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Reference ( gi|18979 )        :  AAACTCC--TATAGTT-T----A-TT-AAAA--TC-C-AC-T-AT---G--TTTCT--ACT--T----A-GA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCG-TTCA--G--A--TTTTGTA--T-T--G---CGCCCC
gi|18978                      :  AAACTCC--CATATTT-T----A-TT-AAAA--TC-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----TAT--GTT--T--GC-CTG-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CACACC
gi|18919                      :  AAACTCC--CATATTT-T----A-TC-AAAA--TT-C-AC-T-AT---T--TTTCT--ACT--T----A-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CTG-TTAA--G--A--TTATGTG--T-T--G---CGCGCC
gi|18920                      : tAAACTCC--TGTATTT-T----A-TT-AAAA--TC-C-AC-T-AT---A--TGTCT--ACT--G----A-AA-AA----CAC--ATG--T--GC-CCG-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---TG
gi|18917                      : tAAACTCC--CATATTT-T----A-TTTAAAG--TT-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACG-------A-AA-AA----CAT--GTG--T--GA-CTG-TTCA--G--A--TTTTGTA--T-T--G---TGCCCC
gi|18934                      : tAAATTCG--TACATTT-T----A-TT-AAAA--TC-A-AC-T-AT---A--CTTCT--ACT--C----A-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCA-TTCC--G--A--TTTTGTG--T-T--G---TGCCTC
gi|18928                      : tAAAATTC--TGTAGTT-T----A-TT-AAAG--TT-A-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----C-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCA-TGCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CGCCC
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gi|18958                      : tAAACTCC--CATATGT-T----A-TT-AAAA--TA-C-AT-T-TT---A--TATTT--ACT---------GA-AA----CGT--GTT--T--GC-TCA-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CTCCC
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gi|18937                      : tAAACTTC--CATATTT-T----A-TT-ATAA--TT-C-AC-A-AT---A--TTTCT--AAT---------GA-AA----AAC--GTA--T--AC-CAG-TTCA--G--A--TTATGTG--T-T--G---CACCCC
gi|18945                      : tAAACTCC--CGTATTT-T----A-TT-AAAA--TT-C-AC-T-TT---A--TTTCA--AAT--G----A-AA-AA----CAT--TTA--T--GC-CCG-TTCA--A--A--TTTTGT
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gi|18955                      : tAAACTCC--CATATTT-T----A-TT-AAAA--TC-C-CC-T-TT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-TA----CAT--GTG--T--GC-CCT-TTCA--
gi|18948                      : tAAACTTC--CATATGT-T----A-TT-AAAA--TG-C-AT-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A--A-AA----CGT--GTT--T--GT-TAG-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---Ctaatatgtgt
gi|18949                      : tAAACTCC--CATATTT-G----A-TT-AAAA--TT-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACTG-T----A-AACAA----CAT--GTG--T--GCGCTT-TTCA--T--A--TATTCAG--T-T--G---TGCTCC
gi|18962                      : tAAACTC---TATATTT-T----A-TT-CAAA--TT-T-AC-T-AA---A--TGTCT--ACT-------A-AA-AA----CCT--GTG--T--GT-CCG-TTCA--T--ATTTTTTGTG--T-T--G---CG
gi|18959                      : tAAACTCC--AATATGT-C----A-TT-ATAA--TG-C-AT-T-AT---A--TTTCA--ACT--G----A--A-AA----CGT--GTT--T--GC-CCG-TTCA--G--A--TTATGTG--T-T--A---CGGCCC
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gi|18942                      : tAAACTCA--CATATTT-T----A-TT-AAAA--TT-A-AA-T-CT---A--TTTCT--ACT--G----A-AT-AA----CAT--GTG--T--GT-TTA-TTCA--G--ATTTTTTGTG--T-T--G---TGCACC
gi|18953                      : tAAACACC--CATATTT-G----A-TT-AAAA--TT-C-AT-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----AAT--GTG--A--GG-CCA-TTCA--ACTA--TTTTG----T-T--G---CGC
gi|18983                      : tAAACTCT--CATAGTTAT----A-AT-ACAA--TT-C-AC-T-TT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CCT--GCG--T--GC-TCT-ATCA--G-----TTTTGTG--T-T--G---CCCCC
gi|18963                      :  AAACGTC--CAT-GTT-T----A-TT-TTAA--TT-C-AC-TCGT---G--TTTCG--ACT--G----A-AA-TA----TAT--GTG--T--GC-CCG-TTCATTT--T--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|18965                      : tAAATTCC--CATATTT-T----A-TT-AAAA--TT-C-AC---AT--------TC---ACT--G----A-TG-AA----CAT--GTG--T--GA-ACG-TTCA--G--A--TTTTG
gi|18964                      : tAAACTCT--CATATTT-T----A-TC-AAAA--TT-A-AA-T-GT---A--TTTTT--TCC--T----G-AATAA----CAT--GTG--T--GC-TTA-TTCA--T--A--TTTTGTATTT-T--G---CACC
gi|18985                      :  tAACTCC--CATATTT-T----A-TT-AAAA--TT-C-AT-T-AT---A--TTTCT--ACTG-T----A--A-AA----CAT--GGG--T--GC-CTG-TTCT--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|18991                      :   AACTCC--TTTATTT-G----A-TT-AAAA--TT-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AG----CAT--GTG--T--GC-CCG-TTCA--C--A--TCTTTTA--T-T--G---TGCTCC
gi|18989                      :   AACTTC--CATATTT-T----A-TT-AAA---TC-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----C-AA-AA----TAT--GTG--T--GC-CCA-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--GTGTTGCCCC
gi|18999                      :   AAC-CT--TATATTT-A----A-TT-AAAA--TC-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AAAAAACAA--GTG--T--GC-CCG-TTCA--G--A--TTTTGTA--G-T--G---CGGCCC
gi|18987                      :   AGCTCC--CATATTT-T----A-TC-AAAA--TA-C-AC-T-AT---A--TTTAT--ACT--G----A-AA-AAAAT-CAT--GTG--T--GC-CCA-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-C--G---CGCC
gi|18986                      :   AACTCC--CGTATTT-T----A-TT-AAAA--TC------T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AG-AA----CAT--GTG--T--GT-CCG-TTCA--G--A--CTCTGTG--T-T--A---CGCCC
gi|18988                      :   AACTCT--CATATTC-T----A-TT-TAAA--TA-C-AC-T-AT---A--TATCT--ACT--G----ATAA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCA-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CGCC
gi|18990                      :   AACACC--CATATTT-G----A-TT-AAAA--TC-C-AC-T-AT---A--ATTTT--ACT--G----A-AG-AA----CAT--GTG--T--AC-CCA-TTCA--G--A--TTTTGCG--T-T--G---CGCC
gi|18995                      :   AACTCC--TATGTTT-T----A-TT-GAAA--TT-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AG----CAT--GTG--T--AC-CCG-TTCA--G--A--TTT
gi|18992                      :   AACTCC--GATATTT-T----A-TT-AAAA--TA-A-AT-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CAT--GCG--T--GC-TCG-TTCA--A--A--TTTTGTG--A-T--G---CATCCC
gi|18994                      :   AACTCC--TATA-TT-T----A-TT-AAAA--TT-C-AC-A-AT---A--TTTTT--GCT--G----A-AA-TA----CAT--GTG--T--GC-CTG-TTCA--T--A--TTTTGTG--T-TTCG---CGCCTC
gi|18997                      :   AACTCC--CATATTT-A----A-AC-AAAA--TC-C-GC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CAT--GCG--C--GC-CCG-TTCA--G--A--GTTTACA--T-T--C---CGCCC
gi|18998                      :   AACTCC--CATATGT-T----A-TT-AAAA--TG-T-AT-T-AT---A--TTTCT--ACT---------GA-AA----CAT--GTT--T--GC-CCG-TTCG--G--A--TTTTGTG--A-G--G---CACCCC
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gi|19001                      :   AACTCC--TACATTT-T----A-TC-AAAA--AT-T-AC-T-AT---A--TTTCT--ACTG-T----A--A-AA----CAT--GTG--T--GC-TCG-TTCA--A--A--TTGTGTG--C-T--G---C
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gi|18993                      :   AGCTCT--CATATGT-T----A-TT-AAAA--TT-T-AC-T-AT---A--TTACA--ACC--G----A-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCT-TTTA--G--A--TTTTATG--T-T--G---TGCCCCagtttcttccc
gi|19005                      :   AACTCC--TACTGTT------A-TT-AAAA--TG-T-AT-T-AT---A--TTTCT--ACT---------GA-AA-----AT--GTG--TTTGC-CCG-TTAA--T--A--TTTTGTG--T-T--G---CGACCC
gi|19003                      :   AACTCC--CATTTGT-T----A-TT-TAAA--TG-C-AT-T-AT---A--TTTTT--ACT--G----A--A-AA----CGT--GTT--T--GC-CCG-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---C
gi|19004                      :   AACTCC--CACA-TT-T----A-TT-AAAA--TT-T-AC-T-AT---A--TTTCT--AA--------A-GA-AAA---CAT--GTG--T--GC-CTT-TTCA--G--A--TTTTAT
gi|18954                      :   AAATCC--CATATTT-T----T-TT-AGAA--TT-C-AC-T-A---------------CT--G----A-AA-AA----TAT--GTG--T--GC-GCA-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--A---CGTCCCg
gi|19008                      :  tAACTCG--TGT-GTT-TG---A-TT-AGAA--TT-C-AC-T-GT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CAA--GTG--T--GC-ACG-TTCA--T--A--ATTTGT
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gi|19006                      :   AACTCCCATATAGT-------G-TT-AAA---TG-C-AT-T-TT---A--TTTAT--AAT--G----A--A-AA----CAT--GTT--T--GC-CCA-TTTA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---TGTCCC
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gi|18944                      :    ATTCC--TATATTT-T----A-TT-CAAA--TC-C-AC-T-AT---A--TTTCT--TCTGAC----A-AA-AA----CAT--GTG--T--AC-AT--TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CACCCC
gi|19014                      : tacACCCC--CATATTT-G----A-TT-AAAA--TC-A-AC-T-AA---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CA----TG--T--GC-TCA-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CCCCCC
gi|19015                      :    ACTCC--TATATTT-T----A-TC-AAAA------------AT---A--TTTCT--ACT--G----G-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCA-TTCA--G--A--TTTTCGG--T-T--G---TGCCCC
gi|19016                      :    ACTAC--TATATCT-T----A-TC-AAAA--TC-C-AC-A-AT---A--TTTCT--ACT--T----G-AA-AA----CAT--TTG--T--GC-CCG-TTGA--G--A--TATTGAG--T-T--G---CTCTCC
gi|19022                      :     CTCC--TATATTT-T----A-TT-AAAC--CC-A-AC-T-AT---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CCA-TTCA--T--A--TTTTGTA--T-T--G---CGCCTC
gi|19021                      :     CCCC--CATATTT-T----A-TT-AAAA--TT-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ATT--G----A-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CTG-TTAA--A--A--TTTTGTA--T-T--G---TGCACC
gi|19023                      :     CTCC--TAGATTT-T----A-TT-AAAA--AT-C-AC-T-AT---A--TTTCT--ACC--G----A-AA-AA----TAT--GTG--T--GC-CCG-TTCA--T--G--TTTTGTG--T-T--G---GGTCCC
gi|19024                      :     CTCC--AATATTT-T----A-T----AA--TT-C-GC-T-AT---A--TTTCT--GCT--G----A-AA-AC----CAT--GTA--T--GT-CCG-TCCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CGCC
gi|19017                      :     CTCC--T----CT-T----A-TT-ATAA--TG-A-AT-C-AT---A--TTTCT--ACT---------GA-AA----CATATGTG--T--GC-CCG-TTCA--G--A--GTTTGTG--T-T--G---TG
gi|18921                      : accccTCC--TATATTT-TTTTAA-TT-AAAA--TT-C-AC-T-AC---A--TTTCT--ACT--G----A-AA-AA----CAT--GTG--T--GC-CTG-TTCA--G--A--TTTTGTG--T-T--G---CACTCC
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gi|19026                      :      TCC--TATATTT-T----A-CC-AAAA--TT-T-AC-T-AT---T--TTACT--ACT--A----A-AA-AA----CAT----G--T--GC-CCG-TTCA--A--A--TTTTGTG--T-T--G---TGCTCC
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Reference ( family-242 )      :         AAACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
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gi|18925                      :        tAAACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACC-AT---A--T-TTCT-A-CA---G----A-AA-A-A---C--GTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-
gi|18926                      :         tAAATTCCATATTG-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AA---A--T-ATCC-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTAC-TCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---TGCCC
gi|18927                      :        tAAACTCC-ATATTT-T----A-GT-AAAA-A-T-C-ACT-TT---A--T-TTCT-A-CC---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTCA--AC--TTTTGGG--T-T--G---CGCCC
gi|18928                      :        tAAAATTCTGTAGTT-T----A-TT-AAAG-T-T-A-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----C-AA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TGCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCC
gi|18929                      :        tAAATTCCAACTTTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TCCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGCATGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTA--T-T--G---
gi|18930                      :        tAAAATCCTATATTT-A----A-TC-AAAA-T-T-C-ACA-GT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-------TGTGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCTCC
gi|18931                      :        tAAGCTCCTATATTG-T----A-TT-AAAA-T-T-T-ACT-AT---A--T-TTCT-A-ATA--A----A-AA-A-A---CGTGTGTGC-CAA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGTCC
gi|18932                      :        tAAATTTCCATACTT-A----A-TA-AACA-------ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTTA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCC
gi|18933                      :               tCATATTT-G----A-AT-AAAA-T-C-C-TCT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTAA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CACACC
gi|18934                      : taaagtatAAATTCGTACATTT-T----A-TT-AAAA-T-C-A-ACT-AT---A--C-TTCT-A-CT---C----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCC--GA--TTTTGTG--T-T--G---TGCCTC
gi|18935                      :        tAAACTCCGATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-A----------------CT---G----A-AA-A-A---C---TGTGC-CCG-TTTA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|18936                      :        tAAACTTTTATATTT-T----A-TT-ACAA-T-T-C-ATT-AT---A--T-ATAC-A-CT---G----A-GA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CACCCC
gi|18937                      :        tAAACTTCCATATTT-T----A-TT-ATAA-T-T-C-ACA-AT---A--T-TTCT-A-AT---G----A-AA-A-A---C--GTATAC-CAG-TTCA--GA--TTATGTG--T-T--G---CACCCC
gi|18938                      :         tAAATTCCATATTG-T----T-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AA---A--T-ATCC-A-CT---G----A-AA-A-T---CATGTGTAC-TCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---TGCCCC
gi|18939                      :        tAAACTCCCACATTT-G----A-TC-CAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-CTAT-A-CT---G----A-AA-A-A---CACATGTGT-CCG-TTCA--GA--TATTTTG--T-T--G---CGTCC
gi|18941                      :        tAAACTGGTATATTT-T----A-CT-TAAA-T-C-C-ACT-AT---A--T-TTAT-A-CT---G----A-AA-A-A---C--GTGTGC-CCG-TTCG--GA--TTTTGTG--T-A--G---CGCTCC
gi|18942                      :        tAAACTCACATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-A-AAT-CT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AT-A-A---CATGTGTGT-TTA-TTCA--GATTTTTTGTG--T-T--G---TGCACC
gi|18943                      :        tAAACTCCCATATTT-G----A-TT-TAAA-T-T-C-ACT-AC---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCGTTTTA--GA--
gi|18944                      :          tATTCCTATATTT-T----A-TT-CAAA-T-C-C-ACT-AT---A--T-TTCT-T-CT---GAC--A-AA-A-A---CATGTGTAC-AT--TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CACCCC
gi|18945                      :      tacAAACTCCCGTATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-TT---A--T-TTCA-A-AT---G----A-AA-A-A---CATTTATGC-CCG-TTCA--AA--TTTTGT
gi|18946                      :        tAAACTCCAATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-TT---A--T-TTCT-A-CT---G------AA-A-A---TAAGTGTGC-CCA-TTCA--GA--TTGTGTG--
gi|18947                      :        tAAACTCCCACATGT-T----A-TT-AAAA-T-G-C-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G------AA-A-T---TGTGTTTGC-CCG-TTCA--GA--TATTGTA--T-T--G---TGTCCC
gi|18948                      :        tAAACTTCCATATGT-T----A-TT-AAAA-T-G-C-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G------AA-A-A---CGTGTTTGT-TAG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---C
gi|18949                      :        tAAACTCCCATATTT-G----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---GT---A-AACA-A---CATGTGTGCGCTT-TTCA--TA--TATTCAG--T-T--G---TGCTCC
gi|18950                      :        tAAACTTCCATAGTT-G----A-TA-AAAA-T-C-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---GAAAAA-AA-A-A---CATAAGTGC-CTG-TTCA--GC--TTTTTTG--T-T--G---CGTCC
gi|18952                      :        tAAAATCCTATATGT-T----A-CT-AAAA-T-G-C-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G------AA-A-A---CGTTTTTGC-CTG-TTCA--GG--TTTTGTG--T-T--G---CACTCC
gi|18953                      :        tAAACACCCATATTT-G----A-TT-AAAA-T-T-C-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---AATGTGAGG-CCA-TTCA--AC--TATTTTG--T-T--G---CGC
gi|18954                      :         tAAATCCCATATTT-T----T-TT-AGAA-T-T-C-ACT-A----------------CT---G----A-AA-A-A---TATGTGTGC-GCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--A---CGTCCC
gi|18955                      :        tAAACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-C-C-CCT-TT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-T-A---CATGTGTGC-CCT-TTCA--TA--ATATGTG--T-
gi|18956                      :        tAAACTCCTACATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-GT------T-TTTT-A-CA---A----A-TA-A-A---CATGTGTGC-CCT-TTCA--TA---TTTGTG--T-T--G---TTCCCC
gi|18957                      :        tAAACTCACATATTT-T------TT-ATAA-T-C-C-ATT-AC---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-G---CATATGAGC-CAC-TTCA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGCACC
gi|18958                      :        tAAACTCCCATATGT-T----A-TT-AAAA-T-A-C-ATT-TT---A--T-ATTT-A-CT---G-------A-A-A---CGTGTTTGC-TCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CTCCC
gi|18959                      :        tAAACTCCAATATGT-C----A-TT-ATAA-T-G-C-ATT-AT---A--T-TTCA-A-CT---G----A-AA-A-----CGTGTTTGC-CCG-TTCA--GA--TTATGTG--T-T--A---CGGCCC
gi|18960                      :             tCCTATAATT-T----A-TT-GAAA-T-T-C-ATT-AT---A--T-TTCT-G-CT---GAA--A-AA-A-A---CATGTATGC-CAG-TTTA--GA--CTTTAAG--T-T--G---CACCCC
gi|18961                      :   taaaaaAAATTCTCGTACTT-T----A-AG-AAAA-T-C-C-ACT-GT------T-TCTT-AGCT---G----A-AA-A-T---CATGTGTGA-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCC
gi|18962                      :        tAAACTCT-ATATTT-T----A-TT-CAAA-T-T-T-ACT-AA---A--T-GTCT-A-CT--------A-AA-A-A---CCTGTGTGT-CCG-TTCA--TATTTTTTGTG--T-T--G---CG
gi|18963                      :        tAAACGTCCATGTTT------A-TT-TTAA-T-T-C-ACTCGT---G--T-TTCG-A-CT---G----A-AA-T-A---TATGTGTGC-CCG-TTCATTTT--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|18964                      :        tAAACTCTCATATTT-T----A-TC-AAAA-T-T-A-AAT-GT---A--T-TTTTTC-CT---G----A-AT-A-A---CATGTGTGC-TTA-TTCA--TA--TTTTGTATTT-T--G---CACC
gi|18965                      :        tAAATTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-AC-------A--T-T--C-A-CT---G----A-TG-A-A---CATGTGTGA-ACG-TTCA--GA--TTTTG
gi|18978                      :        tAAACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-C-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---TATGTTTGC-CTG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CACACC
gi|18979                      :         AAACTCCTATAGTT-T----A-TT-AAAA-T-C-C-ACT-AT---G--T-TTCT-A-CT---T----A-GA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTA--T-T--G---CGCCCC
gi|18980                      :         AAACTCTCATATTT-T----A-TT-AAGA-T-T-C-ACT-AC---A--T-TTAT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CTG-TTTA--GA--TTGTGTG--T-T--G---CGTCCC
gi|18981                      :         AAACTCCCACATTT-C----A-TT-TAAA-T-T-T-ACT-AT---A--T-ATCT-A-CTAAAA----A-AA-A-A---CATGTGTGC-TCA-TTCA--GA--TTTTGTG--C-T--A---CGC
gi|18982                      :         AAACTCCTACCTTC-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT--T---A--TGTTTT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAGGTGTGC-TCG-TTCA--GT--TTTTTTG--T-T--G---CGCCC
gi|18983                      :         AAACTCTCATAGTTAT----A-AT-ACAA-T-T-C-ACT-TT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CCTGCGTGC-TCT-ATCA--G---TTTTGTG--T-T--G---CCCCC
gi|18985                      :          AACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----T-AA-A-A---CATGGGTGC-CTG-TTCT--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|18986                      :          AACTCCCGTATTT-T----A-TT-AAAA-T------CT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AG-A-A---CATGTGTGT-CCG-TTCA--GA--CTCTGTG--T-T--A---CGCCC
gi|18987                      :          AGCTCCCATATTT-T----A-TC-AAAA-T-A-C-ACT-AT---A--T-TTAT-A-CT---G----A-AA-A-AAATCATGTGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-C--G---CGCC
gi|18988                      :          AACTCTCATATTC-T----A-TT-TAAA-T-A-C-ACT-AT---A--T-ATCT-A-CT---G----ATAA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCC
gi|18989                      :          AACTTCCATATTT-T----A-TT-AAA--T-C-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----C-AA-A-A---TATGTGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--GTGTTGCCCC
gi|18990                      :          AACACCCATATTT-G----A-TT-AAAA-T-C-C-ACT-AT---A--A-TTTT-A-CT---G----A-AG-A-A---CATGTGTAC-CCA-TTCA--GA--TTTTGCG--T-T--G---CGCC
gi|18991                      :          AACTCCTTTATTT-G----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-G---CATGTGTGC-CCG-TTCA--CA--TCTTTTA--T-T--G---TGCTCC
gi|18992                      :          AACTCCGATATTT-T----A-TT-AAAA-T-A-A-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGCGTGC-TCG-TTCA--AA--TTTTGTG--A-T--G---CATCCC
gi|18993                      :          AGCTCTCATATGT-T----A-TT-AAAA-T-T-T-ACT-AT---A--T-TACA-A-CC---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCT-TTTA--GA--TTTTATG--T-T--G---TGCCCC
gi|18994                      :          AACTCCTATATTT------A-TT-AAAA-T-T-C-ACA-AT---A--T-TTTT-G-CT---G----A-AA-T-A---CATGTGTGC-CTG-TTCA--TA--TTTTGTG--T-TTCG---CGCCTC
gi|18995                      :          AACTCCTATGTTT-T----A-TT-GAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-G---CATGTGTAC-CCG-TTCA--GA--TTT
gi|18996                      :          AACTCCTATATTT-T----A-TA-AAAA-AAT-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---AATGTGAAC-ACG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CACC
gi|18997                      :          AACTCCCATATTT-A----A-AC-AAAA-T-C-C-GCT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGCGCGC-CCG-TTCA--GA--GTTTACA--T-T--C---CGCCC
gi|18998                      :          AACTCCCATATGT-T----A-TT-AAAA-T-G-T-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G-------A-A-A---CATGTTTGC-CCG-TTCG--GA--TTTTGTG--A-G--G---CACCCC
gi|18999                      :          AAC-CTTATATTT-A----A-TT-AAAA-T-C-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---GAAAAA-AA-A-A---CAAGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTA--G-T--G---CGGCCC
gi|19000                      :          AACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-C-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-AT---G----A-AA-A-A---CTTGTAGGC-CTT-TTCA--GA--TTTTGAG--T-T--T---CTTCCC
gi|19001                      :          AACTCCTACATTT-T----A-TC-AAAA-A-T-T-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----T-AA-A-A---CATGTGTGC-TCG-TTCA--AA--TTGTGTG--C-T--G---C
gi|19002                      :          AATTCCCATATTT-T----AATT-AAAA-A-C-CTACT-AT---G--T-TTCT-G-CT---G----A-AA-AAA---CATGTGTAC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-A--A---CACCCC
gi|19003                      :          AACTCCCATTTGT-T----A-TT-TAAA-T-G-C-ATT-AT---A--T-TTTT-A-CT---G----A-AA-A-----CGTGTTTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---C
gi|19004                      :          AACTCCCACATTT------A-TT-AAAA-T-T-T-ACT-AT---A--T-TTCT-A-AA---G------AA-A-A---CATGTGTGC-CTT-TTCA--GA--TTTTATG--
gi|19005                      :          AACTCCTAC-TGT-T----A-TT-AAAA-T-G-T-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-----TGTGTTTGC-CCG-TTAA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGACCC
gi|19006                      :          AACTCCCATATAG-T----G-TT-AAA--T-G-C-ATT-TT---A--T-TTAT-A-AT---G----A-AA-A-----CATGTTTGC-CCA-TTTA--GA--TTTTGTG--T-T--G---TGTCCC
gi|19007                      :          AACTCGTGTGTTT-G----A-TT-AGAA-T-T-C-ACT-GT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAAGTGTGC-ACG-TTCA--TA--ATTTGT
gi|19008                      :          AACTCGTGTGTTT-G----A-TT-AGAA-T-T-C-ACT-GT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAAGTGTGC-ACG-TTCA--TA--ATTTGT
gi|19013                      :           ACTCAGATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---G--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CACATGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CACCCC
gi|19014                      :           ACCCCCATATTT-G----A-TT-AAAA-T-C-A-ACT-AA---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CA--TGTGC-TCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CCCCCC
gi|19015                      :           ACTCCTATATTT-T----A-TC-AAAA-----------AT---A--T-TTCT-A-CT---G----G-AA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTCGG--T-T--G---TGCCCC
gi|19016                      :           ACTACTATATCT-T----A-TC-AAAA-T-C-C-ACA-AT---A--T-TTCT-A-CT---T----G-AA-A-A---CATTTGTGC-CCG-TTGA--GA--TATTGAG--T-T--G---CTCTCC
gi|19017                      :           ACCCCCTCCTCT-T----A-TT-ATAA-T-G-A-ATC-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-C-A---TATGTGTGC-CCG-TTCA--GA--GTTTGTG--T-T--G---TG
gi|19021                      :            CCCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-TT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CTG-TTAA--AA--TTTTGTA--T-T--G---TGCACC
gi|19022                      :            CTCCTATATTT-T----A-TT-AAAC-C-C-A-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCA--TA--TTTTGTA--T-T--G---CGCCTC
gi|19023                      :            CTCCTAGATTT-T----A-TT-AAAA-A-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CC---G----A-AA-A-A---TATGTGTGC-CCG-TTCA--TG--TTTTGTG--T-T--G---GGTCCC
gi|19024                      :            CTCCAATATTT-T----A-T----AA-T-T-C-GCT-AT---A--T-TTCT-G-CT---G----A-AA-A-C---CATGTATGT-CCG-TCCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCC
gi|19025                      :             TTCTATATTT-G----A-TT-AAAA-T-T-C-GCT-ATTATA--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAGGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CCCCC
gi|19026                      :             TCCTATATTT-T----A-CC-AAAA-T-T-T-ACT-AT---T--T-TACT-A-CT---A----A-AA-A-A---CA--TGTGC-CCG-TTCA--AA--TTTTGTG--T-T--G---TGCTCC
gi|19027                      :              CCCATATTT-T----A-TC-AAAA-T-T-C-ACT-TT---A--T-ATCT-G-CT---G----A-AA-T-----CATGAGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCC
gi|19030                      :                 ATATTT-C----A-TT-AAAA-T-T-C-AGT-AT---A--T-TTCT---CT---G----A-AA-A-----TATGTTTAC-CCG-TTCA--GA--TTCTGTG--T-T--G---C
gi|19031                      :                 ATATTC-T----A-TA-AAAAAT-T-C---T-AA---A--T---CT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTCA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19032                      :                 ATATTT-C----A-TT-AAAA-T-T-C-ACC-AC---A--T-CTCT-A-CT---G------AA-A-T---CATGCGTGC-CCG-TTCA--GT--TATTGTG--T-T--G---AGCCCC
gi|19033                      :                     TT-T----A-TA-AAAA-A---C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATATGTGC-TCG-TTCA--GA--TTATGTG--TCT--G---CCCCC
gi|19034                      :                     TC-T----A-TT-GCAA-T-TTC-TCT-AT---ACAT-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---TATGCGTGC-CCG-TTTA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19035                      :                     TT-T----A-TT-AAAA-T-G-A-AAT-AT---A--T-TTCT-A-CT---GCT--G-AA-A-A---CATGTTTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTA--T-T--G---TG
gi|19038                      :                                 -AAAA-CAT-C-ACT-TT---A--T-TGCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGT-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19039                      :                                 -AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-TT---C----A-AA-A-A---CATGTGTGC-TTG-TTCA--GA--TTTTATG--A-T--G---
gi|19047                      :                                                  T---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---GATGTGTGC-ATG-TTCA--GAC-TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19048                      :                                                             CT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTAC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--A---CGCCCC
gi|19049                      :                                                             CT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTAC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--A---CGCCCC


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Reference ( family-242 )      :         AAACTCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
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gi|19004                      :          AACTCCCACATTT------A-TT-AAAA-T-T-T-ACT-AT---A--T-TTCT-A-AA---G------AA-A-A---CATGTGTGC-CTT-TTCA--GA--TTTTATG--
gi|19005                      :          AACTCCTAC-TGT-T----A-TT-AAAA-T-G-T-ATT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-----TGTGTTTGC-CCG-TTAA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGACCC
gi|19006                      :          AACTCCCATATAG-T----G-TT-AAA--T-G-C-ATT-TT---A--T-TTAT-A-AT---G----A-AA-A-----CATGTTTGC-CCA-TTTA--GA--TTTTGTG--T-T--G---TGTCCC
gi|19007                      :          AACTCGTGTGTTT-G----A-TT-AGAA-T-T-C-ACT-GT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAAGTGTGC-ACG-TTCA--TA--ATTTGT
gi|19008                      :          AACTCGTGTGTTT-G----A-TT-AGAA-T-T-C-ACT-GT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAAGTGTGC-ACG-TTCA--TA--ATTTGT
gi|19013                      :           ACTCAGATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---G--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CACATGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CACCCC
gi|19014                      :           ACCCCCATATTT-G----A-TT-AAAA-T-C-A-ACT-AA---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CA--TGTGC-TCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CCCCCC
gi|19015                      :           ACTCCTATATTT-T----A-TC-AAAA-----------AT---A--T-TTCT-A-CT---G----G-AA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTCGG--T-T--G---TGCCCC
gi|19016                      :           ACTACTATATCT-T----A-TC-AAAA-T-C-C-ACA-AT---A--T-TTCT-A-CT---T----G-AA-A-A---CATTTGTGC-CCG-TTGA--GA--TATTGAG--T-T--G---CTCTCC
gi|19017                      :           ACCCCCTCCTCT-T----A-TT-ATAA-T-G-A-ATC-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-C-A---TATGTGTGC-CCG-TTCA--GA--GTTTGTG--T-T--G---TG
gi|19021                      :            CCCCCATATTT-T----A-TT-AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-TT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CTG-TTAA--AA--TTTTGTA--T-T--G---TGCACC
gi|19022                      :            CTCCTATATTT-T----A-TT-AAAC-C-C-A-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCA-TTCA--TA--TTTTGTA--T-T--G---CGCCTC
gi|19023                      :            CTCCTAGATTT-T----A-TT-AAAA-A-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CC---G----A-AA-A-A---TATGTGTGC-CCG-TTCA--TG--TTTTGTG--T-T--G---GGTCCC
gi|19024                      :            CTCCAATATTT-T----A-T----AA-T-T-C-GCT-AT---A--T-TTCT-G-CT---G----A-AA-A-C---CATGTATGT-CCG-TCCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCC
gi|19025                      :             TTCTATATTT-G----A-TT-AAAA-T-T-C-GCT-ATTATA--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CAGGTGTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CCCCC
gi|19026                      :             TCCTATATTT-T----A-CC-AAAA-T-T-T-ACT-AT---T--T-TACT-A-CT---A----A-AA-A-A---CA--TGTGC-CCG-TTCA--AA--TTTTGTG--T-T--G---TGCTCC
gi|19027                      :              CCCATATTT-T----A-TC-AAAA-T-T-C-ACT-TT---A--T-ATCT-G-CT---G----A-AA-T-----CATGAGTGC-CCA-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCC
gi|19030                      :                 ATATTT-C----A-TT-AAAA-T-T-C-AGT-AT---A--T-TTCT---CT---G----A-AA-A-----TATGTTTAC-CCG-TTCA--GA--TTCTGTG--T-T--G---C
gi|19031                      :                 ATATTC-T----A-TA-AAAAAT-T-C---T-AA---A--T---CT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGC-CCG-TTCA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19032                      :                 ATATTT-C----A-TT-AAAA-T-T-C-ACC-AC---A--T-CTCT-A-CT---G------AA-A-T---CATGCGTGC-CCG-TTCA--GT--TATTGTG--T-T--G---AGCCCC
gi|19033                      :                     TT-T----A-TA-AAAA-A---C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATATGTGC-TCG-TTCA--GA--TTATGTG--TCT--G---CCCCC
gi|19034                      :                     TC-T----A-TT-GCAA-T-TTC-TCT-AT---ACAT-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---TATGCGTGC-CCG-TTTA--TA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19035                      :                     TT-T----A-TT-AAAA-T-G-A-AAT-AT---A--T-TTCT-A-CT---GCT--G-AA-A-A---CATGTTTGC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTA--T-T--G---TG
gi|19038                      :                                 -AAAA-CAT-C-ACT-TT---A--T-TGCT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTGT-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19039                      :                                 -AAAA-T-T-C-ACT-AT---A--T-TTCT-A-TT---C----A-AA-A-A---CATGTGTGC-TTG-TTCA--GA--TTTTATG--A-T--G---
gi|19047                      :                                                  T---A--T-TTCT-A-CT---G----A-AA-A-A---GATGTGTGC-ATG-TTCA--GAC-TTTTGTG--T-T--G---CGCCCC
gi|19048                      :                                                             CT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTAC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--A---CGCCCC
gi|19049                      :                                                             CT-A-CT---G----A-AA-A-A---CATGTGTAC-CCG-TTCA--GA--TTTTGTG--T-T--A---CGCCCC