lowQualScore : 111 11 1 1 1
lowQualScore : 0 111 22 999 444 4 0 444444444444 0 0 111 00 0 444 00 55 0 0 0 4 11 2222 1 5 1 6 4 5
lowQualScore : . ... .. ... ... . . ............ . . ... .. . ... .. .. . . . . .. .... . . . . . .
lowQualScore : 4 333 44 888 111 9 4 111111111111 4 4 222 66 5 111 66 33 5 5 9 8 33 0000 0 4 0 6 7 5
consensus : TCGG-ATAC---CCAC--G--NGT-GATCNATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCC-GT---G--GG-AN--AT--TACGCTAGCTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTATCC-AATCGC-AACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
Reference ( gi|25691 ) : TCGG-ATAC---CCAC--G--TGT-AATCCATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGTCGGT-T-CTACCAAG-CCACGATGGAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTATCC-AATGGC-AACGCTTGTTTCATGCAAACACCGTTCTGATAA
gi|25594 : TCGG-ATAT---CCTC--G--AGT-GATCTATT-CCGATGCTCTCCAT---C---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGTTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-CCACGATGAAA--CAATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCTTGAAGGGAACGTTATTC-AATCGC-AACGCTAGTGTCATGTTAACACCGTTTTGATAA
gi|25598 : catcgTCGGTAAAC---CAAC--G--CGT-AATCCATT-TCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TTCACTAGCTTTGCGTCTTT-T-CTACCAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTGTCC-AATCGC-AACGCAAGTTTCATGCAAACTCCGTTTTGATAA
gi|25590 : catcgTCGG-ACAC---CTAC--A--CGT-TATCCTTT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GC---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGTGTCGTT-T-CTACTAAG-CCACGATACGA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGGAGGGAACGTTATCT-TATTGC-AATGCTAGTTTCGTGTAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25601 : catcgTCGG-ATAC---CCAG--G--CGT-GATTCATT-CCGTTACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--ATATTACACTAGCTTTGCATCATT-T-CTACCAAG-C-ACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAAGTTATTC-AATTGC-AATGCAAGTTTCATGCAAACGCCATTTTGATAA
gi|25607 : cagcaTCGG-ATAC---CCAC--G--CGT-AATCCATT-CCGATACTCTCCAT---T---A----A-TCACGC-AT---G--GA-AT--AT--TACACTTGTTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGTAACGTAATCC-AATCGC-AACGGTAGTTTCATGCAAATA
gi|25605 : catcgTCGG-ATAC---CCAT--G--TGT-AATACATT-CAGATACTCTTGGT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGGTTTGCGTCGTT-T-TTACTAAG-CCACCATGCAG--CCATAT----GAATGGTTCCTTCATGATTCCATGAAGGGAACGTTATCC-AATCGC-AATGCTAGTTTCATGCAAAAGCTATTTTGATAAagactttgttaa
gi|25600 : catcgTCAG-ATAC---CCAC--G--CGT-AATACATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----G-TCACCT-GT---G--GG-AT--AT--TAAACTGGCTTTGTGTTGTT-T-CTACCAAG-TCAAAATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACAATATCATGAAGGGAAGGTTATCC-AGCCGC-AACGCTAGTTTTATGCAAACCCCGTTTTGATAA
gi|25602 : cattgTCGA-ATAC---CCAC-----TGT-AATTCATT-CCAATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCA-TA---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGTCCTT-T-CTACCAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGAAACGTTATCC-AACCTC-AATGCTAGATTCATGCAAACGCCAATTTAATAA
gi|25619 : catcgTTGG-ATAC---CCAT--G--TGT-GATCCGTT-CCTATACTCTGCAT---T---T----A-TCACCC-AT---G--GG-AT--AT--TACACTAGATTTGTGCAGTT-T-CTACCAAG-CCACGTTGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCATAATTTAATGAAAGGAACGTTATCC-AATCGA-AACACTAGCTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25609 : caccaTCGG-ATAC---CCAC--G--CAT-AATCCATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GA-AT--AT--AACACTAGCTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTACACGATTTCATGAAAGGAACATAATCC-AATCAC-AATGCTAGTTTCAT---AACGTCATT
gi|25586 : catcgTCCG-ATAC---CCAC--G--GAT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCC-GT---T--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-TCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTGGCGGTTTCATGTAGGGAACGTTATCC-AATCGC-AACGCTAGTTTCGTGCAAACGCCGTT
gi|25603 : catcgTCGG-ATAC---CCAT--G--TGT-AATCCATT-CTAATAATCTCCAT---T---C----A-TCATTCTGT---T--AG-AT--AT--TGCAATAACT--GCATCGTT-T-CTACCAAG-CCATGATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACTGTTTCATGAAGGAAACGTTATCC-AATCGC-AACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25591 : catggTTGG-ATAC---TAAA--G--TGT-AATTCATT-CCGGTACTCTCCAT---T---T----A-TCACCT-AT---G--GG-AT--AT--TACACTAGGTTTGCATCGTT-T-CTACCAAG-CCACAACGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCATGATTTCATGAAGGGAATGTTATCC-AATCGC-AACGCTAGTTGCATGCAAA
gi|25622 : catctTCGG-ATAC---CCAT--G--TGT-AATCAATT-TTGATACTCTTTAT---TGATT----A-TTATCC-AT---G--GG-AT--AT--TACACTAGGTTTTTGTCGTT-T-CTACCAAA-ACACAACGCAG--CGGTAG----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTATCC-AATCGC-AACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGATAA
gi|25613 : catcaTTGG-ATAC---CCAC--G--CAT-AGTCCAT-------ACTCTCCAT---T---T----A-TAACCC-GT---G--GC-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGTTGTT-T-CTACCAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAGGTTATCC-AATCGC-AATGTTGGTTTCATGCAAAGGTTGTTTTGAT
gi|25616 : catcaTCGG-ATAC---CCAC--A--CGA-TATCCGTT-CCGATACTCTTCAT---T---TT---A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--AACACTAGCTTTGCGTTGTT-T-AGACCAAG-CAACATTGCAA--CCATGT----GATTGGTTACTTCACGATTTCAAGAAAGGAACGTTATCC-AATCGC-TACTCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25692 : catcgTTGG-ATAC---CCAC--A--TAT-AATCCATT-CCGATACTCTCCAT---G---T----A-TCACCC-GT---T--GG-AT--AT--TACACTAGGTTTGCGTCGTT-T-CTACAAAG-CCACAAGGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGTG------ATC------AC-AACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATA
gi|25624 : TCGG-ATAC---CCGC--T--TGT-GATTTATT-CCAATACTCTCCAT---T---T----A-TAACCC-GT---G--AG-AT--AT--TACACTAGTTTTGTGTCGTT-T-CTACCAAG-CCACGATGCAA--CCAAAT----AATTGGTACTTTCATGATTTCAAGAAGGGAACGTTATCC-GATTGC-AGCACTAGTTTCATGTAAAAGCCATT
gi|25611 : catcgTCGG-TTAC---CCAC--G--CTT-AATCCATT-CCGATATTCTCTAT---T---C----A-TCCCCT-GTA--G--GG-TT--TT--TACACTAGCTTTGCATCGTT-T-CTACCAAA-CCACAATGCAA--ATATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGGAACGTTATCC-ATTCAC-AATGCTAGTTCCATGCAAATGCCATTTTGACAAt
gi|25628 : catcgTCGT-ATAC---CCAC--G--TAT-GATCTATT-CAGATACTCTTCAT---T---A----A-TCACCT-GT---A--GG-AT--AT--TACACT----------TGAT-T-CTACCAAG-CCACGATACAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGATCGTTATCCAAATCGC-AACGCTATTTTCATGTGAACGCCGTTTTGATAA
gi|25625 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--CGT-AGTCCATT-CCGATACTCTTTAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TTAACTAGCTTTGTGTCGTT-T-CTACCAAG-TCACAATGCAA--TCATAT----AAATGGTTTCCTCATGATTTCCTGAAAGGAATGTTCTTC-AATCCC-AATGCTAGTTTCATGCAAACG-AGTTTTGAGAA
gi|25638 : catcgTCGG-ATAC---CCGC--G--TGT-AATCCATT-CCGATTCGCTCCAT---T---T----A-TCGCCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-ACACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTTACGATTGCGTTAAGAGAACGTTATCC-A
gi|25633 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--CGT-ATTCCATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCAATC-GT---G--AG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGCCGTT-T-CTACCAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----CATTGGTTACTTCAAGATTTCATG-ATTGAATGTTATTC-AATCGC-AAC-----------GCAAACGCCATATTGATAA
gi|25635 : cattgTCGG-ATAC---CCAA--G--CGT-AATCCATT-CTGATACTCTCCAT---T---T----A-TCAC---------------------------TAGCTTTGTGTCATT-T-CTACAAAG-CCAAGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTTCATGATTTCATGAAGGGAACGTTATCC-AATTGC-AACGCTAGTTTCATGCGAAAGCTGTATTGGTAA
gi|25636 : catcgTCGG-TTAC---TGAC--G--TGT-GAACTATT-CTGATGCTCTCTAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AA--TACACTAGTTTTGTGTC-GT-A-TTACCAAG-CCACGATGTAA--TCATA-----GATTGATTCGTTCACGATTTTATGAACAGAACGTTATCC-TATCGC-AACGGTAGTTTCATGTTAACGCCGTTTTGATAA
gi|25630 : catcgTTGG-ATAC---CCAC--G--TGT-AACCTATT-CTGATAGTGTCCAT---T---C----A-TCACCC-AT---G--GG-AT--AT--TGAACTAGTAGTGCGTTGTT-T-TTATCAAGTCCA-AATGCAA--CCATAT----GATTGGTATCTTCACGATTTCATGAAGGGAACATTATCC-AATCGC-AATACTAGTTTAATGCAAAATCCGTTTTGTTAA
gi|25680 : catccTCGG-ATAC---CAAC--G--TGT-AATCCATT-CCGAT-CTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AC--TACACTAG--GTGCATCGTT-T-CTACCAAG-CCGCAACGCAG--AGATAT----GATTGGTTTCTTCACG-TTTCCTGAAGGGAACATAATCC-AAGCGC-AACGC--GTTTCATTCAAA
gi|25688 : atcgTTGG-ATAC---CCAT--G--CGT-AATCCATT-CCGATACTCTCCAT---G---T----A-TCACTT-CT---G--GT-AT--AG--CACACTAACTTTGCATCGTT-T-CTAACAAG-CCACAATGCAA--CCATATGCCGGATTGGTTCCTTCACGATTTCATAAATGGAACG
gi|25639 : cgTCCG-ATAT---TCAC--G--CGT-ACTCTATT-CCGATAATCTTCAT---T---T----A-TCACCT-GT---G--GG-AT--AT--TACGCTAGCTTTGCGCCGTT-T-CTTCC-------------AA--CCGTAT----AATTGGTT--------ATTCCACGA--------TTATCC-AATCGC-AACGTTAATTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAAgtgtttcacgcaa
gi|25645 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--TGT-AATCCATT-CCGATACTCTC--T---T---T----A-TCACCC-AT---G--GG-AT--AT--CACACTAGCGTTGCATCGTT-T-CTTCCAAG-CCACGATGCAA--CAATAT----GATT
gi|25686 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--CAT-AATCCATT-TTGATACTCTCAAT---T---T----A-TCACCT-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCATCATT-T-CTACCAAG-
gi|25643 : tcgTCTG-ATAC---CCAC--A-----------ACT-CCGATCCTCTTCCT---T---C----A-TCACCC-G--------------------------CTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-TCGCAATGCAA--CC--AT----GATTA-------------TTCATTAAGGGAACGT------AATCGC-AACGCTAGTTTCATGCAGACGTCGTTTTGATAA
gi|25648 : catcgTCGG-ATAC---CCAC---------AATCC------GATACTTTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-GT--AT--TACACTAGCTTTGCGTTGTT-T-TTACCAAG-CCA
gi|25651 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--CGT-AATCCATT-TCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GG---G--GG-AA--AT--AACACTGGCTTTG
gi|25588 : catcaTCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCC-GT---G--GG-AA--AT--TAAGCTAGCTCTGCGTC-GT-T-TTA
gi|25689 : catcgTCGG-ATAC---CCAT--G--TGT-TATCCATT-GCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCATCC-GT---G--GG-AT--AC--AACACTAGATTTtt
gi|25595 : cgTCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCC-GT---G--GG-AA--AA--TACGCTAGCTCTGCGTC-GT-T-TTA
gi|25685 : catcgTCGG-ATAC---CCTA--G--GGT-G-TCAATT-CTAATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCC-A----A--GG-TTA-AT--TACACTAGCTCTGCATT-GT-T-CTAtt
gi|25593 : tctTCAG-ATAC---CCAC--G--CAT-AATCCATT-ATGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---GAAAA-AA--AT--TACGCTACCTTTGCGTC-GT-T-TTAtttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcttatcaaaacggtgtttgcataaaactagcgttgcgattggataacgtttccttcatgaaaca
gi|25642 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--GGATGT-----CAAT-CCGATACTCTCCAT---T---C----A-TCACCC-AT---G--GG-AA--AT--TACACTAGCTCTGCATC-GT-T-TTAtt
gi|25627 : catcgTCGG-ATAC---TCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCTATACTCTCCAT---C---C----A-TCATCC-GT---G--GG-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCGTC-GT-T-TTAtt
gi|25646 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--AGT-G-TCAGTT-CCGATACTCGCCAT---C---C----A-TCACCC-GT---G--GG-AA--AT--TACGCTCGCTCTGCGTC-GT-T-TTAtttaaacagaaccgaacaaaatacagcta
gi|25641 : catcgTCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CAAATACTCTCCAT---C---C----G-TCACCC-GT---G--GA-AA--AT--TATGCTAGCTTTGCGTC-GT-T-TTAtttgaacagaacggaac
gi|25637 : catcgTCGG-ATAT---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCCCCAT---C---C----A-TCACCC-GT---G--GGAAT--A---TACGCTAGCTCTGTGCC-GT-T-TTAtt
gi|25690 : caccgTCAG-ATAT---TCAC--G--TGT-GGTA-ATT-CCGATACTCTCCAT---T---C----A-TCACCT-GT---G--GG-AA--AT--TTTGCTAGCTCTGCTTCGTT-T-TTtttgaacaaaacagaac
gi|25592 : gTCGG-ATAC---CTAC--A--GGT-G-TCAATT-CTGATACTCTCCATGCAT---C----A-TCGCCC-GT---G--GG-AA--AT--TACATTAGTTTTGCGTtttaacagaacaaaatgc
gi|25677 : catggTCGG-ATAC---CCAC--G--AGT-G-TCAATT-ATGATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCT-GT---A--GG-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCATTGTT-T-TTtattttatttgaacaacacaatacagcta
gi|25612 : attgTCGG-ATAC---CCCT--G--GGT-G-TCAATT-CCGATTCTCTCCAT---C---C----G-TCACCC-GT---G--GG-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCATttt
gi|25618 : cattgTCGC-ATAA---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCTAT---A---C----A-TCATCC-GT---G--GG-AA--AT--TATGCCAGCTCTGCGTCGTT-T-aattttatt
gi|25681 : catcgatgTCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATA-CCGATACCCTTCTT---C---C----A-TCACCC-AT---G--GT-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCGTCGTT-T-
gi|25649 : atcgTCGG-ATAC---CCAC--G--GGC-GA--CATTTCCGATACTCAGCAT---A---C----A-TTACCC-GT---G--GG-AG--AT--TACGCTAGCACTGCGTC-GT-T-TTA
gi|25650 : catcgTCAG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-CAACCA-GT---G--GG-AA--AT--TACTAGAGCTTTGCGTC-GT-T-TTAtttgaacagaacaaataaattggt
gi|25644 : cattgTCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAC---C---C----A-TCATCC-GT---G--GG-TA--AT--TACGCCAGTTCTTTGTC-GT-T-TTAttgaacagaacagaatgaaa
gi|25614 : catcgTCGG-ATAC---ACAC--G--TAT-G--TCAAT-ACAATTCTCTCCAT---C---C----A-TCACCT-GT---G--GG-AA--AT--TATGCTAGCTTTGCGTC-AT-T-CTAtttgaacagaacggaac
gi|25682 : catagTCGA-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCTAC---C---T----A-ACACCC-GT---G--GG-AA--AT--TACGTCATCTCTACGTC-GT-T-TTAtt
gi|25626 : atcgTCGG-AAAC---CCAT--G---GT-GA-CAATT-CTGACACTCTCCAT---C---C----A-TCACCT-GT---G--GG-AA--AA--TACACTAGTTCTGCATC-GT-T-TTAtt
gi|25629 : catcgTCGG-ATAC---TAAC--G--AGT-GCTA-ATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCACCT-GT---A--GG-AA--AA--TACGCTTGCTCTGCGTC-GT-T-TTAtt
gi|25606 : catcgTCAG-ATAC---CCAC--GGGTGT-CAT---TT-CCATTACTCTCCAT---A---C----A-TCACAC-GT---G--GG-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCAAC-GT-T-TTAtt
gi|25620 : cattgTCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-GG-CAATT-CCGATACTTTCTAT---C---C----A-TCACCC-AT---G--AG-CA--AG--TATGCTAGCTCTGCGTT-GT-T-TTAttttaacaaaacagaac
gi|25678 : catcaTCGG-ATTG---CCAT--G--GAT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCC-GT---G--GG-AA--AA--TACGCTAGtt
gi|25587 : atcgTCGA-ATAC---CCAC--G--CGT-AATCGATT-CTAATACTCT-CA-----------------ACCG-GC---G--AA-A---AT--TACGCTAGCTCTGCGTCtagtctgcaatattttatttgaatagaacagaacaaaatacagcttgcatttaaatggcttttaca
gi|25658 : catcgTCGA-ATAC---CCAC--A--GGT-AACCTATT-CCGATACTCTCCAT---T---C----ATTCACCC--T---G--Gattttatttgaacaaaacagaac
gi|25647 : catcgTTGG-ATAC---CCCC--A--GGT-GA-CAATT-CTTATACTCTCCAT---C---C----A-TCAACC-TT---G--GG-AA--AT--TACGCCAACTTCATGTC
gi|25608 : caccaTCGA-ATACAC-CCGG--G--TGT-CA--CAT--CCGATACTTTCCAT---------------CACCC-AT---G--GG-AA--AA--TACGCCAGCTCTGTGTC-GT-T-TTAttttatttgaacagaatggaa
gi|25687 : catcgTCGG-ATAC---CCAT--G--GGT--GTCAATT-ACTACACTC-------------------TCACCC-AT---G--GG-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCtt
gi|25654 : cgTCGG-ATGC---CC-C--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---T----A-TCA-CA-GTATCG--GG-GT--AT--T
gi|25640 : catcgTCTG-GTAC---CAAC--G---GA-AGTCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCTATC-GT-------A-ATTAAT--TACGTTAGCTCTGTGTC
gi|25653 : catcgTCGG-ATAC---CCCC--G--GGT-G-TCAATT-CTGATACTCTCCAT---C---CGTGAA-TTACCT-GT------GG-AT--AT--Tattttatttgaacctaacagctaccgttga
gi|25656 : catcgTCGG-CTAC---CCAA--G--GGT-T-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---T---C----A-TCATC-------G--GA-AT--GG--TTTACT-------CGTTGGTAT-TT----GA-CGATGATGTAAAGCC-TAC----GATTGGTcgacgacggtattcgtgtcgtattc
gi|25656 : catagTCAA-ATAC---CAAC--G--AGT-AAACCATT-CCGAT
gi|25631 : catagtcggctacccaagggtttcaattccgatactctccattcatcTTGG-ATAC---CCACTGG--TGT-----------CAAT----TCCAT---T------------ACCC-AT---A--GG-AA--AT--TACGCTAGCTCTGCGTCGCT-T-cgatgatgtaaagcctacgattggt
gi|25634 : catcgTCAG-ATAC---CTAC--GGGTGTCAATCC------------CTTCAT---C---C----A-TCACCA-GT---G--GA-AT--AT--TACGATGACTTAGCGTT-GT-T-TTAtatt
gi|25623 : catcgTCGG-ATAC---CCAA--G--GGT-G-TCAATT-CCGATGATCTCCAT---A---C----A-TCACCT-G----------------------CTAGCTCTGCATTGtt
gi|25661 : catcgTCGG-ATACATCCCCC--G--GGT-A-TCAATT-GCGATACTCTCCAT---C---C----A-TCAC
gi|25683 : cattgTCGG-ATAC---CTCC--G---GT-C-TCAATT-CCGATAATCTCCAT---T---C----A-TCA
gi|25657 : atcgTCGG-ATAC---CCCC--A--GGT-G-TCAATT-TCAATACTCTCCAT---C---C----A-TCA
gi|25589 : catcgTCGG-ATAC---CGCC--G---GT-G-TCAATT-CTGATACTCTCCGT---C---C----A-TCAC
gi|25659 : catcgTCGG-ATTT---CCACCGG--TGT----CAATT-CCGATACTCTCCAT---
gi|25615 : catcgTCGG-ATAC---TCCC--G--GGT-G-TTAATT-CCGATACTTTCCAC---C---C----A-TCA
gi|25660 : cattgTCGG-ATAC---CCCC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACGCTCC
gi|25621 : catcgCGG-ATAC---CCAC--A--CGT-AATCTATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACAG-AT---G--GG-AT--AT--TACACTGGCTTTGGATCATT-T-CTACCAAG-TCACGATGCAA--CAATAT----GATTGGTTCCATCACGATTTCATGAAGGGAATATTATCC-AATCGC-AATGCTAGTTTCATGCAAACGCCATACTGACAActccgt
gi|25617 : catggcCGG-ATAC---CCAC--G--TGT-AATCCATT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCT-GT---G--GG-AT--AT--TGCACTACGTTTGTGTCATT-T-CTACCAAG-CCACGACACAG--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCAT-AAGGGAAGGTTATCC-AAT--CTGATGCTAGTTTCATATAAATGCCATTTTAATAA
gi|25596 : catcgcCGT-ATAC---CCAC--G--CTT-AATCAATT-CCGATACTCTCCAT---T---A----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCATTGTT-T-TTACTAAG-CAACAATGCAA--ACATAT----GATTGGTTACTTCACGATTTCATGAAGGGAACATCATCC-AAATGC-AACGCTAATTTCATGCAAATGCCATTTTGAT
gi|25610 : catcggCGG-ATAC---CCACCAG--TGT-CAT---TT-CTGATACTCTTCAT---C---C----A-TCAACC-GT---G--GG-AA--AT--TACACTAGTTATGTGTTGTT-T-
gi|25632 : catcggCGG-ATAC---CCAC--G--GGT-GA-CAATT-CCGATAGTCTCCAT---A---C----A-TCACCC-GT---G--GA-AA--AT--TACGCgtttgaacagaacaaaacaaaatacagc
gi|25652 : catcgCAG-ACAC---CCAT--G--GGT-G-TCGTTT-CCGATA-TCTTCAT---A---C----A-TTACCT-GT---G--GT-AA--AT--TAAGCTAACTCTGCTTC-GT-T-TTAgtttgttttttttaacagaat
gi|25599 : catcgGG-ATAC---CCAC--G--GGT-G-TCAATT-CCGATACTCTCCAT---C--------A-TCACCC-GT---G--GG-AA--AT--TACGCTAACTTAGAGTC-GT-T-TTAtt
gi|25679 : caccgctGG-ATGC---CCACTGG--TGT----CAACT-GCAATACTTTCCAT---C---C----A-TCACCG-GT---G--GG-AA--AT--TACACTAGCTCTGCGTTGtt
gi|25693 : atcgttgatG-ATAC---CT-C--G--CGT-AATCCATT-CCAATACTCTCCAT---T---T----A-TCACCT-GT---G--GG-AT--AT--TGCACTTGCTTTGCGTCGTT-A-ATACCAAG-TCACAATGTAA--CCATGT----GATTGG-TCCTTTGCAATTTCATGAAGGGaatagaacaaaatacagcta
gi|25597 : G-ATGC---CCAT--GGATGT-CAT---TT-CCAATACTCTACAT---C---C----A-TCACCC-AT---G--GG-AA--AT--TACGCAAGCTCCGCATCGTT-T-C
gi|25696 : catcgttt-ATAC---CCAT--G--GGG-TATCCATT-ACAAAACTCTCCAT---T---C----A-TCACCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTTGCTTTCCGTCGTT-G-CTGGCAAT-CCGAGATGCAA--CAGTAT----GATTGGTTCCCTCATGTTTACATAAAGTAAATTTTATCT-ATTCGC-ATCGCTCATTCCATaattaa
gi|25604 : -ATAC---CCAC--A--TGT-G-TCAACT-CCCATACTCTCCAT---C---C----A-TTACCC-GT---G--GG-AA--AT--TACACTAGCTCTGCTTC-GT-T-TTA
gi|25697 : catcgtcatTAC---CCAC--A---GT-TGTCAATT-CCGATACTCTCCAT---C---A----A-TTTCCC-GT---G--GG-AA--AT--TACTCTAACTCTGCGTC-GT-T-TTAtt
gi|25703 : GT-AATCCATT-ATGATACTCTCCAT---T---C----A-TCACCC-GA---G--GG-AT--AT--TACGCATGCTTCTTGTCATT-G-CAGCCAAT-CCGAGATGCAA--TCATAT----GATTGGTTCCTTCATGTTTTCACGAAACAAAATTTATCC-AATAGC-ATCGTTtttgaacagaacaaaatacagcta
gi|25705 : gT-CCGATACTCTCCAT---T---T----A-TAACCT-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGTTTTGCGTCTTT-T-CTATCGAG-CCATGACGCAA--CCGTAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAACTTTATCC-AATCGC-AACATAAGTTTCATGTAAACGCTGTT
gi|25701 : ATACTCTCCAT---T---T----A-TTACCC-GT---G--GG-AT--AT--TACACTAGCTTTGCGTCGTT-T-CTACCAAG-CCACAATGCAA--CCATTT----AA--------TTCATGATTTCATGAAGGGGACGTTATCC-AATCGC-AACGCTAATTTCATGTAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25706 : acccacactggttggtctcggtagaaactcCCC-GT---G--CT-AT--AT--TTCACTAGCTTTGCGTCTTT-TTCTACCAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTGTCC-AATCGC-AACGCTAGTTTCACG
gi|25707 : ATAT----GATTGGTTCCTCCACGATTGCATGAAGGTAACGTTATCC-AATCGC-ATCGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAAttagctgtattttg
gi|25708 : ATTTCATGAAGGGAACGTTACCC-AGTCAC-AACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGA
gi|25685 : TTTCATGAAGGAAACGTTATCC-AATCGC-AACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25709 : tcttcggataccctagggtgtcaattctaatactctccatccatcacccaaggttaattacactagctctgcattgttctatttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcTCC-AATCGC-AACGCTAATTTCATGCGAACGCCGTTTTGATAAca
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 000 2 4 1 222222222 0 000 0 0 00 2 11 11111 0 0 0 22222 0 11 2222 0 0
lowQualScore : . ... . . . ......... . ... . . .. . .. ..... . . . ..... . .. .... . .
lowQualScore : 4 888 4 8 1 444444444 4 777 4 4 66 4 11 11111 1 5 5 22222 9 33 0000 9 9
consensus : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
Reference ( family-259 ) : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCNATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25586 : TCCG-ATAC---CCACGGATG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-T--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTGGCGGTTTCATGTAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCGTGCAAACGCCGTT
gi|25587 : catcgTCGA-ATAC---CCACGCGTAATCGATTCTAATACTC----------------TCA---ACC-GG-C--GAAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCAT-TT-
gi|25588 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----AAGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-tatttgaacaaaacagaac
gi|25589 : catcgTCGG-ATAC---CGCCG-GTG-TCAATTCTGATACTCTCCGTC---C----A-TCA---Ctatt
gi|25590 : catcgTCGG-ACAC---CTACACGTTATCCTTTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GC-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----TAAG-CCACGATACGA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGGAGGGAACGTTA-TCT-TATTGCAATGCTAGTTTCGTGTAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25591 : catcgTTGG-ATAC---TAAAGTGTAATTCATTCCGGTACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAACGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCATGATTTCATGAAGGGAATGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTGCATGCAAA
gi|25592 : catctTCGG-ATAC---CTACAGGTG-TCAATTCTGATACTCTCCATG---C----A-TCATCGCCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACATTAGTTTTGCGTTAT-TT--TATTTGAACAA---CACAATACAG--CTA
gi|25593 : catggTCAG-ATAC---CCACGCATAATCCATTATGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-GAAAAAAAT--T-----ACGCTACCTTTGCGTCGT-TT-
gi|25594 : catcgTCGG-ATAT---CCTCGAGTGATCTATTCCGATGCTCTCCATC---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGTTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGAAA--CAATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCTTGAAGGGAACGTTA-TTC-AATCGCAACGCTAGTGTCATGTTAACACCGTTTTGATAAtatt
gi|25595 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAA--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25596 : catcgCGT-ATAC---CCACGCTTAATCAATTCCGATACTCTCCATT---A----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCATTGT-TT-TTAC-----TAAG-CAACAATGCAA--ACATAT----GATTGGTTACTTCACGATTTCATGAAGGGAACATCA-TCC-AAATGCAACGCTAATTTCATGCAAATGCCATTTTGATtatt
gi|25597 : catcggG-ATGC---CCATGGATG-TCATTTCCAATACTCTACATC---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACGCAAGCTCCGCATCGT-TT-C
gi|25598 : catcgtttTCGGTAAAC---CAACGCGTAATCCATTTCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----TCACTAGCTTTGCGTCTT-TT-CTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTG-TCC-AATCGCAACGCAAGTTTCATGCAAACTCCGTTTTGATAAaattaa
gi|25599 : catcgGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC--------A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAACTTAGAGTCGT-TT-
gi|25600 : caccgctTCAG-ATAC---CCACGCGTAATACATTCCGATACTCTCCATT---T----G-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----AAACTGGCTTTGTGTTGT-TT-CTAC-----CAAG-TCAAAATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACAATATCATGAAGGGAAGGTTA-TCC-AGCCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACCCCGTTTTGATAAtatt
gi|25601 : cattgTCGG-ATAC---CCAGGCGTGATTCATTCCGTTACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATATATT-----ACACTAGCTTTGCATCAT-TT-CTAC-----CAAG-C-ACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAAGTTA-TTC-AATTGCAATGCAAGTTTCATGCAAACGCCATTTTGATAA
gi|25602 : cagcaTCGA-ATAC---CCAC-TGTAATTCATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCA-TA-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCCT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AACCTCAATGCTAGATTCATGCAAACGCCAATTTAATAA
gi|25603 : catcgTCGG-ATAC---CCATGTGTAATCCATTCTAATAATCTCCATT---C----A-TCA---TTCTGT-T--AGATAT--T-----GCAATAACT--GCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCATGATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACTGTTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25604 : catgg-ATAC---CCACATGTG-TCAACTCCCATACTCTCCATC---C----A-TTA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCTTCGT-TT-
gi|25605 : catcgtcatTCGG-ATAC---CCATGTGTAATACATTCAGATACTCTTGGTT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCGTCGT-TT-TTAC-----TAAG-CCACCATGCAG--CCATAT----GAATGGTTCCTTCATGATTCCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAATGCTAGTTTCATGCAAAAGCTATTTTGATAAtatt
gi|25606 : catcgTCAG-ATAC---CCACGGGTG-TCATTTCCATTACTCTCCATA---C----A-TCA---CAC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCAACGT-TT-
gi|25607 : cattgTCGG-ATAC---CCACGCGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---A----A-TCA---CGC-AT-G--GAATAT--T-----ACACTTGTTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGTAACGTAA-TCC-AATCGCAACGGTAGTTTCATGCAAAtattttaacaaaacagaac
gi|25608 : catcgTCGA-ATAC---ACCCGGGTG-TCACATCCGATACTTTCCATC------------A---CCC-AT-G--GGAAAA--T-----ACGCCAGCTCTGTGTCGT-TT-taagactttgttaa
gi|25609 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCATAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GAATAT--A-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTACACGATTTCATGAAAGGAACATAA-TCC-AATCACAATGCTAGTTTCAT---AACGTCATTtatt
gi|25610 : catcgCGG-ATAC---CCACCAGTG-TCATTTCTGATACTCTTCATC---C----A-TCA---ACC-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGTTATGTGTTGT-TT-
gi|25611 : catcggTCGG-TTAC---CCACGCTTAATCCATTCCGATATTCTCTATT---C----A-TCC---CCT-GTAG--GGTTTT--T-----ACACTAGCTTTGCATCGT-TT-CTAC-----CAAA-CCACAATGCAA--ATATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGGAACGTTA-TCC-ATTCACAATGCTAGTTCCATGCAAATGCCATTTTGACAAgtttgaacagaacaaaacaaaatacagc
gi|25612 : catcgTCGG-ATAC---CCCTGGGTG-TCAATTCCGATTCTCTCCATC---C----G-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCATAAT-TT-
gi|25613 : cattgTTGG-ATAC---CCACGCATAGTCCAT------ACTCTCCATT---T----A-TAA---CCC-GT-G--GCATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-CTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAGGTTA-TCC-AATCGCAATGTTGGTTTCATGCAAAGGTTGTTTTGATtatt
gi|25614 : catcaTCGG-ATAC---ACACGTATG-TCAAT-ACAATTCTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAT--T-----ATGCTAGCTTTGCGTCA--TT-CTA
gi|25615 : catagTCGG-ATAC---TCCCGGGTG-TTAATTCCGATACTTTCCACC---C----A-TCA---tt
gi|25616 : cattgTCGG-ATAC---CCACACGATATCCGTTCCGATACTCTTCATT---TT---A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--A-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-AGAC-----CAAG-CAACATTGCAA--CCATGT----GATTGGTTACTTCACGATTTCAAGAAAGGAACGTTA-TCC-AATCGCTACTCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25617 : catcgCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----GCACTACGTTTGTGTCAT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGACACAG--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCAT-AAGGGAAGGTTA-TCC-AATC-TGATGCTAGTTTCATATAAATGCCATTTTAATAA
gi|25618 : catcgcTCGC-ATAA---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCTATA---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGAAAT--T-----ATGCCAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25619 : catcgatgTTGG-ATAC---CCATGTGTGATCCGTTCCTATACTCTGCATT---T----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGATTTGTGCAGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGTTGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCATAATTTAATGAAAGGAACGTTA-TCC-AATCGAAACACTAGCTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25620 : caccaTCGG-ATAC---CCACGGGTGG-CAATTCCGATACTTTCTATC---C----A-TCA---CCC-AT-G--AGCAAG--T-----ATGCTAGCTCTGCGTTGT-TT-
gi|25621 : catcaCGG-ATAC---CCACACGTAATCTATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CAG-AT-G--GGATAT--T-----ACACTGGCTTTGGATCAT-TT-CTAC-----CAAG-TCACGATGCAA--CAATAT----GATTGGTTCCATCACGATTTCATGAAGGGAATATTA-TCC-AATCGCAATGCTAGTTTCATGCAAACGCCATACTGACAAtatt
gi|25622 : catggcTCGG-ATAC---CCATGTGTAATCAATTTTGATACTCTTTATTGATT----A-TTA---TCC-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTTTGTCGT-TT-CTAC-----CAAA-ACACAACGCAG--CGGTAG----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGATAA
gi|25623 : catcaTCGG-ATAC---CCAAGGGTG-TCAATTCCGATGATCTCCATA---C----A-TCA---CC-----------------------TGCTAGCTCTGCATTG
gi|25624 : catcgTCGG-ATAC---CCGCTTGTGATTTATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCC-GT-G--AGATAT--T-----ACACTAGTTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCAAAT----AATTGGTACTTTCATGATTTCAAGAAGGGAACGTTA-TCC-GATTGCAGCACTAGTTTCATGTAAAAGCCATTT
gi|25625 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCGTAGTCCATTCCGATACTCTTTATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----TAACTAGCTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCACAATGCAA--TCATAT----AAATGGTTTCCTCATGATTTCCTGAAAGGAATGTTC-TTC-AATCCCAATGCTAGTTTCATGCAAACG-AGTTTTGAGAA
gi|25626 : catcgTCGG-AAAC---CCATG-GTGA-CAATTCTGACACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAA--T-----ACACTAGTTCTGCATCGT-TT-
gi|25627 : catcgTCGG-ATAC---TCACGGGTG-TCAATTCCTATACTCTCCATC---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-tatt
gi|25628 : catcgTCGT-ATAC---CCACGTATGATCTATTCAGATACTCTTCATT---A----A-TCA---CCT-GT-A--GGATAT--T-----ACACT----------TGA-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATACAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGATCGTTA-TCCAAATCGCAACGCTATTTTCATGTGAACGCCGTTTTGATAAtatttaaacagaaccgaacaaaatacagcta
gi|25629 : catcgTCGG-ATAC---TAACGAGTGCT-AATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-A--GGAAAA--T-----ACGCTTGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25630 : catcgTTGG-ATAC---CCACGTGTAACCTATTCTGATAGTGTCCATT---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--T-----GAACTAGTAGTGCGTTGT-TT-TTAT-----CAAGTCCA-AATGCAA--CCATAT----GATTGGTATCTTCACGATTTCATGAAGGGAACATTA-TCC-AATCGCAATACTAGTTTAATGCAAAATCCGTTTTGTTAAtatt
gi|25631 : catccTTGG-ATAC---CCACTGGTG-TCAATTCC---------------------A-TTA---CCC-AT-A--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGC-TT-
gi|25632 : catcgCGG-ATAC---CCACGGGTGA-CAATTCCGATAGTCTCCATA---C----A-TCA---CCC-GT-G--GAAAAT--T-----ACGCtatt
gi|25633 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCGTATTCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---ATC-GT-G--AGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGCCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----CATTGGTTACTTCAAGATTTCATG-ATTGAATGTTA-TTC-AATCGCAAC-----------GCAAACGCCATATTGATAAgtttgttttttttaacagaat
gi|25634 : cattgTCAG-ATAC---CTACGGGTG-TCAATCCC-------TTCATC---C----A-TCA---CCA-GT-G--GAATAT--T-----ACGATGACTTAGCGTTGT-TT-
gi|25635 : catcgTCGG-ATAC---CCAAGCGTAATCCATTCTGATACTCTCCATT---T----A-TCA---C---------------------------TAGCTTTGTGTCAT-TT-CTAC-----AAAG-CCAAGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTTCATGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATTGCAACGCTAGTTTCATGCGAAAGCTGTATTGGTAAtatt
gi|25636 : catcgTCGG-TTAC---TGACGTGTGAACTATTCTGATGCTCTCTATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAA--T-----ACACTAGTTTTGTGTCGT-AT--TAC-----CAAG-CCACGATGTAA--TCATA-----GATTGATTCGTTCACGATTTTATGAACAGAACGTTA-TCC-TATCGCAACGGTAGTTTCATGTTAACGCCGTTTTGATAA
gi|25637 : catcgTCGG-ATAT---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCCCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGA-ATA-T-----ACGCTAGCTCTGTGCCGT-TT-
gi|25638 : caccgTCGG-ATAC---CCGCGTGTAATCCATTCCGATTCGCTCCATT---T----A-TCG---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-ACACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTTACGATTGCGTTAAGAGAACGTTA-TCC-Atatttgaacaaaacagaac
gi|25639 : catcgTCCG-ATAT---TCACGCGTACTCTATTCCGATAATCTTCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGCCGT-TT-CT------------------TCCAA--CCGTAT----AATTGGTT--------ATTCCACGA--------TTA-TCC-AATCGCAACGTTAATTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25640 : catcgTCTG-GTAC---CAACGGAAG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCT---ATC-GT-A--ATTAAT--T-----ACGTTAGCTCTGTGTCAT-TT-
gi|25641 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCAAATACTCTCCATC---C----G-TCA---CCC-GT-G--GAAAAT--T-----ATGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-tatttgaacctaacagctaccgttga
gi|25642 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGATG-TCAAT-CCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCATCGT-TT-tatt
gi|25643 : catcgTCTG-ATAC---CCAC--------AACTCCGATCCTCTTCCTT---C----A-TCA---CCC-G--------------------------CTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCGCAATGCAA--CC--AT----GATTA-------------TTCATTAAGGGAACGT-------AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAGACGTCGTTTTGATAAtatt
gi|25644 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCACC---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGTAAT--T-----ACGCCAGTTCTTTGTCGT-TT-
gi|25645 : catcgTCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTC--TT---T----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--C-----ACACTAGCGTTGCATCGT-TT-CTTC-----CAAG-CCACGATGCAA--CAATAT----GATTtatttgaacagaacggaac
gi|25646 : catcgTCGG-ATAC---CCACGAGTG-TCAGTTCCGATACTCGCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTCGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25647 : catcgTTGG-ATAC---CCCCAGGTGA-CAATTCTTATACTCTCCATC---C----A-TCA---ACC-TT-G--GGAAAT--T-----ACGCCAACTTCATGTCTT-TT-tatttgaacagaacggaac
gi|25648 : caccaTCGG-ATAC---CCACAA---------TCCGATACTTTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGGTAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-TTAC-----CAAG-CCAatttgaacagaatggaa
gi|25649 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGCGA-CATTTCCGATACTCAGCATA---C----A-TTA---CCC-GT-G--GGAGAT--T-----ACGCTAGCACTGCGTCGT-TT-
gi|25650 : catcgTCAG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-CAA---CCA-GT-G--GGAAAT--T-----ACTAGAGCTTTGCGTCGT-TT-tatttgaacagaacaaataaattggt
gi|25651 : cattgTCGG-ATAC---CCACGCGTAATCCATTTCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GG-G--GGAAAT--A-----ACACTGGCTTTGtattgaacagaacagaatgaaa
gi|25652 : catcaCAG-ACAC---CCATGGGTG-TCGTTTCCGATA-TCTTCATA---C----A-TTA---CCT-GT-G--GTAAAT--T-----AAGCTAACTCTGCTTCGT-TT-
gi|25653 : catcgTCGG-ATAC---CCCCGGGTG-TCAATTCTGATACTCTCCATC---CGTGAA-TTA---CCT-GT----GGATAT--TCGACGACGGTA--TTCGTGTCGTATT-Ctatt
gi|25654 : catcgTCGG-ATGC---CC-CGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---T----A-TCA---C
gi|25656 : catcgTCGG-CTAC---CCAAGGGTT-TCAATTCCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---TC--------GGA-AT--------------GGTTTAC-TCGT-TG-GTAT-----TTGA-CGATGATGTAAAGCC-TAC----GATTGGTagtatcggggtatt
gi|25657 : catagTCGG-ATAC---CCCCAGGTG-TCAATTTCAATACTCTCCATC---C----A-TCA---
gi|25658 : catcgTCGA-ATAC---CCACAGGTAACCTATTCCGATACTCTCCATT---C----ATTCA---CCC--T-G--G
gi|25659 : catcgTCGG-ATTT---CCACCGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCAT
gi|25660 : catcgTCGG-ATAC---CCCCGGGTG-TCAATTCCGATACGCTCCCTC---C----G-T
gi|25661 : catcgTCGG-ATACATCCCCCGGGT-ATCAATTGCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---C
gi|25677 : cattgTCGG-ATAC---CCACGAGTG-TCAATTATGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-A--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCATTGT-TT-TT
gi|25678 : attgTCGG-ATTG---CCATGGATG-TCAATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAA--T-----ACGCTAGttt
gi|25679 : atcgGG-ATGC---CCACTGGTG-TCAACTGCAATACTTTCCATC---C----A-TCA---CCG-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCGTTGtagtctgcaatattttatttgaatagaacagaacaaaatacagcttgcatttaaatggcttttaca
gi|25680 : atcgttgatTCGG-ATAC---CAACGTGTAATCCATTCCGAT-CTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAC--T-----ACACTAGGT--GCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCGCAACGCAG--AGATAT----GATTGGTTTCTTCACG-TTTCCTGAAGGGAACATAA-TCC-AAGCGCAACGC--GTTTCATTCAAAaatagaacaaaatacagcta
gi|25681 : atcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATACCGATACCCTTCTTC---C----A-TCA---CCC-AT-G--GTAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25682 : atcgTCGA-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCTACC---T----A-ACA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGTCATCTCTACGTCGT-TT-
gi|25683 : atcgTCGG-ATAC---CTCCG-GTC-TCAATTCCGATAATCTCCATT---C----A-TCA---tatt
gi|25685 : atcgTCGG-ATAC---CCTAGGGTG-TCAATTCTAATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-AA-G--GTTAAT--T-----ACACTAGCTCTGCATTG--TT-CTA
gi|25685 : tctTTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAAtttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcttatcaaaacggtgtttgcataaaactagcgttgcgattggataacgtttccttcatgaaaca
gi|25686 : tcttcggataccctagggtgtcaattctaatactctccatccatcacccaaggttaattacactagctctgcattgttctatttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcTCGG-ATAC---CCACGCATAATCCATTTTGATACTCTCAATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCATCAT-TT-CTAC-----CAAG-ca
gi|25687 : tcgTCGG-ATAC---CCATGGGTG-TCAATTACTACACTCTC----------------A---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGC
gi|25688 : cgTTGG-ATAC---CCATGCGTAATCCATTCCGATACTCTCCATG---T----A-TCA---CTT-CT-G--GTATAG--C-----ACACTAACTTTGCATCGT-TT-CTAA-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATATGCCGGATTGGTTCCTTCACGATTTCATAAATGGAACGGTGTTTC-A--CGCAA
gi|25689 : cgTCGG-ATAC---CCATGTGTTATCCATTGCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---TCC-GT-G--GGATAC--A-----ACACTAGATTT
gi|25690 : cgTCAG-ATAT---TCACGTGTGGT-AATTCCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAT--T-----TTGCTAGCTCTGCTTCGT-TT-TT
gi|25691 : gTCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGG-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGGAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATGGCAACGCTTGTTTCATGCAAACACCGTTCTGATAAtttaacagaacaaaatgc
gi|25692 : TTGG-ATAC---CCACATATAATCCATTCCGATACTCTCCATG---T----A-TCA---CCC-GT-T--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----AAAG-CCACAAGGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGTG-------------ATCACAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATA
gi|25693 : G-ATAC---CT-CGCGTAATCCATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----GCACTTGCTTTGCGTCGT-TA-ATAC-----CAAG-TCACAATGTAA--CCATGT----GATTGG-TCCTTTGCAATTTCATGAAGGG
gi|25696 : -ATAC---CCATGGGGTATCCATTACAAAACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTTGCTTTCCGTCGT-TG-CTGG-----CAAT-CCGAGATGCAA--CAGTAT----GATTGGTTCCCTCATGTTTACATAAAGTAAATTTTA-TCT-ATTCGCATCGCTCATTCCAT
gi|25697 : TAC---CCACAGTTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---A----A-TTT---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACTCTAACTCTGCGTCGT-TT-
gi|25701 : ATACTCTCCATT---T----A-TTA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATTT----AA--------TTCATGATTTCATGAAGGGGACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAATTTCATGTAAACGCCGTTTTGATAAtatttgaacagaacaaaatacagcta
gi|25703 : acccacactggttggtctcggtagaaactcGTAATCCATTATGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-GA-G--GGATAT--T-----ACGCATGCTTCTTGTCAT-TG-CAGC-----CAAT-CCGAGATGCAA--TCATAT----GATTGGTTCCTTCATGTTTTCACGAAACAAAATTTA-TCC-AATAGCATCGTT
gi|25705 : gTCCGATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGTTTTGCGTCTT-TT-CTAT-----CGAG-CCATGACGCAA--CCGTAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAACTTTA-TCC-AATCGCAACATAAGTTTCATGTAAACGCTGTT
gi|25706 : ---CCC-GT-G--CTATAT--T-----TCACTAGCTTTGCGTCTT-TTTCTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTG-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCACG
gi|25707 : ATAT----GATTGGTTCCTCCACGATTGCATGAAGGTAACGTTA-TCC-AATCGCATCGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAAttagctgtattttg
gi|25708 : ATTTCATGAAGGGAACGTTA-CCC-AGTCACAACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGA
gi|25709 : -TCC-AATCGCAACGCTAATTTCATGCGAACGCCGTTTTGATAA
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 000 2 4 1 222222222 0 000 0 0 00 2 11 11111 0 0 0 22222 0 11 2222 0 0
lowQualScore : . ... . . . ......... . ... . . .. . .. ..... . . . ..... . .. .... . .
lowQualScore : 4 888 6 9 3 444444444 4 777 4 4 66 4 11 11111 1 5 5 22222 9 33 0000 9 9
consensus : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
Reference ( family-259 ) : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25586 : TCCG-ATAC---CCACGGATG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-T--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTGGCGGTTTCATGTAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCGTGCAAACGCCGTT
gi|25587 : catcgTCGA-ATAC---CCACGCGTAATCGATTCTAATACTC----------------TCA---ACC-GG-C--GAAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCAT-TT-
gi|25588 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----AAGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-tatttgaacaaaacagaac
gi|25589 : catcgTCGG-ATAC---CGCCG-GTG-TCAATTCTGATACTCTCCGTC---C----A-TCA---Ctatt
gi|25590 : catcgTCGG-ACAC---CTACACGTTATCCTTTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GC-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----TAAG-CCACGATACGA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGGAGGGAACGTTA-TCT-TATTGCAATGCTAGTTTCGTGTAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25591 : catcgTTGG-ATAC---TAAAGTGTAATTCATTCCGGTACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAACGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCATGATTTCATGAAGGGAATGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTGCATGCAAA
gi|25592 : catctTCGG-ATAC---CTACAGGTG-TCAATTCTGATACTCTCCATG---C----A-TCATCGCCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACATTAGTTTTGCGTTAT-TT--TATTTGAACAA---CACAATACAG--CTA
gi|25593 : catggTCAG-ATAC---CCACGCATAATCCATTATGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-GAAAAAAAT--T-----ACGCTACCTTTGCGTCGT-TT-
gi|25594 : catcgTCGG-ATAT---CCTCGAGTGATCTATTCCGATGCTCTCCATC---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGTTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGAAA--CAATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCTTGAAGGGAACGTTA-TTC-AATCGCAACGCTAGTGTCATGTTAACACCGTTTTGATAAtatt
gi|25595 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAA--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25596 : catcgCGT-ATAC---CCACGCTTAATCAATTCCGATACTCTCCATT---A----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCATTGT-TT-TTAC-----TAAG-CAACAATGCAA--ACATAT----GATTGGTTACTTCACGATTTCATGAAGGGAACATCA-TCC-AAATGCAACGCTAATTTCATGCAAATGCCATTTTGATtatt
gi|25597 : catcggG-ATGC---CCATGGATG-TCATTTCCAATACTCTACATC---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACGCAAGCTCCGCATCGT-TT-C
gi|25598 : catcgtttTCGGTAAAC---CAACGCGTAATCCATTTCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----TCACTAGCTTTGCGTCTT-TT-CTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTG-TCC-AATCGCAACGCAAGTTTCATGCAAACTCCGTTTTGATAAaattaa
gi|25599 : catcgGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC--------A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAACTTAGAGTCGT-TT-
gi|25600 : caccgctTCAG-ATAC---CCACGCGTAATACATTCCGATACTCTCCATT---T----G-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----AAACTGGCTTTGTGTTGT-TT-CTAC-----CAAG-TCAAAATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACAATATCATGAAGGGAAGGTTA-TCC-AGCCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACCCCGTTTTGATAAtatt
gi|25601 : cattgTCGG-ATAC---CCAGGCGTGATTCATTCCGTTACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATATATT-----ACACTAGCTTTGCATCAT-TT-CTAC-----CAAG-C-ACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAAGTTA-TTC-AATTGCAATGCAAGTTTCATGCAAACGCCATTTTGATAA
gi|25602 : cagcaTCGA-ATAC---CCAC-TGTAATTCATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCA-TA-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCCT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AACCTCAATGCTAGATTCATGCAAACGCCAATTTAATAA
gi|25603 : catcgTCGG-ATAC---CCATGTGTAATCCATTCTAATAATCTCCATT---C----A-TCA---TTCTGT-T--AGATAT--T-----GCAATAACT--GCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCATGATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACTGTTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25604 : catgg-ATAC---CCACATGTG-TCAACTCCCATACTCTCCATC---C----A-TTA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCTTCGT-TT-
gi|25605 : catcgtcatTCGG-ATAC---CCATGTGTAATACATTCAGATACTCTTGGTT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCGTCGT-TT-TTAC-----TAAG-CCACCATGCAG--CCATAT----GAATGGTTCCTTCATGATTCCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAATGCTAGTTTCATGCAAAAGCTATTTTGATAAtatt
gi|25606 : catcgTCAG-ATAC---CCACGGGTG-TCATTTCCATTACTCTCCATA---C----A-TCA---CAC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCAACGT-TT-
gi|25607 : cattgTCGG-ATAC---CCACGCGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---A----A-TCA---CGC-AT-G--GAATAT--T-----ACACTTGTTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGTAACGTAA-TCC-AATCGCAACGGTAGTTTCATGCAAAtattttaacaaaacagaac
gi|25608 : catcgTCGA-ATAC---ACCCGGGTG-TCACATCCGATACTTTCCATC------------A---CCC-AT-G--GGAAAA--T-----ACGCCAGCTCTGTGTCGT-TT-taagactttgttaa
gi|25609 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCATAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GAATAT--A-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTACACGATTTCATGAAAGGAACATAA-TCC-AATCACAATGCTAGTTTCAT---AACGTCATTtatt
gi|25610 : catcgCGG-ATAC---CCACCAGTG-TCATTTCTGATACTCTTCATC---C----A-TCA---ACC-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGTTATGTGTTGT-TT-
gi|25611 : catcggTCGG-TTAC---CCACGCTTAATCCATTCCGATATTCTCTATT---C----A-TCC---CCT-GTAG--GGTTTT--T-----ACACTAGCTTTGCATCGT-TT-CTAC-----CAAA-CCACAATGCAA--ATATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGGAACGTTA-TCC-ATTCACAATGCTAGTTCCATGCAAATGCCATTTTGACAAgtttgaacagaacaaaacaaaatacagc
gi|25612 : catcgTCGG-ATAC---CCCTGGGTG-TCAATTCCGATTCTCTCCATC---C----G-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCATAAT-TT-
gi|25613 : cattgTTGG-ATAC---CCACGCAT-----AGTCC-ATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCC-GT-G--GCATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-CTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAGGTTA-TCC-AATCGCAATGTTGGTTTCATGCAAAGGTTGTTTTGATtatt
gi|25614 : catcaTCGG-ATAC---ACACGTATG-TCAAT-ACAATTCTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAT--T-----ATGCTAGCTTTGCGTCA--TT-CTA
gi|25615 : catagTCGG-ATAC---TCCCGGGTG-TTAATTCCGATACTTTCCACC---C----A-TCA---tt
gi|25616 : cattgTCGG-ATAC---CCACACGATATCCGTTCCGATACTCTTCATT---TT---A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--A-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-AGAC-----CAAG-CAACATTGCAA--CCATGT----GATTGGTTACTTCACGATTTCAAGAAAGGAACGTTA-TCC-AATCGCTACTCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25617 : catcgCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----GCACTACGTTTGTGTCAT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGACACAG--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCAT-AAGGGAAGGTTA-TCC-AATC-TGATGCTAGTTTCATATAAATGCCATTTTAATAA
gi|25618 : catcgcTCGC-ATAA---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCTATA---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGAAAT--T-----ATGCCAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25619 : catcgatgTTGG-ATAC---CCATGTGTGATCCGTTCCTATACTCTGCATT---T----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGATTTGTGCAGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGTTGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCATAATTTAATGAAAGGAACGTTA-TCC-AATCGAAACACTAGCTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25620 : caccaTCGG-ATAC---CCACGGGTGG-CAATTCCGATACTTTCTATC---C----A-TCA---CCC-AT-G--AGCAAG--T-----ATGCTAGCTCTGCGTTGT-TT-
gi|25621 : catcaCGG-ATAC---CCACACGTAATCTATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CAG-AT-G--GGATAT--T-----ACACTGGCTTTGGATCAT-TT-CTAC-----CAAG-TCACGATGCAA--CAATAT----GATTGGTTCCATCACGATTTCATGAAGGGAATATTA-TCC-AATCGCAATGCTAGTTTCATGCAAACGCCATACTGACAAtatt
gi|25622 : catggcTCGG-ATAC---CCATGTGTAATCAATTTTGATACTCTTTATTGATT----A-TTA---TCC-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTTTGTCGT-TT-CTAC-----CAAA-ACACAACGCAG--CGGTAG----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGATAA
gi|25623 : catcaTCGG-ATAC---CCAAGGGTG-TCAATTCCGATGATCTCCATA---C----A-TCA---CC-----------------------TGCTAGCTCTGCATTG
gi|25624 : catcgTCGG-ATAC---CCGCTTGTGATTTATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCC-GT-G--AGATAT--T-----ACACTAGTTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCAAAT----AATTGGTACTTTCATGATTTCAAGAAGGGAACGTTA-TCC-GATTGCAGCACTAGTTTCATGTAAAAGCCATTT
gi|25625 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCGTAGTCCATTCCGATACTCTTTATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----TAACTAGCTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCACAATGCAA--TCATAT----AAATGGTTTCCTCATGATTTCCTGAAAGGAATGTTC-TTC-AATCCCAATGCTAGTTTCATGCAAACG-AGTTTTGAGAA
gi|25626 : catcgTCGG-AAAC---CCATG-GTGA-CAATTCTGACACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAA--T-----ACACTAGTTCTGCATCGT-TT-
gi|25627 : catcgTCGG-ATAC---TCACGGGTG-TCAATTCCTATACTCTCCATC---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-tatt
gi|25628 : catcgTCGT-ATAC---CCACGTATGATCTATTCAGATACTCTTCATT---A----A-TCA---CCT-GT-A--GGATAT--T-----ACACT----------TGA-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATACAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGATCGTTA-TCCAAATCGCAACGCTATTTTCATGTGAACGCCGTTTTGATAAtatttaaacagaaccgaacaaaatacagcta
gi|25629 : catcgTCGG-ATAC---TAACGAGTGCT-AATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-A--GGAAAA--T-----ACGCTTGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25630 : catcgTTGG-ATAC---CCACGTGTAACCTATTCTGATAGTGTCCATT---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--T-----GAACTAGTAGTGCGTTGT-TT-TTAT-----CAAGTCCA-AATGCAA--CCATAT----GATTGGTATCTTCACGATTTCATGAAGGGAACATTA-TCC-AATCGCAATACTAGTTTAATGCAAAATCCGTTTTGTTAAtatt
gi|25631 : catccTTGG-ATAC---CCACTGGTG-TCAATTCC---------------------A-TTA---CCC-AT-A--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGC-TT-
gi|25632 : catcgCGG-ATAC---CCACGGGTGA-CAATTCCGATAGTCTCCATA---C----A-TCA---CCC-GT-G--GAAAAT--T-----ACGCtatt
gi|25633 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCGTATTCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---ATC-GT-G--AGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGCCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----CATTGGTTACTTCAAGATTTCATG-ATTGAATGTTA-TTC-AATCGCAAC-----------GCAAACGCCATATTGATAAgtttgttttttttaacagaat
gi|25634 : cattgTCAG-ATAC---CTACGGGTG-TCAATCCC-------TTCATC---C----A-TCA---CCA-GT-G--GAATAT--T-----ACGATGACTTAGCGTTGT-TT-
gi|25635 : catcgTCGG-ATAC---CCAAGCGTAATCCATTCTGATACTCTCCATT---T----A-TCA---C---------------------------TAGCTTTGTGTCAT-TT-CTAC-----AAAG-CCAAGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTTCATGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATTGCAACGCTAGTTTCATGCGAAAGCTGTATTGGTAAtatt
gi|25636 : catcgTCGG-TTAC---TGACGTGTGAACTATTCTGATGCTCTCTATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAA--T-----ACACTAGTTTTGTGTCGT-AT--TAC-----CAAG-CCACGATGTAA--TCATA-----GATTGATTCGTTCACGATTTTATGAACAGAACGTTA-TCC-TATCGCAACGGTAGTTTCATGTTAACGCCGTTTTGATAA
gi|25637 : catcgTCGG-ATAT---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCCCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGA-ATA-T-----ACGCTAGCTCTGTGCCGT-TT-
gi|25638 : caccgTCGG-ATAC---CCGCGTGTAATCCATTCCGATTCGCTCCATT---T----A-TCG---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-ACACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTTACGATTGCGTTAAGAGAACGTTA-TCC-Atatttgaacaaaacagaac
gi|25639 : catcgTCCG-ATAT---TCACGCGTACTCTATTCCGATAATCTTCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGCCGT-TT-CT------------------TCCAA--CCGTAT----AATTGGTT--------ATTCCACGA--------TTA-TCC-AATCGCAACGTTAATTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25640 : catcgTCTG-GTAC---CAACGGAAG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCT---ATC-GT-A--ATTAAT--T-----ACGTTAGCTCTGTGTCAT-TT-
gi|25641 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCAAATACTCTCCATC---C----G-TCA---CCC-GT-G--GAAAAT--T-----ATGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-tatttgaacctaacagctaccgttga
gi|25642 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGATG-TCAAT-CCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCATCGT-TT-tatt
gi|25643 : catcgTCTG-ATAC---CCAC--------AACTCCGATCCTCTTCCTT---C----A-TCA---CCC-G--------------------------CTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCGCAATGCAA--CC--AT----GATTA-------------TTCATTAAGGGAACGT-------AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAGACGTCGTTTTGATAAtatt
gi|25644 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCACC---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGTAAT--T-----ACGCCAGTTCTTTGTCGT-TT-
gi|25645 : catcgTCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTC--TT---T----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--C-----ACACTAGCGTTGCATCGT-TT-CTTC-----CAAG-CCACGATGCAA--CAATAT----GATTtatttgaacagaacggaac
gi|25646 : catcgTCGG-ATAC---CCACGAGTG-TCAGTTCCGATACTCGCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTCGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25647 : catcgTTGG-ATAC---CCCCAGGTGA-CAATTCTTATACTCTCCATC---C----A-TCA---ACC-TT-G--GGAAAT--T-----ACGCCAACTTCATGTCTT-TT-tatttgaacagaacggaac
gi|25648 : caccaTCGG-ATAC---CCAC--------AAT-CCGATACTTTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGGTAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-TTAC-----CAAG-CCAatttgaacagaatggaa
gi|25649 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGCGA-CATTTCCGATACTCAGCATA---C----A-TTA---CCC-GT-G--GGAGAT--T-----ACGCTAGCACTGCGTCGT-TT-
gi|25650 : catcgTCAG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-CAA---CCA-GT-G--GGAAAT--T-----ACTAGAGCTTTGCGTCGT-TT-tatttgaacagaacaaataaattggt
gi|25651 : cattgTCGG-ATAC---CCACGCGTAATCCATTTCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GG-G--GGAAAT--A-----ACACTGGCTTTGtattgaacagaacagaatgaaa
gi|25652 : catcaCAG-ACAC---CCATGGGTG-TCGTTTCCGATA-TCTTCATA---C----A-TTA---CCT-GT-G--GTAAAT--T-----AAGCTAACTCTGCTTCGT-TT-
gi|25653 : catcgTCGG-ATAC---CCCCGGGTG-TCAATTCTGATACTCTCCATC---CGTGAA-TTA---CCT-GT----GGATAT--TCGACGACGGTA--TTCGTGTCGTATT-Ctatt
gi|25654 : catcgTCGG-ATGC---CC-CGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---T----A-TCA---C
gi|25656 : catcgTCGG-CTAC---CCAAGGGTT-TCAATTCCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---TC--------GGA-AT--------------GGTTTAC-TCGT-TG-GTAT-----TTGA-CGATGATGTAAAGCC-TAC----GATTGGTagtatcggggtatt
gi|25657 : catagTCGG-ATAC---CCCCAGGTG-TCAATTTCAATACTCTCCATC---C----A-TCA---
gi|25658 : catcgTCGA-ATAC---CCACAGGTAACCTATTCCGATACTCTCCATT---C----ATTCA---CCC--T-G--G
gi|25659 : catcgTCGG-ATTT---CCACCGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCAT
gi|25660 : catcgTCGG-ATAC---CCCCGGGTG-TCAATTCCGATACGCTCCCTC---C----G-T
gi|25661 : catcgTCGG-ATACATCCCCCGGGT-ATCAATTGCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---C
gi|25677 : cattgTCGG-ATAC---CCACGAGTG-TCAATTATGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-A--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCATTGT-TT-TT
gi|25678 : attgTCGG-ATTG---CCATGGATG-TCAATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAA--T-----ACGCTAGttt
gi|25679 : atcgGG-ATGC---CCACTGGTG-TCAACTGCAATACTTTCCATC---C----A-TCA---CCG-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCGTTGtagtctgcaatattttatttgaatagaacagaacaaaatacagcttgcatttaaatggcttttaca
gi|25680 : atcgttgatTCGG-ATAC---CAACGTGTAATCCATTCCGAT-CTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAC--T-----ACACTAGGT--GCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCGCAACGCAG--AGATAT----GATTGGTTTCTTCACG-TTTCCTGAAGGGAACATAA-TCC-AAGCGCAACGC--GTTTCATTCAAAaatagaacaaaatacagcta
gi|25681 : atcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATACCGATACCCTTCTTC---C----A-TCA---CCC-AT-G--GTAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25682 : atcgTCGA-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCTACC---T----A-ACA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGTCATCTCTACGTCGT-TT-
gi|25683 : atcgTCGG-ATAC---CTCCG-GTC-TCAATTCCGATAATCTCCATT---C----A-TCA---tatt
gi|25685 : atcgTCGG-ATAC---CCTAGGGTG-TCAATTCTAATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-AA-G--GTTAAT--T-----ACACTAGCTCTGCATTG--TT-CTA
gi|25685 : tctTTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAAtttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcttatcaaaacggtgtttgcataaaactagcgttgcgattggataacgtttccttcatgaaaca
gi|25686 : tcttcggataccctagggtgtcaattctaatactctccatccatcacccaaggttaattacactagctctgcattgttctatttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcTCGG-ATAC---CCACGCATAATCCATTTTGATACTCTCAATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCATCAT-TT-CTAC-----CAAG-ca
gi|25687 : tcgTCGG-ATAC---CCATGGGTG-TCAATTACTACACTCTC----------------A---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGC
gi|25688 : cgTTGG-ATAC---CCATGCGTAATCCATTCCGATACTCTCCATG---T----A-TCA---CTT-CT-G--GTATAG--C-----ACACTAACTTTGCATCGT-TT-CTAA-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATATGCCGGATTGGTTCCTTCACGATTTCATAAATGGAACGGTGTTTC-A--CGCAA
gi|25689 : cgTCGG-ATAC---CCATGTGTTATCCATTGCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---TCC-GT-G--GGATAC--A-----ACACTAGATTT
gi|25690 : cgTCAG-ATAT---TCACGTGTGGT-AATTCCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAT--T-----TTGCTAGCTCTGCTTCGT-TT-TT
gi|25691 : gTCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGG-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGGAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATGGCAACGCTTGTTTCATGCAAACACCGTTCTGATAAtttaacagaacaaaatgc
gi|25692 : TTGG-ATAC---CCACATATAATCCATTCCGATACTCTCCATG---T----A-TCA---CCC-GT-T--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----AAAG-CCACAAGGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGTG-------------ATCACAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATA
gi|25693 : G-ATAC---CT-CGCGTAATCCATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----GCACTTGCTTTGCGTCGT-TA-ATAC-----CAAG-TCACAATGTAA--CCATGT----GATTGG-TCCTTTGCAATTTCATGAAGGG
gi|25696 : -ATAC---CCATGGGGTATCCATTACAAAACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTTGCTTTCCGTCGT-TG-CTGG-----CAAT-CCGAGATGCAA--CAGTAT----GATTGGTTCCCTCATGTTTACATAAAGTAAATTTTA-TCT-ATTCGCATCGCTCATTCCAT
gi|25697 : TAC---CCACAGTTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---A----A-TTT---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACTCTAACTCTGCGTCGT-TT-
gi|25701 : AACTC--ATACTCTCCATT---T----A-TTA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATTT----AA--------TTCATGATTTCATGAAGGGGACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAATTTCATGTAAACGCCGTTTTGATAAtatttgaacagaacaaaatacagcta
gi|25703 : acccacactggttggtctcggtagaGTAATCCATTATGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-GA-G--GGATAT--T-----ACGCATGCTTCTTGTCAT-TG-CAGC-----CAAT-CCGAGATGCAA--TCATAT----GATTGGTTCCTTCATGTTTTCACGAAACAAAATTTA-TCC-AATAGCATCGTT
gi|25705 : gTCCGATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGTTTTGCGTCTT-TT-CTAT-----CGAG-CCATGACGCAA--CCGTAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAACTTTA-TCC-AATCGCAACATAAGTTTCATGTAAACGCTGTT
gi|25706 : ---CCC-GT-G--CTATAT--T-----TCACTAGCTTTGCGTCTT-TTTCTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTG-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCACG
gi|25707 : ATAT----GATTGGTTCCTCCACGATTGCATGAAGGTAACGTTA-TCC-AATCGCATCGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAAttagctgtattttg
gi|25708 : ATTTCATGAAGGGAACGTTA-CCC-AGTCACAACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGA
gi|25709 : -TCC-AATCGCAACGCTAATTTCATGCGAACGCCGTTTTGATAA
blockSeqs : C A G CCGTGA A AT CGACG TTGAA AG GCCG
blockSeqs : G A A TGATT A A . . . .
blockSeqs : C A A TTT T . . . . .
blockSeqs : T A C CC T . . . . .
blockSeqs : G A C CC A . . . . .
blockSeqs : C A A TT A . . . . .
blockSeqs : A A C TT T . . . . .
blockSeqs : G A T GC A . . . . .
blockSeqs : C A A TT T . . . . .
blockSeqs : G A A CT A . . . . .
blockSeqs : C A A CC T . . . . .
blockSeqs : G A C TA A . . . . .
blockSeqs : C A A CC T . . . . .
blockSeqs : C A C TT T . . . . .
blockSeqs : T A C TT T . . . . .
blockSeqs : T A C TT T . . . . .
blockSeqs : T A C TT A . . . . .
blockSeqs : T A A TC T . . . . .
blockSeqs : G G C CC A . . . . .
blockSeqs : C A A TT T . . . . .
blockSeqs : G A C AC A . . . . .
blockSeqs : C A A TA T . . . . .
blockSeqs : A G C TT A . . . . .
blockSeqs : C A A CC T . . . . .
blockSeqs : G A C TC A . . . . .
blockSeqs : C C A CC T . . . . .
blockSeqs : T A A TT A . . . . .
blockSeqs : G A A CC T . . . . .
blockSeqs : C T C CC T . . . . .
blockSeqs : T A C TT A . . . . .
blockSeqs : G A A AC T . . . . .
blockSeqs : T A C TT A . . . . .
blockSeqs : G C A CC T . . . . .
blockSeqs : C A T TT T . . . . .
blockSeqs : T A A AC T . . . . .
blockSeqs : G A A TT T . . . . .
blockSeqs : T A T TT A . . . . .
blockSeqs : C A C CC A . . . . .
blockSeqs : G A A CC T . . . . .
blockSeqs : T A A TA A . . . . .
blockSeqs : A A T CC T . . . . .
blockSeqs : T A A TC A . . . . .
blockSeqs : G A T AC A . . .
blockSeqs : G G A TT T . . .
blockSeqs : C A A CC T . .
blockSeqs : G A C TT T . .
blockSeqs : C A A TT T . .
blockSeqs : T A C CC T . .
blockSeqs : G A T TT A . .
blockSeqs : T . A TT A . .
blockSeqs : C . C CC A . .
blockSeqs : G . T CC A . .
blockSeqs : G . A TC T . .
blockSeqs : G . A TC A . .
blockSeqs : G . A CC A . .
blockSeqs : T . A TT T . .
blockSeqs : A . A CC G . .
blockSeqs : G . C CC A . .
blockSeqs : G . A TT A . .
blockSeqs : G . A AC A . .
blockSeqs : C . A CC T . .
blockSeqs : G . A TT A . .
blockSeqs : G . A AC A . .
blockSeqs : G . C CT A . .
blockSeqs : G . G TC T . .
blockSeqs : G . A CC A . .
blockSeqs : G . A TC A . .
blockSeqs : G . A CC A . .
blockSeqs : G . A CC T . .
blockSeqs : G . T CC A . .
blockSeqs : A . A TT T . .
blockSeqs : G . A CC T . .
blockSeqs : G . A TT A . .
blockSeqs : T . A CC T . .
blockSeqs : G . A CT T . .
blockSeqs : G . A TC T . .
blockSeqs : G . C CC T . .
blockSeqs : C . A TT A . .
blockSeqs : G . A GT T . .
blockSeqs : C . A TT T . .
blockSeqs : T . A TC T . .
blockSeqs : T . C TT T . .
blockSeqs : T . A GT . . .
blockSeqs : T . C TT . . .
blockSeqs : C . C TC . . .
blockSeqs : G . A CA . . .
blockSeqs : G . C TT . . .
blockSeqs : . . C TC
blockSeqs : . . C TT
blockSeqs : . . C C
blockSeqs : . . A C
blockSeqs : . . A .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
finalCons : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 000 2 4 1 222222222 0 000 0 0 00 2 11 11111 0 0 0 22222 0 11 2222 0 0
lowQualScore : . ... . . . ......... . ... . . .. . .. ..... . . . ..... . .. .... . .
lowQualScore : 4 888 6 9 3 444444444 4 777 4 4 66 4 11 11111 1 5 5 22222 9 33 0000 9 9
consensus : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
Reference ( family-259 ) : TCGG-ATAC---CCACGNGTGATCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGANAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25586 : TCCG-ATAC---CCACGGATG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-T--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTGGCGGTTTCATGTAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCGTGCAAACGCCGTT
gi|25587 : catcgTCGA-ATAC---CCACGCGTAATCGATTCTAATACTC----------------TCA---ACC-GG-C--GAAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCAT-TT-
gi|25588 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----AAGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-tatttgaacaaaacagaac
gi|25589 : catcgTCGG-ATAC---CGCCG-GTG-TCAATTCTGATACTCTCCGTC---C----A-TCA---Ctatt
gi|25590 : catcgTCGG-ACAC---CTACACGTTATCCTTTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GC-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----TAAG-CCACGATACGA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGGAGGGAACGTTA-TCT-TATTGCAATGCTAGTTTCGTGTAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25591 : catcgTTGG-ATAC---TAAAGTGTAATTCATTCCGGTACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAACGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCATGATTTCATGAAGGGAATGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTGCATGCAAA
gi|25592 : catctTCGG-ATAC---CTACAGGTG-TCAATTCTGATACTCTCCATG---C----A-TCATCGCCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACATTAGTTTTGCGTTAT-TT--TATTTGAACAA---CACAATACAG--CTA
gi|25593 : catggTCAG-ATAC---CCACGCATAATCCATTATGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-GAAAAAAAT--T-----ACGCTACCTTTGCGTCGT-TT-
gi|25594 : catcgTCGG-ATAT---CCTCGAGTGATCTATTCCGATGCTCTCCATC---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGTTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGAAA--CAATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCTTGAAGGGAACGTTA-TTC-AATCGCAACGCTAGTGTCATGTTAACACCGTTTTGATAAtatt
gi|25595 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAA--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25596 : catcgCGT-ATAC---CCACGCTTAATCAATTCCGATACTCTCCATT---A----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCATTGT-TT-TTAC-----TAAG-CAACAATGCAA--ACATAT----GATTGGTTACTTCACGATTTCATGAAGGGAACATCA-TCC-AAATGCAACGCTAATTTCATGCAAATGCCATTTTGATtatt
gi|25597 : catcggG-ATGC---CCATGGATG-TCATTTCCAATACTCTACATC---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACGCAAGCTCCGCATCGT-TT-C
gi|25598 : catcgtttTCGGTAAAC---CAACGCGTAATCCATTTCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----TCACTAGCTTTGCGTCTT-TT-CTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTG-TCC-AATCGCAACGCAAGTTTCATGCAAACTCCGTTTTGATAAaattaa
gi|25599 : catcgGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC--------A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAACTTAGAGTCGT-TT-
gi|25600 : caccgctTCAG-ATAC---CCACGCGTAATACATTCCGATACTCTCCATT---T----G-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----AAACTGGCTTTGTGTTGT-TT-CTAC-----CAAG-TCAAAATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACAATATCATGAAGGGAAGGTTA-TCC-AGCCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACCCCGTTTTGATAAtatt
gi|25601 : cattgTCGG-ATAC---CCAGGCGTGATTCATTCCGTTACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATATATT-----ACACTAGCTTTGCATCAT-TT-CTAC-----CAAG-C-ACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAAGTTA-TTC-AATTGCAATGCAAGTTTCATGCAAACGCCATTTTGATAA
gi|25602 : cagcaTCGA-ATAC---CCAC-TGTAATTCATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCA-TA-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCCT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AACCTCAATGCTAGATTCATGCAAACGCCAATTTAATAA
gi|25603 : catcgTCGG-ATAC---CCATGTGTAATCCATTCTAATAATCTCCATT---C----A-TCA---TTCTGT-T--AGATAT--T-----GCAATAACT--GCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCATGATGCAA--CCACAT----GATTGGTTCCTTCACTGTTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25604 : catgg-ATAC---CCACATGTG-TCAACTCCCATACTCTCCATC---C----A-TTA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCTTCGT-TT-
gi|25605 : catcgtcatTCGG-ATAC---CCATGTGTAATACATTCAGATACTCTTGGTT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCGTCGT-TT-TTAC-----TAAG-CCACCATGCAG--CCATAT----GAATGGTTCCTTCATGATTCCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAATGCTAGTTTCATGCAAAAGCTATTTTGATAAtatt
gi|25606 : catcgTCAG-ATAC---CCACGGGTG-TCATTTCCATTACTCTCCATA---C----A-TCA---CAC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCAACGT-TT-
gi|25607 : cattgTCGG-ATAC---CCACGCGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---A----A-TCA---CGC-AT-G--GAATAT--T-----ACACTTGTTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGTAACGTAA-TCC-AATCGCAACGGTAGTTTCATGCAAAtattttaacaaaacagaac
gi|25608 : catcgTCGA-ATAC---ACCCGGGTG-TCACATCCGATACTTTCCATC------------A---CCC-AT-G--GGAAAA--T-----ACGCCAGCTCTGTGTCGT-TT-taagactttgttaa
gi|25609 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCATAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GAATAT--A-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTACACGATTTCATGAAAGGAACATAA-TCC-AATCACAATGCTAGTTTCAT---AACGTCATTtatt
gi|25610 : catcgCGG-ATAC---CCACCAGTG-TCATTTCTGATACTCTTCATC---C----A-TCA---ACC-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGTTATGTGTTGT-TT-
gi|25611 : catcggTCGG-TTAC---CCACGCTTAATCCATTCCGATATTCTCTATT---C----A-TCC---CCT-GTAG--GGTTTT--T-----ACACTAGCTTTGCATCGT-TT-CTAC-----CAAA-CCACAATGCAA--ATATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTTATGAAGGGAACGTTA-TCC-ATTCACAATGCTAGTTCCATGCAAATGCCATTTTGACAAgtttgaacagaacaaaacaaaatacagc
gi|25612 : catcgTCGG-ATAC---CCCTGGGTG-TCAATTCCGATTCTCTCCATC---C----G-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCATAAT-TT-
gi|25613 : cattgTTGG-ATAC---CCACGCAT-----AGTCC-ATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCC-GT-G--GCATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-CTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAAGGTTA-TCC-AATCGCAATGTTGGTTTCATGCAAAGGTTGTTTTGATtatt
gi|25614 : catcaTCGG-ATAC---ACACGTATG-TCAAT-ACAATTCTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAT--T-----ATGCTAGCTTTGCGTCA--TT-CTA
gi|25615 : catagTCGG-ATAC---TCCCGGGTG-TTAATTCCGATACTTTCCACC---C----A-TCA---tt
gi|25616 : cattgTCGG-ATAC---CCACACGATATCCGTTCCGATACTCTTCATT---TT---A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--A-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-AGAC-----CAAG-CAACATTGCAA--CCATGT----GATTGGTTACTTCACGATTTCAAGAAAGGAACGTTA-TCC-AATCGCTACTCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25617 : catcgCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----GCACTACGTTTGTGTCAT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGACACAG--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCAT-AAGGGAAGGTTA-TCC-AATC-TGATGCTAGTTTCATATAAATGCCATTTTAATAA
gi|25618 : catcgcTCGC-ATAA---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCTATA---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGAAAT--T-----ATGCCAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25619 : catcgatgTTGG-ATAC---CCATGTGTGATCCGTTCCTATACTCTGCATT---T----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGATTTGTGCAGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGTTGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCATAATTTAATGAAAGGAACGTTA-TCC-AATCGAAACACTAGCTTTATGCAAACACCGTTTTGATAA
gi|25620 : caccaTCGG-ATAC---CCACGGGTGG-CAATTCCGATACTTTCTATC---C----A-TCA---CCC-AT-G--AGCAAG--T-----ATGCTAGCTCTGCGTTGT-TT-
gi|25621 : catcaCGG-ATAC---CCACACGTAATCTATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CAG-AT-G--GGATAT--T-----ACACTGGCTTTGGATCAT-TT-CTAC-----CAAG-TCACGATGCAA--CAATAT----GATTGGTTCCATCACGATTTCATGAAGGGAATATTA-TCC-AATCGCAATGCTAGTTTCATGCAAACGCCATACTGACAAtatt
gi|25622 : catggcTCGG-ATAC---CCATGTGTAATCAATTTTGATACTCTTTATTGATT----A-TTA---TCC-AT-G--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTTTGTCGT-TT-CTAC-----CAAA-ACACAACGCAG--CGGTAG----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGATAA
gi|25623 : catcaTCGG-ATAC---CCAAGGGTG-TCAATTCCGATGATCTCCATA---C----A-TCA---CC-----------------------TGCTAGCTCTGCATTG
gi|25624 : catcgTCGG-ATAC---CCGCTTGTGATTTATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCC-GT-G--AGATAT--T-----ACACTAGTTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCAAAT----AATTGGTACTTTCATGATTTCAAGAAGGGAACGTTA-TCC-GATTGCAGCACTAGTTTCATGTAAAAGCCATTT
gi|25625 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCGTAGTCCATTCCGATACTCTTTATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----TAACTAGCTTTGTGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCACAATGCAA--TCATAT----AAATGGTTTCCTCATGATTTCCTGAAAGGAATGTTC-TTC-AATCCCAATGCTAGTTTCATGCAAACG-AGTTTTGAGAA
gi|25626 : catcgTCGG-AAAC---CCATG-GTGA-CAATTCTGACACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAA--T-----ACACTAGTTCTGCATCGT-TT-
gi|25627 : catcgTCGG-ATAC---TCACGGGTG-TCAATTCCTATACTCTCCATC---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-tatt
gi|25628 : catcgTCGT-ATAC---CCACGTATGATCTATTCAGATACTCTTCATT---A----A-TCA---CCT-GT-A--GGATAT--T-----ACACT----------TGA-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATACAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGATCGTTA-TCCAAATCGCAACGCTATTTTCATGTGAACGCCGTTTTGATAAtatttaaacagaaccgaacaaaatacagcta
gi|25629 : catcgTCGG-ATAC---TAACGAGTGCT-AATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-A--GGAAAA--T-----ACGCTTGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25630 : catcgTTGG-ATAC---CCACGTGTAACCTATTCTGATAGTGTCCATT---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--T-----GAACTAGTAGTGCGTTGT-TT-TTAT-----CAAGTCCA-AATGCAA--CCATAT----GATTGGTATCTTCACGATTTCATGAAGGGAACATTA-TCC-AATCGCAATACTAGTTTAATGCAAAATCCGTTTTGTTAAtatt
gi|25631 : catccTTGG-ATAC---CCACTGGTG-TCAATTCC---------------------A-TTA---CCC-AT-A--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGC-TT-
gi|25632 : catcgCGG-ATAC---CCACGGGTGA-CAATTCCGATAGTCTCCATA---C----A-TCA---CCC-GT-G--GAAAAT--T-----ACGCtatt
gi|25633 : catcgTCGG-ATAC---CCACGCGTATTCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---ATC-GT-G--AGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGCCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGCAA--CCATAT----CATTGGTTACTTCAAGATTTCATG-ATTGAATGTTA-TTC-AATCGCAAC-----------GCAAACGCCATATTGATAAgtttgttttttttaacagaat
gi|25634 : cattgTCAG-ATAC---CTACGGGTG-TCAATCCC-------TTCATC---C----A-TCA---CCA-GT-G--GAATAT--T-----ACGATGACTTAGCGTTGT-TT-
gi|25635 : catcgTCGG-ATAC---CCAAGCGTAATCCATTCTGATACTCTCCATT---T----A-TCA---C---------------------------TAGCTTTGTGTCAT-TT-CTAC-----AAAG-CCAAGATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCTTTCATGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATTGCAACGCTAGTTTCATGCGAAAGCTGTATTGGTAAtatt
gi|25636 : catcgTCGG-TTAC---TGACGTGTGAACTATTCTGATGCTCTCTATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAA--T-----ACACTAGTTTTGTGTCGT-AT--TAC-----CAAG-CCACGATGTAA--TCATA-----GATTGATTCGTTCACGATTTTATGAACAGAACGTTA-TCC-TATCGCAACGGTAGTTTCATGTTAACGCCGTTTTGATAA
gi|25637 : catcgTCGG-ATAT---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCCCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGA-ATA-T-----ACGCTAGCTCTGTGCCGT-TT-
gi|25638 : caccgTCGG-ATAC---CCGCGTGTAATCCATTCCGATTCGCTCCATT---T----A-TCG---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-ACACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTTACGATTGCGTTAAGAGAACGTTA-TCC-Atatttgaacaaaacagaac
gi|25639 : catcgTCCG-ATAT---TCACGCGTACTCTATTCCGATAATCTTCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACGCTAGCTTTGCGCCGT-TT-CT------------------TCCAA--CCGTAT----AATTGGTT--------ATTCCACGA--------TTA-TCC-AATCGCAACGTTAATTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAA
gi|25640 : catcgTCTG-GTAC---CAACGGAAG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-TCT---ATC-GT-A--ATTAAT--T-----ACGTTAGCTCTGTGTCAT-TT-
gi|25641 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCAAATACTCTCCATC---C----G-TCA---CCC-GT-G--GAAAAT--T-----ATGCTAGCTTTGCGTCGT-TT-tatttgaacctaacagctaccgttga
gi|25642 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGATG-TCAAT-CCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCATCGT-TT-tatt
gi|25643 : catcgTCTG-ATAC---CCAC--------AACTCCGATCCTCTTCCTT---C----A-TCA---CCC-G--------------------------CTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-TCGCAATGCAA--CC--AT----GATTA-------------TTCATTAAGGGAACGT-------AATCGCAACGCTAGTTTCATGCAGACGTCGTTTTGATAAtatt
gi|25644 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCACC---C----A-TCA---TCC-GT-G--GGTAAT--T-----ACGCCAGTTCTTTGTCGT-TT-
gi|25645 : catcgTCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTC--TT---T----A-TCA---CCC-AT-G--GGATAT--C-----ACACTAGCGTTGCATCGT-TT-CTTC-----CAAG-CCACGATGCAA--CAATAT----GATTtatttgaacagaacggaac
gi|25646 : catcgTCGG-ATAC---CCACGAGTG-TCAGTTCCGATACTCGCCATC---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGCTCGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25647 : catcgTTGG-ATAC---CCCCAGGTGA-CAATTCTTATACTCTCCATC---C----A-TCA---ACC-TT-G--GGAAAT--T-----ACGCCAACTTCATGTCTT-TT-tatttgaacagaacggaac
gi|25648 : caccaTCGG-ATAC---CCAC--------AAT-CCGATACTTTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGGTAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTTGT-TT-TTAC-----CAAG-CCAatttgaacagaatggaa
gi|25649 : catcgTCGG-ATAC---CCACGGGCGA-CATTTCCGATACTCAGCATA---C----A-TTA---CCC-GT-G--GGAGAT--T-----ACGCTAGCACTGCGTCGT-TT-
gi|25650 : catcgTCAG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---C----A-CAA---CCA-GT-G--GGAAAT--T-----ACTAGAGCTTTGCGTCGT-TT-tatttgaacagaacaaataaattggt
gi|25651 : cattgTCGG-ATAC---CCACGCGTAATCCATTTCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GG-G--GGAAAT--A-----ACACTGGCTTTGtattgaacagaacagaatgaaa
gi|25652 : catcaCAG-ACAC---CCATGGGTG-TCGTTTCCGATA-TCTTCATA---C----A-TTA---CCT-GT-G--GTAAAT--T-----AAGCTAACTCTGCTTCGT-TT-
gi|25653 : catcgTCGG-ATAC---CCCCGGGTG-TCAATTCTGATACTCTCCATC---CGTGAA-TTA---CCT-GT----GGATAT--TCGACGACGGTA--TTCGTGTCGTATT-Ctatt
gi|25654 : catcgTCGG-ATGC---CC-CGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---T----A-TCA---C
gi|25656 : catcgTCGG-CTAC---CCAAGGGTT-TCAATTCCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---TC--------GGA-AT--------------GGTTTAC-TCGT-TG-GTAT-----TTGA-CGATGATGTAAAGCC-TAC----GATTGGTagtatcggggtatt
gi|25657 : catagTCGG-ATAC---CCCCAGGTG-TCAATTTCAATACTCTCCATC---C----A-TCA---
gi|25658 : catcgTCGA-ATAC---CCACAGGTAACCTATTCCGATACTCTCCATT---C----ATTCA---CCC--T-G--G
gi|25659 : catcgTCGG-ATTT---CCACCGGTG-TCAATTCCGATACTCTCCAT
gi|25660 : catcgTCGG-ATAC---CCCCGGGTG-TCAATTCCGATACGCTCCCTC---C----G-T
gi|25661 : catcgTCGG-ATACATCCCCCGGGT-ATCAATTGCGATACTCTCCATC---C----A-TCA---C
gi|25677 : cattgTCGG-ATAC---CCACGAGTG-TCAATTATGATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCT-GT-A--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCATTGT-TT-TT
gi|25678 : attgTCGG-ATTG---CCATGGATG-TCAATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGAAAA--T-----ACGCTAGttt
gi|25679 : atcgGG-ATGC---CCACTGGTG-TCAACTGCAATACTTTCCATC---C----A-TCA---CCG-GT-G--GGAAAT--T-----ACACTAGCTCTGCGTTGtagtctgcaatattttatttgaatagaacagaacaaaatacagcttgcatttaaatggcttttaca
gi|25680 : atcgttgatTCGG-ATAC---CAACGTGTAATCCATTCCGAT-CTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAC--T-----ACACTAGGT--GCATCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCGCAACGCAG--AGATAT----GATTGGTTTCTTCACG-TTTCCTGAAGGGAACATAA-TCC-AAGCGCAACGC--GTTTCATTCAAAaatagaacaaaatacagcta
gi|25681 : atcgTCGG-ATAC---CCACGGGTG-TCAATACCGATACCCTTCTTC---C----A-TCA---CCC-AT-G--GTAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGCGTCGT-TT-
gi|25682 : atcgTCGA-ATAC---CCACGGGTG-TCAATTCCGATACTCTCTACC---T----A-ACA---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACGTCATCTCTACGTCGT-TT-
gi|25683 : atcgTCGG-ATAC---CTCCG-GTC-TCAATTCCGATAATCTCCATT---C----A-TCA---tatt
gi|25685 : atcgTCGG-ATAC---CCTAGGGTG-TCAATTCTAATACTCTCCATC---C----A-TCA---CCC-AA-G--GTTAAT--T-----ACACTAGCTCTGCATTG--TT-CTA
gi|25685 : tctTTTCATGAAGGAAACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTTATGCAAACACCGTTTTGATAAtttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcttatcaaaacggtgtttgcataaaactagcgttgcgattggataacgtttccttcatgaaaca
gi|25686 : tcttcggataccctagggtgtcaattctaatactctccatccatcacccaaggttaattacactagctctgcattgttctatttgaccagaacaaaagacagctaacgtgaatgtcTCGG-ATAC---CCACGCATAATCCATTTTGATACTCTCAATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCATCAT-TT-CTAC-----CAAG-ca
gi|25687 : tcgTCGG-ATAC---CCATGGGTG-TCAATTACTACACTCTC----------------A---CCC-AT-G--GGAAAT--T-----ACGCTAGCTCTGC
gi|25688 : cgTTGG-ATAC---CCATGCGTAATCCATTCCGATACTCTCCATG---T----A-TCA---CTT-CT-G--GTATAG--C-----ACACTAACTTTGCATCGT-TT-CTAA-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATATGCCGGATTGGTTCCTTCACGATTTCATAAATGGAACGGTGTTTC-A--CGCAA
gi|25689 : cgTCGG-ATAC---CCATGTGTTATCCATTGCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---TCC-GT-G--GGATAC--A-----ACACTAGATTT
gi|25690 : cgTCAG-ATAT---TCACGTGTGGT-AATTCCGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCT-GT-G--GGAAAT--T-----TTGCTAGCTCTGCTTCGT-TT-TT
gi|25691 : gTCGG-ATAC---CCACGTGTAATCCATTCCGATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGG-TT-CTAC-----CAAG-CCACGATGGAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGGGAACGTTA-TCC-AATGGCAACGCTTGTTTCATGCAAACACCGTTCTGATAAtttaacagaacaaaatgc
gi|25692 : TTGG-ATAC---CCACATATAATCCATTCCGATACTCTCCATG---T----A-TCA---CCC-GT-T--GGATAT--T-----ACACTAGGTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----AAAG-CCACAAGGCAG--CGATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAGTG-------------ATCACAACGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATA
gi|25693 : G-ATAC---CT-CGCGTAATCCATTCCAATACTCTCCATT---T----A-TCA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----GCACTTGCTTTGCGTCGT-TA-ATAC-----CAAG-TCACAATGTAA--CCATGT----GATTGG-TCCTTTGCAATTTCATGAAGGG
gi|25696 : -ATAC---CCATGGGGTATCCATTACAAAACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTTGCTTTCCGTCGT-TG-CTGG-----CAAT-CCGAGATGCAA--CAGTAT----GATTGGTTCCCTCATGTTTACATAAAGTAAATTTTA-TCT-ATTCGCATCGCTCATTCCAT
gi|25697 : TAC---CCACAGTTG-TCAATTCCGATACTCTCCATC---A----A-TTT---CCC-GT-G--GGAAAT--T-----ACTCTAACTCTGCGTCGT-TT-
gi|25701 : AACTC--ATACTCTCCATT---T----A-TTA---CCC-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGCTTTGCGTCGT-TT-CTAC-----CAAG-CCACAATGCAA--CCATTT----AA--------TTCATGATTTCATGAAGGGGACGTTA-TCC-AATCGCAACGCTAATTTCATGTAAACGCCGTTTTGATAAtatttgaacagaacaaaatacagcta
gi|25703 : acccacactggttggtctcggtagaGTAATCCATTATGATACTCTCCATT---C----A-TCA---CCC-GA-G--GGATAT--T-----ACGCATGCTTCTTGTCAT-TG-CAGC-----CAAT-CCGAGATGCAA--TCATAT----GATTGGTTCCTTCATGTTTTCACGAAACAAAATTTA-TCC-AATAGCATCGTT
gi|25705 : gTCCGATACTCTCCATT---T----A-TAA---CCT-GT-G--GGATAT--T-----ACACTAGTTTTGCGTCTT-TT-CTAT-----CGAG-CCATGACGCAA--CCGTAT----GATTGGTTCCTTCACAATTTCATGAAGGGAACTTTA-TCC-AATCGCAACATAAGTTTCATGTAAACGCTGTT
gi|25706 : ---CCC-GT-G--CTATAT--T-----TCACTAGCTTTGCGTCTT-TTTCTAC-----CAAG-CAACAATGCAA--CCATAT----GATTGGTTCCTTCACGATTTCATGAAAAGAACGTTG-TCC-AATCGCAACGCTAGTTTCACG
gi|25707 : ATAT----GATTGGTTCCTCCACGATTGCATGAAGGTAACGTTA-TCC-AATCGCATCGCTAGTTTCATGCAAACGCCGTTTTGATAAttagctgtattttg
gi|25708 : ATTTCATGAAGGGAACGTTA-CCC-AGTCACAACGCTAGTTTCATGCAAACGCTGTTTTGA
gi|25709 : -TCC-AATCGCAACGCTAATTTCATGCGAACGCCGTTTTGATAA