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gi|25919 : -------AGTGAAATAACATGTGTCATAATAATGT-TTGTTTGA----------------C--TGTCAAAGTGACGTCA-TCGGACAT--TGG-CA-----CAAG-----------G-------TG----TTA--GT-------G---A--A---------AG----G-------GAC----A----G--------T----GTGTT-----CATTCT-GTACA---TAAATTTAGGCA---T----------------------------------------------AA------CTCTC--TTTACGGATTGTAT--CAATTTAATAG------------TAA-T-TC-T--TTCTTTTTT-TT--AAG-AAATTAGTATACTGAAAATA--AACATTT-CAGAAGACAACTAGTTACAAACGAACACTAA---C-CTTT-A-A-A-TATTA--T----TATGTTG-TT-G-TT-T------------TTT---------------CGTT-TGTTA-T--------CTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCT--GTGGTAATTTGTGACG-TA---------ATCACTTGCATATCGTCATTAGATCAAAAGTGTAAC-G-TCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCG-AC--CGTCCA-AACT-AGTA-ATTTTG-CAAGTGTTACAATAA-GAAA--ACATTAGAA--A-----GGGGATTTTAGCCT-CTT------TT----TTTTG-ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCAAATTGAAATTTTATGCATGGTGGT-GT---AT--ATGACAATT-AAATTTTATGCTCTGTGGGT
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gi|25873 : CTCATTCTTACCCCAGCGTCTGAAAAAAT-CATGG-AAAAA----AT--CAGATATTTCTTAGCGGTCATACAAA--A---A--C--ATAAAT----------------------GGACTG-TGAAAT--------------T--GTCTT-T--G-----AG-------C-----------A-----------T---------C------A------A--TA--A--CCG--GAT--TGTTT-GCCAT-C-GGGTGT----GCGAAATGAGGTCAA--ATTAGATTAAACCTT-TATCGATA-GT-A-G--GG-------AGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCA----------------C--TGTCAGAGTGACGTCATCGGACAT--TGG-CA-----CAAG-----------G-------CGTTAAGG---AA-------------AG----G-------GA-CA----G--------CGTGTT-----CATTCTGT-----GCATAAATTTAGGCA---TG----TGT-------A------G-------------TTATAC--ATAA------CTCTC--TTTATGGATTGTAT--CAATTTAATAG------------TAA-T-TCTT--TT------T-TT--AAGAAATTAGTATGTTGAAAATA--AACATTT-TAGAAGACAACTAGTTACAAACAAACACTAA---C-CTTT-A-A-T-TATTATTATG------TT---GTTGG-------TTT------------TT-TTTTTCGTT-TGTTTT-CTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCG---GAGGTAAATTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAGATCAAAAGTGTAAC-G-TCGGCGTACTTCAAAGAAAGTA-GCA-AT--C
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gi|25866 : CTCATTCTTACCCCAGTGTCTGAAAAAAT-CATGG-CGAAA----AG--CAGATGTTTCTTAACGGTCGTAC-AAAA-AC--ATAAATTG--------------------GAC-TG-TGAAA--------T---------TGTCTTTGAG------C-----------A-----------T-----CC--A---------TA--A--CCG--GAT--TGTTT-GCCAT-C-GGGTGT----GCGAAATGAGGTCAA--ATTAGATTAAACCTT-TATCGATAG-T-A-G--GG-------AGT-AAATAACATGTGTCATAATACTGTTTGTTTCA----------------C--TGTCAGAGTGACGTCATCGGACAT--TGG-CA-----CAAG-----------G-----------------C----GTTA----ATG--AA-------------AG----G-------GA-CA----G--------T--GTGTT-----CATTCTGT-----GCATAAATTTAGGCA---TG----TGTA------G------C-----------AT------AA------CTCTC--TTTACGGATCTTAT--CAATTTAATAG------------TAA-T-TA-T--TT------T-TT--AAGAAATTAGTTTACTGAAAATA--AACAATT-TAGAAGACAAACAGTTACAAACAAACACTAA---C-CTTT-A-A-T-TATAATTATG------TT---GT--G-------TTT------------TT-TTTCT-CGTT-TGTTAT-CTATAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCT---GAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAGATC-AAAGTGTAAC-G-TCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCA-AC--CGTCCA-GACTGGTA-ATTTTG-GAAGCGTTACAGTAA-GAAA--ACATTAGAA--A-----GGGGATTTTAGCCT-C-T------TTTTTATTTTT-ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTAT---AT--ATCACAATTAAATTTTATGCTCTTTGGGTAAAAAAAATAAGTGCCGTCCGA-----CC-C---CCCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTCA
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gi|25878 : AAAAAAT-CA-GT-C------------CAGATATTTTCTATCGGTCGTAT-AAAA-TCTCATAATTTGCTCTT--ACCATGCCATACTGACCTG-TGAAAT--------A--------CGCCTTGCGG------CAATATCATTTGA------------CC--CAA-T---------A--A--TCC--AAT--TGTTTTGTCAC-C-TGCTGT----GCAAAATGATGTCAA--TTTTGACTTAACCAT-TAACAATAT-T-A-G--GG-------GG
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gi|25882 : --CAGATATTTTCTATCGG--------------TCATAAATTGCTCTT--ACCATGCCATACTGACCTG-CGAAAT--------A--------CGCCTTGCGGCAATATCATTTGACC--CAATAATCCGTT--TGTTTTGTCAC-C-TGCTGT----GCGAAATGATGTCAA--TTTCGACTAAACCAT-TGACGGTAT-T-A-G--GG-------
gi|25883 : TTTGATC--CAA-AACCTGGT--TGTTT-GTCAT-C-TGGTGT----GCGAAATTGGGTCAA--ATTAGGCTAAACCAT-TACTGATAG-T-A-G--GG-------A
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gi|25948 : --AA-------------NN----N-------NN-NN----N--------N--NTGTT-----CATTCTGT-----ACATAAATTAAATCA---TG----TGTA------G------TTATAAAT------AT------AA------CTCTA--TATACGGATTGTAT--CAGTTTTATAG------------TAA-T-TC-TGATT------T-TT--AAC---------------AAATA--AACATTT-TAGAAGACAATCAGTTACAAACAAACACTGA---C-CTT------T-TATAACT---------TT----------------TT-T------------TTTTT
gi|25949 : aatgcgtCATAAATTTAGTCA---TG----TGTA------G------T------T------AT------AAATATACCTCTT--TTTACTGATTGTATAGTAATTTA-TAG------------TAA-T-TC-TA-TT------T-TT--------------TAC---AAATA--AACATTT-TAGAAGACAACCCGTTACAAACAAACACTGA---C-CTTT-T-A-T-AACTTTTAT--------T-----T--G-------TT-T------------TTTTT----GTT-TGTTATTCTATAATGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCT---TTGGAAAACTGTGACATAATCACTTGCTCATCGGCATTACATCAAAAGTGTTAT-G-TTGGCGTTCTTCAt
gi|25950 : ATTGTAT--CAATTTAATAG------------TAA-T-TC-T--TT------T-TTTAAAGAAATTTGTATAGTGAAAATA--AACATTT-TAGAAGACAACTAGTTACAAACAAACACTAA---G-CTTT-A-A-T-TATTATTATCATTATTTT---G-TT-G-------TT-G------------TTTTGTT-CGTT-TGTTAT-CTGAAGTGCCCCTTTATTTAATTCCCAACCT---GTGGTAAAGTGTGACGTATTCACTTGCATTTCGGCATTAGATCAAAAGTGTAAC-A-TCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCA-AC--CGTTCA-GACTAATA-ATTTTG-CAAGTACTTCAAT
gi|25951 : GAAAATGTTATTATTT-TA-ACCACACCCAGTTTCAAACAAACAATTA---C-CTTT-A-A-T-TATT------------TT---C-T--A-------TT-TCAATATAAAAAATCTTTGT-TGTAATCTTAA-CTATAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCAAACT---GA------------CG----CACATG--TATCGGCAT-ACATCAAAAGAGTTTT-GGTCGGCGTACTTCAAAGCACGTGGGCACGCTACATCGA-GACT-GAA-GTTTTGCAAAG---TATAAAAG-GAAATTACAATACAA--
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gi|25954 : GCGTTCTTCAAAGAAAGTAGGCA-AA--CA-CCATGGCTAGTA-ATTCTGCAAAGTGTTACAATAA-GAGA--AAAGAATAA--A-----GGGGATTTAAACCTACTT------T-----TTTTT-ATTTAGTGCATGGTGGTAATTTATC-AATTAAAATTT
gi|25955 : AGAAAGTAGGCA-AC--CGTTCA-GACTAGTA-ATTTTG-CAAGCATTACAATGA-GAAA--ACATTAGAA--A-----GGGGATTTTAGCCT-TTT------TTT-------T-ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCGAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTAT---AT--ATCTCAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGTAAAAAAAATAAGTGCCGTCCGA-----CC-C---CCCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
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gi|25965 : TGCCGTCCGA----CCC-C----CCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
gi|25967 : TACCGTCCGA----CCC-C---TCCAA-ACATTTAATTCTGGAGAAGCCCT
gi|25968 : TGCCGTCCGA----CCC-C----CCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCCCT
gi|25969 : TGCCGTCCGA----CCC-CCCCCCCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCC
blockSeqs : T AT CG ATATCG TC ATCTC T TA A C CATAAATTA A AT TC T CAGG G TT A T TG A G GC AAGTTAC G T TCAATGATGCAATAAA AA T T GA G AAAAT TTCGAATCAAA TCAGAAATAAATTGTGTC T AATT TT TTGTGTTGGAGTA TTAT AGTTATT T TAAA ACATAAAT AT ATAGA GAGCA ACA CATC TTTTAG GCCTAGTTATAAACATAA TTG CG AG AGGAGAAGTATT C CT GA CTTTTT TA G AAG TT A CCC A T C C G TAT ATTATT TCAATAAAAAAAA G CAATATAAAAAA C T A T TTG G G C TA T T CA C TT TT ACATC A T TTTTTA G T TTG TA CCCCC A CCCC
blockSeqs : . AT CG AA . TCTC C . A C AGTGAAATA A AT . T . G . A T TG A G . T G T ATGATGAAGGAAA . T G . . . . AATATTGT T . . TTGTGTCGG TTAT . . TAAA . . . . . TATT . TTATAAACATAA C CG AG . C C A TG T G TAG . . . . . . . . TAA . GTTGG . . C . . T . . . C TA . . CA . TT . . . T . . T . G CCCC . CC
blockSeqs : . AC CG AA . TCTT C . A C A A AT . T . G . A T G . G . . . T AGAAA . T G . . . . TCAAA T . . TTGTGTCGG TTAT . . TAAA . . . . . . . TTGTAAATATAT C CG . . . C A G . G TAG . . . . . . . . TAA . GTTG . . C . . T . . . . . . . CA . . . . . T . . T . . CC . C
blockSeqs : . AT CG AA . TCTC C . A A A A AT . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC T . . TTGTGTCGG TTAT . . TAAA . . . . . . . TTATAAATATAA C CT . . . C A G . G TAG . . . . . . . . AAT . GTTG . . C . . . . . . . . . . CA . . . . . T . . T . . C . C
blockSeqs : . AT CG AA . TCTC C . T C A A AT . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC T . . TTGTGTCGG TTAT . . TAAA . . . . . . . TTATAAATATAA C CT . . . A A G . G TAG . . . . . . . . TAT . GTTG . . C . . . . . . . . . . CA . . . . . T . . T . . C . C
blockSeqs : . AC CG AA . TCTC T . A C A A AT . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC T . . TTGTATCGG . . . TAAA . . . . . . . TTATTAATATAA C CG . . . C . . . G TAG . . . . . . . . TAA . GTTG . . T . . . . . . . . . . G . . . . . T . . T . . C . C
blockSeqs : . AC CG AA . TCTC T . A A A A AT . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC T . . TTGTGT . . . TAAA . . . . . . . TTGTAAATATAT C CG . . . C . . . G TAG . . . . . . . . TAA . GTG . . C . . . . . . . . . . G . . . . . T . . T . . C . C
blockSeqs : . AT CG AA . TATC C . A C A A AT . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC T . . . . . . TAA . . . . . . . TTGTAAATATAT C GG . . . C . . . G AAG . . . . . . . . TAT . GTG . . C . . . . . . . . . . G . . . . . T . . T . . C . C
blockSeqs : . AT GG AA . TCTC C . A C A A AT . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC T . . . . . . . . . . . . . . TTGTAAATATAT C CG . . . C . . . G TAG . . . . . . . . TAA . GTG . . C . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . C . C
blockSeqs : . AT AA AA . TCTC C . A C A A . . T . G . A T G . G . . . T . . T C . . . . TC T . . . . . . . . . . . . . . TTGTAAATATAT C TG . . . C . . . G TAG . . . . . . . . TAT . GTG . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . C . C
blockSeqs : . AT GG AA . TCTC C . A C A A . . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . TC A . . . . . . . . . . . . . . TTGTAAATATAT C TG . . . C . . . G TAG . . . . . . . . TAT . GTG . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . C . C
blockSeqs : . AT TC AG . TCTC C . A C A A . . T . G . A T G . G . . . T . . T G . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . TTGTAAATATAT C TA . . . C . . . T TGC . . . . . . . . TTT . GTG . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . C . C
blockSeqs : . T TC . . TCTC C . A C A A . . T . T . T A G . G . . . C . . T G . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . TTGTAAAAATAT C TG . . . C . . . G TAG . . . . . . . . AAC . GTG . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . G . . C . C
blockSeqs : . A TC . . TTTC C . A C A A . . T . T . T A G . G . . . T . . T G . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . TTATAAATATAA C TA . . . C . . . C TAG . . . . . . . . AAA . GTG . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . C . C
blockSeqs : . . TC . . TCTC C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . T . . T A . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . TTATAAATATAC C TG . . . C . . . C GCC . . . . . . . . TAA . GTG . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . C . T
blockSeqs : . . TA . . TCTC C . A C A A . . C . T . T A T . . . . . T . . T G . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . TTATACATAA C TG . . . T . . . C ACT . . . . . . . . AAC . TTA . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . C . .
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blockSeqs : . TCTC C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . T G . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . TTATTAATAA C TA . . . A . . . C AAC . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TCTC C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . T G . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . TTATAAATAA C TA . . . C . . . C TGT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TCTC C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . T G . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . TTATTAATAA C TA . . . T . . . C TGT . . . . . .
blockSeqs : . TCTC C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . T C . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . ATATAG C TA . . . C . . . C TGT . . . . . .
blockSeqs : . TCTA C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . T C . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . TTATAA C TA . . . T . . . T TGT . . . . .
blockSeqs : . AGT C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . T C . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . ATATAT C TA . . . T . . . T TGT . . . . .
blockSeqs : . AC C . A C A A . . T . T . C A T . . . . . . . T C . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . ATATAT C TG . . . T . . . T TGT . . . . .
blockSeqs : . AC C . T C A A . . T . T . C C T . . . . . . . . C . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . CATAA A TG . . . A . . . T TGT . . . . .
blockSeqs : . AC C . A C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . C . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . CATAA T TG . . . T . . . T TGT . .
blockSeqs : . AC C . A C A A . . T . T . C A T . . . . . . . . C . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . CATAA . . . . . C . . . T TGC .
blockSeqs : . AC C . . C A A . . T . G . T C T . . . . . . . . C . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . CATAA . . . . . T . . . G GCC
blockSeqs : . AC C . . C A A . . T . T . C A A . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . CATAA . . . . . T . . . T TTG
blockSeqs : . AC C . . C A A . . T . T . T A T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . CATAA . . . . . C . . . G .
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blockSeqs : . TC . . . . . . . . . . T . T A T . . . .
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blockSeqs : . T . . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons : TCTC* A**************** ** TTGTAAATATAA************************ C****
originalCons : CTCATTCTTACCCCAGTGTCTGAAAAAAT-CATGG-CGAAA----AG--CAGATATTTTCTATCGGTCGTA-TAAAA-TCTCATAAATTGCTCTT--ACCATGCCATACTGACCTG-TGAAAT--------A--------CGCCTTGCGGCAATATCATTTGACC--CAATAATCCGAT--TGTTTTGTCAC-C-TGCTGT----GCGAAATGATGTCAA--TTTNGACTAAACCAT-TANCGATAT-T-A-G--GG-------AGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCA----------------C--TGTCAGAGTGACGTCATCGGACAT--TGG-CA-----CAAG-----------G-----------------C----GNTA----GTG--AA-------------AG----G-------GA-CA----G--------C--GTGTT-----CATTCTGT-----ACATAAATTTAGGCA---TG----TGTA------G------T------T------AT------AA------CTCTC--TTTACGGATTGTAT--CAATTTAATAG------------TAA-T-TC-T--TT------T-TT--AANAAATTNNTATACTGAAAATA--AACATTT-TAGAAGACAACCAGTTACAAACAAACACTAA---C-CTTT-A-A-T-TATTANTATG------TT---G-T--G-------TT-T------------TTTTTCT-CGTT-TGTTAT-CTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCT---GAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAGATCAAAAGTGTAAC-G-TCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCA-AC--CGTCCA-GACTAGTA-ATTTTG-GAAGCGTTACAATAA-GAAA--ACATTAGAA--A-----GGGGATTTTAGCCT-CTT------TTTTTATTTTT-ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTAT---AT--ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGTAAAAAAAATAAGTGCCGTCCGA----CCC-C---CCCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
finalCons : CTCATTCTTACCCCAGTGTCTGAAAAAAT-CATGG-CGAAA----AG--CAGATATTTTCTATCGGTCGTA-TAAAATCTC-ATAAATTGCTCTT--ACCATGCCATACTGACCTG-TGAAATA----------------CGCCTTGCGGCAATATCATTTGACC--CAATAATCCGAT--TGTTTTGTCAC-C-TGCTGT----GCGAAATGATGTCAA--TTTNGACTAAACCAT-TANCGATAT-T-A-G--GG-------AGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCA----------------C--TGTCAGAGTGACGTCATCGGACAT--TGG-CA-----CAAG-----------G-----------------C----GNTA----GTG--AA-------------AG----G-------GA-CA----G--------C--GTGTT-----CATTCTGT-----ACATAAATTTAGGCA---TG----TGTA------GTTGTAAATATAA------------------------CTCTC--TTTACGGATTGTAT--CAATTTAATAG------------TAA-T-TC-T--TT------T-TT--AANAAATTNNTATACTGAAAATA--AACATTT-TAGAAGACAACCAGTTACAAACAAACACTAA---C-CTTT-A-A-T-TATTANTATG------TT---G-T--G-------TT-T------------TTTTTCT-CGTT-TGTTAT-CTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCT---GAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAGATCAAAAGTGTAAC-G-TCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCA-AC--CGTCCA-GACTAGTA-ATTTTG-GAAGCGTTACAATAA-GAAA--ACATTAGAA--A-----GGGGATTTTAGCCT-CTT------TTTTTATTTTT-ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTAT---AT--ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGTAAAAAAAATAAGTGCCGTCCGAC----CC-C---CCCCATACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
Alignments
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gi|25883 : TTTGATC--CAA-AACCTGGT--TGTTT-GTCAT-C-TGGTGT----GCGAAATTGGGTCAA--ATTAGGCTAAACCAT-TACTGATAG-T-A-G--GG-------A
gi|25884 : cagatatttcctacaaatcgtataaaaccataaaataaat--CAGATATTTTCTATCGGTCGTA-TAAAA-TCTCATAAATTGCTCTT--ACCATGCCATACTGACCTG-TGAAAT--------A--------TGCCTTCCGGCAATAGCATTTGACC--CAATAATCCGAT--TGTTTTGTCAC-C-AGCTGT----GAGAAATGATGTCAA--TTTTGACTAAACCAT-TAATGATAT-T-A-GGCGG-------AGT-
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gi|25948 : --AA-------------NN----N-------NN-NN----N--------N--NTGTT-----CATTCTGT-----ACATAAATTAAATCA---TGTGTAG------TTATAAAT-ATAACTCTA--TATACGGATTGTAT--CAGTTTTATAG------------TAA-T-TC-TGATT------T-TT--AAC---------------AAATA--AACATTT-TAGAAGACAATCAGTTACAAACAAACACTGA---C-CTT------T-TATAACT---------TT----------------TT-T------------TTTTT
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