lowQualScore : 1 111 11111111111111 11111111111 1111 1111111 11 11111
lowQualScore : 3 0 777 0 11 88888888888888 1 55 0 0 33333333333 1111 6 0 222 111 33 11 7777777 0 444 0 11 6 0 0 0 000 0 000 0 88888
lowQualScore : . . ... . .. .............. . .. . . ........... .... . . ... ... .. .. ....... . ... . .. . . . . ... . ... . .....
lowQualScore : 4 5 555 5 22 11111111111111 0 22 9 5 99999999999 4444 4 4 000 444 66 33 9999999 4 888 4 66 5 4 8 4 777 4 777 4 22222
consensus : TCTTTACATAATTA-T-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CT-T--GTCCGGAGCATAACT-C--GA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--NGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
Reference ( gi|71051 ) : TCTTTACATACTTA-T-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CT-A--GTCCGGAACATAGCT-C--AA---AAA-GT-GTT-T--A-TGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-C---TAGAGGACATT
gi|71023 : TCTTTACATAATTA-T-C-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-A--GTCCGGAACATAACT-A--AA---AAA-GT-GTT-C--T-TGGTAT-TT--AGGTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACAT
gi|71021 : tctgTCTTTACATAATTA-T-T-CAC-TT--T--GT-T--A--TT-G-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-A--GTTCGGAACTTAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---TT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71025 : tctaTCTTAACATAGTTA-T-T-CTC-TT--T--GC-T--A--TT-A-TA-TGT-T-A-TTATG---CT-A--GTCCGGAACATAACT-C--AA---AAA-GC-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---TC-A---AT-G-A---TAGAGGATATT
gi|71046 : tctgTCTTTACATAATTA-T-T-CCC-TT--T--GT-C--A--TT-A-TA-T-T-T-AATTATG---CT-A--GTCTGGAACATAACT-C--AA---CAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TC-C-A-C---AC-AATGAT-G-CATGTAGAGGACATT
gi|71027 : tgTCTTAACATAATTA-T-T-CTC-TT--T--GT-T-----TT-A-TA-T-T-TTA-TTAGG---CT-A--GTCCGGAACATGACT-A--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACA
gi|71028 : tctaTCTTTACAAAATTA-T-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-A--GTCCTAAACATAACT-C--AA---AAA-CT-GTT-A--A-ACGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---TT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71030 : tctgTCTTTATATAACTA-T-T-CCC-TT--T--AC-T--A--TT-A-TA-T-T-TCA-TTATG---CT-A--GCCTGGAATATAACT-C--AA---AGA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTGG-A-TAT-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71031 : tctgTCTTTACGTAATTA-T-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-GAAT-T-T-A-TCATA---CT-A--GTCTGGAACATAACT-C--AA---TAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---GC-A---AT-T-A---TAGAGGATATT
gi|71033 : tctgTCTTTACATAATTA-T-T-CCC-TC--T--GT-T--A--TC-A-TAAT-T-T-A-TTATG---CT-A--GTCTAGAACATAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-A---AC-A---AT-G-
gi|71053 : tctgTCTTTACATAATTA-T-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-ATTA-T-T-T-A-TTATG---CT-A--GTCC-AAACATAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAG-TT--AGTCG-A-TAT-TT-C-A-C---A---------------TAGAGGA
gi|71034 : TCTTTTCATAATTA-T-T-TC---T--T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-A--GTCCAGAACA--ACT-C--AA---AAA-GT-GTT-A--A--GGGAT-TT--AGTTG-A-AAT-TT-C-A-C---AA-A---AT-A-A---TAGAGGACATT
gi|71035 : tctgTCTTTACATAATTA-A-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-TA-GAT-T-A-TTATG---CT-A--CTCCGGAACGTCACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGTAT-TT--AGTTG-A-TAT-TC-C-A-CCTAGC-A---AT-G-A---GAGATGACATT
gi|71048 : tctgTCTTTACATACGTT-T-T-CCG-TT--T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T----TGTGAAACT-A--GTCGGGAAAATAACT-C--AA---TAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTT-A-TAT-TT-C-A-C---GC-A---AT-G-A---TAG-GGACATT
gi|71042 : gTCTTTACATAATTA-T-T-CCC-TT--T--GT-T--A--TT-A-TATT-T-T-A-TTATG---CT-A--GTCTGGAACATAACT-A--AT---AAA-AT-GTT-C---------------------C-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AC-G-A---TAGATGACAT
gi|71038 : tctgTCTTTACATAATTA-T-T-TAC-TT--T--GT-T--A-----A-TA-T-T-T---TTATG---CT-A--GTTCGGAAC-TAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-GAT-
gi|71050 : tctgTCATTATTTAATTA-T-C-CCC-AT--T-----T--A--GC-A-CT-T-T-T-A-GCATA---CT-T--GTCATAAAGGTTACT-T--AA---GAA-CT-ATTCT--A--GGGAT-TT--TGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACAagacgacatt
gi|71037 : TCTTCACAGAATTA-T-TCCCC-TT--T--GT-T--A--T-------T-T-T-A-C-------CT-A--GTTTGGAGCATACCT-T--GA---AAA-GT--TT-T--G-AGTGAA-TG--CTTTG-A-AAC-TG-C-A-T---AC-A---AT-G-A---TTGAGAGCATT
gi|71047 : tctgTCTTCACAGAATTA-T-TTCCC-TT--T--GT-T--A--T-------T-T-T-C-T-------CT-T--GTTTTGAGCATACCT-T--GA---AAA-GT-TTT-G--A-AGTGAA-TA--CTTTG-A-AAT-TG-C-A-T---AC-A---AT-A-A---TAGAGAGCATT
gi|71044 : tgTCTTTGCAGAATTA-T-TCCCC-TT--T--GT-T--A--TT---T--T-C-C-A-TTA------------TTTGGAGCA-ACCT-T--GA---AAA-GT-TTT-G--A-AGTGAA-TG--ATTTG-A-AAC-TG-C-A-T---AC-A---AT-G-A---TAGAG
gi|71022 : tctgTCTTTGCAGAATTA-T-TCCCC-TT--T--GT-T--A--TT------T-T--------CC---CT-T--GTTTGGAGCATACAT-T--GA---AAA-GT-TTT-G--A-AGTGAA-TG--CTTTG-A-AAC-TG-C-A-T---AC-A---AC-G-A---TAGAGAGCATT
gi|71061 : tctgTTTACAT--TTA-T-C-CCC-AT--T-----T--A--TC-A-T--T-T-T-A-GTATA---CT-T--GTCATAAAGATTACT-C--AA---GAA-CT-ATT-C--A-TGGGAT-TT--GGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---TC-A---AT-G-A---TAGAGAACATT
gi|71079 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAGCT-T--GA---AAA-GT-ACC-TG-A-TGGAAT-TT--CATCA-A--AC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71065 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GTAACT-G--A-TGGAAT-TT--CATCA-A--AC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71072 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATTACT-T--AA---AAA-GT-ACC-TG-A-TGGAAT-TT--CATCA-A--AC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71070 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACC-TG-A-TGGAAT-TTC-A--TG-A-AGC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71078 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACC-TG-A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71075 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACC-TG-A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71073 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACC-TG-A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71069 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACTGG--A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71066 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACTGG--A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71074 : TTACAAAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACTGG--A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71071 : TTACAAAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACTGG--A-TGGAAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71064 : TTACAGAGTTA-T-TGCCC-TT--T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-T--GA---AAA-GT-ACTGG--A-T-GGAT-TT--CATCA-A--GC-TT-C-A-T---AC-A---AT-G-G---TAGA
gi|71128 : CATAACTC-T-A-CCT-TT--TCAAT-T--A--TC-A-TG-T-T-T-A-GTATA---CT-T--GCCATAAAGATTACT-C--AA---GAA-CT-ATT-C--C-AGGGAT-TC--GGTTC-A-TAC-TC-C-A-T---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71141 : TATTTA-TCT-CCC-TT--T--GT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CT-T--GTTCGGAACATAACT----AA---AAA-AT-GTT-T--C-AGGGAT-TC--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAGAACATT
gi|71133 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---TT-T--GTCCAGAACATAACT-C--TA---AAA-AT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-CAT-TT-C-A-C---AC-A---AA-G-A---TAGAGGACATT
gi|71140 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-TATT-T-T-A-TTATG---CT-G--GTCCTGAACA-AACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGAAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-T---AC-A---AT-T-A---TACAGGACATT
gi|71135 : TAATTA-TCT-CAC-TT--T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTTTG---CT-T--GTCCGGACCATAACT-T--AA---CAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---CAGAGGACATT
gi|71131 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--AT----------A-T--T-T-T-A-TTATG---CC-T--GTTAGGAACATAATT-A--AA---AAA-GT-GTT-C--A-GGGGAT-TT--AGTTG-A-TA--TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71130 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T-----TT-A-T--T-T-T-A-TTATG---CT-T--GTCCGGAACATAACT-C--AA---AAA-AT-GGT-TGAA-T--GAT-TT--AGTTG-A-CAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TGGAGAAGATT
gi|71147 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T--A--T--A-TA-T-T-T---TTATG---TT-T--GTCCAGAACATAACT-C--AA---AAT-AA-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTT-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAAGACTTT
gi|71143 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CT-T--GTCTGGAGCATAACT-C--TA---AAA-CA-ATT-T--A-AGAGAT-TT--TGTAG-A-ATT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---CAGATGAAATT
gi|71045 : TACTTAAT-T-ATC-TTACT---T-T--A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TT-T--GTCCGGAGCATAACT-CCAAATTTAAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--AT-TT-CCA-C---AC-A---AT-AAC---T-GAGGACATT
gi|71139 : ccgtgctTAATTA-TCT-TCC-TT--T--AT-T--AA-TT-AACA-C-T-T---TT------------GTCCAGAGCATAACT-G--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---GGGAGGACATT
gi|71151 : TAATTA-TCT-CCC-TT--C--AT-T--GATTT-A-CA-C-T-T---TT------------GTCCGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TATTG-A--ATATT-C-A-C---AA-G---AT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71142 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CT-T--GTCCTGGCCATGACT-C--TA---AAA-GT-GCT-G--AATGGAAT-TT--ATTTA-A--AC-TG-C-A-T---AC-A---AA-G-A---CAGAGGACATT
gi|71145 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TT-T--GTTTGGAGCATAACA-C--CA---AAA-CT-ATT-A--A-AGTGAT-TT--TGTTG-A-AAA-TT-C-A-C---AC-A---AT-GAC---T-GAAGACATT
gi|71137 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T--A----------------A-ATACA---CT-T--GTCTGGAGCACAACT-C--CA---AAA-CT-ATA-C--A-AGGGAT-TT--TGTTT-A-TTC-TT-C-A-C---AA-A---AT-G------ATAGGACATT
gi|71149 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CT-T--GTCCTGGCCATGACT-C--TA---AAA-GT-GCT-G--AATGGAAT-TT--ATTTA-A--AC-TG-C-A-T---AT-A---AA-G-A---CAGAGGACATT
gi|71134 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-AA-T-T-T-------G---CT-T--GTCCTGGGCATTACT-C--TA---AAA-GT-GGT-GA-A-TGGAAT-TT--ATTTA-A--AC-TG-C-A-T---AC-A---AA-G-A---CAGAGAACATT
gi|71132 : TAATTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T--A-----A-T--T-T-T-A-CTTT-----------TCCAGAACATAACT-C--CC---AAA-CT-ATT-C--A-AGAGAT-TTTTA-TTA-A-T-C-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---CAGAGATCATT
gi|71176 : CTTA-TAT-CTC-TT--T--AT-T--AATTT-A-CA-C-T-T---TT------------GTCCGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CC-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTC-A--ATCTT-C-A-A---AC-A---AT-G-
gi|71153 : tttgtcTTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T-----TT-A-T--T-T-T-A-TTTTG---CT-T--GTCAGGAACATAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGTGAT-TA--AGTTT-A-TAT-TA-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGATGACATTaccgagaa
gi|71166 : aaTTA-C-T-CCC-TT--T--------A--TT-A-TA-T-C-T-A-TTATG---CT-T--GTCCGGACCATAACT-C--AA---AA-------------------------AGTTG-A-TAT-TT-C-G-C---AC-A---AT-T-A---TAGACGACATT
gi|71138 : TTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T-----TT-A-T--T-G-T-A-ATATG---CT-T--GTCCGGAAC-----T-C--AA---AAT-GT-GTT-C--G-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAA-AT-C-A-C---TT-A---AT-T-A---TAGAGGACATT
gi|71158 : tgaTTA-T---CCC-TA--T---T-T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CT-T--GTCATAAAGATTACT-C--AA---GAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--GGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAAAGGACATT
gi|71161 : aaTTA-TCT-CCC-TT--T--AT-C--A----------------A-ATATA---CT-T--GTCCAGAACATAACT-C--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-G-C---AC-A---AT-G-T---CTGAGGACATT
gi|71062 : aaTTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CT-T--GTCCGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT--TT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-G-CTC-TT-C-A-C---AC-A---AT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71056 : tttaaaTTA-T-C-CCCATT--T--AT-C--A--TT-G-T------T-A-GTATT---CT-T--GTCATAAAGATTACT-C--AA---GAA-CT-ATA-T--A-AGGGAT-TT--GGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGAACATT
gi|71049 : tttttaaaTTA-TCT-CCC-TT--T--------A--TT-A-CA-T-T-T-A-C---G---CT-TTTGTCCTGAGCATAACT-T--CA---CAA-CT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A-ATT-TT-C-A-C---AC-A---AT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71154 : tttttaaaTTA-T-A-CCC-AT--T--G-----A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CT-T--GTTATAAAGATTACT-C--AA---GAA-CT-ATT-C--A-AGGAAT-TT--GGTTT-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---GT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71164 : agTTA-T-C-CCC-AT--T-----T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CT-T--GCCATAAAGATAACT-C--AA---GAA-CTAGTC-T--A--GGGAT-TT--GGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TGAAATACATT
gi|71160 : aTTA-TAT-CCC-TT--T--AT-A--A--TTTA-CA-C-T-T---TT------------GTCCGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT-ATT-T--A-AAGGAT-TG--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---AA-GAC---T-GAGGACATT
gi|71163 : aaTTA-TCT-CCC-TT--T--TT-A--A--TTGA-CA-C-T-T---TT------------GTCCGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT-GTT-C--A-AGGGATATT--A-TTG-AATAT-TC-C---C---AC-A---AT-GGC---T-GAGGACAT
gi|71040 : aaTTA-TAT-CCC-TT--T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CT-T--GTCCGG----TATCT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGCAA------GGTTG-G-TAT-AT-C-A-T---AC-A---
gi|71155 : tccatctttgaaTTA-T---CTC-TA--T---T-T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CT-T--GTCATAAAGATTACT-C--AA---GAA-AT-ATT-C--A-AGAGAT-TT--GGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---CT-A---AT-A-A---TAGAGAACATTcttattaagagga
gi|71168 : aaTTA-C-T-CCT-TT--T--AT-T--ACTTT-A-CA-C-T-T---TT------------GTACGGAGCACAACT-C--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-T---AC-A---AC-GAC---CA-AGGACATT
gi|71157 : TTA-T-C-CCC-AT--T-----T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CT-T--GTCATAAAGATTACT-C--AT---GAT-TT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--GGTTC-A-TAC-TT-C-A-C---AA-A---GT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71162 : aaTTA-TCT-CCC-TT--T--------A--AT-A-AA-T-T-T-A-TT-------T----GTCCAGAGCATAACT-A--CA---AAA-TT-ATT-C--A-AGGGAT-TT----TTATG-TATCTT-C-A-C---AT-A---AT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71156 : aaTTA-T-A-CCC-AT--T-----T--A--TC-A-CA-T-T---A-GTATA---CTTA--GTCACAAAGATTACT-C--AA---GAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--GG-----------------C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACAT
gi|71144 : aaTA-TCT-TCC-TT--T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CT-T--GTCTGGAACATAGCT-A--AA---AAA-GT-ATT-C--A-AAGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-TA--TAGACGACACT
gi|71063 : taaaTA-A-T-CTC-TC--T---T-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-T--GTCCGGAACATAACT-C--AA---AAC-TT-GTT-C--A-AGAGAT-TA--AGCTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAAA
gi|71041 : tttgaaTA-TCT-CCC-TT--T--AT-C--A--------A-T-T-T-A-CAATT---TT----GTACGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--AT-CTAC-A-C---AC-A---AT-T-A---CAGAGAACATT
gi|71058 : tctatcttgcttactttttgaagTA-TCT-CCC-TT--T--AT-T--AATTT-A-CA-C-T-T---TT------------GTCGGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A-ATT-TT-C-A-C---ACAA---ATAA-C---T-GAGAACACT
gi|71165 : tcatttcattcaataA-T-T-ATC-TTA-T--TT-T--A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TT-T--GTCCGGAGCATAACT-CCAAATTTAAA-CT-AAT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--AT-CT-CCA-C---AC-A---AT-AAC---T-GAGGACATT
gi|71172 : ttacttttttta-T-CCC-TT--T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---CT-T--GTCCAAAACATAACTAT--AA---AAT-GT-GAT-C--A-AAGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAGGACATT
gi|71173 : -T-CCC-TT--T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---CT-T--GTCAAGAACATAACT-A--AA---AAATAT-GAT-C--A-ACGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAGGACATT
gi|71171 : -T-CCA-TC--C--GTCT--G--TT-A-CA-T-T-T---TTAT------------CGGGAGCATAACT-A--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGAGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---CAGAGGACATT
gi|71129 : C-TT--T--GT-CTCN--NN-N-NN-N-N-N-N-TTATG---CT-A--GCCCGGAAC----------------------GTT-T--A-ATGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71174 : cataactctt-TT--T--CT-T--G--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-T--GCCCGGAACATAACT-C--AA---AAA-GT-TTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71175 : -TT--T--CT-T--G--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-A--GTCCGAAACATAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAG-TT--AATTA-A-TGT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAGGACATT
gi|71052 : T-T--A--TT-G-TA-T-T-TTA-ATATG---CT-A--GTCTGGAACATACCT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAT-CT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAGGACATT
gi|71043 : tttttaaattatct-T--G--TT-A-TA-T-TGT-A-TCATG---CT-A--GTTCGGAACATAACT-C--AA---ACA-AT-GTT-C--A-AGGGAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-G-C---AC-A---AT-T-A---TAGACGACATT
gi|71178 : tctttcttcataacaattgca-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CT-A--GTCCGAAACATAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AGGGAG-TT--AATTA-A-TGT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---TAGAGGACATT
gi|71179 : -T-T-T-A-TTATG---CT-A--GTCCGGAACATAACT-T--AA---AA-----------------GAT-TT--AGTTG-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---GT-G------AGAGGACA
gi|71180 : at-T-T-A-TCATG---CT-A--GTGCAGTACATAACT-C--AA---AAA-GT-GTT-C--A-AAGGGT-TT--AGTTA-T-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---GAGAGGCCATT
gi|71181 : -T-T-A-TCATG---CT-A--GTGCAGTACATAACT-C--AA---AAA-CT-GTT-C--A-AAGGGT-TT--AGTTA-T-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-T-A---GAGAGGCCATT
gi|71182 : -TTATA---CT-TTTGTCCGAAGCATAACT-T--CA---AAA-CT-ATT-T--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--ATATT-C-A-C---AC-A---TT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71188 : --GTTCGGAGCATAACT-G--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-T---AC-A---AT-G-A---CAGAGGACATT
gi|71185 : --GTCTGGAGCATAACT-C--AA---AAC--T-ATT-C--A-AGGGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---CAGAGGGCACT
gi|71187 : --GTCCGGAGCATAACT-A--CA---AAA-CT-GTT-C--A-AAGGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-----AC-A---AT-G-A---CAGAGGAC
gi|71192 : --GTCTGGAGCATAACT-A--CA---AAA-CT-ATT-T--A-AGCAAT-AT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---CAGAGGACATT
gi|71177 : --GTCCGGAGCATAACT-C--CA---AAA-CT-ATTCT--A--GGGAT-TT--TGTAG-A--AT-TT-T-AAT---AC-A---AT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71183 : tgtcaacatatttt--GTCCGAAGCACAACT-A--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGTGCT-TT--TGTTG-A-AAC-TT-C-A-C---AC-A---AT-GAC---T-GAGGACATT
gi|71186 : --GTCCGGAGTATGACT-A--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AGCGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---AT-G------ACAGGACATT
gi|71184 : --GTCCAGAGCAAAATT-T--CA---AAA-TT-ATT-C--A-AGTGAT-TT--TGTTG-A--ATCTT-C-A-C---AC-A---TT-G-A---CAGAGGACATT
gi|71193 : --GTCAGGAGCATAACT-A--CA---AAA-CT-ATT-C--A-AACAAT-TT--TGTTG-A--ATATT-C-A-C---TC-A---AT-G-A---CAGAGGACATT
gi|71199 : CT-C--AA---TAA-CT-AAT-T--A-AGGGAT-TT--AGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-G-A---TAGAGGACATT
gi|71198 : CT-C--AA---GAA-CT-AGT-C--A-AGGGAT-TT--GGTTC-A-TAT-TT-C-A-C---AC-A---AT-A-A---TAGAGGACATT
Alignments
lowQualScore : 111 1111111111111111111 11111111111 1
lowQualScore : 00 0 666 1 0 8888888888888888888 0 0 33333333333 11 0 7 22222 33 00 5 11 0 1 6 0 0 000 0 0 111111 00
lowQualScore : .. . ... . . ................... . . ........... .. . . ..... .. .. . .. . . . . . ... . . ...... ..
lowQualScore : 77 5 777 9 5 0000000000000000000 9 5 88888888888 55 4 0 00000 88 99 2 77 4 2 8 8 4 777 4 4 222222 66
consensus : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
Reference ( family-200 ) : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71021 : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CAC-TT-T--GT-T--A--TT-G-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTT-CGGAACTTAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AT-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71022 : tctaTCTTTGCAG--AAT-TAT-T-CCCCTT-T--GT-T--A--TT--------------TTCC----CTT--GTT-TGGAGCATACATTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATGC-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-CGA------T--AGAGAGCATT
gi|71023 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-C-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTAAAAA-----A-GT-GTTCTT-GGTATTTA-GGTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACAT
gi|71025 : tctgTCTTAACAT--AGT-TAT-T-CTC-TT-T--GC-T--A--TT-A-TA-TGT-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-GC-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---TC-AA-TGA------T--AGAGGATATT
gi|71027 : tctgTCTTAACAT--AAT-TAT-T-CTC-TT-T--GT-T-----TT-A-TATT-T-T-A-TTAGG---CTA--GTC-CGGAACATGACTAAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACA
gi|71028 : tctaTCTTTACAA--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CTAAACATAACTCAAAA-----A-CT-GTTAAA-CGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AT-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71030 : tctgTCTTTATAT--AAC-TAT-T-CCC-TT-T--AC-T--A--TT-A-TA-T-T-TCA-TTATG---CTA--GCC-TGGAATATAACTCAAAG-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTGG-ATAT-TT-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71031 : tctgTCTTTACGT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-GAAT-T-T-A-TCATA---CTA--GTC-TGGAACATAACTCAATA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---GC-AA-TTA------T--AGAGGATATT
gi|71033 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TC-T--GT-T--A--TC-A-TAAT-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-TAGAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AA---AC-AA-TG
gi|71034 : tctgTCTTTTCAT--AAT-TAT-T-TC---T-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CAGAACA--ACTCAAAA-----A-GT-GTT-AA-GGGATTTA-GTTG-AAAT-TT-C-AC---AA-AA-TAA------T--AGAGGACATT
gi|71035 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAA-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-GAT-T-A-TTATG---CTA--CTC-CGGAACGTCACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGTATTTA-GTTG-ATAT-TC-C-ACCTAGC-AA-TGA------G--AGATGACATT
gi|71037 : tctgTCTTCACAG--AAT-TAT-T-CCCCTT-T--GT-T--A--TT-T-TA-C-C-T-A--------------GTT-TGGAGCATACCTTGAAA-----A-GT--TTTGA-GTGAATGC-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-TGA------T--TGAGAGCATT
gi|71038 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-T-TAC-TT-T--GT-T--A-----A-TA-T-T-T---TTATG---CTA--GTT-CGGAAC-TAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-A---------------------GA------T--AGACGACATT
gi|71040 : tctgTCTTTG-----AAT-TATAT-CCC-TT-T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGG----TATCTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GCAA---G-GTTG-GTAT-AT-C-AT---AC-AC-TTA------TTAAGAGGA
gi|71041 : tcca--AAG-TATCT-CCC-TT-T--AT-C--A--------A-T-T-T-A-CAAT----TTT--GTA-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-AT-CTAC-AC---AC-AA-TTA------C--AGAGAACATT
gi|71042 : tctatcttgcttactttttgTCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TATT-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-TGGAACATAACTAATAA-----A-AT-GTTC-----------------CTAT-TT-C-AC---AC-AA-CGA------T--AGATGACAT
gi|71043 : tctg-T--G--TT-A-TA-T-TGT-A-TCATG---CTA--GTT-CGGAACATAACTCAAAC-----A-AT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-GC---AC-AA-TTA------T--AGACGACATT
gi|71044 : tctttcttcataacaattgcaTCTTTGCAG--AAT-TAT-T-CCCCTT-T--GT-T--A--TT---T--T-C-C-A-TTAT-----TT--G-----GAGCA-ACCTTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATGA-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAG
gi|71045 : tctgTTACTT--AAT-TATCT-TAC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAATTTAAA-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-AT-TTCC-AC---AC-AA-TAA------C--TGAGGACATT
gi|71046 : ccgtgcTCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-C--A--TT-A-TA-T-T-T-AATTATG---CTA--GTC-TGGAACATAACTCAACA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TC-C-AC---AC-AA-TGATGCATGT--AGAGGACATT
gi|71047 : tgTCTTCACAG--AAT-TAT-TTCCC-TT-T--GT-T--A--TT--------------TTCT----CTT--GTT-TTGAGCATACCTTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATAC-TTTG-AAAT-TG-C-AT---AC-AA-TAA------T--AGAGAGCATT
gi|71048 : tgTCTTTACAT--ACG-TTT-T-CCG-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T----TGTGAAACTA--GTC-GGGAAAATAACTCAATA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTT-ATAT-TT-C-AC---GC-AA-TGA------T--AG-GGACATT
gi|71049 : gTTTTTA-----AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-CA-T-T-T-A-C---G---CTTTTGTC-CTGAGCATAACTTCACA-----A-CT-GTTCAA-GGGATTTT-GTTG-AATT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71050 : TCATTATTT--AAT-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--GC-A-CT-T-T-T-A-GCATA---CTT--GTC-ATAAAGGTTACTTAAGA-----A-CT-ATTCTA-GGGATTTT-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACA
gi|71051 : TCTTTACAT--ACT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAGCTCAAAA-----A-GT-GTTTAT-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGC------T--AGAGGACATT
gi|71052 : TTTTTA-----AAT-TAT-----C-TT-T--AT-T--G--T--A-T--T-T-T-A-ATATG---CTA--GTC-TGGAACATACCTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATCTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71053 : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-ATTA-T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-C-AAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-GTCG-ATAT-TT-C-AC-----------A------T--AGAGGA
gi|71056 : TTTTTA-----AAT-TAT-C-CCCATT-T--AT-C--A--TT-G-T------T-A-GTATT---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATATAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGAACATT
gi|71058 : TCATTTCATTCAATATATCT-CCC-TT-T--AT-T--AATTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTC-GGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-AATT-TT-C-AC---ACAAA-TAA------C--TGAGAACACT
gi|71061 : TTTACAT----T-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-T--T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAT-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---TC-AA-TGA------T--AGAGAACATT
gi|71062 : TTTA-----AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT--TTCAA-GGGATTTT-GTTG-GCTC-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71063 : TTTGAAT--AAT-C---T-CTC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----C-TT-GTTCAA-GAGATTAA-GCTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AAA
gi|71064 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGA-TGGATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71065 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GTAACTGAT-GGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71066 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71069 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71070 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-A-TG-AAGC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71071 : TTACAA--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71072 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATTACTTAAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71073 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71074 : TTACAA--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71075 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71078 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71079 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAGCTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71128 : CAT--AAC-TCT-A-CCT-TT-TCAAT-T--A--TC-A-TG-T-T-T-A-GTATA---CTT--GCC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCCA-GGGATTCG-GTTC-ATAC-TC-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71129 : CAT--AAC-TCT-T-C---TT-T--GT-CTCN--NN-N-NN-N-N-N-N-TTATG---CTA--GCC-CGGAAC---------------------GTTTAA-TGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71130 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T-----TT-A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-AT-GGTTGA-ATGATTTA-GTTG-ACAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--GGAGAAGATT
gi|71131 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT----------A-T--T-T-T-A-TTATG---CCT--GTT-AGGAACATAATTAAAAA-----A-GT-GTTCAG-GGGATTTA-GTTG-ATA--TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71132 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A--------A-T-T-T------TA---CTT--TTC-CAGAACATAACTCCCAA-----A-CT-ATTCAA-GAGATTTTTATTA-AT-C-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGATCATT
gi|71133 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---TTT--GTC-CAGAACATAACTCTAAA-----A-AT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ACAT-TT-C-AC---AC-AA-AGA------T--AGAGGACATT
gi|71134 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-------G---CTT--GTC-CTGGGCATTACTCTAAA-----A-GT-GGTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AC-AA-AGA------C--AGAGAACATT
gi|71135 : T--AAT-TATCT-CAC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTTTG---CTT--GTC-CGGACCATAACTTAACA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------C--AGAGGACATT
gi|71137 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A----------------A-ATACA---CTT--GTC-TGGAGCACAACTCCAAA-----A-CT-ATACAA-GGGATTTT-GTTT-ATTC-TT-C-AC---AA-AA-TGA------T----AGGACATT
gi|71138 : T--GAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T-----TT-A-T--T-G-T-A-ATATG---CTT--GTC-CGGA-----ACTCAAAA-----T-GT-GTTCGA-GGGATTTA-GTTG-ATAA-AT-C-AC---TT-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71139 : T--AAT-TATCT-TCC-TT-T--AT-T--AA-TT-AACA-C-T-T------------TT--GTC-CAGAGCATAACTGCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------G--GGAGGACATT
gi|71140 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-TATT-T-T-A-TTATG---CTG--GTC-CTGAACA-AACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGAATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AT---AC-AA-TTA------T--ACAGGACATT
gi|71141 : T--ATT-TATCT-CCC-TT-T--GT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTT-CGGAACATAACT-AAAA-----A-AT-GTTTCA-GGGATTCA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGAACATT
gi|71142 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-CTGGCCATGACTCTAAA-----A-GT-GCTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AC-AA-AGA------C--AGAGGACATT
gi|71143 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-TGGAGCATAACTCTAAA-----A-CA-ATTTAA-GAGATTTT-GTAG-AATT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGATGAAATT
gi|71144 : T--AAA-TATCT-TCC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-TGGAACATAGCTAAAAA-----A-GT-ATTCAA-AGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AATTTA------T--AGACGACACT
gi|71145 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TTT--GTT-TGGAGCATAACACCAAA-----A-CT-ATTAAA-GTGATTTT-GTTG-AAAA-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAAGACATT
gi|71147 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A--T--A-TA-T-T-T---TTATG---TTT--GTC-CAGAACATAACTCAAAA-----T-AA-GTTCAA-GGGATTTA-GTTT-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAAGACTTT
gi|71149 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-CTGGCCATGACTCTAAA-----A-GT-GCTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AT-AA-AGA------C--AGAGGACATT
gi|71151 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-C--AT-T--GATTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-ATTG-A-ATATT-C-AC---AA-GA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71153 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T-----TT-A-T--T-T-T-A-TTTTG---CTT--GTC-AGGAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GTGATTAA-GTTT-ATAT-TA-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGATGACATT
gi|71154 : --AGT-TAT-A-CCC-AT-T--G-----A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTT-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGAATTTG-GTTT-ATAT-TT-C-AC---AC-AG-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71155 : --AAT-TAT---CTC-TA-T---T-T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-AT-ATTCAA-GAGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---CT-AA-TAA------T--AGAGAACATT
gi|71156 : --AAT-TAT-A-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-CA-T-T---A-GTATA---CTTA-GTCACAAAG-ATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTG-G---------------C---AC-AA-TGA------T--AGAGGACAT
gi|71157 : --AAT-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCATGA-----T-TT-ATTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAC-TT-C-AC---AA-AG-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71158 : --AAT-TAT---CCC-TA-T---T-T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AAAGGACATT
gi|71160 : --AAT-TATAT-CCC-TT-T--AT-A--A--TTTA-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTTAA-AGGATTGT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-AGA------C--TGAGGACATT
gi|71161 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-C--A----------------A-ATATA---CTT--GTC-CAGAACATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-GC---AC-AA-TGT------C--TGAGGACATT
gi|71162 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--AT-A-AA-T-T-T-A-TT--------T--GTC-CAGAGCATAACTACAAA-----A-TT-ATTCAA-GGGATTTT-TATG--TATCTT-C-AC---AT-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71163 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--TT-A--A--TTGA-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-GTTCAA-GGGATATT-ATTGAATAT-TC-C--C---AC-AA-TGG------C--TGAGGACAT
gi|71164 : AT-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GCC-ATAAAGATAACTCAAGA-----A-CT-AGTCTA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--GAAATACATT
gi|71165 : T--AAT-TAT-----C-TTAT--TT-T--A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAATTTAAA-CT-AATCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTC-C-AC---AC-AA-TAA------C--TGAGGACATT
gi|71166 : ttacttttttT-TAC-T-CCC-TT-T--------A--TT-A-TA-T-C-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGACCATAACTCAAAA-----A--------------------GTTG-ATAT-TT-C-GC---AC-AA-TTA------T--AGACGACATT
gi|71168 : T-TAC-T-CCT-TT-T--AT-T--ACTTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTA-CGGAGCACAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AT---AC-AA-CGA------C--CAAGGACATT
gi|71171 : -T-CCA-TC-C--GTCT--G--TT-A-CA-T-T-T------------TT--ATC-GGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GAGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71172 : -T-CCC-TT-T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---CTT--GTC-CAAAACATAACTATAAA-----ATGT-GATCAA-AGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71173 : -T-CCC-TT-T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---CTT--GTC-AAGAACATAACTAAAAA-----ATAT-GATCAA-CGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71174 : -TT-T--CT-T--G--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTT--GCC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-GT-TTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71175 : -TT-T--CT-T--G--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CGAAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-ATTA-ATGT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71176 : T-TATAT-CTC-TT-T--AT-T--AATTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CC-ATTCAA-GGGATTTT-GTTC-A-ATCTT-C-AA---AC-AA-TGA------C--CGAGAA
gi|71177 : tttgtccTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCTA-GGGATTTT-GTAG-A-AT-TT-TAAT---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71178 : tgtcaacatattT-A-T--T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGAAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-ATTA-ATGT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71179 : a-T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTTAAAA-------------------GATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AG-TG----------AGAGGACA
gi|71180 : at-T-T-A-TCATG---CTA--GTG-CAGTACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-AGGGTTTA-GTTA-TTAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------G--AGAGGCCATT
gi|71181 : -T-T-A-TCATG---CTA--GTG-CAGTACATAACTCAAAA-----A-CT-GTTCAA-AGGGTTTA-GTTA-TTAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------G--AGAGGCCATT
gi|71182 : -TTATA---CTTTTGTC-CGAAGCATAACTTCAAA-----A-CT-ATTTAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATATT-C-AC---AC-AT-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71183 : --GTC-CGAAGCACAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GTGCTTTT-GTTG-AAAC-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71184 : --GTC-CAGAGCAAAATTTCAAA-----A-TT-ATTCAA-GTGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AT-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71185 : --GTC-TGGAGCATAACTC-AAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGGCACT
gi|71186 : --GTC-CGGAGTATGACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GCGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C----AGGACATT
gi|71187 : --GTC-CGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-GTTCAA-AGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-A----AC-AA-TGA------C--AGAGGAC
gi|71188 : --GTT-CGGAGCATAACTGCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AT---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71192 : --GTC-TGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTTAA-GCAATATT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71193 : --GTC-AGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-ACAATTTT-GTTG-A-ATATT-C-AC---TC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71198 : ACTCAAGA-----A-CT-AGTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TAA------T--AGAGGACATT
gi|71199 : CTCAATA-----A-CT-AATTAA-GGGATTTA-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
Alignments
lowQualScore : 111 1111111111111111111 11111111111 1
lowQualScore : 00 0 666 1 0 8888888888888888888 0 0 33333333333 11 0 7 22222 33 00 5 11 0 1 6 0 0 000 0 0 111111 00
lowQualScore : .. . ... . . ................... . . ........... .. . . ..... .. .. . .. . . . . . ... . . ...... ..
lowQualScore : 77 5 777 9 5 0000000000000000000 9 5 88888888888 55 4 0 00000 88 99 2 77 4 2 8 8 4 777 4 4 222222 66
consensus : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
Reference ( family-200 ) : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71021 : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CAC-TT-T--GT-T--A--TT-G-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTT-CGGAACTTAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AT-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71022 : tctaTCTTTGCAG--AAT-TAT-T-CCCCTT-T--GT-T--A--TT--------------TTCC----CTT--GTT-TGGAGCATACATTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATGC-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-CGA------T--AGAGAGCATT
gi|71023 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-C-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTAAAAA-----A-GT-GTTCTT-GGTATTTA-GGTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACAT
gi|71025 : tctgTCTTAACAT--AGT-TAT-T-CTC-TT-T--GC-T--A--TT-A-TA-TGT-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-GC-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---TC-AA-TGA------T--AGAGGATATT
gi|71027 : tctgTCTTAACAT--AAT-TAT-T-CTC-TT-T--GT-T-----TT-A-TATT-T-T-A-TTAGG---CTA--GTC-CGGAACATGACTAAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACA
gi|71028 : tctaTCTTTACAA--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CTAAACATAACTCAAAA-----A-CT-GTTAAA-CGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AT-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71030 : tctgTCTTTATAT--AAC-TAT-T-CCC-TT-T--AC-T--A--TT-A-TA-T-T-TCA-TTATG---CTA--GCC-TGGAATATAACTCAAAG-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTGG-ATAT-TT-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71031 : tctgTCTTTACGT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-GAAT-T-T-A-TCATA---CTA--GTC-TGGAACATAACTCAATA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---GC-AA-TTA------T--AGAGGATATT
gi|71033 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TC-T--GT-T--A--TC-A-TAAT-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-TAGAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AA---AC-AA-TG
gi|71034 : tctgTCTTTTCAT--AAT-TAT-T-TC---T-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CAGAACA--ACTCAAAA-----A-GT-GTT-AA-GGGATTTA-GTTG-AAAT-TT-C-AC---AA-AA-TAA------T--AGAGGACATT
gi|71035 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAA-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-GAT-T-A-TTATG---CTA--CTC-CGGAACGTCACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGTATTTA-GTTG-ATAT-TC-C-ACCTAGC-AA-TGA------G--AGATGACATT
gi|71037 : tctgTCTTCACAG--AAT-TAT-T-CCCCTT-T--GT-T--A--TT-T-TA-C-C-T-A--------------GTT-TGGAGCATACCTTGAAA-----A-GT--TTTGA-GTGAATGC-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-TGA------T--TGAGAGCATT
gi|71038 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-T-TAC-TT-T--GT-T--A-----A-TA-T-T-T---TTATG---CTA--GTT-CGGAAC-TAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-A---------------------GA------T--AGACGACATT
gi|71040 : tctgTCTTTG-----AAT-TATAT-CCC-TT-T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGG----TATCTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GCAA---G-GTTG-GTAT-AT-C-AT---AC-AC-TTA------TTAAGAGGA
gi|71041 : tcca--AAG-TATCT-CCC-TT-T--AT-C--A--------A-T-T-T-A-CAAT----TTT--GTA-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-AT-CTAC-AC---AC-AA-TTA------C--AGAGAACATT
gi|71042 : tctatcttgcttactttttgTCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TATT-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-TGGAACATAACTAATAA-----A-AT-GTTC-----------------CTAT-TT-C-AC---AC-AA-CGA------T--AGATGACAT
gi|71043 : tctg-T--G--TT-A-TA-T-TGT-A-TCATG---CTA--GTT-CGGAACATAACTCAAAC-----A-AT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-GC---AC-AA-TTA------T--AGACGACATT
gi|71044 : tctttcttcataacaattgcaTCTTTGCAG--AAT-TAT-T-CCCCTT-T--GT-T--A--TT---T--T-C-C-A-TTAT-----TT--G-----GAGCA-ACCTTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATGA-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAG
gi|71045 : tctgTTACTT--AAT-TATCT-TAC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAATTTAAA-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-AT-TTCC-AC---AC-AA-TAA------C--TGAGGACATT
gi|71046 : ccgtgcTCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-C--A--TT-A-TA-T-T-T-AATTATG---CTA--GTC-TGGAACATAACTCAACA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TC-C-AC---AC-AA-TGATGCATGT--AGAGGACATT
gi|71047 : tgTCTTCACAG--AAT-TAT-TTCCC-TT-T--GT-T--A--TT--------------TTCT----CTT--GTT-TTGAGCATACCTTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATAC-TTTG-AAAT-TG-C-AT---AC-AA-TAA------T--AGAGAGCATT
gi|71048 : tgTCTTTACAT--ACG-TTT-T-CCG-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T----TGTGAAACTA--GTC-GGGAAAATAACTCAATA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTT-ATAT-TT-C-AC---GC-AA-TGA------T--AG-GGACATT
gi|71049 : gTTTTTA-----AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-CA-T-T-T-A-C---G---CTTTTGTC-CTGAGCATAACTTCACA-----A-CT-GTTCAA-GGGATTTT-GTTG-AATT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71050 : TCATTATTT--AAT-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--GC-A-CT-T-T-T-A-GCATA---CTT--GTC-ATAAAGGTTACTTAAGA-----A-CT-ATTCTA-GGGATTTT-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACA
gi|71051 : TCTTTACAT--ACT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAGCTCAAAA-----A-GT-GTTTAT-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGC------T--AGAGGACATT
gi|71052 : TTTTTA-----AAT-TAT-----C-TT-T--AT-T--G--T--A-T--T-T-T-A-ATATG---CTA--GTC-TGGAACATACCTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATCTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71053 : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-ATTA-T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-C-AAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-GTCG-ATAT-TT-C-AC-----------A------T--AGAGGA
gi|71056 : TTTTTA-----AAT-TAT-C-CCCATT-T--AT-C--A--TT-G-T------T-A-GTATT---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATATAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGAACATT
gi|71058 : TCATTTCATTCAATATATCT-CCC-TT-T--AT-T--AATTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTC-GGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-AATT-TT-C-AC---ACAAA-TAA------C--TGAGAACACT
gi|71061 : TTTACAT----T-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-T--T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAT-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---TC-AA-TGA------T--AGAGAACATT
gi|71062 : TTTA-----AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT--TTCAA-GGGATTTT-GTTG-GCTC-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71063 : TTTGAAT--AAT-C---T-CTC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----C-TT-GTTCAA-GAGATTAA-GCTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AAA
gi|71064 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGA-TGGATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71065 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GTAACTGAT-GGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71066 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71069 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71070 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-A-TG-AAGC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71071 : TTACAA--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71072 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATTACTTAAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71073 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71074 : TTACAA--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71075 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71078 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71079 : TTACAG--AGT-TAT-TGCCC-TT-T--G-----------A-TA-T-T-T-T-TT------CTT--GTC-CGGAGCATAGCTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71128 : CAT--AAC-TCT-A-CCT-TT-TCAAT-T--A--TC-A-TG-T-T-T-A-GTATA---CTT--GCC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCCA-GGGATTCG-GTTC-ATAC-TC-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71129 : CAT--AAC-TCT-T-C---TT-T--GT-CTCN--NN-N-NN-N-N-N-N-TTATG---CTA--GCC-CGGAAC---------------------GTTTAA-TGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71130 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T-----TT-A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-AT-GGTTGA-ATGATTTA-GTTG-ACAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--GGAGAAGATT
gi|71131 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT----------A-T--T-T-T-A-TTATG---CCT--GTT-AGGAACATAATTAAAAA-----A-GT-GTTCAG-GGGATTTA-GTTG-ATA--TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71132 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A--------A-T-T-T------TA---CTT--TTC-CAGAACATAACTCCCAA-----A-CT-ATTCAA-GAGATTTTTATTA-AT-C-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGATCATT
gi|71133 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---TTT--GTC-CAGAACATAACTCTAAA-----A-AT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ACAT-TT-C-AC---AC-AA-AGA------T--AGAGGACATT
gi|71134 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-------G---CTT--GTC-CTGGGCATTACTCTAAA-----A-GT-GGTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AC-AA-AGA------C--AGAGAACATT
gi|71135 : T--AAT-TATCT-CAC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTTTG---CTT--GTC-CGGACCATAACTTAACA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------C--AGAGGACATT
gi|71137 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A----------------A-ATACA---CTT--GTC-TGGAGCACAACTCCAAA-----A-CT-ATACAA-GGGATTTT-GTTT-ATTC-TT-C-AC---AA-AA-TGA------T----AGGACATT
gi|71138 : T--GAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T-----TT-A-T--T-G-T-A-ATATG---CTT--GTC-CGGA-----ACTCAAAA-----T-GT-GTTCGA-GGGATTTA-GTTG-ATAA-AT-C-AC---TT-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71139 : T--AAT-TATCT-TCC-TT-T--AT-T--AA-TT-AACA-C-T-T------------TT--GTC-CAGAGCATAACTGCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------G--GGAGGACATT
gi|71140 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-TATT-T-T-A-TTATG---CTG--GTC-CTGAACA-AACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGAATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AT---AC-AA-TTA------T--ACAGGACATT
gi|71141 : T--ATT-TATCT-CCC-TT-T--GT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTT-CGGAACATAACT-AAAA-----A-AT-GTTTCA-GGGATTCA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGAACATT
gi|71142 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-CTGGCCATGACTCTAAA-----A-GT-GCTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AC-AA-AGA------C--AGAGGACATT
gi|71143 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-TGGAGCATAACTCTAAA-----A-CA-ATTTAA-GAGATTTT-GTAG-AATT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGATGAAATT
gi|71144 : T--AAA-TATCT-TCC-TT-T--AT-T--A--T--A-T--T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-TGGAACATAGCTAAAAA-----A-GT-ATTCAA-AGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AATTTA------T--AGACGACACT
gi|71145 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TTT--GTT-TGGAGCATAACACCAAA-----A-CT-ATTAAA-GTGATTTT-GTTG-AAAA-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAAGACATT
gi|71147 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T--A--T--A-TA-T-T-T---TTATG---TTT--GTC-CAGAACATAACTCAAAA-----T-AA-GTTCAA-GGGATTTA-GTTT-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAAGACTTT
gi|71149 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--TT-A-AA-T-T-T-A---------CTT--GTC-CTGGCCATGACTCTAAA-----A-GT-GCTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AT-AA-AGA------C--AGAGGACATT
gi|71151 : T--AAT-TATCT-CCC-TT-C--AT-T--GATTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-ATTG-A-ATATT-C-AC---AA-GA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71153 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-T-----TT-A-T--T-T-T-A-TTTTG---CTT--GTC-AGGAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GTGATTAA-GTTT-ATAT-TA-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGATGACATT
gi|71154 : --AGT-TAT-A-CCC-AT-T--G-----A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTT-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGAATTTG-GTTT-ATAT-TT-C-AC---AC-AG-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71155 : --AAT-TAT---CTC-TA-T---T-T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-AT-ATTCAA-GAGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---CT-AA-TAA------T--AGAGAACATT
gi|71156 : --AAT-TAT-A-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-CA-T-T---A-GTATA---CTTA-GTCACAAAG-ATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTG-G---------------C---AC-AA-TGA------T--AGAGGACAT
gi|71157 : --AAT-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCATGA-----T-TT-ATTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAC-TT-C-AC---AA-AG-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71158 : --AAT-TAT---CCC-TA-T---T-T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AAAGGACATT
gi|71160 : --AAT-TATAT-CCC-TT-T--AT-A--A--TTTA-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTTAA-AGGATTGT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-AGA------C--TGAGGACATT
gi|71161 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--AT-C--A----------------A-ATATA---CTT--GTC-CAGAACATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-GC---AC-AA-TGT------C--TGAGGACATT
gi|71162 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--------A--AT-A-AA-T-T-T-A-TT--------T--GTC-CAGAGCATAACTACAAA-----A-TT-ATTCAA-GGGATTTT-TATG--TATCTT-C-AC---AT-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71163 : --AAT-TATCT-CCC-TT-T--TT-A--A--TTGA-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-GTTCAA-GGGATATT-ATTGAATAT-TC-C--C---AC-AA-TGG------C--TGAGGACAT
gi|71164 : AT-TAT-C-CCC-AT-T-----T--A--TC-A-CT-T-T-T-A-GTATA---CTT--GCC-ATAAAGATAACTCAAGA-----A-CT-AGTCTA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--GAAATACATT
gi|71165 : T--AAT-TAT-----C-TTAT--TT-T--A--TT-A-AA-T-T-T-A-C-ACT---TTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAATTTAAA-CT-AATCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTC-C-AC---AC-AA-TAA------C--TGAGGACATT
gi|71166 : ttacttttttT-TAC-T-CCC-TT-T--------A--TT-A-TA-T-C-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGACCATAACTCAAAA-----A--------------------GTTG-ATAT-TT-C-GC---AC-AA-TTA------T--AGACGACATT
gi|71168 : T-TAC-T-CCT-TT-T--AT-T--ACTTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTA-CGGAGCACAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AT---AC-AA-CGA------C--CAAGGACATT
gi|71171 : -T-CCA-TC-C--GTCT--G--TT-A-CA-T-T-T------------TT--ATC-GGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GAGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71172 : -T-CCC-TT-T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---CTT--GTC-CAAAACATAACTATAAA-----ATGT-GATCAA-AGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71173 : -T-CCC-TT-T--AT-C--A--T--A-T--T-T-T-A-CTATG---CTT--GTC-AAGAACATAACTAAAAA-----ATAT-GATCAA-CGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71174 : -TT-T--CT-T--G--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTT--GCC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-GT-TTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71175 : -TT-T--CT-T--G--TT-A-TA-T-T-TTA-TTATG---CTA--GTC-CGAAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-ATTA-ATGT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71176 : T-TATAT-CTC-TT-T--AT-T--AATTT-A-CA-C-T-T------------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CC-ATTCAA-GGGATTTT-GTTC-A-ATCTT-C-AA---AC-AA-TGA------C--CGAGAA
gi|71177 : tttgtccTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCTA-GGGATTTT-GTAG-A-AT-TT-TAAT---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71178 : tgtcaacatattT-A-T--T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGAAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-ATTA-ATGT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71179 : a-T-T-T-A-TTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTTAAAA-------------------GATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AG-TG----------AGAGGACA
gi|71180 : at-T-T-A-TCATG---CTA--GTG-CAGTACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-AGGGTTTA-GTTA-TTAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------G--AGAGGCCATT
gi|71181 : -T-T-A-TCATG---CTA--GTG-CAGTACATAACTCAAAA-----A-CT-GTTCAA-AGGGTTTA-GTTA-TTAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------G--AGAGGCCATT
gi|71182 : -TTATA---CTTTTGTC-CGAAGCATAACTTCAAA-----A-CT-ATTTAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATATT-C-AC---AC-AT-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71183 : --GTC-CGAAGCACAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GTGCTTTT-GTTG-AAAC-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71184 : --GTC-CAGAGCAAAATTTCAAA-----A-TT-ATTCAA-GTGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AT-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71185 : --GTC-TGGAGCATAACTC-AAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGGCACT
gi|71186 : --GTC-CGGAGTATGACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GCGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C----AGGACATT
gi|71187 : --GTC-CGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-GTTCAA-AGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-A----AC-AA-TGA------C--AGAGGAC
gi|71188 : --GTT-CGGAGCATAACTGCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AT---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71192 : --GTC-TGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTTAA-GCAATATT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71193 : --GTC-AGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-ACAATTTT-GTTG-A-ATATT-C-AC---TC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71198 : ACTCAAGA-----A-CT-AGTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TAA------T--AGAGGACATT
gi|71199 : CTCAATA-----A-CT-AATTAA-GGGATTTA-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
blockSeqs : AT C ATTAATTTACA TATTATG TT G TTTAA TG T TT A C TGCATG
blockSeqs : CT C CAATTATCATG TATTATG TT A TTTAA TA T C T A .
blockSeqs : CT C GTCTCNNNNNN CATTATG A A . G T A T C .
blockSeqs : TT A ATTAATTAACA TATTATG . A . G T A T C .
blockSeqs : CT . ATTGATTTACA AATTATG . A . G T A T C .
blockSeqs : CT . ATTACTTTACA TGTGAAA . A . G T A T C .
blockSeqs : CT . ATTAATTTACA TATTATG . A . C T A T C .
blockSeqs : TG . GTTATTAGAA TATTATG . A . G T A T C .
blockSeqs : TG . GTTATCATAA ATTATG . A . G T A A C .
blockSeqs : TG . GTTATTATAT ATTAGG . A . G T A T A .
blockSeqs : TG . GTTATTATTA ATCATA . G . G T A A C .
blockSeqs : TG . ATAATTTACA ATTATG . A . G T C T C .
blockSeqs : TG . TTAATTGACA ATTATG . A . G T A T C .
blockSeqs : TG . GTCTGTTACA ATTATG . C . G . G T C .
blockSeqs : TG . GTTATTATA ATTATG . A . G . T A C .
blockSeqs : TG . GCTATTATA ATCATG . A . C . A T C .
blockSeqs : TG . GTTTTATAT AGCATA . G . A . A A A .
blockSeqs : TG . GTTATTATA ATTATG . C . A . T T . .
blockSeqs : TG . ACTATTATA AATATG . A . G . A A . .
blockSeqs : CT . GTTATTATA ATTATG . G . C . C T . .
blockSeqs : CT . GTTATTATA AGTATT . A . G . A T . .
blockSeqs : CT . GTTATTTTA AGTATA . C . G . T T . .
blockSeqs : CT . GTCATTATA ATTATG . A . G . T T . .
blockSeqs : CT . GTTATTATA AGTATA . A . C . A T . .
blockSeqs : CT . GTTATTATA NTTATG . A . C . A A . .
blockSeqs : CT . TTTATTAAA ATTATG . A . G . A T . .
blockSeqs : CT . CTTGTTATA ATTATG . A . G . G C . .
blockSeqs : CT . CTTGTTATA ACTATG . C . G . T T . .
blockSeqs : CT . ATCATTGT ATTTTG . A . C . G A . .
blockSeqs : CT . ATTATATA AATACA . C . C . T T . .
blockSeqs : CT . TTATCACT AATATG . A . C . A T . .
blockSeqs : CT . TTATCACT ATTATG . G . C . C C . .
blockSeqs : CT . GTTAATA ATTATG . G . T . C T . .
blockSeqs : CT . ATCATAT ATTATG . G . G . C T . .
blockSeqs : CT . GTTATTT ATTTTG . G . G . C C . .
blockSeqs : CT . TAGCACT AGTATA . G . G . C T . .
blockSeqs : CT . ATTGTAT AGTATA . G . G . C T . .
blockSeqs : CT . ATTATAT AGTATA . A . G . C T . .
blockSeqs : AT . ATTTTAT AGTATA . G . G . C T . .
blockSeqs : CT . ATTATAT AGTATA . G . G . C T . .
blockSeqs : CT . ATTATAT AATATA . G . G . C A . .
blockSeqs : CT . ATTTTAT AGTATA . G . G . C T . .
blockSeqs : AT . ATTATAT ATTATG . G . G . C A . .
blockSeqs : T . GTTATAT ACTATG . A . G . G T . .
blockSeqs : C . ATTATAT ACTATG . A . G . A T . .
blockSeqs : T . ATTTTAT ATTATG . A . C . A T . .
blockSeqs : T . GATCACT ATTATG . C . A . A T . .
blockSeqs : T . TATCACA ATCATG . T . G . A T . .
blockSeqs : T . TATCACT ATCATG . T . C . A T . .
blockSeqs : T . TATCACT TTATG . A . A . A T . .
blockSeqs : T . ATCATAT ACAAT . C . G . T T . .
blockSeqs : T . ATCATAT ATTAT . A . G . A T . .
blockSeqs : T . GTTATT ACACT . C . C . T T . .
blockSeqs : T . ATTAAA ACACT . A . G . A T . .
blockSeqs : T . GTTATT TTATG . A . C . A T . .
blockSeqs : T . ATTACA ACACT . T . G . A T . .
blockSeqs : T . TATCAT TTCC . T . A . T T . .
blockSeqs : T . ATTAAA TTCT . A . G . A T . .
blockSeqs : T . ATTAAA ACG . C . C . T T . .
blockSeqs : C . ATTAAA TTT . A . G . A T . .
blockSeqs : T . ATTAAA TTT . T . C . A T . .
blockSeqs : T . ATTAAA TTT . C . A . T A . .
blockSeqs : C . ATTAAA TTT . A . G . A T . .
blockSeqs : C . AATAAA TTT . A . C . G T . .
blockSeqs : T . ATTATA TTT . A . G . G . . .
blockSeqs : A . ATCAA TTT . A . C . G . . .
blockSeqs : T . ATTAA TTT . A . A . G . . .
blockSeqs : A . GATA TTT . A . C . G . . .
blockSeqs : A . GATA TTT . C . T . T . . .
blockSeqs : C . GATA TTT . C . C . T . . .
blockSeqs : C . GATA TTT . C . C . T . . .
blockSeqs : T . GATA ATT . C . C . T . . .
blockSeqs : T . GATA TA . A . T . G . . .
blockSeqs : T . GATA A . C . C . T . . .
blockSeqs : T . GATA A . A . C . T . . .
blockSeqs : T . GATA G . C . C . T . . .
blockSeqs : . . GATA A . C . C . A . . .
blockSeqs : . . GATA A . T . C . A . . .
blockSeqs : . . GATA A . A . G . A . . .
blockSeqs : . . ATAT . . A . G . A . . .
blockSeqs : . ATTA . . A . C . T . . .
blockSeqs : . ATCA . . C . C . T . . .
blockSeqs : . . C . G . A . . .
blockSeqs : . . A . G . A . . .
blockSeqs : . . A . C . A . . .
blockSeqs : . . A . C . A . . .
blockSeqs : . . A . C . T . . .
blockSeqs : . C . T . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . C . C . T . . .
blockSeqs : . A . C . G . . .
blockSeqs : . A . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : CT* GTTATTATA********** ATTATG*****
originalCons : TCTTTACAT--AAT-TAT-T-CCC-TT-T--GT-T--A--TT-A-TA-T-T-T-A-TTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
finalCons : TCTTTACAT--AAT-TATCT-CCC-TT-TGTTATTATA----------T-T-TATTATG-----CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111 1111111111 1
lowQualScore : 00 0 2 999999999999999999999 0 0 3333333333 11 0 7 22222 33 00 5 11 0 1 6 0 0 000 0 0 111111 00
lowQualScore : .. . . ..................... . . .......... .. . . ..... .. .. . .. . . . . . ... . . ...... ..
lowQualScore : 88 5 7 000000000000000000000 9 5 8888888888 55 4 0 00000 88 99 2 77 4 2 8 8 4 777 4 4 222222 66
consensus : TCTTTACAT--AAT-TATCTCCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-A-T-T-T-ATTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
Reference ( family-200 ) : TCTTTACAT--AAT-TATCTCCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-A-T-T-T-ATTATG---CTT--GTC-CGGAGCATAACTCGAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTN-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71021 : TCTTTACAT--AAT-TAT-TCACTTT---GT-T--A--TT-G-T-ATT-T-T-ATTATG---CTA--GTT-CGGAACTTAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AT-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71022 : tctaTCTTTGCAG--AAT-TATTCCCCTTT---GT-T--A--TT--------------TTCC----CTT--GTT-TGGAGCATACATTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATGC-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-CGA------T--AGAGAGCATT
gi|71023 : tctgTCTTTACAT--AAT-TATC-CCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-ATT-T-T-ATTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTAAAAA-----A-GT-GTTCTT-GGTATTTA-GGTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACAT
gi|71025 : tctgTCTTAACAT--AGT-TAT-TCTCTTT---GC-T--A--TT-A-T-A-TGT-T-ATTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-GC-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---TC-AA-TGA------T--AGAGGATATT
gi|71027 : tctgTCTTAACAT--AAT-TAT-TCTCTTT---GT-T-----TT-A-T-A-T-T-TTATTAGG---CTA--GTC-CGGAACATGACTAAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACA
gi|71028 : tctaTCTTTACAA--AAT-TAT-TCCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-A-T-T-TTATTATG---CTA--GTC-CTAAACATAACTCAAAA-----A-CT-GTTAAA-CGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AT-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71030 : tctgTCTTTATAT--AAC-TAT-TCCCTTT---AC-T--A--TT-A-T-A-T-T-TCATTATG---CTA--GCC-TGGAATATAACTCAAAG-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTGG-ATAT-TT-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71031 : tctgTCTTTACGT--AAT-TAT-TCCCTTT---GT-T--A--TT-A-G-AAT-T-T-ATCATA---CTA--GTC-TGGAACATAACTCAATA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---GC-AA-TTA------T--AGAGGATATT
gi|71033 : tctgTCTTTACAT--AAT-TAT-TCCCTCT---GT-T--A--TC-A-TAA-T-T-T-ATTATG---CTA--GTC-TAGAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AA---AC-AA-TG
gi|71034 : tctgTCTTTTCAT--AAT-TATTTC---TT---GT-T--A--TT-A-T-A-T-T-TTATTATG---CTA--GTC-CAGAACA--ACTCAAAA-----A-GT-GTT-AA-GGGATTTA-GTTG-AAAT-TT-C-AC---AA-AA-TAA------T--AGAGGACATT
gi|71035 : tctgTCTTTACAT--AAT-TA-ATCCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-A-GAT-T-ATTATG---CTA--CTC-CGGAACGTCACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGTATTTA-GTTG-ATAT-TC-C-ACCTAGC-AA-TGA------G--AGATGACATT
gi|71037 : tctgTCTTCACAG--AAT-TATTCCCCTTT---GT-T--A--TT-T-T-A-C-C-T-A-------------GTT-TGGAGCATACCTTGAAA-----A-GT--TTTGA-GTGAATGC-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-TGA------T--TGAGAGCATT
gi|71038 : tctgTCTTTACAT--AAT-TATTTAC-TTT---GT-T--A-----A-T-A-T-T-T--TTATG---CTA--GTT-CGGAAC-TAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-A---------------------GA------T--AGACGACATT
gi|71040 : tctgTCTTTG-----AAT-TATATCCCTTT---AT-C--A--T--A-T---T-T-T-ATTATG---CTT--GTC-CGG----TATCTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GCAA---G-GTTG-GTAT-AT-C-AT---AC-AC-TTA------TTAAGAGGA
gi|71041 : tcca--AAG-TATCTCCCTTT---AT-C--A---------A-T-T-T-ACAAT----TTT--GTA-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-AT-CTAC-AC---AC-AA-TTA------C--AGAGAACATT
gi|71042 : tctatcttgcttactttttgTCTTTACAT--AAT-TAT-TCCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-ATT-T-T-ATTATG---CTA--GTC-TGGAACATAACTAATAA-----A-AT-GTTC-----------------CTAT-TT-C-AC---AC-AA-CGA------T--AGATGACAT
gi|71043 : tctg-T--G--TT-A-T-A-T-TGT-ATCATG---CTA--GTT-CGGAACATAACTCAAAC-----A-AT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-GC---AC-AA-TTA------T--AGACGACATT
gi|71044 : tctttcttcataacaattgcaTCTTTGCAG--AAT-TATTCCCCTTT---GT-T--A--TT---T---T-C-C-ATTAT-----TT-------GGAGCA-ACCTTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATGA-TTTG-AAAC-TG-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAG
gi|71045 : tctgTTACTT--AAT-TATCTTACTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T-AC-ACT---TTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAATTTAAA-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-AT-TTCC-AC---AC-AA-TAA------C--TGAGGACATT
gi|71046 : ccgtgcTCTTTACAT--AAT-TAT-TCCCTTT---GT-C--A--TT-A-T-A-T-T-TAATTATG---CTA--GTC-TGGAACATAACTCAACA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TC-C-AC---AC-AA-TGATGCATGT--AGAGGACATT
gi|71047 : tgTCTTCACAG--AAT-TATTTCCCTTT---GT-T--A--TT--------------TTCT----CTT--GTT-TTGAGCATACCTTGAAA-----A-GT-TTTGAA-GTGAATAC-TTTG-AAAT-TG-C-AT---AC-AA-TAA------T--AGAGAGCATT
gi|71048 : tgTCTTTACAT--ACG-T-TTTCCGTTT---GT-T--A--TT-A-T-A-T-T-T---TGTGAAACTA--GTC-GGGAAAATAACTCAATA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTT-ATAT-TT-C-AC---GC-AA-TGA------T--AG-GGACATT
gi|71049 : gTTTTTA-----AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-C-A-T-T-T-AC---G---CTTTTGTC-CTGAGCATAACTTCACA-----A-CT-GTTCAA-GGGATTTT-GTTG-AATT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71050 : TCATTATTT--AAT-TATCCCCATTT---AG-C--A--CT-------T-T-T-AGCATA---CTT--GTC-ATAAAGGTTACTTAAGA-----A-CT-ATTCTA-GGGATTTT-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACA
gi|71051 : TCTTTACAT--ACT-TAT-TCCCTTT---GT-T--A--TT-A-T-A-T-T-T-ATTATG---CTA--GTC-CGGAACATAGCTCAAAA-----A-GT-GTTTAT-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGC------T--AGAGGACATT
gi|71052 : TTTTTA-----AAT-TATCT----------T-T--A--TT-G-T-A-T-T-TTAATATG---CTA--GTC-TGGAACATACCTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGATCTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71053 : TCTTTACAT--AAT-TAT-TCCCTTT---GT-T--A--TT-ATT-A-T-T-T-ATTATG---CTA--GTC-C-AAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-GTCG-ATAT-TT-C-AC-----------A------T--AGAGGA
gi|71056 : TTTTTA-----AAT-TATCCCCATTT---AT-C--A--TT-G-T-------T-AGTATT---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATATAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGAACATT
gi|71058 : TCATTTCATTCAATATATCTCCCTTT---AT-T--AATTT-A-C-A-C-T-T-----------TT--GTC-GGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-AATT-TT-C-AC---ACAAA-TAA------C--TGAGAACACT
gi|71061 : TTTACAT----T-TATCCCCATTT---AT-C--A--TT---------T-T-AGTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAT-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---TC-AA-TGA------T--AGAGAACATT
gi|71062 : TTTA-----AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T-A--------CTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT--TTCAA-GGGATTTT-GTTG-GCTC-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71063 : --AAT-AATCTCTCTTT---AT-T--A--T--A-T---T-T-T-ATTATG---CTT--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----C-TT-GTTCAA-GAGATTAA-GCTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AAA
gi|71064 : tttgTTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGA-TGGATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71065 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GTAACTGAT-GGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71066 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71069 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71070 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-A-TG-AAGC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71071 : TTACAA--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71072 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATTACTTAAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71073 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71074 : TTACAA--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACTGGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71075 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71078 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAACTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-GC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71079 : TTACAG--AGT-TATTGCCCTTT---G-----------A-T-A-T-T-T-TTT------CTT--GTC-CGGAGCATAGCTTGAAA-----A-GT-ACCTGATGGAATTTC-ATCA-A-AC-TT-C-AT---AC-AA-TGG------T--AGA
gi|71128 : CAT--AAC-T--CTACCTTTTCAAT-T--A--TC-A-T-G-T-T-T-AGTATA---CTT--GCC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCCA-GGGATTCG-GTTC-ATAC-TC-C-AT---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71129 : CAT--AAC-T--CTTC-TTT---GT-CTCN--NN-N-N-N-N-N-N-NTTATG---CTA--GCC-CGGAAC---------------------GTTTAA-TGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71130 : T--AAT-TATCTCCCTTT---AT-T-----TT-A-T---T-T-T-ATTATG---CTT--GTC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-AT-GGTTGA-ATGATTTA-GTTG-ACAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--GGAGAAGATT
gi|71131 : T--AAT-TATCTCCCTTT---AT----------A-T---T-T-T-ATTATG---CCT--GTT-AGGAACATAATTAAAAA-----A-GT-GTTCAG-GGGATTTA-GTTG-ATA--TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71132 : T--AAT-TATCTCCCTTT---AT-T--A---------A-T-T-T-----TA---CTT--TTC-CAGAACATAACTCCCAA-----A-CT-ATTCAA-GAGATTTTTATTA-AT-C-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGATCATT
gi|71133 : T--AAT-TATCTCCCTTT---AT-T--A--T--A-T---T-T-T-ACTATG---TTT--GTC-CAGAACATAACTCTAAA-----A-AT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ACAT-TT-C-AC---AC-AA-AGA------T--AGAGGACATT
gi|71134 : T--AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T------G---CTT--GTC-CTGGGCATTACTCTAAA-----A-GT-GGTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AC-AA-AGA------C--AGAGAACATT
gi|71135 : T--AAT-TATCTCACTTT---AT-T--A--T--A-T---T-T-T-ATTTTG---CTT--GTC-CGGACCATAACTTAACA-----A-GT-GTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------C--AGAGGACATT
gi|71137 : T--AAT-TATCTCCCTTT---AT-T--A-----------------AATACA---CTT--GTC-TGGAGCACAACTCCAAA-----A-CT-ATACAA-GGGATTTT-GTTT-ATTC-TT-C-AC---AA-AA-TGA------T----AGGACATT
gi|71138 : T--GAT-TATCTCCCTTT---AT-T-----TT-A-T---T-G-T-AATATG---CTT--GTC-CGGA-----ACTCAAAA-----T-GT-GTTCGA-GGGATTTA-GTTG-ATAA-AT-C-AC---TT-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71139 : T--AAT-TATCTTCCTTT---AT-T--AA-TT-AAC-A-C-T-T-----------TT--GTC-CAGAGCATAACTGCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------G--GGAGGACATT
gi|71140 : T--AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-T-ATT-T-T-ATTATG---CTG--GTC-CTGAACA-AACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGAATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AT---AC-AA-TTA------T--ACAGGACATT
gi|71141 : T--ATT-TATCTCCCTTT---GT-T--A--T--A-T---T-T-T-ATTATG---CTT--GTT-CGGAACATAACT-AAAA-----A-AT-GTTTCA-GGGATTCA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGAACATT
gi|71142 : T--AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T-A--------CTT--GTC-CTGGCCATGACTCTAAA-----A-GT-GCTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AC-AA-AGA------C--AGAGGACATT
gi|71143 : T--AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T-A--------CTT--GTC-TGGAGCATAACTCTAAA-----A-CA-ATTTAA-GAGATTTT-GTAG-AATT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGATGAAATT
gi|71144 : T--AAA-TATCTTCCTTT---AT-T--A--T--A-T---T-T-T-ATTATG---CTT--GTC-TGGAACATAGCTAAAAA-----A-GT-ATTCAA-AGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AATTTA------T--AGACGACACT
gi|71145 : T--AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T-AC-ACT---TTT--GTT-TGGAGCATAACACCAAA-----A-CT-ATTAAA-GTGATTTT-GTTG-AAAA-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAAGACATT
gi|71147 : T--AAT-TATCTCCCTTT---AT-T--A--T--A-T-A-T-T-T--TTATG---TTT--GTC-CAGAACATAACTCAAAA-----T-AA-GTTCAA-GGGATTTA-GTTT-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAAGACTTT
gi|71149 : T--AAT-TATCTCCCTTT---------A--TT-A-A-A-T-T-T-A--------CTT--GTC-CTGGCCATGACTCTAAA-----A-GT-GCTGAATGGAATTTA-TTTA-A-AC-TG-C-AT---AT-AA-AGA------C--AGAGGACATT
gi|71151 : T--AAT-TATCTCCCTTC---AT-T--GATTT-A-C-A-C-T-T-----------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-ATTG-A-ATATT-C-AC---AA-GA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71153 : --AAT-TATCTCCCTTT---AT-T-----TT-A-T---T-T-T-ATTTTG---CTT--GTC-AGGAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GTGATTAA-GTTT-ATAT-TA-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGATGACATT
gi|71154 : CCCATT---G-----A--TC-A-C-T-T-T-T-AGTATA---CTT--GTT-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGAATTTG-GTTT-ATAT-TT-C-AC---AC-AG-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71155 : agttata--AAT-TATCTCTATTT---AT-C--A--CT-------T-T-T-AGTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-AT-ATTCAA-GAGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---CT-AA-TAA------T--AGAGAACATT
gi|71156 : --AAT-TATACCCATTT---------A--TC-A-C-A-T-T---AGTATA---CTTA-GTCACAAAG-ATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTG-G---------------C---AC-AA-TGA------T--AGAGGACAT
gi|71157 : --AAT-TATCCCCATTT---AT-C--A--CT-------T-T-T-AGTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCATGA-----T-TT-ATTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAC-TT-C-AC---AA-AG-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71158 : --AAT-TATCCCTATTT---AT-C--A--CT-------T-T-T-AGTATA---CTT--GTC-ATAAAGATTACTCAAGA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AAAGGACATT
gi|71160 : --AAT-TATATCCCTTT---AT-A--A--TTTA-C-A-C-T-T-----------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTTAA-AGGATTGT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-AGA------C--TGAGGACATT
gi|71161 : --AAT-TATCTCCCTTT---AT-C--A-----------------AATATA---CTT--GTC-CAGAACATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-GC---AC-AA-TGT------C--TGAGGACATT
gi|71162 : --AAT-TATCTCCCTTT---------A--AT-A-A-A-T-T-T-ATT--------T--GTC-CAGAGCATAACTACAAA-----A-TT-ATTCAA-GGGATTTT-TATG--TATCTT-C-AC---AT-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71163 : --AAT-TATCTCCCTTT---TT-A--A--TTGA-C-A-C-T-T-----------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-GTTCAA-GGGATATT-ATTGAATAT-TC-C--C---AC-AA-TGG------C--TGAGGACAT
gi|71164 : AT-TATCCCCATTT---AT-C--A--CT-------T-T-T-AGTATA---CTT--GCC-ATAAAGATAACTCAAGA-----A-CT-AGTCTA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--GAAATACATT
gi|71165 : T--AAT-TATCT---TAT---TT-T--A--TT-A-A-A-T-T-T-AC-ACT---TTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAATTTAAA-CT-AATCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTC-C-AC---AC-AA-TAA------C--TGAGGACATT
gi|71166 : ttacttttttT-TA-CTCCCTTT---------A--TT-A-T-A-T-C-T-ATTATG---CTT--GTC-CGGACCATAACTCAAAA-----A--------------------GTTG-ATAT-TT-C-GC---AC-AA-TTA------T--AGACGACATT
gi|71168 : T-TA-CTCCTTTT---AT-T--ACTTT-A-C-A-C-T-T-----------TT--GTA-CGGAGCACAACTCCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AT---AC-AA-CGA------C--CAAGGACATT
gi|71171 : TCCATCC---GTCT--G--TT-A-C-A-T-T-T-----------TT--ATC-GGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GAGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71172 : TCCCTTT---AT-C--A--T--A-T---T-T-T-ACTATG---CTT--GTC-CAAAACATAACTATAAA-----ATGT-GATCAA-AGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71173 : TCCCTTT---AT-C--A--T--A-T---T-T-T-ACTATG---CTT--GTC-AAGAACATAACTAAAAA-----ATAT-GATCAA-CGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71174 : TTT---CT-T--G--TT-A-T-A-T-T-TTATTATG---CTT--GCC-CGGAACATAACTCAAAA-----A-GT-TTTCAA-GGGATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT
gi|71175 : TTT---CT-T--G--TT-A-T-A-T-T-TTATTATG---CTA--GTC-CGAAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-ATTA-ATGT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71176 : T-TATATCTCTTT---AT-T--AATTT-A-C-A-C-T-T-----------TT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CC-ATTCAA-GGGATTTT-GTTC-A-ATCTT-C-AA---AC-AA-TGA------C--CGAGAA
gi|71177 : tttgtccTT--GTC-CGGAGCATAACTCCAAA-----A-CT-ATTCTA-GGGATTTT-GTAG-A-AT-TT-TAAT---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71178 : tgtcaacatattT-A-T---T-T-T-ATTATG---CTA--GTC-CGAAACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-GGGAGTTA-ATTA-ATGT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------T--AGAGGACATT
gi|71179 : a-T-T-T-ATTATG---CTA--GTC-CGGAACATAACTTAAAA-------------------GATTTA-GTTG-ATAT-TT-C-AC---AC-AG-TG----------AGAGGACA
gi|71180 : at-T-T-ATCATG---CTA--GTG-CAGTACATAACTCAAAA-----A-GT-GTTCAA-AGGGTTTA-GTTA-TTAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------G--AGAGGCCATT
gi|71181 : -T-T-ATCATG---CTA--GTG-CAGTACATAACTCAAAA-----A-CT-GTTCAA-AGGGTTTA-GTTA-TTAT-TT-C-AC---AC-AA-TTA------G--AGAGGCCATT
gi|71182 : TTATA---CTTTTGTC-CGAAGCATAACTTCAAA-----A-CT-ATTTAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATATT-C-AC---AC-AT-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71183 : --GTC-CGAAGCACAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GTGCTTTT-GTTG-AAAC-TT-C-AC---AC-AA-TGA------C--TGAGGACATT
gi|71184 : --GTC-CAGAGCAAAATTTCAAA-----A-TT-ATTCAA-GTGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AT-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71185 : --GTC-TGGAGCATAACTC-AAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGGCACT
gi|71186 : --GTC-CGGAGTATGACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-GCGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C----AGGACATT
gi|71187 : --GTC-CGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-GTTCAA-AGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-A----AC-AA-TGA------C--AGAGGAC
gi|71188 : --GTT-CGGAGCATAACTGCAAA-----A-CT-ATTCAA-GGGATTTT-GTTG-A-ATCTT-C-AT---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71192 : --GTC-TGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTTAA-GCAATATT-GTTG-A-ATCTT-C-AC---AC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71193 : --GTC-AGGAGCATAACTACAAA-----A-CT-ATTCAA-ACAATTTT-GTTG-A-ATATT-C-AC---TC-AA-TGA------C--AGAGGACATT
gi|71198 : ACTCAAGA-----A-CT-AGTCAA-GGGATTTG-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TAA------T--AGAGGACATT
gi|71199 : CTCAATA-----A-CT-AATTAA-GGGATTTA-GTTC-ATAT-TT-C-AC---AC-AA-TGA------T--AGAGGACATT