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lowQualScore                  :                   2       333 5 8888 5     66666  7 7 00000000000000 99   99   999999  99  6 3 88   111 111  111 66666 5  11111111 7 33 88 5  66 555555 5   4444 5   22222     9999999     66 9 9 8  333 666 888  444444  5     22222   0        
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Reference ( gi|140005 )       :               TATGACAACAAA---A-TAA--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-----GGTA-----T--C-A--C--A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----TTTGT--G-A-A-CT---TA--G---CA------TG-TGGAT-----AGATGGCAATAA
gi|139953                     :               TATGGCAACAGA---G-AAA--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-T-G--ATC---G---TG---T-----GAGG-----A--C-A--C--A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACT-----TTTGT--GAA-A-CA---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139996                     :          gttgcTATGGCAACAAA---A-TTG--G-TAATG-----TG-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CA-C-G--ATC---C---TG---T-----GGTA-----A--C-A--C--A-AA--A------A-GAA----T-TCA-----AGCTACA-----TTTGTG-G-A-A-CT---TA--G---CA------TA-TCAAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139956                     :           ttgcTATGGCAACAAA---A-TAT--A-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-C-A--TTC---C---TG---T-----GGTA-----A--T-A--C--A-AA--T------A-GT-----T-GGA-----AGCTACA-----TTTGT--GAA-A-CT---TA--G---CA------TG-TGGTT-----AGAGGGCAATAA
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gi|139993                     :            tgcTATGGCAACAAA---A-TCG--G-TTAAA-----TA-A-C--------------A--GAT--ATA------AC--CT-G-G--ATC---C---TA---C-----AAGA-----A--C-T--C--A-GA--A------GTATA----T-ACA-----AGTTGAG-----TGTAT--GAA-A-CT---TG--C---CA------TG-TGAAT-----AGAgggg
gi|139982                     :            ttgTATGGCATCAAT---A-TAA--A-CAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-----GATA-----
gi|140006                     :         gttggcTATGTCAACAAA---A-TTG--G-TAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--CT-A-G--ATT---C---TG---T-----AGTA-----ac
gi|140003                     :               TATGGCAACATA---A-TTG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---Tac
gi|139981                     :             gcTATGGCAACAAA---T-TTG--G-T----------T---------------------GAT--ATA------AC--CT-A-G--ATC---C---TG---T-----AAGA-----A--C-T--C--A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----TTTAT--T-A-A-acaaggactgagaaagta
gi|139964                     :          gttgcTATGGCAACAAA---A-CAG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--AAA------AC--CT-C-G--A
gi|139984                     :          gttggTATGGCAACAAA---A-TTA--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GC--
gi|139991                     :          gttgcTATGGCAACATA---A-TTG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAA--ATA------GC--GT-G-G--ATC---tacttttgtgaaattttgcatatggatagagagaaataa
gi|139992                     :          gttgcTATGACAATAAA---AATAT--G-TAAAAAA---TA-A-T--------------ATTGGC--AAA------AT--CA-G-G--ATC---C---TG---T-----GATA-----A--C-A--T--A-CA--A------A-GTA----
gi|140000                     :          gttgcTATGGCAACAAA-----TAG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--AT-G-
gi|139954                     :            ttgcATGACAACAAA---A-CTG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---C---TA---T-------TA--------C-A--C--A-AA--A------A-TTA----T-CTA-----ACCTACATTAATTTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TG-TTGAT-----AGAAGGCAATAA
gi|139959                     :          gttgtgATGGCAACACA---A-TTG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------T--AGT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---T---T-----------ATA-----C--C-A--C--A-TA--A------A-TGA----T-CCA-----ACCTACA-----TTCATG-G-A-A-CT---TT--G---CA------T
gi|139986                     :          gttgtcATGGCAACAAA---A-TTG--G-TTAAA-----TG-A-CTGTCTGTCCGTCTTA--GA-----A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-----GGCAA----T--T-A-----A-AA--A------G-GAA----T-GCA-----AGCTAGA-----TTTGTG-G-A-A-TT---TG--A---CA------TG-TGGAT-----AGA
gi|140007                     :          gttgtcATGTCAACTAA---T-TG---G-TAAAA-----TC-A-T--------------A---AC--ACA------AT--CT-G-G--ATC---C---TC---C-----AAGA-----A--C-T--C--A-AA--A------A-GTT----T-TCA-----AGCTGTA-----TTTAT--GAA-A-CT---T
gi|139987                     :                ATGGCAGCAAA---A-TTG--G-TCAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--AT----C---TG---T-------TA----------A--G--A-AA--A------A-GT
gi|139985                     :          gttgccATGGCTACAAA---A-TTG--T-TAAAA-----TT-T-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--GTC---C---TG---T-----
gi|139976                     :          gttgccATGGCAACAAC---A-TTG--T-TAAAC-----TT-A-T--------------A--GAT--ACA------AC--CC-A-A--ATC---C---TG---C-----AAGA-----A--C-C--C--A-GA--A------A-GTA----T---A-----AACCG-G-----TTCG---G-G-A-CT---TA------CA------TA-TTGAT-----
gi|139957                     :           gttgccTGGCAACAAA---A-TTG--G-TTAAA-----TT-G-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--ATC---C---TG---T-----TGTA-----A--C-A--C--A-AA--A------A-GTA----T-GCA-----AGCTATG-----TTTGT----A-A-CT---TA--G---CA------TG-TTGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139974                     :          gttgcttTGAAAA-AAA---A-TTA--G-TCAAA-----TT-G-C--------------A--GAT--ACA------AC--CC-G-G--ATC---A---TG---T-----GATA-----A--C-A--C--A-AA--A------T-GTA----T-CTA-----ACCTACT-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--T---TA------CG-TTGAT-----AGA
gi|140004                     :         gttactacTGA-AACAAA---A-TAG--G--AAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TGCGAT-----GGTA-----gagataa
gi|139988                     :             ctatTGGCAACAAA---A-TTG--T-TAAAA-----TT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--CT-G-A--ATC---C---Taacttagcatgtggaaagaggacaataa
gi|139962                     :              gttgctCAACAAA---AATAG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-----GGTA-----A--C-T--C--A-AA--A------A-GAA----T-CCA-----AGCTGCA-----TTTGT--G-A-A-
gi|139980                     :           gttgctgtgCAACAAA---A-TTA--G-TGAAA-----TA-A-A--------------A--GAT--ACA------CC--TT-G-G--ATC---C---TG---A-----AGTA----------A--C--A-AA--C------T-TTA----T-CCA-----AGCTACA-----TTTGT--GAA-A-CA---TG--G---CA------TG-TGGAT-----GGAGGACAATAAac
gi|139952                     :             gttgctttAACAAA---A-TAA--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ACT---C---TG---T-----GATA-----A--C-A--CA-A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTTCT-----TTTAT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|140008                     :           gttgctaaggtACAAG---A-TAATAG-TAAAG-----TT-T-A--------------A--GAT--TCA------AC--CT-G-G--AAC---C---T-----------ATA-----A--C-A--C----AA--A------A-CTA----T-CTA-----ACATACG-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGA
gi|140009                     :                        AAA---A-TAG--G-TAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--TT-G-G--ATC---C---TA---T-----GGTA-----A--C-A--C----AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----CTTGT--G-A---------A--A---CA------TG-TTAAT-----AGAGGGCAATAaatcaat
gi|139997                     :                        AAA---A-TAT--GATAAAA-----GT-G-T--------------C--AAT--AT-----------CT-G-G--ATC---T---TG---T-----GATA-----A--A-T--T--A-AA--A------A-GTA----T-TTA-----AGTTAGT-----GTTAT--GAA-A-CC---TG--A---CA------GG-GTGAC-----AGACGGCAATGA
gi|139990                     :         ttgctatggaaaataAAA---A-TAT--GACAAAA-----TTCA-C--------------A--GAA--AGA------AG---T-GTG--ATC---C---TG---C-----AATA-----A--C-T--T--T-AA--A------A-GTA----T---A-----TGATATT-----TTTTT--G-A-AACT---TG--G---AA------CA-TAGAT-----AGATGGCAA
gi|140010                     : gttgctatggcaacaaatagtctaAA---A-TTG--G-TAAAA-----TT-G-T--------------C--CAT--ACC------ACGTCT-G-TCCATC---T---TG---A-----AATA-----TAAC-A--C--A-TA--A------G-GTA----T-CCA-----AGCTAAA-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TA-T
gi|140012                     :                                      -TGAAA-----TT-A-T--------------A--AAT--TCA------AC--CT-G-A--ATC---C---TG---C-----AAGAAC---T--A-A--G--A-AAGTA------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----TGTATA-A-A-A-CT---TG--C---CA------TG-TGGAT-----GGA
gi|140013                     :                                         AAA-----TT-A-C--------------A--GGT--ACA------G------G-G--GTC---CAACTG---TTCAGAGAGA-----T--T-A--CT-A-AAC-A------A-GTA----T-CCA-----ATCTAGG-----TTTCT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-CAGAT-----AGAGGGCAATAAaag
gi|140014                     :                                           A-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-C--TTC---C---TG---C--------A-----A--C-A--C--A-AC--GT-----A-TTA----T-CCA-----ACCTACA-----TTTGT--GGA-A-CT---TT--T---CA------TG-TGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139989                     :                                           A-----TT-A-T--------------A--TAT--ACG------AC--CT-G-G--ACC---C---TG---C-----GATA-----A--C-A--C--A-AA--
gi|140015                     :                             gttgctatggcagtt-----TT-AGC--------------A--GAC--AAA------AA--CT-GTG--ATC---A---TA---T-----AG----------C-A--C--A-AA--T------A-TTA----T-CTA-----ACCTTCA-----TTTGT--GTA-A-CG---TT--G---CA------TG-CGTAT-----AGAGAGCAATAActttgcatgtggatagtgagaaataa
gi|139994                     :                                                                      --GAT--ATA------AC--CA-G-G--ATC---C---TG---C-----AAGA-----A--C-T--C--A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCT
gi|140016                     :                                                        ttgatatagcaacacaattgtttA------AG--CT-A-G--ATG---C---CG---T-----GATA-----A--CTA--C--A-AA--G--------GTA----T-GCA-----AGCTAGA-----TTTCT--GGA-A-CT---TA--G---TA------TG-TGGAT-----AGA
gi|140017                     :                                                                               A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-----GATA-----A--C-T--C--C-AA--A------A-GTA----T-GCG-----AGCTA--------------G-A-A-CT---TG--G---CA------TA-TTGAT-----AGAGGGCAATA
gi|140018                     :                                                                                       C--CT-G-C--ATCTGTC---TG---T-----GGAACACTTT--C-T--C--A-AA--A------A-AAA----T-CCA-----AGAAAAG-----TTTGT--G-A-AACT-------G---CA------TG-TGGAT-----AGTGGGCAGTAA
gi|140020                     :                                                                                                --ATC---C---GG---A-----AATA-----T--T-A--CTCA-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAAG-----TTTGG--GAA-A-CT---T---G---CA------AG-CGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139955                     :                                                                                                --ATC---C---AG---A-----AATA-----T--T-ATTC--A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----TTTGT--GAA-A-CT---T-------CA------TATTGGAT-----AAAAGGCAATAA
gi|140021                     :                                                                       gttgctatggcaacaaaactctatc--ATC---C---AG---A-----AATA-----T--T-A--CTCA-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGT-----TTTGT--GAA-A-GT---TT--G---CA------TG-TGCAT-----TAAGGGCAATAA
gi|139983                     :                                                                                                --ATC---C---AG---A-----AATA-----T--T-A--CTCA-AA--A------A-GTA----T---------AGCTAGG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--T---CA------TT-TGGAT-----AGA
gi|139984                     :                                                                            gttgctatggcaacaaaactccgta---C---TA---T-----GGCA----------A--C--A-AA--ATT----A-GTAAAATT-ACAGATACAGCTACT-----TTTGT--G-A-AATT---TT--G---CA------TA-TGGAT-----AGAGAGAAATAAgagc
gi|140019                     :                                                                                                                      gttgA-----T--C-A--CTAA-AA--A------A-GTA----C-CCA-----GGCCAGG-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TT-TGGAT-----AGAAGACAACAA
gi|140033                     :                                                                                                                       gatcgtctgaaag-A--C--A-AA--ATTGGTTA-GTA----T-TCA-----AGCTACA-----TTTGT--GAA-A-CT---TA--A---CA------TG-TTGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140031                     :                                                                                                                                      --C--A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAGG-----TTTGT--GGA-A-CT---TA--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140026                     :                                                                                                                                attact--C--A-AA--A------T-GTA----T-CCA-----AGCTGGG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140025                     :                                                                                                                               gattact--C--A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140024                     :                                                                                                                               gattact--C--A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140027                     :                                                                                                                               gattact--C--A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACAAGA-----TTGTT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140034                     :                                                                                                                               gattact--C--A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TG-T-GAT-----AGG-GGCAATAA
gi|140028                     :                                                                                                                                      --C--A-AA--G------A-GTA----G-CCA-----AGCTAGA-----TTTTTTGA-A-A-CT---TT--G---CA------TA-TGGAT-----AGAGGGCAGTAA
gi|140032                     :                                                                                                                               gattact--C--A-GA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCTAGG-----TTTGT--GAA-A-CA---TT--G---CA------TG-TTGAT-----AGAGGGAAATAA
gi|140030                     :                                                                                                                                attact--C--A-AA--A------A-GCG----T-CTG-----AGCTAGG-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TG-TGGATCATTAAGAGGGCAATAA
gi|140023                     :                                                                                                                                ataact--C--A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGTAAGG-----TTTTT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGAAT-----AGAAGACAATAA
gi|140029                     :                                                                                                                               gatgact--C--A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACTAGG-----TTCGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TA-TGCCT-----AGAGAAAAATAA
gi|140036                     :                                                                                                                                  gattact--A-AAT-A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140037                     :                                                                                                                                         --A-AA--A------A-ATAA---T-TCA-----AGCTATG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAC-----AGATGGCAACAA
gi|140035                     :                                                                                                                                         --A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTATG-----TTTAT--GAA-A-TT---TT--G---CT------TG-TGGAC-----AGAGGGCAATAA
gi|140022                     :                                                                                                                                         --A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTATG-----TTTAT--A-A-A-ATA--TT--G---CA------TG-TGGGT-----AGAGGGCAATAA
gi|140038                     :                                                                                                                                   tgatga--A-AA--A------A-AC-----T-CAA-----AGCTAGG-----TTTGT--G-ACA-CT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGGCAAAAA
gi|140040                     :                                                                                                                                         --A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGATATA-----TTTGT--GAA-A-CC---TA--G---CA------TA-AGTAT-----AGGGGTCAATAA
gi|140039                     :                                                                                                                                         --A-AA--G------A-GTA----T-CCA-----AGCCTGG-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---GA------TG-TGAAT-----AAAGGGCAATAA
gi|140041                     :                                                                                                                                         --A-AA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCCTCA-----TTTGT--ATA-A-CT---TA--A---GT------TG-TGGTT-----AGAGTGCAATAA
gi|140042                     :                                                                                                                                         --A-AA--A------A-ATAA---T-CCA-----ATCTAAA-----TTCTT--G-A-AACT---T---G---CA------TG-TGGAT-----AGA-GGCTATAA
gi|140045                     :                                                                                                                                            -AA--A------A-ATA----T-C-A-----AGCTAGG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140043                     :                                                                                                                                            -AA--A------A-GCA----T-CCA-----AGCTAGG-----TTTGT--GAA-A-CT---TT--G---CA------TG-TTGAT-----AGAGTGTAATAA
gi|140044                     :                                                                                                                                            -AA--A------A-ATA----T-CAA-----AACTAGG-----TTTTT--G-A-AGCT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140046                     :                                                                                                                                            -AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----TTGGT--GAA-A-CT---TT--T---CA------TG-TAGAT-----GGGGGGCAATAA
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gi|140047                     :                                                                                                                                               --A------G-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----TTTGT--G-A-AACT---TT--A---CA------TG-TGTAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140049                     :                                                                                                                                                         -GTA----T-CCA-----AGCCAGG-----TTTGT--G-A-AATT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGGGGGAAATAA
gi|140011                     :                                                                                                                                                            A----T-CTA-----ACCTACA-----TTTGTT-A-A-A-CT---TT--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGAGCAA
gi|140050                     :                                                                                                                               taaaaaaaattatgtttacaggtctacattcgtgaaaatgagcaacacccA-----TTTGT--GGA-A-CT---TG--G---CA------TG-TGGAT-----AGAGGGCAGTAA
gi|140004                     :                                                                                                                                                                                               -A-A-CT---TA--G---CA------TG-TGGAA-----AGAGGACAATAA





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lowQualScore                  :                                                   00   1111111111 1 44 77      55555  6 6 88888888888888 99   99   888888  88  6 2 99   111 111  222 777777777 66666   7777 999999 5  11 888888 4   9999 5   11111     7777777 5   5        111  444444 444444       22222            
consensus                     :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
Reference ( family-308 )      :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139952                     :                                          TAAGGTAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ACT---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-CA-----A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTTCT-----T-TTA-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139953                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AGA----------G-AA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-T-G--ATC---G---TG---T-------GAG-----GAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACT-----T-TTG-TGAAACAT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139954                     :                                      gttgcATGACAAC--AAA----------A-CT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---C---TA---T---------T------AC--A-C------A-AA--A------A-TTA----T-CTA-----ACCTACATTAATT-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAAGGCAATAA
gi|139955                     :                                                                                                                                                                     gttgtg-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--CAT------A------T-TGGAT-----AAAAGGCAATAA
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gi|139959                     :                                      gttgcATGGCAAC--ACA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------T--AGT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---T---T-------------AT-----ACC--A-C------A-TA--A------A-TGA----T-CCA-----ACCTACA-----T-TCA-TGGAACTT--TGC------A------T
gi|139960                     :                                    gttgtcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTT----TGCCA-----AGCTACT-----T-TTG-TAAATCTT--GATAGATTGA------TGCTGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139961                     :                                     gtttcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTACAA--------A-C--------------A-------ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GTA-----AAT--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CTA-----AACTACA-----T-TTG-TGAAAATT--AGC------A------TGCAGAT-----AGAGGGTAATAA
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gi|139964                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-CA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--AAA------AC--CT-C-G--A
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gi|139983                     :                                    gttggcTATGGCAAC--AAA----------ACTC-C--GTAA--------T-C-C--------------A--GAA--ATA-------------------------------------------T-----TAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T---------AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TTC------A------TTTGGAT-----AGAGAGC
gi|139984                     :                                                                                                                                    gttgc---C---TA---T-------GGC-----AAC--A-A------A-AT--T------A-GTAAAATT-ACAGATACAGCTACT-----T-TTG-TGAAATTT--TGC------A------TATGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139984                     :                                      gttgTATGGCAAC--AAA----------A-TT-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GC--
gi|139985                     :                                      gttgcATGGCTAC--AAA----------A-TT-G--TTAAAA-----TT-T-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--GTC---C---TG---T-------tacttttgtgaaattttgcatatggatagagagaaataa
gi|139986                     :                                     gttgccATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTTAAA-----TG-A-CTGTCTGTCCGTCTTA--GA-----A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-------GGC-----AAT--T-A------A-AA--A------G-GAA----T-GCA-----AGCTAGA-----T-TTG-TGGAATTT--GAC------A------TGTGGAT-----AGA
gi|139987                     :                                     gttgtcATGGCAGC--AAA----------A-TT-G--GTCAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--AT----C---TG---T---------T-----A----A-G------A-AA--A------A-GT
gi|139988                     :                                      gttgccTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--TTAAAA-----TT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--CT-G-A--ATC---C---T
gi|139989                     :                                                                         gttgctA-----TT-A-T--------------A--TAT--ACG------AC--CT-G-G--ACC---C---TG---C-------GAT-----AAC--A-C----------------------------------------------------------AAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGTGAGAAATAA
gi|139990                     :                           gttgctatggcagttTATGGCAAC--AAATAGTCTAAAAA-TATG--ACAAAA-----TTCA-C--------------A--GAA--AGA------AG---T-GTG--ATC---C---TG---C-------AAT-----AAC--T-T------T-AA--A------A-GTA----T---A-----TGATATT-----T-TTT-TGAAACTT--GGA------A------CATAGAT-----AGATGGCAA
gi|139991                     :                                     gttgcTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAA--ATA------GC--GT-G-G--ATC---
gi|139992                     :                                     gttgcTATGACAAT--AAA----------AATA-T--GTAAAAAA---TA-A-T--------------ATTGGC--AAA------AT--CA-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-T------A-CA--A------A-GTA----
gi|139993                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TC-G--GTTAAA-----TA-A-C--------------A--GAT--ATA------AC--CT-G-G--ATC---C---TA---C-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------GTATA----T-ACA-----AGTTGAG-----T-GTA-TGAAACTT--GCC------A------TGTGAAT-----AGA
gi|139994                     :                                       ttgTATAGCAAC--ACA----------A-TT-G---T---------TT---------------------GAT--ATA------AC--CA-G-G--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCT
gi|139995                     :                                      ttgaTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------A--AAT--ACA------GA--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-TTA----T-CCA-----AGCTAAA-----T-TTG-TAAAACTT--CGA------A------TGTGGAT-----AGCGGGCAATAA
gi|139996                     :                                      tcgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAATG-----TG-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CA-C-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GAA----T-TCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGGAACTT--AGC------A------TATCAAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139997                     :                                      ttgcTATGGAAAATAAAA----------A-TATG--ATAAAA-----GT-G-T--------------C--AAT--AT-----------CT-G-G--ATC---T---TG---T-------GAT-----AAA--T-T------A-AA--A------A-GTA----T-TTA-----AGTTA-G-----TGTTA-TGAAACCT--GAC------A------GGGTGAC-----AGACGGCAATGA
gi|139998                     :                                      ttgcTATAGCAAC--AAC----------A-TT-AT-ATAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--ATT---C---TG---T-------CGT-----AAT--ACC------A-AA--A------A-GTA----A-CTA-----AGCTATA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TACAGAT-----
gi|139999                     :                                      ttgcTATTGCAAC--AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C----------------GGTAAAAAAAC--A-C------A-AA--A------A-----------CA---------ACA-----T-ATG-TAAAA-TT--AGC------A------TGTAGAT-----
gi|140000                     :                                      ttgcTATGGCAAC--AAA------------TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--AT-G-
gi|140001                     :                                      ttgcTATGGCAAC--AAA----------A-GT-G--GAAAGA-----TT-A-C--------------G--GAC--ACA------AC--C----G--ATC---C---CA---T-------GGT-----AAC--A-A------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTGCA-----A-CTG-TGAAACTA--AGC------A------TGTATAT-----AG
gi|140002                     :                                       tgcTGTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--ATAAAACTTAATT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-T---------CTGAG-----T-GTA-TGAAACTT--GCC------A------TGTGGAT-----AGGGGG
gi|140003                     :                                       tgcTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---T
gi|140004                     :                                        gcTATTGAAAC--AAA----------A-TA-G--G-AAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC----------------------------------------------------------------------------CTGCG-----A-TGG-T-AAACTT--AGC------A------TGTGGAA-----AGAGGACAATAAacaaggactgagaaagta
gi|140005                     :                                         cTATGACAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----ATC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TG-AACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGATGGCAATAA
gi|140006                     :                                          TATGTCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--CT-A-G--ATT---C---TG---T-------AGT-----AAC--
gi|140007                     :                                           ATGTCAAC--TAA------------TT-G--GTAAAA-----TC-A-T--------------A---AC--ACA------AT--CT-G-G--ATC---C---TC---C-------AAG-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GTT----T-TCA-----AGCTGTA-----T-TTA-TGAAACTT--
gi|140008                     :                                                 AC--AAG----------A-TA-ATAGTAAAG-----TT-T-A--------------A--GAT--TCA------AC--CT-G-G--AAC---C---TA---T---------------AAC--A-C------A-AA--A------C--TA----T-CTA-----ACATACG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAAATCAAT
gi|140009                     :                                                   --AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--TT-G-G--ATC---C---TA---T-------GGT-----AAC--A-C--------AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----C-TTG-TGAAA-------C------A------TGTTAAT-----AGAGGGCAATA
gi|140010                     :                                                      AA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-G-T--------------C--CAT--ACC------ACGTCT-G-TCCATC---T---TGAAAT-------A-T-----AAC--A-C------A-TA--A------G-GTA----T-CCA-----AGCTAAA-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TAT
gi|140011                     :                                                                                                                                                                                                    A----T-CTA-----ACCTACA-----T-TTG-TTAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAA
gi|140012                     :                         taaaaaaaattatgtttacaggtctacattcgtgaaaatgagcaacacccTGAAA-----TT-A-T--------------A--AAT--TCA------AC--CT-G-A--ATC---C---TG---C-------AAG-----AACTAA-G------A-AAGTA------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----T-GTA-TAAAACTT--GCC------A------TGTGGAT-----GGA
gi|140013                     :                                                                             AAA-----TT-A-C--------------A--GGT--ACA------G------G-G--GTC---CAACTG---TTCAGAGAGAT-----TAC--T-A------A-AC--A------A-GTA----T-CCA-----ATCTAGG-----T-TTC-TGAAACTT--TGC------A------TGCAGAT-----AGAGGGCAATAAaag
gi|140014                     :                                                                               A-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-C--TTC---C---TG---C---------------AAC--A-C------A-AC--GT-----A-TTA----T-CCA-----ACCTACA-----T-TTG-TGGAACTT--TTC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140015                     :                                                                                -----TT-AGC--------------A--GAC--AAA------AA--CT-GTG--ATC---A---TA---T-------AG--------C--A-C------A-AA--T------A-TTA----T-CTA-----ACCTTCA-----T-TTG-TGTAACGT--TGC------A------TGCGTAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140016                     :                                                                                                                   A------AG--CT-A-G--ATG---C---CG---T-------GAT-----AACT-A-C------A-AA--G--------GTA----T-GCA-----AGCTAGA-----T-TTC-TGGAACTT--AGT------A------TGTGGAT-----AGA
gi|140017                     :                                                                                                                   A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-------GAT-----AAC--T-C------C-AA--A------A-GTA----T-GCG-----AGCTA---------------GAACTT--GGC------A------TATTGAT-----AGAGGGCAATA
gi|140018                     :                                                                                                                           C--CT-G-C--ATCTGTC---TG---T-------GG------AAC--A-CTTTCTCA-AA--A------A-AAA----T-CCA-----AGAAAAG-----T-TTG-TGAAACT----GC------A------TGTGGAT-----AGTGGGCAGTAA
gi|140019                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTA----C-CCA-----GGCCAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TTTGGAT-----AGAAGACAACAA
gi|140020                     :                                                                                                                                                  gatcgtctgaaagatcactaAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAAG-----T-TTG-GGAAACTT---GC------A------AGCGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140021                     :                                                                                                                                                         atccggaaatattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGT-----T-TTG-TGAAAGTT--TGC------A------TGTGCAT-----TAAGGGCAATAA
gi|140022                     :                                                                                                                                                                atccagaaatatt------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTATG-----T-TTA-TAAAATAT--TGC------A------TGTGGGT-----AGAGGGCAATAA
gi|140023                     :                                                                                                                                                tgatga-------GAT-----GAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGTAAGG-----T-TTT-TGAAACTT--TGC------A------TGTGAAT-----AGAAGACAATAA
gi|140024                     :                                                                                                                                                                      AC--T-C------A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140025                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140026                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------T-GTA----T-CCA-----AGCTGGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140027                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AAC-AAG-----A-TTGTTGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
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gi|140029                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACTAGG-----T-TCG-TGAAACTT--TGC------A------TATGCCT-----AGAGAAAAATAA
gi|140030                     :                                                                                                                                                           gattT-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GCG----T-CTG-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGATCATTAAGAGGGCAATAA
gi|140031                     :                                                                                                                                                                     aAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGGAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140032                     :                                                                                                                                                                   attAC--T-C------A-GA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACAT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAGGGAAATAA
gi|140033                     :                                                                                                                                                                     att--A-C------A-AA--ATTGGTTA-GTA----T-TCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AAC------A------TGTTGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140034                     :                                                                                                                                                                           -C------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGT-GAT-----AG-GGGCAATAA
gi|140035                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTATG-----T-TTA-TGAAATTT--TGC------T------TGTGGAC-----AGAGGGCAATAA
gi|140036                     :                                                                                                                                                                             ------A-AAT-A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140037                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATAA---T-TCA-----AGCTATG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAC-----AGATGGCAACAA
gi|140038                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-AC-----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGACACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAAAAA
gi|140039                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--G------A-GTA----T-CCA-----AGCCTGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGG------A------TGTGAAT-----AAAGGGCAATAA
gi|140040                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGATATA-----T-TTG-TGAAACCT--AGC------A------TAAGTAT-----AGGGGTCAATAA
gi|140041                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCCTCA-----T-TTG-TATAACTT--AAG------T------TGTGGTT-----AGAGTGCAATAA
gi|140042                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATAA---T-CCA-----ATCTAAA-----T-TCT-TGAAACTT---GC------A------TGTGGAT-----AGA-GGCTATAA
gi|140043                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-GCA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAGTGTAATAA
gi|140044                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-CAA-----AACTAGG-----T-TTT-TGAAGCTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140045                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-C-A-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140046                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TGG-TGAAACTT--TTC------A------TGTAGAT-----GGGGGGCAATAA
gi|140047                     :                                                                                                                                                                                       --A------G-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TAC------A------TGTGTAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140048                     :                                                                                                                                                                                       --A------A-ACA----T-CCA-----AGCTATG-----T-TTG-TAAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGCGGGCAATAA
gi|140049                     :                                                                                                                                                                                                 -GTA----T-CCA-----AGCCAGG-----T-TTG-TGAAATTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGGGGGAAATAA
gi|140050                     :                                                                                                                                                                                                                          -----T-TTG-TGGAACTT--GGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAGTAA





Alignments
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lowQualScore                  :                                                   00   1111111111 1 44 77      55555  6 6 88888888888888 99   99   888888  88  6 2 99   111 111  222 777777777 66666   7777 999999 5  11 888888 4   9999 5   11111     7777777 5   5        111  444444 444444       22222            
consensus                     :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
Reference ( family-308 )      :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139952                     :                                          TAAGGTAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ACT---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-CA-----A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTTCT-----T-TTA-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139953                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AGA----------G-AA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-T-G--ATC---G---TG---T-------GAG-----GAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACT-----T-TTG-TGAAACAT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139954                     :                                      gttgcATGACAAC--AAA----------A-CT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---C---TA---T---------T------AC--A-C------A-AA--A------A-TTA----T-CTA-----ACCTACATTAATT-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAAGGCAATAA
gi|139955                     :                                                                                                                                                                     gttgtg-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--CAT------A------T-TGGAT-----AAAAGGCAATAA
gi|139956                     : gttgctatggcaacaaaactctatcatccagaaatattattTATGGCAAC--AAA----------A-TA-T--ATAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-C-A--TTC---C---TG---T-------GGT-----AAT--A-C------A-AA--T------A-GT-----T-GGA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TGTGGTT-----AGAGGGCAATAA
gi|139957                     :                                       gttgcTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTTAAA-----TT-G-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--ATC---C---TG---T-------TGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-GCA-----AGCTATG-----T-TTG-T--AACTT--AGC------A------TGTTGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139958                     :                                   gttgcttTATGGCAAT--AAA----------G-TA-C--ATAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-A--ATT---C---TT---T-------GGT-----AAC--A-A------T-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACTACG-----T-TTT-TGAAATTT--AGC------A------TGTAAAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139959                     :                                      gttgcATGGCAAC--ACA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------T--AGT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---T---T-------------AT-----ACC--A-C------A-TA--A------A-TGA----T-CCA-----ACCTACA-----T-TCA-TGGAACTT--TGC------A------T
gi|139960                     :                                    gttgtcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTT----TGCCA-----AGCTACT-----T-TTG-TAAATCTT--GATAGATTGA------TGCTGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139961                     :                                     gtttcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTACAA--------A-C--------------A-------ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GTA-----AAT--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CTA-----AACTACA-----T-TTG-TGAAAATT--AGC------A------TGCAGAT-----AGAGGGTAATAA
gi|139962                     :                                         gttgcGCAAC--AAA----------AATA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GAA----T-CCA-----AGCTGCA-----T-TTG-TGAAAC
gi|139963                     :                                  gttgctgtTATTGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-T--------------A--GATCTACA------AC--CT-G-G--ATC---A---TG---T-------CTT-----AAC--A-C------ATAA--A------A-GTA----T-CCA-----TGCTACA-------TTG-TGAAACCT--AGC------A------AGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139964                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-CA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--AAA------AC--CT-C-G--A
gi|139965                     :                                     gttggTATGGCAAC--AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-A--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--AAC---A---TG---T-------GGT-----AAC--G-C------A-AA--A------A-GCG----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--ATC------T------AGTGGAT-----AGAGGGATATAA
gi|139966                     :                                     gtggtTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAAAA-----TC-A-T--------------A--TAT--ACA------AC--TT-G-G--ACC---C---TG---T-------GGT-----AGC--A-C------A-AA--A------A-GGA----C-ACA-----AGCTGCA-----T-TTG-TGAAACTT--AAC------A------ACTGGGT-----GGAGGGCAATAA
gi|139967                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-T--ATAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--TCA------AA--CT-G-G--ATC---C---TT---T-------GTT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCAACA-----T-TTG-TAAAACT-------------------TGTAGAT-----TAAGGGCAATAA
gi|139968                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------G--GAT--ACA------AT--CA-G-G--AAT---T---TG---T-------GGT-----GAC--A-C------A-AA--A------A-ATG----G-ATA-----AGCTACAT----T-TTT-TGAAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139969                     :                                     gttgtTATGGCAAT--AAA------------TT-G--GTAAAC-----AA-A-A--------------A--GAT--ACA------AC--CTTG-G------------TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTATT-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGTAAAAA
gi|139970                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA------------TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--GT-G-G--AGC---C---TG---T-------AGT-----AAC--A-C------A-AA----------------------A-----AGCCACC-----T-TTG-TGAAACTT--AGT------A------GGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139971                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AGA----------A-AA-G--GTAAAC-----TT-A-C--------------A--GAT--AAA------AC--CT-G-A--ATC---A---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-ATA----T---A-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAAGGT--AGC------A--------TAGAC-----AGAAGGCAATGA
gi|139972                     :                                     gttgcTATGGAAAT--AAC------------TA-A--GTAAAA-----TC-A-C--------------A--AAT--ATACTGGTAAC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-A------A-AA--A------A-GTT----T-TCA-----AACTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------ATGGCAGTGTGGAC-----AGTGGGTAATAA
gi|139973                     :                                     gttgcTATGGCAAT--AAA----------A-TT-G--GTAAA------TT-A-T--------------G--ATT--TCA------AC--CT-G-G--ATA---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-TCA-----AGATACAT----T-TTG-TGAAAATT--ATC------A------TGCCGGT-----TGAGGGCAATAA
gi|139974                     :                                           gctgcAAA--AAA----------A-TT-A--GTCAAA-----TT-G-C--------------A--GAT--ACA------AC--CC-G-G--ATC---A---TG---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--A------T-GTA----T-CTA-----ACCTACT-----T-TTG-TGAAACTT--TTT------A------CGTTGAT-----AGAGAG--ATAA
gi|139975                     :                               gttactactgaTATGGCAAC--ACA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--AT-G-A--TTT---T---TT---T---------T-----TAC--A-C------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----ACCTA-------T-ATG-TGATACTTAATGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139976                     :                                      gttgtATGGCAAC--AAC----------A-TT-G--TTAAAC-----TT-A-T--------------A--GAT--ACA------AC--CC-A-A--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--C-C------A-GA--A------A-GTA----T---A-----AAC--CG-----G-TT--CGGGACTT--A-C------A------TATTGAT-----
gi|139977                     :                                    gttgccTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAA------------------------------GAT--ACA------AT--TT-A-G--AGA---C---CG---T-------GAT-----AAA--A-T------A-AA-----------GTA----T-CCA-----GACTACA-----T-TTG-TGAAACTT--GGC------A------TTTGGAC-----AGAGGACAAT
gi|139978                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTTAAA-----AT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--AT-G-G--ATC---C---TA---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--T------A-GAA----T-CCA----------CG----------------CTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAATTAA
gi|139979                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTTAAA-----AT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--AT-G-G--ATC---C---TA---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--T------A-GAA----T-CCA----------CG----------------CTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAATTAA
gi|139980                     :                                          gttgcCAAC--AAA----------A-TT-A--GTGAAA-----TA-A-A--------------A--GAT--ACA------CC--TT-G-G--ATC---C---TG---A-------AGT-----AAC--A----------AA--C------T-TTA----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACAT--GGC------A------TGTGGAT-----GGAGGACAATAA
gi|139981                     :                                  gttgctttTATGGCAAC--AAA----------T-TT-G--GT----------T---------------------GAT--ATA------AC--CT-A-G--ATC---C---TG---T-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----T-TTA-TTAA
gi|139982                     :                                     gttgcTATGGCATC--AAT----------A-TA-A--ACAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--
gi|139983                     :                                    gttggcTATGGCAAC--AAA----------ACTC-C--GTAA--------T-C-C--------------A--GAA--ATA-------------------------------------------T-----TAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T---------AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TTC------A------TTTGGAT-----AGAGAGC
gi|139984                     :                                                                                                                                    gttgc---C---TA---T-------GGC-----AAC--A-A------A-AT--T------A-GTAAAATT-ACAGATACAGCTACT-----T-TTG-TGAAATTT--TGC------A------TATGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139984                     :                                      gttgTATGGCAAC--AAA----------A-TT-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GC--
gi|139985                     :                                      gttgcATGGCTAC--AAA----------A-TT-G--TTAAAA-----TT-T-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--GTC---C---TG---T-------tacttttgtgaaattttgcatatggatagagagaaataa
gi|139986                     :                                     gttgccATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTTAAA-----TG-A-CTGTCTGTCCGTCTTA--GA-----A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-------GGC-----AAT--T-A------A-AA--A------G-GAA----T-GCA-----AGCTAGA-----T-TTG-TGGAATTT--GAC------A------TGTGGAT-----AGA
gi|139987                     :                                     gttgtcATGGCAGC--AAA----------A-TT-G--GTCAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--AT----C---TG---T---------T-----A----A-G------A-AA--A------A-GT
gi|139988                     :                                      gttgccTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--TTAAAA-----TT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--CT-G-A--ATC---C---T
gi|139989                     :                                                                         gttgctA-----TT-A-T--------------A--TAT--ACG------AC--CT-G-G--ACC---C---TG---C-------GAT-----AAC--A-C----------------------------------------------------------AAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGTGAGAAATAA
gi|139990                     :                           gttgctatggcagttTATGGCAAC--AAATAGTCTAAAAA-TATG--ACAAAA-----TTCA-C--------------A--GAA--AGA------AG---T-GTG--ATC---C---TG---C-------AAT-----AAC--T-T------T-AA--A------A-GTA----T---A-----TGATATT-----T-TTT-TGAAACTT--GGA------A------CATAGAT-----AGATGGCAA
gi|139991                     :                                     gttgcTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAA--ATA------GC--GT-G-G--ATC---
gi|139992                     :                                     gttgcTATGACAAT--AAA----------AATA-T--GTAAAAAA---TA-A-T--------------ATTGGC--AAA------AT--CA-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-T------A-CA--A------A-GTA----
gi|139993                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TC-G--GTTAAA-----TA-A-C--------------A--GAT--ATA------AC--CT-G-G--ATC---C---TA---C-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------GTATA----T-ACA-----AGTTGAG-----T-GTA-TGAAACTT--GCC------A------TGTGAAT-----AGA
gi|139994                     :                                       ttgTATAGCAAC--ACA----------A-TT-G---T---------TT---------------------GAT--ATA------AC--CA-G-G--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCT
gi|139995                     :                                      ttgaTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------A--AAT--ACA------GA--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-TTA----T-CCA-----AGCTAAA-----T-TTG-TAAAACTT--CGA------A------TGTGGAT-----AGCGGGCAATAA
gi|139996                     :                                      tcgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAATG-----TG-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CA-C-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GAA----T-TCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGGAACTT--AGC------A------TATCAAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139997                     :                                      ttgcTATGGAAAATAAAA----------A-TATG--ATAAAA-----GT-G-T--------------C--AAT--AT-----------CT-G-G--ATC---T---TG---T-------GAT-----AAA--T-T------A-AA--A------A-GTA----T-TTA-----AGTTA-G-----TGTTA-TGAAACCT--GAC------A------GGGTGAC-----AGACGGCAATGA
gi|139998                     :                                      ttgcTATAGCAAC--AAC----------A-TT-AT-ATAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--ATT---C---TG---T-------CGT-----AAT--ACC------A-AA--A------A-GTA----A-CTA-----AGCTATA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TACAGAT-----
gi|139999                     :                                      ttgcTATTGCAAC--AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C----------------GGTAAAAAAAC--A-C------A-AA--A------A-----------CA---------ACA-----T-ATG-TAAAA-TT--AGC------A------TGTAGAT-----
gi|140000                     :                                      ttgcTATGGCAAC--AAA------------TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--AT-G-
gi|140001                     :                                      ttgcTATGGCAAC--AAA----------A-GT-G--GAAAGA-----TT-A-C--------------G--GAC--ACA------AC--C----G--ATC---C---CA---T-------GGT-----AAC--A-A------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTGCA-----A-CTG-TGAAACTA--AGC------A------TGTATAT-----AG
gi|140002                     :                                       tgcTGTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--ATAAAACTTAATT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-T---------CTGAG-----T-GTA-TGAAACTT--GCC------A------TGTGGAT-----AGGGGG
gi|140003                     :                                       tgcTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---T
gi|140004                     :                                        gcTATTGAAAC--AAA----------A-TA-G--G-AAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC----------------------------------------------------------------------------CTGCG-----A-TGG-T-AAACTT--AGC------A------TGTGGAA-----AGAGGACAATAAacaaggactgagaaagta
gi|140005                     :                                         cTATGACAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----ATC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TG-AACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGATGGCAATAA
gi|140006                     :                                          TATGTCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--CT-A-G--ATT---C---TG---T-------AGT-----AAC--
gi|140007                     :                                           ATGTCAAC--TAA------------TT-G--GTAAAA-----TC-A-T--------------A---AC--ACA------AT--CT-G-G--ATC---C---TC---C-------AAG-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GTT----T-TCA-----AGCTGTA-----T-TTA-TGAAACTT--
gi|140008                     :                                                 AC--AAG----------A-TA-ATAGTAAAG-----TT-T-A--------------A--GAT--TCA------AC--CT-G-G--AAC---C---TA---T---------------AAC--A-C------A-AA--A------C--TA----T-CTA-----ACATACG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAAATCAAT
gi|140009                     :                                                   --AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--TT-G-G--ATC---C---TA---T-------GGT-----AAC--A-C--------AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----C-TTG-TGAAA-------C------A------TGTTAAT-----AGAGGGCAATA
gi|140010                     :                                                      AA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-G-T--------------C--CAT--ACC------ACGTCT-G-TCCATC---T---TGAAAT-------A-T-----AAC--A-C------A-TA--A------G-GTA----T-CCA-----AGCTAAA-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TAT
gi|140011                     :                                                                                                                                                                                                    A----T-CTA-----ACCTACA-----T-TTG-TTAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAA
gi|140012                     :                         taaaaaaaattatgtttacaggtctacattcgtgaaaatgagcaacacccTGAAA-----TT-A-T--------------A--AAT--TCA------AC--CT-G-A--ATC---C---TG---C-------AAG-----AACTAA-G------A-AAGTA------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----T-GTA-TAAAACTT--GCC------A------TGTGGAT-----GGA
gi|140013                     :                                                                             AAA-----TT-A-C--------------A--GGT--ACA------G------G-G--GTC---CAACTG---TTCAGAGAGAT-----TAC--T-A------A-AC--A------A-GTA----T-CCA-----ATCTAGG-----T-TTC-TGAAACTT--TGC------A------TGCAGAT-----AGAGGGCAATAAaag
gi|140014                     :                                                                               A-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-C--TTC---C---TG---C---------------AAC--A-C------A-AC--GT-----A-TTA----T-CCA-----ACCTACA-----T-TTG-TGGAACTT--TTC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140015                     :                                                                                -----TT-AGC--------------A--GAC--AAA------AA--CT-GTG--ATC---A---TA---T-------AG--------C--A-C------A-AA--T------A-TTA----T-CTA-----ACCTTCA-----T-TTG-TGTAACGT--TGC------A------TGCGTAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140016                     :                                                                                                                   A------AG--CT-A-G--ATG---C---CG---T-------GAT-----AACT-A-C------A-AA--G--------GTA----T-GCA-----AGCTAGA-----T-TTC-TGGAACTT--AGT------A------TGTGGAT-----AGA
gi|140017                     :                                                                                                                   A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-------GAT-----AAC--T-C------C-AA--A------A-GTA----T-GCG-----AGCTA---------------GAACTT--GGC------A------TATTGAT-----AGAGGGCAATA
gi|140018                     :                                                                                                                           C--CT-G-C--ATCTGTC---TG---T-------GG------AAC--A-CTTTCTCA-AA--A------A-AAA----T-CCA-----AGAAAAG-----T-TTG-TGAAACT----GC------A------TGTGGAT-----AGTGGGCAGTAA
gi|140019                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTA----C-CCA-----GGCCAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TTTGGAT-----AGAAGACAACAA
gi|140020                     :                                                                                                                                                  gatcgtctgaaagatcactaAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAAG-----T-TTG-GGAAACTT---GC------A------AGCGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140021                     :                                                                                                                                                         atccggaaatattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGT-----T-TTG-TGAAAGTT--TGC------A------TGTGCAT-----TAAGGGCAATAA
gi|140022                     :                                                                                                                                                                atccagaaatatt------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTATG-----T-TTA-TAAAATAT--TGC------A------TGTGGGT-----AGAGGGCAATAA
gi|140023                     :                                                                                                                                                tgatga-------GAT-----GAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGTAAGG-----T-TTT-TGAAACTT--TGC------A------TGTGAAT-----AGAAGACAATAA
gi|140024                     :                                                                                                                                                                      AC--T-C------A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140025                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140026                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------T-GTA----T-CCA-----AGCTGGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140027                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AAC-AAG-----A-TTGTTGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140028                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--G------A-GTA----G-CCA-----AGCTA-GAT---T-TTT-TGAAACTT--TGC------A------TATGGAT-----AGAGGGCAGTAA
gi|140029                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACTAGG-----T-TCG-TGAAACTT--TGC------A------TATGCCT-----AGAGAAAAATAA
gi|140030                     :                                                                                                                                                           gattT-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GCG----T-CTG-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGATCATTAAGAGGGCAATAA
gi|140031                     :                                                                                                                                                                     aAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGGAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140032                     :                                                                                                                                                                   attAC--T-C------A-GA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACAT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAGGGAAATAA
gi|140033                     :                                                                                                                                                                     att--A-C------A-AA--ATTGGTTA-GTA----T-TCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AAC------A------TGTTGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140034                     :                                                                                                                                                                           -C------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGT-GAT-----AG-GGGCAATAA
gi|140035                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTATG-----T-TTA-TGAAATTT--TGC------T------TGTGGAC-----AGAGGGCAATAA
gi|140036                     :                                                                                                                                                                             ------A-AAT-A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140037                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATAA---T-TCA-----AGCTATG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAC-----AGATGGCAACAA
gi|140038                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-AC-----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGACACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAAAAA
gi|140039                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--G------A-GTA----T-CCA-----AGCCTGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGG------A------TGTGAAT-----AAAGGGCAATAA
gi|140040                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGATATA-----T-TTG-TGAAACCT--AGC------A------TAAGTAT-----AGGGGTCAATAA
gi|140041                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCCTCA-----T-TTG-TATAACTT--AAG------T------TGTGGTT-----AGAGTGCAATAA
gi|140042                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATAA---T-CCA-----ATCTAAA-----T-TCT-TGAAACTT---GC------A------TGTGGAT-----AGA-GGCTATAA
gi|140043                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-GCA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAGTGTAATAA
gi|140044                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-CAA-----AACTAGG-----T-TTT-TGAAGCTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140045                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-C-A-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140046                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TGG-TGAAACTT--TTC------A------TGTAGAT-----GGGGGGCAATAA
gi|140047                     :                                                                                                                                                                                       --A------G-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TAC------A------TGTGTAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140048                     :                                                                                                                                                                                       --A------A-ACA----T-CCA-----AGCTATG-----T-TTG-TAAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGCGGGCAATAA
gi|140049                     :                                                                                                                                                                                                 -GTA----T-CCA-----AGCCAGG-----T-TTG-TGAAATTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGGGGGAAATAA
gi|140050                     :                                                                                                                                                                                                                          -----T-TTG-TGGAACTT--GGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAGTAA


blockSeqs                     :                                                        TAGTCTAAAA A AT TA      CTTAA      TGTCTGTCCGTCTT           CTGGTA        T      TGT AAC  AAA TCAGAGAGA AAAAA   TAA  TTTCTC    GT TTGGTT     AAAT     GATAC     CATTAAT              AAT  AGATTG TGGCAG       CATTA
blockSeqs                     :                                                        .          C AT T       AA         .                        .             T      .   .    .   GA        .       AC   .         T  T          A        .         CAT                  T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          A A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       TA   .         .  .          A        .         CAT                  T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   TG        .       A    .         .  .          .        .         GAT                  C    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CT                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         GG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GT        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         TG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   CT        .       A    .         .  .          .        .         CG                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CT                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GT        .       T    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       G    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         TT                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         CC                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       A    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         CT                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         CG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       C    .         .  .          .        .         CG                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         CG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         AG                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       T    .         .  .          .        .         CT                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       T    .         .  .          .        .         GA                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . C  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       A    .         .  .          .        .         TT                   C    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       T    .         .  .          .        .         AG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         AA                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       T    .         .  .          .        .         TA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   CG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       T    .         .  .          .        .         CA                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       T    .         .  .          .        .         AG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . C  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       A    .         .  .          .        .         CG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AG        .       T    .         .  .          .        .         TA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       A    .         .  .          .        .         CG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   AA        .       T    .         .  .          .        .         AA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   AG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       T    .         .  .          .        .         AG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         GG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   GG        .       A    .         .  .          .        .         CA                   G    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   GA        .       A    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   A         .       T    .         .  .          .        .         GA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   A         .       A    .         .  .          .        .         AG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   .         .       A    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   .         .       T    .         .  .          .        .         AG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . A  .       .          .                        .             .      .   .    .   .         .       A    .         .  .          .        .         GT                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                        .          . T  .       .          .                        .             .      .   .    .   .         .       T    .         .  .          .        .         TG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                .          .                        .             .      .   .    .   .         .       T    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                .          .                        .             .      .   .    .   .         .       T    .         .  .          .        .         AG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                .          .                        .             .      .   .    .   .         .       T    .         .  .          .        .         AG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                .          .                        .             .      .   .                  .       T    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                .          .                        .             .      .   .                          T    .         .  .          .        .         AG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                    .             .      .                              T    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                    .             .                                     T    .         .  .          .        .         GG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        T    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        T    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        T    .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        T    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        A    .         .  .          .        .         TG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .    .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .         .  .          .        .         TG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .         .  .          .        .         GG                   A    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .         .  .          .        .         GG                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .         .  .          .        .         TA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .         .  .          .        .         CA                   T    .      .            .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .         .  .          .        .         AA                   T    .      .            .    
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blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                             ******
originalCons                  :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
finalCons                     :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA





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lowQualScore                  :                                                   00   1111111111 1 44 77      55555  6 6 88888888888888 99   99   888888  88  6 2 99   111 111  222 777777777 66666   7777 999999 5  11 888888 4   9999 5   11111     7777777 5   5        111  444444 444444       22222            
consensus                     :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
Reference ( family-308 )      :                                          TATGGCAAC--AAA----------A-TN-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACG-----T-TTG-TGAAACTT--NGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139952                     :                                          TAAGGTAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ACT---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-CA-----A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTTCT-----T-TTA-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139953                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AGA----------G-AA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-T-G--ATC---G---TG---T-------GAG-----GAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACT-----T-TTG-TGAAACAT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139954                     :                                      gttgcATGACAAC--AAA----------A-CT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---C---TA---T---------T------AC--A-C------A-AA--A------A-TTA----T-CTA-----ACCTACATTAATT-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAAGGCAATAA
gi|139955                     :                                                                                                                                                                     gttgtg-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--CAT------A------T-TGGAT-----AAAAGGCAATAA
gi|139956                     : gttgctatggcaacaaaactctatcatccagaaatattattTATGGCAAC--AAA----------A-TA-T--ATAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-C-A--TTC---C---TG---T-------GGT-----AAT--A-C------A-AA--T------A-GT-----T-GGA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TGTGGTT-----AGAGGGCAATAA
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gi|139958                     :                                   gttgcttTATGGCAAT--AAA----------G-TA-C--ATAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-A--ATT---C---TT---T-------GGT-----AAC--A-A------T-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACTACG-----T-TTT-TGAAATTT--AGC------A------TGTAAAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139959                     :                                      gttgcATGGCAAC--ACA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------T--AGT--ACA------AC--TT-G-G--ATC---T---T-------------AT-----ACC--A-C------A-TA--A------A-TGA----T-CCA-----ACCTACA-----T-TCA-TGGAACTT--TGC------A------T
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gi|139964                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-CA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--AAA------AC--CT-C-G--A
gi|139965                     :                                     gttggTATGGCAAC--AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-A--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--AAC---A---TG---T-------GGT-----AAC--G-C------A-AA--A------A-GCG----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--ATC------T------AGTGGAT-----AGAGGGATATAA
gi|139966                     :                                     gtggtTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAAAA-----TC-A-T--------------A--TAT--ACA------AC--TT-G-G--ACC---C---TG---T-------GGT-----AGC--A-C------A-AA--A------A-GGA----C-ACA-----AGCTGCA-----T-TTG-TGAAACTT--AAC------A------ACTGGGT-----GGAGGGCAATAA
gi|139967                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-T--ATAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--TCA------AA--CT-G-G--ATC---C---TT---T-------GTT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCAACA-----T-TTG-TAAAACT-------------------TGTAGAT-----TAAGGGCAATAA
gi|139968                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------G--GAT--ACA------AT--CA-G-G--AAT---T---TG---T-------GGT-----GAC--A-C------A-AA--A------A-ATG----G-ATA-----AGCTACAT----T-TTT-TGAAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139969                     :                                     gttgtTATGGCAAT--AAA------------TT-G--GTAAAC-----AA-A-A--------------A--GAT--ACA------AC--CTTG-G------------TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTATT-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGTAAAAA
gi|139970                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA------------TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--GT-G-G--AGC---C---TG---T-------AGT-----AAC--A-C------A-AA----------------------A-----AGCCACC-----T-TTG-TGAAACTT--AGT------A------GGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139971                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AGA----------A-AA-G--GTAAAC-----TT-A-C--------------A--GAT--AAA------AC--CT-G-A--ATC---A---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-ATA----T---A-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAAGGT--AGC------A--------TAGAC-----AGAAGGCAATGA
gi|139972                     :                                     gttgcTATGGAAAT--AAC------------TA-A--GTAAAA-----TC-A-C--------------A--AAT--ATACTGGTAAC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-A------A-AA--A------A-GTT----T-TCA-----AACTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------ATGGCAGTGTGGAC-----AGTGGGTAATAA
gi|139973                     :                                     gttgcTATGGCAAT--AAA----------A-TT-G--GTAAA------TT-A-T--------------G--ATT--TCA------AC--CT-G-G--ATA---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-TCA-----AGATACAT----T-TTG-TGAAAATT--ATC------A------TGCCGGT-----TGAGGGCAATAA
gi|139974                     :                                           gctgcAAA--AAA----------A-TT-A--GTCAAA-----TT-G-C--------------A--GAT--ACA------AC--CC-G-G--ATC---A---TG---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--A------T-GTA----T-CTA-----ACCTACT-----T-TTG-TGAAACTT--TTT------A------CGTTGAT-----AGAGAG--ATAA
gi|139975                     :                               gttactactgaTATGGCAAC--ACA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--AT-G-A--TTT---T---TT---T---------T-----TAC--A-C------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----ACCTA-------T-ATG-TGATACTTAATGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|139976                     :                                      gttgtATGGCAAC--AAC----------A-TT-G--TTAAAC-----TT-A-T--------------A--GAT--ACA------AC--CC-A-A--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--C-C------A-GA--A------A-GTA----T---A-----AAC--CG-----G-TT--CGGGACTT--A-C------A------TATTGAT-----
gi|139977                     :                                    gttgccTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAA------------------------------GAT--ACA------AT--TT-A-G--AGA---C---CG---T-------GAT-----AAA--A-T------A-AA-----------GTA----T-CCA-----GACTACA-----T-TTG-TGAAACTT--GGC------A------TTTGGAC-----AGAGGACAAT
gi|139978                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTTAAA-----AT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--AT-G-G--ATC---C---TA---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--T------A-GAA----T-CCA----------CG----------------CTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAATTAA
gi|139979                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TA-A--GTTAAA-----AT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--AT-G-G--ATC---C---TA---T-------GAT-----AAC--A-C------A-AA--T------A-GAA----T-CCA----------CG----------------CTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGAATTAA
gi|139980                     :                                          gttgcCAAC--AAA----------A-TT-A--GTGAAA-----TA-A-A--------------A--GAT--ACA------CC--TT-G-G--ATC---C---TG---A-------AGT-----AAC--A----------AA--C------T-TTA----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACAT--GGC------A------TGTGGAT-----GGAGGACAATAA
gi|139981                     :                                  gttgctttTATGGCAAC--AAA----------T-TT-G--GT----------T---------------------GAT--ATA------AC--CT-A-G--ATC---C---TG---T-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----T-TTA-TTAA
gi|139982                     :                                     gttgcTATGGCATC--AAT----------A-TA-A--ACAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--
gi|139983                     :                                    gttggcTATGGCAAC--AAA----------ACTC-C--GTAA--------T-C-C--------------A--GAA--ATA-------------------------------------------T-----TAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T---------AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TTC------A------TTTGGAT-----AGAGAGC
gi|139984                     :                                                                                                                                    gttgc---C---TA---T-------GGC-----AAC--A-A------A-AT--T------A-GTAAAATT-ACAGATACAGCTACT-----T-TTG-TGAAATTT--TGC------A------TATGGAT-----AGAGAGAAATAA
gi|139984                     :                                      gttgTATGGCAAC--AAA----------A-TT-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GC--
gi|139985                     :                                      gttgcATGGCTAC--AAA----------A-TT-G--TTAAAA-----TT-T-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--GTC---C---TG---T-------tacttttgtgaaattttgcatatggatagagagaaataa
gi|139986                     :                                     gttgccATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTTAAA-----TG-A-CTGTCTGTCCGTCTTA--GA-----A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-------GGC-----AAT--T-A------A-AA--A------G-GAA----T-GCA-----AGCTAGA-----T-TTG-TGGAATTT--GAC------A------TGTGGAT-----AGA
gi|139987                     :                                     gttgtcATGGCAGC--AAA----------A-TT-G--GTCAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--AT----C---TG---T---------T-----A----A-G------A-AA--A------A-GT
gi|139988                     :                                      gttgccTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--TTAAAA-----TT-A-C--------------A--TAT--ACA------AC--CT-G-A--ATC---C---T
gi|139989                     :                                                                         gttgctA-----TT-A-T--------------A--TAT--ACG------AC--CT-G-G--ACC---C---TG---C-------GAT-----AAC--A-C----------------------------------------------------------AAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGTGAGAAATAA
gi|139990                     :                           gttgctatggcagttTATGGCAAC--AAATAGTCTAAAAA-TATG--ACAAAA-----TTCA-C--------------A--GAA--AGA------AG---T-GTG--ATC---C---TG---C-------AAT-----AAC--T-T------T-AA--A------A-GTA----T---A-----TGATATT-----T-TTT-TGAAACTT--GGA------A------CATAGAT-----AGATGGCAA
gi|139991                     :                                     gttgcTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAA--ATA------GC--GT-G-G--ATC---
gi|139992                     :                                     gttgcTATGACAAT--AAA----------AATA-T--GTAAAAAA---TA-A-T--------------ATTGGC--AAA------AT--CA-G-G--ATC---C---TG---T-------GAT-----AAC--A-T------A-CA--A------A-GTA----
gi|139993                     :                                     gttgcTATGGCAAC--AAA----------A-TC-G--GTTAAA-----TA-A-C--------------A--GAT--ATA------AC--CT-G-G--ATC---C---TA---C-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------GTATA----T-ACA-----AGTTGAG-----T-GTA-TGAAACTT--GCC------A------TGTGAAT-----AGA
gi|139994                     :                                       ttgTATAGCAAC--ACA----------A-TT-G---T---------TT---------------------GAT--ATA------AC--CA-G-G--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--T-C------A-GA--A------A-GTA----T-TCA-----AGCT
gi|139995                     :                                      ttgaTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TA-A-C--------------A--AAT--ACA------GA--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-TTA----T-CCA-----AGCTAAA-----T-TTG-TAAAACTT--CGA------A------TGTGGAT-----AGCGGGCAATAA
gi|139996                     :                                      tcgcTATGGCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAATG-----TG-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CA-C-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----AAC--A-C------A-AA--A------A-GAA----T-TCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGGAACTT--AGC------A------TATCAAT-----AGAGGGCAATAA
gi|139997                     :                                      ttgcTATGGAAAATAAAA----------A-TATG--ATAAAA-----GT-G-T--------------C--AAT--AT-----------CT-G-G--ATC---T---TG---T-------GAT-----AAA--T-T------A-AA--A------A-GTA----T-TTA-----AGTTA-G-----TGTTA-TGAAACCT--GAC------A------GGGTGAC-----AGACGGCAATGA
gi|139998                     :                                      ttgcTATAGCAAC--AAC----------A-TT-AT-ATAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-A-G--ATT---C---TG---T-------CGT-----AAT--ACC------A-AA--A------A-GTA----A-CTA-----AGCTATA-----T-TTG-TGAAACTT--AGC------A------TACAGAT-----
gi|139999                     :                                      ttgcTATTGCAAC--AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C----------------GGTAAAAAAAC--A-C------A-AA--A------A-----------CA---------ACA-----T-ATG-TAAAA-TT--AGC------A------TGTAGAT-----
gi|140000                     :                                      ttgcTATGGCAAC--AAA------------TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--AT-G-
gi|140001                     :                                      ttgcTATGGCAAC--AAA----------A-GT-G--GAAAGA-----TT-A-C--------------G--GAC--ACA------AC--C----G--ATC---C---CA---T-------GGT-----AAC--A-A------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTGCA-----A-CTG-TGAAACTA--AGC------A------TGTATAT-----AG
gi|140002                     :                                       tgcTGTGGCAAC--AAA----------A-TT-G--ATAAAACTTAATT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---C-------AAG-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-T---------CTGAG-----T-GTA-TGAAACTT--GCC------A------TGTGGAT-----AGGGGG
gi|140003                     :                                       tgcTATGGCAAC--ATA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--ATT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---T
gi|140004                     :                                        gcTATTGAAAC--AAA----------A-TA-G--G-AAAA-----TT-A-C--------------A--AAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC----------------------------------------------------------------------------CTGCG-----A-TGG-T-AAACTT--AGC------A------TGTGGAA-----AGAGGACAATAAacaaggactgagaaagta
gi|140005                     :                                         cTATGACAAC--AAA----------A-TA-A--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-G--ATC---C---TG---T-------GGT-----ATC--A-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----T-TTG-TG-AACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGATGGCAATAA
gi|140006                     :                                          TATGTCAAC--AAA----------A-TT-G--GTAGAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--CT-A-G--ATT---C---TG---T-------AGT-----AAC--
gi|140007                     :                                           ATGTCAAC--TAA------------TT-G--GTAAAA-----TC-A-T--------------A---AC--ACA------AT--CT-G-G--ATC---C---TC---C-------AAG-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GTT----T-TCA-----AGCTGTA-----T-TTA-TGAAACTT--
gi|140008                     :                                                 AC--AAG----------A-TA-ATAGTAAAG-----TT-T-A--------------A--GAT--TCA------AC--CT-G-G--AAC---C---TA---T---------------AAC--A-C------A-AA--A------C--TA----T-CTA-----ACATACG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAAATCAAT
gi|140009                     :                                                   --AAA----------A-TA-G--GTAAAA-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------GT--TT-G-G--ATC---C---TA---T-------GGT-----AAC--A-C--------AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTACA-----C-TTG-TGAAA-------C------A------TGTTAAT-----AGAGGGCAATA
gi|140010                     :                                                      AA----------A-TT-G--GTAAAA-----TT-G-T--------------C--CAT--ACC------ACGTCT-G-TCCATC---T---TGAAAT-------A-T-----AAC--A-C------A-TA--A------G-GTA----T-CCA-----AGCTAAA-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TAT
gi|140011                     :                                                                                                                                                                                                    A----T-CTA-----ACCTACA-----T-TTG-TTAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAA
gi|140012                     :                         taaaaaaaattatgtttacaggtctacattcgtgaaaatgagcaacacccTGAAA-----TT-A-T--------------A--AAT--TCA------AC--CT-G-A--ATC---C---TG---C-------AAG-----AACTAA-G------A-AAGTA------A-GTA----T-TCA-----AGCTGAG-----T-GTA-TAAAACTT--GCC------A------TGTGGAT-----GGA
gi|140013                     :                                                                             AAA-----TT-A-C--------------A--GGT--ACA------G------G-G--GTC---CAACTG---TTCAGAGAGAT-----TAC--T-A------A-AC--A------A-GTA----T-CCA-----ATCTAGG-----T-TTC-TGAAACTT--TGC------A------TGCAGAT-----AGAGGGCAATAAaag
gi|140014                     :                                                                               A-----TT-A-C--------------A--GAT--ACA------AC--CT-G-C--TTC---C---TG---C---------------AAC--A-C------A-AC--GT-----A-TTA----T-CCA-----ACCTACA-----T-TTG-TGGAACTT--TTC------A------TGTGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140015                     :                                                                                -----TT-AGC--------------A--GAC--AAA------AA--CT-GTG--ATC---A---TA---T-------AG--------C--A-C------A-AA--T------A-TTA----T-CTA-----ACCTTCA-----T-TTG-TGTAACGT--TGC------A------TGCGTAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140016                     :                                                                                                                   A------AG--CT-A-G--ATG---C---CG---T-------GAT-----AACT-A-C------A-AA--G--------GTA----T-GCA-----AGCTAGA-----T-TTC-TGGAACTT--AGT------A------TGTGGAT-----AGA
gi|140017                     :                                                                                                                   A------AT--CT-G-G--ATG---C---TG---C-------GAT-----AAC--T-C------C-AA--A------A-GTA----T-GCG-----AGCTA---------------GAACTT--GGC------A------TATTGAT-----AGAGGGCAATA
gi|140018                     :                                                                                                                           C--CT-G-C--ATCTGTC---TG---T-------GG------AAC--A-CTTTCTCA-AA--A------A-AAA----T-CCA-----AGAAAAG-----T-TTG-TGAAACT----GC------A------TGTGGAT-----AGTGGGCAGTAA
gi|140019                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTA----C-CCA-----GGCCAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TTTGGAT-----AGAAGACAACAA
gi|140020                     :                                                                                                                                                  gatcgtctgaaagatcactaAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAAG-----T-TTG-GGAAACTT---GC------A------AGCGGAT-----AGAGAGCAATAA
gi|140021                     :                                                                                                                                                         atccggaaatattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTAGT-----T-TTG-TGAAAGTT--TGC------A------TGTGCAT-----TAAGGGCAATAA
gi|140022                     :                                                                                                                                                                atccagaaatatt------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGCTATG-----T-TTA-TAAAATAT--TGC------A------TGTGGGT-----AGAGGGCAATAA
gi|140023                     :                                                                                                                                                tgatga-------GAT-----GAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CAA-----AGTAAGG-----T-TTT-TGAAACTT--TGC------A------TGTGAAT-----AGAAGACAATAA
gi|140024                     :                                                                                                                                                                      AC--T-C------A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140025                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------C-GTA----T-CCA-----AGCTTAG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGTCAATAA
gi|140026                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------T-GTA----T-CCA-----AGCTGGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140027                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AAC-AAG-----A-TTGTTGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140028                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--G------A-GTA----G-CCA-----AGCTA-GAT---T-TTT-TGAAACTT--TGC------A------TATGGAT-----AGAGGGCAGTAA
gi|140029                     :                                                                                                                                                                  gattAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AACTAGG-----T-TCG-TGAAACTT--TGC------A------TATGCCT-----AGAGAAAAATAA
gi|140030                     :                                                                                                                                                           gattT-----AAC--T-C------A-AA--A------A-GCG----T-CTG-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGATCATTAAGAGGGCAATAA
gi|140031                     :                                                                                                                                                                     aAC--T-C------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGGAACTT--AGC------A------TGTGGAT-----AGAGGACAATAA
gi|140032                     :                                                                                                                                                                   attAC--T-C------A-GA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACAT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAGGGAAATAA
gi|140033                     :                                                                                                                                                                     att--A-C------A-AA--ATTGGTTA-GTA----T-TCA-----AGCTACA-----T-TTG-TGAAACTT--AAC------A------TGTTGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140034                     :                                                                                                                                                                           -C------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGT-GAT-----AG-GGGCAATAA
gi|140035                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTA----T-CCA-----AGCTATG-----T-TTA-TGAAATTT--TGC------T------TGTGGAC-----AGAGGGCAATAA
gi|140036                     :                                                                                                                                                                             ------A-AAT-A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140037                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATAA---T-TCA-----AGCTATG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAC-----AGATGGCAACAA
gi|140038                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-AC-----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGACACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAAAAA
gi|140039                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--G------A-GTA----T-CCA-----AGCCTGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGG------A------TGTGAAT-----AAAGGGCAATAA
gi|140040                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGATATA-----T-TTG-TGAAACCT--AGC------A------TAAGTAT-----AGGGGTCAATAA
gi|140041                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-GTG----T-CCA-----AGCCTCA-----T-TTG-TATAACTT--AAG------T------TGTGGTT-----AGAGTGCAATAA
gi|140042                     :                                                                                                                                                                             ------A-AA--A------A-ATAA---T-CCA-----ATCTAAA-----T-TCT-TGAAACTT---GC------A------TGTGGAT-----AGA-GGCTATAA
gi|140043                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-GCA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTTGAT-----AGAGTGTAATAA
gi|140044                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-CAA-----AACTAGG-----T-TTT-TGAAGCTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140045                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-C-A-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140046                     :                                                                                                                                                                                    -AA--A------A-ATA----T-CCA-----AGCTAGG-----T-TGG-TGAAACTT--TTC------A------TGTAGAT-----GGGGGGCAATAA
gi|140047                     :                                                                                                                                                                                       --A------G-GTA----T-CAA-----AGCTAGG-----T-TTG-TGAAACTT--TAC------A------TGTGTAT-----AGAGGGCAATAA
gi|140048                     :                                                                                                                                                                                       --A------A-ACA----T-CCA-----AGCTATG-----T-TTG-TAAAACTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGCGGGCAATAA
gi|140049                     :                                                                                                                                                                                                 -GTA----T-CCA-----AGCCAGG-----T-TTG-TGAAATTT--TGC------A------TGTGGAT-----AGGGGGAAATAA
gi|140050                     :                                                                                                                                                                                                                          -----T-TTG-TGGAACTT--GGC------A------TGTGGAT-----AGAGGGCAGTAA