lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333333 1
lowQualScore : 11111 22222222222222222222222222222222222222222 33333 5 222222 0 2 0 00
lowQualScore : ..... ......................................... ..... . ...... . . . ..
lowQualScore : 44444 00000000000000000000000000000000000000000 00000 6 444444 4 6 4 66
consensus : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
Reference ( gi|115122 ) : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115123 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115117 : TTTTGTTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115124 : atatTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCATAAGTTTTGCCAACATTAGATT-C--GACCCTTCCC
gi|115125 : TTTCATTTC-----A---T----A-AAT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAATTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115126 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTTGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTGCCC
gi|115105 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------T-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTACTGCCAACATTAGATT-C--AGCCCTTCCC
gi|115133 : ttttgtttaaacataTTTTATTTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-A--GGCCATTTCC
gi|115080 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----GATAG------GGTTGGG-CCCCAAGTTCTGCCAACATGAGATT-C--GGCCCATC
gi|115129 : tagtttataTTTTATGTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CTT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATAAGACT-C--GGCCCTTCCC
gi|115135 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------T-CAT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CGACAAGTTCTGCCAACATTAGAGT-C--GGTCATTCCC
gi|115150 : TTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-T--GGCCCTTCCC
gi|115110 : TTTTATTTC-----A---T----T-ATA---T-T------A-CAT---G-------A-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAAGGTAAGATT-C--GGCCTTTCCC
gi|115151 : taTTTTATTTA-----A---T----A---------T------ATCAT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTTTGCCAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115077 : TTTTATTTC-----AA--T----AGAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GAACGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115141 : tagtttagtttaaacttaTTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115104 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115154 : tttaatttttagtttaaacataTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115153 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115152 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115156 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAGGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115119 : TTTTATTTC-----AA--T----A-ATT---T-----------AT---G-------A-----AATGG------GATCGGT-CCACACGTTCTGACAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115157 : ataTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGA-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCGTCCC
gi|115108 : TTTTATTTC---------T----A-TTC---A-T------A-TATATAG-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGTCCTCCCC
gi|115162 : tatTTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CGT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATCAGATT-A--GGCCCTTC
gi|115159 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAACTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115155 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CGT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCC
gi|115160 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTTGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115142 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTCCTC
gi|115057 : TTTTATTTC---------T----G-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-CCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115158 : taTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAAGATTAGGTT-C--GGTCCGTCCC
gi|115059 : TTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AAGGA------GGTCGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115070 : taTTTTATTTC---------T----A---T---T-T------A-TAT---GTACAG--A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115164 : taTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTTAACATTAGGAT-C--GGCCCGTCC
gi|115165 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGCTGGG-CCACATGTTCTTTCAACGTTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115068 : TTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTGGATT-T--GGCCGTTCCC
gi|115072 : taTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115081 : taTTTTATTTC---------T----A-TCT---A-T------AACAC---GG------A-----AATGG------GGTTGGGTCCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCT
gi|115128 : taTTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115127 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115130 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCATCCCC
gi|115131 : TTTTATTGC-----A---T----A-ACT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGCTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115109 : TTTTATTGC-----A---TTGATA-ATT------------G-CA----G-------C-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTCTCATCATTAGTTA-C--GGCCTTTCCC
gi|115132 : taTTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCATAAGTTCTAGCAACATAAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115134 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAC-AAACG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTAGAAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115103 : TTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115136 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAGCAAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTATAGCAACATTAGTTA-C--GACCCTCCTC
gi|115078 : TTTTATTTCTGTTTA---T----A-AT-------------A-TAG---A-------A-----AATGG------G-TTGGG-TCACAAATTCTTCCAACATTTAATT-A--GGCCCTCTCC
gi|115098 : taTTTTATTGC-----A---T----A-ATTCGCT-T------A--AT---A-------AGC---AAACG------GGTTAGG-CCACAAATTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTT
gi|115146 : attttattgtttaaacataTTTTATTAC-----G---T----A-ATT---CAT------A-TAG---C-------A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT-TATTAC--AGCCCTCCCC
gi|115118 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---G--------A-CAT---AGC-----A-----AACTG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATGAGTCA-C--GACCCTCCCC
gi|115137 : atatTTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT
gi|115061 : TTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115069 : taTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGC
gi|115082 : taTTTATT-------G---T----A-A--------------A-CAT---G-------G-----AATAGCAAAAGGATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGTCCTTCCC
gi|115076 : tattgtattgcTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGAAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACG-TAAAAT-C--GGCCCTTCTC
gi|115067 : tattgtattgcTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCATCGTAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115145 : tattttattgcTTATTTC-----A---T----T-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GATTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGAAT-C--GGCCCTT
gi|115148 : TTATTTT-----AATTT----A-ATT---T-A------T-CAT---G-------A-----AATGG------G-TCGGG-CCACAAGTTCTGCAAACATTAGATC-C--GGCCCTTC
gi|115144 : TTATTGT-----A---T----A-ATT---C--------A-CATTA-G-------C-----AAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATCAG--T-CAAGGCCCTCCCC
gi|115064 : TATTTT-----A---T----T-ACT---T-TTTATATA-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCTCTTCCC
gi|115060 : TTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---G-------T-----AATAGCAAAAGGGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCC
gi|115071 : tattttattgcttTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------AGTTGGG-CCACAAGGTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115063 : tattttattgcttTTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------AATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115079 : tattttattgcttTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------GTTTGGG-CCACATGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCATCCC
gi|115177 : tattttattgctt-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAGCATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115176 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-AGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTCCC
gi|115178 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCAATTCCC
gi|115180 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTTAACATTGGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115182 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTC
gi|115189 : t-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGA-TCACAAGTTCTAGCAACGTTAGTTG-C--GGCACTCCCC
gi|115161 : -ATT---T-A------A-CAT---G-------A-----AATGG------AGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--AGCCCGTCCC
gi|115173 : ttttT---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115172 : ttacaaT---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115099 : ttacaa-T------A-CA------------A-----AA--G------GGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAC-C--GGCCCTTCCC
gi|115184 : attttgttgctttttgtatacatgcggcAT---G-------C-----AAAAG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-A--GGCCATTCCC
gi|115058 : tacaattga---G-------A-----AA--G------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115206 : tattttattgcttttttatatacatgtagtagc-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115205 : tagc-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115181 : tagc-------A-----AATGG------GTCTGG--CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCCC
gi|115073 : tacaatttaaggc-----AACAG------GGTTGGG-CCACAAGTTATACCAACATTATATT-C--AGCCCTCCC
gi|115084 : tgttttattgcttctgtcaaaatggaacagc-----AACGA------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115231 : tatttaattgcttttttgtatgtatacacagaatggcGG------GGTAGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGACCTTCCC
gi|115230 : GG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCC
gi|115208 : G------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115065 : agcaaaaG------GGTTGGA-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115062 : tattttattgctttttaacatatatatatatatacatatataagcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GACCCTTCCC
gi|115209 : tattgtattgctttttaacatataaatataaatataagcaaaaG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGTTA-C--GGCCCGTCCC
gi|115179 : agcaagaG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115075 : tacaattaaaggcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTC
gi|115207 : tatttatattgcgttcttttggtatacaaatagtagcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--TGCCCTCCCC
gi|115210 : tagcaaacG------GATTGGG-CGACAGGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGTCCTTCCC
gi|115066 : agcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-TCAACATTAAAAT-T--GGCCCTTCC
gi|115190 : tattttattgcttttttgtatacacgtagtagcaaaaG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACAATAGATT-C--GGCCATCCCC
gi|115211 : acaacttatggcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTA
gi|115183 : agcaaaaG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTAAACATTAGATT-C--AGCCATTC
gi|115163 : tacaatttaaggcaaacG------GGTTGGG-TCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGACCT
gi|115234 : ttttatacatgtagtagcaaaa------GGTTGGG-CCACATGTTCTGCCAACATTAGACT-C--GGTCCTTTCC
gi|115074 : TTGGA-CCACAAGTTAT-CCAATATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|115083 ): TATTATATTTCTTTTTATTATAATATAGCAATGGAATTGAGTCACACGTTCTTCCAGCATCAGATGTGACCCTTTCC
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 11111 00000000000000000000000000000000000000000 22222 5 222222 0 7 0 00
lowQualScore : ..... ......................................... ..... . ...... . . . ..
lowQualScore : 44444 33333333333333333333333333333333333333333 99999 3 333333 4 6 4 66
consensus : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
Reference ( family-198 ) : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115057 : TTTTATTTC---------T----G-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-CCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115058 : ta---G-------A-----AA--G------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115059 : tattttattgcttttttatatacatgtagtagcTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AAGGA------GGTCGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115060 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---G-------T-----AATAGCAAAAGGGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCC
gi|115061 : tattttattgcttTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115062 : taG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GACCCTTCCC
gi|115063 : tattgtattgctttttaacatataaatataaatataagcaaaaTTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------AATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115064 : tattttattgcttTATTTT-----A---T----T-ACT---T-TTTATATA-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCTCTTCCC
gi|115065 : G------GGTTGGA-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115066 : tattttattgctttttaacatatatatatatatacatatataagcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTATT-CAACATTAAAAT-T--GGCCCTTCC
gi|115067 : tattttattgcttttttgtatacacgtagtagcaaaaTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCATCGTAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115068 : tattttattgcTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTGGATT-T--GGCCGTTCCC
gi|115069 : taTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGC
gi|115070 : taTTTTATTTC---------T----A---T---T-T------A-TAT---GTACAG--A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115071 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------AGTTGGG-CCACAAGGTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115072 : tattttattgcttTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115073 : ta-----AACAG------GGTTGGG-CCACAAGTTATACCAACATTATATT-C--AGCCCTCCC
gi|115074 : tgttttattgcttctgtcaaaatggaacagcTTGGA-CCACAAGTTAT-CCAATATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115075 : tatttgtattgcttttttgtatacatgtagtagcaaaagtaG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTC
gi|115076 : tatttatattgcgttcttttggtatacaaatagtagcaaaaTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGAAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACG-TAAAAT-C--GGCCCTTCTC
gi|115077 : tattgtattgcTTTTATTTC-----AA--T----AGAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GAACGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115078 : tagtttagtttaaacttaTTTTATTTCTGTTTA---T----A-AT-------------A-TAG---A-------A-----AATGG------G-TTGGG-TCACAAATTCTTCCAACATTTAATT-A--GGCCCTCTCC
gi|115079 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------GTTTGGG-CCACATGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCATCCC
gi|115080 : tattttattgcttTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----GATAG------GGTTGGG-CCCCAAGTTCTGCCAACATGAGATT-C--GGCCCATC
gi|115081 : tagtttataTTTTATTTC---------T----A-TCT---A-T------AACAC---GG------A-----AATGG------GGTTGGGTCCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCT
gi|115082 : taTTTATT-------G---T----A-A--------------A-CAT---G-------G-----AATAGCAAAAGGATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGTCCTTCCC
gi|115083 : tattgtattgcTTTTATT-------A---T----A-AT-------------A-TA----G-------C-----AATGG------AATTGAG-TCACACGTTCTTCCAGCATCAGATG-T--GACCCTTTCC
gi|115084 : tattatatttct-----AACGA------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115098 : tatttaattgcttttttgtatgtatacacagaatggcTTTTATTGC-----A---T----A-ATTCGCT-T------A--AT---A-------AGC---AAACG------GGTTAGG-CCACAAATTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTT
gi|115099 : attttattgtttaaacata-T------A-CA------------A-----AA--G------GGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAC-C--GGCCCTTCCC
gi|115103 : attttgttgctttttgtatacatgcggcTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115104 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115105 : tttaatttttagtttaaacataTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------T-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTACTGCCAACATTAGATT-C--AGCCCTTCCC
gi|115108 : ttttgtttaaacataTTTTATTTC---------T----A-TTC---A-T------A-TATATAG-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGTCCTCCCC
gi|115109 : tatTTTTATTGC-----A---TTGATA-ATT------------G-CA----G-------C-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTCTCATCATTAGTTA-C--GGCCTTTCCC
gi|115110 : taTTTTATTTC-----A---T----T-ATA---T-T------A-CAT---G-------A-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAAGGTAAGATT-C--GGCCTTTCCC
gi|115117 : taTTTTGTTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115118 : atatTTTTATTGC-----A---T----A-ATT---G--------A-CAT---AGC-----A-----AACTG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATGAGTCA-C--GACCCTCCCC
gi|115119 : atatTTTTATTTC-----AA--T----A-ATT---T-----------AT---G-------A-----AATGG------GATCGGT-CCACACGTTCTGACAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115122 : ataTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115123 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115124 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCATAAGTTTTGCCAACATTAGATT-C--GACCCTTCCC
gi|115125 : TTTCATTTC-----A---T----A-AAT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAATTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115126 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTTGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTGCCC
gi|115127 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115128 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115129 : TTTTATGTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CTT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATAAGACT-C--GGCCCTTCCC
gi|115130 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCATCCCC
gi|115131 : TTTTATTGC-----A---T----A-ACT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGCTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115132 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCATAAGTTCTAGCAACATAAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115133 : TTTTATTTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-A--GGCCATTTCC
gi|115134 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAC-AAACG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTAGAAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115135 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------T-CAT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CGACAAGTTCTGCCAACATTAGAGT-C--GGTCATTCCC
gi|115136 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAGCAAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTATAGCAACATTAGTTA-C--GACCCTCCTC
gi|115137 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT
gi|115141 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115142 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTCCTC
gi|115144 : TTATTGT-----A---T----A-ATT---C--------A-CATTA-G-------C-----AAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATCAG--T-CAAGGCCCTCCCC
gi|115145 : TTATTTC-----A---T----T-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GATTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGAAT-C--GGCCCTT
gi|115146 : TTTTATTAC-----G---T----A-ATT---CAT------A-TAG---C-------A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT-TATTAC--AGCCCTCCCC
gi|115148 : TTATTTT-----AATTT----A-ATT---T-A------T-CAT---G-------A-----AATGG------G-TCGGG-CCACAAGTTCTGCAAACATTAGATC-C--GGCCCTTC
gi|115150 : TTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-T--GGCCCTTCCC
gi|115151 : TTTTATTTA-----A---T----ATAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTTTGCCAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115152 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115153 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115154 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115155 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CGT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCC
gi|115156 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAGGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115157 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGA-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCGTCCC
gi|115158 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAAGATTAGGTT-C--GGTCCGTCCC
gi|115159 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAACTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115160 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTTGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115161 : -ATT---T-A------A-CAT---G-------A-----AATGG------AGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--AGCCCGTCCC
gi|115162 : ttttTTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CGT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATCAGATT-A--GGCCCTTC
gi|115163 : G------GGTTGGG-TCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGACCT
gi|115164 : ttttatacatgtagtagcaaaaTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTTAACATTAGGAT-C--GGCCCGTCC
gi|115165 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGCTGGG-CCACATGTTCTTTCAACGTTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115172 : T---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115173 : ttacaaT---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115176 : ttacaa-----A---C----A-ATT---T-A------A-AGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTCCC
gi|115177 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAGCATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115178 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCAATTCCC
gi|115179 : tG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115180 : tacaattaaaggcaaaa-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTTAACATTGGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115181 : t-------A-----AATGG------GTCTGG--CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCCC
gi|115182 : tacaatttaaggc-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTC
gi|115183 : tG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTAAACATTAGATT-C--AGCCATTC
gi|115184 : tacaatttaaggcaaacAT---G-------C-----AAAAG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-A--GGCCATTCCC
gi|115189 : tacaattga-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGA-TCACAAGTTCTAGCAACGTTAGTTG-C--GGCACTCCCC
gi|115190 : G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACAATAGATT-C--GGCCATCCCC
gi|115205 : acaacttatggcaaaa-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115206 : tagc-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115207 : tagcG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--TGCCCTCCCC
gi|115208 : tagcaaacG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115209 : agcaaaaG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGTTA-C--GGCCCGTCCC
gi|115210 : agcaagaG------GATTGGG-CGACAGGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGTCCTTCCC
gi|115211 : agcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTA
gi|115230 : agcaaaaGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCC
gi|115231 : GG------GGTAGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGACCTTCCC
gi|115234 : ------GGTTGGG-CCACATGTTCTGCCAACATTAGACT-C--GGTCCTTTCC
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 11111 00000000000000000000000000000000000000000 22222 5 222222 0 7 0 00
lowQualScore : ..... ......................................... ..... . ...... . . . ..
lowQualScore : 44444 33333333333333333333333333333333333333333 99999 3 333333 4 6 4 66
consensus : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
Reference ( family-198 ) : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115057 : TTTTATTTC---------T----G-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-CCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115058 : ta---G-------A-----AA--G------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115059 : tattttattgcttttttatatacatgtagtagcTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AAGGA------GGTCGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115060 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---G-------T-----AATAGCAAAAGGGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCC
gi|115061 : tattttattgcttTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115062 : taG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GACCCTTCCC
gi|115063 : tattgtattgctttttaacatataaatataaatataagcaaaaTTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------AATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115064 : tattttattgcttTATTTT-----A---T----T-ACT---T-TTTATATA-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCTCTTCCC
gi|115065 : G------GGTTGGA-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115066 : tattttattgctttttaacatatatatatatatacatatataagcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTATT-CAACATTAAAAT-T--GGCCCTTCC
gi|115067 : tattttattgcttttttgtatacacgtagtagcaaaaTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCATCGTAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115068 : tattttattgcTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTGGATT-T--GGCCGTTCCC
gi|115069 : taTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGC
gi|115070 : taTTTTATTTC---------T----A---T---T-T------A-TAT---GTACAG--A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115071 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------AGTTGGG-CCACAAGGTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115072 : tattttattgcttTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115073 : ta-----AACAG------GGTTGGG-CCACAAGTTATACCAACATTATATT-C--AGCCCTCCC
gi|115074 : tgttttattgcttctgtcaaaatggaacagcTTGGA-CCACAAGTTAT-CCAATATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115075 : tatttgtattgcttttttgtatacatgtagtagcaaaagtaG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTC
gi|115076 : tatttatattgcgttcttttggtatacaaatagtagcaaaaTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGAAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACG-TAAAAT-C--GGCCCTTCTC
gi|115077 : tattgtattgcTTTTATTTC-----AA--T----AGAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GAACGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115078 : tagtttagtttaaacttaTTTTATTTCTGTTTA---T----A-AT-------------A-TAG---A-------A-----AATGG------G-TTGGG-TCACAAATTCTTCCAACATTTAATT-A--GGCCCTCTCC
gi|115079 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------GTTTGGG-CCACATGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCATCCC
gi|115080 : tattttattgcttTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----GATAG------GGTTGGG-CCCCAAGTTCTGCCAACATGAGATT-C--GGCCCATC
gi|115081 : tagtttataTTTTATTTC---------T----A-TCT---A-T------AACAC---GG------A-----AATGG------GGTTGGGTCCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCT
gi|115082 : taTTTATT-------G---T----A-A--------------A-CAT---G-------G-----AATAGCAAAAGGATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGTCCTTCCC
gi|115083 : tattgtattgcTTTTATT-------A---T----A-AT-------------A-TA----G-------C-----AATGG------AATTGAG-TCACACGTTCTTCCAGCATCAGATG-T--GACCCTTTCC
gi|115084 : tattatatttct-----AACGA------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115098 : tatttaattgcttttttgtatgtatacacagaatggcTTTTATTGC-----A---T----A-ATTCGCT-T------A--AT---A-------AGC---AAACG------GGTTAGG-CCACAAATTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTT
gi|115099 : attttattgtttaaacata-T------A-CA------------A-----AA--G------GGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAC-C--GGCCCTTCCC
gi|115103 : attttgttgctttttgtatacatgcggcTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115104 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115105 : tttaatttttagtttaaacataTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------T-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTACTGCCAACATTAGATT-C--AGCCCTTCCC
gi|115108 : ttttgtttaaacataTTTTATTTC---------T----A-TTC---A-T------A-TATATAG-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGTCCTCCCC
gi|115109 : tatTTTTATTGC-----A---TTGATA-ATT------------G-CA----G-------C-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTCTCATCATTAGTTA-C--GGCCTTTCCC
gi|115110 : taTTTTATTTC-----A---T----T-ATA---T-T------A-CAT---G-------A-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAAGGTAAGATT-C--GGCCTTTCCC
gi|115117 : taTTTTGTTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115118 : atatTTTTATTGC-----A---T----A-ATT---G--------A-CAT---AGC-----A-----AACTG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATGAGTCA-C--GACCCTCCCC
gi|115119 : atatTTTTATTTC-----AA--T----A-ATT---T-----------AT---G-------A-----AATGG------GATCGGT-CCACACGTTCTGACAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115122 : ataTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115123 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115124 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCATAAGTTTTGCCAACATTAGATT-C--GACCCTTCCC
gi|115125 : TTTCATTTC-----A---T----A-AAT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAATTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115126 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTTGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTGCCC
gi|115127 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115128 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115129 : TTTTATGTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CTT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATAAGACT-C--GGCCCTTCCC
gi|115130 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCATCCCC
gi|115131 : TTTTATTGC-----A---T----A-ACT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGCTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115132 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCATAAGTTCTAGCAACATAAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115133 : TTTTATTTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-A--GGCCATTTCC
gi|115134 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAC-AAACG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTAGAAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115135 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------T-CAT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CGACAAGTTCTGCCAACATTAGAGT-C--GGTCATTCCC
gi|115136 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAGCAAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTATAGCAACATTAGTTA-C--GACCCTCCTC
gi|115137 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT
gi|115141 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115142 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTCCTC
gi|115144 : TTATTGT-----A---T----A-ATT---C--------A-CATTA-G-------C-----AAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATCAG--T-CAAGGCCCTCCCC
gi|115145 : TTATTTC-----A---T----T-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GATTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGAAT-C--GGCCCTT
gi|115146 : TTTTATTAC-----G---T----A-ATT---CAT------A-TAG---C-------A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT-TATTAC--AGCCCTCCCC
gi|115148 : TTATTTT-----AATTT----A-ATT---T-A------T-CAT---G-------A-----AATGG------G-TCGGG-CCACAAGTTCTGCAAACATTAGATC-C--GGCCCTTC
gi|115150 : TTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-T--GGCCCTTCCC
gi|115151 : TTTTATTTA-----A---T----ATAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTTTGCCAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115152 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115153 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115154 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115155 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CGT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCC
gi|115156 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAGGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115157 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGA-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCGTCCC
gi|115158 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAAGATTAGGTT-C--GGTCCGTCCC
gi|115159 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAACTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115160 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTTGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115161 : -ATT---T-A------A-CAT---G-------A-----AATGG------AGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--AGCCCGTCCC
gi|115162 : ttttTTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CGT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATCAGATT-A--GGCCCTTC
gi|115163 : G------GGTTGGG-TCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGACCT
gi|115164 : ttttatacatgtagtagcaaaaTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTTAACATTAGGAT-C--GGCCCGTCC
gi|115165 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGCTGGG-CCACATGTTCTTTCAACGTTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115172 : T---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115173 : ttacaaT---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115176 : ttacaa-----A---C----A-ATT---T-A------A-AGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTCCC
gi|115177 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAGCATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115178 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCAATTCCC
gi|115179 : tG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115180 : tacaattaaaggcaaaa-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTTAACATTGGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115181 : t-------A-----AATGG------GTCTGG--CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCCC
gi|115182 : tacaatttaaggc-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTC
gi|115183 : tG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTAAACATTAGATT-C--AGCCATTC
gi|115184 : tacaatttaaggcaaacAT---G-------C-----AAAAG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-A--GGCCATTCCC
gi|115189 : tacaattga-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGA-TCACAAGTTCTAGCAACGTTAGTTG-C--GGCACTCCCC
gi|115190 : G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACAATAGATT-C--GGCCATCCCC
gi|115205 : acaacttatggcaaaa-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115206 : tagc-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115207 : tagcG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--TGCCCTCCCC
gi|115208 : tagcaaacG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115209 : agcaaaaG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGTTA-C--GGCCCGTCCC
gi|115210 : agcaagaG------GATTGGG-CGACAGGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGTCCTTCCC
gi|115211 : agcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTA
gi|115230 : agcaaaaGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCC
gi|115231 : GG------GGTAGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGACCTTCCC
gi|115234 : ------GGTTGGG-CCACATGTTCTGCCAACATTAGACT-C--GGTCCTTTCC
blockSeqs : TGTTT TTACTTTTTATATACATGTAGTAGC TAAGC G CAAAAG T
blockSeqs : . TTTTTGTATACATGTAGTAGC TAAC T CAAAAG A
blockSeqs : . TTTTTGTATACATGTAGTAGC GC C . A
blockSeqs : . TTTTTGTATACATGTAGTAGC . T . T
blockSeqs : . TATTTATATATACAG . T . T
blockSeqs : . TATACATGTAGTAGC . C . T
blockSeqs : . TATACATGTAGTAGC . T . T
blockSeqs : . TATTTATATATACAG . T . A
blockSeqs : . TATTTATATGTACAG . T . G
blockSeqs : . TATACATGTGGTAGC . T . T
blockSeqs : . TATTTATATATACAG . T . G
blockSeqs : . TATACATGTAGAAGC . T . T
blockSeqs : . TATACATGTGGTAGC . C . T
blockSeqs : . TATTCATATATATAG . A . A
blockSeqs : . ATTTAATTTATCATG . T . T
blockSeqs : . TATCTATAACACGG . T . G
blockSeqs : . TAATTCGCTTAATA . T . T
blockSeqs : . TTGATAATTGCAG . T . C
blockSeqs : . TAATTTTTACATG . T . G
blockSeqs : . TAATTGACATAGC . T . G
blockSeqs : . TAATTTTTACATG . C . A
blockSeqs : . TAATTTTTACATG . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATAGC . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATAGC . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATAGC . T . G
blockSeqs : . TAACTCACATAGC . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATAGC . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATAGC . C . A
blockSeqs : . TAATTCACATTAG . C . A
blockSeqs : . TAATTCATATAGC . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATAGC . C . A
blockSeqs : . TAATTTTACATG . C . A
blockSeqs : . TAATTTTACATG . C . A
blockSeqs : . TTATATTACATG . T . G
blockSeqs : . TAATTTTACATG . A . A
blockSeqs : . TAATTTTACATG . T . G
blockSeqs : . TAAATTTACATG . A . A
blockSeqs : . TCATTTTACTTG . C . A
blockSeqs : . TCATTTTACATG . T . T
blockSeqs : . TAATTTTTCATG . T . T
blockSeqs : . TTATTTTACATG . A . A
blockSeqs : . CAATTTAAAGCA . T . A
blockSeqs : . CAATTTAAGGCA . C . A
blockSeqs : . CAATTTAAGGCA . T . G
blockSeqs : . CAATTTAAGGCA . T . G
blockSeqs : . CAATTTAAGGCA . T . G
blockSeqs : . TAATTCACATA . T . T
blockSeqs : . TAATTCACATA . T . T
blockSeqs : . ATAGATCATG . T . T
blockSeqs : . ATAATTTATG . T . T
blockSeqs : . ATATATCATG . T . T
blockSeqs : . ATATATCGTG . T . T
blockSeqs : . TAATATAGA . T . T
blockSeqs : . GATATTTTG . T . T
blockSeqs : . GATATTTTG . T . T
blockSeqs : . TATATCATG . T . T
blockSeqs : . TATACATG . T . G
blockSeqs : . TAAACATG . T . T
blockSeqs : . TAATATAG . T . T
blockSeqs : . ACATG . A . C
blockSeqs : . ACATG . A . C
blockSeqs : . ACATG . T . C
blockSeqs : . ACATG . A . C
blockSeqs : . ACGTG . C . C
blockSeqs : . ACATG . T . C
blockSeqs : . ACATG . T . C
blockSeqs : . ACATG . . . C
blockSeqs : . ACATG . . . C
blockSeqs : . ACATG . . . C
blockSeqs : . ACATG . . . C
blockSeqs : . ACATG . . . A
blockSeqs : . . . C
blockSeqs : . . . C
blockSeqs : . . . C
blockSeqs : . . . A
blockSeqs : . . . A
blockSeqs : . . . G
blockSeqs : . . . A
blockSeqs : . . . A
blockSeqs : . . . T
blockSeqs : . . . G
blockSeqs : . . . G
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : TAATTTTACATG*****************************
originalCons : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
finalCons : TTTTATTTC-----ATAATTTTACATG-----------------------------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 11111 00000000000000000000000000000000000000000 22222 5 222222 0 7 0 00
lowQualScore : ..... ......................................... ..... . ...... . . . ..
lowQualScore : 44444 33333333333333333333333333333333333333333 99999 3 333333 4 6 4 66
consensus : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
Reference ( family-198 ) : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTNCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115057 : TTTTATTTC---------T----G-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-CCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115058 : ta---G-------A-----AA--G------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115059 : tattttattgcttttttatatacatgtagtagcTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AAGGA------GGTCGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCCCC
gi|115060 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---G-------T-----AATAGCAAAAGGGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCC
gi|115061 : tattttattgcttTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115062 : taG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GACCCTTCCC
gi|115063 : tattgtattgctttttaacatataaatataaatataagcaaaaTTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------AATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACGTTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115064 : tattttattgcttTATTTT-----A---T----T-ACT---T-TTTATATA-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCTCTTCCC
gi|115065 : G------GGTTGGA-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115066 : tattttattgctttttaacatatatatatatatacatatataagcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTATT-CAACATTAAAAT-T--GGCCCTTCC
gi|115067 : tattttattgcttttttgtatacacgtagtagcaaaaTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCATCGTAAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115068 : tattttattgcTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AACGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTGGATT-T--GGCCGTTCCC
gi|115069 : taTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGC
gi|115070 : taTTTTATTTC---------T----A---T---T-T------A-TAT---GTACAG--A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115071 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------AGTTGGG-CCACAAGGTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115072 : tattttattgcttTTTTATTTC---------T----A-TTT---A-T------A-TATACAG-------A-----AATGA------GGTTGGG-TCACAAGTTTTTCCAACATTAGATT-C--CGCCCTCCCC
gi|115073 : ta-----AACAG------GGTTGGG-CCACAAGTTATACCAACATTATATT-C--AGCCCTCCC
gi|115074 : tgttttattgcttctgtcaaaatggaacagcTTGGA-CCACAAGTTAT-CCAATATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115075 : tatttgtattgcttttttgtatacatgtagtagcaaaagtaG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTC
gi|115076 : tatttatattgcgttcttttggtatacaaatagtagcaaaaTTT-TTTT-----A---T----A---------T------A-CAT---GTAGAAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACG-TAAAAT-C--GGCCCTTCTC
gi|115077 : tattgtattgcTTTTATTTC-----AA--T----AGAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GAACGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115078 : tagtttagtttaaacttaTTTTATTTCTGTTTA---T----A-AT-------------A-TAG---A-------A-----AATGG------G-TTGGG-TCACAAATTCTTCCAACATTTAATT-A--GGCCCTCTCC
gi|115079 : taTTTC-----A---T----A---------T------A-CAT---GTGGTAGCA-----AA-AG------GTTTGGG-CCACATGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCATCCC
gi|115080 : tattttattgcttTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----GATAG------GGTTGGG-CCCCAAGTTCTGCCAACATGAGATT-C--GGCCCATC
gi|115081 : tagtttataTTTTATTTC---------T----A-TCT---A-T------AACAC---GG------A-----AATGG------GGTTGGGTCCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCT
gi|115082 : taTTTATT-------G---T----A-A--------------A-CAT---G-------G-----AATAGCAAAAGGATTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGTCCTTCCC
gi|115083 : tattgtattgcTTTTATT-------A---T----A-AT-------------A-TA----G-------C-----AATGG------AATTGAG-TCACACGTTCTTCCAGCATCAGATG-T--GACCCTTTCC
gi|115084 : tattatatttct-----AACGA------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--AGCCCTTCCC
gi|115098 : tatttaattgcttttttgtatgtatacacagaatggcTTTTATTGC-----A---T----A-ATTCGCT-T------A--AT---A-------AGC---AAACG------GGTTAGG-CCACAAATTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTT
gi|115099 : attttattgtttaaacata-T------A-CA------------A-----AA--G------GGTTTGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAC-C--GGCCCTTCCC
gi|115103 : attttgttgctttttgtatacatgcggcTTTTATTGC-----T---T-------TT---T-TGTAT--A-CAT---GTAGTAGCA-----AA-AG------GGTTGGG-CCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGCCCTTCCC
gi|115104 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115105 : tttaatttttagtttaaacataTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------T-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTACTGCCAACATTAGATT-C--AGCCCTTCCC
gi|115108 : ttttgtttaaacataTTTTATTTC---------T----A-TTC---A-T------A-TATATAG-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGTCCTCCCC
gi|115109 : tatTTTTATTGC-----A---TTGATA-ATT------------G-CA----G-------C-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTCTCATCATTAGTTA-C--GGCCTTTCCC
gi|115110 : taTTTTATTTC-----A---T----T-ATA---T-T------A-CAT---G-------A-----AATTG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAAGGTAAGATT-C--GGCCTTTCCC
gi|115117 : taTTTTGTTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115118 : atatTTTTATTGC-----A---T----A-ATT---G--------A-CAT---AGC-----A-----AACTG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATGAGTCA-C--GACCCTCCCC
gi|115119 : atatTTTTATTTC-----AA--T----A-ATT---T-----------AT---G-------A-----AATGG------GATCGGT-CCACACGTTCTGACAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115122 : ataTTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115123 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115124 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCATAAGTTTTGCCAACATTAGATT-C--GACCCTTCCC
gi|115125 : TTTCATTTC-----A---T----A-AAT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAATTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115126 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-TT-----A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTTGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGCCCTGCCC
gi|115127 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115128 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CTACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115129 : TTTTATGTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CTT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATAAGACT-C--GGCCCTTCCC
gi|115130 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCATCCCC
gi|115131 : TTTTATTGC-----A---T----A-ACT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGCTCTAGCAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115132 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCATAAGTTCTAGCAACATAAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115133 : TTTTATTTC-----A---T----C-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-A--GGCCATTTCC
gi|115134 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAC-AAACG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTAGAAACATTAGTTA-C--GGCCCTCCCC
gi|115135 : TTTTATTTC-----A---T----A-ATT---T-T------T-CAT---G-------A-----AATAG------GGTTGGG-CGACAAGTTCTGCCAACATTAGAGT-C--GGTCATTCCC
gi|115136 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---A-------ATAAGCAAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTATAGCAACATTAGTTA-C--GACCCTCCTC
gi|115137 : TTTTATTGC-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT
gi|115141 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115142 : TTTTATTTC-----A---G----ATATT---T-T--------------G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTCCTC
gi|115144 : TTATTGT-----A---T----A-ATT---C--------A-CATTA-G-------C-----AAACG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATCAG--T-CAAGGCCCTCCCC
gi|115145 : TTATTTC-----A---T----T-ATT---T-T------A-CAT---G-------A-----AATGG------GATTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGAAT-C--GGCCCTT
gi|115146 : TTTTATTAC-----G---T----A-ATT---CAT------A-TAG---C-------A-----AACGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATT-TATTAC--AGCCCTCCCC
gi|115148 : TTATTTT-----AATTT----A-ATT---T-A------T-CAT---G-------A-----AATGG------G-TCGGG-CCACAAGTTCTGCAAACATTAGATC-C--GGCCCTTC
gi|115150 : TTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-T--GGCCCTTCCC
gi|115151 : TTTTATTTA-----A---T----ATAT---------------CAT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTTTGCCAACATTAGATC-C--GGCCCTTCCC
gi|115152 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115153 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115154 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115155 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CGT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCC
gi|115156 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAGGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115157 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGA-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGATT-C--GACCCGTCCC
gi|115158 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAAGATTAGGTT-C--GGTCCGTCCC
gi|115159 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAACTTCTTTCAACATTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115160 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTTGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115161 : -ATT---T-A------A-CAT---G-------A-----AATGG------AGTTGGG-CCACAAGTTCTTTCAACATTAGGTT-C--AGCCCGTCCC
gi|115162 : ttttTTTTATTTC-----A---A----T-ATA---T----------CGT---G-------A-----AATGG------GGTCGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATCAGATT-A--GGCCCTTC
gi|115163 : G------GGTTGGG-TCACAAGTTAT-CCAACATTAAAAT-C--GGACCT
gi|115164 : ttttatacatgtagtagcaaaaTTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTTTAACATTAGGAT-C--GGCCCGTCC
gi|115165 : TTTTATTTC-----A-------------------------A-CAT---G-------A-----AATGG------GGCTGGG-CCACATGTTCTTTCAACGTTAGGTT-C--GGCCCGTCCC
gi|115172 : T---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115173 : ttacaaT---T-T------A--AT---G-------C-----AAAAG------GTTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCC
gi|115176 : ttacaa-----A---C----A-ATT---T-A------A-AGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTCCC
gi|115177 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAGCATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115178 : t-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCAATTCCC
gi|115179 : tG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115180 : tacaattaaaggcaaaa-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTTAACATTGGATT-C--GGCCATTCCC
gi|115181 : t-------A-----AATGG------GTCTGG--CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-C--GGCCATTCCC
gi|115182 : tacaatttaaggc-----A---C----A-ATT---T-A------A-GGC---A-------A-----AA--G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATT-T--GGCCATTC
gi|115183 : tG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTAAACATTAGATT-C--AGCCATTC
gi|115184 : tacaatttaaggcaaacAT---G-------C-----AAAAG------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACATTAGATA-A--GGCCATTCCC
gi|115189 : tacaattga-----A---T----A-ATT---C--------A-CAT---AGC-----A-----AACGG------G-TTGGA-TCACAAGTTCTAGCAACGTTAGTTG-C--GGCACTCCCC
gi|115190 : G------GGTCTGG-CCACAAGTTCTCTCAACAATAGATT-C--GGCCATCCCC
gi|115205 : acaacttatggcaaaa-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115206 : tagc-------A-----AATGG------G-TTGGG-CCACAAGTTCTCTCAAC-TTAGATT-C--GGCCCTTCCC
gi|115207 : tagcG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTAGCAACATTAGTTA-C--TGCCCTCCCC
gi|115208 : tagcaaacG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGCCCTTCCC
gi|115209 : agcaaaaG------GGTTGGG-TCACAAGTTCTGCCAACATTAGTTA-C--GGCCCGTCCC
gi|115210 : agcaagaG------GATTGGG-CGACAGGTTCTACCAACATTAGTTA-C--GGTCCTTCCC
gi|115211 : agcaaaaG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTACCAACATTA
gi|115230 : agcaaaaGG------GGTTGGG-CCACAAGTTCTTCCAACATTAGATT-C--GGCCCTCC
gi|115231 : GG------GGTAGGG-CCACAAGTTCTGCCAACATTAGATT-C--GGACCTTCCC
gi|115234 : ------GGTTGGG-CCACATGTTCTGCCAACATTAGACT-C--GGTCCTTTCC