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Reference ( gi|104839 )       :                                                             AAACTTTGCATAAGTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----TA-----TG----GAAC--T---TG------GCACAAGTGTG-CATGGCTTATA
gi|104838                     :                                                             AAACTTTGCATAAGTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----TA-----TG----GAAC--T---TG------GCACAAGTGTG-CATGGCTTATA
gi|104834                     :                                                             AAATTTGGCATAAGTGTGCATG-GCTGGCAG--A--TG----T-A-TG-----CA-----TG----GAAC--T---TG------GCGTGAGTATG-CATGGCTTGTA
gi|104797                     :                                                            cAAGCTATTCATAATTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAC--T---TG------GCATAATTGTG-CATGGCTT
gi|104905                     :                                                    ttctggtgcAAACTTTGCATAAGTGTGCATG-GCTT
gi|104912                     :                             ataagtgtgcatggcttatagatatatgtatgAAACTTTGCATAAGTGTGCATG-GCTT
gi|104910                     :                             acaagtgtgcatggcttatagatatatgtatgAAACTTTGCATAAGTGTGCATG-GCTT
gi|104909                     :                             acaagtgtgcatggcttatagatatatgtatgAAACTTGGCATGAGTGTGCATG-GCTTACA
gi|104915                     :                             ataagtgtgcatggcttgcagatgtaatgatcAAACTTGGCATAAGTGTGAATG-ACTT
gi|104897                     :                               ataagtgcatggcttgaagatatatgtatgAAACTTGGCATAAGTGTGCATG-
gi|104914                     :                             ataagtgtccatggcttgcagatatatggacaAAACTTGGCATGAGTGTGCATG-GCTT
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gi|104908                     :                             ataagtgtgcatggctggtagatatatggctcAAACTTGGCATAAGTGTGCATG-
gi|104790                     :                             ataagtgtgcatggctggcagatataaagatcAAACTGTTCATAAGTGTACATT-GCTTGCAG--T--TT----T-A-TG-----GA-----TA----AAAC------TG------GCATAATTTTG-TAT-GCTTATA
gi|104793                     :                                                    ttttggtgcAAACTTGGCATAAGTGTGCAT--GCTT
gi|104822                     : ttttggtgcagggtgttcataaatgtgtattgctgacagttgtatgactcataatgattgAAGCTGTTCATTAATGTGCATT-GCTTGCAG-----T-----T-A-TG-----AA-----TG----CATC--T---AG------GCATAAGTGTG-TATGat
gi|104799                     :                                                       tgctgcAAATTGTTCATAAGAGTGTATT-GCTTCCAG--T--TA----A-A-T-------A-----TGACCTGAAC--T---TG-------TGTAAGTGTG-CGT-GCTTATAct
gi|104807                     :                                                    ttttggtgcAAACTGTTCATAAGTGTGCA-----TTGCAG--T--CA----T-A-TG-----AC-----TA----GAAC--T-------------AGAAGGGTG-C-TTGTTTATA
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gi|104888                     :                             ataaatgtgaatgacttgcagatatatatatggAACTTGGCATAAGAGTGCATG-GCTTata
gi|104890                     :                             ataattgtgcatggcttgcagatatatggatggAACTTGGCATAGGTGTGCATG-GCTT
gi|104894                     :                             ataagtgtccatggcttgcagatatatggacggAACTTGGCATAAATGTGCATG-GCTT
gi|104895                     :                             atgagtgtgcatggcttacagatatatggacggAACATGGCATAAGAGTGCATG-GCTT
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gi|104892                     :                             atgggtgtgcatagcttgcagatatatggatggAAATTGGCATAAGTGTGCATG-GCTT
gi|104824                     :                             ataaacgtgcatagcttgcagatatatggatggAAATTGGCATAAGTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TG----T-A-AA-----GA-----CA----AAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATGGCTT
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gi|104840                     :                        tgtttataagtgtgcattgcttacagatatatgaatggAACTTGGTTTAAGTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----CA----GAAC--T---TG------GTATAAGTGTG-CTTGACTTata
gi|104886                     :                                                              AACTTGGCATAAGTGTGCATG-
gi|104930                     :                             ataagtgtgcatggctggcagatatatggacggAACTTGGCATAAGTGTACAT--GCTT
gi|104887                     :                              taagtgtgaatgacctgcagatatgtgtatggAACTTGGCATAAGTGTGCATG-ata
gi|104911                     :                             ataggtgtgcatgacttgcagatatatggacggAACTTGGCATAAATGTGCATG-GTT
gi|104913                     :                             ataaatgtgaatgacctgcagatatatgtatggAACTTTGCATAAATGTGCATG-GTT
gi|104862                     :                             acaagtgtgcatggcttatagatatatgcatggAACTTGGCATAAGTGTGCATG-
gi|104904                     :                           tataagtgtgcttgacttgcagatagtatggatggAACTTTGCATAAATGTGAATG-ACTT
gi|104786                     :                             ataaatgtgcatggtttgcagatatatggatggAACTTGGCATAGGTGTGCATG-
gi|104826                     :           ttttggtgcaagatgttaacaagtgtgctttgcttgcagttatatggatggAAATTGGTATAAGTGTGCATT-GCTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----AC-----TG----GAAC--T---GG------GTATAAGTGTA-CATTGCTTtttata
gi|104916                     :                                                           tacAAATTTGCATAAATGTGAATG-ACTTACA
gi|104815                     :                             ataaatgtgcatggtttgcatatatatggatggAACTTTGCATAAGCGTGCATG-CCT
gi|104827                     :            tttggtgcaagttgttcataagtgtgcaattcttgcagttacatgcatggAACTTGGTATAAGTGTGCATT-GCTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----AC-----TT----CAAC--T---TG------GTATAAATGTG-CGTTGCTTata
gi|104816                     :                                                           tacAACTTGGTATAAGTGTGCATG-
gi|104818                     :        tttggtgcaagttgctcataagtgtgcattgcttgcagttagttatatgccttgAACTTGGCATAAATGTGCAT--GCTTc
gi|104792                     :            tttggtgtaagcagttcattagtgtgtatttcttgcagttataagaatggAACTTGGCATAAGTGTGCAT--GCTTa
gi|104830                     : ttttggtgcagggtgttcataaatgtgtattgctggcagttatatgactcgtaatgagtggAACTTGGTATACGTGTGCATT-GCTTGCAG--T--TG----T-A-TG-----AT-----TA----CAGC--T---TG------GTATAAGTTTG-CATTGCTTat
gi|104828                     :                                                           tacAAATTGGTATAAGTGTACATT-GCTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----AC-----TG----CAAC--T---GG------GTATAAGTTTA-CATTGCTT
gi|104829                     :                                                           tacAACTTGTTATAGGTGTGCATT-ACTTGCAT--T--TG----T-A-TG-----AC-----TA----CAAC--T---TG------GTATAAGTGTG-CATTGCTT
gi|104835                     :                                                           tacAACTTGTTATAAGTGTGTATT-GCTTGCTG--T--TG----C-A-TG-----AC-----TA----CAAC--T---TG------GTATAAGTGTG-TATTGCTT
gi|104852                     :                                                                cTTTTCATAAATGTGTATG-GTTTGCAG--T--TA----T-A-GG-----CA-----TG----AAAC--T---TG------GTATGAGTGTG-CAT-GCTTATA
gi|104858                     :                                                                tTTGGCATAAGTGTGCATT-GCTTGCAG--T--AA----T-A-TG-----AC-----TA----CAAA--T---TG------GTATAAGTGTG-CATTGCTT
gi|104794                     :                                                                   gtCATAAGTGTGCATT-GCTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----CA-----TG----GACC--T---TG------TCACACGTGTG-CA
gi|104795                     :                                                    ttttggtgcaagttgttCATATGTGTTCATG-ACTTGCAG--T--AA----T-A-TG-----TA-----TG----GAAC--T---TG------GTATACGTATG-CAT-GCTTATA
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gi|104833                     :                                                    tttttgtgcaagttgttCATAAGTGTGTGTT-ACTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAC--T---TG------GCATAACCTTG-CAT-GCTTATA
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gi|104860                     :                                                     tttggtgcaagttgttCATAAGTGTGCATA-GCTTGCAG--T--TA----T-A-TT-----GA-----TG----AAAT--T---TG------GCATATCTGTG-CAT-GCTTGTA
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gi|104792                     :                                                     tttggtgtaagcagttCATAAATGTGTATT-GCTGGCAG--T--TA----T-A-TGACTCGTAATGAGTG----GAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CAT-GCTTAT
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gi|104888                     :                                                                      ATAATTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAC--T---TG------GCATAAGAGTG-CATGGCTT
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gi|104896                     :                                                                      ATAAGTGTGCATG-GCTTGCAG--A--TG----T-A-TG-----CA-----TT----GAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATG
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gi|104892                     :                                                                      ATAAACGTGCATA-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAA--T---TG------GCATAAGTGTG-CATGGCTT
gi|104856                     :                                                                      ATAAGTGTGCATT-GCTTACAG--A--TA----T-A-TG-----AA-----TG----GAAC--T---TT------GCATAAGTGTG-CA-GGCTTATA
gi|104886                     :                                                                 tgtttATAAGTGTGCATG-GCTGGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----CG----GAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATG
gi|104887                     :                                                                      ATAGGTGTGCATG-ACTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----CG----GAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATG
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gi|104904                     :                                                                      ATAAATGTGCATG-GTTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAC--T---TT------GCATAAATGTG-AATGACTT
gi|104906                     :                                                                      ATGAGTGTGCATG-GCTGGCAG--A--TG----C-A-TG-----GA-----TG----GAAC--T---TG------GCATAAACGTG-CATAGCTT
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gi|104853                     :                                                    ttttggtgcaagatgttaATAAATGTGCATG-ACTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAC--T---TG------GCTTAAGTGTG-CGT-TCTTATA
gi|104914                     :                                                                ttgtttATAAGTGTGCATG-GCTTGCAA--A--TG----T-A-AA-----GA-----CC----AAAC--T---TG------GCATGAGTGTG-CATGGCTTA
gi|104907                     :                                                                      ATAAGTGTGCATG-GCTGGTAG--A--TA----T-A-TG-----GC-----TC----AAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATG
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gi|104902                     :                                                                      ATAAGTGTGCATT-GCTGGCAG--A--TG----C-A-TG-----GA-----TG----GATT--T---TG------GCATAGGTGTG-CATGACTT
gi|104916                     :                                                                      ATAAATGTGCATG-GTTTGCAT--A--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAA--T---TT------GCATAAATGTG-AATGACTTACA
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gi|104876                     :                                                                  gtttATAAATATGCATA-GCTTGCAG--A--TA----T-A-TG-----GA-----TG----GAAC--A---AC------GTATAAGTATG-CATAGCTT
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gi|104848                     :                                                    tttttgtgcaaattaattATAAATGTGCAAG-GCTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----GA-----TG----AAAC--T---TG------GCATGCGTGTG-TATG
gi|104871                     :                                                              aattgtttATAAGTATGCATA-GCTTGCAG--T--AA----T-A-TG-----GC-----TG----GAAC--A---TG------GTATAAGTATG-CATAGCTTct
gi|104872                     :                                                                     tATAAGTATGCATA-ACTTGCAG--T--TA----T-A-TG-----GC-----TG----GAAC--A---TG------GTATAAGTATG-CAT
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gi|104864                     :                                                      ttttggcgagctgtttATAAGTGTGCATT-GTTTGCAG--T--TG----T-A-TG-----AC-----TA----CAGC--T---TG------GTATAAGTGTG-CATTACTTA
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Unaligned ( gi|104805 ): TTTTAGTGCAAGTTGTTCATAACTATGCATTGTTTGCAGTTAATATACTAAAACATGTTGTAAGTATATGTGCTTATA






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Reference ( family-219 )      :                  AAACTTGGCA-TAAGTGTGCATG-GCTTGCAGNTA----T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATGGCTTATA
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gi|104840                     :                   AACTTGGTT-TAAGTGTGCATG-GCTTGCAGATA----T----ATG---------GA-C-AGAAC--T---TG------GTATAAGTGTG-CTTGACTT
gi|104843                     :                           A-TAAATGTGCAAT-GCTTGCAGTTA----T----ATA---------GA-T-AGAAC--T---TG------ATATAAGTGTA-CATG
gi|104848                     :                  aagttgttaA-TAAATGTGCAAG-GCTTGCAGTTA----T----ATG---------GA-T-GAAAC--T---TG------GCATGCGTGTG-TATGattaca
gi|104850                     :                  aattgtttCA-TAATTGTACATAAGTGTGAAGTTG----T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------ACATGATTGTG-CGT-GCTTATAct
gi|104852                     :                   attgtctCA-TAAATGTGTATG-GTTTGCAGTTA----T----AGG---------CA-T-GAAAC--T---TG------GTATGAGTGTG-CAT-GCTTATA
gi|104853                     :                      tttttA-TAAATGTGCATG-ACTTGCAGTTA----T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------GCTTAAGTGTG-CGT-TCTTATA
gi|104856                     :                     ttgtttA-TAAGTGTGCATT-GCTTACAGATA----T----ATG---------AA-T-GGAAC--T---TT------GCATAAGTGTG-CA-GGCTTATA
gi|104857                     :                      tgtttA-TAAGTGTGCATT-GCTTGCATGTA----T----GGG---------GA-T-GAAAC--T---TG------GCATAAATGTG-GAT-GCTTATA
gi|104858                     :                  gtttTTGGCA-TAAGTGTGCATT-GCTTGCAGTAA----T----ATG---------AC-T-ACAAA--T---TG------GTATAAGTGTG-CATTGCTT
gi|104859                     :                         gtA-TAAGTTTGCATA-GCTTGCAGCTG----T----ATG---------GC-T-GTAAC--A---TG------GTATAAGTATA-CATAGCTT
gi|104860                     :                       tttCA-TAAGTGTGCATA-GCTTGCAGTTA----T----ATT---------GA-T-GAAAT--T---TG------GCATATCTGTG-CAT-GCTTGTA
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gi|104909                     :                           A-TAAGTGTGCATG-GCTTGCAGATG----T----AAT---------GA-T-CAAAC--T---TG------GCATGAGTGTG-CATGGCTTACA
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blockSeqs                     :                         G              T         T  .           A                          .                    T
blockSeqs                     :                         .              T         T  .           C                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         A  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           C                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           C                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    T
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    A
blockSeqs                     :                                        G         T  .           C                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    T
blockSeqs                     :                                        G         A  .           T                          .                    T
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    T
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    A
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    A
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    A
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    T
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    A
blockSeqs                     :                                        T         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           C                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           T                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           T                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         T  .           C                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         A  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         G  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         C  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        T         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         T  .           A                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         T  .           G                          .                    A
blockSeqs                     :                                        A         T  .           T                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         T  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           T                          .                    G
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    G
blockSeqs                     :                                        A         A  .           T                          .                    .
blockSeqs                     :                                        A         A  .           G                          .                    .
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    .
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    .
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    .
blockSeqs                     :                                        G         A  .           C                          .                    .
blockSeqs                     :                                        G         A  .           G                          .                    .
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blockSeqs                     :                                        G         A  .           T                          .                     
blockSeqs                     :                                        .         A  .           G                          .                     
blockSeqs                     :                                                  T  .           G                          .                     


blockSeqCons                  :                  
originalCons                  :                  AAACTTGGCA-TAAGTGTGCATG-GCTTGCAGNTA----T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATGGCTTATA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|104805 ): TTTTAGTGCAAGTTGTTCATAACTATGCATTGTTTGCAGTTAATATACTAAAACATGTTGTAAGTATATGTGCTTATA






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consensus                     :                  AAACTTGGCA-TAAGTGTGCATG-GCTTGCAGNTA----T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATGGCTTATA
Reference ( family-219 )      :                  AAACTTGGCA-TAAGTGTGCATG-GCTTGCAGNTA----T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATGGCTTATA
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gi|104857                     :                      tgtttA-TAAGTGTGCATT-GCTTGCATGTA----T----GGG---------GA-T-GAAAC--T---TG------GCATAAATGTG-GAT-GCTTATA
gi|104858                     :                  gtttTTGGCA-TAAGTGTGCATT-GCTTGCAGTAA----T----ATG---------AC-T-ACAAA--T---TG------GTATAAGTGTG-CATTGCTT
gi|104859                     :                         gtA-TAAGTTTGCATA-GCTTGCAGCTG----T----ATG---------GC-T-GTAAC--A---TG------GTATAAGTATA-CATAGCTT
gi|104860                     :                       tttCA-TAAGTGTGCATA-GCTTGCAGTTA----T----ATT---------GA-T-GAAAT--T---TG------GCATATCTGTG-CAT-GCTTGTA
gi|104862                     :                          tA-TAAGTGTGCTTG-ACTTGCAGATAG---T----ATG---------GA-T-GGAAC--T---TG------GCATAAGTGTG-CATG
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gi|104865                     :                          tA-TAAGTGTGCATT-GTTTGCAGTTA----T----ATG---------AC-T-GCTAC--T---GG------ATATAAGTGTG-CATTGCTT
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gi|104874                     :                          tA-TAAGTATGCATA-GCTTGCAGATA----T----ATG---------GC-T-GTAAC--A---TG------GTATAAGTATG-CATAGCTT
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gi|104941                     :                                              GCAGTTA----T----ATG---------GA-T-GGAAC--TTAATG------GCACAAGTGTG-TGT-GCTTATA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|104805 ): TTTTAGTGCAAGTTGTTCATAACTATGCATTGTTTGCAGTTAATATACTAAAACATGTTGTAAGTATATGTGCTTATA