TG--C-ACGGAAATCAAAA----C-A-AA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGTCATA-ACCC-T-T--AAAAT-CGCA------T---TAGCCTGTG--TTTGTCA--TA---ATAAA-TATTATATT-AA-ATTTT-C-AAA-----A---------GATT--CA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACTGAAGC
gi|34296                      :                                                          T--T-AC--AAATTAAAGGT-CC-ACAA---C--TCTACAACCT--CAAA-AGTCACC-ACCC-A----AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCAGTG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----C-G--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TA-AAGTTATTGCATGGAAACC
gi|34297                      :                                                              -AC--AAGCTAAAGGG-GC-AAAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACTC-C-T--AAAAT-CGAA-----CT---AAGCTTGTG-TTCAATCA--TT---GTAAA-CATTGAATT-AC-AATTT-A-AAA-----A-A--G-TTTGATT--CA---TGCATTC-TT-AAGTTATTACACGGGAACCaa
gi|34298                      :                                                                C--ATATTAAAGGG--T-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAC-TGCCATA-ATCC-C-T--AATAT-CGAA-----CT---TAGCCTGTGTTTTTGACA--TC---ATAAA-CA-TGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34299                      :                                                                     ATTAAAGGG-GC-ATAA---C--TGTAGAACGA--CAAA-TGCCACA-ACCC-C-T--TAAAT-CAAA-----CT---TAGCCTGTG-TTTTGCCA--TT---ATAAA-CATTGTTTT-AA-AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---TGAATTT-GT-AAGTTATTGCACAGAAAC
gi|34300                      :                                                                                    AA---C--TGTAGTATGA--CCAA-TGCCACA-ACCC-T-T--AAAAT-CAAA-----CT---AAACGTGTG-TTTGGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATA-AA-AAAAT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--TA---GGCATT--TT-AAGTTATTGCGTGAAA
gi|34301                      :                                                                                              TACAACGT--CAAA-AGTCACA-ACCC-C-A--AAATT-CGAA-----CT---TAGTCTGTA-TTTTGTCA--TT---ATGAA-CATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGATT--TA---GGCATTC-TT-AATTTATTGCACGGAAACCcacaa
gi|34302                      :                                                                                                      --CAAA-AGTCACA-ACCC-C-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGTCTGTG-TTTTATCA--TT---ATAAA-CATTGTATC-AA-AATGT-C-AAA-----A-G--G-TTTT-TT--TATATGGCATTC-CT-AAGTTATTGCACGGAAACCaa
gi|34303                      :                                                                                                                 ACATACCA-A-T--AAATT-TGAA-----CT---TAGTAAGTA-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CATTGTATT-AA-AGTTT-CAAAA-----A-G--ATTTTTTTT--CA---GGCATTT-TTGAAGTTATTGCACAGAaa
gi|34304                      :                                                                                                                 ACA-AACC-T-G--AAAAT-CGAA-----CT---TAGCCTGT---TTTGTCA--CT---ATAAA-TATTGTATT-AG-AATTT-C-AAA-----A-G--A-
gi|34305                      :                                                                                                                    -ACCC-C-TCCAAAATATGAA-----AT---TAGCCTGTG-TTTTGTTG--TT---ATAAA-CACCGTTTT-AA-AGTTT-C-AAA-----A-A--A--TTGATT--CA---GACATTC-TT-
gi|34306                      :                                                                                                                             --AAAAT--GAA-----CT---TGATCTGTA-TTCCATCA--TT---ATTAA-CATTGTCTT-AA-CATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTTTGTA---GGCAAAC-TT-TTGTTGTTGAAAGGAAACC
gi|34307                      :                                                                                                                             --AGAAT-CGAAGTCCCCT---TA--CTGTG-TTTTGTCC--TC---TTAA----TTATAT-----AATTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGCTT--CA---G--ATTA-TT-AAGTTATTGCACTGAAACCa
gi|34308                      :                                                                                                                                       AA-----CT---TAGCATGTA-TTTTGTCA--TT---ATTAA-TATTGTATT-AA-AA--------A-----A-G--A-CTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAATTATTGCACAGAAATCaa
gi|34309                      :                                                                                                                                                          aG-TTTTGTCA--TT---ATAAA-CAT---ATT-AA-AATTT-G-AAA-----A-T--A-GTTGATT--CT---GGCATT--TT-AATCTGTTGCATGGAAACCaa
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gi|34311                      :                                                                                                                                                                             TAAA--ATTGTATT-AA-AATTT-C-AAA-----A-T--A-TTCGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACGGAAAaa
gi|34312                      :                                                                                                                                                                                         TC-AA-CATTT-C-TAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCTCCGAAACC
gi|34313                      :                                                                                                                                                                                                ATTC-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---ATCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAAaa
gi|34314                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-CT-AAGTTAATGCACGGAAAC
gi|34315                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGGAAACCaaa
gi|34316                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-A-AAA-----A-T--A-TTTGATT--GA---GGCATTC-GT-AAGTTATTACATGGAAATCaa
gi|34317                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TCTGATT--CA---AGCATTC-TT-AAGTTACTGCAAAGAAAC
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gi|34319                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-T--A-TTTGTTT--CA---GTCATTC-TT-ATGTTATTTCATGGAACCC
gi|34320                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GACAGTC-TT-AAGTTATTGCACAAAAA
gi|34321                      :                                                                                                                                                                                                 TTC-C-AAA-----A-G--A-TT-GATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCACACAAA
gi|34322                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--TA---GACATTC-TT-AAGTTAATGCACAGA
gi|34323                      :                                                                                                                                                                                                 TTTAC-AAA-----A-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTT-TT-AAGTTATTGCACGGAAACC
gi|34324                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----G-T--A-TTTAATT--GA---GGAAGTC-TT-AAGTTATTACACGGAAACaa
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gi|34326                      :                                                                                                                                                                                                 TTT-C-AAA-----T-G--A-TTTGATT--CA---GGCATTC-TT-AAGTTATTGCATGAAAATCaa
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