lowQualScore : 1
lowQualScore : 00 1 0 0 7 1111 0 66 1 44444 0 000 00 77 1111 0 11111 0 1 11
lowQualScore : .. . . . . .... . .. . ..... . ... .. .. .... . ..... . . ..
lowQualScore : 66 8 1 4 5 7777 4 77 2 77777 4 777 66 11 9999 4 11111 5 0 66
consensus : TTCTTGCATA--CCGGACAAGGATTTCCG-CGTA----TT-TTT-ACC-GGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCCC
Reference ( gi|103205 ) : TTCTTGCATA--CCGGACAAGGATATCCG-CATA----TT-TTT-GCC-GGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-TCCC
gi|103207 : TTCTTGCATA--CCGGACACGGATTTCCG-CGTA----TT-TTC-ACC-AGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-TCTC
gi|103224 : TTCTTGCATA--CCGGA---GGATATCCG-CATA----TT-TTT-ACC-GGC-----T-ATG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTT-C-A-TCCC
gi|103211 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGGATTTCAG-TTTA----TT-TTT-TCT-GGG-----T-ACA---G--A-AT----T-TTCATC-----TTA-C-A-TCCC
gi|103208 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGGATTTTTG-CGTA----TT-TCT-ACC-GGA-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCACC-----CTA-C-A-TTCC
gi|103212 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGGTTTTCCG-CATA----AT-TTT-ACC-AGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTT-C-A-CCCC
gi|103216 : TTCTTGCATA--CCAGGCAAGGATTTCCG-TATA----TT-TTT-ACC-GGG-----T-ACA---G--ATTT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103209 : TTCTTCCATA--CTGGACAAGGATTTCTA-CGTA----TT-TTT-ACC-GGA-----T-ACA---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103218 : TTTTTGCATA--CCGGACAAAGATTTCTG-CATA----TT-TTA-ACC-AGG-----T-ACA---G--A-AT----T-TCCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103236 : TTCTGGCAAA--CTGGACAAGGATATTCG-CATA----TT-TTT-ACT-GGG-----T-ACA---G--A-TT----T-TTCATC-----CTA-T-A-CCCC
gi|103210 : TTCTTGCATA--CCGGACATGGGTTTTCA-CGTA----TT-TTT-ACC-AGA-----T-ACG---A--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-G-TCCC
gi|103213 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGGATTTCCG-TGTA----CT-TTT-AAC-CGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----TCA-C-A-CCCC
gi|103215 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAGATTTCAA-AGTA----TT-TTT-ACC-AGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-
gi|103214 : TTCTTGCATA--CAAGACAAGGATTTCTG-CGTA----TT-TTT-ACA-GGG-----T-ATG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-
gi|103217 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGGATTTGTG-TGTA----TT-TTT-ATC-GGG-----T-ACA---G--A-AT----T-TTAATC-----CTA-CAA-TCC
gi|103220 : TTCTTGCATA--TTGGACGAGGATTTTCG-TGTA----TT-T---ACC-GGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCTC
gi|103221 : TTCTTGCATA--TTGGACACGGAATTCCG-CGTA----TT-TT--ACC-GGG-----T-ACA---G--A-AT----T-TCCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103225 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGGATTTCTG-CGTA----TT-TTT-TTT-GGG-----T-ACG---G--A-ATTTAAT-TTTAGT-----CTA-C-A-CCCC
gi|103228 : TTCCTGCATA--CCAGATAAGGATTTCCA-TGTA----TT-TTT-TCC-GGG-----C-ACT---G--A-AT----T-TTCATT-----CAA-C-A-TCCC
gi|103222 : TTTTTGCATA--CCAGACAAGGATTTCTG-CGTA-----T-TTT-ACC-GGG-----T-ACG---G--A-CT----A-TTTATC-----CTA-C-A-CCC
gi|103223 : TTCTTACATA--CCAAAGAAGGATTTCCG-CGTA----TT-TTT-ACC-GGG-----T-ACG---G--A-AG----T-TTTAAC-----CTA-C-A-
gi|103234 : TTCCTGCATA--CAGGACAAGGATTTCCA-CATA----TT-TTT-ACC-TGG-----T-ATG---G--A-AT----T-TCC-TC-----TTG-C-A-CCCC
gi|103233 : TTCTTGCATT--CTGGACTTGGATTTCCG-CATA----TT-TTT-ACC-GAG-----T-AAA---A--A-TT----T-TTCATC-----CTA-C-A-TCCC
gi|103235 : TTCTTACATA--CAAGACAAGGATTTCCA-TGTA----TT-TTT-GCA-TGG-----T-ACA---G--A-TT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103227 : TTCTCGCAAA--CTGAACAAGGATTTCCA-CGTA----TT-TTT-ACT-CGG-----T-ATG---G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-G-G-TCCC
gi|103229 : TTCTTGCATA--TCGGACAAGGATTTCCA-CGTA----TT-CTT-ACC-GGG-----T-ACA---G--A-TG----G-TTTATC-----CTA-C-A-
gi|103230 : TTCTTGCATG--TCGGACAAGGATTACCG-CGTA----TT-TTC-ACC-GGG-----T-ACA---G--G-TT----G-TTAATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103231 : TTATTGCATA--CCGGACAAGGATTCCTG-CGTA----GT-TTT-ACC-GGG-----T-AAA---G--A-AT----G-TTTATA-----CTA-C-A-CCCC
gi|103238 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGTATTTCGG-CATA-----T-TTA-ACC-AGG-----G-AC----G--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103239 : TTCTTTTATA--CCGGACAAGGATTTCTG-TACA----TC-TTT-ACC-GTA-----T-ACG---G--A-TT----T-TGCATC-----CTA-C-A-CCC
gi|103232 : TTCTTGTATA--CTGGACAAGGATTTCTG-TGTAT---TT-TTT-ACC-AGG-----T-A-----G--A-CT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCC
gi|103237 : TTCTTTAATA--CCGGACAAGGATTTCTA-TGTA----TT-TTT-ACC-AGG-----C-ATG---A--A-TT----T-TTCATC-----CTT-C-A-TCCC
gi|103266 : TTCTTGCATG--CCAGGCAAGGATATATG-CATT----TT-TTTAACC-GGG-----T-ACA---G----AT----T-TTCAAC-----CTA-C-
gi|103245 : TTCGTGCATA--TTGGACAAGGATTTCTG-TATA----TT-TTG-ACC-GGA-----T-ACG---G--A-TT----G-GTCATC-----CTA-C-A-C
gi|103246 : TTCTTGCAAA--CCAGACAAGGATTTCTG-CATA----TT-TTT-ACC-AAA-----C-A-G---G--G-AT----TATTTATC-----CTA-CAA-TCCC
gi|103243 : TTCTAGCATA--CCGGACAAGGATTTCCG-CGTA----TT-TT--------------T-ACG---A--A-AT----T-TTATTC-----CTA-C-A-TTCC
gi|103248 : TTCATGCATA--CCGGAAAAGGAATTCCG-CGTG----TT-TTA-GCC-ATG-----T-ATG---G--A-TA----C-TTCATC-----CTA-C-A-TCCC
gi|103263 : TTCTTGCATA--ACGGACAAGGCAATTTG-CATA-----T-TTT-ACC-GAG-----T-ACG---G--G-AT----T-CTTATC-----C
gi|103254 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGGACTTCTG-CATG-----T-TTC-ACA-ACA-----T-ACA---G--A-AT----T-TATATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103244 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGGATTTC---CATG----TTATTTAACT-GTG-----T-ATG---G--A-TT----T-TTCATC-----CTA-C-A-
gi|103241 : TTTTTGCATA--TCAGAAAAGGATTTCCG-CGTA-----T-TTT-ACC-GGC-----T-ACG---G--A-TG----T-TTTATT-----CTA-C-A-CCC
gi|103242 : TTCTTGTATA--CCGGACAAGGATTTCGG-CGAA----TT-TTA-ACC-GAG-----T-ACG---G--A-AT----T-T
gi|103259 : TTCTTGCACA--CCGGACAAGGATTTCAA-CATA----AT-TTT-ACC-GGG-----T-ATG---G----AT----T-TT
gi|103257 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGTATTTTCG-CATA----TA-TTT-ACT-GGG-----T-ACA---C--ATTT----T-TTTATT-----CTA-C-A-CCTC
gi|103226 : TTCTTGCATATACTGGACGAGGATTTCCG-CATA----AT-TTT-ACT-GGG-----T-ACG---G--A-A
gi|103258 : TTTTTGCATA--CTGGGCACCGATTTCCG-CGTA----TT-TTT-GCC-GTG-----T-ACG---G--ATTT----T-TTTATC-----GTG-C-A-T
gi|103251 : TTCTTGCATA--C-GGATAAGGATCTCTG-AGTA----TT-TTT-ACC-GGG-----T-ACA---G--A-TT----T-TTC
gi|103250 : TTTTTGCATA--CCAAACAAGGGTTTCCA-TGTA----TT-TTT-CCC-TGG-----T-AC----G--A-ATA---G-TTCGTC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103253 : TTTTTGCATA--CCGGACAAGGATTTCTG-CTTATTTTTT-TTT-ACC-GGG-----TAACG---G--A-TT----T-TCCA
gi|103269 : TTCTGACATA--CCCGACAAGGA-ATTTG-CATA----AG-TTT-ACC-AGT-----T-ACG---G--A-AT----T-CTCATC-----ATA-T-A-CCCC
gi|103247 : TTCTTGCATA--CCGGATACGGATTTCTG-CGTG-----T-TTT-ACC-TGG-----T-TCA---G----AT----T-TTTATC-----CTA-C-A-
gi|103249 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAAAT-TTCGTTGTA----GT-TTT-ACC-GGG-----T-ATG---G--A-TT----T-CCCATC-----CT
gi|103252 : TTCTTTTATA--CTCGATAAAGATTTCCG-CGTG----TT-TTT-ATC-GGG-----T-ATG---G--C-TT----T-TTCATT-----CTA-T-A-T
gi|103272 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACCTGGG-----T--TG---G--ATAT----T-TCTATC-----TCA-C-
gi|103219 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGTATATCTG-C--A----TT-TTT-ACT-GGG-----T-TAG---G--T-AT----T-TCTATC-----TTA-C-
gi|103262 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGGATTTCTG-C--A----TT-TTT-ACCAGGG-----T-AAG---A--T-AT----T-TCTATC-----TCA-C-
gi|103255 : TTCTTGCATA--CCTAACTAAGATTTCCA-AGTA----GT-TTT-ACC-AGG-----T-ATG---G--A-TT----T-TTCATC-----CTC-C-A-
gi|103271 : TTTTTGCATA--ACGAACTAGCATATCTG-CGTA----AT-TTT-ACC-GGG-----T-ATT---G--A-TT----G-TTCATT-----CTA-C-A-
gi|103278 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-GGGGT---T-A-----G--ATAT----T-TCTATC-----TCA-C-
gi|103276 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-GGGGT---T-A-----G--ATAT----T-TCTATC-----TCA-C-
gi|103274 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-GGGGT---T-A-----G--ATAT----T-TCTATC-----TCA-C-
gi|103256 : TTTTGGCATA--CTGGGCACCGATTTCCG-CGTA----TT-TTT-ACC-GGG-----T-ACG---G--A-TT----T-TT
gi|103277 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-GGG-----G-ATA---G--ATAT----T-TTGAT
gi|103275 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-GGG-----G-ATA---G--ATAT----T-TTGAT
gi|103206 : TTATTTCATA--CCGAACAAGGATTTCAG-CGGA----TT-TTT-A-C-GGA-----A-ATG---A--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-
gi|103260 : TTCTTGCATA--CCGAATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-AGG-----T-TGA---G--ATAT----T-TCTATC-----TCA-C-
gi|103261 : TTCTTGCATA--CCAGATGAGGATTTCTG-TGCA----TT-TTC-ACA-AAG-----T-ATG---G--A-AT----T-TTAAAC-----CTA-T-A-CCC
gi|103268 : TTCGTGTATA--TCGGACAAGG----------------TT-TTT-ACC-GGA-----T-ACG---G--A-AA----T-TTCATC-----CTA-T-ACTCCC
gi|103267 : TTCTTGTTAA--ACAGACAAAGATTTCCA-CAAT----TT-TTT-ACA-GGG-----T-ATG---A--A-TT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103264 : TTCTTGCATA--T------AAGATTTCTG-CGTA----TT-TTA-GC--AGG-----T-ACA---G--A-TT----C-TTCATC-----CTA-C-A-TCCC
gi|103265 : TTCATGCATG--TCAAACAAGGATTGACG-ATTA----TT-TTT-ACC-GGG-----T-ACG---G--A-TT----T-TTCGTT-----CTG-C-A-C
gi|103282 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGGATATTAG-C--A----TT-TTT-ACC-AGG-----T-TTA---GATA-AT----T-CT-ATC-----TCATC-A-TCC
gi|103281 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TAT-ACCAGGG-----C-TTG---A--T-AT----T-TTTATC-----TCA-C-
gi|103286 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACT-GGGGT---T-A-----G--ATAT----T-TCTATC-----
gi|103285 : TTCTTGCACA--CCAGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ACC-GGGGT---T-A-----G--ATAT----T-TCTATC-----
gi|103284 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGGATATCTG-C--A----TT-TTT-ATC-GGG-----
gi|103280 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGGATATTTG-CGT-----TT-TTT-ACG-GGGTTAGAT-ATGTCTG--ATGT----T-ATCATC-----CAA-C-A-TCC
gi|103273 : TTCTTGTATA--CTGAATAAGGATTT--A-CACA----TT-TTT-ACT-GTG-----A-ACA---G--A-TT----T-TTCATCCCCCACCA-C-A-TCC
gi|103240 : TTCTTGCATG--CCGGACTAGGGTTTCCG-CGTA----TG-ATT-ACA-AGT-----T-ACA---G--A-TT----T-TTCA
gi|103279 : TTTTTGCATA--CTGGACAAGGATTTCTA-CGTA-----T-TTT-ACC-G------------------------------TATC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103283 : TTCTGGCAAA--CCGAACAAGGATTTTCG-CGTA----TT-TTT-
gi|103289 : TCTTGCATA--CCGGACAAAGATTTCCG-CATAC---TT-TTT-TTC-AGG-----T-ACG---G--A-TT----T-GTCATC-----CTA-C-A-CCCCa
gi|103288 : TCTTGCATG--TCGGACAAGTATTTCCA-CGTA----TT-TTG-ACG-GGG-----T-ACA---G--A-TT----T-TTCATC-----CTA-C-A-ACCC
gi|103290 : TCTTGCATA--CCGGACCAGGGTTTCCT-CGTA----TT-TTT-ACC-GGG-----G-TCA---G--A-AT----A-ATCACC-----CTT-C-A-CCCC
gi|103291 : TTTTTCATA--TGGGACAAGGATTTCCG-CGTA----TT-TTT-AAT-GGG-----G-ACA---G--A-AA----T-TTCACA-----CTA-C-A-
gi|103292 : CTTGCATA--CTGAACAAAGATTTCTA-GGTA----TT-TTT-ACT-GGG-----T-ACT---G--A-TT----T-TTCATC-----CTG-C---TCC
gi|103293 : CTTGCATA--CTGGACAAGGATTTCTG-CGTA-----T-TTT-ACC-TGG-----T-ACA---A--A-GT----T-TTTGTT-----TGA-C-A-T
gi|103294 : CTTGCCTA--CCAGACATGGATTTTC---ATT----TG-TTT-ATC-TGG-----T-ACG---A--A-ATAT--T-TTCATC-----CT----A-TCCC
gi|103295 : TTGCATA--CAAGACAAAGATTTCCA-TGTA----TT-TTT-ACC-ATG-----T-ACT---G--A-TT----T-TTCTTC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103296 : TGCATA--CCGGACAAGGGTTTTCA-CGTA----TT-TT--ACC-CGG-----T-ACG---G--A-AT----T-TGCAAC-----CTA-C-A-CCCC
gi|103297 : TGCATA--CCAGAAAAGGATTTCCA-TGTA--------TT-ACT-GGG-----T-ATG---G--ATTT----T-TTCAAC-----CTA-C-A-TCC
gi|103299 : GCATA--CCAGACAAGGATTTCTG-TGTA----TT-ATT-ACC-AGA-----T-ATA---G--A-TT----T-TTCATC-----CTG-C-A-C
gi|103298 : GTATG--CAAGATAAAGATTTCCG-TGTA----TT-TT--ACC-GGG-----A-ACG---G--A-GT----T-TCCTTC-----CTA-C-A-
gi|103300 : ATA--CCGGACGAGGATTTCTG-CGTA----TT-TTT-ACC-TGT-----T-ACG---G--A-AT----T-TTCATA-----CT
gi|103301 : ATA--CAGAACAAGGATTTCCG-CGTA----TT-TT--ACT-GGG-----A-ACA---G--A-AT----G-TTCATC-----CTA-C-A-ACCC
gi|103302 : ATG--CCAGACAAGGATTTCCA-CATA----TT-TTT-ACC-ATATTTT-T-ATG---A--A-AC----T-TTCATC-----CTG-C-A-ACCC
gi|103303 : ATA--CCGAAAAAGAACTTTAG-CGTA----TT-TTA-ACC-GGG-----T-ACG---T--A-TA----T-CTCATC-----CTA-C-ACTCCC
gi|103305 : GGACAAGGATTTCCG-CATA----TG-TTT-ACC-AGA-----T-ACA---C--A-TT----T-TTCA
gi|103306 : CTG-CGTA----AT-TTT-ACC-GGG-----T-ACG---C--A-AT----T-TTCATC-----CTA-C-A-CCTC
gi|103307 : T-TTT-ACT-GGG-----T-ACG---G--A-AT----C-TTCATC-----CTA-C-A-CCC
Alignments
lowQualScore : 00 00 0 2 1111 00 0 1 44444 0 000 77 1111 0
lowQualScore : .. .. . . .... .. . . ..... . ... .. .... .
lowQualScore : 66 66 4 6 7777 66 4 2 66666 4 777 11 9999 4
consensus : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
Reference ( family-299 ) : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103205 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TATCCGCATA----TTT--TT-GCC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACATCCC
gi|103206 : TTATTTCATA--CCGAACAAGG--A-TTTCAGCGGA----TTT--TT-A-C-GGA-----A-ATG---AA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103207 : TTCTTGCATA--CCGGACACGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TC-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACATCTC
gi|103208 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGG--A-TTTTTGCGTA----TTT--CT-ACC-GGA-----T-ACG---GA-AT----T-TTCACCCTACATTCC
gi|103209 : TTCTTCCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTACGTA----TTT--TT-ACC-GGA-----T-ACA---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103210 : TTCTTGCATA--CCGGACATGG--G-TTTTCACGTA----TTT--TT-ACC-AGA-----T-ACG---AA-AT----T-TTCATCCTACGTCCC
gi|103211 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCAGTTTA----TTT--TT-TCT-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TTCATCTTACATCCC
gi|103212 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGG--T-TTTCCGCATA----ATT--TT-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTTCACCCC
gi|103213 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGG--A-TTTCCGTGTA----CTT--TT-AAC-CGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCTCACACCCC
gi|103214 : TTCTTGCATA--CAAGACAAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-ACA-GGG-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103215 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCAAAGTA----TTT--TT-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103216 : TTCTTGCATA--CCAGGCAAGG--A-TTTCCGTATA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GATTT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103217 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTGTGTGTA----TTT--TT-ATC-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TTAATCCTACA
gi|103218 : TTTTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCTGCATA----TTT--TA-ACC-AGG-----T-ACA---GA-AT----T-TCCATCCTACACCCCatcc
gi|103219 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGT--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACT-GGG-----T-TAG---GT-AT----T-TCTATCTTAC
gi|103220 : TTCTTGCATA--TTGGACGAGG--A-TTTTCGTGTA----TTT-----ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCTC
gi|103221 : TTCTTGCATA--TTGGACACGG--A-ATTCCGCGTA----TTT--T--ACC-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TCCATCCTACACCCC
gi|103222 : TTTTTGCATA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGCGTA-----TT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-CT----A-TTTATCCTACACCC
gi|103223 : TTCTTACATA--CCAAAGAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AG----T-TTTAACCTACA
gi|103224 : TTCTTGCATA--CCGGA---GG--A-TATCCGCATA----TTT--TT-ACC-GGC-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTTCATCCC
gi|103225 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-TTT-GGG-----T-ACG---GA-ATTTAAT-TTTAGTCTACACCCC
gi|103226 : TTCTTGCATATACTGGACGAGG--A-TTTCCGCATA----ATT--TT-ACT-GGG-----T-ACG---GA-A
gi|103227 : TTCTCGCAAA--CTGAACAAGG--A-TTTCCACGTA----TTT--TT-ACT-CGG-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTAGGTCCC
gi|103228 : TTCCTGCATA--CCAGATAAGG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-TCC-GGG-----C-ACT---GA-AT----T-TTCATTCAACATCCC
gi|103229 : TTCTTGCATA--TCGGACAAGG--A-TTTCCACGTA----TTC--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GA-TG----G-TTTATCCTACA
gi|103230 : TTCTTGCATG--TCGGACAAGG--A-TTACCGCGTA----TTT--TC-ACC-GGG-----T-ACA---GG-TT----G-TTAATCCTACACCCC
gi|103231 : TTATTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTCCTGCGTA----GTT--TT-ACC-GGG-----T-AAA---GA-AT----G-TTTATACTACACCCC
gi|103232 : TTCTTGTATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTGTGTAT---TTT--TT-ACC-AGG-----T-A-----GA-CT----T-TTCATCCTACACCC
gi|103233 : TTCTTGCATT--CTGGACTTGG--A-TTTCCGCATA----TTT--TT-ACC-GAG-----T-AAA---AA-TT----T-TTCATCCTACATCCC
gi|103234 : TTCCTGCATA--CAGGACAAGG--A-TTTCCACATA----TTT--TT-ACC-TGG-----T-ATG---GA-AT----T-TCC-TCTTGCACCCC
gi|103235 : TTCTTACATA--CAAGACAAGG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-GCA-TGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103236 : TTCTGGCAAA--CTGGACAAGG--A-TATTCGCATA----TTT--TT-ACT-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTATACCCC
gi|103237 : TTCTTTAATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTATGTA----TTT--TT-ACC-AGG-----C-ATG---AA-TT----T-TTCATCCTTCATCCC
gi|103238 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGT--A-TTTCGGCATA-----TT--TA-ACC-AGG-----G-AC----GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103239 : TTCTTTTATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGTACA----TCT--TT-ACC-GTA-----T-ACG---GA-TT----T-TGCATCCTACACCC
gi|103240 : TTCTTGCATG--CCGGACTAGG--G-TTTCCGCGTA----TGA--TT-ACA-AGT-----T-ACA---GA-TT----T-TTCA
gi|103241 : TTTTTGCATA--TCAGAAAAGG--A-TTTCCGCGTA-----TT--TT-ACC-GGC-----T-ACG---GA-TG----T-TTTATTCTACACCC
gi|103242 : TTCTTGTATA--CCGGACAAGG--A-TTTCGGCGAA----TTT--TA-ACC-GAG-----T-ACG---GA-AT----T-T
gi|103243 : TTCTAGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--T--------------T-ACG---AA-AT----T-TTATTCCTACATTCC
gi|103244 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCCATGTT----ATT--TA-ACT-GTG-----T-ATG---GA-TT----T-TTCATCCTACA
gi|103245 : TTCGTGCATA--TTGGACAAGG--A-TTTCTGTATA----TTT--TG-ACC-GGA-----T-ACG---GA-TT----G-GTCATCCTACACC
gi|103246 : TTCTTGCAAA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGCATA----TTT--TT-ACC-AAA-----C-A-G---GG-AT----TATTTATCCTACA
gi|103247 : TTCTTGCATA--CCGGATACGG--A-TTTCTGCGTG-----TT--TT-ACC-TGG-----T-TCA---G--AT----T-TTTATCCTACAatccc
gi|103248 : TTCATGCATA--CCGGAAAAGG--A-ATTCCGCGTG----TTT--TA-GCC-ATG-----T-ATG---GA-TA----C-TTCATCCTACATCCC
gi|103249 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAA--A-TTTCGTTGTA----GTT--TT-ACC-GGG-----T-ATG---GA-TT----T-CCCATCCT
gi|103250 : TTTTTGCATA--CCAAACAAGG--G-TTTCCATGTA----TTT--TT-CCC-TGG-----T-ACG----A-ATA---G-TTCGTCCTACACCCC
gi|103251 : TTCTTGCATA--C-GGATAAGG--A-TCTCTGAGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTC
gi|103252 : TTCTTTTATA--CTCGATAAAG--A-TTTCCGCGTG----TTT--TT-ATC-GGG-----T-ATG---GC-TT----T-TTCATTCTATATC
gi|103253 : TTTTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGCTTATTTTTTT--TT-ACC-GGG-----TAACG---GA-TT----T-TCCA
gi|103254 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-CTTCTGCATG-----TT--TC-ACA-ACA-----T-ACA---GA-AT----T-TATATCCTACACCCC
gi|103255 : TTCTTGCATA--CCTAACTAAG--A-TTTCCAAGTA----GTT--TT-ACC-AGG-----T-ATG---GA-TT----T-TTCATCCTCCA
gi|103256 : TTTTGGCATA--CTGGGCACCG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-TT----T-TT
gi|103257 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGT--A-TTTTCGCATA----TAT--TT-ACT-GGG-----T-ACA---CATTT----T-TTTATTCTACACCTC
gi|103258 : TTTTTGCATA--CTGGGCACCG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-GCC-GTG-----T-ACG---GATTT----T-TTTATCGTGCA
gi|103259 : TTCTTGCACA--CCGGACAAGG--A-TTTCAACATA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ATG---G--AT----T-TTt
gi|103260 : TTCTTGCATA--CCGAATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-AGG-----T-TGA---GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103261 : TTCTTGCATA--CCAGATGAGG--A-TTTCTGTGCA----TTT--TC-ACA-AAG-----T-ATG---GA-AT----T-TTAAACCTATACCC
gi|103262 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TTTCTGC--A----TTT--TT-ACCAGGG-----T-AAG---AT-AT----T-TCTATCTCAC
gi|103263 : TTCTTGCATA--ACGGACAAGGCAA-TTT--GCATA----TTT--T--ACC-GAG-----T-ACG---GG-AT----T-CTTATCC
gi|103264 : TTCTTGCATA--T------AAG--A-TTTCTGCGTA----TTT--T--AGC-AGG-----T-ACA---GA-TT----C-TTCATCCTACATCCC
gi|103265 : TTCATGCATG--TCAAACAAGG--A-TTGACGATTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-TT----T-TTCGTTCTGCACC
gi|103266 : TTCTTGCATG--CCAGGCAAGG--A-TATATGCATT----TTT--TTAACC-GGG-----T-ACA---G--AT----T-TTCAACCTAC
gi|103267 : TTCTTGTTAA--ACAGACAAAG--A-TTTCCACAAT----TTT--TT-ACA-GGG-----T-ATG---AA-TT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103268 : TTCGTGTATA--TCGGACAAGG------------------TTT--TT-ACC-GGA-----T-ACG---GA-AA----T-TTCATCCTATACTCC
gi|103269 : TTCTGACATA--CCCGACAAGG--AATTT--GCATA----AGT--TT-ACC-AGT-----T-ACG---GA-AT----T-CTCATCATATACCCCc
gi|103271 : TTTTTGCATA--ACGAACTAGC--A-TATCTGCGTA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ATT---GA-TT----G-TTCATTCTACA
gi|103272 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACCTGGG-----T--TG---GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103273 : TTCTTGTATA--CTGAATAAGG--A-TTTACAC--A----TTT--TT-ACT-GTG-----A-ACA---GA-TT----T-TTCATCCCCCACC
gi|103274 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCACacatcc
gi|103275 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGG-----G-ATA---GATAT----T-TTGAT
gi|103276 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103277 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGG-----G-ATA---GATAT----T-TTGAT
gi|103278 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103279 : TTTTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTACGTA-----TT--TT-ACC-G----------------------------TATCCTACACCCC
gi|103280 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATTTGCGT-----TTT--TT-ACG-GGGTTAGAT-ATGTCTGATGT----T-ATCATCCAACATCC
gi|103281 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--AT-ACCAGGG-----C-TTG---AT-AT----T-TTTATCTCAC
gi|103282 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TATTAGC--A----TTT--TT-ACC-AGG-----T-
gi|103283 : TTCTGGCAAA--CCGAACAAGG--A-TTTTCGCGTA----TTT--TT-Attagataattctatctcatcatcc
gi|103284 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ATC-GGG-----
gi|103285 : TTCTTGCACA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATC
gi|103286 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACT-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATC
gi|103288 : TCTTGCATG--TCGGACAAGT--A-TTTCCACGTA----TTT--TG-ACG-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTACAACCC
gi|103289 : TCTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCCGCATAC---TTT--TT-TTC-AGG-----T-ACG---GA-TT----T-GTCATCCTACACCCC
gi|103290 : TCTTGCATA--CCGGACCAGG--G-TTTCCTCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----G-TCA---GA-AT----A-ATCACCCTTCACCCC
gi|103291 : TTTTTCATA--TGGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-AAT-GGG-----G-ACA---GA-AA----T-TTCACACTACA
gi|103292 : CTTGCATA--CTGAACAAAG--A-TTTCTAGGTA----TTT--TT-ACT-GGG-----T-ACT---GA-TT----T-TTCATCCTGCTCC
gi|103293 : CTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTGCGTA-----TT--TT-ACC-TGG-----T-ACA---AA-GT----T-TT
gi|103294 : CTTGCCTA--CCAGACATGG--A-TTTTC----A----TTTGTTT-ATC-TGG-----T-ACG---AA-ATAT--T-TTCATCCTAtgtttgacat
gi|103295 : TTGCATA--CAAGACAAAG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-ACC-ATG-----T-ACT---GA-TT----T-TTCTTCCTACACCCCtccc
gi|103296 : TGCATA--CCGGACAAGG--G-TTTTCACGTA-----TT--TT-ACC-CGG-----T-ACG---GA-AT----T-TGCAACCTACACCCC
gi|103297 : TGCATA--CCAGAAAAGG--A-TTTCCATGTA---------TT-ACT-GGG-----T-ATG---GATTT----T-TTCAACCTACATCC
gi|103298 : GTATG--CAAGATAAAG--A-TTTCCGTGTA----TTT--T--ACC-GGG-----A-ACG---GA-GT----T-TCCTTCCTACA
gi|103299 : GCATA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGTGTA----TTA--TT-ACC-AGA-----T-ATA---GA-TT----T-TTCATCCTGCACC
gi|103300 : ATA--CCGGACGAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-ACC-TGT-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATACT
gi|103301 : ATA--CAGAACAAGG--A-TTTCCGCGTA-----TT--TT-ACT-GGG-----A-ACA---GA-AT----G-TTCATCCTACAACCC
gi|103302 : ATG--CCAGACAAGG--A-TTTCCACATA----TTT--TT-ACC-ATATTTT-T-ATG---AA-AC----T-TTCATCCTGCAACCC
gi|103303 : ATA--CCGAAAAAGA--A-CTTTAGCGTA----TTT--TA-ACC-GGG-----T-ACG---TA-TA----T-CTCATCCTACACTCC
gi|103305 : GGACAAGG--A-TTTCCGCATA----TGT--TT-ACC-AGA-----T-ACA---CA-TT----T-TTCAc
gi|103306 : CTGCGTA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---CA-AT----T-TTCATCCTACACCTC
gi|103307 : TT--TT-ACT-GGG-----T-ACG---GA-AT----C-TTCATCCTACACCC
Alignments
lowQualScore : 00 00 0 2 1111 00 0 1 44444 0 000 77 1111 0
lowQualScore : .. .. . . .... .. . . ..... . ... .. .... .
lowQualScore : 66 66 4 6 7777 66 4 2 66666 4 777 11 9999 4
consensus : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
Reference ( family-299 ) : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103205 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TATCCGCATA----TTT--TT-GCC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACATCCC
gi|103206 : TTATTTCATA--CCGAACAAGG--A-TTTCAGCGGA----TTT--TT-A-C-GGA-----A-ATG---AA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103207 : TTCTTGCATA--CCGGACACGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TC-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACATCTC
gi|103208 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGG--A-TTTTTGCGTA----TTT--CT-ACC-GGA-----T-ACG---GA-AT----T-TTCACCCTACATTCC
gi|103209 : TTCTTCCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTACGTA----TTT--TT-ACC-GGA-----T-ACA---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103210 : TTCTTGCATA--CCGGACATGG--G-TTTTCACGTA----TTT--TT-ACC-AGA-----T-ACG---AA-AT----T-TTCATCCTACGTCCC
gi|103211 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCAGTTTA----TTT--TT-TCT-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TTCATCTTACATCCC
gi|103212 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGG--T-TTTCCGCATA----ATT--TT-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTTCACCCC
gi|103213 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGG--A-TTTCCGTGTA----CTT--TT-AAC-CGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCTCACACCCC
gi|103214 : TTCTTGCATA--CAAGACAAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-ACA-GGG-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103215 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCAAAGTA----TTT--TT-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103216 : TTCTTGCATA--CCAGGCAAGG--A-TTTCCGTATA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GATTT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103217 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTGTGTGTA----TTT--TT-ATC-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TTAATCCTACA
gi|103218 : TTTTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCTGCATA----TTT--TA-ACC-AGG-----T-ACA---GA-AT----T-TCCATCCTACACCCCatcc
gi|103219 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGT--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACT-GGG-----T-TAG---GT-AT----T-TCTATCTTAC
gi|103220 : TTCTTGCATA--TTGGACGAGG--A-TTTTCGTGTA----TTT-----ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCTC
gi|103221 : TTCTTGCATA--TTGGACACGG--A-ATTCCGCGTA----TTT--T--ACC-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TCCATCCTACACCCC
gi|103222 : TTTTTGCATA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGCGTA-----TT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-CT----A-TTTATCCTACACCC
gi|103223 : TTCTTACATA--CCAAAGAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AG----T-TTTAACCTACA
gi|103224 : TTCTTGCATA--CCGGA---GG--A-TATCCGCATA----TTT--TT-ACC-GGC-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTTCATCCC
gi|103225 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-TTT-GGG-----T-ACG---GA-ATTTAAT-TTTAGTCTACACCCC
gi|103226 : TTCTTGCATATACTGGACGAGG--A-TTTCCGCATA----ATT--TT-ACT-GGG-----T-ACG---GA-A
gi|103227 : TTCTCGCAAA--CTGAACAAGG--A-TTTCCACGTA----TTT--TT-ACT-CGG-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTAGGTCCC
gi|103228 : TTCCTGCATA--CCAGATAAGG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-TCC-GGG-----C-ACT---GA-AT----T-TTCATTCAACATCCC
gi|103229 : TTCTTGCATA--TCGGACAAGG--A-TTTCCACGTA----TTC--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GA-TG----G-TTTATCCTACA
gi|103230 : TTCTTGCATG--TCGGACAAGG--A-TTACCGCGTA----TTT--TC-ACC-GGG-----T-ACA---GG-TT----G-TTAATCCTACACCCC
gi|103231 : TTATTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTCCTGCGTA----GTT--TT-ACC-GGG-----T-AAA---GA-AT----G-TTTATACTACACCCC
gi|103232 : TTCTTGTATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTGTGTAT---TTT--TT-ACC-AGG-----T-A-----GA-CT----T-TTCATCCTACACCC
gi|103233 : TTCTTGCATT--CTGGACTTGG--A-TTTCCGCATA----TTT--TT-ACC-GAG-----T-AAA---AA-TT----T-TTCATCCTACATCCC
gi|103234 : TTCCTGCATA--CAGGACAAGG--A-TTTCCACATA----TTT--TT-ACC-TGG-----T-ATG---GA-AT----T-TCC-TCTTGCACCCC
gi|103235 : TTCTTACATA--CAAGACAAGG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-GCA-TGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103236 : TTCTGGCAAA--CTGGACAAGG--A-TATTCGCATA----TTT--TT-ACT-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTATACCCC
gi|103237 : TTCTTTAATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTATGTA----TTT--TT-ACC-AGG-----C-ATG---AA-TT----T-TTCATCCTTCATCCC
gi|103238 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGT--A-TTTCGGCATA-----TT--TA-ACC-AGG-----G-AC----GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103239 : TTCTTTTATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGTACA----TCT--TT-ACC-GTA-----T-ACG---GA-TT----T-TGCATCCTACACCC
gi|103240 : TTCTTGCATG--CCGGACTAGG--G-TTTCCGCGTA----TGA--TT-ACA-AGT-----T-ACA---GA-TT----T-TTCA
gi|103241 : TTTTTGCATA--TCAGAAAAGG--A-TTTCCGCGTA-----TT--TT-ACC-GGC-----T-ACG---GA-TG----T-TTTATTCTACACCC
gi|103242 : TTCTTGTATA--CCGGACAAGG--A-TTTCGGCGAA----TTT--TA-ACC-GAG-----T-ACG---GA-AT----T-T
gi|103243 : TTCTAGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--T--------------T-ACG---AA-AT----T-TTATTCCTACATTCC
gi|103244 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCCATGTT----ATT--TA-ACT-GTG-----T-ATG---GA-TT----T-TTCATCCTACA
gi|103245 : TTCGTGCATA--TTGGACAAGG--A-TTTCTGTATA----TTT--TG-ACC-GGA-----T-ACG---GA-TT----G-GTCATCCTACACC
gi|103246 : TTCTTGCAAA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGCATA----TTT--TT-ACC-AAA-----C-A-G---GG-AT----TATTTATCCTACA
gi|103247 : TTCTTGCATA--CCGGATACGG--A-TTTCTGCGTG-----TT--TT-ACC-TGG-----T-TCA---G--AT----T-TTTATCCTACAatccc
gi|103248 : TTCATGCATA--CCGGAAAAGG--A-ATTCCGCGTG----TTT--TA-GCC-ATG-----T-ATG---GA-TA----C-TTCATCCTACATCCC
gi|103249 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAA--A-TTTCGTTGTA----GTT--TT-ACC-GGG-----T-ATG---GA-TT----T-CCCATCCT
gi|103250 : TTTTTGCATA--CCAAACAAGG--G-TTTCCATGTA----TTT--TT-CCC-TGG-----T-ACG----A-ATA---G-TTCGTCCTACACCCC
gi|103251 : TTCTTGCATA--C-GGATAAGG--A-TCTCTGAGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTC
gi|103252 : TTCTTTTATA--CTCGATAAAG--A-TTTCCGCGTG----TTT--TT-ATC-GGG-----T-ATG---GC-TT----T-TTCATTCTATATC
gi|103253 : TTTTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGCTTATTTTTTT--TT-ACC-GGG-----TAACG---GA-TT----T-TCCA
gi|103254 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-CTTCTGCATG-----TT--TC-ACA-ACA-----T-ACA---GA-AT----T-TATATCCTACACCCC
gi|103255 : TTCTTGCATA--CCTAACTAAG--A-TTTCCAAGTA----GTT--TT-ACC-AGG-----T-ATG---GA-TT----T-TTCATCCTCCA
gi|103256 : TTTTGGCATA--CTGGGCACCG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-TT----T-TT
gi|103257 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGT--A-TTTTCGCATA----TAT--TT-ACT-GGG-----T-ACA---CATTT----T-TTTATTCTACACCTC
gi|103258 : TTTTTGCATA--CTGGGCACCG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-GCC-GTG-----T-ACG---GATTT----T-TTTATCGTGCA
gi|103259 : TTCTTGCACA--CCGGACAAGG--A-TTTCAACATA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ATG---G--AT----T-TTt
gi|103260 : TTCTTGCATA--CCGAATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-AGG-----T-TGA---GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103261 : TTCTTGCATA--CCAGATGAGG--A-TTTCTGTGCA----TTT--TC-ACA-AAG-----T-ATG---GA-AT----T-TTAAACCTATACCC
gi|103262 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TTTCTGC--A----TTT--TT-ACCAGGG-----T-AAG---AT-AT----T-TCTATCTCAC
gi|103263 : TTCTTGCATA--ACGGACAAGGCAA-TTT--GCATA----TTT--T--ACC-GAG-----T-ACG---GG-AT----T-CTTATCC
gi|103264 : TTCTTGCATA--T------AAG--A-TTTCTGCGTA----TTT--T--AGC-AGG-----T-ACA---GA-TT----C-TTCATCCTACATCCC
gi|103265 : TTCATGCATG--TCAAACAAGG--A-TTGACGATTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-TT----T-TTCGTTCTGCACC
gi|103266 : TTCTTGCATG--CCAGGCAAGG--A-TATATGCATT----TTT--TTAACC-GGG-----T-ACA---G--AT----T-TTCAACCTAC
gi|103267 : TTCTTGTTAA--ACAGACAAAG--A-TTTCCACAAT----TTT--TT-ACA-GGG-----T-ATG---AA-TT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103268 : TTCGTGTATA--TCGGACAAGG------------------TTT--TT-ACC-GGA-----T-ACG---GA-AA----T-TTCATCCTATACTCC
gi|103269 : TTCTGACATA--CCCGACAAGG--AATTT--GCATA----AGT--TT-ACC-AGT-----T-ACG---GA-AT----T-CTCATCATATACCCCc
gi|103271 : TTTTTGCATA--ACGAACTAGC--A-TATCTGCGTA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ATT---GA-TT----G-TTCATTCTACA
gi|103272 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACCTGGG-----T--TG---GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103273 : TTCTTGTATA--CTGAATAAGG--A-TTTACAC--A----TTT--TT-ACT-GTG-----A-ACA---GA-TT----T-TTCATCCCCCACC
gi|103274 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCACacatcc
gi|103275 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGG-----G-ATA---GATAT----T-TTGAT
gi|103276 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103277 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGG-----G-ATA---GATAT----T-TTGAT
gi|103278 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103279 : TTTTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTACGTA-----TT--TT-ACC-G----------------------------TATCCTACACCCC
gi|103280 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATTTGCGT-----TTT--TT-ACG-GGGTTAGAT-ATGTCTGATGT----T-ATCATCCAACATCC
gi|103281 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--AT-ACCAGGG-----C-TTG---AT-AT----T-TTTATCTCAC
gi|103282 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TATTAGC--A----TTT--TT-ACC-AGG-----T-
gi|103283 : TTCTGGCAAA--CCGAACAAGG--A-TTTTCGCGTA----TTT--TT-Attagataattctatctcatcatcc
gi|103284 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ATC-GGG-----
gi|103285 : TTCTTGCACA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATC
gi|103286 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACT-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATC
gi|103288 : TCTTGCATG--TCGGACAAGT--A-TTTCCACGTA----TTT--TG-ACG-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTACAACCC
gi|103289 : TCTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCCGCATAC---TTT--TT-TTC-AGG-----T-ACG---GA-TT----T-GTCATCCTACACCCC
gi|103290 : TCTTGCATA--CCGGACCAGG--G-TTTCCTCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----G-TCA---GA-AT----A-ATCACCCTTCACCCC
gi|103291 : TTTTTCATA--TGGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-AAT-GGG-----G-ACA---GA-AA----T-TTCACACTACA
gi|103292 : CTTGCATA--CTGAACAAAG--A-TTTCTAGGTA----TTT--TT-ACT-GGG-----T-ACT---GA-TT----T-TTCATCCTGCTCC
gi|103293 : CTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTGCGTA-----TT--TT-ACC-TGG-----T-ACA---AA-GT----T-TT
gi|103294 : CTTGCCTA--CCAGACATGG--A-TTTTC----A----TTTGTTT-ATC-TGG-----T-ACG---AA-ATAT--T-TTCATCCTAtgtttgacat
gi|103295 : TTGCATA--CAAGACAAAG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-ACC-ATG-----T-ACT---GA-TT----T-TTCTTCCTACACCCCtccc
gi|103296 : TGCATA--CCGGACAAGG--G-TTTTCACGTA-----TT--TT-ACC-CGG-----T-ACG---GA-AT----T-TGCAACCTACACCCC
gi|103297 : TGCATA--CCAGAAAAGG--A-TTTCCATGTA---------TT-ACT-GGG-----T-ATG---GATTT----T-TTCAACCTACATCC
gi|103298 : GTATG--CAAGATAAAG--A-TTTCCGTGTA----TTT--T--ACC-GGG-----A-ACG---GA-GT----T-TCCTTCCTACA
gi|103299 : GCATA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGTGTA----TTA--TT-ACC-AGA-----T-ATA---GA-TT----T-TTCATCCTGCACC
gi|103300 : ATA--CCGGACGAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-ACC-TGT-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATACT
gi|103301 : ATA--CAGAACAAGG--A-TTTCCGCGTA-----TT--TT-ACT-GGG-----A-ACA---GA-AT----G-TTCATCCTACAACCC
gi|103302 : ATG--CCAGACAAGG--A-TTTCCACATA----TTT--TT-ACC-ATATTTT-T-ATG---AA-AC----T-TTCATCCTGCAACCC
gi|103303 : ATA--CCGAAAAAGA--A-CTTTAGCGTA----TTT--TA-ACC-GGG-----T-ACG---TA-TA----T-CTCATCCTACACTCC
gi|103305 : GGACAAGG--A-TTTCCGCATA----TGT--TT-ACC-AGA-----T-ACA---CA-TT----T-TTCAc
gi|103306 : CTGCGTA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---CA-AT----T-TTCATCCTACACCTC
gi|103307 : TT--TT-ACT-GGG-----T-ACG---GA-AT----C-TTCATCCTACACCC
blockSeqs : G TTTT A TTAGA TT TTAA
blockSeqs : G T T TTTT TT AT
blockSeqs : G C A GT TT A
blockSeqs : G . . GT TA .
blockSeqs : G . . GT TA .
blockSeqs : T . . GT TA .
blockSeqs : A . . GT TA .
blockSeqs : G . . . TA .
blockSeqs : G . . . TA .
blockSeqs : G . . . TA .
blockSeqs : A . . . TG .
blockSeqs : G . . . TA .
blockSeqs : A . . . TA .
blockSeqs : G . . . TT .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . C .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : A . . . C .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : T . . . T .
blockSeqs : A . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : A . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : T . . . T .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : A . . . T .
blockSeqs : A . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : A . . . T .
blockSeqs : G . . . T .
blockSeqs : A . . . A .
blockSeqs : G . . . A .
blockSeqs : . . . . T .
blockSeqs : . . . . G .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . T .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . G .
blockSeqs : . . . . T .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . T .
blockSeqs : . . . . T .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . A .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
finalCons : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
Alignments
lowQualScore : 00 00 0 2 1111 00 0 1 44444 0 000 77 1111 0
lowQualScore : .. .. . . .... .. . . ..... . ... .. .... .
lowQualScore : 66 66 4 6 7777 66 4 2 66666 4 777 11 9999 4
consensus : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
Reference ( family-299 ) : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103205 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TATCCGCATA----TTT--TT-GCC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACATCCC
gi|103206 : TTATTTCATA--CCGAACAAGG--A-TTTCAGCGGA----TTT--TT-A-C-GGA-----A-ATG---AA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103207 : TTCTTGCATA--CCGGACACGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TC-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACATCTC
gi|103208 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGG--A-TTTTTGCGTA----TTT--CT-ACC-GGA-----T-ACG---GA-AT----T-TTCACCCTACATTCC
gi|103209 : TTCTTCCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTACGTA----TTT--TT-ACC-GGA-----T-ACA---GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103210 : TTCTTGCATA--CCGGACATGG--G-TTTTCACGTA----TTT--TT-ACC-AGA-----T-ACG---AA-AT----T-TTCATCCTACGTCCC
gi|103211 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCAGTTTA----TTT--TT-TCT-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TTCATCTTACATCCC
gi|103212 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGG--T-TTTCCGCATA----ATT--TT-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTTCACCCC
gi|103213 : TTCTTGCATA--CCGGACAGGG--A-TTTCCGTGTA----CTT--TT-AAC-CGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCTCACACCCC
gi|103214 : TTCTTGCATA--CAAGACAAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-ACA-GGG-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103215 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCAAAGTA----TTT--TT-ACC-AGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTAC
gi|103216 : TTCTTGCATA--CCAGGCAAGG--A-TTTCCGTATA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GATTT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103217 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTGTGTGTA----TTT--TT-ATC-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TTAATCCTACA
gi|103218 : TTTTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCTGCATA----TTT--TA-ACC-AGG-----T-ACA---GA-AT----T-TCCATCCTACACCCCatcc
gi|103219 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGT--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACT-GGG-----T-TAG---GT-AT----T-TCTATCTTAC
gi|103220 : TTCTTGCATA--TTGGACGAGG--A-TTTTCGTGTA----TTT-----ACC-GGG-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATCCTACACCTC
gi|103221 : TTCTTGCATA--TTGGACACGG--A-ATTCCGCGTA----TTT--T--ACC-GGG-----T-ACA---GA-AT----T-TCCATCCTACACCCC
gi|103222 : TTTTTGCATA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGCGTA-----TT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-CT----A-TTTATCCTACACCC
gi|103223 : TTCTTACATA--CCAAAGAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-AG----T-TTTAACCTACA
gi|103224 : TTCTTGCATA--CCGGA---GG--A-TATCCGCATA----TTT--TT-ACC-GGC-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTTCATCCC
gi|103225 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-TTT-GGG-----T-ACG---GA-ATTTAAT-TTTAGTCTACACCCC
gi|103226 : TTCTTGCATATACTGGACGAGG--A-TTTCCGCATA----ATT--TT-ACT-GGG-----T-ACG---GA-A
gi|103227 : TTCTCGCAAA--CTGAACAAGG--A-TTTCCACGTA----TTT--TT-ACT-CGG-----T-ATG---GA-AT----T-TTCATCCTAGGTCCC
gi|103228 : TTCCTGCATA--CCAGATAAGG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-TCC-GGG-----C-ACT---GA-AT----T-TTCATTCAACATCCC
gi|103229 : TTCTTGCATA--TCGGACAAGG--A-TTTCCACGTA----TTC--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GA-TG----G-TTTATCCTACA
gi|103230 : TTCTTGCATG--TCGGACAAGG--A-TTACCGCGTA----TTT--TC-ACC-GGG-----T-ACA---GG-TT----G-TTAATCCTACACCCC
gi|103231 : TTATTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTCCTGCGTA----GTT--TT-ACC-GGG-----T-AAA---GA-AT----G-TTTATACTACACCCC
gi|103232 : TTCTTGTATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTGTGTAT---TTT--TT-ACC-AGG-----T-A-----GA-CT----T-TTCATCCTACACCC
gi|103233 : TTCTTGCATT--CTGGACTTGG--A-TTTCCGCATA----TTT--TT-ACC-GAG-----T-AAA---AA-TT----T-TTCATCCTACATCCC
gi|103234 : TTCCTGCATA--CAGGACAAGG--A-TTTCCACATA----TTT--TT-ACC-TGG-----T-ATG---GA-AT----T-TCC-TCTTGCACCCC
gi|103235 : TTCTTACATA--CAAGACAAGG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-GCA-TGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103236 : TTCTGGCAAA--CTGGACAAGG--A-TATTCGCATA----TTT--TT-ACT-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTATACCCC
gi|103237 : TTCTTTAATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTATGTA----TTT--TT-ACC-AGG-----C-ATG---AA-TT----T-TTCATCCTTCATCCC
gi|103238 : TTCTTGCATA--CCAGACAAGT--A-TTTCGGCATA-----TT--TA-ACC-AGG-----G-AC----GA-AT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103239 : TTCTTTTATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGTACA----TCT--TT-ACC-GTA-----T-ACG---GA-TT----T-TGCATCCTACACCC
gi|103240 : TTCTTGCATG--CCGGACTAGG--G-TTTCCGCGTA----TGA--TT-ACA-AGT-----T-ACA---GA-TT----T-TTCA
gi|103241 : TTTTTGCATA--TCAGAAAAGG--A-TTTCCGCGTA-----TT--TT-ACC-GGC-----T-ACG---GA-TG----T-TTTATTCTACACCC
gi|103242 : TTCTTGTATA--CCGGACAAGG--A-TTTCGGCGAA----TTT--TA-ACC-GAG-----T-ACG---GA-AT----T-T
gi|103243 : TTCTAGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--T--------------T-ACG---AA-AT----T-TTATTCCTACATTCC
gi|103244 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCCATGTT----ATT--TA-ACT-GTG-----T-ATG---GA-TT----T-TTCATCCTACA
gi|103245 : TTCGTGCATA--TTGGACAAGG--A-TTTCTGTATA----TTT--TG-ACC-GGA-----T-ACG---GA-TT----G-GTCATCCTACACC
gi|103246 : TTCTTGCAAA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGCATA----TTT--TT-ACC-AAA-----C-A-G---GG-AT----TATTTATCCTACA
gi|103247 : TTCTTGCATA--CCGGATACGG--A-TTTCTGCGTG-----TT--TT-ACC-TGG-----T-TCA---G--AT----T-TTTATCCTACAatccc
gi|103248 : TTCATGCATA--CCGGAAAAGG--A-ATTCCGCGTG----TTT--TA-GCC-ATG-----T-ATG---GA-TA----C-TTCATCCTACATCCC
gi|103249 : TTCTTGCATA--CCGGACAAAA--A-TTTCGTTGTA----GTT--TT-ACC-GGG-----T-ATG---GA-TT----T-CCCATCCT
gi|103250 : TTTTTGCATA--CCAAACAAGG--G-TTTCCATGTA----TTT--TT-CCC-TGG-----T-ACG----A-ATA---G-TTCGTCCTACACCCC
gi|103251 : TTCTTGCATA--C-GGATAAGG--A-TCTCTGAGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTC
gi|103252 : TTCTTTTATA--CTCGATAAAG--A-TTTCCGCGTG----TTT--TT-ATC-GGG-----T-ATG---GC-TT----T-TTCATTCTATATC
gi|103253 : TTTTTGCATA--CCGGACAAGG--A-TTTCTGCTTATTTTTTT--TT-ACC-GGG-----TAACG---GA-TT----T-TCCA
gi|103254 : TTCTTGCATA--CCGGACAAGG--A-CTTCTGCATG-----TT--TC-ACA-ACA-----T-ACA---GA-AT----T-TATATCCTACACCCC
gi|103255 : TTCTTGCATA--CCTAACTAAG--A-TTTCCAAGTA----GTT--TT-ACC-AGG-----T-ATG---GA-TT----T-TTCATCCTCCA
gi|103256 : TTTTGGCATA--CTGGGCACCG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-TT----T-TT
gi|103257 : TTCTTGCATA--CTGGACAAGT--A-TTTTCGCATA----TAT--TT-ACT-GGG-----T-ACA---CATTT----T-TTTATTCTACACCTC
gi|103258 : TTTTTGCATA--CTGGGCACCG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-GCC-GTG-----T-ACG---GATTT----T-TTTATCGTGCA
gi|103259 : TTCTTGCACA--CCGGACAAGG--A-TTTCAACATA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ATG---G--AT----T-TTt
gi|103260 : TTCTTGCATA--CCGAATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-AGG-----T-TGA---GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103261 : TTCTTGCATA--CCAGATGAGG--A-TTTCTGTGCA----TTT--TC-ACA-AAG-----T-ATG---GA-AT----T-TTAAACCTATACCC
gi|103262 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TTTCTGC--A----TTT--TT-ACCAGGG-----T-AAG---AT-AT----T-TCTATCTCAC
gi|103263 : TTCTTGCATA--ACGGACAAGGCAA-TTT--GCATA----TTT--T--ACC-GAG-----T-ACG---GG-AT----T-CTTATCC
gi|103264 : TTCTTGCATA--T------AAG--A-TTTCTGCGTA----TTT--T--AGC-AGG-----T-ACA---GA-TT----C-TTCATCCTACATCCC
gi|103265 : TTCATGCATG--TCAAACAAGG--A-TTGACGATTA----TTT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---GA-TT----T-TTCGTTCTGCACC
gi|103266 : TTCTTGCATG--CCAGGCAAGG--A-TATATGCATT----TTT--TTAACC-GGG-----T-ACA---G--AT----T-TTCAACCTAC
gi|103267 : TTCTTGTTAA--ACAGACAAAG--A-TTTCCACAAT----TTT--TT-ACA-GGG-----T-ATG---AA-TT----T-TTCATCCTACACCCC
gi|103268 : TTCGTGTATA--TCGGACAAGG------------------TTT--TT-ACC-GGA-----T-ACG---GA-AA----T-TTCATCCTATACTCC
gi|103269 : TTCTGACATA--CCCGACAAGG--AATTT--GCATA----AGT--TT-ACC-AGT-----T-ACG---GA-AT----T-CTCATCATATACCCCc
gi|103271 : TTTTTGCATA--ACGAACTAGC--A-TATCTGCGTA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ATT---GA-TT----G-TTCATTCTACA
gi|103272 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACCTGGG-----T--TG---GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103273 : TTCTTGTATA--CTGAATAAGG--A-TTTACAC--A----TTT--TT-ACT-GTG-----A-ACA---GA-TT----T-TTCATCCCCCACC
gi|103274 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCACacatcc
gi|103275 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGG-----G-ATA---GATAT----T-TTGAT
gi|103276 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103277 : TTCTTGCACA--CTGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGG-----G-ATA---GATAT----T-TTGAT
gi|103278 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATCTCAC
gi|103279 : TTTTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTACGTA-----TT--TT-ACC-G----------------------------TATCCTACACCCC
gi|103280 : TTCTTGCATA--CCAGATAAGG--A-TATTTGCGT-----TTT--TT-ACG-GGGTTAGAT-ATGTCTGATGT----T-ATCATCCAACATCC
gi|103281 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--AT-ACCAGGG-----C-TTG---AT-AT----T-TTTATCTCAC
gi|103282 : TTCTTGCATA--CCGGATAAGG--A-TATTAGC--A----TTT--TT-ACC-AGG-----T-
gi|103283 : TTCTGGCAAA--CCGAACAAGG--A-TTTTCGCGTA----TTT--TT-Attagataattctatctcatcatcc
gi|103284 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ATC-GGG-----
gi|103285 : TTCTTGCACA--CCAGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACC-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATC
gi|103286 : TTCTTGCACA--CCGGATAAGG--A-TATCTGC--A----TTT--TT-ACT-GGGGT---T-A-----GATAT----T-TCTATC
gi|103288 : TCTTGCATG--TCGGACAAGT--A-TTTCCACGTA----TTT--TG-ACG-GGG-----T-ACA---GA-TT----T-TTCATCCTACAACCC
gi|103289 : TCTTGCATA--CCGGACAAAG--A-TTTCCGCATAC---TTT--TT-TTC-AGG-----T-ACG---GA-TT----T-GTCATCCTACACCCC
gi|103290 : TCTTGCATA--CCGGACCAGG--G-TTTCCTCGTA----TTT--TT-ACC-GGG-----G-TCA---GA-AT----A-ATCACCCTTCACCCC
gi|103291 : TTTTTCATA--TGGGACAAGG--A-TTTCCGCGTA----TTT--TT-AAT-GGG-----G-ACA---GA-AA----T-TTCACACTACA
gi|103292 : CTTGCATA--CTGAACAAAG--A-TTTCTAGGTA----TTT--TT-ACT-GGG-----T-ACT---GA-TT----T-TTCATCCTGCTCC
gi|103293 : CTTGCATA--CTGGACAAGG--A-TTTCTGCGTA-----TT--TT-ACC-TGG-----T-ACA---AA-GT----T-TT
gi|103294 : CTTGCCTA--CCAGACATGG--A-TTTTC----A----TTTGTTT-ATC-TGG-----T-ACG---AA-ATAT--T-TTCATCCTAtgtttgacat
gi|103295 : TTGCATA--CAAGACAAAG--A-TTTCCATGTA----TTT--TT-ACC-ATG-----T-ACT---GA-TT----T-TTCTTCCTACACCCCtccc
gi|103296 : TGCATA--CCGGACAAGG--G-TTTTCACGTA-----TT--TT-ACC-CGG-----T-ACG---GA-AT----T-TGCAACCTACACCCC
gi|103297 : TGCATA--CCAGAAAAGG--A-TTTCCATGTA---------TT-ACT-GGG-----T-ATG---GATTT----T-TTCAACCTACATCC
gi|103298 : GTATG--CAAGATAAAG--A-TTTCCGTGTA----TTT--T--ACC-GGG-----A-ACG---GA-GT----T-TCCTTCCTACA
gi|103299 : GCATA--CCAGACAAGG--A-TTTCTGTGTA----TTA--TT-ACC-AGA-----T-ATA---GA-TT----T-TTCATCCTGCACC
gi|103300 : ATA--CCGGACGAGG--A-TTTCTGCGTA----TTT--TT-ACC-TGT-----T-ACG---GA-AT----T-TTCATACT
gi|103301 : ATA--CAGAACAAGG--A-TTTCCGCGTA-----TT--TT-ACT-GGG-----A-ACA---GA-AT----G-TTCATCCTACAACCC
gi|103302 : ATG--CCAGACAAGG--A-TTTCCACATA----TTT--TT-ACC-ATATTTT-T-ATG---AA-AC----T-TTCATCCTGCAACCC
gi|103303 : ATA--CCGAAAAAGA--A-CTTTAGCGTA----TTT--TA-ACC-GGG-----T-ACG---TA-TA----T-CTCATCCTACACTCC
gi|103305 : GGACAAGG--A-TTTCCGCATA----TGT--TT-ACC-AGA-----T-ACA---CA-TT----T-TTCAc
gi|103306 : CTGCGTA----ATT--TT-ACC-GGG-----T-ACG---CA-AT----T-TTCATCCTACACCTC
gi|103307 : TT--TT-ACT-GGG-----T-ACG---GA-AT----C-TTCATCCTACACCC