lowQualScore                  :                                               11111 1 3        0    0 55 6    0  9999999     777  1111    0000   0    0                 
lowQualScore                  :                                               ..... . .        .    . .. .    .  .......     ...  ....    ....   .    .                 
lowQualScore                  :                                               11111 5 1        3    3 11 1    5  9999999     444  2222    6666   4    4                 
consensus                     :                                       TTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-NT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
Reference ( gi|92184 )        :                                       TTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92168                      :                                       TTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-GAGG-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92177                      :                                       TTCTATAT-----TAA--GTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92183                      :                                       TTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92178                      :                                       TTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAAG-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92174                      :                                       TTCTATAT-----TAG--GTGTCAA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92173                      :                                       TTCTATAT-----TAGAGTTGTCAA-AAGG-C-GT-CTTT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CAAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92182                      :                                       TTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAAG-C-AT-CTAT-AT-----TAGAGTTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92117                      :                                       TTCTATAA-----TAGAGTCATCCA-AAGC-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92119                      :                              tcaaaacacTTCTATAT-----TAG--GTTTCCA-AAGG-C-GT-CTAG-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TAT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92170                      :                              tcaaaagctTTCTATAT-----TAGAGGTGTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----AGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGATTAA
gi|92185                      :                                       TTCTATAT-----TAG--GTATC-A-AAGG-C-AT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92176                      :                                       TTCTATAT-----TAGAGGTGTCAA-AAGC-C-TT-TGAT-AT-----TAGAGGTGTGCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92306                      :                                       TTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----a
gi|91829                      :                             ttcaaaagccTTCTACAC-----TA----TGTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAgttaa
gi|92312                      :                        agcagtcagaactggTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----a
gi|92311                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92310                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92308                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttga
gi|92307                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92313                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGATGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92323                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92315                      :                             ttcaaaagctTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92314                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----GAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gtta
gi|92321                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92320                      :                             ttcaaaagccTTCTATAC-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gtt
gi|92317                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTGT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92316                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTGT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|91826                      :                             ttcaaaagccTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGAGTTAAgttaaa
gi|92319                      :                        agcaatcagaactggTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----
gi|92318                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|91828                      :                             ttcaaaagccTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-ATTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAAGGTTAAgttaaa
gi|92149                      :                        agcaatcagaaatggTTCTATAT-----TAGAGGTGTTCA-AAGG-T-GT-CCAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----
gi|91843                      :              ctggttttaccattttttcaaagccTTCTATAC-----T----GTTTTCA-AAAC-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAgttgaa
gi|92330                      :                        agcaaaaagaactggTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-ATAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----
gi|92458                      :                             ttcaaaagtcTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AATG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92326                      :                              tcaagagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGTgttaaa
gi|92324                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAAG-G-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----aaatggttaa
gi|92327                      :                             ttcaaaagccTTCTTTAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92335                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTTT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gtt
gi|92340                      :                             tttgaaagccTTCTATGT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92325                      :                             ttaaaaagccTTCTATGT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGTgttaa
gi|91844                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TACAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----aaagagttaaa
gi|92328                      :  agcaatcagaactggtcctacactgttttcaaaagctTTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gctaa
gi|92299                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92332                      :                            tttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-ATGAA--TAAAGGgttaa
gi|92360                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGA-C-GT-CTAT-ATGAAA-TAAAGGgttaa
gi|92136                      :                             ttcagaggccTTCTACAC---------GGTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGACGTGTCCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTgttaaa
gi|91823                      :                              cagaactggTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTACAGGGTTAA
gi|92339                      :                        agcaatcagaactggTTCTATAT-----TAGAGGTGTCAA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAG----CA----AAGG----
gi|92331                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-------GAAGTgttaa
gi|92356                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----Taaacggttaaa
gi|92342                      :                            ttcataaagctTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----ttaa
gi|92341                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCCT-AAGG-C-GT-TTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gataa
gi|91821                      :                             ttcaaaagccTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TAT-CCAT-ATGGAGTAAAGGGTTAAgttaa
gi|92337                      :                        agcaatcagaactggTTCTATAT-------GAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----a
gi|92355                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92363                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----AAGAGGTGTCCA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|91832                      :                             ttcaaaagctTTCTACAC-----T----GTTTTCATAAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----TAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAgttaa
gi|91834                      :                        agcaattagaactggTTCTACAC-----T----GTTTACA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGATTAA
gi|92349                      :                        agcaatcagaactggTTCTATAT-----AAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-GTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----a
gi|92351                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----AAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTTT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92277                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----T--AGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT--T-----T-GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92354                      :                 tacacccaggtattcaaaagccTCCTATGT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|91824                      :                             ttcaacagccTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AGGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGTTTAAgttaaa
gi|91827                      :                        agcaatcagaactggTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTTA----AATG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                        agcaatcagaactggTTCTATAT-----TAGAAGTGTCCA-AAGG-C-TT-CTAT-AT-------GAAGTA---A----AAGG----T
gi|92358                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCTA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-----taa
gi|92357                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCTA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-----gaagaaaagggttaaa
gi|91838                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTTAA-AAGG-T-GT-CCAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gaagaaaagggttaaa
gi|92365                      :  agcaatcagaactggttctacactgttttttcaagccTTCTACAT-----CAGAGGTGTCCA-AAGG-G-GT-CTAT-AT-----gttaaa
gi|92364                      :                             ttcaaaagccTTCTATAT-----TAG--GTGTACA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gaagaaaagggttaaa
gi|91845                      :                             ttcaaaagccTTCTACAC-----T----GTGTTCA-AAAG-C-CTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTTTA----AAGG----TGT-CCAT-ATTAAGTAAAAGGTTAAgttaa
gi|92094                      :                        agcaatcagaactggTTCTACAC-----TA----TTTTCA-AAAGTC-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAAGTTT
gi|91830                      :                         gcaatcagaactgaTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTTT-AT-----TAGAGTTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTA
gi|92135                      :                        agcaatcagaactggTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGTCCTA--ATGAAGTAAAGGTTTAA
gi|91850                      :                              cataacctgTTCTATAT-----TAGAAGTGTTAA-AAGG-T-GT-CCAT-AT-------GAAGTa
gi|92137                      :      agcaaacagaattgttcaccgttttcaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTTCA-AAGG-T-GT-GTAT-AA-----T-GAAGT----A----AAGG----taagggttaa
gi|92110                      :        cagaactgcttttacactgttttcaaaagccTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-TTTCTAT-AT-----TAGAGGTGGTCT----AAGT----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAgata
gi|91847                      :                           aatcagaactgaTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-CTAT-CTTC-AT-----TAGAGGTGTTGA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTGAA
gi|91849                      :                        agcaatcagaactggTTCTACAC-----T---GTTTTCAA-AAGA-C-TT-CTAT-AT-----AAGAGGTGTTAA----AAGG----TGT-ACAT-ATGAAGTAAAGGGCTAA
gi|92141                      :                        agaaaacggaattggTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGGGTTAA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAACGGGTTa
gi|92138                      :                                gaactggTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-TT-----TAGAGGTGTTCG----AATG----TGT-CCAT-ATGAAGTATAGGGTTAA
gi|92280                      :                         cagaattagttctaTTCTATAT-----TAGAGGAATTCA-AGGG-T-GT-CCAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----
gi|91848                      :                      cactgttttcaaaacccTTCTATATAAATTTAGAGGTGTTCA-AAGG-T-GT-CCAT-AT-----gtt
gi|91852                      : agcaatcagaactggttctacacttttttttaaaagccTTCTATAT-----TAGAGGTGTCAA-AAGA-C-GT-CTAT-AT-----TAgaaataaatggtta
gi|91881                      :  agcaatcagaactggtcctaccctgttttcaaaagccTTCTTTAT-----AAGAGGTGTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-----acaaaagggtaaa
gi|91853                      :  agcaatgagaactggtcctgcactgatttcaaaaaccTTCTATAC-----TAGAGGTGTCAA-TAGG-C-GT-CTAT-A
gi|92095                      :  agcaatcagaactggtcctacgctgttttcaaaaaccTTCTACAC-----T----GTTTTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGT-----------------T-CT-T-ATGAAATAAA-GGTTAAaagggtaaaa
gi|92251                      :                          gcaatcagagctggTCTATAT-----TAG--GTGTCCA-AAGG-C-CT-TTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92466                      :                                        TCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----a
gi|92462                      :                              tccaaaggcgTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|92334                      :                              tcaaaaggcaTCTATAT-----TAGAGGTGTCCA-AAGG-T-GT-CTAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaaa
gi|91841                      :                              ttcaaaaggcaCTATAT-----TAGAGATGTTCA-AAGG-T-GT-CCAT-AT-------GAAGT----A----AAGG----gttaa
gi|92277                      :                   agcaatcagaactggttctgcactgttttcaaaagcAGGTATTCA-AAAG-C-CTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-TTGAAGTAAAGGGTTAAgttaaa
gi|91844                      :                                                  tacacccGTTTTCA-AAAG-C-TTTCTAT-AT-----TACAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGCTAAa
gi|91841                      :                                 agcaatcagaactggtcctacactGTTTTCA-AAAG-C----CTAT-AT-----TAGAGATGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|91908                      :                                 agcaatcagaactggttctgcactGTTTTCA-AAGG-C-CTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAa
gi|91907                      :                                 agcaatctgaactcttcctgcactGTTTTCA-AAGG-C-CTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTA
gi|92466                      :                                    agcaatctgaactcttcctgcactTCCA-AAGG-C-GT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92462                      :                                                            TCAA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92334                      :                                                            TCAA-AAGG-C-AT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92306                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92312                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92311                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92310                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTGA
gi|92308                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92307                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92313                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGATGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92323                      :                                                           tTTCA-AAAG-C-TTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92315                      :                                                            TCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTA
gi|92314                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----GAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92321                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTa
gi|92320                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AC-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92317                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTGT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92316                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTGT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92319                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92318                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92149                      :                                                           tTTCA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTGAa
gi|92330                      :                                            ctggttttaccattttTCAA-AAGT-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-ATAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92458                      :                                                           tTCAA-GAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AATG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92326                      :                                                            TCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAATGGTTAAa
gi|92324                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAAG----GGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92327                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTTT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTa
gi|92325                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGAGTTAA
gi|92328                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92299                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92332                      :                                                          ttTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAA-TAAAGGGTTAA
gi|92360                      :                                                           tTTCA-GAGG-C-CTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGA----CGT-CTAT-ATGAAATAAAGGGTTAA
gi|92339                      :                                                            TCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCAA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGCAAAGGGTTAAa
gi|92331                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGTAAACGGTTAA
gi|92342                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGATAAa
gi|92341                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCT----AAGG----CGT-TTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92337                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-------GAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92355                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92363                      :                                                           tTTCA-AAAG-C-TTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92344                      :                                                            TCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGCGTCTGT-CTAT-ATGAAGTAAATGGTTAA
gi|92349                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-GTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92351                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTTT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAAGTGTCCA----AAGG----CTT-CTAT-ATGAAGTAAAAGGTTAAa
gi|92358                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCTA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGAAAAGGGTTAA
gi|92357                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCTA----AAGG----CAT-CTAT-ATGAAGAAAAGGGTTAAa
gi|92365                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAC-AT-----CAGAGGTGTCCA----AAGG----GGT-CTAT-ATGAAGAAAAGGGTTAAa
gi|92364                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAG--GTGTACA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|91850                      :                                                           tTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAAGTGTTAA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTTAAGGGTTAA
gi|92137                      :                                    agcaaacagaattgttcaccgtttTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-GTATAATGAAGTAAAGGGATA
gi|92148                      :                                      cagaactgcttttacactgtttTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGTTGTTCA----AAGA----TGC-CCCT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|91852                      :                                           ctgattttacactgcttTCAA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCAA----AAGA----CGT-CTAT-ATTAACAAAAGGGTAAAa
gi|91881                      :                                agcaatcagaactggtcctaccctgtttTCAA-AAAC-C-TT-CTTT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-AT
gi|91853                      :                                agcaatgagaactggtcctgcactgattTCAA-AAAC-C-TT-CTAT-AC-----TAGAGGTGTCAA----TAGG----CGT-CTAT-AAAGGGTAAA
gi|91925                      :                                agcaatcagaactggtcctacgctgtttTCCA-AAGC-C-TT-CTAA-AT-----TACAGGTGTCC-------------------AT-AGGAAGTAAAGa
gi|92335                      :                                   agcaatcagaactggttatatactgtttA-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTTT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92340                      :                                                           tttgA-AAGC-C-TT-CTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92356                      :                                                           ttaaA-AAGC-T-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----TGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGTTTAA
gi|91848                      :                                                          ttcatA-AAGC-C-TT-CTAT-ATAAATTTAGAGGTGTTCA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAATAAATGGTTA
gi|91838                      :                                agcaatcagaactggttctacactttttttta-AAGC-C-TT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTTAA----AAGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92280                      :                                         agcaatcagaactggttctacactgttttttcT-CTAT-AT-----TAGAGGAATTCA----AGGG----TGT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTa
gi|92354                      :                                                        cactgttttcaaaaccct-CTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGG----CGT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA

Unaligned ( gi|91903 ): AGCAATCAGAACTGGTACTACACTGTTTTCAAAATCCTTTAGTACTGGAGGTGTTAAAAGTAATATCTATGAAACTTGTAATGGGTTAA

lowQualScore                  :                                          5555                                                                                 
lowQualScore                  :                                        0 0000  6  4 0   55 11 9 0   0  11111            1111     0000  0    0                 
lowQualScore                  :                                        . ....  .  . .   .. .. . .   .  .....            ....     ....  .    .                 
lowQualScore                  :                                        7 5555  2  4 4   00 88 7 4   8  00000            7777     9999  4    4                 
consensus                     :                                 TTCTACACTAG--GTTTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
Reference ( family-25 )       :                                 TTCTATATTAGAGGTGTCCA-AAGG-CN-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|91821                      :                                 TTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----AT-CCAT-ATGGAGTAAAGGGTTAA
gi|91823                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTACAGGGTTAAa
gi|91824                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AGGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGTTTAA
gi|91826                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGAGTTAAa
gi|91827                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTTA----AATGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|91828                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CA-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAAGGTTAA
gi|91829                      :                  agcaatcagaaatggTTCTACACTA----TGTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|91830                      :                  agcagtcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TTT-AT-----TAGAGTTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAa
gi|91832                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCATAAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----TAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|91834                      :                  agcaattagaactggTTCTACACT----GTTTACA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----AAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGATTAA
gi|91838                      :                                      agcaatcagaactgg-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTTAA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|91841                      :              agcaatcagaactggttctacactgttttttcGTTTTCA-AAAG-C----C-TAT-AT-----TAGAGATGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|91843                      :         agcaatcagaactggttctgcactTTCTATACT----GTTTTCA-AAAC-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|91844                      :                               agcaaaaagaactggGTTTTCA-AAAG-CT-TTC-TAT-AT-----TACAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGCTAA
gi|91845                      :         agcaatcagaactggtcctacactTTCTACACT----GTGTTCA-AAAG-CC-TTC-TTT-AT-----TAGAGGTGTTTA----AAGGT----GT-CCAT-ATTAAGTAAAAGGTTAA
gi|91847                      :                  agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CTAT-C-TTC-AT-----TAGAGGTGTTGA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTGAA
gi|91848                      :                                     agcaatcagaactggA-AAGC-CT-T-C-TAT-ATAAATTTAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAATAAATGGTTA
gi|91849                      : agcaatcagaactggttctacacttttttttaTTCTACACT---GTTTTCAA-AAGA-CT-T-C-TAT-AT-----AAGAGGTGTTAA----AAGGT----GT-ACAT-ATGAAGTAAAGGGCTAA
gi|91850                      :                                  agaaaacggaattggTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAAGTGTTAA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTTAAGGGTTAAa
gi|91852                      :                         agcaaacagaattgttcaccgtttTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCAA----AAGAC----GT-CTAT-ATTAACAAAAGGGTAAA
gi|91853                      :                     agcaatcagaactggtcctaccctgtttTCAA-AAAC-CT-T-C-TAT-AC-----TAGAGGTGTCAA----TAGGC----GT-CTAT-AAAGGGTAAA
gi|91881                      :                     agcaatcagaactggtcctacgctgtttTCAA-AAAC-CT-T-C-TTT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATa
gi|91907                      :                  agcaatgagaactggtcctgcactgattGTTTTCA-AAGG-CC-TTC-TGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTA
gi|91908                      :                      agcaatctgaactcttcctgcactGTTTTCA-AAGG-CC-TTC-TGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTA
gi|91925                      :                         agcaatctgaactcttcctgcactTCCA-AAGC-CT-T-C-TAA-AT-----TACAGGTGTCC-------------------AT-AGGAAGTAAAG
gi|92094                      :     agcaatcagaactggttatatactgtttTTCTACACTA----TTTTCA-AAAGTCT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAAGTTT
gi|92095                      :                   gcaatcagaactgaTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGT-----------------T-CT-T-ATGAAATAAA-GGTTAA
gi|92110                      :                   gcaatcagagctggTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CT-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGGTCT----AAGTT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92117                      :                     aatcagaactgaTTCTATAATAGAGTCATCCA-AAGC-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92119                      :                        tcaaaacacTTCTATATTAG--GTTTCCA-AAGG-CG-T-C-TAG-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----AT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92135                      :                        tcaaaagctTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GTCCTA--ATGAAGTAAAGGTTTAA
gi|92136                      :                        cataacctgTTCTACAC----GGTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGACGTGTCCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTa
gi|92137                      :                                        cagaactggTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-GTATAATGAAGTAAAGGGATA
gi|92138                      :           cagaactgcttttacactgtttTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-TT-----TAGAGGTGTTCG----AATGT----GT-CCAT-ATGAAGTATAGGGTTAA
gi|92141                      :                   cagaattagttctaTTCTACACT----GTTTTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGGGTTAA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAACGGGTT
gi|92148                      :                                          gaactggTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGTTGTTCA----AAGAT----GC-CCCT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92149                      :                                ctgattttacactgcttTTCA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTGAa
gi|92168                      :                 ctggttttaccattttTTCTATATTAG--GTGTCCA-GAGG-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92170                      :                                 TTCTATATTAGAGGTGTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGA----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGATTAAa
gi|92173                      :                                 TTCTATATTAGAGTTGTCAA-AAGG-CG-T-C-TTT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CAAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92174                      :                                 TTCTATATTAG--GTGTCAA-AAGG-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92176                      :                                 TTCTATATTAGAGGTGTCAA-AAGC-CT-T-T-GAT-AT-----TAGAGGTGTGCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92177                      :                                 TTCTATATTAA--GTGTCCA-AAGG-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92178                      :                                 TTCTATATTAG--GTGTCCA-AAAG-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92182                      :                                 TTCTATATTAG--GTGTCCA-AAAG-CA-T-C-TAT-AT-----TAGAGTTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92183                      :                                 TTCTATATTAG--GTGTCCA-AAGG-CA-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92184                      :                                 TTCTATATTAGAGGTGTCCA-AAGG-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92185                      :                                 TTCTATATTAG--GTATC-A-AAGG-CA-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92251                      :                                  TCTATATTAG--GTGTCCA-AAGG-CC-T-T-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92277                      :                                            AGGTATTCA-AAAG-CC-TTC-TAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-TTGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92280                      :                                          tacacccTCAA-AACC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGAATTCA----AGGGT----GT-CCAT-ATGAAGTAAAGGGTTa
gi|92299                      :                                         cactgtttTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92306                      :                                               ttTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92307                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92308                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92310                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTGA
gi|92311                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92312                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92313                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGATGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92314                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----GAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92315                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAa
gi|92316                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTGT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92317                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTGT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92318                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92319                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92320                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AC-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92321                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTT
gi|92323                      :                                                tTTCA-AAAG-CT-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92324                      :                                                 TCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAAGG----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92325                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGAGTTAAa
gi|92326                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAATGGTTAAa
gi|92327                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TTT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTT
gi|92328                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92330                      :                                                tTCAA-AAGT-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-ATAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92331                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGTAAACGGTTAAa
gi|92332                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA-TAAAGGGTTAAa
gi|92334                      :                                                tTCAA-AAGG-CA-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92335                      :                                                   tA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTTT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92337                      :                                             tttgTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-------GAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92339                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCAA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGCAAAGGGTTAAa
gi|92340                      :                                                   tA-AAGC-CT-T-C-TAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92341                      :                                             ttaaTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCT----AAGGC----GT-TTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92342                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGATAA
gi|92344                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGCGTCTGT-CTAT-ATGAAGTAAATGGTTAA
gi|92349                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-GTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92351                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTTT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92354                      :                                                tTTCA-ACAG-CC-T-CCTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92355                      :                                                 TCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92356                      :                                                   tA-AAGC-TT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGTTTAA
gi|92357                      :                                            ttcatTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCTA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGAAAAGGGTTAA
gi|92358                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCTA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGAAAAGGGTTAAa
gi|92360                      :                                                tTTCA-GAGG-CC-TTC-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGAC----GT-CTAT-ATGAAATAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                                                 TCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAAGTGTCCA----AAGGC----TT-CTAT-ATGAAGTAAAAGGTTAAa
gi|92363                      :                                                tTTCA-AAAG-CT-TTC-TAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92364                      :                                                 TCAA-AAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAG--GTGTACA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAA
gi|92365                      :                                                tTCAA-AAGC-CT-T-C-TAC-AT-----CAGAGGTGTCCA----AAGGG----GT-CTAT-ATGAAGAAAAGGGTTAA
gi|92458                      :                                                tTCAA-GAGC-CT-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AATGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92462                      :                                                 TCAA-AAGG-CA-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa
gi|92466                      :                                                 TCCA-AAGG-CG-T-C-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAAGTAAAGGGTTAAa

Unaligned ( gi|91903 ): AGCAATCAGAACTGGTACTACACTGTTTTCAAAATCCTTTAGTACTGGAGGTGTTAAAAGTAATATCTATGAAACTTGTAATGGGTTAA

lowQualScore                  :                                222222                                                                                   
lowQualScore                  :                                666666 1 0 0  0            0  11111            1111     0000  0    0     0000            
lowQualScore                  :                                ...... . . .  .            .  .....            ....     ....  .    .     ....            
lowQualScore                  :                                000000 6 8 8  4            8  00000            7777     8888  4    4     9999            
consensus                     :                       TTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
Reference ( family-25 )       :                       TTCTACACT-AG--GT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91821                      :                       TTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----AT-CCAT-ATGGA----GTAAAGGGTTAA
gi|91823                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTACAGGGTTAAa
gi|91824                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|91826                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|91827                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTTA----AATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91828                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCATTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91829                      :        agcaatcagaaatggTTCTACACT-AT--GT-T---CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91830                      :        agcagtcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGTTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|91832                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-TAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----TAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91834                      :        agcaattagaactggTTCTACACT-----GT-T-TACA-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAA
gi|91838                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-TT-CAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTAA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91841                      :        agcaatcagaactggTTCTGCACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCT---AT-AT-----TAGAGATGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91843                      :        agcaatcagaactggTTCTATACT--G--TT-T-T-CA-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91844                      :        agcaaaaagaactggTCCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCTTTCTAT-AT-----TACAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91845                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT-GT--GT-T---CA-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTTTA----AAGGT----GT-CCAT-ATTAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91847                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCTATCTTC-AT-----TAGAGGTGTTGA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTGAA
gi|91848                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT-TT--TT-T-T-TA-AAAGCCTTCTAT-ATAAATTTAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----ATAAATGGTTA
gi|91849                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGACTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTAA----AAGGT----GT-ACAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91850                      :                       agaaaacggaattggT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTTAA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTTAAGGGTTAAa
gi|91852                      : agcaaacagaattgttcaccgtTCCTACCCT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCAA----AAGAC----GT-CTAT-ATTAA----CAAAAGGGTAAA
gi|91853                      :        agcaatcagaactggTCCTACGCT--G--TT-T-T-CA-AAAACCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCAA----TAGGC----GT-CTAT-AAAGG----GTAAA
gi|91881                      :        agcaatcagaactggTCCTGCACT--G--AT-T-T-CA-AAAACCTTCTTT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATa
gi|91903                      :          agcaatgagaactggCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAATCCTTTAGT-AC-----TGGAGGTGTTAA----AAGTA----AT-ATCT-ATGAAACTTGTAATGGGTTAA
gi|91907                      :      agcaatcagaactggtaTCCTGCACT--G--TT-T-T-CA-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91908                      :        agcaatctgaactctTCCTGCACT--G--TT-T-T-CA-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91925                      :        agcaatctgaactctTTATATACT--G--TT-T-T-CC-AAAGCCTTCTAA-AT-----TACAGGTGTCC-------------------AT-AGGAA----GTAAAG
gi|92094                      :        agcaatcagaactggTTCTACACT-AT---T-T-T-CA-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGTTT
gi|92095                      :         gcaatcagaactgaTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGT-----------------T-CT-T-ATGAA----ATAAA-GGTTAA
gi|92110                      :         gcaatcagagctggTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGGTCT----AAGTT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92117                      :           aatcagaactgaTTCTATAAT-AGA-GT-CAT-CC-AAAGCCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92119                      :              tcaaaacacTTCTATATT-AG--GT-T-T-CC-AAAGGCGTCTAG-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92135                      :              tcaaaagctTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GTCCTA--ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92136                      :              cataacctgTTCTACAC---G--GT-T-TTCA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGACGTGTCCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92137                      :              cagaactggTTTTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-GTATAATGAA----GTAAAGGGATA
gi|92138                      :              cagaactgcTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-TT-----TAGAGGTGTTCG----AATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTATAGGGTTAA
gi|92141                      :         cagaattagttctaTTCTACACT--G--TT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGGGTTAA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAACGGGTT
gi|92148                      :                gaactggTTTTACACT--G--CT-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGTTGTTCA----AAGAT----GC-CCCT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92149                      :                                  ctgaT-T-T-CA-AA-GCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTCA----AAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGAa
gi|92168                      :        ctggttttaccatttTTCTATATT-AG--GT-G-T-CC-AGAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92170                      :                       TTCTATATT-AGAGGT-G-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGA----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAAa
gi|92173                      :                       TTCTATATT-AGA-GT-TGT-CA-AAAGGCGTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CAAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92174                      :                       TTCTATATT-AG--GT-G-T-CA-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92176                      :                       TTCTATATT-AGAGGT-G-T-CA-AAAGCCTTTGAT-AT-----TAGAGGTGTGCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92177                      :                       TTCTATATT-AA--GT-G-T-CC-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92178                      :                       TTCTATATT-AG--GTGT-C-CA-AAAGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92182                      :                       TTCTATATT-AG--GTGT-C-CA-AAAGCAT-CTAT-AT-----TAGAGTTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92183                      :                       TTCTATATT-AG--GT-G-T-CC-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92184                      :                       TTCTATATT-AGAGGT-G-T-CC-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92185                      :                       TTCTATATT-AG--GT-A-T-CA-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92251                      :                        TCTATATT-AG--GTGT-C-CA-AAGGCCTT-TAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92277                      :                          TACACCCAG--GTAT-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-TTGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92280                      :                            CACT--G--TT-T-T-CA-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGAATTCA----AGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92299                      :                                      T-T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92306                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92307                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92308                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92310                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGA
gi|92311                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92312                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92313                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGATGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92314                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----GAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92315                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|92316                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92317                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92318                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92319                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92320                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92321                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92323                      :                                       -T-T-CA-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92324                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAAGG----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92325                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|92326                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAAa
gi|92327                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92328                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92330                      :                                       -T-T-CA-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-ATAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92331                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAACGGTTAAa
gi|92332                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA-----TAAAGGGTTAAa
gi|92334                      :                                       -T-T-CA-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92335                      :                                       -T-T-TG-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92337                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-------GAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92339                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCAA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GCAAAGGGTTAAa
gi|92340                      :                                       -T-T-AA-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92341                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCT----AAGGC----GT-TTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92342                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGATAA
gi|92344                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGCGTCTGT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAA
gi|92349                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-GTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92351                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92354                      :                                       -T-T-CA-ACAGCCTCCTAT-GT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92355                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCCA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92356                      :                                       -T-T-CATAAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92357                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCTA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92358                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCTA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAAa
gi|92360                      :                                       -T-T-CA-GAGGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGAC----GT-CTAT-ATGAA----ATAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTCCA----AAGGC----TT-CTAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAAa
gi|92363                      :                                       -T-T-CA-AAAGCTTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCCA----AAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92364                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTACA----AAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92365                      :                                       -T-T-CA-AAAGCCTTCTAC-AT-----CAGAGGTGTCCA----AAGGG----GT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92458                      :                                         -T-CA-AGAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AATGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92462                      :                                         -T-CA-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92466                      :                                         -T-CC-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCCA----AAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa

lowQualScore                  :                           1111                                                                                   
lowQualScore                  :                           7777      0 0            0  11111           1111      0000  0    0     0000            
lowQualScore                  :                           ....      . .            .  .....           ....      ....  .    .     ....            
lowQualScore                  :                           3333      4 4            8  00000           7777      8888  4    4     9999            
consensus                     :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
Reference ( family-25 )       :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91821                      :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----AT-CCAT-ATGGA----GTAAAGGGTTAA
gi|91823                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTACAGGGTTAAa
gi|91824                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|91826                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|91827                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTT----AAATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91828                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCATTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91829                      :   agcaatcagaaatggTTCTACACT----ATGTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91830                      :   agcagtcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGTTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|91832                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-TAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----ATAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91834                      :   agcaattagaactggTTCTACACT----GTTTAC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAA
gi|91838                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTT-T-CAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTA----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91841                      :   agcaatcagaactggTTCTGCACT----GTTTTC-A-AAAGCCT---AT-AT-----TAGAGATGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91843                      :   agcaatcagaactggTTCTATACT----GTTTTC-A-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91844                      :   agcaaaaagaactggTCCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TACAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91845                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTGTTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTTT----AAAGGT----GT-CCAT-ATTAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91847                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTATCTTC-AT-----TAGAGGTGTTG----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTGAA
gi|91848                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----TTTTTTTA-AAAGCCTTCTAT-ATAAATTTAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----ATAAATGGTTA
gi|91849                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGACTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTA----AAAGGT----GT-ACAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91850                      :        agaaaacggaattggCACC----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTTA----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTTAAGGGTTAAa
gi|91852                      :  agcaaacagaattgttTCCTACCCT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCA----AAAGAC----GT-CTAT-ATTAA----CAAAAGGGTAAA
gi|91853                      :   agcaatcagaactggTCCTACGCT----GTTTTC-A-AAAACCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCA----ATAGGC----GT-CTAT-AAAGG----GTAAA
gi|91881                      :   agcaatcagaactggTCCTGCACT----GATTTC-A-AAAACCTTCTTT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATa
gi|91903                      :     agcaatgagaactggCTACACT----GTTTTC-A-AAATCCTTTAGT-AC-----TGGAGGTGTTA----AAAGTA----AT-ATCT-ATGAAACTTGTAATGGGTTAA
gi|91907                      : agcaatcagaactggtaTCCTGCACT----GTTTTC-A-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91908                      :   agcaatctgaactctTCCTGCACT----GTTTTC-A-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91925                      :   agcaatctgaactctTTATATACT----GTTTTC-C-AAAGCCTTCTAA-AT-----TACAGGTGTCC-------------------AT-AGGAA----GTAAAG
gi|92094                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----ATTTTC-A-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGTTT
gi|92095                      :    gcaatcagaactgaTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGT-----------------T-CT-T-ATGAA----ATAAA-GGTTAA
gi|92110                      :    gcaatcagagctggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGGTC----TAAGTT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92117                      :      aatcagaactgaTTCTATAATAGA-GTCATC-C-AAAGCCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92119                      :         tcaaaacacTTCTATATTAG--GTTTCC-A-AAGGCGT-CTAG-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92135                      :         tcaaaagctTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GTCCTA--ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92136                      :         cataacctgTTCTACACG----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGACGTGTCC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92137                      :         cagaactggTTTTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-GTATAATGAA----GTAAAGGGATA
gi|92138                      :         cagaactgcTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-TT-----TAGAGGTGTTC----GAATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTATAGGGTTAA
gi|92141                      :    cagaattagttctaTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGGGTTA----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAACGGGTT
gi|92148                      :           gaactggTTTTACACT----GCTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGTTGTTC----AAAGAT----GC-CCCT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92149                      :              ctgaTTTTACCAT----TTTTTC-A-AA-GCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGAa
gi|92168                      :              ctggTTCTATATTAG--GTGTCC-A-GAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92170                      :                  TTCTATATTAGA-GGTGTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGA----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAAa
gi|92173                      :                  TTCTATATTAGA-GTTGTC-A-AAAGGCGTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CAAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92174                      :                  TTCTATATTA---GGTGTC-A-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92176                      :                  TTCTATATTAGA-GGTGTC-A-AAAGCCTTTGAT-AT-----TAGAGGTGTGC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92177                      :                  TTCTATATTAA--GTGTCC-A-AAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92178                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAAGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92182                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAAGCAT-CTAT-AT-----TAGAGTTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92183                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92184                      :                  TTCTATATTAGAGGTGTCC-A-AAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92185                      :                  TTCTATATTA---GGTATC-A-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92251                      :                   TCTATATTAG--GTGTCC-A-AAGGCCTT-TAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92277                      :                     TACACCCAG-GTATTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-TTGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92280                      :                       CACT----GTTTTC-A-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGAATTC----AAGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92299                      :                                 TTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92306                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92307                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92308                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92310                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGA
gi|92311                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92312                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92313                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGATGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92314                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----GAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92315                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|92316                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92317                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92318                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92319                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92320                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92321                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92323                      :                                  TTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92324                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAAGG----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92325                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|92326                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAAa
gi|92327                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92328                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92330                      :                                  TTC-A-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-ATAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92331                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAACGGTTAAa
gi|92332                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA-----TAAAGGGTTAAa
gi|92334                      :                                  TTC-A-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92335                      :                                  TTT-G-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92337                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-------GAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92339                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCA----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GCAAAGGGTTAAa
gi|92340                      :                                  TTA-A-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92341                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----TAAGGC----GT-TTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92342                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGATAA
gi|92344                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGCGTCTGT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAA
gi|92349                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-GTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92351                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92354                      :                                  TTC-A-ACAGCCTCCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92355                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92356                      :                                  TTC-ATAAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92357                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCT----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92358                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCT----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAAa
gi|92360                      :                                  TTC-A-GAGGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGAC----GT-CTAT-ATGAA----ATAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTCC----AAAGGC----TT-CTAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAAa
gi|92363                      :                                  TTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92364                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTAC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92365                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAC-AT-----CAGAGGTGTCC----AAAGGG----GT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92458                      :                                   TC-A-AGAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAATGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92462                      :                                   TC-A-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92466                      :                                   TC-C-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa

lowQualScore                  :                           1111                                                                                   
lowQualScore                  :                           7777      0 0            0  11111           1111      0000  0    0     0000            
lowQualScore                  :                           ....      . .            .  .....           ....      ....  .    .     ....            
lowQualScore                  :                           3333      4 4            8  00000           7777      8888  4    4     9999            
consensus                     :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
Reference ( family-25 )       :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91821                      :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----AT-CCAT-ATGGA----GTAAAGGGTTAA
gi|91823                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTACAGGGTTAAa
gi|91824                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|91826                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|91827                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTT----AAATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91828                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCATTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91829                      :   agcaatcagaaatggTTCTACACT----ATGTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91830                      :   agcagtcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGTTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|91832                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-TAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----ATAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91834                      :   agcaattagaactggTTCTACACT----GTTTAC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAA
gi|91838                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTT-T-CAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTA----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91841                      :   agcaatcagaactggTTCTGCACT----GTTTTC-A-AAAGCCT---AT-AT-----TAGAGATGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91843                      :   agcaatcagaactggTTCTATACT----GTTTTC-A-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91844                      :   agcaaaaagaactggTCCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TACAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91845                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTGTTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTTT----AAAGGT----GT-CCAT-ATTAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91847                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTATCTTC-AT-----TAGAGGTGTTG----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTGAA
gi|91848                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----TTTTTTTA-AAAGCCTTCTAT-ATAAATTTAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----ATAAATGGTTA
gi|91849                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGACTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTA----AAAGGT----GT-ACAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91850                      :        agaaaacggaattggCACC----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTTA----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTTAAGGGTTAAa
gi|91852                      :  agcaaacagaattgttTCCTACCCT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCA----AAAGAC----GT-CTAT-ATTAA----CAAAAGGGTAAA
gi|91853                      :   agcaatcagaactggTCCTACGCT----GTTTTC-A-AAAACCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCA----ATAGGC----GT-CTAT-AAAGG----GTAAA
gi|91881                      :   agcaatcagaactggTCCTGCACT----GATTTC-A-AAAACCTTCTTT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATa
gi|91903                      :     agcaatgagaactggCTACACT----GTTTTC-A-AAATCCTTTAGT-AC-----TGGAGGTGTTA----AAAGTA----AT-ATCT-ATGAAACTTGTAATGGGTTAA
gi|91907                      : agcaatcagaactggtaTCCTGCACT----GTTTTC-A-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91908                      :   agcaatctgaactctTCCTGCACT----GTTTTC-A-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91925                      :   agcaatctgaactctTTATATACT----GTTTTC-C-AAAGCCTTCTAA-AT-----TACAGGTGTCC-------------------AT-AGGAA----GTAAAG
gi|92094                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----ATTTTC-A-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGTTT
gi|92095                      :    gcaatcagaactgaTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGT-----------------T-CT-T-ATGAA----ATAAA-GGTTAA
gi|92110                      :    gcaatcagagctggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGGTC----TAAGTT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92117                      :      aatcagaactgaTTCTATAATAGA-GTCATC-C-AAAGCCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92119                      :         tcaaaacacTTCTATATTAG--GTTTCC-A-AAGGCGT-CTAG-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92135                      :         tcaaaagctTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GTCCTA--ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92136                      :         cataacctgTTCTACACG----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGACGTGTCC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92137                      :         cagaactggTTTTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-GTATAATGAA----GTAAAGGGATA
gi|92138                      :         cagaactgcTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-TT-----TAGAGGTGTTC----GAATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTATAGGGTTAA
gi|92141                      :    cagaattagttctaTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGGGTTA----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAACGGGTT
gi|92148                      :           gaactggTTTTACACT----GCTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGTTGTTC----AAAGAT----GC-CCCT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92149                      :              ctgaTTTTACCAT----TTTTTC-A-AA-GCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGAa
gi|92168                      :              ctggTTCTATATTAG--GTGTCC-A-GAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92170                      :                  TTCTATATTAGA-GGTGTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGA----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAAa
gi|92173                      :                  TTCTATATTAGA-GTTGTC-A-AAAGGCGTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CAAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92174                      :                  TTCTATATTA---GGTGTC-A-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92176                      :                  TTCTATATTAGA-GGTGTC-A-AAAGCCTTTGAT-AT-----TAGAGGTGTGC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92177                      :                  TTCTATATTAA--GTGTCC-A-AAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92178                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAAGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92182                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAAGCAT-CTAT-AT-----TAGAGTTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92183                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92184                      :                  TTCTATATTAGAGGTGTCC-A-AAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92185                      :                  TTCTATATTA---GGTATC-A-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92251                      :                   TCTATATTAG--GTGTCC-A-AAGGCCTT-TAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92277                      :                     TACACCCAG-GTATTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-TTGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92280                      :                       CACT----GTTTTC-A-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGAATTC----AAGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92299                      :                                 TTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92306                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92307                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92308                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92310                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGA
gi|92311                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92312                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92313                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGATGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92314                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----GAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92315                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|92316                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92317                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92318                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92319                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92320                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92321                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92323                      :                                  TTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92324                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAAGG----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92325                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|92326                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAAa
gi|92327                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92328                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92330                      :                                  TTC-A-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-ATAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92331                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAACGGTTAAa
gi|92332                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA-----TAAAGGGTTAAa
gi|92334                      :                                  TTC-A-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92335                      :                                  TTT-G-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92337                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-------GAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92339                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCA----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GCAAAGGGTTAAa
gi|92340                      :                                  TTA-A-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92341                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----TAAGGC----GT-TTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92342                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGATAA
gi|92344                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGCGTCTGT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAA
gi|92349                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-GTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92351                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92354                      :                                  TTC-A-ACAGCCTCCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92355                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92356                      :                                  TTC-ATAAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92357                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCT----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92358                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCT----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAAa
gi|92360                      :                                  TTC-A-GAGGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGAC----GT-CTAT-ATGAA----ATAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTCC----AAAGGC----TT-CTAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAAa
gi|92363                      :                                  TTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92364                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTAC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92365                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAC-AT-----CAGAGGTGTCC----AAAGGG----GT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92458                      :                                   TC-A-AGAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAATGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92462                      :                                   TC-A-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92466                      :                                   TC-C-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa


blockSeqs                     :                           AGAG                        AAATT           AGGA
blockSeqs                     :                           AGA                         .               AGGA
blockSeqs                     :                           AGA                         .               .   
blockSeqs                     :                           AGA                         .               .   
blockSeqs                     :                           AGA                         .               .   
blockSeqs                     :                           CAG                         .               .   
blockSeqs                     :                           AG                          .               .   
blockSeqs                     :                           AG                          .               .   
blockSeqs                     :                           AA                          .               .   
blockSeqs                     :                           AG                          .               .   
blockSeqs                     :                           AG                          .               .   
blockSeqs                     :                           AG                          .               .   
blockSeqs                     :                           AG                          .               .   
blockSeqs                     :                           A                           .               .   
blockSeqs                     :                           A                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                           .                           .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   
blockSeqs                     :                                                       .               .   


blockSeqCons                  :                  
originalCons                  :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
finalCons                     :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA

lowQualScore                  :                           1111                                                                                   
lowQualScore                  :                           7777      0 0            0  11111           1111      0000  0    0     0000            
lowQualScore                  :                           ....      . .            .  .....           ....      ....  .    .     ....            
lowQualScore                  :                           3333      4 4            8  00000           7777      8888  4    4     9999            
consensus                     :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
Reference ( family-25 )       :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91821                      :                  TTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----AT-CCAT-ATGGA----GTAAAGGGTTAA
gi|91823                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTACAGGGTTAAa
gi|91824                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|91826                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|91827                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTT----AAATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91828                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCATTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91829                      :   agcaatcagaaatggTTCTACACT----ATGTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91830                      :   agcagtcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGTTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|91832                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-TAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----ATAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|91834                      :   agcaattagaactggTTCTACACT----GTTTAC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAA
gi|91838                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTT-T-CAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTA----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91841                      :   agcaatcagaactggTTCTGCACT----GTTTTC-A-AAAGCCT---AT-AT-----TAGAGATGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91843                      :   agcaatcagaactggTTCTATACT----GTTTTC-A-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|91844                      :   agcaaaaagaactggTCCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TACAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91845                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTGTTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTTT----AAAGGT----GT-CCAT-ATTAA----GTAAAAGGTTAA
gi|91847                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTATCTTC-AT-----TAGAGGTGTTG----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTGAA
gi|91848                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----TTTTTTTA-AAAGCCTTCTAT-ATAAATTTAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----ATAAATGGTTA
gi|91849                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGACTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTTA----AAAGGT----GT-ACAT-ATGAA----GTAAAGGGCTAA
gi|91850                      :        agaaaacggaattggCACC----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTTA----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTTAAGGGTTAAa
gi|91852                      :  agcaaacagaattgttTCCTACCCT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCA----AAAGAC----GT-CTAT-ATTAA----CAAAAGGGTAAA
gi|91853                      :   agcaatcagaactggTCCTACGCT----GTTTTC-A-AAAACCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCA----ATAGGC----GT-CTAT-AAAGG----GTAAA
gi|91881                      :   agcaatcagaactggTCCTGCACT----GATTTC-A-AAAACCTTCTTT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATa
gi|91903                      :     agcaatgagaactggCTACACT----GTTTTC-A-AAATCCTTTAGT-AC-----TGGAGGTGTTA----AAAGTA----AT-ATCT-ATGAAACTTGTAATGGGTTAA
gi|91907                      : agcaatcagaactggtaTCCTGCACT----GTTTTC-A-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91908                      :   agcaatctgaactctTCCTGCACT----GTTTTC-A-AAGGCCTTCTGTGAT-----T---GGTG--CAGGAAAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTA
gi|91925                      :   agcaatctgaactctTTATATACT----GTTTTC-C-AAAGCCTTCTAA-AT-----TACAGGTGTCC-------------------AT-AGGAA----GTAAAG
gi|92094                      :   agcaatcagaactggTTCTACACT----ATTTTC-A-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAAGTTT
gi|92095                      :    gcaatcagaactgaTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGT-----------------T-CT-T-ATGAA----ATAAA-GGTTAA
gi|92110                      :    gcaatcagagctggTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGGTC----TAAGTT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92117                      :      aatcagaactgaTTCTATAATAGA-GTCATC-C-AAAGCCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92119                      :         tcaaaacacTTCTATATTAG--GTTTCC-A-AAGGCGT-CTAG-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92135                      :         tcaaaagctTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GTCCTA--ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92136                      :         cataacctgTTCTACACG----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGACGTGTCC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92137                      :         cagaactggTTTTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-GTATAATGAA----GTAAAGGGATA
gi|92138                      :         cagaactgcTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-TT-----TAGAGGTGTTC----GAATGT----GT-CCAT-ATGAA----GTATAGGGTTAA
gi|92141                      :    cagaattagttctaTTCTACACT----GTTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGGGTTA----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAACGGGTT
gi|92148                      :           gaactggTTTTACACT----GCTTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGTTGTTC----AAAGAT----GC-CCCT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92149                      :              ctgaTTTTACCAT----TTTTTC-A-AA-GCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTTC----AAAGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGAa
gi|92168                      :              ctggTTCTATATTAG--GTGTCC-A-GAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92170                      :                  TTCTATATTAGA-GGTGTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGA----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGATTAAa
gi|92173                      :                  TTCTATATTAGA-GTTGTC-A-AAAGGCGTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CAAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92174                      :                  TTCTATATTA---GGTGTC-A-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92176                      :                  TTCTATATTAGA-GGTGTC-A-AAAGCCTTTGAT-AT-----TAGAGGTGTGC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92177                      :                  TTCTATATTAA--GTGTCC-A-AAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92178                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAAGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92182                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAAGCAT-CTAT-AT-----TAGAGTTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92183                      :                  TTCTATATTAG--GTGTCC-A-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92184                      :                  TTCTATATTAGAGGTGTCC-A-AAGGCGT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92185                      :                  TTCTATATTA---GGTATC-A-AAGGCAT-CTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92251                      :                   TCTATATTAG--GTGTCC-A-AAGGCCTT-TAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92277                      :                     TACACCCAG-GTATTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-TTGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92280                      :                       CACT----GTTTTC-A-AAACCCTTCTAT-AT-----TAGAGGAATTC----AAGGGT----GT-CCAT-ATGAA----GTAAAGGGTTa
gi|92299                      :                                 TTTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92306                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92307                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92308                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92310                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTGA
gi|92311                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92312                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92313                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGATGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92314                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----GAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92315                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAa
gi|92316                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92317                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTGT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92318                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92319                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92320                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AC-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92321                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92323                      :                                  TTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92324                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAAGG----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92325                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGAGTTAAa
gi|92326                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAAa
gi|92327                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTTT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTT
gi|92328                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92330                      :                                  TTC-A-AAAGTCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-ATAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92331                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAACGGTTAAa
gi|92332                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA-----TAAAGGGTTAAa
gi|92334                      :                                  TTC-A-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92335                      :                                  TTT-G-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92337                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-------GAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92339                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCA----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GCAAAGGGTTAAa
gi|92340                      :                                  TTA-A-AAAGCCTTCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92341                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----TAAGGC----GT-TTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92342                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGATAA
gi|92344                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGCGTCTGT-CTAT-ATGAA----GTAAATGGTTAA
gi|92349                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-GTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92351                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTTT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92354                      :                                  TTC-A-ACAGCCTCCTAT-GT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92355                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTCC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92356                      :                                  TTC-ATAAAGCTTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGTTTAA
gi|92357                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCT----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92358                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCT----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAAa
gi|92360                      :                                  TTC-A-GAGGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGAC----GT-CTAT-ATGAA----ATAAAGGGTTAAa
gi|92362                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAGAAGTGTCC----AAAGGC----TT-CTAT-ATGAA----GTAAAAGGTTAAa
gi|92363                      :                                  TTC-A-AAAGCTTTCTAT-AT-----AAGAGGTGTCC----AAAGGC----AT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92364                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAT-AT-----TAG--GTGTAC----AAAGGC----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAA
gi|92365                      :                                  TTC-A-AAAGCCTTCTAC-AT-----CAGAGGTGTCC----AAAGGG----GT-CTAT-ATGAA----GAAAAGGGTTAA
gi|92458                      :                                   TC-A-AGAGCCTTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAATGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92462                      :                                   TC-A-AAAGGCATCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa
gi|92466                      :                                   TC-C-AAAGGCGTCTAT-AT-----TAGAGGTGTCC----AAAGGT----GT-CTAT-ATGAA----GTAAAGGGTTAAa