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lowQualScore                  :        . .    .  . ..      .....   .   .     ......... .      .        . ..  .......... ...... ... .....  ..  .  ......................  ..  ...... ...    .          .......  ..... . ..  .  .   ..                  .    ......  . .. ........   . ..............   .  . ......   .    ..  ..  .    ...... .  .... ......... . . ..   .  .  . .. ..  .....   ....      .....  .  ... ...   .          
lowQualScore                  :        2 1    5  0 55      33333   5   6     555555555 1      5        4 66  1111111111 000000 333 11111  22  5  5555555555555555555555  55  111111 222    4          3333333  44444 4 99  7  4   99                  3    555555  7 00 77777777   5 44444444444444   9  9 777777   1    55  88  8    888888 1  6666 666666666 2 2 11   2  2  1 44 44  77777   1111      77777  1  888 888   7          
consensus                     : TCGTCGT-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C-TA-GTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----N-G--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------NAG-G-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGATAG-GTCGN-TT--CTGGTCG---N--A-GTCG-AT------TGAT-G-A--AGA-TGTAGGT--T--TGGAAT-AGT----CGTTGT-----CT-AG---T---TGTTGAAGTTGTCT
Reference ( gi|42484 )        : TCGTCGT-A-AGTT-TT-TC-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AT-C-TGTGTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----CTG--AT-TA-----A-G--------------TAA-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------CAG-A-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGACG-------T------TTA-TG-T---AAATAG-GTCGC-TT--CTGGTCG---C--A-GTCG-AT------TGGT-G-A--AGA-TGTAGGT--T--TGAAAT-AGT----CGTTGT-----CT-AG---T---TGTAGAAGTTGTCT
gi|42485                      : TCGTCGT-A-AGTT-TT-TC-TTTACC-----CTC-GCA-TTTTG-AT-C-TATGTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----CTG--AT-TA-----A-G--------------TAA-CC------A---GTTG-ACAGCATCAG------CAG-A-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGATG-------T------TTA-TG-T---AGATAG-TTCGC-TT--CTGGTCG---C--A-GTCG-AT------TGAT-G-A--AGA-TGTAGGT--T--TGGAAA-AGT----CGTTGT-----CT-AG---T---TGTCGAAGTTGTTT
gi|42486                      : TCACCGT-A-AGTT-TT-TC-TTTACC-----CTC-ACA-CTTAG-AT-C-TGTGTCATTTT-GGCGAGCA-A--GA----------T-A----G---G----CTG--AT-TA-----A-G--------------TAA-CC------A---TTGG-ACAGCATCGG------CAG-A-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGATGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGACG-------T------TTA-TA-T---AGATAG-GTCGC-TT--CTGGTCG---C--A-GTCG-AT------TGAT-G-A--AGA-TGAAGGT--T--TGGAAT-AGT----TGTTGT-----CT-AA---T---TGTTGAAGTTGTCT
gi|42487                      : TCGTCGT-A-ATTT-TT-TC-TTTACC-----TTC-GCA-CTTTG-AT-C-TGTGTCATTTT-GACGAGCA-G--GA----------T-G----A---G----CTG--AT-TA-----A-A--------------TTA-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------CAG-A-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACTACTGGCT------GG-A--T------A-AGACG-------T------TAA-CG-T---AGATAG-GTCAC-TT--CTGGTCG---C--A-GTCG-AT------TGAT-G-A--AGA-TGAAGGT--T--TGGAAT-AGT----CTTTTT-----CT-AG---T---TGTTGAAGTTGTCT
gi|42488                      : TCGTCGT-A-TTTT-TTTTC-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AT-C-TGTGTTATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----CTG--AT-TA-----A-G--------------TAA-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------CAG-A-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACGACTGGCT------GG-A--T------A-AGACG-------T------TTA-CG-T---AGATAA-GTCGC-TT--CTGGTCG---G--A-GTCG-AT------TGTT-G-A--AGA-TGAAGGT--T--TGGAGT-AGT----CGTTGT-----CT-AA---T---TGTTGAAGTTATTT
gi|42489                      : TCGTCAT-A-AGTT-TT-TC-TTTATC-----CTC-GCA-CTTTG-AT-C-TGTGTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----CTG--AT-TA-----A-G--------------AAG-CA------A---GTGG-ACAGCATCGA------CAG-A-G-T-C--GC-AA---T--CTCCCGGTGTTGCACCACTGACT------GG-A--T------A-AGACG-------T------TTA-CG-T---AGATAG-GTCGC-TT--GTGGTCG---C--A-GTTG-AT------TGAT-G-A--AGA-TGAAGGT--T--CGGAAT-AGG----CGTT
gi|42490                      : TCGTCGT-A-AGTT-TT-TA-TTTATC-----CTC-GAA-CTTTG-AT-C-CGTGTCAATTT-GGCGAGCA-G--GT----------T-A----G---G----CTG--AT-TA-----A-G--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCAG------CAG-T-G-T-C--GC--A------CCCCTGGTGCTGCACCACTGGCT------GT-G--T------A-AGACGA------TTACGTATTA-CG-T---ACATAG-GGCGC-TT--CAGGTCG---C--A-GTC--AT------TGTT-A-A---------AGGT--T--TGGAAT-AGT----CGTTGT-----CT-AG---T---TGTTGAAGT
gi|42491                      : TCGTCGC-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CCTTG-CT---TGAAACATTT--GGCGAGCATG--AA----------T-A----G---A----AT---AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GTTG-ACAACATCGG------CAG-C-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCGGGTGCTGCACCACTGGCT------GG-AACT------GTAGA----------------TTA-TGTT---GAATA--GTCGA-TT--CTGGT-A---A--A-GTCG--T------TG
gi|42492                      : TTGTTGTTG-AGTT-TT-TC-TCTACC-----CTC-GTT-CCTTG--C-C-TGTAGCATTTT-GGCGAGCA-A--CA----------C-A----AA--G----ATG--AT-TA-----T-A--------------TTG-CT------A---ATGG-ACAGCATCGG------CAG-G-G-T-C--GC-TA-CTT--TTCTCGGTACTGCACCATTGGCT------TG----T------ACCGAAG-------G------TTA-TG-T------TGA-GTCGT-Ttctagaagttgaatattaataagtcggtgagtagatcttggag
gi|42493                      : TCGTCGTTA-AGTT-TT-TG-TTTACT-----CTC-GCAGCTTTG-------------TAGT-GGTCAGCA-A--GA----------A-A----T---G----TTT--AT-TT-----A-T--------------CCA-CA------A---AT----CAGCATCTG------TGG-A-A-T-T--GC-TA-CTT--ATTCCGGTGATG-ACCACTGGCA------GG-A--A------C-AGATG-------A------TTA-CG-T---AGATTA-ATCAA-TT--CTCGTCA---T--T-GCCA-AT------T--C-A-A--AAA-TATTG----T--TGA------T----TCTTG-------A-AG---T---TGGTGAAGTTGT
gi|42494                      :   GTCG--A-AGTT-TT-T--TTTACC-----CTT-GCG-GTTTA-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------A-C----A---G----ATG--CT-TT-----T-G--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------CAG-G-G-T-G--AC-TA-TTT--CTCCCGGTGCTGCACTATTGGTT------GGAA--TTA----A-AGATT-------T------TT-----T---ATCTAC-GTCGA-TT--C--GTCG---A--A-TTC---T--------------------TGTAGTT--G--TTAATT-AGTTGAATGTCGT-----CT-AG---T---TG
gi|42495                      :   GTTGG-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCAGCTTTG-CT-C-TAGG-CATTTT-GGCGAGCA-A--TA----------CAA----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------AAG-CC------A---CTGG-ACAGAATCGG------CA--A-G-T-TTAGCTTA-CGT--CTCCCGGTGCTGCACCAC-GGCT------GG-A--TCAGAACA-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGATTC-GTCTA-TT--AT-GTTGATTC----GTTG-ATTCTTGGTGAT-G-A--AAA-TGTAGTT--TC-TGGAA
gi|42496                      :   GTC-T-A-AGTT-CT-TA-TTTACA-----C-------CTTTA-CT-C-T-TGGCATATC-GGCGGGTA-A--GA----------T-A----A---G----AAG--GT-GA-----T-G--------------TAG-CT------A---GTGG-ACAATATCTT------CAG-T-A-T-C--TC-TA------CTCTCGGTGCTGCACCACTGACTC-----GG-A--A------C-AGATG-------A------TTA-T-------------GTTGA-TT--C---TTG---A--A-GT--------------T-G-A--AGA-T-TAG----T--TG-----AGT------TTGT-----CT-AG---T---TGTCGA
gi|42497                      :   GTCTC-A-AGCT-TT-TA-TTTACC-----CTC-TCG-CTTTG-AA-C-TAT-TCATTTT-GTTGAGCA-A--CAGTTGCTT---T-AT---A---G----CTG--AT-TA-----A-
gi|42498                      :   GTCAT-ATAGTT-T---C-TTTACC-----CTC-GCT-CTTTGTAT---TGAG-CATTTT-GGCGAGCA-G--
gi|42499                      :    TTGT-ATAGTT-TT-CA-TTTACC-----CTTAGCA-CTTTG-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-T--GA----------A-C----A---A----TTG--AT-TA-----A-
gi|42500                      :      GT-A-AGTT-TT-TTATTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCAAGCA-G--TA----------T-C----A---G----
gi|42501                      :      GT-G-AGTA-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TTAGTCATTTT-GGCGAGCC-G--GA----------T-A----G---G----ATG--GT-T
gi|42504                      :       T-A-AGTG-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTTAG-CT-C-TAGG-CTTTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----AAG--AT-TA-----C-G--------------ATG-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------CAG-G-T-T-C--GC-TA-CTC--CTCCCGGTGTTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGATG-------A------TTA-T
gi|42502                      :       T-A-AGTG-TT-TA-TTTATC-----CTC-GCA-CTTAG-CT-C-TAGG-CTTTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----AAG--AT-TA-----C-G--------------ATG-CC------A---GTGG-ACAGCATCGG------CAG-G-T-T-C--GC-TA-CTC--CTCCCGGTGTTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGATG-------A------TTA-T
gi|42506                      :       T-A-AGCA-TT-TC-TTTACC-----CTC-GCA-CTTAG-CT-C-AAGGT--TTTT-GACGAGCA-G--GA----------A-C----A---G----AAA--AT-TA-----T-G--------------ATG-CC------G---GTGG-ACCGCATTGG------CAG-G-T-T-C--GC-TA-CTC--CTCCCGGTGCTGCACCAATGGCT------AG-A--T------A-AGATGATTTTTTT------TTA-TG-T---TGGTTGAGTTGT-TT--CT--TAG------A-GATA-GC------TGGT-T-A--TGT-TGTAG----T--CG---T-AGT----TGTTGT-----CT-
gi|42508                      :       T-A-AGTG-TT-TC-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TAAGTCATTTT-GGCGAGCC-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----tgaagctg
gi|42509                      :       T-A-AGTG-TT-TC-TTTACC-----CTC-ACA-CTTTG-AA-C-TAAGTCATTTT-GGCGAGCC-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42510                      :       T-A-AGTA-TT-TG-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TTAGTCATTTT-GGTGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42511                      :       T-A-AATT-TT-TA-TTTATC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-CA-GTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42512                      :       T-A-AGTA-TT-TC-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C-TAAGTCATTTT-GGCAAGCC-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42513                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTA-AA-C-AA-GTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----G---G----ATG--AT-TA-----
gi|42514                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTATC-----CTC-GCG-CTTTA-AA-C-TAAGTCATTTT-GGTGAGCG-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42503                      :       T-A-AGTA-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TAAGTCATTTT-GGCGAGCC-G--GA----------T-A----A---G-----TA--AT-TA-----
gi|42515                      :       T-A-AGTA-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TAAGTCATTTT-GGCGAGCC-A--GA----------T-A----G---G----ATG--AT-TA-----
gi|42516                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTATC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-AG-GTCATTTT-GGCGAGCA-A--GA----------T-A----A---------TT--AT-TA-----A-
gi|42507                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG-AC-C-TA-GTCATTTT-GGCGAGCC-G--A-------------A----A---GCATCCTGGTAT-TA-----C-A--------------CAG-CCCTATTGA---GTGG-ACAG
gi|42517                      :       T-A-AGTT-TT-TG-TTTACC-----CTC-TCA-CTTTG-AA-C-TA-GTTATTTT-GGCAAGCG-T--GA----------T-A----A---G----TTG--AT-T
gi|42518                      :       T-A-CGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG---------GTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----
gi|42519                      :       T-A-AGTG-TT-TG-TGTACC-----TTC-GCG-CTTAA-AT-C-TA-GTCATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------T-A----A----------G--AT-TA-----A----------------TAC-TCGTG---A---GAGG-ATAGTGACAC------CAA-A-G-A-C--AC-CA-CT
gi|42520                      :       T-A-AGTA-TT-TG-TTTACT-----CTT-ACG-CTTTG-AA-C-CG-GTCATTTT-GGTGAGCA-A--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42521                      :       T-A-CGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-GTTTG-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCCAGCA-GGAGA----------T-G----T---G----TTGC-ATGTA-----A-----------------AA-CC------A---CTGT-ATAGAAT
gi|42522                      :       T-A-AGTT-TTTTC-TTTACC-----CGT-GCG-CTTTG-AA-C-TA-GTTATTTT-GGCGAGCC-G--GA----------T-A----A---G----ACG--AG-TA-----
gi|42524                      :       T-A-AGTT-TG-TA-TTTCCC-----CTC-GCT-CTTTA-AA-T-TA-GTAATTTT-GGCAAGCA-G--GA----------T-A----A---G----GTG--AT-TA-----T-A--------------TAA-
gi|42523                      :       T-A-AGGT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C-CA-GTCATTTT-GGCGAGCA-G--AA----------T-
gi|42525                      :       T-A-AGTT-TT-TA-ATTACC-----CTC-GCG-CTTTT-TG-C-TAT-TCATTTT-GACGAGCC-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-T
gi|42526                      :       T-A-AGTG-TT-TA-TTTACT-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C-TGT-TCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42528                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GGG-GTTTG-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42527                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTATG-AA-C-CA-GTCATTTT-GGCGGGCA-G--G
gi|42529                      :       T-A-AGAT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG-AT-C-TG-GTAATTTT-TGTGAGCA-A--AA----------A-A----A---A----C----AA-CA-----A-G--------------TA
gi|42505                      :       T-A-AGTT-TT-TG-TTTACC-----CTT-GCG-CTTTG-AA-C-AG-GTTATTTT-GGCGAGCC-A--GA------------A----A---A----CT
gi|42530                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTT-GCG-CTTTG-AA-C-CA-GTCATTTT-AGCAAGCA-C--AA----------T-A----
gi|42531                      :       T-A-CGTTATT-TG-TTTACC-----CTT-GCA-CTTTG-AA-C-AA-GTCATTTT-CGCGAGAA-G--GA----------T-A----T---G----ATG--GT-TA-----
gi|42532                      :       T-A-ATTT-TT-TA-TTTACC-----TTC-GCG-CTTTG-AA-C-CA-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42534                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTACG-----CTC-GCG-CTATG-AA-C-CA-GTCATTTT-GGCGGGCA-G--G
gi|42533                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TCTATC-----CCC-GCG-CTTTG-AA-A-TG-GACATTTT-GGCGAGCA-G--G
gi|42535                      :       T-A-AATT-TT-TA-TTAATC-----CTC-ACT-CTTTG-AA-C-CA-GTCATTTT-AACATGCA-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----
gi|42536                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTAACC-----CTT-GCA-ATTTGAAT-C---AGTCATTTT-GGCGAGCA-G--
gi|42537                      :       T-A-AGTT-TT-TA-TTTATC-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C--AAGTCATTTT-GGCGGG--------------------A----A---C----CTG--AT-T
gi|42539                      :       T-A-AATT-TT-TA-TTTATC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TA-GTCATTTT-----AACC-T--GA----------T-A----A---G----ACG--AT-TA-----
gi|42538                      :       T-A-AATT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-GTTCG-AA-C-CA-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42541                      :        -A-AGTT-TT-CC-TTTACC-----CTC-TCAGCTTTG-CT-C-TAGG-CATTTT-GGCGAGCA-A--GT----------T-G----A---G----AAG--AT-TA-----T-T--------------TAA-CC------A---GTGG-ACAGCATTGG------CAG-A-G-T-T--GC-TA-CTT--CTTCCGGTGCTGCACCACTGGCC------GG-A--A------A-AGATG-------A------TTA--G-T---AGATA
gi|42543                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTCACCGCGCCCTC-GCAGCTTTG-CT-C-TAGG-CATTTT-GGCGAGCA-A--TA----------C-A----AA--G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCAG------CAG-G-T-T-A--GC-GG-CGT--CTCCCGGTGATGCACCGCTGGCTGGATCAGG-A--T------A-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGATTC-GTCGA-TT--ATGTTGA---T--ACGTTG-ATTCTTGATGAT-G-A--AGA-TGTAGTT--T--atgtagattatgatgatccattatttctggtcgctgatgaagtcaaagatttcttgaagttgttgataagttgatga
gi|42544                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCAGCTTTG-CA-C-TAGG-CATTTT-GGCGAGTA-A--TA----------C-A----AA--G----ATG--AT-TATGTTCATG--------------TAG-CC------A---CTGG-ACAGCATCGG------CAG-G-T-T-C--GC-TA-CTC--CCCCCGGTGCTGCACCACTGGCTGGATCAGG-A--T------A-AAATG-------A------TTA-TG-T---AGACTC-GTCGA-TT--AT-------------GTAG-AT------TAGTAG-A--TTA-TGTAGctggtagatgatgattcgttgaagatg
gi|42545                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-ACA-CTTAG-CT-C-TAGG-CTTTTT-AGCGAGCA-G--GA----------G-C----A---G----ATG--AT-TT-----T-GCT------------TAG-CC------A---CTGA-ACAACATCGG------CAG-A-G-T-T--GC-TA-ATT--CTCCAGGTGCTGCACCACTGGCT------GG-A--A------C-AGATG-------A------TTA-Ta
gi|42546                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTAAG-CT-C-T-TGGCTTTTT-GGTGAGCA-A--GA----------T-A----A---G----TTG--GT-TG-----A-G--------------TAG-CC------A---GTGG-TCAACATT--------CAT-T-A-C-C--AC-TA-CCT--CATCCAGTGCTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGA
gi|42547                      :        -A-AATG-TT-TA-ATTACC-----CTC-GCA-GTTTG-CT-C-TAGG-CATTTT-CGCGCGCA-G--GA----------T-A----A---G----AGG--AT-TA----------------------TCG-CC------A---CTTG-ACAGCATCAG------GAT-G-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCAACACTGGCTC-----GG-G--T------A-AAACA-------T------ATATTG-T---CGAT-G-GTCagataagactgtctatgtcgat
gi|42548                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-T--GA----------A-C----A---G----ATG--CT-TA-----A-
gi|42549                      :        -A-AGTG-TT-TC-TTTACC-----CTC-GCAACTTTG-CT-C-TAGG-CAATTT-GCCGAAGA-G--GAACAGAACAGGC-A----ATTTG----CTG--AA-CA-----G-GAACAGAACATTGTTTGG-CC------G---CTGG-ACAGCATCGG------CAG-----T-T--GC-G---TTGACTCCTGTTGCTGTACTGCTGGCT------GG-A--A------C-AGAAG-------A------TTA-TG-T---
gi|42540                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTTTG-AA-C-TA-GTCATTTT-GGCGAGTA-T--GA----------A-C----A---G----ATG--CT-TA-----A-
gi|42550                      :        -A-AGTT-CT-TA-TTTACC-----GTC-GCG-CTTTA-AT-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42551                      :        -A-AGTT-CT-TA-TTTACC-----GTC-GCA-CTTTA-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42552                      :        -A-AGTT-TT-TA-TTTGGC-----CTC-GCAGCTTTG-CT-T-TAGGT-ATTTC-GACGAGCA-G--GA------------A----A---G----ACG--AT-AA-----A-C--------------TAG-TC------ATCTGTGG-
gi|42542                      :        -A-AGTG-TT-TA-TTTGCC-----CTC-GGA-ATTTC-GC-A-CAAAGCATCTT-AGTGAACA-T--AA----------A-C----A---G----CTG--AT-TAC----A-G--------------TAGTCC------T---CTGG-GCAGCACAGGAAAGCTTAG-A-C-TAA--GT-TG-TTT--CCTTCTGTGTTGCAACACTGGCC------TG-A---------A-AGA-G-------T------TAA-TC-T----AACAG-AT----TT--CTTGATA---C--A--TTG-AT------T--T-A-A--AGA-TG
gi|42553                      :          -AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCA-CTT-A-ACAC-TAGGTT-TTTT-GGCGAGCA-G--GA----------A-C----A---G----AAG--AT-TA-------G--------------TTG-CC------A---G-----------CGG------CAG-G-T-T-C--GT-TA-CTC--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGTT------AG-A--T------A-AGATG-------A------TTA-TT-TTCTATGTTG-GTTGAGTT--GTTGTCT---A--A-GTTG-TT------TCTT-GTA--AAA-AGCCGGT--TA-TGTCAT-AGT----CG----------T-AG---T---TGTaaatttt
gi|42554                      :          -AGTT-TT-TA-TTTACC-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C-TA-GTCAATTT-GGCGAGCA-G--AA----------T-A----A---G----ATG--AT-TA-----tg
gi|42555                      :             TT-TT-TG-TTTACC-----CTC-GCA-CCTTGCAT-A-TATAGCATATT-AGCGAGCA-G--AAA---------T-A----G---G----A-G--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---ATGG-ACAGCCTCGG------CAG-G-G-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACAACTGGCA------GG--------------------------------TTA-TGTT---GAATA--GTTGT-TT--CTGGTCG---T--A-GAAG--T------TGAA-G-ATTAGA-TG-AGGC--CGATG-AGT-AGT----C-TTGTATATGCT-GA---TTAGTGTTGAAGCTGT
gi|42556                      :             TT-TT-TA-TTCACC-----CTC-GCA-CATTG----CATATAACATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------A-C----A---G----AAG--GT-TA-----T-G--------------TA-----------------------------------------G-T-C--GC-TA-CTT--CTCTCGACGCTGCACCACTGGCT------GG-AACT------GTAGA----------------TTA-TG-TTGAAAAT----TCGA-TT--CTGGTCG---TAAA-GTCGTTT------TCGT-G-A--AGT-TA-AAAT--T--T--AATAAGT----CGATGA-----GT-AGATAT---TGTAGATGT
gi|42557                      :              T-TT-TG-TTTACC-----CTC--CG-CTTTG-AA-C-TG-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42558                      :               -TT-TC-TTTACC-----CTC-ACG-CTTTG-AAAC-TA-GTCATTTTTGGCAAGCA-A--GG----------T-ATTAAA---G----CTG--GT-TA-----A-G--------------TAT-AC------A---GTGT-ACAGCATCGG------CAA-G-G-T-C--AC-TA-CTT--GCCCCGGTGCTGCACTACTGGCT------GG-A--T------A-AGAAG-------T------TTA-T
gi|42559                      :               -TT-TA-TTTACC-----ATC-GCG-CTTTG-AA-C-TA-GTCATTTT-GGTGAGCA-G--GA----------T-A----A---G----ATG--AC-TA-----
gi|42560                      :               -TT-TA-TTTACT-----CTC-GCG-CTTTG-AA-C-TA-ATTATTTT-GGCGAGCA-G--GA----------
gi|42561                      :                 T-TC-TTTACG-----CTC-TTG-CTTTG-AA-A-CAAGTCATTTT-GGCGAGCA-A--GA----------T-A----A---G----CTG--GT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCGC------CAG-G-T-T-C--GC-TA-CTC--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGACA-------A------TTA-TT-T----TCTAT-GTCGG-TTGAGTTGTCT---A--A-GTTA-AA------TTGT-T-A--ACATTGTTGGTTCT--TGAAGA-AA------GTTGT-----TTAAG---T---TGT
gi|42562                      :                  -TT-TTTACC-----CTC-GTA-CTTTG-CA-C--ATATCATTTT-GGCGAGAA-A--GA----------A-C----A---A----TAG--AT-TA-----T-G--------------TTG-CG------T---CTGG-ACACCATCGG------CAG-G-A-T-T--GC-AG-CTT--CTCCCGACGCTGCACCTCTGGCA------GG-A--T------A-AGATG-------A------TTG-TG-T---ACATCG-ATTGtt
gi|42566                      :                                                              T-GGCTA-CA-T--AA----------T-C----A---T----CTG--AT-CA-----A-G--------------T---------------GTGGTGCAGCACTGG------GAG-AAG-T-A--GT-GA--TC--CTTCTGATGCTGT-CCACTGGCT------AT-A--T------A-A
gi|42563                      :                                                       ggatcagatgaCGAACA-A--GA----------C-C----A---G----AAG--AT-TAT----ATG--------------TAA-CC------A---CTAG-ACAGTATTGG------CAG-G-A-T-C--GC-TA-CTT--CTCCCAGTACTGCACCACTGGCT------GG-A--T------A-AGACG-------A------GTA-TC-T-----ATAA-GTTGA-TT--gg
gi|42564                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---A
gi|42565                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-A--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---Ag
gi|42566                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-A--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------TG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGCCAG-Gg
gi|42568                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-AG-T---AGCCAG-G
gi|42567                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCAGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGCCAG-G
gi|42569                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----A-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ATT------TG-A--T------C-AGATG-------A------TAA-TG-T---AGCCAG-G
gi|42570                      :                                                                        -G--AA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACATCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TA-T---A
gi|42571                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-A--------------TAG-CC------A---GTGG-ACAGCATCGA------AAG-G-A-T-C--AC-TT-CTT--CTCTTGGTGTTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AAATG-------A------TTA-TG-T---AGCCAG-Gg
gi|42572                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------T---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-TTT--CTCCCAGTGCTGCATCAC--ACT------GA-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGCCAG-G
gi|42574                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-AA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--ATCCCAGTGCTGCACCACCA--T------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TA-T---A
gi|42573                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---A----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGTATCGG------AAA-G-A-T-C--AT-TA-CTT--CTCCCGGTGCTGCATTACT--CT------TG-A--T------C-AAACG-------A------TTA-TA-T---AGCCAG-Gg
gi|42575                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-TC------A---AGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCA
gi|42576                      :                                                                        -G--GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------T---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACC
gi|42577                      :                                                                          --GA----------T-C----A---G----ATG--AT-AA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGAG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTA--CTCCCGGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGCCAG-G
gi|42578                      :                                                                          --GA----------T-C----A---G----ATG--AT-TA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-G--AC-TA-CTT--CTCCCAGCGCTGCACCAC--ATT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TA-T---A
gi|42579                      :                                                                          --GA----------T-C----A---G----ATG--AT-AA-----T-G--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATCAG------AAG-G-A-T-C--AC-TT-CTT--CTCCGGGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TAA-TG-T---AGCCAG-Gg
gi|42543                      :                                                                                                    ----CTG--AT-CC-----A-G------------------CC------A---GCGGTGCATCACCGG------GAG-ACG-C-C--GC-TAAC----CTGCTGATGCTGT-CCACTGGCT------AC-A--T------A-A
gi|42565                      :                                   aagtttttattcaccgcgccctcgcagctttgctctaggcattttggcgagcaatacaaagatga----CTG--AT-CC-----A-G--------------T---------------GTGGTGCAGCACTGG------GAG-AAG-T-A--GT-GA--TC--CTTCTGATGCTGT-CCACTGGCT------AT-A--T------A-Agataagatgattatgtagattcgtcgattatgttgatacgttgattcttgatgatgaagatgtagtttctggtagatgatgattcgttgaagatg
gi|42580                      :                                                                                               ggatcagatgaG--AT-TA-----T-A--------------TAG-CC------A---GGGG-ACAGCATTGG------AAG-G-A-T-C--AC-TA-CTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GG-A--T------C-AGATG-------A------TTA-TG-T---AGCCAG-Gatgattatgtag
gi|42490                      :                                                                                                                                         AG-CC------A---GTGGTGCAGCACCAG--------G-G-G-TGC--GA-CA-CTG--CT---GATGCTGT-CCACTGGCT------
gi|42561                      :                                                                 tcgtcgtaagtttttatttatcctcgaactttgatccgtgtcaatttggcgagcaggttaggctgattaagtAG-CC------A---GTGGTGCAGCACCGG------GAGGA-G-T-A--GC-GAAC----CTGGCGATGCTGT-CCACTGGCT------AC-A--T------A-Agtgtaagacgattacgtattacgtacatagggcgcttcaggtcgcagtcattgttaaaggtttggaatagtcgttgtctagttgttgaagt
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Reference ( family-306 )      :                                                TCGTCGT-A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---T---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-N--G--T------AG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCGGNAGGGTC-------GC-TACTT--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---ATAG-GTCG-NTT--CTGGT----CG-------NA-GTC-GAT------T--GAT---G-A--AGATGTAGGTT--TG--GAAT-AGTCGTTGT-----CTAGT---TGTTGAAGTTGTCT
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gi|42488                      :                                                TCGTCGT-A-TTTT-TT-TTCTTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAT---C---T---GTGTTATTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-C---T-G--ATTA-A--G--T------AA-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCGGCAGAGTC-------GC-TACTT--CTCCCGGTGCTGCACGACTGGCT------GGA----T------A-AGACGT-------T-TA-----CGTA----G---ATAA-GTCG-CTT--CTGGT----CG-------GA-GTC-GAT------T--GTT---G-A--AGATGAAGGTT--TG--GAGT-AGTCGTTGT-----CTAAT---TGTTGAAGTTATTT
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gi|42502                      :                                                      T-A-AGTG-TT-T-ATTTATC-----CTC-GC-ACTTA-GCT---C---T---A-GGCTTTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-A---A-G--ATTA-C--G--A------TG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCGGCAGGTTC-------GC-TACTC--CTCCCGGTGTTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGATGA-------T-TA-----T
gi|42503                      :                                                      T-A-AGTA-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---TA--A-GTCATTTT-GGCGAGCC-GGA-TA----A-G-----T-A--ATTA-
gi|42504                      :                                                      T-A-AGTG-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACTTA-GCT---C---T---A-GGCTTTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-A---A-G--ATTA-C--G--A------TG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCGGCAGGTTC-------GC-TACTC--CTCCCGGTGTTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGATGA-------T-TA-----T
gi|42505                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-GTTTACC-----CTT-GC-GCTTT-GAA---C---A---G-GTTATTTT-GGCGAGC
gi|42506                      :                                                      T-A-AGCA-TT-T-CTTTACC-----CTC-GC-ACTT---AG---C---TCAAG-GT--TTTT-GACGAGCA-GGA-AC----A-G-A---A-A--ATTA-T--G--A------TG-CC------G---GTGGA-CCGCA-TTGGCAGGTTC-------GC-TACTC--CTCCCGGTGCTGCACCAATGGCT------AGA----T------A-AGATGATTTTTTTT-TA-----TGTT----G---GTTGAGTTG-TTT--CT--T----AG-------AG-ATA-G-C------T--GGT---T-A--TGTTGTAG--T--CG-----T-AGTTGTTGT-----C---------TTGAAGCTGcagaaaact
gi|42507                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-GAC---C---T---A-GTCATTTT-GGCGAGCC-GA---A----A-GCATCCT-GGTATTA-C--A--C------AG-CCCTATTGA---GTGGA-CAG
gi|42508                      :                                                      T-A-AGTG-TT-T-CTTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---T---AAGTCATTTT-GGCGAGCC-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42509                      :                                                      T-A-AGTG-TT-T-CTTTACC-----CTC-AC-ACTTT-GAA---C---T---AAGTCATTTT-GGCGAGCC-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42510                      :                                                      T-A-AGTA-TT-T-GTTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---TT--A-GTCATTTT-GGTGAGCA-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42511                      :                                                      T-A-AATT-TT-T-ATTTATC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42512                      :                                                      T-A-AGTA-TT-T-CTTTACC-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---T---AAGTCATTTT-GGCAAGCC-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42513                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-AAA---C---A---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----G-G-A---T-G--ATTA-
gi|42514                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTATC-----CTC-GC-GCTTT-AAA---C---TA--A-GTCATTTT-GGTGAGCG-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42515                      :                                                      T-A-AGTA-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---TA--A-GTCATTTT-GGCGAGCC-AGA-TA----G-G-A---T-G--ATTA-
gi|42516                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTATC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---A---G-GTCATTTT-GGCGAGCA-AGA-TA----A-
gi|42517                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-GTTTACC-----CTC-TC-ACTTT-GAA---C---T---A-GTTATTTT-GGCAAGCG-TGA-TA----A-G-T---T-G--ATTttattaa
gi|42518                      :                                                      T-A-CGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-G---------------GTCATTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-
gi|42519                      :                                                      T-A-AGTG-TT-T-GTGTACC-----TTC-GC-GCTTA-AAT---C---T---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-GGA-TA----A-G-A---T-
gi|42520                      :                                                      T-A-AGTA-TT-T-GTTTACT-----CTT-AC-GCTTT-GAA---C---C---G-GTCATTTT-GGTGAGCA-AGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-taatactcgtgagaggatagtgacaccaaagacaccact
gi|42521                      :                                                      T-A-CGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GGTTT-GAA---C---T---G-GTCATTTT-GGCCAGCA-GG--------A-G-A---T-G--
gi|42522                      :                                                      T-A-AGTT-TT-TTCTTTACC-----CGT-GC-GCTTT-GAA---C---T---A-GTTATTTT-GGCGAGCC-GGA-TA----A-G-A---C-G--AGTA-tgttgcatgtaaaaccactgtatagaat
gi|42523                      :                                                      T-A-AGGT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-GAA-T
gi|42524                      :                                                      T-A-AGTT-TG-T-ATTTCCC-----CTC-GC-TCTTT-AAA---T---T---A-GTAATTTT-GGCAAGCA-GGA-TA----A-G-G---T-G--ATTA-T--A--T------A
gi|42525                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-AATTACC-----CTC-GC-GCTTT-TTG---C---T---A-TTCATTTT-GACGAGCC-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTa
gi|42526                      :                                                      T-A-AGTG-TT-T-ATTTACT-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---T---G-TTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42527                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTAT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-GGCGGGCA-GG
gi|42528                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GG-GGTTT-GAA---C---T---G-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42529                      :                                                      T-A-AGAT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-GAT---C---T---G-GTAATTTT-TGTGAGCA-
gi|42530                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTT-GC-GCTTT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-AGCAAGCA-CAA-TA----aaaaaaacaacaagta
gi|42531                      :                                                      T-A-CGTTATT-T-GTTTACC-----CTT-GC-ACTTT-GAA---C---A---A-GTCATTTT-CGCGAGAA-GGA-TA----T-G-A---T-G--GTTA-
gi|42532                      :                                                      T-A-ATTT-TT-T-ATTTACC-----TTC-GC-GCTTT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42533                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATCTATC-----CCC-GC-GCTTT-GAA---A---T---G-GACATTTT-GGCGAGCA-GG
gi|42534                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTACG-----CTC-GC-GCTAT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-GGCGGGCA-GG
gi|42535                      :                                                      T-A-AATT-TT-T-ATTAATC-----CTC-AC-TCTTT-GAA---C---C---A-GTCATTTT-AACATGCA-GGA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42536                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTAACC-----CTT-GC-AATTT-GAA---T---C---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-G
gi|42537                      :                                                      T-A-AGTT-TT-T-ATTTATC-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---A---A-GTCATTTT-GGCGGG
gi|42538                      :                                                      T-A-AATT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GGTTC-GAA---C---C---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-aacctgatt
gi|42539                      :                                                      T-A-AATT-TT-T-ATTTATC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---T---A-GTCATTTT-----AACC-TGA-TA----A-G-A---C-G--ATTA-
gi|42540                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---T---A-GTCATTTT-GGCGAGTA-TGA-AC----A-G-A---T-G--CTTA-
gi|42541                      :                                                       -A-AGTT-TT-C-CTTTACC-----CTC-TCAGCTTT-GCT---C---T---A-GGCATTTT-GGCGAGCA-AGT-TG----A-G-A---A-G--ATTA-T--T--T------AA-CC------A---GTGGA-CAGCA-TTGGCAGAGTT-------GC-TACTT--CTTCCGGTGCTGCACCACTGGCC------GGA----A------A-AGATGA-------T-TA------GTA----G---ATAATGTAG-ATT--ATGATGATCCATTATTTCTG-GTC-G-C------T--GAT---G-A--AGTCAAAGATTTCTT--GA---AGTTGTTGA-----TAAGT---TGATGAa
gi|42542                      :                                                       -A-AGTG-TT-T-ATTTGCC-----CTC-GG-AATTTCGCA---C---A---A-AGCATCTT-AGTGAACA-TAA-AC----A-G-C---T-G--ATTACA--G--T------AGTCC------T---CTGGG-CAGCA-CAGGAAAGCTTAGACTAAGT-TGTTT--CCTTCTGTGTTGCAACACTGGCC------TGA-----------A-AGA-GT-------T-AA-----TCTA--------ACAG-AT----TT--CTTGA----TA-------CA--TT-GAT------T----T---A-A--AGATG
gi|42543                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTCACCGCGCCCTC-GCAGCTTT-GCT---C---T---A-GGCATTTT-GGCGAGCA-ATA-CA----AAG-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCAGCAGGTTA-------GC-GGCGT--CTCCCGGTGATGCACCGCTGGCTGGATCAGGA----T------A-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---ATTC-GTCG-ATT--ATGTT----GA-------TACGTT-GATTCTTGAT--GAT---G-A--AGATGTAGTTTC-TG--G--T-AGATGATG--------ATT---CGTTGAAGATGaaatttt
gi|42544                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GCAGCTTT-GCA---C---T---A-GGCATTTT-GGCGAGTA-ATA-CA----AAG-A---T-G--ATTA-T--G--TTCATGTAG-CC------A---CTGGA-CAGCA-TCGGCAGGTTC-------GC-TACTC--CCCCCGGTGCTGCACCACTGGCTGGATCAGGA----T------A-AAATGA-------T-TA-----TGTA----G---ACTC-GTCG-ATT--AT-GT----AGAT-----TA-GTA-GAT------T---AT---G-T--AGA
gi|42545                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-AC-ACTTA-GCT---C---T---A-GGCTTTTT-AGCGAGCA-GGA-GC----A-G-A---T-G--ATTT-T--GCTT------AG-CC------A---CTGAA-CAACA-TCGGCAGAGTT-------GC-TAATT--CTCCAGGTGCTGCACCACTGGCT------GGA----A------C-AGATGA-------T-TA-----T
gi|42546                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACT----AAGCTC---T---T-GGCTTTTT-GGTGAGCA-AGA-TA----A-G-T---T-G--GTTG-A--G--T------AG-CC------A---GTGGT-CAACATTCATTA---CC-------AC-TACCT--CATCCAGTGCTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGAAGA-------T-
gi|42547                      :                                                       -A-AATG-TT-T-AATTACC-----CTC-GC-AGTTT-GCT---C---T---A-GGCATTTT-CGCGCGCA-GGA-TA----A-G-A---G-G--ATTA-------T------CG-CC------A---CTTGA-CAGCA-TCAGGATGGTC-------GC-TACTT--CTCCCGGTGCTGCAACACTGGCTC-----GGG----T------A-AAAC-A-------TATAT----TGTC----G---AT-G-GTCaagactgtctatgtcgat
gi|42548                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACTTT-GAA---C---T---G-GTCATTTT-GGCGAGCA-TGA-AC----A-G-A---T-G--CTTA-
gi|42549                      :                                                       -A-AGTG-TT-T-CTTTACC-----CTC-GCAACTTT-GCT---C---T---A-GGCAATTT-GCCGAAGA-GGA-a
gi|42549                      :                                                                                            -GAA---C-------A-GGCAATTT-GCTGAACA-GGA-AC----A-G-A---A-C--ATTG-T--T--T------GG-CC------G---CTGGA-CAGCA-TCGGCAG--TT-------GC-G--TTGACTCCTGTTGCTGTACTGCTGGCT------GGA----A------C-AGAAGA-------T-TA-----TGTacagaacaggcaatttgctgaacaggaacagaacattgtttggccgctggacagcatcggcagttgcgttgactcctgttgctgtactgctggctggaacagaagattatgt
gi|42550                      : aagtgtttctttaccctcgcaactttgctctaggcaatttgccgaagaggaaca-A-AGTT-CT-T-ATTTACC-----GTC-GC-GCTTT-AAT---C---T---G-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42551                      :                                                       -A-AGTT-CT-T-ATTTACC-----GTC-GC-ACTTT-AAA---C---T---G-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42552                      :                                                       -A-AGTT-TT-T-ATTTGGC-----CTC-GCAGCTTT-GCT---T---T---A-GGTATTTC-GACGAGCA-GGA--A----A-G-A---C-G--ATAA-A--C--T------AG-TC------ATCTGTGG
gi|42553                      :                                                         -AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-ACTTA-ACA---C---T---A-GGTTTTTT-GGCGAGCA-GGA-AC----A-G-A---A-G--ATTA----G--T------TG-CC------A---G------------CGGCAGGTTC-------GT-TACTC--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGTT------AGA----T------A-AGATGA-------T-TATTT--TCTA----T---GTTG-GTTGAGTT--GTTGT----CT-------AA-GTT-GTT------T--CTT---GTA--AAAAGCCGGTTA-TG--TCAT-AGTCG----------TAGT---TGTTG
gi|42554                      :                                                         -AGTT-TT-T-ATTTACC-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---T---A-GTCAATTT-GGCGAGCA-GAA-TA----A-G-A---T-G--ATTA-
gi|42555                      :                                                            TT-TT-T-GTTTACC-----CTC-GC-ACCTT-GCA---TATAT---A-G-CATATT-AGCGAGCA-GAAATA----G-G-A-----G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---ATGGA-CAGCC-TCGGCAGGGTC-------GC-TACTT--CTCCCGGTGCTGCACAACTGGCA------GG---------------------------T-TA-----TGTT----GA--ATA--GTTG-TTT--CTGGT----CG-------TA-GAA-G-T------T--GAA---G-ATTAGATG-AGG-C--CGATGAGT-AGTC-TTGTATATGCTGATTAGTGTTGAAGCTGT
gi|42556                      :                                                            TT-TT-T-ATTCACC-----CTC-GC-ACATT-GCA---TA--T---A-A-CATTTT-GGCGAGCA-GGA-AC----A-G-A---A-G--GTTA-T--G--T------AG----------------------------------TC-------GC-TACTT--CTCTCGACGCTGCACCACTGGCT------GGAACTGT------A-----GA-------T-TA-----TGTT----G---AAAA-TTCG-ATT--CTGGT----CGTA-----AA-GTC-GTT------TTCG-T---G-A--AGTTA-AAATT--T----AATAAGTCGATGA-----GTAGA---TATTGTAGATGT
gi|42557                      :                                                             T-TT-T-GTTTACC-----CTC--C-GCTTT-GAA---C---T---G-GTCATTTT-GGCGAGCA-
gi|42558                      :                                                              -TT-T-CTTTACC-----CTC-AC-GCTTT-GAAA--C---T---A-GTCATTTTTGGCAAGCA-AGG-TATTAAA-G-C---T-G--GTTA-A--G--T------AT-AC------A---GTGTA-CAGCA-TCGGCAAGGTC-------AC-TACTT--GCCCCGGTGCTGCACTACTGGCT------GGA----T------A-AGAAGT-------T-TA-----T
gi|42559                      :                                                              -TT-T-ATTTACC-----ATC-GC-GCTTT-GAA---C---T---A-GTCATTTT-GGTGAGCA-GGA-TA----A-G-A---T-G--ACTA-
gi|42560                      :                                                              -TT-T-ATTTACT-----CTC-GC-GCTTT-GAA---C---T---A-ATTATTTT-GGCGAGCA-GGA-
gi|42561                      :                                                                T-T-CTTTACG-----CTC-TT-GCTTT-GAAA--C---A---A-GTCATTTT-GGCGAGCA-AGA-TA----A-G-C---T-G--GTTA-T--G--T------AG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCGCCAGGTTC-------GC-TACTC--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGACAA-------T-TA-----TTT-----T---CTAT-GTCG-GTTGAGTTGT----CT-------AA-GTTAAAT------T--GTT---A-A--CATTGTTGGTTC-TT--GAAG-AA--------------AGT---TGTTTAAGTTGTTT
gi|42562                      :                                                                     TTTACC-----CTC-GT-ACTTT-GCA---CA--T---A--TCATTTT-GGCGAGAA-AGA--A----C-A-A---TAG--ATTA-T--G--T------TG-CG------T---CTGGA-CACCA-TCGGCAGGATT-------GC-AGCTT--CTCCCGACGCTGCACCTCTGGCA------GGA----T------A-AGATGA-------T-TG-----TGTA----C---ATCG-ATTG-
gi|42563                      :                                                                                                                      ttCGAACA-AGA-CC----A-G-A---A-G--ATTA-TATG--T------AA-CC------A---CTAGA-CAGTA-TTGGCAGGATC-------GC-TACTT--CTCCCAGTACTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGACGA-------G-TA-----TCT---------ATAA-GTTG-ATT--
gi|42564                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCGGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---
gi|42565                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--A--T------AG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---
gi|42566                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--A--T------AG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------TGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42567                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCAGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42568                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----AGTA----G---CCAG-G
gi|42569                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-A--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ATT------TGA----T------C-AGATGA-------T-AA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42570                      :                                                                                                                              -GAA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CATCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TATA----G---
gi|42571                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--A--T------AG-CC------A---GTGGA-CAGCA-TCGAAAGGATC-------AC-TTCTT--CTCTTGGTGTTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AAATGA-------T-TA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42572                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------T---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TATTT--CTCCCAGTGCTGCATCAC--ACT------GAA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42573                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-A-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGTA-TCGGAAAGATC-------AT-TACTT--CTCCCGGTGCTGCATTACT--CT------TGA----T------C-AAACGA-------T-TA-----TATA----G---CCAG-G
gi|42574                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATAA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--ATCCCAGTGCTGCACCACCA--T------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TATA----G---
gi|42575                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-TC------A---AGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCA
gi|42576                      :                                                                                                                              -GGA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------T---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACC
gi|42577                      :                                                                                                                                GA-TC----A-G-A---T-G--ATAA-T--G--T------AG-CC------A---GGAGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TACTA--CTCCCGGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42578                      :                                                                                                                                GA-TC----A-G-A---T-G--ATTA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATG-------AC-TACTT--CTCCCAGCGCTGCACCAC--ATT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TATA----G---
gi|42579                      :                                                                                                                                GA-TC----A-G-A---T-G--ATAA-T--G--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TCAGAAGGATC-------AC-TTCTT--CTCCGGGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-AA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42580                      :                                                                                                                                                  -G--ATTA-T--A--T------AG-CC------A---GGGGA-CAGCA-TTGGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42581                      :                                                                                                                                                                                                  -TCAGAAGGATC-------AC-TACTT--CTCCCGGTGCTGCACCAC--ACT------GGA----T------C-AGATGA-------T-TA-----TGTA----G---
gi|42582                      :                                                                                                                                                                                                        AGGATC-------AC-TACTT--CTCCCAGTGCTGCACCAC--ACT------TGA----T------C-AGATGA-------T-AA-----TGTA----G---CCAG-G
gi|42583                      :                                                                                                                                                                                                                           TT--CTCCCGGTGCTGCACCACTGGCT------GGA----T------A-AGACGA-------T-TAATTTCTCTA----A---GTAG-GT