lowQualScore : 111111 2222222222222 1
lowQualScore : 8 0 0 22 22222 11 0 0 11111 11111 00 66 000 7777 00 0 0 0 0 0 33333333 0 11 222222 111111 0 0 0 22 0 111111 00 0 0 0 111 00 999 111 0 4444 1111 11111 6666666666666 0 11 0 0 0 11 11 4
lowQualScore : . . . .. ..... .. . . ..... ..... .. .. ... .... .. . . . . . ........ . .. ...... ...... . . . .. . ...... .. . . . ... .. ... ... . .... .... ..... ............. . .. . . . .. .. .
lowQualScore : 5 5 5 33 44444 00 4 4 11111 11111 66 22 777 7777 66 4 4 4 4 8 22222222 4 00 222222 666666 4 4 4 22 4 222222 66 4 4 4 111 66 111 111 8 1111 4444 66666 3333333333333 4 22 4 4 5 22 44 1
consensus : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--A---GAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-GG-TTT--T-GGAGTTGT
Reference ( gi|59273 ) : AACAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-TTC---A--C-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--T---GAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAG--A---GTT-TC-A--T----G-----A---T--TT-TG--CC-T--T-GAAC-GG-TTT--T-AGATTTGT
gi|59281 : AACAATAT-GT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T-------AC------AA-CTT-AT-G-GT------TG--A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---T--GT-TA--CC-T--T-GAAC-AA-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59284 : aAACAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-TTC---A--A-A--GC-A-AA-A-A-TAA--------C-TAC--T--T---GAC------TA-C-T-A--G-AC------AG--A-C-AT-A---TATA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---A--AC-AA--CC-T--T-GAAC-AG-TTT--T-AAATTTAT
gi|59296 : AAAAA-AT--T--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--C-A--GC-A-GA-A-G-GCA--------C-TAG--A--T---GAT------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ACT-TC-A--C----A-----A---A--AT-TA--TC-T--T-GAAC-AG-TTT--
gi|59283 : AAGAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-TA-A-----A-----ACTC--C-TTC---A--C-A--GC-A-AA-A-G-GAA--------C-TAC--T--A---GG-------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TC-G--T----GAAGTTA---T--TT-TGAAC-------GAAC-GG-TTT--T-GGAGCTGTaaagttat
gi|59318 : AACAA-AT-AT--A-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--A-CTC---G--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------A-TAC--T--T---GAC------CA-C-T-A--T-GT------TG--A-C-AT-G---TTGA--CAA--A---GTT-TC-A--T----T-----A----------A--AC-T--T-GAAC-AG-TTT--T-AAA
gi|59298 : AACAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-AA-A-----A-----ACTC--C-CTC---T--T-T--GC-A-AA-A-G-ACA--------C-TAC--C--A---GAT------CG-C-T-A--G-GC------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TT-T--T----T-----A---A--GT-TA--CC-T--A-GAAT-GG-TTT--T-AGagttat
gi|59280 : AAAAA-AT-ATGTT-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ATTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TTC--T-------AC------AA-C-TCAT-G-GT------TG--A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TT-G--T----T-----A---T--GT-TA--CC-T--T-GAAC-AA-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59279 : AAAAA-AT-GT--T-----GACAA--T-AA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-ACGCA--------T-TAC--T--A---GGC------CT-C-C-A--G-GT------TG--G-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAT-GG-CTT--T-GTAGTTGT
gi|59301 : AAAAA-AT-ATAGT-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--C-CTC---A--T-A--CC-A-AA-A-G-ACA--------C-TAC--T--A---GAC------CA---T-AT-G-GT------TG--A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---T--GT-TA--CT-T--T-AAGC-AG-TTT--T-GGA
gi|59286 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAC--T-GG-A-----A-----ACTT--C-C-C---A--T-A--GT-A-AA-A-G-GCA--------C-TGC--T--A---GGC------CT-C-T-T--G-GT------TA--A-T-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAGT-GG-TTT--T-AGAGTCGTat
gi|59306 : AACAA-GT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTCAAC-TCCGTTA--C-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------T-TAC--T--T---GAC------CA-C-T-T--A-TT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAATTAAATGTT-TC-A--T----A-----A----------A--AC-T--T-AAAC-AG-TTT--T-A
gi|59274 : AACAA--T-AT--T-----GAAA---T-GA-C-----A-----ACTC--T-CCC---A--T-ATAGC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--A---GAT------CA-C-C-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---CATA--CAA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAA-AA-TTT--T-GGAaggttat
gi|59289 : aAAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--T-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-ACA--------C-TTC--T-------ACT-----CA-G-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAC--AT--TTT-TT-G--T----G-----C---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-AG-TTT--C-GGAGTTg
gi|59282 : AAAAA-AT-GT--T-----AACAA--T-CA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-ACGCA--------T-TAC--T--A---GGC------CT-C-C-T--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAT-GG-CTTCGT-AG--TTGT
gi|59302 : AACAA-AC-AC--G-----GAAAA--T--A-A-----A-----ACTA--C-CTC---A--T-A--GC-A-AT-A-G-GCA--------C-TAC--T--T---GAC------TA-C-T-A--G-AT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--
gi|59275 : AAAAA-AT-AG--T-----AAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-TCA---A--A-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------T-TAT--A--A---GAC------CA-C-T-T--G-GTTGGCGGTG--A-C-AT-G---TGTG--TAC--A---GTT-TT-G--C----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-AG-TTT--T-GGAGTTGTcaagaaaacagttttgaagtt
gi|59305 : AAAAA-TT-AT--T-----CAAAT--T-GA-A-----A-----ACTC--C-TTT---A--T-A--GC-A-AG-C-T-GCA--------T-TAC--T--A---GAT------TA-C-A-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TT-G--T----T-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAT-GG-TTT--T-AGAGTTGT
gi|59287 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-G-----A-----ATTC--C-TTG---A--T-A--AC-A-AA-T-G-GCA--------T-TAC--T--A---GAC------AA-C-T-A--G-TT------TA--A-T-AT-T---TGTA--CAA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---A--GA-TA--CC-T--T-GAAT-CC-TTT--T-AGAGTTGT
gi|59315 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-AA-A-----A-----ACTC--A-ATC---A--A-A--CC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--T---CAC------CA-T-G-A--G-GT------TG--A-T-AT-G---TGAA--CAA--C---GTT-TT-G--T----G-----A---A--GT-GA--CC-T--T-GAAA-GG-ATT--T-GGAATTAT
gi|59316 : AAAAA-AC-AT--T-----TAAAA--T-GA-T-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-A-A--------C-TAC--T--A---GAC------CA-C-T-A--A-GT------TG--A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GGT-TC-A--T----T-----A---C--GT-TA--TC-T--TAGAA
gi|59319 : AATAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GT-A-----T-----AGTC--C-CTC---A----A--AC-A-AA-ATG-GCAA-------T-TAG--T--T---CAC------CT-C-T-A--T-GT------TG--A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---A--GT-T---CT-T--T-GAAC-AG-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59300 : AAAAA-AA-AA--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----A-TA--C-CCC---A--TTA--GC-A-AT-A-G-A-A--------C-TAC--T--A---GAT------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-A---TGTA--CAA--C---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CT-T--T-GAAC-AG-TTT--T-GGAGTT
gi|59323 : AAAAA-GC-AT--T-----AAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--C-A--GC-A-AA-A-T-GCATTT-----C-TACA-T--T-----T------CA-G-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-T-----T----G---------T--T------CC-T--T-TAAT-GG-GTT--
gi|59320 : AAAAA-GT-AT--T-----TAAAA--T-GG-A-----A-----ACTC--C-TAA---A--T-A--GC-A-AA-A-G-TCT--------C-TGC--T--A---GAA------CA-C-T-A--G-AT------TG--A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---ggagtt
gi|59278 : AACAA-AC-GC--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GA-A-AA-A-G-GCA----------TAT--A--A---AAC------CA-C-T-A--G-AT------TG--T-G-AA-G---TGTA--CAA--A---GTT-C-----T----G-----G---TAAAT-TA--TC-T--T-GAAC-GG-TTT--C-GGAATTATagttacc
gi|59288 : AAAAA-AT-TT--T-----GAAAA--T--A-A-----A-----ACTC--A-ATC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA-----------AC--T--T---CAC------TA-T-C-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-AA--CC-T--T-G
gi|59304 : AATAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-AA-A-----A-----AGTC--C-CTC---A--T-A--GCAA-AA-A-A-GCAAT------C-TAC----------A-------CA-G-T-C--G-GT------TG--A-A-AT-G---TGTA--CAA--A---AAT-TT-G--T----G-----C---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-GG-TTT--TGAGGT
gi|59326 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-C-----A-----ACTC--G-CTC---A--C-----C-A-AA-A-G-GCA--------C-TAA--T--A---GAC------CA-C-G-C--G-GC------TG--A-C-AT-A---TGTA--AAA--C---ATT-TC-G--T----G-----AAG-T--TT-T----C-TAAT-GAAT-GG-T
gi|59312 : AAAAA-AC-AT--T-----GAGAA--T-GA-A-----A-----ACTT--C-CAA---A--T-A--GC-A-AA---G-GCA--------C-TAC--A--A---TAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TATG--CA---A---GTT-TT-T--T----A-----A---A--GT-AA--CT-G--T-GAAC-AC-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59307 : AAAAA-AT-AT--T-----AATAA--T-GA-A-----A-----ATTT--C---C---AAGT-A--GC-A-AT-A-C-ACA--------C-TTC--T--G---GAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-T---TGTA--TAA--A---GTT-TA-G--C----A-----A---A--TG-TA--CC-T--T-GAAT-GA-TTT--
gi|59329 : AAAAA-AT-AT--T-----GGTAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CAC---A--T-A--GC-A-AA-A-T-GAA--------C-TAC----------AC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT------------------------------T----G-----A---G--TT-TA--CT-T--T-GGAC-GG-TTT--T-
gi|59356 : AACAA--T-AT--T-----GAAAG--T-GA-A-----T-----ACGC--C-ATC---A--T-A--CC-A-AA-A-G--TA--------C-TAC--T--A---TAC-------A-T-G-A--T-GT------TG--A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TC-C--T----C-----A---T--GT-TA--AC-T--T-CAAT-AG-TTT--T-AGAGTTATgcagtt
gi|59355 : AACAA--T-AT--T-----GAAAG--T-GA-A-----T-----ACGC--C-ATC---A--T-A--CC-A-AA-A-G--TA--------C-TAC--T--A---TAC-------A-T-G-A--T-GT------TG--A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TC-C--T----C-----A---T--GT-TA--AC-T--T-CAAT-AG-TTT--T-AGAGTTAT
gi|59321 : AAAAA-AA-AT--T-----GAAAA--T-AA-A-----A-----ACTT--T-CCC---A--A-A--GC-A-AA-A-T-GCA--------A-TTT--TGTT---GAC-------A-T-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--TAA--A---GTT-TT-G--T----C-----A---G--GT-TA--AC-T--C-GAAC-AG-TGT--T-
gi|59327 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAAC-T-GA-A-----G-----ACTA--C-ATC---A--T-G--GC-A-AA-A-G-AAA--------C-TTC--T--A---GAC------CA-T-T-A--C-GT------TA--A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-T--G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-
gi|59295 : AAAAA-AT-ATA-T-----TTAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CCA---A--C-A--CC-A-AA-A-G-GCA--------C-TGGGGT--T---G---------------------T------TG--A-C-AT-G---TCTA--TAA--A---GTT-TT-A--T----G-----C---A--GT-TA--TC-T--T-GAAC-AGTTTT--T-AGAGTTGT
gi|59303 : AAAAA-AA-AA--T-----GAAAA--T-AA-A-----A-----AAAT--C-CTC---A--T-A--TC-A-AA-A-G------------T-TAC----------AC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTG--CAA--A---ATT-GT-G--T----T-----A---A--GT-TA--CT-A--T-GAAT-GG-TTT--T-AGA
gi|59325 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--A-GGTA-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GTG--------T-TAC--T--A---GAT------CA-G-C-A--G-G---------------AT-G---TGCA--CAA--C---ATT-TC-C--T----G-----A---A--GT-CA--CC-T--G-GAACTGA-TTT--G-AGgtagt
gi|59317 : AAAAA-AT-AA--T-----AATAT--T-GA-A------------CTC--C-CTC---A--T-A--TC-A-AA-T-G-GAA--------C-TAC--A--A---GGC------CA-C-T-A--G-GT------AA--A-C-ATAA---TGTT--CAA--T---GTT-TC-A--T----G-----A---A--GT-TG--TC-T--T-GAAC-Gttat
gi|59308 : AAAAA-AT-A----------AAAA--T-TA-A-----A-----TCTC--A-ATC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-ACATGTGTACAC-CAC--T--A---TAC------TA-C-C-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---AGTA--CAA--A---GAT-TC-G--T----G-----A---A--GT-AA--CT-A--T-AATC-GG-TTT--T-ttatgaagt
gi|59299 : AAAAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CCC---A--T-A--GC-A-AA-A---------------------T--T------------CA-C-A-A--A-G------------------G---TGTA--CAA--A---GCT-TT-G--T----G-----A---A--GT-AA--CTGT--G-GAAT-AG-TTT--T-GGAg
gi|59337 : AA-AT-AT--T-----GAAAA--C-GA-A-----A-----ACTC--A-CTC---A--G-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAA--A--A---GAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---A--GT-TA--CC-G--T-GAAC-GA-TTT--C-AGAgatgt
gi|59277 : aaAA-AA-AA--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACCC--C-TTC---A--T-A--AC-A-AA-A-G-TCA--------C-TAC--T--A---GAC------CA-G-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-GT-GTT--T-GGAGCTGTgccgt
gi|59371 : AA-GT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----GCTC--C-CAA---A--T-A--GA-A-AA-A-G-GCA--------A-TAC--T--G---GAC------TA-T-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--T----GAA---A---T--TT-T----C-T--T-AAAG-GA-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59359 : AA-AT-GT--T-----GAAAA--T-TA-A-----A-----ACTT--C-CCT---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--T---AAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-T-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---A--GT-T----------------GG-CTT--T-AGAGTTGT
gi|59360 : aAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----CCTT--C-GCC---A--C-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-AAC--C--A---GAT------CA-T-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAC--A---GT--------T----A-----A---T--T---------T--T-AAAC-AG-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59372 : aAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--T-CCC---G--C-A--GC-A-GA-A-G-GCA--------C-------------GAT------CA-T-T-A--G-GA------TG--T-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----T-----A---A--GT-TA--CA-T--T-GAAC-GG-TTT--T-GTAGTTGT
gi|59349 : AA-AT-AA--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACAC--T-CTC---A--T-A--TC-A-AA-C-A-GCA--------C-TAT--T--C---GAC------TA-C-T-A--G-GT------TG--A-T-AT-G---TGT---CA---A---GTT-TT-A--T----G-----A---A--GA-TG--TC-T--T-GAAC-GG-TT
gi|59348 : aaAA-AT-AA--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACAC--T-CTC---A--T-A--TC-A-AA-C-A-GCA--------C-TAT--T--C---GAC------TA-C-T-A--G-GT------TG--A-T-AT-G---TGT---CA---A---GTT-TT-A--T----G-----A---A--GA-TG--TC-T--T-GAAC-GG-TTatg
gi|59343 : aaAA-AT-GT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--T-CTC---A--T-A--GC-A-AA-C-G-GCA--------T-TTC--T--G---GGC------CA-C-T-A--G-GT------TT--A-C-AA-T---TATA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---G--GT-TA--CC-T--T-GAAG-AG-TTatg
gi|59351 : aaAA-AT-AA--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACAC--T-CTC---A--T-A--TC-A-AA-C-A-GCA--------C-TAT--T--C---GAC------TA-C-T-A--G-GT------TG--A-T-AT-G---TGT---CA---A---GTT-TT-A--T----G-----A---A--GA-TG--TC-T--T-GAAC-G---TT--T-Aacgga
gi|59352 : aaAA-AT-AT--T-----TAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-TTT---G--T-A--GT-A-AA-A-T-GCT--------C-TAC--T--A---AAC------TA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CA---A---ATT-TT-G--T----G-----A---tg
gi|59285 : aaAA-AT-ATA-T-----TAAAA--T-TA-A-----A-----TCTC--T-CTC---A--T-A--CC-A-AA-A-G-GCA--------C-CAC--T--A---GAC------CT-T-G-A--A-GT------TG--A-C-AC-G---TTTA--CAA--A---GTA-TC-C--T----G-----A---T--GT-TA--CA-T--T-GGAC-GG-TTT--T-Aagtt
gi|59368 : aAA-AT-AT--T-----GAAAG--T-AG-A-----A-----AATC--C-CCA---G--T-A--GG-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--T---TAC------CA-C-T-A--G-GT------TC--A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CA-T--T-TAAC-cagt
gi|59367 : aAA-AT-GT--T------------T-GA-A-----A-----AATT--C-CTC---A--T-A---C-----------CA--------C-TAC--T--A---GAC------CA-T-A-A--G-GT------TG--A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TC-C--T----G-----A---T--AT-TA--CC-T--T-GAAT-TG-TTT--T-AGAGTTGT
gi|59373 : aAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----CCTT--C-CCA---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAA--C--A---GAC------AA-C-C-C--G-GT------TG--T-C-AT-A---TGTA--CAC--A----TT-TC-G--T----A-----A---A--GT-CA--CC-T--C-GAAC-AG-TTT--T-GGTGTTGT
gi|59338 : AA-AT-AT--T-----TAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--G-CCC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCC--------A-TTC--T--G---GAC------CA-C-T-A--T-GT------TG--A-C-AT-T---TGTATGCCG--C---GTT-TC-A--T----G-----A---A--GT-GA--CC-T--T-GAAT-AC-TTT--T-
gi|59341 : aaAA-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACT------TA---A--T-A--GC-A-AA-A-T-AGA--------T-AAC--T--A---GAT------TG-C-A-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGCA--C----A---GTT-TC-A--T----G-----A---A--AT-TA--CC-T--T-GAAT-AG-TTC--T-
gi|59340 : aaAA-AT-AC--T-----GACAA--T--A-A-----A-----ACTC--C-TCC---A--T-A--TC-A-AA-A-T-ACA--------C-TAC--T--A---GAC------CA-C-T-A--G-GT------AA--A-C-AT-G---TGTA--TTA--A---GTT-TC-T--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--gtagttat
gi|59350 : aaAA-AT-AC--T-----GACAA--T-AC-A-----A-----ACAC--A-TCC---A--T-A--GC-A-AA-A-A-AAT--------C-TAC--T--G---GAC------CA-C-T-T--G-GT------AA--A-C-AA-G---TGTA--CAC--A---GTT-TC-T--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-TAAT-GG-TTT--T-GGAGTTGgctacatctttggggttgt
gi|59361 : aaAA-ATGAT--T-----GATAA--T-GA-A-----T-----ACTC--C-CTC---A--T-G--TC-C-AA-A-G-TAA--------C-TAC--T--T---GAA------TA-C-T-A--G-GT------CA--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--TAAAAG-----G---T--TT-TG--
gi|59364 : aAA-AT-AT--TCATAAGGAAA--G-GA-A-----A-----GCTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-TAA--------C-TAC--T--T---GAC------CA-C-T-T--T-GT------TG--T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TC-A--T----G-----A---T------------------A---GG-TTT--T-AGAGTTaagtggt
gi|59363 : aAA-AT-AT--TCATAAGGAAA--G-GA-A-----A-----GCTC--C-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-TAA--------C-TAC--T--T---GAC------CA-C-T-T--T-GT------TG--T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TC-A--T----G-----A---T------------------A---GG-TTT--T-AGAGTT
gi|59342 : aAA-AT-AC--A-----GACAA--T--A-A-----A-----ACCC--CATCC---A--T-A--GC-A-AA-A-T-ACA--------C-TAC--T--A---GAC------CA-C-T-A--G-AT------AA--A-G-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-T--T----A-----A---A--GT-TA--CC-T--G-TAAC-GG-CCT--T-GGAGTTAT
gi|59353 : aaAA-AT-GT--T-----CAAAA--T-GA-G-----A-----TCAC--C-CTC---A--G-A--TC-A-GA-A-G-TCA--------C-TAC--T--A---GAT------TA-C-T-A--G-GT------TC--A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---
gi|59362 : aaAA-AA-AC--T-----GAAAC--T-GA-A-----A-----TCTC--T-CTC---A--T-T--GC-A-AA-A-T-GCA--------C-TGT--A--A---GAC------TA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---CATA--CA---A---ATT-TT-AGTT----G-----A---G--TTATT--TC-T--T-AAA--AG-TTT--T-GGAGTTATa
gi|59344 : A-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--T-CTC---C--T-A--GA-G-AA-C-G-GCA--------C-TAC--T--G---GCC------CA-C-T-A--G-GT------TT--A-C-AT-T---TATA--CAA--A---GAT-TC-G--T----T-----A---G--GT-TA--CC-T--T-AAAC-AG-TT
gi|59376 : aagA-AC-AT--T-----AAAAAAAT-GA-ATATTGA-----ACTC--C-CTC---A--T-A--CC-A-AA---G-GCA--------C-TTC--A--G---GGT------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-CAAT-A---TGTG--CAA--A---ATT-TC-A--T----G-----A---A--GT-TG--TA-T--T-GAAT-Gcggga
gi|59294 : -AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----ACTAAAACAT--C-CTC---A--T-A--GC-T-AA-A-G-ACA--------C-TAC--T--A---CAC------CA-T-T-A--G-GT------TG--G-C-AT-G---TGTA--C----A---GCT-TT-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-AG-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59291 : aaaac-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ATGC--C-CTC---A-------GC-G-AA-A-G-GCA--------C-TAC--A--A---CAT------AA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---A--AC-TA--TC-T--T-G-AC-AC-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59310 : aaaac-AT-AT--T-----AAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC-----TC---A--T-A--CC-A-AA-A-G-GCA--------C-TTA--T--A---TAT------CA-C-A-A--G-GT------TA--A-C-AT-G---TGCA--CAA--A---GTT-TC-A--T----A-----A---T--GC-TG--CC-T--T-GAAC-AG-CT
gi|59292 : aaagt-AT-AT--T-----AAAAA--T-GA-A-----A-----ATTC--T-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-TCA--------C-AAC--T--A---AAC------CA-A-T-A--G-GA------TG--A-C-AT-A---TGTC--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----AAGTT--TC-TG--TC-------AAC-AG-TTT--T-TGAGTTGTatctgga
gi|59313 : aaaat-AT-AT--T-----GTAAA--T-AA-A-----A-----ACTC--C-CTC---A--T-A--TT-A-AA-T-G-GCG--------C-TAC--T--A---GAC------CA-T-G-A--T-GT------TG--G-C-AT-G---TGTG--GAA--A---GTCATC-C--T----G-----A---T--GT-TA--CC-T--T-GAAT-AG-TTT--T-GAAGTTGT
gi|59297 : aaaat-AT-AT--C-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-C-C---A--T-A---C-A-AATA-G-GCA--------C-AAC--T--A---GAC------CT-A-T-A--A-GA------TG--A-C-AT-A---TGT---TAA--A---GTT-TA-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-GAAC-AG-TTT--T-AG--TTGT
gi|59378 : aaaat-AT-TT--T-----GAAAA--G-GA-A-----A-----ACCC--C-TTA---A----A--CC-A-AA-T-A-GCA--------C-TAC--T--A---GAC------CA-T-G-A--T-GT------TG--A-C-AA-G---TGCA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A------AT-TA--CC-T--T-GATC-GG-ATT--T-TGAGCTGT
gi|59347 : -AT-AT--T-----AGAAA--T--A-G-----A-----ACTC--C-ACA---A--T-A--GT-A-AG-A-G-GCA--------C-TAT--T--A---GAC------CA-C-T-AA-G-GT------TG--A-C-AT-G---TATA--TAA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--C-AAAC-AT-TTT--T-
gi|59377 : aaac-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--C-CCC---G--A-A--GC-A-AA-A-T-ACA--------C-TAC--C--A---GAT------CA-C-T-A--GAAT------TG----C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-T
gi|59322 : -AT-AT--T-----GAAAA--TTGA-A-----A-----TCTC--C-CTA---A--A-A--A--A-AA-A-G-GCA--------CATAA--T--TATAGAC------TG-T-G-A--G-GT------TA--A-C-AT-G---TGAA--CTG--A---GTT-TC-G--T----G-----A---T--GT-CA--CC-A--T-GAAC-AG-TTT--T-TGA
gi|59379 : aaaat-AT-AT--T-----GAAAA--T-GA-A-----A-----ATTC--T-CTC---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TTC--T--A---GTC------CA-T-G-A--T-GT------TGTCA-C-AT-G---TG------------------------------------------T-TA--CC-T--T-GAAT-GG-TTT--T-GGAGTTgt
gi|59382 : T-AT--T-----CAAAA--T-GA-A-----A-----ACTC--T-ATC---A--T-A--CC-A-AA-A-T-ACA--------C-TAC--C--A---GAT------CA---T-G--G-GT------TG--T-C-GT-T---TGTA--CAG--C---ATT-TC-G--T----G-----A---T--GT-TA--CC-A--T-AAAC-GG-TTT--C-CGAGTTGT
gi|59384 : -AT--T-----GATAA--G-AA-A-----A-----GCCC--A-CTT---G--G-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--A---GAC------TA-C-T-T--G-G-------TG--ATC-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TC-G--T----G-----A---G--GT-AA--TC-T--T-GAAC-GG-TAT--T-AGAATT
gi|59385 : -AT--T-----AATAT--T-GA-A-----A-----ACTC--T-CTC---A--T-A--GC-ATAA-A-G-GCA--------T-TAA--T--A---GAC------CA-T-T-A--G-GT------TG--A-C-AA-GT--TATG--TGA--A---GTTATC-------------------T--AT-TA--TC-T--T-GAAT-GA-TTT--T-GGAGTT
gi|59387 : T--T-----GACAA--T-GA-A-----A-----ACTC--C-CAA---A--T-A--GT-A-AA-A-G--TA--------C-TAC--T--T---TAT------CA-C-T-G--A-AT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--T---CTT-TCTT--T----G-----A------AT-TA--TC-T--C-GAAC-GG-GTT--T-
gi|59389 : -----GAAAA--T-GA-A-----G-----ACTC--C-CGT---A--T-A--TC-A-GT-G-G-GCT--------C-TAC--T--A---GGC------CA-T-T-A--A-GA------CA--A-C-A--G---TATA--CAA--A---GAT-TT-A--T----G-----A---A--GT-TA--AC-TAAT-GAAC-AG-TTT--T-GGAg
gi|59324 : AAGA--A-GA-A-----A-----ACTT--C-ATC---A--T-A--CC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--A---AAT------CA-T-T-A--G-TT------TG--A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---GTT-TC-A--T----G-----A---T--GG-CG--CC-T--T-TAAC-GG-CTT--T-GGgtggt
gi|59390 : aaaaaaAAAA--T-GA-A-----A-----ACTT--C-CTC---A--T-A--CA-A-AA-A-G-GCA--------T-TAC--T--A---GAC------CA-T-T-A--G-TT------TG--A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---ATT-TT-G--T----G-----A---------TA--CC-G--G-TAAC-GG-TTT--T-GG
gi|59345 : AAA--T-GA-A-----A-----ACTC--T-GCC---A--T-A--GC-A-AA-A-G--CA--------T-AAC--T--G---GAA------CAAC-T-ATAG-AT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ATT-TC-G--T----G-----A---A--GT-CA--CC-T--T-AAAT-GG-TTT--T-GGAGTTGT
gi|59392 : aaacatattgaatggaaaatAA--T-GA-G-----A-----ACAC--C-CTT---G--T-A--GC-A-AC-A-A-GCA--------C-TGC--T--A---AAC------CA-C-T-A--G-TA------CA--A-C-AT-G---TGTA--CCA--A---GTT-TT-G--A----G-----A---A--GA-AA--CC-A--T-GAAC-GG-TTT--T-
gi|59290 : A--T-TA-A-----A-----ACGC--C-ATC---A--T-A--AC-G-AA-A-T-AAA--------C-TTC--T--T---GCT------CA-C-C-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--TT-TA--TC-T--T-GAAC-CG-TTT--T-GAAGTTATg
gi|59339 : aaaaagtA--T-AA-A-----A-----ACTT--C-CAC---A--T-A--TC-A-AA-A-A-GTA--------C-TAC--T--A---G-T------TG-C-T-A--G-AT------TT--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---A--GT-TA--CA-A--T-GAAA-GG-CTT--T-GGAGTTGT
gi|59394 : aaaagtactacA--T-GG-A-----A-----ACTC--C-ACC---A--T-A--GC-A-----------------------C--T--T---GACGAGAGGCA-C-T-A--G-GT------TG--G-C-AT-G---TGTG--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--CT-TA--CC-T--G-AAAT-GG-TTG--T-GGAGCTGT
gi|59397 : A-A-----G-----ATTC--C-ATT---G--T-A--CC-A-AA-T-A-ACA--------C-TAC--T--A---GAT------CA-T-C-G--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TT-G--T----G-----A---T--GT-TA--CC-T--T-GAAC-G
gi|59399 : -----A-----ACCC--C-T-C---A--A-G--GC-A-AA-A-C-GCA--------C-TAC--T--T---GAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GGT-TC-A--T----G-----A---A--AT-TA--TC-T--T-GAAC-AT-TTTG-T-AAAGTTATttccgga
gi|59400 : -----A-----ACTC--C-TCA---A--T-A--GC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--T--T---AAC------CA-C-C-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TATA--TGA--A---GTT-TT-G--T----G-----A---T----------A-T--T-AAAC-AG-TTG--T-AAA
gi|59405 : -A--AC-A-AA-A-G-GCA--------C-TAC--C--A---GAT------GA-C-T-A--G--T------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TT-G--TAA--G-----A---T--AT------C-T--T-AAAC-AG-TTgt
gi|59409 : A-A-G-GCA--------C-TAC--A--A---GAC------TA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-GTGATGTA--CAA--A---GTT-TC-A--T----------A---C--AG-TGA-CC-T--A-GAAC-AG-TTT--T-aaggagtt
gi|59410 : C--T--A---GAC------CA-C-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-T---GGTA--CAA--A---GTT-AC-A--T----G-----A---A--AT-TA--CC-T--T-AAAG-GG-TTT--T-GGAtggagtagt
gi|59411 : ---GAC------CA-A-T-A--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-A--T----G-----A---A--AT-TA--CC-T--T-GAAT-GG-TTT--T-
gi|59413 : ta--G-GT------TG--A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TC-G--T----G-----A---A--GT-TA--CC-T--T-AATC-AG-TTT--T-GGAGTTATg
Alignments
lowQualScore : 0 22 22222 111111111 11 0 0 11111 11111 0000 0 0 0 00 0 0 0 1 11111111 11111 00 00 000 00 0 0 0 0 22 0 111111 0 0 0 000 00 00 111 0 1111111 00 0 11 1111 0 00 0 00
lowQualScore : . .. ..... ......... .. . . ..... ..... .... . . . .. . . . . ........ ..... .. .. ... .. . . . . .. . ...... . . . ... .. .. ... . ....... .. . .. .... . .. . ..
lowQualScore : 5 33 22222 888888888 00 4 4 11111 11111 9999 4 4 4 66 4 4 4 2 55555555 00000 66 66 777 66 8 4 4 4 11 4 111111 4 4 4 777 55 55 111 4 3333333 66 4 11 3333 9 66 4 66
consensus : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
Reference ( family-231 ) : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59273 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAG--A---GTT-TCATGATT-------TTG--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-A--GATTTGT
gi|59274 : AAACAAT-AT--T-----GAA---------A---T-GA-C-----A-----ACTC----TC-CC-AT-ATAGCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---CATA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAAAAA-T--TTT-G--GAG
gi|59275 : AAAAAAT-AG--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-CA-AA-A--GCA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ATAA--G---A--C-CA-C-T-T--G-GTTGGCGGTGA-C-AT-G---TGTG--TAC--A---GTT-TTGCGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59277 : AAAAAAT-----------GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACCC----CT-TC-AT-A--ACA-AA-A-G-TCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGT-G--TTT-G--GAGCTGT
gi|59278 : AACAAAC-GC--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GAA-AA-A-G-GCA--------------T--ATAA--A---A--C-CA-C-T-A--G-ATTG------T-G-AA-G---TGTA--CAA--A---GTT-CTGGTAAA-------TTA--TC-T--T----GAACGG-T--TTC-G--GAATTAT
gi|59279 : AAAAAAT-GT--T-----GAC---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-ACGCA--------T-----T--ACTA--G---G--C-CT-C-C-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-C--TTT-G--TAGTTGT
gi|59280 : AAAAAAT-ATGTT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCT-------A--C-AA-C-TCAT-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TTGTTATG-------TTA--CC-T--T----GAACAA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59281 : AAACAAT-ATGTT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACT-------A--C-AA-CTT-AT-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCGTGATG-------TTA--CC-T--T----GAACAA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59282 : AAAAAAT-GT--T-----AAC---------AA--T-CA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-ACGCA--------T-----T--ACTA--G---G--C-CT-C-C-T--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-C--TTC-G--TAGTTGT
gi|59283 : AAGAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-TA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AC-A--GCA-AA-A-G-GAA--------C-----T--ACTA--G---G--C--A-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TCGTGAAG-------TTA--TT-T--TGAACGAACGG-T--TTT-G--GAGCTGT
gi|59284 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AA-A--GCA-AA-A-A-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-TA-C-T-A--G-ACAG------A-C-AT-A---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------CAA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-A--AATTTAT
gi|59285 : AAAATAT-AT--T------AA---------AA--T-TA-A-----A-----TCTC----TC-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----C--ACTA--G---A--C-CT-T-G-A--A-GTTG------A-C-AC-G---TTTA--CAA--A---GTA-TCCTGATG-------TTA--CA-T--T----GGACGG-T--TTT-A--CAGT
gi|59286 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AC--T-GG-A-----A-----ACTT----CC--C-AT-A--GTA-AA-A-G-GCA--------C-----T--GCTA--G---G--C-CT-C-T-T--G-GTTA------A-T-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAGTGG-T--TTT-A--GAGTCGT
gi|59287 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-G-----A-----ATTC----CT-TG-AT-A--ACA-AA-T-G-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--C-AA-C-T-A--G-TTTA------A-T-AT-T---TGTA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------ATA--CC-T--T----GAATCC-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59288 : AAAAAAT-TT--T-----GAA---------AA--T--A-A-----A-----ACTC----AA-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA-----------------ACTT--C---A--C-TA-T-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TAA--CC-T--T----
gi|59289 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--TCT-------A--CTCA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAC--AT--TTT-TTGTGCAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTC-G--GAGTT
gi|59290 : AAAAAGT-AT--T------------------------A-A-----A-----ACGC----CA-TC-AT-A--ACG-AA-A-T-AAA--------C-----T--TCTT--G---C--T-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAT-------TTA--TC-T--T----GAACCG-T--TTT-G--AAGTTAT
gi|59291 : AAAACAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATGC----CC-TC-A-----GCG-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACAA--C---A--T-AA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------CTA--TC-T--T----G-ACAC-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59292 : AAAATAT-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TCA--------C-----A--ACTA--A---A--C-CA-A-T-A--G-GATG------A-C-AT-A---TGTC--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTT--CT-G--T----CAACAG-T--TTT-T--GAGTTGT
gi|59294 : AAAACAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----ACTAAAACAT----CC-TC-AT-A--GCT-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACTA--C---A--C-CA-T-T-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTA--C----A---GCT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59295 : AAAAAAT-ATA-T-----TTA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-CA-AC-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--G--G--G---G--T-T-----------GTTG------A-C-AT-G---TCTA--TAA--A---GTT-TTATGCAG-------TTA--TC-T--T----GAACAGTT--TTT-A--GAGTTGT
gi|59296 : AAAAAAT--T--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AC-A--GCA-GA-A-G-GCA--------C-----T--AGAT--G---A--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ACT-TCACAAAA-------TTA--TC-T--T----GAACAG----TTT-A--AAGTTAT
gi|59297 : AAAATAT-AT--C-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC--C-AT-A---CA-AATA-G-GCA--------C-----A--ACTA--G---A--C-CT-A-T-A--A-GATG------A-C-AT-A---TGT---TAA--A---GTT-TAGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-----AGTTGT
gi|59298 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-TT-T--GCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CG-C-T-A--G-GCTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTTTTAAG-------TTA--CC-T--A----GAATGG-T--TTT-A--G
gi|59299 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-CC-AT-A--GCA-AA-A-T-TCA--------C-----A--A--A--G-------------------------------------G---TGTA--CAA--A---GCT-TTGTGAAG-------TAA--CTGT--G----GAATAG-T--TTT-G--GAGATGT
gi|59300 : AAAAAAA-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----A-TA----CC-CC-ATTA--GCA-AT-A-G-A-A--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--C---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CT-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTT
gi|59301 : AAAAAAT-ATAGT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA---T-AT-G-GTTG------A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TTGTGATG-------TTA--CT-T--T----AAGCAG-T--TTT-G--GAAT
gi|59302 : AACAAAC-AC--G-----GAA---------AA--T--A-A-----A-----ACTA----CC-TC-AT-A--GCA-AT-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-TA-C-T-A--G-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCAC-AAG---------A-------------AAACAG-T--TTT-G--AAGTT
gi|59303 : AAAAAAA-AA--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----AAAT----CC-TC-AT-A--TCA-AA-A-G------------T-----T--AC--------A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAA--A---ATT-GTGTTAAG-------TTA--CT-A--T----GAATGG-T--TTT-A--GAGTAGT
gi|59304 : AATAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----AGTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-AAGCA--------A-----T---CTA--C---A--C--A-G-T-C--G-GTTG------A-A-AT-G---TGTA--CAA--A---AAT-TTGTGCAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--AGGTT
gi|59305 : AAAAATT-AT--T-----CAA---------AT--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TT-AT-A--GCA-AG-C-T-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--T-TA-C-A-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TTGTTAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59306 : AACAAGT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTCAACTCCGTT-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--A-TTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAATTAAATGTT-TCATAAAA-------------C-T--T----AAACAG-T--TTT-A--AGGTTAT
gi|59307 : AAAAAAT-AT--T-----AAT---------AA--T-GA-A-----A-----ATTT----CC-AA-GT-A--GCA-AT-A-C-ACA--------C-----T--TCTG--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-T---TGTA--TAA--A---GTT-TAGCAAAT-------GTA--CC-T--T----GAATGA-T--TT
gi|59308 : AAAAAAT-A----------AA---------AA--T-TA-A-----A-----TCTC----AA-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-ACATGTGTACAC-----C--ACTA--T---A--C-TA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---AGTA--CAA--A---GAT-TCGTGAAG-------TAA--CT-A--T----AATCGG-T--TTT-G--
gi|59310 : AAAGTAT-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC-------TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TATA--T---A--T-CA-C-A-A--G-GTTA------A-C-AT-G---TGCA--CAA--A---GTT-TCATAATG-------CTG--CC-T--T----GAACAG-CTATCT-G--GA
gi|59312 : AAAAAAC-AT--T-----GAG---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-AA-AT-A--GCA-AA---G-GCA--------C-----T--ACAA--T---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TATG--C-A--A---GTT-TTTTAAAG-------TAA--CT-G--T----GAACAC-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59313 : AAAATAT-AT--T-----GTA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--TTA-AA-T-G-GCG--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-G-A--T-GTTG------G-C-AT-G---TGTG--GAA--A---GTCATCCTGATG-------TTA--CC-T--T----GAATAG-T--TTT-G--AAGTTGT
gi|59315 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----AA-TC-AA-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--C---A--C-CA-T-G-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGAA--CAA--C---GTT-TTGTGAAG-------TGA--CC-T--T----GAAAGG-A--TTT-G--GAATTAT
gi|59316 : AAAAAAC-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-T-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-A-A--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--A-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GGT-TCATTACG-------TTA--TC-T--TA---GAA
gi|59317 : AAAAAAT-AA--T-----AAT---------AT--T-GA-A------------CTC----CC-TC-AT-A--TCA-AA-T-G-GAA--------C-----T--ACAA--G---G--C-CA-C-T-A--G-GTAA------A-C-ATAA---TGTT--CAA--T---GTT-TCATGAAG-------TTG--TC-T--T----GAAC-G-T--TAT-G--AAGT
gi|59318 : AACAAAT-AT--A-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----AC-TC-GT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------A-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-G---TTGA--CAA--A---GTT-TCATTAAA-------------C-T--T----GAACAG-T--TTTAA--AAGTTAT
gi|59319 : AATAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GT-A-----T-----AGTC----CC-TC-A--A--ACA-AA-ATG-GCA-----------------ATTA--GTTCA--C-CT-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TT---CT-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59320 : AAAAAGT-AT--T-----TAA---------AA--T-GG-A-----A-----ACTC----CT-AA-AT-A--GCA-AA-A-G-TCT--------C-----T--GCTA--G---A--A-CA-C-T-A--G-ATTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CC-
gi|59321 : AAAAAAA-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTT----TC-CC-AA-A--GCA-AA-A-T-GCA--------A-----T--TTTGTTG---A--C--A-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--TAA--A---GTT-TTGTCAGG-------TTA--AC-T--C----GAACAG-T--GTT-
gi|59322 : AAAATAT-AT--T-----GAA---------AA--TTGA-A-----A-----TCTC----CC-TA-A--A--AAA-AA-A-G-GCA--------CATAATT--A-TA--G---A--C-TG-T-G-A--G-GTTA------A-C-AT-G---TGAA--CTG--A---GTT-TCGTGATG-------TCA--CC-A--T----GAACAG-T--TTT-T--GAGT
gi|59323 : AAAAAGC-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AC-A--GCA-AA-A-T-GCA--------T-----T--TCTA--C---ATTT-CA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTGT-----------T----CC-T--T----TAATGG----GTT-G--GAGTT
gi|59324 : AAAAAA-------------AA---------GA--A-GA-A-----A-----ACTT----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--A---A--T-CA-T-T-A--G-TTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---GTT-TCATGATG-------GCG--CC-T--T----TAACGG-C--TTT-G--G
gi|59325 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--A-GGTA-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GTG--------T-----T--ACTA--G---A--T-CA-G-C-A--G-G-------------AT-G---TGCA--CAA--C---ATT-TCCTGAAG-------TCA--CC-T--G----GAACTG-A--TTT----GAGTTAT
gi|59326 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-C-----A-----ACTC----GC-TC-AC-----CA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AATA--G---A--C-CA-C-G-C--G-GCTG------A-C-AT-A---TGTA--AAA--C---ATT-TCGTGAAG-------TTT--TC-TAAT----GAATGG-T--
gi|59327 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AAC-T-GA-A-----G-----ACTA----CA-TC-AT-G--GCA-AA-A-G-AAA--------C-----T--TCTA--G---A--C-CA-T-T-A--C-GTTA------A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-T-GTGAAG-------TTA--CC-T--T----
gi|59329 : AAAAAAT-AT--T-----GGT---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-AC-AT-A--GCA-AA-A-T-GAA--------C-----T--AC--------A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT---------------------------TGAGT-------TTA--CT-T--T----GGACGG-T--TTT-G--CAGTT
gi|59337 : AAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--C-GA-A-----A-----ACTC----AC-TC-AG-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AAAA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CC-G--T----GAACGA-T--TTC-A--GAGCCGT
gi|59338 : AAAAAT-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----GC-CC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCC--------A-----T--TCTG--G---A--C-CA-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-T---TGTATGCCG--C---GTT-TCATGAAG-------TGA--CC-T--T----GAATAC-T--TTT-
gi|59339 : AAAAGT-AC--T-------A---------CA--T-AA-A-----A-----ACTT----CC-AC-AT-A--TCA-AA-A-A-GTA--------C-----T--ACTA--G------T-TG-C-T-A--G-ATTT------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CA-A--T----GAAAGG-C--TTT-G--GAGTTGT
gi|59340 : AAAAAT-AC--T-----GAC---------AA--T--A-A-----A-----ACTC----CT-CC-AT-A--TCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTAA------A-C-AT-G---TGTA--TTA--A---GTT-TCTTGAAG-------TTA--CC-T--G----CTACAT-C--TTT-G--GGGTTGT
gi|59341 : AAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACT--------TA-AT-A--GCA-AA-A-T-AGA--------T-----A--ACTA--G---A--T-TG-C-A-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGCA--CA-------GTT-TCATGAAA-------TTA--CC-T--T----GAATAG-T--TCT-G--TAGTTAT
gi|59342 : AAAAAT-AC--A-----GAC---------AA--T--A-A-----A-----ACCC----CA-TCCAT-A--GCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-ATAA------A-G-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCTTAAAG-------TTA--CC-T--G----TAACGG-C--CTT-G--GAGTTAT
gi|59343 : AAAAAT-GT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-TC-AT-A--GCA-AA-C-G-GCA--------T-----T--TCTG--G---G--C-CA-C-T-A--G-GTTT------A-C-AA-T---TATA--CAA--A---GTT-TCGTGAGG-------TTA--CC-T--T----GAAGAG-T--TAC-G--GA
gi|59344 : AAGAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-TC-CT-A--GAG-AA-C-G-GCA--------C-----T--ACTG--G---C--C-CA-C-T-A--G-GTTT------A-C-AT-T---TATA--CAA--A---GAT-TCGTTAGG-------TTA--CC-T--T----AAACAG-T--TCG-G--GA
gi|59345 : AAACAT-AT--T-----GAATGGAAAATAAA--T-GA-A-----A-----ACTC----TG-CC-AT-A--GCA-AA-A-G--CA--------T-----A--ACTG--G---A--A-CAAC-T-ATAG-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ATT-TCGTGAAG-------TCA--CC-T--T----AAATGG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59347 : AAACAT-AT--T-----AGA---------AA--T--A-G-----A-----ACTC----CA-CA-AT-A--GTA-AG-A-G-GCA--------C-----T--ATTA--G---A--C-CA-C-T-AA-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--TAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--C----AAACAT-T--TTT-
gi|59348 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGG-T--TAT-G--
gi|59349 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGG-T--TAT-G--
gi|59350 : AAAAAT-AC--T-----GAC---------AA--T-AC-A-----A-----ACAC----AT-CC-AT-A--GCA-AA-A-A-AAT--------C-----T--ACTG--G---A--C-CA-C-T-T--G-GTAA------A-C-AA-G---TGTA--CAC--A---GTT-TCTTGAAG-------TTA--CC-T--T----TAATGG-T--TTT-G--GAGTTG
gi|59351 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGT-T--TAT-G--
gi|59352 : AAAAAT-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TT-GT-A--GTA-AA-A-T-GCT--------C-----T--ACTA--A---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A----TT-TTGTGAAG-------TT
gi|59353 : AAAAAT-GT--T-----CAA---------AA--T-GA-G-----A-----TCAC----CC-TC-AG-A--TCA-GA-A-G-TCA--------C-----T--ACTA--G---A--T-TA-C-T-A--G-GTTC------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAA
gi|59355 : AACAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-GA-A-----T-----ACGC----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTA--T---A--C--A-T-G-A--T-GTTG------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCCTCATG-------TTA--AC-T--T----CAATAG-T--TTT-A--GAGTTAT
gi|59356 : AACAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-GA-A-----T-----ACGC----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTA--T---A--C--A-T-G-A--T-GTTG------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCCTCATG-------TTA--AC-T--T----CAATAG-T--TTT-A--GAGTTAT
gi|59359 : AAAAT-GT--T-----GAA---------AA--T-TA-A-----A-----ACTT----CC-CT-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--A---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TT------------------GG-C--TTT-A--GAGTTGT
gi|59360 : AAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----CCTT----CG-CC-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----A--ACCA--G---A--T-CA-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAC--A---GTT-------AA-------TT------T--T----AAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59361 : AAAATGAT--T-----GAT---------AA--T-GA-A-----T-----ACTC----CC-TC-AT-G--TCC-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--A-TA-C-T-A--G-GTCA------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATAAAA---------------------------GG-T--TTT-G--AAGTGGT
gi|59362 : AAAA--AC--T-----GAA---------AC--T-GA-A-----A-----TCTC----TC-TC-AT-T--GCA-AA-A-T-GCA--------C-----T--GTAA--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---CATA--CAA--A---TTT-TAGTTGAG-------TTATTTC-T--T----AAA-AG-T--TTT-G--GAGTTAT
gi|59363 : AAAAT-AT--TCATAAGGA---------AA--G-GA-A-----A-----GCTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--T-GTTG------T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TCATGA----------TA-----------------GG-T--TTT-A--GAGTT
gi|59364 : AAAAT-AT--TCATAAGGA---------AA--G-GA-A-----A-----GCTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--T-GTTG------T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TCATGA----------TA-----------------GG-T--TTT-A--GAGTT
gi|59367 : AAAAT-GT--T---------------------T-GA-A-----A-----AATT----CC-TC-AT-A---C----------CA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-A-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TCCTGATA-------TTA--CC-T--T----GAATTG-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59368 : AAAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-AG-A-----A-----AATC----CC-CA-GT-A--GGA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--T---A--C-CA-C-T-A--G-GTTC------A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CA-T--T----TAAC
gi|59371 : AAGT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----GCTC----CC-AA-AT-A--GAA-AA-A-G-GCA--------A-----T--ACTG--G---A--C-TA-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------TTT--TC-T--T----AAAGGA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59372 : AAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-CC-GC-A--GCA-GA-A-G-GCA--------C--------------G---A--T-CA-T-T-A--G-GATG------T-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTTAAG-------TTA--CA-T--T----GAACGG-T--TTT-G--TAGTTGT
gi|59373 : AAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----CCTT----CC-CA-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AACA--G---A--C-AA-C-C-C--G-GTTG------T-C-AT-A---TGTA--CAC--A----TT-TCGTAAAG-------TCA--CC-T--C----GAACAG-T--TTT-G--GTGTTGT
gi|59376 : AAC-AT--T-----AAA---------AAAAT-GA-ATATTGA-----ACTC----CC-TC-AT-A---CC-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCAG--G---G--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-CAAT-A---TGTG--CAA--A---ATT-TCATGAAG-------TTG--TA-T--T----GAATG
gi|59377 : AT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-CC-GA-A--GCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CA-C-T-A--GAATTG--------C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-T
gi|59378 : AT-TT--T-----GAA---------AA--G-GA-A-----A-----AC-C----CC-TT-AA-A--CCA-AA-T-A-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-G-A--T-GTTG------A-C-AA-G---TGCA--CAA--A---GTT-TCGTGAA--------TTA--CC-T--T----GATCGG-A--TTT-T--GAGCTGT
gi|59379 : AT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCTA--G---T--C-CA-T-G-A--T-GTTG------T-C-AC-A---TGT-----------------------G-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-G--GAGTT
gi|59382 : T-AT--T-----CAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----TA-TC-AT-A--CCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CA---T-G--G-GTTG------T-C-GT-T---TGTA--CAG--C---ATT-TCGTGATG-------TTA--CC-A--T----AAACGG-T--TTC-C--GAGTTGT
gi|59384 : -AT--T-----GAT---------AA--G-AA-A-----A-----GCCC----AC-TT-GG-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-TA-C-T-T--G-G-TG------ATC-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TCGTGAGG-------TAA--TC-T--T----GAACGG-T--ATT-A--GAATT
gi|59385 : -AT--T-----AAT---------AT--T-GA-A-----A-----ACTC----TC-TC-AT-A--GCATAA-A-G-GCA--------T-----T--AATA--G---A--C-CA-T-T-A--G-GTTG------A-C----------------A--A---GTT-ATGTGAAGTTATCTATTA--TC-T--T----GAATGA-T--TTT-G--GAGTT
gi|59387 : T--T-----GAC---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-AA-AT-A--GTA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTT--T---A--T-CA-C-T-G--A-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--T---CTT-TCTTTGAA-------TTA--TC-T--C----GAACGG-G--TTT-G--
gi|59389 : -----GAA---------AA--T-GA-A-----G-----ACTC----CC-GT-AT-A--TCA-GT-G-G-GCT--------C-----T--ACTA--G---G--C-CA-T-T-A--A-GACA------A-C-A--G---TATA--CAA--A---GAT-TTATGAAG-------TTA--AC-TAAT----GAACAG-T--TTT-G--GAGTGGT
gi|59390 : AA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-TC-AT-A--CAA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-T-A--G-TTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---ATT-TTGTGA----------TA--CC-G--G----TAACGG-T--TTT-G--G
gi|59392 : ---------AA--T-GA-G-----A-----ACAC----CC-TT-GT-A--GCA-AC-A-A-GCA--------C-----T--GCTA--A---A--C-CA-C-T-A--G-TACA------A-C-AT-G---TGTA--CCA--A---GTT-TTGAGAAG-------AAA--CC-A--T----GAACGG-T--TTT-G--
gi|59394 : A--T-GG-A-----A-----ACTC----CA-CC-AT-A--GCA-------------------C-----TTGACGA--G---A--GGCA-C-T-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTG--CAA--A---GTT-TCGTGAAC-------TTA--CC-T--G----AAATGG-T--TGT-G--GAGCTGT
gi|59397 : A-A-----G-----ATTC----CA-TT-GT-A--CCA-AA-T-A-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-T-C-G--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TTGTGATG-------TTA--CC-T--T----GAAC-G-T--TCC-G--GA
gi|59399 : -----A-----AC-C----CC-TC-AA-G--GCA-AA-A-C-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GGT-TCATGAAA-------TTA--TC-T--T----GAAC-A-T--TTT-GTAAAGTTAT
gi|59400 : -----A-----ACTC----CT-CA-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--A---A--C-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--TGA--A---GTT-TTGTGA----------TA-----T--T----AAACAG-T--TGT-A--AAGT
gi|59405 : -A--ACA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACCA--G---A--T-GA-C-T-A--G--TTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTGT-AAG-------ATA--TC-T--T----AAACAG-T--TAA-G--GAGTT
gi|59409 : A-A-G-GCA--------C-----T--ACAA--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-GTGATGTA--CAA--A---GTT-TCATACAG-------TGA--CC-T--A----GAACAGTT--TTT-G--GAGTAGT
gi|59410 : CTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-T---GGTA--CAA--A---GTT-ACATGAAA-------TTA--CC-T--T----AAAGGG-T--TTT-G--GA
gi|59411 : TA--G---A--C-CA-A-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-G--
gi|59413 : --G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----AATCAG-T--TTT-G--GAGTTAT
Alignments
lowQualScore : 0 22 22222 111111111 11 0 0 11111 11111 0000 0 0 0 00 0 0 0 1 11111111 11111 00 00 000 00 0 0 0 0 22 0 111111 0 0 0 000 00 00 111 0 1111111 00 0 11 1111 0 00 0 00
lowQualScore : . .. ..... ......... .. . . ..... ..... .... . . . .. . . . . ........ ..... .. .. ... .. . . . . .. . ...... . . . ... .. .. ... . ....... .. . .. .... . .. . ..
lowQualScore : 5 33 22222 888888888 00 4 4 11111 11111 9999 4 4 4 66 4 4 4 2 55555555 00000 66 66 777 66 8 4 4 4 11 4 111111 4 4 4 777 55 55 111 4 3333333 66 4 11 3333 9 66 4 66
consensus : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
Reference ( family-231 ) : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59273 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAG--A---GTT-TCATGATT-------TTG--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-A--GATTTGT
gi|59274 : AAACAAT-AT--T-----GAA---------A---T-GA-C-----A-----ACTC----TC-CC-AT-ATAGCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---CATA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAAAAA-T--TTT-G--GAG
gi|59275 : AAAAAAT-AG--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-CA-AA-A--GCA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ATAA--G---A--C-CA-C-T-T--G-GTTGGCGGTGA-C-AT-G---TGTG--TAC--A---GTT-TTGCGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59277 : AAAAAAT-----------GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACCC----CT-TC-AT-A--ACA-AA-A-G-TCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGT-G--TTT-G--GAGCTGT
gi|59278 : AACAAAC-GC--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GAA-AA-A-G-GCA--------------T--ATAA--A---A--C-CA-C-T-A--G-ATTG------T-G-AA-G---TGTA--CAA--A---GTT-CTGGTAAA-------TTA--TC-T--T----GAACGG-T--TTC-G--GAATTAT
gi|59279 : AAAAAAT-GT--T-----GAC---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-ACGCA--------T-----T--ACTA--G---G--C-CT-C-C-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-C--TTT-G--TAGTTGT
gi|59280 : AAAAAAT-ATGTT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCT-------A--C-AA-C-TCAT-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TTGTTATG-------TTA--CC-T--T----GAACAA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59281 : AAACAAT-ATGTT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACT-------A--C-AA-CTT-AT-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCGTGATG-------TTA--CC-T--T----GAACAA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59282 : AAAAAAT-GT--T-----AAC---------AA--T-CA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-ACGCA--------T-----T--ACTA--G---G--C-CT-C-C-T--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-C--TTC-G--TAGTTGT
gi|59283 : AAGAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-TA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AC-A--GCA-AA-A-G-GAA--------C-----T--ACTA--G---G--C--A-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TCGTGAAG-------TTA--TT-T--TGAACGAACGG-T--TTT-G--GAGCTGT
gi|59284 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AA-A--GCA-AA-A-A-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-TA-C-T-A--G-ACAG------A-C-AT-A---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------CAA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-A--AATTTAT
gi|59285 : AAAATAT-AT--T------AA---------AA--T-TA-A-----A-----TCTC----TC-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----C--ACTA--G---A--C-CT-T-G-A--A-GTTG------A-C-AC-G---TTTA--CAA--A---GTA-TCCTGATG-------TTA--CA-T--T----GGACGG-T--TTT-A--CAGT
gi|59286 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AC--T-GG-A-----A-----ACTT----CC--C-AT-A--GTA-AA-A-G-GCA--------C-----T--GCTA--G---G--C-CT-C-T-T--G-GTTA------A-T-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAGTGG-T--TTT-A--GAGTCGT
gi|59287 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-G-----A-----ATTC----CT-TG-AT-A--ACA-AA-T-G-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--C-AA-C-T-A--G-TTTA------A-T-AT-T---TGTA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------ATA--CC-T--T----GAATCC-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59288 : AAAAAAT-TT--T-----GAA---------AA--T--A-A-----A-----ACTC----AA-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA-----------------ACTT--C---A--C-TA-T-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TAA--CC-T--T----
gi|59289 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--TCT-------A--CTCA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAC--AT--TTT-TTGTGCAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTC-G--GAGTT
gi|59290 : AAAAAGT-AT--T------------------------A-A-----A-----ACGC----CA-TC-AT-A--ACG-AA-A-T-AAA--------C-----T--TCTT--G---C--T-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAT-------TTA--TC-T--T----GAACCG-T--TTT-G--AAGTTAT
gi|59291 : AAAACAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATGC----CC-TC-A-----GCG-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACAA--C---A--T-AA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------CTA--TC-T--T----G-ACAC-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59292 : AAAATAT-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TCA--------C-----A--ACTA--A---A--C-CA-A-T-A--G-GATG------A-C-AT-A---TGTC--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTT--CT-G--T----CAACAG-T--TTT-T--GAGTTGT
gi|59294 : AAAACAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----ACTAAAACAT----CC-TC-AT-A--GCT-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACTA--C---A--C-CA-T-T-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTA--C----A---GCT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59295 : AAAAAAT-ATA-T-----TTA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-CA-AC-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--G--G--G---G--T-T-----------GTTG------A-C-AT-G---TCTA--TAA--A---GTT-TTATGCAG-------TTA--TC-T--T----GAACAGTT--TTT-A--GAGTTGT
gi|59296 : AAAAAAT--T--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AC-A--GCA-GA-A-G-GCA--------C-----T--AGAT--G---A--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ACT-TCACAAAA-------TTA--TC-T--T----GAACAG----TTT-A--AAGTTAT
gi|59297 : AAAATAT-AT--C-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC--C-AT-A---CA-AATA-G-GCA--------C-----A--ACTA--G---A--C-CT-A-T-A--A-GATG------A-C-AT-A---TGT---TAA--A---GTT-TAGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-----AGTTGT
gi|59298 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-TT-T--GCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CG-C-T-A--G-GCTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTTTTAAG-------TTA--CC-T--A----GAATGG-T--TTT-A--G
gi|59299 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-CC-AT-A--GCA-AA-A-T-TCA--------C-----A--A--A--G-------------------------------------G---TGTA--CAA--A---GCT-TTGTGAAG-------TAA--CTGT--G----GAATAG-T--TTT-G--GAGATGT
gi|59300 : AAAAAAA-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----A-TA----CC-CC-ATTA--GCA-AT-A-G-A-A--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--C---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CT-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTT
gi|59301 : AAAAAAT-ATAGT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA---T-AT-G-GTTG------A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TTGTGATG-------TTA--CT-T--T----AAGCAG-T--TTT-G--GAAT
gi|59302 : AACAAAC-AC--G-----GAA---------AA--T--A-A-----A-----ACTA----CC-TC-AT-A--GCA-AT-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-TA-C-T-A--G-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCAC-AAG---------A-------------AAACAG-T--TTT-G--AAGTT
gi|59303 : AAAAAAA-AA--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----AAAT----CC-TC-AT-A--TCA-AA-A-G------------T-----T--AC--------A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAA--A---ATT-GTGTTAAG-------TTA--CT-A--T----GAATGG-T--TTT-A--GAGTAGT
gi|59304 : AATAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----AGTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-AAGCA--------A-----T---CTA--C---A--C--A-G-T-C--G-GTTG------A-A-AT-G---TGTA--CAA--A---AAT-TTGTGCAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--AGGTT
gi|59305 : AAAAATT-AT--T-----CAA---------AT--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TT-AT-A--GCA-AG-C-T-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--T-TA-C-A-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TTGTTAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59306 : AACAAGT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTCAACTCCGTT-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--A-TTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAATTAAATGTT-TCATAAAA-------------C-T--T----AAACAG-T--TTT-A--AGGTTAT
gi|59307 : AAAAAAT-AT--T-----AAT---------AA--T-GA-A-----A-----ATTT----CC-AA-GT-A--GCA-AT-A-C-ACA--------C-----T--TCTG--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-T---TGTA--TAA--A---GTT-TAGCAAAT-------GTA--CC-T--T----GAATGA-T--TT
gi|59308 : AAAAAAT-A----------AA---------AA--T-TA-A-----A-----TCTC----AA-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-ACATGTGTACAC-----C--ACTA--T---A--C-TA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---AGTA--CAA--A---GAT-TCGTGAAG-------TAA--CT-A--T----AATCGG-T--TTT-G--
gi|59310 : AAAGTAT-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC-------TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TATA--T---A--T-CA-C-A-A--G-GTTA------A-C-AT-G---TGCA--CAA--A---GTT-TCATAATG-------CTG--CC-T--T----GAACAG-CTATCT-G--GA
gi|59312 : AAAAAAC-AT--T-----GAG---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-AA-AT-A--GCA-AA---G-GCA--------C-----T--ACAA--T---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TATG--C-A--A---GTT-TTTTAAAG-------TAA--CT-G--T----GAACAC-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59313 : AAAATAT-AT--T-----GTA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--TTA-AA-T-G-GCG--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-G-A--T-GTTG------G-C-AT-G---TGTG--GAA--A---GTCATCCTGATG-------TTA--CC-T--T----GAATAG-T--TTT-G--AAGTTGT
gi|59315 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----AA-TC-AA-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--C---A--C-CA-T-G-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGAA--CAA--C---GTT-TTGTGAAG-------TGA--CC-T--T----GAAAGG-A--TTT-G--GAATTAT
gi|59316 : AAAAAAC-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-T-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-A-A--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--A-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GGT-TCATTACG-------TTA--TC-T--TA---GAA
gi|59317 : AAAAAAT-AA--T-----AAT---------AT--T-GA-A------------CTC----CC-TC-AT-A--TCA-AA-T-G-GAA--------C-----T--ACAA--G---G--C-CA-C-T-A--G-GTAA------A-C-ATAA---TGTT--CAA--T---GTT-TCATGAAG-------TTG--TC-T--T----GAAC-G-T--TAT-G--AAGT
gi|59318 : AACAAAT-AT--A-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----AC-TC-GT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------A-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-G---TTGA--CAA--A---GTT-TCATTAAA-------------C-T--T----GAACAG-T--TTTAA--AAGTTAT
gi|59319 : AATAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GT-A-----T-----AGTC----CC-TC-A--A--ACA-AA-ATG-GCA-----------------ATTA--GTTCA--C-CT-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TT---CT-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59320 : AAAAAGT-AT--T-----TAA---------AA--T-GG-A-----A-----ACTC----CT-AA-AT-A--GCA-AA-A-G-TCT--------C-----T--GCTA--G---A--A-CA-C-T-A--G-ATTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CC-
gi|59321 : AAAAAAA-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTT----TC-CC-AA-A--GCA-AA-A-T-GCA--------A-----T--TTTGTTG---A--C--A-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--TAA--A---GTT-TTGTCAGG-------TTA--AC-T--C----GAACAG-T--GTT-
gi|59322 : AAAATAT-AT--T-----GAA---------AA--TTGA-A-----A-----TCTC----CC-TA-A--A--AAA-AA-A-G-GCA--------CATAATT--A-TA--G---A--C-TG-T-G-A--G-GTTA------A-C-AT-G---TGAA--CTG--A---GTT-TCGTGATG-------TCA--CC-A--T----GAACAG-T--TTT-T--GAGT
gi|59323 : AAAAAGC-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AC-A--GCA-AA-A-T-GCA--------T-----T--TCTA--C---ATTT-CA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTGT-----------T----CC-T--T----TAATGG----GTT-G--GAGTT
gi|59324 : AAAAAA-------------AA---------GA--A-GA-A-----A-----ACTT----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--A---A--T-CA-T-T-A--G-TTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---GTT-TCATGATG-------GCG--CC-T--T----TAACGG-C--TTT-G--G
gi|59325 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--A-GGTA-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GTG--------T-----T--ACTA--G---A--T-CA-G-C-A--G-G-------------AT-G---TGCA--CAA--C---ATT-TCCTGAAG-------TCA--CC-T--G----GAACTG-A--TTT----GAGTTAT
gi|59326 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-C-----A-----ACTC----GC-TC-AC-----CA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AATA--G---A--C-CA-C-G-C--G-GCTG------A-C-AT-A---TGTA--AAA--C---ATT-TCGTGAAG-------TTT--TC-TAAT----GAATGG-T--
gi|59327 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AAC-T-GA-A-----G-----ACTA----CA-TC-AT-G--GCA-AA-A-G-AAA--------C-----T--TCTA--G---A--C-CA-T-T-A--C-GTTA------A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-T-GTGAAG-------TTA--CC-T--T----
gi|59329 : AAAAAAT-AT--T-----GGT---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-AC-AT-A--GCA-AA-A-T-GAA--------C-----T--AC--------A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT---------------------------TGAGT-------TTA--CT-T--T----GGACGG-T--TTT-G--CAGTT
gi|59337 : AAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--C-GA-A-----A-----ACTC----AC-TC-AG-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AAAA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CC-G--T----GAACGA-T--TTC-A--GAGCCGT
gi|59338 : AAAAAT-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----GC-CC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCC--------A-----T--TCTG--G---A--C-CA-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-T---TGTATGCCG--C---GTT-TCATGAAG-------TGA--CC-T--T----GAATAC-T--TTT-
gi|59339 : AAAAGT-AC--T-------A---------CA--T-AA-A-----A-----ACTT----CC-AC-AT-A--TCA-AA-A-A-GTA--------C-----T--ACTA--G------T-TG-C-T-A--G-ATTT------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CA-A--T----GAAAGG-C--TTT-G--GAGTTGT
gi|59340 : AAAAAT-AC--T-----GAC---------AA--T--A-A-----A-----ACTC----CT-CC-AT-A--TCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTAA------A-C-AT-G---TGTA--TTA--A---GTT-TCTTGAAG-------TTA--CC-T--G----CTACAT-C--TTT-G--GGGTTGT
gi|59341 : AAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACT--------TA-AT-A--GCA-AA-A-T-AGA--------T-----A--ACTA--G---A--T-TG-C-A-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGCA--CA-------GTT-TCATGAAA-------TTA--CC-T--T----GAATAG-T--TCT-G--TAGTTAT
gi|59342 : AAAAAT-AC--A-----GAC---------AA--T--A-A-----A-----ACCC----CA-TCCAT-A--GCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-ATAA------A-G-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCTTAAAG-------TTA--CC-T--G----TAACGG-C--CTT-G--GAGTTAT
gi|59343 : AAAAAT-GT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-TC-AT-A--GCA-AA-C-G-GCA--------T-----T--TCTG--G---G--C-CA-C-T-A--G-GTTT------A-C-AA-T---TATA--CAA--A---GTT-TCGTGAGG-------TTA--CC-T--T----GAAGAG-T--TAC-G--GA
gi|59344 : AAGAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-TC-CT-A--GAG-AA-C-G-GCA--------C-----T--ACTG--G---C--C-CA-C-T-A--G-GTTT------A-C-AT-T---TATA--CAA--A---GAT-TCGTTAGG-------TTA--CC-T--T----AAACAG-T--TCG-G--GA
gi|59345 : AAACAT-AT--T-----GAATGGAAAATAAA--T-GA-A-----A-----ACTC----TG-CC-AT-A--GCA-AA-A-G--CA--------T-----A--ACTG--G---A--A-CAAC-T-ATAG-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ATT-TCGTGAAG-------TCA--CC-T--T----AAATGG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59347 : AAACAT-AT--T-----AGA---------AA--T--A-G-----A-----ACTC----CA-CA-AT-A--GTA-AG-A-G-GCA--------C-----T--ATTA--G---A--C-CA-C-T-AA-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--TAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--C----AAACAT-T--TTT-
gi|59348 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGG-T--TAT-G--
gi|59349 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGG-T--TAT-G--
gi|59350 : AAAAAT-AC--T-----GAC---------AA--T-AC-A-----A-----ACAC----AT-CC-AT-A--GCA-AA-A-A-AAT--------C-----T--ACTG--G---A--C-CA-C-T-T--G-GTAA------A-C-AA-G---TGTA--CAC--A---GTT-TCTTGAAG-------TTA--CC-T--T----TAATGG-T--TTT-G--GAGTTG
gi|59351 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGT-T--TAT-G--
gi|59352 : AAAAAT-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TT-GT-A--GTA-AA-A-T-GCT--------C-----T--ACTA--A---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A----TT-TTGTGAAG-------TT
gi|59353 : AAAAAT-GT--T-----CAA---------AA--T-GA-G-----A-----TCAC----CC-TC-AG-A--TCA-GA-A-G-TCA--------C-----T--ACTA--G---A--T-TA-C-T-A--G-GTTC------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAA
gi|59355 : AACAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-GA-A-----T-----ACGC----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTA--T---A--C--A-T-G-A--T-GTTG------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCCTCATG-------TTA--AC-T--T----CAATAG-T--TTT-A--GAGTTAT
gi|59356 : AACAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-GA-A-----T-----ACGC----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTA--T---A--C--A-T-G-A--T-GTTG------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCCTCATG-------TTA--AC-T--T----CAATAG-T--TTT-A--GAGTTAT
gi|59359 : AAAAT-GT--T-----GAA---------AA--T-TA-A-----A-----ACTT----CC-CT-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--A---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TT------------------GG-C--TTT-A--GAGTTGT
gi|59360 : AAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----CCTT----CG-CC-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----A--ACCA--G---A--T-CA-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAC--A---GTT-------AA-------TT------T--T----AAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59361 : AAAATGAT--T-----GAT---------AA--T-GA-A-----T-----ACTC----CC-TC-AT-G--TCC-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--A-TA-C-T-A--G-GTCA------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATAAAA---------------------------GG-T--TTT-G--AAGTGGT
gi|59362 : AAAA--AC--T-----GAA---------AC--T-GA-A-----A-----TCTC----TC-TC-AT-T--GCA-AA-A-T-GCA--------C-----T--GTAA--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---CATA--CAA--A---TTT-TAGTTGAG-------TTATTTC-T--T----AAA-AG-T--TTT-G--GAGTTAT
gi|59363 : AAAAT-AT--TCATAAGGA---------AA--G-GA-A-----A-----GCTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--T-GTTG------T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TCATGA----------TA-----------------GG-T--TTT-A--GAGTT
gi|59364 : AAAAT-AT--TCATAAGGA---------AA--G-GA-A-----A-----GCTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--T-GTTG------T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TCATGA----------TA-----------------GG-T--TTT-A--GAGTT
gi|59367 : AAAAT-GT--T---------------------T-GA-A-----A-----AATT----CC-TC-AT-A---C----------CA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-A-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TCCTGATA-------TTA--CC-T--T----GAATTG-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59368 : AAAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-AG-A-----A-----AATC----CC-CA-GT-A--GGA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--T---A--C-CA-C-T-A--G-GTTC------A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CA-T--T----TAAC
gi|59371 : AAGT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----GCTC----CC-AA-AT-A--GAA-AA-A-G-GCA--------A-----T--ACTG--G---A--C-TA-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------TTT--TC-T--T----AAAGGA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59372 : AAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-CC-GC-A--GCA-GA-A-G-GCA--------C--------------G---A--T-CA-T-T-A--G-GATG------T-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTTAAG-------TTA--CA-T--T----GAACGG-T--TTT-G--TAGTTGT
gi|59373 : AAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----CCTT----CC-CA-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AACA--G---A--C-AA-C-C-C--G-GTTG------T-C-AT-A---TGTA--CAC--A----TT-TCGTAAAG-------TCA--CC-T--C----GAACAG-T--TTT-G--GTGTTGT
gi|59376 : AAC-AT--T-----AAA---------AAAAT-GA-ATATTGA-----ACTC----CC-TC-AT-A---CC-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCAG--G---G--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-CAAT-A---TGTG--CAA--A---ATT-TCATGAAG-------TTG--TA-T--T----GAATG
gi|59377 : AT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-CC-GA-A--GCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CA-C-T-A--GAATTG--------C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-T
gi|59378 : AT-TT--T-----GAA---------AA--G-GA-A-----A-----AC-C----CC-TT-AA-A--CCA-AA-T-A-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-G-A--T-GTTG------A-C-AA-G---TGCA--CAA--A---GTT-TCGTGAA--------TTA--CC-T--T----GATCGG-A--TTT-T--GAGCTGT
gi|59379 : AT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCTA--G---T--C-CA-T-G-A--T-GTTG------T-C-AC-A---TGT-----------------------G-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-G--GAGTT
gi|59382 : T-AT--T-----CAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----TA-TC-AT-A--CCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CA---T-G--G-GTTG------T-C-GT-T---TGTA--CAG--C---ATT-TCGTGATG-------TTA--CC-A--T----AAACGG-T--TTC-C--GAGTTGT
gi|59384 : -AT--T-----GAT---------AA--G-AA-A-----A-----GCCC----AC-TT-GG-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-TA-C-T-T--G-G-TG------ATC-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TCGTGAGG-------TAA--TC-T--T----GAACGG-T--ATT-A--GAATT
gi|59385 : -AT--T-----AAT---------AT--T-GA-A-----A-----ACTC----TC-TC-AT-A--GCATAA-A-G-GCA--------T-----T--AATA--G---A--C-CA-T-T-A--G-GTTG------A-C----------------A--A---GTT-ATGTGAAGTTATCTATTA--TC-T--T----GAATGA-T--TTT-G--GAGTT
gi|59387 : T--T-----GAC---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-AA-AT-A--GTA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTT--T---A--T-CA-C-T-G--A-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--T---CTT-TCTTTGAA-------TTA--TC-T--C----GAACGG-G--TTT-G--
gi|59389 : -----GAA---------AA--T-GA-A-----G-----ACTC----CC-GT-AT-A--TCA-GT-G-G-GCT--------C-----T--ACTA--G---G--C-CA-T-T-A--A-GACA------A-C-A--G---TATA--CAA--A---GAT-TTATGAAG-------TTA--AC-TAAT----GAACAG-T--TTT-G--GAGTGGT
gi|59390 : AA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-TC-AT-A--CAA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-T-A--G-TTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---ATT-TTGTGA----------TA--CC-G--G----TAACGG-T--TTT-G--G
gi|59392 : ---------AA--T-GA-G-----A-----ACAC----CC-TT-GT-A--GCA-AC-A-A-GCA--------C-----T--GCTA--A---A--C-CA-C-T-A--G-TACA------A-C-AT-G---TGTA--CCA--A---GTT-TTGAGAAG-------AAA--CC-A--T----GAACGG-T--TTT-G--
gi|59394 : A--T-GG-A-----A-----ACTC----CA-CC-AT-A--GCA-------------------C-----TTGACGA--G---A--GGCA-C-T-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTG--CAA--A---GTT-TCGTGAAC-------TTA--CC-T--G----AAATGG-T--TGT-G--GAGCTGT
gi|59397 : A-A-----G-----ATTC----CA-TT-GT-A--CCA-AA-T-A-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-T-C-G--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TTGTGATG-------TTA--CC-T--T----GAAC-G-T--TCC-G--GA
gi|59399 : -----A-----AC-C----CC-TC-AA-G--GCA-AA-A-C-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GGT-TCATGAAA-------TTA--TC-T--T----GAAC-A-T--TTT-GTAAAGTTAT
gi|59400 : -----A-----ACTC----CT-CA-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--A---A--C-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--TGA--A---GTT-TTGTGA----------TA-----T--T----AAACAG-T--TGT-A--AAGT
gi|59405 : -A--ACA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACCA--G---A--T-GA-C-T-A--G--TTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTGT-AAG-------ATA--TC-T--T----AAACAG-T--TAA-G--GAGTT
gi|59409 : A-A-G-GCA--------C-----T--ACAA--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-GTGATGTA--CAA--A---GTT-TCATACAG-------TGA--CC-T--A----GAACAGTT--TTT-G--GAGTAGT
gi|59410 : CTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-T---GGTA--CAA--A---GTT-ACATGAAA-------TTA--CC-T--T----AAAGGG-T--TTT-G--GA
gi|59411 : TA--G---A--C-CA-A-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-G--
gi|59413 : --G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----AATCAG-T--TTT-G--GAGTTAT
blockSeqs : GT CATAA TGGAAAATA AA TATTG CTAAA C TGTGTACA ATAAT TA GCGGTG AAT TTATCTA AA GAAC
blockSeqs : GT CATAA . C . . C . . T . T . AA A
blockSeqs : AG . . . . . A . . T . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
finalCons : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
Alignments
lowQualScore : 0 22 22222 111111111 11 0 0 11111 11111 0000 0 0 0 00 0 0 0 1 11111111 11111 00 00 000 00 0 0 0 0 22 0 111111 0 0 0 000 00 00 111 0 1111111 00 0 11 1111 0 00 0 00
lowQualScore : . .. ..... ......... .. . . ..... ..... .... . . . .. . . . . ........ ..... .. .. ... .. . . . . .. . ...... . . . ... .. .. ... . ....... .. . .. .... . .. . ..
lowQualScore : 5 33 22222 888888888 00 4 4 11111 11111 9999 4 4 4 66 4 4 4 2 55555555 00000 66 66 777 66 8 4 4 4 11 4 111111 4 4 4 777 55 55 111 4 3333333 66 4 11 3333 9 66 4 66
consensus : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
Reference ( family-231 ) : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59273 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAG--A---GTT-TCATGATT-------TTG--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-A--GATTTGT
gi|59274 : AAACAAT-AT--T-----GAA---------A---T-GA-C-----A-----ACTC----TC-CC-AT-ATAGCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---CATA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAAAAA-T--TTT-G--GAG
gi|59275 : AAAAAAT-AG--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-CA-AA-A--GCA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ATAA--G---A--C-CA-C-T-T--G-GTTGGCGGTGA-C-AT-G---TGTG--TAC--A---GTT-TTGCGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59277 : AAAAAAT-----------GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACCC----CT-TC-AT-A--ACA-AA-A-G-TCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACGT-G--TTT-G--GAGCTGT
gi|59278 : AACAAAC-GC--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GAA-AA-A-G-GCA--------------T--ATAA--A---A--C-CA-C-T-A--G-ATTG------T-G-AA-G---TGTA--CAA--A---GTT-CTGGTAAA-------TTA--TC-T--T----GAACGG-T--TTC-G--GAATTAT
gi|59279 : AAAAAAT-GT--T-----GAC---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-ACGCA--------T-----T--ACTA--G---G--C-CT-C-C-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-C--TTT-G--TAGTTGT
gi|59280 : AAAAAAT-ATGTT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCT-------A--C-AA-C-TCAT-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TTGTTATG-------TTA--CC-T--T----GAACAA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59281 : AAACAAT-ATGTT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACT-------A--C-AA-CTT-AT-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCGTGATG-------TTA--CC-T--T----GAACAA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59282 : AAAAAAT-GT--T-----AAC---------AA--T-CA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-ACGCA--------T-----T--ACTA--G---G--C-CT-C-C-T--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-C--TTC-G--TAGTTGT
gi|59283 : AAGAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-TA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AC-A--GCA-AA-A-G-GAA--------C-----T--ACTA--G---G--C--A-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TCGTGAAG-------TTA--TT-T--TGAACGAACGG-T--TTT-G--GAGCTGT
gi|59284 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TC-AA-A--GCA-AA-A-A-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-TA-C-T-A--G-ACAG------A-C-AT-A---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------CAA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-A--AATTTAT
gi|59285 : AAAATAT-AT--T------AA---------AA--T-TA-A-----A-----TCTC----TC-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----C--ACTA--G---A--C-CT-T-G-A--A-GTTG------A-C-AC-G---TTTA--CAA--A---GTA-TCCTGATG-------TTA--CA-T--T----GGACGG-T--TTT-A--CAGT
gi|59286 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AC--T-GG-A-----A-----ACTT----CC--C-AT-A--GTA-AA-A-G-GCA--------C-----T--GCTA--G---G--C-CT-C-T-T--G-GTTA------A-T-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAGTGG-T--TTT-A--GAGTCGT
gi|59287 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-G-----A-----ATTC----CT-TG-AT-A--ACA-AA-T-G-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--C-AA-C-T-A--G-TTTA------A-T-AT-T---TGTA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------ATA--CC-T--T----GAATCC-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59288 : AAAAAAT-TT--T-----GAA---------AA--T--A-A-----A-----ACTC----AA-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA-----------------ACTT--C---A--C-TA-T-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TAA--CC-T--T----
gi|59289 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--TCT-------A--CTCA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAC--AT--TTT-TTGTGCAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTC-G--GAGTT
gi|59290 : AAAAAGT-AT--T------------------------A-A-----A-----ACGC----CA-TC-AT-A--ACG-AA-A-T-AAA--------C-----T--TCTT--G---C--T-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAT-------TTA--TC-T--T----GAACCG-T--TTT-G--AAGTTAT
gi|59291 : AAAACAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATGC----CC-TC-A-----GCG-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACAA--C---A--T-AA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------CTA--TC-T--T----G-ACAC-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59292 : AAAATAT-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TCA--------C-----A--ACTA--A---A--C-CA-A-T-A--G-GATG------A-C-AT-A---TGTC--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTT--CT-G--T----CAACAG-T--TTT-T--GAGTTGT
gi|59294 : AAAACAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----ACTAAAACAT----CC-TC-AT-A--GCT-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACTA--C---A--C-CA-T-T-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTA--C----A---GCT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59295 : AAAAAAT-ATA-T-----TTA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-CA-AC-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--G--G--G---G--T-T-----------GTTG------A-C-AT-G---TCTA--TAA--A---GTT-TTATGCAG-------TTA--TC-T--T----GAACAGTT--TTT-A--GAGTTGT
gi|59296 : AAAAAAT--T--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AC-A--GCA-GA-A-G-GCA--------C-----T--AGAT--G---A--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ACT-TCACAAAA-------TTA--TC-T--T----GAACAG----TTT-A--AAGTTAT
gi|59297 : AAAATAT-AT--C-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC--C-AT-A---CA-AATA-G-GCA--------C-----A--ACTA--G---A--C-CT-A-T-A--A-GATG------A-C-AT-A---TGT---TAA--A---GTT-TAGTGAAG-------TTA--CC-T--T----GAACAG-T--TTT-----AGTTGT
gi|59298 : AACAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-TT-T--GCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CG-C-T-A--G-GCTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTTTTAAG-------TTA--CC-T--A----GAATGG-T--TTT-A--G
gi|59299 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-CC-AT-A--GCA-AA-A-T-TCA--------C-----A--A--A--G-------------------------------------G---TGTA--CAA--A---GCT-TTGTGAAG-------TAA--CTGT--G----GAATAG-T--TTT-G--GAGATGT
gi|59300 : AAAAAAA-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----A-TA----CC-CC-ATTA--GCA-AT-A-G-A-A--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--C---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CT-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTT
gi|59301 : AAAAAAT-ATAGT-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA---T-AT-G-GTTG------A-C-AT-G---TGAA--CAA--A---GTT-TTGTGATG-------TTA--CT-T--T----AAGCAG-T--TTT-G--GAAT
gi|59302 : AACAAAC-AC--G-----GAA---------AA--T--A-A-----A-----ACTA----CC-TC-AT-A--GCA-AT-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-TA-C-T-A--G-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCAC-AAG---------A-------------AAACAG-T--TTT-G--AAGTT
gi|59303 : AAAAAAA-AA--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----AAAT----CC-TC-AT-A--TCA-AA-A-G------------T-----T--AC--------A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAA--A---ATT-GTGTTAAG-------TTA--CT-A--T----GAATGG-T--TTT-A--GAGTAGT
gi|59304 : AATAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----AGTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-AAGCA--------A-----T---CTA--C---A--C--A-G-T-C--G-GTTG------A-A-AT-G---TGTA--CAA--A---AAT-TTGTGCAG-------TTA--CC-T--T----GAACGG-T--TTT-G--AGGTT
gi|59305 : AAAAATT-AT--T-----CAA---------AT--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TT-AT-A--GCA-AG-C-T-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--T-TA-C-A-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---ATT-TTGTTAAG-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59306 : AACAAGT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTCAACTCCGTT-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--A-TTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAATTAAATGTT-TCATAAAA-------------C-T--T----AAACAG-T--TTT-A--AGGTTAT
gi|59307 : AAAAAAT-AT--T-----AAT---------AA--T-GA-A-----A-----ATTT----CC-AA-GT-A--GCA-AT-A-C-ACA--------C-----T--TCTG--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-T---TGTA--TAA--A---GTT-TAGCAAAT-------GTA--CC-T--T----GAATGA-T--TT
gi|59308 : AAAAAAT-A----------AA---------AA--T-TA-A-----A-----TCTC----AA-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-ACATGTGTACAC-----C--ACTA--T---A--C-TA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---AGTA--CAA--A---GAT-TCGTGAAG-------TAA--CT-A--T----AATCGG-T--TTT-G--
gi|59310 : AAAGTAT-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC-------TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TATA--T---A--T-CA-C-A-A--G-GTTA------A-C-AT-G---TGCA--CAA--A---GTT-TCATAATG-------CTG--CC-T--T----GAACAG-CTATCT-G--GA
gi|59312 : AAAAAAC-AT--T-----GAG---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-AA-AT-A--GCA-AA---G-GCA--------C-----T--ACAA--T---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TATG--C-A--A---GTT-TTTTAAAG-------TAA--CT-G--T----GAACAC-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59313 : AAAATAT-AT--T-----GTA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--TTA-AA-T-G-GCG--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-G-A--T-GTTG------G-C-AT-G---TGTG--GAA--A---GTCATCCTGATG-------TTA--CC-T--T----GAATAG-T--TTT-G--AAGTTGT
gi|59315 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTC----AA-TC-AA-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--C---A--C-CA-T-G-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGAA--CAA--C---GTT-TTGTGAAG-------TGA--CC-T--T----GAAAGG-A--TTT-G--GAATTAT
gi|59316 : AAAAAAC-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-T-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-A-A--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--A-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GGT-TCATTACG-------TTA--TC-T--TA---GAA
gi|59317 : AAAAAAT-AA--T-----AAT---------AT--T-GA-A------------CTC----CC-TC-AT-A--TCA-AA-T-G-GAA--------C-----T--ACAA--G---G--C-CA-C-T-A--G-GTAA------A-C-ATAA---TGTT--CAA--T---GTT-TCATGAAG-------TTG--TC-T--T----GAAC-G-T--TAT-G--AAGT
gi|59318 : AACAAAT-AT--A-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----AC-TC-GT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------A-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-G---TTGA--CAA--A---GTT-TCATTAAA-------------C-T--T----GAACAG-T--TTTAA--AAGTTAT
gi|59319 : AATAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GT-A-----T-----AGTC----CC-TC-A--A--ACA-AA-ATG-GCA-----------------ATTA--GTTCA--C-CT-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TT---CT-T--T----GAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59320 : AAAAAGT-AT--T-----TAA---------AA--T-GG-A-----A-----ACTC----CT-AA-AT-A--GCA-AA-A-G-TCT--------C-----T--GCTA--G---A--A-CA-C-T-A--G-ATTG------A-C-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CC-
gi|59321 : AAAAAAA-AT--T-----GAA---------AA--T-AA-A-----A-----ACTT----TC-CC-AA-A--GCA-AA-A-T-GCA--------A-----T--TTTGTTG---A--C--A-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--TAA--A---GTT-TTGTCAGG-------TTA--AC-T--C----GAACAG-T--GTT-
gi|59322 : AAAATAT-AT--T-----GAA---------AA--TTGA-A-----A-----TCTC----CC-TA-A--A--AAA-AA-A-G-GCA--------CATAATT--A-TA--G---A--C-TG-T-G-A--G-GTTA------A-C-AT-G---TGAA--CTG--A---GTT-TCGTGATG-------TCA--CC-A--T----GAACAG-T--TTT-T--GAGT
gi|59323 : AAAAAGC-AT--T-----AAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-TC-AC-A--GCA-AA-A-T-GCA--------T-----T--TCTA--C---ATTT-CA-G-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTGT-----------T----CC-T--T----TAATGG----GTT-G--GAGTT
gi|59324 : AAAAAA-------------AA---------GA--A-GA-A-----A-----ACTT----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--A---A--T-CA-T-T-A--G-TTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---GTT-TCATGATG-------GCG--CC-T--T----TAACGG-C--TTT-G--G
gi|59325 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--A-GGTA-----A-----ACTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GTG--------T-----T--ACTA--G---A--T-CA-G-C-A--G-G-------------AT-G---TGCA--CAA--C---ATT-TCCTGAAG-------TCA--CC-T--G----GAACTG-A--TTT----GAGTTAT
gi|59326 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-C-----A-----ACTC----GC-TC-AC-----CA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AATA--G---A--C-CA-C-G-C--G-GCTG------A-C-AT-A---TGTA--AAA--C---ATT-TCGTGAAG-------TTT--TC-TAAT----GAATGG-T--
gi|59327 : AAAAAAT-AT--T-----GAA---------AAC-T-GA-A-----G-----ACTA----CA-TC-AT-G--GCA-AA-A-G-AAA--------C-----T--TCTA--G---A--C-CA-T-T-A--C-GTTA------A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-T-GTGAAG-------TTA--CC-T--T----
gi|59329 : AAAAAAT-AT--T-----GGT---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-AC-AT-A--GCA-AA-A-T-GAA--------C-----T--AC--------A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT---------------------------TGAGT-------TTA--CT-T--T----GGACGG-T--TTT-G--CAGTT
gi|59337 : AAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--C-GA-A-----A-----ACTC----AC-TC-AG-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AAAA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CC-G--T----GAACGA-T--TTC-A--GAGCCGT
gi|59338 : AAAAAT-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----GC-CC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCC--------A-----T--TCTG--G---A--C-CA-C-T-A--T-GTTG------A-C-AT-T---TGTATGCCG--C---GTT-TCATGAAG-------TGA--CC-T--T----GAATAC-T--TTT-
gi|59339 : AAAAGT-AC--T-------A---------CA--T-AA-A-----A-----ACTT----CC-AC-AT-A--TCA-AA-A-A-GTA--------C-----T--ACTA--G------T-TG-C-T-A--G-ATTT------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAG-------TTA--CA-A--T----GAAAGG-C--TTT-G--GAGTTGT
gi|59340 : AAAAAT-AC--T-----GAC---------AA--T--A-A-----A-----ACTC----CT-CC-AT-A--TCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTAA------A-C-AT-G---TGTA--TTA--A---GTT-TCTTGAAG-------TTA--CC-T--G----CTACAT-C--TTT-G--GGGTTGT
gi|59341 : AAAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACT--------TA-AT-A--GCA-AA-A-T-AGA--------T-----A--ACTA--G---A--T-TG-C-A-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGCA--CA-------GTT-TCATGAAA-------TTA--CC-T--T----GAATAG-T--TCT-G--TAGTTAT
gi|59342 : AAAAAT-AC--A-----GAC---------AA--T--A-A-----A-----ACCC----CA-TCCAT-A--GCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-ATAA------A-G-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCTTAAAG-------TTA--CC-T--G----TAACGG-C--CTT-G--GAGTTAT
gi|59343 : AAAAAT-GT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-TC-AT-A--GCA-AA-C-G-GCA--------T-----T--TCTG--G---G--C-CA-C-T-A--G-GTTT------A-C-AA-T---TATA--CAA--A---GTT-TCGTGAGG-------TTA--CC-T--T----GAAGAG-T--TAC-G--GA
gi|59344 : AAGAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-TC-CT-A--GAG-AA-C-G-GCA--------C-----T--ACTG--G---C--C-CA-C-T-A--G-GTTT------A-C-AT-T---TATA--CAA--A---GAT-TCGTTAGG-------TTA--CC-T--T----AAACAG-T--TCG-G--GA
gi|59345 : AAACAT-AT--T-----GAATGGAAAATAAA--T-GA-A-----A-----ACTC----TG-CC-AT-A--GCA-AA-A-G--CA--------T-----A--ACTG--G---A--A-CAAC-T-ATAG-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---ATT-TCGTGAAG-------TCA--CC-T--T----AAATGG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59347 : AAACAT-AT--T-----AGA---------AA--T--A-G-----A-----ACTC----CA-CA-AT-A--GTA-AG-A-G-GCA--------C-----T--ATTA--G---A--C-CA-C-T-AA-G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--TAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TTA--CC-T--C----AAACAT-T--TTT-
gi|59348 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGG-T--TAT-G--
gi|59349 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGG-T--TAT-G--
gi|59350 : AAAAAT-AC--T-----GAC---------AA--T-AC-A-----A-----ACAC----AT-CC-AT-A--GCA-AA-A-A-AAT--------C-----T--ACTG--G---A--C-CA-C-T-T--G-GTAA------A-C-AA-G---TGTA--CAC--A---GTT-TCTTGAAG-------TTA--CC-T--T----TAATGG-T--TTT-G--GAGTTG
gi|59351 : AAAAAT-AA--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACAC----TC-TC-AT-A--TCA-AA-C-A-GCA--------C-----T--ATTC--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-G---TGT---C-A--A---GTT-TTATGAAG-------ATG--TC-T--T----GAACGT-T--TAT-G--
gi|59352 : AAAAAT-AT--T-----TAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CT-TT-GT-A--GTA-AA-A-T-GCT--------C-----T--ACTA--A---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A----TT-TTGTGAAG-------TT
gi|59353 : AAAAAT-GT--T-----CAA---------AA--T-GA-G-----A-----TCAC----CC-TC-AG-A--TCA-GA-A-G-TCA--------C-----T--ACTA--G---A--T-TA-C-T-A--G-GTTC------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCATGAA
gi|59355 : AACAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-GA-A-----T-----ACGC----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTA--T---A--C--A-T-G-A--T-GTTG------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCCTCATG-------TTA--AC-T--T----CAATAG-T--TTT-A--GAGTTAT
gi|59356 : AACAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-GA-A-----T-----ACGC----CA-TC-AT-A--CCA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTA--T---A--C--A-T-G-A--T-GTTG------A-T-AT-G---TATA--CAA--A---GTT-TCCTCATG-------TTA--AC-T--T----CAATAG-T--TTT-A--GAGTTAT
gi|59359 : AAAAT-GT--T-----GAA---------AA--T-TA-A-----A-----ACTT----CC-CT-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--A---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-T-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TTGTGAAG-------TT------------------GG-C--TTT-A--GAGTTGT
gi|59360 : AAAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----CCTT----CG-CC-AC-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----A--ACCA--G---A--T-CA-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAC--A---GTT-------AA-------TT------T--T----AAACAG-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59361 : AAAATGAT--T-----GAT---------AA--T-GA-A-----T-----ACTC----CC-TC-AT-G--TCC-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--A-TA-C-T-A--G-GTCA------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATAAAA---------------------------GG-T--TTT-G--AAGTGGT
gi|59362 : AAAA--AC--T-----GAA---------AC--T-GA-A-----A-----TCTC----TC-TC-AT-T--GCA-AA-A-T-GCA--------C-----T--GTAA--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---CATA--CAA--A---TTT-TAGTTGAG-------TTATTTC-T--T----AAA-AG-T--TTT-G--GAGTTAT
gi|59363 : AAAAT-AT--TCATAAGGA---------AA--G-GA-A-----A-----GCTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--T-GTTG------T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TCATGA----------TA-----------------GG-T--TTT-A--GAGTT
gi|59364 : AAAAT-AT--TCATAAGGA---------AA--G-GA-A-----A-----GCTC----CC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-TAA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-T--T-GTTG------T-C-AT-G---TTTG--CAA--A---ATT-TCATGA----------TA-----------------GG-T--TTT-A--GAGTT
gi|59367 : AAAAT-GT--T---------------------T-GA-A-----A-----AATT----CC-TC-AT-A---C----------CA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-A-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TCCTGATA-------TTA--CC-T--T----GAATTG-T--TTT-A--GAGTTGT
gi|59368 : AAAAT-AT--T-----GAA---------AG--T-AG-A-----A-----AATC----CC-CA-GT-A--GGA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--T---A--C-CA-C-T-A--G-GTTC------A-C-AT-G---TGTG--CAA--T---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CA-T--T----TAAC
gi|59371 : AAGT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----GCTC----CC-AA-AT-A--GAA-AA-A-G-GCA--------A-----T--ACTG--G---A--C-TA-T-T-A--G-GTTG------A-C-AT-A---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------TTT--TC-T--T----AAAGGA-T--TTT-G--GAGTTGT
gi|59372 : AAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----TC-CC-GC-A--GCA-GA-A-G-GCA--------C--------------G---A--T-CA-T-T-A--G-GATG------T-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTTAAG-------TTA--CA-T--T----GAACGG-T--TTT-G--TAGTTGT
gi|59373 : AAAT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----CCTT----CC-CA-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--AACA--G---A--C-AA-C-C-C--G-GTTG------T-C-AT-A---TGTA--CAC--A----TT-TCGTAAAG-------TCA--CC-T--C----GAACAG-T--TTT-G--GTGTTGT
gi|59376 : AAC-AT--T-----AAA---------AAAAT-GA-ATATTGA-----ACTC----CC-TC-AT-A---CC-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCAG--G---G--T-CA-C-T-A--G-GTTG------A-CAAT-A---TGTG--CAA--A---ATT-TCATGAAG-------TTG--TA-T--T----GAATG
gi|59377 : AT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-CC-GA-A--GCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CA-C-T-A--GAATTG--------C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-T
gi|59378 : AT-TT--T-----GAA---------AA--G-GA-A-----A-----AC-C----CC-TT-AA-A--CCA-AA-T-A-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-G-A--T-GTTG------A-C-AA-G---TGCA--CAA--A---GTT-TCGTGAA--------TTA--CC-T--T----GATCGG-A--TTT-T--GAGCTGT
gi|59379 : AT-AT--T-----GAA---------AA--T-GA-A-----A-----ATTC----TC-TC-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--TCTA--G---T--C-CA-T-G-A--T-GTTG------T-C-AC-A---TGT-----------------------G-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-G--GAGTT
gi|59382 : T-AT--T-----CAA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----TA-TC-AT-A--CCA-AA-A-T-ACA--------C-----T--ACCA--G---A--T-CA---T-G--G-GTTG------T-C-GT-T---TGTA--CAG--C---ATT-TCGTGATG-------TTA--CC-A--T----AAACGG-T--TTC-C--GAGTTGT
gi|59384 : -AT--T-----GAT---------AA--G-AA-A-----A-----GCCC----AC-TT-GG-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTA--G---A--C-TA-C-T-T--G-G-TG------ATC-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TCGTGAGG-------TAA--TC-T--T----GAACGG-T--ATT-A--GAATT
gi|59385 : -AT--T-----AAT---------AT--T-GA-A-----A-----ACTC----TC-TC-AT-A--GCATAA-A-G-GCA--------T-----T--AATA--G---A--C-CA-T-T-A--G-GTTG------A-C----------------A--A---GTT-ATGTGAAGTTATCTATTA--TC-T--T----GAATGA-T--TTT-G--GAGTT
gi|59387 : T--T-----GAC---------AA--T-GA-A-----A-----ACTC----CC-AA-AT-A--GTA-AA-A-G--TA--------C-----T--ACTT--T---A--T-CA-C-T-G--A-ATTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--T---CTT-TCTTTGAA-------TTA--TC-T--C----GAACGG-G--TTT-G--
gi|59389 : -----GAA---------AA--T-GA-A-----G-----ACTC----CC-GT-AT-A--TCA-GT-G-G-GCT--------C-----T--ACTA--G---G--C-CA-T-T-A--A-GACA------A-C-A--G---TATA--CAA--A---GAT-TTATGAAG-------TTA--AC-TAAT----GAACAG-T--TTT-G--GAGTGGT
gi|59390 : AA---------AA--T-GA-A-----A-----ACTT----CC-TC-AT-A--CAA-AA-A-G-GCA--------T-----T--ACTA--G---A--C-CA-T-T-A--G-TTTG------A-C-AT-G---TGTG--CAC--A---ATT-TTGTGA----------TA--CC-G--G----TAACGG-T--TTT-G--G
gi|59392 : ---------AA--T-GA-G-----A-----ACAC----CC-TT-GT-A--GCA-AC-A-A-GCA--------C-----T--GCTA--A---A--C-CA-C-T-A--G-TACA------A-C-AT-G---TGTA--CCA--A---GTT-TTGAGAAG-------AAA--CC-A--T----GAACGG-T--TTT-G--
gi|59394 : A--T-GG-A-----A-----ACTC----CA-CC-AT-A--GCA-------------------C-----TTGACGA--G---A--GGCA-C-T-A--G-GTTG------G-C-AT-G---TGTG--CAA--A---GTT-TCGTGAAC-------TTA--CC-T--G----AAATGG-T--TGT-G--GAGCTGT
gi|59397 : A-A-----G-----ATTC----CA-TT-GT-A--CCA-AA-T-A-ACA--------C-----T--ACTA--G---A--T-CA-T-C-G--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--C---GTT-TTGTGATG-------TTA--CC-T--T----GAAC-G-T--TCC-G--GA
gi|59399 : -----A-----AC-C----CC-TC-AA-G--GCA-AA-A-C-GCA--------C-----T--ACTT--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GGT-TCATGAAA-------TTA--TC-T--T----GAAC-A-T--TTT-GTAAAGTTAT
gi|59400 : -----A-----ACTC----CT-CA-AT-A--GCA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACTT--A---A--C-CA-C-C-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TATA--TGA--A---GTT-TTGTGA----------TA-----T--T----AAACAG-T--TGT-A--AAGT
gi|59405 : -A--ACA-AA-A-G-GCA--------C-----T--ACCA--G---A--T-GA-C-T-A--G--TTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TTGT-AAG-------ATA--TC-T--T----AAACAG-T--TAA-G--GAGTT
gi|59409 : A-A-G-GCA--------C-----T--ACAA--G---A--C-TA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-GTGATGTA--CAA--A---GTT-TCATACAG-------TGA--CC-T--A----GAACAGTT--TTT-G--GAGTAGT
gi|59410 : CTA--G---A--C-CA-C-T-A--G-GTTG------A-C-AT-T---GGTA--CAA--A---GTT-ACATGAAA-------TTA--CC-T--T----AAAGGG-T--TTT-G--GA
gi|59411 : TA--G---A--C-CA-A-T-A--G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCATGAAA-------TTA--CC-T--T----GAATGG-T--TTT-G--
gi|59413 : --G-GTTG------A-C-AT-G---TGTA--CAA--A---GTT-TCGTGAAG-------TTA--CC-T--T----AATCAG-T--TTT-G--GAGTTAT