lowQualScore                  :                                222                                                                             1                                               1    
lowQualScore                  :              111 000 1111 0    444 2 1 0  000           0  0    0 111   33    0 000  000            111  00    4 0  0 0         222  888888 000     777 1  222 1    
lowQualScore                  :              ... ... .... .    ... . . .  ...           .  .    . ...   ..    . ...  ...            ...  ..    . .  . .         ...  ...... ...     ... .  ... .    
lowQualScore                  :              555 777 6666 4    555 5 2 4  777           4  4    4 111   99    8 777  777            111  66    8 4  4 4         888  444444 888     333 6  888 2    
consensus                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
Reference ( gi|145747 )       : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCAT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145759                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCAT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145758                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCAT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145757                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCAT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145756                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCAT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145732                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GAACTT-AG-A-GATGAGAGG---TA------G---GTGAT--CT-TG---A-GAT
gi|145723                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCAT-AG-C-GTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--tg
gi|145749                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-----GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145751                     : GTCCTTCCGCAAG---T---T----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CA---GAACTCGAACCT---AT--GACCTT-AC-T-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145739                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T---GGA--GCAA-G---CG---GAACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145743                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-G-CT---TTTTCACACAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-AGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145727                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TGCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--ACGA-A---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGATA-TT-TG---A-
gi|145728                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CAGGC--A-A-A-CT---TTCTTACATAA-AG-TTTTTT---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145761                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCAGATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACCTA-AG-C-GATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145733                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTT-AG-C-GGTTAGAAG---TT------A---GTGAT--
gi|145720                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTT-AG-C-AATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145719                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTT-AG-C-AATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145736                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGG---C-ATA-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCCA-G---CG---GGACTCAAAACT---AC--AACCTT-AG-C-AGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--GT-TG---A-GA
gi|145734                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGT--A-A-A-CT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AC--GAACTT-AG-C-GGTGAGATG---TA------A---GTGAT--ctgat
gi|145760                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-TT--GGA--ACGA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--AACCTA-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145740                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CGGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GAGA-G---CG---GGACTCGAACCT---GC--GACATT-AG-C-GATGGGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145738                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----G-CTGC---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-TGGAGGA--GTGA-G---CA---GGACTCGAACCT---AT--GACCTT-AG-G-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145718                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-ATGA---A-A-A-CT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T---GGT--GCGA-G---CA---TGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-GATGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145755                     : GTCCTTCTGTAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATTA-AG-TTTT-T---GGA--GCCG-G---CA---AGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-AGCGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145726                     : GTCATTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACAGTA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTA-AA-C-TGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145744                     : GTCCTGCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACGTAACAA-TTTT-T---GGA--GCAA-G---CG---GCATTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-GATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145714                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CCGAC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-T---TG---GGACTCGAACTT---AG--GACCTT-AG-C-CGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145737                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTAGC--A-A-A-CT---TTCTCATATAA-AG-ATTT-T---AGA--ACCA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--CACCTT-AG-C-AGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145721                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---C-A-ATCT---TTCTCACTTAA-TG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AT--GACCTT-AG-C-AATGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145742                     : GTCATTCCGCAAG---T---T----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-A---CA---GGACTTGAACCT---AT--GCCCTT-GG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--C
gi|145716                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACGTGA-AG-TATT-T---GGA--GTGA-G---CG---TAACTCAAACCT---AT--GACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--at
gi|145752                     : GTCCTTCCGTAAG---T---A----A-CTTGT--A-A-A-CC---CTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--ACGA-G---CG---AGGCTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-GGTGAGAGA---TA------
gi|145753                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCACATATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CT---GAACTCAAACCT---TA--GACCTT-AG-C-CGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145722                     : GTCCTTCCGCAAG---T---G----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T---GGT--ACGA-A---CG---GGGCTCGAACCT---AC--GACCTT-TA-T-GGTGACAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145741                     : GTCTTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---GTCT--CATAA-AGATTTT-T---GGA--GCGA-G---AG---TTACTCGAACCT---AC--GACATT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-CG---A-
gi|145731                     : GTCCTTCCACAAG---T---A----A-CTTGC--A-A-A-CG---TCCTCATATAA-AG-TTTT-T---GAA--GCGA-A---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-A-GGTGAAAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145715                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGCC--A-A-A-CT---TCCTCACATAG-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-G---CT---GGACTCAAACCT---AA--GACCTT-AA-C-AGTGAGAGT---TA------A---GTGAT--
gi|145748                     : GTCCTTTTGCAAG---T---T----T-CTGAT--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AA-TTTT-T---GAA--GCAA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTT-AG-T-GGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145725                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT-----CTCGTATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-A---TG---GGATTCCAACCT---AC--GACCTT-AG-T-GTTGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145729                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---GTCCCGTCTAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-G---TG---GGGCTCGAACCT---AT--GA-CATCAC-C-GGTGAGAGG---TC------A---GTGAT--
gi|145730                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CA---TTTTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--CAAA-G---TG---GTACTCGAACCT---AC--GACTTC-TG-C-AGTGAGATG---TT------A---GTGAT--
gi|145717                     : GTCCTTCCGCAAG---T---A----T-CTGGC--A-A-A-CT---TTCCGAAATAA-AG-TATT-T---GGA--GAGA-----CA---GAACTCGAACCT---AC--GACATT-GG-C-GGTGAGAGG---TA------
gi|145724                     : GTCCTTTTGCAAG---T---A----A-ATCA---ACA-A-ATAAATTCTCAAATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACCTC-AG-C-AGTGAGAGG---TA------A---AT
gi|145745                     : GTCCTTCTGCAAG-------A----A-CCGA---C-ATA-TT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGC-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCCT-Atttatgat
gi|145750                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATGA-AG-TTTT-T---GGA--CCGA-G---CA---GGACCTGAACCC---A
gi|145746                     : GTCATTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-TT---TTCTCACGTAA-AG-TATT-T---GAA--GCAA-G---TT---GGGCTCGAAGCT---AT--GGCCTT-Atacatgggatagatttggtga
gi|145754                     : GTCCTTCGACAAG---T---A----A-CAGCC--A-A-A-CT---TTCTTATATGA-AG-TTTT-T---GGC--GCTA-G---CA---GGACTCGAACTG---AT--GACTAT-AA------GAGAGA---TA------
gi|145735                     : GTCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACTTAA-AG-TTTT-T---GGA--CTGA-GTTTTG---G--CTCGAATCA---AT--GGTCTC-AG-C-AGAGAGA
gi|145701                     : GTCATTCTGCAAG---A---A----A-CAAGC--A-A-A-TT---ATCCCAAGTAA-AG-TCTT-T---GGA--CTAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTT-AC-C-AGTGAGAGA---TATTTAGTA---ATGAT--TTATG---ATGATGattt
gi|145712                     : GTCATTGTGCAAG---T---A----A-AAGC---A-A-A-TT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T---GGA---CAA-----CATTTGG-CTCGTACCT---AC--GACTTT-AC-C-AGTGAGAGA---TATTT---A---GTGAT--atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgataatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattgacggta
gi|145711                     : GTCATTCTGCAAA---T---A----T-CGAGC--A-A-A-TT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T---GGA--TCTC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTT-AC-A-AGTAAGAGA---TATTT---A---GTGAT--aat
gi|145710                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----T-CAAGT--A-A-A-TC---ATTTCAAGTAA-AG-TCTT-T---GCA--CCAA-A---CT---TGGCTCGAACAT---AC--GA-CAT-AA-CTAGTGAGAGA---TA------ATATGTGATGATT-TGTGAA-GATGtatctatgatgatgatgttgtttatattgatgatgatcaagttgaggaagtatcaggtaatgttatcgatggcattggtagta
gi|145707                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CAAGC--G-A-A-CA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GGACCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AC-C-AGTGAGAGA---TA------atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgattatgttgaggaagtatcaggtaatgttaataatggcataggtggta
gi|145704                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CAAGC--G-A-A-CA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GGACCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AC-C-AGTGAGAGA---TA------cttcatgataatttatgatgatattgatattgataatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145706                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CAAG---CCA-A-CA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GGACCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AT-C-AGTGAGAGATACTA------A---ATGAT--cttcatgataatttatgatgatattgatattgatgatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145709                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CAAG---CCA-A-CA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GGGCCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AT-C-AGTGAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGaatttatgatgataatgatattgatattgatgatgattatgataatattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattgatggta
gi|145708                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CAAG---CCA-A-CA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GGACCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AT-C-TGTGAGAGATACTA------A---ATGAT--ataatgatattgatattattgatgattgtgataatattgatgatga
gi|145705                     : GTCATTCTGCAAG---T---A----A-CAAG---CCA-A-CA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GGGCCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AC-C-AGTTAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGaatttatgatgattatgatattgatattgatgatgattgtgataatattgctgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145700                     : GTCGTTCTTCAAG---T---A-------TCGCCCA-A-A-CT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T---GGA--CTAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTT-AC-A-GTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGataatgatattgacattattgatgattgtgataatattgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatgacattgatggta
gi|145699                     : GTCATTCTTCAAG---T---A-------TCGCCCA-A-A-CT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T---GGA--CTAC-A---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTT-AC-A-GTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggt
gi|145702                     : GTCATTCTGCTAG---T---ATCA-A-CC-----A-A-A-CT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T---CGA--CTAT-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTT-AC-A-ATTGAGAGA---TATCT---A---GTGAT--ttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgta
gi|145713                     : GTCATTCAGCAAGAAAC---A----A-CC-----A-A-A-CT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T---GGA--CTAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACgattgatggtgttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcactggttgca
gi|145703                     : GTCATTCTGCAAG---TATCA----A-CC-----A-A-A-CT---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T---GG---GCTACA---CT---TGGCTTGGACCT---AG--CACTTT-AC-A-ATTGAGAAA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGtttacaa
gi|145771                     :  TCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GAA--GCGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTT-AG-C-AGTGAGAAG---TT------A---GTGAT--AT-TG---A-ttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtattttaaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgt
gi|145766                     :  TCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTAAC--A-A-A-TT---TTCTCTGATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-T-TGTGAGATT---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145768                     :  TCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAT-G---TG---GGACTCAAACCT---AC--GACTTT-AA-T-GGTGAGAGG---TA------A---ATGAT--
gi|145774                     :  TCGTTCCGCAAG---T---A----A-CCGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAC-AG-TGTT-T---GGA--GCGA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-T-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145780                     :  TCCTTTTGCAAG---T---A----A-TTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAG-AG-TTTT-----GGA--CCGA-G---TG---GGACTCTAACCT---AC--GACCTT-AA-A-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145764                     :  TCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTTG---A-C-A-CT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T---GGA--ACAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTA-AG-C-ATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145763                     :  TCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTTG---A-C-A-CT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T---GGA--ACAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTA-AG-C-ATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145776                     :  TCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-G---CA---GGACTTGAACCT---AC--GCACTT-GG-C-AGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145770                     :  TCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCGCATATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACC-T-AG-C-AATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145773                     :  TCCTTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTATCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-G---TG---GGTCTCGCACCT---AT--AACCTT-AG-C-ATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145778                     :  TCATTCCACAAG---G---A----A-CTGGC--A-A-A-CA---TTCTCACATAA-AG-TTTC-T---GGA--GTAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-C-AGCTAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145779                     :  TCCTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCAAATAA-AG-TTTT-T---ACA--GTGA-G---TG---GTACTTGAACCT---AC--AACCTT-GG-T-GTTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145765                     :  TCTTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTTTCACTTAA-AG-TTTT-T---GGA--GC-A-T---CT---GGACTCGAATCT---AT--GACCTA-AG-T-GTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--acctatagtactggtttaaccaaggaagacgtcgagagtggcttgtgatgatatatatgaagttgtt
gi|145769                     :  TCTTTCCACAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-AT---TTCTCACA--A-AG-TTTT-T---AGA--CCGA-A---CT---TGACTCGAACCT---GA--GACCTC-AA-A-GTTGAGAAG---TA------A----TAAT--CT-TG---A-GATG
gi|145775                     :  TCCTTCTGCAGA---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTAAAATAA-AG-TTTT-T---GAA--TCAA-G---CG---GAACTCGACCGT---AC--AACATT-TA-C-AGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145772                     :  TCATTCTGCAAG---T---A----A-CTGCC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T---GTT--ACGA-G---TG---GAACTTGAACCT---AT--GACCTT-AG-C-AGTGAG
gi|145767                     :  TCCTTTGGCAAG---T---A----G-CTGCT--A-A-A-CT---TTCT-A-ATAA-AG-TTTT-T---TAA--CCAA-A---TG---GGACTCAAACCT---AT--GACCTC-AG-T-GTTGAGAGGT--TT------A---GTGAT--
gi|145784                     :  tcaTTCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-G---TG---GGACTTGAACCT---AT--GACCCT-AG-T-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145786                     :    aTTCCGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CC---TTCTCACGTAA-AG-TTTT-T---GGA--GCTA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTC-AG-C-GGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145791                     :     TTCTGCAAG---T---A----A-CTGG---A-A-A-CT---TTCTCGCGTAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACATT-AG-C-GATGACAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145777                     :     TTTTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-A---AGA--CTGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTAGT--CT-TG---A-GACG
gi|145787                     :  ttaTTCTGCAAG---T---A----A-CTGG---C-A-A-AT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GCA--GCAA-A---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACTTT-AG-T-AGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATGgtg
gi|145790                     :     TTCCGCAAG---T---A----T-CTGA---CTA-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-T---CG---GGACTCGAACCTG--AC---ACCTT-AG-C-AGTGAGAGG---TG------A---GTGAT--
gi|145792                     :     TCCTGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTTACATAA-AG-TTGT-T---TTA--GTGA-------------CTCGAACCT---AC--GACTTT-AG-C-AGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145788                     :     TTCCGTAAG---T---A----AATTTC---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--CTAA-G---TG---GGACTCAAACCC---AT--GACCGC-AG-C-AGTGAGAGA---TA------A---TTGGT--
gi|145789                     :     TTCTGCAAG---T---A----A-CAGGC--A-A-A-CT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCAA-G---CA---GGACTTGAACCT---AT--GACATT-AGAC-GATG-GAGaat
gi|145785                     :     TTCCGCAAG---T---A----A-CTGGC--A-A-A-CT---TTCTGACGCAA-AG-TTTT-T---GGA--CTAA-G---CT---GGGCTCAAATCT---A
gi|145783                     :     TTCTGCAAGAAAC---A----A-CC-----A-A-A-CT---ATCTGAAGTTT-AG-TCTT-T---GGA---CGACA---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTT-AC-A-ATTGAGAGA---TATTT---A---ATGATG-AT-TG---ATGATGgtac
gi|145794                     :    caTCCACAAG---T---ATTAAA-CTGT---A-A-A-CT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GTGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTT-AG-C-GGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--ttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145795                     :      TCCGCAAG---T---A----A-CTGG---C-ACA-CT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T---GGA--GCGA-G---AA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTT-AG-A-ACTGAGATG---TA------A---GTGA
gi|145793                     :      TCTGCAAG---T---A----A-CTAGC--A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--CCAA-G---CT---TGGCTCAAACCT---AT--GACCGC-AG-T-GGTGAGATG---TT------A---GTG
gi|145796                     :       CTGCAAG---T---A----A-CCAAC--A-A-A-CT---TTCTTAAATAA-AG-TTTT-T---GTA---CAG-A---TG---GG-CTCAAACCC---AT--GACCTC-AA-C-AGTGAGATA---CA------A---GTGAT--
gi|145797                     :          CAAG---T---A----C-CTGGC--A-A-A-GT---TTCTTGAATAA-AG-ATTT-T---GGA--GCAA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTC-AA-T-GGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--g
gi|145798                     :                                ---A-A-A-CA---ATCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--CCAT-A---CT---AGACTCGAACCCCTGACCTGACCTC-AG-T-GATGAGAGG---TA------A---GTGGT--C
gi|145799                     :                               c---A-A-A-CT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T---GGA--CTGA-G---TT---GGGCTCGAACCA---AA--GACTTC-AG-T-GATTAAAGA---Tatt
gi|145800                     :                                                     cTAA-AG-CCTT-T---GGACCACAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTT-AT-T-AGTGAGAGATACTA------A---ATGAT--
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|145801 ): TAAAGTTTTAAATTATATCTCAATTTAGCATTAATCAGAGAAATATTTAATGATGACGATAATGATGTTATGATGATATTGATGATAATGATGATAATGATGATGATAATGATGA






Alignments
lowQualScore                  :                  0000   0  0     000           0  0    0 0   33 000   0 000  000            111  00        0          222  888888 000     777 1  222 9    
lowQualScore                  :                  ....   .  .     ...           .  .    . .   .. ...   . ...  ...            ...  ..        .          ...  ...... ...     ... .  ... .    
lowQualScore                  :                  9999   4  7     777           4  4    4 4   99 777   8 777  777            111  66        4          777  333333 888     000 3  333 3    
consensus                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
Reference ( family-300 )      :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
gi|145699                     :   GTCATTCTTCAAGTA----TCG-CCCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTTAC-AGTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATG
gi|145700                     :   GTCGTTCTTCAAGTA----TCG-CCCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAC-AGTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgta
gi|145701                     :   GTCATTCTGCAAGAA----ACA-AGCAAATT---ATCCCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TATTTAGTA---ATGAT--TTATG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggt
gi|145702                     :   GTCATTCTGCTAGTA----TCA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-CGA--C---TAT-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAC-AATTGAGAGA---TATCT---A---GTGATG-AT-TG---A-atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgataatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattgacggta
gi|145703                     :   GTCATTCTGCAAGTA----TCA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GG---G---CTACA---CT---TGGCTTGGACCT---AG--CACTTTAC-AATTGAGAAA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGtggtgttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcactggttgca
gi|145704                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCGAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TA------ttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtattttaaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgt
gi|145705                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGGCCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTTAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGcttcatgataatttatgatgatattgatattgatgatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145706                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CAGTGAGAGATACTA------A---ATGATAATT-TA---T-GATGataatgatattgacattattgatgattgtgataatattgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatgacattgatggta
gi|145707                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCGAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TA------ataatgatattgatattgatgatgattatgataatattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattgatggta
gi|145708                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CTGTGAGAGATACTA------A---ATGATAATT-TA---T-GATGcttcatgataatttatgatgatattgatattgataatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145709                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGGCCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CAGTGAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGattatgatattgatattgatgatgattgtgataatattgctgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145710                     :   GTCATTCTGCAAGTA----TCA-AGTAAATC---ATTTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GCA--C---CAA-A---CT---TGGCTCGAACAT---AC--GACATAAC-TAGTGAGAGA---TA------ATATGTGATGATT-TGTGAA-GATGataatgatattgatattattgatgattgtgataatattgatgatga
gi|145711                     :   GTCATTCTGCAAATA----TCG-AGCAAATT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--T---CTC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTTAC-AAGTAAGAGA---TATTT---A---GTGAT--atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgattatgttgaggaagtatcaggtaatgttaataatggcataggtggta
gi|145712                     :   GTCATTGTGCAAGTA----AA--AGCAAATT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA------CAA-----CATTTGG-CTCGTACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TATTT---A---GTGAT--tatctatgatgatgatgttgtttatattgatgatgatcaagttgaggaagtatcaggtaatgttatcgatggcattggtagta
gi|145713                     :   GTCATTCAGCAAGAA----ACA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAaat
gi|145714                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACC-GACAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-T---TG---GGACTCGAACTT---AG--GACCTTAG-CCGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--caa
gi|145715                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GCCAAACT---TCCTCACATAG-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CT---GGACTCAAACCT---AA--GACCTTAA-CAGTGAGAGT---TA------A---GTGAT--
gi|145716                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACGTGA-AG-TATT-T-GGA--G---TGA-G---CG---TAACTCAAACCT---AT--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145717                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----TCT-GGCAAACT---TTCCGAAATAA-AG-TATT-T-GGA--G---AGA-----CA---GAACTCGAACCT---AC--GACATTGG-CGGTGAGAGG---TA------
gi|145718                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----AAT-GA-AAACT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T-GGT--G---CGA-G---CA---TGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145719                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTTAG-CAATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145720                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTTAG-CAATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145721                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAATCT---TTCTCACTTAA-TG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AT--GACCTTAG-CAATGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145722                     :   GTCCTTCCGCAAGTG----ACT-GGCAAACT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T-GGT--A---CGA-A---CG---GGGCTCGAACCT---AC--GACCTTTA-TGGTGACAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145723                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145724                     :   GTCCTTTTGCAAGTA----AATCAACAAA-TAAATTCTCAAATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACCTCAG-CAGTGAGAGG---TA------A------AT--TT-TA---T-GAT
gi|145725                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT-----CTCGTATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-A---TG---GGATTCCAACCT---AC--GACCTTAG-TGTTGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145726                     :   GTCATTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACAGTA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAA-CTGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145727                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TGCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--A---CGA-A---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-T
gi|145728                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACA-GGCAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTTTT-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--tga
gi|145729                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---GTCCCGTCTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---TG---GGGCTCGAACCT---AT--GACATCAC-CGGTGAGAGG---TC------A---GTGAT--
gi|145730                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACA---TTTTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---AAA-G---TG---GTACTCGAACCT---AC--GACTTCTG-CAGTGAGATG---TT------A---GTGAT--
gi|145731                     :   GTCCTTCCACAAGTA----ACT-TGCAAACG---TCCTCATATAA-AG-TTTT-T-GAA--G---CGA-A---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-AGGTGAAAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145732                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GAACTTAG-AGATGAGAGG---TA------G---GTGAT--CT-TG---A-GAT
gi|145733                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTTAGAAG---TT------A---GTGAT--tg
gi|145734                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGTAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AC--GAACTTAG-CGGTGAGATG---TA------A---GTGAT--
gi|145735                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACTTAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TGA-GTTTTG---G--CTCGAATCA---AT--GGTCTCAG-CAGAGAGA
gi|145736                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCATACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CCA-G---CG---GGACTCAAAACT---AC--AACCTTAG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--GT-TG---A-GAattt
gi|145737                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-AGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-ATTT-T-AGA--A---CCA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--CACCTTAG-CAGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--ctgat
gi|145738                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----GCT-G-CAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--GGAGTGA-G---CA---GGACTCGAACCT---AT--GACCTTAG-GGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145739                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GAACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145740                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACG-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---AGA-G---CG---GGACTCGAACCT---GC--GACATTAG-CGATGGGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145741                     :   GTCTTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---GTCTCA--TAA-AGATTTT-T-GGA--G---CGA-G---AG---TTACTCGAACCT---AC--GACATTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-CG---A-
gi|145742                     :   GTCATTCCGCAAGTT----ACT-GGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-A---CA---GGACTTGAACCT---AT--GCCCTTGG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145743                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAGCT---TTTTCACACAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--cat
gi|145744                     :   GTCCTGCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACGTAACAA-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GCATTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145745                     :   GTCCTTCTGCAAG-A----ACC-GACATATT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGC-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCCTA
gi|145746                     :   GTCATTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAATT---TTCTCACGTAA-AG-TATT-T-GAA--G---CAA-G---TT---GGGCTCGAAGCT---AT--GGCCTTA
gi|145747                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145748                     :   GTCCTTTTGCAAGTT----TCT-GATAAACT---TTCTCACATAA-AA-TTTT-T-GAA--G---CAA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-TGGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145749                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT---GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145750                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATGA-AG-TTTT-T-GGA--C---CGA-G---CA---GGACCTGAACCC---A
gi|145751                     :   GTCCTTCCGCAAGTT----ACT-GG-AAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CA---GAACTCGAACCT---AT--GACCTTAC-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGtacatgggatagatttggtga
gi|145752                     :   GTCCTTCCGTAAGTA----ACT-TGTAAACC---CTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--A---CGA-G---CG---AGGCTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGA---TA------
gi|145753                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCACATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CT---GAACTCAAACCT---TA--GACCTTAG-CCGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145754                     :   GTCCTTCGACAAGTA----ACA-GCCAAACT---TTCTTATATGA-AG-TTTT-T-GGC--G---CTA-G---CA---GGACTCGAACTG---AT--GACTATAA-----GAGAGA---TA------
gi|145755                     :   GTCCTTCTGTAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATTA-AG-TTTT-T-GGA--G---CCG-G---CA---AGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGCGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145756                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145757                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145758                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145759                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145760                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-TTGGA--A---CGA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--AACCTAAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145761                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCAGATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACCTAAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145763                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-TG-ACACT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T-GGA--A---CAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145764                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-TG-ACACT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T-GGA--A---CAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145765                     :    TCTTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTTTCACTTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---C-A-T---CT---GGACTCGAATCT---AT--GACCTAAG-TGTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145766                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-AACAAATT---TTCTCTGATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-TTGTGAGATT---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145767                     :    TCCTTTGGCAAGTA----GCT-GCTAAACT---TTCT-A-ATAA-AG-TTTT-T-TAA--C---CAA-A---TG---GGACTCAAACCT---AT--GACCTCAG-TGTTGAGAGGT--TT------A---GTGAT--
gi|145768                     : tcaTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAT-G---TG---GGACTCAAACCT---AC--GACTTTAA-TGGTGAGAGG---TA------A---ATGAT--
gi|145769                     :    TCTTTCCACAAGTA----ACT-GGCAAAAT---TTCTCACA--A-AG-TTTT-T-AGA--C---CGA-A---CT---TGACTCGAACCT---GA--GACCTCAA-AGTTGAGAAG---TA------A----TAAT--CT-TG---A-GATG
gi|145770                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCGCATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACC-TAG-CAATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145771                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GAA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTTAG-CAGTGAGAAG---TT------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145772                     :    TCATTCTGCAAGTA----ACT-GCCAAACT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T-GTT--A---CGA-G---TG---GAACTTGAACCT---AT--GACCTTAG-CAGTGAG
gi|145773                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTATCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---TG---GGTCTCGCACCT---AT--AACCTTAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145774                     :    TCGTTCCGCAAGTA----ACC-GGCAAACT---TTCTCACATAC-AG-TGTT-T-GGA--G---CGA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145775                     :    TCCTTCTGCAGATA----ACT-GGCAAACT---TTCTAAAATAA-AG-TTTT-T-GAA--T---CAA-G---CG---GAACTCGACCGT---AC--AACATTTA-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145776                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CA---GGACTTGAACCT---AC--GCACTTGG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145777                     :       TTTTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-A-AGA--C---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTAGT--CT-TG---A-GACG
gi|145778                     : ttaTCATTCCACAAGGA----ACT-GGCAAACA---TTCTCACATAA-AG-TTTC-T-GGA--G---TAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGCTAGAGG---TA------A---GTGAT--gtg
gi|145779                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCAAATAA-AG-TTTT-T-ACA--G---TGA-G---TG---GTACTTGAACCT---AC--AACCTTGG-TGTTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145780                     :    TCCTTTTGCAAGTA----ATT-GGCAAACT---TTCTCACATAG-AG-TTTT---GGA--C---CGA-G---TG---GGACTCTAACCT---AC--GACCTTAA-AGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGacctatagtactggtttaaccaaggaagacgtcgagagtggcttgtgatgatatatatgaagttgtt
gi|145783                     :       TTCTGCAAGAA----ACA-ACCAAACT---ATCTGAAGTTT-AG-TCTT-T-GGA------CGACA---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTTAC-AATTGAGAGA---TATTT---A---ATGATG-AT-TG---ATGATG
gi|145784                     :     caTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---TG---GGACTTGAACCT---AT--GACCCTAG-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145785                     :      aTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTGACGCAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TAA-G---CT---GGGCTCAAATCT---A
gi|145786                     :       TTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACC---TTCTCACGTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CTA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTCAG-CGGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--gtac
gi|145787                     :       TTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAA-T---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GCA--G---CAA-A---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACTTTAG-TAGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145788                     :       TTCCGTAAGTA----AAT-TTCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TAA-G---TG---GGACTCAAACCC---AT--GACCGCAG-CAGTGAGAGA---TA------A---TTGGT--
gi|145789                     :       TTCTGCAAGTA----ACA-GGCAAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CA---GGACTTGAACCT---AT--GACATTAGACGATG-GAGaat
gi|145790                     :       TTCCGCAAGTA----TCT-GACTAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-T---CG---GGACTCGAACCTG--AC---ACCTTAG-CAGTGAGAGG---TG------A---GTGAT--
gi|145791                     :       TTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCGCGTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACATTAG-CGATGACAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145792                     :       TCCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTGT-T-TTA--G---TGA-------------CTCGAACCT---AC--GACTTTAG-CAGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145793                     :        TCTGCAAGTA----ACT-AGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---CAA-G---CT---TGGCTCAAACCT---AT--GACCGCAG-TGGTGAGATG---TT------A---GTG
gi|145794                     :        TCCACAAGTATTAAACT-G-TAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145795                     :        TCCGCAAGTA----ACT-GGCACACT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---AA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-AACTGAGATG---TA------A---GTGA
gi|145796                     :         CTGCAAGTA----ACC-AACAAACT---TTCTTAAATAA-AG-TTTT-T-GTA------CAG-A---TG---GG-CTCAAACCC---AT--GACCTCAA-CAGTGAGATA---CA------A---GTGAT--
gi|145797                     :            CAAGTA----CCT-GGCAAAGT---TTCTTGAATAA-AG-ATTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTCAA-TGGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--g
gi|145798                     :                            CAAACA---ATCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---CAT-A---CT---AGACTCGAACCCCTGACCTGACCTCAG-TGATGAGAGG---TA------A---GTGGT--
gi|145799                     :                            CAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TGA-G---TT---GGGCTCGAACCA---AA--GACTTCAG-TGATTAAAGA---Tcatt
gi|145800                     :                                             TAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-TAGTGAGAGATACTA------A---ATGATAATT-TA---T-GATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|145801 ): TAAAGTTTTAAATTATATCTCAATTTAGCATTAATCAGAGAAATATTTAATGATGACGATAATGATGTTATGATGATATTGATGATAATGATGATAATGATGATGATAATGATGA






Alignments
lowQualScore                  :                  0000   0  0     000           0  0    0 0   33 000   0 000  000            111  00        0          222  888888 000     777 1  222 9    
lowQualScore                  :                  ....   .  .     ...           .  .    . .   .. ...   . ...  ...            ...  ..        .          ...  ...... ...     ... .  ... .    
lowQualScore                  :                  9999   4  7     777           4  4    4 4   99 777   8 777  777            111  66        4          777  333333 888     000 3  333 3    
consensus                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
Reference ( family-300 )      :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
gi|145699                     :   GTCATTCTTCAAGTA----TCG-CCCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTTAC-AGTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATG
gi|145700                     :   GTCGTTCTTCAAGTA----TCG-CCCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAC-AGTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgta
gi|145701                     :   GTCATTCTGCAAGAA----ACA-AGCAAATT---ATCCCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TATTTAGTA---ATGAT--TTATG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggt
gi|145702                     :   GTCATTCTGCTAGTA----TCA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-CGA--C---TAT-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAC-AATTGAGAGA---TATCT---A---GTGATG-AT-TG---A-atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgataatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattgacggta
gi|145703                     :   GTCATTCTGCAAGTA----TCA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GG---G---CTACA---CT---TGGCTTGGACCT---AG--CACTTTAC-AATTGAGAAA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGtggtgttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcactggttgca
gi|145704                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCGAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TA------ttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtattttaaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgt
gi|145705                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGGCCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTTAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGcttcatgataatttatgatgatattgatattgatgatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145706                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CAGTGAGAGATACTA------A---ATGATAATT-TA---T-GATGataatgatattgacattattgatgattgtgataatattgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatgacattgatggta
gi|145707                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCGAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TA------ataatgatattgatattgatgatgattatgataatattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattgatggta
gi|145708                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CTGTGAGAGATACTA------A---ATGATAATT-TA---T-GATGcttcatgataatttatgatgatattgatattgataatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145709                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGGCCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CAGTGAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGattatgatattgatattgatgatgattgtgataatattgctgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145710                     :   GTCATTCTGCAAGTA----TCA-AGTAAATC---ATTTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GCA--C---CAA-A---CT---TGGCTCGAACAT---AC--GACATAAC-TAGTGAGAGA---TA------ATATGTGATGATT-TGTGAA-GATGataatgatattgatattattgatgattgtgataatattgatgatga
gi|145711                     :   GTCATTCTGCAAATA----TCG-AGCAAATT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--T---CTC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTTAC-AAGTAAGAGA---TATTT---A---GTGAT--atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgattatgttgaggaagtatcaggtaatgttaataatggcataggtggta
gi|145712                     :   GTCATTGTGCAAGTA----AA--AGCAAATT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA------CAA-----CATTTGG-CTCGTACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TATTT---A---GTGAT--tatctatgatgatgatgttgtttatattgatgatgatcaagttgaggaagtatcaggtaatgttatcgatggcattggtagta
gi|145713                     :   GTCATTCAGCAAGAA----ACA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAaat
gi|145714                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACC-GACAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-T---TG---GGACTCGAACTT---AG--GACCTTAG-CCGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--caa
gi|145715                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GCCAAACT---TCCTCACATAG-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CT---GGACTCAAACCT---AA--GACCTTAA-CAGTGAGAGT---TA------A---GTGAT--
gi|145716                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACGTGA-AG-TATT-T-GGA--G---TGA-G---CG---TAACTCAAACCT---AT--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145717                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----TCT-GGCAAACT---TTCCGAAATAA-AG-TATT-T-GGA--G---AGA-----CA---GAACTCGAACCT---AC--GACATTGG-CGGTGAGAGG---TA------
gi|145718                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----AAT-GA-AAACT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T-GGT--G---CGA-G---CA---TGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145719                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTTAG-CAATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145720                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTTAG-CAATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145721                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAATCT---TTCTCACTTAA-TG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AT--GACCTTAG-CAATGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145722                     :   GTCCTTCCGCAAGTG----ACT-GGCAAACT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T-GGT--A---CGA-A---CG---GGGCTCGAACCT---AC--GACCTTTA-TGGTGACAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145723                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145724                     :   GTCCTTTTGCAAGTA----AATCAACAAA-TAAATTCTCAAATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACCTCAG-CAGTGAGAGG---TA------A------AT--TT-TA---T-GAT
gi|145725                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT-----CTCGTATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-A---TG---GGATTCCAACCT---AC--GACCTTAG-TGTTGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145726                     :   GTCATTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACAGTA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAA-CTGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145727                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TGCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--A---CGA-A---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-T
gi|145728                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACA-GGCAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTTTT-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--tga
gi|145729                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---GTCCCGTCTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---TG---GGGCTCGAACCT---AT--GACATCAC-CGGTGAGAGG---TC------A---GTGAT--
gi|145730                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACA---TTTTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---AAA-G---TG---GTACTCGAACCT---AC--GACTTCTG-CAGTGAGATG---TT------A---GTGAT--
gi|145731                     :   GTCCTTCCACAAGTA----ACT-TGCAAACG---TCCTCATATAA-AG-TTTT-T-GAA--G---CGA-A---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-AGGTGAAAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145732                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GAACTTAG-AGATGAGAGG---TA------G---GTGAT--CT-TG---A-GAT
gi|145733                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTTAGAAG---TT------A---GTGAT--tg
gi|145734                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGTAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AC--GAACTTAG-CGGTGAGATG---TA------A---GTGAT--
gi|145735                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACTTAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TGA-GTTTTG---G--CTCGAATCA---AT--GGTCTCAG-CAGAGAGA
gi|145736                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCATACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CCA-G---CG---GGACTCAAAACT---AC--AACCTTAG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--GT-TG---A-GAattt
gi|145737                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-AGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-ATTT-T-AGA--A---CCA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--CACCTTAG-CAGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--ctgat
gi|145738                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----GCT-G-CAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--GGAGTGA-G---CA---GGACTCGAACCT---AT--GACCTTAG-GGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145739                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GAACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145740                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACG-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---AGA-G---CG---GGACTCGAACCT---GC--GACATTAG-CGATGGGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145741                     :   GTCTTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---GTCTCA--TAA-AGATTTT-T-GGA--G---CGA-G---AG---TTACTCGAACCT---AC--GACATTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-CG---A-
gi|145742                     :   GTCATTCCGCAAGTT----ACT-GGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-A---CA---GGACTTGAACCT---AT--GCCCTTGG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145743                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAGCT---TTTTCACACAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--cat
gi|145744                     :   GTCCTGCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACGTAACAA-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GCATTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145745                     :   GTCCTTCTGCAAG-A----ACC-GACATATT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGC-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCCTA
gi|145746                     :   GTCATTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAATT---TTCTCACGTAA-AG-TATT-T-GAA--G---CAA-G---TT---GGGCTCGAAGCT---AT--GGCCTTA
gi|145747                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145748                     :   GTCCTTTTGCAAGTT----TCT-GATAAACT---TTCTCACATAA-AA-TTTT-T-GAA--G---CAA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-TGGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145749                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT---GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145750                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATGA-AG-TTTT-T-GGA--C---CGA-G---CA---GGACCTGAACCC---A
gi|145751                     :   GTCCTTCCGCAAGTT----ACT-GG-AAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CA---GAACTCGAACCT---AT--GACCTTAC-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGtacatgggatagatttggtga
gi|145752                     :   GTCCTTCCGTAAGTA----ACT-TGTAAACC---CTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--A---CGA-G---CG---AGGCTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGA---TA------
gi|145753                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCACATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CT---GAACTCAAACCT---TA--GACCTTAG-CCGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145754                     :   GTCCTTCGACAAGTA----ACA-GCCAAACT---TTCTTATATGA-AG-TTTT-T-GGC--G---CTA-G---CA---GGACTCGAACTG---AT--GACTATAA-----GAGAGA---TA------
gi|145755                     :   GTCCTTCTGTAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATTA-AG-TTTT-T-GGA--G---CCG-G---CA---AGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGCGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145756                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145757                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145758                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145759                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145760                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-TTGGA--A---CGA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--AACCTAAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145761                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCAGATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACCTAAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145763                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-TG-ACACT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T-GGA--A---CAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145764                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-TG-ACACT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T-GGA--A---CAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145765                     :    TCTTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTTTCACTTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---C-A-T---CT---GGACTCGAATCT---AT--GACCTAAG-TGTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145766                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-AACAAATT---TTCTCTGATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-TTGTGAGATT---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145767                     :    TCCTTTGGCAAGTA----GCT-GCTAAACT---TTCT-A-ATAA-AG-TTTT-T-TAA--C---CAA-A---TG---GGACTCAAACCT---AT--GACCTCAG-TGTTGAGAGGT--TT------A---GTGAT--
gi|145768                     : tcaTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAT-G---TG---GGACTCAAACCT---AC--GACTTTAA-TGGTGAGAGG---TA------A---ATGAT--
gi|145769                     :    TCTTTCCACAAGTA----ACT-GGCAAAAT---TTCTCACA--A-AG-TTTT-T-AGA--C---CGA-A---CT---TGACTCGAACCT---GA--GACCTCAA-AGTTGAGAAG---TA------A----TAAT--CT-TG---A-GATG
gi|145770                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCGCATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACC-TAG-CAATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145771                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GAA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTTAG-CAGTGAGAAG---TT------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145772                     :    TCATTCTGCAAGTA----ACT-GCCAAACT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T-GTT--A---CGA-G---TG---GAACTTGAACCT---AT--GACCTTAG-CAGTGAG
gi|145773                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTATCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---TG---GGTCTCGCACCT---AT--AACCTTAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145774                     :    TCGTTCCGCAAGTA----ACC-GGCAAACT---TTCTCACATAC-AG-TGTT-T-GGA--G---CGA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145775                     :    TCCTTCTGCAGATA----ACT-GGCAAACT---TTCTAAAATAA-AG-TTTT-T-GAA--T---CAA-G---CG---GAACTCGACCGT---AC--AACATTTA-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145776                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CA---GGACTTGAACCT---AC--GCACTTGG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145777                     :       TTTTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-A-AGA--C---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTAGT--CT-TG---A-GACG
gi|145778                     : ttaTCATTCCACAAGGA----ACT-GGCAAACA---TTCTCACATAA-AG-TTTC-T-GGA--G---TAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGCTAGAGG---TA------A---GTGAT--gtg
gi|145779                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCAAATAA-AG-TTTT-T-ACA--G---TGA-G---TG---GTACTTGAACCT---AC--AACCTTGG-TGTTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145780                     :    TCCTTTTGCAAGTA----ATT-GGCAAACT---TTCTCACATAG-AG-TTTT---GGA--C---CGA-G---TG---GGACTCTAACCT---AC--GACCTTAA-AGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGacctatagtactggtttaaccaaggaagacgtcgagagtggcttgtgatgatatatatgaagttgtt
gi|145783                     :       TTCTGCAAGAA----ACA-ACCAAACT---ATCTGAAGTTT-AG-TCTT-T-GGA------CGACA---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTTAC-AATTGAGAGA---TATTT---A---ATGATG-AT-TG---ATGATG
gi|145784                     :     caTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---TG---GGACTTGAACCT---AT--GACCCTAG-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145785                     :      aTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTGACGCAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TAA-G---CT---GGGCTCAAATCT---A
gi|145786                     :       TTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACC---TTCTCACGTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CTA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTCAG-CGGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--gtac
gi|145787                     :       TTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAA-T---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GCA--G---CAA-A---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACTTTAG-TAGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145788                     :       TTCCGTAAGTA----AAT-TTCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TAA-G---TG---GGACTCAAACCC---AT--GACCGCAG-CAGTGAGAGA---TA------A---TTGGT--
gi|145789                     :       TTCTGCAAGTA----ACA-GGCAAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CA---GGACTTGAACCT---AT--GACATTAGACGATG-GAGaat
gi|145790                     :       TTCCGCAAGTA----TCT-GACTAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-T---CG---GGACTCGAACCTG--AC---ACCTTAG-CAGTGAGAGG---TG------A---GTGAT--
gi|145791                     :       TTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCGCGTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACATTAG-CGATGACAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145792                     :       TCCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTGT-T-TTA--G---TGA-------------CTCGAACCT---AC--GACTTTAG-CAGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145793                     :        TCTGCAAGTA----ACT-AGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---CAA-G---CT---TGGCTCAAACCT---AT--GACCGCAG-TGGTGAGATG---TT------A---GTG
gi|145794                     :        TCCACAAGTATTAAACT-G-TAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145795                     :        TCCGCAAGTA----ACT-GGCACACT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---AA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-AACTGAGATG---TA------A---GTGA
gi|145796                     :         CTGCAAGTA----ACC-AACAAACT---TTCTTAAATAA-AG-TTTT-T-GTA------CAG-A---TG---GG-CTCAAACCC---AT--GACCTCAA-CAGTGAGATA---CA------A---GTGAT--
gi|145797                     :            CAAGTA----CCT-GGCAAAGT---TTCTTGAATAA-AG-ATTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTCAA-TGGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--g
gi|145798                     :                            CAAACA---ATCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---CAT-A---CT---AGACTCGAACCCCTGACCTGACCTCAG-TGATGAGAGG---TA------A---GTGGT--
gi|145799                     :                            CAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TGA-G---TT---GGGCTCGAACCA---AA--GACTTCAG-TGATTAAAGA---Tcatt
gi|145800                     :                                             TAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-TAGTGAGAGATACTA------A---ATGATAATT-TA---T-GATG


blockSeqs                     :                                                              CC                             CTG                       TAC  TTTAGT         AAT A  TGA T
blockSeqs                     :                                                              CC                             G                         TAC  TTT            AAT .  .   T
blockSeqs                     :                                                              CC                             .                         TAC  TCT            GAT .  .   T
blockSeqs                     :                                                              CC                             .                         T    TTT            AAT .  .   T
blockSeqs                     :                                                              CC                             .                         .    TTT            GA  .  .   T
blockSeqs                     :                                                              CC                             .                         .    TTT            GA  .  .   T
blockSeqs                     :                                                              CC                             .                         .    TTT            GA  .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    TTT            AA  .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    TTT            AA  .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              GA  .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              T   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              A   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              A   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              T   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              A   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              G   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              A   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              T   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              T   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              A   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .  .   .
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .              C   .       
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .    .                          
blockSeqs                     :                                                              .                              .                         .                               
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         
blockSeqs                     :                                                              .                              .                                                         


blockSeqCons                  :                                                                                                                            ******         C**
originalCons                  :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
finalCons                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGATC--T-TG---A-GATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|145801 ): TAAAGTTTTAAATTATATCTCAATTTAGCATTAATCAGAGAAATATTTAATGATGACGATAATGATGTTATGATGATATTGATGATAATGATGATAATGATGATGATAATGATGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                      1    
lowQualScore                  :                  0000   0  0     000           0  0    0 0   33 000   0 000  000            111  00        0          222  888888 000     666 1  222 0    
lowQualScore                  :                  ....   .  .     ...           .  .    . .   .. ...   . ...  ...            ...  ..        .          ...  ...... ...     ... .  ... .    
lowQualScore                  :                  9999   4  7     777           4  4    4 4   99 777   8 777  777            111  66        4          777  333333 888     888 5  777 8    
consensus                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--NT-TG---A-GATG
Reference ( family-300 )      :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145699                     :   GTCATTCTTCAAGTA----TCG-CCCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTTAC-AGTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATG
gi|145700                     :   GTCGTTCTTCAAGTA----TCG-CCCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAC-AGTTGAGAGA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgta
gi|145701                     :   GTCATTCTGCAAGAA----ACA-AGCAAATT---ATCCCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TATTTAGTA---ATGAT--TTATG---ATGATGttgatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggt
gi|145702                     :   GTCATTCTGCTAGTA----TCA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-CGA--C---TAT-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAC-AATTGAGAGA---TATCT---A---GTGAT--atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgataatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattgacggta
gi|145703                     :   GTCATTCTGCAAGTA----TCA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GG---G---CTACA---CT---TGGCTTGGACCT---AG--CACTTTAC-AATTGAGAAA---TATTT---A---GTGATG-AT-TG---ATGATGgattgatggtgttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcactggttgca
gi|145704                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCGAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TA------ttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtattttaaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggttgt
gi|145705                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGGCCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTTAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGcttcatgataatttatgatgatattgatattgatgatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145706                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CAGTGAGAGATACTA------A---ATGAT--ataatgatattgacattattgatgattgtgataatattgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatgacattgatggta
gi|145707                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCGAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TA------aatttatgatgataatgatattgatattgatgatgattatgataatattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattgatggta
gi|145708                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CTGTGAGAGATACTA------A---ATGAT--cttcatgataatttatgatgatattgatattgataatgattgtgataacattgatgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145709                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACA-AGCCAACA---ATCTGAAGTAA-AG-CCTT-T-GGGCCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-CAGTGAGAGA---TATTT---A---ATGATA-AT-TG---ATGATGaatttatgatgattatgatattgatattgatgatgattgtgataatattgctgatgataatgttgatgaaatatcgggtaatgttaacgatggcattggtggta
gi|145710                     :   GTCATTCTGCAAGTA----TCA-AGTAAATC---ATTTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GCA--C---CAA-A---CT---TGGCTCGAACAT---AC--GACATAAC-TAGTGAGAGA---TA------ATATGTGATGATT-TGTGAA-GATGataatgatattgatattattgatgattgtgataatattgatgatga
gi|145711                     :   GTCATTCTGCAAATA----TCG-AGCAAATT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--T---CTC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AC--GACTTTAC-AAGTAAGAGA---TATTT---A---GTGAT--atgatgttgatattgatgatgattgtgatgatattgatgatgattatgttgaggaagtatcaggtaatgttaataatggcataggtggta
gi|145712                     :   GTCATTGTGCAAGTA----AA--AGCAAATT---ATCTCAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA------CAA-----CATTTGG-CTCGTACCT---AC--GACTTTAC-CAGTGAGAGA---TATTT---A---GTGAT--tatctatgatgatgatgttgtttatattgatgatgatcaagttgaggaagtatcaggtaatgttatcgatggcattggtagta
gi|145713                     :   GTCATTCAGCAAGAA----ACA-ACCAAACT---ATCTGAAGTAA-AG-TCTT-T-GGA--C---TAC-A---CT---TGGCTCGAACCT---AG--GACTTTAaat
gi|145714                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACC-GACAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-T---TG---GGACTCGAACTT---AG--GACCTTAG-CCGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--caa
gi|145715                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GCCAAACT---TCCTCACATAG-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CT---GGACTCAAACCT---AA--GACCTTAA-CAGTGAGAGT---TA------A---GTGAT--
gi|145716                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACGTGA-AG-TATT-T-GGA--G---TGA-G---CG---TAACTCAAACCT---AT--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145717                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----TCT-GGCAAACT---TTCCGAAATAA-AG-TATT-T-GGA--G---AGA-----CA---GAACTCGAACCT---AC--GACATTGG-CGGTGAGAGG---TA------
gi|145718                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----AAT-GA-AAACT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T-GGT--G---CGA-G---CA---TGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145719                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTTAG-CAATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145720                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-CTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCAAACCT---AC--GACCTTAG-CAATGAGAGA---TA------A---ATGAT--
gi|145721                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAATCT---TTCTCACTTAA-TG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AT--GACCTTAG-CAATGAGAGG---TT------A---GTGAT--
gi|145722                     :   GTCCTTCCGCAAGTG----ACT-GGCAAACT---TTCTAACATAA-AG-ATTT-T-GGT--A---CGA-A---CG---GGGCTCGAACCT---AC--GACCTTTA-TGGTGACAGG---TA------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145723                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145724                     :   GTCCTTTTGCAAGTA----AATCAACAAA-TAAATTCTCAAATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACCTCAG-CAGTGAGAGG---TA------A---AT
gi|145725                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT-----CTCGTATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-A---TG---GGATTCCAACCT---AC--GACCTTAG-TGTTGAGAGG---TT------A---GTGAT--tttatgat
gi|145726                     :   GTCATTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACAGTA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAA-CTGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145727                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TGCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--A---CGA-A---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGATA-TT-TG---A-
gi|145728                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACA-GGCAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTTTT-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145729                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---GTCCCGTCTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---TG---GGGCTCGAACCT---AT--GACATCAC-CGGTGAGAGG---TC------A---GTGAT--
gi|145730                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACA---TTTTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---AAA-G---TG---GTACTCGAACCT---AC--GACTTCTG-CAGTGAGATG---TT------A---GTGAT--
gi|145731                     :   GTCCTTCCACAAGTA----ACT-TGCAAACG---TCCTCATATAA-AG-TTTT-T-GAA--G---CGA-A---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-AGGTGAAAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145732                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GAACTTAG-AGATGAGAGG---TA------G---GTGAT--CT-TG---A-GAT
gi|145733                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTTAGAAG---TT------A---GTGAT--tg
gi|145734                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGTAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CT---GGACTCGAACCT---AC--GAACTTAG-CGGTGAGATG---TA------A---GTGAT--
gi|145735                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACTTAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TGA-GTTTTG---G--CTCGAATCA---AT--GGTCTCAG-CAGAGAGA
gi|145736                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCATACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CCA-G---CG---GGACTCAAAACT---AC--AACCTTAG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--GT-TG---A-GAattt
gi|145737                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-AGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-ATTT-T-AGA--A---CCA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--CACCTTAG-CAGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--ctgat
gi|145738                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----GCT-G-CAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--GGAGTGA-G---CA---GGACTCGAACCT---AT--GACCTTAG-GGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145739                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GAACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145740                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACG-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---AGA-G---CG---GGACTCGAACCT---GC--GACATTAG-CGATGGGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145741                     :   GTCTTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---GTCTCA--TAA-AGATTTT-T-GGA--G---CGA-G---AG---TTACTCGAACCT---AC--GACATTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--AT-CG---A-
gi|145742                     :   GTCATTCCGCAAGTT----ACT-GGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-A---CA---GGACTTGAACCT---AT--GCCCTTGG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--C
gi|145743                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAGCT---TTTTCACACAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--at
gi|145744                     :   GTCCTGCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACGTAACAA-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GCATTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145745                     :   GTCCTTCTGCAAG-A----ACC-GACATATT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGC-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCCTA
gi|145746                     :   GTCATTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAATT---TTCTCACGTAA-AG-TATT-T-GAA--G---CAA-G---TT---GGGCTCGAAGCT---AT--GGCCTTA
gi|145747                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145748                     :   GTCCTTTTGCAAGTT----TCT-GATAAACT---TTCTCACATAA-AA-TTTT-T-GAA--G---CAA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-TGGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145749                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT---GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145750                     :   GTCATTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATGA-AG-TTTT-T-GGA--C---CGA-G---CA---GGACCTGAACCC---A
gi|145751                     :   GTCCTTCCGCAAGTT----ACT-GG-AAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CA---GAACTCGAACCT---AT--GACCTTAC-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGtacatgggatagatttggtga
gi|145752                     :   GTCCTTCCGTAAGTA----ACT-TGTAAACC---CTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--A---CGA-G---CG---AGGCTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CGGTGAGAGA---TA------
gi|145753                     :   GTCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCACATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CT---GAACTCAAACCT---TA--GACCTTAG-CCGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145754                     :   GTCCTTCGACAAGTA----ACA-GCCAAACT---TTCTTATATGA-AG-TTTT-T-GGC--G---CTA-G---CA---GGACTCGAACTG---AT--GACTATAA-----GAGAGA---TA------
gi|145755                     :   GTCCTTCTGTAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATTA-AG-TTTT-T-GGA--G---CCG-G---CA---AGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGCGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145756                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145757                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145758                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145759                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCATAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145760                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-TTGGA--A---CGA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--AACCTAAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145761                     :   GTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCAGATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACCTAAG-CGATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145763                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-TG-ACACT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T-GGA--A---CAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145764                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-TG-ACACT---TTCTCACATAA-CG-TTTT-T-GGA--A---CAA-A---CA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTAAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--TT-TG---A-GATG
gi|145765                     :    TCTTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTTTCACTTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---C-A-T---CT---GGACTCGAATCT---AT--GACCTAAG-TGTTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145766                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-AACAAATT---TTCTCTGATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-TTGTGAGATT---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATG
gi|145767                     :    TCCTTTGGCAAGTA----GCT-GCTAAACT---TTCT-A-ATAA-AG-TTTT-T-TAA--C---CAA-A---TG---GGACTCAAACCT---AT--GACCTCAG-TGTTGAGAGGT--TT------A---GTGAT--
gi|145768                     : tcaTCCTTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAT-G---TG---GGACTCAAACCT---AC--GACTTTAA-TGGTGAGAGG---TA------A---ATGAT--
gi|145769                     :    TCTTTCCACAAGTA----ACT-GGCAAAAT---TTCTCACA--A-AG-TTTT-T-AGA--C---CGA-A---CT---TGACTCGAACCT---GA--GACCTCAA-AGTTGAGAAG---TA------A----TAAT--CT-TG---A-GATG
gi|145770                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCGCATATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---GGACTCGAACCA---AT--GACC-TAG-CAATGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145771                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GAA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAATCT---AC--GACCTTAG-CAGTGAGAAG---TT------A---GTGAT--AT-TG---A-
gi|145772                     :    TCATTCTGCAAGTA----ACT-GCCAAACT---TTCTCACATAA-AG-ATTT-T-GTT--A---CGA-G---TG---GAACTTGAACCT---AT--GACCTTAG-CAGTGAG
gi|145773                     :    TCCTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTATCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---TG---GGTCTCGCACCT---AT--AACCTTAG-CATTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145774                     :    TCGTTCCGCAAGTA----ACC-GGCAAACT---TTCTCACATAC-AG-TGTT-T-GGA--G---CGA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145775                     :    TCCTTCTGCAGATA----ACT-GGCAAACT---TTCTAAAATAA-AG-TTTT-T-GAA--T---CAA-G---CG---GAACTCGACCGT---AC--AACATTTA-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145776                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CA---GGACTTGAACCT---AC--GCACTTGG-CAGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145777                     :       TTTTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCATATAA-AG-TTTT-A-AGA--C---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTAGT--CT-TG---A-GACG
gi|145778                     : ttaTCATTCCACAAGGA----ACT-GGCAAACA---TTCTCACATAA-AG-TTTC-T-GGA--G---TAA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-CAGCTAGAGG---TA------A---GTGAT--gtg
gi|145779                     :    TCCTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCAAATAA-AG-TTTT-T-ACA--G---TGA-G---TG---GTACTTGAACCT---AC--AACCTTGG-TGTTGAGAGA---TA------A---GTGAT--
gi|145780                     :    TCCTTTTGCAAGTA----ATT-GGCAAACT---TTCTCACATAG-AG-TTTT---GGA--C---CGA-G---TG---GGACTCTAACCT---AC--GACCTTAA-AGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGacctatagtactggtttaaccaaggaagacgtcgagagtggcttgtgatgatatatatgaagttgtt
gi|145783                     :       TTCTGCAAGAA----ACA-ACCAAACT---ATCTGAAGTTT-AG-TCTT-T-GGA------CGACA---CT---TGGCTTGAACCT---AG--GACTTTAC-AATTGAGAGA---TATTT---A---ATGATG-AT-TG---ATGATG
gi|145784                     :     caTTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---TG---GGACTTGAACCT---AT--GACCCTAG-TGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--CT-TG---A-GATGttcatattgatgattgtgatgatattgatgatgagtatgttgaggaagtatcaggtaatgttaacaatggcattggtggta
gi|145785                     :      aTTCCGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTGACGCAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TAA-G---CT---GGGCTCAAATCT---A
gi|145786                     :       TTCCGCAAGTA----ACT-GG-AAACC---TTCTCACGTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CTA-G---TG---GGACTCGAACCT---AC--GACCTCAG-CGGTGAGAGA---TA------A---GTGAT--gtac
gi|145787                     :       TTCTGCAAGTA----ACT-GGCAAA-T---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GCA--G---CAA-A---TC---AGACTCGAACCT---AC--GACTTTAG-TAGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145788                     :       TTCCGTAAGTA----AAT-TTCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TAA-G---TG---GGACTCAAACCC---AT--GACCGCAG-CAGTGAGAGA---TA------A---TTGGT--
gi|145789                     :       TTCTGCAAGTA----ACA-GGCAAACT---TTCCCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CAA-G---CA---GGACTTGAACCT---AT--GACATTAGACGATG-GAGaat
gi|145790                     :       TTCCGCAAGTA----TCT-GACTAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-T---CG---GGACTCGAACCTG--AC---ACCTTAG-CAGTGAGAGG---TG------A---GTGAT--
gi|145791                     :       TTCTGCAAGTA----ACT-GG-AAACT---TTCTCGCGTAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--GACATTAG-CGATGACAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145792                     :       TCCTGCAAGTA----ACT-GGCAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTGT-T-TTA--G---TGA-------------CTCGAACCT---AC--GACTTTAG-CAGTGAGAGG---TT------A---GTGCT--CT-TG---A-GATG
gi|145793                     :        TCTGCAAGTA----ACT-AGCAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---CAA-G---CT---TGGCTCAAACCT---AT--GACCGCAG-TGGTGAGATG---TT------A---GTG
gi|145794                     :        TCCACAAGTATTAAACT-G-TAAACT---TTCTTACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---TGA-G---CG---GGACTCGAACCT---AC--AACCTTAG-CGGTGAGAGG---TA------A---GTGAT--
gi|145795                     :        TCCGCAAGTA----ACT-GGCACACT---TTCTAACATAA-AG-TTTT-T-GGA--G---CGA-G---AA---GGACTCGAACCT---AC--GACCTTAG-AACTGAGATG---TA------A---GTGA
gi|145796                     :         CTGCAAGTA----ACC-AACAAACT---TTCTTAAATAA-AG-TTTT-T-GTA------CAG-A---TG---GG-CTCAAACCC---AT--GACCTCAA-CAGTGAGATA---CA------A---GTGAT--
gi|145797                     :            CAAGTA----CCT-GGCAAAGT---TTCTTGAATAA-AG-ATTT-T-GGA--G---CAA-G---CG---TGACTCGAACCT---AC--GACCTCAA-TGGTGAGAGG---TT------A---GTGAT--g
gi|145798                     :                            CAAACA---ATCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---CAT-A---CT---AGACTCGAACCCCTGACCTGACCTCAG-TGATGAGAGG---TA------A---GTGGT--C
gi|145799                     :                            CAAACT---TTCTCACATAA-AG-TTTT-T-GGA--C---TGA-G---TT---GGGCTCGAACCA---AA--GACTTCAG-TGATTAAAGA---Tatt
gi|145800                     :                                             TAA-AG-CCTT-T-GGACCA---CAA-T---TG---G--CTCGAACCT---AC--GACTTTAT-TAGTGAGAGATACTA------A---ATGAT--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|145801 ): TAAAGTTTTAAATTATATCTCAATTTAGCATTAATCAGAGAAATATTTAATGATGACGATAATGATGTTATGATGATATTGATGATAATGATGATAATGATGATGATAATGATGA