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lowQualScore                  :                  8  2 1  6  4           777 4    6666666   888     11111  4     00000     8  222222 4    4444 66     0   
consensus                     :            TAATCA-TCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACATACA
Reference ( gi|33023 )        :            TAATCA-TCCT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TT---GTTT--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACACACA
gi|33025                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-CGCTCACCAAA---A-TGAC--TTA--GTTT--AAAGC-----GC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACATACA
gi|33024                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--AAAGT-----GC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AATT----T--ATACATATA
gi|33030                      :            TAATCA-TCCT-AT-CT-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TTA--GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-TACT----T--ATACATACA
gi|33028                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TTA--GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-CACT----T--ATACATACA
gi|33029                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-GGCTTGCCAAA---A-TGAC--TTA--GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-TACT----T--ATACATACA
gi|33026                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-TGCTCACCAAA---A-TGAC--TAA--GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAC-AA------A-TACT----T--ATACATACA
gi|33027                      :            TAATCA-TCTT-AT-TC-TGCTCGCCAAA---T-TGAC--TA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACTA---T--ATATATATA
gi|33031                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TTA--GTTC--AAAGT-----GT-GAGGG-----TAAAG-AA------A-CACT----T--ATACATACA
gi|33032                      :            TAATTA--CTT-AT-CC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TTA--GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-TACT----T--ATACATACA
gi|33039                      :            TAATAA-T--T-AT-CT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CT---GTTC--AAAGT-----GC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AACT----T--AAACATACA
gi|33036                      : taatcatctttTAATCA-CCTT-AT-CC-TGCTTGCCAAA---A-TTAC--TA---ATTT--AAAGA-----GC-GAGGG-----GAAAT-AC------A-AACT----T--ATACATACA
gi|33046                      :            TAACCA-TCAT-AT-CC-TTCTCGCGAAA---A-TGAC--TT---GTTC--AAAGT-----GC-AAGGG-----TAAAC-AA------ATAACG----T--ATACATACA
gi|33037                      :            TAATCA-TCTT-AT-CT-TGCTCACCAAA---A-TGAC--CG---GTTC--AAAGC-----GT-AAGAG-----TAAAC-AA------A-TACT----T--ATACAT
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gi|33038                      :            TACTCG-TCTT-AT-CC-GGCTCGCCAAA---A-TAAC--TA---GTTC--AAAGC-----GC-ACGGG-----TAAAGAAA------A-AACT----T--ATACATACA
gi|33040                      :            TAATCA-TCTT-AT-CC-TGCATGTTAAA---A-TGAC--TG---GTTC--AAAGA-----GT-GAGGA-----TTAAT-AA------A-AATT----T--ATACATACA
gi|33033                      :            TAATCA-GCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-CA---GATC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-AACT----T--A
gi|33041                      :            TAATCA-GCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-TA---GATC--AAAAT-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-AACT----T--A
gi|33044                      :            TAAGCA-TCTG-TT-CA-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--
gi|33042                      :            TAAGCA-TCTG-TT-CA-TACTCGCCAAA---A-TGAC--TA---GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--
gi|33045                      :            TAATCA-GCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-CA---GATC--AAAGT-----GC-GAGGA-----TAAAG-AA------A-AACT----T--AT
gi|33055                      :            TAATCA-GCCT-AT-CT-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-CA---GATC--TAAGT-----GT-GAGGG-----TAAAG-AA------A-AACT----T--A
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gi|33052                      :            TAATCA-TCTTTGT-AT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--TA---GAGC--AAAGCT----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----TCCA-ACACACA
gi|33057                      :            TAATCA-GCCT-AA-CC-TGCTCGCCAAA---T-TGACA-CG---GATC--AAAGT-----TC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AACT----T--A
gi|33050                      :            TAATCA-GCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TAACA-CA---GATC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-AA
gi|33049                      :            TAATCG-TCTT-AT-CA-GGTT----AAA---A-TGAC--TA---GTTC--AAAGT-----GC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AATT----T--ATACA
gi|33053                      :            TAATCAATTGT--T-CA-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAAGT-----GCTAAGGG-----TAAAT-GA------A-AAC-----T--ATACAAACAttca
gi|33059                      :            TAACCA-GCTT-AT-CT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TT---GTTTC-AAAGC-----AA-GAGCG-----TAAA--GA------A-CACA----T--ATATA
gi|33051                      :            TAATCT-TCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-AGCC--TA---GAGC--TAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-CACT----T--A-ACAt
gi|33034                      :            TAATCT-TCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-AGCC--TA---GAGC--TAAGT-----GC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-CACT----T--A-ACAGACA
gi|33043                      :            TAATC--TTCT-GTTCC-TGCTCGCCAAA---A--AAC--CTA--GTGT--TAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----
gi|33054                      :            TAATCA-GCTC-AT-CC-TGCTCGTCAAA---A-TGACA-CA---GATC--AAAGT-----GC-GAAGG-----TAAAG-AA------A-AAAT----T--A
gi|33066                      :            TAAT-A-TTCT-AT-TCATGCTCGCCAAA------------T---GTTT--CAAGCAAGGTGC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--
gi|33058                      :            TAATCA-TCTTTGT-AT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--TA---GAGC--AAAGCT----GC-GAGGGCGCGGTGAAT-AA------A-AACT----T--TAACACACA
gi|33047                      :            TAATCT-TCTC-AA-CT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--TA---GAGC--AAAGCT----GA-GAGGG-----TAAAG-GA------A-AACT----T--
gi|33062                      :            TAGTTA-TCTT----CC-GGCTCACCAAG-----TGAC--TA---ATT----AAGT-----GC-TAGGG-----TAAAT-GA------A-AACT----T--ACAC
gi|33060                      :            TAATCA-TCTT-AT-TC-TGCTTGCAAAAATGA-TGAC--TA---GTTC--ATAGC-----AC-TAGGA-----TAAAgtcca
gi|33061                      :            TAATCC-TCTT-AT-CC-TGCGCGCGAAA---A-TGCC--TA---GAGC--AAACT-----GC-GAGGG-----TAATT-AA------A-CATT----T--acttgttcat
gi|33063                      :            TAATCA-TCGT-----T-TGTTT-TTAAA---A-TGAA--A----GTTC--AAAGC-----GC-AAGGA-----TAAAT-AA------A-AAAT----T--ATATATACA
gi|33070                      :             AACCA-TCCT-AT-CC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TAA--GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-TACT----C--ACACACACA
gi|33069                      :             AATCA-ACTT-AT-CA-CGCTTGCCAAA---A-TAAC--TA---GTTC--AAAGT-----GA-GAGGG-----TAAAC-AA------A-AACT----T--ATACATACA
gi|33071                      :             AATCA-TCTT-AT-CC-GGCTCGTCAAA---A-TGAA--TA---GCAA--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAATT-AA------A-AACTTAAAT--ATACATACA
gi|33073                      :             AAGCA-TCTG-TT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTT--AAACC-----GC-AAGGG-----TAAA--AA------A-AACT----T--
gi|33075                      :             AATCA-TCTG-CT-CC-TGCTCGCTAAA---A-AGCC--TA---GAGC--TAAGT-----GT-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--
gi|33074                      :             AACCA-ACTT-AT-CT-TGCTCACCAAA---A-AGCCAAGA---GCTT--A--GT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--
gi|33076                      :              ATAA-CCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C----------AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACG----T--ATACATACA
gi|33077                      :              ATCC-TCCC-A--CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--ATAGC-----GC-GAGCG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATATA
gi|33078                      :              ATCG-TCTT--T-CC-TGCTCGTCGAA---A-TACC--TA---AAGC--AAAGCT----GC-GAGGC-----CAAAT-AA------A-AACT----T--
gi|33079                      :                CA-TC----T-CC-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAACC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACG----T--AAAC
gi|33080                      :                 A-TCTT-AT-CC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TA---GATT--TAAGC-----GC-GAAGG-----TACAC-AA------A-CACT----T--ATACATACA
gi|33082                      :                    CTT-AT----TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---TTTC--AAAGC-----GC-GAGAG-----TTTAT-CA------A-AACT----T--A
gi|33084                      :                      T-AT-TG-TGCTTGCTAAA---A-TGAC--TG---GTTC--AAAGC-----GC-AAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACATACA
gi|33056                      :                      T-AC-CT-TGCTTGCCAAA---AATGAC--TA---GTTTC-AAAGC-----GT-GAGGG-----TAAAG-AA------A-CATT----A--ATACATACA
gi|33085                      :          taaccagctttaa-AT-TC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-ACCT----T--ATA
gi|33081                      :                       -AT-AC-TGCTTGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAATAAA------A-AACT----T--ACACaatata
gi|33086                      :                   tctg-AT-CC-TGTTCGCCTAA---A-TGAC--TA---GTTC--AAAAC-----AT-GAGGG-----GAGAC-AA------C-GACG----C--ATACAT
gi|33072                      :                         T-CC-TGCTCGCCAAA---A-TAAT--TA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGAG-----TAAAT-AAAGTCATA-AACA----T--ATATATACA
gi|33087                      :               aatgatttgtT-TC-TGCTTGCAAAA---T-TGAC--TA---GTTC--AAAGT-----GA-AAGGG-----TAAAC-AA------A-AACT----A--ACACACACA
gi|33064                      :                         T-CC-TGCTCGTCAAA---A---AC--CTTGAGCT----AAGT-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-TGCT----T--ATACATACA
gi|33088                      :              taattttctgtT-CT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC----------C--AGAGA-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-A
gi|33065                      :                         T-CC-TGCTCGCCAAA---A-TG----TT---ATATGCAATGT-----GC-GAGGG-----TGAAT-AA------A-AA
gi|33089                      :               taaccttctgt-CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--ATAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACAT
gi|33090                      :                          -CC-TGCTCGCCAAA---A-TGTC--CA---TTTC--AAAGC-----GC-GGGGA-----TAGAT-AA------A-AACT----T--AAAC
gi|33091                      :                          -CC-TGCTCGCAAAA---A-TGAC--AA---TTTC--AAAGC-----AA-AAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--AAAC
gi|33092                      :                            C-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TG---ATTC--AAATT-----GC-AAGGG-----TTAAT-AA------A-AACT----T--AT
gi|33093                      :                            C-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC---AATC-----GC-GAGGG-----TAAA--GA------A-AATT----T--ATACA
gi|33097                      :                            C-TGCACGCCAAA---A-TGAA--TT---GTTC--AAAGC-----GC-AAGGG-----TCAAT-At
gi|33094                      :                            C-TTCCCTCTGAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGAG-----TAAAT-AA------A-AACA----T--A
gi|33095                      :                            C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--CA---GTTC--ACAGC-----GC-GAGAG-----TAAaata
gi|33096                      :                            C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--CA---GTTC--ACAGC-----GC-GAAAG-----TAA
gi|33100                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--GAACC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AATT----T--ATACATACA
gi|33101                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--AAAGC-----GC-GAAGG-----TAAAT-AA------A-AAAT----T--ATATACATA
gi|33102                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TG---GTTC--TAAGA-----AC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACG----T--ATACATACAca
gi|33103                      :                             -TGTTCGCTAAA---A-TGAC--TG---GTTC--CAAGC-----GC-GAGGT-----TAAAT-AA------A-AACT----T---TACATACA
gi|33109                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTT--AAAGT-----GC-GACGG-----TAAAT-AA------G-AACT----T--
gi|33104                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAACC-----CC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--AAAC
gi|33111                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GATT--AAAGC-----GC-GACGG-----TAAAT-AA------G-AACT----T--
gi|33108                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--CA---GTTC--AAAGC-----G--GAGGG-----TAAAC--A------A-AATT----T--GTATACACA
gi|33107                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TGAA--CA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGAG-----TAAAT-AA------A-CACT----T--AAACtaca
gi|33106                      :                             -TGTTAGCCAAA---A-TAAC--TA---GTTC--AAAGC-----AT-AAGGG-----TAAAC-AA------A-AACT----T--ATACAT
gi|33117                      :                             -TGCTTGCCAAA---A-TGAC--AT---GTTT--ATAGT-----GC-GACGG-----TAAAT-AA------G-AACT----T--
gi|33083                      :                             -TGCTCGCCAAA---A-TAAC--CT---GTTC--AAAGC-----CC-AAGGG-----TAAAC-AC------A-AACT----T--
gi|33110                      :                         ttat-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--TA---GTTC--AAATC-----GC-GGTAG-----TACAT-AA------A-TACT----T--ATATATATAgacat
gi|33112                      :                             -TGCTCAACAAA---A-TGAA--TA---GTTC--AAAGC-----GA-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AGCT----T--
gi|33105                      :                             -TGTTCCACAAA---A-CGAC--TG---GTTC--AAAGC-----AC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AAAA----T--AAACACACA
gi|33115                      :                             -TGCTTGCCAAA---A-TGAT--CA---ATTT--AAAGC-----AC-AAGGA-----TTAAT-AA------A-AACA----C--ATACCCATA
gi|33113                      :                             -TGCTCACAAAA---A-TTAC--CA---GATC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-ATCT----T--Aca
gi|33114                      :                             -TGCTTGCCAAA---A-GGAC--CA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAGAT-
gi|33118                      :                             -TGCTCGTCAAA---A-TGCC--CA---GTTT--TAAGC-----GC-GAGAT-----TAAAT--A------A-AACT----T--
gi|33120                      :                               GCTCGCCAAA---A-TAAC--CT---GTTC--AAAGC-----GC-AAGGG-----TAAAC-AA------A-AACT----T--AAACACACA
gi|33119                      :                               GCTCGCCAAA---A-TGAC--TA---GGTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--A-ACA
gi|33121                      :                               GCTCAACAAA---A-TGAC--TA---GTTC--AAAAC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--aataca
gi|33123                      :                                CCCGCCAAA---A-TGAC--TT---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGA-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACACAC
gi|33124                      :                                CTCACCAAA---A-CCAC--TA-----TT--AAAGT-----GT-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--ATACATACA
gi|33122                      :                                CTCCCTGAC---A-TAAC--TTA--GTTC--AAAGT-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-TACT----T--ATACATACA
gi|33126                      :                                        A---A-TGACGATA---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAG-AA------A-AAAT----T--ATACATACA
gi|33128                      :                                                      ---GTTC--AAAGC-----GC-GAGGG-----TAAAT-AA------A-AACT----T--
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33116 ): TGCTCCCCACATGACTAGTTCAAAGCAAGAGCTAAACAAAAACGTATATATACA






Alignments
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lowQualScore                  :           999999999    9           777 4    333333 2 111  4      0  4   00000       8  222222 4    7777   6 88 88     
consensus                     : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
Reference ( family-295 )      : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
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gi|33049                      : TAATCGTCTT---------ATCA-GGTT----AAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATTCA
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gi|33058                      : TAATCATCTTT--------GTAT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--T---A-G---AG-CAAAGCTGC-GAGGGCGCGGTGAAT-AA------A-AACT----TTA-A--C--ACACA
gi|33059                      : TAACCAGCTT---------ATCT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---T-GT--TT-CAAAGC-AA-GAG-----CGTAAA--GA------A-CACA----TAT-A--T--AT
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gi|33062                      : TAGTTATCTT-----------CC-GGCTCACCAAG-----TGAC--T---A-A---TT---AAGT-GC-TAG-----GGTAAAT-GA------A-AACT----TAC-A--C--GTCCA
gi|33063                      : TAATCATCGT------------T-TGTTT-TTAAA---A-TGAA------A-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GATAAAT-AA------A-AAAT----TAT-A--T--ATACA
gi|33064                      : TAATTTTCTG---------TTCC-TGCTCGTCAAA---A---AC--CTTGA-G---CT---AAGT-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-TGCT----TAT-A--C--ATACA
gi|33065                      : TAACCTTCTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TG-T--T---ATA---TG-CAATGT-GC-GAG-----GGTGAAT-AA------A-AA
gi|33066                      : TAAT-ATTCT---------ATTCATGCTCGCCAAA-----TGTT--TCA-A-G------CAAGGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33069                      :  AATCAACTT---------ATCA-CGCTTGCCAAA---A-TAAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GA-GAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33070                      :  AACCATCCT---------ATCC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---AAG---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----CAC-A--C--ACACA
gi|33071                      :  AATCATCTT---------ATCC-GGCTCGTCAAA---A-TGAA--T---A-G---CA-AAAAGC-GC-GAG-----GGTAATT-AA------A-AACTTAAATAT-A--C--ATACA
gi|33072                      :  AATGATTTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TAAT--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AAAGTCATA-AACA----TAT-A--T--ATACA
gi|33073                      :  AAGCATCTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-TAAACC-GC-AAG-----GGTAAA--AA------A-AACT----
gi|33074                      :  AACCAACTT---------ATCT-TGCTCACCAAA---A-AGCC--A---A-GAGCTT----AGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33075                      :  AATCATCTG---------CTCC-TGCTCGCTAAA---A-AGCC--T---A-G---AG-CTAAGT-GT-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33076                      :   ATAACCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC---------------CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAT-A--C--ATACA
gi|33077                      :   ATCCTCCC---------A-CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CATAGC-GC-GAG-----CGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--T--A
gi|33078                      :   ATCGTCTT----------TCC-TGCTCGTCGAA---A-TACC--T---A-A---AG-CAAAGCTGC-GAG-----GCCAAAT-AA------A-AACT----
gi|33079                      :     CATCT------------CC-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAACC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAA-A--C--
gi|33080                      :      ATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---AT-TTAAGC-GC-GAA-----GGTACAC-AA------A-CACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33081                      :       TCTG---------ATAC-TGCTTGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAATAAA------A-AACT----TAC-A--C--
gi|33082                      :        CTT---------AT---TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-T---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTTTAT-CA------A-AACT----TA
gi|33083                      :         TT---------AT---TGCTCGCCAAA---A-TAAC--C---T-G---TT-CAAAGC-CC-AAG-----GGTAAAC-AC------A-AACT----TG--A--C--AT
gi|33084                      :          T---------ATTG-TGCTTGCTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33085                      :           ---------ATTC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-ACCT----TAT-A--A--ATATA
gi|33086                      :           ---------ATCC-TGTTCGCCTAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAAC-AT-GAG-----GGGAGAC-AA------C-GACG----CAT-A--C--ATA
gi|33087                      :                     TTC-TGCTTGCAAAA---T-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GA-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----AAC-A--C--ACACA
gi|33088                      :                     TCT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC---------------CAGAGA-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-A
gi|33089                      :                      CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CATAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATA
gi|33090                      :                      CC-TGCTCGCCAAA---A-TGTC--C---A-T---TT-CAAAGC-GC-GGG-----GATAGAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33091                      :                      CC-TGCTCGCAAAA---A-TGAC--A---A-T---TT-CAAAGC-AA-AAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33092                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-A---TT-CAAATT-GC-AAG-----GGTTAAT-AA------A-AACT----TAT-
gi|33093                      :                       C-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-C-AATC-GC-GAG-----GGTAAA--GA------A-AATT----TAT-A--C--AT
gi|33094                      :                       C-TTCCCTCTGAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AA------A-AAC------AT-A--A--ATA
gi|33095                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--C---A-G---TT-CACAGC-GC-GAG-----AGTAA
gi|33096                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--C---A-G---TT-CACAGC-GC-GAA-----AGTAA
gi|33097                      :                       C-TGCACGCCAAA---A-TGAA--T---T-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTCAAT-A
gi|33100                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CGAACC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATACA
gi|33101                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-GAA-----GGTAAAT-AA------A-AAATTA--TAT-A--C--ATACA
gi|33102                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CTAAGA-AC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAT-A--C--ATACA
gi|33103                      :                        -TGTTCGCTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CCAAGC-GC-GAG-----GTTAAAT-AA------A-AACT----T-T-A--C--ATACA
gi|33104                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAACC-CC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33105                      :                        -TGTTCCACAAA---A-CGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-AC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AAAA----TAA-A--C--ACACA
gi|33106                      :                        -TGTTAGCCAAA---A-TAAC--T---A-G---TT-CAAAGC-AT-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATA
gi|33107                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAA--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AA------A-CACT----TAA-A--C--
gi|33108                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-G--GAG-----GGTAAAC-AA------A-ATTTGTA-TAC-A--C--ATACA
gi|33109                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-TAAAGT-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33110                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAATC-GC-GGT-----AGTACAT-AA------A-TACT----TAT-A--T--ATATA
gi|33111                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---AT-TAAAGC-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33112                      :                        -TGCTCAACAAA---A-TGAA--T---A-G---TT-CAAAGC-GA-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AGCT----
gi|33113                      :                        -TGCTCACAAAA---A-TTAC--C---A-G---AT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-ATCT----TA
gi|33114                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-GGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAGAT-
gi|33115                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-TGAT--C---A-A---TT-TAAAGC-AC-AAG-----GATTAAT-AA------A-AACA----CAT-ACCC--ATACA
gi|33116                      :                        -TGCTCCCCACA-----TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-AA-GA------GCTAAAC-AA------A-AACG----TAT-A--T--ATACA
gi|33117                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-TGAC--A---T-G---TT-TATAGT-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33118                      :                        -TGCTCGTCAAA---A-TGCC--C---A-G---TT-TTAAGC-GC-GAG-----ATTAAAT--A------A-AACT----
gi|33119                      :                          GCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---GT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TA--A--CAAATACA
gi|33120                      :                          GCTCGCCAAA---A-TAAC--C---T-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAA-A--C--ACACA
gi|33121                      :                          GCTCAACAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAAC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33122                      :                           CTCCCTGAC---A-TAAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33123                      :                           CCCGCCAAA---A-TGAC--T---T-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ACAC
gi|33124                      :                           CTCACCAAA---A-CCAC--T---A------T-TAAAGT-GT-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33126                      :                                   A---A-TGACGAT---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AAAT----TAT-A--C--ATACA
gi|33128                      :                                                ---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----





Alignments
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lowQualScore                  :           .........    .           ... .    ...... . ...  .      .  .   .....       .  ...... .    ....   . .. ..     
lowQualScore                  :           999999999    9           777 4    333333 2 111  4      0  4   00000       8  222222 4    7777   6 88 88     
consensus                     : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
Reference ( family-295 )      : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33023                      : TAATCATCCT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---T-G---TT-TAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ACACA
gi|33024                      : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATATA
gi|33025                      : TAATCATCTT---------ATCC-CGCTCACCAAA---A-TGAC--TT--A-G---TT-TAAAGC-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33026                      : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCACCAAA---A-TGAC--T---AAG---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAC-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33027                      : TAATCATCTT---------ATTC-TGCTCGCCAAA---T-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACTA---TAT-A--T--ATATA
gi|33028                      : TAATCATCTT---------ATCC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-CACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33029                      : TAATCATCTT---------ATCC-GGCTTGCCAAA---A-TGAC--TT--A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33030                      : TAATCATCCT---------ATCT-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33031                      : TAATCATCTT---------ATCC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GT-GAG-----GGTAAAG-AA------A-CACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33032                      : TAATTA-CTT---------ATCC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33033                      : TAATCAGCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-C---A-G---AT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AACT----TA
gi|33034                      : TAATCTTCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-AGCC--T---A-G---AG-CTAAGT-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-CACT----TA--A--C--AGACA
gi|33035                      : TAGTCATCTT---------ATCC-TGCTCACCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAT-----GGTAAAT-AA------A-CATG----CAT-A--C--ATA
gi|33036                      : TAATCACCTT---------ATCC-TGCTTGCCAAA---A-TTAC--T---A-A---TT-TAAAGA-GC-GAG-----GGGAAAT-AC------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33037                      : TAATCATCTT---------ATCT-TGCTCACCAAA---A-TGAC--C---G-G---TT-CAAAGC-GT-AAG-----AGTAAAC-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATA
gi|33038                      : TACTCGTCTT---------ATCC-GGCTCGCCAAA---A-TAAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-ACG-----GGTAAAGAAA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33039                      : TAATCATCTTTTAATAATTATCT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---T-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--ATACA
gi|33040                      : TAATCATCTT---------ATCC-TGCATGTTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGA-GT-GAG-----GATTAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATACA
gi|33041                      : TAATCAGCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-T---A-G---AT-CAAAAT-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AACT----TA
gi|33042                      : TAAGCATCTG---------TTCA-TACTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33043                      : TAATCTTCTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-AACC--T---A-G---TG-TTAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33044                      : TAAGCATCTG---------TTCA-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33045                      : TAATCAGCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-C---A-G---AT-CAAAGT-GC-GAG-----GATAAAG-AA------A-AACT----TAT-
gi|33046                      : TAACCATCAT---------ATCC-TTCTCGCGAAA---A-TGAC--T---T-G---TT-CAAAGT-GC-AAG-----GGTAAAC-AA------ATAACG----TAT-A--C--ATACA
gi|33047                      : TAATCTTCTC---------AACT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--T---A-G---AG-CAAAGCTGA-GAG-----GGTAAAG-GA------A-AACT----
gi|33048                      : TAATCATCTTT--------GTAT-TACTCGCCAAA---A-TGCC--T---A-G---TG-CAAAGCTGC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33049                      : TAATCGTCTT---------ATCA-GGTT----AAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATTCA
gi|33050                      : TAATCAGCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TAACA-C---A-G---AT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AA
gi|33051                      : TAATCTTCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-AGCC--T---A-G---AG-CTAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-CACT----TA--A--C--A
gi|33052                      : TAATCATCTTT--------GTAT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--T---A-G---AG-CAAAGCTGC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TCCAA--C--ACACA
gi|33053                      : TAATCA-ATT---------GTTCATGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGT-GCTAAG-----GGTAAAT-GA------A-AAC-----TAT-A--C--AAACA
gi|33054                      : TAATCAGCTC---------ATCC-TGCTCGTCAAA---A-TGACA-C---A-G---AT-CAAAGT-GC-GAA-----GGTAAAG-AA------A-AAAT----TA
gi|33055                      : TAATCAGCCT---------ATCT-TGCTCGCCAAA---A-TGACA-C---A-G---AT-CTAAGT-GT-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AACT----TA
gi|33056                      : TAACCAGCTTTAAT-----ACCT-TGCTTGCCAAA---AATGAC--T---A-G---TTTCAAAGC-GT-GAG-----GGTAAAG-AA------A-CATT----AAT-A--C--ATACA
gi|33057                      : TAATCAGCCT---------AACC-TGCTCGCCAAA---T-TGACA-C---G-G---AT-CAAAGT-TC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AACT----TA
gi|33058                      : TAATCATCTTT--------GTAT-TGCTCGCCAAA---A-TGCC--T---A-G---AG-CAAAGCTGC-GAGGGCGCGGTGAAT-AA------A-AACT----TTA-A--C--ACACA
gi|33059                      : TAACCAGCTT---------ATCT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---T-GT--TT-CAAAGC-AA-GAG-----CGTAAA--GA------A-CACA----TAT-A--T--AT
gi|33060                      : TAATCATCTT---------ATTC-TGCTTGCAAAAATGA-TGAC--T---A-G---TT-CATAGC-AC-TAG-----GAT------A------A-AACT----TGT-T--C--AT
gi|33061                      : TAATCCTCTT---------ATCC-TGCGCGCGAAA---A-TGCC--T---A-G---AG-CAAACT-GC-GAG-----GGTAATT-AA------A-CATT----
gi|33062                      : TAGTTATCTT-----------CC-GGCTCACCAAG-----TGAC--T---A-A---TT---AAGT-GC-TAG-----GGTAAAT-GA------A-AACT----TAC-A--C--GTCCA
gi|33063                      : TAATCATCGT------------T-TGTTT-TTAAA---A-TGAA------A-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GATAAAT-AA------A-AAAT----TAT-A--T--ATACA
gi|33064                      : TAATTTTCTG---------TTCC-TGCTCGTCAAA---A---AC--CTTGA-G---CT---AAGT-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-TGCT----TAT-A--C--ATACA
gi|33065                      : TAACCTTCTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TG-T--T---ATA---TG-CAATGT-GC-GAG-----GGTGAAT-AA------A-AA
gi|33066                      : TAAT-ATTCT---------ATTCATGCTCGCCAAA-----TGTT--TCA-A-G------CAAGGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33069                      :  AATCAACTT---------ATCA-CGCTTGCCAAA---A-TAAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GA-GAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33070                      :  AACCATCCT---------ATCC-GGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---AAG---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----CAC-A--C--ACACA
gi|33071                      :  AATCATCTT---------ATCC-GGCTCGTCAAA---A-TGAA--T---A-G---CA-AAAAGC-GC-GAG-----GGTAATT-AA------A-AACTTAAATAT-A--C--ATACA
gi|33072                      :  AATGATTTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TAAT--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AAAGTCATA-AACA----TAT-A--T--ATACA
gi|33073                      :  AAGCATCTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-TAAACC-GC-AAG-----GGTAAA--AA------A-AACT----
gi|33074                      :  AACCAACTT---------ATCT-TGCTCACCAAA---A-AGCC--A---A-GAGCTT----AGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33075                      :  AATCATCTG---------CTCC-TGCTCGCTAAA---A-AGCC--T---A-G---AG-CTAAGT-GT-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33076                      :   ATAACCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC---------------CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAT-A--C--ATACA
gi|33077                      :   ATCCTCCC---------A-CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CATAGC-GC-GAG-----CGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--T--A
gi|33078                      :   ATCGTCTT----------TCC-TGCTCGTCGAA---A-TACC--T---A-A---AG-CAAAGCTGC-GAG-----GCCAAAT-AA------A-AACT----
gi|33079                      :     CATCT------------CC-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAACC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAA-A--C--
gi|33080                      :      ATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---AT-TTAAGC-GC-GAA-----GGTACAC-AA------A-CACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33081                      :       TCTG---------ATAC-TGCTTGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAATAAA------A-AACT----TAC-A--C--
gi|33082                      :        CTT---------AT---TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-T---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTTTAT-CA------A-AACT----TA
gi|33083                      :         TT---------AT---TGCTCGCCAAA---A-TAAC--C---T-G---TT-CAAAGC-CC-AAG-----GGTAAAC-AC------A-AACT----TG--A--C--AT
gi|33084                      :          T---------ATTG-TGCTTGCTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33085                      :           ---------ATTC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-ACCT----TAT-A--A--ATATA
gi|33086                      :           ---------ATCC-TGTTCGCCTAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAAC-AT-GAG-----GGGAGAC-AA------C-GACG----CAT-A--C--ATA
gi|33087                      :                     TTC-TGCTTGCAAAA---T-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGT-GA-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----AAC-A--C--ACACA
gi|33088                      :                     TCT-TGCTCGCCAAA---A-TGAC---------------CAGAGA-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-A
gi|33089                      :                      CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CATAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATA
gi|33090                      :                      CC-TGCTCGCCAAA---A-TGTC--C---A-T---TT-CAAAGC-GC-GGG-----GATAGAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33091                      :                      CC-TGCTCGCAAAA---A-TGAC--A---A-T---TT-CAAAGC-AA-AAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33092                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-A---TT-CAAATT-GC-AAG-----GGTTAAT-AA------A-AACT----TAT-
gi|33093                      :                       C-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-C-AATC-GC-GAG-----GGTAAA--GA------A-AATT----TAT-A--C--AT
gi|33094                      :                       C-TTCCCTCTGAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AA------A-AAC------AT-A--A--ATA
gi|33095                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--C---A-G---TT-CACAGC-GC-GAG-----AGTAA
gi|33096                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--C---A-G---TT-CACAGC-GC-GAA-----AGTAA
gi|33097                      :                       C-TGCACGCCAAA---A-TGAA--T---T-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTCAAT-A
gi|33100                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CGAACC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATACA
gi|33101                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-GAA-----GGTAAAT-AA------A-AAATTA--TAT-A--C--ATACA
gi|33102                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CTAAGA-AC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAT-A--C--ATACA
gi|33103                      :                        -TGTTCGCTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CCAAGC-GC-GAG-----GTTAAAT-AA------A-AACT----T-T-A--C--ATACA
gi|33104                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAACC-CC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33105                      :                        -TGTTCCACAAA---A-CGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-AC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AAAA----TAA-A--C--ACACA
gi|33106                      :                        -TGTTAGCCAAA---A-TAAC--T---A-G---TT-CAAAGC-AT-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATA
gi|33107                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAA--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AA------A-CACT----TAA-A--C--
gi|33108                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-G--GAG-----GGTAAAC-AA------A-ATTTGTA-TAC-A--C--ATACA
gi|33109                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-TAAAGT-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33110                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAATC-GC-GGT-----AGTACAT-AA------A-TACT----TAT-A--T--ATATA
gi|33111                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---AT-TAAAGC-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33112                      :                        -TGCTCAACAAA---A-TGAA--T---A-G---TT-CAAAGC-GA-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AGCT----
gi|33113                      :                        -TGCTCACAAAA---A-TTAC--C---A-G---AT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-ATCT----TA
gi|33114                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-GGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAGAT-
gi|33115                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-TGAT--C---A-A---TT-TAAAGC-AC-AAG-----GATTAAT-AA------A-AACA----CAT-ACCC--ATACA
gi|33116                      :                        -TGCTCCCCACA-----TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-AA-GA------GCTAAAC-AA------A-AACG----TAT-A--T--ATACA
gi|33117                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-TGAC--A---T-G---TT-TATAGT-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33118                      :                        -TGCTCGTCAAA---A-TGCC--C---A-G---TT-TTAAGC-GC-GAG-----ATTAAAT--A------A-AACT----
gi|33119                      :                          GCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---GT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TA--A--CAAATACA
gi|33120                      :                          GCTCGCCAAA---A-TAAC--C---T-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAA-A--C--ACACA
gi|33121                      :                          GCTCAACAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAAC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33122                      :                           CTCCCTGAC---A-TAAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33123                      :                           CCCGCCAAA---A-TGAC--T---T-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ACAC
gi|33124                      :                           CTCACCAAA---A-CCAC--T---A------T-TAAAGT-GT-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33126                      :                                   A---A-TGACGAT---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AAAT----TAT-A--C--ATACA
gi|33128                      :                                                ---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----


blockSeqs                     :           TTAATAATT                         CTTG   A AGC         T                     AGTCAT      TAAA
blockSeqs                     :           TAAT                              TCA    T T           T                     .           GTA 
blockSeqs                     :           T                                 GAT    A .           T                     .           TA  
blockSeqs                     :           T                                 TT     . .           T                     .           A   
blockSeqs                     :           T                                 TT     . .           T                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 TT     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 TT     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 TT     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 TT     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AC     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AT     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AC     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AC     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AC     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AC     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 AC     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 TT     . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 A      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :           .                                 T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             A      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             A      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             C      . .           .                     .           .   
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .               
blockSeqs                     :                                             T      . .           .                     .               
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Reference ( family-295 )      : TAATCATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
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gi|33072                      :  AATGATTTG---------TTCC-TGCTCGCCAAA---A-TAAT--T---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AAAGTCATA-AACA----TAT-A--T--ATACA
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gi|33074                      :  AACCAACTT---------ATCT-TGCTCACCAAA---A-AGCC--A---A-GAGCTT----AGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33075                      :  AATCATCTG---------CTCC-TGCTCGCTAAA---A-AGCC--T---A-G---AG-CTAAGT-GT-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
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gi|33077                      :   ATCCTCCC---------A-CC-TGCCCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CATAGC-GC-GAG-----CGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--T--A
gi|33078                      :   ATCGTCTT----------TCC-TGCTCGTCGAA---A-TACC--T---A-A---AG-CAAAGCTGC-GAG-----GCCAAAT-AA------A-AACT----
gi|33079                      :     CATCT------------CC-TGCTGGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAACC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAA-A--C--
gi|33080                      :      ATCTT---------ATCC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---AT-TTAAGC-GC-GAA-----GGTACAC-AA------A-CACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33081                      :       TCTG---------ATAC-TGCTTGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAATAAA------A-AACT----TAC-A--C--
gi|33082                      :        CTT---------AT---TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-T---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTTTAT-CA------A-AACT----TA
gi|33083                      :         TT---------AT---TGCTCGCCAAA---A-TAAC--C---T-G---TT-CAAAGC-CC-AAG-----GGTAAAC-AC------A-AACT----TG--A--C--AT
gi|33084                      :          T---------ATTG-TGCTTGCTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33085                      :           ---------ATTC-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-ACCT----TAT-A--A--ATATA
gi|33086                      :           ---------ATCC-TGTTCGCCTAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAAC-AT-GAG-----GGGAGAC-AA------C-GACG----CAT-A--C--ATA
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gi|33092                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-A---TT-CAAATT-GC-AAG-----GGTTAAT-AA------A-AACT----TAT-
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gi|33094                      :                       C-TTCCCTCTGAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AA------A-AAC------AT-A--A--ATA
gi|33095                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--C---A-G---TT-CACAGC-GC-GAG-----AGTAA
gi|33096                      :                       C-TGCTCGCCAAA---A-TGAT--C---A-G---TT-CACAGC-GC-GAA-----AGTAA
gi|33097                      :                       C-TGCACGCCAAA---A-TGAA--T---T-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTCAAT-A
gi|33100                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CGAACC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AATT----TAT-A--C--ATACA
gi|33101                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-GC-GAA-----GGTAAAT-AA------A-AAATTA--TAT-A--C--ATACA
gi|33102                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CTAAGA-AC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACG----TAT-A--C--ATACA
gi|33103                      :                        -TGTTCGCTAAA---A-TGAC--T---G-G---TT-CCAAGC-GC-GAG-----GTTAAAT-AA------A-AACT----T-T-A--C--ATACA
gi|33104                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAACC-CC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAA-A--C--
gi|33105                      :                        -TGTTCCACAAA---A-CGAC--T---G-G---TT-CAAAGC-AC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AAAA----TAA-A--C--ACACA
gi|33106                      :                        -TGTTAGCCAAA---A-TAAC--T---A-G---TT-CAAAGC-AT-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATA
gi|33107                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAA--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----AGTAAAT-AA------A-CACT----TAA-A--C--
gi|33108                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-G--GAG-----GGTAAAC-AA------A-ATTTGTA-TAC-A--C--ATACA
gi|33109                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---TT-TAAAGT-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33110                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAATC-GC-GGT-----AGTACAT-AA------A-TACT----TAT-A--T--ATATA
gi|33111                      :                        -TGCTCGCCAAA---A-TGAC--C---A-G---AT-TAAAGC-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33112                      :                        -TGCTCAACAAA---A-TGAA--T---A-G---TT-CAAAGC-GA-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AGCT----
gi|33113                      :                        -TGCTCACAAAA---A-TTAC--C---A-G---AT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-ATCT----TA
gi|33114                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-GGAC--C---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAGAT-
gi|33115                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-TGAT--C---A-A---TT-TAAAGC-AC-AAG-----GATTAAT-AA------A-AACA----CAT-ACCC--ATACA
gi|33116                      :                        -TGCTCCCCACA-----TGAC--T---A-G---TT-CAAAGC-AA-GA------GCTAAAC-AA------A-AACG----TAT-A--T--ATACA
gi|33117                      :                        -TGCTTGCCAAA---A-TGAC--A---T-G---TT-TATAGT-GC-GAC-----GGTAAAT-AA------G-AACT----
gi|33118                      :                        -TGCTCGTCAAA---A-TGCC--C---A-G---TT-TTAAGC-GC-GAG-----ATTAAAT--A------A-AACT----
gi|33119                      :                          GCTCGCCAAA---A-TGAC--T---A-G---GT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TA--A--CAAATACA
gi|33120                      :                          GCTCGCCAAA---A-TAAC--C---T-G---TT-CAAAGC-GC-AAG-----GGTAAAC-AA------A-AACT----TAA-A--C--ACACA
gi|33121                      :                          GCTCAACAAA---A-TGAC--T---A-G---TT-CAAAAC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----
gi|33122                      :                           CTCCCTGAC---A-TAAC--TT--A-G---TT-CAAAGT-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-TACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33123                      :                           CCCGCCAAA---A-TGAC--T---T-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GATAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ACAC
gi|33124                      :                           CTCACCAAA---A-CCAC--T---A------T-TAAAGT-GT-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----TAT-A--C--ATACA
gi|33126                      :                                   A---A-TGACGAT---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAG-AA------A-AAAT----TAT-A--C--ATACA
gi|33128                      :                                                ---A-G---TT-CAAAGC-GC-GAG-----GGTAAAT-AA------A-AACT----