lowQualScore : 22222 11 11 11111111 111111 1 11 111111111111
lowQualScore : 66666 44 1 1 44 1 44 44444444 2 2 666666 7 0 3 1111 1 00 00 22 0 8888888888 666666 22 1 11 33333 1 4444 2 5555 33 999 6666 33 333 888 55555 9 22 3 777777777777 3 44 3
lowQualScore : ..... .. . . .. . .. ........ . . ...... . . . .... . .. .. .. . .......... ...... .. . .. ..... . .... . .... .. ... .... .. ... ... ..... . .. . ............ . .. .
lowQualScore : 66666 55 8 8 33 7 44 44444444 4 0 333333 5 5 4 0000 5 66 66 00 5 7777777777 444444 22 0 44 77777 5 7777 2 0000 22 000 1111 99 666 555 66666 0 33 3 111111111111 1 66 6
consensus : TAGAACACNGAGTCGAACTAGAAATTAGGTCCNGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--T-T--T----CGA-CA-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGATACA----ACT--CA-GGAAAT---TAATA---TATGATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GAAGA-TCTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
Reference ( gi|118322 ) : TAGAACACAAAATCGAACTAGAAATTAGGTCAAGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--T-T--T----CGA-CA-CTCTT--CG-TTCGAACTACTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCG----ATCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--TGATACA----ACT--CA-GAAAAT---TAACA---TATGATTTTCA-ATTG-CTGTC------------GAAGA-TCTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118323 : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTAGGTCCAGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--T-T--T----TGG-CA-CTCTT--TG-CTCGAA-TATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCT----ATCCATC--GAATTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGATATA----ACT--CA-GGAAAT---TTATA---TATGATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GGAGA-TCTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTT
gi|118324 : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTAGGTCCAGCCAACA-TATTT-AAATGTA--T-T--T----TGA-CA-CTCTT--CG-TTCGAACTGTTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTC---------------------TACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGATACA----ACT--CA-AGAAAT---TAATA---TATGATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GAAGA-TCTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-TTTTTT
gi|118325 : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTAGGTCCAGCCAACA-TATTT-ACTTGTA--T-T--T----TGA-CA-CTCTT--CG-TCCGAATTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCG----ATCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGAT
gi|118326 : TAGAACACAGTGTCAAACTAGAAATTAGGTCCAGCCAACA-TATTT-ACATGTA--T-T--T----TGA-CA-TTCTT--CG-TTCGAACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCG----ATCCATC--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-C-AT-----CT--G-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGATA
gi|118329 : TGGAACA----GTCCAACTAGAAATTAGGTCCTGCCAACA-CACTT-ACCTGTGTTT-T--T----CG--CA-CCTTT--CA-GTCAAA
gi|118332 : TGGAACA----GTCAAACTAGAAATTAGGTCCCGCCAACA-CACTT-ATCTGTG--T-T--T----
gi|118333 : TGGAACA----GTCGAACTAGAAATTAGATCCCACCAACA-CACTT-TCCTGTACTT-T--T----C-A-CA-CTt
gi|118334 : AGAACACCGAGTCAAACTAGAAGTTAGGTCCAGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--T-T--T----TGA-CA-ATCTT--CG-TTCGAACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCG----ATCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAG-C----AT--TC--CGATATA----TCTGCC----AAATA--TAATA---T----TTTTCA-A
gi|118336 : AGAGTCAAACTAGAAATTAGGTTCAGCCAACA-TATTT-CCCTGTA--T-T--T----TTA-CA-CTCTT--CG-TTCAAACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCG----ATTTATC--AAAGTTCTTCTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGTATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CAATACA----ACT--CA-GGAAAT---TAATA---TATGATTTGCA-CTTG-CT-TC------------GAAAA-TCTGCCAAATATAATGTGTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-CTTTTTccatctacacttatgcactttttt
gi|118337 : AGAGTCGAACTAAAAATTAGATACAGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--T-T--T----TTA-TA-TTCTT--CG-TTCGAACTATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCG----ATCTATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----TA--A-T--A-----TATTC-TTGGAATAAGTTC----TAT-T----AT--TC--CTATACA----ACT--CA-GGAAAT---TAATA---TATAATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GAAGA-TCTGTCAAATATAATGTTTTACAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTT
gi|118338 : AGAGTCGAACTTGAAATAAGGTCCTGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--A-T--T----------------------------TACTCT-CTTC-----------GTTCG----AACTATTTTG----TCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----AT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--AGATACA----ATT--CA-GGAAAT---TGATA---TATGATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GAAGA-TCTGTCAAATATAATACTTCTCAACCAGTTACAAAAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118339 : AGTCGAACTAGAAAGAAGGTCCAGCTAACA-TATTT-ACCTATA--TGT--T----TTA-CT-CTCTT--CG-TTCGAACTATTTT-GTCCA--------------------TCCATC--GAAGTTCTTCTT--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TACAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-A----AT--TC--CGATACA----ACT--CA-GGAAATCTATAATA---TATGATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GAAGA-TCTGTCAAATAAAATGCTTTTCAACCAGTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118341 : gAGTCGAACTAGAAATTAGGTCCCGCCAACA-CATTT-ACCTGTA--T-TTGT----C-A-CA-CCTTT--CG-GTCGAA
gi|118342 : AGTCGAACTAGAAATAAGGTCCCGCCAACA-CACTT-ACCTGTGTTT-T--T----CG--CA-CCTTT--TG-GTCGAA
gi|118343 : AGTCAAACTAGAAATTAAGTCCCGCCAACA-CACAA-ACCTGTATTT-T--T----C-A-CA-CCTTT--CG-GTCGAA
gi|118340 : AGTCGAACTAGAAGTAAAGTCCCGCCAACA-CACTT-ACCTGTGTTT-T--T----CG--CA-CCTTT--CG-GTC
gi|118328 : gGAACTAGAAATTAAGTCCCGCCAACA-CACTT-ACCTGTGTTT-T--T----CG--CA-CCTTT--CG-GTTGAA
gi|118346 : tggaacagtaTAGAAATTAGGCCAAGCTAAGT-TATTA-ACCTGCA--T-T--T----TTA-CG-CTCTT--C--------------------------GTTGGGTTCG----ATCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--
gi|118345 : TAGAAATTAGGCCAAGCTAAGT-TATTA-ACCTGCA--T-T--T----TTA-CG-CTCTT--C--------------------------GTTGGGTTCG----ATCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--
gi|118347 : AGCCAACA-TATTT-ACCTGTA--T-TGTT----TTA-CA-CTCTT--CG-TTCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCG---------------------AGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-ATGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGATACA----ACT--CA-GGACAT---TAATAATATATGATTTGCA-CTTG-CTGTC------------GAAGA-TGTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-
gi|118348 : AACAATATTTGACTTG---------------AA-CAACCCTT--AA-CTTGAACTA-TTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCG----AGACATT--GAAGTTCTACTG--T--A-A------A-CTAT-----CT--T-T--A-----
gi|118350 : A-TGTTT-AACCATA--C-T--TGGCTCGAACA-ACCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGTGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T----------AT-----TT--CGT--A-----TATA
gi|118344 : A--T-T--T----TGAACAACCCTT--AA-CTCGAACTAACTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCG----AGCAATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TA-----T-A-AT-----AA--T-T--A-----TA-AC-T
gi|118357 : tcgaacaagttatctggtccagaccggttcatatttcgatgtatatacatggtatg-T--T----GGA-CAACCCTT--GA-ATTGAACTATTTT-GTCCAGTCCCATCAGATTTG----AGCCATT--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118355 : --T----CGAACA-ATCTT--TA-GTCGAACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCG----CGCCATC--GAAAATCTACTG--T--A-T------
gi|118360 : tactttgcA-CATCCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCA----AATTATC--AAAGTTCTACTT--T--A-T------T-T-GT-----AT--A-T--A-----TA
gi|118359 : A-CA-ATCCT--AA-CTCGAATTATTTT-GTTTAGTCCCGTCGTGTTCG----AGCCGTT--GAAGTTGTACTG--T--A-T------
gi|118365 : A-CCCTT--AG-CTCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118366 : A-CCCTT--TG-CTCGAACTATTTT-GGTCAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTC--T--A-
gi|118367 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCGAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118370 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGCCGGGTTCG----AGCTATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118369 : A-CCCTT--CA-GTTGAACTATTTT-GTCCAGCCCCGTCAGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118376 : A-CCCTT--AA-ATCGAACTAGTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATA---T-A-AT-----AA--T-T--A-----TATAT-ATGCAA-AAGT
gi|118373 : A-CCCTT--AA-CTCAAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCT----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-G------T-T-A------------T--A-----TATAT-T
gi|118371 : A-CCCTT--AC-CTCGAATTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118375 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCG----AACCATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118374 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCG----AACCATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118379 : A-CCCTTAGCG-T--GAACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCAGGTTCA----AGCTATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T----------AT-----AA--T-T--A-----TACA
gi|118378 : A-CTCTT--TA-CTCGAACTATTGT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCG----AGCAA-C--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----AT--A-T--A-----TATA
gi|118364 : A-CCCTT--AG-CTCGAACTATTGT-GTCGAATCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118382 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-ATGAAGTCCCGTCAGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118387 : A-CCCTT--AG-CTCGTACTATTTT-GTTCAGTCTCTTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTTTACTG--C--A-G------T-C-
gi|118383 : A-CCCTT--CA-CTCGAACTATATT-GGCCAATCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTTTACAG--T--A-TTGTTGAT-C-AT-----TT--T-C--A-----T-TAC-Ttcgtagttctaattataattgacaattactacatattcgttaca
gi|118384 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGCGCTAGTG--T--A-T------T---AT-----AT--T-T--
gi|118386 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTAATTT-GTCCAGTCCCATCGGGATCG----AGCCACG--AAAGTTCTACTG--T--A--------------------T--T-T--G-----GATAT-TTGCACTCACTTC----GTT-T----AT--TCAACGATATA----ACT--TA-
gi|118372 : A-CTCTT--AA-TTCGAAATGTTTT-TTCCAGTCCCGTCGTGTTCG----AGCCATC--GAAATTCTACTG--T--A-C------T-
gi|118388 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-ATTCAATCCCGTCGGTTTCG----ATCTATC--GAACTTTTATTG--T--A-T----------AT-----TTA-T-T--A-----TA
gi|118377 : A-CCCTT--AA-GTCGAACAATTTT-GTACAGTCCTGTTGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T------T-
gi|118389 : A-TTCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCCTGTCCCATCGGGTGCG----AGTCATT--GAAATTCTACTG--T--A-T------T-T-TT-----CT--T-TCAG-----TATAT-TT
gi|118391 : A-CCCTT--AA-CTCAAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCTGGTTCA----AGCAATA--AAAGTTCTACTG--T--A-T------------------T--T-T--A-----TATA---TGCAACAAAT
gi|118380 : A-CCCTT--AA-CTGGAACTATTTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTG----ATCTATC--GAAGTACTACTG--T--A-T------A-C-CC-----TT--T-T--AGAGGTTATTCATTGGAAcaaacaatatattaatatattttggacatttgtataaggtcattgttaaaaaatgtt
gi|118402 : A-CTTTT--AA-CTCAAACTAATTT-GTCCTGTCCCGTCGGATTCG----AGTCATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118393 : A-CTGTT--GA-CTCAAACTATTTT-GTCCAGTCCGGTCGAGTTCG----AGCGATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118381 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTTGGGTTCG----TGCCATC--GCAGTTCAACTG--T--A-
gi|118394 : A-CACTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCAAATCCCGTCGGGTTCG----TGTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118390 : A-CCCTT--AA-TTCGAATTATTTT--CCCTGTCCCGTCGGGCTCA----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATC---T-T-AT------T--T-T--G-----TATA
gi|118399 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCTCGTCCCATCGAGTTCA----AGTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118356 : A-CCCTT--AA-GTCGAACTATTTT-GTCCAGCCCCGCCGGGTTTG----AGTCATC--GTAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AC-----AT--T-T--A-----
gi|118401 : tttgactcgaacaA-CCCTT--AA-CTCGAACTAATTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTG----AGCCTTT--GAAGTTCTTCTG--T--A-TA-----T-G-A---------------A-----AATAT-T--AAACAAGCTCCAATTAT-T----ATTATC--TGAAACATTGTATT--TA-AAAAGT---TAATA---
gi|118404 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-TCCTAGTCCCGCCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGCTCTACTA--TA-A-T------G-C-AC-----GT--T-T--A------ATAT-TCG
gi|118395 : A-CTCTT--AA-CTCAAACTAACTT-ATTCAGTCCCATTGGGCTCG----AGCCATC--GAAATTCTGCTG--T--A-C------T-
gi|118405 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATATT-GTCCGGACCCGCCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTATACTG--T--A-TAA----T-C-ATTGACCCA--T-T--A------ATGC-C---AATAAGCTA----TAT-
gi|118403 : A-CCCTT--GG-CTTGAACTGTTTT-GACAAGTCTCGTCGGGTTTG----AGTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------atgccaaaataa
gi|118363 : A-CACTT--AG-CTCGAACTTTTGT-GTCCAGTCCTGCCGGGTTCG----AGCCATC--AAAGGTCTACTG--T--A-T------
gi|118385 : A-CCCTT--AA-ATCGAACTATTTT-GTCCAGTGTCATTGGGTTTG----AGCCATC--GAGGTTCTACTG--T--A-TA-----T-T-GT-----CT--T-
gi|118398 : A-CCCTT--AA-CTCAAACTA-TTT-GTCCAGTCCTGTTGGATTCG----AGCCATT--GACGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118400 : A-CCCTT--TA-ACCGAACTATTTT-GTCGAGCCCCATCGTGTTCG----AGCCACC--GAAGTTCTATT------------------------------T-T--A-----T--------GATTAATTTC----TAT-CTACCAT--GC--CGATA-A----ACT--T--TAAAGT---TTAC----TCTCCTTGTCA-AA-G-ATGAC------------CAAAACTCTGCTAAATAGGGTACTTTTCAACAATATGCA
gi|118392 : A-CCCTT--GG-CTCAAACTGTTTT-GTTGAGTCCTGCTGGGTTCA----AGCCATC--CAAGTTCTACTG--T--G-T------
gi|118397 : A-CCCTT--AA-CTCGAACTATTTT-GTCCATTCCTGTTGGAGTCG----AACTGTC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118423 : CTT--AA-CTCGAACTATTGT-GTTAAGTCCCGTCGGGTTCGAGCTATTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118422 : CTT--CAACTTGAACTATTTTTGTTCAGTCCCGTTGGGTTCG----AGCCATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------TAT-ATTC---CA--T-T--A-----TACAT-T
gi|118424 : CTT--AA-CTCGAAGTATTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTTCG----AATCATC--GAAGTTCTACTA--TTAA-T------TAA-AT-----CT--T-A--A-----T
gi|118425 : TT--GG-CTTGAACTATTTT-GTGCAGTCCCGCCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTGATT--G-T------T----T-----CT--T-T--A--------AT-TT---ATAAATTC----TACGC----AT--TC--
gi|118428 : G-CTCGAACTATTCT-GATAAGTCCCATTGGGTTCC----AGCCATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------c
gi|118429 : -TTCGAACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCG----AGCTATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118430 : -TTCGAACTATTGT-GTCCAGTCCTATTTGATTCG----AGTCATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118435 : TCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCG----ACCAATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----AT--T-
gi|118436 : TCGAACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGATTCG----AGCCATC--GGAGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118439 : TCGAACTAGTTT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCAACTG--TA-A-T------T-T-AT-----CC--T-
gi|118445 : TCGAACTACTTT-GTCTACTCCCGTCGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTACCACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118438 : TCGAATTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCTATC--GAAGTTCTACTG--aatttgtgacgtggttcgttcattaaacagatataa
gi|118354 : TCGAACAATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCG----AGCCACC--CAAGTTCTACTG--T--AGT------T-C-Aaacattataacataatgatcaatgcaagtactgttttattcctacatctc
gi|118441 : tattttgcccgaaaaaccctttaacTCGAACTATTTA-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCG----AGCCATC--AAAGTTCTAATG--TA-A-T------T-A-AT-----AT--A-T--A-----TATA
gi|118443 : TCGAACTAGTTT-GTCCAGTCCGGTCAGGTTCG----AGCCATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118444 : TCAAACTATTGT-GTCCAATCCCGTCAGGTACA----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118465 : CGAACTATTAT-TTCCAGTCCTGTCGGGTTCG----AGTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118463 : CAAACTATTTT-GTCTGGTTCCATTGGGTTCG----AGCCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118464 : CAAAGTATTTT-GTACAGTCCCATCAGGTTCG----AGCCATC--AGAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118396 : GAACTGTTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTACA----AGCCATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------A-C-AT-----CTTGT-T--A-----TAT
gi|118467 : acgcttaactcgGAAGTATTTT-GTCCAGTCCCGTCAAGTTTG----AGCGATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118330 : GAACTATTTT-GTCCAGTCCTGTTAAGTTTG----AACCATA--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----AT--A-T--AT----TATAT-TT
gi|118473 : tggaacaccatatatagcttgaacaacttatctggtcccaaccaaaattcctattttgatgcatatacaaccgttaactcaTATTTT-GTCCAGTCCCAGCAGGTTCG----AGCCATT--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-T-AT-----tatttattacttcaatagaaatcttcaaatgtttatatatg
gi|118477 : ATTTT-GTTCAGTCCCGTCGAGTTCG----AGCGATT--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118479 : TTT-GTCCAGTCCCGTCGTGTTCG----AGCCATC--AAAGTTTTACTG--T--A-T------T-
gi|118478 : tTTT-GTCCAGTCCCGTAGTGTTCG----ATCCATC--AAAGTTCTGCTG--T--A-
gi|118483 : tCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----CT--T-T--A-----TATAC-TTGGAATAAGTTC----TAT-C----AT--TC--CGATACA----ACT--CA-AGAAAT---TAATA---TATGATTTGCA-CTCG-CTGTC------------GAAGA-TCTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCATATTTTTT
gi|118484 : T--T-C--A-----TATGC-TTGGAATAAGTCC----TAT-C----AT--TC--CGATACA----ACT--CA-GGAAGT---TATTA---TATGATTTGCA-CTTG-GTGTC------------GAAGA-TCTGCTAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGTAATATGC
gi|118486 : TTC----TAT-C----TT--AC--CTATAAA----AAT--GGTGAAAAT----AAAA---CATG--TTTCATATTTTCTGTCATACGTGACTACGAAAA-T--GCCAAATATAATGGCTGTCAATCATTTACAAGAGT--TATGCCC-CTTT
gi|118488 : G-TTGTC------------GAAGA-TCTGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAATGA--TATGCAC-TTTTTT
gi|118334 : A-TCTGCCAAATATAATATTTTTCAACCATCTAC---ACT--TATGCAC-TTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11 11 1111111111 111111111111 1111111111
lowQualScore : 66 333 1 1 22 1 9999999999 222 1 33 1 22 3333333333 2 0 0 0 1111 00 00 22 0 8888888888 77777777777 22 0 11 44444 1 333 22 3333 22 5555 44 222 22 4444 0 0 33 33 666 444 44 444444444444 1111111111 33 44 3
lowQualScore : .. ... . . .. . .......... ... . .. . .. .......... . . . . .... .. .. .. . .......... ........... .. . .. ..... . ... .. .... .. .... .. ... .. .... . . .. .. ... ... .. ............ .......... .. .. .
lowQualScore : 66 333 0 8 44 7 0000000000 999 7 88 6 11 8888888888 3 5 5 5 0000 66 66 00 5 2222222222 88888888888 00 9 33 66666 3 555 33 5555 33 2222 00 999 33 0000 1 8 44 44 999 444 22 666666666666 7777777777 77 22 3
consensus : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTA---GGTCCAG-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
Reference ( family-208 ) : TAGAACACNGAGTCGAACTAGAAATTA---GGTCCNG-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118322 : TAGAACACAAAATCGAACTAGAAATTA---GGTCAAG-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CTCTTCGTTC-G-AACTACTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--TGATACA----ACTCAGA--AAA--T---TAAC---ATATGATTTT--CAATTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118323 : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTA---GGTCCAG-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--G-CA-CTCTTTGCTC-G-AA-TATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCTATC----CATC--GAATTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATATA----ACTCAGG--AAA--T---TTAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GGAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTT
gi|118324 : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTA---GGTCCAG-CCAA--CA-TATTT----------AAATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTCTTCGTTC-G-AACTGTTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTC---------------------TACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-TTTTTT
gi|118325 : TAGAACACCGAGTCGAACTAGAAATTA---GGTCCAG-CCAA--CA-TATTT----------ACTTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTCTTCGTCC-G-AATTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGAT
gi|118326 : TAGAACACAGTGTCAAACTAGAAATTA---GGTCCAG-CCAA--CA-TATTT----------ACATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-TTCTTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-C-AT-----C-----T--G-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATA
gi|118328 : TGGAACA----GTAGAACTAGAAATTA---AGTCCCG-CCAA--CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCTTT
gi|118329 : TGGAACA----GTCCAACTAGAAATTA---GGTCCTG-CCAA--CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCTTTCAGTC-A-AAcggttgaa
gi|118330 : A-CCGTTAACTCAG-AACTATTTT-GTCCAGTCCTGTTAAGTTTGAAC----CATA--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--AT----TATAT-TT------T--A---TT----TA--T----TAC--T---T--CAATAGA----AATCTTC--AAATGT---TTAT---ATATG
gi|118332 : tggaacaccatatatagcttgaacaacttatctggtcccaaccaaaattcctattttgatgcatatacaTGGAACA----GTCAAACTAGAAATTA---GGTCCCG-CCAA--CA-CACTT----------ATCTG---T-G--T-T--T----
gi|118333 : TGGAACA----GTCGAACTAGAAATTA---GATCCCA-CCAA--CA-CACTT----------TCCTG---T-ACTT-T--T----C---A-CA-Ct
gi|118334 : AGAACACCGAGTCAAACTAGAAGTTA---GGTCCAG-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-ATCTTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--G----CAT--T---C--CGATATA----TCT---GCCAAA--TA--TAAT---ATt
gi|118334 : A----------TC--TGCCAAATATAATATTTTTCAACCATCTAC---ACT--TATGCAC-TTTTTTttttcaaccatctacacttatgcactttttt
gi|118336 : agaacaccgagtcaaactagaagttaggtccagccaacatatttacctgtattttgacaatcttcgttcgaactattttgttcagtcccgtcgggttcgatccatcgaagttctactgtattcatctttatatacttggaataagttctagcattccgatatGAGTCAAACTAGAAATTA---GGTTCAG-CCAA--CA-TATTT----------CCCTG---T-A--T-T--T----TT--A-CA-CTCTTCGTTC-A-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATT----TATC--AAAGTTCTTCTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--TAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CAATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCT-TC------------GAAAA----------TC--TGCCAAATATAATGTGTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-CTTTTT
gi|118337 : aGAGTCGAACTAAAAATTA---GATACAG-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TT--A-TA-TTCTTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCGATC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----T-----A--A-T--A-----TATTC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----TAT--T---C--CTATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATAATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATGTTTTACAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTT
gi|118338 : aGAGTCGAACTTGAAATAA---GGTCCTG-CCAA--CA-TATTT----------------------------------------A-CCTGTAA------------TTT-----ACTCTCTTCG--TTCGAAC----TATTTTG----TCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--AGATACA----ATTCAGG--AAA--T---TGAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATACTTCTCAACCAGTTACAAAAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118339 : aGAGTCGAACTAGAAAGAA---GGTCCAG-CTAA--CA-TATTT----------ACCTA---T-A--TGT--T----TT--A-CT-CTCTTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCA------------TC--------CATC--GAAGTTCTTCTT--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TACAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----AAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--TCTATAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATAAAATGCTTTTCAACCAGTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118340 : GAGTCGAACTAGAAGTAA---AGTCCCG-CCAA--CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCTTT
gi|118341 : AGTCGAACTAGAAATTA---GGTCCCG-CCAA--CA-CATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T-----GTCA-CA-CCTTTCGGTC-G-AAcggtc
gi|118342 : AGTCGAACTAGAAATAA---GGTCCCG-CCAA--CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCTTTTGGTC-G-AA
gi|118343 : AGTCAAACTAGAAATTA---AGTCCCG-CCAA--CA-CACAA----------ACCTG---T-ATTT-T--T----C---A-CA-CCTTTCGGTC-G-AA
gi|118344 : TCGAAC---AAGTTATCTGGTCCAGACCGGTTCA-TATTTCGATGTATATACATGGTATGA--T-T--T----TG--AACAACCCTTAACTC-G-AACTAACTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TA-----T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TA-AC-T
gi|118345 : TAGAAATTA---GGCCAAG-CTAA--GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTCTT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118346 : TAGAAATTA---GGCCAAG-CTAA--GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTCTT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118347 : G-CCAA--CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-TGTT----TT--A-CA-CTCTTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCG---------------------AGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-ATGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--ACA--T---TAATAATATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TG--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-
gi|118348 : aAA--CAATATTTG---------ACTTG-------------------A--A-CAACCCTTAACTT-G-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGA----CATT--GAAGTTCTACTG--T--A-A------A-CTAT-----C-----T--T-T--A-----
gi|118350 : A-TGTTT----------AACCA---T-A--C-T--TGGCTCG--AACA-ACCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T----------AT-----T-----T--CGT--A-----TATA
gi|118354 : -CCTTTAACTC-G-AACAATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CACC--CAAGTTCTACTG--T--AGT------T-C-A
gi|118355 : tattttgcccgaaaaac--T----CG--AACA-ATCTTTAGTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGCGC----CATC--GAAAATCTACTG--T--A-T------
gi|118356 : tactttgcA-CCCTTAAGTC-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGCCGGGTTTGAGT----CATC--GTAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AC-----A-----T--T-T--A-----
gi|118357 : tttgactcgaaca-T--T----GG--A-CAACCCTTGAATT-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATCAGATTTGAGC----CATT--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118359 : --A-CA-ATCCTAACTC-G-AATTATTTT-GTTTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CGTT--GAAGTTGTACTG--T--A-T------
gi|118360 : --A-CATCCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCAAAT----TATC--AAAGTTCTACTT--T--A-T------T-T-GT-----A-----T--A-T--A-----TA
gi|118363 : A-CACTTAGCTC-G-AACTTTTGT-GTCCAGTCCTGCCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGGTCTACTG--T--A-T------
gi|118364 : A-CCCTTAGCTC-G-AACTATTGT-GTCGAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118365 : A-CCCTTAGCTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118366 : A-CCCTTTGCTC-G-AACTATTTT-GGTCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTC--T--A-
gi|118367 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCGAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118369 : A-CCCTTCAGTT-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118370 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118371 : A-CCCTTACCTC-G-AATTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118372 : A-CTCTTAATTC-G-AAATGTTTT-TTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAATTCTACTG--T--A-C------T-
gi|118373 : A-CCCTTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCTAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-G------T-T-A-----------------T--A-----TATAT-T
gi|118374 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118375 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118376 : A-CCCTTAAATC-G-AACTAGTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATA---T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TATAT-ATGC--AA---AAGT
gi|118377 : A-CCCTTAAGTC-G-AACAATTTT-GTACAGTCCTGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T------T-
gi|118378 : A-CTCTTTACTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----AA-C--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118379 : A-CCCTTAGCGT-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCAGGTTCAAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T----------AT-----A-----A--T-T--A-----TACA
gi|118380 : A-CCCTTAACTG-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGATC----TATC--GAAGTACTACTG--T--A-T------A-C-CC-----T-----T--T-T--AGAGGTTATTCATTGG--AA
gi|118381 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTTGGGTTCGTGC----CATC--GCAGTTCAACTG--T--A-
gi|118382 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-ATGAAGTCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118383 : A-CCCTTCACTC-G-AACTATATT-GGCCAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACAG--T--A-TTGTTGAT-C-AT-----T-----T--T-C--A-----T-TAC-T
gi|118384 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCGCTAGTG--T--A-T------T---AT-----A-----T--T-T--
gi|118385 : A-CCCTTAAATC-G-AACTATTTT-GTCCAGTGTCATTGGGTTTGAGC----CATC--GAGGTTCTACTG--T--A-TA-----T-T-GT-----C-----T--T-
gi|118386 : A-CCCTTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATCGGGATCGAGC----CACG--AAAGTTCTACTG--T--A-------------------------T--T-T--G-----GATAT-TTGC--ACT--CACTTC----GT--T----TAT--T---CAACGATATA----ACTTA
gi|118387 : A-CCCTTAGCTC-G-TACTATTTT-GTTCAGTCTCTTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACTG--C--A-G------T-C--T-----CGTAGTT--C-T--AAT---TATAA-TTG----AC--AATTAC----TA-------CATA-T---T--CGTTACA----
gi|118388 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-ATTCAATCCCGTCGGTTTCGATC----TATC--GAACTTTTATTG--T--A-T----------AT-----T-----TA-T-T--A-----TA
gi|118389 : CTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCTGTCCCATCGGGTGCGAGT----CATT--GAAATTCTACTG--T--A-T------T-T-TT-----C-----T--T-TCAG-----TATAT-TT
gi|118390 : attA-CCCTTAATTC-G-AATTATTTT--CCCTGTCCCGTCGGGCTCAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATC---T-T-AT-----------T--T-T--G-----TATA
gi|118391 : A-CCCTTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCTGGTTCAAGC----AATA--AAAGTTCTACTG--T--A-T-----------------------T--T-T--A-----TATA---TGC--AAC--AA---------A--T----CA------------A-ACA----AT-------ATA--T---TAAT---ATAT--TTTGGACATTTG-TAT--------------AAGG----------TCATTGTTAAA-A-AATGTT
gi|118392 : A-CCCTTGGCTC-A-AACTGTTTT-GTTGAGTCCTGCTGGGTTCAAGC----CATC--CAAGTTCTACTG--T--G-T------
gi|118393 : TTGACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCGGTCGAGTTCGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118394 : actgA-CACTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCAAATCCCGTCGGGTTCGTGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118395 : A-CTCTTAACTC-A-AACTAACTT-ATTCAGTCCCATTGGGCTCGAGC----CATC--GAAATTCTGCTG--T--A-C------T-
gi|118396 : A-CGCTTAACTC-GGAACTGTTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTACAAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------A-C-AT-----C-----TTGT-T--A-----TAT
gi|118397 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCATTCCTGTTGGAGTCGAAC----TGTC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118398 : A-CCCTTAACTC-A-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTTGGATTCGAGC----CATT--GACGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118399 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTCGTCCCATCGAGTTCAAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118400 : -CCTTTAAC-C-G-AACTATTTT-GTCGAGCCCCATCGTGTTCGAGC----CACC--GAAGTTCTA----------------------------T-----T--T-T--A-----T--------G--ATT--AATTTC----TA--TCTACCAT--G---C--CGATA-A----ACT-----------T---TAA--------AGTTTA--CTCTCCTTGTC------------AAAGATGACCAAAACTC--TGCTAAATAGGGTACTTTTCAACAATATGCA
gi|118401 : acA-CCCTTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGAGC----CTTT--GAAGTTCTTCTG--T--A-TA-----T-G-A--------------------A-----AATAT-T--A--AAC--AAGCTCCAATTA--T----TATTAT---C--TGAAACATTGTATTTAAA--AAG--T---TAAT---A
gi|118402 : A-CTTTTAACTC-A-AACTAATTT-GTCCTGTCCCGTCGGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118403 : A-CCCTTGGCTT-G-AACTGTTTT-GACAAGTCTCGTCGGGTTTGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118404 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATTTT-TCCTAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCTCTACTA--TA-A-T------G-C-AC-----G-----T--T-T--A------ATAT-TCG
gi|118405 : A-CCCTTAACTC-G-AACTATATT-GTCCGGACCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTATACTG--T--A-TAA----T-C-ATTGACCC-----A--T-T--A------ATGC-C-----AAT--AAGCTA----TA--T-----AT--G---C--CAAAATA----A
gi|118422 : CTTCAACTT-G-AACTATTTTTGTTCAGTCCCGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------TAT-ATTC---C-----A--T-T--A-----TACAT-T
gi|118423 : CTTAACTC-G-AACTATTGT-GTTAAGTCCCGTCGGGTTCGAGCTATTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118424 : CTTAACTC-G-AAGTATTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTTCGAAT----CATC--GAAGTTCTACTA--TTAA-T------TAA-AT-----C-----T--T-A--A-----T
gi|118425 : TTGGCTT-G-AACTATTTT-GTGCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTGATT--G-T------T----T-----C-----T--T-T--A--------AT-TT-----AT--AAATTC----TA--CG---CAT--T---C--C
gi|118428 : CTC-G-AACTATTCT-GATAAGTCCCATTGGGTTCCAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118429 : gTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118430 : tTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCCTATTTGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118435 : tTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGACC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-
gi|118436 : TC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GGAGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118438 : TC-G-AATTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--A--A----------C-AT-----T-----A--T-A--A-----CATAA--TGATCAATGCAAGTAC----TGTTT----TAT--T---C--C--TACA----TCTC
gi|118439 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCAACTG--TA-A-T------T-T-AT-----C-----C--T-
gi|118441 : TC-G-AACTATTTA-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTAATG--TA-A-T------T-A-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118443 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCCGGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118444 : TC-A-AACTATTGT-GTCCAATCCCGTCAGGTACAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118445 : TC-G-AACTACTTT-GTCTACTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTACCACTG--T--A-T------T-T-AA-----A-----T--T-T--G-----TG-AC-GTG----------GTTC----GT--T----CAT--TAAAC--AGATATA----A
gi|118463 : C-A-AACTATTTT-GTCTGGTTCCATTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118464 : C-A-AAGTATTTT-GTACAGTCCCATCAGGTTCGAGC----CATC--AGAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118465 : C-G-AACTATTAT-TTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118467 : -G-AAGTATTTT-GTCCAGTCCCGTCAAGTTTGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118473 : TATTTT-GTCCAGTCCCAGCAGGTTCGAGC----CATT--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-T-AT-----
gi|118477 : ATTTT-GTTCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----GATT--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118478 : TTTT-GTCCAGTCCCGTAGTGTTCGATC----CATC--AAAGTTCTGCTG--T--A-
gi|118479 : TTTT-GTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--AAAGTTTTACTG--T--A-T------T-
gi|118483 : CTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTCGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCATATTTTTT
gi|118484 : -----T--T-C--A-----TATGC-TTGG--AAT--AAGTCC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAG--T---TATT---ATATGATTTG--CACTTGGTGTC------------GAAGA----------TC--TGCTAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGTAATATGC
gi|118486 : TTC----TA--T----CTT--A---C--CTATAAA----AATGGTG--AAA--A---TAAA---ACATGTTTCA--TATTTTCTGTCATACGTGACTACGAAAA----------T----GCCAAATATAATGGCTGTCAATCATTTACAAGAGT--TATGCCC-CTTT
gi|118488 : GTTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAATGA--TATGCAC-TTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 11 1111111111 111111111111 1111111111
lowQualScore : 55555555 2 666 22 1 5555 1 8888888888 222 1 33 1 22 5555555555 2 0 0 0 0 1111 00 00 22 0 8888888888 77777777777 22 0 11 44444 1 333 22 3333 22 5555 44 222 22 4444 0 0 33 33 666 444 44 444444444444 1111111111 33 44 3
lowQualScore : ........ . ... .. . .... . .......... ... . .. . .. .......... . . . . . .... .. .. .. . .......... ........... .. . .. ..... . ... .. .... .. .... .. ... .. .... . . .. .. ... ... .. ............ .......... .. .. .
lowQualScore : 33333333 0 444 33 7 8888 6 6666666666 888 6 22 5 00 1111111111 3 5 5 5 5 0000 66 66 00 5 2222222222 88888888888 00 9 33 66666 3 555 33 5555 33 2222 00 999 33 0000 1 8 44 44 999 444 22 666666666666 7777777777 77 22 3
consensus : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
Reference ( family-208 ) : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118322 : TAGAACACAA-----AA-TCGAACTAGAAATTA---GGTCA-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTACTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--TGATACA----ACTCAGA--AAA--T---TAAC---ATATGATTTT--CAATTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118323 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--G-CA-CTC-TTTGCTC-G-AA-TATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCTATC----CATC--GAATTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATATA----ACTCAGG--AAA--T---TTAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GGAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTT
gi|118324 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------AAATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTGTTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTC---------------------TACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-TTTTTT
gi|118325 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACTTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTC-TTCGTCC-G-AATTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGAT
gi|118326 : TAGAACACAG-----TG-TCAAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-TTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-C-AT-----C-----T--G-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATA
gi|118328 : TGGAACA---------G-TAGAACTAGAAATTA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TT
gi|118329 : TGGAACA---------G-TCCAACTAGAAATTA---GGTCC-TG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TTCAGTC-A-AAcggttgaa
gi|118330 : TGGAACACCATATATAGCTTGAAC---AACTTATCTGGTCCCAA-CCAAAATTCC-TATTT----------TGATG---C-A--T-A--T--------A-CA-ACCGTTAACTCAG-AACTATTTT-GTCCAGTCCTGTTAAGTTTGAAC----CATA--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--AT----TATAT-TT------T--A---TT----TA--T----TAC--T---T--CAATAGA----AATCTTC--AAATGT---TTAT---ATATG
gi|118332 : TGGAACA---------G-TCAAACTAGAAATTA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ATCTG---T-G--T-T--T----
gi|118333 : TGGAACA---------G-TCGAACTAGAAATTA---GATCC-CA-CCAA----CA-CACTT----------TCCTG---T-ACTT-T--T----C---A-CA-Ct
gi|118334 : AGAACACCG-----AG-TCAAACTAGAAGTTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-ATC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--G----CAT--T---C--CGATATA----TCT---GCCAAA--TA--TAAT---ATt
gi|118334 : A----------TC--TGCCAAATATAATATTTTTCAACCATCTAC---ACT--TATGCAC-TTTTTTttttcaaccatctacacttatgcactttttt
gi|118336 : agaacaccgagtcaaactagaagttaggtccagccaacatatttacctgtattttgacaatcttcgttcgaactattttgttcagtcccgtcgggttcgatccatcgaagttctactgtattcatctttatatacttggaataagttctagcattccgatatG-----AG-TCAAACTAGAAATTA---GGTTC-AG-CCAA----CA-TATTT----------CCCTG---T-A--T-T--T----TT--A-CA-CTC-TTCGTTC-A-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATT----TATC--AAAGTTCTTCTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--TAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CAATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCT-TC------------GAAAA----------TC--TGCCAAATATAATGTGTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-CTTTTT
gi|118337 : aG-----AG-TCGAACTAAAAATTA---GATAC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TT--A-TA-TTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCGATC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----T-----A--A-T--A-----TATTC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----TAT--T---C--CTATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATAATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATGTTTTACAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTT
gi|118338 : aG-----AG-TCGAACTTGAAATAA---GGTCC-TG-CCAA----CA-TATTT----------------------------------------A-CCT-GTAA------------TTT-----ACTCTCTTCG--TTCGAAC----TATTTTG----TCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--AGATACA----ATTCAGG--AAA--T---TGAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATACTTCTCAACCAGTTACAAAAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118339 : aG-----AG-TCGAACTAGAAAGAA---GGTCC-AG-CTAA----CA-TATTT----------ACCTA---T-A--TGT--T----TT--A-CT-CTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCA------------TC--------CATC--GAAGTTCTTCTT--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TACAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----AAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--TCTATAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATAAAATGCTTTTCAACCAGTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118340 : G-----AG-TCGAACTAGAAGTAA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TT
gi|118341 : -----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T-----GTCA-CA-CCT-TTCGGTC-G-AAcggtc
gi|118342 : -----AG-TCGAACTAGAAATAA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TTTGGTC-G-AA
gi|118343 : -----AG-TCAAACTAGAAATTA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACAA----------ACCTG---T-ATTT-T--T----C---A-CA-CCT-TTCGGTC-G-AA
gi|118344 : -TCGAAC---AAGTTATCTGGTCC-AGACCGGTT--CA-TATTTCGATGTATATACATGGTATGA--T-T--T----TG--AACAACCC-TTAACTC-G-AACTAACTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TA-----T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TA-AC-T
gi|118345 : TAGAAATTA---GGCCA-AG-CTAA----GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTC-TT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118346 : TAGAAATTA---GGCCA-AG-CTAA----GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTC-TT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118347 : -AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-TGTT----TT--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCG---------------------AGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-ATGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--ACA--T---TAATAATATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TG--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-
gi|118348 : AA----CAATATTTG---------ACTTG-------------------A--A-CAACCC-TTAACTT-G-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGA----CATT--GAAGTTCTACTG--T--A-A------A-CTAT-----C-----T--T-T--A-----
gi|118350 : A-TGTTT----------AACCA---T-A--C-T--TGGCTCG--AACA-ACC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T----------AT-----T-----T--CGT--A-----TATA
gi|118354 : -CCT-TTAACTC-G-AACAATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CACC--CAAGTTCTACTG--T--AGT------T-C-A
gi|118355 : tattttgcccgaaaaac--T----CG--AACA-ATC-TTTAGTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGCGC----CATC--GAAAATCTACTG--T--A-T------
gi|118356 : tactttgcA-CCC-TTAAGTC-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGCCGGGTTTGAGT----CATC--GTAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AC-----A-----T--T-T--A-----
gi|118357 : tttgactcgaaca-T--T----GG--A-CAACCC-TTGAATT-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATCAGATTTGAGC----CATT--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118359 : --A-CA-ATC-CTAACTC-G-AATTATTTT-GTTTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CGTT--GAAGTTGTACTG--T--A-T------
gi|118360 : --A-CATCCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCAAAT----TATC--AAAGTTCTACTT--T--A-T------T-T-GT-----A-----T--A-T--A-----TA
gi|118363 : A-CAC-TTAGCTC-G-AACTTTTGT-GTCCAGTCCTGCCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGGTCTACTG--T--A-T------
gi|118364 : A-CCC-TTAGCTC-G-AACTATTGT-GTCGAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118365 : A-CCC-TTAGCTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118366 : A-CCC-TTTGCTC-G-AACTATTTT-GGTCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTC--T--A-
gi|118367 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCGAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118369 : A-CCC-TTCAGTT-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118370 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118371 : A-CCC-TTACCTC-G-AATTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118372 : A-CTC-TTAATTC-G-AAATGTTTT-TTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAATTCTACTG--T--A-C------T-
gi|118373 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCTAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-G------T-T-A-----------------T--A-----TATAT-T
gi|118374 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118375 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118376 : A-CCC-TTAAATC-G-AACTAGTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATA---T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TATAT-ATGC--AA---AAGT
gi|118377 : A-CCC-TTAAGTC-G-AACAATTTT-GTACAGTCCTGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T------T-
gi|118378 : A-CTC-TTTACTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----AA-C--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118379 : A-CCC-TTAGCGT-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCAGGTTCAAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T----------AT-----A-----A--T-T--A-----TACA
gi|118380 : A-CCC-TTAACTG-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGATC----TATC--GAAGTACTACTG--T--A-T------A-C-CC-----T-----T--T-T--AGAGGTTATTCATTGG--AA
gi|118381 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTTGGGTTCGTGC----CATC--GCAGTTCAACTG--T--A-
gi|118382 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-ATGAAGTCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118383 : A-CCC-TTCACTC-G-AACTATATT-GGCCAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACAG--T--A-TTGTTGAT-C-AT-----T-----T--T-C--A-----T-TAC-T
gi|118384 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCGCTAGTG--T--A-T------T---AT-----A-----T--T-T--
gi|118385 : A-CCC-TTAAATC-G-AACTATTTT-GTCCAGTGTCATTGGGTTTGAGC----CATC--GAGGTTCTACTG--T--A-TA-----T-T-GT-----C-----T--T-
gi|118386 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATCGGGATCGAGC----CACG--AAAGTTCTACTG--T--A-------------------------T--T-T--G-----GATAT-TTGC--ACT--CACTTC----GT--T----TAT--T---CAACGATATA----ACTTA
gi|118387 : A-CCC-TTAGCTC-G-TACTATTTT-GTTCAGTCTCTTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACTG--C--A-G------T-C--T-----CGTAGTT--C-T--AAT---TATAA-TTG----AC--AATTAC----TA-------CATA-T---T--CGTTACA----
gi|118388 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-ATTCAATCCCGTCGGTTTCGATC----TATC--GAACTTTTATTG--T--A-T----------AT-----T-----TA-T-T--A-----TA
gi|118389 : C-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCTGTCCCATCGGGTGCGAGT----CATT--GAAATTCTACTG--T--A-T------T-T-TT-----C-----T--T-TCAG-----TATAT-TT
gi|118390 : attA-CCC-TTAATTC-G-AATTATTTT--CCCTGTCCCGTCGGGCTCAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATC---T-T-AT-----------T--T-T--G-----TATA
gi|118391 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCTGGTTCAAGC----AATA--AAAGTTCTACTG--T--A-T-----------------------T--T-T--A-----TATA---TGC--AAC--AA---------A--T----CA------------A-ACA----AT-------ATA--T---TAAT---ATAT--TTTGGACATTTG-TAT--------------AAGG----------TCATTGTTAAA-A-AATGTT
gi|118392 : A-CCC-TTGGCTC-A-AACTGTTTT-GTTGAGTCCTGCTGGGTTCAAGC----CATC--CAAGTTCTACTG--T--G-T------
gi|118393 : -TTGACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCGGTCGAGTTCGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118394 : actgA-CAC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCAAATCCCGTCGGGTTCGTGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118395 : A-CTC-TTAACTC-A-AACTAACTT-ATTCAGTCCCATTGGGCTCGAGC----CATC--GAAATTCTGCTG--T--A-C------T-
gi|118396 : A-CGC-TTAACTC-GGAACTGTTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTACAAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------A-C-AT-----C-----TTGT-T--A-----TAT
gi|118397 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCATTCCTGTTGGAGTCGAAC----TGTC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118398 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTTGGATTCGAGC----CATT--GACGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118399 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTCGTCCCATCGAGTTCAAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118400 : -CCT-TTAAC-C-G-AACTATTTT-GTCGAGCCCCATCGTGTTCGAGC----CACC--GAAGTTCTA----------------------------T-----T--T-T--A-----T--------G--ATT--AATTTC----TA--TCTACCAT--G---C--CGATA-A----ACT-----------T---TAA--------AGTTTA--CTCTCCTTGTC------------AAAGATGACCAAAACTC--TGCTAAATAGGGTACTTTTCAACAATATGCA
gi|118401 : acA-CCC-TTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGAGC----CTTT--GAAGTTCTTCTG--T--A-TA-----T-G-A--------------------A-----AATAT-T--A--AAC--AAGCTCCAATTA--T----TATTAT---C--TGAAACATTGTATTTAAA--AAG--T---TAAT---A
gi|118402 : A-CTT-TTAACTC-A-AACTAATTT-GTCCTGTCCCGTCGGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118403 : A-CCC-TTGGCTT-G-AACTGTTTT-GACAAGTCTCGTCGGGTTTGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118404 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-TCCTAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCTCTACTA--TA-A-T------G-C-AC-----G-----T--T-T--A------ATAT-TCG
gi|118405 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATATT-GTCCGGACCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTATACTG--T--A-TAA----T-C-ATTGACCC-----A--T-T--A------ATGC-C-----AAT--AAGCTA----TA--T-----AT--G---C--CAAAATA----A
gi|118422 : CT-TCAACTT-G-AACTATTTTTGTTCAGTCCCGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------TAT-ATTC---C-----A--T-T--A-----TACAT-T
gi|118423 : C-TTAACTC-G-AACTATTGT-GTTAAGTCCCGTCGGGTTCGAGCTATTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118424 : C-TTAACTC-G-AAGTATTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTTCGAAT----CATC--GAAGTTCTACTA--TTAA-T------TAA-AT-----C-----T--T-A--A-----T
gi|118425 : -TTGGCTT-G-AACTATTTT-GTGCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTGATT--G-T------T----T-----C-----T--T-T--A--------AT-TT-----AT--AAATTC----TA--CG---CAT--T---C--C
gi|118428 : CTC-G-AACTATTCT-GATAAGTCCCATTGGGTTCCAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118429 : gTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118430 : tTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCCTATTTGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118435 : tTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGACC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-
gi|118436 : TC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GGAGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118438 : TC-G-AATTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--A--A----------C-AT-----T-----A--T-A--A-----CATAA--TGATCAATGCAAGTAC----TGTTT----TAT--T---C--C--TACA----TCTC
gi|118439 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCAACTG--TA-A-T------T-T-AT-----C-----C--T-
gi|118441 : TC-G-AACTATTTA-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTAATG--TA-A-T------T-A-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118443 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCCGGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118444 : TC-A-AACTATTGT-GTCCAATCCCGTCAGGTACAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118445 : TC-G-AACTACTTT-GTCTACTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTACCACTG--T--A-T------T-T-AA-----A-----T--T-T--G-----TG-AC-GTG----------GTTC----GT--T----CAT--TAAAC--AGATATA----A
gi|118463 : C-A-AACTATTTT-GTCTGGTTCCATTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118464 : C-A-AAGTATTTT-GTACAGTCCCATCAGGTTCGAGC----CATC--AGAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118465 : C-G-AACTATTAT-TTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118467 : -G-AAGTATTTT-GTCCAGTCCCGTCAAGTTTGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118473 : TATTTT-GTCCAGTCCCAGCAGGTTCGAGC----CATT--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-T-AT-----
gi|118477 : ATTTT-GTTCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----GATT--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118478 : TTTT-GTCCAGTCCCGTAGTGTTCGATC----CATC--AAAGTTCTGCTG--T--A-
gi|118479 : TTTT-GTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--AAAGTTTTACTG--T--A-T------T-
gi|118483 : CTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTCGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCATATTTTTT
gi|118484 : -----T--T-C--A-----TATGC-TTGG--AAT--AAGTCC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAG--T---TATT---ATATGATTTG--CACTTGGTGTC------------GAAGA----------TC--TGCTAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGTAATATGC
gi|118486 : TTC----TA--T----CTT--A---C--CTATAAA----AATGGTG--AAA--A---TAAA---ACATGTTTCA--TATTTTCTGTCATACGTGACTACGAAAA----------T----GCCAAATATAATGGCTGTCAATCATTTACAAGAGT--TATGCCC-CTTT
gi|118488 : GTTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAATGA--TATGCAC-TTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 11 1111111111 111111111111 1111111111
lowQualScore : 55555555 2 666 22 1 5555 1 8888888888 222 1 33 1 22 5555555555 2 0 0 0 0 1111 00 00 22 0 8888888888 77777777777 22 0 11 44444 1 333 22 3333 22 5555 44 222 22 4444 0 0 33 33 666 444 44 444444444444 1111111111 33 44 3
lowQualScore : ........ . ... .. . .... . .......... ... . .. . .. .......... . . . . . .... .. .. .. . .......... ........... .. . .. ..... . ... .. .... .. .... .. ... .. .... . . .. .. ... ... .. ............ .......... .. .. .
lowQualScore : 33333333 0 444 33 7 8888 6 6666666666 888 6 22 5 00 1111111111 3 5 5 5 5 0000 66 66 00 5 2222222222 88888888888 00 9 33 66666 3 555 33 5555 33 2222 00 999 33 0000 1 8 44 44 999 444 22 666666666666 7777777777 77 22 3
consensus : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
Reference ( family-208 ) : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118322 : TAGAACACAA-----AA-TCGAACTAGAAATTA---GGTCA-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTACTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--TGATACA----ACTCAGA--AAA--T---TAAC---ATATGATTTT--CAATTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118323 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--G-CA-CTC-TTTGCTC-G-AA-TATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCTATC----CATC--GAATTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATATA----ACTCAGG--AAA--T---TTAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GGAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTT
gi|118324 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------AAATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTGTTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTC---------------------TACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-TTTTTT
gi|118325 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACTTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTC-TTCGTCC-G-AATTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGAT
gi|118326 : TAGAACACAG-----TG-TCAAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-TTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-C-AT-----C-----T--G-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATA
gi|118328 : TGGAACA---------G-TAGAACTAGAAATTA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TT
gi|118329 : TGGAACA---------G-TCCAACTAGAAATTA---GGTCC-TG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TTCAGTC-A-AAcggttgaa
gi|118330 : TGGAACACCATATATAGCTTGAAC---AACTTATCTGGTCCCAA-CCAAAATTCC-TATTT----------TGATG---C-A--T-A--T--------A-CA-ACCGTTAACTCAG-AACTATTTT-GTCCAGTCCTGTTAAGTTTGAAC----CATA--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--AT----TATAT-TT------T--A---TT----TA--T----TAC--T---T--CAATAGA----AATCTTC--AAATGT---TTAT---ATATG
gi|118332 : TGGAACA---------G-TCAAACTAGAAATTA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ATCTG---T-G--T-T--T----
gi|118333 : TGGAACA---------G-TCGAACTAGAAATTA---GATCC-CA-CCAA----CA-CACTT----------TCCTG---T-ACTT-T--T----C---A-CA-Ct
gi|118334 : GAACACCG-----AG-TCAAACTAGAAGTTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-ATC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--G----CAT--T---C--CGATATA----TCT---GCCAAA--TA--TAAT---ATt
gi|118334 : aA----------TC--TGCCAAATATAATATTTTTCAACCATCTAC---ACT--TATGCAC-TTTTTTttttcaaccatctacacttatgcactttttt
gi|118336 : agaacaccgagtcaaactagaagttaggtccagccaacatatttacctgtattttgacaatcttcgttcgaactattttgttcagtcccgtcgggttcgatccatcgaagttctactgtattcatctttatatacttggaataagttctagcattccgatatG-----AG-TCAAACTAGAAATTA---GGTTC-AG-CCAA----CA-TATTT----------CCCTG---T-A--T-T--T----TT--A-CA-CTC-TTCGTTC-A-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATT----TATC--AAAGTTCTTCTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--TAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CAATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCT-TC------------GAAAA----------TC--TGCCAAATATAATGTGTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-CTTTTT
gi|118337 : aG-----AG-TCGAACTAAAAATTA---GATAC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TT--A-TA-TTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCGATC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----T-----A--A-T--A-----TATTC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----TAT--T---C--CTATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATAATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATGTTTTACAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTT
gi|118338 : aG-----AG-TCGAACTTGAAATAA---GGTCC-TG-CCAA----CA-TATTT----------------------------------------A-CCT-GTAA------------TTT-----ACTCTCTTCG--TTCGAAC----TATTTTG----TCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--AGATACA----ATTCAGG--AAA--T---TGAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATACTTCTCAACCAGTTACAAAAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118339 : aG-----AG-TCGAACTAGAAAGAA---GGTCC-AG-CTAA----CA-TATTT----------ACCTA---T-A--TGT--T----TT--A-CT-CTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCA------------TC--------CATC--GAAGTTCTTCTT--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TACAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----AAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--TCTATAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATAAAATGCTTTTCAACCAGTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118340 : G-----AG-TCGAACTAGAAGTAA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TT
gi|118341 : -----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T-----GTCA-CA-CCT-TTCGGTC-G-AAcggtc
gi|118342 : -----AG-TCGAACTAGAAATAA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TTTGGTC-G-AA
gi|118343 : -----AG-TCAAACTAGAAATTA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACAA----------ACCTG---T-ATTT-T--T----C---A-CA-CCT-TTCGGTC-G-AA
gi|118344 : -TCGAAC---AAGTTATCTGGTCC-AGACCGGTT--CA-TATTTCGATGTATATACATGGTATGA--T-T--T----TG--AACAACCC-TTAACTC-G-AACTAACTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TA-----T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TA-AC-T
gi|118345 : TAGAAATTA---GGCCA-AG-CTAA----GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTC-TT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118346 : TAGAAATTA---GGCCA-AG-CTAA----GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTC-TT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118347 : -AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-TGTT----TT--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCG---------------------AGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-ATGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--ACA--T---TAATAATATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TG--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-
gi|118348 : AA----CAATATTTG---------ACTTG-------------------A--A-CAACCC-TTAACTT-G-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGA----CATT--GAAGTTCTACTG--T--A-A------A-CTAT-----C-----T--T-T--A-----
gi|118350 : A-TGTTT----------AACCA---T-A--C-T--TGGCTCG--AACA-ACC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T----------AT-----T-----T--CGT--A-----TATA
gi|118354 : -CCT-TTAACTC-G-AACAATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CACC--CAAGTTCTACTG--T--AGT------T-C-A
gi|118355 : tattttgcccgaaaaac--T----CG--AACA-ATC-TTTAGTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGCGC----CATC--GAAAATCTACTG--T--A-T------
gi|118356 : tactttgcA-CCC-TTAAGTC-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGCCGGGTTTGAGT----CATC--GTAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AC-----A-----T--T-T--A-----
gi|118357 : tttgactcgaaca-T--T----GG--A-CAACCC-TTGAATT-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATCAGATTTGAGC----CATT--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118359 : --A-CA-ATC-CTAACTC-G-AATTATTTT-GTTTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CGTT--GAAGTTGTACTG--T--A-T------
gi|118360 : --A-CATCCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCAAAT----TATC--AAAGTTCTACTT--T--A-T------T-T-GT-----A-----T--A-T--A-----TA
gi|118363 : A-CAC-TTAGCTC-G-AACTTTTGT-GTCCAGTCCTGCCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGGTCTACTG--T--A-T------
gi|118364 : A-CCC-TTAGCTC-G-AACTATTGT-GTCGAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118365 : A-CCC-TTAGCTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118366 : A-CCC-TTTGCTC-G-AACTATTTT-GGTCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTC--T--A-
gi|118367 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCGAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118369 : A-CCC-TTCAGTT-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118370 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118371 : A-CCC-TTACCTC-G-AATTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118372 : A-CTC-TTAATTC-G-AAATGTTTT-TTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAATTCTACTG--T--A-C------T-
gi|118373 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCTAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-G------T-T-A-----------------T--A-----TATAT-T
gi|118374 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118375 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118376 : A-CCC-TTAAATC-G-AACTAGTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATA---T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TATAT-ATGC--AA---AAGT
gi|118377 : A-CCC-TTAAGTC-G-AACAATTTT-GTACAGTCCTGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T------T-
gi|118378 : A-CTC-TTTACTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----AA-C--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118379 : A-CCC-TTAGCGT-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCAGGTTCAAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T----------AT-----A-----A--T-T--A-----TACA
gi|118380 : A-CCC-TTAACTG-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGATC----TATC--GAAGTACTACTG--T--A-T------A-C-CC-----T-----T--T-T--AGAGGTTATTCATTGG--AA
gi|118381 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTTGGGTTCGTGC----CATC--GCAGTTCAACTG--T--A-
gi|118382 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-ATGAAGTCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118383 : A-CCC-TTCACTC-G-AACTATATT-GGCCAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACAG--T--A-TTGTTGAT-C-AT-----T-----T--T-C--A-----T-TAC-T
gi|118384 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCGCTAGTG--T--A-T------T---AT-----A-----T--T-T--
gi|118385 : A-CCC-TTAAATC-G-AACTATTTT-GTCCAGTGTCATTGGGTTTGAGC----CATC--GAGGTTCTACTG--T--A-TA-----T-T-GT-----C-----T--T-
gi|118386 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATCGGGATCGAGC----CACG--AAAGTTCTACTG--T--A-------------------------T--T-T--G-----GATAT-TTGC--ACT--CACTTC----GT--T----TAT--T---CAACGATATA----ACTTA
gi|118387 : A-CCC-TTAGCTC-G-TACTATTTT-GTTCAGTCTCTTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACTG--C--A-G------T-C--T-----CGTAGTT--C-T--AAT---TATAA-TTG----AC--AATTAC----TA-------CATA-T---T--CGTTACA----
gi|118388 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-ATTCAATCCCGTCGGTTTCGATC----TATC--GAACTTTTATTG--T--A-T----------AT-----T-----TA-T-T--A-----TA
gi|118389 : C-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCTGTCCCATCGGGTGCGAGT----CATT--GAAATTCTACTG--T--A-T------T-T-TT-----C-----T--T-TCAG-----TATAT-TT
gi|118390 : attA-CCC-TTAATTC-G-AATTATTTT--CCCTGTCCCGTCGGGCTCAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATC---T-T-AT-----------T--T-T--G-----TATA
gi|118391 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCTGGTTCAAGC----AATA--AAAGTTCTACTG--T--A-T-----------------------T--T-T--A-----TATA---TGC--AAC--AA---------A--T----CA------------A-ACA----AT-------ATA--T---TAAT---ATAT--TTTGGACATTTG-TAT--------------AAGG----------TCATTGTTAAA-A-AATGTT
gi|118392 : A-CCC-TTGGCTC-A-AACTGTTTT-GTTGAGTCCTGCTGGGTTCAAGC----CATC--CAAGTTCTACTG--T--G-T------
gi|118393 : -TTGACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCGGTCGAGTTCGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118394 : actgA-CAC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCAAATCCCGTCGGGTTCGTGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118395 : A-CTC-TTAACTC-A-AACTAACTT-ATTCAGTCCCATTGGGCTCGAGC----CATC--GAAATTCTGCTG--T--A-C------T-
gi|118396 : A-CGC-TTAACTC-GGAACTGTTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTACAAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------A-C-AT-----C-----TTGT-T--A-----TAT
gi|118397 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCATTCCTGTTGGAGTCGAAC----TGTC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118398 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTTGGATTCGAGC----CATT--GACGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118399 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTCGTCCCATCGAGTTCAAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118400 : -CCT-TTAAC-C-G-AACTATTTT-GTCGAGCCCCATCGTGTTCGAGC----CACC--GAAGTTCTA----------------------------T-----T--T-T--A-----T--------G--ATT--AATTTC----TA--TCTACCAT--G---C--CGATA-A----ACT-----------T---TAA--------AGTTTA--CTCTCCTTGTC------------AAAGATGACCAAAACTC--TGCTAAATAGGGTACTTTTCAACAATATGCA
gi|118401 : acA-CCC-TTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGAGC----CTTT--GAAGTTCTTCTG--T--A-TA-----T-G-A--------------------A-----AATAT-T--A--AAC--AAGCTCCAATTA--T----TATTAT---C--TGAAACATTGTATTTAAA--AAG--T---TAAT---A
gi|118402 : A-CTT-TTAACTC-A-AACTAATTT-GTCCTGTCCCGTCGGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118403 : A-CCC-TTGGCTT-G-AACTGTTTT-GACAAGTCTCGTCGGGTTTGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118404 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-TCCTAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCTCTACTA--TA-A-T------G-C-AC-----G-----T--T-T--A------ATAT-TCG
gi|118405 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATATT-GTCCGGACCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTATACTG--T--A-TAA----T-C-ATTGACCC-----A--T-T--A------ATGC-C-----AAT--AAGCTA----TA--T-----AT--G---C--CAAAATA----A
gi|118422 : CT-TCAACTT-G-AACTATTTTTGTTCAGTCCCGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------TAT-ATTC---C-----A--T-T--A-----TACAT-T
gi|118423 : C-TTAACTC-G-AACTATTGT-GTTAAGTCCCGTCGGGTTCGAGCTATTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118424 : C-TTAACTC-G-AAGTATTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTTCGAAT----CATC--GAAGTTCTACTA--TTAA-T------TAA-AT-----C-----T--T-A--A-----T
gi|118425 : -TTGGCTT-G-AACTATTTT-GTGCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTGATT--G-T------T----T-----C-----T--T-T--A--------AT-TT-----AT--AAATTC----TA--CG---CAT--T---C--C
gi|118428 : CTC-G-AACTATTCT-GATAAGTCCCATTGGGTTCCAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118429 : gTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118430 : tTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCCTATTTGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118435 : tTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGACC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-
gi|118436 : TC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GGAGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118438 : TC-G-AATTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--A--A----------C-AT-----T-----A--T-A--A-----CATAA--TGATCAATGCAAGTAC----TGTTT----TAT--T---C--C--TACA----TCTC
gi|118439 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCAACTG--TA-A-T------T-T-AT-----C-----C--T-
gi|118441 : TC-G-AACTATTTA-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTAATG--TA-A-T------T-A-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118443 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCCGGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118444 : TC-A-AACTATTGT-GTCCAATCCCGTCAGGTACAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118445 : TC-G-AACTACTTT-GTCTACTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTACCACTG--T--A-T------T-T-AA-----A-----T--T-T--G-----TG-AC-GTG----------GTTC----GT--T----CAT--TAAAC--AGATATA----A
gi|118463 : C-A-AACTATTTT-GTCTGGTTCCATTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118464 : C-A-AAGTATTTT-GTACAGTCCCATCAGGTTCGAGC----CATC--AGAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118465 : C-G-AACTATTAT-TTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118467 : -G-AAGTATTTT-GTCCAGTCCCGTCAAGTTTGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118473 : TATTTT-GTCCAGTCCCAGCAGGTTCGAGC----CATT--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-T-AT-----
gi|118477 : ATTTT-GTTCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----GATT--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118478 : TTTT-GTCCAGTCCCGTAGTGTTCGATC----CATC--AAAGTTCTGCTG--T--A-
gi|118479 : TTTT-GTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--AAAGTTTTACTG--T--A-T------T-
gi|118483 : CTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTCGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCATATTTTTT
gi|118484 : -----T--T-C--A-----TATGC-TTGG--AAT--AAGTCC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAG--T---TATT---ATATGATTTG--CACTTGGTGTC------------GAAGA----------TC--TGCTAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGTAATATGC
gi|118486 : TTC----TA--T----CTT--A---C--CTATAAA----AATGGTG--AAA--A---TAAA---ACATGTTTCA--TATTTTCTGTCATACGTGACTACGAAAA----------T----GCCAAATATAATGGCTGTCAATCATTTACAAGAGT--TATGCCC-CTTT
gi|118488 : GTTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAATGA--TATGCAC-TTTTTT
blockSeqs : CCATATAT C TCT CA A AATT A CGATGTATAT GTA G TT G GT GGCTCGAA A TA TGTTGATC CGTAGT TG CA GAGGT A ATC GC CAAT TT CTAC TA AAA AA TTGT CC TG CTA AAT GA ATACGTGACTAC TGACCAAAAC AT AA A
blockSeqs : CCG . TCT A . TT . G . . TT . . GTCA A A ATATA TGACCC A . AT . G . . . G A . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : CCG . . A . . . . . . CT . . TGAA A A ATCTT TCC . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : CCG . . A . . . . . . TT . . CGAA T A AATC C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : CAG . . A . . . . . . TT . . TGG . . ATA C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : CCG . . C . . . . . . TT . . TGA . . ACT C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . TGA . . ATT C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . TGA . . ATG A . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . TGA . . TAT C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . TTA . . TAA C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . TTA . . TC T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . TTA . . TC A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . TTA . . TC C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . TTA . . TC A . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . TTA . . AT C . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . GGA . . TC C . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . CG . . TC C . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . CG . . TC C . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . CA . . TT T . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . CG . . TC A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . CG . . TC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . CA . . TC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AA . . TC A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TC A . . . . .
blockSeqs : . . . . . AT T . . . .
blockSeqs : . . . TT T . . . .
blockSeqs : . . TT A . . . .
blockSeqs : . . AT C . . . .
blockSeqs : . . AC T . . . .
blockSeqs : . . TC C . . . .
blockSeqs : . . TT C . . .
blockSeqs : . . AC T . . .
blockSeqs : . . TT G . . .
blockSeqs : . . GC C . . .
blockSeqs : . . TT C . . .
blockSeqs : . . TT A . . .
blockSeqs : . . TA T . . .
blockSeqs : . . TT C . . .
blockSeqs : . . TT A . . .
blockSeqs : . . TT A . . .
blockSeqs : . . TC C . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
finalCons : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 11 1111111111 111111111111 1111111111
lowQualScore : 55555555 2 666 22 1 5555 1 8888888888 222 1 33 1 22 5555555555 2 0 0 0 0 1111 00 00 22 0 8888888888 77777777777 22 0 11 44444 1 333 22 3333 22 5555 44 222 22 4444 0 0 33 33 666 444 44 444444444444 1111111111 33 44 3
lowQualScore : ........ . ... .. . .... . .......... ... . .. . .. .......... . . . . . .... .. .. .. . .......... ........... .. . .. ..... . ... .. .... .. .... .. ... .. .... . . .. .. ... ... .. ............ .......... .. .. .
lowQualScore : 33333333 0 444 33 7 8888 6 6666666666 888 6 22 5 00 1111111111 3 5 5 5 5 0000 66 66 00 5 2222222222 88888888888 00 9 33 66666 3 555 33 5555 33 2222 00 999 33 0000 1 8 44 44 999 444 22 666666666666 7777777777 77 22 3
consensus : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
Reference ( family-208 ) : TGGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118322 : TAGAACACAA-----AA-TCGAACTAGAAATTA---GGTCA-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----CG--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTACTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--TGATACA----ACTCAGA--AAA--T---TAAC---ATATGATTTT--CAATTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118323 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--G-CA-CTC-TTTGCTC-G-AA-TATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCTATC----CATC--GAATTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATATA----ACTCAGG--AAA--T---TTAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GGAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTT
gi|118324 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------AAATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTGTTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTC---------------------TACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-TTTTTT
gi|118325 : TAGAACACCG-----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACTTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-CTC-TTCGTCC-G-AATTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGAT
gi|118326 : TAGAACACAG-----TG-TCAAACTAGAAATTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACATG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-TTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-C-AT-----C-----T--G-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATA
gi|118328 : TGGAACA---------G-TAGAACTAGAAATTA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TT
gi|118329 : TGGAACA---------G-TCCAACTAGAAATTA---GGTCC-TG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TTCAGTC-A-AAcggttgaa
gi|118330 : TGGAACACCATATATAGCTTGAAC---AACTTATCTGGTCCCAA-CCAAAATTCC-TATTT----------TGATG---C-A--T-A--T--------A-CA-ACCGTTAACTCAG-AACTATTTT-GTCCAGTCCTGTTAAGTTTGAAC----CATA--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--AT----TATAT-TT------T--A---TT----TA--T----TAC--T---T--CAATAGA----AATCTTC--AAATGT---TTAT---ATATG
gi|118332 : TGGAACA---------G-TCAAACTAGAAATTA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ATCTG---T-G--T-T--T----
gi|118333 : TGGAACA---------G-TCGAACTAGAAATTA---GATCC-CA-CCAA----CA-CACTT----------TCCTG---T-ACTT-T--T----C---A-CA-Ct
gi|118334 : GAACACCG-----AG-TCAAACTAGAAGTTA---GGTCC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TG--A-CA-ATC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--G----CAT--T---C--CGATATA----TCT---GCCAAA--TA--TAAT---ATt
gi|118334 : aA----------TC--TGCCAAATATAATATTTTTCAACCATCTAC---ACT--TATGCAC-TTTTTTttttcaaccatctacacttatgcactttttt
gi|118336 : agaacaccgagtcaaactagaagttaggtccagccaacatatttacctgtattttgacaatcttcgttcgaactattttgttcagtcccgtcgggttcgatccatcgaagttctactgtattcatctttatatacttggaataagttctagcattccgatatG-----AG-TCAAACTAGAAATTA---GGTTC-AG-CCAA----CA-TATTT----------CCCTG---T-A--T-T--T----TT--A-CA-CTC-TTCGTTC-A-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCGGGTTCGATT----TATC--AAAGTTCTTCTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--TAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CAATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTTGCT-TC------------GAAAA----------TC--TGCCAAATATAATGTGTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-CTTTTT
gi|118337 : aG-----AG-TCGAACTAAAAATTA---GATAC-AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T----TT--A-TA-TTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTTGGGTTCGATC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----T-----A--A-T--A-----TATTC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----TAT--T---C--CTATACA----ACTCAGG--AAA--T---TAAT---ATATAATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATGTTTTACAACCATTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTT
gi|118338 : aG-----AG-TCGAACTTGAAATAA---GGTCC-TG-CCAA----CA-TATTT----------------------------------------A-CCT-GTAA------------TTT-----ACTCTCTTCG--TTCGAAC----TATTTTG----TCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--AGATACA----ATTCAGG--AAA--T---TGAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATATAATACTTCTCAACCAGTTACAAAAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118339 : aG-----AG-TCGAACTAGAAAGAA---GGTCC-AG-CTAA----CA-TATTT----------ACCTA---T-A--TGT--T----TT--A-CT-CTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCA------------TC--------CATC--GAAGTTCTTCTT--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TACAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----AAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAA--TCTATAAT---ATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGTCAAATAAAATGCTTTTCAACCAGTTACAAGAGT--TATGCAC-TTTTTT
gi|118340 : G-----AG-TCGAACTAGAAGTAA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TT
gi|118341 : -----AG-TCGAACTAGAAATTA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CATTT----------ACCTG---T-A--T-T--T-----GTCA-CA-CCT-TTCGGTC-G-AAcggtc
gi|118342 : -----AG-TCGAACTAGAAATAA---GGTCC-CG-CCAA----CA-CACTT----------ACCTG---T-GTTT-T--T----CG----CA-CCT-TTTGGTC-G-AA
gi|118343 : -----AG-TCAAACTAGAAATTA---AGTCC-CG-CCAA----CA-CACAA----------ACCTG---T-ATTT-T--T----C---A-CA-CCT-TTCGGTC-G-AA
gi|118344 : -TCGAAC---AAGTTATCTGGTCC-AGACCGGTT--CA-TATTTCGATGTATATACATGGTATGA--T-T--T----TG--AACAACCC-TTAACTC-G-AACTAACTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TA-----T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TA-AC-T
gi|118345 : TAGAAATTA---GGCCA-AG-CTAA----GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTC-TT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118346 : TAGAAATTA---GGCCA-AG-CTAA----GT-TATTA----------ACCTG---C-A--T-T--T----TT--A-CG-CTC-TT---------------------------CGTTGGGTTCGATC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--
gi|118347 : -AG-CCAA----CA-TATTT----------ACCTG---T-A--T-TGTT----TT--A-CA-CTC-TTCGTTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCG---------------------AGTTCTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-ATGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--ACA--T---TAATAATATATGATTTG--CACTTGCTGTC------------GAAGA----------TG--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TACGCAC-
gi|118348 : AA----CAATATTTG---------ACTTG-------------------A--A-CAACCC-TTAACTT-G-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGA----CATT--GAAGTTCTACTG--T--A-A------A-CTAT-----C-----T--T-T--A-----
gi|118350 : A-TGTTT----------AACCA---T-A--C-T--TGGCTCG--AACA-ACC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T----------AT-----T-----T--CGT--A-----TATA
gi|118354 : -CCT-TTAACTC-G-AACAATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CACC--CAAGTTCTACTG--T--AGT------T-C-A
gi|118355 : tattttgcccgaaaaac--T----CG--AACA-ATC-TTTAGTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGCGC----CATC--GAAAATCTACTG--T--A-T------
gi|118356 : tactttgcA-CCC-TTAAGTC-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGCCGGGTTTGAGT----CATC--GTAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AC-----A-----T--T-T--A-----
gi|118357 : tttgactcgaaca-T--T----GG--A-CAACCC-TTGAATT-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATCAGATTTGAGC----CATT--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118359 : --A-CA-ATC-CTAACTC-G-AATTATTTT-GTTTAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CGTT--GAAGTTGTACTG--T--A-T------
gi|118360 : --A-CATCCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCAAAT----TATC--AAAGTTCTACTT--T--A-T------T-T-GT-----A-----T--A-T--A-----TA
gi|118363 : A-CAC-TTAGCTC-G-AACTTTTGT-GTCCAGTCCTGCCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGGTCTACTG--T--A-T------
gi|118364 : A-CCC-TTAGCTC-G-AACTATTGT-GTCGAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118365 : A-CCC-TTAGCTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118366 : A-CCC-TTTGCTC-G-AACTATTTT-GGTCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTC--T--A-
gi|118367 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCGAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118369 : A-CCC-TTCAGTT-G-AACTATTTT-GTCCAGCCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118370 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118371 : A-CCC-TTACCTC-G-AATTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118372 : A-CTC-TTAATTC-G-AAATGTTTT-TTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--GAAATTCTACTG--T--A-C------T-
gi|118373 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCTAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-G------T-T-A-----------------T--A-----TATAT-T
gi|118374 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118375 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GCCCAGTCCCGTCGGGTTCGAAC----CATC--GAAGTTTTACTG--T--
gi|118376 : A-CCC-TTAAATC-G-AACTAGTTT-GCCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATA---T-A-AT-----A-----A--T-T--A-----TATAT-ATGC--AA---AAGT
gi|118377 : A-CCC-TTAAGTC-G-AACAATTTT-GTACAGTCCTGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTATTG--T--A-T------T-
gi|118378 : A-CTC-TTTACTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----AA-C--GAAGTTCTACTG--T--A-T------A-T-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118379 : A-CCC-TTAGCGT-G-AACTATTTT-GTTCAGTCCCGTCAGGTTCAAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T----------AT-----A-----A--T-T--A-----TACA
gi|118380 : A-CCC-TTAACTG-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGATC----TATC--GAAGTACTACTG--T--A-T------A-C-CC-----T-----T--T-T--AGAGGTTATTCATTGG--AA
gi|118381 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTTGGGTTCGTGC----CATC--GCAGTTCAACTG--T--A-
gi|118382 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-ATGAAGTCCCGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118383 : A-CCC-TTCACTC-G-AACTATATT-GGCCAATCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACAG--T--A-TTGTTGAT-C-AT-----T-----T--T-C--A-----T-TAC-T
gi|118384 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCGCTAGTG--T--A-T------T---AT-----A-----T--T-T--
gi|118385 : A-CCC-TTAAATC-G-AACTATTTT-GTCCAGTGTCATTGGGTTTGAGC----CATC--GAGGTTCTACTG--T--A-TA-----T-T-GT-----C-----T--T-
gi|118386 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATCGGGATCGAGC----CACG--AAAGTTCTACTG--T--A-------------------------T--T-T--G-----GATAT-TTGC--ACT--CACTTC----GT--T----TAT--T---CAACGATATA----ACTTA
gi|118387 : A-CCC-TTAGCTC-G-TACTATTTT-GTTCAGTCTCTTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTTTACTG--C--A-G------T-C--T-----CGTAGTT--C-T--AAT---TATAA-TTG----AC--AATTAC----TA-------CATA-T---T--CGTTACA----
gi|118388 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-ATTCAATCCCGTCGGTTTCGATC----TATC--GAACTTTTATTG--T--A-T----------AT-----T-----TA-T-T--A-----TA
gi|118389 : C-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCTGTCCCATCGGGTGCGAGT----CATT--GAAATTCTACTG--T--A-T------T-T-TT-----C-----T--T-TCAG-----TATAT-TT
gi|118390 : attA-CCC-TTAATTC-G-AATTATTTT--CCCTGTCCCGTCGGGCTCAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-TATC---T-T-AT-----------T--T-T--G-----TATA
gi|118391 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCTGGTTCAAGC----AATA--AAAGTTCTACTG--T--A-T-----------------------T--T-T--A-----TATA---TGC--AAC--AA---------A--T----CA------------A-ACA----AT-------ATA--T---TAAT---ATAT--TTTGGACATTTG-TAT--------------AAGG----------TCATTGTTAAA-A-AATGTT
gi|118392 : A-CCC-TTGGCTC-A-AACTGTTTT-GTTGAGTCCTGCTGGGTTCAAGC----CATC--CAAGTTCTACTG--T--G-T------
gi|118393 : -TTGACTC-A-AACTATTTT-GTCCAGTCCGGTCGAGTTCGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118394 : actgA-CAC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCAAATCCCGTCGGGTTCGTGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118395 : A-CTC-TTAACTC-A-AACTAACTT-ATTCAGTCCCATTGGGCTCGAGC----CATC--GAAATTCTGCTG--T--A-C------T-
gi|118396 : A-CGC-TTAACTC-GGAACTGTTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTACAAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------A-C-AT-----C-----TTGT-T--A-----TAT
gi|118397 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCCATTCCTGTTGGAGTCGAAC----TGTC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118398 : A-CCC-TTAACTC-A-AACTATTT--GTCCAGTCCTGTTGGATTCGAGC----CATT--GACGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118399 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-GTCTCGTCCCATCGAGTTCAAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118400 : -CCT-TTAAC-C-G-AACTATTTT-GTCGAGCCCCATCGTGTTCGAGC----CACC--GAAGTTCTA----------------------------T-----T--T-T--A-----T--------G--ATT--AATTTC----TA--TCTACCAT--G---C--CGATA-A----ACT-----------T---TAA--------AGTTTA--CTCTCCTTGTC------------AAAGATGACCAAAACTC--TGCTAAATAGGGTACTTTTCAACAATATGCA
gi|118401 : acA-CCC-TTAACTC-G-AACTAATTT-GTCCAGTCCCATTGGGTTTGAGC----CTTT--GAAGTTCTTCTG--T--A-TA-----T-G-A--------------------A-----AATAT-T--A--AAC--AAGCTCCAATTA--T----TATTAT---C--TGAAACATTGTATTTAAA--AAG--T---TAAT---A
gi|118402 : A-CTT-TTAACTC-A-AACTAATTT-GTCCTGTCCCGTCGGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118403 : A-CCC-TTGGCTT-G-AACTGTTTT-GACAAGTCTCGTCGGGTTTGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118404 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATTTT-TCCTAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGCTCTACTA--TA-A-T------G-C-AC-----G-----T--T-T--A------ATAT-TCG
gi|118405 : A-CCC-TTAACTC-G-AACTATATT-GTCCGGACCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTATACTG--T--A-TAA----T-C-ATTGACCC-----A--T-T--A------ATGC-C-----AAT--AAGCTA----TA--T-----AT--G---C--CAAAATA----A
gi|118422 : CT-TCAACTT-G-AACTATTTTTGTTCAGTCCCGTTGGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------TAT-ATTC---C-----A--T-T--A-----TACAT-T
gi|118423 : C-TTAACTC-G-AACTATTGT-GTTAAGTCCCGTCGGGTTCGAGCTATTCATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118424 : C-TTAACTC-G-AAGTATTTT-ATCCAGTCCAGTCGGGTTCGAAT----CATC--GAAGTTCTACTA--TTAA-T------TAA-AT-----C-----T--T-A--A-----T
gi|118425 : -TTGGCTT-G-AACTATTTT-GTGCAGTCCCGCCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTGATT--G-T------T----T-----C-----T--T-T--A--------AT-TT-----AT--AAATTC----TA--CG---CAT--T---C--C
gi|118428 : CTC-G-AACTATTCT-GATAAGTCCCATTGGGTTCCAGC----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118429 : gTC-G-AACTGTTTT-GTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118430 : tTC-G-AACTATTGT-GTCCAGTCCTATTTGATTCGAGT----CATC--AAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118435 : tTC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGACC----AATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-AT-----A-----T--T-
gi|118436 : TC-G-AACTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGATTCGAGC----CATC--GGAGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118438 : TC-G-AATTATTTT-GTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGC----TATC--GAAGTTCTACTG--A--A----------C-AT-----T-----A--T-A--A-----CATAA--TGATCAATGCAAGTAC----TGTTT----TAT--T---C--C--TACA----TCTC
gi|118439 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCTCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCAACTG--TA-A-T------T-T-AT-----C-----C--T-
gi|118441 : TC-G-AACTATTTA-GTCCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----CATC--AAAGTTCTAATG--TA-A-T------T-A-AT-----A-----T--A-T--A-----TATA
gi|118443 : TC-G-AACTAGTTT-GTCCAGTCCGGTCAGGTTCGAGC----CATC--GAGGTTTTACTG--T--A-T------
gi|118444 : TC-A-AACTATTGT-GTCCAATCCCGTCAGGTACAAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------T-T-A
gi|118445 : TC-G-AACTACTTT-GTCTACTCCCGTCGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTACCACTG--T--A-T------T-T-AA-----A-----T--T-T--G-----TG-AC-GTG----------GTTC----GT--T----CAT--TAAAC--AGATATA----A
gi|118463 : C-A-AACTATTTT-GTCTGGTTCCATTGGGTTCGAGC----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118464 : C-A-AAGTATTTT-GTACAGTCCCATCAGGTTCGAGC----CATC--AGAGTTCTACTG--T--A-T------T-
gi|118465 : C-G-AACTATTAT-TTCCAGTCCTGTCGGGTTCGAGT----CATC--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118467 : -G-AAGTATTTT-GTCCAGTCCCGTCAAGTTTGAGC----GATC--GAAGTTCTACTG--T--A-
gi|118473 : TATTTT-GTCCAGTCCCAGCAGGTTCGAGC----CATT--GAAGTTCTACTG--C--A-T------T-T-AT-----
gi|118477 : ATTTT-GTTCAGTCCCGTCGAGTTCGAGC----GATT--GAAGTTCTACTG--T--A-T------
gi|118478 : TTTT-GTCCAGTCCCGTAGTGTTCGATC----CATC--AAAGTTCTGCTG--T--A-
gi|118479 : TTTT-GTCCAGTCCCGTCGTGTTCGAGC----CATC--AAAGTTTTACTG--T--A-T------T-
gi|118483 : CTACTG--T--A-T------T-C-AT-----C-----T--T-T--A-----TATAC-TTGG--AAT--AAGTTC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAAG--AAA--T---TAAT---ATATGATTTG--CACTCGCTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGT--TATGCATATTTTTT
gi|118484 : -----T--T-C--A-----TATGC-TTGG--AAT--AAGTCC----TA--T----CAT--T---C--CGATACA----ACTCAGG--AAG--T---TATT---ATATGATTTG--CACTTGGTGTC------------GAAGA----------TC--TGCTAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAGAGTAATATGC
gi|118486 : TTC----TA--T----CTT--A---C--CTATAAA----AATGGTG--AAA--A---TAAA---ACATGTTTCA--TATTTTCTGTCATACGTGACTACGAAAA----------T----GCCAAATATAATGGCTGTCAATCATTTACAAGAGT--TATGCCC-CTTT
gi|118488 : GTTGTC------------GAAGA----------TC--TGCCAAATATAATGTTTTTCAACCATTTACAAATGA--TATGCAC-TTTTTT