lowQualScore : 0 6 0 44444 00 00 0000 11 00 1 11 222 66666666 222222 11 1 111 1
lowQualScore : . . . ..... .. .. .... .. .. . .. ... ........ ...... .. . ... .
lowQualScore : 5 6 4 55555 66 66 9999 88 99 4 00 555 22222222 111111 00 0 999 1
consensus : ACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
Reference ( gi|61464 ) : ACAAGAGG-CCCATGGACC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-C------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61395 : ACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAT----G--GTCCCCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C---TA-T------A------T--GAAACTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61396 : aACAAGAGG-CCCACGG-CC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---TC-TGTCCT
gi|61397 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTTACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TTCTGCCTT
gi|61408 : aACAAGAGG-CCCATGGTCC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CAAAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATGTCTTTTC-CAACT---TT-TGTC
gi|61401 : aACAACAGG-CCAATGGGCC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAC-AG--C---TA-T------A------T--GAGTCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61402 : aACAAGAGG-TCCATGGGCC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CTTAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TAT
gi|61398 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--ATCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---GC-TGTCCT
gi|61410 : aACAAGAGG-CTC-TGAACC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-CATGTATA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61405 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CCGAA-AG--C---AA-T------A------T--GAAACTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61407 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTTAT----G--GTCATCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATTTATTTTT-AAACT---TT-TGTC
gi|61412 : aACAAGTTG-CCCATGAGCC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-A------A------C--AAATCTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61409 : aACAAGAAG-CCCATGGGCC-TTAAT----G--GTCACCC--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61399 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACAA--CATAA-AG--C---TG-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACA---TA-TGTC
gi|61411 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAT----A--GTCACCT--GAC----TATCCTTG---------ATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-CGACT---TT-TGTCCT
gi|61465 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTCG--ATGA--CATAA-AG--T---TA-T------A------T--GAATCTGTTTTC----CT---TC-TGTCCT
gi|61413 : ACAAATGG-CCCATGGGTC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTAGATTC-CAACT---TT-TATC
gi|61466 : aACAAGAGG-CTCCTGGGCC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACGA--CATAA-AG--C---TG-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TC-TGT
gi|61404 : ACAAGGGG-CCCAGGGGCC-TTAGC----G--GTCACCT--GAT----TAACTTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTT-CAACT---TT-TGTC
gi|61406 : aACAAGGAG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--G---TT-T------A------T--AAATCTATTTTC-CAACT---TT-TATC
gi|61415 : aACAAGAGT-CCCATGGGCC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTGT-CAA
gi|61414 : aACAAAAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--ATCATCA--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTAATTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61416 : aACAAGAGG-CCCATTGGCC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATGA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTA-TGTCT---TT-TG
gi|61417 : aATAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACTT--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTAT
gi|61418 : aACAAGATA-ACCATGGGCC-TAAAC----G--GTCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTGTTTTC-CAAGTTCATC-TGTCCT
gi|61420 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAG----G--GTCACCT--GATTATCTATCCATG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCT
gi|61468 : aACAAGTGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--ATCACCA--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------C------T--GAATCTAT
gi|61422 : ACAAGAGA-CCCATGGGCA-TTAAC----G--GTCACTT--GAT----TATCTTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-C------A------T--GAA-CTA
gi|61423 : aACAAGAAG-CCTATGGATC-TTAAC----G--GTCCCCT--GAT----TATATGTG--ATGA--CATAA-AC--C---TA-T------A------T--GAATCTTTTTTC-TAACT---AT-AGTC
gi|61421 : aACAAGAGA-CTCATGGTCT-TAAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAA-AA--C----A-T------A------T--GAATCTGTTT-----ACT---TT-TGTC
gi|61424 : aACAAGAGG-CCTATGGCCC-TTTAG----G--ATCACCT--TAT----TATCCTTA--ATGA--TA-GA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61427 : aACAAGAGA-GCCATGGGCT-TTAAC----G--GTCACTT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C---TATT------T------T--GAATCTA
gi|61425 : aACAAGAGG-CCTTTGGCTC-TTTAC----G--ATCACCT--TGT----TATCCGTA--ATGA--TA-GA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61429 : aACAAGTGA-CCTATTGGTC-TCAAC----G--GTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATAATC-CA
gi|61430 : aACAAGTGA-CCTACTGGCC-TCAAC----G--ATCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61432 : aACAAATGA-CCTATTGGCC-TCAAC----G--GTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C---TT-T------A------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61438 : aACAAGAGG-CCCATGGGTC-TTTCTTTTCG--GTCAGCT--GAG----TATCCTTGCAATAA--CATAA-AG--C---TA-C------A------T--
gi|61436 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--GTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T---CA-C------A------T--AAATCTATT
gi|61435 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--GTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T---CA-C------A------T--AAATCTATT
gi|61469 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61433 : ACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61394 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61434 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61449 : aACAAGAGG-CCAATGGACC-TTAAC----G--GCCACCT--GAT----TATCC
gi|61403 : aACAAGAGG-CCCTTGGGCC-TTAAT----G--ATCACCT--GAT----TATCC
gi|61455 : aACAAGAGG-TCCATA-ACCGTTTAT----G--GTCACCT--GGT----TATCCTTG--ATGA--C
gi|61452 : aACAAGAGG-CCCGTGGACC-TTAAC----G--GTCATTT--GAT----TATCC
gi|61472 : aACAAGAAG-CCCATGGGCT-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61471 : ACAAGAAG-CCCATGGGCT-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61470 : ACAAGAAG-CCCATGGGCT-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61441 : ACAAAAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61440 : aACAAGAGA-CCCATGGGTC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61439 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--ATCACCT--GAT----TATCC
gi|61451 : aATAAGAGG-CCCATGAACC-TTAAC----G--GTAACCT--GAT----TATCCT
gi|61442 : aACAAGAGG-CCAATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61445 : aATAAGAGA-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61444 : aACAAGAGG-CCCATGAGCC-TTAAC----G--GTCACCT--AAT----TATC
gi|61443 : aACAAGAGG-CCCATGAGCC-TTAAC----G--GTCACCT--AAT----TATC
gi|61467 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAT----G--GTCACCT--GA
gi|61476 : ACAAGAGG-CCCATGG-CT-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61437 : ACAAGAGG-CCTGTAGGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCC--------A--AATAATAT--T---CA-T------A------T--AAGTCTATT
gi|61473 : aACAAAAAG-CCCATGGGCT-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61446 : ACAAGAGG-CCAATGGGCC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61447 : aACTAGAGG-CCCATGGGCC-TTATC----G--GTCACCT--GAT----TATCC
gi|61457 : aACAAGAGG-CCCATAGACC-TTAAC----A--GTCACCTCAGAT----TATC
gi|61474 : aACAAGAGG-CTCATGGGCC-TTAAC----G--GCAACCT--GAT----TATCC
gi|61448 : ACCAGAGG-CCCATTGGTT-TTAAC----G--GTCGCCG--GAG----TATCCTTGCAATGA--CATAA-A
gi|61475 : aACAAGAGG-CCCATGGGCT-TTAAC----A--GTAACCT--GAT----TATCC
gi|61450 : ACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----G--GTCACCA--TAT----TATC
gi|61454 : aACAAGAGG-CACATGGGCC-TTAAC----A--ATCACAT--GAT----TATC--------AA--AAAAACAG--T---TA-C------A------T--AAGTCTATT
gi|61477 : aACAAGAGG-CCCATGGGCC-TTAAC----A--GTCATCT--GAT----T
gi|61463 : ACAAGATA-CCCATGGACC-TTATC----G--GTCACTT--GCA----TATCCTTG--------CA-AA-A--------A-C------A------T---AATCTATCT
gi|61458 : aACGAGCGG-TACCTGAGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAG----TATCC-TG--AGTATCCATAA-AA--CATTTA-C------A------T--AAGTCTATTg
gi|61456 : aACAAGAGG-CCCATAGGAC-TAAAC----G--GTCGCCT--GAT----TATCC
gi|61400 : aACAGGAGG-CCAATGGACC-TTACC----T--GTCACCT--GAT----TATC
gi|61478 : aACAAGAGG-CCCATGGG-C-TTAAC----G--GTCACCT--GAG----AATCC
gi|61459 : ACAAGAGA-CCCATGGGTC-TTCAC----G--CTCACCT--GAT----TATC
gi|61460 : aACAAGAAG-CCCATGGGCC-TTAAC----GAGGTC--CT--GAT----TATCC
gi|61461 : aACAAGAGG-CTCATGGGCT-GCAAC----T--GTCACTG--GAC----AATCCTTG--ATGA--C
gi|61419 : aCAAGAAG-ACCATGGGCC-TTAAC----G--GCCACCT--GAT----TATACTTG--ATGA--CATAA-AGATA---TA-T------A------T--GAATCTATCTTC-CAAAT---TT-TGTC
gi|61453 : agCAAGAGG-TACATGGGCC-TTAAC----A--GTCACCT--GAT----TAT----------A--CAAAA-AA--CATTCA-C------A------T--AAATCTATT
gi|61479 : agCAAGAAG-CCCATGGGTT-TTATC----A--GTCACCT--GAT----TATCCACA--AT-A--CAT
gi|61426 : AAGAGGACCTA-GGGTA-TTAAC----G--ATCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TAAAA-AG--T---TA-T------A------T--GAATCTATTTTTATAACT---TT-TGTACT
gi|61428 : aagAAGAGG-CATATGGTCC-TTAAC----G--GTCACAT--AAT----TCTCCTTG--ACGG--CATAA-AG--C---TA-T------G------TAAGAAACTA-TTTC-TAACT---TT-TGTC
gi|61480 : aaaAAGAGG-CCTATTG-CC-TTAAT----G--GTCACCT---------------TG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTAT
gi|61462 : AATAGG-CCCATGG--------------------CCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--CA----------------------------------ATCTATTTTT-CAACT---TT-CGTCCT
gi|61481 : aaaAAGAGG-CCCATGGGCC-TAAAC----A--GTCACCT--GAT----T
gi|61482 : AGAGG-CACATGAGCC-TTAAC----G--GTCACCG--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTAT
gi|61483 : G-CCTATAAGCC-TTAAC----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--TATAA-AG--T---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-AAACT---TT-TGT
gi|61484 : CCATGGGCC-TTAAC----G--GTCATCT--GAT----TGTCCATG--ATTA--CATAA-AT--C---TA-C------ATGTTTTT--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61485 : CC-TTAAT----G--GTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61486 : cacaagCC-TCAAC----G--GTCATCT--GAT----AATTTTTA--ATGA--CATAA-AA--C---TA-T------A------T--AAATTTATGATC-CA
gi|61488 : -TCAAC----A--GTCAACT--TAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61487 : -TTAAC----A--GTCACCT--GAT----CATCCTTG--ATGA--CCCAA-AG--
gi|61431 : --GTCACCA--AAT----TATCTTTA--ATGA--CA--A-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
gi|61489 : aacaagaaaccaact--GTCACCA--AAT----TATTTTTA--ATGA--CA--A-AG--C---TA-T------A------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
Alignments
lowQualScore : 0 0000 00 00 0000 22 00 1 00 444444 0 222222 11 1 111 1
lowQualScore : . .... .. .. .... .. .. . .. ...... . ...... .. . ... .
lowQualScore : 4 9999 66 66 9999 77 99 4 99 555555 7 000000 00 0 999 1
consensus : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
Reference ( family-317 ) : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61394 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61395 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCCCCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C------TA-TA------T--GAAACTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61396 : aACAAGAGG-CCCACGG-CCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---TC-TGTCCT
gi|61397 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTTACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TTCTGCCTT
gi|61398 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GATCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---GC-TGTCCT
gi|61399 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACAA--CATAA-AG--C------TG-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACA---TA-TGTC
gi|61400 : aACAGGAGG-CCAATGGACCTTAC----C--TGTCACCT--GAT----TATC
gi|61401 : aACAACAGG-CCAATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAC-AG--C------TA-TA------T--GAGTCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61402 : aACAAGAGG-TCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CTTAA-AG--C------TA-TA------T--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TAT
gi|61403 : aACAAGAGG-CCCTTGGGCCTTAA----T--GATCACCT--GAT----TATCC
gi|61404 : aACAAGGGG-CCCAGGGGCCTTAG----C--GGTCACCT--GAT----TAACTTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTT-CAACT---TT-TGTC
gi|61405 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CCGAA-AG--C------AA-TA------T--GAAACTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61406 : aACAAGGAG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--G------TT-TA------T--AAATCTATTTTC-CAACT---TT-TATC
gi|61407 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTTA----T--GGTCATCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATTTATTTTT-AAACT---TT-TGTC
gi|61408 : aACAAGAGG-CCCATGGTCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CAAAA-AG--C------TA-TA------T--GAATGTCTTTTC-CAACT---TT-TGTC
gi|61409 : aACAAGAAG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCC--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61410 : aACAAGAGG-CTC-TGAACCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--CTACATGTA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61411 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--AGTCACCT--GAC----TATCCTTG---------ATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CGACT---TT-TGTCCT
gi|61412 : aACAAGTTG-CCCATGAGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-AA------C--AAATCTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61413 : aACAAATGG-CCCATGGGTCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAGATTC-CAACT---TT-TATC
gi|61414 : aACAAAAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AATCATCA--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAATTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61415 : aACAAGAGT-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTGT-CAA
gi|61416 : aACAAGAGG-CCCATTGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATGA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTA-TGTCT---TT-TG
gi|61417 : aATAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61418 : aACAAGATA-ACCATGGGCCTAAA----C--GGTCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAAGTTCATC-TGTCCT
gi|61419 : aCAAGAAG-ACCATGGGCCTTAA----C--GGCCACCT--GAT----TATACTTG--ATGA--CATAA-AGATA------TA-TA------T--GAATCTATCTTC-CAAAT---TT-TGTC
gi|61420 : agACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----G--GGTCACCT--GATTATCTATCCATG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCT
gi|61421 : aACAAGAGA-CTCATGGTCTTAAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAA-AA--C-------A-TA------T--GAATCTGTTT-----ACT---TT-TGTC
gi|61422 : aACAAGAGA-CCCATGGGCATTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATCTTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--GAA-CTA
gi|61423 : aACAAGAAG-CCTATGGATCTTAA----C--GGTCCCCT--GAT----TATATGTG--ATGA--CATAA-AC--C------TA-TA------T--GAATCTTTTTTC-TAACT---AT-AGTC
gi|61424 : aACAAGAGG-CCTATGGCCCTTTA----G--GATCACCT--TAT----TATCCTTA--ATGA--TA-GA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61425 : aACAAGAGG-CCTTTGGCTCTTTA----C--GATCACCT--TGT----TATCCGTA--ATGA--TA-GA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61426 : aAAGAGGACCTA-GGGTATTAA----C--GATCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TAAAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTATTTTTATAACT---TT-TGTACT
gi|61427 : aagACAAGAGA-GCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C------TATTT------T--GAATCTA
gi|61428 : aAAGAGG-CATATGGTCCTTAA----C--GGTCACAT--AAT----TCTCCTTG--ACGG--CATAA-AG--C------TA-TG------TAAGAAACTA-TTTC-TAACT---TT-TGTC
gi|61429 : aaaACAAGTGA-CCTATTGGTCTCAA----C--GGTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATAATC-CA
gi|61430 : aACAAGTGA-CCTACTGGCCTCAA----C--GATCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61431 : aAA----C--TGTCACCA--AAT----TATCTTTA--ATGA--CA--A-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
gi|61432 : aacaagaaaccACAAATGA-CCTATTGGCCTCAA----C--GGTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TT-TA------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61433 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61434 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61435 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T------CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61436 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T------CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61437 : aACAAGAGG-CCTGTAGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC--------A--AATAATAT--T------CA-TA------T--AAGTCTATT
gi|61438 : aACAAGAGG-CCCATGGGTCTTTCTTTTC--GGTCAGCT--GAG----TATCCTTGCAATAA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--
gi|61439 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AATCACCT--GAT----TATCC
gi|61440 : aACAAGAGA-CCCATGGGTCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61441 : aACAAAAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61442 : aACAAGAGG-CCAATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61443 : aACAAGAGG-CCCATGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--AAT----TATC
gi|61444 : aACAAGAGG-CCCATGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--AAT----TATC
gi|61445 : aATAAGAGA-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61446 : aACAAGAGG-CCAATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATC
gi|61447 : aACTAGAGG-CCCATGGGCCTTAT----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61448 : aACCAGAGG-CCCATTGGTTTTAA----C--GGTCGCCG--GAG----TATCCTTGCAATGA--CATAA-A
gi|61449 : aACAAGAGG-CCAATGGACCTTAA----C--GGCCACCT--GAT----TATCC
gi|61450 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCA--TAT----TATC
gi|61451 : aATAAGAGG-CCCATGAACCTTAA----C--GGTAACCT--GAT----TATCCT
gi|61452 : aACAAGAGG-CCCGTGGACCTTAA----C--GGTCATTT--GAT----TATCC
gi|61453 : aCAAGAGG-TACATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TAT----------A--CAAAA-AA--CATT---CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61454 : agACAAGAGG-CACATGGGCCTTAA----C--AATCACAT--GAT----TATC--------AA--AAAAACAG--T------TA-CA------T--AAGTCTATT
gi|61455 : aACAAGAGG-TCCATAACCGTTTA----T--GGTCACCT--GGT----TATCCTTG--ATGA--C
gi|61456 : aACAAGAGG-CCCATAGGACTAAA----C--GGTCGCCT--GAT----TATCC
gi|61457 : aACAAGAGG-CCCATAGACCTTAA----C--AGTCACCTCAGAT----TATC
gi|61458 : aACGAGCGG-TACCTGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAG----TATCC-TG--AGTATCCATAA-AA--CATT---TA-CA------T--AAGTCTATT
gi|61459 : aACAAGAGA-CCCATGGGTCTTCA----C--GCTCACCT--GAT----TATC
gi|61460 : aACAAGAAG-CCCATGGGCCTTAA----CGAGGT--CCT--GAT----TATCC
gi|61461 : aACAAGAGG-CTCATGGGCTGCAA----C--TGTCACTG--GAC----AATCCTTG--ATGA--C
gi|61462 : aAATAGG-CCCATGG-------------------CCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--C-------------------------------AATCTATTTTT-CAACT---TT-CGTCCT
gi|61463 : aaaACAAGATA-CCCATGGACCTTAT----C--GGTCACTT--GCA----TATCCTTGCAAAAA--CAT-A-AT--C------TA-TC------T--G
gi|61464 : aACAAGAGG-CCCATGGACCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61465 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTCG--ATGA--CATAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC----CT---TC-TGTCCT
gi|61466 : ACAAGAGG-CTCCTGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACGA--CATAA-AG--C------TG-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TC-TGT
gi|61467 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GA
gi|61468 : ACAAGTGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GATCACCA--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TC------T--GAATCTAT
gi|61469 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61470 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61471 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61472 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61473 : ACAAAAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61474 : ACAAGAGG-CTCATGGGCCTTAA----C--GGCAACCT--GAT----TATCC
gi|61475 : ACAAGAGG-CCCATGGGCTTTAA----C--AGTAACCT--GAT----TATCC
gi|61476 : ACAAGAGG-CCCATGG-CTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61477 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----T
gi|61478 : ACAAGAGG-CCCATGGG-CTTAA----C--GGTCACCT--GAG----AATCC
gi|61479 : CAAGAAG-CCCATGGGTTTTAT----C--AGTCACCT--GAT----TATCCACA--AT-A--CAT
gi|61480 : AAGAGG-CCTATTG-CCTTAA----T--GGTCACCT---------------TG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61481 : AAGAGG-CCCATGGGCCTAAA----C--AGTCACCT--GAT----T
gi|61482 : AGAGG-CACATGAGCCTTAA----C--GGTCACCG--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61483 : G-CCTATAAGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--TATAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-AAACT---TT-TGT
gi|61484 : CCATGGGCCTTAA----C--GGTCATCT--GAT----TGTCCATG--ATTA--CATAA-AT--C------TA-CATGTTTTT--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61485 : CACAAGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61486 : CCTCAA----C--GGTCATCT--GAT----AATTTTTA--ATGA--CATAA-AA--C------TA-TA------T--AAATTTATGATC-CA
gi|61487 : TTAA----C--AGTCACCT--GAT----CATCCTTG--ATGA--CCCAA-AG--
gi|61488 : TCAA----C--AGTCAACT--TAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61489 : AA----C--TGTCACCA--AAT----TATTTTTA--ATGA--CA--A-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
Alignments
lowQualScore : 0 0000 00 00 0000 22 00 1 00 444444 0 222222 11 1 111 1
lowQualScore : . .... .. .. .... .. .. . .. ...... . ...... .. . ... .
lowQualScore : 4 9999 66 66 9999 77 99 4 99 555555 7 000000 00 0 999 1
consensus : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
Reference ( family-317 ) : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61394 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61395 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCCCCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C------TA-TA------T--GAAACTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61396 : aACAAGAGG-CCCACGG-CCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---TC-TGTCCT
gi|61397 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTTACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TTCTGCCTT
gi|61398 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GATCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---GC-TGTCCT
gi|61399 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACAA--CATAA-AG--C------TG-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACA---TA-TGTC
gi|61400 : aACAGGAGG-CCAATGGACCTTAC----C--TGTCACCT--GAT----TATC
gi|61401 : aACAACAGG-CCAATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAC-AG--C------TA-TA------T--GAGTCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61402 : aACAAGAGG-TCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CTTAA-AG--C------TA-TA------T--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TAT
gi|61403 : aACAAGAGG-CCCTTGGGCCTTAA----T--GATCACCT--GAT----TATCC
gi|61404 : aACAAGGGG-CCCAGGGGCCTTAG----C--GGTCACCT--GAT----TAACTTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTT-CAACT---TT-TGTC
gi|61405 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CCGAA-AG--C------AA-TA------T--GAAACTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61406 : aACAAGGAG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--G------TT-TA------T--AAATCTATTTTC-CAACT---TT-TATC
gi|61407 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTTA----T--GGTCATCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATTTATTTTT-AAACT---TT-TGTC
gi|61408 : aACAAGAGG-CCCATGGTCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CAAAA-AG--C------TA-TA------T--GAATGTCTTTTC-CAACT---TT-TGTC
gi|61409 : aACAAGAAG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCC--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61410 : aACAAGAGG-CTC-TGAACCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--CTACATGTA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61411 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--AGTCACCT--GAC----TATCCTTG---------ATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CGACT---TT-TGTCCT
gi|61412 : aACAAGTTG-CCCATGAGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-AA------C--AAATCTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61413 : aACAAATGG-CCCATGGGTCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAGATTC-CAACT---TT-TATC
gi|61414 : aACAAAAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AATCATCA--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAATTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61415 : aACAAGAGT-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTGT-CAA
gi|61416 : aACAAGAGG-CCCATTGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATGA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTA-TGTCT---TT-TG
gi|61417 : aATAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61418 : aACAAGATA-ACCATGGGCCTAAA----C--GGTCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAAGTTCATC-TGTCCT
gi|61419 : aCAAGAAG-ACCATGGGCCTTAA----C--GGCCACCT--GAT----TATACTTG--ATGA--CATAA-AGATA------TA-TA------T--GAATCTATCTTC-CAAAT---TT-TGTC
gi|61420 : agACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----G--GGTCACCT--GATTATCTATCCATG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCT
gi|61421 : aACAAGAGA-CTCATGGTCTTAAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAA-AA--C-------A-TA------T--GAATCTGTTT-----ACT---TT-TGTC
gi|61422 : aACAAGAGA-CCCATGGGCATTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATCTTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--GAA-CTA
gi|61423 : aACAAGAAG-CCTATGGATCTTAA----C--GGTCCCCT--GAT----TATATGTG--ATGA--CATAA-AC--C------TA-TA------T--GAATCTTTTTTC-TAACT---AT-AGTC
gi|61424 : aACAAGAGG-CCTATGGCCCTTTA----G--GATCACCT--TAT----TATCCTTA--ATGA--TA-GA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61425 : aACAAGAGG-CCTTTGGCTCTTTA----C--GATCACCT--TGT----TATCCGTA--ATGA--TA-GA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61426 : aAAGAGGACCTA-GGGTATTAA----C--GATCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TAAAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTATTTTTATAACT---TT-TGTACT
gi|61427 : aagACAAGAGA-GCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C------TATTT------T--GAATCTA
gi|61428 : aAAGAGG-CATATGGTCCTTAA----C--GGTCACAT--AAT----TCTCCTTG--ACGG--CATAA-AG--C------TA-TG------TAAGAAACTA-TTTC-TAACT---TT-TGTC
gi|61429 : aaaACAAGTGA-CCTATTGGTCTCAA----C--GGTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATAATC-CA
gi|61430 : aACAAGTGA-CCTACTGGCCTCAA----C--GATCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61431 : aAA----C--TGTCACCA--AAT----TATCTTTA--ATGA--CA--A-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
gi|61432 : aacaagaaaccACAAATGA-CCTATTGGCCTCAA----C--GGTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TT-TA------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61433 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61434 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61435 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T------CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61436 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T------CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61437 : aACAAGAGG-CCTGTAGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC--------A--AATAATAT--T------CA-TA------T--AAGTCTATT
gi|61438 : aACAAGAGG-CCCATGGGTCTTTCTTTTC--GGTCAGCT--GAG----TATCCTTGCAATAA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--
gi|61439 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AATCACCT--GAT----TATCC
gi|61440 : aACAAGAGA-CCCATGGGTCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61441 : aACAAAAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61442 : aACAAGAGG-CCAATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61443 : aACAAGAGG-CCCATGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--AAT----TATC
gi|61444 : aACAAGAGG-CCCATGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--AAT----TATC
gi|61445 : aATAAGAGA-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61446 : aACAAGAGG-CCAATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATC
gi|61447 : aACTAGAGG-CCCATGGGCCTTAT----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61448 : aACCAGAGG-CCCATTGGTTTTAA----C--GGTCGCCG--GAG----TATCCTTGCAATGA--CATAA-A
gi|61449 : aACAAGAGG-CCAATGGACCTTAA----C--GGCCACCT--GAT----TATCC
gi|61450 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCA--TAT----TATC
gi|61451 : aATAAGAGG-CCCATGAACCTTAA----C--GGTAACCT--GAT----TATCCT
gi|61452 : aACAAGAGG-CCCGTGGACCTTAA----C--GGTCATTT--GAT----TATCC
gi|61453 : aCAAGAGG-TACATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TAT----------A--CAAAA-AA--CATT---CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61454 : agACAAGAGG-CACATGGGCCTTAA----C--AATCACAT--GAT----TATC--------AA--AAAAACAG--T------TA-CA------T--AAGTCTATT
gi|61455 : aACAAGAGG-TCCATAACCGTTTA----T--GGTCACCT--GGT----TATCCTTG--ATGA--C
gi|61456 : aACAAGAGG-CCCATAGGACTAAA----C--GGTCGCCT--GAT----TATCC
gi|61457 : aACAAGAGG-CCCATAGACCTTAA----C--AGTCACCTCAGAT----TATC
gi|61458 : aACGAGCGG-TACCTGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAG----TATCC-TG--AGTATCCATAA-AA--CATT---TA-CA------T--AAGTCTATT
gi|61459 : aACAAGAGA-CCCATGGGTCTTCA----C--GCTCACCT--GAT----TATC
gi|61460 : aACAAGAAG-CCCATGGGCCTTAA----CGAGGT--CCT--GAT----TATCC
gi|61461 : aACAAGAGG-CTCATGGGCTGCAA----C--TGTCACTG--GAC----AATCCTTG--ATGA--C
gi|61462 : aAATAGG-CCCATGG-------------------CCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--C-------------------------------AATCTATTTTT-CAACT---TT-CGTCCT
gi|61463 : aaaACAAGATA-CCCATGGACCTTAT----C--GGTCACTT--GCA----TATCCTTGCAAAAA--CAT-A-AT--C------TA-TC------T--G
gi|61464 : aACAAGAGG-CCCATGGACCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61465 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTCG--ATGA--CATAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC----CT---TC-TGTCCT
gi|61466 : ACAAGAGG-CTCCTGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACGA--CATAA-AG--C------TG-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TC-TGT
gi|61467 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GA
gi|61468 : ACAAGTGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GATCACCA--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TC------T--GAATCTAT
gi|61469 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61470 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61471 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61472 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61473 : ACAAAAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61474 : ACAAGAGG-CTCATGGGCCTTAA----C--GGCAACCT--GAT----TATCC
gi|61475 : ACAAGAGG-CCCATGGGCTTTAA----C--AGTAACCT--GAT----TATCC
gi|61476 : ACAAGAGG-CCCATGG-CTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61477 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----T
gi|61478 : ACAAGAGG-CCCATGGG-CTTAA----C--GGTCACCT--GAG----AATCC
gi|61479 : CAAGAAG-CCCATGGGTTTTAT----C--AGTCACCT--GAT----TATCCACA--AT-A--CAT
gi|61480 : AAGAGG-CCTATTG-CCTTAA----T--GGTCACCT---------------TG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61481 : AAGAGG-CCCATGGGCCTAAA----C--AGTCACCT--GAT----T
gi|61482 : AGAGG-CACATGAGCCTTAA----C--GGTCACCG--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61483 : G-CCTATAAGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--TATAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-AAACT---TT-TGT
gi|61484 : CCATGGGCCTTAA----C--GGTCATCT--GAT----TGTCCATG--ATTA--CATAA-AT--C------TA-CATGTTTTT--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61485 : CACAAGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61486 : CCTCAA----C--GGTCATCT--GAT----AATTTTTA--ATGA--CATAA-AA--C------TA-TA------T--AAATTTATGATC-CA
gi|61487 : TTAA----C--AGTCACCT--GAT----CATCCTTG--ATGA--CCCAA-AG--
gi|61488 : TCAA----C--AGTCAACT--TAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61489 : AA----C--TGTCACCA--AAT----TATTTTTA--ATGA--CA--A-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
blockSeqs : CA T TACATG TGTTTT TCA C
blockSeqs : CA C ATT . . .
blockSeqs : CA . ATT . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
finalCons : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
Alignments
lowQualScore : 0 0000 00 00 0000 22 00 1 00 444444 0 222222 11 1 111 1
lowQualScore : . .... .. .. .... .. .. . .. ...... . ...... .. . ... .
lowQualScore : 4 9999 66 66 9999 77 99 4 99 555555 7 000000 00 0 999 1
consensus : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
Reference ( family-317 ) : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61394 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61395 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCCCCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C------TA-TA------T--GAAACTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61396 : aACAAGAGG-CCCACGG-CCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---TC-TGTCCT
gi|61397 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTTACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TTCTGCCTT
gi|61398 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GATCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAACT---GC-TGTCCT
gi|61399 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACAA--CATAA-AG--C------TG-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACA---TA-TGTC
gi|61400 : aACAGGAGG-CCAATGGACCTTAC----C--TGTCACCT--GAT----TATC
gi|61401 : aACAACAGG-CCAATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAC-AG--C------TA-TA------T--GAGTCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61402 : aACAAGAGG-TCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CTTAA-AG--C------TA-TA------T--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TAT
gi|61403 : aACAAGAGG-CCCTTGGGCCTTAA----T--GATCACCT--GAT----TATCC
gi|61404 : aACAAGGGG-CCCAGGGGCCTTAG----C--GGTCACCT--GAT----TAACTTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTT-CAACT---TT-TGTC
gi|61405 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CCGAA-AG--C------AA-TA------T--GAAACTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61406 : aACAAGGAG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--G------TT-TA------T--AAATCTATTTTC-CAACT---TT-TATC
gi|61407 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTTA----T--GGTCATCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATTTATTTTT-AAACT---TT-TGTC
gi|61408 : aACAAGAGG-CCCATGGTCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CAAAA-AG--C------TA-TA------T--GAATGTCTTTTC-CAACT---TT-TGTC
gi|61409 : aACAAGAAG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCC--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61410 : aACAAGAGG-CTC-TGAACCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--CTACATGTA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61411 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--AGTCACCT--GAC----TATCCTTG---------ATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CGACT---TT-TGTCCT
gi|61412 : aACAAGTTG-CCCATGAGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-AA------C--AAATCTATTTTC-TAACT---TT-TGTCCT
gi|61413 : aACAAATGG-CCCATGGGTCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAGATTC-CAACT---TT-TATC
gi|61414 : aACAAAAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AATCATCA--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAATTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61415 : aACAAGAGT-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTGT-CAA
gi|61416 : aACAAGAGG-CCCATTGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATGA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTA-TGTCT---TT-TG
gi|61417 : aATAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATTCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61418 : aACAAGATA-ACCATGGGCCTAAA----C--GGTCACCT--GAA----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC-CAAGTTCATC-TGTCCT
gi|61419 : aCAAGAAG-ACCATGGGCCTTAA----C--GGCCACCT--GAT----TATACTTG--ATGA--CATAA-AGATA------TA-TA------T--GAATCTATCTTC-CAAAT---TT-TGTC
gi|61420 : agACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----G--GGTCACCT--GATTATCTATCCATG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCT
gi|61421 : aACAAGAGA-CTCATGGTCTTAAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTA--ATGA--CATAA-AA--C-------A-TA------T--GAATCTGTTT-----ACT---TT-TGTC
gi|61422 : aACAAGAGA-CCCATGGGCATTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATCTTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--GAA-CTA
gi|61423 : aACAAGAAG-CCTATGGATCTTAA----C--GGTCCCCT--GAT----TATATGTG--ATGA--CATAA-AC--C------TA-TA------T--GAATCTTTTTTC-TAACT---AT-AGTC
gi|61424 : aACAAGAGG-CCTATGGCCCTTTA----G--GATCACCT--TAT----TATCCTTA--ATGA--TA-GA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61425 : aACAAGAGG-CCTTTGGCTCTTTA----C--GATCACCT--TGT----TATCCGTA--ATGA--TA-GA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-TAACG---TG-TGTC
gi|61426 : aAAGAGGACCTA-GGGTATTAA----C--GATCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--TAAAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTATTTTTATAACT---TT-TGTACT
gi|61427 : aagACAAGAGA-GCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACTT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AA--C------TATTT------T--GAATCTA
gi|61428 : aAAGAGG-CATATGGTCCTTAA----C--GGTCACAT--AAT----TCTCCTTG--ACGG--CATAA-AG--C------TA-TG------TAAGAAACTA-TTTC-TAACT---TT-TGTC
gi|61429 : aaaACAAGTGA-CCTATTGGTCTCAA----C--GGTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATAATC-CA
gi|61430 : aACAAGTGA-CCTACTGGCCTCAA----C--GATCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61431 : aAA----C--TGTCACCA--AAT----TATCTTTA--ATGA--CA--A-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT
gi|61432 : aacaagaaaccACAAATGA-CCTATTGGCCTCAA----C--GGTCACCT--GAA----AATCTTTA--ATGG--CATAA-AG--C------TT-TA------T--GAATCTATGATC-CA
gi|61433 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61434 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61435 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T------CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61436 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----TATCCAAA--A-AA--CAT-------T------CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61437 : aACAAGAGG-CCTGTAGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC--------A--AATAATAT--T------CA-TA------T--AAGTCTATT
gi|61438 : aACAAGAGG-CCCATGGGTCTTTCTTTTC--GGTCAGCT--GAG----TATCCTTGCAATAA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--
gi|61439 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AATCACCT--GAT----TATCC
gi|61440 : aACAAGAGA-CCCATGGGTCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61441 : aACAAAAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61442 : aACAAGAGG-CCAATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61443 : aACAAGAGG-CCCATGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--AAT----TATC
gi|61444 : aACAAGAGG-CCCATGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--AAT----TATC
gi|61445 : aATAAGAGA-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61446 : aACAAGAGG-CCAATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATC
gi|61447 : aACTAGAGG-CCCATGGGCCTTAT----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61448 : aACCAGAGG-CCCATTGGTTTTAA----C--GGTCGCCG--GAG----TATCCTTGCAATGA--CATAA-A
gi|61449 : aACAAGAGG-CCAATGGACCTTAA----C--GGCCACCT--GAT----TATCC
gi|61450 : aACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCA--TAT----TATC
gi|61451 : aATAAGAGG-CCCATGAACCTTAA----C--GGTAACCT--GAT----TATCCT
gi|61452 : aACAAGAGG-CCCGTGGACCTTAA----C--GGTCATTT--GAT----TATCC
gi|61453 : aCAAGAGG-TACATGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TAT----------A--CAAAA-AA--CATT---CA-CA------T--AAATCTATT
gi|61454 : agACAAGAGG-CACATGGGCCTTAA----C--AATCACAT--GAT----TATC--------AA--AAAAACAG--T------TA-CA------T--AAGTCTATT
gi|61455 : aACAAGAGG-TCCATAACCGTTTA----T--GGTCACCT--GGT----TATCCTTG--ATGA--C
gi|61456 : aACAAGAGG-CCCATAGGACTAAA----C--GGTCGCCT--GAT----TATCC
gi|61457 : aACAAGAGG-CCCATAGACCTTAA----C--AGTCACCTCAGAT----TATC
gi|61458 : aACGAGCGG-TACCTGAGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAG----TATCC-TG--AGTATCCATAA-AA--CATT---TA-CA------T--AAGTCTATT
gi|61459 : aACAAGAGA-CCCATGGGTCTTCA----C--GCTCACCT--GAT----TATC
gi|61460 : aACAAGAAG-CCCATGGGCCTTAA----CGAGGT--CCT--GAT----TATCC
gi|61461 : aACAAGAGG-CTCATGGGCTGCAA----C--TGTCACTG--GAC----AATCCTTG--ATGA--C
gi|61462 : aAATAGG-CCCATGG-------------------CCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--C-------------------------------AATCTATTTTT-CAACT---TT-CGTCCT
gi|61463 : aaaACAAGATA-CCCATGGACCTTAT----C--GGTCACTT--GCA----TATCCTTGCAAAAA--CAT-A-AT--C------TA-TC------T--G
gi|61464 : aACAAGAGG-CCCATGGACCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-CA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61465 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTCG--ATGA--CATAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTGTTTTC----CT---TC-TGTCCT
gi|61466 : ACAAGAGG-CTCCTGGGCCTTAA----C--AGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ACGA--CATAA-AG--C------TG-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TC-TGT
gi|61467 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----T--GGTCACCT--GA
gi|61468 : ACAAGTGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GATCACCA--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TC------T--GAATCTAT
gi|61469 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61470 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61471 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61472 : ACAAGAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61473 : ACAAAAAG-CCCATGGGCTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCC
gi|61474 : ACAAGAGG-CTCATGGGCCTTAA----C--GGCAACCT--GAT----TATCC
gi|61475 : ACAAGAGG-CCCATGGGCTTTAA----C--AGTAACCT--GAT----TATCC
gi|61476 : ACAAGAGG-CCCATGG-CTTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATC
gi|61477 : ACAAGAGG-CCCATGGGCCTTAA----C--AGTCATCT--GAT----T
gi|61478 : ACAAGAGG-CCCATGGG-CTTAA----C--GGTCACCT--GAG----AATCC
gi|61479 : CAAGAAG-CCCATGGGTTTTAT----C--AGTCACCT--GAT----TATCCACA--AT-A--CAT
gi|61480 : AAGAGG-CCTATTG-CCTTAA----T--GGTCACCT---------------TG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61481 : AAGAGG-CCCATGGGCCTAAA----C--AGTCACCT--GAT----T
gi|61482 : AGAGG-CACATGAGCCTTAA----C--GGTCACCG--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTAT
gi|61483 : G-CCTATAAGCCTTAA----C--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATAA--TATAA-AG--T------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-AAACT---TT-TGT
gi|61484 : CCATGGGCCTTAA----C--GGTCATCT--GAT----TGTCCATG--ATTA--CATAA-AT--C------TA-CATGTTTTT--GAATATATTTTC-CAACT---TT-TGCC
gi|61485 : CACAAGCCTTAA----T--GGTCACCT--GAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAACTTATTTTC-CATAT---TT-TGTCTT
gi|61486 : CCTCAA----C--GGTCATCT--GAT----AATTTTTA--ATGA--CATAA-AA--C------TA-TA------T--AAATTTATGATC-CA
gi|61487 : TTAA----C--AGTCACCT--GAT----CATCCTTG--ATGA--CCCAA-AG--
gi|61488 : TCAA----C--AGTCAACT--TAT----TATCCTTG--ATGA--CATAA-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---TT-TGTCCT
gi|61489 : AA----C--TGTCACCA--AAT----TATTTTTA--ATGA--CA--A-AG--C------TA-TA------T--GAATCTATTTTC-CAACT---CT-GGTCCT