lowQualScore                  :         1                   11                                              1                                                                                                   1111111111111                           11111111                                    
lowQualScore                  :       6 3  3                22            1                                 3             7  555   66           22 5   5  1 555  3          111   0 33333 2  44444444444 444444 0000000000000   0000 000 11 0  0 00     22222222 0000           00   0 0000         
lowQualScore                  :       . .  .                ..            .                                 .             .  ...   ..           .. .   .  . ...  .          ...   . ..... .  ........... ...... .............   .... ... .. .  . ..     ........ ....           ..   . ....         
lowQualScore                  :       7 3  3                66            5                                 6             4  000   88           66 0   1  6 555  4          222   4 44444 1  44444444444 666666 3333333333333   9999 777 00 8  4 66     33333333 9999           66   4 9999         
consensus                     : TTTTTA-A-TT-CTCATTCATAATATGTCGATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTCCCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCG--CGGTCGCACGN--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
Reference ( gi|120286 )       : TTTTTA-A-TT-CTCATTCATAATATGTAAATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTCCCAACAGATTCCGTTTGGAACTTCCAGTTGGT---AAA--ATCGGCTTCCG--CGGTTGCACGT--CTTGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------CT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120287                     : TTTTTA-A-TT-CTCATTCATAATATGTCAATTCTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTCCCAACAGATTGCGTTGGGAACTTCCAGTTAAT---AAA--ATCGGCTTCCG--CGGTTGCACGT--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AG-G--GCTCT-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120289                     : TTTTTA-A-TT-ATCATTCATAATATGTCAATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTCCCAACAGATTCCGTTAAGAACTTCCAGTTAGT---AAAT-TTCGGCTTCCA--TGGTTGCACGT--CTTGGGAGACGCA---AAA-C-----T-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120290                     : TTTTCA-T-TT-CTTATTCATTATATGTCAATTGTTCGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTTCCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCG--CGGTTGCACAT--CTCAGGAGAGGCAT--AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120288                     :  TTTTACA-TT-CTCATTCATAATATGTTGATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTCCCAACAGATTCCATTGGGAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGGCTTCCG--CAGTTGCACCG--CTCAGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAAACATGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120291                     :  TTTTA-ACTT-CTCATT-ATAATATGTCGATTGTTCGGATAGTAAATTTGTAAAACCTTCCCCACAGATTCTGTTGGGAACTTCCAGTGAGT---AAA--ATCGGCTTCCG--TGGTTGCATGG--CTCAGGAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTTC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120292                     :  TTTTA-A-TTTCTCATTCATAATATATCGATTGTAAGGATAATAAAGTCGTGATACCTTCCCAAAAGATTCCGTTGGGAACTTCCAATGAGT---AAA--ATCGGCTTCCG--CAGTTGCAAGG--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------TTT----TAAAA--A-AA-G--GCT-C-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120293                     :  TTTTATA-TT-CTCATTCATAATATGTTGATTGTTTGTATTGTAAA----------------------TTCTGTTGGAAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGACTCCCG--TGGTTGCACGG--CTTGGGAGATGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTACACTA
gi|120294                     :  TTTTA-ACTT-CTCTATCATAATATGTCGATTGTTTGGATTTTAA-GTCGTGCAGCCTCCCAAATATATTCCGTTAAGAATATCCAGTAGGT---AAA--ATCGTCCCACG--CGGTTGCACGT--CTCGGTAGATGCA---TAA-T-----A-CA-----------A------A------------------------A--A-AA-A--ACTTCAA-----AT----GGAGACATGAA--ATA-G----TTTGCACTA
gi|120295                     :  TTTGA-ACTT-CTCATTCA--ATATATATATTAT---GATTTTTTTATTTTGGAGCTACTCCAACAGTTTCTGTTGGCAACTTCCAATACAT---AAAGAAACAAA----G--CAGTCACA---------GGAGATATA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----C---A--A-AC-A--GCTCC-------TC----AGAAATGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120296                     :  TTTCA-ACTT-CTCGCTCATG---TGTAGATTGTTT--------AAGTCATGAACTCTTCCCAATACATTAAATTGGGAACTTCCAACTGGTTTAAAG--AT-GACTTCAG--CAATTACTGAT--CCAAAGAGATACG---AAA-T-----A-AA-----------
gi|120298                     :   TTAA-A-TT-TTCATTCATAATATGTCAATTGTTTGGATTTTAAAGTGGTGAAACATTCCCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGC---AAA--ATCGTCTTCCG--CGGTTGCAAGG--CTCGGGAGACGCA---AAA-------A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--T-AA-G--GCTCC-------AT----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120299                     :      A-A-TT-CTCATTCATAATATCTGGATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTCCCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCA----GT---AAA--ATTGGCTTCCG--CTGTTGCATGG--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGCCGTGGA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120297                     :              taACTCATAATATGTCGACTGTTTGGGTTTGAAAGTCGTGAAACCTTCCCAACAGATTCTGTTTGGAACTTTCAGTT--T---AAA--A--GGCTCC
gi|120300                     :              tttaaataacaATGTCAACTGTTTGGATC--AAAGTCATGAAACCTTCTCAACAGATTCTGTTGACAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCAGCTTCCG--CGGTTGCACGG--CTTGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC-------AT----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120304                     :                                                                                                            TTCTG--CTGTC-CATAA--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120303                     :                                                                                                            TTCTG--CTGTC-CATAA--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120305                     :                                                                                                            TTCTG--CTGTC-CATAA--CTCGGAAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAAA-CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120306                     :                                                                                                            TTCTG--CTGTC-CATAA--CTCGGGAGATGAA---AAA-T-----A-AATT---------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGTACTA
gi|120308                     :                                                                                                            TTCTG--C--TTGTCTGT--CTGAGTAGACGCA---AAA-T-----A-TA-----------A------A--------T----CTT----C---G--A-AA-G--GCTCC-------AT----AATGACTTGCA--ACA-T----GTCGCACT
gi|120307                     :                                                                                                            TTCTG--CTGTC-CATAA--CTCGGGAGACGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----AAA----T---A--A-AA-G--GCT-C-------CT----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTAGTACTA
gi|120302                     :                                                                                                             TCCGATCTGTTGTCCATAACTCAGGAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------CAAA-CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGATGTGCA--ATT-T----GTCGCACT
gi|120311                     :                                                                                                      ttggataTCTG--CTGTC-CATGG--CTCAGGAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----ATAGAAG-GCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120313                     :                                                                                                                     GTTACACGT--CTCAGGAGACACA---AAA-T-----AAAA-----------A------A--------T----CAT----T---C--A-A-------------------------AGACGTGCA--GTA-T----GTCTCATTA
gi|120314                     :                                                                                                                       TGCA--T--CTTGTGAGACACA---AA--C-----A-AA-----------A------T--------T----GTC----C---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACATGCA--AAA-T----GTCACACTA
gi|120315                     :                                                                                                                         CATGT--CTCGGAAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CCA----C---A--A-AA-T--GCTTC-------TC----AGAGACAT--A--ATA-T----GTTGCGCTA
gi|120316                     :                                                                                                                          ACGT--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120318                     :                                                                                                                          ACGT--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GGTCT-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120317                     :                                                                                                                          ACGG--CTCGGCAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------C------------------G--GCTCC-------AT----AGAAAC-TAAG--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120324                     :                                                                                                                           CGT--CTCTAGAGACGCA---AAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CTT----C---AG-A-AA-G--GCTAT-------TT----AGAGACGTGTA--ATA-T----GATGCACTA
gi|120323                     :                                                                                                                           CGG--CTTGGGA-----A---AGA-A-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----GGAGACTTGTA--ATA-C----GTCGCACT
gi|120331                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120332                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGCA---AAA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120333                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTGACACTA
gi|120334                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-T--GCTCC-------CT----AAAGACATGCA--ATA-T----GTGGCACTA
gi|120327                     :                                                                                                                              --CTCAGGAGACGCA---ATA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120301                     :                                                                                                                             g--CTCAGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTCC-------TT----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120321                     :                                                                                                         ttggatatctgctgtccataa--CTCGGGAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----TAC----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120328                     :                                                                                                                           cag--CTCAGGAGACGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-C--GCTCC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120309                     :                                                                                                                             g--CTCGGGAGATGCG---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA-------AC----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120335                     :                                                                                                                tctgctgtccataa--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A------------------------------------TT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120336                     :                                                                                                                              --CTCAGAAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----GGAGATGTGCA--GTA-T----GCCGCACT
gi|120337                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGAA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AACAACTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120341                     :                                                                                                                              --CTTGGGAGACGCA---AGA-T-----A-AACAAAATATTTAA------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCA-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120340                     :                                                                                                                              --CTCGAGAGACACA---AAT-C-----A-AA-----------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC-------TC----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120326                     :                                                                                                                              --CTCAGGAAACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----TGAGACATGCA--ATA-G----GTCACAC
gi|120320                     :                                                                                                                            gg--CTCGAGAGAC-CA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTG----T---A--A-AA-G--GCACC-------AT----AGAGACGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120343                     :                                                                                                                          acag--CTCGGGAGACGCA---AAA-A-----A-AA-----------A------AAAAAAATGT----C----------A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120339                     :                                                                                                                              --CTCGGCAGACGCA---AAA-T-----A-AATAAA-------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCA
gi|120330                     :                                                                                                                              --CTTGGGAGATGCA---AAT-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTT----T---A--G-AA-G--GCTCT--------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTCAACTA
gi|120345                     :                                                                                                                             g--CTTGAGAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----GTC--------A--A-AA-G--G-TCC-------TT----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120342                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACTCA---AAAAT-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAGATGTGCA--ATA-TGTCCGTCGCACTA
gi|120349                     :                                                                                                                              --CTTGGGAGACGCA---TAA-T-----G-AA-----------T------A--------T----TTT----C---A--A-AA-A--ACTAC-------TT----AGAGAAGTGCA--ATA-T----GTCACAC
gi|120348                     :                                                                                                                              --CTTGGGAGAAGTG---AAA-T-----GTGA-----------G------A--------T----CGT----C---A--A-AA-G--GCTTC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCATACTA
gi|120312                     :                                                                                                                              --CTCGGGAAACACA---AAA-T-----A-AA-----------AAAAA--A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TA----AGA-AC-TACA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120347                     :                                                                                                                tctgctgtccataa--CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------ATAAAAAA--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GATCT-------TT----AGAAAC--GCAATATA-T----GTCGTACTA
gi|120346                     :                                                                                                                              --CTCAGCAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----ATT----T---A--A-AA-T--ATTTC-------TT----AAAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120350                     :                                                                                                                              --CTCAGAAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTTATTTT---A--ATAA-G--GCTGC-------TT----AGAGACGTACA--ATA-T----GACGCGCTA
gi|120353                     :                                                                                                                              --CTCAGGAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CTT----A---A--G-AA-G--GCTCT-------TA----AGAGTTGTGCA--ATA-T----GCCAC
gi|120351                     :                                                                                                                              --CTCAGGAGAGGCA---AAA-TGAAATA-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-AA-AAAGTCTT-------TT----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120338                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----AAG----C---A--A-AA-G--GTTCC-------TTTTAAAGAGACATGCA--AAA-T----GCCACAGTA
gi|120357                     :                                                                                                                              --CTCAGGAGACGTA---AAA-A-----A-AA-----------C------A--------A----CAT----C---A--ACAA-G--GCTCC-------TT----AAAGATGTGCA--ATA-T-------GCACT
gi|120358                     :                                                                                                                              --CTCGGGAGACGCT---AAA-T-----T-AA-----------A---------------------TT----A---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----GGAGATGTGAA--ATA-T----AT
gi|120355                     :                                                                                                                              --CTCGAGGGAC--A---AAA-T-----A-AT-----------T------T--------T----GTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AT----AGAAATGTGTA--ACA-T----GTTACACCA
gi|120310                     :                                                                                                                                 TCGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120359                     :                                                                                                                  tctgctgtccataatTCGGGAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTTC-------TT----AAAGACATTCA--GTA-T----GTTGCACT
gi|120362                     :                                                                                                                                 TTGGAAGAGGCA---TAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CAT----T---A--T-AA-G--GCTCC-------TT----GGAGATGTACA--ATA-T----ATCACACTA
gi|120363                     :                                                                                                                                 TTGGGAGATACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAA------G----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----TGAGACGTGCA--A
gi|120364                     :                                                                                                                                 TTGGGAGGCGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAAA----T----C----------A--A-AA-G--GCTAC-------TT----GGAGAATTACA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120361                     :                                                                                                                                 TCGGGAGACGTA---AAA-T-----A------------------------------TTTG-CTT----T---ATAA-AA-G--GCTCC-------GT----AGAGACGTGCA----C-T----GTCACACTA
gi|120329                     :                                                                                                                                  TGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----AAT----T---A--A-AA-A--GTTCC-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120325                     :                                                                                                                                 gcGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCTCACTA
gi|120365                     :                                                                                                                               ggccGGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CAT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------GT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120368                     :                                                                                                                                  cGGGAGACACACAAAAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCT-------GT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120369                     :                                                                                                                                    GGAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACT
gi|120319                     :                                                                                                                                    GGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGACATGCA--ATACT----GTCACACTA
gi|120344                     :                                                                                                                            actgttcaGGAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CAT----C---A--G-AA-G--ACTCC-------TT----AGAGATGTGCA----A-T----GTCACACTA
gi|120360                     :                                                                                                                                ctccGGAGACGCA---AAA-T------------------------------------------------T---A--A-AA-G--ACTCC-------CC----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCATTA
gi|120370                     :                                                                                                                                  tcaGAGACGCA---AAA-T-----A-AAC----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC-------TT----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120322                     :                                                                                                                                     GAGACACA---AAA-T-----A-AAGA---------A------A--------T----CGT----T---A--A-AA-G--ACTCC-------TT----AGAGACCTGCA--GTA-T----GTCGCAC
gi|120352                     :                                                                                                                           cggctctgctGAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT-------CA----AGAAAT-TGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120367                     :                                                                                                                                ctccaGAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------TAA--TCT----T---A--T-AA-A--GCTCC-------TT----TTAGACGTGCA--GTA-T----GTCCAACTA
gi|120354                     :                                                                                                                                  cgcGAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GATTC-------TA----ATAAAT-TGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120371                     :                                                                                                                                 ctctaAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC-------AT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCACTA
gi|120356                     :                                                                                                                                      AGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT-------CA----AGAAAT-TGCA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120372                     :                                                                                                                                ctccaaAGATGCA---AA--T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTCCTTAGATTCT----AGAGACATGCC--AAA-T----GTTGCACTA
gi|120373                     :                                                                                                                                       GACGCA---AAA-G-----A-AA-----------A------AAA------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCTTT-------TT----AGAGATGTACA--ATA-T----GTCGCAC
gi|120374                     :                                                                                                                                        ACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AAAG--GCTCC-------AT----AGAGACGTGAA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120366                     :                                                                                                                                        ACGCA---AAA-T-----A-AA-----------C------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AC----AGAGACTTGCG--ATA-T----ATCGCACTA
gi|120375                     :                                                                                                                                      cggcatA---AAA-T-----A-AA-----------A------T--------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCACC-------AT----ACAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120376                     :                                                                                                                                            A---AAA-TCAA--A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--TCTCC-------TT----AGAGATGTGCA--ATA-C----GTCACAGTA
gi|120377                     :                                                                                                                                            A---AAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-A--G--GCTTC-------TT----ACAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120378                     :                                                                                                                                             ---AAA-T-----ACAA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCT-------TT----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120379                     :                                                                                                                                             ---AAA-T-----A-AA-----------AT-----A--------T----CTT--------A--A-AA-A--GCTCC-------TT----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120380                     :                                                                                                                                                 AA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--G-TTT-------TT----AGAGACGTGCA----A-T----GTCGCACTA
gi|120381                     :                                                                                                                                                 AA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CGT----C---A--A-AA-G--GTTCC-------AT----AAAGATGTGCA--ATA-T----CTTGCACTA
gi|120382                     :                                                                                                                                                  A-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC-------AA----AGAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120383                     :                                                                                                                                                     -----A-AA-----------G------G--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GCTTC-------TT----AGAGACATGCA--ATA-T----GGCGCTCTA
gi|120384                     :                                                                                                                                                           -AA-----------A------A--------T----CAT----C---A--A-AA-G--GCTCC-------TT----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120386                     :                                                                                                                                                                                                T----C---A--A-AA-G--ACTCC-------TT----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA





Alignments
lowQualScore                  :                  1                                                                                                                 1                                                         1111111111111                                                                         
lowQualScore                  :                6 2  3        2  2       33             0                  2                                444   66            4   3    1   0  00        111   0 33333 1  44444444444 444444 0000000000000   0000 000 11 0  0 00     2222222222 0000           00   0 0000         
lowQualScore                  :                . .  .        .  .       ..             .                  .                                ...   ..            .   .    .   .  ..        ...   . ..... .  ........... ...... .............   .... ... .. .  . ..     .......... ....           ..   . ....         
lowQualScore                  :                2 3  1        9  9       77             8                  7                                777   33            6   0    4   5  77        222   4 88888 6  33333333333 555555 1111111111111   9999 777 00 8  4 66     6666666666 9999           66   4 9999         
consensus                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCNGTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
Reference ( family-303 )      :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCGGTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120286                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTA--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTTGGAACTTCCAGTTGGT---AAA--ATCGGCTTCCGCGGTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--C-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120287                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTCTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTGCGTTGGGAACTTCCAGTTAAT---AAA--ATCGGCTTCCGCGGTTGCACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AG-G--GCTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120288                     :           TTTTACA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCATTGGGAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGGCTTCCGCAGTTGCACCGCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACATGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120289                     :          TTTTTA-A-TT-ATCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTAAGAACTTCCAGTTAGT---AAAT-TTCGGCTTCCATGGTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-C-----T-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120290                     :          TTTTCA-T-TT-CTTATTCA-TT-ATATGTC--AATTGTTCGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTT-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCGGTTGCACATCTC-AG--GAGAGGCAT--AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120291                     :           TTTTA-ACTT-CTCATT-A-TA-ATATGTC--GATTGTTCGGATAGTAAATTTGTAAAACCTTC-CCCACAGATTCTGTTGGGAACTTCCAGTGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGTGGTTGCATGGCTC-AG--GAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120292                     :           TTTTA-A-TTTCTCATTCA-TA-ATATATC--GATTGTAAGGATAATAAAGTCGTGATACCTTC-CCAAAAGATTCCGTTGGGAACTTCCAATGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCAGTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------TTT----TAAAA--A-AA-G--GCT-C--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120293                     :           TTTTATA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGTATTGTAAA-----------------------TTCTGTTGGAAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGACTCCCGTGGTTGCACGGCTT-GG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTACACTA
gi|120294                     :           TTTTA-ACTT-CTCTATCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAA-GTCGTGCAGCCTCC-CAAATATATTCCGTTAAGAATATCCAGTAGGT---AAA--ATCGTCCCACGCGGTTGCACGTCTC-GG--TAGATGCA---TAA-T-----A-CA-----------A------A------------------------A--A-AA-A--ACTTCAAA-------T----GGAGACATGAA--ATA-G----TTTGCACTA
gi|120295                     :           TTTGA-ACTT-CTCATTCAATATATATATTATGATTTTTTT-ATTTTGGAG---------CTACTCCAACAGTTTCTGTTGGCAACTTCCAATACAT---AAAGAAACAAA----GCAGTCACA--------G--GAGATATA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----C---A--A-AC-A--GCTCC--T-------C----AGAAATGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120296                     :           TTTCA-ACTT-CTCGCTCA-TG----TGTA--GATTGTTT--------AAGTCATGAACTCTTC-CCAATACATTAAATTGGGAACTTCCAACTGGTTTAAAG--AT-GACTTCAGCAATTAC-TGATCCAAA--GAGATACG---AAA-T-----A-AA-----------
gi|120297                     :                         ACTCA-TA-ATATGTC--GACTGTTTGGGTTTGAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCTGTTTGGAACTTTCAGTT--T---AAA--A--GGCTCC
gi|120298                     : tttaaataacaTTAA-A-TT-TTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTGGTGAAACATTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGC---AAA--ATCGTCTTCCGCGGTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-------A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--T-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120299                     :               A-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATCTG--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCC----AGT---AAA--ATTGGCTTCCGCTGTTGCATGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGCCGTGGA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120300                     :                                  taATGTC--AACTGTTTGGATC--AAAGTCATGAAACCTTC-TCAACAGATTCTGTTGACAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCAGCTTCCGCGGTTGCACGGCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120301                     :                                                                                                                           TCTGCTGTC-CATAACTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120302                     :                                                                                                                    ttggataTCTGTTGTC-CATAACTC-AG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------CAAA-CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATT-T----GTCGCACT
gi|120303                     :                                                                                                              ttggatatccgaTTCTGCTGTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120304                     :                                                                                                                          TTCTGCTGTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120305                     :                                                                                                                          TTCTGCTGTC-CATAACTC-GG--AAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAAA-CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120306                     :                                                                                                                          TTCTGCTGTC-CATAACTC-GG--GAGATGAA---AAA-T-----A-AATT---------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGTACTA
gi|120307                     :                                                                                                                          TTCTGCTGTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----AAA----T---A--A-AA-G--GCTCC----------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTAGTACTA
gi|120308                     :                                                                                                                                        GTCTG-AG--TAGACGCA---AAA-T-----A-TA-----------A------A--------T----CTT----C---G--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AATGACTTGCA--ACA-T----GTCGCACT
gi|120309                     :                                                                                                               ttctgcttgtctTCTGCTGTC-CATAACTC-GG--GAGATGCG---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--A-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120310                     :                                                                                                                           TCTGCTGTC-CATAATTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120311                     :                                                                                                                           TCTGCTGTC-CATGGCTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----ATAGAAG-GCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120312                     :                                                                                                                           TCTGCTGTC-CATAACTC-GG--GAAACACA---AAA-T-----A-AA-----------AAAAA--A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------A----AGA-AC-TACA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120313                     :                                                                                                                                 GTTACACGTCTC-AG--GAGACACA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CAT----T---C--A-A---------------------------AGACGTGCA--GTA-T----GTCTCATTA
gi|120314                     :                                                                                                                                       CATCTT-GT--GAGACACA---AA--C-----A-AA-----------A------T--------T----GTC----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--AAA-T----GTCACACTA
gi|120315                     :                                                                                                                                   tgCATGTCTC-GG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CCA----C---A--A-AA-T--GCTTC--T-------C----AGAGACAT--A--ATA-T----GTTGCGCTA
gi|120316                     :                                                                                                                                      ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120317                     :                                                                                                                                      ACGGCTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------C------------------G--GCTCC--A-------T----AGAAAC-TAAG--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120318                     :                                                                                                                                      ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GGTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120319                     :                                                                                                                                           TC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATACT----GTCACACTA
gi|120320                     :                                                                                                                                 actgtACAGCTC-GA--GAGAC-CA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTG----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----AGAGACGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120321                     :                                                                                                                                       CAGCTC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----TAC----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120322                     :                                                                                                                                       CGGCTC-TGCTGAGACACA---AAA-T-----A-AAGA---------A------A--------T----CGT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACCTGCA--GTA-T----GTCGCAC
gi|120323                     :                                                                                                                                       CGGCTT-GG--GA-----A---AGA-A-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGACTTGTA--ATA-C----GTCGCACT
gi|120324                     :                                                                                                                                       CGTCTC-TA--GAGACGCA---AAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CTT----C---AG-A-AA-G--GCTAT--T-------T----AGAGACGTGTA--ATA-T----GATGCACTA
gi|120325                     :                                                                                                                                            C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCTCACTA
gi|120326                     :                                                                                                                                     ggcGGCTC-AG--GAAACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACATGCA--ATA-G----GTCACAC
gi|120327                     :                                                                                                                                          CTC-AG--GAGACGCA---ATA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120328                     :                                                                                                                                         gCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-C--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120329                     :                                                                                                                                            g-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----AAT----T---A--A-AA-A--GTTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120330                     :                                                                                                                                       gctCTT-GG--GAGATGCA---AAT-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTT----T---A--G-AA-G--GCTC---T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTCAACTA
gi|120331                     :                                                                                                                                         gCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120332                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120333                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTGACACTA
gi|120334                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-T--GCTCC--C-------T----AAAGACATGCA--ATA-T----GTGGCACTA
gi|120335                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A------------------------------------TT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120336                     :                                                                                                                                          CTC-AG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGCA--GTA-T----GCCGCACT
gi|120337                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGAA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AACAACTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120338                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----AAG----C---A--A-AA-G--GTTCC--T-------TTTAAAGAGACATGCA--AAA-T----GCCACAGTA
gi|120339                     :                                                                                                                                          CTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AATAAA-------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T------------AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCA
gi|120340                     :                                                                                                                                          CTC-GA--GAGACACA---AAT-C-----A-AA-----------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--T-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120341                     :                                                                                                                                          CTT-GG--GAGACGCA---AGA-T-----A-AACAAAATATTTAA------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120342                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACTCA---AAAAT-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGATGTGCA--ATA-TGTCCGTCGCACTA
gi|120343                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-A-----A-AA-----------A------AAAAAAATGT----C----------A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120344                     :                                                                                                                                          CTC-CG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CAT----C---A--G-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA----A-T----GTCACACTA
gi|120345                     :                                                                                                                                          CTT-GA--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----GTC--------A--A-AA-G--G-TCC--T-------T----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120346                     :                                                                                                                                          CTC-AG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----ATT----T---A--A-AA-T--ATTTC--T-------T----AAAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120347                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------ATAAAAAA--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GATCT--T-------T----AGAAAC--GCAATATA-T----GTCGTACTA
gi|120348                     :                                                                                                                                          CTT-GG--GAGAAGTG---AAA-T-----GTGA-----------G------A--------T----CGT----C---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCATACTA
gi|120349                     :                                                                                                                                          CTT-GG--GAGACGCA---TAA-T-----G-AA-----------T------A--------T----TTT----C---A--A-AA-A--ACTAC--T-------T----AGAGAAGTGCA--ATA-T----GTCACAC
gi|120350                     :                                                                                                                                          CTC-AG--AAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTTATTTT---A--ATAA-G--GCTGC--T-------T----AGAGACGTACA--ATA-T----GACGCGCTA
gi|120351                     :                                                                                                                                          CTC-AG--GAGAGGCA---AAA-TGAAATA-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-AA-AAAGTCTT--T-------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120352                     :                                                                                                                                          CTC-CA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120353                     :                                                                                                                                          CTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CTT----A---A--G-AA-G--GCTCT--T-------A----AGAGTTGTGCA--ATA-T----GCCAC
gi|120354                     :                                                                                                                                          CTC-TA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GATTC--T-------A----ATAAAT-TGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120355                     :                                                                                                                                          CTC-GA--GGGAC--A---AAA-T-----A-AT-----------T------T--------T----GTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAATGTGTA--ACA-T----GTTACACCA
gi|120356                     :                                                                                                                                          CTC-CA--AAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120357                     :                                                                                                                                          CTC-AG--GAGACGTA---AAA-A-----A-AA-----------C------A--------A----CAT----C---A--ACAA-G--GCTCC--T-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T-------GCACT
gi|120358                     :                                                                                                                                          CTC-GG--GAGACGCT---AAA-T-----T-AA-----------A---------------------TT----A---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGAA--ATA-T----AT
gi|120359                     :                                                                                                                                           TC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTTC--T-------T----AAAGACATTCA--GTA-T----GTTGCACT
gi|120360                     :                                                                                                                                           TC-AG--GAGACGCA---AAA-T------------------------------------------------T---A--A-AA-G--ACTCC--C-------C----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCATTA
gi|120361                     :                                                                                                                                           TC-GG--GAGACGTA---AAA-T-----A------------------------------TTTG-CTT----T---ATAA-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA----C-T----GTCACACTA
gi|120362                     :                                                                                                                                           TT-GG--AAGAGGCA---TAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CAT----T---A--T-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTACA--ATA-T----ATCACACTA
gi|120363                     :                                                                                                                                           TT-GG--GAGATACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAA------G----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACGTGCA--A
gi|120364                     :                                                                                                                                           TT-GG--GAGGCGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAAA----T----C----------A--A-AA-G--GCTAC--T-------T----GGAGAATTACA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120365                     :                                                                                                                                            C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CAT----T---A--A-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120366                     :                                                                                                                                            C-GG--CATACGCA---AAA-T-----A-AA-----------C------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------C----AGAGACTTGCG--ATA-T----ATCGCACTA
gi|120367                     :                                                                                                                                            C-GC--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------TAA--TCT----T---A--T-AA-A--GCTCC--T-------T----TTAGACGTGCA--GTA-T----GTCCAACTA
gi|120368                     :                                                                                                                                             -GG--GAGACACACAAAAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCT--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120369                     :                                                                                                                                               G--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACT
gi|120370                     :                                                                                                                                                --GAGACGCA---AAA-T-----A-AAC----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120371                     :                                                                                                                                                   AGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCACTA
gi|120372                     :                                                                                                                                                   AGATGCA---AA--T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTCC--TTAGATTCT----AGAGACATGCC--AAA-T----GTTGCACTA
gi|120373                     :                                                                                                                                                    GACGCA---AAA-G-----A-AA-----------A------AAA------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCTTT--T-------T----AGAGATGTACA--ATA-T----GTCGCAC
gi|120374                     :                                                                                                                                                     ACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AAAG--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGAA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120375                     :                                                                                                                                                         A---AAA-T-----A-AA-----------A------T--------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----ACAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120376                     :                                                                                                                                                         A---AAA-TCAA--A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--TCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-C----GTCACAGTA
gi|120377                     :                                                                                                                                                         A---AAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-A--G--GCTTC--T-------T----ACAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120378                     :                                                                                                                                                          ---AAA-T-----ACAA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCT--T-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120379                     :                                                                                                                                                          ---AAA-T-----A-AA-----------AT-----A--------T----CTT--------A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120380                     :                                                                                                                                                              AA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTT---T-------T----AGAGACGTGCA----A-T----GTCGCACTA
gi|120381                     :                                                                                                                                                              AA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CGT----C---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T----CTTGCACTA
gi|120382                     :                                                                                                                                                               A-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------A----AGAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120383                     :                                                                                                                                                                  -----A-AA-----------G------G--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GGCGCTCTA
gi|120384                     :                                                                                                                                                                        -AA-----------A------A--------T----CAT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120386                     :                                                                                                                                                                                                             T----C---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA





Alignments
lowQualScore                  :                  1                                                                                                                  1                                                         1111111111111                                                                         
lowQualScore                  :                6 2  3        2  2       33             0                  2                                444   66            22   4    1   0  00        111   0 33333 1  44444444444 444444 0000000000000   0000 000 11 0  0 00     2222222222 0000           00   0 0000         
lowQualScore                  :                . .  .        .  .       ..             .                  .                                ...   ..            ..   .    .   .  ..        ...   . ..... .  ........... ...... .............   .... ... .. .  . ..     .......... ....           ..   . ....         
lowQualScore                  :                2 3  1        9  9       77             8                  7                                777   33            55   0    4   5  77        222   4 88888 6  33333333333 555555 1111111111111   9999 777 00 8  4 66     6666666666 9999           66   4 9999         
consensus                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
Reference ( family-303 )      :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120286                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTA--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTTGGAACTTCCAGTTGGT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--C-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120287                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTCTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTGCGTTGGGAACTTCCAGTTAAT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AG-G--GCTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120288                     :           TTTTACA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCATTGGGAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGGCTTCCGCA-GTTGCACCGCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACATGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120289                     :          TTTTTA-A-TT-ATCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTAAGAACTTCCAGTTAGT---AAAT-TTCGGCTTCCATG-GTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-C-----T-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120290                     :          TTTTCA-T-TT-CTTATTCA-TT-ATATGTC--AATTGTTCGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTT-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACATCTC-AG--GAGAGGCAT--AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120291                     :           TTTTA-ACTT-CTCATT-A-TA-ATATGTC--GATTGTTCGGATAGTAAATTTGTAAAACCTTC-CCCACAGATTCTGTTGGGAACTTCCAGTGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGTG-GTTGCATGGCTC-AG--GAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120292                     :           TTTTA-A-TTTCTCATTCA-TA-ATATATC--GATTGTAAGGATAATAAAGTCGTGATACCTTC-CCAAAAGATTCCGTTGGGAACTTCCAATGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCA-GTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------TTT----TAAAA--A-AA-G--GCT-C--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120293                     :           TTTTATA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGTATTGTAAA-----------------------TTCTGTTGGAAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGACTCCCGTG-GTTGCACGGCTT-GG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTACACTA
gi|120294                     :           TTTTA-ACTT-CTCTATCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAA-GTCGTGCAGCCTCC-CAAATATATTCCGTTAAGAATATCCAGTAGGT---AAA--ATCGTCCCACGCG-GTTGCACGTCTC-GG--TAGATGCA---TAA-T-----A-CA-----------A------A------------------------A--A-AA-A--ACTTCAAA-------T----GGAGACATGAA--ATA-G----TTTGCACTA
gi|120295                     :           TTTGA-ACTT-CTCATTCAATATATATATTATGATTTTTTT-ATTTTGGAG---------CTACTCCAACAGTTTCTGTTGGCAACTTCCAATACAT---AAAGAAACAAA----GCA-GTCACA--------G--GAGATATA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----C---A--A-AC-A--GCTCC--T-------C----AGAAATGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120296                     :           TTTCA-ACTT-CTCGCTCA-TG----TGTA--GATTGTTT--------AAGTCATGAACTCTTC-CCAATACATTAAATTGGGAACTTCCAACTGGTTTAAAG--AT-GACTTCAGCA-ATTAC-TGATCCAAA--GAGATACG---AAA-T-----A-AA-----------
gi|120297                     :                         ACTCA-TA-ATATGTC--GACTGTTTGGGTTTGAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCTGTTTGGAACTTTCAGTT--T---AAA--A--GGCTCC
gi|120298                     : tttaaataacaTTAA-A-TT-TTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTGGTGAAACATTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGC---AAA--ATCGTCTTCCGCG-GTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-------A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--T-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120299                     :               A-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATCTG--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCC----AGT---AAA--ATTGGCTTCCGCT-GTTGCATGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGCCGTGGA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120300                     :                                  taATGTC--AACTGTTTGGATC--AAAGTCATGAAACCTTC-TCAACAGATTCTGTTGACAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCAGCTTCCGCG-GTTGCACGGCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120301                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120302                     :                                                                                                                    ttggataTCTGTT-GTC-CATAACTC-AG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------CAAA-CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATT-T----GTCGCACT
gi|120303                     :                                                                                                              ttggatatccgaTTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120304                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120305                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--AAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAAA-CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120306                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGATGAA---AAA-T-----A-AATT---------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGTACTA
gi|120307                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----AAA----T---A--A-AA-G--GCTCC----------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTAGTACTA
gi|120308                     :                                                                                                                          TTCTGCTTGTC---TGTCTG-AG--TAGACGCA---AAA-T-----A-TA-----------A------A--------T----CTT----C---G--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AATGACTTGCA--ACA-T----GTCGCACT
gi|120309                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGATGCG---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--A-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120310                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAATTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120311                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATGGCTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----ATAGAAG-GCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120312                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAAACACA---AAA-T-----A-AA-----------AAAAA--A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------A----AGA-AC-TACA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120313                     :                                                                                                                                 -GTTACACGTCTC-AG--GAGACACA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CAT----T---C--A-A---------------------------AGACGTGCA--GTA-T----GTCTCATTA
gi|120314                     :                                                                                                                                        CATCTT-GT--GAGACACA---AA--C-----A-AA-----------A------T--------T----GTC----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--AAA-T----GTCACACTA
gi|120315                     :                                                                                                                                    tgCATGTCTC-GG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CCA----C---A--A-AA-T--GCTTC--T-------C----AGAGACAT--A--ATA-T----GTTGCGCTA
gi|120316                     :                                                                                                                                       ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120317                     :                                                                                                                                       ACGGCTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------C------------------G--GCTCC--A-------T----AGAAAC-TAAG--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120318                     :                                                                                                                                       ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GGTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120319                     :                                                                                                                                            TC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATACT----GTCACACTA
gi|120320                     :                                                                                                                                  actgtACAGCTC-GA--GAGAC-CA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTG----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----AGAGACGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120321                     :                                                                                                                                        CAGCTC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----TAC----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120322                     :                                                                                                                                        CGGCTC-TGCTGAGACACA---AAA-T-----A-AAGA---------A------A--------T----CGT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACCTGCA--GTA-T----GTCGCAC
gi|120323                     :                                                                                                                                        CGGCTT-GG--GA-----A---AGA-A-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGACTTGTA--ATA-C----GTCGCACT
gi|120324                     :                                                                                                                                        CGTCTC-TA--GAGACGCA---AAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CTT----C---AG-A-AA-G--GCTAT--T-------T----AGAGACGTGTA--ATA-T----GATGCACTA
gi|120325                     :                                                                                                                                             C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCTCACTA
gi|120326                     :                                                                                                                                      ggcGGCTC-AG--GAAACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACATGCA--ATA-G----GTCACAC
gi|120327                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACGCA---ATA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120328                     :                                                                                                                                          gCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-C--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120329                     :                                                                                                                                             g-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----AAT----T---A--A-AA-A--GTTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120330                     :                                                                                                                                        gctCTT-GG--GAGATGCA---AAT-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTT----T---A--G-AA-G--GCTC---T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTCAACTA
gi|120331                     :                                                                                                                                          gCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120332                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120333                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTGACACTA
gi|120334                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-T--GCTCC--C-------T----AAAGACATGCA--ATA-T----GTGGCACTA
gi|120335                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A------------------------------------TT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120336                     :                                                                                                                                           CTC-AG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGCA--GTA-T----GCCGCACT
gi|120337                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGAA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AACAACTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120338                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----AAG----C---A--A-AA-G--GTTCC--T-------TTTAAAGAGACATGCA--AAA-T----GCCACAGTA
gi|120339                     :                                                                                                                                           CTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AATAAA-------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T------------AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCA
gi|120340                     :                                                                                                                                           CTC-GA--GAGACACA---AAT-C-----A-AA-----------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--T-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120341                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGACGCA---AGA-T-----A-AACAAAATATTTAA------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120342                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACTCA---AAAAT-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGATGTGCA--ATA-TGTCCGTCGCACTA
gi|120343                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-A-----A-AA-----------A------AAAAAAATGT----C----------A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120344                     :                                                                                                                                           CTC-CG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CAT----C---A--G-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA----A-T----GTCACACTA
gi|120345                     :                                                                                                                                           CTT-GA--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----GTC--------A--A-AA-G--G-TCC--T-------T----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120346                     :                                                                                                                                           CTC-AG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----ATT----T---A--A-AA-T--ATTTC--T-------T----AAAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120347                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------ATAAAAAA--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GATCT--T-------T----AGAAAC--GCAATATA-T----GTCGTACTA
gi|120348                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGAAGTG---AAA-T-----GTGA-----------G------A--------T----CGT----C---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCATACTA
gi|120349                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGACGCA---TAA-T-----G-AA-----------T------A--------T----TTT----C---A--A-AA-A--ACTAC--T-------T----AGAGAAGTGCA--ATA-T----GTCACAC
gi|120350                     :                                                                                                                                           CTC-AG--AAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTTATTTT---A--ATAA-G--GCTGC--T-------T----AGAGACGTACA--ATA-T----GACGCGCTA
gi|120351                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGAGGCA---AAA-TGAAATA-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-AA-AAAGTCTT--T-------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120352                     :                                                                                                                                           CTC-CA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120353                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CTT----A---A--G-AA-G--GCTCT--T-------A----AGAGTTGTGCA--ATA-T----GCCAC
gi|120354                     :                                                                                                                                           CTC-TA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GATTC--T-------A----ATAAAT-TGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120355                     :                                                                                                                                           CTC-GA--GGGAC--A---AAA-T-----A-AT-----------T------T--------T----GTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAATGTGTA--ACA-T----GTTACACCA
gi|120356                     :                                                                                                                                           CTC-CA--AAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120357                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACGTA---AAA-A-----A-AA-----------C------A--------A----CAT----C---A--ACAA-G--GCTCC--T-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T-------GCACT
gi|120358                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCT---AAA-T-----T-AA-----------A---------------------TT----A---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGAA--ATA-T----AT
gi|120359                     :                                                                                                                                            TC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTTC--T-------T----AAAGACATTCA--GTA-T----GTTGCACT
gi|120360                     :                                                                                                                                            TC-AG--GAGACGCA---AAA-T------------------------------------------------T---A--A-AA-G--ACTCC--C-------C----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCATTA
gi|120361                     :                                                                                                                                            TC-GG--GAGACGTA---AAA-T-----A------------------------------TTTG-CTT----T---ATAA-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA----C-T----GTCACACTA
gi|120362                     :                                                                                                                                            TT-GG--AAGAGGCA---TAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CAT----T---A--T-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTACA--ATA-T----ATCACACTA
gi|120363                     :                                                                                                                                            TT-GG--GAGATACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAA------G----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACGTGCA--A
gi|120364                     :                                                                                                                                            TT-GG--GAGGCGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAAA----T----C----------A--A-AA-G--GCTAC--T-------T----GGAGAATTACA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120365                     :                                                                                                                                             C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CAT----T---A--A-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120366                     :                                                                                                                                             C-GG--CATACGCA---AAA-T-----A-AA-----------C------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------C----AGAGACTTGCG--ATA-T----ATCGCACTA
gi|120367                     :                                                                                                                                             C-GC--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------TAA--TCT----T---A--T-AA-A--GCTCC--T-------T----TTAGACGTGCA--GTA-T----GTCCAACTA
gi|120368                     :                                                                                                                                              -GG--GAGACACACAAAAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCT--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120369                     :                                                                                                                                                G--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACT
gi|120370                     :                                                                                                                                                 --GAGACGCA---AAA-T-----A-AAC----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120371                     :                                                                                                                                                    AGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCACTA
gi|120372                     :                                                                                                                                                    AGATGCA---AA--T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTCC--TTAGATTCT----AGAGACATGCC--AAA-T----GTTGCACTA
gi|120373                     :                                                                                                                                                     GACGCA---AAA-G-----A-AA-----------A------AAA------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCTTT--T-------T----AGAGATGTACA--ATA-T----GTCGCAC
gi|120374                     :                                                                                                                                                      ACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AAAG--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGAA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120375                     :                                                                                                                                                          A---AAA-T-----A-AA-----------A------T--------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----ACAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120376                     :                                                                                                                                                          A---AAA-TCAA--A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--TCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-C----GTCACAGTA
gi|120377                     :                                                                                                                                                          A---AAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-A--G--GCTTC--T-------T----ACAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120378                     :                                                                                                                                                           ---AAA-T-----ACAA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCT--T-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120379                     :                                                                                                                                                           ---AAA-T-----A-AA-----------AT-----A--------T----CTT--------A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120380                     :                                                                                                                                                               AA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTT---T-------T----AGAGACGTGCA----A-T----GTCGCACTA
gi|120381                     :                                                                                                                                                               AA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CGT----C---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T----CTTGCACTA
gi|120382                     :                                                                                                                                                                A-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------A----AGAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120383                     :                                                                                                                                                                   -----A-AA-----------G------G--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GGCGCTCTA
gi|120384                     :                                                                                                                                                                         -AA-----------A------A--------T----CAT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120386                     :                                                                                                                                                                                                              T----C---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA





Alignments
lowQualScore                  :                  1                                                                                                                  1                                                         1111111111111                                                                         
lowQualScore                  :                6 2  3        2  2       33             0                  2                                444   66            22   4    1   0  00        111   0 33333 1  44444444444 444444 0000000000000   0000 000 11 0  0 00     2222222222 0000           00   0 0000         
lowQualScore                  :                . .  .        .  .       ..             .                  .                                ...   ..            ..   .    .   .  ..        ...   . ..... .  ........... ...... .............   .... ... .. .  . ..     .......... ....           ..   . ....         
lowQualScore                  :                2 3  1        9  9       77             8                  7                                777   33            55   0    4   5  77        222   4 88888 6  33333333333 555555 1111111111111   9999 777 00 8  4 66     6666666666 9999           66   4 9999         
consensus                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
Reference ( family-303 )      :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120286                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTA--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTTGGAACTTCCAGTTGGT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--C-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120287                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTCTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTGCGTTGGGAACTTCCAGTTAAT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AG-G--GCTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120288                     :           TTTTACA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCATTGGGAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGGCTTCCGCA-GTTGCACCGCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACATGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120289                     :          TTTTTA-A-TT-ATCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTAAGAACTTCCAGTTAGT---AAAT-TTCGGCTTCCATG-GTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-C-----T-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120290                     :          TTTTCA-T-TT-CTTATTCA-TT-ATATGTC--AATTGTTCGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTT-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACATCTC-AG--GAGAGGCAT--AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120291                     :           TTTTA-ACTT-CTCATT-A-TA-ATATGTC--GATTGTTCGGATAGTAAATTTGTAAAACCTTC-CCCACAGATTCTGTTGGGAACTTCCAGTGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGTG-GTTGCATGGCTC-AG--GAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120292                     :           TTTTA-A-TTTCTCATTCA-TA-ATATATC--GATTGTAAGGATAATAAAGTCGTGATACCTTC-CCAAAAGATTCCGTTGGGAACTTCCAATGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCA-GTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------TTT----TAAAA--A-AA-G--GCT-C--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120293                     :           TTTTATA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGTATTGTAAA-----------------------TTCTGTTGGAAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGACTCCCGTG-GTTGCACGGCTT-GG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTACACTA
gi|120294                     :           TTTTA-ACTT-CTCTATCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAA-GTCGTGCAGCCTCC-CAAATATATTCCGTTAAGAATATCCAGTAGGT---AAA--ATCGTCCCACGCG-GTTGCACGTCTC-GG--TAGATGCA---TAA-T-----A-CA-----------A------A------------------------A--A-AA-A--ACTTCAAA-------T----GGAGACATGAA--ATA-G----TTTGCACTA
gi|120295                     :           TTTGA-ACTT-CTCATTCAATATATATATTATGATTTTTTT-ATTTTGGAG---------CTACTCCAACAGTTTCTGTTGGCAACTTCCAATACAT---AAAGAAACAAA----GCA-GTCACA--------G--GAGATATA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----C---A--A-AC-A--GCTCC--T-------C----AGAAATGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120296                     :           TTTCA-ACTT-CTCGCTCA-TG----TGTA--GATTGTTT--------AAGTCATGAACTCTTC-CCAATACATTAAATTGGGAACTTCCAACTGGTTTAAAG--AT-GACTTCAGCA-ATTAC-TGATCCAAA--GAGATACG---AAA-T-----A-AA-----------
gi|120297                     :                         ACTCA-TA-ATATGTC--GACTGTTTGGGTTTGAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCTGTTTGGAACTTTCAGTT--T---AAA--A--GGCTCC
gi|120298                     : tttaaataacaTTAA-A-TT-TTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTGGTGAAACATTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGC---AAA--ATCGTCTTCCGCG-GTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-------A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--T-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120299                     :               A-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATCTG--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCC----AGT---AAA--ATTGGCTTCCGCT-GTTGCATGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGCCGTGGA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120300                     :                                  taATGTC--AACTGTTTGGATC--AAAGTCATGAAACCTTC-TCAACAGATTCTGTTGACAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCAGCTTCCGCG-GTTGCACGGCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120301                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120302                     :                                                                                                                    ttggataTCTGTT-GTC-CATAACTC-AG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------CAAA-CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATT-T----GTCGCACT
gi|120303                     :                                                                                                              ttggatatccgaTTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120304                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120305                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--AAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAAA-CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120306                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGATGAA---AAA-T-----A-AATT---------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGTACTA
gi|120307                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----AAA----T---A--A-AA-G--GCTCC----------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTAGTACTA
gi|120308                     :                                                                                                                          TTCTGCTTGTC---TGTCTG-AG--TAGACGCA---AAA-T-----A-TA-----------A------A--------T----CTT----C---G--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AATGACTTGCA--ACA-T----GTCGCACT
gi|120309                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGATGCG---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--A-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120310                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAATTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120311                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATGGCTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----ATAGAAG-GCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120312                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAAACACA---AAA-T-----A-AA-----------AAAAA--A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------A----AGA-AC-TACA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120313                     :                                                                                                                                 -GTTACACGTCTC-AG--GAGACACA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CAT----T---C--A-A---------------------------AGACGTGCA--GTA-T----GTCTCATTA
gi|120314                     :                                                                                                                                        CATCTT-GT--GAGACACA---AA--C-----A-AA-----------A------T--------T----GTC----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--AAA-T----GTCACACTA
gi|120315                     :                                                                                                                                    tgCATGTCTC-GG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CCA----C---A--A-AA-T--GCTTC--T-------C----AGAGACAT--A--ATA-T----GTTGCGCTA
gi|120316                     :                                                                                                                                       ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120317                     :                                                                                                                                       ACGGCTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------C------------------G--GCTCC--A-------T----AGAAAC-TAAG--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120318                     :                                                                                                                                       ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GGTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120319                     :                                                                                                                                            TC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATACT----GTCACACTA
gi|120320                     :                                                                                                                                  actgtACAGCTC-GA--GAGAC-CA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTG----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----AGAGACGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120321                     :                                                                                                                                        CAGCTC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----TAC----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120322                     :                                                                                                                                        CGGCTC-TGCTGAGACACA---AAA-T-----A-AAGA---------A------A--------T----CGT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACCTGCA--GTA-T----GTCGCAC
gi|120323                     :                                                                                                                                        CGGCTT-GG--GA-----A---AGA-A-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGACTTGTA--ATA-C----GTCGCACT
gi|120324                     :                                                                                                                                        CGTCTC-TA--GAGACGCA---AAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CTT----C---AG-A-AA-G--GCTAT--T-------T----AGAGACGTGTA--ATA-T----GATGCACTA
gi|120325                     :                                                                                                                                             C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCTCACTA
gi|120326                     :                                                                                                                                      ggcGGCTC-AG--GAAACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACATGCA--ATA-G----GTCACAC
gi|120327                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACGCA---ATA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120328                     :                                                                                                                                          gCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-C--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120329                     :                                                                                                                                             g-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----AAT----T---A--A-AA-A--GTTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120330                     :                                                                                                                                        gctCTT-GG--GAGATGCA---AAT-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTT----T---A--G-AA-G--GCTC---T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTCAACTA
gi|120331                     :                                                                                                                                          gCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120332                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120333                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTGACACTA
gi|120334                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-T--GCTCC--C-------T----AAAGACATGCA--ATA-T----GTGGCACTA
gi|120335                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A------------------------------------TT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120336                     :                                                                                                                                           CTC-AG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGCA--GTA-T----GCCGCACT
gi|120337                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGAA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AACAACTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120338                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----AAG----C---A--A-AA-G--GTTCC--T-------TTTAAAGAGACATGCA--AAA-T----GCCACAGTA
gi|120339                     :                                                                                                                                           CTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AATAAA-------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T------------AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCA
gi|120340                     :                                                                                                                                           CTC-GA--GAGACACA---AAT-C-----A-AA-----------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--T-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120341                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGACGCA---AGA-T-----A-AACAAAATATTTAA------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120342                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACTCA---AAAAT-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGATGTGCA--ATA-TGTCCGTCGCACTA
gi|120343                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-A-----A-AA-----------A------AAAAAAATGT----C----------A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120344                     :                                                                                                                                           CTC-CG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CAT----C---A--G-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA----A-T----GTCACACTA
gi|120345                     :                                                                                                                                           CTT-GA--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----GTC--------A--A-AA-G--G-TCC--T-------T----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120346                     :                                                                                                                                           CTC-AG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----ATT----T---A--A-AA-T--ATTTC--T-------T----AAAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120347                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------ATAAAAAA--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GATCT--T-------T----AGAAAC--GCAATATA-T----GTCGTACTA
gi|120348                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGAAGTG---AAA-T-----GTGA-----------G------A--------T----CGT----C---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCATACTA
gi|120349                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGACGCA---TAA-T-----G-AA-----------T------A--------T----TTT----C---A--A-AA-A--ACTAC--T-------T----AGAGAAGTGCA--ATA-T----GTCACAC
gi|120350                     :                                                                                                                                           CTC-AG--AAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTTATTTT---A--ATAA-G--GCTGC--T-------T----AGAGACGTACA--ATA-T----GACGCGCTA
gi|120351                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGAGGCA---AAA-TGAAATA-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-AA-AAAGTCTT--T-------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120352                     :                                                                                                                                           CTC-CA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120353                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CTT----A---A--G-AA-G--GCTCT--T-------A----AGAGTTGTGCA--ATA-T----GCCAC
gi|120354                     :                                                                                                                                           CTC-TA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GATTC--T-------A----ATAAAT-TGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120355                     :                                                                                                                                           CTC-GA--GGGAC--A---AAA-T-----A-AT-----------T------T--------T----GTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAATGTGTA--ACA-T----GTTACACCA
gi|120356                     :                                                                                                                                           CTC-CA--AAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120357                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACGTA---AAA-A-----A-AA-----------C------A--------A----CAT----C---A--ACAA-G--GCTCC--T-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T-------GCACT
gi|120358                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCT---AAA-T-----T-AA-----------A---------------------TT----A---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGAA--ATA-T----AT
gi|120359                     :                                                                                                                                            TC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTTC--T-------T----AAAGACATTCA--GTA-T----GTTGCACT
gi|120360                     :                                                                                                                                            TC-AG--GAGACGCA---AAA-T------------------------------------------------T---A--A-AA-G--ACTCC--C-------C----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCATTA
gi|120361                     :                                                                                                                                            TC-GG--GAGACGTA---AAA-T-----A------------------------------TTTG-CTT----T---ATAA-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA----C-T----GTCACACTA
gi|120362                     :                                                                                                                                            TT-GG--AAGAGGCA---TAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CAT----T---A--T-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTACA--ATA-T----ATCACACTA
gi|120363                     :                                                                                                                                            TT-GG--GAGATACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAA------G----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACGTGCA--A
gi|120364                     :                                                                                                                                            TT-GG--GAGGCGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAAA----T----C----------A--A-AA-G--GCTAC--T-------T----GGAGAATTACA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120365                     :                                                                                                                                             C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CAT----T---A--A-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120366                     :                                                                                                                                             C-GG--CATACGCA---AAA-T-----A-AA-----------C------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------C----AGAGACTTGCG--ATA-T----ATCGCACTA
gi|120367                     :                                                                                                                                             C-GC--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------TAA--TCT----T---A--T-AA-A--GCTCC--T-------T----TTAGACGTGCA--GTA-T----GTCCAACTA
gi|120368                     :                                                                                                                                              -GG--GAGACACACAAAAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCT--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120369                     :                                                                                                                                                G--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACT
gi|120370                     :                                                                                                                                                 --GAGACGCA---AAA-T-----A-AAC----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120371                     :                                                                                                                                                    AGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCACTA
gi|120372                     :                                                                                                                                                    AGATGCA---AA--T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTCC--TTAGATTCT----AGAGACATGCC--AAA-T----GTTGCACTA
gi|120373                     :                                                                                                                                                     GACGCA---AAA-G-----A-AA-----------A------AAA------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCTTT--T-------T----AGAGATGTACA--ATA-T----GTCGCAC
gi|120374                     :                                                                                                                                                      ACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AAAG--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGAA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120375                     :                                                                                                                                                          A---AAA-T-----A-AA-----------A------T--------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----ACAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120376                     :                                                                                                                                                          A---AAA-TCAA--A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--TCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-C----GTCACAGTA
gi|120377                     :                                                                                                                                                          A---AAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-A--G--GCTTC--T-------T----ACAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120378                     :                                                                                                                                                           ---AAA-T-----ACAA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCT--T-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120379                     :                                                                                                                                                           ---AAA-T-----A-AA-----------AT-----A--------T----CTT--------A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120380                     :                                                                                                                                                               AA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTT---T-------T----AGAGACGTGCA----A-T----GTCGCACTA
gi|120381                     :                                                                                                                                                               AA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CGT----C---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T----CTTGCACTA
gi|120382                     :                                                                                                                                                                A-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------A----AGAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120383                     :                                                                                                                                                                   -----A-AA-----------G------G--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GGCGCTCTA
gi|120384                     :                                                                                                                                                                         -AA-----------A------A--------T----CAT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120386                     :                                                                                                                                                                                                              T----C---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA


blockSeqs                     :                C C  T        A  T       AT                                T                                TTA   GA            TT   G    T                CAA     GAAAT T  CAAAATATTTA TAAAAA AAAAAATGT                               TTAGATTC  
blockSeqs                     :                T C  .        .  .       .                                 .                                .     T             G    G    G                T       CAA   T  TAAA        AAAA   AACAA                                   AAA       
blockSeqs                     :                . C  .        .  .       .                                 .                                .     .             A    G    T                .       A     T  TT          A      AAAAT                                   A         
blockSeqs                     :                . C  .        .  .       .                                 .                                .     .             G    G    T                .       A     C  GA          A      CAAA                                    A         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             G    G    G                .       A     .  C           A      AAAA                                    A         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             G    G    G                .       A     .  .           A      AAAT                                    T         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             A    G    G                .       A     .  .           A      TTTG                                    T         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             G    G    T                .       .     .  .           T      AAAT                                    T         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             G    A    A                .       .     .  .           .      AAA                                     A         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             A    A    G                .       .     .  .           .      AAA                                     T         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             A    G    G                .       .     .  .           .      AAA                                     A         
blockSeqs                     :                . .  .        .  .       .                                 .                                .     .             G    G    G                .       .     .  .           .      AAG                                     A         
blockSeqs                     :                              .  .       .                                 .                                .     .             T    G    A                .       .     .  .           .      TAA                                     A         
blockSeqs                     :                                         .                                 .                                .     .             G    A    A                .       .     .  .           .      AAT                                     T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      AT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      AT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      CT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      AT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      AT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    T                .       .     .  .           .      AT                                      A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      CT                                      A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      CT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    G                .       .     .  .           .      AT                                      T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    A                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                T    .    T                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                     .    T                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          T                .       .     .  .           .      A                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          T                .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          G                .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          T                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          G                .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          G                .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          G                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          G                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          T                .       .     .  .           .      A                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          G                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       C         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      A                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      A                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       C         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      A                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       C         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       C         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       G         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      A                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       G         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       G         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      T                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      .                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .       .     .  .           .      .                                       A         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                   .     .  .           .      .                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                   .     .  .           .      .                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                   .     .  .           .      .                                       T         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                   .     .  .           .      .                                       .         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         .  .                                                          .         


blockSeqCons                  :          
originalCons                  :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
finalCons                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA





Alignments
lowQualScore                  :                  1                                                                                                                  1                                                         1111111111111                                                                         
lowQualScore                  :                6 2  3        2  2       33             0                  2                                444   66            22   4    1   0  00        111   0 33333 1  44444444444 444444 0000000000000   0000 000 11 0  0 00     2222222222 0000           00   0 0000         
lowQualScore                  :                . .  .        .  .       ..             .                  .                                ...   ..            ..   .    .   .  ..        ...   . ..... .  ........... ...... .............   .... ... .. .  . ..     .......... ....           ..   . ....         
lowQualScore                  :                2 3  1        9  9       77             8                  7                                777   33            55   0    4   5  77        222   4 88888 6  33333333333 555555 1111111111111   9999 777 00 8  4 66     6666666666 9999           66   4 9999         
consensus                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
Reference ( family-303 )      :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCN-GTCGCACGNCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120286                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTA--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTTGGAACTTCCAGTTGGT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--C-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120287                     :          TTTTTA-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTCTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTGCGTTGGGAACTTCCAGTTAAT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AG-G--GCTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120288                     :           TTTTACA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCATTGGGAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGGCTTCCGCA-GTTGCACCGCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACATGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120289                     :          TTTTTA-A-TT-ATCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTAAGAACTTCCAGTTAGT---AAAT-TTCGGCTTCCATG-GTTGCACGTCTT-GG--GAGACGCA---AAA-C-----T-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120290                     :          TTTTCA-T-TT-CTTATTCA-TT-ATATGTC--AATTGTTCGGATTTTAAAGTCGTGAAACCTTT-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCG-GTTGCACATCTC-AG--GAGAGGCAT--AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120291                     :           TTTTA-ACTT-CTCATT-A-TA-ATATGTC--GATTGTTCGGATAGTAAATTTGTAAAACCTTC-CCCACAGATTCTGTTGGGAACTTCCAGTGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGTG-GTTGCATGGCTC-AG--GAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120292                     :           TTTTA-A-TTTCTCATTCA-TA-ATATATC--GATTGTAAGGATAATAAAGTCGTGATACCTTC-CCAAAAGATTCCGTTGGGAACTTCCAATGAGT---AAA--ATCGGCTTCCGCA-GTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------TTT----TAAAA--A-AA-G--GCT-C--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120293                     :           TTTTATA-TT-CTCATTCA-TA-ATATGTT--GATTGTTTGTATTGTAAA-----------------------TTCTGTTGGAAACTTCCAGATAGT---AAA--ATTGACTCCCGTG-GTTGCACGGCTT-GG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTACACTA
gi|120294                     :           TTTTA-ACTT-CTCTATCA-TA-ATATGTC--GATTGTTTGGATTTTAA-GTCGTGCAGCCTCC-CAAATATATTCCGTTAAGAATATCCAGTAGGT---AAA--ATCGTCCCACGCG-GTTGCACGTCTC-GG--TAGATGCA---TAA-T-----A-CA-----------A------A------------------------A--A-AA-A--ACTTCAAA-------T----GGAGACATGAA--ATA-G----TTTGCACTA
gi|120295                     :           TTTGA-ACTT-CTCATTCAATATATATATTATGATTTTTTT-ATTTTGGAG---------CTACTCCAACAGTTTCTGTTGGCAACTTCCAATACAT---AAAGAAACAAA----GCA-GTCACA--------G--GAGATATA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----C---A--A-AC-A--GCTCC--T-------C----AGAAATGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120296                     :           TTTCA-ACTT-CTCGCTCA-TG----TGTA--GATTGTTT--------AAGTCATGAACTCTTC-CCAATACATTAAATTGGGAACTTCCAACTGGTTTAAAG--AT-GACTTCAGCA-ATTAC-TGATCCAAA--GAGATACG---AAA-T-----A-AA-----------
gi|120297                     :                         ACTCA-TA-ATATGTC--GACTGTTTGGGTTTGAAAGTCGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCTGTTTGGAACTTTCAGTT--T---AAA--A--GGCTCC
gi|120298                     : tttaaataacaTTAA-A-TT-TTCATTCA-TA-ATATGTC--AATTGTTTGGATTTTAAAGTGGTGAAACATTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCCAGTTAGC---AAA--ATCGTCTTCCGCG-GTTGCAAGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-------A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--T-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120299                     :               A-A-TT-CTCATTCA-TA-ATATCTG--GATTGTTTGGATTTTAAAGTTGTGAAACCTTC-CCAACAGATTCCGTTGGGAACTTCC----AGT---AAA--ATTGGCTTCCGCT-GTTGCATGGCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGCCGTGGA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120300                     :                                  taATGTC--AACTGTTTGGATC--AAAGTCATGAAACCTTC-TCAACAGATTCTGTTGACAACTTCCAGTTAGT---AAA--ATCAGCTTCCGCG-GTTGCACGGCTT-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120301                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120302                     :                                                                                                                    ttggataTCTGTT-GTC-CATAACTC-AG--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------CAAA-CTT----T---T--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATT-T----GTCGCACT
gi|120303                     :                                                                                                              ttggatatccgaTTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120304                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120305                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--AAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAAA-CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120306                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGATGAA---AAA-T-----A-AATT---------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGTACTA
gi|120307                     :                                                                                                                          TTCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGACGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----AAA----T---A--A-AA-G--GCTCC----------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTAGTACTA
gi|120308                     :                                                                                                                          TTCTGCTTGTC---TGTCTG-AG--TAGACGCA---AAA-T-----A-TA-----------A------A--------T----CTT----C---G--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AATGACTTGCA--ACA-T----GTCGCACT
gi|120309                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAGATGCG---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--A-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120310                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAATTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AAA--CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T------------AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120311                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATGGCTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----ATAGAAG-GCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120312                     :                                                                                                                           TCTGCT-GTC-CATAACTC-GG--GAAACACA---AAA-T-----A-AA-----------AAAAA--A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------A----AGA-AC-TACA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120313                     :                                                                                                                                 -GTTACACGTCTC-AG--GAGACACA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CAT----T---C--A-A---------------------------AGACGTGCA--GTA-T----GTCTCATTA
gi|120314                     :                                                                                                                                        CATCTT-GT--GAGACACA---AA--C-----A-AA-----------A------T--------T----GTC----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--AAA-T----GTCACACTA
gi|120315                     :                                                                                                                                    tgCATGTCTC-GG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CCA----C---A--A-AA-T--GCTTC--T-------C----AGAGACAT--A--ATA-T----GTTGCGCTA
gi|120316                     :                                                                                                                                       ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120317                     :                                                                                                                                       ACGGCTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A--------------------C------------------G--GCTCC--A-------T----AGAAAC-TAAG--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120318                     :                                                                                                                                       ACGTCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GGTCT--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120319                     :                                                                                                                                            TC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATACT----GTCACACTA
gi|120320                     :                                                                                                                                  actgtACAGCTC-GA--GAGAC-CA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTG----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----AGAGACGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120321                     :                                                                                                                                        CAGCTC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----TAC----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120322                     :                                                                                                                                        CGGCTC-TGCTGAGACACA---AAA-T-----A-AAGA---------A------A--------T----CGT----T---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACCTGCA--GTA-T----GTCGCAC
gi|120323                     :                                                                                                                                        CGGCTT-GG--GA-----A---AGA-A-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGACTTGTA--ATA-C----GTCGCACT
gi|120324                     :                                                                                                                                        CGTCTC-TA--GAGACGCA---AAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CTT----C---AG-A-AA-G--GCTAT--T-------T----AGAGACGTGTA--ATA-T----GATGCACTA
gi|120325                     :                                                                                                                                             C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTCTCACTA
gi|120326                     :                                                                                                                                      ggcGGCTC-AG--GAAACGCA---AAA-T-----A-AA-----------AA-----A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACATGCA--ATA-G----GTCACAC
gi|120327                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACGCA---ATA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120328                     :                                                                                                                                          gCTC-AG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AC-----------A------A--------T----CTT----A---A--A-AA-C--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120329                     :                                                                                                                                             g-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----AAT----T---A--A-AA-A--GTTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120330                     :                                                                                                                                        gctCTT-GG--GAGATGCA---AAT-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTT----T---A--G-AA-G--GCTC---T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTCAACTA
gi|120331                     :                                                                                                                                          gCTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120332                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120333                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTGACACTA
gi|120334                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-T--GCTCC--C-------T----AAAGACATGCA--ATA-T----GTGGCACTA
gi|120335                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A------------------------------------TT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120336                     :                                                                                                                                           CTC-AG--AAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGCA--GTA-T----GCCGCACT
gi|120337                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGAA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------AACAACTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120338                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------A----AAG----C---A--A-AA-G--GTTCC--T-------TTTAAAGAGACATGCA--AAA-T----GCCACAGTA
gi|120339                     :                                                                                                                                           CTC-GG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AATAAA-------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T------------AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCA
gi|120340                     :                                                                                                                                           CTC-GA--GAGACACA---AAT-C-----A-AA-----------A------A--------A----CTT----T---A--A-AA-G--GTTCC--T-------C----AGAGACGTGCA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120341                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGACGCA---AGA-T-----A-AACAAAATATTTAA------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCA--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120342                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACTCA---AAAAT-----A-AA-----------A------A--------A----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAGATGTGCA--ATA-TGTCCGTCGCACTA
gi|120343                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-A-----A-AA-----------A------AAAAAAATGT----C----------A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120344                     :                                                                                                                                           CTC-CG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CAT----C---A--G-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGATGTGCA----A-T----GTCACACTA
gi|120345                     :                                                                                                                                           CTT-GA--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----GTC--------A--A-AA-G--G-TCC--T-------T----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120346                     :                                                                                                                                           CTC-AG--CAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----ATT----T---A--A-AA-T--ATTTC--T-------T----AAAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCATTA
gi|120347                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------ATAAAAAA--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GATCT--T-------T----AGAAAC--GCAATATA-T----GTCGTACTA
gi|120348                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGAAGTG---AAA-T-----GTGA-----------G------A--------T----CGT----C---A--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCATACTA
gi|120349                     :                                                                                                                                           CTT-GG--GAGACGCA---TAA-T-----G-AA-----------T------A--------T----TTT----C---A--A-AA-A--ACTAC--T-------T----AGAGAAGTGCA--ATA-T----GTCACAC
gi|120350                     :                                                                                                                                           CTC-AG--AAAATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CTTATTTT---A--ATAA-G--GCTGC--T-------T----AGAGACGTACA--ATA-T----GACGCGCTA
gi|120351                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGAGGCA---AAA-TGAAATA-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-AA-AAAGTCTT--T-------T----AGAGATGTTCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120352                     :                                                                                                                                           CTC-CA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--ATA-T----GTCACACTA
gi|120353                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CTT----A---A--G-AA-G--GCTCT--T-------A----AGAGTTGTGCA--ATA-T----GCCAC
gi|120354                     :                                                                                                                                           CTC-TA--GAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GATTC--T-------A----ATAAAT-TGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120355                     :                                                                                                                                           CTC-GA--GGGAC--A---AAA-T-----A-AT-----------T------T--------T----GTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------T----AGAAATGTGTA--ACA-T----GTTACACCA
gi|120356                     :                                                                                                                                           CTC-CA--AAGAAGCA---AAA-TA----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--C-AA-G--GCTTT--C-------A----AGAAAT-TGCA--AAA-T----GTCGCACTA
gi|120357                     :                                                                                                                                           CTC-AG--GAGACGTA---AAA-A-----A-AA-----------C------A--------A----CAT----C---A--ACAA-G--GCTCC--T-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T-------GCACT
gi|120358                     :                                                                                                                                           CTC-GG--GAGACGCT---AAA-T-----T-AA-----------A---------------------TT----A---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTGAA--ATA-T----AT
gi|120359                     :                                                                                                                                            TC-GG--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----T---A--A-AA-G--ACTTC--T-------T----AAAGACATTCA--GTA-T----GTTGCACT
gi|120360                     :                                                                                                                                            TC-AG--GAGACGCA---AAA-T------------------------------------------------T---A--A-AA-G--ACTCC--C-------C----GGAGACGTACA--AAA-T----GTCGCATTA
gi|120361                     :                                                                                                                                            TC-GG--GAGACGTA---AAA-T-----A------------------------------TTTG-CTT----T---ATAA-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA----C-T----GTCACACTA
gi|120362                     :                                                                                                                                            TT-GG--AAGAGGCA---TAA-T-----ATAA-----------A------A--------T----CAT----T---A--T-AA-G--GCTCC--T-------T----GGAGATGTACA--ATA-T----ATCACACTA
gi|120363                     :                                                                                                                                            TT-GG--GAGATACA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAA------G----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----TGAGACGTGCA--A
gi|120364                     :                                                                                                                                            TT-GG--GAGGCGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAAA----T----C----------A--A-AA-G--GCTAC--T-------T----GGAGAATTACA--ATA-T----CTCGCACTA
gi|120365                     :                                                                                                                                             C-GG--GAGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------AAAA-----T----CAT----T---A--A-AA-G--GCTCC--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120366                     :                                                                                                                                             C-GG--CATACGCA---AAA-T-----A-AA-----------C------A--------T----ATT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------C----AGAGACTTGCG--ATA-T----ATCGCACTA
gi|120367                     :                                                                                                                                             C-GC--GAGATGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------TAA--TCT----T---A--T-AA-A--GCTCC--T-------T----TTAGACGTGCA--GTA-T----GTCCAACTA
gi|120368                     :                                                                                                                                              -GG--GAGACACACAAAAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----TGT----C---A--A-AA-G--GCTCT--G-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120369                     :                                                                                                                                                G--GAGACACA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAAACGTGCA--ATA-T----GTTGCACT
gi|120370                     :                                                                                                                                                 --GAGACGCA---AAA-T-----A-AAC----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GTTGCA
gi|120371                     :                                                                                                                                                    AGACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-A--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GCCGCACTA
gi|120372                     :                                                                                                                                                    AGATGCA---AA--T-----A-AA-----------A------AC-------T----CTT----A---A--A-AA-G--GCTCC--TTAGATTCT----AGAGACATGCC--AAA-T----GTTGCACTA
gi|120373                     :                                                                                                                                                     GACGCA---AAA-G-----A-AA-----------A------AAA------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCTTT--T-------T----AGAGATGTACA--ATA-T----GTCGCAC
gi|120374                     :                                                                                                                                                      ACGCA---AAA-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AAAG--GCTCC--A-------T----AGAGACGTGAA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120375                     :                                                                                                                                                          A---AAA-T-----A-AA-----------A------T--------T----CTC----T---A--A-AA-G--GCACC--A-------T----ACAGATGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120376                     :                                                                                                                                                          A---AAA-TCAA--A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--TCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-C----GTCACAGTA
gi|120377                     :                                                                                                                                                          A---AAA-A-----A-AA-----------A------A--------T----ATT----T---A--A-A--G--GCTTC--T-------T----ACAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCAATA
gi|120378                     :                                                                                                                                                           ---AAA-T-----ACAA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCT--T-------T----GGAGACGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120379                     :                                                                                                                                                           ---AAA-T-----A-AA-----------AT-----A--------T----CTT--------A--A-AA-A--GCTCC--T-------T----AGAGAGGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120380                     :                                                                                                                                                               AA-C-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GTTT---T-------T----AGAGACGTGCA----A-T----GTCGCACTA
gi|120381                     :                                                                                                                                                               AA-T-----A-AA-----------A------AA-------T----CGT----C---A--A-AA-G--GTTCC--A-------T----AAAGATGTGCA--ATA-T----CTTGCACTA
gi|120382                     :                                                                                                                                                                A-T-----A-AA-----------A------A--------T----CTT----T---A--A-AA-G--GCTCC--A-------A----AGAGACCTGCA--ATA-T----GTCGCACTA
gi|120383                     :                                                                                                                                                                   -----A-AA-----------G------G--------T----CTT----T---G--A-AA-G--GCTTC--T-------T----AGAGACATGCA--ATA-T----GGCGCTCTA
gi|120384                     :                                                                                                                                                                         -AA-----------A------A--------T----CAT----C---A--A-AA-G--GCTCC--T-------T----AGAGATGTGCA--ATA-T----GTTGCACTA
gi|120386                     :                                                                                                                                                                                                              T----C---A--A-AA-G--ACTCC--T-------T----AGAGACGTGCA--ATA-T----GTCGCACTA