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lowQualScore                  :    .     . . .     .........  . . . .. . .  .   . .  ..  ........ .  ....  . ...  ................... ..... ...  .  .   .. .....     ...     ... ....... .  ......   . .. ...... . ...  .     .  .  .  .   ..  .      
lowQualScore                  :    5     3 6 6     666666666  1 1 5 22 0 5  0   5 0  88  99999999 5  0000  5 222  5555555555555555555 33333 888  4  4   66 55555     555     888 6666666 4  666666   4 66 666666 8 888  9     4  5  5  5   77  0      
consensus                     :   TCAAAAT-C-T-GTCAA--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAT-A-TG-GAG-----C--G-GA----CA-C---GA---A----------A----T-T---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-T--A------A-G---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTT-GAGCTACGGA
Reference ( gi|83441 )        :   TTAAAAT-C-T-GTCAA--A------TG-G-T-T--A-C-AA-GAT-A-TG-AAG-----T--G-GA----CA-C---AA---G----------C----T-T---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-T--A------A-G---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTT-AAGTTATGGA
gi|83445                      :   TCAAAAT-C-T-GTTGA--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAT-A-TG-GAG-----C--G-GA----CA-C---A---------------CA---T-T---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TA------A-AC------CTC-T--A------T-G---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTT-CAGCTACAGA
gi|83446                      :   TCAAAAT-G-G-GTTCA--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAT-A-TG-GAG-----T--G-TA----CA-C---AA---A----------A----T-T---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-C--A------A-G---TG-TGACC-TT-GG-CC-TTT-GAACTAGGGA
gi|83451                      :   TCAAAAT-C-T-GTCAT--G------CG-G-T-TT-A-C-AA-AAT-A-TG-GAG-----T--G-TA----TA-C---CA---A----------A----T-A---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-T--T------A-G---CG-TGACC-TT-GA-CA-TTT-GAGCTATGGA
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gi|83459                      :   TCAAAAT-C-T-GTCGA--A------TC-G--------C-AA-AAT-A-TG-GAG-----C--G-GA----CA-C---AA---A----------T----T-T---T---TG-TA-CCC--A-----TTTCT---GACCT---TA------A-AC------CTC-----------------TG-TGACC-TT-GA-CC-TTC-AAGACATGG
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gi|83483                      :   TTAAAAT-C-T--TGAA--G------TG-ACT-T--A-C-AA-GAT-A-TG-GAA-----C--A-GA----CA-C---AA---A----------A----T-TATTT---TG-TA-CCT--G-----TATCT---GACCA---CA------A-AC------CTCTT--A------A-G---TG-T
gi|83447                      :   TCAAAAT-C-TTGTCAG--G------TT-G-T-TT-A-G-AA-GGT-A-TG-GAA-----C--A-AA----CA-TTAAAA---A----------T----TGT---T---TA-TA-CATGCA-----TTTCT---GACCT---TT------A-AC------CCC-T--A------T-G---GG-TGACC-TT-GT-CC-TTT-GAGCCAGGGA
gi|83450                      :   TTAAAAT-C-T---CAA--G------CG-G-T-TT-G-C-AA-GAT-A-AG-GAA-----C--T-GA----TA-C---AA---A----------A----C-T---T---TA-T----------------CT---GACCT---TG------G-AC------CTC-C--A------A-G---TG-AGCCC-TT-CA-CC-TTT-GAGCCAAGGA
gi|83490                      :   TCAAAATAT-T-GTCAA--A------TG-G-T-TT-A-G-AA-GAT-A-TG-GAG-----C--G-GA----CA-C-----------------------------------G-GA------A-----TTT-T---GACCT---TT------A-AC------CGC-T--A------A-G---TGTTGACA--T-GA-CT-TTT-GAG
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gi|83487                      :   TCAAATT-A-T-GTCAG--A------TG-T-T-TT-A-A-AA-GAT-A-TG-CAGCTGATT--G-GA----CA-C---A--------------------T-A---A---TG-CA-CCA--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AG------ACG-T--A------A-A---TA-TGA-C-TT-GA-CC-TT
gi|83496                      :   TCAAAAT-C-T-GTCCA--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAC-A-TG-GGA-----T--G-GA----CA-A---GA---A----------T----A-T---T---TC-CA-CCT--A-----TTTCT---GAGCA---TG--------AC------CTT-T--G------A-
gi|83497                      :   TCAAAAT-T-T-GTCAA--G------TG-G-T-TT-A-C-AG-GAT-A-TT-GAT-----T--G-GA----CA-CCA-AA---A----------TTTAAT-T---T---TG-TA-CCT--AGGCTTTTTCT---AACCA---TG------A-A
gi|83463                      :   TCAAAAT-G-T-GTCAA--G------TA-G-T-TT-A-T-AA-AAT-A-TG-GAG-----C--G-GA----CA-C---AA---A----------A----T-T---G---TG-TA-CTT--A-----CATCT---TACAT---T
gi|83481                      :   TCAAACT-T-T-ATCAA--G------TG-G-TAT--A-C-AA-GAT-G-TG-GAG-----T--G-GA----CACC---AA---A----------A----T-A---T---TG-TA-CCT--C-----TATCT---
gi|83484                      :   TCAAAAT-T-TTGTCAA--G------AG-G-T-TT-A-G-AA-GAT-A-TG-GAA-----C--A-GG----CA-T---GA----------------------------------------A-----TTTCT---GACCT---CT------A-GT------CTT-C--A------A-G---TG-TGACT-AT-GA-CA-TTT-GA
gi|83489                      :   TCAAAAT-A-T-GTTGA--G------T----T-T--A-C-AA-GAT-A-TA-GAG------------------------------------------------------TG-TA-TCT--AT----TTTTT---AACCT---AG------A-A---------C-T--A------A-G---AA-TGACA-TT-TA-CC-TTT-GGGTTA
gi|83471                      :   TTAAATT-C-T-CACAG--G------TG-G-T-TT-A-G-AA-GAT-A-TG-GAG-----C--T-AA----CA-T---GA---A----------A----T-A---T---TG-TA-CTT--A-----TTTCT---AACTT---
gi|83511                      :     AAAAT-C-T-GTCAA--A------TG-A-T-TT-A-A-AA-GAT-A-TG-GAA-----C--G-AA----CA-C---AA---A----------A----T-T---T---TG-TA-TCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-C--A------A-G---TG-TGACC-TA-GA-CA-TTT-AAGCTACAGA
gi|83512                      :     AAAAT-C-T-GTCAA--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAT-A-TA-GAA-----C--A-GA----TG-C---CA---A----------A----T-T---G---TG-TA-AAT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-GC------CAC-T--A------A-A---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTT-GAG
gi|83502                      :     AAAAT-C-C-ATCAA--G------TT-G-T-TT-A-C-AA-GAT-A-TG-AAG-----C--A-AA----CA-CC--AA---A----------C----A-T---T----G-TA-CTC--A-----TT-CT---GACCT---TG------A-AC------ATC-T--C------A-G---TA-TTACC-AT-GA-CC-ATT-TACCTATGAAc
gi|83513                      :    cAAAAT-C-C-CCTAA--AG-----TG-G-T-T--A-A-AAAGAT-A-TG-GAG-----G--G-GA----CA-C---GG---A----------A----T-G---C---TG-T---CT--A-----TTT-----GACCT---TT------G-AC------CGC-T--C------A-G---TA-TGACT-TT-GA-CC-
gi|83504                      :     AAAAT-C-T-CTCAA--G------CA-G-T-TA-A-A-AA-GAT-A-TG-GAG-----A--A-GG----TA-TG--AA---G-------------------------TGCTA-CC---A-----TTTTT----ACCT---TT------G-GC------CAC-T--C------A-G---TG-CAACC-CT-GA-GC-TT
gi|83515                      :    cAAAAT-C-----CAATAA------TGCA-T-G--A-C-AAAGAT-A-C---AG-----TCCG-GA----CA-C---AA---A----------A----T-C---T---CA-CA-CAG--A-----CTCCA---AGTGT---TGTAAAAAA-AA------CTC-A--A------A-G---TG-TGACC-TT-CA-CC-TTT-GAGGTATGGgagccat
gi|83466                      :      AAAT-C-T-GTCCT--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAA-A-TG-GAG-----T--G-GC----CA-C---AA---A----------A----T-T---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACTC---TG------A-AT------CTC-T-----------T---TG-TGACC-TC-GA--C-TTC-GAGCTA
gi|83520                      :   tctAAAT-T-T-ATAAG--A------TG-G-T-TT-A-G-AA-GAT-A-CT-AAG-----C--A-GC----AA-T---GG---A----------A----T-A---T---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-AC------CTG-T--A------A-G---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTT-
gi|83476                      :      AAAT-C-T-GT------------TG-G-T-TT-A-C-AA-GAT-A-TG-GAG-----T--G-GA----CA-A---GA---A----------T----A-T---T---TT-TA--CT--A-----TTTCCAAAAAC-----TG------A-AC------ATT-T--A------A-G---TG-TAACT-GT-GA-CC-TTT-GAGCTATAGAgtcctat
gi|83478                      :   tccAAAT-C-T-GTCCA--G------TG-G-T-TT-A-C-AT-GAT-A-AG-GAC-----C--A-GA----CA-C---GA---A----------A----T-T---G---TG-TA-ACT--A-----TATTT---GACCT---CC------A-AC------CTC-T-----------G---TG-TGACC-TT-TG-CA-TTT-GAGATGTGGA
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gi|83528                      :        AT-C-T-GTCCA--G------TA-A-T-TT-A-T-AA-GAT-A-TG-CAG-----C--A-GA----TA-T---AA---A----------A----T-A---C---TG-TA-TCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-TCTGTTTTTTG-T--A------A-G---TT-TGACC-TT-GA-CC-TTT-GAGT
gi|83527                      :        AT-G-T-GT--A--G------TG-G-T-TTGA---AA-GAT-A-TG-GAG----------GA----CA-C---GA---A----------A----T-T---T---GG-TA-CCT--A-----TTTCT---GAC-----TG------------------T-T--A------A-A---TG-TGACC-AG-GA-CC-TTG-AAGT
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gi|83485                      :    tcagat-C-T-GTCAA--G------TG-GCT-T--A-C-AA-AAT-A-TA-GAG-----A--G-GA----AA-T---GA---A----------A----T----------G-TA-CAC--A-----TTTCT---GGCCT---TG------A-ACT-----TTT-T--ACATAATA-A---TA-TGACC-AT-GA-CC-TTT-
gi|83530                      : tcagaatggga-T-GTCAA--A------T-----------T-AA-GAT-A-TG-GAG-----C--A-GA----CT-T---AA---A---------------T-T---C---TG-TA-CCT--A-----TTTTT---GACCT---T---------------------T--A------A-G---AC-TAACC-TT-GA-CC-TTT-CAGCTTTGGA
gi|83529                      :            -T-GTGGA--G------TG-G-T-TT-A-C-AA-AAA-A-CG-GAG-----C--G-GA----CA-C---GA---T----------T----T-T---G---TG-TA-TAT--A-----TGTAT---GACTT---TT------A-AC------CGC-C--A------A-G---TG-TGACC-TA-TA-CC-TT
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gi|83533                      :       tcaaaattacgAA--G------TG-G-T-T----T-GA-GTT-A-TG-GAG-----C--A-GA----CA-C---AA---A----------A----T-T---G---TA-TA-CTT--A-----TTTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-C--A------A-G---TG-TGACA-CT-GA-CC-TTTGGACCTATGG
gi|83534                      :                   A--A------TG-G-T-A--A-G-GA-GAT-A-TGTAAT-----T--A-GAGCTGCA-T---GG---A----------G----T-T---A---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---GACCT---TG------A-GC------CTC-T--A------A-G---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTC-GAGC
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gi|83546                      :                                        -C-AA-AAT-A-TC-CAA-----A--G-GA----CA-C---CA---T----------A----T-A---G---TG-TA-CCT--A-----TTTCT---CACCT---TT------A-AC------CTT-T--A------A-G---TA-TGACT-TT-AA-CC-CCT-AAGTtcagctaagga
gi|83548                      :                                          -AA-AAT---TA-AAG-----T--G-GA----GA-T---GA---A----------A----T-T---T---TG-TA-CCT--A-----TTTAT---GACCT---TT------A-AC------T---------------G---TG-TGACC-TT-GA-CC-TTT-GATCTACGGAat
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gi|83558                      :                                                        AG-----C--A-GA----CA-A---AA-------------------T-T---T---TG-CA-CCT--A-----TTTCT---GACCA---TG------A-GC------CTC-T--A------A-G---TG-AGGCC-TT-CAGCT-TTT-GAGCTAgtgaccttgtctttgagctacgga
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gi|83565                      :                                                                                                              aaaG-TA-TTT--A-----TTTCT---GACCT---TT------T-AC------CTC-T--T------G-G---TG-TTACT-GT-GA-CC-TTT-GAGCTA
gi|83486                      :                                                                                                                    A-CCT--A-----TTTCT---GCCCT---TG------A-AC------CTT-C--A------A-G---TA-TGACT-TT-GA-CC-GTT-GATCTATGGA
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Alignments
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gi|83490                      :                          TCAAAATA---T-T-G-TCAAA------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GG------A---AT--T----T---------------------------------T---GACCT---TT------A-AC------CGC-TA------A-G---TGTTGACA---------------T-GA-C-----T-TTT-GAGCCA
gi|83491                      :                          TCAAAAT----C-TTG-TCACA------T--GGTTTAAGACGA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GC------A---CT--T----T---TG-TAA---C----A-----T------TT---------T---TT------A-AC------CTT-CA------A-A---TG-TGAAC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGCCAGGGA
gi|83492                      :                          TCAAAAT----A-T-G-T--AG------TATGTTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----A-GACA-C--TA------A---AG--T----G---TG-TAT---GT---A-----T------TTAT---GACCT---TG------A-AC------CTG-CA------A-G---TG-TGATC-T-------------TCCA-C-----C-TT
gi|83493                      :                          TCAAAAT----C-T-G-CTAAA------C--TTTTTACAA-GA-T-A----TG------AAA--C-----A-TACT-T---------------T--T----T---TT-TAT---CT---T-----T------TTCT---TTCCT---TG------T-TC------CTC-TA------A-G---TT-TGACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83494                      :                          TCAAAAT----A-T-G-TCAAG------C--AGTTTATAG-AA-C-A----TG------GAG--T-----G-AAAACC--AA------A---AT--TTATAT---TG-TAC---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------A-A-------CTT-TA------A-G---TA-T
gi|83495                      :                          TTAAATT----C-T-A-TCAAA------C--TGTTAACAA-AA-A-A----TT------TAG--C-----T-GAAA-C--AA------A---TT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CT--TA------A-
gi|83496                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCCAG------T--GGTTTACAA-GA-C-A----TG------GGA--T-----G-GACA-A--GA------AT--AT--T----T---C--CAC---CT---A-----T------TTCT---GAGCA---TG--------AC------CTT-TG------A-
gi|83497                      :                          TCAAAAT----T-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAG-GA-T-A----TT------GAT--T-----G-GACA-C--CAAAATTTA---AT--T----T---TG-TAC---CT---AGGCTTT------TTCT---AACCA---TG------A-A
gi|83502                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCAAG------T--TGTTTACAA-GA-T-A----TG------AAG--C-----A-AACA-C--CA------A---AC--A----T---TG-TAC---TC---A------------TTCT---GACCT---TG------A-AC------ATC-TC------A-G---TA-TTACC-A-------------T-GA-C-----C-ATT-TACCTATGAA
gi|83503                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCCA-------T--GCATGACAAAGT-T-A----CA------GGC--C-----G-GACA-T--GA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TCAT---AATGT---TGTC----A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83504                      :                           CAAAAT----C-T-C-TCAAG------C--AGTTAAAAA-GA-T-A----TG------GAG--A-----A-GGTA-T--GA------A---G------------TGCTAC---C----A-----T------TTTT----ACCT---TT------G-GC------CAC-TC------A-G---TG-CAACC-C-------------T-GA-G-----C--TT-GAGCCA
gi|83505                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCTA--------------TACAT-GA-C-AAAGTTG------CAGGCC-----G-GACA-C--GA------A---AT----------------------------------------CT---CACCT---AG------A---------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTACGGt
gi|83506                      :                           CAAAAT----C-A-A-TCAA-------T--GCATGACAAAGA-T-A----CA------GGC--C-----G-GAAA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CACAAACTCAAA-----G------TGTT---G---T---CA------A-ACAAA---CTC-AA------A-T---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83511                      :                            AAAAT----C-T-G-TCAAA------T--GATTTAAAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----G-AACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------A-GA-C-----A-TTT-AAGCTACAGA
gi|83512                      :                            AAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TA------GAA--C-----A-GATG-C--CA------A---AT--T----G---TG-TAA---AT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-GC------CAC-TA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGC
gi|83513                      :                            AAAAT----C-C-CCTAAAG------T--GGTTAAAAA-GA-T-A----TG------GAG--G-----G-GACA-C--GG------A---AT--G----C---TG-T-----CT---A-----T------T--T---GACCT---TT------G-AC------CGC-TC------A-G---TA-TGACT-T-------------T-GA-C-----C-
gi|83515                      :                                                                AA-GA-T-A----CA------GTC--C-----G-GACA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TCCA---AGTGT---TGTAAAAAA-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-CA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83520                      :        aaaatccaataatgcatgacaAAAT----T-T-A-TAAGA------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----CT------AAG--C-----A-GCAA-T--GG------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-G
gi|83522                      :                             AAAT----C-C-A-TCAA-------T--GCATGACAAAGT-T-A----CA------GGC--C-----G-GAAA-C--GA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TTGC---AAAC------------A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTACGGAtcctat
gi|83523                      :                             AAAT----T-T-A-TCCA-------T--AGGTGACAA-AG-T-AA---CA------GAC--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CACAAACTCAAA-----G------TGTT---G---T---CA------A-ACAAA---CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGGA
gi|83526                      :                               AT----C-T-G-TCAAG------T--GATTTATAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----T-GACA-T--GA------C---AC--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTTT---G-----------------AC------CTC-TA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83527                      :                               AT----G-T-G-T--AG------T--GGTTTGAAA-GA-T-A----TG------GAG----------GACA-C--GA------A---AT--T----T---GG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GAC-----TG------------------T-TA------A-A---TG-TGACC-A-------------G-GA-C-----C-TTG-AAGTTttga
gi|83528                      :                               AT----C-T-G-TCCAG------T--AATTTATAA-GA-T-A----TG------CAG--C-----A-GATA-T--AA------A---AT--A----C---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-TCTGTTTTTTG-TA------A-G---TT-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGTT
gi|83529                      :                                      -T-G-TGGAG------T--GGTTTACAA-AA-A-A----CG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------T---TT--T----G---TG-TAT---AT---A-----T------GTAT---GACTT---TT------A-AC------CGC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------A-TA-C-----C-TT
gi|83530                      :                                      -T-G-TCAAA------T--------TAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----A-GAC--T--TA------A---AT--T----C---TG-TAC---CT---A-----T------TTTT---GACCT---T---------------------TA------A-G---AC-TAACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-CAGCTTTGGA
gi|83531                      :                                      -T-G-TCAAC------T--GGTTAACAC-GA-T-A----TG------GAG--T-----A-GACA-C--AA------A---AC--C----T---TG-TAC---CT---A-------------------------------------------------CA------A-G---TA-TAACC-T-------------T-GA-T-----T-TTT-AAGCTA
gi|83532                      :                                                                                                                       T--T----T---TT-TAA---CT---A-----T------TTAT---GAACT---TG------A-AC------AGC-TA------T-G---TG-TAACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTATGGA
gi|83533                      : tgccaaatgtctgcaatgttgggcatgccaacacagactcttttAAG------T--GGTTTG--A-GT-T-A----TG------GAG--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--T----G---TA-TAC---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACA-C-------------T-GA-C-----C-TTTGGACCTATGG
gi|83534                      :                                                                 A-GA-T-A----TGTAATTAGAG--C-----T-G-CA-T--GG------A---GT--T----A---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-GC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTC-GAGCT
gi|83535                      :                                                      aatggtaaggAA-AA-T-A----TG------GAG--C-----G-GAC--C--AG------A---AT--T----T---TT-TAC---CC---A-----T------TTCT---GAATT---AG------G-AC------CTC-CA------G-G---TG-GGACC-A-------------T-GA-C-----C-TGT-GAGATATGGA
gi|83536                      :                                      atggcatata------T--GGTTGACAA-GA-TTA----TG------GAG--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAC---TT---A-----C------CTCC---AACCT---TA------A-AC------CAC-TA------A-A---TGCTGA
gi|83537                      :                                                ------T--GGTTTAAAA-AAAT-A----TG------AAG--T-----G-GACG-C--AA------A---AT--T----T---TA-GAC---TT---A-----T------TTTT---TACCT---TC------A-AC------ACC-TA------T-A---TG-T-----T-------------T-AA-C-----C-GCT-AAG
gi|83538                      :                                                           TTTACAA-CA-T-A----TG------GCA--T-----G-GATA-C--AA------A---AT--T----T---TA-TAT---CT---A-----T------TTCT----------------------------------A------A-G---TG-TAACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGATACGGA
gi|83539                      :                                                            TTATCA-GA-T-A----TT------GAG--C-----C-AACT-T--GA------A---AT--G----T---TG-TAA---CT---T-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACT-G-------------T-GA-C-----T-TTT-
gi|83540                      :                                                            TTACAA-GA-T-A----GG------AAA--C-----A-AACA-C--AA------A---AT--T----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------T-AC------CTC-AA------A-A---TG---------------------T-GA-C-----T-TTT-GAACTACGGA
gi|83541                      :                                                            TTACAA-TA-T-A----TG------TAG--C-----G-GGCA-C--GA------A---AT--G----T---TG-TGC---CC---A-----T------T-CT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TT------A-G---TG-TGACA-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83543                      :                                                             TACAA-GA-T-A----TG------AAT--C--------ACA-T--AC------A---ATTGT----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------TGC-AA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GG-C-----C-TTT-GAGATATGGAttga
gi|83544                      :                                                             TACAA-GA-T-T----TG------AAA--C-----G-TACA-T--GA------A---AT--T----G---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACC----TG------A-CC------ATG-TA------A-G---TG-TGACC-G-------------T-GA-T-----C-TTC-GAGCTA
gi|83545                      :                                                              ACAA-TA-C-A----TG------GAG--C-----G-GAGA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---TT---T-----T------TGCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGGC-------------------A---------TTT-CAGCTAAGGA
gi|83546                      :                                                               CAA-AA-T-A----TC------CAA--A-----G-GACA-C--CA------T---AT--A----G---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---CACCT---TT------A-AC------CTT-TA------A-G---TA-TGACT-T-------------T-AA-C-----C-CCT-AAG
gi|83547                      :                                                                AA-GG-T-A----TG------GAG--C-----A-GACA-C--GA------A---ATA-T----G---TG-TAC---CT---T-----T------TTCT---GACCT---GG------A-AC------CTC-TA------A-G----G----------------------------------TTT-GAGCTACGGAtat
gi|83548                      :                                                                AA-AA-T------TA------AAG--T-----G-GAGA-T--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTAT---GACCT---TT------A-AC------T-------------G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GATCTACGGA
gi|83554                      :                                                                     -T-A----AG------GAC--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--C----T---CA-TAC---AA---A-----CACAAAGTTTT---G-------TC------A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGGA
gi|83557                      :                                                                       -A----TG------AAG--A-----GTGACA-T--AA------A---AT--T----G---TG-TAT---GT---A-----T------TTCT---AACCT---TG------A-AC------ATC-TA------A-G---TG-TGACC-TTGTCATCTAAGTGT-GA-CCTTGTC-TTT-GAGCTACGGA
gi|83558                      :                                                                                      AG--C-----A-GACA-----A------A---AT--T----T---TG-CAC---CT---A-----T------TTCT---GACCA---TG------A-GC------CTC-TA------A-G---TG-AGGCC-T-------------T-CAGC-----T-TTT-GAGCTA
gi|83561                      :                                                                                                   ACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAT---TT---A-----T------TTCT---GACTT---AT------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTAAGGA
gi|83562                      :                                                                                                           A------A---AT--T----G---TG-TAC---GT---A-----T------TTTT---GACAT---TT------A-AC------ATC-TA------A-G---TA-TGACA-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GACCTACG
gi|83563                      :                                                                                                           A------A---AT--T----C---TG-TAC---CT---A-----T------TTCTTCTGATCT---TT------A-AC------CTC-TA------G-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----T-TTT-GAGTTATGGA
gi|83565                      :                                                                                                                                    G-TAT---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------T-AC------CTC-TT------G-G---TG-TTACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83567                      :                                                                                                                                             T---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGATA-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GACCTACGGA
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Alignments
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lowQualScore                  :                                 .... . . .     ...... ..         .  . . ....  ......   .. ..... .    . ... ...... ...  ....... ...  .   ...  ... ..... ......    ...     ... ....... .  ......   .  ...... . ...  .     . ............. .  . ..... .   .      .   
lowQualScore                  :                                 4444 1 3 5     555555 77         8  4 4 8888  333333   66 11111 4    9 666 222222 000  0000000 777  4   444  000 00000 222222    888     777 3333333 4  111111   4  666666 4 333  9     4 4444444444444 4  4 11111 4   5      3   
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Reference ( family-244 )      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTACGGA
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gi|83481                      :                          TCAAACT----T-T-A-TCAAG------T--GGTATACAA-GA-T-G----TG------GAG--T-----G-GACACC--AA------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---C-----T------ATCT---
gi|83482                      :                          TCAAAAT----C-T-A-TCAAG------T--GTTTTATAA-GA-G-T----TG------GAG--C-----A-GACA-T--GA------A---AT--T----T---TG-TTC---AT---G-----G------ATCT---GACCT---TT------A-AC------CTG-CA------A-G---TA-TGACA-T-------------T-GA-C-----C--TT-AAGCTACGGA
gi|83483                      :                          TTAAAAT----C-T---TGAAG------T--GACTTACAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----A-GACA-C--AA------AATTAT--T----T---TG-TAC---CT---G-----T------ATCT---GACCA---CA------A-AC------CTCTTA------A-G---TG-T
gi|83484                      :                          TCAAAAT----T-TTG-TCAAG------A--GGTTTAGAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----A-GGCA-T--GA-------------------------------------A-----T------TTCT---GACCT---CT------A-GT------CTT-CA------A-G---TG-TGACT-A-------------T-GA-C-----A-TTT-GA
gi|83485                      :                          TCAGAATGGGAC-T-G-TCAAG------T--GGCTTACAA-AA-T-A----TA------GAG--A-----G-GAAA-T--GA------A---A------------TG-TAC---AC---A-----T------TTCT---GGCCT---TG------A-ACT-----TTT-TACATAATA-A---TA-TGACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-
gi|83486                      :                          TCATAAT----C-T-G-CCGTG------T--TGTTTACTA-AA-T-A----CT------GAG--T-----G--------------------------------------AC---CT---A-----T------TTCT---GCCCT---TG------A-AC------CTT-CA------A-G---TA-TGACT-T-------------T-GA-C-----C-GTT-GATCTATGGA
gi|83487                      :                          TCAAATT----A-T-G-TCAGA------T--GTTTTAAAA-GA-T-A----TG------CAG--CTGATTG-GACA-C--AT------A---AT------------G-CAC---CA---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AG------ACG-TA------A-A---TA-TGA-C-T-------------T-GA-C-----C-TT
gi|83488                      :                          TTAAAAT----AAT-G-TCGAT------T--GTTTTGGAA--A-T-A----TG------GCG--C-----G-AACG-T--GA------C---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TCGT---GACCT---TG------C-AT------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGATATGAA
gi|83489                      :                          TCAAAAT----A-T-G-TTGAG------T-----TTACAA-GA-T-A----TA------GAG-------------------------------------------TG-TAT---CT---A-----T------TTTTT--AACCT---AG------A-AC----------TA------A-G---AA-TGACA-T-------------T-TA-C-----C-TTT-GGGTTA
gi|83490                      :                          TCAAAATA---T-T-G-TCAAA------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GG------A---AT--T----T---------------------------------T---GACCT---TT------A-AC------CGC-TA------A-G---TGTTGACA---------------T-GA-C-----T-TTT-GAGCCA
gi|83491                      :                          TCAAAAT----C-TTG-TCACA------T--GGTTTAAGACGA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GC------A---CT--T----T---TG-TAA---C----A-----T------TT---------T---TT------A-AC------CTT-CA------A-A---TG-TGAAC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGCCAGGGA
gi|83492                      :                          TCAAAAT----A-T-G-T--AG------TATGTTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----A-GACA-C--TA------A---AG--T----G---TG-TAT---GT---A-----T------TTAT---GACCT---TG------A-AC------CTG-CA------A-G---TG-TGATC-T-------------TCCA-C-----C-TT
gi|83493                      :                          TCAAAAT----C-T-G-CTAAA------C--TTTTTACAA-GA-T-A----TG------AAA--C-----A-TACT-T---------------T--T----T---TT-TAT---CT---T-----T------TTCT---TTCCT---TG------T-TC------CTC-TA------A-G---TT-TGACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83494                      :                          TCAAAAT----A-T-G-TCAAG------C--AGTTTATAG-AA-C-A----TG------GAG--T-----G-AAAACC--AA------A---AT--TTATAT---TG-TAC---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------A-A-------CTT-TA------A-G---TA-T
gi|83495                      :                          TTAAATT----C-T-A-TCAAA------C--TGTTAACAA-AA-A-A----TT------TAG--C-----T-GAAA-C--AA------A---TT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CT--TA------A-
gi|83496                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCCAG------T--GGTTTACAA-GA-C-A----TG------GGA--T-----G-GACA-A--GA------AT--AT--T----T---C--CAC---CT---A-----T------TTCT---GAGCA---TG--------AC------CTT-TG------A-
gi|83497                      :                          TCAAAAT----T-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAG-GA-T-A----TT------GAT--T-----G-GACA-C--CAAAATTTA---AT--T----T---TG-TAC---CT---AGGCTTT------TTCT---AACCA---TG------A-A
gi|83502                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCAAG------T--TGTTTACAA-GA-T-A----TG------AAG--C-----A-AACA-C--CA------A---AC--A----T---TG-TAC---TC---A------------TTCT---GACCT---TG------A-AC------ATC-TC------A-G---TA-TTACC-A-------------T-GA-C-----C-ATT-TACCTATGAA
gi|83503                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCCA-------T--GCATGACAAAGT-T-A----CA------GGC--C-----G-GACA-T--GA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TCAT---AATGT---TGTC----A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83504                      :                           CAAAAT----C-T-C-TCAAG------C--AGTTAAAAA-GA-T-A----TG------GAG--A-----A-GGTA-T--GA------A---G------------TGCTAC---C----A-----T------TTTT----ACCT---TT------G-GC------CAC-TC------A-G---TG-CAACC-C-------------T-GA-G-----C--TT-GAGCCA
gi|83505                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCTA--------------TACAT-GA-C-AAAGTTG------CAGGCC-----G-GACA-C--GA------A---AT----------------------------------------CT---CACCT---AG------A---------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTACGGt
gi|83506                      :                           CAAAAT----C-A-A-TCAA-------T--GCATGACAAAGA-T-A----CA------GGC--C-----G-GAAA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CACAAACTCAAA-----G------TGTT---G---T---CA------A-ACAAA---CTC-AA------A-T---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83511                      :                            AAAAT----C-T-G-TCAAA------T--GATTTAAAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----G-AACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------A-GA-C-----A-TTT-AAGCTACAGA
gi|83512                      :                            AAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TA------GAA--C-----A-GATG-C--CA------A---AT--T----G---TG-TAA---AT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-GC------CAC-TA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGC
gi|83513                      :                            AAAAT----C-C-CCTAAAG------T--GGTTAAAAA-GA-T-A----TG------GAG--G-----G-GACA-C--GG------A---AT--G----C---TG-T-----CT---A-----T------T--T---GACCT---TT------G-AC------CGC-TC------A-G---TA-TGACT-T-------------T-GA-C-----C-
gi|83515                      :                                                                AA-GA-T-A----CA------GTC--C-----G-GACA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TCCA---AGTGT---TGTAAAAAA-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-CA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83520                      :        aaaatccaataatgcatgacaAAAT----T-T-A-TAAGA------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----CT------AAG--C-----A-GCAA-T--GG------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-G
gi|83522                      :                             AAAT----C-C-A-TCAA-------T--GCATGACAAAGT-T-A----CA------GGC--C-----G-GAAA-C--GA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TTGC---AAAC------------A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTACGGAtcctat
gi|83523                      :                             AAAT----T-T-A-TCCA-------T--AGGTGACAA-AG-T-AA---CA------GAC--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CACAAACTCAAA-----G------TGTT---G---T---CA------A-ACAAA---CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGGA
gi|83526                      :                               AT----C-T-G-TCAAG------T--GATTTATAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----T-GACA-T--GA------C---AC--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTTT---G-----------------AC------CTC-TA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83527                      :                               AT----G-T-G-T--AG------T--GGTTTGAAA-GA-T-A----TG------GAG----------GACA-C--GA------A---AT--T----T---GG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GAC-----TG------------------T-TA------A-A---TG-TGACC-A-------------G-GA-C-----C-TTG-AAGTTttga
gi|83528                      :                               AT----C-T-G-TCCAG------T--AATTTATAA-GA-T-A----TG------CAG--C-----A-GATA-T--AA------A---AT--A----C---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-TCTGTTTTTTG-TA------A-G---TT-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGTT
gi|83529                      :                                      -T-G-TGGAG------T--GGTTTACAA-AA-A-A----CG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------T---TT--T----G---TG-TAT---AT---A-----T------GTAT---GACTT---TT------A-AC------CGC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------A-TA-C-----C-TT
gi|83530                      :                                      -T-G-TCAAA------T--------TAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----A-GAC--T--TA------A---AT--T----C---TG-TAC---CT---A-----T------TTTT---GACCT---T---------------------TA------A-G---AC-TAACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-CAGCTTTGGA
gi|83531                      :                                      -T-G-TCAAC------T--GGTTAACAC-GA-T-A----TG------GAG--T-----A-GACA-C--AA------A---AC--C----T---TG-TAC---CT---A-------------------------------------------------CA------A-G---TA-TAACC-T-------------T-GA-T-----T-TTT-AAGCTA
gi|83532                      :                                                                                                                       T--T----T---TT-TAA---CT---A-----T------TTAT---GAACT---TG------A-AC------AGC-TA------T-G---TG-TAACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTATGGA
gi|83533                      : tgccaaatgtctgcaatgttgggcatgccaacacagactcttttAAG------T--GGTTTG--A-GT-T-A----TG------GAG--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--T----G---TA-TAC---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACA-C-------------T-GA-C-----C-TTTGGACCTATGG
gi|83534                      :                                                                 A-GA-T-A----TGTAATTAGAG--C-----T-G-CA-T--GG------A---GT--T----A---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-GC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTC-GAGCT
gi|83535                      :                                                      aatggtaaggAA-AA-T-A----TG------GAG--C-----G-GAC--C--AG------A---AT--T----T---TT-TAC---CC---A-----T------TTCT---GAATT---AG------G-AC------CTC-CA------G-G---TG-GGACC-A-------------T-GA-C-----C-TGT-GAGATATGGA
gi|83536                      :                                      atggcatata------T--GGTTGACAA-GA-TTA----TG------GAG--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAC---TT---A-----C------CTCC---AACCT---TA------A-AC------CAC-TA------A-A---TGCTGA
gi|83537                      :                                                ------T--GGTTTAAAA-AAAT-A----TG------AAG--T-----G-GACG-C--AA------A---AT--T----T---TA-GAC---TT---A-----T------TTTT---TACCT---TC------A-AC------ACC-TA------T-A---TG-T-----T-------------T-AA-C-----C-GCT-AAG
gi|83538                      :                                                           TTTACAA-CA-T-A----TG------GCA--T-----G-GATA-C--AA------A---AT--T----T---TA-TAT---CT---A-----T------TTCT----------------------------------A------A-G---TG-TAACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGATACGGA
gi|83539                      :                                                            TTATCA-GA-T-A----TT------GAG--C-----C-AACT-T--GA------A---AT--G----T---TG-TAA---CT---T-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACT-G-------------T-GA-C-----T-TTT-
gi|83540                      :                                                            TTACAA-GA-T-A----GG------AAA--C-----A-AACA-C--AA------A---AT--T----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------T-AC------CTC-AA------A-A---TG---------------------T-GA-C-----T-TTT-GAACTACGGA
gi|83541                      :                                                            TTACAA-TA-T-A----TG------TAG--C-----G-GGCA-C--GA------A---AT--G----T---TG-TGC---CC---A-----T------T-CT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TT------A-G---TG-TGACA-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83543                      :                                                             TACAA-GA-T-A----TG------AAT--C--------ACA-T--AC------A---ATTGT----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------TGC-AA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GG-C-----C-TTT-GAGATATGGAttga
gi|83544                      :                                                             TACAA-GA-T-T----TG------AAA--C-----G-TACA-T--GA------A---AT--T----G---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACC----TG------A-CC------ATG-TA------A-G---TG-TGACC-G-------------T-GA-T-----C-TTC-GAGCTA
gi|83545                      :                                                              ACAA-TA-C-A----TG------GAG--C-----G-GAGA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---TT---T-----T------TGCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGGC-------------------A---------TTT-CAGCTAAGGA
gi|83546                      :                                                               CAA-AA-T-A----TC------CAA--A-----G-GACA-C--CA------T---AT--A----G---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---CACCT---TT------A-AC------CTT-TA------A-G---TA-TGACT-T-------------T-AA-C-----C-CCT-AAG
gi|83547                      :                                                                AA-GG-T-A----TG------GAG--C-----A-GACA-C--GA------A---ATA-T----G---TG-TAC---CT---T-----T------TTCT---GACCT---GG------A-AC------CTC-TA------A-G----G----------------------------------TTT-GAGCTACGGAtat
gi|83548                      :                                                                AA-AA-T------TA------AAG--T-----G-GAGA-T--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTAT---GACCT---TT------A-AC------T-------------G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GATCTACGGA
gi|83554                      :                                                                     -T-A----AG------GAC--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--C----T---CA-TAC---AA---A-----CACAAAGTTTT---G-------TC------A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGGA
gi|83557                      :                                                                       -A----TG------AAG--A-----GTGACA-T--AA------A---AT--T----G---TG-TAT---GT---A-----T------TTCT---AACCT---TG------A-AC------ATC-TA------A-G---TG-TGACC-TTGTCATCTAAGTGT-GA-CCTTGTC-TTT-GAGCTACGGA
gi|83558                      :                                                                                      AG--C-----A-GACA-----A------A---AT--T----T---TG-CAC---CT---A-----T------TTCT---GACCA---TG------A-GC------CTC-TA------A-G---TG-AGGCC-T-------------T-CAGC-----T-TTT-GAGCTA
gi|83561                      :                                                                                                   ACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAT---TT---A-----T------TTCT---GACTT---AT------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTAAGGA
gi|83562                      :                                                                                                           A------A---AT--T----G---TG-TAC---GT---A-----T------TTTT---GACAT---TT------A-AC------ATC-TA------A-G---TA-TGACA-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GACCTACG
gi|83563                      :                                                                                                           A------A---AT--T----C---TG-TAC---CT---A-----T------TTCTTCTGATCT---TT------A-AC------CTC-TA------G-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----T-TTT-GAGTTATGGA
gi|83565                      :                                                                                                                                    G-TAT---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------T-AC------CTC-TT------G-G---TG-TTACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83567                      :                                                                                                                                             T---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGATA-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GACCTACGGA
gi|83570                      :                                                                                                                                                                              G------A-AC------CTT-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGCTACGAA
gi|83572                      :                                                                                                                                                                               ------A-AA------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG


blockSeqs                     :                                 GGGA A T       ACTTAG            C      AAGT  TAATTA      TGATT        TAA AAATTT ATT  TTATA            AAA  CAA GGCTT ACAAAG    AAA         GTAAAAA    TGTTTT      CATAAT   ACT          TGTCATCTAAGTG      CTTGT
blockSeqs                     :                                 A    A T       .                 A      A     .           .            A   .      C    AATA             AAA  CAA .     .         TCT         GTC        AAA         T        AA           .                  .    
blockSeqs                     :                                 A    . T       .                 A      A     .           .            G   .      T    TGT              .    GC  .     .         T           T          AAA         .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . T       .                 A      .     .           .            C   .      T    TGT              .    .   .     .         .           T          T           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . T       .                 .      .     .           .            A   .      .    AT               .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . T       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            C   .      .    C                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    G                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    G                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            C   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    G                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            T   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    G                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    A                .    .   .     .         .           C          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           C          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    G                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            T   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            C   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            C   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    C                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    C                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            C   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    G                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    C                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    C                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    C                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            T   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    C                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                 .    . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                      . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                      . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           C          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                      . .       .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                .                 .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           A          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                .                 .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                .                 .      .     .           .            G   .      .    G                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            G   .      .    G                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            C   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            G   .      .    A                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            G   .      .    T                .    .   .     .         .           C          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            G   .      .    C                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           G          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            A   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            .   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
blockSeqs                     :                                                                  .      .     .           .            .   .      .    T                .    .   .     .         .           T          .           .        .            .                  .    
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originalCons                  :                          TCAAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTACGGA
finalCons                     :                          TCAAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTACGGA





Alignments
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lowQualScore                  :                                 .... . . .     ...... ..         .  . . ....  ......   .. ..... .    . ... ...... ...  ....... ...  .   ...  ... ..... ......    ...     ... ....... .  ......   .  ...... . ...  .     . ............. .  . ..... .   .      .   
lowQualScore                  :                                 4444 1 3 5     555555 77         8  4 4 8888  333333   66 11111 4    9 666 222222 000  0000000 777  4   444  000 00000 222222    888     777 3333333 4  111111   4  666666 4 333  9     4 4444444444444 4  4 11111 4   5      3   
consensus                     :                          TCAAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTACGGA
Reference ( family-244 )      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTACGGA
gi|83441                      :                          TTAAAAT----C-T-G-TCAAA------T--GGTT-ACAA-GA-T-A----TG------AAG--T-----G-GACA-C--AA------G---CT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGTTATGGA
gi|83442                      :                          TCAAAAT----C-TTG-TCATG------T--GGTTTAGCA-GG-T-A----TG------GAG--------A-AACA-C--AA------A---AA--T----T---TG-TAC---CC---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-AAA-TG-TGACC-T-------------T-GA-T-----C-TTT-GA
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gi|83451                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCATG------C--GGTTTACAA-AA-T-A----TG------GAG--T-----G-TATA-C--CA------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TT------A-G---CG-TGACC-T-------------T-GA-C-----A-TTT-GAGCTATGGA
gi|83452                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCACG------T--GGTTTACCA-GA-T-A----TG------G----C-----A-GACA-T--GA------C---AT--T----T---TA-TTC---CT---T-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------GTC-TA------A-G---TG-TCACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AACCTACAGA
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gi|83455                      :                          TCAAAAT----C-T-A-TCAAGACTTAGT--GGTTTACAT-GA-A-A----TG------GAG--C-----A-GACA-T--GA------A---AT--T----A---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------A-AC------CTC-T---------G---TG-TGACT-T-------------T-GA-C-----A-TTT-GAGATATGGA
gi|83456                      :                          TTAAAAT----A-T-G-TCAA-------T--GATTTACAA-GA-T-A----AG------AAG--C-----G-GACA-C--AA------A---GT--G----C---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---AA------A-AT------CTG-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TGT-GAGCTA
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gi|83460                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCGAA------T--CG----CAA-AA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--AA------A---TT--T----T---TG-TAC---CC---A-----T------TTCT---GACCT---TA------A-AC------CTC---------------TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTC-AAGACATGG
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gi|83462                      :                          TCAAATT----G-T-C-TCGAG------T--GATTTACAA-GA-T-T----TG------GAG--C-----G-GATA-C--GA------A---AT--G----T---TG-TAC---GT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CAC-TA------A-G---TG-TGACA-T-------------T-TG-C-----C-TTT-GAGCTATAGA
gi|83463                      :                          TCAAAAT----G-T-G-TCAAG------T--AGTTTATAA-AA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--AA------A---AT--T----G---TG-TAC---TT---A-----C------ATCT---TACAT---T
gi|83464                      :                          TCAAAAG----T-T-T-TCATG------T--GGCTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----A--ACA-C--AA------T---TT--T----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GAACT---TG------A-AC------ATC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-A-----C-TTT-GAGCTA
gi|83465                      :                          TCAAAAT----C-TTG-TCAGG------T--GGTTTAGAA-CA-T-A----TG------GCG--T-----G-GACA-T--GA------A---GT--G----T---TA-TAT---GT---A-----T------TTCT---GACCG---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGC
gi|83466                      :                          TCTAAAT----C-T-G-TCCTG------T--GGTTTACAA-GA-A-A----TG------GAG--T-----G-GCCA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACTC---TG------A-AT------CTC-T---------T---TG-TGACC-T-------------C-GA-------C-TTC-GAGCTA
gi|83467                      :                          TCAAAAT----C-A-G-TCAAG------T--GATTTACAA-GA-T-A----TA------ATG--C-----A-AACA-C--GA------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GA--------------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TTACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAACTACAGA
gi|83468                      :                          TCAAAAT----A-T-A-TTGAG------T--GGTTTATAA-AA-T-A----TA------GAT--T-----T-GACA-C--CA------A---AT--A----T---TG-TGC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTT-TA------G-G---TG-TGGCC-T-------------T-GA-A-----C-TTT-AAGCTACAGA
gi|83469                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCCAG------T--AGTTTATAT-GG-T-AA---TA------AAG--C-----A-GACA-T--GA------A---AT--T----C---TG-AAC---CT---C-----T------TTCT---GACAT---TA------A-AC------CTC-TA------A-G---CG-TGACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83470                      :                          TCAAAAT----TAC-G--CAAG------T--GGTTTACAA-CA-T-A----TG------GAG--T-----G-GGTA-C--TA------A---ATAATA---TACATG-TGC---CT---A-----T------TTCT---GAGCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TA-TGACC-T-------------T-GA-T-----C-TTT-GAGCTA
gi|83471                      :                          TTAAATT----C-T-C-ACAGG------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----T-AACA-T--GA------A---AT--A----T---TG-TAC---TT---A-----T------TTCT---AACTT---
gi|83472                      :                          TCAAAAT----A-T-G-CCGAA------T--GGTTTACAA--A-T-A----TG------TAA--T-----G-CACA-C--GA------A---AT--T----G---TG-AAA---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------G-AC------CTC-TT------A-G---TG-ACACT-T-------------T-GA-C-----C-TGT-GAGCTACGGA
gi|83473                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCATG------T--GGTTT-CAA-GA-T-A----TG------AAG--C-----A-GATA-T--GG-----------------------TG-TG-----T---A-----T------TCCT---GATCT---TA------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTC-AAGTTACGGA
gi|83474                      :                          TTAAAAT----C-T-G-TAAAC------T--GAGTTACAA-GA-A-A----TG------GAG--C-----A-TGCA-C--AA------A---AT--T----A---TA-TAC---AT---A-----T------ATAT---GACCT---TG------A-AT------CTC-TA------A-G---TC-TGACC-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAACTACAGA
gi|83475                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TTAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----CT------GAG----------GACA-T---A------A---AT--A----T---TG--AC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-A---TG-TAAT-----------------------------TTT-GAGCTAAGGA
gi|83476                      :                          TCCAAAT----C-T-G-T----------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----G-GACA-A--GA------AT--AT--T----T---T--TA----CT---A-----T------TTCCAAAAAC-----TG------A-AC------ATT-TA------A-G---TG-TAACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTATAGA
gi|83477                      :                          TTAAAAT----A-T-T-TCAA-------T--GATTTACAA-G----------------------C-----G-AACA-C--AA------A---GT--T----T---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACTT---AA------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-AA-C-----C-TTT-GAACTACAGA
gi|83478                      :                          TCTAAAT----C-T-G-TCCAG------T--GGTTTACAT-GA-T-A----AG------GAC--C-----A-GACA-C--GA------A---AT--T----G---TG-TAA---CT---A-----T------ATTT---GACCT---CC------A-AC------CTC-T---------G---TG-TGACC-T-------------T-TG-C-----A-TTT-GAGATGTGGA
gi|83479                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-AA-T-------G------GAG--C-----A-GACA-C--GA------A---AT--A----T---TG-TAA---CG---A-----T------TTCT---GACTT---TG------ACAG------AT--TA------A-G---TA-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-GTC-AAG
gi|83480                      :                          TCAAAAT----G-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-T--GA------A---AT--G----C---TT-TAC---CT---A-----T------TTAT---GAACT---TC------A-AC------GTC-CG------A-G---TG-TGATC-T-------------
gi|83481                      :                          TCAAACT----T-T-A-TCAAG------T--GGTATACAA-GA-T-G----TG------GAG--T-----G-GACACC--AA------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---C-----T------ATCT---
gi|83482                      :                          TCAAAAT----C-T-A-TCAAG------T--GTTTTATAA-GA-G-T----TG------GAG--C-----A-GACA-T--GA------A---AT--T----T---TG-TTC---AT---G-----G------ATCT---GACCT---TT------A-AC------CTG-CA------A-G---TA-TGACA-T-------------T-GA-C-----C--TT-AAGCTACGGA
gi|83483                      :                          TTAAAAT----C-T---TGAAG------T--GACTTACAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----A-GACA-C--AA------AATTAT--T----T---TG-TAC---CT---G-----T------ATCT---GACCA---CA------A-AC------CTCTTA------A-G---TG-T
gi|83484                      :                          TCAAAAT----T-TTG-TCAAG------A--GGTTTAGAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----A-GGCA-T--GA-------------------------------------A-----T------TTCT---GACCT---CT------A-GT------CTT-CA------A-G---TG-TGACT-A-------------T-GA-C-----A-TTT-GA
gi|83485                      :                          TCAGAATGGGAC-T-G-TCAAG------T--GGCTTACAA-AA-T-A----TA------GAG--A-----G-GAAA-T--GA------A---A------------TG-TAC---AC---A-----T------TTCT---GGCCT---TG------A-ACT-----TTT-TACATAATA-A---TA-TGACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-
gi|83486                      :                          TCATAAT----C-T-G-CCGTG------T--TGTTTACTA-AA-T-A----CT------GAG--T-----G--------------------------------------AC---CT---A-----T------TTCT---GCCCT---TG------A-AC------CTT-CA------A-G---TA-TGACT-T-------------T-GA-C-----C-GTT-GATCTATGGA
gi|83487                      :                          TCAAATT----A-T-G-TCAGA------T--GTTTTAAAA-GA-T-A----TG------CAG--CTGATTG-GACA-C--AT------A---AT------------G-CAC---CA---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AG------ACG-TA------A-A---TA-TGA-C-T-------------T-GA-C-----C-TT
gi|83488                      :                          TTAAAAT----AAT-G-TCGAT------T--GTTTTGGAA--A-T-A----TG------GCG--C-----G-AACG-T--GA------C---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TCGT---GACCT---TG------C-AT------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGATATGAA
gi|83489                      :                          TCAAAAT----A-T-G-TTGAG------T-----TTACAA-GA-T-A----TA------GAG-------------------------------------------TG-TAT---CT---A-----T------TTTTT--AACCT---AG------A-AC----------TA------A-G---AA-TGACA-T-------------T-TA-C-----C-TTT-GGGTTA
gi|83490                      :                          TCAAAATA---T-T-G-TCAAA------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GG------A---AT--T----T---------------------------------T---GACCT---TT------A-AC------CGC-TA------A-G---TGTTGACA---------------T-GA-C-----T-TTT-GAGCCA
gi|83491                      :                          TCAAAAT----C-TTG-TCACA------T--GGTTTAAGACGA-T-A----TG------GAG--C-----G-GACA-C--GC------A---CT--T----T---TG-TAA---C----A-----T------TT---------T---TT------A-AC------CTT-CA------A-A---TG-TGAAC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGCCAGGGA
gi|83492                      :                          TCAAAAT----A-T-G-T--AG------TATGTTTTACAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----A-GACA-C--TA------A---AG--T----G---TG-TAT---GT---A-----T------TTAT---GACCT---TG------A-AC------CTG-CA------A-G---TG-TGATC-T-------------TCCA-C-----C-TT
gi|83493                      :                          TCAAAAT----C-T-G-CTAAA------C--TTTTTACAA-GA-T-A----TG------AAA--C-----A-TACT-T---------------T--T----T---TT-TAT---CT---T-----T------TTCT---TTCCT---TG------T-TC------CTC-TA------A-G---TT-TGACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83494                      :                          TCAAAAT----A-T-G-TCAAG------C--AGTTTATAG-AA-C-A----TG------GAG--T-----G-AAAACC--AA------A---AT--TTATAT---TG-TAC---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------A-A-------CTT-TA------A-G---TA-T
gi|83495                      :                          TTAAATT----C-T-A-TCAAA------C--TGTTAACAA-AA-A-A----TT------TAG--C-----T-GAAA-C--AA------A---TT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CT--TA------A-
gi|83496                      :                          TCAAAAT----C-T-G-TCCAG------T--GGTTTACAA-GA-C-A----TG------GGA--T-----G-GACA-A--GA------AT--AT--T----T---C--CAC---CT---A-----T------TTCT---GAGCA---TG--------AC------CTT-TG------A-
gi|83497                      :                          TCAAAAT----T-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAG-GA-T-A----TT------GAT--T-----G-GACA-C--CAAAATTTA---AT--T----T---TG-TAC---CT---AGGCTTT------TTCT---AACCA---TG------A-A
gi|83502                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCAAG------T--TGTTTACAA-GA-T-A----TG------AAG--C-----A-AACA-C--CA------A---AC--A----T---TG-TAC---TC---A------------TTCT---GACCT---TG------A-AC------ATC-TC------A-G---TA-TTACC-A-------------T-GA-C-----C-ATT-TACCTATGAA
gi|83503                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCCA-------T--GCATGACAAAGT-T-A----CA------GGC--C-----G-GACA-T--GA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TCAT---AATGT---TGTC----A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83504                      :                           CAAAAT----C-T-C-TCAAG------C--AGTTAAAAA-GA-T-A----TG------GAG--A-----A-GGTA-T--GA------A---G------------TGCTAC---C----A-----T------TTTT----ACCT---TT------G-GC------CAC-TC------A-G---TG-CAACC-C-------------T-GA-G-----C--TT-GAGCCA
gi|83505                      :                           CAAAAT----C-C-A-TCTA--------------TACAT-GA-C-AAAGTTG------CAGGCC-----G-GACA-C--GA------A---AT----------------------------------------CT---CACCT---AG------A---------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTACGGt
gi|83506                      :                           CAAAAT----C-A-A-TCAA-------T--GCATGACAAAGA-T-A----CA------GGC--C-----G-GAAA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CACAAACTCAAA-----G------TGTT---G---T---CA------A-ACAAA---CTC-AA------A-T---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83511                      :                            AAAAT----C-T-G-TCAAA------T--GATTTAAAA-GA-T-A----TG------GAA--C-----G-AACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------A-GA-C-----A-TTT-AAGCTACAGA
gi|83512                      :                            AAAAT----C-T-G-TCAAG------T--GGTTTACAA-GA-T-A----TA------GAA--C-----A-GATG-C--CA------A---AT--T----G---TG-TAA---AT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-GC------CAC-TA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGC
gi|83513                      :                            AAAAT----C-C-CCTAAAG------T--GGTTAAAAA-GA-T-A----TG------GAG--G-----G-GACA-C--GG------A---AT--G----C---TG-T-----CT---A-----T------T--T---GACCT---TT------G-AC------CGC-TC------A-G---TA-TGACT-T-------------T-GA-C-----C-
gi|83515                      :                                                                AA-GA-T-A----CA------GTC--C-----G-GACA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TCCA---AGTGT---TGTAAAAAA-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-CA-C-----C-TTT-GAGGTATGG
gi|83520                      :        aaaatccaataatgcatgacaAAAT----T-T-A-TAAGA------T--GGTTTAGAA-GA-T-A----CT------AAG--C-----A-GCAA-T--GG------A---AT--A----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-G
gi|83522                      :                             AAAT----C-C-A-TCAA-------T--GCATGACAAAGT-T-A----CA------GGC--C-----G-GAAA-C--GA------A---AT--C----T---CA-CAC---AG---A-----C------TTGC---AAAC------------A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTACGGAtcctat
gi|83523                      :                             AAAT----T-T-A-TCCA-------T--AGGTGACAA-AG-T-AA---CA------GAC--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--C----T---CA-CACAAACTCAAA-----G------TGTT---G---T---CA------A-ACAAA---CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGGA
gi|83526                      :                               AT----C-T-G-TCAAG------T--GATTTATAA-GA-T-A----TG------GAG--T-----T-GACA-T--GA------C---AC--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTTT---G-----------------AC------CTC-TA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83527                      :                               AT----G-T-G-T--AG------T--GGTTTGAAA-GA-T-A----TG------GAG----------GACA-C--GA------A---AT--T----T---GG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GAC-----TG------------------T-TA------A-A---TG-TGACC-A-------------G-GA-C-----C-TTG-AAGTTttga
gi|83528                      :                               AT----C-T-G-TCCAG------T--AATTTATAA-GA-T-A----TG------CAG--C-----A-GATA-T--AA------A---AT--A----C---TG-TAT---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-TCTGTTTTTTG-TA------A-G---TT-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGTT
gi|83529                      :                                      -T-G-TGGAG------T--GGTTTACAA-AA-A-A----CG------GAG--C-----G-GACA-C--GA------T---TT--T----G---TG-TAT---AT---A-----T------GTAT---GACTT---TT------A-AC------CGC-CA------A-G---TG-TGACC-T-------------A-TA-C-----C-TT
gi|83530                      :                                      -T-G-TCAAA------T--------TAA-GA-T-A----TG------GAG--C-----A-GAC--T--TA------A---AT--T----C---TG-TAC---CT---A-----T------TTTT---GACCT---T---------------------TA------A-G---AC-TAACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-CAGCTTTGGA
gi|83531                      :                                      -T-G-TCAAC------T--GGTTAACAC-GA-T-A----TG------GAG--T-----A-GACA-C--AA------A---AC--C----T---TG-TAC---CT---A-------------------------------------------------CA------A-G---TA-TAACC-T-------------T-GA-T-----T-TTT-AAGCTA
gi|83532                      :                                                                                                                       T--T----T---TT-TAA---CT---A-----T------TTAT---GAACT---TG------A-AC------AGC-TA------T-G---TG-TAACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTATGGA
gi|83533                      : tgccaaatgtctgcaatgttgggcatgccaacacagactcttttAAG------T--GGTTTG--A-GT-T-A----TG------GAG--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--T----G---TA-TAC---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-CA------A-G---TG-TGACA-C-------------T-GA-C-----C-TTTGGACCTATGG
gi|83534                      :                                                                 A-GA-T-A----TGTAATTAGAG--C-----T-G-CA-T--GG------A---GT--T----A---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-GC------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTC-GAGCT
gi|83535                      :                                                      aatggtaaggAA-AA-T-A----TG------GAG--C-----G-GAC--C--AG------A---AT--T----T---TT-TAC---CC---A-----T------TTCT---GAATT---AG------G-AC------CTC-CA------G-G---TG-GGACC-A-------------T-GA-C-----C-TGT-GAGATATGGA
gi|83536                      :                                      atggcatata------T--GGTTGACAA-GA-TTA----TG------GAG--C-----A-GACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAC---TT---A-----C------CTCC---AACCT---TA------A-AC------CAC-TA------A-A---TGCTGA
gi|83537                      :                                                ------T--GGTTTAAAA-AAAT-A----TG------AAG--T-----G-GACG-C--AA------A---AT--T----T---TA-GAC---TT---A-----T------TTTT---TACCT---TC------A-AC------ACC-TA------T-A---TG-T-----T-------------T-AA-C-----C-GCT-AAG
gi|83538                      :                                                           TTTACAA-CA-T-A----TG------GCA--T-----G-GATA-C--AA------A---AT--T----T---TA-TAT---CT---A-----T------TTCT----------------------------------A------A-G---TG-TAACC-A-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGATACGGA
gi|83539                      :                                                            TTATCA-GA-T-A----TT------GAG--C-----C-AACT-T--GA------A---AT--G----T---TG-TAA---CT---T-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGACT-G-------------T-GA-C-----T-TTT-
gi|83540                      :                                                            TTACAA-GA-T-A----GG------AAA--C-----A-AACA-C--AA------A---AT--T----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TA------T-AC------CTC-AA------A-A---TG---------------------T-GA-C-----T-TTT-GAACTACGGA
gi|83541                      :                                                            TTACAA-TA-T-A----TG------TAG--C-----G-GGCA-C--GA------A---AT--G----T---TG-TGC---CC---A-----T------T-CT---GACCT---TG------A-AC------CTC-TT------A-G---TG-TGACA-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83543                      :                                                             TACAA-GA-T-A----TG------AAT--C--------ACA-T--AC------A---ATTGT----T---TT-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACCT---TG------A-AC------TGC-AA------A-A---TG-TGACC-T-------------T-GG-C-----C-TTT-GAGATATGGAttga
gi|83544                      :                                                             TACAA-GA-T-T----TG------AAA--C-----G-TACA-T--GA------A---AT--T----G---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---GACC----TG------A-CC------ATG-TA------A-G---TG-TGACC-G-------------T-GA-T-----C-TTC-GAGCTA
gi|83545                      :                                                              ACAA-TA-C-A----TG------GAG--C-----G-GAGA-C--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---TT---T-----T------TGCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGGC-------------------A---------TTT-CAGCTAAGGA
gi|83546                      :                                                               CAA-AA-T-A----TC------CAA--A-----G-GACA-C--CA------T---AT--A----G---TG-TAC---CT---A-----T------TTCT---CACCT---TT------A-AC------CTT-TA------A-G---TA-TGACT-T-------------T-AA-C-----C-CCT-AAG
gi|83547                      :                                                                AA-GG-T-A----TG------GAG--C-----A-GACA-C--GA------A---ATA-T----G---TG-TAC---CT---T-----T------TTCT---GACCT---GG------A-AC------CTC-TA------A-G----G----------------------------------TTT-GAGCTACGGAtat
gi|83548                      :                                                                AA-AA-T------TA------AAG--T-----G-GAGA-T--GA------A---AT--T----T---TG-TAC---CT---A-----T------TTAT---GACCT---TT------A-AC------T-------------G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GATCTACGGA
gi|83554                      :                                                                     -T-A----AG------GAC--C-----G-GACA-C--GA------A---AT--C----T---CA-TAC---AA---A-----CACAAAGTTTT---G-------TC------A-AA------CTC-AA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGGA
gi|83557                      :                                                                       -A----TG------AAG--A-----GTGACA-T--AA------A---AT--T----G---TG-TAT---GT---A-----T------TTCT---AACCT---TG------A-AC------ATC-TA------A-G---TG-TGACC-TTGTCATCTAAGTGT-GA-CCTTGTC-TTT-GAGCTACGGA
gi|83558                      :                                                                                      AG--C-----A-GACA-----A------A---AT--T----T---TG-CAC---CT---A-----T------TTCT---GACCA---TG------A-GC------CTC-TA------A-G---TG-AGGCC-T-------------T-CAGC-----T-TTT-GAGCTA
gi|83561                      :                                                                                                   ACA-C--AA------A---AT--T----T---TG-TAT---TT---A-----T------TTCT---GACTT---AT------A-AC------CTG-TA------A-G---TG-TGACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTAAGGA
gi|83562                      :                                                                                                           A------A---AT--T----G---TG-TAC---GT---A-----T------TTTT---GACAT---TT------A-AC------ATC-TA------A-G---TA-TGACA-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GACCTACG
gi|83563                      :                                                                                                           A------A---AT--T----C---TG-TAC---CT---A-----T------TTCTTCTGATCT---TT------A-AC------CTC-TA------G-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----T-TTT-GAGTTATGGA
gi|83565                      :                                                                                                                                    G-TAT---TT---A-----T------TTCT---GACCT---TT------T-AC------CTC-TT------G-G---TG-TTACT-G-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGCTA
gi|83567                      :                                                                                                                                             T---A-----T------TTCT---GACCT---TT------A-AC------CTC-TA------A-G---TG-TGATA-A-------------T-GA-C-----C-TTT-GACCTACGGA
gi|83570                      :                                                                                                                                                                              G------A-AC------CTT-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-AAGCTACGAA
gi|83572                      :                                                                                                                                                                               ------A-AA------CTC-TA------A-G---TG-TGACC-T-------------T-GA-C-----C-TTT-GAGGTATGG