lowQualScore : 1111 444444
lowQualScore : 1 11 3 0 2 0 000 22222 555 77 1111 666666
lowQualScore : . .. . . . . ... ..... ... .. .... ......
lowQualScore : 2 00 8 4 4 4 777 55555 666 99 2222 000000
consensus : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAG--AAACCGACAGATCTGC-GC-AAATGTCGCA
Reference ( gi|17497 ) : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAG--AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17498 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAG--AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17501 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAG--AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17500 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAG--AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17503 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAG--AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17499 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATGT-----TAA---CAG--AAACTGACAGATCTGC------CTGTTGCA
gi|17502 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGGCATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CAT--AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAgtgttaa
gi|17504 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17508 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17510 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17509 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17514 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17513 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17512 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17419 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---gcatggcaa
gi|17518 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACGTG----TAG---CAt
gi|17520 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACGT-----tatgcaaa
gi|17521 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----GAA---
gi|17516 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17522 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG
gi|17524 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATGC-----T
gi|17505 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17526 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----GAA---
gi|17423 : TTTTATCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17507 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAATTGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---t
gi|17527 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGATGT-----
gi|17528 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGTCATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGattgttgtcg
gi|17515 : TTTT-TCGC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATTTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17530 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAACC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACCT-----T
gi|17424 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17525 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAACTGTTACAA-TGGATCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17533 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTGGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACAT-----TAA---tgtttcacaa
gi|17532 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTGGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACAT-----TAA---
gi|17422 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----AAA---
gi|17529 : tTTTT-TCAC--TCAGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGGGGTGTGAGACGTAATACTAG---CAG--Agtgtaaatcgtaaa
gi|17506 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTAT-GGAAATGTAGTAGTGGTGTGAGACGT-----c
gi|17425 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAGTGTTACAC-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGACGT-----TAA---actgcgccaccgcaacaacgccaaaaacgttgcac
gi|17427 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTAGGGCATAAATGCTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---TAt
gi|17511 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTAAGGGAATTGTTATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---t
gi|17428 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTC-GGACATAAATATTACAA-TGGAGCC---CTATGGGGAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----t
gi|17537 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGATATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGTGAGAC
gi|17432 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-CGGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGATGTGAGACGT-----Taatg
gi|17426 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGTAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17539 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAAAGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAACTGTAATAGTGGGGTGAGACGatatgtc
gi|17433 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGATACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG
gi|17430 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTGGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATACAATAGTGGTGTGAGACGT-----GAA---Cagtaacgtc
gi|17449 : tTTTT-TCTC--TCCGT-TTT-GGACTTAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTAAGACGT-----tccgc
gi|17517 : tTTTT-TCTT--TCTGT-TTT-GGACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGTGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17519 : TTTT-TCGC--TATGT-TTG-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGtatgttatgaagcctactgcaaaat
gi|17531 : TTTT-TTAA--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGnnnnnnnnnnaa
gi|17523 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-AGACATAAATGTTACAA-TAGAGCC---CTATGGGAAATGTAATGGTGGTGTGAGACAT-----
gi|17536 : TTTT-CCAC--TCTGT-TTT-GGACATAATTGTTACAA-TGGAGCC---CTAAGGGAAATGTAATAGTGGTGCAAGACG------TGA---CGGC-AAACgtagtg
gi|17420 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACGA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGCGAGACGTA----TAA---gcca
gi|17441 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTCACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACAT-----T
gi|17429 : tTTTT-TCACATTGTGT-TCT-GAACATAAATGTTAAAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----Ttaat
gi|17453 : tTCTT-TCAC--TATGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAACAATGGTGTGAGACTT-----Tgtattcgtaaac
gi|17443 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGCAAGATGT-----CAA---
gi|17435 : tTTTC-TCGC--TATGT-TTT-GGATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGAC-T-----TA
gi|17440 : tTTTT-TCAC--TGTTTGTTT-GGACATAAATATTACAA-TGTAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17438 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTTCAA-TGACGCA---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----Ttatctgataaac
gi|17538 : tTTTT-TCAC--TATGT-TTT-GGACATCAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCGATACTGGTGCGAGACGT-----Ttatattg
gi|17535 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATACATGTTA--A-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGCGGTGTGAGACGT-----T
gi|17444 : TTTC-CCAC--TGTGT-TTT-TGATATAAATGTAACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGGCGT-----TAA---Ctaat
gi|17439 : tTTTT-TCGC--TATGT-TTT-GATTATAAATGCTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----ccccacaacccttc
gi|17534 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACTTAAATTTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGACAT-----TGA---
gi|17448 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-TAACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATAGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17495 : tTTTT-TAGC--TGTGT-TTT-GGACAAAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGTTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17416 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-TGACATCTATATTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGAGGTGTGAGACGT-----TAATGTCGG--AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAtgtctcaaacccatctgccgccagatgtcgcacgtttaacacgctatggcatagcaccacatcgggaacagggtgcgcttc
gi|17445 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GAAGATAAATGTTACAA-TGGAGGC---CTATGGGAAATGTAATTATGGTGTGAGACGT-----Tcgtttaacacgttatggcatagcaccacattgggaacaggatgcgattc
gi|17452 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTAAAA-TAGAGCT---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACGT-----TAA---TAcagtccaaa
gi|17434 : tTTTT-TTAC--TGTGT-ATT-TGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAGAGTGGTGTGAGACAT-----AAA---t
gi|17451 : tTTTT-TAAC--TTTGA-TTT-GGACATAAATATTACAT-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---tgttacaa
gi|17414 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTTTGGACATAA-TGTTACAA-TTGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17458 : tTTTT-TCAC--TGTGT-GTT-GAAGATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGAGTGAGACGT-----Ttgttgcaaacccatctgccgccaaatgtctcacgtttaacacgctatggcatagtaccacattgggaacaggatgcgcttc
gi|17436 : tTTGT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATTTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTTTGAGACAT-----AAA---tat
gi|17446 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTG-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGAAAGATATAATAGTGGTGTGAGACGT-----AAA---tgttacaa
gi|17457 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTA-GGAGATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTTTGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACGggcgtaaa
gi|17437 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTGGACATTAATGTGACAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTTTGAGACGT-----attcatgtgggattcaaac
gi|17442 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTCACGA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTTTGAAACAT-----ggatatc
gi|17447 : tTTTT-TTATG-TGTGT-TTT-GGATATAGATGTTTCAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17417 : TTTT-TCGC--TGTAT-TTT-GGACATAAATGTAACAA-TTGAACC---CTATGGGCAATGTAATAGTGGTGTAAGCCGT-----TAA---
gi|17496 : tTTTT-TCGC--TGTGT-TTT-GGACATAAATATTACAA-TTGAGCC---CTAAGGGATATCTAACAGTAGTGTGAGATGT-----TAATGTCGC--AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAtgtcgcaaacccattcgccgccaaatatcgcacgtttaactcgatatggcatagcaccacatcgggaacaagatgcgcttc
gi|17413 : TTTTATCGC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTCGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACGT-----TAA---cgttaaacacgctagggcataccaccacattgggaacagaatgcgcttc
gi|17415 : TTTTATCGC--TGTGT-TTT-GGAAATAAATGTTGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACGT-----TAA---tgttgcaaacccatctgccgccaaatgtcgcacgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacaggatgcacttc
gi|17560 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAtgttgcaaacccatctgccgccaaatgtcgcacgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacagaatgcacttc
gi|17561 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAAATGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17565 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-GGACATTAATGTTACAA-TGAAGCC---CTACGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGt
gi|17563 : TTT-TCAC--TGAGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGagaattgtcgc
gi|17418 : TTT-TCAC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGTGAAATATAATTGTTGTGTGAGACGT-----TAATG-TAGCAAAACC-----ATCTGCCGCTAAATGTCGCAggtaatg
gi|17562 : tcTTT-TCAC--TGTGC-TTT-GGATATAACTGTTACAA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACGT-----TAA---cgttgaatacgttatgtcatagcaccacatttggaacaggatgtgcttc
gi|17568 : TTT-TCAC--TGTGT-TTT-TAACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAGATGTAATAGTGATGTGAGACGT-----AAA---
gi|17567 : TTT-TCAC--TGTAT-TTT-GGATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAATGGTATGAGAC-T-----TA
gi|17564 : TTT-TTGC--AGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTACTGTGAGACGT-----Tttttcaaaaa
gi|17559 : TTT-TTGC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TTGAACCCTACTATGGGAAATGTAAC--CGGTGTGAGACGT-----TAATGTCGC--AAACC--C--ATCTGCAGCCAAATGTCGCAtatg
gi|17431 : TT-TCGC--TGTGT-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGCGTGAGACGT-----cgttttatacgctatggcatagaactacattgggaacaggatgctcttc
gi|17581 : tttaTT-TCTC--TCTGT-TTT-GGATATAAATGTTAGAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGAC
gi|17456 : TT-TCAC--TGTGT-TTT-GAACATAAATGTTACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTATGAGACGTG----TAA---CA
gi|17584 : ttaT-TCAT--TCTGT-TTT-GGACATATATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAtacgc
gi|17605 : T-TTT-GGACATAAATGTTACAA-TGGAATC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17592 : GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----AAA---ttatctcgcaa
Alignments
lowQualScore : 1111111111 33333 444444444
lowQualScore : 1 11 2 0 2 0 0 000 22222 6666666666 33333 888888888
lowQualScore : . .. . . . . . ... ..... .......... ..... .........
lowQualScore : 2 00 2 4 4 8 4 777 55555 5555555555 22222 777777777
consensus : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CG--G--AAACCGACAGATCTGCCGC-C-AAATGTCGCA
Reference ( family-183 ) : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--G--AAACCGACAGATCTG-CG--C-AAATGTCGCA
gi|17413 : TTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACGT-----TAA---TGTTGC-AAACC--C--ATCTGCCGC-C-AAATGTCGCA
gi|17414 : TTTT-CCAT--TGTGT-TTTTG-GACATAA-TGTTACAA-TTGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---TGTTGC-AAACC--C--ATCTGCCGC-C-AAATGTCTCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacaggatgcacttc
gi|17415 : tTTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GAAATAAATGTTGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACGT-----TAA---TGTTGC-AAACC--C--ATCTGCCGC-C-AAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagtaccacattgggaacaggatgcgcttc
gi|17416 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-T-GACATCTATATTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGAGGTGTGAGACGT-----TAATGTCG--G--AAACC--C--ATCTGCCGC-C-AAATGTCGCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacagaatgcacttc
gi|17417 : tTTTT-TCGC--TGTAT-TTT-G-GACATAAATGTAACAA-TTGAACC---CTATGGGCAATGTAATAGTGGTGTAAGCCGT-----TAATGTCG--C--AAACCCAT---TCGC-CGC-C-AAATATCGCAcgtttaacacgttatggcatagcaccacattgggaacaggatgcgattc
gi|17418 : tTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGTGAAATATAATTGTTGTGTGAGACGT-----TAATG-TA--GCAAAACC-----ATCTGCCG--CTAAATGTCGCAcgtttaactcgatatggcatagcaccacatcgggaacaagatgcgcttc
gi|17419 : tcTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---cgttgaatacgttatgtcatagcaccacatttggaacaggatgtgcttc
gi|17420 : tTTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACGA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGCGAGACGTA----TAA---t
gi|17422 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----AAA---
gi|17423 : tTTTTATCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---gtgtaaatcgtaaa
gi|17424 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAGTGGTGTGAGACGT-----t
gi|17425 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAGTGTTACAC-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGACGT-----TAA---
gi|17426 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGTAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----t
gi|17427 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTAG-GGCATAAATGCTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---TA--atatgtc
gi|17428 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTC-G-GACATAAATATTACAA-TGGAGCC---CTATGGGGAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----t
gi|17429 : tTTTT-TCACATTGTGT-TCT-G-AACATAAATGTTAAAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17430 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATACAATAGTGGTGTGAGACGT-----GAA---Cgtattcgtaaac
gi|17431 : tTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGCGTGAGACGT-----tccgc
gi|17432 : tttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-CGGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGATGTGAGACGT-----T
gi|17433 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGATACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG
gi|17434 : tTTTT-TTAC--TGTGT-ATT-T-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAGAGTGGTGTGAGACAT-----AAA---agtaacgtc
gi|17435 : tTTTC-TCGC--TATGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGAC-T-----TAtgttacaa
gi|17436 : tTTGT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATTTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTTTGAGACAT-----AAA---
gi|17436 : tGTGG-TTT-GAGACATAAATGTTACAA-tgttacaa
gi|17437 : tttgttcactgtgttttggacataaattttacaatggagccctatgggaattgtaataTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATTAATGTGACAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTTTGAGACGT-----
gi|17438 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTTCAA-TGACGCA---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----Tggatatc
gi|17439 : tTTTT-TCGC--TATGT-TTT-G-ATTATAAATGCTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----tatattg
gi|17440 : tTTTT-TCAC--TGTTTGTTT-G-GACATAAATATTACAA-TGTAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17441 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACAT-----Ttatctgataaac
gi|17442 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACGA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTTTGAAACAT-----taat
gi|17443 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGCAAGATGT-----CAA---
gi|17444 : tTTTC-CCAC--TGTGT-TTT-T-GATATAAATGTAACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGGCGT-----TAA---C
gi|17445 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGGC---CTATGGGAAATGTAATTATGGTGTGAGACGT-----Tccccacaacccttc
gi|17446 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGAAAGATATAATAGTGGTGTGAGACGT-----AAA---cagtccaaa
gi|17447 : tTTTT-TTATG-TGTGT-TTT-G-GATATAGATGTTTCAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----Tggcgtaaa
gi|17448 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-T-AACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATAGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17449 : tTTTT-TCTC--TCCGT-TTT-G-GACTTAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTAAGACGT-----
gi|17451 : tTTTT-TAAC--TTTGA-TTT-G-GACATAAATATTACAT-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17452 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTAAAA-TAGAGCT---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACGT-----TAA---TA--
gi|17453 : tTCTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAACAATGGTGTGAGACTT-----Tt
gi|17456 : tTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AACATAAATGTTACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTATGAGACGTG----TAA---CA--
gi|17457 : ttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTA-G-GAGATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTTTGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACGtacgc
gi|17458 : tTTTT-TCAC--TGTGT-GTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGAGTGAGACGT-----Tattcatgtgggattcaaac
gi|17495 : tTTTT-TAGC--TGTGT-TTT-G-GACAAAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGTTGTGAGACGT-----TAATGTCT--C--AAACC--C--ATCTGCCGC-C-AGATGTCGCAtat
gi|17496 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATATTACAA-TTGAGCC---CTAAGGGATATCTAACAGTAGTGTGAGATGT-----TAATGTCG--C--AAACC--C--ATCTGCCGC-C-AAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagcaccacatcgggaacagggtgcgcttc
gi|17497 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--G--AAACTGACAGATCTG-C-------ATGTTGCAcgttaaacacgctagggcataccaccacattgggaacagaatgcgcttc
gi|17498 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--G--AAACTGACAGATCTG-C-------ATGTTGCA
gi|17499 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATGT-----TAA---CA--G--AAACTGACAGATCTG-C---C----TGTTGCA
gi|17500 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--G--AAACTGACAGATCTG-C-------ATGTTGCAgtgttaa
gi|17501 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--G--AAACTGACAGATCTG-C-------ATGTTGCA
gi|17502 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GGCATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--T--AAACTGACAGATCTG-C-------ATGTTGCA
gi|17503 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---CA--G--AAACTGACAGATCTG-C-------ATGTTGCA
gi|17504 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17505 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17506 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTAT-GGAAATGTAGTAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17507 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---actgcgccaccgcaacaacgccaaaaacgttgcac
gi|17508 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17509 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17510 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17511 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTAAGGGAATTGTTATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17512 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----t
gi|17513 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----gcatggcaa
gi|17514 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17515 : TTTT-TCGC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATTTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17516 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----
gi|17517 : TTTT-TCTT--TCTGT-TTT-G-GACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGTGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17518 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACGTG----TAG---CA--tatgttatgaagcctactgcaaaat
gi|17519 : TTTT-TCGC--TATGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGtatgcaaa
gi|17520 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACGT-----nnnnnnnnnnaa
gi|17521 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----GAA---
gi|17522 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG
gi|17523 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-A-GACATAAATGTTACAA-TAGAGCC---CTATGGGAAATGTAATGGTGGTGTGAGACAT-----
gi|17524 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATGC-----Tgtagtg
gi|17525 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAACTGTTACAA-TGGATCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----T
gi|17526 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----GAA---tgtttcacaa
gi|17527 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGATGT-----
gi|17528 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GTCATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGattgttgtcg
gi|17529 : TTTT-TCAC--TCAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGGGGTGTGAGACGTAATACTAG---CA--G--A
gi|17530 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAACC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACCT-----Tc
gi|17531 : TTTT-TTAA--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG
gi|17532 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACAT-----TAA---
gi|17533 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACAT-----TAA---
gi|17534 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACTTAAATTTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGACAT-----TGA---
gi|17535 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATACATGTTA--A-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGCGGTGTGAGACGT-----T
gi|17536 : TTTT-CCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TGGAGCC---CTAAGGGAAATGTAATAGTGGTGCAAGACG------TGA---CG--GC-AAACtaat
gi|17537 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GATATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGTGAGACgcca
gi|17538 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATCAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCGATACTGGTGCGAGACGT-----Taatg
gi|17539 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAAAGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAACTGTAATAGTGGGGTGAGACG
gi|17559 : TTT-TTGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAACCCTACTATGGGAAATGTAAC--CGGTGTGAGACGT-----TAATGTCG--C--AAACC--C--ATCTG-CAGCC-AAATGTCGCA
gi|17560 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAcgttttatacgctatggcatagaactacattgggaacaggatgctcttc
gi|17561 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAAATGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---
gi|17562 : TTT-TCAC--TGTGC-TTT-G-GATATAACTGTTACAA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACGT-----TAA---t
gi|17563 : TTT-TCAC--TGAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG
gi|17564 : TTT-TTGC--AGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTACTGTGAGACGT-----Tggtaatg
gi|17565 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATTAATGTTACAA-TGAAGCC---CTACGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGtatg
gi|17567 : TTT-TCAC--TGTAT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAATGGTATGAGAC-T-----TAagaattgtcgc
gi|17568 : TTT-TCAC--TGTGT-TTT-T-AACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAGATGTAATAGTGATGTGAGACGT-----AAA---ttttcaaaaa
gi|17581 : TT-TCTC--TCTGT-TTT-G-GATATAAATGTTAGAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGAC
gi|17584 : T-TCAT--TCTGT-TTT-G-GACATATATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TA
gi|17592 : GTGG-TGT-GAGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----AAA---
gi|17605 : T-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAATC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGT-----TAA---tgttacaa
Alignments
lowQualScore : 222222 33333 111111
lowQualScore : 1 11 2 0 2 0 0 000 0 0 777 444444 22222 999999
lowQualScore : . .. . . . . . ... . . ... ...... ..... ......
lowQualScore : 2 00 2 4 4 8 4 777 4 9 888 444444 66666 666666
consensus : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
Reference ( family-183 ) : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
gi|17413 : TTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCA
gi|17414 : TTTT-CCAT--TGTGT-TTTTG-GACATAA-TGTTACAA-TTGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCTCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacaggatgcacttc
gi|17415 : tTTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GAAATAAATGTTGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagtaccacattgggaacaggatgcgcttc
gi|17416 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-T-GACATCTATATTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGAGGTGTGAGACG-T-TAATGTCG----G-AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacagaatgcacttc
gi|17417 : tTTTT-TCGC--TGTAT-TTT-G-GACATAAATGTAACAA-TTGAACC---CTATGGGCAATGTAATAGTGGTGTAAGCCG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATTCGCCGCCAAATATCGCAcgtttaacacgttatggcatagcaccacattgggaacaggatgcgattc
gi|17418 : tTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGTGAAATATAATTGTTGTGTGAGACG-T-TAA---TGTAGCA-AAACC-----ATCTGCCGCTAAATGTCGCAcgtttaactcgatatggcatagcaccacatcgggaacaagatgcgcttc
gi|17419 : tcTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---cgttgaatacgttatgtcatagcaccacatttggaacaggatgtgcttc
gi|17420 : tTTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACGA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGCGAGACG-TATAA---t
gi|17422 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAAG--TG----T-AAATCG
gi|17423 : tTTTTATCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---taaa
gi|17424 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17425 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAGTGTTACAC-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGACG-T-TAA---
gi|17426 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGTAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17427 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTAG-GGCATAAATGCTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---atatgtc
gi|17428 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTC-G-GACATAAATATTACAA-TGGAGCC---CTATGGGGAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-tat
gi|17429 : tTTTT-TCACATTGTGT-TCT-G-AACATAAATGTTAAAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17430 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATACAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---Cgtattcgtaaac
gi|17431 : tTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGCGTGAGACG-T-tccgc
gi|17432 : tttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-CGGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGATGTGAGACG-T-T
gi|17433 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGATACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGAG-TAA---CG----
gi|17434 : tTTTT-TTAC--TGTGT-ATT-T-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAGAGTGGTGTGAGACA-T-AAA---TG----tc
gi|17435 : tTTTC-TCGC--TATGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGAC--T-TAttacaa
gi|17436 : tTTGT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATTTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTTTGAGACA-T-AAA---TG----
gi|17436 : tGTGG-TTT-GAGACATAAATGTTACAA-ttacaa
gi|17437 : tttgttcactgtgttttggacataaattttacaatggagccctatgggaattgtaataTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATTAATGTGACAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTTTGAGACG-T-
gi|17438 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTTCAA-TGACGCA---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-Tggatatc
gi|17439 : tTTTT-TCGC--TATGT-TTT-G-ATTATAAATGCTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-tatattg
gi|17440 : tTTTT-TCAC--TGTTTGTTT-G-GACATAAATATTACAA-TGTAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17441 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACA-T-Ttatctgataaac
gi|17442 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACGA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTTTGAAACA-T-taat
gi|17443 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGCAAGATG-T-CAA---
gi|17444 : tTTTC-CCAC--TGTGT-TTT-T-GATATAAATGTAACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGGCG-T-TAA---C
gi|17445 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGGC---CTATGGGAAATGTAATTATGGTGTGAGACG-T-Tccccacaacccttc
gi|17446 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGAAAGATATAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAAGG-CG----T-AAAcagtccaaa
gi|17447 : tTTTT-TTATG-TGTGT-TTT-G-GATATAGATGTTTCAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17448 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-T-AACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATAGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17449 : tTTTT-TCTC--TCCGT-TTT-G-GACTTAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTAAGACG-T-
gi|17451 : tTTTT-TAAC--TTTGA-TTT-G-GACATAAATATTACAT-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17452 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTAAAA-TAGAGCT---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17453 : tTCTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAACAATGGTGTGAGACT-T-Ttat
gi|17456 : tTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AACATAAATGTTACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTATGAGACG-TGTAA---C
gi|17457 : ttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTA-G-GAGATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTTTGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACG-atacgc
gi|17458 : tTTTT-TCAC--TGTGT-GTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGAGTGAGACG-T-Tattcatgtgggattcaaac
gi|17495 : tTTTT-TAGC--TGTGT-TTT-G-GACAAAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGTTGTGAGACG-T-TAA---TGTCT-C-AAACC--C--ATCTGCCGCCAGATGTCGCAtat
gi|17496 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATATTACAA-TTGAGCC---CTAAGGGATATCTAACAGTAGTGTGAGATG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagcaccacatcgggaacagggtgcgcttc
gi|17497 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAcgttaaacacgctagggcataccaccacattgggaacagaatgcgcttc
gi|17498 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17499 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGCC------TGTTGCA
gi|17500 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAgtgttaa
gi|17501 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17502 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GGCATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----T-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17503 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17504 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17505 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17506 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTAT-GGAAATGTAGTAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17507 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---actgcgccaccgcaacaacgccaaaaacgttgcac
gi|17508 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17509 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17510 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17511 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTAAGGGAATTGTTATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17512 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17513 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-gcatggcaa
gi|17514 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17515 : TTTT-TCGC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATTTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17516 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17517 : TTTT-TCTT--TCTGT-TTT-G-GACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGTGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TTA---TGTTATG-AAGCCTAC
gi|17518 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACG-T-tgcaaaat
gi|17519 : TTTT-TCGC--TATGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-gtagcatatgcaaa
gi|17520 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACG-T-nnnnnnnnnnaa
gi|17521 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---
gi|17522 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17523 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-A-GACATAAATGTTACAA-TAGAGCC---CTATGGGAAATGTAATGGTGGTGTGAGACA-T-
gi|17524 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATG-C-Tgtagtg
gi|17525 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAACTGTTACAA-TGGATCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17526 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---tgtttcacaa
gi|17527 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGATG-T-
gi|17528 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GTCATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-attgttgtcg
gi|17529 : TTTT-TCAC--TCAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGGGGTGTGAGACG-T-
gi|17530 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAACC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACC-T-Taatactagcagac
gi|17531 : TTTT-TTAA--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17532 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACA-T-TAA---
gi|17533 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACA-T-TAA---
gi|17534 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACTTAAATTTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGACA-T-TGA---
gi|17535 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATACATGTTA--A-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGCGGTGTGAGACG-T-T
gi|17536 : TTTT-CCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TGGAGCC---CTAAGGGAAATGTAATAGTGGTGCAAGACG---TGA---CG----GCAAACtaat
gi|17537 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GATATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGTGAGACgcca
gi|17538 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATCAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCGATACTGGTGCGAGACG-T-Taatg
gi|17539 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAAAGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAACTGTAATAGTGGGGTGAGACG-
gi|17559 : TTT-TTGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAACCCTACTATGGGAAATGTAAC--CGGTGTGAGACG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATCTGCAGCCAAATGTCGCA
gi|17560 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAcgttttatacgctatggcatagaactacattgggaacaggatgctcttc
gi|17561 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAAATGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17562 : TTT-TCAC--TGTGC-TTT-G-GATATAACTGTTACAA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACG-T-TAA---t
gi|17563 : TTT-TCAC--TGAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17564 : TTT-TTGC--AGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTACTGTGAGACG-T-Tggtaatg
gi|17565 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATTAATGTTACAA-TGAAGCC---CTACGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-tatg
gi|17567 : TTT-TCAC--TGTAT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAATGGTATGAGAC--T-TAagaattgtcgc
gi|17568 : TTT-TCAC--TGTGT-TTT-T-AACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAGATGTAATAGTGATGTGAGACG-T-AAA---ttttcaaaaa
gi|17581 : TT-TCTC--TCTGT-TTT-G-GATATAAATGTTAGAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGAC
gi|17584 : T-TCAT--TCTGT-TTT-G-GACATATATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TA
gi|17592 : GTGG-TGT-GAGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAA---TG----
gi|17605 : T-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAATC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---ttacaa
Alignments
lowQualScore : 222222 33333 111111
lowQualScore : 1 11 2 0 2 0 0 000 0 0 777 444444 22222 999999
lowQualScore : . .. . . . . . ... . . ... ...... ..... ......
lowQualScore : 2 00 2 4 4 8 4 777 4 9 888 444444 66666 666666
consensus : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
Reference ( family-183 ) : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
gi|17413 : TTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCA
gi|17414 : TTTT-CCAT--TGTGT-TTTTG-GACATAA-TGTTACAA-TTGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCTCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacaggatgcacttc
gi|17415 : tTTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GAAATAAATGTTGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagtaccacattgggaacaggatgcgcttc
gi|17416 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-T-GACATCTATATTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGAGGTGTGAGACG-T-TAATGTCG----G-AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacagaatgcacttc
gi|17417 : tTTTT-TCGC--TGTAT-TTT-G-GACATAAATGTAACAA-TTGAACC---CTATGGGCAATGTAATAGTGGTGTAAGCCG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATTCGCCGCCAAATATCGCAcgtttaacacgttatggcatagcaccacattgggaacaggatgcgattc
gi|17418 : tTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGTGAAATATAATTGTTGTGTGAGACG-T-TAA---TGTAGCA-AAACC-----ATCTGCCGCTAAATGTCGCAcgtttaactcgatatggcatagcaccacatcgggaacaagatgcgcttc
gi|17419 : tcTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---cgttgaatacgttatgtcatagcaccacatttggaacaggatgtgcttc
gi|17420 : tTTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACGA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGCGAGACG-TATAA---t
gi|17422 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAAG--TG----T-AAATCG
gi|17423 : tTTTTATCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---taaa
gi|17424 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17425 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAGTGTTACAC-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGACG-T-TAA---
gi|17426 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGTAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17427 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTAG-GGCATAAATGCTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---atatgtc
gi|17428 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTC-G-GACATAAATATTACAA-TGGAGCC---CTATGGGGAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-tat
gi|17429 : tTTTT-TCACATTGTGT-TCT-G-AACATAAATGTTAAAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17430 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATACAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---Cgtattcgtaaac
gi|17431 : tTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGCGTGAGACG-T-tccgc
gi|17432 : tttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-CGGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGATGTGAGACG-T-T
gi|17433 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGATACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGAG-TAA---CG----
gi|17434 : tTTTT-TTAC--TGTGT-ATT-T-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAGAGTGGTGTGAGACA-T-AAA---TG----tc
gi|17435 : tTTTC-TCGC--TATGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGAC--T-TAttacaa
gi|17436 : tTTGT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATTTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTTTGAGACA-T-AAA---TG----
gi|17436 : tGTGG-TTT-GAGACATAAATGTTACAA-ttacaa
gi|17437 : tttgttcactgtgttttggacataaattttacaatggagccctatgggaattgtaataTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATTAATGTGACAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTTTGAGACG-T-
gi|17438 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTTCAA-TGACGCA---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-Tggatatc
gi|17439 : tTTTT-TCGC--TATGT-TTT-G-ATTATAAATGCTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-tatattg
gi|17440 : tTTTT-TCAC--TGTTTGTTT-G-GACATAAATATTACAA-TGTAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17441 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACA-T-Ttatctgataaac
gi|17442 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACGA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTTTGAAACA-T-taat
gi|17443 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGCAAGATG-T-CAA---
gi|17444 : tTTTC-CCAC--TGTGT-TTT-T-GATATAAATGTAACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGGCG-T-TAA---C
gi|17445 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGGC---CTATGGGAAATGTAATTATGGTGTGAGACG-T-Tccccacaacccttc
gi|17446 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGAAAGATATAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAAGG-CG----T-AAAcagtccaaa
gi|17447 : tTTTT-TTATG-TGTGT-TTT-G-GATATAGATGTTTCAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17448 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-T-AACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATAGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17449 : tTTTT-TCTC--TCCGT-TTT-G-GACTTAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTAAGACG-T-
gi|17451 : tTTTT-TAAC--TTTGA-TTT-G-GACATAAATATTACAT-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17452 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTAAAA-TAGAGCT---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17453 : tTCTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAACAATGGTGTGAGACT-T-Ttat
gi|17456 : tTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AACATAAATGTTACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTATGAGACG-TGTAA---C
gi|17457 : ttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTA-G-GAGATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTTTGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACG-atacgc
gi|17458 : tTTTT-TCAC--TGTGT-GTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGAGTGAGACG-T-Tattcatgtgggattcaaac
gi|17495 : tTTTT-TAGC--TGTGT-TTT-G-GACAAAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGTTGTGAGACG-T-TAA---TGTCT-C-AAACC--C--ATCTGCCGCCAGATGTCGCAtat
gi|17496 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATATTACAA-TTGAGCC---CTAAGGGATATCTAACAGTAGTGTGAGATG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagcaccacatcgggaacagggtgcgcttc
gi|17497 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAcgttaaacacgctagggcataccaccacattgggaacagaatgcgcttc
gi|17498 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17499 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGCC------TGTTGCA
gi|17500 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAgtgttaa
gi|17501 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17502 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GGCATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----T-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17503 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17504 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17505 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17506 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTAT-GGAAATGTAGTAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17507 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---actgcgccaccgcaacaacgccaaaaacgttgcac
gi|17508 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17509 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17510 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17511 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTAAGGGAATTGTTATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17512 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17513 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-gcatggcaa
gi|17514 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17515 : TTTT-TCGC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATTTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17516 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17517 : TTTT-TCTT--TCTGT-TTT-G-GACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGTGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TTA---TGTTATG-AAGCCTAC
gi|17518 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACG-T-tgcaaaat
gi|17519 : TTTT-TCGC--TATGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-gtagcatatgcaaa
gi|17520 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACG-T-nnnnnnnnnnaa
gi|17521 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---
gi|17522 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17523 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-A-GACATAAATGTTACAA-TAGAGCC---CTATGGGAAATGTAATGGTGGTGTGAGACA-T-
gi|17524 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATG-C-Tgtagtg
gi|17525 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAACTGTTACAA-TGGATCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17526 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---tgtttcacaa
gi|17527 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGATG-T-
gi|17528 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GTCATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-attgttgtcg
gi|17529 : TTTT-TCAC--TCAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGGGGTGTGAGACG-T-
gi|17530 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAACC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACC-T-Taatactagcagac
gi|17531 : TTTT-TTAA--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17532 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACA-T-TAA---
gi|17533 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACA-T-TAA---
gi|17534 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACTTAAATTTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGACA-T-TGA---
gi|17535 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATACATGTTA--A-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGCGGTGTGAGACG-T-T
gi|17536 : TTTT-CCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TGGAGCC---CTAAGGGAAATGTAATAGTGGTGCAAGACG---TGA---CG----GCAAACtaat
gi|17537 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GATATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGTGAGACgcca
gi|17538 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATCAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCGATACTGGTGCGAGACG-T-Taatg
gi|17539 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAAAGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAACTGTAATAGTGGGGTGAGACG-
gi|17559 : TTT-TTGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAACCCTACTATGGGAAATGTAAC--CGGTGTGAGACG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATCTGCAGCCAAATGTCGCA
gi|17560 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAcgttttatacgctatggcatagaactacattgggaacaggatgctcttc
gi|17561 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAAATGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17562 : TTT-TCAC--TGTGC-TTT-G-GATATAACTGTTACAA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACG-T-TAA---t
gi|17563 : TTT-TCAC--TGAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17564 : TTT-TTGC--AGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTACTGTGAGACG-T-Tggtaatg
gi|17565 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATTAATGTTACAA-TGAAGCC---CTACGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-tatg
gi|17567 : TTT-TCAC--TGTAT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAATGGTATGAGAC--T-TAagaattgtcgc
gi|17568 : TTT-TCAC--TGTGT-TTT-T-AACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAGATGTAATAGTGATGTGAGACG-T-AAA---ttttcaaaaa
gi|17581 : TT-TCTC--TCTGT-TTT-G-GATATAAATGTTAGAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGAC
gi|17584 : T-TCAT--TCTGT-TTT-G-GACATATATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TA
gi|17592 : GTGG-TGT-GAGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAA---TG----
gi|17605 : T-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAATC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---ttacaa
blockSeqs : A G T TGT TAGCA GACAG CGCCAA
blockSeqs : A G A TGT TTATG GACAG CGCCAA
blockSeqs : . G T TGT TTGC GACAG CGCCAA
blockSeqs : . G T TGT TTGC GACAG CGCCAA
blockSeqs : . G T GG TCTC GACAG CGCTAA
blockSeqs : . G T G GC GACAG CGCCAG
blockSeqs : . G . . G GACAG CGCCAA
blockSeqs : . G . . C C AGCCAA
blockSeqs : . G . . T C C
blockSeqs : . G . . T C .
blockSeqs : . C . . C C .
blockSeqs : . G . . G C .
blockSeqs : . G . . G C .
blockSeqs : . G . . G C .
blockSeqs : . G . . G . .
blockSeqs : . G . . G
blockSeqs : . G . . T
blockSeqs : . G . . G
blockSeqs : . G . . C
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . A . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . A . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . A . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqs : . T . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . A . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . A .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . A .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : G .
blockSeqs : .
blockSeqCons : G*****
originalCons : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
finalCons : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CGG-----AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
Alignments
lowQualScore : 222222 33333 111111
lowQualScore : 1 11 2 0 2 0 0 000 0 0 777 444444 22222 999999
lowQualScore : . .. . . . . . ... . . ... ...... ..... ......
lowQualScore : 2 00 2 4 4 8 4 777 4 9 888 444444 66666 666666
consensus : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
Reference ( family-183 ) : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CG----G-AAACCGACAGATCTGCCGCCAAATGTCGCA
gi|17413 : TTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCA
gi|17414 : TTTT-CCAT--TGTGT-TTTTG-GACATAA-TGTTACAA-TTGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCTCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacaggatgcacttc
gi|17415 : tTTTTATCGC--TGTGT-TTT-G-GAAATAAATGTTGCAA-TTGAGTT---CTATTGTAAATGTAATATTGGTGTGAGACG-T-TAA---TGTT--GCAAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagtaccacattgggaacaggatgcgcttc
gi|17416 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-T-GACATCTATATTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGAGGTGTGAGACG-T-TAATGTCG----G-AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaccacgctatggcatagcaccacattaggaacagaatgcacttc
gi|17417 : tTTTT-TCGC--TGTAT-TTT-G-GACATAAATGTAACAA-TTGAACC---CTATGGGCAATGTAATAGTGGTGTAAGCCG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATTCGCCGCCAAATATCGCAcgtttaacacgttatggcatagcaccacattgggaacaggatgcgattc
gi|17418 : tTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGTGAAATATAATTGTTGTGTGAGACG-T-TAA---TGTAGCA-AAACC-----ATCTGCCGCTAAATGTCGCAcgtttaactcgatatggcatagcaccacatcgggaacaagatgcgcttc
gi|17419 : tcTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---cgttgaatacgttatgtcatagcaccacatttggaacaggatgtgcttc
gi|17420 : tTTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACGA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGCGAGACG-TATAA---t
gi|17422 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAAG--TG----T-AAATCG
gi|17423 : tTTTTATCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---taaa
gi|17424 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17425 : tTTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAGTGTTACAC-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGACG-T-TAA---
gi|17426 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGTAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17427 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTAG-GGCATAAATGCTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---atatgtc
gi|17428 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTC-G-GACATAAATATTACAA-TGGAGCC---CTATGGGGAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-tat
gi|17429 : tTTTT-TCACATTGTGT-TCT-G-AACATAAATGTTAAAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17430 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATAGGAAATACAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---Cgtattcgtaaac
gi|17431 : tTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGCGTGAGACG-T-tccgc
gi|17432 : tttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-CGGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGATGTGAGACG-T-T
gi|17433 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGATACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACGAG-TAA---CG----
gi|17434 : tTTTT-TTAC--TGTGT-ATT-T-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAGAGTGGTGTGAGACA-T-AAA---TG----tc
gi|17435 : tTTTC-TCGC--TATGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTATGAGAC--T-TAttacaa
gi|17436 : tTTGT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATTTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTTTGAGACA-T-AAA---TG----
gi|17436 : tGTGG-TTT-GAGACATAAATGTTACAA-ttacaa
gi|17437 : tttgttcactgtgttttggacataaattttacaatggagccctatgggaattgtaataTTTT-TCAC--TGTGT-TTTTG-GACATTAATGTGACAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTTTGAGACG-T-
gi|17438 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTTCAA-TGACGCA---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-Tggatatc
gi|17439 : tTTTT-TCGC--TATGT-TTT-G-ATTATAAATGCTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-tatattg
gi|17440 : tTTTT-TCAC--TGTTTGTTT-G-GACATAAATATTACAA-TGTAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17441 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACA-T-Ttatctgataaac
gi|17442 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTCACGA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTTTGAAACA-T-taat
gi|17443 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGCAAGATG-T-CAA---
gi|17444 : tTTTC-CCAC--TGTGT-TTT-T-GATATAAATGTAACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGGCG-T-TAA---C
gi|17445 : tTTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGGC---CTATGGGAAATGTAATTATGGTGTGAGACG-T-Tccccacaacccttc
gi|17446 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGAAAGATATAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAAGG-CG----T-AAAcagtccaaa
gi|17447 : tTTTT-TTATG-TGTGT-TTT-G-GATATAGATGTTTCAA-TGGAGCC---CTATTGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17448 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-T-AACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATAGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17449 : tTTTT-TCTC--TCCGT-TTT-G-GACTTAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTAAGACG-T-
gi|17451 : tTTTT-TAAC--TTTGA-TTT-G-GACATAAATATTACAT-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17452 : tTTTT-CCAT--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTAAAA-TAGAGCT---CTATGGGAAATGTAAATGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17453 : tTCTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAACAATGGTGTGAGACT-T-Ttat
gi|17456 : tTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-AACATAAATGTTACAA-TGGAGAC---CTATGGGAAATGTTATAGTGGTATGAGACG-TGTAA---C
gi|17457 : ttaTTTT-TCAC--TGTGT-TTA-G-GAGATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTTTGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACG-atacgc
gi|17458 : tTTTT-TCAC--TGTGT-GTT-G-AAGATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATAGGAAATGTAATAGTGGAGTGAGACG-T-Tattcatgtgggattcaaac
gi|17495 : tTTTT-TAGC--TGTGT-TTT-G-GACAAAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGTTGTGAGACG-T-TAA---TGTCT-C-AAACC--C--ATCTGCCGCCAGATGTCGCAtat
gi|17496 : TTTT-TCGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATATTACAA-TTGAGCC---CTAAGGGATATCTAACAGTAGTGTGAGATG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATCTGCCGCCAAATGTCGCAcgtttaacacgctatggcatagcaccacatcgggaacagggtgcgcttc
gi|17497 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAcgttaaacacgctagggcataccaccacattgggaacagaatgcgcttc
gi|17498 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17499 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGCC------TGTTGCA
gi|17500 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCAgtgttaa
gi|17501 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGAAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17502 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GGCATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----T-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17503 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---CA----G-AAACTGACAGATCTGC------ATGTTGCA
gi|17504 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17505 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17506 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTAT-GGAAATGTAGTAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17507 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TTGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---actgcgccaccgcaacaacgccaaaaacgttgcac
gi|17508 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGGGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17509 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17510 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17511 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---TTAAGGGAATTGTTATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17512 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-t
gi|17513 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-gcatggcaa
gi|17514 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17515 : TTTT-TCGC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATTTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17516 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-
gi|17517 : TTTT-TCTT--TCTGT-TTT-G-GACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGTGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TTA---TGTTATG-AAGCCTAC
gi|17518 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACG-T-tgcaaaat
gi|17519 : TTTT-TCGC--TATGT-TTG-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-gtagcatatgcaaa
gi|17520 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGCGTGAGACG-T-nnnnnnnnnnaa
gi|17521 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCT---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---
gi|17522 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGAAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17523 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-A-GACATAAATGTTACAA-TAGAGCC---CTATGGGAAATGTAATGGTGGTGTGAGACA-T-
gi|17524 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGATG-C-Tgtagtg
gi|17525 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAACTGTTACAA-TGGATCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-T
gi|17526 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTTTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-GAA---tgtttcacaa
gi|17527 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGATG-T-
gi|17528 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GTCATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-attgttgtcg
gi|17529 : TTTT-TCAC--TCAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGGGGTGTGAGACG-T-
gi|17530 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAACC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACC-T-Taatactagcagac
gi|17531 : TTTT-TTAA--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17532 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACA-T-TAA---
gi|17533 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTTTG-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAATTGTAATAGTGGTGTGAGACA-T-TAA---
gi|17534 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACTTAAATTTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGCAATAGTGGTGTGAGACA-T-TGA---
gi|17535 : TTTT-TCAC--TGTGT-TTT-G-GACATACATGTTA--A-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGCGGTGTGAGACG-T-T
gi|17536 : TTTT-CCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAATTGTTACAA-TGGAGCC---CTAAGGGAAATGTAATAGTGGTGCAAGACG---TGA---CG----GCAAACtaat
gi|17537 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GATATGAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAAAAGTGGTGTGAGACgcca
gi|17538 : TTTT-TCAC--TATGT-TTT-G-GACATCAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGCGATACTGGTGCGAGACG-T-Taatg
gi|17539 : TTTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAAAGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAACTGTAATAGTGGGGTGAGACG-
gi|17559 : TTT-TTGC--TGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TTGAACCCTACTATGGGAAATGTAAC--CGGTGTGAGACG-T-TAATGTCG----C-AAACC--C--ATCTGCAGCCAAATGTCGCA
gi|17560 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAcgttttatacgctatggcatagaactacattgggaacaggatgctcttc
gi|17561 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAAATGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---
gi|17562 : TTT-TCAC--TGTGC-TTT-G-GATATAACTGTTACAA-TTGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTTGTGTGAGACG-T-TAA---t
gi|17563 : TTT-TCAC--TGAGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTGTGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-
gi|17564 : TTT-TTGC--AGTGT-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAGTC---CTATGGGAAATGTAATAGTACTGTGAGACG-T-Tggtaatg
gi|17565 : TTT-TCAC--TCTGT-TTT-G-GACATTAATGTTACAA-TGAAGCC---CTACGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-tatg
gi|17567 : TTT-TCAC--TGTAT-TTT-G-GATATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATATAATAATGGTATGAGAC--T-TAagaattgtcgc
gi|17568 : TTT-TCAC--TGTGT-TTT-T-AACATACATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAGATGTAATAGTGATGTGAGACG-T-AAA---ttttcaaaaa
gi|17581 : TT-TCTC--TCTGT-TTT-G-GATATAAATGTTAGAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGAC
gi|17584 : T-TCAT--TCTGT-TTT-G-GACATATATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TA
gi|17592 : GTGG-TGT-GAGACATAAATGTTACAA-TGGAGCC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-AAA---TG----
gi|17605 : T-TTT-G-GACATAAATGTTACAA-TGGAATC---CTATGGGAAATGTAATAGTGGTGTGAGACG-T-TAA---ttacaa