lowQualScore : 11111 111 1 5 0 0000 0 4444 00 000
lowQualScore : ..... ... . . . .... . .... .. ...
lowQualScore : 00000 444 5 1 4 8888 4 5555 55 777
consensus : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
Reference ( gi|31771 ) : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31707 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31705 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTA---TATA
gi|31703 : gTGGTTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31680 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31669 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CA----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31677 : gaatgTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAAGTTTGACTG---TAT
gi|31670 : aggTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AGTAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTG---TACA
gi|31728 : gaatgTGGCTGCTTAAGACAAGTT-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31706 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----TTC-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31691 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-TG----CTT-G---TA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31716 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCAGCTT---AATAG-AGGTGAC-TG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31679 : gTGGCTACTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTA---TAT
gi|31700 : aaaTGGCTACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAAGTTTGACTG---TAT
gi|31709 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTC---AATAG-AGGTGGC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31710 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-TG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31645 : gTGGCTGCTTAAGATAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31773 : attttgaaatagcaaatgTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AAGTGAC-CG----CTT-A---TA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31694 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-TG----CAT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31779 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--AAGGTTTGACTG---TATA
gi|31715 : TGGCTGCTTAAGACAAGTA-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31714 : gTGACTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTA---TATA
gi|31692 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CG----CTT-A---AA--CAGGTTTGACTG---TACA
gi|31727 : gTGGCTGCTTAAGACAAGGG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-AG----CTT-A---AA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31676 : gTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCCGCTT---AATAG-AGGTGGC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31708 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGAC-CG----CTT-G---CA--CAGGTTTGACTG---CA
gi|31784 : gTGGCCACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31734 : TGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-TG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31733 : gTGGCTGCATAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-AG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31664 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CGACCACTT-A---AA--CAGGTCTGACTG---TATA
gi|31704 : tgaatgTGGCTGCTTAAGACAAATG-----ACTGCTT---TATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31689 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---AA--CAAGTTTGACTG---TACA
gi|31696 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGTC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31783 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTGAACTGGCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31770 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTTACTG---TATA
gi|31782 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31775 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGAC-CG----CTT-G---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31698 : TGGCTGCTTAATACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TACA
gi|31723 : gTAGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGC-TG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31713 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---TATAG-AGGTGGC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGATTG---TATA
gi|31789 : gTGGCTGCTTAACACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-TG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTA---TA
gi|31718 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGCGAC-CA----CAT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31720 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CAT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31681 : gTGGCTGCTTAAGGCAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTAACTA---TACA
gi|31778 : aagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGGC-CA----CTT-G---CA--CAGATTTGACTG---TATA
gi|31725 : TGGCTGGTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TACA
gi|31726 : gTGGCTGCTTATGACAAGTG-----GCTGCTC---AAAAG-AGGTGAC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31780 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGATGAC-CG----CTT-A---CA--CAAGTTTGACTGGCTTATA
gi|31693 : TGGTTGCTTAAGACAGATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTAGACTG---TAT
gi|31772 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGAGAC-CG----CTA-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31721 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTCGC-CA----CTT-G---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31769 : gTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGAC-TG----CTA-A---TA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31774 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGAC-CT----CTT-A---CA--CAGATTTGACTG---TAT
gi|31697 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AAAAG-AGGTGGC-CA----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31785 : gTGGCCACTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGAC-AG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31678 : TGGTTGCTTAATACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-TG----CTT-A---CA--CAGGTTTGATTG---TATA
gi|31788 : aaaTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-TG----CTT-G---AA--CAGGTTTGATTG---TA
gi|31712 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AATAG-AGGTAAC-CA----CTA-A---GG--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31701 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ACTAG-AGGTGAG-TG----CTT-A---AA--CAGGTTTGACTA---TATA
gi|31786 : gTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGATGAC-CC----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31790 : TGGCTGCTTAAAACAGGTA-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CC--CAGGTTGGACTG---TACA
gi|31732 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CC----CTT-A---CA--CAGGTTTGACCG---TGTA
gi|31776 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGAC-CT----CTT-A---CA--CAGGTTAGACTG---TA
gi|31730 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGAT-TG----CTT-A---CA--CAGGTTCGACTG---TATA
gi|31729 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGAT-TG----CTT-A---CA--CAGGTTCGACTG---TATA
gi|31690 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----AATGCTT---AATAA-AGGTGGC-CG----CTA-A---CA--CAGATTTGACTG---TATA
gi|31735 : gTGACCGCTTAAAACAAGTG-----ATTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---TA--CATATTTGACTG---TAT
gi|31736 : gTGGCTGCTTCAAACGAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTG-G---CA--CAGGTGTGACTG---TATA
gi|31731 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGAC-CA----ATA-A---CA--CAGGTTTGAATG---TA
gi|31695 : gTAGCTGCTTAACACAAGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGC-CA----CAT-A---CA--CAGGTTTGATTG---TAT
gi|31671 : gTGGTTTCTTAAGACAGGTG-----GCTGCCT---AAAAG-AGGTGAC-TG----CTA-A---CA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31650 : gaagataTGGCCGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31652 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31651 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31722 : tctgaaacTGGCTGCTTAAGACAGGTA-----GCTGCTT---AATAT-TGGTGGC-TG----CTT-A---CA--CAAGTTAGACTG---TA
gi|31654 : gTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TGTA
gi|31655 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--TAGGTTTGACTG---TATA
gi|31653 : tctgaaacTGACCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31663 : tctgaagcTGGC-GCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31711 : tgaaacTGGCTGCTTAAGACATGTG-----TCTGCTT---GCACG-AGGTGAC-TG----CTA-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31666 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----C
gi|31662 : tgaatgTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGAC-TG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31656 : tgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTAAC-CG----TTA-G---TA--CAGGTTTGACTG---TA
gi|31649 : tctgaaacTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGC-CG----CAA-G---GA--CAGGTTAGACTG---TATA
gi|31646 : tttgaagTGGCTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---TTTAG-AGGTGAT-CA----C---------------TTTGACTG---TATA
gi|31644 : attgtgaaagTGGCCGTTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGC-CG----C---AAGGAA--CAGGTTAGACTG---TATA
gi|31640 : actttaaagTGACTGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGC-CG----CAA-G---GA--CAAGTTAGACTG---TACA
gi|31641 : attttgaagTGGCCACTTAACACAGGTG-----ACCACTT---ATAAG-AGGTGAC-CG----CAA-G---GA--CAAGTTAGACTG---TACA
gi|31668 : attttgaagTGGCCGCTTAACAAAGGGG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGAA-CA----CAT-G---GA--CAAGTTAGACTG---TATA
gi|31643 : gaagTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCACTT---A-TA--AGGTGTC-CG----CAA-A---GA--TAAGTTAGACTG---TATA
gi|31658 : atttagtagTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGT-CG----CTA-C---TG--CAAGTTTGACTG---TATA
gi|31659 : tttaatgTGGTCGCTTACATCAGGAG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGT-CG----CTA-C---TG--CAAGTTTGACTG---TAT
gi|31660 : tttaacgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGT-CG----CTA-C---TG--CAAGTTTGACTG---TA
gi|31811 : tttaatgGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---GACAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TATA
gi|31810 : GACCGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGAC-CG----CTT-A---CA--CAGGTTTGACTG---TAT
gi|31642 : GGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGC-CT----CAA-G---GA--CAGGTTAGACTG---TAT
gi|31648 : attttgaagaTGTTTAACACAAGAG-----TTTGCTC---A-TAGGAGGTGAC-CG------T-A---TGCTCAAGTTAGACTG---TA
gi|31665 : ttttaaaaAAATG-----GCC-CTT---AATGG-AGG-GACACG----CTT-AT--TA--CAGGT
gi|31647 : taAAGTG-----ACTGTTT---AATAC-AGGTGAC-CA----ATC-A---TA--gcccgttagtacaagtttgactgtat
gi|31657 : ttttgAAGTG-----GCCATTT---A-CAC-AGGTGAC-CG----CTC-A---TA--agagcagaccgcatgcatgagtt
gi|31666 : tttgGTG-----GCTGCTT---AAGAC-AAGTGAC-TG----CTTAA---TA--GAGG--TGACCG---agaggtg
gi|31665 : tgaatGCTT---ATTAC-AGGTGCC-CG----TTA-G---TA--CAAGTTTGACTG---TATc
Alignments
lowQualScore : 11111 111 1 5 0000 000 1 000
lowQualScore : ..... ... . . .... ... . ...
lowQualScore : 00000 444 6 2 9999 777 2 777
consensus : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
Reference ( family-204 ) : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31640 : TGACTGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----CAAG---G-ACAAGTTAGACTG---TACA
gi|31641 : attttgaagTGGCCACTTAACACAGGTG-----ACCACTT---ATAAG-AGGTGACCG----CAAG---G-ACAAGTTAGACTG---TACA
gi|31642 : attttgaagGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGCCT----CAAG---G-ACAGGTTAGACTG---TAT
gi|31643 : attttgaagaTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCACTT---A-TA--AGGTGTCCG----CAAA---G-ATAAGTTAGACTG---TATA
gi|31644 : atttagtagTGGCCGTTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----C--AAGGA-ACAGGTTAGACTG---TATA
gi|31645 : actttaaagTGGCTGCTTAAGATAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31646 : attttgaaatagcaaatgTGGCTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---TTTAG-AGGTGATCA----C-------------TTTGACTG---TATA
gi|31647 : attgtgaaagAAGTG-----ACTGTTT---AATAC-AGGTGACC
gi|31648 : ttttgTGTTTAACACAAGAG-----TTTGCTC---A-TAGGAGGTGACCG----TATG---C-TCAAGTTAGACTG---TAaatcataagagcagaccgcatgcatgagtt
gi|31649 : ttttaaaaTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----CAAG---G-ACAGGTTAGACTG---TATA
gi|31650 : tttgaagTGGCCGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31651 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31652 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31653 : tctgaaacTGACCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31654 : tctgaagcTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TGTA
gi|31655 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ATAGGTTTGACTG---TATA
gi|31656 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTAACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31657 : tctgaaacAAGTG-----GCCATTT---A-CAC-AGGTGACCG----CTCA---T-
gi|31658 : tttgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TATAagaggtg
gi|31659 : tttaatgTGGTCGCTTACATCAGGAG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TAT
gi|31660 : tttaacgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TA
gi|31662 : tttaatgTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACTG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31663 : tgaaacTGGC-GCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31664 : tgaaacTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCGACCACTTA---A-ACAGGTCTGACTG---TATA
gi|31665 : tgaatgGCTT---ATTAC-AGGTGCCCG----TTAG---T-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31666 : taaaatggcccttaatggagggacacTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----C
gi|31668 : tgaatgTGGCCGCTTAACAAAGGGG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGAACA----CATG---G-ACAAGTTAGACTG---TATA
gi|31669 : gaagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31670 : gaatgTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AGTAG-AGGTGACCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31671 : gaatgTGGTTTCTTAAGACAGGTG-----GCTGCCT---AAAAG-AGGTGACTG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31676 : gaagataTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCCGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31677 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31678 : aggTGGTTGCTTAATACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGATTG---TATA
gi|31679 : aaaTGGCTACTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTA---TAT
gi|31680 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31681 : aaaTGGCTGCTTAAGGCAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTAACTA---TACA
gi|31689 : aagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCG----CTTA---A-ACAAGTTTGACTG---TACA
gi|31690 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----AATGCTT---AATAA-AGGTGGCCG----CTAA---C-ACAGATTTGACTG---TATA
gi|31691 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31692 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31693 : gTGGTTGCTTAAGACAGATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTAGACTG---TAT
gi|31694 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31695 : gTAGCTGCTTAACACAAGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCA----CATA---C-ACAGGTTTGATTG---TAT
gi|31696 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGTCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31697 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AAAAG-AGGTGGCCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31698 : gTGGCTGCTTAATACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31700 : gTGGCTACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31701 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ACTAG-AGGTGAGTG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31703 : gTGGTTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31704 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----ACTGCTT---TATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31705 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31706 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----TTCA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31707 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31708 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGACCG----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---CA
gi|31709 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTC---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31710 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31711 : gTGGCTGCTTAAGACATGTG-----TCTGCTT---GCACG-AGGTGACTG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31712 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AATAG-AGGTAACCA----CTAA---G-GCAGGTTTGACTG---TATA
gi|31713 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---TATAG-AGGTGGCCA----CTTA---C-ACAGGTTTGATTG---TATA
gi|31714 : gTGACTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31715 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTA-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31716 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCAGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31718 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGCGACCA----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31720 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31721 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTCGCCA----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31722 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTA-----GCTGCTT---AATAT-TGGTGGCTG----CTTA---C-ACAAGTTAGACTG---TA
gi|31723 : gTAGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31725 : gTGGCTGGTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31726 : gTGGCTGCTTATGACAAGTG-----GCTGCTC---AAAAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31727 : gTGGCTGCTTAAGACAAGGG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACAG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31728 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTT-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31729 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGATTG----CTTA---C-ACAGGTTCGACTG---TATA
gi|31730 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGATTG----CTTA---C-ACAGGTTCGACTG---TATA
gi|31731 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCA----ATAA---C-ACAGGTTTGAATG---TA
gi|31732 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCC----CTTA---C-ACAGGTTTGACCG---TGTA
gi|31733 : gTGGCTGCATAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCAG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31734 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31735 : gTGACCGCTTAAAACAAGTG-----ATTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACATATTTGACTG---TAT
gi|31736 : gTGGCTGCTTCAAACGAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTGG---C-ACAGGTGTGACTG---TATA
gi|31769 : gTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTAA---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31770 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTTACTG---TATA
gi|31771 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31772 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGAGACCG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31773 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AAGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31774 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCT----CTTA---C-ACAGATTTGACTG---TAT
gi|31775 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGACCG----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31776 : TGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCT----CTTA---C-ACAGGTTAGACTG---TA
gi|31778 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGGCCA----CTTG---C-ACAGATTTGACTG---TATA
gi|31779 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-AAAGGTTTGACTG---TATA
gi|31780 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGATGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTGGCTTATA
gi|31782 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31783 : TGGCTGCTTAAGACAAGTGAACTGGCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31784 : TGGCCACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31785 : TGGCCACTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGACAG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31786 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGATGACCC----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31788 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTG---A-ACAGGTTTGATTG---TA
gi|31789 : TGGCTGCTTAACACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTA---TA
gi|31790 : TGGCTGCTTAAAACAGGTA-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-CCAGGTTGGACTG---TACA
gi|31810 : GACCGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31811 : GGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---GACAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
Alignments
lowQualScore : 11111 111 1 5 0000 000 1 000
lowQualScore : ..... ... . . .... ... . ...
lowQualScore : 00000 444 6 2 9999 777 2 777
consensus : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
Reference ( family-204 ) : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31640 : TGACTGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----CAAG---G-ACAAGTTAGACTG---TACA
gi|31641 : attttgaagTGGCCACTTAACACAGGTG-----ACCACTT---ATAAG-AGGTGACCG----CAAG---G-ACAAGTTAGACTG---TACA
gi|31642 : attttgaagGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGCCT----CAAG---G-ACAGGTTAGACTG---TAT
gi|31643 : attttgaagaTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCACTT---A-TA--AGGTGTCCG----CAAA---G-ATAAGTTAGACTG---TATA
gi|31644 : atttagtagTGGCCGTTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----C--AAGGA-ACAGGTTAGACTG---TATA
gi|31645 : actttaaagTGGCTGCTTAAGATAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31646 : attttgaaatagcaaatgTGGCTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---TTTAG-AGGTGATCA----C-------------TTTGACTG---TATA
gi|31647 : attgtgaaagAAGTG-----ACTGTTT---AATAC-AGGTGACC
gi|31648 : ttttgTGTTTAACACAAGAG-----TTTGCTC---A-TAGGAGGTGACCG----TATG---C-TCAAGTTAGACTG---TAaatcataagagcagaccgcatgcatgagtt
gi|31649 : ttttaaaaTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----CAAG---G-ACAGGTTAGACTG---TATA
gi|31650 : tttgaagTGGCCGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31651 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31652 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31653 : tctgaaacTGACCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31654 : tctgaagcTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TGTA
gi|31655 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ATAGGTTTGACTG---TATA
gi|31656 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTAACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31657 : tctgaaacAAGTG-----GCCATTT---A-CAC-AGGTGACCG----CTCA---T-
gi|31658 : tttgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TATAagaggtg
gi|31659 : tttaatgTGGTCGCTTACATCAGGAG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TAT
gi|31660 : tttaacgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TA
gi|31662 : tttaatgTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACTG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31663 : tgaaacTGGC-GCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31664 : tgaaacTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCGACCACTTA---A-ACAGGTCTGACTG---TATA
gi|31665 : tgaatgGCTT---ATTAC-AGGTGCCCG----TTAG---T-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31666 : taaaatggcccttaatggagggacacTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----C
gi|31668 : tgaatgTGGCCGCTTAACAAAGGGG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGAACA----CATG---G-ACAAGTTAGACTG---TATA
gi|31669 : gaagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31670 : gaatgTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AGTAG-AGGTGACCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31671 : gaatgTGGTTTCTTAAGACAGGTG-----GCTGCCT---AAAAG-AGGTGACTG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31676 : gaagataTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCCGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31677 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31678 : aggTGGTTGCTTAATACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGATTG---TATA
gi|31679 : aaaTGGCTACTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTA---TAT
gi|31680 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31681 : aaaTGGCTGCTTAAGGCAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTAACTA---TACA
gi|31689 : aagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCG----CTTA---A-ACAAGTTTGACTG---TACA
gi|31690 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----AATGCTT---AATAA-AGGTGGCCG----CTAA---C-ACAGATTTGACTG---TATA
gi|31691 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31692 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31693 : gTGGTTGCTTAAGACAGATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTAGACTG---TAT
gi|31694 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31695 : gTAGCTGCTTAACACAAGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCA----CATA---C-ACAGGTTTGATTG---TAT
gi|31696 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGTCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31697 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AAAAG-AGGTGGCCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31698 : gTGGCTGCTTAATACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31700 : gTGGCTACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31701 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ACTAG-AGGTGAGTG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31703 : gTGGTTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31704 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----ACTGCTT---TATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31705 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31706 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----TTCA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31707 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31708 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGACCG----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---CA
gi|31709 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTC---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31710 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31711 : gTGGCTGCTTAAGACATGTG-----TCTGCTT---GCACG-AGGTGACTG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31712 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AATAG-AGGTAACCA----CTAA---G-GCAGGTTTGACTG---TATA
gi|31713 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---TATAG-AGGTGGCCA----CTTA---C-ACAGGTTTGATTG---TATA
gi|31714 : gTGACTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31715 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTA-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31716 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCAGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31718 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGCGACCA----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31720 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31721 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTCGCCA----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31722 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTA-----GCTGCTT---AATAT-TGGTGGCTG----CTTA---C-ACAAGTTAGACTG---TA
gi|31723 : gTAGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31725 : gTGGCTGGTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31726 : gTGGCTGCTTATGACAAGTG-----GCTGCTC---AAAAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31727 : gTGGCTGCTTAAGACAAGGG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACAG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31728 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTT-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31729 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGATTG----CTTA---C-ACAGGTTCGACTG---TATA
gi|31730 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGATTG----CTTA---C-ACAGGTTCGACTG---TATA
gi|31731 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCA----ATAA---C-ACAGGTTTGAATG---TA
gi|31732 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCC----CTTA---C-ACAGGTTTGACCG---TGTA
gi|31733 : gTGGCTGCATAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCAG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31734 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31735 : gTGACCGCTTAAAACAAGTG-----ATTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACATATTTGACTG---TAT
gi|31736 : gTGGCTGCTTCAAACGAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTGG---C-ACAGGTGTGACTG---TATA
gi|31769 : gTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTAA---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31770 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTTACTG---TATA
gi|31771 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31772 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGAGACCG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31773 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AAGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31774 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCT----CTTA---C-ACAGATTTGACTG---TAT
gi|31775 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGACCG----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31776 : TGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCT----CTTA---C-ACAGGTTAGACTG---TA
gi|31778 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGGCCA----CTTG---C-ACAGATTTGACTG---TATA
gi|31779 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-AAAGGTTTGACTG---TATA
gi|31780 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGATGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTGGCTTATA
gi|31782 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31783 : TGGCTGCTTAAGACAAGTGAACTGGCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31784 : TGGCCACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31785 : TGGCCACTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGACAG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31786 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGATGACCC----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31788 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTG---A-ACAGGTTTGATTG---TA
gi|31789 : TGGCTGCTTAACACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTA---TA
gi|31790 : TGGCTGCTTAAAACAGGTA-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-CCAGGTTGGACTG---TACA
gi|31810 : GACCGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31811 : GGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---GACAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
blockSeqs : AACTG TAT T G T
blockSeqs : . TAT T C T
blockSeqs : . . T C T
blockSeqs : . . A C .
blockSeqs : . . T C .
blockSeqs : . . A C .
blockSeqs : . . T C .
blockSeqs : . . A C .
blockSeqs : . . T C .
blockSeqs : . . A C .
blockSeqs : . . T C .
blockSeqs : . . A C .
blockSeqs : . . G C .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
finalCons : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
Alignments
lowQualScore : 11111 111 1 5 0000 000 1 000
lowQualScore : ..... ... . . .... ... . ...
lowQualScore : 00000 444 6 2 9999 777 2 777
consensus : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
Reference ( family-204 ) : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31640 : TGACTGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----CAAG---G-ACAAGTTAGACTG---TACA
gi|31641 : attttgaagTGGCCACTTAACACAGGTG-----ACCACTT---ATAAG-AGGTGACCG----CAAG---G-ACAAGTTAGACTG---TACA
gi|31642 : attttgaagGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCGCTT---ATAAG-AGGTGGCCT----CAAG---G-ACAGGTTAGACTG---TAT
gi|31643 : attttgaagaTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACCACTT---A-TA--AGGTGTCCG----CAAA---G-ATAAGTTAGACTG---TATA
gi|31644 : atttagtagTGGCCGTTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----C--AAGGA-ACAGGTTAGACTG---TATA
gi|31645 : actttaaagTGGCTGCTTAAGATAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31646 : attttgaaatagcaaatgTGGCTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---TTTAG-AGGTGATCA----C-------------TTTGACTG---TATA
gi|31647 : attgtgaaagAAGTG-----ACTGTTT---AATAC-AGGTGACC
gi|31648 : ttttgTGTTTAACACAAGAG-----TTTGCTC---A-TAGGAGGTGACCG----TATG---C-TCAAGTTAGACTG---TAaatcataagagcagaccgcatgcatgagtt
gi|31649 : ttttaaaaTGGCCGCTTAACACAGGTG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGGCCG----CAAG---G-ACAGGTTAGACTG---TATA
gi|31650 : tttgaagTGGCCGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31651 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31652 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31653 : tctgaaacTGACCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31654 : tctgaagcTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TGTA
gi|31655 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ATAGGTTTGACTG---TATA
gi|31656 : tctgaaacTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTAACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31657 : tctgaaacAAGTG-----GCCATTT---A-CAC-AGGTGACCG----CTCA---T-
gi|31658 : tttgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TATAagaggtg
gi|31659 : tttaatgTGGTCGCTTACATCAGGAG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TAT
gi|31660 : tttaacgTGGTCGCTTACATCAGGGG-----GTCGCTT---A-TAACAAGTGGTCG----CT-A---CTGCAAGTTTGACTG---TA
gi|31662 : tttaatgTGGCCGCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACTG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31663 : tgaaacTGGC-GCTTAAGGCAGGTG-----GCTGCTT---A-TAACAGGTGACCG----TTAG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31664 : tgaaacTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCGACCACTTA---A-ACAGGTCTGACTG---TATA
gi|31665 : tgaatgGCTT---ATTAC-AGGTGCCCG----TTAG---T-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31666 : taaaatggcccttaatggagggacacTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----C
gi|31668 : tgaatgTGGCCGCTTAACAAAGGGG-----ACTGCTT---ATAAG-AGGTGAACA----CATG---G-ACAAGTTAGACTG---TATA
gi|31669 : gaagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31670 : gaatgTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AGTAG-AGGTGACCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31671 : gaatgTGGTTTCTTAAGACAGGTG-----GCTGCCT---AAAAG-AGGTGACTG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31676 : gaagataTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCCGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31677 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31678 : aggTGGTTGCTTAATACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGATTG---TATA
gi|31679 : aaaTGGCTACTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTA---TAT
gi|31680 : aaaTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31681 : aaaTGGCTGCTTAAGGCAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTAACTA---TACA
gi|31689 : aagTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCG----CTTA---A-ACAAGTTTGACTG---TACA
gi|31690 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----AATGCTT---AATAA-AGGTGGCCG----CTAA---C-ACAGATTTGACTG---TATA
gi|31691 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTG---T-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31692 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31693 : gTGGTTGCTTAAGACAGATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTAGACTG---TAT
gi|31694 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31695 : gTAGCTGCTTAACACAAGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCA----CATA---C-ACAGGTTTGATTG---TAT
gi|31696 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGTCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31697 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AAAAG-AGGTGGCCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31698 : gTGGCTGCTTAATACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31700 : gTGGCTACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTG---TAT
gi|31701 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ACTAG-AGGTGAGTG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31703 : gTGGTTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31704 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----ACTGCTT---TATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31705 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31706 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----TTCA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31707 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31708 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGACCG----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---CA
gi|31709 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTC---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31710 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31711 : gTGGCTGCTTAAGACATGTG-----TCTGCTT---GCACG-AGGTGACTG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31712 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTTCTT---AATAG-AGGTAACCA----CTAA---G-GCAGGTTTGACTG---TATA
gi|31713 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---TATAG-AGGTGGCCA----CTTA---C-ACAGGTTTGATTG---TATA
gi|31714 : gTGACTGCTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTA---TATA
gi|31715 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTA-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31716 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCAGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31718 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGCGACCA----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31720 : gTGACTGCTTAAGACAAGTG-----GTTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CATA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31721 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTCGCCA----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31722 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTA-----GCTGCTT---AATAT-TGGTGGCTG----CTTA---C-ACAAGTTAGACTG---TA
gi|31723 : gTAGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31725 : gTGGCTGGTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TACA
gi|31726 : gTGGCTGCTTATGACAAGTG-----GCTGCTC---AAAAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31727 : gTGGCTGCTTAAGACAAGGG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACAG----CTTA---A-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31728 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTT-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31729 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGATTG----CTTA---C-ACAGGTTCGACTG---TATA
gi|31730 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GTTGCTTTATAATAG-AGGTGATTG----CTTA---C-ACAGGTTCGACTG---TATA
gi|31731 : gTGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCA----ATAA---C-ACAGGTTTGAATG---TA
gi|31732 : gTGGCTGCTTAAGACAGGTG-----TCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCC----CTTA---C-ACAGGTTTGACCG---TGTA
gi|31733 : gTGGCTGCATAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCAG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31734 : gTGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGGCTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31735 : gTGACCGCTTAAAACAAGTG-----ATTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACATATTTGACTG---TAT
gi|31736 : gTGGCTGCTTCAAACGAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTGG---C-ACAGGTGTGACTG---TATA
gi|31769 : gTGGTTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTAA---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31770 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTTACTG---TATA
gi|31771 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31772 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGAGACCG----CTAA---C-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31773 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----ACTGCTT---AATAG-AAGTGACCG----CTTA---T-ACAGGTTTGACTG---TA
gi|31774 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCT----CTTA---C-ACAGATTTGACTG---TAT
gi|31775 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGACCG----CTTG---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31776 : TGGCTGCTTAAGACAAATG-----GCTGCTT---AAAAG-AGGTGACCT----CTTA---C-ACAGGTTAGACTG---TA
gi|31778 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGATGGCCA----CTTG---C-ACAGATTTGACTG---TATA
gi|31779 : TGGCTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCA----CTTA---C-AAAGGTTTGACTG---TATA
gi|31780 : TGGCTGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGATGACCG----CTTA---C-ACAAGTTTGACTGGCTTATA
gi|31782 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AACAG-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31783 : TGGCTGCTTAAGACAAGTGAACTGGCTGCTT---AATAG-AGGTGGCCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31784 : TGGCCACTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGACCA----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31785 : TGGCCACTTAATACAAGTG-----GCTGCTT---AATAA-AGGTGACAG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA
gi|31786 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---ATTAG-AGATGACCC----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31788 : TGGTTGCTTAAGACAGGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTG---A-ACAGGTTTGATTG---TA
gi|31789 : TGGCTGCTTAACACAAGTG-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACTG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTA---TA
gi|31790 : TGGCTGCTTAAAACAGGTA-----GCTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-CCAGGTTGGACTG---TACA
gi|31810 : GACCGCTTAAGACAAGTG-----ACTGCTT---AATAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TAT
gi|31811 : GGCTGCTTAAGACAAGTG-----GCTGCTT---GACAG-AGGTGACCG----CTTA---C-ACAGGTTTGACTG---TATA