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lowQualScore                  :            333    5555    2 4   00  4       4 22222    4     00       7777  8 777     4     0000 77  55 2    0  0  
consensus                     : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
Reference ( gi|4903 )         : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATCTTGTAT
gi|4904                       : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-A
gi|4902                       : AATATTAAACG-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4905                       : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATA
gi|4913                       : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GA-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATAc
gi|4917                       : AATATTAAACG-G-GCCT----AATG-T-TTTTTTC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-c
gi|4911                       : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACC--AAAAATT-GG-GT-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-A
gi|4901                       : AACATTAAACT-A-GCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-TAT--acgttat
gi|4915                       : AACATTAAACT-T-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----ATGA-AAACA--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4927                       : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACC-G-----ATGA-AAACT--CAGAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTC----A-AGT--
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gi|4919                       : AACCTTAAACT-A-GCCA----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAATT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-A
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gi|4924                       : AACATTAAACT-A-TCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-G-----ATGA-AAACT--CAAACTT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----
gi|4937                       : AACATTTAACT-G-GTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACTC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-TG-GC-A---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttatttacattgtat
gi|4930                       : AACATTAAATT-G-GCCT----AATGGT-TTT--CC-ATCACCC-C-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GTAT---TTTAA-TCCTT----A-tttcattat
gi|4908                       : AACATTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCGCCC-G-----TTGA-AAACTA-AAAAAAT-GG-GC-T---TTTAA-TTCTT----A-AAT--A-A
gi|4938                       : AACATTAAACT-A-GACT----ACTG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--acgtaatat
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gi|4929                       : AGCATTAAAAT-A-GGCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATAA-AAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----
gi|4944                       : AGCATTAAACT-G-GTCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAATT--CAAAATA-CA-AC-T---TTTAA-TCTTT----A-Agtattgacattatat
gi|4934                       : AACATTAAACT-A-GACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAG-CTCTT-------AT--T-ATACTTTATA
gi|4918                       : AACATTAAACT-A-GTCT----AATG-T-TTT--TC-ATAACCC-G-----ATTA-AAACC--CAAAAGT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--
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gi|4952                       : AACACTAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATTTACC-G-----ATGA-AAACT--AAAAATT-GG-AC-T---TTTAG-TCCTT----A-Acataaaacatataata
gi|4922                       : AACATTAAACT-A-GCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTT-C-----ATGA-AAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTTA-TACTT----A-TAT--
gi|4912                       : AACAATAAACT-G-GTCT----AATG-T-TTT--TA-ATCACCC-A-----ATGA-AAACT--CCAAATT-CT-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-TAT--ttacattata
gi|4948                       : AACATAAAACT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAATC-G-----ATGA-AAATT--CAAAATT-CG-AC-T---TTAAA-TCA-T----A-AATTAA-ATAttacatt
gi|4946                       : AACATTAAACT-A-GCCA----AATG-T-TCT--TC-ATCACCA-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCGTC----A-Acagtata
gi|4942                       : AACATTAAACT-T-GTCT----AATG-C-TTT--TC-ATCATCC-A-----ATGA-AAACT--CAAAATA-CA-CC-T---TTTAA-TCCTT----ATATT--A-ACAT
gi|4954                       : AGCATTAAACT-G-GCCT----AATA-T-TTT---C-ATCACCC-A-----AAGA-AAACT--AAAAATT-GG-TC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAtatat
gi|4910                       : AACATTAAACG-G-GCCT----AATG-T-TTA--TC-AGCACCT-A-----ATGA-CATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCCTT----A-Agata
gi|4947                       : AACATTAAACT-A-GCCT----AATG-T-TCT--CC-ATCACCC-G-----ACGA-AAACT--CAAAATTGTG-TC-C---TTCAG-TCATT----A-AAT--
gi|4925                       : AACATTAAACT-G-GCGT----ATTT-T-TTT--TC-ATCGCCA-G-----ATAA-AAACT--AAAAATT-C--AC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ATAgcaacacatt
gi|4949                       : AACTTTAAACT-A-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----AAGA-AAACT--CAACATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-
gi|4951                       : AACAATAAACT-A-GCCT----AATG-C-TTT--TC-ATCACCC-A-----ATGA-AAACT--C-AAATA-CG-GC-T---TTTA
gi|4955                       : AACATTAAACT-A-GCAT----AATG-T-T-----C-ATCACCT-G-----ATAA-AAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-TTCTC----A-AAT--A-
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gi|4914                       : AACATTAA--T-AAGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----TTAA-AAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--gttgcatatttagatat
gi|4906                       : AACATTAA--T-AAGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----TTAA-AAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--ttacattatat
gi|4950                       : AACATTAAAAT-G-GACT----AATG-T-TTT--TC-ACCAACA-A-----ATGA-AAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|4945                       : AACATTAAACT-A-GATT----ACTG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATAT-AAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--ttacatta
gi|4963                       : AACATTAATCG-G-GACA----AATG-T-TTT--AC--TCACCG-G-----ATAA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-AGT--ctacattttat
gi|4958                       : AACATAATATA-A-GCCT----TATA-G-TTT--TC-ACTACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCC
gi|4956                       : AACTTTAAACT-G-GACT----AATG-T-TTT--TC-ATCAC---------ATG----ACT--CAAAATT-GG-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--
gi|4960                       : AACATTAAACT-A-GATT----TATG-T-CTT--TC-GTTACCC-G-----ATGA-AAACA--TAAAATT-CT-GC-T---TTTAA-Tttacattata
gi|4953                       : AACATTAAACT-A-GTCT----AATG-T-TAT--TT-ATCAACT-A-----ATGA-AAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-CACTT----A-TAT--agttacatttacttaatat
gi|4961                       : AAAATTAAACA-A-GTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----ATGA-AA--T-----AATT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTC----A-AAttacattatat
gi|4966                       : AACATTAAACA-C-TCCT----GATG-T-TTT--TC-ACCACTC-G-----ACGA-AAACT--C-AAATT-TGTGC-A---TTTAA-TCCTC----A-
gi|4965                       : AACAATAAACTTG-GCTT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-ACACTAAAAAAATT--G-GT-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--
gi|4962                       : AACATTAAACA-A-GCCT----AATA-A-TTT--TC-ATCATCC-G-----AGGA-AAACT--CAAGCCT-TT-AC-A---TTTAA-TCCTA----A-AAT--A-Attacatttat
gi|4970                       : AACACAAAACT-G-GA-T----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-T-----CTGA-AAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAacgtta
gi|4964                       : AACATCAAACT-G-TCTT----AGTT-T-TTT--TT-ATCACGC-A-----ATTA-AA-CT--CATAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCCT-------AAT--A-
gi|4933                       : AACATTAA-------CCT----AG-G-T-TTT--CC-ATCACCC-T-----ATGA-AAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTTA-TCGTT----A-TAT--tttaattatat
gi|4957                       : AACAGTAAACT-A-CACTTAGTAATG-AATTT--TC-GTCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAAGT-GT-GT-T---TTAAA-TCCTT----A-AAT--A-Attaaattaaat
gi|4931                       : AATATTAAACT-A-GTCT----TATA-A-TTT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAAaca
gi|4968                       : AACATTAAGCT-A-GATT----AATA-T-TTT--T--ATCACCA-G-----ATGA-AAACT--CAAGATT-GT-GC-T---TTAAA-T
gi|4928                       : AAAATTAAACT-A-GTCC----CATG-T-TTT--TA-ATTACCC-G-----ATAA-AAACA--AAAAATT-CG-GC-T---atttctatttacatcatat
gi|4972                       : AATACCAAAAT-A-ACCT----GATG-T-TTT--TA-ATCACCC-G-----ATGG-AAACT--CAAA--T-GT-GT-T---TCTAT-TCCTT----A-ATT--A-A
gi|4969                       : AACATTAAA-T-A----T----GATG-T-TTT-----ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TATTT----A-TAT--aca
gi|4973                       : AACATTAACCT-A-AACA----AATG-T-TTT--TC-ATCATTA-G-----ATGA-AAACA--CAAAATT-GT-GC-T---TTttacatt
gi|4971                       : AACATTAACTT-A-GTCT----TATGCT-TTT--TA-ATCACCC-A-----ATGA-ATACT--CAAAATT-CG-ACATATATGTAATTCCTT----A-TAT--gattactgatatttacattat
gi|4967                       : AGCATTCAACT-A-GACT----ACTG-T-TTT-----ATCACCC-T-----ACGA-AAACT--C-AAATC-TGTGC-T---CTAAA-TCCTT----A-TAT--ttacat
gi|4978                       :  ACATAAAACT-C-GCCTTA--AAT--T-TTT--TC-ATCACTG-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTCAA-TCCTT----G-AAT--A-ttacattatat
gi|4977                       :  ACATTAAACT-A-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCA-T-----ATG----ACT--AAAGATT----GC-----TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4979                       :  ACATTTAACT-A-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAGCC-GTC---ATGA-AAACT--CAAAATT-GT-GC-T---ATAAT-TCCTG----T-AAT--A-A
gi|4981                       :  ACATTAAACT-A-GCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAACT-GTC---CTGA-AAACT--CAAAATT-GT-AC-T---ATCAT-TCTTG----A-AAT--A-Aacat
gi|4983                       :  ACATTGAACT-A-GCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-GCC---ATAA-AAACT--CCAAATT----GT-T---CTTAT-TCCTA----A-AAaca
gi|4980                       :  ACATTGAACT-A-GCCT----AAAG-T-TTTC-TC-ATCAACT-GTC---ATGA-AAACT--CAAAATT----GT-T---CT--A-TCCTTCCTGA-AAT--A-
gi|4984                       :  ACAATAAACT-A-TCCT-------G-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----ATCA-AAACT--CAAAATT-AT-GC-T---ACCAT-TCCTG----A-AAT--A-Atacat
gi|4989                       :   CATTAAACT-A-GCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----ATGA-AAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--aca
gi|4991                       :   CATTAAACT-A-GACT----ATTG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----ATGA-AAGCT--CAAAATA-TT-GC-T---TTTGA-TACTT----A-TAT--T-ATAttacattatat
gi|4990                       :   CATTTAATT-A-ACCT----AATG-T-TTT--TT-GTCACCC-A-----ATGA-AAACT--CAAAAAT-GG-GA-T---TTCAA-TCCTA----A-AGT--attaacattatat
gi|4992                       :   CATTAA-CT-G-GCCT----AATG-T-----------CACCC-G-----A--ATAAATT--CAAAATT-AG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--
gi|4993                       :    ATTAAACT-A-GCCT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCCCG-----ATGA-AAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AA---A-AT
gi|4994                       :     TTAAA-T-G-GCCT----AATG-T-TAT--TC-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-tata
gi|4995                       :     TTAAACT-A-GTGT----TATG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----ATGA-AATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCTTT----ATATT--A-ACATt
gi|4996                       :      TAAACG-A-GCTT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----ATGA-AATCT--CAAAATC-AA-AC-T---TTTAA-TTCTT----G-AGT--A-tatat
gi|4999                       :        AAAT-G-GCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----ATGA-AAACT--CAGAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5000                       :        AACT-G-GCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTCCT-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5001                       :        AACT-A-ACCT----GATG-T-TTT--TC-ATAGCCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ATACATTTTAtcacattatat
gi|5002                       :        AAAT-A-GACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----GTGA-AAACT--CGAAATT-GT-GC-T---TTTGA-T
gi|5005                       :                CCT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACTA-G-----ATTA-AAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-acattgtacttatat
gi|4982                       :                 CT----ATTG-T-TTT--TTTATCACTC-G-----ATGA-AACCT--CAAAACT-CT-GC-T---TTCAA-TCCTT----T-AAT--A-ttcaaacatacatggatata
gi|5007                       :        acaatatacaagccgaATT-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5009                       :                        ATT-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--CAATATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5008                       :                        ATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-G-----ATGA-GAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--tttcattat
gi|5010                       :                         TG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----ATGA-AAACT--AAAAATT-GT-GC-A---TTTAA-TCCTT----A-Attacattatat
gi|5011                       :                                    C-AACACCT-G-----ATGG-AAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5012                       :                                         ACCC-G-----ATGA-AAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat





Alignments
lowQualScore                  :                        0   0     1111    1 0   11  0       0 33333 0        00       2222  0 000     0     1111 22  11 3          
lowQualScore                  :                        .   .     ....    . .   ..  .       . ..... .        ..       ....  . ...     .     .... ..  .. .          
lowQualScore                  :                        9   4     5555    2 4   00  4       4 22222 4        99       5555  8 777     4     0000 22  55 7          
consensus                     :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
Reference ( family-275 )      :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
gi|4901                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-TAT--
gi|4902                       :                AATATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4903                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATCTTGTA
gi|4904                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-At
gi|4905                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATA
gi|4906                       :                AACATTAATA---AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----T-TAAAAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--c
gi|4907                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----GATG-T-TTT---C-ACCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|4908                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCGCCC-G-----T-TGAAAACTA-AAAAAAT-GG-GC-T---TTTAA-TTCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4909                       :                AACATTAA-ACT-AACTT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--acgtaatat
gi|4910                       :                AACATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTA--TC-AGCACCT-A-----A-TGACATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCCTT----A-Attacattata
gi|4911                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACC--AAAAATT-GG-GT-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4912                       :                AACAATAA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TA-ATCACCC-A-----A-TGAAAACT--CCAAATT-CT-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-TAT--acgttat
gi|4913                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GA-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATAttacatt
gi|4914                       :                AACATTAATA---AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----T-TAAAAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--c
gi|4915                       :                AACATTAA-ACT-TGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACA--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4916                       :                AACATTAA-CCT-GGCCT----GATG-T-TTT--TC-ATCACTC-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCATT----A-TAT--
gi|4917                       :                AATATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTTTTTC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4918                       :                AACATTAA-ACT-AGTCT----AATG-T-TTT--TC-ATAACCC-G-----A-TTAAAACC--CAAAAGT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--
gi|4919                       :                AACCTTAA-ACT-AGCCA----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAATT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ttacattatat
gi|4920                       :                AGCATTAA-ACG-GACCT----TATG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----G-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-acgtca
gi|4921                       :                AACATTAA-ACC-ATCCT----TATG-T-TTT--TC-GTCACCC-G-----A-TGGAAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----t
gi|4922                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTT-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTTA-TACTT----A-TAT--cataaaacatataata
gi|4923                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTTCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCAC----A-AAT--A-ttacattata
gi|4924                       :                AACATTAA-ACT-ATCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-G-----A-TGAAAACT--CAAACTT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----agttata
gi|4925                       :                AACATTAA-ACT-GGCGT----ATTT-T-TTT--TC-ATCGCCA-G-----A-TAAAAACT--AAAAATT-C--AC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ATAttatttacattgtat
gi|4926                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AAGGGT-TTT--TC-ATCACCT-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TCTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4927                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACC-G-----A-TGAAAACT--CAGAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTC----A-AGT--
gi|4928                       :                AAAATTAA-ACT-AGTCC----CATG-T-TTT--TA-ATTACCC-G-----A-TAAAAACA--AAAAATT-CG-GC-T---ttgattat
gi|4929                       :                AGCATTAA-AAT-AGGCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----GTATT--G-ACATTATAT
gi|4930                       :                AACATTAA-ATT-GGCCT----AATGGT-TTT--CC-ATCACCC-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GTAT---TTTAA-TCCTT----A-
gi|4931                       :                AATATTAA-ACT-AGTCT----TATA-A-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAA
gi|4932                       :                AAC-TTAT-ACT-GGCCT----AATA-T-CTT--TC-ATCGCCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--ACATATT
gi|4933                       :                AACATTAA-------CCT----AG-G-T-TTT--CC-ATCACCC-T-----A-TGAAAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTTA-TCGTT----A-TAT--aca
gi|4934                       :                AACATTAA-ACT-AGACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAG-CTCTT-------AT--T-ATACTTTATAttaaattaaat
gi|4935                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-A-----A-CGAAAACT--CCAAATT-TG-GG-T---TTTAA-TCCTT----T-AATGAA-ATAT
gi|4936                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACT-G-----A-TGAAAACT--AAAAATC-GG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-AAT--A-a
gi|4937                       :                AACATTTA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-A---TTTAA-TCCTT-------------ATATTTT
gi|4938                       :                AACATTAA-ACT-AGACT----ACTG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--cattat
gi|4939                       :                AACATTTA-ACT-GTCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--A-
gi|4940                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--TAAAATT-CA-GT-T---TTTAA-GCCatacgata
gi|4941                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-GACTAAA-TGATAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TC
gi|4942                       :                AACATTAA-ACT-TGTCT----AATG-C-TTT--TC-ATCATCC-A-----A-TGAAAACT--CAAAATA-CA-CC-T---TTTAA-TCCTT----ATATT--A-ACATTATAT
gi|4943                       :                AACATTTA-ACT-GGCCG----AATG-T-TTT--TC-AGCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAATTT-CA-GC-T---TTTAA-TCC-T----A-AAT--
gi|4944                       :                AGCATTAA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAATT--CAAAATA-CA-AC-T---TTTAA-TCTTT----A-A
gi|4945                       :                AACATTAA-ACT-AGATT----ACTG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TATAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--CTACATTTTAT
gi|4946                       :                AACATTAA-ACT-AGCCA----AATG-T-TCT--TC-ATCACCA-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCGTC----A-A
gi|4947                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TCT--CC-ATCACCC-G-----A-CGAAAACT--CAAAATTGTG-TC-C---TTCAG-TCATT----A-AAT--
gi|4948                       :                AACATAAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAATC-G-----A-TGAAAATT--CAAAATT-CG-AC-T---TTAAA-TCA-T----A-AATTAA-ATAgcaacacatt
gi|4949                       :                AACTTTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-AGAAAACT--CAACATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-cagtata
gi|4950                       :                AACATTAA-AAT-GGACT----AATG-T-TTT--TC-ACCAACA-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-TAT--
gi|4951                       :                AACAATAA-ACT-AGCCT----AATG-C-TTT--TC-ATCACCC-A-----A-TGAAAACT--C-AAATA-CG-GC-T---TTTAttacatta
gi|4952                       :                AACACTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATTTACC-G-----A-TGAAAACT--AAAAATT-GG-AC-T---TTTAG-TCCTT----A-A
gi|4953                       :                AACATTAA-ACT-AGTCT----AATG-T-TAT--TT-ATCAACT-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-CACTT----A-TAT--
gi|4954                       :                AGCATTAA-ACT-GGCCT----AATA-T-TTT---C-ATCACCC-A-----A-AGAAAACT--AAAAATT-GG-TC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAttacattatat
gi|4955                       :                AACATTAA-ACT-AGCAT----AATG-T-T-----C-ATCACCT-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-TTCTC----A-AAT--A-gata
gi|4956                       :                AACTTTAA-ACT-GGACT----AATG-T-TTT--TC-ATCAC---------A-TG---ACT--CAAAATT-GG-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--
gi|4957                       :                AACAGTAA-ACT-ACACTTAGTAATG-AATTT--TC-GTCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAAGT-GT-GT-T---TTAAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattata
gi|4958                       :                AACATAAT-ATA-AGCCT----TATA-G-TTT--TC-ACTACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCaca
gi|4959                       :                AACATTAA-GCT-AGCCC----AACG-T-TTT--TC-ATCACCC-T-----G-CGGAAACT--CACAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-GTT--GCATATTT
gi|4960                       :                AACATTAA-ACT-AGATT----TATG-T-CTT--TC-GTTACCC-G-----A-TGAAAACA--TAAAATT-CT-GC-T---TTTAA-Tagatat
gi|4961                       :                AAAATTAA-ACA-AGTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----A-TGAAA--T-----AATT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTC----A-AAagttacatttacttaatat
gi|4962                       :                AACATTAA-ACA-AGCCT----AATA-A-TTT--TC-ATCATCC-G-----A-GGAAAACT--CAAGCCT-TT-AC-A---TTTAA-TCCTA----A-AAT--A-
gi|4963                       :                AACATTAA-TCG-GGACA----AATG-T-TTT--AC--TCACCG-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-AGT--acgtta
gi|4964                       :                AACATCAA-ACT-GTCTT----AGTT-T-TTT--TT-ATCACGC-A-----A-TTAAA-CT--CATAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCC----------T--A-ATATTTAAT
gi|4965                       :                AACAATAA-ACTTGGCTT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAACACTAAAAAAATT--G-GT-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--tatat
gi|4966                       :                AACATTAA-ACA-CTCCT----GATG-T-TTT--TC-ACCACTC-G-----A-CGAAAACT--C-AAATT-TGTGC-A---TTTAA-TCCTC----A-ttacatttat
gi|4967                       :                AGCATTCA-ACT-AGACT----ACTG-T-TTT-----ATCACCC-T-----A-CGAAAACT--C-AAATC-TGTGC-T---CTAAA-TCCTT----A-TAT--
gi|4968                       :                AACATTAA-GCT-AGATT----AATA-T-TTT--T--ATCACCA-G-----A-TGAAAACT--CAAGATT-GT-GC-T---TTAAA-Tttacattatat
gi|4969                       :                AACATTAA-A-T-A---T----GATG-T-TTT-----ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TATTT----A-TAT--atttctatttacatcatat
gi|4970                       :                AACACAAA-ACT-GGA-T----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-T-----C-TGAAAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAttacatt
gi|4971                       :                AACATTAA-CTT-AGTCT----TATGCT-TTT--TA-ATCACCC-A-----A-TGAATACT--CAAAATT-CG-ACATATATGTAATTCCTT----A-TAT--
gi|4972                       :                AATACCAA-AAT-AACCT----GATG-T-TTT--TA-ATCACCC-G-----A-TGGAAACT--CAAA--T-GT-GT-T---TCTAT-TCCTT----A-ATT--A-ttacat
gi|4973                       :                AACATTAA-CCT-AAACA----AATG-T-TTT--TC-ATCATTA-G-----A-TGAAAACA--CAAAATT-GT-GC-T---TTaca
gi|4977                       :                 ACATTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCA-T-----A-TG---ACT--AAAGATT----GC-----TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-gattactgatatttacattat
gi|4978                       :                 ACATAAA-ACT-CGCCTTA--AAT--T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTCAA-TCCTT----G-AAT--A-
gi|4979                       :                 ACATTTA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAGCC-GTC---A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---ATAAT-TCCTG----T-AAT--A-
gi|4980                       :                 ACATTGA-ACT-AGCCT----AAAG-T-TTTC-TC-ATCAACT-GTC---A-TGAAAACT--CAAAATT----GT-T---CT--A-TCCTTCCTGA-AAT--A-acat
gi|4981                       :                 ACATTAA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAACT-GTC---C-TGAAAACT--CAAAATT-GT-AC-T---ATCAT-TCTTG----A-AAT--A-tacat
gi|4982                       :                                CT----ATTG-T-TTT--TTTATCACTC-G-----A-TGAAACCT--CAAAACT-CT-GC-T---TTCAA-TCCTT----T-AAT--A-aca
gi|4983                       : acaatatacaagccgaACATTGA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-GCC---A-TAAAAACT--CCAAATT----GT-T---CTTAT-TCCTA----A-AA
gi|4984                       :                 ACAATAA-ACT-ATCCT-------G-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TCAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---ACCAT-TCCTG----A-AAT--A-
gi|4989                       :                  CATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--aca
gi|4990                       :                  CATTTA-ATT-AACCT----AATG-T-TTT--TT-GTCACCC-A-----A-TGAAAACT--CAAAAAT-GG-GA-T---TTCAA-TCCTA----A-AGT--ttacattatat
gi|4991                       :                  CATTAA-ACT-AGACT----ATTG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----A-TGAAAGCT--CAAAATA-TT-GC-T---TTTGA-TACTT----A-TAT--T-ATAATT
gi|4992                       :                  CATTAA--CT-GGCCT----AATG-T-----------CACCC-G-----AAT--AAATT--CAAAATT-AG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--aacattatat
gi|4993                       :                   ATTAA-ACT-AGCCT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCCCG-----A-TGAAAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AA---A-AT
gi|4994                       :                    TTAA-A-T-GGCCT----AATG-T-TAT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-tata
gi|4995                       :                    TTAA-ACT-AGTGT----TATG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----A-TGAAATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCTTT----ATATT--A-ACATTATATt
gi|4996                       :                     TAA-ACG-AGCTT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TGAAATCT--CAAAATC-AA-AC-T---TTTAA-TTCTT----G-AGT--A-
gi|4999                       :                       A-AAT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--CAGAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5000                       :                       A-ACT-GGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTCCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5001                       :                       A-ACT-AACCT----GATG-T-TTT--TC-ATAGCCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ATACATTTTATtcacattatat
gi|5002                       :                       A-AAT-AGACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----G-TGAAAACT--CGAAATT-GT-GC-T---TTTGA-T
gi|5005                       :                               CCT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACTA-G-----A-TTAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-acattgtacttatat
gi|5007                       :                                       ATT-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttcaaacatacatggatata
gi|5008                       :                                       ATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-G-----A-TGAGAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5009                       :                                       ATT-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAATATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT-------------ATATTTTttacattatat
gi|5010                       :                                        TG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--AAAAATT-GT-GC-A---TTTAA-TCCTT----A-Acattat
gi|5011                       :                                                   C-AACACCT-G-----A-TGGAAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5012                       :                                                        ACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat





Alignments
lowQualScore                  :                        0   0     1111    1 0   11  0       0 33333 0        00       2222  0 000     0     1111 22  11 3          
lowQualScore                  :                        .   .     ....    . .   ..  .       . ..... .        ..       ....  . ...     .     .... ..  .. .          
lowQualScore                  :                        9   4     5555    2 4   00  4       4 22222 4        99       5555  8 777     4     0000 22  55 7          
consensus                     :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
Reference ( family-275 )      :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
gi|4901                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-TAT--
gi|4902                       :                AATATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4903                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATCTTGTA
gi|4904                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-At
gi|4905                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATA
gi|4906                       :                AACATTAATA---AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----T-TAAAAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--c
gi|4907                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----GATG-T-TTT---C-ACCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|4908                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCGCCC-G-----T-TGAAAACTA-AAAAAAT-GG-GC-T---TTTAA-TTCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4909                       :                AACATTAA-ACT-AACTT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--acgtaatat
gi|4910                       :                AACATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTA--TC-AGCACCT-A-----A-TGACATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCCTT----A-Attacattata
gi|4911                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACC--AAAAATT-GG-GT-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4912                       :                AACAATAA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TA-ATCACCC-A-----A-TGAAAACT--CCAAATT-CT-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-TAT--acgttat
gi|4913                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GA-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATAttacatt
gi|4914                       :                AACATTAATA---AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----T-TAAAAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--c
gi|4915                       :                AACATTAA-ACT-TGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACA--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4916                       :                AACATTAA-CCT-GGCCT----GATG-T-TTT--TC-ATCACTC-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCATT----A-TAT--
gi|4917                       :                AATATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTTTTTC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4918                       :                AACATTAA-ACT-AGTCT----AATG-T-TTT--TC-ATAACCC-G-----A-TTAAAACC--CAAAAGT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--
gi|4919                       :                AACCTTAA-ACT-AGCCA----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAATT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ttacattatat
gi|4920                       :                AGCATTAA-ACG-GACCT----TATG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----G-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-acgtca
gi|4921                       :                AACATTAA-ACC-ATCCT----TATG-T-TTT--TC-GTCACCC-G-----A-TGGAAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----t
gi|4922                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTT-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTTA-TACTT----A-TAT--cataaaacatataata
gi|4923                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTTCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCAC----A-AAT--A-ttacattata
gi|4924                       :                AACATTAA-ACT-ATCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-G-----A-TGAAAACT--CAAACTT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----agttata
gi|4925                       :                AACATTAA-ACT-GGCGT----ATTT-T-TTT--TC-ATCGCCA-G-----A-TAAAAACT--AAAAATT-C--AC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ATAttatttacattgtat
gi|4926                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AAGGGT-TTT--TC-ATCACCT-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TCTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4927                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACC-G-----A-TGAAAACT--CAGAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTC----A-AGT--
gi|4928                       :                AAAATTAA-ACT-AGTCC----CATG-T-TTT--TA-ATTACCC-G-----A-TAAAAACA--AAAAATT-CG-GC-T---ttgattat
gi|4929                       :                AGCATTAA-AAT-AGGCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----GTATT--G-ACATTATAT
gi|4930                       :                AACATTAA-ATT-GGCCT----AATGGT-TTT--CC-ATCACCC-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GTAT---TTTAA-TCCTT----A-
gi|4931                       :                AATATTAA-ACT-AGTCT----TATA-A-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAA
gi|4932                       :                AAC-TTAT-ACT-GGCCT----AATA-T-CTT--TC-ATCGCCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--ACATATT
gi|4933                       :                AACATTAA-------CCT----AG-G-T-TTT--CC-ATCACCC-T-----A-TGAAAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTTA-TCGTT----A-TAT--aca
gi|4934                       :                AACATTAA-ACT-AGACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAG-CTCTT-------AT--T-ATACTTTATAttaaattaaat
gi|4935                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-A-----A-CGAAAACT--CCAAATT-TG-GG-T---TTTAA-TCCTT----T-AATGAA-ATAT
gi|4936                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACT-G-----A-TGAAAACT--AAAAATC-GG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-AAT--A-a
gi|4937                       :                AACATTTA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-A---TTTAA-TCCTT-------------ATATTTT
gi|4938                       :                AACATTAA-ACT-AGACT----ACTG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--cattat
gi|4939                       :                AACATTTA-ACT-GTCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--A-
gi|4940                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--TAAAATT-CA-GT-T---TTTAA-GCCatacgata
gi|4941                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-GACTAAA-TGATAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TC
gi|4942                       :                AACATTAA-ACT-TGTCT----AATG-C-TTT--TC-ATCATCC-A-----A-TGAAAACT--CAAAATA-CA-CC-T---TTTAA-TCCTT----ATATT--A-ACATTATAT
gi|4943                       :                AACATTTA-ACT-GGCCG----AATG-T-TTT--TC-AGCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAATTT-CA-GC-T---TTTAA-TCC-T----A-AAT--
gi|4944                       :                AGCATTAA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAATT--CAAAATA-CA-AC-T---TTTAA-TCTTT----A-A
gi|4945                       :                AACATTAA-ACT-AGATT----ACTG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TATAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--CTACATTTTAT
gi|4946                       :                AACATTAA-ACT-AGCCA----AATG-T-TCT--TC-ATCACCA-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCGTC----A-A
gi|4947                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TCT--CC-ATCACCC-G-----A-CGAAAACT--CAAAATTGTG-TC-C---TTCAG-TCATT----A-AAT--
gi|4948                       :                AACATAAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAATC-G-----A-TGAAAATT--CAAAATT-CG-AC-T---TTAAA-TCA-T----A-AATTAA-ATAgcaacacatt
gi|4949                       :                AACTTTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-AGAAAACT--CAACATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-cagtata
gi|4950                       :                AACATTAA-AAT-GGACT----AATG-T-TTT--TC-ACCAACA-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-TAT--
gi|4951                       :                AACAATAA-ACT-AGCCT----AATG-C-TTT--TC-ATCACCC-A-----A-TGAAAACT--C-AAATA-CG-GC-T---TTTAttacatta
gi|4952                       :                AACACTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATTTACC-G-----A-TGAAAACT--AAAAATT-GG-AC-T---TTTAG-TCCTT----A-A
gi|4953                       :                AACATTAA-ACT-AGTCT----AATG-T-TAT--TT-ATCAACT-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-CACTT----A-TAT--
gi|4954                       :                AGCATTAA-ACT-GGCCT----AATA-T-TTT---C-ATCACCC-A-----A-AGAAAACT--AAAAATT-GG-TC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAttacattatat
gi|4955                       :                AACATTAA-ACT-AGCAT----AATG-T-T-----C-ATCACCT-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-TTCTC----A-AAT--A-gata
gi|4956                       :                AACTTTAA-ACT-GGACT----AATG-T-TTT--TC-ATCAC---------A-TG---ACT--CAAAATT-GG-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--
gi|4957                       :                AACAGTAA-ACT-ACACTTAGTAATG-AATTT--TC-GTCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAAGT-GT-GT-T---TTAAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattata
gi|4958                       :                AACATAAT-ATA-AGCCT----TATA-G-TTT--TC-ACTACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCaca
gi|4959                       :                AACATTAA-GCT-AGCCC----AACG-T-TTT--TC-ATCACCC-T-----G-CGGAAACT--CACAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-GTT--GCATATTT
gi|4960                       :                AACATTAA-ACT-AGATT----TATG-T-CTT--TC-GTTACCC-G-----A-TGAAAACA--TAAAATT-CT-GC-T---TTTAA-Tagatat
gi|4961                       :                AAAATTAA-ACA-AGTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----A-TGAAA--T-----AATT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTC----A-AAagttacatttacttaatat
gi|4962                       :                AACATTAA-ACA-AGCCT----AATA-A-TTT--TC-ATCATCC-G-----A-GGAAAACT--CAAGCCT-TT-AC-A---TTTAA-TCCTA----A-AAT--A-
gi|4963                       :                AACATTAA-TCG-GGACA----AATG-T-TTT--AC--TCACCG-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-AGT--acgtta
gi|4964                       :                AACATCAA-ACT-GTCTT----AGTT-T-TTT--TT-ATCACGC-A-----A-TTAAA-CT--CATAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCC----------T--A-ATATTTAAT
gi|4965                       :                AACAATAA-ACTTGGCTT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAACACTAAAAAAATT--G-GT-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--tatat
gi|4966                       :                AACATTAA-ACA-CTCCT----GATG-T-TTT--TC-ACCACTC-G-----A-CGAAAACT--C-AAATT-TGTGC-A---TTTAA-TCCTC----A-ttacatttat
gi|4967                       :                AGCATTCA-ACT-AGACT----ACTG-T-TTT-----ATCACCC-T-----A-CGAAAACT--C-AAATC-TGTGC-T---CTAAA-TCCTT----A-TAT--
gi|4968                       :                AACATTAA-GCT-AGATT----AATA-T-TTT--T--ATCACCA-G-----A-TGAAAACT--CAAGATT-GT-GC-T---TTAAA-Tttacattatat
gi|4969                       :                AACATTAA-A-T-A---T----GATG-T-TTT-----ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TATTT----A-TAT--atttctatttacatcatat
gi|4970                       :                AACACAAA-ACT-GGA-T----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-T-----C-TGAAAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAttacatt
gi|4971                       :                AACATTAA-CTT-AGTCT----TATGCT-TTT--TA-ATCACCC-A-----A-TGAATACT--CAAAATT-CG-ACATATATGTAATTCCTT----A-TAT--
gi|4972                       :                AATACCAA-AAT-AACCT----GATG-T-TTT--TA-ATCACCC-G-----A-TGGAAACT--CAAA--T-GT-GT-T---TCTAT-TCCTT----A-ATT--A-ttacat
gi|4973                       :                AACATTAA-CCT-AAACA----AATG-T-TTT--TC-ATCATTA-G-----A-TGAAAACA--CAAAATT-GT-GC-T---TTaca
gi|4977                       :                 ACATTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCA-T-----A-TG---ACT--AAAGATT----GC-----TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-gattactgatatttacattat
gi|4978                       :                 ACATAAA-ACT-CGCCTTA--AAT--T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTCAA-TCCTT----G-AAT--A-
gi|4979                       :                 ACATTTA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAGCC-GTC---A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---ATAAT-TCCTG----T-AAT--A-
gi|4980                       :                 ACATTGA-ACT-AGCCT----AAAG-T-TTTC-TC-ATCAACT-GTC---A-TGAAAACT--CAAAATT----GT-T---CT--A-TCCTTCCTGA-AAT--A-acat
gi|4981                       :                 ACATTAA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAACT-GTC---C-TGAAAACT--CAAAATT-GT-AC-T---ATCAT-TCTTG----A-AAT--A-tacat
gi|4982                       :                                CT----ATTG-T-TTT--TTTATCACTC-G-----A-TGAAACCT--CAAAACT-CT-GC-T---TTCAA-TCCTT----T-AAT--A-aca
gi|4983                       : acaatatacaagccgaACATTGA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-GCC---A-TAAAAACT--CCAAATT----GT-T---CTTAT-TCCTA----A-AA
gi|4984                       :                 ACAATAA-ACT-ATCCT-------G-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TCAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---ACCAT-TCCTG----A-AAT--A-
gi|4989                       :                  CATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--aca
gi|4990                       :                  CATTTA-ATT-AACCT----AATG-T-TTT--TT-GTCACCC-A-----A-TGAAAACT--CAAAAAT-GG-GA-T---TTCAA-TCCTA----A-AGT--ttacattatat
gi|4991                       :                  CATTAA-ACT-AGACT----ATTG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----A-TGAAAGCT--CAAAATA-TT-GC-T---TTTGA-TACTT----A-TAT--T-ATAATT
gi|4992                       :                  CATTAA--CT-GGCCT----AATG-T-----------CACCC-G-----AAT--AAATT--CAAAATT-AG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--aacattatat
gi|4993                       :                   ATTAA-ACT-AGCCT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCCCG-----A-TGAAAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AA---A-AT
gi|4994                       :                    TTAA-A-T-GGCCT----AATG-T-TAT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-tata
gi|4995                       :                    TTAA-ACT-AGTGT----TATG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----A-TGAAATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCTTT----ATATT--A-ACATTATATt
gi|4996                       :                     TAA-ACG-AGCTT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TGAAATCT--CAAAATC-AA-AC-T---TTTAA-TTCTT----G-AGT--A-
gi|4999                       :                       A-AAT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--CAGAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5000                       :                       A-ACT-GGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTCCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5001                       :                       A-ACT-AACCT----GATG-T-TTT--TC-ATAGCCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ATACATTTTATtcacattatat
gi|5002                       :                       A-AAT-AGACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----G-TGAAAACT--CGAAATT-GT-GC-T---TTTGA-T
gi|5005                       :                               CCT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACTA-G-----A-TTAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-acattgtacttatat
gi|5007                       :                                       ATT-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttcaaacatacatggatata
gi|5008                       :                                       ATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-G-----A-TGAGAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5009                       :                                       ATT-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAATATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT-------------ATATTTTttacattatat
gi|5010                       :                                        TG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--AAAAATT-GT-GC-A---TTTAA-TCCTT----A-Acattat
gi|5011                       :                                                   C-AACACCT-G-----A-TGGAAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5012                       :                                                        ACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat


blockSeqs                     :                                  TAGT    G                   ACTAA                   GTG                        TA  GA C
blockSeqs                     :                                  TA      G                   TC                      TGT                        TA  TA T
blockSeqs                     :                                  .       C                   TC                      TGT                        TA  .  C
blockSeqs                     :                                  .       .                   TC                      CG                         A   .  T
blockSeqs                     :                                  .       .                   CC                      CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CT                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CT                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CT                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       AT                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                         T   .  .
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         G   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       AT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       AT                         A   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CT                         T   .   
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       AT                         T       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         T       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GG                         A       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TT                         T       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       AG                         T       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         .       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         .       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                         .       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       AA                         .       
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       TG                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CA                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       GT                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                                 
blockSeqs                     :                                  .       .                   .                       CG                                 
blockSeqs                     :                                          .                   .                       C                                  
blockSeqs                     :                                          .                   .                       G                                  
blockSeqs                     :                                          .                   .                       .                                  
blockSeqs                     :                                          .                   .                       .                                  
blockSeqs                     :                                                              .                       .                                  
blockSeqs                     :                                                              .                                                          


blockSeqCons                  :                
originalCons                  :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
finalCons                     :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA





Alignments
lowQualScore                  :                        0   0     1111    1 0   11  0       0 33333 0        00       2222  0 000     0     1111 22  11 3          
lowQualScore                  :                        .   .     ....    . .   ..  .       . ..... .        ..       ....  . ...     .     .... ..  .. .          
lowQualScore                  :                        9   4     5555    2 4   00  4       4 22222 4        99       5555  8 777     4     0000 22  55 7          
consensus                     :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
Reference ( family-275 )      :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATTTTATA
gi|4901                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-TAT--
gi|4902                       :                AATATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4903                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ATATCTTGTA
gi|4904                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-At
gi|4905                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATA
gi|4906                       :                AACATTAATA---AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----T-TAAAAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--c
gi|4907                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----GATG-T-TTT---C-ACCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|4908                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCGCCC-G-----T-TGAAAACTA-AAAAAAT-GG-GC-T---TTTAA-TTCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4909                       :                AACATTAA-ACT-AACTT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--acgtaatat
gi|4910                       :                AACATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTA--TC-AGCACCT-A-----A-TGACATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCCTT----A-Attacattata
gi|4911                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACC--AAAAATT-GG-GT-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4912                       :                AACAATAA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TA-ATCACCC-A-----A-TGAAAACT--CCAAATT-CT-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-TAT--acgttat
gi|4913                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GA-T---TTTAA-TCCTT------AAC--A-ATAttacatt
gi|4914                       :                AACATTAATA---AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-A-----T-TAAAAACT--CAAAGTT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--c
gi|4915                       :                AACATTAA-ACT-TGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACA--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4916                       :                AACATTAA-CCT-GGCCT----GATG-T-TTT--TC-ATCACTC-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCATT----A-TAT--
gi|4917                       :                AATATTAA-ACG-GGCCT----AATG-T-TTTTTTC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattatat
gi|4918                       :                AACATTAA-ACT-AGTCT----AATG-T-TTT--TC-ATAACCC-G-----A-TTAAAACC--CAAAAGT-CG-GC-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--
gi|4919                       :                AACCTTAA-ACT-AGCCA----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAATT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ttacattatat
gi|4920                       :                AGCATTAA-ACG-GACCT----TATG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----G-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-acgtca
gi|4921                       :                AACATTAA-ACC-ATCCT----TATG-T-TTT--TC-GTCACCC-G-----A-TGGAAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----t
gi|4922                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTT-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTTA-TACTT----A-TAT--cataaaacatataata
gi|4923                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTTCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCAC----A-AAT--A-ttacattata
gi|4924                       :                AACATTAA-ACT-ATCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-G-----A-TGAAAACT--CAAACTT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----agttata
gi|4925                       :                AACATTAA-ACT-GGCGT----ATTT-T-TTT--TC-ATCGCCA-G-----A-TAAAAACT--AAAAATT-C--AC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--G-ATAttatttacattgtat
gi|4926                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AAGGGT-TTT--TC-ATCACCT-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TCTAA-TCCTT----A-AAT--A-
gi|4927                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACC-G-----A-TGAAAACT--CAGAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTC----A-AGT--
gi|4928                       :                AAAATTAA-ACT-AGTCC----CATG-T-TTT--TA-ATTACCC-G-----A-TAAAAACA--AAAAATT-CG-GC-T---ttgattat
gi|4929                       :                AGCATTAA-AAT-AGGCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----GTATT--G-ACATTATAT
gi|4930                       :                AACATTAA-ATT-GGCCT----AATGGT-TTT--CC-ATCACCC-C-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GTAT---TTTAA-TCCTT----A-
gi|4931                       :                AATATTAA-ACT-AGTCT----TATA-A-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAA
gi|4932                       :                AAC-TTAT-ACT-GGCCT----AATA-T-CTT--TC-ATCGCCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--ACATATT
gi|4933                       :                AACATTAA-------CCT----AG-G-T-TTT--CC-ATCACCC-T-----A-TGAAAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTTA-TCGTT----A-TAT--aca
gi|4934                       :                AACATTAA-ACT-AGACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAG-CTCTT-------AT--T-ATACTTTATAttaaattaaat
gi|4935                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-A-----A-CGAAAACT--CCAAATT-TG-GG-T---TTTAA-TCCTT----T-AATGAA-ATAT
gi|4936                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAACT-G-----A-TGAAAACT--AAAAATC-GG-GC-T---TTTAA-CCCTT----A-AAT--A-a
gi|4937                       :                AACATTTA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-A---TTTAA-TCCTT-------------ATATTTT
gi|4938                       :                AACATTAA-ACT-AGACT----ACTG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--cattat
gi|4939                       :                AACATTTA-ACT-GTCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AGT--A-
gi|4940                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--TAAAATT-CA-GT-T---TTTAA-GCCatacgata
gi|4941                       :                AACATTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-GACTAAA-TGATAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TC
gi|4942                       :                AACATTAA-ACT-TGTCT----AATG-C-TTT--TC-ATCATCC-A-----A-TGAAAACT--CAAAATA-CA-CC-T---TTTAA-TCCTT----ATATT--A-ACATTATAT
gi|4943                       :                AACATTTA-ACT-GGCCG----AATG-T-TTT--TC-AGCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAATTT-CA-GC-T---TTTAA-TCC-T----A-AAT--
gi|4944                       :                AGCATTAA-ACT-GGTCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAATT--CAAAATA-CA-AC-T---TTTAA-TCTTT----A-A
gi|4945                       :                AACATTAA-ACT-AGATT----ACTG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TATAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--CTACATTTTAT
gi|4946                       :                AACATTAA-ACT-AGCCA----AATG-T-TCT--TC-ATCACCA-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCGTC----A-A
gi|4947                       :                AACATTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TCT--CC-ATCACCC-G-----A-CGAAAACT--CAAAATTGTG-TC-C---TTCAG-TCATT----A-AAT--
gi|4948                       :                AACATAAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAATC-G-----A-TGAAAATT--CAAAATT-CG-AC-T---TTAAA-TCA-T----A-AATTAA-ATAgcaacacatt
gi|4949                       :                AACTTTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-AGAAAACT--CAACATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-cagtata
gi|4950                       :                AACATTAA-AAT-GGACT----AATG-T-TTT--TC-ACCAACA-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TGCTT----A-TAT--
gi|4951                       :                AACAATAA-ACT-AGCCT----AATG-C-TTT--TC-ATCACCC-A-----A-TGAAAACT--C-AAATA-CG-GC-T---TTTAttacatta
gi|4952                       :                AACACTAA-ACT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATTTACC-G-----A-TGAAAACT--AAAAATT-GG-AC-T---TTTAG-TCCTT----A-A
gi|4953                       :                AACATTAA-ACT-AGTCT----AATG-T-TAT--TT-ATCAACT-A-----A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-CACTT----A-TAT--
gi|4954                       :                AGCATTAA-ACT-GGCCT----AATA-T-TTT---C-ATCACCC-A-----A-AGAAAACT--AAAAATT-GG-TC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAttacattatat
gi|4955                       :                AACATTAA-ACT-AGCAT----AATG-T-T-----C-ATCACCT-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-GT-GT-T---TTTAA-TTCTC----A-AAT--A-gata
gi|4956                       :                AACTTTAA-ACT-GGACT----AATG-T-TTT--TC-ATCAC---------A-TG---ACT--CAAAATT-GG-GC-T---TTTAA-TACTT----A-TAT--
gi|4957                       :                AACAGTAA-ACT-ACACTTAGTAATG-AATTT--TC-GTCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAAGT-GT-GT-T---TTAAA-TCCTT----A-AAT--A-ttacattata
gi|4958                       :                AACATAAT-ATA-AGCCT----TATA-G-TTT--TC-ACTACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCaca
gi|4959                       :                AACATTAA-GCT-AGCCC----AACG-T-TTT--TC-ATCACCC-T-----G-CGGAAACT--CACAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-GTT--GCATATTT
gi|4960                       :                AACATTAA-ACT-AGATT----TATG-T-CTT--TC-GTTACCC-G-----A-TGAAAACA--TAAAATT-CT-GC-T---TTTAA-Tagatat
gi|4961                       :                AAAATTAA-ACA-AGTCT----AATG-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----A-TGAAA--T-----AATT-CT-GC-T---TTTAA-TCTTC----A-AAagttacatttacttaatat
gi|4962                       :                AACATTAA-ACA-AGCCT----AATA-A-TTT--TC-ATCATCC-G-----A-GGAAAACT--CAAGCCT-TT-AC-A---TTTAA-TCCTA----A-AAT--A-
gi|4963                       :                AACATTAA-TCG-GGACA----AATG-T-TTT--AC--TCACCG-G-----A-TAAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-ACCTT----A-AGT--acgtta
gi|4964                       :                AACATCAA-ACT-GTCTT----AGTT-T-TTT--TT-ATCACGC-A-----A-TTAAA-CT--CATAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCC----------T--A-ATATTTAAT
gi|4965                       :                AACAATAA-ACTTGGCTT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAACACTAAAAAAATT--G-GT-T---TTTAA-TCTTT----A-TAT--tatat
gi|4966                       :                AACATTAA-ACA-CTCCT----GATG-T-TTT--TC-ACCACTC-G-----A-CGAAAACT--C-AAATT-TGTGC-A---TTTAA-TCCTC----A-ttacatttat
gi|4967                       :                AGCATTCA-ACT-AGACT----ACTG-T-TTT-----ATCACCC-T-----A-CGAAAACT--C-AAATC-TGTGC-T---CTAAA-TCCTT----A-TAT--
gi|4968                       :                AACATTAA-GCT-AGATT----AATA-T-TTT--T--ATCACCA-G-----A-TGAAAACT--CAAGATT-GT-GC-T---TTAAA-Tttacattatat
gi|4969                       :                AACATTAA-A-T-A---T----GATG-T-TTT-----ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTTAA-TATTT----A-TAT--atttctatttacatcatat
gi|4970                       :                AACACAAA-ACT-GGA-T----AATG-T-TTT--TC-ATCACTT-T-----C-TGAAAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAttacatt
gi|4971                       :                AACATTAA-CTT-AGTCT----TATGCT-TTT--TA-ATCACCC-A-----A-TGAATACT--CAAAATT-CG-ACATATATGTAATTCCTT----A-TAT--
gi|4972                       :                AATACCAA-AAT-AACCT----GATG-T-TTT--TA-ATCACCC-G-----A-TGGAAACT--CAAA--T-GT-GT-T---TCTAT-TCCTT----A-ATT--A-ttacat
gi|4973                       :                AACATTAA-CCT-AAACA----AATG-T-TTT--TC-ATCATTA-G-----A-TGAAAACA--CAAAATT-GT-GC-T---TTaca
gi|4977                       :                 ACATTAA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACCA-T-----A-TG---ACT--AAAGATT----GC-----TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-gattactgatatttacattat
gi|4978                       :                 ACATAAA-ACT-CGCCTTA--AAT--T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---TTCAA-TCCTT----G-AAT--A-
gi|4979                       :                 ACATTTA-ACT-AGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCAGCC-GTC---A-TGAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---ATAAT-TCCTG----T-AAT--A-
gi|4980                       :                 ACATTGA-ACT-AGCCT----AAAG-T-TTTC-TC-ATCAACT-GTC---A-TGAAAACT--CAAAATT----GT-T---CT--A-TCCTTCCTGA-AAT--A-acat
gi|4981                       :                 ACATTAA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAACT-GTC---C-TGAAAACT--CAAAATT-GT-AC-T---ATCAT-TCTTG----A-AAT--A-tacat
gi|4982                       :                                CT----ATTG-T-TTT--TTTATCACTC-G-----A-TGAAACCT--CAAAACT-CT-GC-T---TTCAA-TCCTT----T-AAT--A-aca
gi|4983                       : acaatatacaagccgaACATTGA-ACT-AGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-GCC---A-TAAAAACT--CCAAATT----GT-T---CTTAT-TCCTA----A-AA
gi|4984                       :                 ACAATAA-ACT-ATCCT-------G-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TCAAAACT--CAAAATT-AT-GC-T---ACCAT-TCCTG----A-AAT--A-
gi|4989                       :                  CATTAA-ACT-AGCCT----AATA-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--C-AAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--aca
gi|4990                       :                  CATTTA-ATT-AACCT----AATG-T-TTT--TT-GTCACCC-A-----A-TGAAAACT--CAAAAAT-GG-GA-T---TTCAA-TCCTA----A-AGT--ttacattatat
gi|4991                       :                  CATTAA-ACT-AGACT----ATTG-T-TTT--TC-ATCATCC-G-----A-TGAAAGCT--CAAAATA-TT-GC-T---TTTGA-TACTT----A-TAT--T-ATAATT
gi|4992                       :                  CATTAA--CT-GGCCT----AATG-T-----------CACCC-G-----AAT--AAATT--CAAAATT-AG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--aacattatat
gi|4993                       :                   ATTAA-ACT-AGCCT----AATG-A-TTT--TC-ATCACCCCG-----A-TGAAAACT--CAAAACT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-AA---A-AT
gi|4994                       :                    TTAA-A-T-GGCCT----AATG-T-TAT--TC-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GG-T---TTTAA-TCCTT----A-AAT--A-tata
gi|4995                       :                    TTAA-ACT-AGTGT----TATG-T-TTT--TC-ATTACCC-G-----A-TGAAATCT--CAAAATT-CG-GC-T---TTAAA-TCTTT----ATATT--A-ACATTATATt
gi|4996                       :                     TAA-ACG-AGCTT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTG-G-----A-TGAAATCT--CAAAATC-AA-AC-T---TTTAA-TTCTT----G-AGT--A-
gi|4999                       :                       A-AAT-GGCCT----AATG-T-TTT--TC-ATCACTC-G-----A-TGAAAACT--CAGAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5000                       :                       A-ACT-GGCCT----TATG-T-TTT--TC-ATCTCCT-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5001                       :                       A-ACT-AACCT----GATG-T-TTT--TC-ATAGCCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-TG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ATACATTTTATtcacattatat
gi|5002                       :                       A-AAT-AGACT----TATG-T-TTT--TC-ATCACCC-G-----G-TGAAAACT--CGAAATT-GT-GC-T---TTTGA-T
gi|5005                       :                               CCT----A-TG-T-TTT--TC-ATCACTA-G-----A-TTAAAACT--CAAAATT-GT-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-acattgtacttatat
gi|5007                       :                                       ATT-T-TTT--TT-ATCACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-AC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttcaaacatacatggatata
gi|5008                       :                                       ATG-T-TTT--TC-ATCAGCT-G-----A-TGAGAACT--CAAAATT-CA-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat
gi|5009                       :                                       ATT-T-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--CAATATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT-------------ATATTTTttacattatat
gi|5010                       :                                        TG-A-TTT--TC-ATCACCT-G-----A-TGAAAACT--AAAAATT-GT-GC-A---TTTAA-TCCTT----A-Acattat
gi|5011                       :                                                   C-AACACCT-G-----A-TGGAAAAT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--
gi|5012                       :                                                        ACCC-G-----A-TGAAAACT--CAAAATT-CG-GC-T---TTTAA-TCCTT----A-TAT--ttacattatat