lowQualScore : 111
lowQualScore : 000 1 0 0 777 0 777 77 1
lowQualScore : ... . . . ... . ... .. .
lowQualScore : 666 1 6 9 666 8 777 66 3
consensus : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CCG---CCACTGCTGTCGACAGCAGTGG
Reference ( gi|45613 ) : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CTGCTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45614 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CTGCTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45637 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---T
gi|45635 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45610 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45609 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45638 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---T
gi|45636 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45622 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45621 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45620 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45619 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45692 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-ataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45691 : ccactgctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-
gi|45690 : ccactgctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-
gi|45689 : ccactgctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-
gi|45688 : ccactgctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-
gi|45687 : ccactgctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-
gi|45618 : ccactgctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---T
gi|45617 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tatactgccattgctgtcgacagcagtggc
gi|45676 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-atactgccattgctgtcgacagcagtggc
gi|45676 : gccactgctgtcgacagcaatggcagtatACTGCCAT---TGCTGTCGACAGCAGTGG-C-
gi|45675 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-atactgccactgctgtcgacagcaatagc
gi|45675 : gccactgctgtcgacagcaatggcagtatACTGCCAT---TGCTGTCGACAGCAGTGG-C-
gi|45592 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAatactgccactgctgtcgacagcaatagc
gi|45589 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45645 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tc
gi|45643 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtggc
gi|45602 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAataccgctattgctgtcgacagcagtggc
gi|45601 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAc
gi|45650 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG-C-GG---Tc
gi|45649 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagcagtggc
gi|45586 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCTATGataccgctattgctgtcgacagcagtggc
gi|45585 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCTATGc
gi|45640 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tc
gi|45639 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---Tatactgccattgctgtcgaaagcagtggc
gi|45678 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-atactgccattgctgtcgaaagcagtggc
gi|45677 : gccactgctttcgacagcaatggcagtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-
gi|45626 : gccactgctttcgacagcaatggcagtatACTGCCAT-A--GCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45626 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGG-C-AG---Tc
gi|45624 : ACTGCCAT-A--GCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGataccactattgctgtcgacagcagtggc
gi|45624 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGG-C-AG---Tc
gi|45594 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAataccactattgctgtcgacagcagtggc
gi|45593 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45591 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45590 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45628 : ACTGCCAT---TGCTGTTGACAGCAGTTG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45628 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGG-C-AG---Tc
gi|45627 : ACTGCCAT---TGCTGTTGACAGCAGTTG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGataccactattgctgtcgacagcagtggc
gi|45627 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGG-C-AG---Tc
gi|45608 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGG-C-ataccactattgctgtcgacagcagtggc
gi|45607 : acggccactgctgtcgacagcaatagtggtatACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGG-C-
gi|45588 : acggccactgctgtcgacagcaatagtggtatACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATG
gi|45587 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45616 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---Tc
gi|45615 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---Tataccgccattgctgccgacagcagtggc
gi|45604 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGG-C-ataccgccattgctgccgacagcagtggc
gi|45603 : acggccactgctgtcggcagcaatggcggtatACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGG-C-
gi|45680 : acggccactgctgtcggcagcaatggcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGG-C-
gi|45679 : gccacagctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGG-C-
gi|45597 : gccacagctgtcgacagcaatagcggtatACTGCCAT---TTCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGC
gi|45597 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGG-C-AG---Ttgtggc
gi|45595 : ACTGCCAT---TTCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCataccgctattgctgtcgacagctgtggc
gi|45595 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGG-C-AG---Ttgtggc
gi|45646 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---Tataccgctattgctgtcgacagctgtggc
gi|45644 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---Tataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45694 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGG-C-ataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45693 : ccactgctgtcgacagcaatggcgttatACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGG-C-
gi|45600 : ccactgctgtcgacagcaatggcgttatACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---TCACTGCTGTTGACAGCAATG
gi|45599 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---TCACTGCTGTTGACAGCAATGc
gi|45634 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGG-C-c
gi|45633 : attACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGG-C-ataccactattgctgtcgacagc
gi|45612 : attACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATGataccactattgctgtcgacagc
gi|45611 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATGc
gi|45642 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTCTGGACAGCAATAc
gi|45642 : ACTGCCAT---TGCTGTTGACAGCAGTTG-C-AG---Tc
gi|45641 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTCTGGACAGCAATAataccgctattgctctggacagcaatagc
gi|45641 : ACTGCCAT---TGCTGTTGACAGCAGTTG-C-AG---Tc
gi|45598 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGG-C-AG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGataccgctattgctctggacagcaatagc
gi|45598 : ACTGCCAT-A--GCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---Tc
gi|45596 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGG-C-AG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGataatgccaccactgctgtcgacagcaatggc
gi|45596 : ACTGCCAT-A--GCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---Tc
gi|45606 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGG-C-AAT--TAT--CGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATGataatgccaccactgctgtcgacagcaatggc
gi|45605 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGG-C-AAT--TAT--CGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45664 : ACTGCCAT---TGCTGTCGACAGCAGTGGCC-GA---TA-A-TTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45661 : ACTGCCAT---TGCTGTCGACAGCAGTGGCC-GA---TA-A-TTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45632 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGG-C-AGT--TAT--CGG---CCACTGCTTTCGACAGCAATGc
gi|45632 : ACTGCCAT---TTCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---Tc
gi|45631 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGG-C-AGT--TAT--CGG---CCACTGCTTTCGACAGCAATGtatcggccactgctttcgacagcaatggc
gi|45631 : ACTGCCAT---TTCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---Tc
gi|45634 : TACCACTATTGCTGTCGACAGCtatcggccactgctttcgacagcaatggc
gi|45633 : attgccattgctgtcgacagcagtggcagtaTACCACTATTGCTGTCGACAGC
gi|45612 : attgccattgctgtcgacagcagtggcagtaTACCGCCATTGCTGTCGACAGCA
gi|45611 : actgcaccTACCGCCATTGCTGTCGACAGCAtacggccactgctgtcggcagcaatggc
gi|45696 : actgcaccTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-tacggccactgctgtcggcagcaatggc
gi|45695 : gtcgacagcaatagcggtataaTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-
gi|45663 : gtcgacagcaatagcggtataaTACCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAG-C-GG---T
gi|45660 : TACCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAG-C-GG---Ttactgccattgctgttgacagc
gi|45637 : CCACTATTGCTGTCGACAGCAGCAG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGtactgccattgctgttgacagc
gi|45635 : aCCACTATTGCTGTCGACAGCAGCAG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45638 : aCCACTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45636 : aCCACTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45622 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45621 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45620 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45619 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45618 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45617 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45645 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45643 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45658 : aCCACTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CTATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45657 : aCCACTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CTATTGCTGCCGACAGCAGTG
gi|45650 : aCCGCTATTGCTGCCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45649 : aCCGCTATTGCTGCCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45640 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGAAAGCAGTGc
gi|45639 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGAAAGCAGTGc
gi|45656 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45655 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45654 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45653 : aCCGCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45616 : aCCGCCATTGCTGTCAACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45615 : aCCGCCATTGCTGTCAACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45646 : aCCGCCATTGCTGTCGACAGCAGGTG-C-AG---TATA-ACG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45644 : aCCGCCATTGCTGTCGACAGCAGGTG-C-AG---TATA-ACG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45630 : aCCGCCATTGCTGTCAACAGCAGTGA-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCAACAGCAGTG
gi|45629 : aCCGCCATTGCTGTCAACAGCAGTGA-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCAACAGCAGTGc
gi|45648 : aCCGCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATT-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45647 : aCCGCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATT-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45674 : aCCGCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCGACAGCc
gi|45673 : CCGCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCGACAGC
gi|45662 : CCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATA
gi|45659 : aCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAc
gi|45663 : aCCGCTATTGCTGTCCAGAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCATTGCTGTTGACAGCc
gi|45660 : aCCGCTATTGCTGTCCAGAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCATTGCTGTTGACAGC
gi|45614 : aCTATTGCTGTCGACAGCAGCAG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45637 : actgccaCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CTGCTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45635 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CTGCTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45610 : accaCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CTATTGCTGCCGACAGCAGTG
gi|45609 : actgccaCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CTATTGCTGCCGACAGCAGTG
gi|45638 : actgccaCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45636 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45622 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45621 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45620 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45619 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45692 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45692 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45691 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45691 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45690 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45690 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45689 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45689 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45688 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45688 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45687 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45687 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45618 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45617 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45676 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45676 : gCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45675 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45675 : gCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45592 : gCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45589 : actgCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45645 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45643 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45658 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATAG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45657 : accaCCACTGCTGTCGGCAGCAATAG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45602 : accaCTATTGCTGCCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
gi|45601 : actgCTATTGCTGCCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45650 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAc
gi|45649 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAc
gi|45586 : accgCCATAGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45585 : actgCCATAGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45640 : actgCCACTGCTTTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45639 : accgCCACTGCTTTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45678 : accgCCACTGCTTTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45678 : gCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGAAAGCAGTGc
gi|45677 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGG-C-AG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45677 : gCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CTG---CCATTGCTGTCGAAAGCAGTGc
gi|45626 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCTATGc
gi|45624 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCTATGc
gi|45594 : actgCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45593 : actgCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45591 : actgCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45590 : actgCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45628 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CAACTGCTGTCAACAGCAATGc
gi|45627 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CAACTGCTGTCAACAGCAATGc
gi|45608 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CAACTGCTGTCAACAGCAATGc
gi|45608 : acggCCATTGCTGTTGACAGCAGTTG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45607 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CAACTGCTGTCAACAGCAATGc
gi|45607 : acggCCATTGCTGTTGACAGCAGTTG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45588 : acggCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGCAc
gi|45587 : actgCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCAGCAc
gi|45656 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45655 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45654 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45653 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45616 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTTGACAGCAATGc
gi|45615 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTTGACAGCAATGc
gi|45604 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTTGACAGCAATGc
gi|45604 : acggCCATTGCTGTCAACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45603 : acggCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTTGACAGCAATGc
gi|45603 : acggCCATTGCTGTCAACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45680 : acggCCACAGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGAAATGc
gi|45680 : gCCATTTCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCc
gi|45679 : gccacaCCACAGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGAAATGc
gi|45679 : gCCATTTCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTGTCGACAGCc
gi|45597 : gccacaCCACAGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGAAATGc
gi|45595 : actgCCACAGCTGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGAAATGc
gi|45646 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-GT---TATA-CTG---CACCTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45644 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-GT---TATA-CTG---CACCTGCTGTCGACAGCAATG
gi|45694 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-GT---TATA-CTG---CACCTGCTGTCGACAGCAATG
gi|45694 : CCATTGCTGTCGACAGCAGGTG-C-AG---TATA-ACG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45693 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-GT---TATA-CTG---CACCTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45693 : CCATTGCTGTCGACAGCAGGTG-C-AG---TATA-ACG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45600 : CCATTGCTGTCAACAGCAGTGA-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCAACAGCAGTGc
gi|45599 : actgCCATTGCTGTCAACAGCAGTGA-C-AG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCAACAGCAGTGc
gi|45634 : actgCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGCc
gi|45633 : attgCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-C-AG---TATA-CCA---CTATTGCTGTCGACAGC
gi|45630 : attgCCACTGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---TCACTGCTGTTGACAGCAATG
gi|45629 : accgCCACTGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CTG---TCACTGCTGTTGACAGCAATGc
gi|45612 : accgCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCGACAGCAc
gi|45611 : actgcaccCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATA-CCG---CCATTGCTGTCGACAGCAc
gi|45648 : actgcaccCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---AATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATGc
gi|45647 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---AATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATGc
gi|45625 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---AATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATGc
gi|45625 : acggCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATT-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45623 : acggCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---AATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATGc
gi|45623 : acggCCATTGCTGCCGACAGCAGTGG-C-CG---TATT-CCG---CCATTGCTGCCGACAGCAGTGc
gi|45674 : acggCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---c
gi|45673 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGG-C-GG---ccgtataccgccattgctgtcgacagc
gi|45662 : CTATTGCTGCCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCCAGAGCAATAccgtataccgccattgctgtcgacagc
gi|45659 : accgCTATTGCTGCCGACAGCAGTGG-T-GGCAGTATA-CCG---CTATTGCTGTCCAGAGCAATAc
gi|45642 : accgCTATTGCTGTCCAGAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCATTGCTGTTGACAGCAGTc
gi|45641 : actgcaCTATTGCTGTCCAGAGCAATAG-C-GG---TATA-CTG---CCATTGCTGTTGACAGCAGTc
gi|45598 : actgcaCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CTG---CCATAGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45596 : actgCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CTG---CCATAGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45696 : actgCTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACc
gi|45695 : CTATTGCTGTCGACAGCAGTGG-T-GGCATTATA-CCG---CTATTGCTGTCGACc
gi|45606 : CCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-CCGA---TA-A-TTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45605 : actgCCATTGCTGTCGACAGCAGTGG-CCGA---TA-A-TTG---CCATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45664 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-AA---T-TATCGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45661 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATGG-C-AA---T-TATCGG---CCACTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45652 : actgCTATTGCTGTCGACAGCTGTGGCC-GA---TA-A-CCG---CCATTGCTGTCAACAGCAGTc
gi|45651 : actgtcCTATTGCTGTCGACAGCTGTGGCC-GA---TA-A-CCG---CCATTGCTGTCAACAGCAGTc
gi|45632 : actgtcCCATTGCTGTCGAAAGCAGTGG-CCGA---TA-A-CTG---CCATTTCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45631 : actgCCATTGCTGTCGAAAGCAGTGG-CCGA---TA-A-CTG---CCATTTCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45682 : actgCCACTGCTTTCGACAGCAATGG-C-AGT--TAT--CGG---CCACTGCTTTCGACAGCAATGc
gi|45682 : gCCATTGCTGTCGAAAGCAGTGG-CCGA---TA-A-CTG---CCATTGCTGTCGAAAGCAGTGc
gi|45681 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGG-C-AGT--TAT--CGG---CCACTGCTTTCGACAGCAATGc
gi|45681 : gCCATTGCTGTCGAAAGCAGTGG-CCGA---TA-A-CTG---CCATTGCTGTCGAAAGCAGTGc
gi|45652 : gCACTGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---T-TATCGG---CCACAGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45651 : actgtCACTGCTGTTGACAGCAATGG-C-GG---T-TATCGG---CCACAGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45634 : actgtGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATGc
gi|45633 : attgGCTGTCGACAGCAATAG-T-GG---TATA-CTG---CCACTGCTGTCGACAGCAATG
gi|45674 : attgGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATG
gi|45673 : ccgGCTGTCGACAGCAATGG-C-GG---TATA-CGG---CCACTGCTGTCGGCAGCAATG
gi|45663 : ccgGCTGTCAACAGCAATGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTCTGGACAGCAATA
gi|45660 : accgGCTGTCAACAGCAATGG-C-AG---TATA-CCG---CTATTGCTCTGGACAGCAATA
gi|45696 : accgGTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATA
gi|45695 : GTCGACAGCAATAG-C-GG---TATA-ATGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAc
gi|45696 : G---CTATTGCTGTCGACAGCAGTGc
gi|45695 : gtcgacagcaatagcggtataatgccaG---CTATTGCTGTCGACAGCAGTG
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 444 55 5
lowQualScore : . ... .. .
lowQualScore : 9 888 00 4
consensus : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
Reference ( family-278 ) : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAGTGG
gi|45585 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGG
gi|45586 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45587 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45588 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45589 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45590 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45591 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45592 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45593 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45594 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45595 : CCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45596 : actgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGGCAGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45597 : CCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45598 : actgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGGCAGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45599 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45600 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45601 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45602 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45603 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45604 : acggCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45605 : acggACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45606 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45607 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45608 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45609 : acggACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45610 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45611 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45612 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45613 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45614 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45615 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGG
gi|45616 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45617 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45618 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45619 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45620 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45621 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45622 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45623 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45624 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45625 : actgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45626 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45627 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45628 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45629 : actgCCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45630 : accgCCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45631 : accgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45632 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45633 : GCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45634 : attgGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45635 : attgA---CC-ACTATTGCTGTCGACAGCAG
gi|45635 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGcagcagtataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45636 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45637 : accaA---CC-ACTATTGCTGTCGACAGCAG
gi|45637 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGcagcagtataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45638 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45639 : accaCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45640 : accgCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45641 : accgACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45642 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45643 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45644 : accgA---CC-GCCATTGCTGTCGACAGCAGc
gi|45644 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGgtgcagtataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45645 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45646 : accgA---CC-GCCATTGCTGTCGACAGCAGc
gi|45646 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGgtgcagtataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45647 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45648 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45649 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45650 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45651 : accgCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGT-TA---TCGGCCACAGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45652 : actgtCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGT-TA---TCGGCCACAGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45653 : actgtCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45654 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45655 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45656 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45657 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45658 : accaCCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45659 : accaCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG
gi|45660 : aCCGCTATTGCTGTCCAGAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCATTGCTGTTGACAGCc
gi|45661 : aCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45662 : actgCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45663 : aCCGCTATTGCTGTCCAGAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCATTGCTGTTGACAGCc
gi|45664 : aCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45673 : actgGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45674 : ccgGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45675 : ccgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45676 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45677 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45678 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45679 : gCCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45680 : gCCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45681 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45682 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45687 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45688 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45689 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45690 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45691 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45692 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45693 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45694 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45695 : GTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45696 : GTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 444 44
lowQualScore : . ... ..
lowQualScore : 8 888 77
consensus : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
Reference ( family-278 ) : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45585 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGG
gi|45586 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45587 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45588 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45589 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45590 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45591 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45592 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45593 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45594 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45595 : CCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45596 : actgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGGCAGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45597 : CCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45598 : actgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGGCAGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45599 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45600 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45601 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45602 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45603 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45604 : acggCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45605 : acggACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45606 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45607 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45608 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45609 : acggACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45610 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45611 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45612 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45613 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45614 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45615 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGG
gi|45616 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45617 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45618 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45619 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45620 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45621 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45622 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45623 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45624 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45625 : actgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45626 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45627 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45628 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45629 : actgCCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45630 : accgCCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45631 : accgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45632 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45633 : GCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45634 : attgGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45635 : attgA---CC-ACTATTGCTGTCGACAGCA
gi|45635 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGgcagcagtataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45636 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45637 : accaA---CC-ACTATTGCTGTCGACAGCA
gi|45637 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGgcagcagtataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45638 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45639 : accaCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45640 : accgCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45641 : accgACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45642 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45643 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45644 : accgA---CC-GCCATTGCTGTCGACAGCAc
gi|45644 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGggtgcagtataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45645 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45646 : accgA---CC-GCCATTGCTGTCGACAGCAc
gi|45646 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGggtgcagtataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45647 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45648 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45649 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45650 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45651 : accgCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGT-TA---TCGGCCACAGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45652 : actgtCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGT-TA---TCGGCCACAGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45653 : actgtCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45654 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45655 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45656 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45657 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45658 : accaCCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45659 : accaCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG
gi|45660 : aGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45661 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45662 : actgCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45663 : aGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45664 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45673 : actgGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45674 : ccgGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45675 : ccgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45676 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45677 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45678 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45679 : gCCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45680 : gCCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45681 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45682 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45687 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45688 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45689 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45690 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45691 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45692 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45693 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45694 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45695 : GTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45696 : GTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
blockSeqs : C CTG CG
blockSeqs : C ATG CG
blockSeqs : C ATG CG
blockSeqs : C CTG CG
blockSeqs : C ATG CG
blockSeqs : C ATG CG
blockSeqs : C ATG CG
blockSeqs : C ATG CG
blockSeqs : C CTG CG
blockSeqs : C CTG CG
blockSeqs : C CTG T
blockSeqs : C CTG T
blockSeqs : C CTG T
blockSeqs : C CTG C
blockSeqs : C ATG C
blockSeqs : C ATG C
blockSeqs : C ATG C
blockSeqs : C ATG C
blockSeqs : C CTG C
blockSeqs : C CTG T
blockSeqs : C ATG C
blockSeqs : C ATG T
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . G
blockSeqs : C . G
blockSeqs : C . G
blockSeqs : C . G
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . G
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . G
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : T . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : T . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . T
blockSeqs : C . C
blockSeqs : C . C
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . C
blockSeqs : . C
blockSeqCons :
originalCons : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
finalCons : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 444 44
lowQualScore : . ... ..
lowQualScore : 8 888 77
consensus : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
Reference ( family-278 ) : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CC-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45585 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGG
gi|45586 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45587 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45588 : ACTGCTGC---TGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45589 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45590 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45591 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45592 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45593 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45594 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45595 : CCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45596 : actgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGGCAGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45597 : CCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45598 : actgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCTATGGCAGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45599 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45600 : ACTGCCAC---TGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45601 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45602 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45603 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45604 : acggCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45605 : acggACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45606 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45607 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45608 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45609 : acggACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45610 : ACTGCCACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45611 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45612 : ACTGC-ACC--TGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45613 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45614 : ACTGCCACCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45615 : CCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGG
gi|45616 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45617 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45618 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45619 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45620 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45621 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45622 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45623 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45624 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45625 : actgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45626 : acggCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCTATGGc
gi|45627 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45628 : actgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCAACTGCTGTCAACAGCAATGGc
gi|45629 : actgCCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45630 : accgCCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGTATA---CT-GTCACTGCTGTTGACAGCAATGGc
gi|45631 : accgACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45632 : ACTGCCAC---TGCTGTCGACAGAAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45633 : GCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45634 : attgGCTGTCGACAGCAATAGTGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45635 : attgA---CC-ACTATTGCTGTCGACAGCA
gi|45635 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGgcagcagtataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45636 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45637 : accaA---CC-ACTATTGCTGTCGACAGCA
gi|45637 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCTGCTGCTGTCGACAGCAATAGgcagcagtataccgctattgctgtcgacagcagtgg
gi|45638 : accaCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45639 : accaCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45640 : accgCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45641 : accgACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45642 : ACTGC-A--ACTGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45643 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45644 : accgA---CC-GCCATTGCTGTCGACAGCAc
gi|45644 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGggtgcagtataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45645 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45646 : accgA---CC-GCCATTGCTGTCGACAGCAc
gi|45646 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGggtgcagtataacgccattgctgtcgacagcagtgg
gi|45647 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45648 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGCGGAATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45649 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45650 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45651 : accgCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGT-TA---TCGGCCACAGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45652 : actgtCACTGCTGTTGACAGCAATGGCGGT-TA---TCGGCCACAGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45653 : actgtCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45654 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45655 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45656 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45657 : accgCCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45658 : accaCCACTGCTGTCGGCAGCAATAGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45659 : accaCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAG
gi|45660 : aGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45661 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45662 : actgCCGCTATTGCTCTGGACAGCAATAGCGGTATACTGCC-ACCACTGCTGTCGGCAGCAATAGc
gi|45663 : aGCTGTCAACAGCAATGGCAGTATA---CC-GCTATTGCTCTGGACAGCAATAGc
gi|45664 : accgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAAT-TA---TCGGCCACTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45673 : actgGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGGc
gi|45674 : ccgGCTGTCGACAGCAATGGCGGTATA---CG-GCCACTGCTGTCGGCAGCAATGG
gi|45675 : ccgCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45676 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45677 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45678 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45679 : gCCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45680 : gCCACAGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGAAATGGc
gi|45681 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45682 : gCCACTGCTTTCGACAGCAATGGCAGT-TA---TCGGCCACTGCTTTCGACAGCAATGGc
gi|45687 : gCCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45688 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45689 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45690 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45691 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45692 : CCACTGCTGTCGACAGCAATAGCGGTATA---CT-GCCACTGCTGTCGACAGCAATAG
gi|45693 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGG
gi|45694 : CCACTGCTGTCGACAGCAATGGCGTTATA---CT-GCACCTGCTGTCGACAGCAATGGc
gi|45695 : GTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc
gi|45696 : GTCGACAGCAATAGCGGTATAATGCC-ACCACTGCTGTCGACAGCAATAGc