lowQualScore : 222 1 1 22222 11111111111111 5555555555555 11 11 11 111 1 111 3333333333333 1 1111
lowQualScore : 7 333 7 3 3 1 33 3 0 5 0 2 0 3 8 3 55 1 11111 0 1 5555 2 2 666 33 666 44444444444444 33 2222 333 11 0 11 9999999999999 1111 22 6 0 11 22 00 0 1111 0 00 888 1 00 00 1111 1 111 00 1 0 33333 8888888888888888888 1111 0000000000000 111 2 888 0 5555555555555555555555555 11111111 2222222 1111 6666 4 4 66 0 0 1111 5
lowQualScore : . ... . . . . .. . . . . . . . . . .. . ..... . . .... . . ... .. ... .............. .. .... ... .. . .. ............. .... .. . . .. .. .. . .... . .. ... . .. .. .... . ... .. . . ..... ................... .... ............. ... . ... . ......................... ........ ....... .... .... . . .. . . .... .
lowQualScore : 3 333 3 2 5 2 55 2 0 5 8 5 8 2 0 2 44 4 22222 4 4 3333 4 4 999 22 222 88888888888888 11 3333 999 00 7 00 6666666666666 4444 66 8 7 88 00 99 6 3333 6 99 666 0 88 88 2222 2 000 88 1 6 11111 6666666666666666666 8888 2222222222222 666 8 888 5 7777777777777777777777777 77777777 3333333 5555 8888 6 8 00 7 7 6666 2
consensus : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATANACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGNTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCGC
Reference ( gi|52244 ) : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-C-TTT-A-A--GCTT----TCT-CTTTAGTA-AGCGATGG-CAA--GT-TTATT----GA-A--T-AGCAAATA--G--GAAGG----T-CG--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C-T-T------------------------GT--------TCGTC-------AATG----TTT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAAT-G---CGTGACTTTGTCGC
gi|52245 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-C-TTT-A-A--GCTT----TCT-CTTTAGTA-AGCGATGG-CAA--GT-TTATT----GA-A--T-AGCAAATA--G--GAAGG----T-CG--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C-T-T------------------------GT--------TCGTC-------AATG----TTT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAAT-G---CGTGACTTTGTCGC
gi|52243 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-C-TTT-A-A--GCTT----TCT-CTTTAGTA-AGCGATGG-CAA--GT-TTATT----GA-A--T-AGCAAATA--G--GAAGG----T-CG--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C-T-T------------------------GT--------TCGTC-------AATG----TTT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAAT-G---CGTGACTTTGTCGC
gi|52247 : AACTATGA-TACTGAACATTTAAA--TAAAAAC--AATAGATACAT---TATA-TAAGTTATTGA-CTCTGAGCTGACGATA-TGA--------------TGAGCTTTAAC----A-CT-T---T-CTT---TGAAATACG------TAG-T----T---T--AAA-G--ATGCAATACCT-A-T-----A--ACTT----TTT-GTTCAGTA-AAAGATTG-AAA--GA-GTATT----GA-A--C-CTCAAACA--G--GAAAG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCTG-T-C-
gi|52248 : TAAATATTAAAAAAACAAAAAAACAGAATCAAT-ATTAA--------TTT---TTA-TGAAAATTTAAAGCATTTAAATTTCAATCGATA-CT-TAC-TACTTG--T--------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-G-TT-------ACTT----TCT-GTTTAGTA-AACGATGG-AAA--GT-TTATT----AA-C--T--TTAAAGT--G--GAAGA----A-CC--C--A-T-TTGAAG-----A-----------------catatggcttatcttatttataagaaaggtcggaattttccgttttattcgccgatgttttagcataacccgatattgaccaatgagcaaatttaccgc
gi|52250 : TACGATGGTGAGAATGTAAAT--------TTTCAAC----A-TT-T---T-GTC---TGAAATGAAGAAAATTA--T----TGATT--AAA-G--ATGCATCACCT-------A-A--ACTT----TCT-GTTCAATA-AATGTTGG-AAA--ATATTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----------------------GTT----T------TGGTTGAT---TCCG-T-C-T-TTATAGATTATCATATTTATGAAAAAT--------TCGTCATTACACAATG----TAT---TAGCATAACACGATAC-CG-GCCAAT-G---AGTGACTTT
gi|52253 : AAATTT--GC----A-TT-T---T-GTTACAC--------------TA--T----T---TTTAAG-G--ATGTATCACTT-A-AAT-A-A---CTT----TCT-GATCAGTA-AATGATAG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAATA--G--AGCGA----T-AT--C--A-T-TCAAAG-----A-----------------
gi|52254 : AATTTTAAT----A-TA-T---T-CTC---T---------------A--T-----------AAA-G--ATGCATTGCTT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAATA-CATTATAG-CAC--GT-TTATT----GA-A--T-CTCAAAGC--G--GAATG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------taatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcggcattttccgttttattcgtcaatgttttagcctaacccaatacgcgcgccaatgagtgactttatc
gi|52256 : TTAAC----A-CC-T---T-TTT---T--------------TA--A----GA--T--AAA-G--ATGCATCACCG-G-T-----A--ATTT----GCT-ATCCAGTA-AATGATGG-CAA--GG-T-ATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GCAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TTCGTT-C-T-T------------------------GT--------tattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcggcattttccattttattcgtcaatgttttagcataacccgatactggccaacgagtg
gi|52257 : TTAAG----A-TT-TCGGT-CTT---TC-------------TC--T----T---T--AAA-G--ATGTATC--CA-C-TAT-A-A---CTC----TCT-TTTTAGTA-AATGATGG-AAA--AT-GTATT----GA-A--C-AATAACGA--C--GATGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------
gi|52259 : CAAC----A-TT-T---T-CTA---C--------------CA--TACTGT---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TTT-GTTCAGTA-AATGATAG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CAC------------AGT----T-CC--C--A-T-TCGAGG-----A-----------------
gi|52260 : AAC----AATTAT---T-GTT---T--------------CA--T----T---C--AA--G--AGACATCAACT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGCA-AATGATGG-AAA--TT-TCATT----TT-A--T-CTCAACGA--G--GCAGG----T-CC--C--A-T-TTGAAG-----A-----------------TAA----TGGGAAAT------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TTGTC-------AATA----TTT---CAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-A---AGTGACTTTATC
gi|52262 : AC----A-TG-T---A-CGT---T--------------TA--T----TGT-T--TAA-G--ATGCATTACCA-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAAA--A--AAAGG----T-CA--C--A-T-TTGATG-----A-----------------
gi|52264 : AT----A-TT-T---A-TTT---T--------------TAACC----T---T--AAA-A--GTGCATTACCT---------A----TT----TCT-GTTGCGTA-AATGATGG-AAA--AC-TTACT----GA-A--T-TGCAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TAGAAG-----ATAAT-------------GC-----T------TGA----T---TTCG-TCC-T-T------------------------GT--------tttatcttatttatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtcattttccatttcattcatcagtgttttagcataacccgatactacccaatgagtgactttattgc
gi|52266 : C----A-TT-T---T-AAT---TAA------------TA--T----TAC-T--AAA-G--ATGCATGACTT-A-T-----A--ACTT----TAT-GTTCAGTA-CATGTTGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--AAAGG----T-CG--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------
gi|52268 : ----A-TT-T---T-ATTA--T--------------TA--C----T---C--AAA-G--ATGTATCA--T-C-TAT-A-A--G-TA----TCT-GTTCAATA-AATGATGG-AAC--GT-TTATT----GA-A--T-AACACAGA--G--GAAGT----T-CC--C--A-T-TTGAAG-----A-----------------TAA----T------G------T---TTCA-T-T-C-T------------------------GT--------
gi|52267 : ----A-TT-T---T-GTT---T--------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGC--CACAT-C-ATT-A-A---CTT----TCT-ATTCATTA-AATGATGG-AAA--TG-TTATT----GA-A--T---CACATAGCG--GAAGG----T-TC--T--A-T-ACAAAG-----A-----------------TAA----TCG----T------TGAGTCCGTT-C-T-T------------------------GT--------
gi|52269 : -TT-T---T-TTT---T--------------TC--T----C---T--TAA-G--ATGCAACACCT-A-T-----A--ACTT-----CT-GTTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TCATT----GA-A--T-CACAAACA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-GCGAAG-----ATAAT-------------GGA----T------GA-----T---TCTG-T-C-T-T------------------------
gi|52272 : ---T-CTT---T--------------C---T----T---T--AA--G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----CCC-GTTCAGTA-A-TGATTG-AAA--GT-TTATT----AA-A--T-CGCAAAGA--T--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------
gi|52274 : TT---T--------------CA--T----A---T--AAA-G--ATACATCAGCT-A-T---A-A--A-TT----TCT-GTTCAGTA-AATTTTTA-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCAAAG-----A-----------------TAA----TAGC---TGA----T---TCCG-T-C-CAT------------------------GT--------TTTTT-------AAT
gi|52276 : T---T--------------TA--C----T---T--AAA-G--GCGCATCACCT-A-----A-A--ACTT----TCT-ATTCAGTA-GATGATGG-AAT--AT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-C---C--A-T-TCGAAT-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52280 : ---T--------------TA--A----T---T--AAA-ATTATGCATC--CT-C-TAT-A-A---CTT----GCT-GTTCAGTG-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------AAA----TGG----TTGA---T---TGCG-T-C-T-T------------------------
gi|52281 : ---T--------------TG--C----T---T--TAA-G--ATGCATCACAA-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAATA-TATTATGA-AAA--GT-GTATC----AA-A--T-CGCAAAGA--G--ACAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TCACGG-T------TGA----T---TCCA-TCC-T-T------------------------GTAGTTTATCTCATT-------TATGAGAATTT---TAGCATAACCTGATAC-TG-ACAAAT-G---AGT
gi|52282 : ---T--------------TAC-T----T---T--AAA-G--ATGCATCAACT-A-T-----A--ACAT----TCT-GTTCAGTA-AATGATTG-AAA--AT-GTATT----GA-A--T-CACAAAGA--A--GAAGG----T-TC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52283 : ---T--------------TA--T----T------AAA-G--ATACGTCACCT-A-T-----A--ACTT----T-T-GTTCAGTA-AATGAATG-AAA--AT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--T--GAAGG----T-CT--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCGTT-C-T-T------------------------GT--------
gi|52284 : --------------TA--G----T---T--AAA-G--ATGCAATACCT-G-T-----A--ACTT----TCT-GTTCTGTA-AATTATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-AACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCAAAG-----A-----------------
gi|52286 : --------------TG--T----T---T--GAA-G--ATGCCTCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGCA-AACGATTG-AAG--GT-TTATT----GA-A--T-CAAAAAGA--G--GGAGG----T-CC--C--A-T-TCAAAG-----A-----------------TGA----TGG----T------TGAATCCA-T-C-T-T------------------------GT--------
gi|52287 : --------------TA--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ATTT----TCT-GCTCAGTA-AATGATGG-AAA--AT-GTATT----GA-A--T-AACAAAGA--G--TCAAA----T-CC--C--A-T-TCAAAG-----A------------------CA----A------TGGCTGAT---TCCGTT-C-T-T------------------------GT--------
gi|52290 : --------------TA--C----T---T--AAA-G--TTGCATCACCT-A-T-----A--GCTT----TAT-GTTCAGTT-AATGTTGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAAA--G--GAAGG----T-CC--C--A-C-TCTAAA-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52292 : --------------TG--T----T---T--TAA-G--ATGCATCAACT-A-T-----A--ACTT----TCT-ATTCAGTA-AATGAAGG-AAA--AT-TTATT----GACA--C-A-CAAAGA--T--GAAGG----TCCG--C----T-TCGAAGATA--A-----------------GTG----T------TGA----T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52291 : --------------TG--T----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTCTAGTA-GATGATGG-AAT--AT-CTTTT----AA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--T-T-TTAAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-T-CAT-T------------------------GT--------
gi|52293 : --------------TA--TG---T---T--AAA-G--ATGCGTCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTAATTA-AATGATGG-CAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAA--------GAGG----T-CA--C--A------AAG-----A-----------------CCA----agtttattcaattcgttaatacacagatcggcattttccgtcttattcgtcaatgttttagcataatccgatactaagcaat
gi|52289 : --------------TA--C----T---T--AAAAG--ATGCGTCACCT-A-T-----A--CCTT----TCT-GTTCAGAA-AATGATGG-GAA--AT-TAATT----GA-A--T-AACAAAGA--G--GAAGG----
gi|52295 : A--C----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTCCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-GTATT----GA-A--T-AACAAAGA--A--GAAGG----T-CA--C--A-T-TAGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------aattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttggcattttccgttttattcttcaatgcttagcataacccgacactggccaatcgcg
gi|52296 : A--T----T---T--AAA-G--ATGCATCATCT-C-T-----A--ACTT----TAT-GTTCGGTACATTGATGA--AA--TT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------
gi|52297 : A--T----G---T--AAA-G--ATGCATCATCT-C-TT-------ACTT----TAT-GTTCGGTA-AATGATGA-AAT--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----C-CC--C--A-T-TCAAAG-----A-----------------
gi|52300 : A--C----T---T--AAA-G--ATGCATCAC---C-TTT-A-A---CTT----TCT-GTTCAGTA-AGTGTTGG-AAA--G-----TT----GA-A--T-CCAAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-C-TCAAAG-----A-----------------
gi|52305 : --T----T---T--AAA-G--ATGCATCACTT-A-T-----A--ACTT----ACT-CTTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-GACAAAAA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TTGAAG-----A-----------------
gi|52306 : --T----T---T--AAA-G--ATGCACCATCT-A-T-----A--GCTT----TCT-GATCAGTA-AATGATGGACAA---T-TTGTT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----C-CC--C--A-T-CCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52308 : --T----T---T--AAA-G--ATGCCTCACGT-A-T-----A--ATTT----TCT-GTTCAGCA-AATTATTG-CAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-TC--C--A-T-CCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTG----T---TCCG-T-CAT-TTAA---------------------GT--------TTATC-------A
gi|52311 : --T----T---T--AAA-G--GTACATCACCC-C-C-----A--ACTT----TCC-GTTAAGTA-AATGATGG-CAA--AT-TTATT----GA-A--T-CATAAAGA--G--TTGGG----T-TC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----TAG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52310 : --T----T---T--AAA-G--GTACATCACCC-C-C-----A--ACTT----TCC-GTTAAGTA-AATGATGG-CAA--AT-TTATT----GA-A--T-CATAAAGA--G--TTGGG----T-TC--C--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----TAG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52309 : --T----T---C--AAA-A--ATGCATCACCTACATGT-ATA--ACTT----TCT-GTTCAGTA-A-TGGTGG-AAA--CT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GCAGG----T-C---C--ATT-TCGAAG-----A------------------CAATGGT------TGA----T---TCCG-T-C-C-T------------------------TT--------TAGT
gi|52313 : --T----T---C--AAA-G--ATGCATCACCTAC-------A--ACTT----TGT-GTTCAGTA-AATGATGG-AAA--CT-GAATT----GA-A--T-CATGAGGA--G--GGAGG----T-CA--C--A-T-TTGAAG-----A-----------------TAA----TGGTCGAT------T---TCTG-T-C-T-T------------------------GT--------
gi|52307 : --T----T---T--AAA-G--ATGTATCACCT-A-T-----A--ATTT----TCT-GTTCAATA-A-TGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--T--GAATG----TCCG--T----T-TCGAAG-----A-----------------
gi|52317 : ----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----T-T-GTTCAGTA-AATGATGG-AAT--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAATA--G--GGAGG----T-CT--T--A-T-TTGAAG-----A--------------------------------------T---TCTG-TCC-T-T------------------------GT--------tgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacaggtcgtcaaagttttagtataaaccgataccggccaatgaatgactttatcgc
gi|52318 : ----T---T--AAA-G--GTGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGTG-GATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--AAAGT----A-CA--C--A-T-TTGAAG-----G-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52319 : ----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGTA-AATGATGA-AAA--AA-TTATT----GA-A--T---CAAAAA--GTTGAAGG----T-CC--C--A-C-TCGAAG-----A------------------TA----T------TGGCTAAT---TCCGTT-C-T-T------------------------AT--------
gi|52320 : ----T---T--AAA-G--ATACATCACCT----TT-A-A---CAT----TCT-GTTCCGTA-AATGACGG-AAA--GT-T-ATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGG----T-CC--C--A-T-TCAAAGTTGATA-----------------G------T------TAA----T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52321 : ----T---T--AAA-G--ATGCA-CACCT-A-T-----A--ATTT----TCT-GTTCAGTA-AATGGTGG-CAA--GT-TCATT----GA-A--T-CACAAAGT--G--GAAGG----T-TC--C--A-T-TTGAAG-----
gi|52322 : ----T---T--AAA-C--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAATA-AATGTTGT-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GAAGA----T-CC--C--A-T-TTGAAT-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52323 : ----T---T--AAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAATA-AATGATGT-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAGA-------GAAGT----T-C---C--A-T-TCGAGG-----A-----------------
gi|52316 : ----T---T--CAA-G--ATGCATCACCT-A-T-----A--TTTT----TCTGCTC--GTA-TATGACGC-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--G--GTAGG----T-CC--G--A-T-TCGAAG-----A-----------------
gi|52324 : ----T---T--AAA-G--ATACATCAACT-A-T-----A--ACTT----TCT-CTTCAGTA-AATGATGA-AAC--AT-TCATT----GA-A--T-CACAAAAA--G--GAAGGAAGAC-CC--C--A-T-TTGAAG-----A-----------------taatggttgactcactccttgtaaacaggtcggtattttccattttattcgtcaatgtttcggcataacccgatactggccaatgggacgtgatttagt
gi|52325 : ----T---T--AAA-G--ATACATCACTT-A-T-----A--ACTT----TGT-GTTCAGTG-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAAA--G--GCAGA----T-CC--T--G-T-TTGAAG-----A-----------------
gi|52326 : ----T---T--AAA-G--ATGAATCACCT-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGTA-AATTATGG--AACTGT-TT-TT----GA-C--T-CACAAACA--G--AAAGG----T-CT--C--A-T-TCGAAA-----A-----------------TAA----TAA----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52332 : ---T--AAA-G--ATGCATCTCAC-C-TAC-A-A---CTT----TCT-GTTCAGTA-AGTGCTGG-CAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAAGA--T--GAGTG-------------------GAAG-----A-----------------TAA----TGG----T------T---TCCGTT-C-T-T------------------------GT--------
gi|52335 : TGCATCATGT-T-TTCCA-ACGGCTTCAAGTTT-CTT------AGAGATGA--AA--GT-GTACT----GA-A--T-CACGAAGA--G--GAAGG----T-TC--C--A-T-TCGAAG-----ATAATGGTTGATTCTCCAGCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTA---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATTGCagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcggccttttccgttttattcgtcaatgtttaaatagcataactcgacactagtcgatgtgtgaccttatagc
gi|52336 : CATCACCA-A-T-----A--ACTT----TCT-GTTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CATAAAGA--G--GAAGG----T-CC--A--A-T-TCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-TCC-T-T------------------------GT--------
gi|52340 : -A--GCTT----TCT-GTTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----GA-A--T-CACAAACA--G--GAAGG----T-CT--T--A-T-TCAAAG-----
gi|52339 : -A--GTTT----TTT-CTTATGTA------TGA-GAA--AT-TTGTT-----A-A--T-A---AACA--G--GTAGG----T-------------------------------------------A----T------T------T---CCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATGACCCGGTAC-TG-ACCAAT-G---GTTGACTTTATCG
gi|52342 : TTCAGTA-AATGATGG-AAA--GT-TTATT----T--A--T-CACAAAAA--G--GAAGG----T-TG-----A-T-TC
gi|52344 : CGTTGT-CAA--TC-TTATTTTGAGA-AATT-AGTAAATA----------------CA--C--A-TGTCG--------------------------GCA----T------T------T----CAA-T-A-T-T------------------------AT--------TCGTG-------AATG----TTT---TAGCATAACCCAATAC-TA-GCCAAT-G---CGTGATTTTATCGcatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttggcatgttctattctattcgtcaatgttttagcataaatcgatactggccaatgagtgactttattgc
gi|52291 : A--GT-TTATT----CA-A--TTCGTTAATA--C--ACAGA----T-CG--------------------------------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAATCCGATAC-TA-AGCAAT-
gi|52347 : tgtttaaagatgcatcacctataactttctgtctagtagatgatggaatatcttttaaatcacaaagaggaaggtcccttttaaagataatggttgattccgtcattgtGTAAATA--C--ACAGG----T-CG--------------------------------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-C-T------------------------AT--------TCGTC-------GATG----TTT---AAGCATAACCCAATAA-TG-GCAAAT-G---AATGACTTTATCGC
gi|52253 : AATA--C--GTAGG----T-CG--------------------------------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCCTAACCCAATACGCGCGCCAAT-G---AGTGACTTTATC
gi|52348 : aaatttgcattttgttacactatttttaaggatgtatcacttaaataactttctgatcagtaaatgatagaaagtttattgaatcacaaatagagcgatatcattcaaagataatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtATA--A--GAAAT----T-CGATC--A-T-ACACAGTTC--G-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCATC-------AATG----GTT---TAGCATAACGCAATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGATTTTATCGC
gi|52349 : ATA--G--GAAAT----T-CG--TTAA-T-ACACAG-----ACCA--------------GCA----T------T------T---TCCC-T-T-T-T------------------------AA--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCAAAT-G---AGTGACTTTATC
gi|52254 : TA--T--GAAGG----T-CG--------------------------------------GCA----T------T------T---TCCA-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAC-G---AGTG
gi|52247 : aattttaatatattctctataaagatgcattgcttataactttctgttcaatacattatagcacgtttattgaatctcaaagcggaatgtcccattcgaagatattggataattacgtcattgtagtttatcttattA--G--AAAGG----T-CG--------------G-----A-------------------A----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGCC-------GATG----TTT---TAGCATAACCCGATAT-TG-ACCAAT-G---AGCAAATTTACCGC
gi|52332 : aactatgatactgaacatttaaataaaaacaatagatacattatataagttattgactctgagctgacgatatgatgagctttaacactttctttgaaatacgtagtttaaagatgcaatacctataactttttgttcagtaaaagattgaaagagtattgaacctcaaacaggaaagtcccattcgaagataattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataG--C--AGT-TCG--------------------------GCC----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTTAAATAGCATAACTCGACAC-TA-GTCGAT-G---TGTGACCTTATAGC
gi|52350 : taaagatgcatctcacctacaactttctgttcagtaagtgctggcaagtttattgaatcacaaagatgagtggaagataatggtttccgttcttgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgt--C--A-C-TGGAAG-----------------------GTG----T------T------T---TCCA-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------GATG----TTT---TAGCATAACCCGAAAC-TG-GCCAAT-G---AGCAACTTTATCGC
gi|52351 : --A-T-TCAAAG-----GTCG--------------GCA----T------T------T---TCCG-A-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---AAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAAT-G---AGTGTCTTTATCGC
gi|52352 : GAAG-----------------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATGACCCGGTCC-CG-GCCAAT-G---GTTGACTTTATCGC
gi|52354 : G-----A-----------------GAA----T------T------T---TCCA-T-T-T-T------------------------AT--------TTGTC-------GATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-ACCAAT-T---TGTGACTTTA
gi|52356 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TCTG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCGATAT-TA-GCCAAT-G---AGTGACATTATCGC
gi|52357 : -----A-----------------ACA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------GATG----TTT---TAGTATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCG
gi|52358 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------ACTG----TTT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCCAAT-G---TGTGACTTTA
gi|52360 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TTTA-T-T-T-T------------------------AT--------TCATC-------AATG----TTT---TAGTATAGCCTGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCG
gi|52355 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TCCA-T-T-T-T------------------------AC--------TCGTC-------AGTG----TTT---TAGCATAACCTGATTC-TG-GCCAAT-T---AGTGACTTTATCAC
gi|52367 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------GATG----TTT---TAGCATAACCCGATAA-TG-GCCAAT-G---TGTAACTTTATCGC
gi|52369 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAAT-G---AGTGACTCTATCGC
gi|52370 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGCC-------AATG----TTT---TAGCATAACCATTTAC-TG-ACCAAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52371 : -----------------GCA----T------T------T---TCCT-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TCT---TAGCATAACCAGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52375 : -----------------GCA----T------T------T---TCTG-T-T-T-T------------------------GT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCGATAA-TT-GCCGGT-G---GGTGACTTTATCGC
gi|52378 : -----------------GCT----T------T------T---TCTG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------ATTG----TTT---TAGTATAACCTGATAT-TG-GCCAAT-G---TTTGACTTTATCGC
gi|52380 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----ATT---TAGCATAACCCTATAC-TG-GCCATT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52368 : -----------------GCA----T------T------T---TCCA-T---T-T------------------------AT--------TTGTC-------AACA----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52384 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-A------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAACAAAACCCGATAC-TG-ACCAAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52316 : -----------------GTA----T------T------T---TCCA-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---CGGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-GGGACGTGATTTAG
gi|52386 : ttcaagatgcatcacctatatttttctgctcgtatatgacgcaaagtttattgaatcacaaagaggtaggtccgattcgaagataatggttgactcactccttgtaaacaggtcg-----------------GCA----T------T------T---TTCA-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AAAG----TTT---TAGTTTAACCCGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52389 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-G-T------------------------AT--------TTGTC-------AATG----TTT---TAACATAACCCGGTAC-TG-GCCAAC-G---AGGGACTTTATCG
gi|52365 : -----------------GCA----G------T------T---TCCG-T-T-T-C------------------------AT--------TCGTA-------GATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAAT-G---CGTCACTTTATGGC
gi|52391 : -----------------GCA----T------T------T---TCCC-T---T-T------------------------AT--------TCGTC-------AAAG----TTT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTCTCG
gi|52372 : -----------------GCA----T------T------T---TCT--T-T-T-T------------------------AT--------TCATC-------AATG----TTT---TAACATAACCCACTAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATCAC
gi|52392 : -----------------GTA----T------T------T---TCCA-T-T-T-T------------------------AT--------TTGTC-------AATG----TTT---TAGTATAACCCAATAC-TG-ACCAAT-G---AGTGACTTTATCG
gi|52377 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCCTC-------AATG----TTT---TAGCTTAACCCGATAC-CG-ATCAAT-G---AGTGACTTTATCG
gi|52381 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-C-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTA---TAGTATAATCCGATAC-TT-GCAAAT-G---CGTGACTCTATCGC
gi|52342 : -----------------GCA----T------G------T---TCTA-T-T-C-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAAATCGATAC-TG-GCCAAT-G---AGTGACTTTATTGC
gi|52289 : ttcagtaaatgatggaaagtttatttatcacaaaaaggaaggttgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttg-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCTTC-------AATG----CTT----AGCATAACCCGACAC-TG-GCCAATCG---CG
gi|52406 : tacttaaaagatgcgtcacctatacctttctgttcagaaaatgatgggaaattaattgaataacaaagaggaaggaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttgCA----T------T------T---TCTG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TATCATAACCCGATAC-TG-GCCGAT-G---TGTGACTTTATCGC
gi|52262 : CA----T------T------T---TCCA-T-T-T-C------------------------AT--------TCATC-------AGTG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TA-CCCAAT-G---AGTGACTTTATTGC
gi|52407 : acatgtacgtttattgtttaagatgcattaccaataactttctgttcagtaaatgatggaaagtttattgaatcacaaaaaaaaaggtcacatttgatgatttatcttatttatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtCA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAAT-G---AGAGACTTTATC
gi|52404 : CA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAACATAACCCGATAC-TG-TCCAAT-G---AGTGACTTAATCGC
gi|52409 : CA----T------T------T---TCCG-T-T-T-C------------------------AT--------TCGTT-------AATG----TTT---TGGCATAACCCGATAC-TG-GCTAAT-G---AGTAACTTTATCGC
gi|52411 : CA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------CCGTC-------ATTG----TTT---CAGCATAACCCCATAC-TG-GCTGAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52413 : CA----T------G------T---TCTG-T-T-G-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGTGTAACTTGATAC-TG-GCCAAT-G---CGTGACTTTATCAC
gi|52414 : CA----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TTGTC-------AGTG----TTT---TAGCATAACCTGTTAC-TG-TCAGCT-G---AGTAACTTTATCGC
gi|52417 : A----T------T------T---TCCG-T-T-T-T------------------------AT--------TCGTC-------AATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GGAAAT-G---AGTGACTTTATCGC
gi|52307 : --------TCGTC-------AAAG----TTT---TAGTATAAACCGATAC-CG-GCCAAT-G---AATGACTTTATCGC
Alignments
lowQualScore : 111 1 1111 11111111111111 2222222222222
lowQualScore : 3 777 3 0 1 0 0 8 0 1 6 1 6 0000 0 5555 2 2 666 22 666 44444444444444 33 2222 333 11 0 0 11 111 00 222222 333 0 0 0 0 1111 33333 44444444444444444 1111 3333333333333 000 1 3333333333 444444444444444444444444 00 0 0 2222222 1111 111 0 0 111
lowQualScore : . ... . . . . . . . . . . . .... . .... . . ... .. ... .............. .. .... ... .. . . .. ... .. ...... ... . . . . .... ..... ................. .... ............. ... . .......... ........................ .. . . ....... .... ... . . ...
lowQualScore : 2 555 2 8 0 8 8 0 6 0 7 0 3 7777 4 0000 2 2 666 55 000 44444444444444 00 2222 999 00 7 7 00 222 99 999999 666 7 6 6 6 4444 44444 77777777777777777 9999 2222222222222 999 0 8888888888 999999999999999999999999 88 6 7 2222222 5555 222 7 7 333
consensus : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
Reference ( family-196 ) : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATANACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGNTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52243 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C--------TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----TTT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52244 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C--------TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----TTT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52245 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C--------TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----TTT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52247 : AACTATGA-TACTGAACATTTAAA--TAAAAAC--AATAGATACAT---TATA-TAAGTTATTGA-CTCTGAGCTGACGATA-TGA--------------TGAGCTTTAAC----A-CT-T---T-CTT---TGAAATACG------TAG-T----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-AG-ATTGAAA-GA-GTATTGAACCTCAAACAGGAAAG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCTG-T-C--------
gi|52247 : A----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGC-------CGATG----TTT---TAGCATAACCCGATAT-TG-ACCAATGA---GCAAATTTACCGCcatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaattttccgttttattcgccgatgttttagcataacccgatattgaccaatgagcaaatttaccgc
gi|52248 : aactatgatactgaacatttaaataaaaacaatagatacattatataagttattgactctgagctgacgatatgatgagctttaacactttctttgaaatacgtagtttaaagatgcaatacctataactttttgttcagtaaaagattgaaagagtattgaacctcaaacaggaaagtcccattcgaagataattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaTAAATATTAAAAAAACAAAAAAACAGAATCAAT-ATTAA--------TTT---TTA-TGAAAATTTAAAGCATTTAAATTTCAATCGATA-CT-TAC-TACTTG--T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTG------T---TACTTTCTGTTTAGTAAA-CG-ATGGAAA-GT-TTATTAACTT-TAAAGTGGAAGA----ACCCATTTGAAG-----A-----------------
gi|52250 : TACGATGGTGAGAATGTAAAT--------TTTCAAC----A-TT-T---T-GTC---TGAAATGAAGAAAATTA--T----TGATT--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA----------AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGGAAA-ATATTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG-----------------------GTT----T------TGGTTGAT---TCCG-T-C--------TTTATAGATTATCATATTTATGAAAAA--T-T-CGTCATTACACAATG----TAT---TAGCATAACACGATAC-CG-GCCAATGA---GTGACTTT
gi|52253 : AAATTT--GC----A-TT-T---T-GTTACAC--------------TA--T----T---TTTAA-G-G--ATG---TATC--ACTTAAA----T---AACTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCACAAATAGAGCGA----TATCATTCAAAGAT---A-----------------ATA----C------TTGA---T---TCTG-T-C--------CC------------------------A--T-T-
gi|52253 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCCTAACCCAATACGCGCGCCAATGA---GTGACTTTATCacaagaaatttgtaatacgtaggtcggcattttccgttttattcgtcaatgttttagcctaacccaatacgcgcgccaatgagtgactttatc
gi|52254 : aaatttgcattttgttacactatttttaaggatgtatcacttaaataactttctgatcagtaaatgatagaaagtttattgaatcacaaatagagcgatatcattcaaagataatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcgAATTTTAAT----A-TA-T---T-CTC---T---------------A--T-----------AA-A-G--ATG---CATT--GCTTA------T---AACTTTCTGTTCAATACA-TT-ATAGCAC-GT-TTATTGAATCTCAAAGCGGAATG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------
gi|52254 : -----------------GCA----T------T------T---TCCA-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAACGA---GTGtattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcggcattttccattttattcgtcaatgttttagcataacccgatactggccaacgagtg
gi|52256 : aattttaatatattctctataaagatgcattgcttataactttctgttcaatacattatagcacgtttattgaatctcaaagcggaatgtcccattcgaagatattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcgTTAAC----A-CC-T---T-TTT---T--------------TA--A----GA--T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCGG------T---AATTTGCTATCCAGTAAA-TG-ATGGCAA-GG-T-ATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------
gi|52257 : TTAAG----A-TT-TCGGT-CTT---TC-------------TC--T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--CACTA------T---AACTCTCTTTTTAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAACAATAACGACGATGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------taattgttgatttcgttcttgt
gi|52259 : CAAC----A-TT-T---T-CTA---C--------------CA--TACTGT---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCAC--------AGT----TCCCATTCGAGG-----A-----------------
gi|52260 : AAC----AATTAT---T-GTT---T--------------CA--T----T---C--AAGA-G--A-----CATC--AACTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-TG-ATGGAAA-TT-TCATTTTATCTCAACGAGGCAGG----TCCCATTTGAAG-----A-----------------TAA----TGGGAAAT------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATA----TTT---CAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATAA---GTGACTTTATC
gi|52262 : AC----A-TG-T---A-CGT---T--------------TA--T----TGT-T--TA-A-G--ATG---CATT--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAAAAAGG----TCACATTTGATG-------------------------A----T------T------T------A-T-C--------TT------------------------A--T-T-
gi|52262 : CA----T------T------T---TCCA-T-T--------TC------------------------A--T-T-CAT-------CAGTG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TA-CCCAATGA---GTGACTTTATTGCtatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtcattttccatttcattcatcagtgttttagcataacccgatactacccaatgagtgactttattgc
gi|52264 : acatgtacgtttattgtttaagatgcattaccaataactttctgttcagtaaatgatggaaagtttattgaatcacaaaaaaaaaggtcacatttgatgatttatcttatttatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtAT----A-TT-T---A-TTT---T--------------TAACC----T---T--AA-A-A--GTG---CATT--ACCTA------T-------TTCTGTTGCGTAAA-TG-ATGGAAA-AC-TTACTGAATTGCAAAGAGGAAGG----TCCCATTAGAAG-----A-----------------
gi|52266 : C----A-TT-T---T-AAT---TAA------------TA--T----TAC-T--AA-A-G--ATG---CATG--ACTTA------T---AACTTTATGTTCAGTACA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGG----TCGCATTCGAAG-----A-----------------taatgcttgatttcgtccttgt
gi|52267 : ----A-TT-T---T-GTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATGCCACATC--AT---------T---AACTTTCTATTCATTAAA-TG-ATGGAAA-TG-TTATTGAATCACATAGCGGAAGG----TTCTATACAAAG-----A-----------------
gi|52268 : ----A-TT-T---T-ATTA--T--------------TA--C----T---C--AA-A-G--ATG---TATC--ATCTA------T---AAGTATCTGTTCAATAAA-TG-ATGGAAC-GT-TTATTGAATAACACAGAGGAAGT----TCCCATTTGAAG-----A-----------------taatcgttgagtccgttcttgt
gi|52269 : -TT-T---T-TTT---T--------------TC--T----C---T--TA-A-G--ATG---CAAC--ACCTA------T---AACTT-CTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TCATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCCCATGCGAAG-----ATAAT-------------GGA----T------GA-----T---TCTG-T-C--------TT------------------------taatgtttcattctgt
gi|52272 : ---T-CTT---T--------------C---T----T---T--AA---G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTCCCGTTCAGTAA--TG-ATTGAAA-GT-TTATTAAATCGCAAAGATGAAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------
gi|52274 : TT---T--------------CA--T----A---T--AA-A-G--ATA---CATC--AGCTA------T---AAATTTCTGTTCAGTAAA-TT-TTTAAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG-----A-----------------TAA----T--------------------A-G-C--------TG------------------------A--T-TCCGT-------CCATG----TTT---T
gi|52276 : T---T--------------TA--C----T---T--AA-A-G--GCG---CATC--ACCTA------A---AACTTTCTATTCAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----T-CCATTCGAAttaat
gi|52280 : ---T--------------TA--A----T---T--AA-A-ATTATG---CATC--CTCTA------T---AACTTGCTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------AAA----TGG----TTGA---T---TGCG-T-C--------TT------------------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52281 : ---T--------------TG--C----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--ACAAA------T---AACTTTCTGTTCAATATA-TT-ATGAAAA-GT-GTATCAAATCGCAAAGAGACAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------TCACGG-T------TGA----T---TCCA-T-CCTTGTAGTTT------------------------A--TCT-CAT-------TTATGAGAATTT---TAGCATAACCTGATAC-TG-ACAAATGA---GT
gi|52282 : ---T--------------TAC-T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACATTCTGTTCAGTAAA-TG-ATTGAAA-AT-GTATTGAATCACAAAGAAGAAGG----TTCCATTCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52283 : ---T--------------TA--T----T------AA-A-G--ATA---CGTC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-AATGAAA-AT-TTATTGAATCACAAAGATGAAGG----TCTCATTCGAAG-----A-----------------tgt
gi|52284 : --------------TA--G----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTG------T---AACTTTCTGTTCTGTAAA-TT-ATGGAAA-GT-TTATTGAATAACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG-----A-----------------taatggttgattccgttcttgt
gi|52286 : --------------TG--T----T---T--GA-A-G--ATG---CCTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-CG-ATTGAAG-GT-TTATTGAATCAAAAAGAGGGAGG----TCCCATTCAAAG-----A-----------------TGA----TGG----T------TGAATCCA-T-C--------TT------------------------G--T-
gi|52287 : --------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AATTTTCTGCTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAATAACAAAGAGTCAAA----TCCCATTCAAAG-----A-----------------
gi|52289 : --------------TA--C----T---T--AA-AAG--ATG---CGTC--ACCTA------T---ACCTTTCTGTTCAGAAAA-TG-ATGGGAA-AT-TAATTGAATAACAAAGAGGAAGG----caatggctgattccgttcttgt
gi|52289 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CTT-------CAATG----CTT----AGCATAACCCGACAC-TG-GCCAATaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttggcattttccgttttattcttcaatgcttagcataacccgacactggccaatcgcg
gi|52290 : tacttaaaagatgcgtcacctatacctttctgttcagaaaatgatgggaaattaattgaataacaaagaggaaggaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttg--------------TA--C----T---T--AA-A-G--TTG---CATC--ACCTA------T---AGCTTTATGTTCAGTTAA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGAAGG----TCCCACTCTAAA-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------cgcg
gi|52291 : --------------TG--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCTAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-CTTTTAAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCTTTTAAAG-----A-----------------tgt
gi|52291 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-C--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAATCCGATAC-TA-AGCAATtaatggttgattccgtcattgtagtttattcaattcgttaatacacagatcggcattttccgtcttattcgtcaatgttttagcataatccgatactaagcaat
gi|52292 : tgtttaaagatgcatcacctataactttctgtctagtagatgatggaatatcttttaaatcacaaagaggaaggtcccttttaaagataatggttgattccgtcattgtagtttattcaattcgttaatacacagatcg--------------TG--T----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACTTTCTATTCAGTAAA-TG-AAGGAAA-AT-TTATTGACACACAAAGATGAAGG----TCCGCTTCGAAGATA--A-----------------GTG----T------TGA----T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52293 : --------------TA--TG---T---T--AA-A-G--ATG---CGTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTAATTAAA-TG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGtgt
gi|52295 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-GTATTGAATAACAAAGAAGAAGG----TCACATTAGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------tcacaaagacca
gi|52296 : A--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---AACTTTATGTTCGGTACATTG-AT-GAAA-TT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG-----A-----------------tgt
gi|52297 : A--T----G---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---TACTTTATGTTCGGTAAA-TG-ATGAAAT-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATTCAAAG-----A-----------------
gi|52300 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTT------T---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-TTGGAAA-G-----TTGAATCCAAAAGAGGAAGG----TCCCACTCAAAG-----A-----------------
gi|52305 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACTTA------T---AACTTACTCTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATGACAAAAAGGAAGG----TCCCATTTGAAG-----A-----------------
gi|52306 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CACC--ATCTA------T---AGCTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATGGACA-AT-TTGTTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATCCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52307 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAATAA--TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAATG----TCCGTTTCGAAG-----A-----------------TGA----T------TGTTGA-T---TACG-TAC--------TT------------------------A--T-tgt
gi|52307 : -T-CGT-------CAAAG----TTT---TAGTATAAACCGATAC-CG-GCCAATGA---ATGACTTTATCGCagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacaggtcgtcaaagttttagtataaaccgataccggccaatgaatgactttatcgc
gi|52308 : tttaaagatgtatcacctataattttctgttcaataatgatggaaagtttattgaatcacaaagatgaatgtccgtttcgaagatgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacagg--T----T---T--AA-A-G--ATG---CCTC--ACGTA------T---AATTTTCTGTTCAGCAAA-TT-ATTGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TTCCATCCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTG----T---TCCG-T-CAT------TT------------------------AAGT-T-TAT-------CA
gi|52309 : --T----T---C--AA-A-A--ATG---CATC--ACCTACATGTAT---AACTTTCTGTTCAGTAA--TG-GTGGAAA-CT-TTATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCATTTCGAAG-----A------------------CAATGGT------TGA----T---TCCG-T-C--------CT------------------------T--T-T-AGT-------
gi|52310 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG-----A-----------------TAA----TAG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52311 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG-----A-----------------TAA----TAG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------tgt
gi|52313 : --T----T---C--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------C---AACTTTGTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-CT-GAATTGAATCATGAGGAGGGAGG----TCACATTTGAAG-----A-----------------TAA----TGGTCGAT------T---TCTG-T-C--------TT------------------------G--T-tgt
gi|52316 : ----T---T--CA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---ATTTTTCTGCTC-GTATA-TG-ACGCAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGTAGG----TCCGATTCGAAG-----A-----------------
gi|52316 : -----------------GTA----T------T------T---TCCA-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---CGGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGGGACGTGATTTtaatggttgactcactccttgtaaacaggtcggtattttccattttattcgtcaatgtttcggcataacccgatactggccaatgggacgtgatttagt
gi|52317 : ttcaagatgcatcacctatatttttctgctcgtatatgacgcaaagtttattgaatcacaaagaggtaggtccgattcgaagataatggttgactcactccttgtaaacaggtcg----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAT-GT-TTATTGAATCACAAATAGGGAGG----TCTTATTTGAAG-----A--------------------------------------T---TCTG-T-C--------CT------------------------agt
gi|52318 : ----T---T--AA-A-G--GTG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTGGA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGT----ACACATTTGAAG-----G-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCCG-T-C--------CT------------------------tgt
gi|52319 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGAAAA-AA-TTATTGAATCAAAAAGTTGAAGG----TCCCACTCGAAG-----A------------------TA----T------TGGCTAAT---TCCGTT-C--------TT------------------------A--T-tgt
gi|52320 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACCTT------T---AACATTCTGTTCCGTAAA-TG-ACGGAAA-G--TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAGTTGATA-----------------G------T------TAA----T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52321 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CA-C--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAGTAAA-TG-GTGGCAA-GT-TCATTGAATCACAAAGTGGAAGG----TTCCATTTGAAG-----tgt
gi|52322 : ----T---T--AA-A-C--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGTAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGA----TCCCATTTGAA
gi|52323 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-ATGTAAA-GT-TTATTGAATCACAGAG----AAG----TTCCATTCGAGG-----A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52324 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--AACTA------T---AACTTTCTCTTCAGTAAA-TG-ATGAAAC-AT-TCATTGAATCACAAAAAGGAAGGAAGACCCCATTTGAAG-----A-----------------
gi|52325 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACTTA------T---AACTTTGTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGCAGA----TCCTGTTTGAAG-----A-----------------
gi|52326 : ----T---T--AA-A-G--ATG---AATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TT-ATGGAACTGT-TT-TTGACTCACAAACAGAAAGG----TCTCATTCGAAA-----A-----------------TAA----TAA----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52332 : ---T--AA-A-G--ATG---CATCTCACCTA------C---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-CTGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAGTG------------GAAG-----A-----------------TAA----TGG----T------T---TCCGTT-C--------TT------------------------G--T-tgt
gi|52332 : -----------------GCC----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTTAAATAGCATAACTCGACAC-TA-GTCGATGT---GTGACCTTATAGCagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcggccttttccgttttattcgtcaatgtttaaatagcataactcgacactagtcgatgtgtgaccttatagc
gi|52335 : taaagatgcatctcacctacaactttctgttcagtaagtgctggcaagtttattgaatcacaaagatgagtggaagataatggtttccgttcttgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcgG-ATG-AAA-GT-GTACTGAATCACGAAGAGGAAGG----TTCCATTCGAAG-----ATAATGGTTGATTCTCCAGCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTA---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGC
gi|52336 : tgcatcatgttttccaacggcttcaagtttcttaga---CATC--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCATAAAGAGGAAGG----TCCAATTCGAAG-----A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCG-T-C--------CT------------------------
gi|52339 : A-TGTATGAGAA-AT-TTGTT-AAT---AAACAGGTAGG----T------------------------------------A----T------T------T---CCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATGACCCGGTAC-TG-ACCAATGG---TTGACTTTATCGtgt
gi|52340 : agttttttctt---AGCTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCTTATTCAAAG-----
gi|52342 : TTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTT-ATCACAAAAAGGAAGG----T
gi|52342 : -----------------GCA----T------G------T---TCTA-T-T--------CT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAAATCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGCtgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttggcatgttctattctattcgtcaatgttttagcataaatcgatactggccaatgagtgactttattgc
gi|52344 : ttcagtaaatgatggaaagtttatttatcacaaaaaggaaggttgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttg-----------------GCA----T------T------T----CAA-T-A--------TT------------------------A--T-T-CGT-------GAATG----TTT---TAGCATAACCCAATAC-TA-GCCAATGC---GTGATTTTATCG
gi|52347 : cgttgtcaatcttattttgagaaattagtaaatacacatgtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------CT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----TTT---AAGCATAACCCAATAA-TG-GCAAATGA---ATGACTTTATCGC
gi|52348 : gtaaatacacaggtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----GTT---TAGCATAACGCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGATTTTATCGC
gi|52349 : ataagaaattcgatcatacacagttcg-----A-----------------GCA----T------T------T---TCCC-T-T--------TT------------------------A--A-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTTTATC
gi|52350 : ataggaaattcgttaatacacagaccCACTGGAAG-----------------------GTG----T------T------T---TCCA-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----TTT---TAGCATAACCCGAAAC-TG-GCCAATGA---GCAACTTTATCGC
gi|52351 : ATTCAAAG-----GTCG--------------GCA----T------T------T---TCCG-A-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---AAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGTCTTTATCGC
gi|52352 : GAAG-----------------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATGACCCGGTCC-CG-GCCAATGG---TTGACTTTATCGC
gi|52354 : G-----A-----------------GAA----T------T------T---TCCA-T-T--------TT------------------------A--T-T-TGT-------CGATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-ACCAATTT---GTGACTTTAT
gi|52355 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TCCA-T-T--------TT------------------------A--C-T-CGT-------CAGTG----TTT---TAGCATAACCTGATTC-TG-GCCAATTA---GTGACTTTATCAC
gi|52356 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TCTG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAT-TA-GCCAATGA---GTGACATTATCGC
gi|52357 : -----A-----------------ACA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----TTT---TAGTATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52358 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CACTG----TTT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCCAATGT---GTGACTTTAT
gi|52360 : -----A-----------------GCA----T------T------T---TTTA-T-T--------TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----TTT---TAGTATAGCCTGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52365 : -----------------GCA----G------T------T---TCCG-T-T--------TC------------------------A--T-T-CGT-------AGATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGC---GTCACTTTATGGC
gi|52367 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----TTT---TAGCATAACCCGATAA-TG-GCCAATGT---GTAACTTTATCGC
gi|52368 : -----------------GCA----T------T------T---TCCA-T----------TT------------------------A--T-T-TGT-------CAACA----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52369 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTCTATCGC
gi|52370 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGC-------CAATG----TTT---TAGCATAACCATTTAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52371 : -----------------GCA----T------T------T---TCCT-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TCT---TAGCATAACCAGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52372 : -----------------GCA----T------T------T---TCT--T-T--------TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----TTT---TAACATAACCCACTAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCAC
gi|52375 : -----------------GCA----T------T------T---TCTG-T-T--------TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAA-TT-GCCGGTGG---GTGACTTTATCGC
gi|52377 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CCT-------CAATG----TTT---TAGCTTAACCCGATAC-CG-ATCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52378 : -----------------GCT----T------T------T---TCTG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CATTG----TTT---TAGTATAACCTGATAT-TG-GCCAATGT---TTGACTTTATCGC
gi|52380 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----ATT---TAGCATAACCCTATAC-TG-GCCATTGA---GTGACTTTATCGC
gi|52381 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-C-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTA---TAGTATAATCCGATAC-TT-GCAAATGC---GTGACTCTATCGC
gi|52384 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------TA------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAACAAAACCCGATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52386 : -----------------GCA----T------T------T---TTCA-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----TTT---TAGTTTAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52389 : -----------------GCA----T------T------T---TCCG-T-T--------GT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----TTT---TAACATAACCCGGTAC-TG-GCCAACGA---GGGACTTTATCG
gi|52391 : -----------------GCA----T------T------T---TCCC-T----------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----TTT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTCTCG
gi|52392 : -----------------GTA----T------T------T---TCCA-T-T--------TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----TTT---TAGTATAACCCAATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52404 : CA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAACATAACCCGATAC-TG-TCCAATGA---GTGACTTAATCGC
gi|52406 : CA----T------T------T---TCTG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TATCATAACCCGATAC-TG-GCCGATGT---GTGACTTTATCGC
gi|52407 : CA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GAGACTTTATC
gi|52409 : CA----T------T------T---TCCG-T-T--------TC------------------------A--T-T-CGT-------TAATG----TTT---TGGCATAACCCGATAC-TG-GCTAATGA---GTAACTTTATCGC
gi|52411 : CA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-C-CGT-------CATTG----TTT---CAGCATAACCCCATAC-TG-GCTGATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52413 : CA----T------G------T---TCTG-T-T--------GT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGTGTAACTTGATAC-TG-GCCAATGC---GTGACTTTATCAC
gi|52414 : CA----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-TGT-------CAGTG----TTT---TAGCATAACCTGTTAC-TG-TCAGCTGA---GTAACTTTATCGC
gi|52417 : A----T------T------T---TCCG-T-T--------TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----TTT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GGAAATGA---GTGACTTTATCGC
Alignments
lowQualScore : 111 1 1111 11111111111111 111111
lowQualScore : 3 777 3 0 1 0 0 8 0 1 6 1 6 0000 0 5555 2 2 666 22 666 44444444444444 33 2222 333 11 0 0 11 111 00 222222 333 0 0 0 0 1111 111 33333333333333333 2222 666666 000000 111 22222222 0 777777777777777777777777 00 0 1 2222222 1111 00 111 0 0 111
lowQualScore : . ... . . . . . . . . . . . .... . .... . . ... .. ... .............. .. .... ... .. . . .. ... .. ...... ... . . . . .... ... ................. .... ...... ...... ... ........ . ........................ .. . . ....... .... .. ... . . ...
lowQualScore : 2 555 2 8 0 8 8 0 6 0 7 0 3 7777 4 0000 2 2 666 55 000 44444444444444 00 2222 999 00 7 7 00 222 99 999999 666 7 6 6 6 4444 000 88888888888888888 2222 444444 555555 666 99999999 6 666666666666666666666666 99 6 3 1111111 5555 99 222 7 7 333
consensus : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
Reference ( family-196 ) : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52243 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52244 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52245 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52247 : AACTATGA-TACTGAACATTTAAA--TAAAAAC--AATAGATACAT---TATA-TAAGTTATTGA-CTCTGAGCTGACGATA-TGA--------------TGAGCTTTAAC----A-CT-T---T-CTT---TGAAATACG------TAG-T----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-AG-ATTGAAA-GA-GTATTGAACCTCAAACAGGAAAG----TCCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52247 : A----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGC-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAT-TG-ACCAATGA---GCAAATTTACCGCtaattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaattttccgttttattcgccgatgttttagcataacccgatattgaccaatgagcaaatttaccgc
gi|52248 : aactatgatactgaacatttaaataaaaacaatagatacattatataagttattgactctgagctgacgatatgatgagctttaacactttctttgaaatacgtagtttaaagatgcaatacctataactttttgttcagtaaaagattgaaagagtattgaacctcaaacaggaaagtcccattcgaagataattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaTAAATATTAAAAAAACAAAAAAACAGAATCAAT-ATTAA--------TTT---TTA-TGAAAATTTAAAGCATTTAAATTTCAATCGATA-CT-TAC-TACTTG--T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTG------T---TACTTTCTGTTTAGTAAA-CG-ATGGAAA-GT-TTATTAACTT-TAAAGTGGAAGA----ACCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52250 : TACGATGGTGAGAATGTAAAT--------TTTCAAC----A-TT-T---T-GTC---TGAAATGAAGAAAATTA--T----TGATT--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA----------AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGGAAA-ATATTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---------------------GTT----T------TGGTTGAT---TCCGT--------C-TTTATAGATTATCATATTTATGAAAAA--T-T-CGTCATTACACAATG----T--AT---TAGCATAACACGATAC-CG-GCCAATGA---GTGACTTT
gi|52253 : AAATTT--GC----A-TT-T---T-GTTACAC--------------TA--T----T---TTTAA-G-G--ATG---TATC--ACTTAAA----T---AACTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCACAAATAGAGCGA----TATCATTCAAAG---A-----------------
gi|52253 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCCTAACCCAATACGCGCGCCAATGA---GTGACTTTATCtaatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcggcattttccgttttattcgtcaatgttttagcctaacccaatacgcgcgccaatgagtgactttatc
gi|52254 : aaatttgcattttgttacactatttttaaggatgtatcacttaaataactttctgatcagtaaatgatagaaagtttattgaatcacaaatagagcgatatcattcaaagataatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcgAATTTTAAT----A-TA-T---T-CTC---T---------------A--T-----------AA-A-G--ATG---CATT--GCTTA------T---AACTTTCTGTTCAATACA-TT-ATAGCAC-GT-TTATTGAATCTCAAAGCGGAATG----TCCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52254 : -----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAACGA---GTGtattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcggcattttccattttattcgtcaatgttttagcataacccgatactggccaacgagtg
gi|52256 : aattttaatatattctctataaagatgcattgcttataactttctgttcaatacattatagcacgtttattgaatctcaaagcggaatgtcccattcgaagatattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcgTTAAC----A-CC-T---T-TTT---T--------------TA--A----GA--T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCGG------T---AATTTGCTATCCAGTAAA-TG-ATGGCAA-GG-T-ATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------TAA----T------T------G---TTGAT--------T-TC------------------------G--T-T-C
gi|52257 : TTAAG----A-TT-TCGGT-CTT---TC-------------TC--T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--CACTA------T---AACTCTCTTTTTAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAACAATAACGACGATGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------ttgt
gi|52259 : CAAC----A-TT-T---T-CTA---C--------------CA--TACTGT---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCAC--------AGT----TCCCATTCGAGG---A-----------------
gi|52260 : AAC----AATTAT---T-GTT---T--------------CA--T----T---C--AAGA-G--A-----CATC--AACTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-TG-ATGGAAA-TT-TCATTTTATCTCAACGAGGCAGG----TCCCATTTGAAG---A-----------------TAA----TGGGAAAT------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATA----T--TT---CAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATAA---GTGACTTTATC
gi|52262 : AC----A-TG-T---A-CGT---T--------------TA--T----TGT-T--TA-A-G--ATG---CATT--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAAAAAGG----TCACATTTGATG-----------------------A----T------T------TA--TCTTA--------T-TTATGAGAA-----------------A--T-T-CGT-------CAAT
gi|52262 : CA----T------T------T---TCCAT--------T-TC------------------------A--T-T-CAT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TA-CCCAATGA---GTGACTTTATTGCacacaggtcgtcattttccatttcattcatcagtgttttagcataacccgatactacccaatgagtgactttattgc
gi|52264 : acatgtacgtttattgtttaagatgcattaccaataactttctgttcagtaaatgatggaaagtttattgaatcacaaaaaaaaaggtcacatttgatgatttatcttatttatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtAT----A-TT-T---A-TTT---T--------------TAACC----T---T--AA-A-A--GTG---CATT--ACCTA------T-------TTCTGTTGCGTAAA-TG-ATGGAAA-AC-TTACTGAATTGCAAAGAGGAAGG----TCCCATTAGAAG---A-----------------
gi|52266 : C----A-TT-T---T-AAT---TAA------------TA--T----TAC-T--AA-A-G--ATG---CATG--ACTTA------T---AACTTTATGTTCAGTACA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------taatgcttgatttcgtccttgt
gi|52267 : ----A-TT-T---T-GTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATGCCACATC--AT---------T---AACTTTCTATTCATTAAA-TG-ATGGAAA-TG-TTATTGAATCACATAGCGGAAGG----TTCTATACAAAG---A-----------------TAA----TCG----T------TGAGTCCGT--------T-CT------------------------
gi|52268 : ----A-TT-T---T-ATTA--T--------------TA--C----T---C--AA-A-G--ATG---TATC--ATCTA------T---AAGTATCTGTTCAATAAA-TG-ATGGAAC-GT-TTATTGAATAACACAGAGGAAGT----TCCCATTTGAAG---A-----------------TAA----T------G------T---TTCAT--------T-CT------------------------G--T-tgt
gi|52269 : -TT-T---T-TTT---T--------------TC--T----C---T--TA-A-G--ATG---CAAC--ACCTA------T---AACTT-CTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TCATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCCCATGCGAAG---A-----------------
gi|52272 : ---T-CTT---T--------------C---T----T---T--AA---G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTCCCGTTCAGTAA--TG-ATTGAAA-GT-TTATTAAATCGCAAAGATGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------taatggatgattctgtctt
gi|52274 : TT---T--------------CA--T----A---T--AA-A-G--ATA---CATC--AGCTA------T---AAATTTCTGTTCAGTAAA-TT-TTTAAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---A------------------TA----A------T------A---GCTG-------------------------------------A--T-TCCGT-------CCATG----T--TT---T
gi|52276 : T---T--------------TA--C----T---T--AA-A-G--GCG---CATC--ACCTA------A---AACTTTCTATTCAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----T-CCATTCGAAttaat
gi|52280 : ---T--------------TA--A----T---T--AA-A-ATTATG---CATC--CTCTA------T---AACTTGCTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52281 : ---T--------------TG--C----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--ACAAA------T---AACTTTCTGTTCAATATA-TT-ATGAAAA-GT-GTATCAAATCGCAAAGAGACAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------TCACGG-T------TGA----T---TCCATCCTTGTAGT-TT------------------------A--TCT-CAT-------TTATGAGAAT--TT---TAGCATAACCTGATAC-TG-ACAAATGA---GTaaatggttgattgcgtctt
gi|52282 : ---T--------------TAC-T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACATTCTGTTCAGTAAA-TG-ATTGAAA-AT-GTATTGAATCACAAAGAAGAAGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52283 : ---T--------------TA--T----T------AA-A-G--ATA---CGTC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-AATGAAA-AT-TTATTGAATCACAAAGATGAAGG----TCTCATTCGAAG---A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCGT--------T-CT------------------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52284 : --------------TA--G----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTG------T---AACTTTCTGTTCTGTAAA-TT-ATGGAAA-GT-TTATTGAATAACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---A-----------------tgt
gi|52286 : --------------TG--T----T---T--GA-A-G--ATG---CCTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-CG-ATTGAAG-GT-TTATTGAATCAAAAAGAGGGAGG----TCCCATTCAAAG---A-----------------
gi|52287 : --------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AATTTTCTGCTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAATAACAAAGAGTCAAA----TCCCATTCAAAG---A------------------CA----A------TGGCTGAT---TCCGT--------T-CT------------------------tgatggttgaatccatcttgt
gi|52289 : --------------TA--C----T---T--AA-AAG--ATG---CGTC--ACCTA------T---ACCTTTCTGTTCAGAAAA-TG-ATGGGAA-AT-TAATTGAATAACAAAGAGGAAGG----tgt
gi|52289 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CTT-------CAATG-------CT---TAGCATAACCCGACAC-TG-GCCAATaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttggcattttccgttttattcttcaatgcttagcataacccgacactggccaatcgcg
gi|52290 : tacttaaaagatgcgtcacctatacctttctgttcagaaaatgatgggaaattaattgaataacaaagaggaaggaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttg--------------TA--C----T---T--AA-A-G--TTG---CATC--ACCTA------T---AGCTTTATGTTCAGTTAA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGAAGG----TCCCACTCTAAA---A-----------------cgcg
gi|52291 : --------------TG--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCTAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-CTTTTAAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCTTTTAAAG---A-----------------TAA----T--------------------GG--------T-TG------------------------A--T-TCCGT-------CATTG----TAGTT---TAtaatggttgattccgtccttgt
gi|52291 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAATCCGATAC-TA-AGCAATttcaattcgttaatacacagatcggcattttccgtcttattcgtcaatgttttagcataatccgatactaagcaat
gi|52292 : tgtttaaagatgcatcacctataactttctgtctagtagatgatggaatatcttttaaatcacaaagaggaaggtcccttttaaagataatggttgattccgtcattgtagtttattcaattcgttaatacacagatcg--------------TG--T----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACTTTCTATTCAGTAAA-TG-AAGGAAA-AT-TTATTGACACACAAAGATGAAGG----TCCGCTTCGAAGATAA-----------------GTG----T------TGA----T---TCCGT--------
gi|52293 : --------------TA--TG---T---T--AA-A-G--ATG---CGTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTAATTAAA-TG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGccttgt
gi|52295 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-GTATTGAATAACAAAGAAGAAGG----TCACATTAGAAG---A-----------------tcacaaagacca
gi|52296 : A--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---AACTTTATGTTCGGTACATTG-AT-GAAA-TT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52297 : A--T----G---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---TACTTTATGTTCGGTAAA-TG-ATGAAAT-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATTCAAAG---A-----------------
gi|52300 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTT------T---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-TTGGAAA-G-----TTGAATCCAAAAGAGGAAGG----TCCCACTCAAAG---A-----------------
gi|52305 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACTTA------T---AACTTACTCTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATGACAAAAAGGAAGG----TCCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52306 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CACC--ATCTA------T---AGCTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATGGACA-AT-TTGTTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATCCGAAG---A-----------------
gi|52307 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAATAA--TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAATG----TCCGTTTCGAAG---A-----------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52307 : -T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGTATAAACCGATAC-CG-GCCAATGA---ATGACTTTATCGCtgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacaggtcgtcaaagttttagtataaaccgataccggccaatgaatgactttatcgc
gi|52308 : tttaaagatgtatcacctataattttctgttcaataatgatggaaagtttattgaatcacaaagatgaatgtccgtttcgaagatgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacagg--T----T---T--AA-A-G--ATG---CCTC--ACGTA------T---AATTTTCTGTTCAGCAAA-TT-ATTGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TTCCATCCGAAG---A-----------------TAA----TGG----TTG----T---TCCGTCA------T-TT------------------------AAGT-T-TAT-------CA
gi|52309 : --T----T---C--AA-A-A--ATG---CATC--ACCTACATGTAT---AACTTTCTGTTCAGTAA--TG-GTGGAAA-CT-TTATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCATTTCGAAG---A------------------CAATGGT------TGA----T---TCCGT--------C-CT------------------------T--T-T-AGT-------
gi|52310 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52311 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------taatagttgattccgtccttgt
gi|52313 : --T----T---C--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------C---AACTTTGTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-CT-GAATTGAATCATGAGGAGGGAGG----TCACATTTGAAG---A-----------------TAA----TGGTCGAT------T---TCTGT--------C-TT------------------------G--T-taatagttgattccgtccttgt
gi|52316 : ----T---T--CA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---ATTTTTCTGCTC-GTATA-TG-ACGCAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGTAGG----TCCGATTCGAAG---A-----------------
gi|52316 : -----------------GTA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CGGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGGGACGTGATTTtaatggttgactcactccttgtaaacaggtcggtattttccattttattcgtcaatgtttcggcataacccgatactggccaatgggacgtgatttagt
gi|52317 : ttcaagatgcatcacctatatttttctgctcgtatatgacgcaaagtttattgaatcacaaagaggtaggtccgattcgaagataatggttgactcactccttgtaaacaggtcg----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAT-GT-TTATTGAATCACAAATAGGGAGG----TCTTATTTGAAG---A-----------------agt
gi|52318 : ----T---T--AA-A-G--GTG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTGGA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGT----ACACATTTGAAG---G-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCCGT--------ttctgtccttgt
gi|52319 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGAAAA-AA-TTATTGAATCAAAAAGTTGAAGG----TCCCACTCGAAG---A------------------TA----T------TGGCTAAT---TCCGT--------TCTT------------------------A--T-ccttgt
gi|52320 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACCTT------T---AACATTCTGTTCCGTAAA-TG-ACGGAAA-G--TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---
gi|52321 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CA-C--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAGTAAA-TG-GTGGCAA-GT-TCATTGAATCACAAAGTGGAAGG----TTCCATTTGAAG---ttgatagttaattccgtccttgt
gi|52322 : ----T---T--AA-A-C--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGTAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGA----TCCCATTTGAA
gi|52323 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-ATGTAAA-GT-TTATTGAATCACAGAG----AAG----TTCCATTCGAGG---A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52324 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--AACTA------T---AACTTTCTCTTCAGTAAA-TG-ATGAAAC-AT-TCATTGAATCACAAAAAGGAAGGAAGACCCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52325 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACTTA------T---AACTTTGTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGCAGA----TCCTGTTTGAAG---A-----------------
gi|52326 : ----T---T--AA-A-G--ATG---AATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TT-ATGGAACTGT-TT-TTGACTCACAAACAGAAAGG----TCTCATTCGAAA---A-----------------
gi|52332 : ---T--AA-A-G--ATG---CATCTCACCTA------C---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-CTGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAGTG------------GAAG---A-----------------TAA----TGG----T------T---TCCGT--------T-CT------------------------taataattgattccgtccttgt
gi|52332 : -----------------GCC----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TTAAATAGCATAACTCGACAC-TA-GTCGATGT---GTGACCTTATAGCtgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcggccttttccgttttattcgtcaatgtttaaatagcataactcgacactagtcgatgtgtgaccttatagc
gi|52335 : taaagatgcatctcacctacaactttctgttcagtaagtgctggcaagtttattgaatcacaaagatgagtggaagataatggtttccgttcttgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcgG-ATG-AAA-GT-GTACTGAATCACGAAGAGGAAGG----TTCCATTCGAAG---ATAATGGTTGATTCTCCAGCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TA---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGC
gi|52336 : tgcatcatgttttccaacggcttcaagtttcttaga---CATC--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCATAAAGAGGAAGG----TCCAATTCGAAG---A-----------------
gi|52339 : A-TGTATGAGAA-AT-TTGTT-AAT---AAACAGGTAGG----T----------------------------------A----T------T------T---CCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATGACCCGGTAC-TG-ACCAATGG---TTGACTTTATCGtaatggttgattccgtccttgt
gi|52340 : agttttttctt---AGCTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCTTATTCAAAG---
gi|52342 : TTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTT-ATCACAAAAAGGAAGG----T
gi|52342 : -----------------GCA----T------G------T---TCTAT--------T-CT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAAATCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGCtgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttggcatgttctattctattcgtcaatgttttagcataaatcgatactggccaatgagtgactttattgc
gi|52344 : ttcagtaaatgatggaaagtttatttatcacaaaaaggaaggttgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttg-----------------GCA----T------T------T----CAAT--------A-TT------------------------A--T-T-CGT-------GAATG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TA-GCCAATGC---GTGATTTTATCG
gi|52347 : cgttgtcaatcttattttgagaaattagtaaatacacatgtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-CT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---AAGCATAACCCAATAA-TG-GCAAATGA---ATGACTTTATCGC
gi|52348 : gtaaatacacaggtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----G--TT---TAGCATAACGCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGATTTTATCGC
gi|52349 : ataagaaattcgatcatacacagttcg---A-----------------GCA----T------T------T---TCCCT--------T-TT------------------------A--A-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTTTATC
gi|52350 : ataggaaattcgttaatacacagaccCACTGGAAG---------------------GTG----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGAAAC-TG-GCCAATGA---GCAACTTTATCGC
gi|52351 : ATTCAAAG---GTCG--------------GCA----T------T------T---TCCGA--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---AAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGTCTTTATCGC
gi|52352 : GAAG---------------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATGACCCGGTCC-CG-GCCAATGG---TTGACTTTATCGC
gi|52354 : G---A-----------------GAA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-ACCAATTT---GTGACTTTAT
gi|52355 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--C-T-CGT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCTGATTC-TG-GCCAATTA---GTGACTTTATCAC
gi|52356 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAT-TA-GCCAATGA---GTGACATTATCGC
gi|52357 : ---A-----------------ACA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGTATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52358 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CACTG----T--TT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCCAATGT---GTGACTTTAT
gi|52360 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TTTAT--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----T--TT---TAGTATAGCCTGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52365 : -----------------GCA----G------T------T---TCCGT--------T-TC------------------------A--T-T-CGT-------AGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGC---GTCACTTTATGGC
gi|52367 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAA-TG-GCCAATGT---GTAACTTTATCGC
gi|52368 : -----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-T-------------------------A--T-T-TGT-------CAACA----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52369 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTCTATCGC
gi|52370 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGC-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCATTTAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52371 : -----------------GCA----T------T------T---TCCTT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--CT---TAGCATAACCAGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52372 : -----------------GCA----T------T------T---TCT-T--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCACTAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCAC
gi|52375 : -----------------GCA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAA-TT-GCCGGTGG---GTGACTTTATCGC
gi|52377 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CCT-------CAATG----T--TT---TAGCTTAACCCGATAC-CG-ATCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52378 : -----------------GCT----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CATTG----T--TT---TAGTATAACCTGATAT-TG-GCCAATGT---TTGACTTTATCGC
gi|52380 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----A--TT---TAGCATAACCCTATAC-TG-GCCATTGA---GTGACTTTATCGC
gi|52381 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGC--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TA---TAGTATAATCCGATAC-TT-GCAAATGC---GTGACTCTATCGC
gi|52384 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TA------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAACAAAACCCGATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52386 : -----------------GCA----T------T------T---TTCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGTTTAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52389 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-GT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCGGTAC-TG-GCCAACGA---GGGACTTTATCG
gi|52391 : -----------------GCA----T------T------T---TCC-C--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTCTCG
gi|52392 : -----------------GTA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----T--TT---TAGTATAACCCAATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52404 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCGATAC-TG-TCCAATGA---GTGACTTAATCGC
gi|52406 : CA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TATCATAACCCGATAC-TG-GCCGATGT---GTGACTTTATCGC
gi|52407 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GAGACTTTATC
gi|52409 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TC------------------------A--T-T-CGT-------TAATG----T--TT---TGGCATAACCCGATAC-TG-GCTAATGA---GTAACTTTATCGC
gi|52411 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-C-CGT-------CATTG----T--TT---CAGCATAACCCCATAC-TG-GCTGATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52413 : CA----T------G------T---TCTGT--------T-GT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGTGTAACTTGATAC-TG-GCCAATGC---GTGACTTTATCAC
gi|52414 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCTGTTAC-TG-TCAGCTGA---GTAACTTTATCGC
gi|52417 : A----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GGAAATGA---GTGACTTTATCGC
Alignments
lowQualScore : 111 1 1111 11111111111111 111111
lowQualScore : 3 777 3 0 1 0 0 8 0 1 6 1 6 0000 0 5555 2 2 666 22 666 44444444444444 33 2222 333 11 0 0 11 111 00 222222 333 0 0 0 0 1111 111 33333333333333333 2222 666666 000000 111 22222222 0 777777777777777777777777 00 0 1 2222222 1111 00 111 0 0 111
lowQualScore : . ... . . . . . . . . . . . .... . .... . . ... .. ... .............. .. .... ... .. . . .. ... .. ...... ... . . . . .... ... ................. .... ...... ...... ... ........ . ........................ .. . . ....... .... .. ... . . ...
lowQualScore : 2 555 2 8 0 8 8 0 6 0 7 0 3 7777 4 0000 2 2 666 55 000 44444444444444 00 2222 999 00 7 7 00 222 99 999999 666 7 6 6 6 4444 000 88888888888888888 2222 444444 555555 666 99999999 6 666666666666666666666666 99 6 3 1111111 5555 99 222 7 7 333
consensus : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
Reference ( family-196 ) : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52243 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52244 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52245 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52247 : AACTATGA-TACTGAACATTTAAA--TAAAAAC--AATAGATACAT---TATA-TAAGTTATTGA-CTCTGAGCTGACGATA-TGA--------------TGAGCTTTAAC----A-CT-T---T-CTT---TGAAATACG------TAG-T----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-AG-ATTGAAA-GA-GTATTGAACCTCAAACAGGAAAG----TCCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52247 : A----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGC-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAT-TG-ACCAATGA---GCAAATTTACCGCtaattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaattttccgttttattcgccgatgttttagcataacccgatattgaccaatgagcaaatttaccgc
gi|52248 : aactatgatactgaacatttaaataaaaacaatagatacattatataagttattgactctgagctgacgatatgatgagctttaacactttctttgaaatacgtagtttaaagatgcaatacctataactttttgttcagtaaaagattgaaagagtattgaacctcaaacaggaaagtcccattcgaagataattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaTAAATATTAAAAAAACAAAAAAACAGAATCAAT-ATTAA--------TTT---TTA-TGAAAATTTAAAGCATTTAAATTTCAATCGATA-CT-TAC-TACTTG--T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTG------T---TACTTTCTGTTTAGTAAA-CG-ATGGAAA-GT-TTATTAACTT-TAAAGTGGAAGA----ACCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52250 : TACGATGGTGAGAATGTAAAT--------TTTCAAC----A-TT-T---T-GTC---TGAAATGAAGAAAATTA--T----TGATT--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA----------AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGGAAA-ATATTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---------------------GTT----T------TGGTTGAT---TCCGT--------C-TTTATAGATTATCATATTTATGAAAAA--T-T-CGTCATTACACAATG----T--AT---TAGCATAACACGATAC-CG-GCCAATGA---GTGACTTT
gi|52253 : AAATTT--GC----A-TT-T---T-GTTACAC--------------TA--T----T---TTTAA-G-G--ATG---TATC--ACTTAAA----T---AACTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCACAAATAGAGCGA----TATCATTCAAAG---A-----------------
gi|52253 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCCTAACCCAATACGCGCGCCAATGA---GTGACTTTATCtaatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcggcattttccgttttattcgtcaatgttttagcctaacccaatacgcgcgccaatgagtgactttatc
gi|52254 : aaatttgcattttgttacactatttttaaggatgtatcacttaaataactttctgatcagtaaatgatagaaagtttattgaatcacaaatagagcgatatcattcaaagataatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcgAATTTTAAT----A-TA-T---T-CTC---T---------------A--T-----------AA-A-G--ATG---CATT--GCTTA------T---AACTTTCTGTTCAATACA-TT-ATAGCAC-GT-TTATTGAATCTCAAAGCGGAATG----TCCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52254 : -----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAACGA---GTGtattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcggcattttccattttattcgtcaatgttttagcataacccgatactggccaacgagtg
gi|52256 : aattttaatatattctctataaagatgcattgcttataactttctgttcaatacattatagcacgtttattgaatctcaaagcggaatgtcccattcgaagatattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcgTTAAC----A-CC-T---T-TTT---T--------------TA--A----GA--T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCGG------T---AATTTGCTATCCAGTAAA-TG-ATGGCAA-GG-T-ATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------TAA----T------T------G---TTGAT--------T-TC------------------------G--T-T-C
gi|52257 : TTAAG----A-TT-TCGGT-CTT---TC-------------TC--T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--CACTA------T---AACTCTCTTTTTAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAACAATAACGACGATGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------ttgt
gi|52259 : CAAC----A-TT-T---T-CTA---C--------------CA--TACTGT---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCAC--------AGT----TCCCATTCGAGG---A-----------------
gi|52260 : AAC----AATTAT---T-GTT---T--------------CA--T----T---C--AAGA-G--A-----CATC--AACTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-TG-ATGGAAA-TT-TCATTTTATCTCAACGAGGCAGG----TCCCATTTGAAG---A-----------------TAA----TGGGAAAT------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATA----T--TT---CAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATAA---GTGACTTTATC
gi|52262 : AC----A-TG-T---A-CGT---T--------------TA--T----TGT-T--TA-A-G--ATG---CATT--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAAAAAGG----TCACATTTGATG-----------------------A----T------T------TA--TCTTA--------T-TTATGAGAA-----------------A--T-T-CGT-------CAAT
gi|52262 : CA----T------T------T---TCCAT--------T-TC------------------------A--T-T-CAT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TA-CCCAATGA---GTGACTTTATTGCacacaggtcgtcattttccatttcattcatcagtgttttagcataacccgatactacccaatgagtgactttattgc
gi|52264 : acatgtacgtttattgtttaagatgcattaccaataactttctgttcagtaaatgatggaaagtttattgaatcacaaaaaaaaaggtcacatttgatgatttatcttatttatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtAT----A-TT-T---A-TTT---T--------------TAACC----T---T--AA-A-A--GTG---CATT--ACCTA------T-------TTCTGTTGCGTAAA-TG-ATGGAAA-AC-TTACTGAATTGCAAAGAGGAAGG----TCCCATTAGAAG---A-----------------
gi|52266 : C----A-TT-T---T-AAT---TAA------------TA--T----TAC-T--AA-A-G--ATG---CATG--ACTTA------T---AACTTTATGTTCAGTACA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------taatgcttgatttcgtccttgt
gi|52267 : ----A-TT-T---T-GTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATGCCACATC--AT---------T---AACTTTCTATTCATTAAA-TG-ATGGAAA-TG-TTATTGAATCACATAGCGGAAGG----TTCTATACAAAG---A-----------------TAA----TCG----T------TGAGTCCGT--------T-CT------------------------
gi|52268 : ----A-TT-T---T-ATTA--T--------------TA--C----T---C--AA-A-G--ATG---TATC--ATCTA------T---AAGTATCTGTTCAATAAA-TG-ATGGAAC-GT-TTATTGAATAACACAGAGGAAGT----TCCCATTTGAAG---A-----------------TAA----T------G------T---TTCAT--------T-CT------------------------G--T-tgt
gi|52269 : -TT-T---T-TTT---T--------------TC--T----C---T--TA-A-G--ATG---CAAC--ACCTA------T---AACTT-CTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TCATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCCCATGCGAAG---A-----------------
gi|52272 : ---T-CTT---T--------------C---T----T---T--AA---G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTCCCGTTCAGTAA--TG-ATTGAAA-GT-TTATTAAATCGCAAAGATGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------taatggatgattctgtctt
gi|52274 : TT---T--------------CA--T----A---T--AA-A-G--ATA---CATC--AGCTA------T---AAATTTCTGTTCAGTAAA-TT-TTTAAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---A------------------TA----A------T------A---GCTG-------------------------------------A--T-TCCGT-------CCATG----T--TT---T
gi|52276 : T---T--------------TA--C----T---T--AA-A-G--GCG---CATC--ACCTA------A---AACTTTCTATTCAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----T-CCATTCGAAttaat
gi|52280 : ---T--------------TA--A----T---T--AA-A-ATTATG---CATC--CTCTA------T---AACTTGCTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52281 : ---T--------------TG--C----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--ACAAA------T---AACTTTCTGTTCAATATA-TT-ATGAAAA-GT-GTATCAAATCGCAAAGAGACAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------TCACGG-T------TGA----T---TCCATCCTTGTAGT-TT------------------------A--TCT-CAT-------TTATGAGAAT--TT---TAGCATAACCTGATAC-TG-ACAAATGA---GTaaatggttgattgcgtctt
gi|52282 : ---T--------------TAC-T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACATTCTGTTCAGTAAA-TG-ATTGAAA-AT-GTATTGAATCACAAAGAAGAAGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52283 : ---T--------------TA--T----T------AA-A-G--ATA---CGTC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-AATGAAA-AT-TTATTGAATCACAAAGATGAAGG----TCTCATTCGAAG---A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCGT--------T-CT------------------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52284 : --------------TA--G----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTG------T---AACTTTCTGTTCTGTAAA-TT-ATGGAAA-GT-TTATTGAATAACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---A-----------------tgt
gi|52286 : --------------TG--T----T---T--GA-A-G--ATG---CCTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-CG-ATTGAAG-GT-TTATTGAATCAAAAAGAGGGAGG----TCCCATTCAAAG---A-----------------
gi|52287 : --------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AATTTTCTGCTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAATAACAAAGAGTCAAA----TCCCATTCAAAG---A------------------CA----A------TGGCTGAT---TCCGT--------T-CT------------------------tgatggttgaatccatcttgt
gi|52289 : --------------TA--C----T---T--AA-AAG--ATG---CGTC--ACCTA------T---ACCTTTCTGTTCAGAAAA-TG-ATGGGAA-AT-TAATTGAATAACAAAGAGGAAGG----tgt
gi|52289 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CTT-------CAATG-------CT---TAGCATAACCCGACAC-TG-GCCAATaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttggcattttccgttttattcttcaatgcttagcataacccgacactggccaatcgcg
gi|52290 : tacttaaaagatgcgtcacctatacctttctgttcagaaaatgatgggaaattaattgaataacaaagaggaaggaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttg--------------TA--C----T---T--AA-A-G--TTG---CATC--ACCTA------T---AGCTTTATGTTCAGTTAA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGAAGG----TCCCACTCTAAA---A-----------------cgcg
gi|52291 : --------------TG--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCTAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-CTTTTAAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCTTTTAAAG---A-----------------TAA----T--------------------GG--------T-TG------------------------A--T-TCCGT-------CATTG----TAGTT---TAtaatggttgattccgtccttgt
gi|52291 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAATCCGATAC-TA-AGCAATttcaattcgttaatacacagatcggcattttccgtcttattcgtcaatgttttagcataatccgatactaagcaat
gi|52292 : tgtttaaagatgcatcacctataactttctgtctagtagatgatggaatatcttttaaatcacaaagaggaaggtcccttttaaagataatggttgattccgtcattgtagtttattcaattcgttaatacacagatcg--------------TG--T----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACTTTCTATTCAGTAAA-TG-AAGGAAA-AT-TTATTGACACACAAAGATGAAGG----TCCGCTTCGAAGATAA-----------------GTG----T------TGA----T---TCCGT--------
gi|52293 : --------------TA--TG---T---T--AA-A-G--ATG---CGTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTAATTAAA-TG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGccttgt
gi|52295 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-GTATTGAATAACAAAGAAGAAGG----TCACATTAGAAG---A-----------------tcacaaagacca
gi|52296 : A--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---AACTTTATGTTCGGTACATTG-AT-GAAA-TT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52297 : A--T----G---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---TACTTTATGTTCGGTAAA-TG-ATGAAAT-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATTCAAAG---A-----------------
gi|52300 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTT------T---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-TTGGAAA-G-----TTGAATCCAAAAGAGGAAGG----TCCCACTCAAAG---A-----------------
gi|52305 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACTTA------T---AACTTACTCTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATGACAAAAAGGAAGG----TCCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52306 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CACC--ATCTA------T---AGCTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATGGACA-AT-TTGTTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATCCGAAG---A-----------------
gi|52307 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAATAA--TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAATG----TCCGTTTCGAAG---A-----------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52307 : -T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGTATAAACCGATAC-CG-GCCAATGA---ATGACTTTATCGCtgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacaggtcgtcaaagttttagtataaaccgataccggccaatgaatgactttatcgc
gi|52308 : tttaaagatgtatcacctataattttctgttcaataatgatggaaagtttattgaatcacaaagatgaatgtccgtttcgaagatgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacagg--T----T---T--AA-A-G--ATG---CCTC--ACGTA------T---AATTTTCTGTTCAGCAAA-TT-ATTGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TTCCATCCGAAG---A-----------------TAA----TGG----TTG----T---TCCGTCA------T-TT------------------------AAGT-T-TAT-------CA
gi|52309 : --T----T---C--AA-A-A--ATG---CATC--ACCTACATGTAT---AACTTTCTGTTCAGTAA--TG-GTGGAAA-CT-TTATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCATTTCGAAG---A------------------CAATGGT------TGA----T---TCCGT--------C-CT------------------------T--T-T-AGT-------
gi|52310 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52311 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------taatagttgattccgtccttgt
gi|52313 : --T----T---C--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------C---AACTTTGTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-CT-GAATTGAATCATGAGGAGGGAGG----TCACATTTGAAG---A-----------------TAA----TGGTCGAT------T---TCTGT--------C-TT------------------------G--T-taatagttgattccgtccttgt
gi|52316 : ----T---T--CA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---ATTTTTCTGCTC-GTATA-TG-ACGCAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGTAGG----TCCGATTCGAAG---A-----------------
gi|52316 : -----------------GTA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CGGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGGGACGTGATTTtaatggttgactcactccttgtaaacaggtcggtattttccattttattcgtcaatgtttcggcataacccgatactggccaatgggacgtgatttagt
gi|52317 : ttcaagatgcatcacctatatttttctgctcgtatatgacgcaaagtttattgaatcacaaagaggtaggtccgattcgaagataatggttgactcactccttgtaaacaggtcg----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAT-GT-TTATTGAATCACAAATAGGGAGG----TCTTATTTGAAG---A-----------------agt
gi|52318 : ----T---T--AA-A-G--GTG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTGGA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGT----ACACATTTGAAG---G-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCCGT--------ttctgtccttgt
gi|52319 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGAAAA-AA-TTATTGAATCAAAAAGTTGAAGG----TCCCACTCGAAG---A------------------TA----T------TGGCTAAT---TCCGT--------TCTT------------------------A--T-ccttgt
gi|52320 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACCTT------T---AACATTCTGTTCCGTAAA-TG-ACGGAAA-G--TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---
gi|52321 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CA-C--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAGTAAA-TG-GTGGCAA-GT-TCATTGAATCACAAAGTGGAAGG----TTCCATTTGAAG---ttgatagttaattccgtccttgt
gi|52322 : ----T---T--AA-A-C--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGTAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGA----TCCCATTTGAA
gi|52323 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-ATGTAAA-GT-TTATTGAATCACAGAG----AAG----TTCCATTCGAGG---A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52324 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--AACTA------T---AACTTTCTCTTCAGTAAA-TG-ATGAAAC-AT-TCATTGAATCACAAAAAGGAAGGAAGACCCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52325 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACTTA------T---AACTTTGTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGCAGA----TCCTGTTTGAAG---A-----------------
gi|52326 : ----T---T--AA-A-G--ATG---AATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TT-ATGGAACTGT-TT-TTGACTCACAAACAGAAAGG----TCTCATTCGAAA---A-----------------
gi|52332 : ---T--AA-A-G--ATG---CATCTCACCTA------C---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-CTGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAGTG------------GAAG---A-----------------TAA----TGG----T------T---TCCGT--------T-CT------------------------taataattgattccgtccttgt
gi|52332 : -----------------GCC----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TTAAATAGCATAACTCGACAC-TA-GTCGATGT---GTGACCTTATAGCtgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcggccttttccgttttattcgtcaatgtttaaatagcataactcgacactagtcgatgtgtgaccttatagc
gi|52335 : taaagatgcatctcacctacaactttctgttcagtaagtgctggcaagtttattgaatcacaaagatgagtggaagataatggtttccgttcttgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcgG-ATG-AAA-GT-GTACTGAATCACGAAGAGGAAGG----TTCCATTCGAAG---ATAATGGTTGATTCTCCAGCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TA---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGC
gi|52336 : tgcatcatgttttccaacggcttcaagtttcttaga---CATC--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCATAAAGAGGAAGG----TCCAATTCGAAG---A-----------------
gi|52339 : A-TGTATGAGAA-AT-TTGTT-AAT---AAACAGGTAGG----T----------------------------------A----T------T------T---CCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATGACCCGGTAC-TG-ACCAATGG---TTGACTTTATCGtaatggttgattccgtccttgt
gi|52340 : agttttttctt---AGCTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCTTATTCAAAG---
gi|52342 : TTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTT-ATCACAAAAAGGAAGG----T
gi|52342 : -----------------GCA----T------G------T---TCTAT--------T-CT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAAATCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGCtgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttggcatgttctattctattcgtcaatgttttagcataaatcgatactggccaatgagtgactttattgc
gi|52344 : ttcagtaaatgatggaaagtttatttatcacaaaaaggaaggttgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttg-----------------GCA----T------T------T----CAAT--------A-TT------------------------A--T-T-CGT-------GAATG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TA-GCCAATGC---GTGATTTTATCG
gi|52347 : cgttgtcaatcttattttgagaaattagtaaatacacatgtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-CT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---AAGCATAACCCAATAA-TG-GCAAATGA---ATGACTTTATCGC
gi|52348 : gtaaatacacaggtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----G--TT---TAGCATAACGCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGATTTTATCGC
gi|52349 : ataagaaattcgatcatacacagttcg---A-----------------GCA----T------T------T---TCCCT--------T-TT------------------------A--A-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTTTATC
gi|52350 : ataggaaattcgttaatacacagaccCACTGGAAG---------------------GTG----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGAAAC-TG-GCCAATGA---GCAACTTTATCGC
gi|52351 : ATTCAAAG---GTCG--------------GCA----T------T------T---TCCGA--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---AAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGTCTTTATCGC
gi|52352 : GAAG---------------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATGACCCGGTCC-CG-GCCAATGG---TTGACTTTATCGC
gi|52354 : G---A-----------------GAA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-ACCAATTT---GTGACTTTAT
gi|52355 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--C-T-CGT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCTGATTC-TG-GCCAATTA---GTGACTTTATCAC
gi|52356 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAT-TA-GCCAATGA---GTGACATTATCGC
gi|52357 : ---A-----------------ACA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGTATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52358 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CACTG----T--TT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCCAATGT---GTGACTTTAT
gi|52360 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TTTAT--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----T--TT---TAGTATAGCCTGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52365 : -----------------GCA----G------T------T---TCCGT--------T-TC------------------------A--T-T-CGT-------AGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGC---GTCACTTTATGGC
gi|52367 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAA-TG-GCCAATGT---GTAACTTTATCGC
gi|52368 : -----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-T-------------------------A--T-T-TGT-------CAACA----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52369 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTCTATCGC
gi|52370 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGC-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCATTTAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52371 : -----------------GCA----T------T------T---TCCTT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--CT---TAGCATAACCAGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52372 : -----------------GCA----T------T------T---TCT-T--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCACTAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCAC
gi|52375 : -----------------GCA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAA-TT-GCCGGTGG---GTGACTTTATCGC
gi|52377 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CCT-------CAATG----T--TT---TAGCTTAACCCGATAC-CG-ATCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52378 : -----------------GCT----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CATTG----T--TT---TAGTATAACCTGATAT-TG-GCCAATGT---TTGACTTTATCGC
gi|52380 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----A--TT---TAGCATAACCCTATAC-TG-GCCATTGA---GTGACTTTATCGC
gi|52381 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGC--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TA---TAGTATAATCCGATAC-TT-GCAAATGC---GTGACTCTATCGC
gi|52384 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TA------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAACAAAACCCGATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52386 : -----------------GCA----T------T------T---TTCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGTTTAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52389 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-GT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCGGTAC-TG-GCCAACGA---GGGACTTTATCG
gi|52391 : -----------------GCA----T------T------T---TCC-C--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTCTCG
gi|52392 : -----------------GTA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----T--TT---TAGTATAACCCAATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52404 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCGATAC-TG-TCCAATGA---GTGACTTAATCGC
gi|52406 : CA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TATCATAACCCGATAC-TG-GCCGATGT---GTGACTTTATCGC
gi|52407 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GAGACTTTATC
gi|52409 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TC------------------------A--T-T-CGT-------TAATG----T--TT---TGGCATAACCCGATAC-TG-GCTAATGA---GTAACTTTATCGC
gi|52411 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-C-CGT-------CATTG----T--TT---CAGCATAACCCCATAC-TG-GCTGATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52413 : CA----T------G------T---TCTGT--------T-GT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGTGTAACTTGATAC-TG-GCCAATGC---GTGACTTTATCAC
gi|52414 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCTGTTAC-TG-TCAGCTGA---GTAACTTTATCGC
gi|52417 : A----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GGAAATGA---GTGACTTTATCGC
blockSeqs : A ACA A T T A C G G A GAGG CGAT A A CGG AC ACA GAAATGAAGAAAAT AC ACTG GAT CCA CATGTA TTA AAGA ATA TAATGGTTGATTCTCCA ATGG GGGAAA GGTTGA GAG CCTTGTAG TATAGATTATCATATTTATGAAAA C CATTACA AGAA AAA GAC
blockSeqs : A . A T . A C . G A GAGG . . . AC C G GAAATACG G G GT . AA TTA . . TCG CGG GGTCGA GGCTGA A CA ATGAGAA C . . . .
blockSeqs : . . . G . . A . A T CATT . . . . C A AA C . AC . . . . . . . CG GGCTAA . . . . . . . .
blockSeqs : A . . T . G G . . . . . C . C . . A . . . . . . . GG GTTGA . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . GG TGA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . GG GA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ***
originalCons : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
finalCons : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
Alignments
lowQualScore : 111 1 1111 11111111111111 111111
lowQualScore : 3 777 3 0 1 0 0 8 0 1 6 1 6 0000 0 5555 2 2 666 22 666 44444444444444 33 2222 333 11 0 0 11 111 00 222222 333 0 0 0 0 1111 111 33333333333333333 2222 666666 000000 111 22222222 0 777777777777777777777777 00 0 1 2222222 1111 00 111 0 0 111
lowQualScore : . ... . . . . . . . . . . . .... . .... . . ... .. ... .............. .. .... ... .. . . .. ... .. ...... ... . . . . .... ... ................. .... ...... ...... ... ........ . ........................ .. . . ....... .... .. ... . . ...
lowQualScore : 2 555 2 8 0 8 8 0 6 0 7 0 3 7777 4 0000 2 2 666 55 000 44444444444444 00 2222 999 00 7 7 00 222 99 999999 666 7 6 6 6 4444 000 88888888888888888 2222 444444 555555 666 99999999 6 666666666666666666666666 99 6 3 1111111 5555 99 222 7 7 333
consensus : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
Reference ( family-196 ) : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACGTAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52243 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52244 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52245 : ATGCAAACGATGATACTCTTTTCTGTCAAGTTACCTGCAAAATCATGCATATACTTTAGATATAACTATAAATATTGA---TTTAAAACTAAAAACTAAATATACATATAGACATAACAAGC-ACTAAACTTTGCGTTTACGCTA-TGAGAACATAGATGAGGTAAGTTTCAAC----A-TT-T---T-CTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTC------TTTAAGCTTTCTCTTTAGTAAG-CG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATAGCAAATAGGAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CAGCATAACCTGTTAT-TG-GCCAATGC---GTGACTTTGTCGC
gi|52247 : AACTATGA-TACTGAACATTTAAA--TAAAAAC--AATAGATACAT---TATA-TAAGTTATTGA-CTCTGAGCTGACGATA-TGA--------------TGAGCTTTAAC----A-CT-T---T-CTT---TGAAATACG------TAG-T----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-AG-ATTGAAA-GA-GTATTGAACCTCAAACAGGAAAG----TCCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52247 : A----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGC-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAT-TG-ACCAATGA---GCAAATTTACCGCtaattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaattttccgttttattcgccgatgttttagcataacccgatattgaccaatgagcaaatttaccgc
gi|52248 : aactatgatactgaacatttaaataaaaacaatagatacattatataagttattgactctgagctgacgatatgatgagctttaacactttctttgaaatacgtagtttaaagatgcaatacctataactttttgttcagtaaaagattgaaagagtattgaacctcaaacaggaaagtcccattcgaagataattgttgattctgtccatatggcttatcttatttataagaaaggtcggaTAAATATTAAAAAAACAAAAAAACAGAATCAAT-ATTAA--------TTT---TTA-TGAAAATTTAAAGCATTTAAATTTCAATCGATA-CT-TAC-TACTTG--T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTG------T---TACTTTCTGTTTAGTAAA-CG-ATGGAAA-GT-TTATTAACTT-TAAAGTGGAAGA----ACCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52250 : TACGATGGTGAGAATGTAAAT--------TTTCAAC----A-TT-T---T-GTC---TGAAATGAAGAAAATTA--T----TGATT--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA----------AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGGAAA-ATATTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---------------------GTT----T------TGGTTGAT---TCCGT--------C-TTTATAGATTATCATATTTATGAAAAA--T-T-CGTCATTACACAATG----T--AT---TAGCATAACACGATAC-CG-GCCAATGA---GTGACTTT
gi|52253 : AAATTT--GC----A-TT-T---T-GTTACAC--------------TA--T----T---TTTAA-G-G--ATG---TATC--ACTTAAA----T---AACTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCACAAATAGAGCGA----TATCATTCAAAG---A-----------------
gi|52253 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCCTAACCCAATACGCGCGCCAATGA---GTGACTTTATCtaatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcggcattttccgttttattcgtcaatgttttagcctaacccaatacgcgcgccaatgagtgactttatc
gi|52254 : aaatttgcattttgttacactatttttaaggatgtatcacttaaataactttctgatcagtaaatgatagaaagtttattgaatcacaaatagagcgatatcattcaaagataatacttgattctgtcccattacaagaaatttgtaatacgtaggtcgAATTTTAAT----A-TA-T---T-CTC---T---------------A--T-----------AA-A-G--ATG---CATT--GCTTA------T---AACTTTCTGTTCAATACA-TT-ATAGCAC-GT-TTATTGAATCTCAAAGCGGAATG----TCCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52254 : -----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAACGA---GTGtattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcggcattttccattttattcgtcaatgttttagcataacccgatactggccaacgagtg
gi|52256 : aattttaatatattctctataaagatgcattgcttataactttctgttcaatacattatagcacgtttattgaatctcaaagcggaatgtcccattcgaagatattggataattacgtcattgtagtttatcttatttatgaaggtcgTTAAC----A-CC-T---T-TTT---T--------------TA--A----GA--T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCGG------T---AATTTGCTATCCAGTAAA-TG-ATGGCAA-GG-T-ATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------TAA----T------T------G---TTGAT--------T-TC------------------------G--T-T-C
gi|52257 : TTAAG----A-TT-TCGGT-CTT---TC-------------TC--T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--CACTA------T---AACTCTCTTTTTAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAACAATAACGACGATGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------ttgt
gi|52259 : CAAC----A-TT-T---T-CTA---C--------------CA--TACTGT---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTTTGTTCAGTAAA-TG-ATAGAAA-GT-TTATTGAATCAC--------AGT----TCCCATTCGAGG---A-----------------
gi|52260 : AAC----AATTAT---T-GTT---T--------------CA--T----T---C--AAGA-G--A-----CATC--AACTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-TG-ATGGAAA-TT-TCATTTTATCTCAACGAGGCAGG----TCCCATTTGAAG---A-----------------TAA----TGGGAAAT------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATA----T--TT---CAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATAA---GTGACTTTATC
gi|52262 : AC----A-TG-T---A-CGT---T--------------TA--T----TGT-T--TA-A-G--ATG---CATT--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAAAAAGG----TCACATTTGATG-----------------------A----T------T------TA--TCTTA--------T-TTATGAGAA-----------------A--T-T-CGT-------CAAT
gi|52262 : CA----T------T------T---TCCAT--------T-TC------------------------A--T-T-CAT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TA-CCCAATGA---GTGACTTTATTGCacacaggtcgtcattttccatttcattcatcagtgttttagcataacccgatactacccaatgagtgactttattgc
gi|52264 : acatgtacgtttattgtttaagatgcattaccaataactttctgttcagtaaatgatggaaagtttattgaatcacaaaaaaaaaggtcacatttgatgatttatcttatttatgagaaattcgtcaatacacaggtcgtAT----A-TT-T---A-TTT---T--------------TAACC----T---T--AA-A-A--GTG---CATT--ACCTA------T-------TTCTGTTGCGTAAA-TG-ATGGAAA-AC-TTACTGAATTGCAAAGAGGAAGG----TCCCATTAGAAG---A-----------------
gi|52266 : C----A-TT-T---T-AAT---TAA------------TA--T----TAC-T--AA-A-G--ATG---CATG--ACTTA------T---AACTTTATGTTCAGTACA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGG----TCGCATTCGAAG---A-----------------taatgcttgatttcgtccttgt
gi|52267 : ----A-TT-T---T-GTT---T--------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATGCCACATC--AT---------T---AACTTTCTATTCATTAAA-TG-ATGGAAA-TG-TTATTGAATCACATAGCGGAAGG----TTCTATACAAAG---A-----------------TAA----TCG----T------TGAGTCCGT--------T-CT------------------------
gi|52268 : ----A-TT-T---T-ATTA--T--------------TA--C----T---C--AA-A-G--ATG---TATC--ATCTA------T---AAGTATCTGTTCAATAAA-TG-ATGGAAC-GT-TTATTGAATAACACAGAGGAAGT----TCCCATTTGAAG---A-----------------TAA----T------G------T---TTCAT--------T-CT------------------------G--T-tgt
gi|52269 : -TT-T---T-TTT---T--------------TC--T----C---T--TA-A-G--ATG---CAAC--ACCTA------T---AACTT-CTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TCATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCCCATGCGAAG---A-----------------
gi|52272 : ---T-CTT---T--------------C---T----T---T--AA---G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTCCCGTTCAGTAA--TG-ATTGAAA-GT-TTATTAAATCGCAAAGATGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------taatggatgattctgtctt
gi|52274 : TT---T--------------CA--T----A---T--AA-A-G--ATA---CATC--AGCTA------T---AAATTTCTGTTCAGTAAA-TT-TTTAAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---A------------------TA----A------T------A---GCTG-------------------------------------A--T-TCCGT-------CCATG----T--TT---T
gi|52276 : T---T--------------TA--C----T---T--AA-A-G--GCG---CATC--ACCTA------A---AACTTTCTATTCAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----T-CCATTCGAAttaat
gi|52280 : ---T--------------TA--A----T---T--AA-A-ATTATG---CATC--CTCTA------T---AACTTGCTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52281 : ---T--------------TG--C----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--ACAAA------T---AACTTTCTGTTCAATATA-TT-ATGAAAA-GT-GTATCAAATCGCAAAGAGACAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------TCACGG-T------TGA----T---TCCATCCTTGTAGT-TT------------------------A--TCT-CAT-------TTATGAGAAT--TT---TAGCATAACCTGATAC-TG-ACAAATGA---GTaaatggttgattgcgtctt
gi|52282 : ---T--------------TAC-T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACATTCTGTTCAGTAAA-TG-ATTGAAA-AT-GTATTGAATCACAAAGAAGAAGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52283 : ---T--------------TA--T----T------AA-A-G--ATA---CGTC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-AATGAAA-AT-TTATTGAATCACAAAGATGAAGG----TCTCATTCGAAG---A-----------------TAA----TGG----TTGA---T---TCCGT--------T-CT------------------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52284 : --------------TA--G----T---T--AA-A-G--ATG---CAAT--ACCTG------T---AACTTTCTGTTCTGTAAA-TT-ATGGAAA-GT-TTATTGAATAACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---A-----------------tgt
gi|52286 : --------------TG--T----T---T--GA-A-G--ATG---CCTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGCAAA-CG-ATTGAAG-GT-TTATTGAATCAAAAAGAGGGAGG----TCCCATTCAAAG---A-----------------
gi|52287 : --------------TA--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AATTTTCTGCTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-AT-GTATTGAATAACAAAGAGTCAAA----TCCCATTCAAAG---A------------------CA----A------TGGCTGAT---TCCGT--------T-CT------------------------tgatggttgaatccatcttgt
gi|52289 : --------------TA--C----T---T--AA-AAG--ATG---CGTC--ACCTA------T---ACCTTTCTGTTCAGAAAA-TG-ATGGGAA-AT-TAATTGAATAACAAAGAGGAAGG----tgt
gi|52289 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CTT-------CAATG-------CT---TAGCATAACCCGACAC-TG-GCCAATaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttggcattttccgttttattcttcaatgcttagcataacccgacactggccaatcgcg
gi|52290 : tacttaaaagatgcgtcacctatacctttctgttcagaaaatgatgggaaattaattgaataacaaagaggaaggaattgctgattccgttcttgtagttcatcttatttatgagaaattcgttaatacacaggttg--------------TA--C----T---T--AA-A-G--TTG---CATC--ACCTA------T---AGCTTTATGTTCAGTTAA-TG-TTGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGAAGG----TCCCACTCTAAA---A-----------------cgcg
gi|52291 : --------------TG--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCTAGTAGA-TG-ATGGAAT-AT-CTTTTAAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCTTTTAAAG---A-----------------TAA----T--------------------GG--------T-TG------------------------A--T-TCCGT-------CATTG----TAGTT---TAtaatggttgattccgtccttgt
gi|52291 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------C-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAATCCGATAC-TA-AGCAATttcaattcgttaatacacagatcggcattttccgtcttattcgtcaatgttttagcataatccgatactaagcaat
gi|52292 : tgtttaaagatgcatcacctataactttctgtctagtagatgatggaatatcttttaaatcacaaagaggaaggtcccttttaaagataatggttgattccgtcattgtagtttattcaattcgttaatacacagatcg--------------TG--T----T---T--TA-A-G--ATG---CATC--AACTA------T---AACTTTCTATTCAGTAAA-TG-AAGGAAA-AT-TTATTGACACACAAAGATGAAGG----TCCGCTTCGAAGATAA-----------------GTG----T------TGA----T---TCCGT--------
gi|52293 : --------------TA--TG---T---T--AA-A-G--ATG---CGTC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTAATTAAA-TG-ATGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGccttgt
gi|52295 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTCCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-GTATTGAATAACAAAGAAGAAGG----TCACATTAGAAG---A-----------------tcacaaagacca
gi|52296 : A--T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---AACTTTATGTTCGGTACATTG-AT-GAAA-TT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCGAAG---A-----------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52297 : A--T----G---T--AA-A-G--ATG---CATC--ATCTC------T---TACTTTATGTTCGGTAAA-TG-ATGAAAT-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATTCAAAG---A-----------------
gi|52300 : A--C----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTT------T---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-TTGGAAA-G-----TTGAATCCAAAAGAGGAAGG----TCCCACTCAAAG---A-----------------
gi|52305 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACTTA------T---AACTTACTCTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATGACAAAAAGGAAGG----TCCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52306 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---CACC--ATCTA------T---AGCTTTCTGATCAGTAAA-TG-ATGGACA-AT-TTGTTGAATCACAAAGAGGAAGG----CCCCATCCGAAG---A-----------------
gi|52307 : --T----T---T--AA-A-G--ATG---TATC--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAATAA--TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAATG----TCCGTTTCGAAG---A-----------------taatggttgattccgtccttgt
gi|52307 : -T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGTATAAACCGATAC-CG-GCCAATGA---ATGACTTTATCGCtgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacaggtcgtcaaagttttagtataaaccgataccggccaatgaatgactttatcgc
gi|52308 : tttaaagatgtatcacctataattttctgttcaataatgatggaaagtttattgaatcacaaagatgaatgtccgtttcgaagatgattgttgattacgtacttatagtttatcttatttatgaggaactcgttaaaacacagg--T----T---T--AA-A-G--ATG---CCTC--ACGTA------T---AATTTTCTGTTCAGCAAA-TT-ATTGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TTCCATCCGAAG---A-----------------TAA----TGG----TTG----T---TCCGTCA------T-TT------------------------AAGT-T-TAT-------CA
gi|52309 : --T----T---C--AA-A-A--ATG---CATC--ACCTACATGTAT---AACTTTCTGTTCAGTAA--TG-GTGGAAA-CT-TTATTGAATCACAAAGAGGCAGG----TCCATTTCGAAG---A------------------CAATGGT------TGA----T---TCCGT--------C-CT------------------------T--T-T-AGT-------
gi|52310 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------
gi|52311 : --T----T---T--AA-A-G--GTA---CATC--ACCCC------C---AACTTTCCGTTAAGTAAA-TG-ATGGCAA-AT-TTATTGAATCATAAAGAGTTGGG----TTCCATTCGAAG---A-----------------taatagttgattccgtccttgt
gi|52313 : --T----T---C--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------C---AACTTTGTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-CT-GAATTGAATCATGAGGAGGGAGG----TCACATTTGAAG---A-----------------TAA----TGGTCGAT------T---TCTGT--------C-TT------------------------G--T-taatagttgattccgtccttgt
gi|52316 : ----T---T--CA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---ATTTTTCTGCTC-GTATA-TG-ACGCAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGTAGG----TCCGATTCGAAG---A-----------------
gi|52316 : -----------------GTA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---CGGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGGGACGTGATTTtaatggttgactcactccttgtaaacaggtcggtattttccattttattcgtcaatgtttcggcataacccgatactggccaatgggacgtgatttagt
gi|52317 : ttcaagatgcatcacctatatttttctgctcgtatatgacgcaaagtttattgaatcacaaagaggtaggtccgattcgaagataatggttgactcactccttgtaaacaggtcg----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTT-TGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAT-GT-TTATTGAATCACAAATAGGGAGG----TCTTATTTGAAG---A-----------------agt
gi|52318 : ----T---T--AA-A-G--GTG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTGGA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGAAAGT----ACACATTTGAAG---G-----------------TAA----T------TGTTGA-T---TCCGT--------ttctgtccttgt
gi|52319 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGAAAA-AA-TTATTGAATCAAAAAGTTGAAGG----TCCCACTCGAAG---A------------------TA----T------TGGCTAAT---TCCGT--------TCTT------------------------A--T-ccttgt
gi|52320 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACCTT------T---AACATTCTGTTCCGTAAA-TG-ACGGAAA-G--TTATTGAATCACAAAGAGGAAGG----TCCCATTCAAAG---
gi|52321 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CA-C--ACCTA------T---AATTTTCTGTTCAGTAAA-TG-GTGGCAA-GT-TCATTGAATCACAAAGTGGAAGG----TTCCATTTGAAG---ttgatagttaattccgtccttgt
gi|52322 : ----T---T--AA-A-C--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-TTGTAAA-GT-TTATTGAATCACAAAGAGGAAGA----TCCCATTTGAA
gi|52323 : ----T---T--AA-A-G--ATG---CATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAATAAA-TG-ATGTAAA-GT-TTATTGAATCACAGAG----AAG----TTCCATTCGAGG---A-----------------tataatggttgattccgtccttgt
gi|52324 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--AACTA------T---AACTTTCTCTTCAGTAAA-TG-ATGAAAC-AT-TCATTGAATCACAAAAAGGAAGGAAGACCCCATTTGAAG---A-----------------
gi|52325 : ----T---T--AA-A-G--ATA---CATC--ACTTA------T---AACTTTGTGTTCAGTGAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAAAAGGCAGA----TCCTGTTTGAAG---A-----------------
gi|52326 : ----T---T--AA-A-G--ATG---AATC--ACCTA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TT-ATGGAACTGT-TT-TTGACTCACAAACAGAAAGG----TCTCATTCGAAA---A-----------------
gi|52332 : ---T--AA-A-G--ATG---CATCTCACCTA------C---AACTTTCTGTTCAGTAAG-TG-CTGGCAA-GT-TTATTGAATCACAAAGATGAGTG------------GAAG---A-----------------TAA----TGG----T------T---TCCGT--------T-CT------------------------taataattgattccgtccttgt
gi|52332 : -----------------GCC----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TTAAATAGCATAACTCGACAC-TA-GTCGATGT---GTGACCTTATAGCtgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcggccttttccgttttattcgtcaatgtttaaatagcataactcgacactagtcgatgtgtgaccttatagc
gi|52335 : taaagatgcatctcacctacaactttctgttcagtaagtgctggcaagtttattgaatcacaaagatgagtggaagataatggtttccgttcttgtagtttatcttatttatgagaagttcgatagtgtgcagttcgG-ATG-AAA-GT-GTACTGAATCACGAAGAGGAAGG----TTCCATTCGAAG---ATAATGGTTGATTCTCCAGCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TA---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGC
gi|52336 : tgcatcatgttttccaacggcttcaagtttcttaga---CATC--ACCAA------T---AACTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCATAAAGAGGAAGG----TCCAATTCGAAG---A-----------------
gi|52339 : A-TGTATGAGAA-AT-TTGTT-AAT---AAACAGGTAGG----T----------------------------------A----T------T------T---CCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATGACCCGGTAC-TG-ACCAATGG---TTGACTTTATCGtaatggttgattccgtccttgt
gi|52340 : agttttttctt---AGCTTTCTGTTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTGAATCACAAACAGGAAGG----TCTTATTCAAAG---
gi|52342 : TTCAGTAAA-TG-ATGGAAA-GT-TTATTT-ATCACAAAAAGGAAGG----T
gi|52342 : -----------------GCA----T------G------T---TCTAT--------T-CT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAAATCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATTGCtgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttggcatgttctattctattcgtcaatgttttagcataaatcgatactggccaatgagtgactttattgc
gi|52344 : ttcagtaaatgatggaaagtttatttatcacaaaaaggaaggttgattccatcagtttattttatttatgagaaatgcgtaaatacacaggtttg-----------------GCA----T------T------T----CAAT--------A-TT------------------------A--T-T-CGT-------GAATG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TA-GCCAATGC---GTGATTTTATCG
gi|52347 : cgttgtcaatcttattttgagaaattagtaaatacacatgtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-CT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---AAGCATAACCCAATAA-TG-GCAAATGA---ATGACTTTATCGC
gi|52348 : gtaaatacacaggtcg-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----G--TT---TAGCATAACGCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGATTTTATCGC
gi|52349 : ataagaaattcgatcatacacagttcg---A-----------------GCA----T------T------T---TCCCT--------T-TT------------------------A--A-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTTTATC
gi|52350 : ataggaaattcgttaatacacagaccCACTGGAAG---------------------GTG----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGAAAC-TG-GCCAATGA---GCAACTTTATCGC
gi|52351 : ATTCAAAG---GTCG--------------GCA----T------T------T---TCCGA--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---AAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGTCTTTATCGC
gi|52352 : GAAG---------------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATGACCCGGTCC-CG-GCCAATGG---TTGACTTTATCGC
gi|52354 : G---A-----------------GAA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-ACCAATTT---GTGACTTTAT
gi|52355 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--C-T-CGT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCTGATTC-TG-GCCAATTA---GTGACTTTATCAC
gi|52356 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAT-TA-GCCAATGA---GTGACATTATCGC
gi|52357 : ---A-----------------ACA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGTATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52358 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CACTG----T--TT---TAGCATAATCAGATAC-TG-GCCAATGT---GTGACTTTAT
gi|52360 : ---A-----------------GCA----T------T------T---TTTAT--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----T--TT---TAGTATAGCCTGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52365 : -----------------GCA----G------T------T---TCCGT--------T-TC------------------------A--T-T-CGT-------AGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGC---GTCACTTTATGGC
gi|52367 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CGATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAA-TG-GCCAATGT---GTAACTTTATCGC
gi|52368 : -----------------GCA----T------T------T---TCCAT--------T-T-------------------------A--T-T-TGT-------CAACA----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52369 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GCAAATGA---GTGACTCTATCGC
gi|52370 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGC-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCATTTAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52371 : -----------------GCA----T------T------T---TCCTT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--CT---TAGCATAACCAGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52372 : -----------------GCA----T------T------T---TCT-T--------T-TT------------------------A--T-T-CAT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCACTAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCAC
gi|52375 : -----------------GCA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------G--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAA-TT-GCCGGTGG---GTGACTTTATCGC
gi|52377 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CCT-------CAATG----T--TT---TAGCTTAACCCGATAC-CG-ATCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52378 : -----------------GCT----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CATTG----T--TT---TAGTATAACCTGATAT-TG-GCCAATGT---TTGACTTTATCGC
gi|52380 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----A--TT---TAGCATAACCCTATAC-TG-GCCATTGA---GTGACTTTATCGC
gi|52381 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGC--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TA---TAGTATAATCCGATAC-TT-GCAAATGC---GTGACTCTATCGC
gi|52384 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-TA------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAACAAAACCCGATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52386 : -----------------GCA----T------T------T---TTCAT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGTTTAACCCGATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52389 : -----------------GCA----T------T------T---TCCGT--------T-GT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCGGTAC-TG-GCCAACGA---GGGACTTTATCG
gi|52391 : -----------------GCA----T------T------T---TCC-C--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAAAG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GTGACTTTCTCG
gi|52392 : -----------------GTA----T------T------T---TCCAT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAATG----T--TT---TAGTATAACCCAATAC-TG-ACCAATGA---GTGACTTTATCG
gi|52404 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAACATAACCCGATAC-TG-TCCAATGA---GTGACTTAATCGC
gi|52406 : CA----T------T------T---TCTGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TATCATAACCCGATAC-TG-GCCGATGT---GTGACTTTATCGC
gi|52407 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCAATAC-TG-GCCAATGA---GAGACTTTATC
gi|52409 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TC------------------------A--T-T-CGT-------TAATG----T--TT---TGGCATAACCCGATAC-TG-GCTAATGA---GTAACTTTATCGC
gi|52411 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-C-CGT-------CATTG----T--TT---CAGCATAACCCCATAC-TG-GCTGATGA---GTGACTTTATCGC
gi|52413 : CA----T------G------T---TCTGT--------T-GT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGTGTAACTTGATAC-TG-GCCAATGC---GTGACTTTATCAC
gi|52414 : CA----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-TGT-------CAGTG----T--TT---TAGCATAACCTGTTAC-TG-TCAGCTGA---GTAACTTTATCGC
gi|52417 : A----T------T------T---TCCGT--------T-TT------------------------A--T-T-CGT-------CAATG----T--TT---TAGCATAACCCGATAC-TG-GGAAATGA---GTGACTTTATCGC