lowQualScore                  :                                                                                                                          1                  1                                                                           
lowQualScore                  :        5     333 1111   1 1 999999999  0     00 00 111 11111     000 0 0 0 0  111111 11 22222 0   000  8 1111 1111       4 11111   33   111 1    0       0000 0   0000 0 0 0    00 000 0   0  11  0    0 111  000       
lowQualScore                  :        .     ... ....   . . .........  .     .. .. ... .....     ... . . . .  ...... .. ..... .   ...  . .... ....       . .....   ..   ... .    .       .... .   .... . . .    .. ... .   .  ..  .    . ...  ...       
lowQualScore                  :        2     999 1111   6 0 333333333  5     66 66 666 66666     888 4 4 4 4  222222 00 55555 9   777  2 1111 3333       5 00000   66   333 4    8       9999 4   9999 4 4 4    66 777 4   4  11  4    5 888  888       
consensus                     :      AAATTCTG--TT----TTT-C-TC--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TCATC---TTGA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
Reference ( gi|79930 )        :      AAGTTCTG--CT----TTT-C-TT--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGAGGA-----TTG-CTTA---GACATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79929                      :      AAATTCTG--TT----TTT-C-TA--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTCA--T-G----CCTGAAGCA-----TTG-CTTA---GACATA-ATAGTTG----A-GAT----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GGTTATA--AT---A
gi|79937                      :      AAATTCTG--TT----TTT-C-AT--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-G-T-T-TC------ACAA-----TTATC---TTGA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTGG----A-GAT----T-G-G-GTTC--T---T-TTA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79931                      :      AAATTCTG--TT----TTT-C-TG--------AT-CTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--T-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGGGCA-----TTG-CTTA---GACATA-ACAATTT----A-GAC----A-A-G-GTCC--T---T-TAA-TG--GA-GAAT-TG--AT---ATAAATA
gi|79932                      :      AAATTCTG--TT----TTTTC-TG--------AG-CCATT--T--T---A-----TGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTGTC---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---GACATA-ATAGTTG----T-GAC------A-G-GTCC--T---T-T-A-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79936                      :      AAATTCTG--CT----TTA-C-TG--------AT-CTATT--T--T---A-----AGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTAA--T-G----TCTTGAGCA-----TTG-TTTA---GACATG-ACAGTTG----A-GAT----A-G-G-CTCCTTT---T-TAA-A----G-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79935                      :      AAATTTTG--CT----TTT-T-TG--------AT-GTATT--T--A---A-----GATTT---T-A-T-TATA------A--A-----TTATA---TTTA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTG---GTTATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79934                      :      AAATTCTG--CT----TTT-T-TTTTTTTTTTAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----CTATC---TTCA--T-G----TCTGCAGCA-----TTG-CTTA---GACATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCG--T---T-TA
gi|79940                      :      AAATTATG--TT----TTC-C-TC--------AT-TTATT--T--T---T-----GGTAT---T-A-T-T-CC------A--A-----TCATA---TTGT--T-G----TCTGAAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-CAA-AG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79942                      :      AAATTCTGGGTT----TTT-T-TC--------AT-CTATT--T--T---A-----AATAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TCATC---TTTA--T-G----TCTGGAGTA-----TTG-TTGA---GTCATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-T-GTTC------T-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---GTA
gi|79943                      :      AAATTCTG--CT----TTT-C-TG--------AT-TTATT--T--T---A-----GGAGT---T-A-T-T-TT------A--A-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TCG-CTTA---GATATA-TCAGTTG----A-GA--------------C--A---T-TAA-A---GG-GATT-----AT---AT
gi|79946                      :      AAATTTTG--TT----TTT-C-TC--------AT-ATATT--T--T---T-----GGTAT---T-G-C-T-TT------A--A-----TCATC---TTGA--T-G----TCTGAAACA-----CTG-TTTA---GTCATA-ACATTTG----A-GAC----T-G-G-GTCT--T---T-TAA-AG--GA-TATT-AA--AT---A
gi|79951                      :      AAATTGTG--TT----TTTTC-TC--------AT-TTATC--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----ACATC---TTGA--T-G-----CCGGGGCA-----TTG-TTTA---GTCATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTGA------T-TAA-AG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79953                      :      AAATTCTC--TT----CTT-A-TC--------AT-CTATT--T------A-----GGAAT---T-A-T-T-CT------A--A-----TCTTC---TTAA--G-A----TCTGGAGTA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-AAA-GG--AA-GATT-TT--AT---AT
gi|79944                      :      AAATTATG--TT----TGT-C-TC--------AT-ATATT--T--T---A-----TGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----ACATC---TTGA--T-G----TCTGGGGCA-----ATT-TTTA---GTCATA-ACGGTGG----A-GAA----T-A-G-ATCC--T---T-TCA-AG--GG-GATT-TT--AT---ACACATA
gi|79959                      :      AAATTATG--TT----TTT-C-TC--------AT-TCAGT--T--T---T-----GGTAT---T-A-T-T-CC------A--A-----T-ATT---ATTA--TTG----TCCAAAGCA-----TTG-TTTT---ATCATA-GCAGTTA----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---G-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79961                      :      AAATTATG--TT----TTT-C-TC--------AT-CCAAT--T--T---T-----GGTAT---T-A-T-T-CC------A--A-----TCATA---TTGA--T-G----TCTAAAGCA-----CTG-TTTA---TCCATA-AGAGTTG----A-GAC----T-T-T-GTCA--T---T-TAA-AG--AG-GTTT-TA--AT---AT
gi|79957                      :      AAATTATG--TT----TTT-C-TT--------AT-ACATT--T--A---T-----TGTAT---T-A-T-T-GC------A--A-----TCATA---TTGA--T-A----TCTGAACCA-----ATT-TTTA---GTCACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-GG--GG-AATT-TG--AT---
gi|79949                      :      AAATTATG--CA----TTT-C-TG--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTTT---T-A-T-T-TC------A--A-----CTATC---TT-A--T-G----TCTCAAGCA-----TTG-CTTA---GAC--A-ACAGTTG----A-TGC----A-G-G-ATCC--TGAAT-TGATAC--AG-GACA-TG--AA---TTAAATA
gi|79948                      :      AAATTCTG--TT----TTT-C-TG--------AT-ATATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATT---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---
gi|79952                      :      AAATTCTT--TT----TTT-T-TC--------AT-CCATT--T--T---ATTTTTGGAAT---T-A-T-T-TT------A--A-----TTA-C---TTGA--A-GA---TCTTGAGTA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTC----A-TAA----A-G-A-GTCT--T---T-TAA-AAT-GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79962                      :      AAATTATG--TT----TTT-C-TC--------AT-TTATT--T--T---------GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----ACATC---TGGA--T-T----TCTGAGGCA-----TTG-TTTA---GTTATA-ACAGTTG----A-GAA----T-A-A-GTGA--T---T-----AA--GG-GATT-TA--
gi|79941                      :      AAACTCTC--TT----TTT-A-TC--------AT-CTATT--T--T---G-----GGAAT---T-A-T-T-TT------A--A-----ACATC---AATA--G-A----TCTAAAGTA-----TTG--TTAAA-GACAAA-ATAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--T---T-AAA-AA--GA-GATT-TG--ATTTCATAA
gi|79965                      :      AAATTTTG--TT----TTT-C-TC--------CT-CTATT--T--T---C-----CGCAT---C-A-T-T-TC------A--A-----TCGT----TTTA--T-GAGTATCTGAAACT-----TTG-TTTA---GTCATA-GAAGTTATACTA-AGC----T-A-G-GTCC--T---T-TAA-GG--AG-GATT-TG--AT---AT
gi|79974                      :      AAATTC-G--CT----TTT-TATC--------AT-CTGTCAGTAGT---A-----GAAAT---T-A-T-T-T-------A--A-----CCATC---TTAA--T-A----TCTCTAGTA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAATTG----C-GAC----T-G-G-GTTT--T---A-TAA-AG--GA-AATT-TG--AT---AT
gi|79970                      :      AAATTGTG--TT----TTT-T-TTTC------AT-CTATT--T--T---T-----GGTAT---T-A-T-C-TT------A--A-----T----------G--T-A----TTTGG-GCA-----TTG-TTTA---GTCATT-AAAGTAG----A-GAC----T-T-G-GTCC--T---T-TGA-AG--GA-GATT-TA--
gi|79955                      :      AAATTATG--TT----TTT-G-TT--------AA-CTGTT--G--A---T-----GGTAA---T-A-T-T-TC------A--A-----ACATC---TTGC--T-G----TCTGGGGCA-----TTT-TTTA---GTC-TGTACAGTGG----A-GAC----T-G-G-GGCA--T---T-TAA-AG--GA-GATT-TA--AT---ACACATA
gi|79969                      :      AAGTTATA--TT----TTT-A-AC--------AG-TTATT--T--T---G-----GGAAT---T-A-T-T-TT------A--A-----TCATC---TTGA--G-A----TCCGAAGTA-----TTG-TTAA---GTCATA-GCAGTTG----A-GCC----CAG-A-AACC--T---T-TAA-AG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|79975                      :      AAATTCT---CT----TTTAC-TT--------AT-CTATT--T--T---G-----GATAG---T-A-T-T-G---------------------------A--T-A----CCTGGAGCT-----TCA-ATTA---GTCATA-ACAGTTT----A-AAC----T-G-G-ATTT--T---T-TTA-AG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79954                      :      AAATTATG--TT----TTT-C-TC--------AT-CTATT--T--TCTCA-----TCTAT---T-A-T-G-TC------A--A-----ACATT---TTGA--T-G----TCTTGGGCA-----TTG-TTTA---GTTATT-ACAGTTG----A-GA--------------C--T---T-TAA-AA--AG-GGTT-TA--AT---ACA
gi|79972                      :      AAATTATG--TT----TTT-TATC--------AT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----------------------------GGAGCA-----TTG-TTTA---GTCTTT-GCAGTTT----G-GAC----T-G-G-A--C--T---T-TAA-AG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79987                      :       AATTCTG--TT----TTA-C-TG--------AT-CTATT--T--T---A-----GGCAA---T-A-AAT-TC------A--A-----TTATC---TTTA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---AACATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GT-GATT-TGATAT---ATAAATA
gi|79991                      :       AATTCCA--TT----TTT-C-TT--------AC-CTGTT--T--G---A-----AGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTGA--G-G----TCTGGTACA-----TTG-TTTT---GTAATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|79989                      :       AATTCTG--TTATTTTTT-C-TC--------AT-CTATT--T--T---A-----TGTAT---T-A-G-T-TC------A--A-----TTATC---TTGA--G-A----TTTGGAACA-----TTA-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-AAC----T-T-T-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TT--AT---AT
gi|79983                      :       AATTCTG--TT----TTT-C-TC--------AC-ATATT--T------A-----TGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTGA--G-G----TCTTGAACA-----TGT-ATTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---C-TAA-AG--GG-GATA-TA--AT---AT
gi|79993                      :       AATTCTC--TT----TTT-C-TC--------AT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-A-T-C-TT------A--A-----TAGTT---TTTA----G----TCTGAAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AT--TG-G-TT-TG---T---ATA
gi|79990                      :       AATTTTA--TC----TTT-T-TT--------AT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-C-T-C-TT------A--G-----TCATC---TTCA--G-A----TCTGGAGTA-----TTG-TTTA---GTCGTA-ACAGTTG----A-TAC----T-G-G-TTCC--T---C-CAA-A
gi|79986                      :       AATTCTG--TT----TTT-C-TC--------AC-CTATT--T--T---A-------CAT-----A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTGA--G-G----TCTTGAACA-----TTG-TTTA---GTCGTA-ACAACTG----A-GGC----A-G-G-TTTC--T---T-TAA-AG--GA-TAAT-TA--AT---AT
gi|79988                      :       AGTTCTT--TT----TTT-C-TC--------AT-CTA-------------------------------T-TC------A--T-----TTATA---TTGA--G-G----TCTGGAACA-----TTT-TTTT---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-ATAC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79996                      :       AATTCTA--AT----TTT-A-TC--------AG-TTATT--T--T---A-----GGAAT---T-A-T-T-TT------A--A-----TCATC---TTGA--G-G----TCTGGAGTA-----TTG-TTTA---GTCATC-ACAGCTG----A-GGT----T-G-A-GACT--T---A-TAA-A---AG-TATT-TA--AT---AT
gi|79995                      :       AATTCTA--TT----TTT-C-TC--------AC-CTATT--T--T---G-----TGTTT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTGA--G-G----TCTGGAACA-----TTG-TTAA---GTCGTA-ACA-----------------------GTCC--T---T-T-A-AG--GG-GATT-TA--GT---AT
gi|79999                      :       AATTTTA--TT----TCT-A-TC--------AT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TT------C--A-----TCATC---TTGA--T-A----TCTGGAGAA-----TTG-TTTG---ATCGGAGACGG-TG----G-GAC----T-A-T-AACC--T---TATAA-AG--AG-AATT-TA--AT---ATCGATA
gi|80010                      :         TTCTG--TT----TTT-C-TG--------AT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTCA--T-A----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---AACACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80003                      :         TTCTG--TT----TTT-C-TG--------AT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--G-----TTATT---TTCA--T-G----CCTCGAGCA-----TTG-CTTA---GACATA-ACAGTGG----A-GAT----A-G-G-GTCC--T---T-TAA--------GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80012                      :        aTTCTA--TT----TTT-C-TG--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------AT-A-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---GACATT-GCAGTTC----A-TAT----A-A-G-GTCC--T---T-TGA-AT--GG-GATT-TG--GC---ATAAATA
gi|80005                      :         TTCT----T----TTT-A-TA--------AT-CTATT--T--T---A-----GGATT---T-A-T-T-TT------A--A-----TCATC---TTGA--G-A----TCTGGAGTA-----TTG-TTTA---GTCATT-ACAGTGG----A-GAC----T-G-G-ATCC--T---T-TAA-AA--GG-GA-T-TA--AT---ATAAATA
gi|80006                      :      attTTCTG--TT----TTT---TC--------AC-CTATT--T--T---A-----CATAT---T-G-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTGA--G-G----TTTGGAACA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-
gi|80007                      :        aTTATG--TT----TTT-C-TC--------AT-CCATT--T--T---AA----GGTGT---T---T-T-TCTAATCAA--A-----TTGTT---TTCA------------GAAGCA-----TTG-TTTG---GTCATA-ACAGTGG----A-TAT----T-C-T-GTCC--T---T-TAA-AG--TG-GATT-TA--AT---AT
gi|79960                      :         aTCTG--TT----TTT-G-TC--------AT-TTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-T-T-T-TC------A--A-----TCATT---TTAA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-AAAG--------------------G-GTA---T---C-TAA-AG--GG-AATT-TA--AT---AT
gi|79984                      :       aaaaCTA--CT----TTT-C-TG--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-GC------A--A-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---GACATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TGA-AG--GG-AATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79985                      :       aataCTA--CT----TTT-C-TG--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-GC------A--A-----TTATT---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---GACATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-AATT-TG--AA---ATAAATA
gi|79939                      :        aataTG--CT----TTT-C-TA--------TT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGAGCA-----TTG-CTTA---AACATA-ACAGCTG----A-GAC----A-T-A-GTTC--T---T-TAA-A---CG-GATA-AA--AT---ATAAATA
gi|79958                      :      aaatgtTG--TT----TTT-C-TT--------AT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-C-AC------A--A-----ACATC---TTGA--T-G----TCTAGGGCT-----TTG-TTTA---GTCATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATGA--T---T-C-A-AG--GG-AATT-TG--AT---ATA
gi|79950                      :        aaatTG--TT----TTT-C-TC--------AT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-A-T-T-CC------A--A-----TGATA---TTGA--T-G----TCTGAAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC------A-G-GTCC--T---T-
gi|80017                      :      aaagtaTG--TT----ATT-C-TC--------AT---ATT--T--T---A-----GATAT---T-A-A-T-TT------G--A-----TTATA---TTGA--T-G----TCTGGGTTC-----TTG-TTCA---GTCATA-ACGGTTA----G-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|79964                      :            TG--CT----TTC-T-TT--------AT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-A-C-T-TG------A--AA----TCATA---TTGA--G-G----TCTGGTGCA-----TTG-TTCA---GTCAAA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-T-GTTC--T---T-TAA-AG--GG-AATT-T---AT---GTCAAT
gi|80018                      :        aaatTG--TT----TTT-C-TC--------AT-TT--T--T--T---A-----GATAT---T-A-A-T-TT------G--A-----TTATA---TTGA--T-G----TCTGGGTTC-----TTG-TTTA---TTCATA-ACAATTA----G-GAC----T-G-C-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80020                      :            TG--AT----TTT-C-CC--------AT-CTATT--T--TTTTA-------TAT---T-A-T-T-TC------A--A-----ACATT---TTAA--T-T----TCTAGGGCA-----TTG-GTTA---GTTGTT-ACAATGA----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--AA-GATT-AA--AT---ACACATA
gi|79973                      :            TG--TT----TTC-C-TC--------AT-CTATT--T--T---T-----TGTAT---T-A-C-T-CC------A--A-----ACATC---TTGT--T-A----TCTGGGGCA-----TTG-TTTG---GTCACT-ACAATGG----A-ATC----T-G-G-GTTC--A---T-TTA-AG--GA-GATT-TA--AT---ACACAT
gi|80019                      :      aaataaTG--TT----TTT-C-AG--------AT-CTATT--T--T---T-----AGAAT---T-A-T-A-TC---------------TTAT-----TCA--T-------CTTGAGAACTCTATTG-TTTA---GATATA-ACAGTTG----G-AAA----T-G-G-GTCC--T---T-TA
gi|80024                      :             G--CT----TTT-C-TC--------AT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-A-T-T-CC------A--A-----TCATA---TTGA--T-G----TCTGAAGCA-----TTG-TTAA---GTCACA-ACAGTT
gi|79994                      :              --CT----CTT-T-AT--------GT-CTACT--T--C---A-----GGAAT---T-A-T-T-TT------A--A-----TCATC---TTGA--G-A----TCTAAAGTA-----TTG-CTTA---GTCATA-ACAGTCA----A-GAC----T-G-G-GAAC--T---T-AAA-GG--GG-GA
gi|80011                      :             aattT----TTT-C-TTCTG-----AT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATC---TTCA--T-G----TCTGGAGAA-----TTG-CTTA---GATATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80004                      :              tttT----TTT-C-CT--------AT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TG------A--A-----TCATT---TTGA--T-A----TCTGGAGCA-----GTG-TTTA---GTCATA-ACTGTTT----A-GAC----T-G-G-GACC--T---T-TAA-AG--AA-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|80025                      :          attatatT----TTT-C-CC--------AC-CAATT--C--T---A-----TGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TCATC---TTGA--G-G----TCTGGAACA-----TTG-TTCA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-----GTTC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80027                      :                tT----TTT-C-TC--------AA-TTATT--T--T---A-----TTTAT---T-A-T-T-TT------G--A-----CTACC---TTGA--G-G----TCTGGAACA-----TTG-CTTA---GTCATA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--T---G-TCA-AG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79963                      :                tT----TTT-C-TC--------AT-CTATT--C--T---G-----GG-AT---T-AAT-T-TT------A--A-----TTATC---TGGA--G-A----TCTGGAATA-----TTG-TTTG---GTCATA-ACAGTTG----A-TAT----T---G-GTCA--T---T-TAA-AA--GC-GATT-TA--AT---ATACATA
gi|79998                      :       aaactctcttT----TTT-T-TT--------AT-----------T---A-----GGGAT---T-G-T-T-TT------A--A-----TCATC---TTTA--G-A----TCTGGAGTA-----TCG-TTCA---GTCATA-ATAGTCG----A-AGC----T-G-G-GTCC--T---T-CAA-AA--GT-GACT-TA--AT---AT
gi|79997                      : aatactatacttataaT----TTT-C-CT--------ATTCTATT--T--T---A-----TGTAT---T---T-T-TT------A--A-----TCATT---TTGA--G-G----TTTGAAACA-----TTG-TTTA---GTCA-A-ATAGCTG----A-GAA----T-G-G-GTCC--T---T-TAC-AA--GG-GAT
gi|79971                      :             aattT----TTT-C-TTTTTAGC--AT-CTATT--T--C---A-----GGAAT---T-A-G-T-GT------A--A-----TCACC---TTGA--G-A----TCAGGAGCA-----TTG-TTCA---ATCATG-AGATTTG----A-CAC----T-G-A-ATCT--T---T-TAA-AG--AG-GATT-TG--AT---AT
gi|80029                      :              aaaT----TTT-C-TC--------AT-ACAAT--T--T---A-----GGTAT---T-A-C-T-TC------A--A-----TCATC---TTGA--T-A----TCTAGGGCA-----TTG-TTTA---GTAATA-AAAGTTA----A-G
gi|80033                      :                 t----TTT-C-TT-----------CAAGT--T--T---T-----GGTAT---G-A-T-T-CC------A--A-----TCATA---TTGA--T-G----TCTGAAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-CAC----T-G-G-TTCC--T---T-CAA-AG--AG-GACT-TA--
gi|80028                      :                  ----TTT-T-TC--------AT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-A-T-T-TC------A--A-----ACATA---TTGA--T-G----TGTTGGGCA-----TTG-TGAA---GTCATT-ACAGTTG----A-GAC----A-GTG-GTTG--A---T-TAA-AG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80008                      :                  ----TTT-C-TC--------GT-CTATT--T--T---A-----GGAAA---T-A-T-T-TT------A--A-----CCATC---AGAA--G-A----TATAGAGTA-----TTG-TTTA---GTAACA-ACAGTTC----A-GAC----C-A-G-GGCC--T---T-TAA-AG--GA-GATT-TA--AT---AT
gi|80015                      :        atttttttta----TTT-A-TC--------AT-CTAAT--T--T---A-----GGAAT---T-A-T-T-TC------A--A-----TTATCATCTTGA--T-A----TCTGGAATA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAATTG----A-GA
gi|80016                      :               ctg----TTT-A-TC--------AT-GTATT--G--T---A-----GCGAC---G-A-T-T-TT------A--T-----TCATT---TTGA--G-A----TCGGAAGTA-----TTG-TTTA---GATAAA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-G-CC--C---T-TAA-AT--GG-GATT-TA--AT---ATtcaaatatccataagggg
gi|79945                      :                    ctgTT-A-TC--------AT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-A-T-T-AC------A--T-----GTATC---TGGA--C-A----TCTGGAGTG-----TTGTTTTA---ATCATA-ACAGTTG----A-GA-----T-G-GTGTCC------T-TAA-TGGTGG-GGTT-TA--AT---AT
gi|80038                      :              aaattctcaga-C-TT--------AT-CTATT--T--T---A-----CGTAT---T-T-T-T-TC------A--A-----TCATC---TTGA--T-G----TCTGAAGTA-----CT--TTTA---GTCATA-AGAATTG----A-AAC----T-G-G-GACC--T---T-TAA-A---AA-GATT-TA--GT---AT
gi|80039                      :                           -TT--------AT--TATG--T--G---A-----AGTAT---T-A-T-T-TG------A--A-----CCATT---TTGA--T-G----TCTGCAGCA-----TTG-TTTG---GCCATA-ACACTTG----A-GAC----A-G-G-GTCT--T---T-TTT-AA--TG-GAAT-TA--AT---AT
gi|80041                      :                           tga--------AT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-A-T-T-TT------A--A-----GCATC---TTGA--G-G----TCTGAAGCA-----TTG-TTAA---GTCATA-ACAGGTG----A-GGCTGCTT-G-G-GTAC--T---T-TAC-AG--GC-GGTT-TA--AT---A
gi|80042                      :                                      gT-CT-TT--T--T---A-----CGAAT---T-A-T-C-TA------A--A-----C-ATA---TTGA--G-G----TCTGGAATA-----TTA-ATTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|79968                      :                                       T-CTATT--T--T---C-----A--AT---T-G-T-T-TC------A--A-----ACATC---TTAA--T-G----TCTAGGGCA-----TTG-TTTA---GTAATT-ACAGTAG----A-GAT----T-T-G-GACC--T---T-TAA-AA--GA-GATT-TG--AT---ACACATA
gi|80045                      :                           aaataatgtttgtccTATT--T------------GGTATAACTGA-T-C-TC------A--------TTATC---TTGA--T-A----TCTAGAACA-----TGG-TTTC---GTCATA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-AAT------AT---AT
gi|80046                      :                                          TATT--T--T---G-----GAAAC---T-A-T-T-CC------A--------TTCTC---TTTG--T-G----CCTTGGGCA-----TTG-CTTA---TGCATA-ATAGTTG----AGGAT----T-G-A-ACTC--T---T-TAG-AG--GG-GATT-TG--CT---A
gi|80048                      :                                            TT--T--T---A-----AGAAT---T-A-C-T-TT------A--A-----TTTTC---TCGA--T-A----TCTGGAGTA-----TTG-TTTA---TTTGGA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GCCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TA--CT---AT
gi|80050                      :                                             T--T--T---A-----GGAAC---T-A-T-T-TC------A--A-----ATATC---TTGA--G-A----TCCTGAACA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GCC----T-G-G-GCCC--T---A-TAA-AG--GA-G
gi|80052                      :                                                        -----GGTAT---T-A-T-T-CC------A--A-----TCATA---TTGA--T-G----GCTGAAGCA-----TTG-TTAA---GTCATA-ACAGCTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--T---T-TAA-AG--GG-AGTT-TA--AT---AT
gi|80058                      :                                                                AT---T-C-T-T-TC------A--A-----TCATC---TTGA--T-G----TGTGAAGCA-----TTG-CTTT---GTCATA-ATAGTTC----A-AAC----T-G-G-GTCC--T---T-AAA-AG--GG-AATT-T
gi|80059                      :                                                                AT---A-A-T-T-TT------A--A-----TCATC-----CAGCT-G----TCAGGAGCA-----TTG-TTTA---GTCGTG-ACAGTCG----A-GGC----T-G-G-GGCT--T---T-TAA-AA--GGTGATT-TG--AT---AT
gi|80060                      :                                                                 T---T-C-T-T-TC------A--A-----GTTTG---TTCA--T-G----TCTGGATCA-----TTG-CTTA---GACATA-ACAATTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80061                      :                                                                 T---T-G-T-T-CC------G--A-----TCATG------A--T-G----TTTGAAGGA-----CTG-TTTA---GGCGTA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80062                      :                                                                  ---T-A-T-G-TA------A--A-----TTA-------CA--A-A----TCTGGAGCA-----TTG-TTAA---GTCATA-ACAGATG----G-GAG----T-G-G-ATCC--T---T-TAA-AG--TG-GATT-TG--AT---AT
gi|80063                      :                                                                        -T-T-TC------A--AAAGTATCATC---TTCA--G-A----TCTGGAGCA-----TTG-TTAA---GTCATA-ATAGTTC----A-TAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80064                      :                                                                        -T-T-TC------A--AAAGTATCATC---TTCA--G-A----TCTTGAGCA-----TTG-TTAA---GTCATA-ATAGTTC----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--AG-GA------------ATAAATA
gi|80069                      :                                                                               ------A--A-----ATATC---TTGA--T-G----TCTGCAGCA-----TTG-TTTA---GTCATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-A-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80072                      :                                                                                      --A-----TCATC---TTCA--G-A----TCTTGAGCA-----TTG-TTAA---GTCATA-ATAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80073                      :                                                                                               TATA---CTCA--T-G----TCTGAAGCA-----TTT-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----T-GAC----A-G-G-GTCC--T---T-TTA-AA--GG-GATC-TT--AT---AT
gi|80074                      :                                                                                                       TCA--T-C----TCTTGAGTA-----CTG-TTTA---GTTAAA-ATAGTTG----A-GAA----T-G-T-GTCC--T---T-TAA-AG--GG-GTTT-TA--AT---ATCAGTA
gi|80075                      :                                                                                                             -G----TCTGAAGCA-----TTG-TTTA---GTCATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--T---T-TAA-AG--GA-GATT-TA--AT---A
gi|80071                      :                                                                                                                                  TG-CTCATCTGATATA-ACAATTG----A-GGC----A-G-G-GTCA--T---T-TAA-AG--GG-GATT-TG--AT---ATAAAT





Alignments
lowQualScore                  :                             1  22222222  1111 00 0 1 0 000  0     00 00 111 11111     000 0  0 0  00 11 22222 000    00 00   00 0        000    0 0 0     0   0       0000 0   0000 0 0 0    00  0     11  0    0  00  000       
lowQualScore                  :                             .  ........  .... .. . . . ...  .     .. .. ... .....     ... .  . .  .. .. ..... ...    .. ..   .. .        ...    . . .     .   .       .... .   .... . . .    ..  .     ..  .    .  ..  ...       
lowQualScore                  :                             3  88888888  1111 77 5 0 5 777  5     66 66 666 66666     888 9  4 4  66 00 55555 777    66 66   55 4        777    4 4 4     4   4       9999 4   9999 4 4 4    66  4     11  4    5  77  999       
consensus                     :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
Reference ( family-227 )      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
gi|79929                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--AAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-CCTGAAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ATAGTTG----A-GAT----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GGTTATA--AT---A
gi|79930                      :                        AAGTTCTG--------CT----T--T-T-C-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGG---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79931                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--T-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGGGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAATTT----A-GAC----A-A-G-GTCC--TT-TAATG--GA-GAAT-TG--AT---ATAAATA
gi|79932                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-TTC-T--GAG-CCATT--T--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TGTC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ATAGTTG----T-GAC------A-G-GTCC--TT-T-AAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79934                      :                        AAATTCTGCTTTTTTTTT----T--T-T-T-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----C---TATC--T--TCA-TG-TCTGCAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCG--TT-TA
gi|79935                      :                        AAATTTTG--------CT----T--T-T-T-T--GAT-GTATT--T--A---A-----GATTT---T-AT-TATA--A--A-----T---TATA--T--TTA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TGGTT-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79936                      :                        AAATTCTG--------CT----T--T-A-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----AGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TAA-TG-TCTTGAGC---ATTG-T-T-TAGAC-ATG-ACAGTTG----A-GAT----A-G-G-CTCCTTTT-TAAA----G-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79937                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-A--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-GT-T-TC--ACAA-----T---TATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTGG----A-GAT----T-G-G-GTTC--TT-TTAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79939                      :                        AAATGTTG--------CT----T--T-T-C-T--ATT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ATA-ACAGCTG----A-GAC----A-T-A-GTTC--TT-TAAA---CG-GATA-AA--AT---ATAAATA
gi|79940                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-C-C-T--CAT-TTATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGT-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-CAAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79941                      :                        AAACTCTC--------TT----T--T-T-A-T--CAT-CTATT--T--T---G-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----A---CATCAAT--AGA----TCTAAAGT---ATTG-T-TAAAGAC-AAA-ATAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--TT-AAAAA--GA-GATT-TG--ATTTCATAA
gi|79942                      :                        AAATTCTGGG------TT----T--T-T-T-T--CAT-CTATT--T--T---A-----AATAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TTA-TG-TCTGGAGT---ATTG-T-T-GAGTC-ATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-T-GTTC---T-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---GTA
gi|79943                      :                        AAATTCTG--------CT----T--T-T-C-T--GAT-TTATT--T--T---A-----GGAGT---T-AT-T-TT--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATCG-C-T-TAGAT-ATA-TCAGTTG----A-GA--------------C--AT-TAAA---GG-GATT-----AT---AT
gi|79944                      :                        AAATTATG--------TT----T--G-T-C-T--CAT-ATATT--T--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG-TCTGGGGC---AATT-T-T-TAGTC-ATA-ACGGTGG----A-GAA----T-A-G-ATCC--TT-TCAAG--GG-GATT-TT--AT---ACACATA
gi|79945                      :                                               --T-T-A-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-AC--A--T-----G---TATC--T--GGA-CA-TCTGGAGT---GTTGTT-T-TAATC-ATA-ACAGTTG----A-GA-----T-G-GTGTCC---T-TAATGGTGG-GGTT-TA--AT---AT
gi|79946                      :             aaattctcagaAAATTTTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-ATATT--T--T---T-----GGTAT---T-GC-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGAAAC---ACTG-T-T-TAGTC-ATA-ACATTTG----A-GAC----T-G-G-GTCT--TT-TAAAG--GA-TATT-AA--AT---A
gi|79948                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-ATATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATT--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TA
gi|79949                      :                        AAATTATG--------CA----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTTT---T-AT-T-TC--A--A-----C---TATC--T--T-A-TG-TCTCAAGC---ATTG-C-T-TAG---ACA-ACAGTTG----A-TGC----A-G-G-ATCC--T
gi|79950                      :                        AAAGTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---GATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC------A-G-GTCC--TT-gaattgatacaggacatgaattaaata
gi|79951                      :                        AAATTGTG--------TT----T--T-TTC-T--CAT-TTATC--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG--CCGGGGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTGA---T-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79952                      :                        AAATTCTT--------TT----T--T-T-T-T--CAT-CCATT--T--T---ATTTTTGGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---TA-C--T--TGA-AGATCTTGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTC----A-TAA----A-G-A-GTCT--TT-TAAAAT-GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79953                      :                        AAATTCTC--------TT----C--T-T-A-T--CAT-CTATT--T------A-----GGAAT---T-AT-T-CT--A--A-----T---CTTC--T--TAA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-AAAGG--AA-GATT-TT--AT---AT
gi|79954                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--TCTCA-----TCTAT---T-AT-G-TC--A--A-----A---CATT--T--TGA-TG-TCTTGGGC---ATTG-T-T-TAGTT-ATT-ACAGTTG----A-GA--------------C--TT-TAAAA--AG-GGTT-TA--AT---ACA
gi|79955                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-G-T--TAA-CTGTT--G--A---T-----GGTAA---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGC-TG-TCTGGGGC---ATTT-T-T-TAGTCTGTA--CAGTGG----A-GAC----T-G-G-GGCA--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---ACACATA
gi|79957                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--TAT-ACATT--T--A---T-----TGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TA-TCTGAACC---AATT-T-T-TAGTC-ACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAGG--GG-AATT-TG--AT---
gi|79958                      :                        AAATT--G--------TT----T--T-T-C-T--TAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-C-AC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG-TCTAGGGC---TTTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATGA--TT-C-AAG--GG-AATT-TG--AT---ATA
gi|79959                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TCAGT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---ATTA--T--TAT-TG-TCCAAAGC---ATTG-T-T-TTATC-ATA-GCAGTTA----A-GAC----T-G-G-GTCC--TG-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79960                      :                        AAAATCTG--------TT----T--T-T-G-T--CAT-TTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-TT-T-TC--A--A-----T---CATT--T--TAA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-AAA-------------------G-G-GT-A--TC-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---AT
gi|79961                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCAAT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTAAAGC---ACTG-T-T-TATCC-ATA-AGAGTTG----A-GAC----T-T-T-GTCA--TT-TAAAG--AG-GTTT-TA--AT---AT
gi|79962                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TTATT--T--T---------GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--GGA-TT-TCTGAGGC---ATTG-T-T-TAGTT-ATA-ACAGTTG----A-GAA----T-A-A-GTGA--TT----AA--GG-GATT-TA--A
gi|79963                      :                        AAACTCTC--------TT----T--TTT-C-T--CAT-CTATT--C--T---G-----GG-AT---TAAT-T-TT--A--A-----T---TATC--T--GGA-GA-TCTGGAAT---ATTG-T-T-TGGTC-ATA-ACAGTTG----A-TAT----T---G-GTCA--TT-TAAAA--GC-GATT-TA--AT---ATACATA
gi|79964                      :                        AAATT--G--------CT----T--T-C-T-T--TAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AC-T-TG--A--AA----T---CATA--T--TGA-GG-TCTGGTGC---ATTG-T-T-CAGTC-AAA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-T-GTTC--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--
gi|79965                      :                        AAATTTTG--------TT----T--T-T-C-T--CCT-CTATT--T--T---C-----CGCAT---C-AT-T-TC--A--A-----T---CGTT--TTATGAGTA-TCTGAAAC---TTTG-T-T-TAGTC-ATA-GAAGTTATACTA-AGC----T-A-G-GTCC--TT-TAAGG--AG-GATT-TG--AT---ATtgtcaat
gi|79968                      :                        AAATAATG--------TT----T--G-T-C-C----T-CTATT--T--T---C-----A--AT---T-GT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TAA-TG-TCTAGGGC---ATTG-T-T-TAGTA-ATT-ACAGTAG----A-GAT----T-T-G-GACC--TT-TAAAA--GA-GATT-TG--AT---ACACATA
gi|79969                      :                        AAGTTATA--------TT----T--T-T-A-A--CAG-TTATT--T--T---G-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCCGAAGT---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-GCAGTTG----A-GCC----CAG-A-AACC--TT-TAAAG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|79970                      :                        AAATTGTG--------TT----T--T-T-T-TTTCAT-CTATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-C-TT--A--A-----T--------------G-TA-TTTGG-GC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-AAAGTAG----A-GAC----T-T-G-GTCC--TT-TGAAG--GA-GATT-TA--A
gi|79971                      :                        AAATTTTC--------TT----T--T-T-A-G--CAT-CTATT--T--C---A-----GGAAT---T-AG-T-GT--A--A-----T---CACC--T--TGA-GA-TCAGGAGC---ATTG-T-T-CAATC-ATG-AGATTTG----A-CAC----T-G-A-ATCT--TT-TAAAG--AG-GATT-TG--AT---AT
gi|79972                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-TAT--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A----------------------------GGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-TTT-GCAGTTT----G-GAC----T-G-G-A--C--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79973                      :                        AAATAATG--------TT----T--T-C-C-T--CAT-CTATT--T--T---T-----TGTAT---T-AC-T-CC--A--A-----A---CATC--T--TGT-TA-TCTGGGGC---ATTG-T-T-TGGTC-ACT-ACAATGG----A-ATC----T-G-G-GTTC--AT-TTAAG--GA-GATT-TA--AT---ACACAT
gi|79974                      :                        AAATTCGC--------TT----T--T-T-A-T--CAT-CTGTCAGTAGT---A-----GAAAT---T-AT-T-T---A--A-----C---CATC--T--TAA-TA-TCTCTAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----C-GAC----T-G-G-GTTT--TA-TAAAG--GA-AATT-TG--AT---AT
gi|79975                      :                        AAATTCTC--------TT----T--T-A-C-T--TAT-CTATT--T--T---G-----GATAG---T-AT-T----------------------------GA-TA-CCTGGAGC---TTCA-A-T-TAGTC-ATA-ACAGTTT----A-AAC----T-G-G-ATTT--TT-TTAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79983                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAC-ATATT--T------A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTTGAAC---A-TG-TAT-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TC-TAAAG--GG-GATA-TA--AT---AT
gi|79984                      :                         AATACTA--------CT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TGAAG--GG-AATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79985                      :                         AATACTA--------CT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---TATT--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATT-TG--AA---ATAAATA
gi|79986                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAC-CTATT--T--T---A-------CAT-----AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTTGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-GTA-ACAACTG----A-GGC----A-G-G-TTTC--TT-TAAAG--GA-TAAT-TA--AT---AT
gi|79987                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-A-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGCAA---T-AAAT-TC--A--A-----T---TATC--T--TTA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GT-GATT-TGATAT---ATAAATA
gi|79988                      :                         AGTTCTT--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTAT--------------------T---C-AT-T-T-----------------ATA--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTT-T-T-TTGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-ATAC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79989                      :                         AATTCTG--------TTATTTT--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----TGTAT---T-AG-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GA-TTTGGAAC---ATTA-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-AAC----T-T-T-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TT--AT---AT
gi|79990                      :                         AATTTTA--------TC----T--T-T-T-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-CT-C-TT--A--G-----T---CATC--T--TCA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-GTA-ACAGTTG----A-TAC----T-G-G-TTCC--TC-CAAA
gi|79991                      :                         AATTCCA--------TT----T--T-T-C-T--TAC-CTGTT--T--G---A-----AGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTGGTAC---ATTG-T-T-TTGTA-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|79993                      :                         AATTCTC--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AT-C-TT--A--A-----T---AGTT--T--TTA--G-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAA
gi|79994                      :                         AATTCTC--------TT----T--A-T-------GT-CTACT--T--C---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCTAAAGT---ATTG-C-T-TAGTC-ATA-ACAGTCA----A-GAC----T-G-G-GAAC--TT-AAAGG--GG-GAttggtttgtata
gi|79995                      :                         AATTCTA--------TT----T--T-T-C-T--CAC-CTATT--T--T---G-----TGTTT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-T-T-AAGTC-GTA-ACA-----------------------GTCC--TT-T-AAG--GG-GATT-TA--GT---AT
gi|79996                      :                         AATTCTA--------AT----T--T-T-A-T--CAG-TTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GG-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATC-ACAGCTG----A-GGT----T-G-A-GACT--TA-TAAA---AG-TATT-TA--AT---AT
gi|79997                      :                                --------TT----T--T-T-C-C--TATTCTATT--T--T---A-----TGTAT---T--T-T-TT--A--A-----T---CATT--T--TGA-GG-TTTGAAAC---ATTG-T-T-TAGTC-A-A-ATAGCTG----A-GAA----T-G-G-GTCC--TT-TACAA--GG-GAT
gi|79998                      :                                                                aat--T--T---A-----GGGAT---T-GT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TTA-GA-TCTGGAGT---ATCG-T-T-CAGTC-ATA-ATAGTCG----A-AGC----T-G-G-GTCC--TT-CAAAA--GT-GACT-TA--AT---AT
gi|79999                      : aatactatacttataatttttttaAATTTTA--------TT----T--C-T-A-T--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TT--C--A-----T---CATC--T--TGA-TA-TCTGGAGA---ATTG-T-T-TGATC-GGAGACGG-TG----G-GAC----T-A-T-AACC--TTATAAAG--AG-AATT-TA--AT---ATCGATA
gi|80003                      :                          ATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--G-----T---TATT--T--TCA-TG-CCTCGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTGG----A-GAT----A-G-G-GTCC--TT-TAA-------GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80004                      :                          ATTATA--------TT----T--T-T-C-C--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TG--A--A-----T---CATT--T--TGA-TA-TCTGGAGC---AGTG-T-T-TAGTC-ATA-ACTGTTT----A-GAC----T-G-G-GACC--TT-TAAAG--AA-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|80005                      :                          ATTTTC--------TT----T--T-T-A-T--AAT-CTATT--T--T---A-----GGATT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTGG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TT-TAAAA--GG-GA-T-TA--AT---ATAAATA
gi|80006                      :                          ATTCTG--------TT----T--T-T---T--CAC-CTATT--T--T---A-----CATAT---T-GT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TTTGGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAA
gi|80007                      :                          ATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---AA----GGTGT---T-TT-T-CT--A--A-----T---CAAA--T--TGT-TT-TCAGAAGC---ATTG-T-T-TGGTC-ATA-ACAGTGG----A-TAT----T-C-T-GTCC--TT-TAAAG--TG-GATT-TA--AT---AT
gi|80008                      :                          ATTTTT--------TT----TATT-T-C-T--CGT-CTATT--T--T---A-----GGAAA---T-AT-T-TT--A--A-----C---CATC--A--GAA-GA-TATAGAGT---ATTG-T-T-TAGTA-ACA-ACAGTTC----A-GAC----C-A-G-GGCC--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---AT
gi|80010                      :                           TTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TA-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80011                      :                           TTTTT--------TT----C--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGA---ATTG-C-T-TAGAT-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80012                      :                           TTCTA--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--AT-A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATT-GCAGTTC----A-TAT----A-A-G-GTCC--TT-TGAAT--GG-GATT-TG--GC---ATAAATA
gi|80015                      :                                          ----T--T-T-A-T--CAT-CTAAT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TC--A--A-----TTATCATC--T--TGA-TA-TCTGGAAT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----A-GA
gi|80016                      :                                       ctg----T--T-T-A-T--CAT-GTATT--G--T---A-----GCGAC---G-AT-T-TT--A--T-----T---CATT--T--TGA-GA-TCGGAAGT---ATTG-T-T-TAGAT-AAA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-G-CC--CT-TAAAT--GG-GATT-TA--AT---ATtcaaatatccataagggg
gi|80017                      :                           ctgTG--------TT----A--T-T-C-T--CAT---ATT--T--T---A-----GATAT---T-AA-T-TT--G--A-----T---TATA--T--TGA-TG-TCTGGGTT---CTTG-T-T-CAGTC-ATA-ACGGTTA----G-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80018                      :                              TG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TT--T--T--T---A-----GATAT---T-AA-T-TT--G--A-----T---TATA--T--TGA-TG-TCTGGGTT---CTTG-T-T-TATTC-ATA-ACAATTA----G-GAC----T-G-C-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80019                      :                              TG--------TT----T--T-T-C-A--GAT-CTATT--T--T---T-----AGAAT---T-AT-A-TCTTA--T-----T---CATC--T--TGA--------GAACTCTATTG-T-T-TAGAT-ATA-ACAGTTG----G-AAA----T-G-G-GTCC--TT-TA
gi|80020                      :                              TG--------AT----T--T-T-C-C--CAT-CTATT--T--TTTTA-------TAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATT--T--TAA-TT-TCTAGGGC---ATTG-G-T-TAGTT-GTT-ACAATGA----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AA-GATT-AA--AT---ACACATA
gi|80024                      :                               G--------CT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ACA-ACAGTT
gi|80025                      :                                --------TT----T--T-T-C-C--CAC-CAATT--C--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-T-T-CAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-----GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80027                      :                                --------TT----T--T-T-C-T--CAA-TTATT--T--T---A-----TTTAT---T-AT-T-TT--G--A-----C---TACC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-C-T-TAGTC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TG-TCAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|80028                      :                                          ----T--T-T-T-T--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATA--T--TGA-TG-TGTTGGGC---ATTG-T-G-AAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----A-GTG-GTTG--AT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80029                      :                                --------TT----T--T-T-C-T--CAT-ACAAT--T--T---A-----GGTAT---T-AC-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TA-TCTAGGGC---ATTG-T-T-TAGTA-ATA-AAAGTTA----A-G
gi|80033                      :                                          ----T--T-T-C-T----T-CAAGT--T--T---T-----GGTAT---G-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-CAC----T-G-G-TTCC--TT-CAAAG--AG-GACT-TA--A
gi|80038                      :                                                    -C-T--TAT-CTATT--T--T---A-----CGTAT---T-TT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGAAGT---ACT--T-T-TAGTC-ATA-AGAATTG----A-AAC----T-G-G-GACC--TT-TAAA---AA-GATT-TA--GT---AT
gi|80039                      :                                                               TATG--T--G---A-----AGTAT---T-AT-T-TG--A--A-----C---CATT--T--TGA-TG-TCTGCAGC---ATTG-T-T-TGGCC-ATA-ACACTTG----A-GAC----A-G-G-GTCT--TT-TTTAA--TG-GAAT-TA--AT---AT
gi|80041                      :                                                    tgattatAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----G---CATC--T--TGA-GG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGGTG----A-GGCTGCTT-G-G-GTAC--TT-TACAG--GC-GGTT-TA--AT---A
gi|80042                      :                                                           gT-CT-TT--T--T---A-----CGAAT---T-AT-C-TA--A--A---------CATA--T--TGA-GG-TCTGGAAT---ATTA-A-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|80045                      :                                                               TATT--T------------GGTATAACTGAT-C-TC--A--------T---TATC--T--TGA-TA-TCTAGAAC---ATGG-T-T-TCGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATA-TA--
gi|80046                      :                                                               TATT--T--T---G-----GAAAC---T-AT-T-CC--A--T-----T---C-TC--T--TTG-TG-CCTTGGGC---ATTG-C-T-TATGC-ATA-ATAGTTG----AGGAT----T-G-A-ACTC--TT-TAGAG--GG-GATT-Tt
gi|80048                      :                                                                 TT--T--T---A-----AGAAT---T-AC-T-TT--A--A-----T---TTTC--T--CGA-TA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TATTT-GGA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GCCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--CT---ATgcta
gi|80050                      :                                                                  T--T--T---A-----GGAAC---T-AT-T-TC--A--A-----A---TATC--T--TGA-GA-TCCTGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GCC----T-G-G-GCCC--TA-TAAAG--GA-G
gi|80052                      :                                                                             -----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-GCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGCTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TT-TAAAG--GG-AGTT-TA--AT---AT
gi|80058                      :                                                                                     AT---T-CT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TGTGAAGC---ATTG-C-T-TTGTC-ATA-ATAGTTC----A-AAC----T-G-G-GTCC--TT-AAAAG--GG-AATT-T
gi|80059                      :                                                                                     AT---A-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--C--AGC-TG-TCAGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-GTG-ACAGTCG----A-GGC----T-G-G-GGCT--TT-TAAAA--GGTGATT-TG--AT---AT
gi|80060                      :                                                                                      T---T-CT-T-TC--A--A-----G---TTTG--T--TCA-TG-TCTGGATC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAATTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80061                      :                                                                                      T---T-GT-T-CC--G--A-----T---CAT-------GA-TG-TTTGAAGG---ACTG-T-T-TAGGC-GTA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80062                      :                                                                                                                                 -TCTGGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGATG----G-GAG----T-G-G-ATCC--TT-TAAAG--TG-GATT-TG--AT---AT
gi|80063                      :                                                                              tatgtaaattacaaaT-T-TC--A--AAAGTAT---CATC--T--TCA-GA-TCTGGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAGTTC----A-TAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80064                      :                                                                                             T-T-TC--A--AAAGTAT---CATC--T--TCA-GA-TCTTGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAGTTC----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GA------------ATAAATA
gi|80069                      :                                                                                                   --A--A-----T----ATC--T--TGA-TG-TCTGCAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-A-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80071                      :                                                                                                                                                          a-ATA-ACAATTG----A-GGC----A-G-G-GTCA--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAAT
gi|80072                      :                                                                                aatttctttatgctcatctgat--A-----T---CATC--T--TCA-GA-TCTTGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80073                      :                                                                                                                             A-TG-TCTGAAGC---ATTT-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----T-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TTAAA--GG-GATC-TT--AT---AT
gi|80074                      :                                                                                                                      tatactcA-TC-TCTTGAGT---ACTG-T-T-TAGTT-AAA-ATAGTTG----A-GAA----T-G-T-GTCC--TT-TAAAG--GG-GTTT-TA--AT---ATCAGTA
gi|80075                      :                                                                                                                              tcG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---A





Alignments
lowQualScore                  :                             1  22222222  1111 00 0 1 0 000  0     00 00 111 11111     000 0  0 0  00 11 22222 000    00 00   00 0        000    0 0 0     0   0       0000 0   0000 0 0 0    00  0     11  0    0  00  000       
lowQualScore                  :                             .  ........  .... .. . . . ...  .     .. .. ... .....     ... .  . .  .. .. ..... ...    .. ..   .. .        ...    . . .     .   .       .... .   .... . . .    ..  .     ..  .    .  ..  ...       
lowQualScore                  :                             3  88888888  1111 77 5 0 5 777  5     66 66 666 66666     888 9  4 4  66 00 55555 777    66 66   55 4        777    4 4 4     4   4       9999 4   9999 4 4 4    66  4     11  4    5  77  999       
consensus                     :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
Reference ( family-227 )      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
gi|79929                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--AAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-CCTGAAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ATAGTTG----A-GAT----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GGTTATA--AT---A
gi|79930                      :                        AAGTTCTG--------CT----T--T-T-C-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGG---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79931                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--T-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGGGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAATTT----A-GAC----A-A-G-GTCC--TT-TAATG--GA-GAAT-TG--AT---ATAAATA
gi|79932                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-TTC-T--GAG-CCATT--T--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TGTC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ATAGTTG----T-GAC------A-G-GTCC--TT-T-AAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79934                      :                        AAATTCTGCTTTTTTTTT----T--T-T-T-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----C---TATC--T--TCA-TG-TCTGCAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCG--TT-TA
gi|79935                      :                        AAATTTTG--------CT----T--T-T-T-T--GAT-GTATT--T--A---A-----GATTT---T-AT-TATA--A--A-----T---TATA--T--TTA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TGGTT-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79936                      :                        AAATTCTG--------CT----T--T-A-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----AGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TAA-TG-TCTTGAGC---ATTG-T-T-TAGAC-ATG-ACAGTTG----A-GAT----A-G-G-CTCCTTTT-TAAA----G-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79937                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-A--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-GT-T-TC--ACAA-----T---TATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTGG----A-GAT----T-G-G-GTTC--TT-TTAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79939                      :                        AAATGTTG--------CT----T--T-T-C-T--ATT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ATA-ACAGCTG----A-GAC----A-T-A-GTTC--TT-TAAA---CG-GATA-AA--AT---ATAAATA
gi|79940                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-C-C-T--CAT-TTATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGT-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-CAAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79941                      :                        AAACTCTC--------TT----T--T-T-A-T--CAT-CTATT--T--T---G-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----A---CATCAAT--AGA----TCTAAAGT---ATTG-T-TAAAGAC-AAA-ATAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--TT-AAAAA--GA-GATT-TG--ATTTCATAA
gi|79942                      :                        AAATTCTGGG------TT----T--T-T-T-T--CAT-CTATT--T--T---A-----AATAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TTA-TG-TCTGGAGT---ATTG-T-T-GAGTC-ATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-T-GTTC---T-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---GTA
gi|79943                      :                        AAATTCTG--------CT----T--T-T-C-T--GAT-TTATT--T--T---A-----GGAGT---T-AT-T-TT--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATCG-C-T-TAGAT-ATA-TCAGTTG----A-GA--------------C--AT-TAAA---GG-GATT-----AT---AT
gi|79944                      :                        AAATTATG--------TT----T--G-T-C-T--CAT-ATATT--T--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG-TCTGGGGC---AATT-T-T-TAGTC-ATA-ACGGTGG----A-GAA----T-A-G-ATCC--TT-TCAAG--GG-GATT-TT--AT---ACACATA
gi|79945                      :                                               --T-T-A-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-AC--A--T-----G---TATC--T--GGA-CA-TCTGGAGT---GTTGTT-T-TAATC-ATA-ACAGTTG----A-GA-----T-G-GTGTCC---T-TAATGGTGG-GGTT-TA--AT---AT
gi|79946                      :             aaattctcagaAAATTTTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-ATATT--T--T---T-----GGTAT---T-GC-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGAAAC---ACTG-T-T-TAGTC-ATA-ACATTTG----A-GAC----T-G-G-GTCT--TT-TAAAG--GA-TATT-AA--AT---A
gi|79948                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-ATATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATT--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TA
gi|79949                      :                        AAATTATG--------CA----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTTT---T-AT-T-TC--A--A-----C---TATC--T--T-A-TG-TCTCAAGC---ATTG-C-T-TAG---ACA-ACAGTTG----A-TGC----A-G-G-ATCC--T
gi|79950                      :                        AAAGTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---GATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC------A-G-GTCC--TT-gaattgatacaggacatgaattaaata
gi|79951                      :                        AAATTGTG--------TT----T--T-TTC-T--CAT-TTATC--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG--CCGGGGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTGA---T-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79952                      :                        AAATTCTT--------TT----T--T-T-T-T--CAT-CCATT--T--T---ATTTTTGGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---TA-C--T--TGA-AGATCTTGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTC----A-TAA----A-G-A-GTCT--TT-TAAAAT-GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79953                      :                        AAATTCTC--------TT----C--T-T-A-T--CAT-CTATT--T------A-----GGAAT---T-AT-T-CT--A--A-----T---CTTC--T--TAA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-AAAGG--AA-GATT-TT--AT---AT
gi|79954                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--TCTCA-----TCTAT---T-AT-G-TC--A--A-----A---CATT--T--TGA-TG-TCTTGGGC---ATTG-T-T-TAGTT-ATT-ACAGTTG----A-GA--------------C--TT-TAAAA--AG-GGTT-TA--AT---ACA
gi|79955                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-G-T--TAA-CTGTT--G--A---T-----GGTAA---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGC-TG-TCTGGGGC---ATTT-T-T-TAGTCTGTA--CAGTGG----A-GAC----T-G-G-GGCA--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---ACACATA
gi|79957                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--TAT-ACATT--T--A---T-----TGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TA-TCTGAACC---AATT-T-T-TAGTC-ACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAGG--GG-AATT-TG--AT---
gi|79958                      :                        AAATT--G--------TT----T--T-T-C-T--TAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-C-AC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG-TCTAGGGC---TTTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATGA--TT-C-AAG--GG-AATT-TG--AT---ATA
gi|79959                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TCAGT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---ATTA--T--TAT-TG-TCCAAAGC---ATTG-T-T-TTATC-ATA-GCAGTTA----A-GAC----T-G-G-GTCC--TG-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79960                      :                        AAAATCTG--------TT----T--T-T-G-T--CAT-TTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-TT-T-TC--A--A-----T---CATT--T--TAA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-AAA-------------------G-G-GT-A--TC-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---AT
gi|79961                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCAAT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTAAAGC---ACTG-T-T-TATCC-ATA-AGAGTTG----A-GAC----T-T-T-GTCA--TT-TAAAG--AG-GTTT-TA--AT---AT
gi|79962                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TTATT--T--T---------GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--GGA-TT-TCTGAGGC---ATTG-T-T-TAGTT-ATA-ACAGTTG----A-GAA----T-A-A-GTGA--TT----AA--GG-GATT-TA--A
gi|79963                      :                        AAACTCTC--------TT----T--TTT-C-T--CAT-CTATT--C--T---G-----GG-AT---TAAT-T-TT--A--A-----T---TATC--T--GGA-GA-TCTGGAAT---ATTG-T-T-TGGTC-ATA-ACAGTTG----A-TAT----T---G-GTCA--TT-TAAAA--GC-GATT-TA--AT---ATACATA
gi|79964                      :                        AAATT--G--------CT----T--T-C-T-T--TAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AC-T-TG--A--AA----T---CATA--T--TGA-GG-TCTGGTGC---ATTG-T-T-CAGTC-AAA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-T-GTTC--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--
gi|79965                      :                        AAATTTTG--------TT----T--T-T-C-T--CCT-CTATT--T--T---C-----CGCAT---C-AT-T-TC--A--A-----T---CGTT--TTATGAGTA-TCTGAAAC---TTTG-T-T-TAGTC-ATA-GAAGTTATACTA-AGC----T-A-G-GTCC--TT-TAAGG--AG-GATT-TG--AT---ATtgtcaat
gi|79968                      :                        AAATAATG--------TT----T--G-T-C-C----T-CTATT--T--T---C-----A--AT---T-GT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TAA-TG-TCTAGGGC---ATTG-T-T-TAGTA-ATT-ACAGTAG----A-GAT----T-T-G-GACC--TT-TAAAA--GA-GATT-TG--AT---ACACATA
gi|79969                      :                        AAGTTATA--------TT----T--T-T-A-A--CAG-TTATT--T--T---G-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCCGAAGT---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-GCAGTTG----A-GCC----CAG-A-AACC--TT-TAAAG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|79970                      :                        AAATTGTG--------TT----T--T-T-T-TTTCAT-CTATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-C-TT--A--A-----T--------------G-TA-TTTGG-GC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-AAAGTAG----A-GAC----T-T-G-GTCC--TT-TGAAG--GA-GATT-TA--A
gi|79971                      :                        AAATTTTC--------TT----T--T-T-A-G--CAT-CTATT--T--C---A-----GGAAT---T-AG-T-GT--A--A-----T---CACC--T--TGA-GA-TCAGGAGC---ATTG-T-T-CAATC-ATG-AGATTTG----A-CAC----T-G-A-ATCT--TT-TAAAG--AG-GATT-TG--AT---AT
gi|79972                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-TAT--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A----------------------------GGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-TTT-GCAGTTT----G-GAC----T-G-G-A--C--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79973                      :                        AAATAATG--------TT----T--T-C-C-T--CAT-CTATT--T--T---T-----TGTAT---T-AC-T-CC--A--A-----A---CATC--T--TGT-TA-TCTGGGGC---ATTG-T-T-TGGTC-ACT-ACAATGG----A-ATC----T-G-G-GTTC--AT-TTAAG--GA-GATT-TA--AT---ACACAT
gi|79974                      :                        AAATTCGC--------TT----T--T-T-A-T--CAT-CTGTCAGTAGT---A-----GAAAT---T-AT-T-T---A--A-----C---CATC--T--TAA-TA-TCTCTAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----C-GAC----T-G-G-GTTT--TA-TAAAG--GA-AATT-TG--AT---AT
gi|79975                      :                        AAATTCTC--------TT----T--T-A-C-T--TAT-CTATT--T--T---G-----GATAG---T-AT-T----------------------------GA-TA-CCTGGAGC---TTCA-A-T-TAGTC-ATA-ACAGTTT----A-AAC----T-G-G-ATTT--TT-TTAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79983                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAC-ATATT--T------A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTTGAAC---A-TG-TAT-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TC-TAAAG--GG-GATA-TA--AT---AT
gi|79984                      :                         AATACTA--------CT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TGAAG--GG-AATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79985                      :                         AATACTA--------CT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---TATT--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATT-TG--AA---ATAAATA
gi|79986                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAC-CTATT--T--T---A-------CAT-----AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTTGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-GTA-ACAACTG----A-GGC----A-G-G-TTTC--TT-TAAAG--GA-TAAT-TA--AT---AT
gi|79987                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-A-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGCAA---T-AAAT-TC--A--A-----T---TATC--T--TTA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GT-GATT-TGATAT---ATAAATA
gi|79988                      :                         AGTTCTT--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTAT--------------------T---C-AT-T-T-----------------ATA--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTT-T-T-TTGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-ATAC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79989                      :                         AATTCTG--------TTATTTT--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----TGTAT---T-AG-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GA-TTTGGAAC---ATTA-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-AAC----T-T-T-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TT--AT---AT
gi|79990                      :                         AATTTTA--------TC----T--T-T-T-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-CT-C-TT--A--G-----T---CATC--T--TCA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-GTA-ACAGTTG----A-TAC----T-G-G-TTCC--TC-CAAA
gi|79991                      :                         AATTCCA--------TT----T--T-T-C-T--TAC-CTGTT--T--G---A-----AGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTGGTAC---ATTG-T-T-TTGTA-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|79993                      :                         AATTCTC--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AT-C-TT--A--A-----T---AGTT--T--TTA--G-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAA
gi|79994                      :                         AATTCTC--------TT----T--A-T-------GT-CTACT--T--C---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCTAAAGT---ATTG-C-T-TAGTC-ATA-ACAGTCA----A-GAC----T-G-G-GAAC--TT-AAAGG--GG-GAttggtttgtata
gi|79995                      :                         AATTCTA--------TT----T--T-T-C-T--CAC-CTATT--T--T---G-----TGTTT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-T-T-AAGTC-GTA-ACA-----------------------GTCC--TT-T-AAG--GG-GATT-TA--GT---AT
gi|79996                      :                         AATTCTA--------AT----T--T-T-A-T--CAG-TTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GG-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATC-ACAGCTG----A-GGT----T-G-A-GACT--TA-TAAA---AG-TATT-TA--AT---AT
gi|79997                      :                                --------TT----T--T-T-C-C--TATTCTATT--T--T---A-----TGTAT---T--T-T-TT--A--A-----T---CATT--T--TGA-GG-TTTGAAAC---ATTG-T-T-TAGTC-A-A-ATAGCTG----A-GAA----T-G-G-GTCC--TT-TACAA--GG-GAT
gi|79998                      :                                                                aat--T--T---A-----GGGAT---T-GT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TTA-GA-TCTGGAGT---ATCG-T-T-CAGTC-ATA-ATAGTCG----A-AGC----T-G-G-GTCC--TT-CAAAA--GT-GACT-TA--AT---AT
gi|79999                      : aatactatacttataatttttttaAATTTTA--------TT----T--C-T-A-T--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TT--C--A-----T---CATC--T--TGA-TA-TCTGGAGA---ATTG-T-T-TGATC-GGAGACGG-TG----G-GAC----T-A-T-AACC--TTATAAAG--AG-AATT-TA--AT---ATCGATA
gi|80003                      :                          ATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--G-----T---TATT--T--TCA-TG-CCTCGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTGG----A-GAT----A-G-G-GTCC--TT-TAA-------GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80004                      :                          ATTATA--------TT----T--T-T-C-C--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TG--A--A-----T---CATT--T--TGA-TA-TCTGGAGC---AGTG-T-T-TAGTC-ATA-ACTGTTT----A-GAC----T-G-G-GACC--TT-TAAAG--AA-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|80005                      :                          ATTTTC--------TT----T--T-T-A-T--AAT-CTATT--T--T---A-----GGATT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTGG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TT-TAAAA--GG-GA-T-TA--AT---ATAAATA
gi|80006                      :                          ATTCTG--------TT----T--T-T---T--CAC-CTATT--T--T---A-----CATAT---T-GT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TTTGGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAA
gi|80007                      :                          ATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---AA----GGTGT---T-TT-T-CT--A--A-----T---CAAA--T--TGT-TT-TCAGAAGC---ATTG-T-T-TGGTC-ATA-ACAGTGG----A-TAT----T-C-T-GTCC--TT-TAAAG--TG-GATT-TA--AT---AT
gi|80008                      :                          ATTTTT--------TT----TATT-T-C-T--CGT-CTATT--T--T---A-----GGAAA---T-AT-T-TT--A--A-----C---CATC--A--GAA-GA-TATAGAGT---ATTG-T-T-TAGTA-ACA-ACAGTTC----A-GAC----C-A-G-GGCC--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---AT
gi|80010                      :                           TTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TA-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80011                      :                           TTTTT--------TT----C--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGA---ATTG-C-T-TAGAT-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80012                      :                           TTCTA--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--AT-A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATT-GCAGTTC----A-TAT----A-A-G-GTCC--TT-TGAAT--GG-GATT-TG--GC---ATAAATA
gi|80015                      :                                          ----T--T-T-A-T--CAT-CTAAT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TC--A--A-----TTATCATC--T--TGA-TA-TCTGGAAT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----A-GA
gi|80016                      :                                       ctg----T--T-T-A-T--CAT-GTATT--G--T---A-----GCGAC---G-AT-T-TT--A--T-----T---CATT--T--TGA-GA-TCGGAAGT---ATTG-T-T-TAGAT-AAA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-G-CC--CT-TAAAT--GG-GATT-TA--AT---ATtcaaatatccataagggg
gi|80017                      :                           ctgTG--------TT----A--T-T-C-T--CAT---ATT--T--T---A-----GATAT---T-AA-T-TT--G--A-----T---TATA--T--TGA-TG-TCTGGGTT---CTTG-T-T-CAGTC-ATA-ACGGTTA----G-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80018                      :                              TG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TT--T--T--T---A-----GATAT---T-AA-T-TT--G--A-----T---TATA--T--TGA-TG-TCTGGGTT---CTTG-T-T-TATTC-ATA-ACAATTA----G-GAC----T-G-C-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80019                      :                              TG--------TT----T--T-T-C-A--GAT-CTATT--T--T---T-----AGAAT---T-AT-A-TCTTA--T-----T---CATC--T--TGA--------GAACTCTATTG-T-T-TAGAT-ATA-ACAGTTG----G-AAA----T-G-G-GTCC--TT-TA
gi|80020                      :                              TG--------AT----T--T-T-C-C--CAT-CTATT--T--TTTTA-------TAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATT--T--TAA-TT-TCTAGGGC---ATTG-G-T-TAGTT-GTT-ACAATGA----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AA-GATT-AA--AT---ACACATA
gi|80024                      :                               G--------CT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ACA-ACAGTT
gi|80025                      :                                --------TT----T--T-T-C-C--CAC-CAATT--C--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-T-T-CAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-----GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80027                      :                                --------TT----T--T-T-C-T--CAA-TTATT--T--T---A-----TTTAT---T-AT-T-TT--G--A-----C---TACC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-C-T-TAGTC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TG-TCAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|80028                      :                                          ----T--T-T-T-T--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATA--T--TGA-TG-TGTTGGGC---ATTG-T-G-AAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----A-GTG-GTTG--AT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80029                      :                                --------TT----T--T-T-C-T--CAT-ACAAT--T--T---A-----GGTAT---T-AC-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TA-TCTAGGGC---ATTG-T-T-TAGTA-ATA-AAAGTTA----A-G
gi|80033                      :                                          ----T--T-T-C-T----T-CAAGT--T--T---T-----GGTAT---G-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-CAC----T-G-G-TTCC--TT-CAAAG--AG-GACT-TA--A
gi|80038                      :                                                    -C-T--TAT-CTATT--T--T---A-----CGTAT---T-TT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGAAGT---ACT--T-T-TAGTC-ATA-AGAATTG----A-AAC----T-G-G-GACC--TT-TAAA---AA-GATT-TA--GT---AT
gi|80039                      :                                                               TATG--T--G---A-----AGTAT---T-AT-T-TG--A--A-----C---CATT--T--TGA-TG-TCTGCAGC---ATTG-T-T-TGGCC-ATA-ACACTTG----A-GAC----A-G-G-GTCT--TT-TTTAA--TG-GAAT-TA--AT---AT
gi|80041                      :                                                    tgattatAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----G---CATC--T--TGA-GG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGGTG----A-GGCTGCTT-G-G-GTAC--TT-TACAG--GC-GGTT-TA--AT---A
gi|80042                      :                                                           gT-CT-TT--T--T---A-----CGAAT---T-AT-C-TA--A--A---------CATA--T--TGA-GG-TCTGGAAT---ATTA-A-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|80045                      :                                                               TATT--T------------GGTATAACTGAT-C-TC--A--------T---TATC--T--TGA-TA-TCTAGAAC---ATGG-T-T-TCGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATA-TA--
gi|80046                      :                                                               TATT--T--T---G-----GAAAC---T-AT-T-CC--A--T-----T---C-TC--T--TTG-TG-CCTTGGGC---ATTG-C-T-TATGC-ATA-ATAGTTG----AGGAT----T-G-A-ACTC--TT-TAGAG--GG-GATT-Tt
gi|80048                      :                                                                 TT--T--T---A-----AGAAT---T-AC-T-TT--A--A-----T---TTTC--T--CGA-TA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TATTT-GGA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GCCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--CT---ATgcta
gi|80050                      :                                                                  T--T--T---A-----GGAAC---T-AT-T-TC--A--A-----A---TATC--T--TGA-GA-TCCTGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GCC----T-G-G-GCCC--TA-TAAAG--GA-G
gi|80052                      :                                                                             -----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-GCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGCTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TT-TAAAG--GG-AGTT-TA--AT---AT
gi|80058                      :                                                                                     AT---T-CT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TGTGAAGC---ATTG-C-T-TTGTC-ATA-ATAGTTC----A-AAC----T-G-G-GTCC--TT-AAAAG--GG-AATT-T
gi|80059                      :                                                                                     AT---A-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--C--AGC-TG-TCAGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-GTG-ACAGTCG----A-GGC----T-G-G-GGCT--TT-TAAAA--GGTGATT-TG--AT---AT
gi|80060                      :                                                                                      T---T-CT-T-TC--A--A-----G---TTTG--T--TCA-TG-TCTGGATC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAATTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80061                      :                                                                                      T---T-GT-T-CC--G--A-----T---CAT-------GA-TG-TTTGAAGG---ACTG-T-T-TAGGC-GTA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80062                      :                                                                                                                                 -TCTGGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGATG----G-GAG----T-G-G-ATCC--TT-TAAAG--TG-GATT-TG--AT---AT
gi|80063                      :                                                                              tatgtaaattacaaaT-T-TC--A--AAAGTAT---CATC--T--TCA-GA-TCTGGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAGTTC----A-TAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80064                      :                                                                                             T-T-TC--A--AAAGTAT---CATC--T--TCA-GA-TCTTGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAGTTC----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GA------------ATAAATA
gi|80069                      :                                                                                                   --A--A-----T----ATC--T--TGA-TG-TCTGCAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-A-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80071                      :                                                                                                                                                          a-ATA-ACAATTG----A-GGC----A-G-G-GTCA--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAAT
gi|80072                      :                                                                                aatttctttatgctcatctgat--A-----T---CATC--T--TCA-GA-TCTTGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80073                      :                                                                                                                             A-TG-TCTGAAGC---ATTT-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----T-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TTAAA--GG-GATC-TT--AT---AT
gi|80074                      :                                                                                                                      tatactcA-TC-TCTTGAGT---ACTG-T-T-TAGTT-AAA-ATAGTTG----A-GAA----T-G-T-GTCC--TT-TAAAG--GG-GTTT-TA--AT---ATCAGTA
gi|80075                      :                                                                                                                              tcG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---A


blockSeqs                     :                             C  CTTTTTTT  ATTT      T                    CTC TTTTT                    CA AAGTA                                                                                          GT
blockSeqs                     :                             C  GG        .         T                    TTT A                        T  AAGTA                                                                                          T 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  A                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             G  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             G  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             A  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             T  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             C  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             .  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                             .  .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                .         .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                          .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                          .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                          .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                          .         .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                    .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                    .                    .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                         .   .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                             .                        .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                              . 
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                      .  .                                                                                                


blockSeqCons                  :                        
originalCons                  :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
finalCons                     :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA





Alignments
lowQualScore                  :                             1  22222222  1111 00 0 1 0 000  0     00 00 111 11111     000 0  0 0  00 11 22222 000    00 00   00 0        000    0 0 0     0   0       0000 0   0000 0 0 0    00  0     11  0    0  00  000       
lowQualScore                  :                             .  ........  .... .. . . . ...  .     .. .. ... .....     ... .  . .  .. .. ..... ...    .. ..   .. .        ...    . . .     .   .       .... .   .... . . .    ..  .     ..  .    .  ..  ...       
lowQualScore                  :                             3  88888888  1111 77 5 0 5 777  5     66 66 666 66666     888 9  4 4  66 00 55555 777    66 66   55 4        777    4 4 4     4   4       9999 4   9999 4 4 4    66  4     11  4    5  77  999       
consensus                     :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
Reference ( family-227 )      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATAAATA
gi|79929                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--AAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-CCTGAAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ATAGTTG----A-GAT----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GGTTATA--AT---A
gi|79930                      :                        AAGTTCTG--------CT----T--T-T-C-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGG---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79931                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--T-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGGGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAATTT----A-GAC----A-A-G-GTCC--TT-TAATG--GA-GAAT-TG--AT---ATAAATA
gi|79932                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-TTC-T--GAG-CCATT--T--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TGTC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ATAGTTG----T-GAC------A-G-GTCC--TT-T-AAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79934                      :                        AAATTCTGCTTTTTTTTT----T--T-T-T-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----C---TATC--T--TCA-TG-TCTGCAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCG--TT-TA
gi|79935                      :                        AAATTTTG--------CT----T--T-T-T-T--GAT-GTATT--T--A---A-----GATTT---T-AT-TATA--A--A-----T---TATA--T--TTA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TGGTT-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79936                      :                        AAATTCTG--------CT----T--T-A-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----AGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TAA-TG-TCTTGAGC---ATTG-T-T-TAGAC-ATG-ACAGTTG----A-GAT----A-G-G-CTCCTTTT-TAAA----G-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79937                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-A--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-GT-T-TC--ACAA-----T---TATC--T--TGA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTGG----A-GAT----T-G-G-GTTC--TT-TTAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79939                      :                        AAATGTTG--------CT----T--T-T-C-T--ATT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ATA-ACAGCTG----A-GAC----A-T-A-GTTC--TT-TAAA---CG-GATA-AA--AT---ATAAATA
gi|79940                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-C-C-T--CAT-TTATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGT-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-CAAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79941                      :                        AAACTCTC--------TT----T--T-T-A-T--CAT-CTATT--T--T---G-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----A---CATCAAT--AGA----TCTAAAGT---ATTG-T-TAAAGAC-AAA-ATAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--TT-AAAAA--GA-GATT-TG--ATTTCATAA
gi|79942                      :                        AAATTCTGGG------TT----T--T-T-T-T--CAT-CTATT--T--T---A-----AATAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TTA-TG-TCTGGAGT---ATTG-T-T-GAGTC-ATA-ACAATTG----A-GAC----T-G-T-GTTC---T-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---GTA
gi|79943                      :                        AAATTCTG--------CT----T--T-T-C-T--GAT-TTATT--T--T---A-----GGAGT---T-AT-T-TT--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATCG-C-T-TAGAT-ATA-TCAGTTG----A-GA--------------C--AT-TAAA---GG-GATT-----AT---AT
gi|79944                      :                        AAATTATG--------TT----T--G-T-C-T--CAT-ATATT--T--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG-TCTGGGGC---AATT-T-T-TAGTC-ATA-ACGGTGG----A-GAA----T-A-G-ATCC--TT-TCAAG--GG-GATT-TT--AT---ACACATA
gi|79945                      :                                               --T-T-A-T--CAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-AC--A--T-----G---TATC--T--GGA-CA-TCTGGAGT---GTTGTT-T-TAATC-ATA-ACAGTTG----A-GA-----T-G-GTGTCC---T-TAATGGTGG-GGTT-TA--AT---AT
gi|79946                      :             aaattctcagaAAATTTTG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-ATATT--T--T---T-----GGTAT---T-GC-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGAAAC---ACTG-T-T-TAGTC-ATA-ACATTTG----A-GAC----T-G-G-GTCT--TT-TAAAG--GA-TATT-AA--AT---A
gi|79948                      :                        AAATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-ATATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATT--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TA
gi|79949                      :                        AAATTATG--------CA----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTTT---T-AT-T-TC--A--A-----C---TATC--T--T-A-TG-TCTCAAGC---ATTG-C-T-TAG---ACA-ACAGTTG----A-TGC----A-G-G-ATCC--T
gi|79950                      :                        AAAGTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---GATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC------A-G-GTCC--TT-gaattgatacaggacatgaattaaata
gi|79951                      :                        AAATTGTG--------TT----T--T-TTC-T--CAT-TTATC--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG--CCGGGGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTGA---T-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79952                      :                        AAATTCTT--------TT----T--T-T-T-T--CAT-CCATT--T--T---ATTTTTGGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---TA-C--T--TGA-AGATCTTGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTC----A-TAA----A-G-A-GTCT--TT-TAAAAT-GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79953                      :                        AAATTCTC--------TT----C--T-T-A-T--CAT-CTATT--T------A-----GGAAT---T-AT-T-CT--A--A-----T---CTTC--T--TAA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-AAAGG--AA-GATT-TT--AT---AT
gi|79954                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--TCTCA-----TCTAT---T-AT-G-TC--A--A-----A---CATT--T--TGA-TG-TCTTGGGC---ATTG-T-T-TAGTT-ATT-ACAGTTG----A-GA--------------C--TT-TAAAA--AG-GGTT-TA--AT---ACA
gi|79955                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-G-T--TAA-CTGTT--G--A---T-----GGTAA---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TGC-TG-TCTGGGGC---ATTT-T-T-TAGTCTGTA--CAGTGG----A-GAC----T-G-G-GGCA--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---ACACATA
gi|79957                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--TAT-ACATT--T--A---T-----TGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TA-TCTGAACC---AATT-T-T-TAGTC-ACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAGG--GG-AATT-TG--AT---
gi|79958                      :                        AAATT--G--------TT----T--T-T-C-T--TAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-C-AC--A--A-----A---CATC--T--TGA-TG-TCTAGGGC---TTTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATGA--TT-C-AAG--GG-AATT-TG--AT---ATA
gi|79959                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TCAGT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---ATTA--T--TAT-TG-TCCAAAGC---ATTG-T-T-TTATC-ATA-GCAGTTA----A-GAC----T-G-G-GTCC--TG-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79960                      :                        AAAATCTG--------TT----T--T-T-G-T--CAT-TTTTT--T--T---A-----GGTAT---T-TT-T-TC--A--A-----T---CATT--T--TAA-TG-TCTGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-AAA-------------------G-G-GT-A--TC-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---AT
gi|79961                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCAAT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTAAAGC---ACTG-T-T-TATCC-ATA-AGAGTTG----A-GAC----T-T-T-GTCA--TT-TAAAG--AG-GTTT-TA--AT---AT
gi|79962                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TTATT--T--T---------GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--GGA-TT-TCTGAGGC---ATTG-T-T-TAGTT-ATA-ACAGTTG----A-GAA----T-A-A-GTGA--TT----AA--GG-GATT-TA--A
gi|79963                      :                        AAACTCTC--------TT----T--TTT-C-T--CAT-CTATT--C--T---G-----GG-AT---TAAT-T-TT--A--A-----T---TATC--T--GGA-GA-TCTGGAAT---ATTG-T-T-TGGTC-ATA-ACAGTTG----A-TAT----T---G-GTCA--TT-TAAAA--GC-GATT-TA--AT---ATACATA
gi|79964                      :                        AAATT--G--------CT----T--T-C-T-T--TAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AC-T-TG--A--AA----T---CATA--T--TGA-GG-TCTGGTGC---ATTG-T-T-CAGTC-AAA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-T-GTTC--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--
gi|79965                      :                        AAATTTTG--------TT----T--T-T-C-T--CCT-CTATT--T--T---C-----CGCAT---C-AT-T-TC--A--A-----T---CGTT--TTATGAGTA-TCTGAAAC---TTTG-T-T-TAGTC-ATA-GAAGTTATACTA-AGC----T-A-G-GTCC--TT-TAAGG--AG-GATT-TG--AT---ATtgtcaat
gi|79968                      :                        AAATAATG--------TT----T--G-T-C-C----T-CTATT--T--T---C-----A--AT---T-GT-T-TC--A--A-----A---CATC--T--TAA-TG-TCTAGGGC---ATTG-T-T-TAGTA-ATT-ACAGTAG----A-GAT----T-T-G-GACC--TT-TAAAA--GA-GATT-TG--AT---ACACATA
gi|79969                      :                        AAGTTATA--------TT----T--T-T-A-A--CAG-TTATT--T--T---G-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCCGAAGT---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-GCAGTTG----A-GCC----CAG-A-AACC--TT-TAAAG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|79970                      :                        AAATTGTG--------TT----T--T-T-T-TTTCAT-CTATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-C-TT--A--A-----T--------------G-TA-TTTGG-GC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-AAAGTAG----A-GAC----T-T-G-GTCC--TT-TGAAG--GA-GATT-TA--A
gi|79971                      :                        AAATTTTC--------TT----T--T-T-A-G--CAT-CTATT--T--C---A-----GGAAT---T-AG-T-GT--A--A-----T---CACC--T--TGA-GA-TCAGGAGC---ATTG-T-T-CAATC-ATG-AGATTTG----A-CAC----T-G-A-ATCT--TT-TAAAG--AG-GATT-TG--AT---AT
gi|79972                      :                        AAATTATG--------TT----T--T-T-TAT--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A----------------------------GGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-TTT-GCAGTTT----G-GAC----T-G-G-A--C--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|79973                      :                        AAATAATG--------TT----T--T-C-C-T--CAT-CTATT--T--T---T-----TGTAT---T-AC-T-CC--A--A-----A---CATC--T--TGT-TA-TCTGGGGC---ATTG-T-T-TGGTC-ACT-ACAATGG----A-ATC----T-G-G-GTTC--AT-TTAAG--GA-GATT-TA--AT---ACACAT
gi|79974                      :                        AAATTCGC--------TT----T--T-T-A-T--CAT-CTGTCAGTAGT---A-----GAAAT---T-AT-T-T---A--A-----C---CATC--T--TAA-TA-TCTCTAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----C-GAC----T-G-G-GTTT--TA-TAAAG--GA-AATT-TG--AT---AT
gi|79975                      :                        AAATTCTC--------TT----T--T-A-C-T--TAT-CTATT--T--T---G-----GATAG---T-AT-T----------------------------GA-TA-CCTGGAGC---TTCA-A-T-TAGTC-ATA-ACAGTTT----A-AAC----T-G-G-ATTT--TT-TTAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|79983                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAC-ATATT--T------A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTTGAAC---A-TG-TAT-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TC-TAAAG--GG-GATA-TA--AT---AT
gi|79984                      :                         AATACTA--------CT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TGAAG--GG-AATT-TG--AT---ATAAATA
gi|79985                      :                         AATACTA--------CT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-GC--A--A-----T---TATT--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATT-TG--AA---ATAAATA
gi|79986                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--CAC-CTATT--T--T---A-------CAT-----AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTTGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-GTA-ACAACTG----A-GGC----A-G-G-TTTC--TT-TAAAG--GA-TAAT-TA--AT---AT
gi|79987                      :                         AATTCTG--------TT----T--T-A-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGCAA---T-AAAT-TC--A--A-----T---TATC--T--TTA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GT-GATT-TGATAT---ATAAATA
gi|79988                      :                         AGTTCTT--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTAT--------------------T---C-AT-T-T-----------------ATA--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTT-T-T-TTGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-ATAC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|79989                      :                         AATTCTG--------TTATTTT--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--T---A-----TGTAT---T-AG-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GA-TTTGGAAC---ATTA-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-AAC----T-T-T-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TT--AT---AT
gi|79990                      :                         AATTTTA--------TC----T--T-T-T-T--TAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-CT-C-TT--A--G-----T---CATC--T--TCA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-GTA-ACAGTTG----A-TAC----T-G-G-TTCC--TC-CAAA
gi|79991                      :                         AATTCCA--------TT----T--T-T-C-T--TAC-CTGTT--T--G---A-----AGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTGGTAC---ATTG-T-T-TTGTA-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|79993                      :                         AATTCTC--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AT-C-TT--A--A-----T---AGTT--T--TTA--G-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAA
gi|79994                      :                         AATTCTC--------TT----T--A-T-------GT-CTACT--T--C---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCTAAAGT---ATTG-C-T-TAGTC-ATA-ACAGTCA----A-GAC----T-G-G-GAAC--TT-AAAGG--GG-GAttggtttgtata
gi|79995                      :                         AATTCTA--------TT----T--T-T-C-T--CAC-CTATT--T--T---G-----TGTTT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-T-T-AAGTC-GTA-ACA-----------------------GTCC--TT-T-AAG--GG-GATT-TA--GT---AT
gi|79996                      :                         AATTCTA--------AT----T--T-T-A-T--CAG-TTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GG-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATC-ACAGCTG----A-GGT----T-G-A-GACT--TA-TAAA---AG-TATT-TA--AT---AT
gi|79997                      :                                --------TT----T--T-T-C-C--TATTCTATT--T--T---A-----TGTAT---T--T-T-TT--A--A-----T---CATT--T--TGA-GG-TTTGAAAC---ATTG-T-T-TAGTC-A-A-ATAGCTG----A-GAA----T-G-G-GTCC--TT-TACAA--GG-GAT
gi|79998                      :                                                                aat--T--T---A-----GGGAT---T-GT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TTA-GA-TCTGGAGT---ATCG-T-T-CAGTC-ATA-ATAGTCG----A-AGC----T-G-G-GTCC--TT-CAAAA--GT-GACT-TA--AT---AT
gi|79999                      : aatactatacttataatttttttaAATTTTA--------TT----T--C-T-A-T--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TT--C--A-----T---CATC--T--TGA-TA-TCTGGAGA---ATTG-T-T-TGATC-GGAGACGG-TG----G-GAC----T-A-T-AACC--TTATAAAG--AG-AATT-TA--AT---ATCGATA
gi|80003                      :                          ATTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--G-----T---TATT--T--TCA-TG-CCTCGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAGTGG----A-GAT----A-G-G-GTCC--TT-TAA-------GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80004                      :                          ATTATA--------TT----T--T-T-C-C--TAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TG--A--A-----T---CATT--T--TGA-TA-TCTGGAGC---AGTG-T-T-TAGTC-ATA-ACTGTTT----A-GAC----T-G-G-GACC--TT-TAAAG--AA-GATT-TA--AT---ATCAATA
gi|80005                      :                          ATTTTC--------TT----T--T-T-A-T--AAT-CTATT--T--T---A-----GGATT---T-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--T--TGA-GA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTGG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TT-TAAAA--GG-GA-T-TA--AT---ATAAATA
gi|80006                      :                          ATTCTG--------TT----T--T-T---T--CAC-CTATT--T--T---A-----CATAT---T-GT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TGA-GG-TTTGGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAA
gi|80007                      :                          ATTATG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---AA----GGTGT---T-TT-T-CT--A--A-----T---CAAA--T--TGT-TT-TCAGAAGC---ATTG-T-T-TGGTC-ATA-ACAGTGG----A-TAT----T-C-T-GTCC--TT-TAAAG--TG-GATT-TA--AT---AT
gi|80008                      :                          ATTTTT--------TT----TATT-T-C-T--CGT-CTATT--T--T---A-----GGAAA---T-AT-T-TT--A--A-----C---CATC--A--GAA-GA-TATAGAGT---ATTG-T-T-TAGTA-ACA-ACAGTTC----A-GAC----C-A-G-GGCC--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---AT
gi|80010                      :                           TTCTG--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTAGT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TA-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAAAC-ACA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80011                      :                           TTTTT--------TT----C--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--A---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGA---ATTG-C-T-TAGAT-ATA-ACAGTTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80012                      :                           TTCTA--------TT----T--T-T-C-T--GAT-CTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--AT-A-----T---TATC--T--TCA-TG-TCTGGAGC---ATTG-C-T-TAGAC-ATT-GCAGTTC----A-TAT----A-A-G-GTCC--TT-TGAAT--GG-GATT-TG--GC---ATAAATA
gi|80015                      :                                          ----T--T-T-A-T--CAT-CTAAT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TC--A--A-----TTATCATC--T--TGA-TA-TCTGGAAT---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAATTG----A-GA
gi|80016                      :                                       ctg----T--T-T-A-T--CAT-GTATT--G--T---A-----GCGAC---G-AT-T-TT--A--T-----T---CATT--T--TGA-GA-TCGGAAGT---ATTG-T-T-TAGAT-AAA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-G-CC--CT-TAAAT--GG-GATT-TA--AT---ATtcaaatatccataagggg
gi|80017                      :                           ctgTG--------TT----A--T-T-C-T--CAT---ATT--T--T---A-----GATAT---T-AA-T-TT--G--A-----T---TATA--T--TGA-TG-TCTGGGTT---CTTG-T-T-CAGTC-ATA-ACGGTTA----G-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80018                      :                              TG--------TT----T--T-T-C-T--CAT-TT--T--T--T---A-----GATAT---T-AA-T-TT--G--A-----T---TATA--T--TGA-TG-TCTGGGTT---CTTG-T-T-TATTC-ATA-ACAATTA----G-GAC----T-G-C-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TG--AT---AT
gi|80019                      :                              TG--------TT----T--T-T-C-A--GAT-CTATT--T--T---T-----AGAAT---T-AT-A-TCTTA--T-----T---CATC--T--TGA--------GAACTCTATTG-T-T-TAGAT-ATA-ACAGTTG----G-AAA----T-G-G-GTCC--TT-TA
gi|80020                      :                              TG--------AT----T--T-T-C-C--CAT-CTATT--T--TTTTA-------TAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATT--T--TAA-TT-TCTAGGGC---ATTG-G-T-TAGTT-GTT-ACAATGA----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AA-GATT-AA--AT---ACACATA
gi|80024                      :                               G--------CT----T--T-T-C-T--CAT-CCATT--T--T---T-----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ACA-ACAGTT
gi|80025                      :                                --------TT----T--T-T-C-C--CAC-CAATT--C--T---A-----TGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-T-T-CAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-----GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80027                      :                                --------TT----T--T-T-C-T--CAA-TTATT--T--T---A-----TTTAT---T-AT-T-TT--G--A-----C---TACC--T--TGA-GG-TCTGGAAC---ATTG-C-T-TAGTC-ATA-GCAGTTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TG-TCAAG--GG-GATT-TG--AT---AT
gi|80028                      :                                          ----T--T-T-T-T--CAT-TTATT--T--T---A-----GGTAT---T-AT-T-TC--A--A-----A---CATA--T--TGA-TG-TGTTGGGC---ATTG-T-G-AAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----A-GTG-GTTG--AT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80029                      :                                --------TT----T--T-T-C-T--CAT-ACAAT--T--T---A-----GGTAT---T-AC-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TA-TCTAGGGC---ATTG-T-T-TAGTA-ATA-AAAGTTA----A-G
gi|80033                      :                                          ----T--T-T-C-T----T-CAAGT--T--T---T-----GGTAT---G-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-CAC----T-G-G-TTCC--TT-CAAAG--AG-GACT-TA--A
gi|80038                      :                                                    -C-T--TAT-CTATT--T--T---A-----CGTAT---T-TT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TCTGAAGT---ACT--T-T-TAGTC-ATA-AGAATTG----A-AAC----T-G-G-GACC--TT-TAAA---AA-GATT-TA--GT---AT
gi|80039                      :                                                               TATG--T--G---A-----AGTAT---T-AT-T-TG--A--A-----C---CATT--T--TGA-TG-TCTGCAGC---ATTG-T-T-TGGCC-ATA-ACACTTG----A-GAC----A-G-G-GTCT--TT-TTTAA--TG-GAAT-TA--AT---AT
gi|80041                      :                                                    tgattatAT-CTATT--T--T---A-----GGAAT---T-AT-T-TT--A--A-----G---CATC--T--TGA-GG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGGTG----A-GGCTGCTT-G-G-GTAC--TT-TACAG--GC-GGTT-TA--AT---A
gi|80042                      :                                                           gT-CT-TT--T--T---A-----CGAAT---T-AT-C-TA--A--A---------CATA--T--TGA-GG-TCTGGAAT---ATTA-A-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-TATT-TA--AT---AT
gi|80045                      :                                                               TATT--T------------GGTATAACTGAT-C-TC--A--------T---TATC--T--TGA-TA-TCTAGAAC---ATGG-T-T-TCGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATA-TA--
gi|80046                      :                                                               TATT--T--T---G-----GAAAC---T-AT-T-CC--A--T-----T---C-TC--T--TTG-TG-CCTTGGGC---ATTG-C-T-TATGC-ATA-ATAGTTG----AGGAT----T-G-A-ACTC--TT-TAGAG--GG-GATT-Tt
gi|80048                      :                                                                 TT--T--T---A-----AGAAT---T-AC-T-TT--A--A-----T---TTTC--T--CGA-TA-TCTGGAGT---ATTG-T-T-TATTT-GGA-ACAGTTG----A-GAT----T-G-G-GCCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--CT---ATgcta
gi|80050                      :                                                                  T--T--T---A-----GGAAC---T-AT-T-TC--A--A-----A---TATC--T--TGA-GA-TCCTGAAC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GCC----T-G-G-GCCC--TA-TAAAG--GA-G
gi|80052                      :                                                                             -----GGTAT---T-AT-T-CC--A--A-----T---CATA--T--TGA-TG-GCTGAAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGCTG----A-GAC----T-G-G-ATCC--TT-TAAAG--GG-AGTT-TA--AT---AT
gi|80058                      :                                                                                     AT---T-CT-T-TC--A--A-----T---CATC--T--TGA-TG-TGTGAAGC---ATTG-C-T-TTGTC-ATA-ATAGTTC----A-AAC----T-G-G-GTCC--TT-AAAAG--GG-AATT-T
gi|80059                      :                                                                                     AT---A-AT-T-TT--A--A-----T---CATC--C--AGC-TG-TCAGGAGC---ATTG-T-T-TAGTC-GTG-ACAGTCG----A-GGC----T-G-G-GGCT--TT-TAAAA--GGTGATT-TG--AT---AT
gi|80060                      :                                                                                      T---T-CT-T-TC--A--A-----G---TTTG--T--TCA-TG-TCTGGATC---ATTG-C-T-TAGAC-ATA-ACAATTG----A-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAATA
gi|80061                      :                                                                                      T---T-GT-T-CC--G--A-----T---CAT-------GA-TG-TTTGAAGG---ACTG-T-T-TAGGC-GTA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTTC--TT-TAAAG--GG-GATT-TA--AT---AT
gi|80062                      :                                                                                                                                 -TCTGGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ACAGATG----G-GAG----T-G-G-ATCC--TT-TAAAG--TG-GATT-TG--AT---AT
gi|80063                      :                                                                              tatgtaaattacaaaT-T-TC--A--AAAGTAT---CATC--T--TCA-GA-TCTGGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAGTTC----A-TAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80064                      :                                                                                             T-T-TC--A--AAAGTAT---CATC--T--TCA-GA-TCTTGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAGTTC----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GA------------ATAAATA
gi|80069                      :                                                                                                   --A--A-----T----ATC--T--TGA-TG-TCTGCAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATT-ACAGTTG----A-GAC----T-G-A-GTCC--TT-TAAAG--GG-AATT-TA--AT---ACA
gi|80071                      :                                                                                                                                                          a-ATA-ACAATTG----A-GGC----A-G-G-GTCA--TT-TAAAG--GG-GATT-TG--AT---ATAAAT
gi|80072                      :                                                                                aatttctttatgctcatctgat--A-----T---CATC--T--TCA-GA-TCTTGAGC---ATTG-T-T-AAGTC-ATA-ATAATTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--AG-GAAT-AA--AT---ATCAATA
gi|80073                      :                                                                                                                             A-TG-TCTGAAGC---ATTT-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----T-GAC----A-G-G-GTCC--TT-TTAAA--GG-GATC-TT--AT---AT
gi|80074                      :                                                                                                                      tatactcA-TC-TCTTGAGT---ACTG-T-T-TAGTT-AAA-ATAGTTG----A-GAA----T-G-T-GTCC--TT-TAAAG--GG-GTTT-TA--AT---ATCAGTA
gi|80075                      :                                                                                                                              tcG-TCTGAAGC---ATTG-T-T-TAGTC-ATA-ACAGTTG----A-GAC----T-G-G-GTCC--TT-TAAAG--GA-GATT-TA--AT---A