lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              11111111111                                                      1                                                           
lowQualScore                  :  5           0 111 111  0 00  0    1111111 0 2222222  0  00 1111   11   00 222222 0 0 000 111 55555555555555 44444444 111 222   33333 1111 2222222   00 0   00 111 1 1111111 11111111111  111111 0 0 0 00 1 77777777777777777 11111 00  0 0 0 3  0 0     1   0 0 00 1111      000     0   00    2         
lowQualScore                  :  .           . ... ...  . ..  .    ....... . .......  .  .. ....   ..   .. ...... . . ... ... .............. ........ ... ...   ..... .... .......   .. .   .. ... . ....... ...........  ...... . . . .. . ................. ..... ..  . . . .  . .     .   . . .. ....      ...     .   ..    .         
lowQualScore                  :  3           5 000 000  5 88  5    8888888 6 6666666  5  77 6666   99   77 888888 5 5 999 999 44444444444444 99999999 444 222   99999 0000 1111111   77 5   77 666 0 6666666 11111111111  444444 5 5 9 66 4 00000000000000000 66666 66  4 4 4 2  4 4     7   4 4 66 0000      888     5   77    5         
consensus                     : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
Reference ( gi|54701 )        : TCTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--G--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-ATGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54697                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54699                      : TCTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----C-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCAATTC
gi|54698                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----A--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTC
gi|54700                      : TTTGGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----TA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------AA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54702                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------CA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-TTA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-ACGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TAAAC-ATT--AGATTCAGCCATTC
gi|54704                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-A-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GT--TC---TCAAT-ATT--
gi|54707                      : TTTAATTTAAACA-T---A---TT-T--AA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----GCA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---A-A-TAG----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-A-------A--A--------AT------A-C-A-A--A-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AATG-A-TCT-G-CC--C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54705                      : TTTAGTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--AAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--AC-A-A-AAGT-G-TTTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-CTT--
gi|54709                      : TTTATTTCAAACA-T---A---TA-T--TT-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------TGCATGT--A---T-G-TAT----TA----T-------GTT--T-ATA--TG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-A------TT---------A-----G--GT-A-A-AATG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACAGCCATTC
gi|54710                      : TTTAGTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTAC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------AATAT-A-TAT----CG----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------G--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----
gi|54712                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTTC-------T-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-G---C---A-------T------T--------A---T-A-TGT----TG----C-------GCA--T-GTT--GA--T-C-------A--T--------AT------A-C-G-A--G-T------AT---------A-----G--GA-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAT-ATC--AGATACGGCAATTC
gi|54716                      : TTTAATTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------C------T--------A---T-A-TAT----TATAACT-------GTA--T-ATA--AG--T-C-------A--G--------AT------A-T-A-A--T-G------TA---------A-----G--GC-A-A-A-GG-G-TCTGG-TCA-C-A--A----G
gi|54714                      : TTTGGTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-A-T---C---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA--T-ATA--AA--T-C-------A--T--------AT------A-C-A-A--T-T------TT---------A-----G--GC-A-C-AAGG-G-TCTTG-CCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54713                      : TTTGGTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-A-T---C---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA--T-ATA--AA--T-C-------A--T--------AT------A-C-A-A--T-T------TT---------A-----G--GC-A-C-AAGG-G-TCTTG-CCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54718                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------T-T-------TT-TA--A---------CAT--A------T-------------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA--T-ATA------------------------------------------------------TA---------A-----G---C-A-A-AAGG-G-TTGGA-CCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54719                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------T---------TT-TT--A----ACA--TAT--A------TAT-A---T---AT------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ATA--T-ATA--TA--TAT-------A--C--------AT------A-C-ATA--T-A------TA---------A--------GC-A-A-AAGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--A
gi|54715                      : TTTGGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC------------------------------------------------------C---A-------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA--T-ATA--------------------------------------------------------------------------GC-A-A-ATGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54722                      : TTTAGTTTTAACA-C---A---TT-T--TA-TTTC-------A-A-------TA-TA--A----ACA--CAG--A------T-T-T---C---A-------A------T--------A---T-A-TTT----TA----T-------AAA--T-ATA--AA--T-C-------A--G--------AA------A-C-A-G--T-T------T----------A-----G--AC-A-A-AATG-G-TCTGG-TC
gi|54721                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A--------A-TA--A----AT---------------T-T-A---CA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA--T-ACA--AGAAA-C-------ATTG--------AA------A-T-A-A--T-T-----------------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----CTGCTC---ACCAC-TTT--A
gi|54723                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T---A-TTGC-------T---------TA-TA--ATCGTACAATTAC--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A-----G-TA------G----T-------GTAGCT-ATA--A-------------A--G--------ATTTACAAA-C-ACA--T-A------TA---------A-----G---C-A-A-GAGG-G-TTGGG-TCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGTTACGGCC
gi|54726                      : TTTAGTTTAATCA-T---A---TT-T--TA-TTGTGTAATATT-A-------TG-TT--A----ACAA-CAT--A------T---A---C---A--------------T--------A---T---TAC----CA----T-------TCA--T-ACA--AT--TGC-------A--A--------A---------C-A-A--T-A------TA---------A-----G---C-A-A-ATGG-G-TTTGG-CTA-C-A--C----GTTATT---ACGAC-ATT--AG
gi|54729                      : TTTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC------------------A-TA--AT---TCA--CAT--A------
gi|54724                      : TTTAGTTTATACA-T---A---TT-G--TA-TTGC-------T-T-------TT-TA--A---------CAT--A------T-----------A-------A----------------------------------------------A--T-ATA--A-------------------------AT------A-T-A-A-------------------------------GC-A-A-AAGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGACCCTTCgcaaacgggttgggccacaagttctagcaacattagttacggccatcc
gi|54730                      : TTTACTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTAC-------
gi|54753                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-TTA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTCtttttatatacatgtagtagcaaaagggttgggccacaagttatccaacattaaaatcggctcttc
gi|54755                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-G-------TA-TA--A----AAA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA--T-ATC--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------GA---------A-----T--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAGGCCATTC
gi|54756                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-AA--A----TCA--CAT--A------T-T-A---C---A-----------------------A---T-A-TAT----CA----T-------ACA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----A--GC-A-A-A-GT-G-TCTGG-CCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAC-A-T--AGATATAGCCATTC
gi|54758                      :   TAGTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTGT-------C-A-------TA-AA--A----ACA--CAT--ACATGTAT-T-A---C---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------TT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----T--GC-A-A-AAGG-T-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54757                      :   TAGTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTGT-------C-A-------TA-AA--A----ACA--CAT--ACATGTAT-T-A---C---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------TT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----T--GC-A-A-AAGG-T-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54754                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGT-------C-A-------AAATA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AA--A-C-------A--A--------AA------A-C-A-A--C-T------TA---------T-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-AAT--AGATTCGGCCATCC
gi|54759                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-T--CA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA--T-ATA--AA--T-C-------A-----------AT------A-C-A-A--T-T------TT---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--T----GTTTT--------C-ATA--AGATGCGACCATT
gi|54761                      :   TAGTTTAAACA-T---G---TT-T---A-TTGT-------G-A-------TA-TC--A----ACA--CAT--A------C-T-A---C---A-------A------TCTGCGATTG---T-A-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--TG--T-C-------A--A--------AT------A-A-A-A--T-T------TA---------A-----G--GT-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCATT-T--T----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54760                      :   TAGTTTAACCA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-G-A--T-T------TA---------A-----G--TC-A-A-AAGG-G-TCTGG------------------------TCAAT-ATT--CGATGTGGCCATTC
gi|54762                      :   TAGTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GTA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TT---------A-----G--GC-A-A-AAGG-A-TTTGA-CCT-C-A--A----TTTCTC---CGAAC-ATT--AGAT
gi|54763                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-ATGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------C------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCC--T-ATC--AG--T-C-------A-----------AT------A-A-A-A--T-T------TA---------A-----A--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-A-A--C----GTTCTC---CCAAC-ATT--tc
gi|54764                      :   TAGTT---ACA-TCGCA---TG-T--TA-CTGT-------C-A-------TA-TT--G----GCA--CAT--A------------------------------------------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--TAT------TAG--------A-----G--GT-A-A-AAGG-T-TCTGG-TTA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54765                      :   TAGTT--AACAAT---A---TT-T--TA-TTGC-------C-G-------TA--A--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA--T-ATA--AA--T-A-------A--A--------AC------A-C-A-A--A-T------AT---------A-----G--GC-ATA-AT-G-G-TCAGG-CCA-C-A--A----GTT-TC---TCAAC-ATT--TGATTTAGCCGTT
gi|54738                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTAC-------C-A-------TA-CA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---G---A-------G------T--------G---T-G-CAT-----A----T-------ACT--A-ATA--AA--T-T-------A--T--------TT------A-T-G-A--T-T------AT---------A-----G--GC-A-A-AACT-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTTTC---TGAAC-ATT--AACTGCAGCCATT
gi|54742                      :  tTACTTTAAACA-T---A---TC-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACG--C-----------------------------------------------A---T-A-TAT----CA----T-------GC-----ATA--AG--T-------------------------------C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-ATG------TG--------------------TC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54766                      :  tTAGTTTAAACA-T---A---C------A-T------------G-------TG-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAT----GG----T-------GCA--T-ATA--TA--C-T-------A--T--------AT------A-C-A-G--T-T------AT---------G-----G--GT-A-A-AAGA-G-TCTGA-CCA-C-A--A----ATTCTCATATTACC-ATT--AGATACGGTCATT
gi|54739                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-T-------TT-TA--A-----CA--TAT--A------T-------------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA--T-ATA------------------------------------------------------TA---------A-----G---C-A-A-AAGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54767                      :  tTAGTTTAAACA-T---A---CA-T--TA-TTGC-------T-A-------TA-TA--A----ACA--CCC--A------A-T-G---C---G-------T------T--------A---T-A-TGC----TA----T-------GAA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TG---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCGGG-CCA-
gi|54772                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTGC-------T-A-------TA-TA--A-----CA--CCC--A------A-T-G---C---A-------T------T--------A---T-A-TAC----TA----T-------GAA--T-ATA--AA--T-A-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TG---------A-----G--GC-A-A-ATGG-G-TGGGG-CCA-
gi|54770                      :   TAGTTCGAACA-T---A---GT-T--TA-TTGC-------C-A-------TT-TA--A----GCA--CAT--G------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAA----CA----T-------GCA--T-ATA--TG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------AA---------A-----G--GC-A-A-A
gi|54741                      :   TAGTTTAAACA-T---A---TT-G--CA-TTGT-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CTT--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA--T-A-A--AG--T-A-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-TTACATATA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-A-Ta
gi|54769                      :  tTGGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC------------------------------------------------------C---A-------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA--T-ATA--------------------------------------------------------------------------GC-A-A-ATGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54740                      :   TAGTTTAA-CT-T---G---TT-G--TA-TTGT-------C-A-------TA-AA--A----ATA--CAT------------------------------------T--------A---T-A-AAC----TA----T-------ACA--T-ATA--AG--T-C-------C--A--------AT------A-C---A--C-T------CAT--------A-----G--GC-A-A-GAGG-G-CCTGG-ACA-C-A--A----GTTCTG---TCAAC-ATTTCAGAT
gi|54768                      :  tTAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-AATATATTTA-CA--A----ATATACAT--A------T-T-G---C---AGGCAA--A------C--------A---A-A-AAA----CA----T-------TTA--TTACA--AG------------A--A--------AT------A-----A--T-T-----------------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--A
gi|54748                      :   TAGTTTAAACA-T---A---AT-A--TAATTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAT----GA----T-------GCA--T-ATA--GT--T-C-------A--tttgccat
gi|54745                      :  tTAGTTTAAACA-----A---AT-T--TA-CTGC-------C----------------A----ATA--TAT---------T-T-A---CA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA--T-ACA--AGAAA-C-------ATTG--------AA------A-T-A-A--T-T-----------------A-----G--GC-A-A-AATA-G-TTTGG-TCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--AGTTACGACCAta
gi|54771                      :  tTAGTTTAGACA-T--------T-T--TA-TTAC-------C-AAA-----TA-TA--T----ACA--CAT--A------------------A-------A------T--------A---T---TA-----CA----A-------ACG--T-ACA--AG---------------G--------A-------A-C-T-A--A-A------TA---------A-----A--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCG-C-A--A----GTGCTA---ACTAT-ATT--AGTTAAGGCCAT
gi|54747                      :   TAGTTCAAACA-T---A---TT-T--GA-TTGC-------CAA-------TA-TATTT----ACA--CAT--A----------A---C-----------A------T--------A---TGA-CATGA--CA----A-------GCA--T-ACA--AG---------------G--------A-------A-C-A-A--A-TAA----TA---------A-----T--GC-A-A-AATG-G-TCTAG-CCA-C-A--A----GTGCC-------AC-ATT--AG
gi|54746                      :  tTACTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-T---A----ACA--CAT---------------------G-------A------T------------T-A-TAT----TA----T-------GCA--C-GTA--AA--C-C-------A--T--------AT------A-C-A-A--G-C------AT---------A-----G--AT-C-A-CTGG-G-TCCAG-CCT-T-A--A----CGTCTC---ACCACTATT--ACAT
gi|54744                      :  tTACTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------t
gi|54774                      :   tAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--GGATTCGGCCATTCtttttcatatacatgtaatagcaaaagggtttggccacaagttatccaacattaaaatcggcccttc
gi|54706                      :    AGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------TTTAC----G---T-A-TCT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AACG-G-TCCTG-CCG-T-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--AGATACATCCATTC
gi|54703                      : ttcAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GTA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--AGTTCGTTCTC---CCAAC-ATT--AGA
gi|54776                      : ttaAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-G-A---C---T-------A------T--------A---T-A-AAT----TA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-A-------A--A--------AT------A-T------T-T------TA---------C-----G--GC-G-A-AAGA-G-TCTTG-CCA-C-A--A----ATTCTC---CCAAC-ATC--AGGTACGGCCTTTCatc
gi|54775                      :    AGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-AA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----
gi|54711                      :    AGTTTAAACA-T---A---TT-T--TG-TTGC-------C-A-------TA-TA--G----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---C-A-TAT----TA----T-------GCA--T-TTA--AG--T-C-------A--A--------AC------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--
gi|54777                      : ttaAGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--C----ACA--TAT--A------T-T-A---G---A-------T------T--------A---T-A-TAC----CA----T-------ACA--T-ATA--AA--T-C-------A--C--------AT------A-C-A-A--T-TC-----TA---------A-----G--TT-A-A-A-GG-G-T-------A-------------TCTC---TTAAC-ATT--ATATACGGCTATTC
gi|54725                      :    AGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTGC-------A-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A--------T-A---C---C-------A------A--------A---T-G-CAT----TA----T-------GTA--T-AT
gi|54778                      : tttaGTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------AA-TA--A----ACA--CAT--A------A-T-A---C---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGggccacaagttctatcaacattagatacggccattc
gi|54717                      :     GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TGAC-------C-A-------TA-TA--A----ACG--CAT--A------T-T-A---CACTA-------A------T--------A---T-G-TAT----TG----T-------GCA--A-ATG--AT--T-C-------A--T--------AT------A-C-T-A--T-TA-----TA---------A--------GC-A-A-AAGG-G-T-TGG-TCA-CTAATA----ATTCTC---TCACC-ATC--AGATATTGCAATTC
gi|54720                      : ttttGTTTAATCA-T---AATATTATAGTA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A-----------C--A------T-T-A---C---A--------------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GCA--T-ATA--GA--T-C-------A--T--------AT------A-CGA-A--TGT------T----------------G--GC-A-A-AAGA-G-TCTTG-TCA-C-C--A----GTTCTC---GCAAC-ATT--TGATACGACCATT
gi|54708                      :    tttTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-AA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-G-TAT----TA----C-------GCA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TT---------A-----G--AA-A-A-A-AG-G-TC
gi|54743                      :  tttggTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--G----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------ATACATGT--------A---T-A-TAT----CT----T-------GCA--T-ATA--AG--T-T-------G--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-
gi|54780                      :   ttaaaTATACA-T---A---TT-T--TA-TTGC-------T-G-------TA-TT--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---ATATTATTA------TTA------G---T-A-TAT----TG----C-------GCG--T-ATACGAG--T-C-------A--T--------AT------A-T-G-A--T-G------AT---------A-----G--GT-A-A-AGGG-G-TCTGG-CCA-C-A--C----GTTCTC---TCTAC-AGT--AGATGCGACAATTC
gi|54781                      :        TGAACA-T---G---TT-T--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------C-T-A---G---T-------A------T--------A---TTA-TAT----CA----TATGTTATGCA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------AT------A-T-A-A--T-T------TT---------A-----G--GC-T-A-AAGG-G-
gi|54782                      :        TAATCA-T---A---TC-T--AA-TTAC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--G------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TG----T-------GTA--T-ATC--AA--T-CCTATACGA--GTGTTGTGTAT------ATC-A-A--TCC------TATACGAGTGTA-----G--GC-A-ATAT-G-G-TCTGG-TCA-T-A--A----G--ACC---TCAAC-ATT--AAATACGAGCATTC
gi|54784                      :          AACA-T---A---TT-G--TA-TTGC-------C-A-------TA-TA--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------CA---------A-----G--GC-A-A-AAAG-A-TCTGG-TCA-C-A--A----GTTCTC---ACAAC-ATT--AGGT
gi|54785                      :          AACA-T---A---TG-T--TA-TT-C-------C-T-------TG-TA--T----ACA--CAC--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-AAT----TT----T-------GTA--T-ATA--AA--C-C-------T--T--------AC------A-C-G-A--T-T------AC---------A-----G--GC-A-A-AATG-A-TCTTG-CAA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATACGACCATTCttg
gi|54786                      :          AACG-T---A---TG-T--TA-TT-C-------C-T-------TG-CA--T----ACA--CAC--A------T-T-A---C---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TT----T-------GTA--T-ATA--AA--C-C-------T--T--------AC------A-T-G-A--T-T------AC---------A-----G--GC-A-A-AATG-A-TCTGG-CCA-C-C--A----GATCTC---TCAGC-ATT--
gi|54789                      :                                 TGT-------C-A-------TA-TA--A----ACG--CAT-----------T-A---T---A-------A------A--------AC--T-A-TAT----TA----T-------GTA--T-ATA--AA--C-C-------A--A--------AT------G-C-A-A--T-T------TT---------A-----G--GC-A-A-AGGG-A-TTTGG-CAA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGACACGGCCATT
gi|54791                      :                                                      A-TA--A----ACA--CAT-----------T-A---T---A-------A------T--------C---T-A-TAT----TA----T-------GCA--T-ATA--TA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-T------TA---------------G--GC-A-A-AATA-G-TCTTG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54792                      :                                                     aA-TG--A----ACA--AAT--A------T-G-A---T---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------AAA--T-ATA--CA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--G-T------TT---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATA--AGATACGGCCATT
gi|54793                      :                                                      A-TA--A----ATA--CATTTA------T-T-A---C---A-------T------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GAT--T-ATA--AC--T-C-------A--T--------AT------C-C-A-A--G-TATGA--TA---------ACTGTAG--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--G----GTTTTC---TCAA
gi|54794                      :                                                       -TA--A----ACA--TAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T---TATGA--TA----T-------GTA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--T-A------TT---------A-----G--AC-A-C-AGGG-G-GGTTG-CCA-C-A--A----GATGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATCC
gi|54725                      :                                                       -TA--A----ACA--TAT--G------T-T-ATTGC---A-------A------T--------A---T-A-AA-----CA-------------CA--T-ATA------C-C-------A--A--------AT------G-C-A------T------TA--------------------------TGT-A-TATGG-CCA-C-A--A----GTTCTA---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54797                      :                                                  tttaagtt--A----ACA--CAT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-G-TAT----CA----T-------GCA--T-ATA--AA--T-C-------A--A--------GT------A-C-A-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAAG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAA-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54798                      :                                                                   A--CCT--A------T-T-A---C---A-------A------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA--T-ATA--AC--T-C-------A--A--------AT------A-C-A-A--C-T------TT---------A-----G--AC-A-A-AAGG-G-TCTGG-TCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--TGATACG
gi|54799                      :                                                                       AT--A------T-T-A---T---A-------A------C--------A---T-A-TAC----CA----T-------GCA--T-ATA--AG--T-T-------A--A--------AT------A-C-C-A--T-T------TA---------A-----G--GC-A-A-AAGG-G-TCTGG-CCA-C-A--A----GCTCTC---TCACC-ATT--AGATACGACCAT
gi|54800                      :                                                                        T--A------T-TGA---C---G-------A---------------A---T-T-TTT----CA----T-------TAA--T-GTA--AA--T-C-------T--T--------AT------A-G-G-A--T-T------AG---------A-----G--AC-A-A-AATA-G-TCCGG-TCA-C-C--A----GTGCTC---TCAGT-ATT--AAATACGGCCATTC
gi|54729                      :                                                                            ------T-T-A-------A-------A------C--------A---T-A-TTT----TA----TT------GCA--T-A----AT--T-C-------A--C--------AT------A-------------------------------------GC-A-A-ACGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTA---GCAAC-ATT--AGTTACGGCCATCC
gi|54804                      :                                                                                                                       tttagt-TAC----CA----T-------GC---T-ATG--AG----C-------A--T--------GT------G-C-G-A--T-T------AT---------A-----G--GC-A-A-ACGG-G-TCT---TCT-C-G--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAAGTCATTC
gi|54806                      :                                                                                                                                                    CG--T-ATA--AA----C-------A--T--------AT------A-T-A-AACC-T------TA---------A-----G--AC-A-A-AAGG-G-TCTGA-CAA-C-A--A-------CTC---TCAAC-ATT--AAATACAGCTATT
gi|54744                      :                                                                                                                                                                 --T-C-------A--T--------AT------A-C-A----T-G------TA---------AT----A--GC-A-A-AAGG-G-TTTGG-CCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTC
gi|54810                      :                                                                                                                                                      ttactttaaacatattttattgctttt--------AT------A---A-A--T-T------TAC--------A-----T--G--A-A-ATGG-G-GTTGGGCCA-C-A--A----ATTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54815                      :                                                                                                                                                                               tc--------AT------A-C-A-A--A-T-----------------A-----GTAGC-A-A-AAGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTC
gi|54808                      :                                                                                                                                                                                                     t-A--T-T------TA---------A-----C--ATGA-A-ATGGAG-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCAGCC
gi|54730                      :                                                                                                                                                                                                                         taagcatatttt--GC-A-A-AAGG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCTCTTC
gi|54819                      :                                                                                                                                                                                             tttactttaaacatattttattactttttatatacatgtagtaC-A-A-AAGG-G-TTTGG-CCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAACCGGCCCTTC
gi|54802                      :                                                                                                                                                                                                                                         -A-A-ATGG-GGTCGGG-CCA-C-A--A----GTTTTG---CCAAC-ATT--AGATCCGGCCCTTC
gi|54816                      :                                                                                                                                                                                           attgcaatatttggccttatagttaaattttatttaatatatcatg-A-A-ATGG-G-GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54805                      :                                                                                                                                                                                                                            ataattttacatg-A-A-ATGG-G-GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54812                      :                                                                                                                                                                                                            tacgtttaaacatattttatttcaacatg-A-A-ATGG-G-GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54824                      :                                                                                                                                                                                                                             catattttatttcaacgtgGG-G-TTTGG-CCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54825                      :                                                                                                                                                                                                                                                GG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54829                      :                                                                                                                                                                                                                                                GG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54828                      :                                                                                                                                                                                                                                                GG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54827                      :                                                                                                                                                                                                                                                GG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54826                      :                                                                                                                                                                                                                                                GG-G-TTGGG-CCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54727                      :                                                                                                                                                                                                                                                 G-G-TCGGG-CCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC





Alignments
lowQualScore                  :                                               0         0 111 111  0 00  0   1111111  0 2222222  0  00 1111  0 11   00 222222 0 0  111 44444444444444 44444444 111 222   33333 1111 2222222   222222222 0   11  333333 44444444444   1111    0 0 00 0 555555555 11111 00   11111   33333  00         0 0 00 1111      000     0   00    1         
lowQualScore                  :                                               .         . ... ...  . ..  .   .......  . .......  .  .. ....  . ..   .. ...... . .  ... .............. ........ ... ...   ..... .... .......   ......... .   ..  ...... ...........   ....    . . .. . ......... ..... ..   .....   .....  ..         . . .. ....      ...     .   ..    .         
lowQualScore                  :                                               6         6 000 000  6 88  6   8888888  6 6666666  5  77 1111  5 44   77 888888 5 5  888 66666666666666 99999999 333 222   88888 0000 0000000   666666666 5   33  777777 33333333333   0000    5 5 66 9 222222222 66666 66   55555   33333  66         4 4 66 0000      888     5   66    0         
consensus                     :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
Reference ( family-238 )      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
gi|54697                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54698                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTC
gi|54699                      :                                           TCTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----C-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCAATTC
gi|54700                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------AA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54701                      :                                           TCTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAG----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAT-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54702                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------CA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAC-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TAAAC-ATT--AGATTCAGCCATTC
gi|54703                      :                                           TTAA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--AGTTCGTTCTC---CCAAC-ATT--AGA
gi|54704                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GT--TC---TCAAT-ATT--atc
gi|54705                      :                                           TTTA-GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--AAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--ACA-----AAA-----GT--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-CTT--
gi|54706                      :                                           TTCA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------TTTAC----G---T-A-TCT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----CG--GTCCTGCCG-T-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--AGATACATCCATTC
gi|54707                      :                                           TTTA-ATTTAAACA-T---A---TT-T--AA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----GC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---A-A-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------AAA----ATAC-A-A--A-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCT-GCC--C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54708                      :                                           TTTG-GTT-AAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-G-TAT----TA----C-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--A-A-----AAA-----AG--GTC
gi|54709                      :                                           TTTA-TTTCAAACA-T---A---TA-T--TT-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------TGCATGT--A---T-G-TAT----TA----T-------GTT---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-A------TT-A-----G--GTA-----AAA-----TG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACAGCCATTC
gi|54710                      :                                           TTTA-GTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------AATAT-A-TAT----CG----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CGA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----
gi|54711                      :                                           TTAA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TG-TTG-------CC-A-------TA-TA--G----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---C-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ACAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--
gi|54712                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTT-------CT-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-GC---A-------T------T--------A---T-A-TGT----TG----C-------GCA---------T-GTT--GA------T-----------CAT----ATAC-G-A--G-T------AT-A-----G--GAA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAT-ATC--AGATACGGCAATTC
gi|54713                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-TC---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAT----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----CAA-----GG--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54714                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-TC---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAT----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----CAA-----GG--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54715                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A------------------------------------------------------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA---------T-ATA------------------------------------------------------------GCA-----AAT-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54716                      :                                           TTTA-ATTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------C------T--------A---T-A-TAT----TATAACT-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAG----ATAT-A-A--T-G------TA-A-----G--GC------AAA-----GG--GTCTGGTCA-C-A--A----G
gi|54717                      :                                           TTTT-GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TGA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-G--CAT--A------T-T-ACACTA-------A------T--------A---T-G-TAT----TG----T-------GCA---------A-ATG--AT------T-----------CAT----ATAC-T-A--T-TA-----TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GT-TGGTCA-CTAATA----ATTCTC---TCACC-ATC--AGATATTGCAATTC
gi|54718                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT-T-------TT-TA----------A--CAT--A------T----------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA---------T-ATA------------------------------------------------TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GTTGGACCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54719                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT---------TT-TT--A----AC-A--TAT--A------TAT-AT---AT------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ATA---------T-ATA--TA------TA----------TAC----ATAC-ATA--T-A------TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--A
gi|54720                      :                                           TTT--GTTTAATCA-T---AATATTATAGTA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A------------C--A------T-T-AC---A--------------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GCA---------T-ATA--GA------T-----------CAT----ATACGA-A--TGT------T--------G--GCA-----AAA-----GA--GTCTTGTCA-C-C--A----GTTCTC---GCAAC-ATT--TGATACGACCATT
gi|54721                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A--------A-TA--A----AT----------------T-T-ACA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA---------T-ACA--AGAAACATT-----------GAA----AT---A-A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----CTGCTC---ACCAC-TTT--A
gi|54722                      :                                           TTTA-GTTTTAACA-C---A---TT-T--TA-TTT-------CA-A-------TA-TA--A----AC-A--CAG--A------T-T-TC---A-------A------T--------A---T-A-TTT----TA----T-------AAA---------T-ATA--AA------T-----------CAG----AAAC-A-G--T-T------T--A-----G--ACA-----AAA-----TG--GTCTGGTC
gi|54723                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T---A-TTG-------CT---------TA-TA--ATCGTAC-AATTAC--A------T-T-AC---A-------A------T--------A-----G-TA------G----T-------GTAGC-------T-ATA--AAGATT--TA----------CAA----ACAC-A----T-A------TA-A-----G---CA-----AGA-----GG--GTTGGGTCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGTTACGGCC
gi|54724                      :                                           TTTA-GTTTATACA-T---A---TT-G--TA-TTG-------CT-T-------TT-TA--A-----C-A--TAT--A---------------A-------A------T--------A---T-A---------------------------------------------------------------A----ATAT-A-A-----------------------GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGACCCTTC
gi|54725                      :                                           TTTAAGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CA-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-CC---A-------A-------------------------------A----T-------GCA---------T--TA--TG------T------------------ATA---------------------------------------------------TGGCCA-C-A--A----GTTCTA---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54726                      :                                           TTTA-GTTTAATCA-T---A---TT-T--TA-TTGTGTAATATT-A-------TG-TT--A----ACAA--CAT--A--------T-AC-----------A------T--------A---T---TAC----CA----T-------TCA---------T-ACA--AT------TG----------CAA------AC-A-A--T-A------TA-A--------GCA-----AAT-----GG--GTTTGGCTA-C-A--C----GTTATT---ACGAC-ATT--AG
gi|54727                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            -----AAA-----GGAGGTCGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54729                      :                                                                                 tttggtttaaacatattttatttctatttatatatacag------T-T-A----A-------A------C--------A---T-A-TTT----TA----TT------GCA---------T-A----AT------T-----------CAC----ATA----------------------------GCA-----AAC-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---GCAAC-ATT--AGTTACGGCCATCC
gi|54730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 tttagt--GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCTCTTC
gi|54738                      : tttactttaaacatattttattactttttatatacatgtagtaTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTA-------CC-A-------TA-CA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AG---A-------G------T--------G---T-G-CAT-----A----T-------ACT---------A-ATA--AA------T-----------TAT----TTAT-G-A--T-T------AT-A-----G--GCA-----AAA-----CT--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTTTC---TGAAC-ATT--AACTGCAGCCATT
gi|54739                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-T-------TT-TA--A-----C-A--TAT--A------T----------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA---------T-ATA------------------------------------------------TA-A-----G---CA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54740                      :                                            TTA-GTTTAA-CT-T---G---TT-G--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AT-A--CAT---------------------------------T--------A---T-A-AAC----TA----T-------ACA---------T-ATA--AG------T-----------CCA----ATAC---A--C-T------CATA-----G--GCA-----AGA-----GG--GCCTGGACA-C-A--A----GTTCTG---TCAAC-ATTTCAGAT
gi|54741                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--CA-TTG-------TC-A-------TA-TA--A----AC-A--CTT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-A-A--AG------T-----------AAA----ATAC-A-A--T-TTACATATA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--AT
gi|54742                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TC-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-G--C--------------------------------------------A---T-A-TAT----CA----T-------GC------------ATA--AG------T---------------------C-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AA-------------TG-----------------TGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54743                      :                                            TTA-AATTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--G----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------ATACATGT--------A---T-A-TAT----CT----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------TGA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----A
gi|54744                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------C
gi|54744                      :                                                                                                                                                                                                                 ------T-----------CAT----ATAC-A----T-G------TA-AT----A--GCA-----AAA-----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTCtttttcatatacatgtaatagcaaaagggtttggccacaagttatccaacattaaaatcggcccttc
gi|54745                      :                 ttactttaaacatattttattgcttttTTA-GTTTAAACA-----A---AT-T--TA-CTG-------CC----------------A----AT-A--TAT---------T-T-ACA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA---------T-ACA--AGAAACATT-----------GAA----AT---A-A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----TA--GTTTGGTCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--AGTTACGACCA
gi|54746                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-T---A----AC-A--CAT------------------G-------A------T------------T-A-TAT----TA----T-------GCA---------C-GTA--AA------C-----------CAT----ATAC-A-A-----------------------GCAT----AGATCACTGG--GTCCAGCCT-T-A--A----CGTCTC---ACCACTATT--ACAT
gi|54747                      :                                            TTA-GTTCAAACA-T---A---TT-T--GA-TTG-------CCAA-------TA-TATTT----AC-A--CAT--A----------AC-----------A------T--------A---TGA-CATGA--CA----A-------GCA---------T-ACA--AG------GAA---------CAA----ATA--A-------------TA-A-----T--GCA-----AAA-----TG--GTCTAGCCA-C-A--A----GTGCC-------AC-ATT--AGt
gi|54748                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---AT-A--TAATTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----GA----T-------GCA---------T-ATA--GT------T-----------CA
gi|54753                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTCta
gi|54754                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------AAATA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AA------A-----------CAA----AAAC-A-A--C-T------TA-T-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-AAT--AGATTCGGCCATCC
gi|54755                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-G-------TA-TA--A----AA-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATC--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------GA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAGGCCATTC
gi|54756                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----TC-A--CAT--A------T-T-AC---A-----------------------A---T-A-TAT----CA----T-------ACA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----A--GC------AAA-----GT--GTCTGGCCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAC-A-T--AGATATAGCCATTC
gi|54757                      :                                             TA-GTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--ACATGTAT-T-AC---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----TTAC-A-A--T-T------TA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--TTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54758                      :                                             TA-GTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--ACATGTAT-T-AC---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----TTAC-A-A--T-T------TA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--TTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54759                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--CA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------C-A----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--T----GTTTT--------C-ATA--AGATGCGACCATT
gi|54760                      :                                             TA-GTTTAACCA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-G-A--T-T------TA-A-----G--TCA-----AAA-----GG--GTCTGG-----------------------TCAAT-ATT--CGATGTGGCCATTC
gi|54761                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---G---TT-T---A-TTG-------TG-A-------TA-TC--A----AC-A--CAT--A------C-T-AC---A-------A------TCTGCGATTG---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----G--GTA-----AAA-----GG--GTCTGGCCATT-T--T----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54762                      :                                             TA-GTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--ATTTGACCT-C-A--A----TTTCTC---CGAAC-ATT--AGATT
gi|54763                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-ATG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------C------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCC---------T-ATC--AG------T-----------C-A----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-A-A--C----GTTCTC---CCAAC-ATT--
gi|54764                      :                                             TA-GTT---ACA-TCGCA---TG-T--TA-CTG-------TC-A-------TA-TT--G----GC-A--CAT--A---------------------------------------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--TAT------TAGA-----G--GTA-----AAA-----GG--TTCTGGTTA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54765                      :                                             TA-GTT--AACAAT---A---TT-T--TA-TTG-------CC-G-------TA--A--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------AAA----ACAC-A-A--A-T------AT-A-----G--GCA-----TAA-----TG--GTCAGGCCA-C-A--A----GTT-TC---TCAAC-ATT--TGATTTAGCCGTT
gi|54766                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---C------A-T------------G-------TG-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----GG----T-------GCA---------T-ATA--TA------C-----------TAT----ATAC-A-G--T-T------AT-G-----G--GTA-----AAA-----GA--GTCTGACCA-C-A--A----ATTCTCATATTACC-ATT--AGATACGGTCATT
gi|54767                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---CA-T--TA-TTG-------CT-A-------TA-TA--A----AC-A--CCC--A------A-T-GC---G-------T------T--------A---T-A-TGC----TA----T-------GAA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TG-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCGGGCCA-
gi|54768                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-AATATATTTA-CA--A----AT-ATACAT--A------T-T-GC---AGGCAA--A------C--------A---A-A-AAA----CA----T-------TTA---------TTACA--AG-------------------AA----ATA----A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--A
gi|54769                      :                                             TG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A------------------------------------------------------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA---------T-ATA------------------------------------------------------------GCA-----AAT-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTCtttgccat
gi|54770                      :                                             TA-GTTCGAACA-T---A---GT-T--TA-TTG-------CC-A-------TT-TA--A----GC-A--CAT--G------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAA----CA----T-------GCA---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------AA-A-----G--GCA-----AAA-----
gi|54771                      :                                             TA-GTTTAGACA-T--------T-T--TA-TTA-------CC-AAA-----TA-TA--T----AC-A--CAT--A---------------A-------A------T--------A---T---TA-----CA----A-------ACG---------T-ACA--AG------G------------AA----CTA--A-A--T---------A-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCG-C-A--A----GTGCTA---ACTAT-ATT--AGTTAAGGCCAT
gi|54772                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CT-A-------TA-TA--A-----C-A--CCC--A------A-T-GC---A-------T------T--------A---T-A-TAC----TA----T-------GAA---------T-ATA--AA------T-----------AAA----ATAC-A-A--T-T------TG-A-----G--GCA-----AAT-----GG--GTGGGGCCA-
gi|54774                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--GGATTCGGCCATTC
gi|54775                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----
gi|54776                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-G-AC---T-------A------T--------A---T-A-AAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------AAA----ATAT------T-T------TA-C-----G--GCG-----AAA-----GA--GTCTTGCCA-C-A--A----ATTCTC---CCAAC-ATC--AGGTACGGCCTTTC
gi|54777                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--C----AC-A--TAT--A------T-T-AG---A-------T------T--------A---T-A-TAC----CA----T-------ACA---------T-ATA--AA------T-----------CAC----ATAC-A-A--T-T------CT-A-----A--GTT-----AAA-----GG--GT------A-------------TCTC---TTAAC-ATT--ATATACGGCTATTC
gi|54778                      :                                               -GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------A-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTG
gi|54780                      :                                                   TATACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT-G-------TA-TT--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---ATATTATTA------TTA------G---T-A-TAT----TG----C-------GCG---------T-ATACGAG------T-----------CAT----ATAT-G-A--T-G------AT-A-----G--GTA-----AAG-----GG--GTCTGGCCA-C-A--C----GTTCTC---TCTAC-AGT--AGATGCGACAATTC
gi|54781                      :                                                   TGAACA-T---G---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------C-T-AG---T-------A------T--------A---TTA-TAT----CA----TATGTTATGCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAT-A-A--T-T------TT-A-----G--GCT-----AAA-----GG--G
gi|54782                      :                                                   TAATCA-T---A---TC-T--AA-TTA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--G------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TG----T-------GTATATCAATCCT-ATACGAG------TGTTGTGTATATCAATCCTATAC-G-A--G-T------GT-A-----G--GCA-----ATA-----TG--GTCTGGTCA-T-A--A----G--ACC---TCAAC-ATT--AAATACGAGCATTC
gi|54784                      :                                                     AACA-T---A---TT-G--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------CA-A-----G--GCA-----AAA-----AG--ATCTGGTCA-C-A--A----GTTCTC---ACAAC-ATT--AGGTTTG
gi|54785                      :                                                     AACA-T---A---TG-T--TA-TT--------CC-T-------TG-TA--T----AC-A--CAC--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-AAT----TT----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CTT----ACAC-G-A--T-T------AC-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCTTGCAA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54786                      :                                                     AACG-T---A---TG-T--TA-TT--------CC-T-------TG-CA--T----AC-A--CAC--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TT----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CTT----ACAT-G-A--T-T------AC-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCTGGCCA-C-C--A----GATCTC---TCAGC-ATT--
gi|54789                      :                                                                            TG-------TC-A-------TA-TA--A----AC-G--CAT-----------T-AT---A-------A------A--------AC--T-A-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CAA----ATGC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAG-----GG--ATTTGGCAA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGACACGGCCATT
gi|54791                      :                                                                                                 A-TA--A----AC-A--CAT-----------T-AT---A-------A------T--------C---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--TA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-------G--GCA-----AAA-----TA--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54792                      :                                                                                                aA-TG--A----AC-A--AAT--A------T-G-AT---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------AAA---------T-ATA--CA------T-----------CAA----ATAC-A-A--G-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATA--AGATACGGCCATT
gi|54793                      :                                                                                                 A-TA--A----AT-A--CATTTA------T-T-AC---A-------T------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GAT---------T-ATA--AC------T-----------CAT----ATCC-A-A--G-TATGA--TA-ACTGTAG--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--G----GTTTTC---TCAA
gi|54794                      :                                                                                                  -TA--A----AC-A--TAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T---TATGA--TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-A------TT-A-----G--ACA-----CAG-----GG--GGGTTGCCA-C-A--A----GATGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATCC
gi|54797                      :                                                                                                     --A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-G-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----GTAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----AG--GTCTGGCCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAA-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54798                      :                                                                                                              -A--CCT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AC------T-----------CAA----ATAC-A-A--C-T------TT-A-----G--ACA-----AAA-----GG--GTCTGGTCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--TGATACG
gi|54799                      :                                                                                                                   AT--A------T-T-AT---A-------A------C--------A---T-A-TAC----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------TAA----ATAC-C-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GCTCTC---TCACC-ATT--AGATACGACCAT
gi|54800                      :                                                                                                                    T--A------T-TGAC---G-------A---------------A---T-T-TTT----CA----T-------TAA---------T-GTA--AA------T-----------CTT----ATAG-G-A--T-T------AG-A-----G--ACA-----AAA-----TA--GTCCGGTCA-C-C--A----GTGCTC---TCAGT-ATT--AAATACGGCCATTC
gi|54802                      :                                                                                                                     --A------T-T-GC---A-------A------T--------A---T-T-TGG----CC----T-------------------T-ATA---G------T-----------TAA----ATTT-T-A--T-T------TA-A-----T--ATATCATGAAATG---GG--GTCGGGCCA-C-A--A----GTTTTG---CCAAC-ATT--AGATCCGGCCCTTC
gi|54804                      :                                                                                                                                                                      -TAC----CA----T-------GC----------T-ATG--AG------------------CAT----GTGC-G-A--T-T------AT-A-----G--GCA-----AAC-----GG--GTCT--TCT-C-G--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAAGTCATTC
gi|54805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54806                      :                                                                                                                                                           tacgtttaaacatattttatttcaacatgaaatgCG---------T-ATA--AA------------------CAT----ATAT-A-AACC-T------TA-A-----G--ACA-----AAA-----GG--GTCTGACAA-C-A--A-------CTC---TCAAC-ATT--AAATACAGCTATT
gi|54808                      :                                                                                                                                                                                                                                                -A--T-T------TA-A-----C--ATG-----AAATG---GA--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCAGCC
gi|54810                      :                                                                                                                                                                                                                          taagcatatttt----ATA--A-A--T-T------TACA-----T--GAA-----ATG-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----ATTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54812                      :                                                                                                                                                                                                                                                tc--T-T------CA-A-----C--GTG-----AAATG---GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54815                      :                                                                                                                                                                                                                            catattttat----ATAC-A-A--A-T---------A-----GTAGCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTC
gi|54816                      :                                                                                                                                                                                                                                           tAT-A-A--T-T------TT-A-----C--ATG-----AAATG---GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          CA-----AAA-----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAACCGGCCCTTC
gi|54824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54828                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC





Alignments
lowQualScore                  :                                               0         0 111 111  0 00  0   1111111  0 2222222  0  00 1111  0 11   00 222222 0 0  111 44444444444444 44444444 111 222   33333 1111 2222222   222222222 0   11  333333 44444444444   1111    0 0 00 0 555555555 11111 00   11111   33333  00         0 0 00 1111      000     0   00    1         
lowQualScore                  :                                               .         . ... ...  . ..  .   .......  . .......  .  .. ....  . ..   .. ...... . .  ... .............. ........ ... ...   ..... .... .......   ......... .   ..  ...... ...........   ....    . . .. . ......... ..... ..   .....   .....  ..         . . .. ....      ...     .   ..    .         
lowQualScore                  :                                               6         6 000 000  6 88  6   8888888  6 6666666  5  77 1111  5 44   77 888888 5 5  888 66666666666666 99999999 333 222   88888 0000 0000000   666666666 5   33  777777 33333333333   0000    5 5 66 9 222222222 66666 66   55555   33333  66         4 4 66 0000      888     5   66    0         
consensus                     :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
Reference ( family-238 )      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
gi|54697                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54698                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTC
gi|54699                      :                                           TCTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----C-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCAATTC
gi|54700                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------AA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54701                      :                                           TCTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAG----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAT-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54702                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------CA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAC-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TAAAC-ATT--AGATTCAGCCATTC
gi|54703                      :                                           TTAA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--AGTTCGTTCTC---CCAAC-ATT--AGA
gi|54704                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GT--TC---TCAAT-ATT--atc
gi|54705                      :                                           TTTA-GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--AAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--ACA-----AAA-----GT--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-CTT--
gi|54706                      :                                           TTCA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------TTTAC----G---T-A-TCT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----CG--GTCCTGCCG-T-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--AGATACATCCATTC
gi|54707                      :                                           TTTA-ATTTAAACA-T---A---TT-T--AA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----GC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---A-A-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------AAA----ATAC-A-A--A-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCT-GCC--C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54708                      :                                           TTTG-GTT-AAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-G-TAT----TA----C-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--A-A-----AAA-----AG--GTC
gi|54709                      :                                           TTTA-TTTCAAACA-T---A---TA-T--TT-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------TGCATGT--A---T-G-TAT----TA----T-------GTT---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-A------TT-A-----G--GTA-----AAA-----TG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACAGCCATTC
gi|54710                      :                                           TTTA-GTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------AATAT-A-TAT----CG----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CGA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----
gi|54711                      :                                           TTAA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TG-TTG-------CC-A-------TA-TA--G----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---C-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ACAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--
gi|54712                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTT-------CT-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-GC---A-------T------T--------A---T-A-TGT----TG----C-------GCA---------T-GTT--GA------T-----------CAT----ATAC-G-A--G-T------AT-A-----G--GAA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAT-ATC--AGATACGGCAATTC
gi|54713                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-TC---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAT----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----CAA-----GG--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54714                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-TC---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAT----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----CAA-----GG--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54715                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A------------------------------------------------------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA---------T-ATA------------------------------------------------------------GCA-----AAT-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54716                      :                                           TTTA-ATTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------C------T--------A---T-A-TAT----TATAACT-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAG----ATAT-A-A--T-G------TA-A-----G--GC------AAA-----GG--GTCTGGTCA-C-A--A----G
gi|54717                      :                                           TTTT-GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TGA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-G--CAT--A------T-T-ACACTA-------A------T--------A---T-G-TAT----TG----T-------GCA---------A-ATG--AT------T-----------CAT----ATAC-T-A--T-TA-----TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GT-TGGTCA-CTAATA----ATTCTC---TCACC-ATC--AGATATTGCAATTC
gi|54718                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT-T-------TT-TA----------A--CAT--A------T----------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA---------T-ATA------------------------------------------------TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GTTGGACCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54719                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT---------TT-TT--A----AC-A--TAT--A------TAT-AT---AT------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ATA---------T-ATA--TA------TA----------TAC----ATAC-ATA--T-A------TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--A
gi|54720                      :                                           TTT--GTTTAATCA-T---AATATTATAGTA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A------------C--A------T-T-AC---A--------------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GCA---------T-ATA--GA------T-----------CAT----ATACGA-A--TGT------T--------G--GCA-----AAA-----GA--GTCTTGTCA-C-C--A----GTTCTC---GCAAC-ATT--TGATACGACCATT
gi|54721                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A--------A-TA--A----AT----------------T-T-ACA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA---------T-ACA--AGAAACATT-----------GAA----AT---A-A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----CTGCTC---ACCAC-TTT--A
gi|54722                      :                                           TTTA-GTTTTAACA-C---A---TT-T--TA-TTT-------CA-A-------TA-TA--A----AC-A--CAG--A------T-T-TC---A-------A------T--------A---T-A-TTT----TA----T-------AAA---------T-ATA--AA------T-----------CAG----AAAC-A-G--T-T------T--A-----G--ACA-----AAA-----TG--GTCTGGTC
gi|54723                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T---A-TTG-------CT---------TA-TA--ATCGTAC-AATTAC--A------T-T-AC---A-------A------T--------A-----G-TA------G----T-------GTAGC-------T-ATA--AAGATT--TA----------CAA----ACAC-A----T-A------TA-A-----G---CA-----AGA-----GG--GTTGGGTCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGTTACGGCC
gi|54724                      :                                           TTTA-GTTTATACA-T---A---TT-G--TA-TTG-------CT-T-------TT-TA--A-----C-A--TAT--A---------------A-------A------T--------A---T-A---------------------------------------------------------------A----ATAT-A-A-----------------------GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGACCCTTC
gi|54725                      :                                           TTTAAGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CA-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-CC---A-------A-------------------------------A----T-------GCA---------T--TA--TG------T------------------ATA---------------------------------------------------TGGCCA-C-A--A----GTTCTA---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54726                      :                                           TTTA-GTTTAATCA-T---A---TT-T--TA-TTGTGTAATATT-A-------TG-TT--A----ACAA--CAT--A--------T-AC-----------A------T--------A---T---TAC----CA----T-------TCA---------T-ACA--AT------TG----------CAA------AC-A-A--T-A------TA-A--------GCA-----AAT-----GG--GTTTGGCTA-C-A--C----GTTATT---ACGAC-ATT--AG
gi|54727                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            -----AAA-----GGAGGTCGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54729                      :                                                                                 tttggtttaaacatattttatttctatttatatatacag------T-T-A----A-------A------C--------A---T-A-TTT----TA----TT------GCA---------T-A----AT------T-----------CAC----ATA----------------------------GCA-----AAC-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---GCAAC-ATT--AGTTACGGCCATCC
gi|54730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 tttagt--GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCTCTTC
gi|54738                      : tttactttaaacatattttattactttttatatacatgtagtaTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTA-------CC-A-------TA-CA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AG---A-------G------T--------G---T-G-CAT-----A----T-------ACT---------A-ATA--AA------T-----------TAT----TTAT-G-A--T-T------AT-A-----G--GCA-----AAA-----CT--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTTTC---TGAAC-ATT--AACTGCAGCCATT
gi|54739                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-T-------TT-TA--A-----C-A--TAT--A------T----------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA---------T-ATA------------------------------------------------TA-A-----G---CA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54740                      :                                            TTA-GTTTAA-CT-T---G---TT-G--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AT-A--CAT---------------------------------T--------A---T-A-AAC----TA----T-------ACA---------T-ATA--AG------T-----------CCA----ATAC---A--C-T------CATA-----G--GCA-----AGA-----GG--GCCTGGACA-C-A--A----GTTCTG---TCAAC-ATTTCAGAT
gi|54741                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--CA-TTG-------TC-A-------TA-TA--A----AC-A--CTT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-A-A--AG------T-----------AAA----ATAC-A-A--T-TTACATATA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--AT
gi|54742                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TC-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-G--C--------------------------------------------A---T-A-TAT----CA----T-------GC------------ATA--AG------T---------------------C-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AA-------------TG-----------------TGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54743                      :                                            TTA-AATTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--G----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------ATACATGT--------A---T-A-TAT----CT----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------TGA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----A
gi|54744                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------C
gi|54744                      :                                                                                                                                                                                                                 ------T-----------CAT----ATAC-A----T-G------TA-AT----A--GCA-----AAA-----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTCtttttcatatacatgtaatagcaaaagggtttggccacaagttatccaacattaaaatcggcccttc
gi|54745                      :                 ttactttaaacatattttattgcttttTTA-GTTTAAACA-----A---AT-T--TA-CTG-------CC----------------A----AT-A--TAT---------T-T-ACA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA---------T-ACA--AGAAACATT-----------GAA----AT---A-A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----TA--GTTTGGTCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--AGTTACGACCA
gi|54746                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-T---A----AC-A--CAT------------------G-------A------T------------T-A-TAT----TA----T-------GCA---------C-GTA--AA------C-----------CAT----ATAC-A-A-----------------------GCAT----AGATCACTGG--GTCCAGCCT-T-A--A----CGTCTC---ACCACTATT--ACAT
gi|54747                      :                                            TTA-GTTCAAACA-T---A---TT-T--GA-TTG-------CCAA-------TA-TATTT----AC-A--CAT--A----------AC-----------A------T--------A---TGA-CATGA--CA----A-------GCA---------T-ACA--AG------GAA---------CAA----ATA--A-------------TA-A-----T--GCA-----AAA-----TG--GTCTAGCCA-C-A--A----GTGCC-------AC-ATT--AGt
gi|54748                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---AT-A--TAATTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----GA----T-------GCA---------T-ATA--GT------T-----------CA
gi|54753                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTCta
gi|54754                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------AAATA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AA------A-----------CAA----AAAC-A-A--C-T------TA-T-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-AAT--AGATTCGGCCATCC
gi|54755                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-G-------TA-TA--A----AA-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATC--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------GA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAGGCCATTC
gi|54756                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----TC-A--CAT--A------T-T-AC---A-----------------------A---T-A-TAT----CA----T-------ACA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----A--GC------AAA-----GT--GTCTGGCCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAC-A-T--AGATATAGCCATTC
gi|54757                      :                                             TA-GTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--ACATGTAT-T-AC---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----TTAC-A-A--T-T------TA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--TTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54758                      :                                             TA-GTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--ACATGTAT-T-AC---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----TTAC-A-A--T-T------TA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--TTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54759                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--CA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------C-A----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--T----GTTTT--------C-ATA--AGATGCGACCATT
gi|54760                      :                                             TA-GTTTAACCA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-G-A--T-T------TA-A-----G--TCA-----AAA-----GG--GTCTGG-----------------------TCAAT-ATT--CGATGTGGCCATTC
gi|54761                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---G---TT-T---A-TTG-------TG-A-------TA-TC--A----AC-A--CAT--A------C-T-AC---A-------A------TCTGCGATTG---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----G--GTA-----AAA-----GG--GTCTGGCCATT-T--T----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54762                      :                                             TA-GTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--ATTTGACCT-C-A--A----TTTCTC---CGAAC-ATT--AGATT
gi|54763                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-ATG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------C------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCC---------T-ATC--AG------T-----------C-A----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-A-A--C----GTTCTC---CCAAC-ATT--
gi|54764                      :                                             TA-GTT---ACA-TCGCA---TG-T--TA-CTG-------TC-A-------TA-TT--G----GC-A--CAT--A---------------------------------------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--TAT------TAGA-----G--GTA-----AAA-----GG--TTCTGGTTA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54765                      :                                             TA-GTT--AACAAT---A---TT-T--TA-TTG-------CC-G-------TA--A--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------AAA----ACAC-A-A--A-T------AT-A-----G--GCA-----TAA-----TG--GTCAGGCCA-C-A--A----GTT-TC---TCAAC-ATT--TGATTTAGCCGTT
gi|54766                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---C------A-T------------G-------TG-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----GG----T-------GCA---------T-ATA--TA------C-----------TAT----ATAC-A-G--T-T------AT-G-----G--GTA-----AAA-----GA--GTCTGACCA-C-A--A----ATTCTCATATTACC-ATT--AGATACGGTCATT
gi|54767                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---CA-T--TA-TTG-------CT-A-------TA-TA--A----AC-A--CCC--A------A-T-GC---G-------T------T--------A---T-A-TGC----TA----T-------GAA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TG-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCGGGCCA-
gi|54768                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-AATATATTTA-CA--A----AT-ATACAT--A------T-T-GC---AGGCAA--A------C--------A---A-A-AAA----CA----T-------TTA---------TTACA--AG-------------------AA----ATA----A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--A
gi|54769                      :                                             TG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A------------------------------------------------------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA---------T-ATA------------------------------------------------------------GCA-----AAT-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTCtttgccat
gi|54770                      :                                             TA-GTTCGAACA-T---A---GT-T--TA-TTG-------CC-A-------TT-TA--A----GC-A--CAT--G------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAA----CA----T-------GCA---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------AA-A-----G--GCA-----AAA-----
gi|54771                      :                                             TA-GTTTAGACA-T--------T-T--TA-TTA-------CC-AAA-----TA-TA--T----AC-A--CAT--A---------------A-------A------T--------A---T---TA-----CA----A-------ACG---------T-ACA--AG------G------------AA----CTA--A-A--T---------A-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCG-C-A--A----GTGCTA---ACTAT-ATT--AGTTAAGGCCAT
gi|54772                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CT-A-------TA-TA--A-----C-A--CCC--A------A-T-GC---A-------T------T--------A---T-A-TAC----TA----T-------GAA---------T-ATA--AA------T-----------AAA----ATAC-A-A--T-T------TG-A-----G--GCA-----AAT-----GG--GTGGGGCCA-
gi|54774                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--GGATTCGGCCATTC
gi|54775                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----
gi|54776                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-G-AC---T-------A------T--------A---T-A-AAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------AAA----ATAT------T-T------TA-C-----G--GCG-----AAA-----GA--GTCTTGCCA-C-A--A----ATTCTC---CCAAC-ATC--AGGTACGGCCTTTC
gi|54777                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--C----AC-A--TAT--A------T-T-AG---A-------T------T--------A---T-A-TAC----CA----T-------ACA---------T-ATA--AA------T-----------CAC----ATAC-A-A--T-T------CT-A-----A--GTT-----AAA-----GG--GT------A-------------TCTC---TTAAC-ATT--ATATACGGCTATTC
gi|54778                      :                                               -GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------A-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTG
gi|54780                      :                                                   TATACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT-G-------TA-TT--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---ATATTATTA------TTA------G---T-A-TAT----TG----C-------GCG---------T-ATACGAG------T-----------CAT----ATAT-G-A--T-G------AT-A-----G--GTA-----AAG-----GG--GTCTGGCCA-C-A--C----GTTCTC---TCTAC-AGT--AGATGCGACAATTC
gi|54781                      :                                                   TGAACA-T---G---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------C-T-AG---T-------A------T--------A---TTA-TAT----CA----TATGTTATGCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAT-A-A--T-T------TT-A-----G--GCT-----AAA-----GG--G
gi|54782                      :                                                   TAATCA-T---A---TC-T--AA-TTA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--G------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TG----T-------GTATATCAATCCT-ATACGAG------TGTTGTGTATATCAATCCTATAC-G-A--G-T------GT-A-----G--GCA-----ATA-----TG--GTCTGGTCA-T-A--A----G--ACC---TCAAC-ATT--AAATACGAGCATTC
gi|54784                      :                                                     AACA-T---A---TT-G--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------CA-A-----G--GCA-----AAA-----AG--ATCTGGTCA-C-A--A----GTTCTC---ACAAC-ATT--AGGTTTG
gi|54785                      :                                                     AACA-T---A---TG-T--TA-TT--------CC-T-------TG-TA--T----AC-A--CAC--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-AAT----TT----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CTT----ACAC-G-A--T-T------AC-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCTTGCAA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54786                      :                                                     AACG-T---A---TG-T--TA-TT--------CC-T-------TG-CA--T----AC-A--CAC--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TT----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CTT----ACAT-G-A--T-T------AC-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCTGGCCA-C-C--A----GATCTC---TCAGC-ATT--
gi|54789                      :                                                                            TG-------TC-A-------TA-TA--A----AC-G--CAT-----------T-AT---A-------A------A--------AC--T-A-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CAA----ATGC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAG-----GG--ATTTGGCAA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGACACGGCCATT
gi|54791                      :                                                                                                 A-TA--A----AC-A--CAT-----------T-AT---A-------A------T--------C---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--TA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-------G--GCA-----AAA-----TA--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54792                      :                                                                                                aA-TG--A----AC-A--AAT--A------T-G-AT---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------AAA---------T-ATA--CA------T-----------CAA----ATAC-A-A--G-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATA--AGATACGGCCATT
gi|54793                      :                                                                                                 A-TA--A----AT-A--CATTTA------T-T-AC---A-------T------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GAT---------T-ATA--AC------T-----------CAT----ATCC-A-A--G-TATGA--TA-ACTGTAG--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--G----GTTTTC---TCAA
gi|54794                      :                                                                                                  -TA--A----AC-A--TAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T---TATGA--TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-A------TT-A-----G--ACA-----CAG-----GG--GGGTTGCCA-C-A--A----GATGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATCC
gi|54797                      :                                                                                                     --A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-G-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----GTAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----AG--GTCTGGCCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAA-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54798                      :                                                                                                              -A--CCT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AC------T-----------CAA----ATAC-A-A--C-T------TT-A-----G--ACA-----AAA-----GG--GTCTGGTCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--TGATACG
gi|54799                      :                                                                                                                   AT--A------T-T-AT---A-------A------C--------A---T-A-TAC----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------TAA----ATAC-C-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GCTCTC---TCACC-ATT--AGATACGACCAT
gi|54800                      :                                                                                                                    T--A------T-TGAC---G-------A---------------A---T-T-TTT----CA----T-------TAA---------T-GTA--AA------T-----------CTT----ATAG-G-A--T-T------AG-A-----G--ACA-----AAA-----TA--GTCCGGTCA-C-C--A----GTGCTC---TCAGT-ATT--AAATACGGCCATTC
gi|54802                      :                                                                                                                     --A------T-T-GC---A-------A------T--------A---T-T-TGG----CC----T-------------------T-ATA---G------T-----------TAA----ATTT-T-A--T-T------TA-A-----T--ATATCATGAAATG---GG--GTCGGGCCA-C-A--A----GTTTTG---CCAAC-ATT--AGATCCGGCCCTTC
gi|54804                      :                                                                                                                                                                      -TAC----CA----T-------GC----------T-ATG--AG------------------CAT----GTGC-G-A--T-T------AT-A-----G--GCA-----AAC-----GG--GTCT--TCT-C-G--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAAGTCATTC
gi|54805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54806                      :                                                                                                                                                           tacgtttaaacatattttatttcaacatgaaatgCG---------T-ATA--AA------------------CAT----ATAT-A-AACC-T------TA-A-----G--ACA-----AAA-----GG--GTCTGACAA-C-A--A-------CTC---TCAAC-ATT--AAATACAGCTATT
gi|54808                      :                                                                                                                                                                                                                                                -A--T-T------TA-A-----C--ATG-----AAATG---GA--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCAGCC
gi|54810                      :                                                                                                                                                                                                                          taagcatatttt----ATA--A-A--T-T------TACA-----T--GAA-----ATG-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----ATTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54812                      :                                                                                                                                                                                                                                                tc--T-T------CA-A-----C--GTG-----AAATG---GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54815                      :                                                                                                                                                                                                                            catattttat----ATAC-A-A--A-T---------A-----GTAGCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTC
gi|54816                      :                                                                                                                                                                                                                                           tAT-A-A--T-T------TT-A-----C--ATG-----AAATG---GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          CA-----AAA-----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAACCGGCCCTTC
gi|54824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54828                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC


blockSeqs                     :                                                                              TGTAATA    ATATATT        TCGT    AT      CATGTA      ACT TATTATTA       CTGCGATT ATA AG    ATTAC TAAC ATGTTAT   TATCAATCC     CG  AAACAT GTTGTGTATAT                    TACATATA  CTGTA      TCATG   TCACT                                                T
blockSeqs                     :                                                                              .          AA             .       TA      CATGTA      A   ATACATG        GCATGT   C   AG    ATTAC .    T         GC            CG  AAACAT AA                             ATGATA    T          T       TG                                                   T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           A   GGCAAA         TTAC     .   GA    GAC   .    .         .             .   GATT   A                              ATA       .          .       TG                                                   T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   TTA            TA       .   TA    GAT   .    .         .             .   .      A                              CAT       .          .       TG                                                   A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   TTA            .        .   TA    C     .    .         .             .   .      G                              TAG       .          .       TG                                                   T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   TA             .        .   TA    C     .    .         .             .   .      .                              TAC       .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              AA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   G     C     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   G     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    G
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              AT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   C              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   G     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              AT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   G     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    G
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    G
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   G              .        .   G     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     G     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              GA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    G
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              AT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     T     .    .         .             .   .      .                              AT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     G     .    .         .             .   .      .                              TG        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   C              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              AA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TG        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              CT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    C
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              AT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              GT        .          .       .                                                    A
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              CA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   T     T     .    .         .             .   .      .                              AC        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              AC        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   T     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    C
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              AG        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   T              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                    T
blockSeqs                     :                                                                              .          .              .       .       .           .   A              .        .   A     T     .    .         .             .   .      .                              AT        .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                              .                         .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                        .       .       .           .   A              .        .   G     C     .    .         .             .   .      .                              TA        .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                        .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              CA        .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                        .       .       .           .   A              .        .   A     C     .    .         .             .   .      .                              TT        .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                        .       .       .           .   A              .        .   T     .     .    .         .             .   .      .                              T         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                .       .           .   .              .        .   T     .     .    .         .             .   .      .                              T         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                        .           .   .              .        .   .     .     .    .         .             .   .      .                              A         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                        .           .   .              .        .   .     .     .    .         .             .   .      .                              .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                        .           .   .              .        .   .     .     .    .         .             .   .      .                              .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                        .           .   .              .        .   .     .     .    .         .             .   .      .                              .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .     .    .         .             .   .      .                              .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .             .   .      .                              .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                 .      .                              .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                       .         .          .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .       .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .                                                     


blockSeqCons                  :                                           
originalCons                  :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
finalCons                     :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC





Alignments
lowQualScore                  :                                               0         0 111 111  0 00  0   1111111  0 2222222  0  00 1111  0 11   00 222222 0 0  111 44444444444444 44444444 111 222   33333 1111 2222222   222222222 0   11  333333 44444444444   1111    0 0 00 0 555555555 11111 00   11111   33333  00         0 0 00 1111      000     0   00    1         
lowQualScore                  :                                               .         . ... ...  . ..  .   .......  . .......  .  .. ....  . ..   .. ...... . .  ... .............. ........ ... ...   ..... .... .......   ......... .   ..  ...... ...........   ....    . . .. . ......... ..... ..   .....   .....  ..         . . .. ....      ...     .   ..    .         
lowQualScore                  :                                               6         6 000 000  6 88  6   8888888  6 6666666  5  77 1111  5 44   77 888888 5 5  888 66666666666666 99999999 333 222   88888 0000 0000000   666666666 5   33  777777 33333333333   0000    5 5 66 9 222222222 66666 66   55555   33333  66         4 4 66 0000      888     5   66    0         
consensus                     :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
Reference ( family-238 )      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATNCGGCCATTC
gi|54697                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54698                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTC
gi|54699                      :                                           TCTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----C-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCAATTC
gi|54700                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------AA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTCGGCCATTC
gi|54701                      :                                           TCTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAG----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAT-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54702                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------CA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAC-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TAAAC-ATT--AGATTCAGCCATTC
gi|54703                      :                                           TTAA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--AGTTCGTTCTC---CCAAC-ATT--AGA
gi|54704                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GT--TC---TCAAT-ATT--atc
gi|54705                      :                                           TTTA-GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--AAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--ACA-----AAA-----GT--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-CTT--
gi|54706                      :                                           TTCA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------TTTAC----G---T-A-TCT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----CG--GTCCTGCCG-T-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--AGATACATCCATTC
gi|54707                      :                                           TTTA-ATTTAAACA-T---A---TT-T--AA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----GC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---A-A-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------AAA----ATAC-A-A--A-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCT-GCC--C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54708                      :                                           TTTG-GTT-AAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-G-TAT----TA----C-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--A-A-----AAA-----AG--GTC
gi|54709                      :                                           TTTA-TTTCAAACA-T---A---TA-T--TT-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------TGCATGT--A---T-G-TAT----TA----T-------GTT---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-A------TT-A-----G--GTA-----AAA-----TG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACAGCCATTC
gi|54710                      :                                           TTTA-GTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------AATAT-A-TAT----CG----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CGA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----
gi|54711                      :                                           TTAA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TG-TTG-------CC-A-------TA-TA--G----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---C-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ACAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--
gi|54712                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTT-------CT-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-GC---A-------T------T--------A---T-A-TGT----TG----C-------GCA---------T-GTT--GA------T-----------CAT----ATAC-G-A--G-T------AT-A-----G--GAA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAT-ATC--AGATACGGCAATTC
gi|54713                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-TC---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAT----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----CAA-----GG--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54714                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---AT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-TC---ATT-----A------T--------A---T-AGTAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAT----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----CAA-----GG--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTATG---TCAAC-ATT--ATAT
gi|54715                      :                                           TTTG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A------------------------------------------------------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA---------T-ATA------------------------------------------------------------GCA-----AAT-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54716                      :                                           TTTA-ATTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------C------T--------A---T-A-TAT----TATAACT-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAG----ATAT-A-A--T-G------TA-A-----G--GC------AAA-----GG--GTCTGGTCA-C-A--A----G
gi|54717                      :                                           TTTT-GTTTAAATA-T---A---TT-T--TA-TGA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-G--CAT--A------T-T-ACACTA-------A------T--------A---T-G-TAT----TG----T-------GCA---------A-ATG--AT------T-----------CAT----ATAC-T-A--T-TA-----TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GT-TGGTCA-CTAATA----ATTCTC---TCACC-ATC--AGATATTGCAATTC
gi|54718                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT-T-------TT-TA----------A--CAT--A------T----------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA---------T-ATA------------------------------------------------TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GTTGGACCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54719                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT---------TT-TT--A----AC-A--TAT--A------TAT-AT---AT------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ATA---------T-ATA--TA------TA----------TAC----ATAC-ATA--T-A------TA-A--------GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--A
gi|54720                      :                                           TTT--GTTTAATCA-T---AATATTATAGTA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A------------C--A------T-T-AC---A--------------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GCA---------T-ATA--GA------T-----------CAT----ATACGA-A--TGT------T--------G--GCA-----AAA-----GA--GTCTTGTCA-C-C--A----GTTCTC---GCAAC-ATT--TGATACGACCATT
gi|54721                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A--------A-TA--A----AT----------------T-T-ACA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA---------T-ACA--AGAAACATT-----------GAA----AT---A-A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----CTGCTC---ACCAC-TTT--A
gi|54722                      :                                           TTTA-GTTTTAACA-C---A---TT-T--TA-TTT-------CA-A-------TA-TA--A----AC-A--CAG--A------T-T-TC---A-------A------T--------A---T-A-TTT----TA----T-------AAA---------T-ATA--AA------T-----------CAG----AAAC-A-G--T-T------T--A-----G--ACA-----AAA-----TG--GTCTGGTC
gi|54723                      :                                           TTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T---A-TTG-------CT---------TA-TA--ATCGTAC-AATTAC--A------T-T-AC---A-------A------T--------A-----G-TA------G----T-------GTAGC-------T-ATA--AAGATT--TA----------CAA----ACAC-A----T-A------TA-A-----G---CA-----AGA-----GG--GTTGGGTCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGTTACGGCC
gi|54724                      :                                           TTTA-GTTTATACA-T---A---TT-G--TA-TTG-------CT-T-------TT-TA--A-----C-A--TAT--A---------------A-------A------T--------A---T-A---------------------------------------------------------------A----ATAT-A-A-----------------------GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGACCCTTC
gi|54725                      :                                           TTTAAGTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CA-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-A-CC---A-------A-------------------------------A----T-------GCA---------T--TA--TG------T------------------ATA---------------------------------------------------TGGCCA-C-A--A----GTTCTA---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54726                      :                                           TTTA-GTTTAATCA-T---A---TT-T--TA-TTGTGTAATATT-A-------TG-TT--A----ACAA--CAT--A--------T-AC-----------A------T--------A---T---TAC----CA----T-------TCA---------T-ACA--AT------TG----------CAA------AC-A-A--T-A------TA-A--------GCA-----AAT-----GG--GTTTGGCTA-C-A--C----GTTATT---ACGAC-ATT--AG
gi|54727                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            -----AAA-----GGAGGTCGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54729                      :                                                                                 tttggtttaaacatattttatttctatttatatatacag------T-T-A----A-------A------C--------A---T-A-TTT----TA----TT------GCA---------T-A----AT------T-----------CAC----ATA----------------------------GCA-----AAC-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---GCAAC-ATT--AGTTACGGCCATCC
gi|54730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 tttagt--GCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCTCTTC
gi|54738                      : tttactttaaacatattttattactttttatatacatgtagtaTTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--TA-TTA-------CC-A-------TA-CA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AG---A-------G------T--------G---T-G-CAT-----A----T-------ACT---------A-ATA--AA------T-----------TAT----TTAT-G-A--T-T------AT-A-----G--GCA-----AAA-----CT--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTTTC---TGAAC-ATT--AACTGCAGCCATT
gi|54739                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-T-------TT-TA--A-----C-A--TAT--A------T----------------A------T--------A---T-A-TAT-----A----T-------ACA---------T-ATA------------------------------------------------TA-A-----G---CA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTA---CCAAC-ATT--AGTTACGGCCCTTC
gi|54740                      :                                            TTA-GTTTAA-CT-T---G---TT-G--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AT-A--CAT---------------------------------T--------A---T-A-AAC----TA----T-------ACA---------T-ATA--AG------T-----------CCA----ATAC---A--C-T------CATA-----G--GCA-----AGA-----GG--GCCTGGACA-C-A--A----GTTCTG---TCAAC-ATTTCAGAT
gi|54741                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---TT-G--CA-TTG-------TC-A-------TA-TA--A----AC-A--CTT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-A-A--AG------T-----------AAA----ATAC-A-A--T-TTACATATA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--AT
gi|54742                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TC-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-G--C--------------------------------------------A---T-A-TAT----CA----T-------GC------------ATA--AG------T---------------------C-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AA-------------TG-----------------TGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54743                      :                                            TTA-AATTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--G----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------ATACATGT--------A---T-A-TAT----CT----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------TGA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----A
gi|54744                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------C
gi|54744                      :                                                                                                                                                                                                                 ------T-----------CAT----ATAC-A----T-G------TA-AT----A--GCA-----AAA-----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTCtttttcatatacatgtaatagcaaaagggtttggccacaagttatccaacattaaaatcggcccttc
gi|54745                      :                 ttactttaaacatattttattgcttttTTA-GTTTAAACA-----A---AT-T--TA-CTG-------CC----------------A----AT-A--TAT---------T-T-ACA--A-------A------T--------A---T-A-CATATTACA----A-------GCA---------T-ACA--AGAAACATT-----------GAA----AT---A-A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----TA--GTTTGGTCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--AGTTACGACCA
gi|54746                      :                                            TTA-CTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-T---A----AC-A--CAT------------------G-------A------T------------T-A-TAT----TA----T-------GCA---------C-GTA--AA------C-----------CAT----ATAC-A-A-----------------------GCAT----AGATCACTGG--GTCCAGCCT-T-A--A----CGTCTC---ACCACTATT--ACAT
gi|54747                      :                                            TTA-GTTCAAACA-T---A---TT-T--GA-TTG-------CCAA-------TA-TATTT----AC-A--CAT--A----------AC-----------A------T--------A---TGA-CATGA--CA----A-------GCA---------T-ACA--AG------GAA---------CAA----ATA--A-------------TA-A-----T--GCA-----AAA-----TG--GTCTAGCCA-C-A--A----GTGCC-------AC-ATT--AGt
gi|54748                      :                                            TTA-GTTTAAACA-T---A---AT-A--TAATTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----GA----T-------GCA---------T-ATA--GT------T-----------CA
gi|54753                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-TTA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATTTGGCCATTCta
gi|54754                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------AAATA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AA------A-----------CAA----AAAC-A-A--C-T------TA-T-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-AAT--AGATTCGGCCATCC
gi|54755                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-G-------TA-TA--A----AA-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATC--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------GA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAGGCCATTC
gi|54756                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----TC-A--CAT--A------T-T-AC---A-----------------------A---T-A-TAT----CA----T-------ACA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----A--GC------AAA-----GT--GTCTGGCCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAC-A-T--AGATATAGCCATTC
gi|54757                      :                                             TA-GTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--ACATGTAT-T-AC---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----TTAC-A-A--T-T------TA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--TTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54758                      :                                             TA-GTTTTAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------TC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--ACATGTAT-T-AC---A-------A------T--------A---TTA-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----TTAC-A-A--T-T------TA-A-----T--GCA-----AAA-----GG--TTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54759                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--CA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------C-A----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--T----GTTTT--------C-ATA--AGATGCGACCATT
gi|54760                      :                                             TA-GTTTAACCA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-G-A--T-T------TA-A-----G--TCA-----AAA-----GG--GTCTGG-----------------------TCAAT-ATT--CGATGTGGCCATTC
gi|54761                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---G---TT-T---A-TTG-------TG-A-------TA-TC--A----AC-A--CAT--A------C-T-AC---A-------A------TCTGCGATTG---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----G--GTA-----AAA-----GG--GTCTGGCCATT-T--T----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54762                      :                                             TA-GTTAAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--ATTTGACCT-C-A--A----TTTCTC---CGAAC-ATT--AGATT
gi|54763                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-ATG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------C------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCC---------T-ATC--AG------T-----------C-A----ATAA-A-A--T-T------TA-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-A-A--C----GTTCTC---CCAAC-ATT--
gi|54764                      :                                             TA-GTT---ACA-TCGCA---TG-T--TA-CTG-------TC-A-------TA-TT--G----GC-A--CAT--A---------------------------------------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--TAT------TAGA-----G--GTA-----AAA-----GG--TTCTGGTTA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54765                      :                                             TA-GTT--AACAAT---A---TT-T--TA-TTG-------CC-G-------TA--A--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAG----TA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------AAA----ACAC-A-A--A-T------AT-A-----G--GCA-----TAA-----TG--GTCAGGCCA-C-A--A----GTT-TC---TCAAC-ATT--TGATTTAGCCGTT
gi|54766                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---C------A-T------------G-------TG-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----GG----T-------GCA---------T-ATA--TA------C-----------TAT----ATAC-A-G--T-T------AT-G-----G--GTA-----AAA-----GA--GTCTGACCA-C-A--A----ATTCTCATATTACC-ATT--AGATACGGTCATT
gi|54767                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---CA-T--TA-TTG-------CT-A-------TA-TA--A----AC-A--CCC--A------A-T-GC---G-------T------T--------A---T-A-TGC----TA----T-------GAA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TG-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCGGGCCA-
gi|54768                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-AATATATTTA-CA--A----AT-ATACAT--A------T-T-GC---AGGCAA--A------C--------A---A-A-AAA----CA----T-------TTA---------TTACA--AG-------------------AA----ATA----A--T-T---------A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTGCTC---ACCAC-ATT--A
gi|54769                      :                                             TG-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A------------------------------------------------------A------T--------A---T-A-TA-----CA----T-------GTA---------T-ATA------------------------------------------------------------GCA-----AAT-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC--TT--AGATTCGGCCCTTCtttgccat
gi|54770                      :                                             TA-GTTCGAACA-T---A---GT-T--TA-TTG-------CC-A-------TT-TA--A----GC-A--CAT--G------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAA----CA----T-------GCA---------T-ATA--TG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------AA-A-----G--GCA-----AAA-----
gi|54771                      :                                             TA-GTTTAGACA-T--------T-T--TA-TTA-------CC-AAA-----TA-TA--T----AC-A--CAT--A---------------A-------A------T--------A---T---TA-----CA----A-------ACG---------T-ACA--AG------G------------AA----CTA--A-A--T---------A-A-----A--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCG-C-A--A----GTGCTA---ACTAT-ATT--AGTTAAGGCCAT
gi|54772                      :                                             TA-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CT-A-------TA-TA--A-----C-A--CCC--A------A-T-GC---A-------T------T--------A---T-A-TAC----TA----T-------GAA---------T-ATA--AA------T-----------AAA----ATAC-A-A--T-T------TG-A-----G--GCA-----AAT-----GG--GTGGGGCCA-
gi|54774                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TTAAC-ATT--GGATTCGGCCATTC
gi|54775                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TG-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-AA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----
gi|54776                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-G-AC---T-------A------T--------A---T-A-AAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------AAA----ATAT------T-T------TA-C-----G--GCG-----AAA-----GA--GTCTTGCCA-C-A--A----ATTCTC---CCAAC-ATC--AGGTACGGCCTTTC
gi|54777                      :                                              A-GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--C----AC-A--TAT--A------T-T-AG---A-------T------T--------A---T-A-TAC----CA----T-------ACA---------T-ATA--AA------T-----------CAC----ATAC-A-A--T-T------CT-A-----A--GTT-----AAA-----GG--GT------A-------------TCTC---TTAAC-ATT--ATATACGGCTATTC
gi|54778                      :                                               -GTTTAAACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------AA-TA--A----AC-A--CAT--A------A-T-AC---A-------A------T--------A---T-T-TAG----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTG
gi|54780                      :                                                   TATACA-T---A---TT-T--TA-TTG-------CT-G-------TA-TT--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---ATATTATTA------TTA------G---T-A-TAT----TG----C-------GCG---------T-ATACGAG------T-----------CAT----ATAT-G-A--T-G------AT-A-----G--GTA-----AAG-----GG--GTCTGGCCA-C-A--C----GTTCTC---TCTAC-AGT--AGATGCGACAATTC
gi|54781                      :                                                   TGAACA-T---G---TT-T--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------C-T-AG---T-------A------T--------A---TTA-TAT----CA----TATGTTATGCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAT-A-A--T-T------TT-A-----G--GCT-----AAA-----GG--G
gi|54782                      :                                                   TAATCA-T---A---TC-T--AA-TTA-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--G------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TG----T-------GTATATCAATCCT-ATACGAG------TGTTGTGTATATCAATCCTATAC-G-A--G-T------GT-A-----G--GCA-----ATA-----TG--GTCTGGTCA-T-A--A----G--ACC---TCAAC-ATT--AAATACGAGCATTC
gi|54784                      :                                                     AACA-T---A---TT-G--TA-TTG-------CC-A-------TA-TA--A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------CA-A-----G--GCA-----AAA-----AG--ATCTGGTCA-C-A--A----GTTCTC---ACAAC-ATT--AGGTTTG
gi|54785                      :                                                     AACA-T---A---TG-T--TA-TT--------CC-T-------TG-TA--T----AC-A--CAC--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-AAT----TT----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CTT----ACAC-G-A--T-T------AC-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCTTGCAA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--AGATACGACCATTC
gi|54786                      :                                                     AACG-T---A---TG-T--TA-TT--------CC-T-------TG-CA--T----AC-A--CAC--A------T-T-AC---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TT----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CTT----ACAT-G-A--T-T------AC-A-----G--GCA-----AAA-----TG--ATCTGGCCA-C-C--A----GATCTC---TCAGC-ATT--
gi|54789                      :                                                                            TG-------TC-A-------TA-TA--A----AC-G--CAT-----------T-AT---A-------A------A--------AC--T-A-TAT----TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------C-----------CAA----ATGC-A-A--T-T------TT-A-----G--GCA-----AAG-----GG--ATTTGGCAA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGACACGGCCATT
gi|54791                      :                                                                                                 A-TA--A----AC-A--CAT-----------T-AT---A-------A------T--------C---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--TA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-T------TA-------G--GCA-----AAA-----TA--GTCTTGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54792                      :                                                                                                aA-TG--A----AC-A--AAT--A------T-G-AT---A-------T------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------AAA---------T-ATA--CA------T-----------CAA----ATAC-A-A--G-T------TT-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GTTCTC---TCAAC-ATA--AGATACGGCCATT
gi|54793                      :                                                                                                 A-TA--A----AT-A--CATTTA------T-T-AC---A-------T------T--------A---C-A-TAT----TG----T-------GAT---------T-ATA--AC------T-----------CAT----ATCC-A-A--G-TATGA--TA-ACTGTAG--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--G----GTTTTC---TCAA
gi|54794                      :                                                                                                  -TA--A----AC-A--TAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T---TATGA--TA----T-------GTA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----ATAC-A-A--T-A------TT-A-----G--ACA-----CAG-----GG--GGGTTGCCA-C-A--A----GATGTC---TCAAC-ATT--AGATACGGCCATCC
gi|54797                      :                                                                                                     --A----AC-A--CAT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-G-TAT----CA----T-------GCA---------T-ATA--AA------T-----------CAA----GTAC-A-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----AG--GTCTGGCCA-C-A--A----ATTCTC---TCAAA-ATT--AGATACGGCCATTC
gi|54798                      :                                                                                                              -A--CCT--A------T-T-AC---A-------A------T--------A---T-A-TAT----TA----T-------GCA---------T-ATA--AC------T-----------CAA----ATAC-A-A--C-T------TT-A-----G--ACA-----AAA-----GG--GTCTGGTCA-C-A--A----GTTCTC---TCAGC-ATT--TGATACG
gi|54799                      :                                                                                                                   AT--A------T-T-AT---A-------A------C--------A---T-A-TAC----CA----T-------GCA---------T-ATA--AG------T-----------TAA----ATAC-C-A--T-T------TA-A-----G--GCA-----AAA-----GG--GTCTGGCCA-C-A--A----GCTCTC---TCACC-ATT--AGATACGACCAT
gi|54800                      :                                                                                                                    T--A------T-TGAC---G-------A---------------A---T-T-TTT----CA----T-------TAA---------T-GTA--AA------T-----------CTT----ATAG-G-A--T-T------AG-A-----G--ACA-----AAA-----TA--GTCCGGTCA-C-C--A----GTGCTC---TCAGT-ATT--AAATACGGCCATTC
gi|54802                      :                                                                                                                     --A------T-T-GC---A-------A------T--------A---T-T-TGG----CC----T-------------------T-ATA---G------T-----------TAA----ATTT-T-A--T-T------TA-A-----T--ATATCATGAAATG---GG--GTCGGGCCA-C-A--A----GTTTTG---CCAAC-ATT--AGATCCGGCCCTTC
gi|54804                      :                                                                                                                                                                      -TAC----CA----T-------GC----------T-ATG--AG------------------CAT----GTGC-G-A--T-T------AT-A-----G--GCA-----AAC-----GG--GTCT--TCT-C-G--A----GTTCTC---TCAAC-ATT--AGATAAAGTCATTC
gi|54805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54806                      :                                                                                                                                                           tacgtttaaacatattttatttcaacatgaaatgCG---------T-ATA--AA------------------CAT----ATAT-A-AACC-T------TA-A-----G--ACA-----AAA-----GG--GTCTGACAA-C-A--A-------CTC---TCAAC-ATT--AAATACAGCTATT
gi|54808                      :                                                                                                                                                                                                                                                -A--T-T------TA-A-----C--ATG-----AAATG---GA--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCAGCC
gi|54810                      :                                                                                                                                                                                                                          taagcatatttt----ATA--A-A--T-T------TACA-----T--GAA-----ATG-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----ATTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54812                      :                                                                                                                                                                                                                                                tc--T-T------CA-A-----C--GTG-----AAATG---GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54815                      :                                                                                                                                                                                                                            catattttat----ATAC-A-A--A-T---------A-----GTAGCA-----AAA-----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAATCGGCCCTTC
gi|54816                      :                                                                                                                                                                                                                                           tAT-A-A--T-T------TT-A-----C--ATG-----AAATG---GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          CA-----AAA-----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTATC----CAAC-ATT--AAAACCGGCCCTTC
gi|54824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTTGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC
gi|54825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTG---CCAAC-ATT--AGATTCGGCCCTTC
gi|54826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54828                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---TCAAC-ATT--AGGTTCGGCC
gi|54829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----GG--GTTGGGCCA-C-A--A----GTTCTT---CCAAC-ATT--AGATTCGGCC