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gi|91653                      :      ttcaAGAA-GG-TG-A--A-A--G------G-----G-C---AT-T--AA--G-TG----TTACC----C-----C----TT-TC----C-----T---TC---T-G----TCT----GTCC
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gi|91658                      :            AATGG-TG-A--A-T--G------G-----G-C---AT-T--GA--G-TG----TTACC----C-----C-----G-----------------TC---T-G----TCC----ATTCCTC
gi|91659                      :            AATGG-TC-A--A-A--A------G-----G-C---AT-T--AA--G-TG----TGACC----C-----C----TG-TG----T-----G---TA---T-G----TCT----GTTCATCcgt
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|91612 ): CATTCCAAGATTGTGAAGGGGCATCAAGTGTCACCGCTGGTCGTC
Unaligned ( gi|91613 ): CATTCAAAGAATGGTGATGGGGAATGAAGTGTTATAAATCAGTTTGTTTGTTCTTC






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Reference ( family-281 )      :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GT----C----C--------G----T---C----T-G----TC---C-GTCCGTC
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gi|91618                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AC--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GT----C----T--------G----T---C----C-C----TT---G-GTCCGTCtaaatcagtttgtttgttcttc
gi|91619                      :           ATT-CAAATAATAG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GT----C----C--------G----T---C----T-G----TT---C-ATATGTC
gi|91620                      :           ATT-CAAAAAATGG-TGTA-GG------G-CC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GT----T----T--------G----T---T----T-G----TT---T-GTtgt
gi|91621                      :           ATT-CGTAGAATGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-AG----TTA-----CCT-C-C---GT----C----T--------G----T---C----T-G----TC---T-GTTTGT
gi|91622                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AC--A-TG----TTA-----CCC-C-T---GT----C----T--------G----T---C----C-C----TT---G-GTCTGTC
gi|91623                      :           ATT-CACAGAAAGG-TTAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-T---GT----C----T--------A----T---C----A-G----TC---T-GTCC
gi|91625                      :           ATT-TTAAGAATGG-TGAA-GG------G-GT----ACTTGTAT------T--TA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GT----T----C--------G----T---C----T-G----TC---C-GT
gi|91626                      :           ATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------C-GC----A------T------C--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-
gi|91627                      :           ATTACAAAGAATGA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----T-----------C-T---GT----T----C--------G----T---C----A-G----TC---C-GTCCATccatgcatcaatttgcctatttgtcc
gi|91628                      :           ATT-GGAAGATTGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--CA--C-TG----TTG-----TTC-C-T---GT----C----C--------A----T---C----A-G----TT---T-GT
gi|91629                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----TCC-C-T---GT----C----C--------G----T---C----T-G----T
gi|91630                      :            TT-TAAAGTATAG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GT----C----C--------G----T---C----C-G----TT---C-GTTCATCt
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gi|91634                      :            TT-CGAAGAATGG-CGAA-GG------G-AC----A------T------C--CA--G-TT----TTA-----CCC-C-T---GT----T----C--------G----T---C----T-G----
gi|91635                      :            TT-CAAAGAATGG-TAAA-GG------G--C----A------A------T--A-----TGGAAATTA-----CTG-C-T---GT----C----C--------G----T---C----T-G----TT---T-GTCCATC
gi|91636                      :            TT-TGAAAAATGG-TGAA-AG------G-GT----A------TATGTATT--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GT----C----C--------G----T---C----C-G----TC---C-GTC
gi|91637                      :            TT-CAAAGACTGG-TGAA-GG------GTGTTA--A------T------T--AA--G-TG----TCA-----TCT-C-T---GT----C----C--------G----T---T----C-G----TC---C-GTC
gi|91638                      :            TT-TGAAGAATTG-TTCA-GA------G-GT----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GT----C----C--------G----T---C----T-G----TC---C-GTTCGTC
gi|91639                      :            TT-AGAA-AATGG-TGAA-AA------G-GC----A------T------G--AA--C-TG----TAA-----CCT-T-T---GT----C----T--------A----T---C----C-G----TT---T-GCCCATC
gi|91642                      :            tT-CAAAGAATAG-TAAA-GC------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----CTA-----CCC-C-T---GT----C----C--------A----A---C----C-T----TC---CTGTCTGT
gi|91643                      :                GAAAACTGG-TAAA-GG------G-GT----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-----GT----C----T--------G----T---T----T-G----TT---C-GTtagtcc
gi|91644                      :                tcaGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--TA--G-TT----TTA-----CGT-T-T---GT----C----C--------A----T---C----C-G----TC---T-GTTTGT
gi|91645                      :             caatAAGAATGG-TGAAAGG------G-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CGT-T-T---GT----C----T--------G----T---G----T-G----TT---C-GTCCGT
gi|91646                      :                 aAAAATGG-TGCA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----GTC-----TCC-C-T---GC----A----T--------G----TC--C----T-G----TC---T-GTCCAT
gi|91647                      :               agAAGACAGA-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GT----C----T--------G----T---T----T-G----TT---C-ATCCGT
gi|91648                      :                 AAGACAGG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-A---GT----C----C--------A----T---C----T-G----TC---C-GTTTGT
gi|91649                      :                 AAGAATTG-TGAA-AG------G-GC----A------T------G--AA--G-TG----TTG-----CCC-T-T---GT----C----T--------G----T---C----TGG----TC---C-
gi|91650                      :                 AAGAATGG-TGAA-GGTACATTGTAC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T---GT----C----T--------G----T---T----C-T----TT---T-GTCAGTC
gi|91651                      :                 AAGAATGG-TGCA-GG------A-GT----A------T------C--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GT----C----T--------A----T---C----T-C----TT---T-GT
gi|91652                      :                 AAGAATGG-GGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--T-TG-----TA-----ACC-C-A---GT----C----C--------GATCTT---C----T-G----TT---T-GTGCGT
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gi|91654                      :                  AGAATCT-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----CTG-----TCC-C-T---GT----T----C--------A----T---C----T-G----TT---T-GT
gi|91655                      :                   GAATGG-TGAA-GT------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TCA-----CCC-A-T---GT----C----T--------G----T---C----T-G----CC---T-GTC
gi|91656                      :                   GAATGG-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TA----TAA-----CCC-C-G---GT----C----C--------A----T---C----A-G----TT---C-CTCC
gi|91657                      :                    AATGG-TGAA-GG------G--C----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-C-C---TT----C----C--------G----G---C----T-G----TT---C-GTCTGTC
gi|91658                      :                    AATGG-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GT----C----T--------G----T---C----C-A----TT---C-CTCCGT
gi|91659                      :                    AATGG-TCAA-AA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-C-T---GT----G----T--------G----T---A----T-G----TC---T-GTTCATC
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gi|91661                      :                      TGG-TGAA-GG------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----TCT-C-C---GT----T----C--------G----T---T----C-A----TT---T-GCCCATC
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Alignments
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lowQualScore                  :              .          .    .  ...... .  .... ...... ...... ..  .. .  ....   .....   . . ...     .... ... ................. ....   .       
lowQualScore                  :              5          4    2  222222 8  4444 222222 666666 00  00 4  9999   00000   8 4 777     9999 777 77777777777777777 0000   5       
consensus                     :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
Reference ( family-281 )      :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
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gi|91583                      :          CATT-GCAAGAATGG-TGGT-GA------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-T---GTCTG----T---T----T------------G----TCC-GTtgtc
gi|91584                      :                 AAGAATGGCTGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--A-TG----GCG-----CCC-C-T---GTCCA----T---C----C------------GATCATTT-GTTCGTC
gi|91585                      :    cgtctaCATT-TGAGGAATGG-TAAA-GG------G-GT----G------C------T--AA--G-TG----GCA-----CTC-A-T---GTCTG----T---T----T------------G----TCT-GTCCGT
gi|91586                      :          CATT-TGTAGAATAG-TAAA-GG------G-CC----T------T------T--AA--G-TG----TAA-----CCC-TGT---GTCCG----T---C----CTTTT--------G----TTT-GTCCGTC
gi|91587                      :          CACT-TGAAGAATGG-TGTA-GG------G-TC----A------C------T--AA--G-CG----ATA-----ACT-C-T---GCCCA----T---C----T------------G----TTT-GTTCAT
gi|91588                      :          CATT-CGAGGAATGG-TGAA-GG------T-GC----A------T------C--AA--G-TG----GTA-----TCC-T-T---GTTCA----T---C----T------------G----
gi|91589                      :          CATT-CAGAGAATGG-TTAT-AG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCCAC-T---GTCCG----T---
gi|91590                      :          CATT-TGAAGAACAA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--CA--G-TG----TTG-----GCT-C-T---GTCCG----T---C----C------------A----TTC-GTCCATatg
gi|91591                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--A----------------CC-C-T---GTCTG----T---T----C------------A----TTC-GTCCGT
gi|91592                      :          CATG-TGAAGAATGG-TGGA-GA------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CAC-C-T---GTTTG----T---C----
gi|91593                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------A-GC----A------T------T--AG--G-TG----TTA-----CTCAC-T---Gtat
gi|91594                      :          CATT-TGAAGAGTGA-TGAA-AG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T----TTCA----T---T----C------------G----TTC-GTTCAT
gi|91595                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-TC----A------T------T--TA--G-TG----TTATGGTTCCT-C-T---ATTTG----TCGAC----T------------G----TGT-GTCCGCC
gi|91596                      :          CATT-CAAAGAATAG-TGAT-GG------G-CT----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-C---GCCAG----T---C----C------------A----TCT-GT
gi|91597                      :          CATT-TTAAGAATGG-TGAT-TG------G-GC----A------T------T--AA--A-T-----TTA-----CCC-C-T---GTCTA----T---G----C------------G----TCT-GTt
gi|91598                      :          CATT-CGATGAATGG-TAAA-GC------G--C----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-G---CTCCG----G---C----C------------G----TTT-GTGCGT
gi|91599                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------A-GC----A------T------T--AG--G-TG----TTT-----CTC-A-T---GTATG----C---C----C------------G----CTC-G
gi|91600                      :          CATT-AGGAGAATAG-TG---GG------G-GC----A------T------T--AA--T-GG----TTA-----CCC-C-A---GTCGG----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91601                      :          CATT-CGAAATATGG-CGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-A-TAACGTTCG----T---T----C------------C----TCC-GT
gi|91602                      :          CATT-CAAAAAATGG-TGAT-GG------T-TT----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-T-T---CTCTG----T---C----T------------G----ACT-TTCCATC
gi|91603                      :          CATT-CAAAGAATAA-AAAT-GG------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----CTA-----TCC-C-T---GTCAG----T---C----C------------
gi|91604                      :          CATT-TGAAGAATGG-TTAA-GG------A-GC----C------A------A--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTATG----T---C----CATTCTTTGGTTTG----TTC-GTCCGTCtttt
gi|91605                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GC------G-AC----A-------------T--AA--GTTG----TT------CTC-C-T---GTCTG----T---C----A------------G----TCT-GTTTGT
gi|91606                      :          CACT-TGAAATATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA----TG----ATA-----CAC-C-T---GTCAG----T--------T------------G----TCC-GTCTGTC
gi|91607                      :          CATT-AAAAGAATGA-TTAC-GG------G-GC----A------TA-----T--AGATG-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------A----T
gi|91608                      :          CATT-CAAAGAATTG-TTAA-GT------G-TC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-A---GTACG----T---t
gi|91609                      :                        G-TTAA-GG------G-AC----A------T------TTGAA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTTCGTCgtgt
gi|91610                      : cattacaaaCATT-CTAAGAATGG-TGAT-AG------T-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CCT-C-
gi|91611                      :          CATT-TGAAGAATAG-TG----G------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GTCTG----T---attcattctgtttgcttgt
gi|91612                      :          CATT-CCAAGA-TTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----CCG-C-T---GGTCG----T---C----
gi|91613                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGAT-GG------G-GA----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----
gi|91618                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AC--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------C----TTG-GTCCGTCtaaatcagtttgtttgttcttc
gi|91619                      :           ATT-CAAATAATAG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATATGTC
gi|91620                      :           ATT-CAAAAAATGG-TGTA-GG------G-CC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTTTG----T---T----T------------G----TTT-GTtgt
gi|91621                      :           ATT-CGTAGAATGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-AG----TTA-----CCT-C-C---GTCTG----T---C----T------------G----TCT-GTTTGT
gi|91622                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AC--A-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------C----TTG-GTCTGTC
gi|91623                      :           ATT-CACAGAAAGG-TTAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-T---GTCTA----T---C----A------------G----TCT-GTCC
gi|91625                      :           ATT-TTAAGAATGG-TGAA-GG------G-GT----ACTTGTAT------T--TA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----TCC-GT
gi|91626                      :           ATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------C-GC----A------T------C--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-
gi|91627                      :           ATTACAAAGAATGA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----T-----------C-T---GTTCG----T---C----A------------G----TCC-GTCCATccatgcatcaatttgcctatttgtcc
gi|91628                      :           ATT-GGAAGATTGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--CA--C-TG----TTG-----TTC-C-T---GTCCA----T---C----A------------G----TTT-GT
gi|91629                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----TCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----T
gi|91630                      :            TT-TAAAGTATAG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TTC-GTTCATCt
gi|91632                      :            TT-CCAGGAATGG-TGAG-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-T---GTTCA----T---C----C------------A----TCT-GTCTG
gi|91633                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-AA----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCTA----T---T----G------------G----TTT-GTTC
gi|91634                      :            TT-CGAAGAATGG-CGAA-GG------G-AC----A------T------C--CA--G-TT----TTA-----CCC-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----
gi|91635                      :            TT-CAAAGAATGG-TAAA-GG------G--C----A------A------T--A-----TGGAAATTA-----CTG-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTT-GTCCATC
gi|91636                      :            TT-TGAAAAATGG-TGAA-AG------G-GT----A------TATGTATT--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTC
gi|91637                      :            TT-CAAAGACTGG-TGAA-GG------GTGTTA--A------T------T--AA--G-TG----TCA-----TCT-C-T---GTCCG----T---T----C------------G----TCC-GTC
gi|91638                      :            TT-TGAAGAATTG-TTCA-GA------G-GT----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTCCG----T---C----T------------G----TCC-GTTCGTC
gi|91639                      :            TT-AGAA-AATGG-TGAA-AA------G-GC----A------T------G--AA--C-TG----TAA-----CCT-T-T---GTCTA----T---C----C------------G----TTT-GCCCATC
gi|91642                      :            tT-CAAAGAATAG-TAAA-GC------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----CTA-----CCC-C-T---GTCCA----A---C----C------------T----TCCTGTCTGT
gi|91643                      :                GAAAACTGG-TAAA-GG------G-GT----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-----GTCTG----T---T----T------------G----TTC-GTtagtcc
gi|91644                      :                tcaGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--TA--G-TT----TTA-----CGT-T-T---GTCCA----T---C----C------------G----TCT-GTTTGT
gi|91645                      :             caatAAGAATGG-TGAAAGG------G-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CGT-T-T---GTCTG----T---G----T------------G----TTC-GTCCGT
gi|91646                      :                 aAAAATGG-TGCA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----GTC-----TCC-C-T---GCATG----T---C----CT-----------G----TCT-GTCCAT
gi|91647                      :               agAAGACAGA-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---T----T------------G----TTC-ATCCGT
gi|91648                      :                 AAGACAGG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-A---GTCCA----T---C----T------------G----TCC-GTTTGT
gi|91649                      :                 AAGAATTG-TGAA-AG------G-GC----A------T------G--AA--G-TG----TTG-----CCC-T-T---GTCTG----T---C----TG-----------G----TCC-
gi|91650                      :                 AAGAATGG-TGAA-GGTACATTGTAC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T---GTCTG----T---T----C------------T----TTT-GTCAGTC
gi|91651                      :                 AAGAATGG-TGCA-GG------A-GT----A------T------C--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GTCTA----T---C----
gi|91652                      :                 AAGAATGG-GGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--T-TG-----TA-----ACC-C-A---GTCCGATCTT---C----T------------G----TTT-GTGCGTtctttgt
gi|91653                      :                  AGAA-GG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---TTCCT----T---C----T------------G----TCT-GTCC
gi|91654                      :                  AGAATCT-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----CTG-----TCC-C-T---GTTCA----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91655                      :                   GAATGG-TGAA-GT------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TCA-----CCC-A-T---GTCTG----T---C----T------------G----CCT-GTC
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gi|91657                      :                    AATGG-TGAA-GG------G--C----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-C-C---TTCCG----G---C----T------------G----TTC-GTCTGTC
gi|91658                      :                    AATGG-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GTCTG----T---C----C------------A----TTC-CTCCGT
gi|91659                      :                    AATGG-TCAA-AA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-C-T---GTGTG----T---A----T------------G----TCT-GTTCATC
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gi|91661                      :                      TGG-TGAA-GG------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----TCT-C-C---GTTCG----T---T----C------------A----TTT-GCCCATC
gi|91663                      :                         -TAAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----GCC-C-T---GTCTA----T---C----T------------G----TTT-GTCTGTC





Alignments
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lowQualScore                  :              .          .    .  ...... .  .... ...... ...... ..  .. .  ....   .....   . . ...     .... ... ................. ....   .       
lowQualScore                  :              5          4    2  222222 8  4444 222222 666666 00  00 4  9999   00000   8 4 777     9999 777 77777777777777777 0000   5       
consensus                     :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
Reference ( family-281 )      :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
gi|91555                      :          CATT-CAAAGAATGG-GGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-T-T---GTCTG----T---T----T------------G----TTT-GTCCATC
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gi|91560                      :          CATT-CAAAATATGG-TGAAAGG------G-GC----T------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATTCATC
gi|91561                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-AG------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-C---ATCTG----T---C----C------------G----TCC-GTCCATC
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gi|91564                      :          CATT-GGAAGAATGG-TAAA-GG------G--C----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----T------------G----TCC-ATCCGTC
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gi|91566                      :          CATT-CAAGGAATGG-CAAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTC-----CTC-C-C---GTCCG----T---C----C------------A----CCT-GTTTGTC
gi|91567                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAT-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---CCTTTC------------T----TTC-ATCCGTCtgt
gi|91568                      :          CATT-CGAAGAATGG-TGAC-GA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCA-C-T---G-CCG----T---T----C------------G----TCC-GTCCGTtgtttgtctgtc
gi|91569                      :          CATT-CGAAAAATGG-TGAA-GA------G-GT----A------T------T--AA--C-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------G----
gi|91570                      :          CATT-GGAAGAATGG-TGAA-GA------G-GT----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTCCA----T---C----C------------G----T
gi|91571                      :          CATT-CAAAATATGG-TGGT-GG------T-GC----A------T------T--AC--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------T----TTT-GTCCttg
gi|91572                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGAA-GG------G-AC----A----------------AAT-G-TT----TTA-----CCC-C-T---GTCGA----T---C----C------------G----T
gi|91573                      :          CATT-CAAAGAAAGG-TGAT-GG------G-AC----A------G------T--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCTG----T---C----T------------A----TCC-ttat
gi|91574                      :          CATT-TGAAGAATAG-AGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--C-TG----TTA-----CCT-C-T---GGCCG----T---C----ttgt
gi|91575                      :          CATT-CAATGAGTAG-AGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCG-C-T---GTTCA----G---T----T------------G----TTT-GTTCATCggcttattc
gi|91576                      :          CATT-CAAAGAATAT-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AT--G-TG----TTA-----CCA-C-T---ACTCG----T---T----T------------G----TGT-GTCTG
gi|91577                      :          CGTT-TAAAGAATGG-TGAA-TG------T-GC----A------T------G--AA--G-TG----TGA-----CCC-C-T---GTCCG----T---A----T------------G----TCG-ATCCTTC
gi|91578                      :          CATT-TGAAGAATGG-CGAA-GG------G-TT-----------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCCC----T---G----C------------A----TCC-GTC
gi|91579                      :          CATT-CAAAGAATGG-CGAA-GA------A-GC----G------T------T--AA--G-TG----TTG-----CTC-C-T---GATCA----T---G----T------------G----TCT-GTTCAT
gi|91580                      :          CATT-CAAGGAATGG-TGAG-GG------A-GC----A------T------TA-AA--G-TG----TTG-----TCT-T-T---GTCCA----T---C----C------------A----TCA-GTCCATC
gi|91581                      :          CATT-GGAACAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--A-TC----TTA-----ATC-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----T
gi|91582                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGA-------------CCATTA------T------T--AA--G-TG----TTA-----CAG-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATTTGTCtagt
gi|91583                      :          CATT-GCAAGAATGG-TGGT-GA------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-T---GTCTG----T---T----T------------G----TCC-GTtgtc
gi|91584                      :                 AAGAATGGCTGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--A-TG----GCG-----CCC-C-T---GTCCA----T---C----C------------GATCATTT-GTTCGTC
gi|91585                      :    cgtctaCATT-TGAGGAATGG-TAAA-GG------G-GT----G------C------T--AA--G-TG----GCA-----CTC-A-T---GTCTG----T---T----T------------G----TCT-GTCCGT
gi|91586                      :          CATT-TGTAGAATAG-TAAA-GG------G-CC----T------T------T--AA--G-TG----TAA-----CCC-TGT---GTCCG----T---C----CTTTT--------G----TTT-GTCCGTC
gi|91587                      :          CACT-TGAAGAATGG-TGTA-GG------G-TC----A------C------T--AA--G-CG----ATA-----ACT-C-T---GCCCA----T---C----T------------G----TTT-GTTCAT
gi|91588                      :          CATT-CGAGGAATGG-TGAA-GG------T-GC----A------T------C--AA--G-TG----GTA-----TCC-T-T---GTTCA----T---C----T------------G----
gi|91589                      :          CATT-CAGAGAATGG-TTAT-AG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCCAC-T---GTCCG----T---
gi|91590                      :          CATT-TGAAGAACAA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--CA--G-TG----TTG-----GCT-C-T---GTCCG----T---C----C------------A----TTC-GTCCATatg
gi|91591                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--A----------------CC-C-T---GTCTG----T---T----C------------A----TTC-GTCCGT
gi|91592                      :          CATG-TGAAGAATGG-TGGA-GA------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CAC-C-T---GTTTG----T---C----
gi|91593                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------A-GC----A------T------T--AG--G-TG----TTA-----CTCAC-T---Gtat
gi|91594                      :          CATT-TGAAGAGTGA-TGAA-AG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T----TTCA----T---T----C------------G----TTC-GTTCAT
gi|91595                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-TC----A------T------T--TA--G-TG----TTATGGTTCCT-C-T---ATTTG----TCGAC----T------------G----TGT-GTCCGCC
gi|91596                      :          CATT-CAAAGAATAG-TGAT-GG------G-CT----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-C---GCCAG----T---C----C------------A----TCT-GT
gi|91597                      :          CATT-TTAAGAATGG-TGAT-TG------G-GC----A------T------T--AA--A-T-----TTA-----CCC-C-T---GTCTA----T---G----C------------G----TCT-GTt
gi|91598                      :          CATT-CGATGAATGG-TAAA-GC------G--C----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-G---CTCCG----G---C----C------------G----TTT-GTGCGT
gi|91599                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------A-GC----A------T------T--AG--G-TG----TTT-----CTC-A-T---GTATG----C---C----C------------G----CTC-G
gi|91600                      :          CATT-AGGAGAATAG-TG---GG------G-GC----A------T------T--AA--T-GG----TTA-----CCC-C-A---GTCGG----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91601                      :          CATT-CGAAATATGG-CGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-A-TAACGTTCG----T---T----C------------C----TCC-GT
gi|91602                      :          CATT-CAAAAAATGG-TGAT-GG------T-TT----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-T-T---CTCTG----T---C----T------------G----ACT-TTCCATC
gi|91603                      :          CATT-CAAAGAATAA-AAAT-GG------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----CTA-----TCC-C-T---GTCAG----T---C----C------------
gi|91604                      :          CATT-TGAAGAATGG-TTAA-GG------A-GC----C------A------A--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTATG----T---C----CATTCTTTGGTTTG----TTC-GTCCGTCtttt
gi|91605                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GC------G-AC----A-------------T--AA--GTTG----TT------CTC-C-T---GTCTG----T---C----A------------G----TCT-GTTTGT
gi|91606                      :          CACT-TGAAATATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA----TG----ATA-----CAC-C-T---GTCAG----T--------T------------G----TCC-GTCTGTC
gi|91607                      :          CATT-AAAAGAATGA-TTAC-GG------G-GC----A------TA-----T--AGATG-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------A----T
gi|91608                      :          CATT-CAAAGAATTG-TTAA-GT------G-TC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-A---GTACG----T---t
gi|91609                      :                        G-TTAA-GG------G-AC----A------T------TTGAA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTTCGTCgtgt
gi|91610                      : cattacaaaCATT-CTAAGAATGG-TGAT-AG------T-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CCT-C-
gi|91611                      :          CATT-TGAAGAATAG-TG----G------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GTCTG----T---attcattctgtttgcttgt
gi|91612                      :          CATT-CCAAGA-TTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----CCG-C-T---GGTCG----T---C----
gi|91613                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGAT-GG------G-GA----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----
gi|91618                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AC--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------C----TTG-GTCCGTCtaaatcagtttgtttgttcttc
gi|91619                      :           ATT-CAAATAATAG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATATGTC
gi|91620                      :           ATT-CAAAAAATGG-TGTA-GG------G-CC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTTTG----T---T----T------------G----TTT-GTtgt
gi|91621                      :           ATT-CGTAGAATGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-AG----TTA-----CCT-C-C---GTCTG----T---C----T------------G----TCT-GTTTGT
gi|91622                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AC--A-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------C----TTG-GTCTGTC
gi|91623                      :           ATT-CACAGAAAGG-TTAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-T---GTCTA----T---C----A------------G----TCT-GTCC
gi|91625                      :           ATT-TTAAGAATGG-TGAA-GG------G-GT----ACTTGTAT------T--TA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----TCC-GT
gi|91626                      :           ATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------C-GC----A------T------C--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-
gi|91627                      :           ATTACAAAGAATGA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----T-----------C-T---GTTCG----T---C----A------------G----TCC-GTCCATccatgcatcaatttgcctatttgtcc
gi|91628                      :           ATT-GGAAGATTGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--CA--C-TG----TTG-----TTC-C-T---GTCCA----T---C----A------------G----TTT-GT
gi|91629                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----TCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----T
gi|91630                      :            TT-TAAAGTATAG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TTC-GTTCATCt
gi|91632                      :            TT-CCAGGAATGG-TGAG-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-T---GTTCA----T---C----C------------A----TCT-GTCTG
gi|91633                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-AA----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCTA----T---T----G------------G----TTT-GTTC
gi|91634                      :            TT-CGAAGAATGG-CGAA-GG------G-AC----A------T------C--CA--G-TT----TTA-----CCC-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----
gi|91635                      :            TT-CAAAGAATGG-TAAA-GG------G--C----A------A------T--A-----TGGAAATTA-----CTG-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTT-GTCCATC
gi|91636                      :            TT-TGAAAAATGG-TGAA-AG------G-GT----A------TATGTATT--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTC
gi|91637                      :            TT-CAAAGACTGG-TGAA-GG------GTGTTA--A------T------T--AA--G-TG----TCA-----TCT-C-T---GTCCG----T---T----C------------G----TCC-GTC
gi|91638                      :            TT-TGAAGAATTG-TTCA-GA------G-GT----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTCCG----T---C----T------------G----TCC-GTTCGTC
gi|91639                      :            TT-AGAA-AATGG-TGAA-AA------G-GC----A------T------G--AA--C-TG----TAA-----CCT-T-T---GTCTA----T---C----C------------G----TTT-GCCCATC
gi|91642                      :            tT-CAAAGAATAG-TAAA-GC------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----CTA-----CCC-C-T---GTCCA----A---C----C------------T----TCCTGTCTGT
gi|91643                      :                GAAAACTGG-TAAA-GG------G-GT----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-----GTCTG----T---T----T------------G----TTC-GTtagtcc
gi|91644                      :                tcaGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--TA--G-TT----TTA-----CGT-T-T---GTCCA----T---C----C------------G----TCT-GTTTGT
gi|91645                      :             caatAAGAATGG-TGAAAGG------G-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CGT-T-T---GTCTG----T---G----T------------G----TTC-GTCCGT
gi|91646                      :                 aAAAATGG-TGCA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----GTC-----TCC-C-T---GCATG----T---C----CT-----------G----TCT-GTCCAT
gi|91647                      :               agAAGACAGA-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---T----T------------G----TTC-ATCCGT
gi|91648                      :                 AAGACAGG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-A---GTCCA----T---C----T------------G----TCC-GTTTGT
gi|91649                      :                 AAGAATTG-TGAA-AG------G-GC----A------T------G--AA--G-TG----TTG-----CCC-T-T---GTCTG----T---C----TG-----------G----TCC-
gi|91650                      :                 AAGAATGG-TGAA-GGTACATTGTAC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T---GTCTG----T---T----C------------T----TTT-GTCAGTC
gi|91651                      :                 AAGAATGG-TGCA-GG------A-GT----A------T------C--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GTCTA----T---C----
gi|91652                      :                 AAGAATGG-GGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--T-TG-----TA-----ACC-C-A---GTCCGATCTT---C----T------------G----TTT-GTGCGTtctttgt
gi|91653                      :                  AGAA-GG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---TTCCT----T---C----T------------G----TCT-GTCC
gi|91654                      :                  AGAATCT-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----CTG-----TCC-C-T---GTTCA----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91655                      :                   GAATGG-TGAA-GT------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TCA-----CCC-A-T---GTCTG----T---C----T------------G----CCT-GTC
gi|91656                      :                   GAATGG-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TA----TAA-----CCC-C-G---GTCCA----T---C----A------------G----TTC-CTCC
gi|91657                      :                    AATGG-TGAA-GG------G--C----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-C-C---TTCCG----G---C----T------------G----TTC-GTCTGTC
gi|91658                      :                    AATGG-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GTCTG----T---C----C------------A----TTC-CTCCGT
gi|91659                      :                    AATGG-TCAA-AA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-C-T---GTGTG----T---A----T------------G----TCT-GTTCATC
gi|91660                      :                     ATGG-TGAC-GG------G-GC----G------T------T--AA--G-TT----TTA-----CTC-T-T---GTCCG----T---G----C------------G----TCC-GTCCGCC
gi|91661                      :                      TGG-TGAA-GG------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----TCT-C-C---GTTCG----T---T----C------------A----TTT-GCCCATC
gi|91663                      :                         -TAAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----GCC-C-T---GTCTA----T---C----T------------G----TTT-GTCTGTC


blockSeqs                     :                              A  TACATT    CATT CTTGTA ATGTAT                  TGGTT                        CATTCTTTGGTTT    
blockSeqs                     :                              A  .         TA   .      A                       .                            CTTTC            
blockSeqs                     :                              A  .         .    .      .                       .                            CTTTT            
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            CT               
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            TG               
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            A                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
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blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
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blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            A                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            G                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
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blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
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blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            A                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            C                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                            T                
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
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blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             
blockSeqs                     :                              .  .         .    .      .                       .                                             


blockSeqCons                  :          
originalCons                  :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
finalCons                     :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC





Alignments
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lowQualScore                  :              .          .    .  ...... .  .... ...... ...... ..  .. .  ....   .....   . . ...     .... ... ................. ....   .       
lowQualScore                  :              5          4    2  222222 8  4444 222222 666666 00  00 4  9999   00000   8 4 777     9999 777 77777777777777777 0000   5       
consensus                     :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
Reference ( family-281 )      :          CATT-CGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTCCGTC
gi|91555                      :          CATT-CAAAGAATGG-GGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-T-T---GTCTG----T---T----T------------G----TTT-GTCCATC
gi|91556                      :          CATT-CAAAGACTGG-TGAA-GG------G-GC----G------T------T--AA--G-TG----TTG-----ACC-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----TGT-GTTCGTC
gi|91557                      :          CATT-CACAGAATGT-CCAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91558                      :          CATT-AGAAGAATGG-TGAA-AG------G-TC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCT----T---C----T------------G----TCC-ATCCGTC
gi|91559                      :          CATT-TGAATACTGG-TGAA-GA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---CTCCA----T---C----T------------G----TTT-GTCTGTC
gi|91560                      :          CATT-CAAAATATGG-TGAAAGG------G-GC----T------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATTCATC
gi|91561                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-AG------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-C---ATCTG----T---C----C------------G----TCC-GTCCATC
gi|91562                      :          CATT-CAAAATATGG-TGAAAGG------G-GC----T------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATTCATC
gi|91563                      :          CATT-CAAAGAACGG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-T-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTC
gi|91564                      :          CATT-GGAAGAATGG-TAAA-GG------G--C----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----T------------G----TCC-ATCCGTC
gi|91565                      :          CATT-GAAAGAATTT-TAAT-GA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTC------T---C----T------------G----TTT-GTCCGTC
gi|91566                      :          CATT-CAAGGAATGG-CAAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTC-----CTC-C-C---GTCCG----T---C----C------------A----CCT-GTTTGTC
gi|91567                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAT-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---CCTTTC------------T----TTC-ATCCGTCtgt
gi|91568                      :          CATT-CGAAGAATGG-TGAC-GA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCA-C-T---G-CCG----T---T----C------------G----TCC-GTCCGTtgtttgtctgtc
gi|91569                      :          CATT-CGAAAAATGG-TGAA-GA------G-GT----A------T------T--AA--C-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------G----
gi|91570                      :          CATT-GGAAGAATGG-TGAA-GA------G-GT----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTCCA----T---C----C------------G----T
gi|91571                      :          CATT-CAAAATATGG-TGGT-GG------T-GC----A------T------T--AC--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------T----TTT-GTCCttg
gi|91572                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGAA-GG------G-AC----A----------------AAT-G-TT----TTA-----CCC-C-T---GTCGA----T---C----C------------G----T
gi|91573                      :          CATT-CAAAGAAAGG-TGAT-GG------G-AC----A------G------T--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCTG----T---C----T------------A----TCC-ttat
gi|91574                      :          CATT-TGAAGAATAG-AGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--C-TG----TTA-----CCT-C-T---GGCCG----T---C----ttgt
gi|91575                      :          CATT-CAATGAGTAG-AGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCG-C-T---GTTCA----G---T----T------------G----TTT-GTTCATCggcttattc
gi|91576                      :          CATT-CAAAGAATAT-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AT--G-TG----TTA-----CCA-C-T---ACTCG----T---T----T------------G----TGT-GTCTG
gi|91577                      :          CGTT-TAAAGAATGG-TGAA-TG------T-GC----A------T------G--AA--G-TG----TGA-----CCC-C-T---GTCCG----T---A----T------------G----TCG-ATCCTTC
gi|91578                      :          CATT-TGAAGAATGG-CGAA-GG------G-TT-----------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCCC----T---G----C------------A----TCC-GTC
gi|91579                      :          CATT-CAAAGAATGG-CGAA-GA------A-GC----G------T------T--AA--G-TG----TTG-----CTC-C-T---GATCA----T---G----T------------G----TCT-GTTCAT
gi|91580                      :          CATT-CAAGGAATGG-TGAG-GG------A-GC----A------T------TA-AA--G-TG----TTG-----TCT-T-T---GTCCA----T---C----C------------A----TCA-GTCCATC
gi|91581                      :          CATT-GGAACAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--A-TC----TTA-----ATC-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----T
gi|91582                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGA-------------CCATTA------T------T--AA--G-TG----TTA-----CAG-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATTTGTCtagt
gi|91583                      :          CATT-GCAAGAATGG-TGGT-GA------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-T---GTCTG----T---T----T------------G----TCC-GTtgtc
gi|91584                      :                 AAGAATGGCTGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--A-TG----GCG-----CCC-C-T---GTCCA----T---C----C------------GATCATTT-GTTCGTC
gi|91585                      :    cgtctaCATT-TGAGGAATGG-TAAA-GG------G-GT----G------C------T--AA--G-TG----GCA-----CTC-A-T---GTCTG----T---T----T------------G----TCT-GTCCGT
gi|91586                      :          CATT-TGTAGAATAG-TAAA-GG------G-CC----T------T------T--AA--G-TG----TAA-----CCC-TGT---GTCCG----T---C----CTTTT--------G----TTT-GTCCGTC
gi|91587                      :          CACT-TGAAGAATGG-TGTA-GG------G-TC----A------C------T--AA--G-CG----ATA-----ACT-C-T---GCCCA----T---C----T------------G----TTT-GTTCAT
gi|91588                      :          CATT-CGAGGAATGG-TGAA-GG------T-GC----A------T------C--AA--G-TG----GTA-----TCC-T-T---GTTCA----T---C----T------------G----
gi|91589                      :          CATT-CAGAGAATGG-TTAT-AG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCCAC-T---GTCCG----T---
gi|91590                      :          CATT-TGAAGAACAA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--CA--G-TG----TTG-----GCT-C-T---GTCCG----T---C----C------------A----TTC-GTCCATatg
gi|91591                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--A----------------CC-C-T---GTCTG----T---T----C------------A----TTC-GTCCGT
gi|91592                      :          CATG-TGAAGAATGG-TGGA-GA------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CAC-C-T---GTTTG----T---C----
gi|91593                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------A-GC----A------T------T--AG--G-TG----TTA-----CTCAC-T---Gtat
gi|91594                      :          CATT-TGAAGAGTGA-TGAA-AG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T----TTCA----T---T----C------------G----TTC-GTTCAT
gi|91595                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-TC----A------T------T--TA--G-TG----TTATGGTTCCT-C-T---ATTTG----TCGAC----T------------G----TGT-GTCCGCC
gi|91596                      :          CATT-CAAAGAATAG-TGAT-GG------G-CT----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-C---GCCAG----T---C----C------------A----TCT-GT
gi|91597                      :          CATT-TTAAGAATGG-TGAT-TG------G-GC----A------T------T--AA--A-T-----TTA-----CCC-C-T---GTCTA----T---G----C------------G----TCT-GTt
gi|91598                      :          CATT-CGATGAATGG-TAAA-GC------G--C----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-G---CTCCG----G---C----C------------G----TTT-GTGCGT
gi|91599                      :          CATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------A-GC----A------T------T--AG--G-TG----TTT-----CTC-A-T---GTATG----C---C----C------------G----CTC-G
gi|91600                      :          CATT-AGGAGAATAG-TG---GG------G-GC----A------T------T--AA--T-GG----TTA-----CCC-C-A---GTCGG----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91601                      :          CATT-CGAAATATGG-CGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-A-TAACGTTCG----T---T----C------------C----TCC-GT
gi|91602                      :          CATT-CAAAAAATGG-TGAT-GG------T-TT----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-T-T---CTCTG----T---C----T------------G----ACT-TTCCATC
gi|91603                      :          CATT-CAAAGAATAA-AAAT-GG------A-GC----A------T------T--AA--G-TG----CTA-----TCC-C-T---GTCAG----T---C----C------------
gi|91604                      :          CATT-TGAAGAATGG-TTAA-GG------A-GC----C------A------A--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTATG----T---C----CATTCTTTGGTTTG----TTC-GTCCGTCtttt
gi|91605                      :          CATT-TGAAGAATGG-TGAA-GC------G-AC----A-------------T--AA--GTTG----TT------CTC-C-T---GTCTG----T---C----A------------G----TCT-GTTTGT
gi|91606                      :          CACT-TGAAATATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA----TG----ATA-----CAC-C-T---GTCAG----T--------T------------G----TCC-GTCTGTC
gi|91607                      :          CATT-AAAAGAATGA-TTAC-GG------G-GC----A------TA-----T--AGATG-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------A----T
gi|91608                      :          CATT-CAAAGAATTG-TTAA-GT------G-TC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-A---GTACG----T---t
gi|91609                      :                        G-TTAA-GG------G-AC----A------T------TTGAA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTTCGTCgtgt
gi|91610                      : cattacaaaCATT-CTAAGAATGG-TGAT-AG------T-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CCT-C-
gi|91611                      :          CATT-TGAAGAATAG-TG----G------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GTCTG----T---attcattctgtttgcttgt
gi|91612                      :          CATT-CCAAGA-TTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----CCG-C-T---GGTCG----T---C----
gi|91613                      :          CATT-CAAAGAATGG-TGAT-GG------G-GA----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----
gi|91618                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AC--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------C----TTG-GTCCGTCtaaatcagtttgtttgttcttc
gi|91619                      :           ATT-CAAATAATAG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTC-ATATGTC
gi|91620                      :           ATT-CAAAAAATGG-TGTA-GG------G-CC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTTTG----T---T----T------------G----TTT-GTtgt
gi|91621                      :           ATT-CGTAGAATGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-AG----TTA-----CCT-C-C---GTCTG----T---C----T------------G----TCT-GTTTGT
gi|91622                      :           ATT-CAAAGAGTTG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AC--A-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---C----C------------C----TTG-GTCTGTC
gi|91623                      :           ATT-CACAGAAAGG-TTAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-T---GTCTA----T---C----A------------G----TCT-GTCC
gi|91625                      :           ATT-TTAAGAATGG-TGAA-GG------G-GT----ACTTGTAT------T--TA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----TCC-GT
gi|91626                      :           ATT-CAAAGAATGA-TGAA-GG------C-GC----A------T------C--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-
gi|91627                      :           ATTACAAAGAATGA-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----T-----------C-T---GTTCG----T---C----A------------G----TCC-GTCCATccatgcatcaatttgcctatttgtcc
gi|91628                      :           ATT-GGAAGATTGG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--CA--C-TG----TTG-----TTC-C-T---GTCCA----T---C----A------------G----TTT-GT
gi|91629                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----TCA-----TCC-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----T
gi|91630                      :            TT-TAAAGTATAG-TGAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TTC-GTTCATCt
gi|91632                      :            TT-CCAGGAATGG-TGAG-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCC-C-T---GTTCA----T---C----C------------A----TCT-GTCTG
gi|91633                      :            TT-TGAAGAATGG-TGAA-GG------G-AA----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----TCC-C-T---GTCTA----T---T----G------------G----TTT-GTTC
gi|91634                      :            TT-CGAAGAATGG-CGAA-GG------G-AC----A------T------C--CA--G-TT----TTA-----CCC-C-T---GTTCG----T---C----T------------G----
gi|91635                      :            TT-CAAAGAATGG-TAAA-GG------G--C----A------A------T--A-----TGGAAATTA-----CTG-C-T---GTCCG----T---C----T------------G----TTT-GTCCATC
gi|91636                      :            TT-TGAAAAATGG-TGAA-AG------G-GT----A------TATGTATT--AA--G-TG----TTA-----CCT-C-T---GTCCG----T---C----C------------G----TCC-GTC
gi|91637                      :            TT-CAAAGACTGG-TGAA-GG------GTGTTA--A------T------T--AA--G-TG----TCA-----TCT-C-T---GTCCG----T---T----C------------G----TCC-GTC
gi|91638                      :            TT-TGAAGAATTG-TTCA-GA------G-GT----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-A-T---GTCCG----T---C----T------------G----TCC-GTTCGTC
gi|91639                      :            TT-AGAA-AATGG-TGAA-AA------G-GC----A------T------G--AA--C-TG----TAA-----CCT-T-T---GTCTA----T---C----C------------G----TTT-GCCCATC
gi|91642                      :            tT-CAAAGAATAG-TAAA-GC------G-GC----A------T------C--AA--G-TG----CTA-----CCC-C-T---GTCCA----A---C----C------------T----TCCTGTCTGT
gi|91643                      :                GAAAACTGG-TAAA-GG------G-GT----A------T------G--AA--G-TG----TTA-----CTA-C-----GTCTG----T---T----T------------G----TTC-GTtagtcc
gi|91644                      :                tcaGAATGG-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--TA--G-TT----TTA-----CGT-T-T---GTCCA----T---C----C------------G----TCT-GTTTGT
gi|91645                      :             caatAAGAATGG-TGAAAGG------G-GC----A------T------T--AA--G-TA----TTA-----CGT-T-T---GTCTG----T---G----T------------G----TTC-GTCCGT
gi|91646                      :                 aAAAATGG-TGCA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----GTC-----TCC-C-T---GCATG----T---C----CT-----------G----TCT-GTCCAT
gi|91647                      :               agAAGACAGA-TGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---GTCTG----T---T----T------------G----TTC-ATCCGT
gi|91648                      :                 AAGACAGG-TGAT-GG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTG-----CCT-C-A---GTCCA----T---C----T------------G----TCC-GTTTGT
gi|91649                      :                 AAGAATTG-TGAA-AG------G-GC----A------T------G--AA--G-TG----TTG-----CCC-T-T---GTCTG----T---C----TG-----------G----TCC-
gi|91650                      :                 AAGAATGG-TGAA-GGTACATTGTAC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-T-T---GTCTG----T---T----C------------T----TTT-GTCAGTC
gi|91651                      :                 AAGAATGG-TGCA-GG------A-GT----A------T------C--AA--G-TG----TAA-----CCC-C-T---GTCTA----T---C----
gi|91652                      :                 AAGAATGG-GGAA-GG------G-GC----A------T------T--AA--T-TG-----TA-----ACC-C-A---GTCCGATCTT---C----T------------G----TTT-GTGCGTtctttgt
gi|91653                      :                  AGAA-GG-TGAA-AG------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----CCC-C-T---TTCCT----T---C----T------------G----TCT-GTCC
gi|91654                      :                  AGAATCT-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TG----CTG-----TCC-C-T---GTTCA----T---C----T------------G----TTT-GT
gi|91655                      :                   GAATGG-TGAA-GT------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TCA-----CCC-A-T---GTCTG----T---C----T------------G----CCT-GTC
gi|91656                      :                   GAATGG-TGAA-GG------G-GT----A------T------T--AA--G-TA----TAA-----CCC-C-G---GTCCA----T---C----A------------G----TTC-CTCC
gi|91657                      :                    AATGG-TGAA-GG------G--C----A------T------T--TA--G-TG----TTA-----CCC-C-C---TTCCG----G---C----T------------G----TTC-GTCTGTC
gi|91658                      :                    AATGG-TGAA-TG------G-GC----A------T------T--GA--G-TG----TTA-----CCC-C-----GTCTG----T---C----C------------A----TTC-CTCCGT
gi|91659                      :                    AATGG-TCAA-AA------G-GC----A------T------T--AA--G-TG----TGA-----CCC-C-T---GTGTG----T---A----T------------G----TCT-GTTCATC
gi|91660                      :                     ATGG-TGAC-GG------G-GC----G------T------T--AA--G-TT----TTA-----CTC-T-T---GTCCG----T---G----C------------G----TCC-GTCCGCC
gi|91661                      :                      TGG-TGAA-GG------G-GC----A------A------T--AA--G-TG----TTA-----TCT-C-C---GTTCG----T---T----C------------A----TTT-GCCCATC
gi|91663                      :                         -TAAA-GG------G-AC----A------T------T--AA--G-TG----TTA-----GCC-C-T---GTCTA----T---C----T------------G----TTT-GTCTGTC