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Reference ( gi|32084 )        :  GATAGAG--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGAAACAGTT
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gi|32182                      :   agAGAG--C--TTAATGCCA-------GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGTAGAGAGTT
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gi|32152                      :   agtGAG--T--TTCATGCCAACT----GATA----T----------TGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATTGAGAGAG
gi|32120                      :   agtGAG--T--TTCGTGCCAGTT----AATA----G----------GGTC----TGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGAGAGAGTT
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gi|32147                      :    ggGAG--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GATC----AGT-AG---TGG-T---G---A---AGTGAAGATCGTT
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gi|32102                      :  gagacAG--T--TTCGTGCCTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGG-T---G---A---CATGGAGA
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gi|32191                      :         --T--TCCACACCAATT----GACA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGAGAGAGTT
gi|32159                      :         --T--TTCGTGGAAAAT----GGTA----T----------GTTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGAGATAGTT
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Alignments
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Reference ( family-279 )      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32082                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAACT----GATA----T----------GGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GA
gi|32083                      : GAGAG--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGAC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GAAAGTTtcgtt
gi|32084                      : GATAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--AACAGTT
gi|32085                      : GAGAT--A--G--T--TTCGTGCCTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GAGAGTT
gi|32086                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGC-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--G
gi|32087                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32088                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCTGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TAAGGA--GATAGTT
gi|32089                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCTAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---AATGG---GAGAGTT
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gi|32091                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATC----GGTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--G
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gi|32097                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGT-T---G---A---CATTGA--G
gi|32098                      : GAGAG--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGAC----AGA-TG---TGA-T---G---A---TATAGA--GAGAGTT
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gi|32102                      : GAGAC--A--G--T--TTCGTGCCTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGG-T---G---A---CATGGA--GA
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gi|32107                      : GAGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTT-T---G---A---TATGGA--TGGAGTT
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gi|32109                      : GAGAT--A--G--T--TTTGTGCAAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AG---TAA-T---A---A---TATAGA--GATAGT
gi|32110                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----AATA----T----------GGCT----ATT-AA---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32111                      : GAGAG--A--A--T--TTTGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGC-AG---TAA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGTTt
gi|32112                      : GAGAG--A--G--T--TTTGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AT---TAA-T---A---A---CATAGA--GAGAGTT
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gi|32119                      : GAGAG--T--G--T--TTCGAGCCAATT----GTTA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGG
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gi|32122                      : GAAAG--G--G--T--TTCATACCAATT----GCTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---C---CTTTGA--GAGAGTTcaccgtt
gi|32123                      : GAGAT--A--T--T--TTGGTGCAAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-C---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32124                      : GAGTG--A--G--T--TTCCTGCCAATC----GATA----TNNNNNNNNNNGGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
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gi|32126                      : GAGAG--A--G--T--GTCATGCCTATT----GATA----C----------GGTC----AGT-AG---GAA-T---G---G---TATG
gi|32127                      : GAGAG--T--G--T--TTCGTGCCAATT----TATA----T----------TTTC----AGT-AG---TGA-A---G---A---CATGGA--GAAAGT
gi|32128                      : GAGAG--A--G--T--TTCATTCCAATT----GATA----T----------GGTA----AGC-AG---TAA-T---A---C---CATGGA--AA
gi|32129                      : GAGAG--A--T--T--TTGGTGCCTATA----GATA----T----------GGTC----AGT-AGTAATGA-T---G---A---AATGGA--GAGAGTT
gi|32130                      : GAAAC--A--G--T--TTCATGCCATTT----GATA----TTGTC------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32131                      : GAGTG--A--G--T--TCCATGTCAATC----GATA----A----------GGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGAA--GTGAGTT
gi|32132                      : GAGAG--A--T--T--TTTGTGCCAACT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTA-T---A---A---CATAGAGCGAGAGTT
gi|32133                      : GAAAG--A--G--T--TTGATGCAAATT----GTTA----T----------GGTC----AGC-AG---TGA-T---G---A---CATGCT--GAGAGTT
gi|32134                      : GAGAG--A--G--T--TT-GTGCCAACT----CATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTA-T---G---A-------GA--GGGAGTT
gi|32135                      : GAAAT--A--G--T--TTGGTGCTAATT----GTTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---AATGGT--GAGAGTTagtt
gi|32136                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTACTA-TT----GATA----T----------TGTC----AGT-AG---TAA-T---G---C---CATGGA--AAGAGTT
gi|32137                      : GAGAG--A--A--T--TTCATGCATATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-C---A---A---CATAGA--GA
gi|32138                      : GGGAG--A--G--T--TTCGTGCCGATG----AATA----T----------GGTC----ATT-AT---TGA-T---G---A---AATAGA--GAGAGTT
gi|32139                      : GAGAA--A--G--T--GCCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AG---TAA-T---A---A---TATACA--AAGAGT
gi|32145                      :  AGAG--A--G--T--TTCATGGTAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32146                      :  AGAG--A--G--T--GTCATGACAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATAAG--GATAGTT
gi|32147                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GATC----AGT-AG---TGG-T---G---A---AGTGAA--GA
gi|32148                      :  AGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTCAGA-AGT-AA---TAA-T---GCTTA---CATGGA--GAtcgtt
gi|32149                      :  AGAG--G--A--T--TTTATGCCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGTTttgtt
gi|32150                      :  AGAG--A--G--T--TCCGTGCCAATT----AACA----T----------GGTC----AGT-AG---AGA-T---A---A---CATAGA--GAAAGTT
gi|32151                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------TGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CAT
gi|32152                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAACT----GATA----T----------TGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATTGA--GAGAG
gi|32153                      :  AGAG--A--C--T--TTCGAGCTTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32154                      :  AGAGTTA--G--T--TTCGTGCCACTT----TATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATTGA--G
gi|32155                      :  AGTG--A--G--T--CTCATGCCAATA----GTTA----T----------TGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---GATGGA--GAGAGTT
gi|32156                      :  AAAG--A--G--T--GTTGTGCCAATT----AATA----T----------GGTC----ATT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--AAAAGTT
gi|32157                      :  AGAA--G--G--T--TTCATGCCAATC----GATA----C----------GGTC----TGT-AG---TGC-T---G---A---CATAAA--GAAAGTT
gi|32158                      :  AGAA--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GGTA----A----------AGTC----AGT-AG---TGA-A---A---A---CATGGA--AAGAGTT
gi|32159                      :  AGAG--A--TCCT--TTCGTGGAAAAT----GGTA----T----------GTTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GATAGTT
gi|32160                      :  AGAG--C--G--T--TTTGTGCCAACT----GATA----T----------TGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATTGA--GA
gi|32161                      :  AGAG--A--G--T--TTCGCAACAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---
gi|32162                      :  AGAG--A--G--T--TTTATTCCTGTT----GATG----T----------GGCC----AGA-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GGGAGTT
gi|32163                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGTCAATT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---C---CATTGA--AAAGGTT
gi|32168                      :   GAG--A--G--T--TTGATGCTAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32169                      :   GAG--A--G--T--TTTGTGCCAATT----AATA----T----------TGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--G
gi|32170                      :   GAA--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---TAT
gi|32171                      :   GAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGCC----AGT-AG---TTA-T---G---C---CATGTA--GTTAGTT
gi|32172                      :   GAG--A--G--T--TTCATGGCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGT
gi|32173                      :   GAG--A--G--T--TTCGTACTAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---T---A---TATAG
gi|32174                      :   GAG--C--G--T--TT-ATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AAT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--
gi|32175                      :   GAA--A--G--G--TTCGTGGCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---CGA-T---G---C---TATGGA--GA
gi|32176                      :   GAG--A--G--T--CTCGTGTTAATT----GATA----C----------GATC----AAT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--GA
gi|32177                      :   GAG--ACCG--T--TTTGTTTCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATGGA--AA
gi|32178                      :   GAG--A--G--TGATTCATACCACTT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TAA-T---G---A---CATTGA--AAGAGTTttgt
gi|32179                      :   GGG--A--G--T--TTCTTGACAACT----AATA----A----------GGTC----AAT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GACAGTT
gi|32181                      :    AG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---A---A---CATGGA--GAGGGTT
gi|32182                      :    AG--A--G--C--TTAATGCCA-------GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGTA--GAGAGTT
gi|32184                      :     G--A--G--T--TTTGTGCCAGTT----GATA----T----------GGTCAGTAAGT-AA---TGA-T---G---A---AATGGA--AATAGTT
gi|32186                      :      --A--G--T--TTCGTGCTAATT----GATA----C----------GTTC----AGT-AG---TGA-C---G---A---CACGGA--GAGAGTT
gi|32187                      :      --A--G--T--TTCGTGCCAATT----AAGA----T----------GGTC----AGT-AA---TAA-T---A---A---CATGGA--GAAAGTT
gi|32188                      :      --A--G--T--TTCTTGCCAATT----GATA----C----------GGTC----AAT-AG---TGC-A---G---A---TATGGA--
gi|32189                      :         --G--T--TTCATAGTAATT----GTTA----T----------GGTC----AGA-AG---TGA-T---G---A---TATGGG--GAGAGTTtatactt
gi|32190                      :            --T--TTCGTGCCTATCTATGGATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GATAGTT
gi|32191                      :            --T--TCCACACCAATT----GACA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32192                      :                  TCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTT----AGT-AG---CGG-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32193                      :                  TCATGCCAATT----GATA----G----------TGTC----AGT-AG---TAA-C---G---A---CATGGA--GA





Alignments
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Reference ( family-279 )      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
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gi|32083                      : GAGAG--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGAC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GAAAGTTtcgtt
gi|32084                      : GATAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--AACAGTT
gi|32085                      : GAGAT--A--G--T--TTCGTGCCTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GAGAGTT
gi|32086                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGC-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--G
gi|32087                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32088                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCTGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TAAGGA--GATAGTT
gi|32089                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCTAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---AATGG---GAGAGTT
gi|32090                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GAGAG
gi|32091                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATC----GGTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--G
gi|32092                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---CATTGA--GAGAGTT
gi|32093                      : GGGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GGTA----T----------AGTC----CGT-GG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32094                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCTAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AT---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32095                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGG-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32096                      : GAGAC--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATG
gi|32097                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGT-T---G---A---CATTGA--G
gi|32098                      : GAGAG--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGAC----AGA-TG---TGA-T---G---A---TATAGA--GAGAGTT
gi|32099                      : GAGGG--A--G--T--TTAATGCAAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGAT--GACAGTT
gi|32100                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AT---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32101                      : GAGAG--T--G--T--TTCAGGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGT-T---G---A---CATGAA--GA
gi|32102                      : GAGAC--A--G--T--TTCGTGCCTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGG-T---G---A---CATGGA--GA
gi|32103                      : GAAAG--A--G--T--TTCTTGCCAATT----CATA----T----------GGCC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32104                      : GAGAG--A--G--A--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGG-G---G---A---CATTGA--
gi|32105                      : GAGAG--A--G--T--TTCAGGCCAATT----AATA----T----------GATC----AGT-AG---TGA-T---G---A---ATTTGA--GAGAGTTcatactt
gi|32106                      : GAGAG--A--G--T--CTAATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATGAA--
gi|32107                      : GAGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTT-T---G---A---TATGGA--TGGAGTT
gi|32108                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCTATC----GATC----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---T---CATGGA--GAGGGTT
gi|32109                      : GAGAT--A--G--T--TTTGTGCAAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AG---TAA-T---A---A---TATAGA--GATAGT
gi|32110                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----AATA----T----------GGCT----ATT-AA---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32111                      : GAGAG--A--A--T--TTTGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGC-AG---TAA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGTTt
gi|32112                      : GAGAG--A--G--T--TTTGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AT---TAA-T---A---A---CATAGA--GAGAGTT
gi|32113                      : GAGTG--A--A--T--TTCGTGCAAATT----GATA----T----------GGTT----AGT-AG---TGG-T---G---A---CATGAA--GAGAGTT
gi|32114                      : GAGAA--G--G--T--GTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGAGTTAGG---A---TATGGA--GAGAG
gi|32115                      : GAGAG--A--A--T--TTCATACCAAAT----GATA----G----------TGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGC--GATAGT
gi|32116                      : GAGAG--A--G--T--TTGGTGCTAATT----GTTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---C---TATGGT--GAGAGTT
gi|32117                      : GAAAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-GG---TGG-T---G---A---CAAAGA--GAAAGTT
gi|32118                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------TGTT----AGTCAG---TAA-T---A---ATCTCATGAA--GACAGTT
gi|32119                      : GAGAG--T--G--T--TTCGAGCCAATT----GTTA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGG
gi|32120                      : GAGGG--A--G--T--TTCGTGCCAGTT----AATA----G----------GGTC----TGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGA--GAGAGTTtcagtagt
gi|32121                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGTCAGTT----GATATCGTT----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---A---A---TATGGA--
gi|32122                      : GAAAG--G--G--T--TTCATACCAATT----GCTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---C---CTTTGA--GAGAGTTcaccgtt
gi|32123                      : GAGAT--A--T--T--TTGGTGCAAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-C---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32124                      : GAGTG--A--G--T--TTCCTGCCAATC----GATA----TNNNNNNNNNNGGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32125                      : GAGAA--A--G--T--TTCATGACAATT----AATA----T----------GGTC----AGC-AA---TGA-T---G---A---
gi|32126                      : GAGAG--A--G--T--GTCATGCCTATT----GATA----C----------GGTC----AGT-AG---GAA-T---G---G---TATG
gi|32127                      : GAGAG--T--G--T--TTCGTGCCAATT----TATA----T----------TTTC----AGT-AG---TGA-A---G---A---CATGGA--GAAAGT
gi|32128                      : GAGAG--A--G--T--TTCATTCCAATT----GATA----T----------GGTA----AGC-AG---TAA-T---A---C---CATGGA--AA
gi|32129                      : GAGAG--A--T--T--TTGGTGCCTATA----GATA----T----------GGTC----AGT-AGTAATGA-T---G---A---AATGGA--GAGAGTT
gi|32130                      : GAAAC--A--G--T--TTCATGCCATTT----GATA----TTGTC------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32131                      : GAGTG--A--G--T--TCCATGTCAATC----GATA----A----------GGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGAA--GTGAGTT
gi|32132                      : GAGAG--A--T--T--TTTGTGCCAACT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTA-T---A---A---CATAGAGCGAGAGTT
gi|32133                      : GAAAG--A--G--T--TTGATGCAAATT----GTTA----T----------GGTC----AGC-AG---TGA-T---G---A---CATGCT--GAGAGTT
gi|32134                      : GAGAG--A--G--T--TT-GTGCCAACT----CATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTA-T---G---A-------GA--GGGAGTT
gi|32135                      : GAAAT--A--G--T--TTGGTGCTAATT----GTTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---AATGGT--GAGAGTTagtt
gi|32136                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTACTA-TT----GATA----T----------TGTC----AGT-AG---TAA-T---G---C---CATGGA--AAGAGTT
gi|32137                      : GAGAG--A--A--T--TTCATGCATATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-C---A---A---CATAGA--GA
gi|32138                      : GGGAG--A--G--T--TTCGTGCCGATG----AATA----T----------GGTC----ATT-AT---TGA-T---G---A---AATAGA--GAGAGTT
gi|32139                      : GAGAA--A--G--T--GCCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AG---TAA-T---A---A---TATACA--AAGAGT
gi|32145                      :  AGAG--A--G--T--TTCATGGTAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32146                      :  AGAG--A--G--T--GTCATGACAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATAAG--GATAGTT
gi|32147                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GATC----AGT-AG---TGG-T---G---A---AGTGAA--GA
gi|32148                      :  AGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTCAGA-AGT-AA---TAA-T---GCTTA---CATGGA--GAtcgtt
gi|32149                      :  AGAG--G--A--T--TTTATGCCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGTTttgtt
gi|32150                      :  AGAG--A--G--T--TCCGTGCCAATT----AACA----T----------GGTC----AGT-AG---AGA-T---A---A---CATAGA--GAAAGTT
gi|32151                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------TGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CAT
gi|32152                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAACT----GATA----T----------TGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATTGA--GAGAG
gi|32153                      :  AGAG--A--C--T--TTCGAGCTTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32154                      :  AGAGTTA--G--T--TTCGTGCCACTT----TATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATTGA--G
gi|32155                      :  AGTG--A--G--T--CTCATGCCAATA----GTTA----T----------TGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---GATGGA--GAGAGTT
gi|32156                      :  AAAG--A--G--T--GTTGTGCCAATT----AATA----T----------GGTC----ATT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--AAAAGTT
gi|32157                      :  AGAA--G--G--T--TTCATGCCAATC----GATA----C----------GGTC----TGT-AG---TGC-T---G---A---CATAAA--GAAAGTT
gi|32158                      :  AGAA--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GGTA----A----------AGTC----AGT-AG---TGA-A---A---A---CATGGA--AAGAGTT
gi|32159                      :  AGAG--A--TCCT--TTCGTGGAAAAT----GGTA----T----------GTTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GATAGTT
gi|32160                      :  AGAG--C--G--T--TTTGTGCCAACT----GATA----T----------TGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATTGA--GA
gi|32161                      :  AGAG--A--G--T--TTCGCAACAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---
gi|32162                      :  AGAG--A--G--T--TTTATTCCTGTT----GATG----T----------GGCC----AGA-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GGGAGTT
gi|32163                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGTCAATT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---C---CATTGA--AAAGGTT
gi|32168                      :   GAG--A--G--T--TTGATGCTAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32169                      :   GAG--A--G--T--TTTGTGCCAATT----AATA----T----------TGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--G
gi|32170                      :   GAA--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---TAT
gi|32171                      :   GAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGCC----AGT-AG---TTA-T---G---C---CATGTA--GTTAGTT
gi|32172                      :   GAG--A--G--T--TTCATGGCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGT
gi|32173                      :   GAG--A--G--T--TTCGTACTAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---T---A---TATAG
gi|32174                      :   GAG--C--G--T--TT-ATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AAT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--
gi|32175                      :   GAA--A--G--G--TTCGTGGCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---CGA-T---G---C---TATGGA--GA
gi|32176                      :   GAG--A--G--T--CTCGTGTTAATT----GATA----C----------GATC----AAT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--GA
gi|32177                      :   GAG--ACCG--T--TTTGTTTCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATGGA--AA
gi|32178                      :   GAG--A--G--TGATTCATACCACTT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TAA-T---G---A---CATTGA--AAGAGTTttgt
gi|32179                      :   GGG--A--G--T--TTCTTGACAACT----AATA----A----------GGTC----AAT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GACAGTT
gi|32181                      :    AG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---A---A---CATGGA--GAGGGTT
gi|32182                      :    AG--A--G--C--TTAATGCCA-------GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGTA--GAGAGTT
gi|32184                      :     G--A--G--T--TTTGTGCCAGTT----GATA----T----------GGTCAGTAAGT-AA---TGA-T---G---A---AATGGA--AATAGTT
gi|32186                      :      --A--G--T--TTCGTGCTAATT----GATA----C----------GTTC----AGT-AG---TGA-C---G---A---CACGGA--GAGAGTT
gi|32187                      :      --A--G--T--TTCGTGCCAATT----AAGA----T----------GGTC----AGT-AA---TAA-T---A---A---CATGGA--GAAAGTT
gi|32188                      :      --A--G--T--TTCTTGCCAATT----GATA----C----------GGTC----AAT-AG---TGC-A---G---A---TATGGA--
gi|32189                      :         --G--T--TTCATAGTAATT----GTTA----T----------GGTC----AGA-AG---TGA-T---G---A---TATGGG--GAGAGTTtatactt
gi|32190                      :            --T--TTCGTGCCTATCTATGGATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GATAGTT
gi|32191                      :            --T--TCCACACCAATT----GACA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32192                      :                  TCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTT----AGT-AG---CGG-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32193                      :                  TCATGCCAATT----GATA----G----------TGTC----AGT-AG---TAA-C---G---A---CATGGA--GA


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Reference ( family-279 )      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
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gi|32086                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGC-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--G
gi|32087                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32088                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCTGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TAAGGA--GATAGTT
gi|32089                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCTAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---AATGG---GAGAGTT
gi|32090                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GAGAG
gi|32091                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATC----GGTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--G
gi|32092                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---CATTGA--GAGAGTT
gi|32093                      : GGGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GGTA----T----------AGTC----CGT-GG---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32094                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCTAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AT---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32095                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCGATT----ATTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGG-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32096                      : GAGAC--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATG
gi|32097                      : GAGAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGT-T---G---A---CATTGA--G
gi|32098                      : GAGAG--A--G--T--TTCATACCAATT----GATA----T----------GGAC----AGA-TG---TGA-T---G---A---TATAGA--GAGAGTT
gi|32099                      : GAGGG--A--G--T--TTAATGCAAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGAT--GACAGTT
gi|32100                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AT---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32101                      : GAGAG--T--G--T--TTCAGGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGT-T---G---A---CATGAA--GA
gi|32102                      : GAGAC--A--G--T--TTCGTGCCTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGG-T---G---A---CATGGA--GA
gi|32103                      : GAAAG--A--G--T--TTCTTGCCAATT----CATA----T----------GGCC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32104                      : GAGAG--A--G--A--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGG-G---G---A---CATTGA--
gi|32105                      : GAGAG--A--G--T--TTCAGGCCAATT----AATA----T----------GATC----AGT-AG---TGA-T---G---A---ATTTGA--GAGAGTTcatactt
gi|32106                      : GAGAG--A--G--T--CTAATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATGAA--
gi|32107                      : GAGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTT-T---G---A---TATGGA--TGGAGTT
gi|32108                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCTATC----GATC----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---T---CATGGA--GAGGGTT
gi|32109                      : GAGAT--A--G--T--TTTGTGCAAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AG---TAA-T---A---A---TATAGA--GATAGT
gi|32110                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----AATA----T----------GGCT----ATT-AA---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32111                      : GAGAG--A--A--T--TTTGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGC-AG---TAA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGTTt
gi|32112                      : GAGAG--A--G--T--TTTGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AT---TAA-T---A---A---CATAGA--GAGAGTT
gi|32113                      : GAGTG--A--A--T--TTCGTGCAAATT----GATA----T----------GGTT----AGT-AG---TGG-T---G---A---CATGAA--GAGAGTT
gi|32114                      : GAGAA--G--G--T--GTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGAGTTAGG---A---TATGGA--GAGAG
gi|32115                      : GAGAG--A--A--T--TTCATACCAAAT----GATA----G----------TGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGC--GATAGT
gi|32116                      : GAGAG--A--G--T--TTGGTGCTAATT----GTTA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---C---TATGGT--GAGAGTT
gi|32117                      : GAAAG--A--G--T--TTCGTGCCAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-GG---TGG-T---G---A---CAAAGA--GAAAGTT
gi|32118                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------TGTT----AGTCAG---TAA-T---A---ATCTCATGAA--GACAGTT
gi|32119                      : GAGAG--T--G--T--TTCGAGCCAATT----GTTA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGG
gi|32120                      : GAGGG--A--G--T--TTCGTGCCAGTT----AATA----G----------GGTC----TGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGA--GAGAGTTtcagtagt
gi|32121                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTGTCAGTT----GATATCGTT----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---A---A---TATGGA--
gi|32122                      : GAAAG--G--G--T--TTCATACCAATT----GCTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---C---CTTTGA--GAGAGTTcaccgtt
gi|32123                      : GAGAT--A--T--T--TTGGTGCAAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-C---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32124                      : GAGTG--A--G--T--TTCCTGCCAATC----GATA----TNNNNNNNNNNGGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32125                      : GAGAA--A--G--T--TTCATGACAATT----AATA----T----------GGTC----AGC-AA---TGA-T---G---A---
gi|32126                      : GAGAG--A--G--T--GTCATGCCTATT----GATA----C----------GGTC----AGT-AG---GAA-T---G---G---TATG
gi|32127                      : GAGAG--T--G--T--TTCGTGCCAATT----TATA----T----------TTTC----AGT-AG---TGA-A---G---A---CATGGA--GAAAGT
gi|32128                      : GAGAG--A--G--T--TTCATTCCAATT----GATA----T----------GGTA----AGC-AG---TAA-T---A---C---CATGGA--AA
gi|32129                      : GAGAG--A--T--T--TTGGTGCCTATA----GATA----T----------GGTC----AGT-AGTAATGA-T---G---A---AATGGA--GAGAGTT
gi|32130                      : GAAAC--A--G--T--TTCATGCCATTT----GATA----TTGTC------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GA
gi|32131                      : GAGTG--A--G--T--TCCATGTCAATC----GATA----A----------GGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGAA--GTGAGTT
gi|32132                      : GAGAG--A--T--T--TTTGTGCCAACT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTA-T---A---A---CATAGAGCGAGAGTT
gi|32133                      : GAAAG--A--G--T--TTGATGCAAATT----GTTA----T----------GGTC----AGC-AG---TGA-T---G---A---CATGCT--GAGAGTT
gi|32134                      : GAGAG--A--G--T--TT-GTGCCAACT----CATA----T----------GGTC----AGT-AG---TTA-T---G---A-------GA--GGGAGTT
gi|32135                      : GAAAT--A--G--T--TTGGTGCTAATT----GTTA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---AATGGT--GAGAGTTagtt
gi|32136                      : GAGAG--A--G--T--TTCGTACTA-TT----GATA----T----------TGTC----AGT-AG---TAA-T---G---C---CATGGA--AAGAGTT
gi|32137                      : GAGAG--A--A--T--TTCATGCATATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-C---A---A---CATAGA--GA
gi|32138                      : GGGAG--A--G--T--TTCGTGCCGATG----AATA----T----------GGTC----ATT-AT---TGA-T---G---A---AATAGA--GAGAGTT
gi|32139                      : GAGAA--A--G--T--GCCATGCCAATT----GATA----T----------GGTC----ATT-AG---TAA-T---A---A---TATACA--AAGAGT
gi|32145                      :  AGAG--A--G--T--TTCATGGTAACT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32146                      :  AGAG--A--G--T--GTCATGACAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATAAG--GATAGTT
gi|32147                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GATC----AGT-AG---TGG-T---G---A---AGTGAA--GA
gi|32148                      :  AGAG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTCAGA-AGT-AA---TAA-T---GCTTA---CATGGA--GAtcgtt
gi|32149                      :  AGAG--G--A--T--TTTATGCCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGTTttgtt
gi|32150                      :  AGAG--A--G--T--TCCGTGCCAATT----AACA----T----------GGTC----AGT-AG---AGA-T---A---A---CATAGA--GAAAGTT
gi|32151                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------TGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CAT
gi|32152                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGCCAACT----GATA----T----------TGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATTGA--GAGAG
gi|32153                      :  AGAG--A--C--T--TTCGAGCTTATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TGA-T---G---A---CATGGA--GAGAATT
gi|32154                      :  AGAGTTA--G--T--TTCGTGCCACTT----TATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATTGA--G
gi|32155                      :  AGTG--A--G--T--CTCATGCCAATA----GTTA----T----------TGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---GATGGA--GAGAGTT
gi|32156                      :  AAAG--A--G--T--GTTGTGCCAATT----AATA----T----------GGTC----ATT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--AAAAGTT
gi|32157                      :  AGAA--G--G--T--TTCATGCCAATC----GATA----C----------GGTC----TGT-AG---TGC-T---G---A---CATAAA--GAAAGTT
gi|32158                      :  AGAA--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GGTA----A----------AGTC----AGT-AG---TGA-A---A---A---CATGGA--AAGAGTT
gi|32159                      :  AGAG--A--TCCT--TTCGTGGAAAAT----GGTA----T----------GTTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GATAGTT
gi|32160                      :  AGAG--C--G--T--TTTGTGCCAACT----GATA----T----------TGCC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATTGA--GA
gi|32161                      :  AGAG--A--G--T--TTCGCAACAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---
gi|32162                      :  AGAG--A--G--T--TTTATTCCTGTT----GATG----T----------GGCC----AGA-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--GGGAGTT
gi|32163                      :  AGTG--A--G--T--TTCATGTCAATT----GATG----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---C---CATTGA--AAAGGTT
gi|32168                      :   GAG--A--G--T--TTGATGCTAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32169                      :   GAG--A--G--T--TTTGTGCCAATT----AATA----T----------TGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--G
gi|32170                      :   GAA--A--G--T--TTCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---CGA-T---G---A---TAT
gi|32171                      :   GAG--A--G--T--TTCATGCCAATT----GATA----T----------GGCC----AGT-AG---TTA-T---G---C---CATGTA--GTTAGTT
gi|32172                      :   GAG--A--G--T--TTCATGGCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CTTTGA--GAGAGT
gi|32173                      :   GAG--A--G--T--TTCGTACTAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---T---A---TATAG
gi|32174                      :   GAG--C--G--T--TT-ATACCAATT----GATA----T----------GGTC----AAT-AG---TGA-T---G---A---CATGGA--
gi|32175                      :   GAA--A--G--G--TTCGTGGCAATT----GATA----T----------AGTC----AGT-AG---CGA-T---G---C---TATGGA--GA
gi|32176                      :   GAG--A--G--T--CTCGTGTTAATT----GATA----C----------GATC----AAT-AG---TGA-T---G---G---CATGGA--GA
gi|32177                      :   GAG--ACCG--T--TTTGTTTCAATT----GATA----T----------GGTC----AGT-GG---TGA-T---G---A---CATGGA--AA
gi|32178                      :   GAG--A--G--TGATTCATACCACTT----GATA----T----------GGTC----AGT-AA---TAA-T---G---A---CATTGA--AAGAGTTttgt
gi|32179                      :   GGG--A--G--T--TTCTTGACAACT----AATA----A----------GGTC----AAT-AG---TGA-T---G---A---CATAGA--GACAGTT
gi|32181                      :    AG--A--G--T--TTCGTGCCAATT----AATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---A---A---CATGGA--GAGGGTT
gi|32182                      :    AG--A--G--C--TTAATGCCA-------GATA----C----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---CATGTA--GAGAGTT
gi|32184                      :     G--A--G--T--TTTGTGCCAGTT----GATA----T----------GGTCAGTAAGT-AA---TGA-T---G---A---AATGGA--AATAGTT
gi|32186                      :      --A--G--T--TTCGTGCTAATT----GATA----C----------GTTC----AGT-AG---TGA-C---G---A---CACGGA--GAGAGTT
gi|32187                      :      --A--G--T--TTCGTGCCAATT----AAGA----T----------GGTC----AGT-AA---TAA-T---A---A---CATGGA--GAAAGTT
gi|32188                      :      --A--G--T--TTCTTGCCAATT----GATA----C----------GGTC----AAT-AG---TGC-A---G---A---TATGGA--
gi|32189                      :         --G--T--TTCATAGTAATT----GTTA----T----------GGTC----AGA-AG---TGA-T---G---A---TATGGG--GAGAGTTtatactt
gi|32190                      :            --T--TTCGTGCCTATCTATGGATA----T----------GGTC----AGT-AG---TGA-T---G---A---TATGGA--GATAGTT
gi|32191                      :            --T--TCCACACCAATT----GACA----T----------GGTC----AGT-AG---TAA-T---A---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32192                      :                  TCGTGCCAATT----GATA----T----------GGTT----AGT-AG---CGG-T---G---A---CATGGA--GAGAGTT
gi|32193                      :                  TCATGCCAATT----GATA----G----------TGTC----AGT-AG---TAA-C---G---A---CATGGA--GA