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lowQualScore                  :             . . . . . ....   .     .  .. . . ..    . . . ..  . ................. ...  ........... ..... ........ ......... ...... ......... ...... ....   ......... .    ........... . . ..  .    . .    .. . .  ..      
lowQualScore                  :             6 4 2 2 2 5555   7     2  55 2 4 33    2 2 2 33  2 66666666666666666 444  44444444444 77777 11111111 222222222 888888 444444444 444444 4444   888888888 2    00000000000 8 2 99  2    2 6    55 3 8  55      
consensus                     :         ATAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAN-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-AATATAT
Reference ( gi|4285 )         :         ATAT-CAT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGT-G-G-CG-AATATAT
gi|4286                       :         ATATTCGC-C-A-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-TG-A
gi|4284                       :         ATAT-CAC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GC-A-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-ATTAT
gi|4287                       :         ATAT-CGT-C-C-T----ATT-GGTGC-CAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---CT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-AATGG-G-A-CG-Atat
gi|4289                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----C--C--A-------AA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GAAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG-A
gi|4302                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATC-TGTGC-AAA-A-A-A--GGAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------T------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG--ATAT
gi|4302                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-A-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTCC-----------T-T-TT-TT-GCAC-A-GATGG-G-G-CG--ATATtat
gi|4296                       :         ATTT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TA-TT-GCAC-CAAATGG-G-A-CG-Atat
gi|4297                       :         ATAT-CGT-C-C-C----ATTTGGTGC-AAT-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4290                       :         ATAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTTC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------T----T--G--G-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4306                       :         ATAT-CGC-C-C-T----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--TG-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-ATAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG-A
gi|4293                       :         ATGT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A---G--GTAC-A-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CG-A
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gi|4291                       :         ATAT-CGT-C-C-C----ATT-AGAGT-AAT-T-A-A--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAT-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG--ATATcat
gi|4427                       :         ATAT-TGT-C-T-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-G-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------TTAGAAGG---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAT-T-AATGcat
gi|4298                       :  atcaaccATAT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----C--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------T-GTAC-----------C-T-TG-TT-GTTC-T-AATAG-G-A-CG--ATATat
gi|4298                       :         ATAT-CGT-C-C-T----ATT-AGAAC-AAC-A-A-G--GTAC-A-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--G-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG--ATATta
gi|4310                       :         ATTT-CAC-C-A-C----ATT-GATGC-TAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-T-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CG-Ata
gi|4305                       :         ATTT-CAC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-T--TT-G-----T--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-AATGG-G-A-TG-GAT-TAT
gi|4307                       :         ATAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAT-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAGACAG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATAG-G-G-CG-A
gi|4325                       :         ATAT-CGC-C-C-A----ATT-GGTGC-GAT-A-A-G--GTAT-C-A-T--GT-G-----C--TT-TT--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-A-AATGT-G-A-CG-A
gi|4351                       :         ATTT-CGT-C-C-C----ACT-GGTGC-AAG-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-C---AT------T----G--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AA
gi|4320                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATT-GCTGC-AAA-A-A-G--ATAT-C-A-T--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TA-TT-GCTC-T-AATGC-G-T-CG-A
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gi|4335                       :         ATAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAG-A-A-G---------------T-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG-A
gi|4294                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-A-A-A--AC-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--CATA-------TA---------T------A---------T------A----CTT---------G-GTAT-----------C-T-TA-TT-GCTG-T-AATGG-G-G-CG-AAT-TAT
gi|4312                       :         ATAT-CAC-C-C-C----ATT-GATGC-AAA-A-A-G--GTAC-G-A-A--GC-G-----C--TT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTC---------G-CTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-ATTGG-G-A-CA-AAT-TAT
gi|4406                       :         ATAT-TGT-C-C-C----ATT-GGAG--AAA-T-A-A--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------C------AAGAAGG---C------A----CAC---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-A-AATAG-G-G-TG-A
gi|4350                       :       taATGT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAG-A-A-T--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----G--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------A-T-TA-TT-GCAA-C-AATGat
gi|4318                       :         ATATTCAC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTACGC-A-A---T-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------A-GTAC-----------C-T-TA-TT-GTAC-T-CATGG-G-A-TG-AAT
gi|4313                       :         ATAT-CGC-C-C-C-----TT-GGTGC-AAA-A-A-G--ATAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTA---------G-GTAC-----------C-T-TG-TA-ACTC-T-AATGG-G-A-CG-At
gi|4322                       :         ATTT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-ATA-A-A-T--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------A-G-TA-TT-ACAC-T-TAT-T-G-GACG-AAT
gi|4332                       :         ACAT-CACGC-T-C----ACT-GATGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----C--C--A-------TA---------A------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------A-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CG-At
gi|4347                       :         ACAT-CGT-C-C-C----ATT-GGAGC-AAA-A---G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--TT-TC--T-T---AT------T----G--C--G-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-ACGC-T-AAAGC-G-A-CG--ATAT
gi|4347                       :         ATAT-CGT-C-G-C----TTT-AGCGT-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---ATA-----C----G--C--A--------A---------T------AAGAAAG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-T--TT-GCTC-C-AATGG-G-A-CG-Ata
gi|4355                       :      acaATAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAG-A-A-G--GTAC-C-A-A--AT-G-----C--C--------------------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TA-TT-TCAC-C-AATGG-G-A-CG-Ata
gi|4343                       :         ATTT-CGT-A-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-G-A-A--AT-G-----C--CCCTT--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------G----CTT---------G-GTAT-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-AATGG-G-A-TG-A
gi|4354                       :         ATTT-CGT-T-C-T----GTT-GGTGC-AAG-A-A-G---TGT-C-A-A--GT-G-----C--CG-TT--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-TG-AATttt
gi|4323                       :         ACAT-TGC-C-C-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-G--ATAC-C-A-A--AT-G-----C--CT-TC--T-T---GT------T----A--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C---TA-TT-ACAC-T-AATGG-G-A-CG-At
gi|4346                       :         ATTT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--G-------TT---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------G-T-TA-TA-TTAC-T-ATTGG-G-A-CG-A
gi|4327                       :         ATTT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--ATAC-A-G-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--G-------TA---------A------G---------T------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CA-Act
gi|4345                       :         ATAT-CG--C-C-C----ATT-GGTGC-GAA-A-A-G--TCAT-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---TT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-TTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-TATGG-G-A-TG-Att
gi|4356                       :         ATAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGA-AAT-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT-----------------A-------TA---------A------AGG-------C------A----TTT---------G-GTAC-----------C-T-TC-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG-A
gi|4337                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTTT-C-A-T--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CCC---------G-GT-------------C-T-TA-TT-GCAC-T-GATGG-A-A-CG-A
gi|4344                       :         ATAT-CGC-C-CAT----ATT-GATGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--T-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTACCCGGTATCCGGC-T-TA-TT-GCCC-T-AATG
gi|4357                       :         ATAT-AAT-T-C-T----GTT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-A-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-TTCC-----------A-T-TA-TT-GTTC-T-GATGaaacga
gi|4362                       :         ATAT-CAA-C-T-C----ACT-GGTAC-AAA-A-T-G--GTAC-C-A-A--GT-GAAGTGT--CT-TC--T-T---AT------G----C--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-T--TT-ACAC-T-AATGG-G-A-CG-Aggacacattat
gi|4360                       :         ATAA-CGT-C-C-C----ACT-GGTGC-AGA-A-A-G--GTAT-C-A-A--GA-G-----T--CT-TC--T-A---AT------T----T--C--A-------TA---------TAC----A---------C------A----CTT---------G-ATAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AAT-T-G-GACG-A
gi|4358                       :         ATAT-CGC-C-C-C----ATT-AGTGC-AAA-A-T-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CG-TC--T-A---AT------T----G--C--A-------TA---------T------A---------C---------------------------AC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG-A
gi|4429                       :         ATTT-CGT-T-C-A----ATT-AGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-T--GT-G-----T---------T-T---AT------G----A--A--A-------TA---------AGAAA--A---------C------A----TTG---------G-GAAG-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4340                       :        aATCT-CGC-C-C-C----ATT-AGTGC-ATA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TG--T-T---GT------T----T--C--A-------AA---------A------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATa
gi|4329                       :         ATCT-CAC-C-C-C----ATT-AGTGC-ATA-C-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-T---------AT------T----T--C--A-------AA---------T------A---------C------A----CTT---------A-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AAT-T-G-GACG-A
gi|4352                       :         ATTT-CGC-C-C-C----ATT-TGTGA-TAT-A-A-G--TTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-AT--T-T---AT------T----T--C--C-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-G-AATGG-G-A-CG-A
gi|4363                       :         ATAT-CGT-C-C-A----ATT-TGTGC-AAA-A-A-G---TAT-C-A-A--GT-A-----CACCT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------C------A---------C------A----CTT---------G-ATAC-----------A-C-TG-TT-GCAC-T-AATGG-A-A-CG-Atttat
gi|4361                       :         ACAT-CTC-C-C-C----ATT-GGT----AA-A-A-T--GTAC-C-A-A--GT-G-----T--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------T------A----CAT---------G-GCAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATG
gi|4370                       :         ATTT-CGC-C-C-C----TCT-GGTGT-AAA-A-G-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------G---------C------A----TTT---------G-GAAC-----------G-T-TA-TT-GTCC-T-AATgga
gi|4365                       :         ATAG-CGC-C-C-A----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--G--------A--GT-G-----C--CT-T---------AT------T----T--C--A-------TA---------T------G---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATG
gi|4364                       :         ATAT-CGC-C-C-A----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTTC-C-A-A--GT-G-----T--CT-TC--C-T---A-------T----T--C--T-------TA---------T------A---------T------A----CTT---------C-GTACAGTAT------C-T-TA-TT-GCTC-T-AGTGG-G-A-CG-Aagacaa
gi|4367                       :         ACAT-CGC-C-C-A----ATT-GGTGC-ATA-A-A-G--ATAC-C-A-A--AT-G-----C--CT-T----------T------T----T--C--A-------TA---------A------A---------C------A----CTT---------G-GTAA-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AACGG-G-A-CA-A
gi|4369                       :         ATAT-CGC-C-A-C----ATT-TATGC-AAA-A-A-A--GTAC-C-T-A--GA-G-----C--CA-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----ATT---------G-GTAC-----------A-T-TG-GT-GCAC-T-AATGG-A-A-CG-A
gi|4373                       :         ATTT-CAC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-G-C-A--GAAC-C-A-A--TT-------C--C---C--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------A------A---------C------A----TTT---------G-ATAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGA-G-A-CA-AAT
gi|4372                       :         ATAT-CGC-T-T-C----TTT-GGTGC-AAA-A-C-G--GTAC-C-A-A--GC-A-----C--CT-TA--T-C---AT------T----T--T--A-------TT---------C------A---------G------A----CTT---------G-GTAC-----------A-A-TA-TT-GCAC-T-AATGA-G-A-CG-At
gi|4374                       :         ATAT-TGC-T-C-C----ATT-GGTTC-CAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C---------------GT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------G------A----CTT---------G-ATAC-----------T-T-TA-TT-GCACGC-ATTG--G-A-CG-A
gi|4398                       :          TAT-CGC-C-C-C----ATT-GATGC-AAG-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------CA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATG
gi|4406                       :          TAT-CAC-C-C-T----ATT-TGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-G-T--GT-G-----C--CT-TC--T-T---GT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTA------------C-T-TA-TT-TCTC-C-AATGG-G-A-C--AATATATgtacga
gi|4400                       :          TAT-CGT-C-C-C----ATTTGGTGC-AGA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------A----T--C--A-------TG---------T------A---------C------A----ATT---------G-GTAA-----------A-T-TA-TT-GCAC-T-AATG
gi|4405                       :          TAT-CGC-C-A-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C------C--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CAA---------A-GTAC-----------C-T-TA-TT-GAAC-C-AATG--G-G-Cgaacg
gi|4404                       :          TAT-CAT-C-C-C----ATT-AGAGT-TAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGA---C------A----GTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-CATTT-G-G-CG-cgttat
gi|4410                       :       taaTAT-CGC-C-C-A----ATT-GGGGC-GAA-A-A-G--GT---C-ACA--GT-G-----C--TT-CC--T-T---TT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CCT---------G-GTAT-----------C-T-TA-AT-GCTC-T-AAatta
gi|4284                       :           AT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---T------G----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-TG--ATAT
gi|4419                       :           AT-CGT-C-C-C----ATA-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--A-T---AT------T----T--T--AT------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CGTAATtattat
gi|4420                       :           AT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-AAAGTAC-C-A-A--AT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--C-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-AG-AA-ATAgat
gi|4418                       :           AT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-G--GT-C-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-A-A-CG-A
gi|4427                       :           AT-CAA-C-C-C----ATT-AATGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-A---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTC---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGA-G-A-C--AATATAT
gi|4417                       :           AT-CAC-C-C-C----TTT-GGTGC-AAA-G-A-G--GCAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-A
gi|4317                       :           AT-CGC-CTC-C----ATT-GGTGC-AAT-A-T-A--GTAC-C-A----------------CT-TG--T-----AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----TTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-T-CG-Atttggatgaa
gi|4423                       :         atAT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------A------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAttat
gi|4423                       :           AT-CAT-C-C-G----TCT-ATTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----T---------T-T---AT------G----------A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-Aatagacggatgat
gi|4315                       :          aAT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTTC-T-G-T--GT-G-----T--GT-----------AT------G----A--A--A-------TAAGAA-----T------G---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AGTGG-A-G-CG--ATAT
gi|4421                       :           AT-CGC-A-C-C----ATT-GGTGT-AAA-A-A-T--ATAT-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---GT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GGAC-C-AATGG-G-A-CA-AATtat
gi|4343                       :           AT-CAT-C-C-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-G--ATAC-C-A-A--GC-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAAAGGGG--C------A----TTT---------C-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-T-A-CG-At
gi|4327                       :         atAT-TGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-A-----C---------T-T---A---------------CG-A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTC---------T-GTAT-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-Att
gi|4431                       :         atAT-CGC-C-T-C----ATT-GGTAC-AAT-A-A-G--CTCC-C-A-G--GT-G-----C--CT-TC--T-T---GT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-AAAC-----------C-T-TA-AT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-CATt
gi|4443                       :           AT-CGT-C-C-CTGGCATC-AGAGC-AAT-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAG-------T------AGGTTCTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAT-C-AATGG-G-G-CG-Atgt
gi|4429                       :           AT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--CTTC-C-C-A--AT-G-----T--TT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------A------A---------C------A----CAT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-AAT-T-GAA-CG-AA-ATAttgt
gi|4352                       :           AT-CGT-C-C-C----ATT-CGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---ATAGGAAAT----A--A--A-------TA---------G------G---------C------A----CTT---------G-GTAA-----------C-T-TA-TA-TCAC-A-AATGG-G-G-CG-A
gi|4474                       :         atAT-CGT-C-T-C----ATA-AGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-T-T-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AATAAGA---C------A----ATT---------G-ATAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-ATTGttat
gi|4447                       :          cAT-CGT-T-C-A----GTT-GTTGT-AAT-A-A-G--GCAT-C-A-A--GT-----------------------AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGCAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATAG-G-G-CA-Attgt
gi|4450                       :           AT-CAT-T-C-C----AGT-ATAGC-AAT-T-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---GTA-----T----G--C--A--------A---------T------AAGAAAG---C------A----CTT---------G-GCAT-----------C-T--A-TTAGCAC-C-AATTA-G-G-CG-Ata
gi|4286                       :            T-CAT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGT-G-G-CG-AATATtat
gi|4287                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------G------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TG-GCAC-C-AATAG-G-A-CG--ATAT
gi|4289                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTTC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------T----T--G--G-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG--ATAT
gi|4296                       :            T-CGT-C-C-C----ATTTGGTGC-AAT-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4297                       :          atT-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TA-TT-GCAC-CAAATGG-G-A-CG--ATAT
gi|4290                       :            T-CGC-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----C--C--A-------AA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GAAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG--ATATa
gi|4418                       :            T-CGT-T-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------A---------AGAAGGGA----CCT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4306                       :           aT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAT-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAGACAG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATAG-G-G-CG--ATATa
gi|4293                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------T-GTAC-----------C-T-T--TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4398                       :         atgT-CGT-A-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------G----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TC-TT-GCAT-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4417                       :          taT-CAT-C-C-A----AAT-AGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTGC-----------C-T-CT-TT-GCAC-C-AAAGG-G-G-TG-A
gi|4310                       :           aT-CGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------A---------AGAAGGAA----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TA-GCAT-C-AATGT-G-G-TG-Aa
gi|4307                       :          atT-CGC-C-C-T----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--TG-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-ATAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG--ATATa
gi|4325                       :            T-CGT-C-A-C----ATT-TGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAAAAAG---C------A----CAT---------G-ATAC-----------C-T-TA-TC-GCAC-C-AATTG-G-G-CG--ATAT
gi|4335                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------A----------------A----GAA---------G-GCA------------C-T-TC-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG--ATAT
gi|4294                       :            T-CGC-C-C-C----ATT-ACAGC-AAT-A-A-G--ATAC-C-A-A--GT-A-----T--AT-----------AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------G----TTT---------T-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG--ATAT
gi|4462                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-AAAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------T-GAAC-----------CTT-TT-TT-GCAT-C-AATGattat
gi|4479                       :          ccT-CGT-C-C-C----ATT-AGTAA-AAT-A-A-A--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--AAAT----TA---------G------AAGT------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATattat
gi|4318                       :            T-CAT-C-C-C----ATG-AGTAC-AAT-A-A-G--GTAC-T-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A-----TT---------GCGTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-TG-AATATatta
gi|4313                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-AGAGT-TAC-A-A-G--GTAC-C-T-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAT-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AA-GG-G-G-CG--ATATatt
gi|4322                       :            T-CGT-C-C-A----ATA-AGTGT-AAT-A-C-T--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTACA----------T-T-TA-T--GCAC-C-AATGG-G-A-CG-A
gi|4332                       :          atT-CGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-T--GTAC-C-A-A--GT-G-----T---------T-T---AT------G----G--A--A-------TA----------------AGAAGG----C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAT-C-AGTGatt
gi|4333                       :  acatcacgctT-CGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-CTA-A--GTTA-----C--CA-AG--TGT---AT------A----T--G--A-------AA---------T------A---------AGAAGGGA----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAT-C-GATG--G-G-C--AATAT
gi|4355                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-GGTGA-AAT-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT-----------------A-------TA---------A------AGG-------C------A----TTT---------G-GTAC-----------C-T-TC-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG--ATAT
gi|4354                       :            T-CAT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAAACGG---C------A----CTT---------G-ACA------------C-T-TC-TT-GCAC-C-AA
gi|4323                       : atttcgttctgT-CGT-C-C-C----ATT-AGTGT-AAT-A---G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT-----------------A-------TG---------T------AACAAGAAGGC------A----TTT---------G-GTAT-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-AATGG-G-G-C--AATGTatt
gi|4464                       :            T-CAT-C-C-C----ATA-AGAGT-AAT-A-A-G--GTAT-G-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------CTT-TT-TT-GCAG-C-AATGa
gi|4453                       :          ccT-CGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--AT-G-----------------T---AT------G----T--A--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-A-TA-TT-CCGC-C-AATGatgat
gi|4345                       :       cgaccT-CAT-C-C-C----ATA-AGTGC-AAT-A-A-G--GTAA-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------A------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-ATGA-----------C-T-TT-TC-GCAC-C-AATG--G-G-CG--ATAT
gi|4443                       :            T-CGC-C-C-C----ATT-GATGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GA-A-----C--CT-AC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TA-TT-GCTC-T-GATG
gi|4356                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAG-A-A-G--GTAC-C-A-A--AT-G-----C--C--------------------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TA-TT-TCAC-C-AATGG-G-A-CG--ATATccagggacgatttgt
gi|4337                       :            T-CGT-T-C-C----ATC-AGTGC-AAT-A-A-G----AC-C-G-G--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CAT---------G-AAAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG--ATAT
gi|4362                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-AGTGT-AAA-A---G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----TGGC--A-------TAAGAAGACACT------T---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-A-TT-TT-GTAC-C-AGTG
gi|4360                       :   atatcaactT-CGT-C-C-A----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAT-C-A-A--GT-G-----------TG--TAT---ATGAAA--T----T--A--G-------AA---------G------A---------C------T----CTT---------G-ATAC-----------C-T-TT-CT-GCAC-C-AGTGG-G-A-CG-
gi|4358                       :        ataaT-CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTGT---A-T--AT-G-----C--A------------AT------T----------A-------GA---------C------GG--------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-A-TT-TT-GCAC-T-AATGG-G-G-CG--ATAT
gi|4349                       :            T-CGT-C-C-C----ATG-AGTGCAAAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTC---------G-TTAC-----------C-T-TA-CT-GAAC-T-AACGG-G-T-CG-A
gi|4329                       :          atT-CGT-C-C-A----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-T-A-A--GT-G-----------------T---AT------T----T--G--A-------AA---------T------AAGG------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-TGTA--T-GCAC-T-AATGG-G-G-TG-Aattat
gi|4342                       :         atcT-CGT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTGC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------G----T--G--AAATAAAATA---------T------A---------C------T----TTT---------G-GTAC-----------C-C-TT-TT-GCAC-C-AATGA-C-G-C--AATAT
gi|4401                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-T--GCAT-A-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------A------AAAGAAAG--C------A----CTT---------G-GCAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-AATGT-G-G-C----TATAattat
gi|4449                       :            T-CGC-C-C-C----GTT-GGAGC-AAA-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TA--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-C-Tat
gi|4369                       :            T-CGT-T-C-C----ATT-AGTGC-ACC-A-A-T--GTAC-C-A-A--TT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAGATGG---C------T----CTA---------G-GTAC-----------T-T-TT-TT-GCAT-A-AATGT-G-G-CG--ATAT
gi|4409                       :            T-CGT-C-C-C----ATT-ATAGC-AGT-T-A-G--GTTC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAATG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TATTT-TCTT-C-AATGA-A-G-C--AATA
gi|4372                       :            T-CGT-C-T-C----ATT-AGTGC-AAT-A-T-T--GTAC-C-A-A--GT--------------C--T-G---AA------TAAAAT--G--A-------TA----------------AGG-------T------G----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TT-TT-GCAC-C-AAAGA-A-G-CG--ATAT
gi|4374                       :            T-CGT-C-C-A----ATG-CGTGC-AAT-A-A-A--GTAT-C-A-A--GT-----------------C-T---AT------A----T--G--A-------AA---------C------G---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TG-GAAC-C-AATGG-A-G-C--AATAT
gi|4448                       :            T-CGC-T-C-C----ATT-GATGC-AAA-A-A-G--GTAT-C-A-A--GT-A-----C--CT-TC--C-T---AT------T----T--C--A--------A----------------A---------C------A----CTT---------G-ATAT-----------C-T-TA-TA-TCAC-T-TATG
gi|4419                       :             -CGT-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------TA--T-A---AT------A----A--A--A-------TA---------TGAAG--G---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-TATGG-G-A-CG-Aggac
gi|4305                       :            a-CAT-C-C-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGA---C------A----AAT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-TG-Ataatgat
gi|4480                       :           at-CAT-C-C-T----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G---------T-ACAGG-T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATgattat
gi|4400                       :             -CGT-T-C-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-T--TTAC-C-A-A--TT-G-----------------T---AC------A----T--G--A-------TA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-CT-GCAC-CAAATGG-G-A-CG-Agactat
gi|4375                       :           ta-CGT-C-C-C----AAG-GGTGC-AAA-A-AAG--GT-C-C-A-A--AT-G-----------------T---AT------T----T--G--A-------AA---------G------AAGAACG---C------A----CTT---------G-CTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATTG-G-G-CA-A
gi|4308                       :              atT-C-C-C----ATT-AGTGC-ATT-A-A-G--GTAC-T-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------A---------AGAAAGAA----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-TATGG-G-G-CA-Agaaatt
gi|4482                       :              atT-C-C-C----ATT-AATGC-AAT-A-A-G--GTAT-T-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------A------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AAcaaatt
gi|4312                       :                T-C-C-C----AAT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAG-C-G-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAAG---C------G----CTT---------C-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAT-C-AATGG-G-G-TG--ATATcaaaattttat
gi|4458                       :                T-C-T-T----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---GC------T----T--C--A-------TA---------T------A---------T------A----CTT---------G-GTAT-----------G-T-TA-TT-GCAC-A-AATcaaattat
gi|4357                       :               gT-C-C-C----ATC-AGAAC-AAT-A-A-T--GGAA-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---T------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AA
gi|4466                       :     atataattctgT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-T-A-A--GT-A---------T-AC--A-T---A-------T----G--A--A-------TA---------A------AGAAG-----C------A----GTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GTAC-C-AATGcacattat
gi|4361                       :              ccT-C-C-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTGC-C-A-T--GT-A-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGA---C------A----CTT---------G-GTAC----------------A-TT-TTAC-C-AATGG-G-G-AG-Acaaatt
gi|4365                       :             acaT-C-T-C----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C---------------AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGG------C------A----CT---------------C-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATTG-G-G-CG-
gi|4367                       :            atagT-C-C-C----GTT-AGAGC-AAT-A-A-G--TTAC-C-A-A--GT-G-----T---------T-T---AT------G----A--A--A-------AA---------G------G---------C------A----TTT---------G-GTAT-----------C-T-TT-AT-GCAC-C-AATTG-G-G-CG-Acaa
gi|4420                       :              aca-C-C-C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----G--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----TTT---------G-GTACTT---------T-T-TT-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-Acaa
gi|4317                       :                a-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--AT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----AGT---------G-GTAC-----------T-A-TA-TT-GCAC-C-AATGGAG-G-CG-Agagaaata
gi|4459                       :          atttcga-C-C-C----ATT-GGTGC-AAG-A-C-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-ATAC-----------A-T-TA-TT-GCAC-C-AATGtttat
gi|4308                       :                c-C-C-C----ATA-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-T-----C--TT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------A-GTAC-----------C-T-TA-AT-GCAC-T-AATGG-G-A-CA-AAT
gi|4462                       :          attttgc-C-C-C----ATT-GATGC-AAA-A-AAG--GTTC-A-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTT-T-AATGG-G-A-CG-AAT-TATt
gi|4328                       :                 -C-C-C----ATT-AGTAC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---GT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAG----A------A----CTT---------G-GTAT-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AACAA-A-G-C--AATAT
gi|4339                       :                 -C-C-C----ATT-AGTAC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---GT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAG----A------A----CTT---------G-GTAT-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATAA-A-G-C--AATATgcaattat
gi|4333                       :                 -C-C-C----ATC-GATGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-C-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTTGGTAACTTAG-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CG-Agcatttat
gi|4465                       :           atattg-C-C-C----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--TT-G-----C--CT-TT--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------C------A---------C------A----TAT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AGTA--A-G-CG-A
gi|4405                       :                 -C-C-C----ATT-GGTTC-AAT-A-A-G--GTAC-T-T-T--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGG------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATGT-G-G-CG-A
gi|4464                       :               ta-C-C-C----ATT-GCTGC-AAA-AAA-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------C-ATAC-----------C-T-TA-TT-ACTC-T-TATGG-G-A-TG-AATccgttat
gi|4453                       :                 -C-C-C----ATT-GGCGG-AAT-A-T-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--T--A-------CA---------T------A---------C------A----TTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CG-Agat
gi|4431                       :              cga-C-C-C----ATT-GGTGC-ATT-A-A-G--GTTT-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------C------AAGAAGG---C------A----CCT---------G-GGAG-----------C-T-TA-TT-GTAC-C-AATGA-G-G-CG-A
gi|4349                       :                a-C-C-C----GTT-AGTTC-AGT-A-A-G--GTAA-C-G-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------CTT-TT-TT-GCAC-T-CATGG-G-A-CG-AAT-TATgcgcattgt
gi|4466                       :          atttcga-C-C-C----ATT-GGTAC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--CT-G-----C--TT-CT--T-T---A-------T----T--C--A-------TATG-------T------A---------T------A----CTT---------A-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CA-AAT
gi|4460                       :                 -C-C-A----ATT-ATTGT-AAA-A-A-G--GTGC-C-A-A--GT-G-----C--TT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------T-GTAT-----------C-T-CA-TT-GTAC-T-CATGA-G-G-TG-At
gi|4447                       :                c-C-C-T----ATT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-GC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T-----------------------A----CTT---------G-ATGC-----------C-T-TA-TT-ACAA-C-AA
gi|4375                       :             ttgc-C-C-A----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAG-C-A-A--GT-G-----C--GT-TC--T-T---CT------T----T--C--A-------AA---------T------A---------C------A----TTT---------G-G-AC-----------CTT-TT-TT-GCAC-C-ctgaacgatta
gi|4473                       :            attttgc-C-C----ATT-GGTGC-CAA-A-A-A--GTAC-C-A-A--CT-G-----C--CT-TT--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------T------A----CTT---------G-GTGC-----------C-T-TA-TT-GCAA-C-AATGG-G-A-CG-Acttgggacggaaatt
gi|4474                       :                   -C-C----AAT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAT-C-A-A--TT-G-----T--CT-TA--T-T---AT------T----T--T--A-------TA---------T------A---------C------A----CTA---------A-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-T-TATGA-G-A-CG-A
gi|4475                       :                   -C-C----ATT-AGTTC-AAA-A-A-G--GTGC-C-A-C--GT-G-----T--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-ACAC-----------T-T-TA-TT-Gtttgt
gi|4459                       :                     -C----ATT-GGTGC-AAT-A-A-T--GTAT-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--A--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TC-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-ttttagcgggacga
gi|4350                       :                     -C----ATT-GTTGC-AAT-A-A-T--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----TA-C--A--------A---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------A-T-TC-TT-GCAC-C-AATGG-G-G-CG-A
gi|4342                       :                  atg-C----ATT-GGTGC-AAA-A-G-G--GTAC-C-A-AAAGT-A-----T--AT-T---T-T---AT------T----T--C--A-------CA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GCAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATGG-G-A-CG-AAT-TAT
gi|4401                       :            atattgcgt-C----ATT-AGTGC-AAT-A-A-G--GTGC-C-A-A--GT-G-----C--TT-TC--T-T---TT------T----TT-C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------T-ATGC-----------A-T-TA-TT-GCAC-T-AATGG-G-A-CG-AAT
gi|4409                       :             tatagcca-C----ATT-GAAGA-AAATA-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--AT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GAAC-----------C-T-AA-CT-GCTA-T-AATGG-G-A-CG-A
gi|4479                       :               tattgctt----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----A--CT-TC--T-A---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------T-T-TA-TT-TTAC-T-AATGG-G-A-CG-AAT
gi|4339                       :                       ----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--ATAC-C-A-A--GT-------T--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------C------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GTAC-T-AATGG-G-G-Cta
gi|4480                       :             atattgcttt----ATT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TATACCTG---T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCTC-T-AATatttat
gi|4458                       :                       ----ATT-TGTGC-AAT-A-A-C--ATAC-C-A-A--GT-A-----------------T---AT------A----T--G--A-------AG---------C------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATaggatggactat
gi|4404                       :                  gtctt----ATG-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--CT-G-----T--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TA-ACTC-T-AATGG-G-A-TG-A
gi|4340                       :              taacgccaa----ATT-AGAGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G---------T-TT--T-TGAAAC------A----A--C--A--------A---------G------G---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-AT-GCAC-T-AATGG-G-G-CG-Ataatta
gi|4370                       :                    atc----ATT-AGGAC-AAT-A-A-C--GTTC-C-A-A--AT-G-----C---------------AT------A----T--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-C-TT-TT-ACAC-C-AGAGG-G-G-CG-A
gi|4450                       :                     at----ATT-GGTGC-TAA-T-A-G--ATGC-C-A-A--GT-G-----C--TT-TC--T-T---AT------T----G--C--A-------TA---------C------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-AA-TT-GC
gi|4351                       :                     tcgcctaTT-GGTGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT-----------------A-------TA---------C------AATGAGAAGGC------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TC-TT-GCAC-C-AGTGG-G-A-CG-Atatactggaatgattat
gi|4482                       :                          atTT-GGTGC-AAA-A-A-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----C--CT-TC--T-T---TT------T----T--C--A-------TA---------T------A---------C------A----CTT---------A-ATAC-----------C-T-TA-TT-GCAT-T-AATGG-G-A-CA-A
gi|4328                       :                            TT-GGTGC-AAA-A-A-G--ATAC-C-A-A--GT-------T--CT-TC--T-T---AT------T----T--C--A-------TA---------C------A---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GTAC-T-AATGG-G-G-CA-ATTATattttat
gi|4465                       :                       atattgctttgGC-AAT-A-A-G--GTAC-C-A-T--AT-G-----------------T---GT------A----T--G--A-------AA---------T------AAAAAGG---C------A----ATT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATG
gi|4449                       :                                      cc-A-G-G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----T--G--A-------AA---------T------AATAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-G-TT-TT-GCTC-C-AACGG-G-G-CG-Atctagtaagcgaa
gi|4344                       :                                            -G--GTAC-C-A-A--GT-G-----------------T---AT------A----A--G--A-------AA---------T------AAGAAGG---C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TT-TT-GCAT-C-AATATGG-G-CG--ATAT
gi|4364                       :                                                                                                                            ------A---------C------A----CTT---------G-GAAC-----------C-T-TT-TT-GCAC-C-AATTG-G-G-CG--ATATcggtatccggcttattgccctaatgaaacga
gi|4346                       :                                                                                                                                   ---------C------A----CTT---------G-GTAC-----------C-T-TA-TT-GCAC-C-AATGG-G-A-CG-Acttcctattcttatatacttcgtacagtatcttattgctctagtgggacga

lowQualScore                  :             0  4  0    0       22  0 00  0  0   00   11111 00  0        0 00 0  111111 11      111111111     22222222222 0       0 22   0000  0 4  0  0 2   
lowQualScore                  :             .  .  .    .       ..  . ..  .  .   ..   ..... ..  .        . .. .  ...... ..      .........     ........... .       . ..   ....  . .  .  . .   
lowQualScore                  :             5  3  4    4       22  8 66  4  4   66   00000 66  4        4 55 4  111111 11      666666666     99999999999 8       9 22   9999  4 0  5  9 3   
consensus                     :         ATAT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-TATAT
Reference ( family-178 )      :         ATAT-CGTCC-CATT-GGTGCAAN-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG-AA-TATAT
gi|4284                       :         ATAT-CACCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG-AT-TA
gi|4285                       :         ATAT-CATCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GT-GGCG-AA-TATATtat
gi|4286                       :            T-CATCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GT-GGCG-AA-TA
gi|4287                       :         ATAT-CGTCC-TATT-GGTGCCAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTCTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-A
gi|4289                       :         ATAT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-AA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4290                       :            T-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-AA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4291                       :         ATAT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--AT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------T-TAATTACTCT-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4293                       :         ATGT-CGCCC-CATT-GGTGCAA--AA-G--GT-AC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-Acat
gi|4294                       :         ATAT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-AAA--ACG-----C--CT-TCTTATTT-CATA-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------C-TTATTGCTGT-AAT----GG-GGCG-AA-T-TAT
gi|4296                       :         ATTT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCACCAAAT----GG-GACG-A
gi|4297                       :            T-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCACCAAAT----GG-GACG--A-TA
gi|4298                       :         ATAT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-TA------T--ACACTT---------TGTAC-----------C-TTGTTGTTCT-AAT----AG-GACG--A-TAa
gi|4302                       :         ATAT-CGCCC-CATC-TGTGCAAA-AA-A--GG-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG--A-TAta
gi|4305                       :         ATTT-CACCC-CATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-AC-CAT--TTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GATG-GA-T-TATtat
gi|4306                       :         ATAT-CGCCC-TATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4307                       :            T-CGCCC-TATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4308                       :         ATTT-TGCCC-CATA-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTT-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTAATGCACT-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4310                       :         ATTT-CACCA-CATT-GATGCTAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTT-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-AA-t
gi|4312                       :         ATAT-CACCC-CATT-GATGCAAA-AA-G--GT-AC-GAA--GCG-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTC---------GCTAC-----------C-TTATTGCTCT-ATT----GG-GACA-AA-T-TAT
gi|4313                       :         ATAT-CGCCC-C-TT-GGTGCAAA-AA-G--AT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTA---------GGTAC-----------C-TTGTAACTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4315                       :         ATAT-CGCTC-CACT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACAC---------AGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-AT-TA
gi|4317                       :         ATTT-CGACC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACAAGT---------GGTAC-----------T-ATATTGCACC-AAT----GGAGGCG-A
gi|4318                       :         ATATTCACCC-CATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-ACGCAA---TG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGTACT-CAT----GG-GATG-AA-Ttttat
gi|4320                       :         ATAT-CGCCC-CATT-GCTGCAAA-AA-G--AT-AT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-AAT----GC-GTCG-At
gi|4322                       :         ATTT-CGTCC-CATT-GGTGCATA-AA-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-GTATTACACT-TAT----TG-GACG-AA-T
gi|4323                       :         ACAT-TGCCC-CATT-AGTGCAAT-AA-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTGTTA-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C--TATTACACT-AAT----GG-GACG-AA-t
gi|4325                       :         ATAT-CGCCC-AATT-GGTGCGAT-AA-G--GT-AT-CAT--GTG-----C--TT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACA-AAT----GT-GACG-A
gi|4327                       :         ATTT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--AT-AC-AGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TA------A--GTACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-A
gi|4328                       :         ATAT-TGCTT-TGTT-GGTGCAAA-AA-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGCA-AT-TAtt
gi|4329                       :         ATCT-CACCC-CATT-AGTGCATA-CA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-AA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4332                       :                 CT-CACT-GATGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4333                       : acatcacgATAT-TG-CC-CATC-GATGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTC-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTTGGTAACTTAGGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4335                       :         ATAT-CGTCC-CATT-GGTGCAAG-AA-G--------------TG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4337                       :         ATAT-CGCCC-CATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-TT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACCC---------GGT-------------C-TTATTGCACT-GAT----GG-AACG-A
gi|4339                       :         ATAT-TGCTT-TATT-GGTGCAAA-AA-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGC
gi|4340                       :         ATCT-CGCCC-CATT-AGTGCATA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TGTTGTTT-C--A-AA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----atttat
gi|4342                       :         ATAT-TGCGT-CATT-GGTGCAAA-AG-G--GT-AC-CAAAAGTA-----T--AT-T-TTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4343                       :         ATTT-CGTAC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-GAA--ATG-----C--CCCTTTTATTT-C--A-TA------T--ACGCTT---------GGTAT-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GATG-A
gi|4344                       :         ATAT-CGCCCATATT-GATGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--T-TA------T--ACACTT---------GGTACCCGGTATCCGGC-TTATTGCCCT-AAT----GA-AACG-Attt
gi|4345                       :         ATAT-CG-CC-CATT-GGTGCGAA-AA-G--TC-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GTTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GG-GATG-A
gi|4346                       :         ATTT-CGTCC-CATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TT------T--ACACTT---------GGTAC-----------G-TTATATTACT-ATT----GG-GACG-AA-
gi|4347                       :         ACAT-CGTCC-CATT-GGAGCAA--AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--G-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTACGCT-AAA----GC-GACG--A-TAct
gi|4349                       :         ATTT-CGACC-CGTT-AGTTCAGT-AA-G--GT-AA-CGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------CTTTTTTGCACT-CAT----GG-GACG-AA-T-TATta
gi|4350                       :         ATGT-CGCCC-CATT-GGTGCAAG-AA-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCAAC-AAT----G
gi|4351                       :         ATTT-CGTCC-CACT-GGTGCAAG-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTCATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AA
gi|4352                       :         ATTT-CGCCC-CATT-TGTGATAT-AA-G--TT-AC-CAA--GTG-----C--CT-ATTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACG-AAT----GG-GACG-A
gi|4354                       :         ATTT-CGTTC-TGTT-GGTGCAAG-AA-G---T-GT-CAA--GTG-----C--CG-TTTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GATG-AA-Ttttat
gi|4355                       :         ATAT-CGTCC-CATT-GGTGCAAG-AA-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG-At
gi|4356                       :            T-CGTCC-CATT-GGTGCAAG-AA-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4357                       :         ATAT-AATTC-TGTT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GTTCC-----------A-TTATTGTTCT-GAT----GG-GAC
gi|4358                       :         ATAT-CGCCC-CATT-AGTGCAAA-AT-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CG-TCTAATTG-C--A-TA------T--AC----------------AC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-Aacattat
gi|4360                       :         ATAA-CGTCC-CACT-GGTGCAGA-AA-G--GT-AT-CAA--GAG-----T--CT-TCTAATTT-C--A-TA------TACACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4361                       :         ACAT-CTCCC-CATT-GGT---AA-AA-T--GT-AC-CAA--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ATACAT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-G
gi|4362                       :         ATAT-CAACT-CACT-GGTACAAA-AT-G--GT-AC-CAA--GTGAAGTGT--CT-TCTTATGC-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TT-TTACACT-AAT----GG-GACG-Aa
gi|4363                       :         ATAT-CGTCC-AATT-TGTGCAAA-AA-G---T-AT-CAA--GTA-----CACCT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GATAC-----------A-CTGTTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4364                       :         ATAT-CGCCC-AATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-TC-CAA--GTG-----T--CT-TCCTA-TT-C--T-TA------T--ATACTT---------CGTACAGTAT------C-TTATTGCTCT-AGT----GG-GACG-A
gi|4365                       :         ATAG-CGCCC-AATT-GGTGCAAA-AA-G--G-------A--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-TA------T--GCACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-A
gi|4367                       :         ACAT-CGCCC-AATT-GGTGCATA-AA-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-T----TTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAA-----------C-TTATTGCTCT-AAC----GG-GACA-A
gi|4369                       :         ATAT-CGCCA-CATT-TATGCAAA-AA-A--GT-AC-CTA--GAG-----C--CA-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACAATT---------GGTAC-----------A-TTGGTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4370                       :         ATTT-CGCCC-CTCT-GGTGTAAA-AG-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--GCATTT---------GGAAC-----------G-TTATTGTCCT-AAT----
gi|4372                       :         ATAT-CGCTT-CTTT-GGTGCAAA-AC-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TATCATTT-T--A-TT------C--AGACTT---------GGTAC-----------A-ATATTGCACT-AAT----GA-GACG-A
gi|4373                       :         ATTT-CACCC-CATT-GGTGCAAA-GC-A--GA-AC-CAA--TT------C--C---CTTATTT-C--A-TA------A--ACATTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-AA-T
gi|4374                       :         ATAT-TGCTC-CATT-GGTTCCAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C---------GTTT-C--A-TA------T--AGACTT---------GATAC-----------T-TTATTGCACG-CAT----TG-GACG-At
gi|4375                       :         ATTT-TGCCC-AATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AG-CAA--GTG-----C--GT-TCTTCTTT-C--A-AA------T--ACATTT---------GG-AC-----------CTTTTTTGCACC-CTT----GG-GACG-GA-AA
gi|4398                       :          TAT-CGCCC-CATT-GATGCAAG-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-TACG-At
gi|4400                       :          TAT-CGTCC-CATTTGGTGCAGA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATAT-C--A-TG------T--ACAATT---------GGTAA-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-AACG-
gi|4401                       :          TAT-AGCCA-CATT-AGTGCAAT-AA-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTTTTTTC--A-TA------T--ACACTT---------TATGC-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4404                       :                     ATG-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--CTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATAACTCT-AAT----GG-GATG-A
gi|4405                       : taacgccaaTAT-CGCCA-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C------CTTATTT-C--A-TA------T--ACACAA---------AGTAC-----------C-TTATTGAACC-AAT----GG-GCCG-taatta
gi|4406                       :          TAT-CACCC-TATT-TGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CGT--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTA------------C-TTATTTCTCC-AAT----GG-GAC--AA-TATATttat
gi|4409                       :          TAT-TGCTT-CATT-GAAGAAAATAA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TAACTGCTAT-AAT----GG-GACG-A
gi|4410                       :          TAT-CGCCC-AATT-GGGGCGAA-AA-G--GTCAC---A--GTG-----C--TT-CCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACCT---------GGTAT-----------C-TTAATGCTCT-AA
gi|4417                       :           AT-CACCC-CTTT-GGTGCAAA-GA-G--GC-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-ATT----TG-GATG-AA-
gi|4418                       :           AT-CGCCC-CATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-AC-CAG--GTC-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-AACG-AA-
gi|4419                       :           AT-CGTCC-CATA-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCATATTT-T--ATTA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACGTAA-T
gi|4420                       :           AT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-AAAGT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGAG-AA--ATAgat
gi|4421                       :           AT-CGCAC-CATT-GGTGTAAA-AA-T--AT-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGGACC-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4423                       :           AT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AC-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCAt
gi|4427                       :           AT-CAACC-CATT-AATGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTC---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GAC--AA-TATATatagacggatgat
gi|4429                       :           AT-CGCCC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--CT-TC-CCA--ATG-----T--TT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----TG-AACG-AA--ATA
gi|4431                       :           AT-CGCCT-CATT-GGTACAAT-AA-G--CT-CC-CAG--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GAAAC-----------C-TTAATGCACC-AAT----GG-GGCG-CA-T
gi|4443                       :            T-CGCCC-CATT-GATGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GAA-----C--CT-ACTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-GATGCCAGG-GACG-Atgt
gi|4447                       :            T-TGCCC-TATT-GGTGCAAT-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-GCTTATTT-C--A-TA------T----ACTT---------GATGC-----------C-TTATTACAAC-AAC----TG-AACG-AT-TAtttgt
gi|4448                       :            T-CGCTC-CATT-GATGCAAA-AA-G--GT-AT-CAA--GTA-----C--CT-TCCTATTT-C--A--A---------ACACTT---------GATAT-----------C-TTATATCACT-TAT----GG-GAC
gi|4449                       :            T-CGCCC-CGTT-GGAGCAAA-AC-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TATTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-CT
gi|4450                       :            T-CGCCT-AATT-GGTGCTAA-TA-G--AT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TAATTGC
gi|4453                       :             -CGACC-CATT-GGCGGAAT-AT-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-CA------T--ACATTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-Atatactggaatgattat
gi|4458                       :               GTCT-TATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGCTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------G-TTATTGCACA-AAT----
gi|4459                       :                 CC-CATT-GGTGCAAG-AC-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------A-TTATTGCACC-AAT----G
gi|4460                       :                cCC-AATT-ATTGTAAA-AA-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------TGTAT-----------C-TCATTGTACT-CAT----GA-GGTG-A
gi|4462                       :                cCC-CATT-GATGCAAA-AAAG--GT-TC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTTT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4464                       :                 CC-CATT-GCTGCAAA-AAAG--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------CATAC-----------C-TTATTACTCT-TAT----GG-GATG-AA-T
gi|4465                       :                 CC-CATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--TTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------C--ACATAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AGT-----A-AGCG-AA-gat
gi|4466                       :                 CC-CATT-GGTACAAA-AA-G--GT-AC-CAA--CTG-----C--TT-CTTTATT--C--A-TA------TGTATACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4473                       :                  C-CATT-GGTGCCAA-AA-A--GT-AC-CAA--CTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTGC-----------C-TTATTGCAAC-AAT----GG-GACG-At
gi|4474                       :                  C-CAAT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AT-CAA--TTG-----T--CT-TATTATTT-T--A-TA------T--ACACTA---------AGTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GA-GACG-A
gi|4475                       :                  C-CATT-AGTTCAAA-AA-G--GT-GC-CAC--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GACAC-----------T-TTATTGTTTT-AGC----GG-GACG-Atttgt
gi|4479                       :                     ATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----A--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------T-TTATTTTACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4480                       :                     ATT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TATACCTGT--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----AG-GATG-GACTAta
gi|4482                       :                      TT-GGTGCAAA-AA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AATAC-----------C-TTATTGCATT-AAT----GG-GACA-AA-

lowQualScore                  :     0   0  0    0        0 0 0 00  0  0   00   11111 00  0        0 00 0  111111 11      111111111     22222222222 0       1  0   0000  0    0  0 1   
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lowQualScore                  :     5   4  4    4        4 4 4 66  4  4   66   00000 66  4        4 55 4  111111 11      666666666     99999999999 8       1  8   9999  4    5  9 9   
consensus                     : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-TATAT
Reference ( family-178 )      : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-TATAT
gi|4284                       : ATAT-CAC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG-AT-TA
gi|4285                       : ATAT-CAT-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GT-GGCG-AA-TATATtat
gi|4286                       :    T-CAT-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GT-GGCG-AA-TA
gi|4287                       : ATAT-CGT-CC-TATT-GGTGCCAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTCTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-A
gi|4289                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-AA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4290                       :    T-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-AA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4291                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------T-TAATTACTCT-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4293                       : ATGT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A---G--GT-AC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-Acat
gi|4294                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-AAA--ACG-----C--CT-TCTTATTT-CATA-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------C-TTATTGCTGT-AAT----GG-GGCG-AA-T-TAT
gi|4296                       : ATTT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCACCAAAT----GG-GACG-A
gi|4297                       :    T-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCACCAAAT----GG-GACG--A-TA
gi|4298                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-TA------T--ACACTT---------TGTAC-----------C-TTGTTGTTCT-AAT----AG-GACG--A-TAa
gi|4302                       : ATAT-CGC-CC-CATC-TGTGCAAA-A-A-A--GG-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG--A-TAta
gi|4305                       : ATTT-CAC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAT--TTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GATG-GA-T-TATtat
gi|4306                       : ATAT-CGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4307                       :    T-CGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4308                       : ATTT-TGC-CC-CATA-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTT-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTAATGCACT-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4310                       : ATTT-CAC-CA-CATT-GATGCTAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTT-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-AA-t
gi|4312                       : ATAT-CAC-CC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-GAA--GCG-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTC---------GCTAC-----------C-TTATTGCTCT-ATT----GG-GACA-AA-T-TAT
gi|4313                       : ATAT-CGC-CC-C-TT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTA---------GGTAC-----------C-TTGTAACTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4315                       : ATAT-CGC-TC-CACT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACAC---------AGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-AT-TA
gi|4317                       : ATTT-CGA-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACAAGT---------GGTAC-----------T-ATATTGCACC-AAT----GGAGGCG-A
gi|4318                       : ATATTCAC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-ACGCAA---TG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGTACT-CAT----GG-GATG-AA-Ttttat
gi|4320                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GCTGCAAA-A-A-G--AT-AT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-AAT----GC-GTCG-At
gi|4322                       : ATTT-CGT-CC-CATT-GGTGCATA-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-GTATTACACT-TAT----TG-GACG-AA-T
gi|4323                       : ACAT-TGC-CC-CATT-AGTGCAAT-A-A-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTGTTA-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C--TATTACACT-AAT----GG-GACG-AA-t
gi|4325                       : ATAT-CGC-CC-AATT-GGTGCGAT-A-A-G--GT-AT-CAT--GTG-----C--TT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACA-AAT----GT-GACG-A
gi|4327                       : ATTT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-AGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TA------A--GTACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-A
gi|4328                       : ATAT-TGC-TT-TGTT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGCA-AT-TAtt
gi|4329                       : ATCT-CAC-CC-CATT-AGTGCATA-C-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-AA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4332                       : ACAT-CACGCT-CACT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4333                       : ATAT-TGC-CC--ATC-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTC-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTTGGTAACTTAGGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4335                       : ATAT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--------------TG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4337                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-TT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACCC---------GGT-------------C-TTATTGCACT-GAT----GG-AACG-A
gi|4339                       : ATAT-TGC-TT-TATT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGC
gi|4340                       : ATCT-CGC-CC-CATT-AGTGCATA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TGTTGTTT-C--A-AA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----atttat
gi|4342                       : ATAT-TGC-GT-CATT-GGTGCAAA-A-G-G--GT-AC-CAAAAGTA-----T--AT-T-TTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4343                       : ATTT-CGT-AC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-GAA--ATG-----C--CCCTTTTATTT-C--A-TA------T--ACGCTT---------GGTAT-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GATG-A
gi|4344                       : ATAT-CGC-CCATATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--T-TA------T--ACACTT---------GGTACCCGGTATCCGGC-TTATTGCCCT-AAT----GA-AACG-Attt
gi|4345                       : ATAT-CGC-CC--ATT-GGTGCGAA-A-A-G--TC-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GTTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GG-GATG-A
gi|4346                       : ATTT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TT------T--ACACTT---------GGTAC-----------G-TTATATTACT-ATT----GG-GACG-AA-
gi|4347                       : ACAT-CGT-CC-CATT-GGAGCAAA-A---G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--G-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTACGCT-AAA----GC-GACG--A-TAct
gi|4349                       : ATTT-CGA-CC-CGTT-AGTTCAGT-A-A-G--GT-AA-CGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------CTTTTTTGCACT-CAT----GG-GACG-AA-T-TATta
gi|4350                       : ATGT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCAAC-AAT----G
gi|4351                       : ATTT-CGT-CC-CACT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTCATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AA
gi|4352                       : ATTT-CGC-CC-CATT-TGTGATAT-A-A-G--TT-AC-CAA--GTG-----C--CT-ATTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACG-AAT----GG-GACG-A
gi|4354                       : ATTT-CGT-TC-TGTT-GGTGCAAG-A-A-G---T-GT-CAA--GTG-----C--CG-TTTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GATG-AA-Ttttat
gi|4355                       : ATAT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG-At
gi|4356                       :    T-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4357                       : ATAT-AAT-TC-TGTT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GTTCC-----------A-TTATTGTTCT-GAT----GG-GAC
gi|4358                       : ATAT-CGC-CC-CATT-AGTGCAAA-A-T-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CG-TCTAATTG-C--A-TA------T--AC----------------AC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-Aacattat
gi|4360                       : ATAA-CGT-CC-CACT-GGTGCAGA-A-A-G--GT-AT-CAA--GAG-----T--CT-TCTAATTT-C--A-TA------TACACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4361                       : ACAT-CTC-CC-CATT-GGT---AA-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ATACAT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GA
gi|4362                       : ATAT-CAA-CT-CACT-GGTACAAA-A-T-G--GT-AC-CAA--GTGAAGTGT--CT-TCTTATGC-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TT-TTACACT-AAT----GG-GACG-A
gi|4363                       : ATAT-CGT-CC-AATT-TGTGCAAA-A-A-G---T-AT-CAA--GTA-----CACCT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GATAC-----------A-CTGTTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4364                       : ATAT-CGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-TC-CAA--GTG-----T--CT-TCCTA-TT-C--T-TA------T--ATACTT---------CGTACAGTAT------C-TTATTGCTCT-AGT----GG-GACG-A
gi|4365                       : ATAG-CGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--G-------A--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-TA------T--GCACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-A
gi|4367                       : ACAT-CGC-CC-AATT-GGTGCATA-A-A-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-T----TTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAA-----------C-TTATTGCTCT-AAC----GG-GACA-A
gi|4369                       : ATAT-CGC-CA-CATT-TATGCAAA-A-A-A--GT-AC-CTA--GAG-----C--CA-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACAATT---------GGTAC-----------A-TTGGTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4370                       : ATTT-CGC-CC-CTCT-GGTGTAAA-A-G-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--GCATTT---------GGAAC-----------G-TTATTGTCCT-AAT----
gi|4372                       : ATAT-CGC-TT-CTTT-GGTGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TATCATTT-T--A-TT------C--AGACTT---------GGTAC-----------A-ATATTGCACT-AAT----GA-GACG-A
gi|4373                       : ATTT-CAC-CC-CATT-GGTGCAAA-G-C-A--GA-AC-CAA--TT------C--C---CTTATTT-C--A-TA------A--ACATTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-AA-T
gi|4374                       : ATAT-TGC-TC-CATT-GGTTCCAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C---------GTTT-C--A-TA------T--AGACTT---------GATAC-----------T-TTATTGCACG-CAT----TG-GACG-At
gi|4375                       : ATTT-TGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AG-CAA--GTG-----C--GT-TCTTCTTT-C--A-AA------T--ACATTT---------GG-AC-----------CTTTTTTGCACC-CTT----GG-GACG-GA-AA
gi|4398                       :  TAT-CGC-CC-CATT-GATGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-TACG-At
gi|4400                       :  TAT-CGT-CC-CATTTGGTGCAGA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATAT-C--A-TG------T--ACAATT---------GGTAA-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-AACG-
gi|4401                       :  TAT-AGC-CA-CATT-AGTGCAAT-A-A-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTTTTTTC--A-TA------T--ACACTT---------TATGC-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4404                       :  TAA-CGC-CA-AATG-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--CTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATAACTCT-AAT----GG-GATG-A
gi|4405                       :  TAT-CGC-CA-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C------CTTATTT-C--A-TA------T--ACACAA---------AGTAC-----------C-TTATTGAACC-AAT----GG-GCCG-taatta
gi|4406                       :  TAT-CAC-CC-TATT-TGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CGT--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTA------------C-TTATTTCTCC-AAT----GG-GAC--AA-TATATttat
gi|4409                       :  TAT-TGC-TT-CATT-GAAGAAAATA-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TAACTGCTAT-AAT----GG-GACG-A
gi|4410                       :  TAT-CGC-CC-AATT-GGGGCGAA-A-A-G--GTCAC---A--GTG-----C--TT-CCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACCT---------GGTAT-----------C-TTAATGCTCT-AA
gi|4417                       :   AT-CAC-CC-CTTT-GGTGCAAA-G-A-G--GC-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-ATT----TG-GATG-AA-
gi|4418                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAG--GTC-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-AACG-AA-
gi|4419                       :   AT-CGT-CC-CATA-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCATATTT-T--ATTA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACGTAA-T
gi|4420                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-AAAGT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGAG-AA--ATAgat
gi|4421                       :   AT-CGC-AC-CATT-GGTGTAAA-A-A-T--AT-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGGACC-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4423                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCAAT-A---------GACG-GA-Tt
gi|4427                       :   AT-CAA-CC-CATT-AATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTC---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GAC--AA-TATATgat
gi|4429                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--CT-TC-CCA--ATG-----T--TT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----TG-AACG-AA--ATA
gi|4431                       :   AT-CGC-CT-CATT-GGTACAAT-A-A-G--CT-CC-CAG--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GAAAC-----------C-TTAATGCACC-AAT----GG-GGCG-CA-T
gi|4443                       :    T-CGC-CC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GAA-----C--CT-ACTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-GATGCCAGG-GACG-Atgt
gi|4447                       :    T-TGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-GCTTATTT-C--A-TA------T----ACTT---------GATGC-----------C-TTATTACAAC-AAC----TG-AACG-AT-TAtttgt
gi|4448                       :    T-CGC-TC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AT-CAA--GTA-----C--CT-TCCTATTT-C--A--A---------ACACTT---------GATAT-----------C-TTATATCACT-TAT----GG-GAC
gi|4449                       :    T-CGC-CC-CGTT-GGAGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TATTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-CT
gi|4450                       :    T-CGC-CT-AATT-GGTGCTAA-T-A-G--AT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TAATTGCTAT-ACT----GG-AATG-AT-TA
gi|4453                       :     -CGA-CC-CATT-GGCGGAAT-A-T-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-CA------T--ACATTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4458                       :       GT-CT-TATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGCTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------G-TTATTGCACA-AAT----
gi|4459                       :        C-CC-CATT-GGTGCAAG-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------A-TTATTGCACC-AAT----G
gi|4460                       :        C-CC-AATT-ATTGTAAA-A-A-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------TGTAT-----------C-TCATTGTACT-CAT----GA-GGTG-A
gi|4462                       :         -CC-CATT-GATGCAAA-A-AAG--GT-TC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTTT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4464                       :         -CC-CATT-GCTGCAAA-AAA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------CATAC-----------C-TTATTACTCT-TAT----GG-GATG-AA-T
gi|4465                       :         -CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--TTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------C--ACATAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AGT----AA-G-CG-AA-gat
gi|4466                       :         -CC-CATT-GGTACAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--CTG-----C--TT-CTTTATT--C--A-TA------TGTATACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4473                       :           C-CATT-GGTGCCAA-A-A-A--GT-AC-CAA--CTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTGC-----------C-TTATTGCAAC-AAT----GG-GACG-At
gi|4474                       :           C-CAAT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AT-CAA--TTG-----T--CT-TATTATTT-T--A-TA------T--ACACTA---------AGTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GA-GACG-A
gi|4475                       :           C-CATT-AGTTCAAA-A-A-G--GT-GC-CAC--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GACAC-----------T-TTATTGTTTT-AGC----GG-GACG-Atttgt
gi|4479                       :              ATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----A--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------T-TTATTTTACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4480                       :              ATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TATACCTGT--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----AG-GATG-GACTAta
gi|4482                       :               TT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AATAC-----------C-TTATTGCATT-AAT----GG-GACA-AA-

lowQualScore                  :     0   0  0    0        0 0 0 00  0  0   00   11111 00  0        0 00 0  111111 11      111111111     22222222222 0       1  0   0000  0    0  0 1   
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consensus                     : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-TATAT
Reference ( family-178 )      : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-TATAT
gi|4284                       : ATAT-CAC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG-AT-TA
gi|4285                       : ATAT-CAT-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GT-GGCG-AA-TATATtat
gi|4286                       :    T-CAT-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GT-GGCG-AA-TA
gi|4287                       : ATAT-CGT-CC-TATT-GGTGCCAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTCTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-A
gi|4289                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-AA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4290                       :    T-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-AA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
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gi|4293                       : ATGT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A---G--GT-AC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-Acat
gi|4294                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-AAA--ACG-----C--CT-TCTTATTT-CATA-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------C-TTATTGCTGT-AAT----GG-GGCG-AA-T-TAT
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gi|4302                       : ATAT-CGC-CC-CATC-TGTGCAAA-A-A-A--GG-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGCG--A-TAta
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gi|4307                       :    T-CGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
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gi|4320                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GCTGCAAA-A-A-G--AT-AT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-AAT----GC-GTCG-At
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gi|4323                       : ACAT-TGC-CC-CATT-AGTGCAAT-A-A-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTGTTA-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C--TATTACACT-AAT----GG-GACG-AA-t
gi|4325                       : ATAT-CGC-CC-AATT-GGTGCGAT-A-A-G--GT-AT-CAT--GTG-----C--TT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACA-AAT----GT-GACG-A
gi|4327                       : ATTT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-AGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TA------A--GTACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-A
gi|4328                       : ATAT-TGC-TT-TGTT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGCA-AT-TAtt
gi|4329                       : ATCT-CAC-CC-CATT-AGTGCATA-C-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-AA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4332                       : ACAT-CACGCT-CACT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4333                       : ATAT-TGC-CC--ATC-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTC-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTTGGTAACTTAGGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4335                       : ATAT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--------------TG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
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gi|4342                       : ATAT-TGC-GT-CATT-GGTGCAAA-A-G-G--GT-AC-CAAAAGTA-----T--AT-T-TTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
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gi|4347                       : ACAT-CGT-CC-CATT-GGAGCAAA-A---G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--G-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTACGCT-AAA----GC-GACG--A-TAct
gi|4349                       : ATTT-CGA-CC-CGTT-AGTTCAGT-A-A-G--GT-AA-CGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------CTTTTTTGCACT-CAT----GG-GACG-AA-T-TATta
gi|4350                       : ATGT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCAAC-AAT----G
gi|4351                       : ATTT-CGT-CC-CACT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTCATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AA
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gi|4355                       : ATAT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG-At
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gi|4357                       : ATAT-AAT-TC-TGTT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GTTCC-----------A-TTATTGTTCT-GAT----GG-GAC
gi|4358                       : ATAT-CGC-CC-CATT-AGTGCAAA-A-T-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CG-TCTAATTG-C--A-TA------T--AC----------------AC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-Aacattat
gi|4360                       : ATAA-CGT-CC-CACT-GGTGCAGA-A-A-G--GT-AT-CAA--GAG-----T--CT-TCTAATTT-C--A-TA------TACACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
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gi|4369                       : ATAT-CGC-CA-CATT-TATGCAAA-A-A-A--GT-AC-CTA--GAG-----C--CA-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACAATT---------GGTAC-----------A-TTGGTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4370                       : ATTT-CGC-CC-CTCT-GGTGTAAA-A-G-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--GCATTT---------GGAAC-----------G-TTATTGTCCT-AAT----
gi|4372                       : ATAT-CGC-TT-CTTT-GGTGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TATCATTT-T--A-TT------C--AGACTT---------GGTAC-----------A-ATATTGCACT-AAT----GA-GACG-A
gi|4373                       : ATTT-CAC-CC-CATT-GGTGCAAA-G-C-A--GA-AC-CAA--TT------C--C---CTTATTT-C--A-TA------A--ACATTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-AA-T
gi|4374                       : ATAT-TGC-TC-CATT-GGTTCCAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C---------GTTT-C--A-TA------T--AGACTT---------GATAC-----------T-TTATTGCACG-CAT----TG-GACG-At
gi|4375                       : ATTT-TGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AG-CAA--GTG-----C--GT-TCTTCTTT-C--A-AA------T--ACATTT---------GG-AC-----------CTTTTTTGCACC-CTT----GG-GACG-GA-AA
gi|4398                       :  TAT-CGC-CC-CATT-GATGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-TACG-At
gi|4400                       :  TAT-CGT-CC-CATTTGGTGCAGA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATAT-C--A-TG------T--ACAATT---------GGTAA-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-AACG-
gi|4401                       :  TAT-AGC-CA-CATT-AGTGCAAT-A-A-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTTTTTTC--A-TA------T--ACACTT---------TATGC-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4404                       :  TAA-CGC-CA-AATG-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--CTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATAACTCT-AAT----GG-GATG-A
gi|4405                       :  TAT-CGC-CA-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C------CTTATTT-C--A-TA------T--ACACAA---------AGTAC-----------C-TTATTGAACC-AAT----GG-GCCG-taatta
gi|4406                       :  TAT-CAC-CC-TATT-TGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CGT--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTA------------C-TTATTTCTCC-AAT----GG-GAC--AA-TATATttat
gi|4409                       :  TAT-TGC-TT-CATT-GAAGAAAATA-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TAACTGCTAT-AAT----GG-GACG-A
gi|4410                       :  TAT-CGC-CC-AATT-GGGGCGAA-A-A-G--GTCAC---A--GTG-----C--TT-CCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACCT---------GGTAT-----------C-TTAATGCTCT-AA
gi|4417                       :   AT-CAC-CC-CTTT-GGTGCAAA-G-A-G--GC-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-ATT----TG-GATG-AA-
gi|4418                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAG--GTC-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-AACG-AA-
gi|4419                       :   AT-CGT-CC-CATA-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCATATTT-T--ATTA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACGTAA-T
gi|4420                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-AAAGT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGAG-AA--ATAgat
gi|4421                       :   AT-CGC-AC-CATT-GGTGTAAA-A-A-T--AT-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGGACC-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4423                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCAAT-A---------GACG-GA-Tt
gi|4427                       :   AT-CAA-CC-CATT-AATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTC---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GAC--AA-TATATgat
gi|4429                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--CT-TC-CCA--ATG-----T--TT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----TG-AACG-AA--ATA
gi|4431                       :   AT-CGC-CT-CATT-GGTACAAT-A-A-G--CT-CC-CAG--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GAAAC-----------C-TTAATGCACC-AAT----GG-GGCG-CA-T
gi|4443                       :    T-CGC-CC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GAA-----C--CT-ACTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-GATGCCAGG-GACG-Atgt
gi|4447                       :    T-TGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-GCTTATTT-C--A-TA------T----ACTT---------GATGC-----------C-TTATTACAAC-AAC----TG-AACG-AT-TAtttgt
gi|4448                       :    T-CGC-TC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AT-CAA--GTA-----C--CT-TCCTATTT-C--A--A---------ACACTT---------GATAT-----------C-TTATATCACT-TAT----GG-GAC
gi|4449                       :    T-CGC-CC-CGTT-GGAGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TATTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-CT
gi|4450                       :    T-CGC-CT-AATT-GGTGCTAA-T-A-G--AT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TAATTGCTAT-ACT----GG-AATG-AT-TA
gi|4453                       :     -CGA-CC-CATT-GGCGGAAT-A-T-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-CA------T--ACATTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4458                       :       GT-CT-TATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGCTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------G-TTATTGCACA-AAT----
gi|4459                       :        C-CC-CATT-GGTGCAAG-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------A-TTATTGCACC-AAT----G
gi|4460                       :        C-CC-AATT-ATTGTAAA-A-A-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------TGTAT-----------C-TCATTGTACT-CAT----GA-GGTG-A
gi|4462                       :         -CC-CATT-GATGCAAA-A-AAG--GT-TC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTTT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4464                       :         -CC-CATT-GCTGCAAA-AAA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------CATAC-----------C-TTATTACTCT-TAT----GG-GATG-AA-T
gi|4465                       :         -CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--TTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------C--ACATAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AGT----AA-G-CG-AA-gat
gi|4466                       :         -CC-CATT-GGTACAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--CTG-----C--TT-CTTTATT--C--A-TA------TGTATACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4473                       :           C-CATT-GGTGCCAA-A-A-A--GT-AC-CAA--CTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTGC-----------C-TTATTGCAAC-AAT----GG-GACG-At
gi|4474                       :           C-CAAT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AT-CAA--TTG-----T--CT-TATTATTT-T--A-TA------T--ACACTA---------AGTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GA-GACG-A
gi|4475                       :           C-CATT-AGTTCAAA-A-A-G--GT-GC-CAC--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GACAC-----------T-TTATTGTTTT-AGC----GG-GACG-Atttgt
gi|4479                       :              ATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----A--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------T-TTATTTTACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4480                       :              ATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TATACCTGT--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----AG-GATG-GACTAta
gi|4482                       :               TT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AATAC-----------C-TTATTGCATT-AAT----GG-GACA-AA-


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blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                      .
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                      .
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                      .
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   C                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   G                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   C                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   A                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
blockSeqs                     :                                                .                          .      .       .             .                   T                       
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Reference ( family-178 )      : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-TATAT
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gi|4306                       : ATAT-CGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4307                       :    T-CGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TG-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
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gi|4313                       : ATAT-CGC-CC-C-TT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTA---------GGTAC-----------C-TTGTAACTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4315                       : ATAT-CGC-TC-CACT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACAC---------AGAAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-AT-TA
gi|4317                       : ATTT-CGA-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACAAGT---------GGTAC-----------T-ATATTGCACC-AAT----GGAGGCG-A
gi|4318                       : ATATTCAC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-ACGCAA---TG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGTACT-CAT----GG-GATG-AA-Ttttat
gi|4320                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GCTGCAAA-A-A-G--AT-AT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-AAT----GC-GTCG-At
gi|4322                       : ATTT-CGT-CC-CATT-GGTGCATA-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-GTATTACACT-TAT----TG-GACG-AA-T
gi|4323                       : ACAT-TGC-CC-CATT-AGTGCAAT-A-A-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTGTTA-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C--TATTACACT-AAT----GG-GACG-AA-t
gi|4325                       : ATAT-CGC-CC-AATT-GGTGCGAT-A-A-G--GT-AT-CAT--GTG-----C--TT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACA-AAT----GT-GACG-A
gi|4327                       : ATTT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-AGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TA------A--GTACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-A
gi|4328                       : ATAT-TGC-TT-TGTT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGCA-AT-TAtt
gi|4329                       : ATCT-CAC-CC-CATT-AGTGCATA-C-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-AA------T--ACACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4332                       : ACAT-CACGCT-CACT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTC-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4333                       : ATAT-TGC-CC--ATC-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTC-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTTGGTAACTTAGGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4335                       : ATAT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--------------TG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-A
gi|4337                       : ATAT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-TT-CAT--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACCC---------GGT-------------C-TTATTGCACT-GAT----GG-AACG-A
gi|4339                       : ATAT-TGC-TT-TATT-GGTGCAAA-A-A-G--AT-AC-CAA--GT------T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGTACT-AAT----GG-GGC
gi|4340                       : ATCT-CGC-CC-CATT-AGTGCATA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TGTTGTTT-C--A-AA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----atttat
gi|4342                       : ATAT-TGC-GT-CATT-GGTGCAAA-A-G-G--GT-AC-CAAAAGTA-----T--AT-T-TTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4343                       : ATTT-CGT-AC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-GAA--ATG-----C--CCCTTTTATTT-C--A-TA------T--ACGCTT---------GGTAT-----------C-TTATTGCACT-AAT----GG-GATG-A
gi|4344                       : ATAT-CGC-CCATATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--T-TA------T--ACACTT---------GGTACCCGGTATCCGGC-TTATTGCCCT-AAT----GA-AACG-Attt
gi|4345                       : ATAT-CGC-CC--ATT-GGTGCGAA-A-A-G--TC-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GTTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GG-GATG-A
gi|4346                       : ATTT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--G-TT------T--ACACTT---------GGTAC-----------G-TTATATTACT-ATT----GG-GACG-AA-
gi|4347                       : ACAT-CGT-CC-CATT-GGAGCAAA-A---G--GT-AC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--G-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTACGCT-AAA----GC-GACG--A-TAct
gi|4349                       : ATTT-CGA-CC-CGTT-AGTTCAGT-A-A-G--GT-AA-CGA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------CTTTTTTGCACT-CAT----GG-GACG-AA-T-TATta
gi|4350                       : ATGT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------A-TTATTGCAAC-AAT----G
gi|4351                       : ATTT-CGT-CC-CACT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTCATTG-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AA
gi|4352                       : ATTT-CGC-CC-CATT-TGTGATAT-A-A-G--TT-AC-CAA--GTG-----C--CT-ATTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACG-AAT----GG-GACG-A
gi|4354                       : ATTT-CGT-TC-TGTT-GGTGCAAG-A-A-G---T-GT-CAA--GTG-----C--CG-TTTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GATG-AA-Ttttat
gi|4355                       : ATAT-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG-At
gi|4356                       :    T-CGT-CC-CATT-GGTGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--ATG-----C--C--------TT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTTCACC-AAT----GG-GACG--A-TA
gi|4357                       : ATAT-AAT-TC-TGTT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTA-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GTTCC-----------A-TTATTGTTCT-GAT----GG-GAC
gi|4358                       : ATAT-CGC-CC-CATT-AGTGCAAA-A-T-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CG-TCTAATTG-C--A-TA------T--AC----------------AC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACG-Aacattat
gi|4360                       : ATAA-CGT-CC-CACT-GGTGCAGA-A-A-G--GT-AT-CAA--GAG-----T--CT-TCTAATTT-C--A-TA------TACACACTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----TG-GACG-A
gi|4361                       : ACAT-CTC-CC-CATT-GGT---AA-A-A-T--GT-AC-CAA--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ATACAT---------GGCAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GA
gi|4362                       : ATAT-CAA-CT-CACT-GGTACAAA-A-T-G--GT-AC-CAA--GTGAAGTGT--CT-TCTTATGC-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TT-TTACACT-AAT----GG-GACG-A
gi|4363                       : ATAT-CGT-CC-AATT-TGTGCAAA-A-A-G---T-AT-CAA--GTA-----CACCT-TCTTATTT-C--A-TA------C--ACACTT---------GATAC-----------A-CTGTTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4364                       : ATAT-CGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-TC-CAA--GTG-----T--CT-TCCTA-TT-C--T-TA------T--ATACTT---------CGTACAGTAT------C-TTATTGCTCT-AGT----GG-GACG-A
gi|4365                       : ATAG-CGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--G-------A--GTG-----C--CT-T---ATTT-C--A-TA------T--GCACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-A
gi|4367                       : ACAT-CGC-CC-AATT-GGTGCATA-A-A-G--AT-AC-CAA--ATG-----C--CT-T----TTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAA-----------C-TTATTGCTCT-AAC----GG-GACA-A
gi|4369                       : ATAT-CGC-CA-CATT-TATGCAAA-A-A-A--GT-AC-CTA--GAG-----C--CA-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACAATT---------GGTAC-----------A-TTGGTGCACT-AAT----GG-AACG-A
gi|4370                       : ATTT-CGC-CC-CTCT-GGTGTAAA-A-G-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--GCATTT---------GGAAC-----------G-TTATTGTCCT-AAT----
gi|4372                       : ATAT-CGC-TT-CTTT-GGTGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GCA-----C--CT-TATCATTT-T--A-TT------C--AGACTT---------GGTAC-----------A-ATATTGCACT-AAT----GA-GACG-A
gi|4373                       : ATTT-CAC-CC-CATT-GGTGCAAA-G-C-A--GA-AC-CAA--TT------C--C---CTTATTT-C--A-TA------A--ACATTT---------GATAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GACA-AA-T
gi|4374                       : ATAT-TGC-TC-CATT-GGTTCCAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C---------GTTT-C--A-TA------T--AGACTT---------GATAC-----------T-TTATTGCACG-CAT----TG-GACG-At
gi|4375                       : ATTT-TGC-CC-AATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AG-CAA--GTG-----C--GT-TCTTCTTT-C--A-AA------T--ACATTT---------GG-AC-----------CTTTTTTGCACC-CTT----GG-GACG-GA-AA
gi|4398                       :  TAT-CGC-CC-CATT-GATGCAAG-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-CA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-TACG-At
gi|4400                       :  TAT-CGT-CC-CATTTGGTGCAGA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATAT-C--A-TG------T--ACAATT---------GGTAA-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-AACG-
gi|4401                       :  TAT-AGC-CA-CATT-AGTGCAAT-A-A-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTTTTTTC--A-TA------T--ACACTT---------TATGC-----------A-TTATTGCACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4404                       :  TAA-CGC-CA-AATG-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--CTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATAACTCT-AAT----GG-GATG-A
gi|4405                       :  TAT-CGC-CA-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C------CTTATTT-C--A-TA------T--ACACAA---------AGTAC-----------C-TTATTGAACC-AAT----GG-GCCG-taatta
gi|4406                       :  TAT-CAC-CC-TATT-TGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CGT--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTA------------C-TTATTTCTCC-AAT----GG-GAC--AA-TATATttat
gi|4409                       :  TAT-TGC-TT-CATT-GAAGAAAATA-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--AT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGAAC-----------C-TAACTGCTAT-AAT----GG-GACG-A
gi|4410                       :  TAT-CGC-CC-AATT-GGGGCGAA-A-A-G--GTCAC---A--GTG-----C--TT-CCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACCT---------GGTAT-----------C-TTAATGCTCT-AA
gi|4417                       :   AT-CAC-CC-CTTT-GGTGCAAA-G-A-G--GC-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-ATT----TG-GATG-AA-
gi|4418                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAG--GTC-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-AACG-AA-
gi|4419                       :   AT-CGT-CC-CATA-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCATATTT-T--ATTA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GACGTAA-T
gi|4420                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-AAAGT-AC-CAA--ATG-----C--CT-TCTTATTT-C--C-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACC-AAT----GG-GGAG-AA--ATAgat
gi|4421                       :   AT-CGC-AC-CATT-GGTGTAAA-A-A-T--AT-AT-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGGACC-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4423                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCAAT-A---------GACG-GA-Tt
gi|4427                       :   AT-CAA-CC-CATT-AATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTC---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GA-GAC--AA-TATATgat
gi|4429                       :   AT-CGC-CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--CT-TC-CCA--ATG-----T--TT-TCTTATTT-C--A-TA------A--ACACAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCACT-AAT----TG-AACG-AA--ATA
gi|4431                       :   AT-CGC-CT-CATT-GGTACAAT-A-A-G--CT-CC-CAG--GTG-----C--CT-TCTTGTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GAAAC-----------C-TTAATGCACC-AAT----GG-GGCG-CA-T
gi|4443                       :    T-CGC-CC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GAA-----C--CT-ACTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-GTATTGCTCT-GATGCCAGG-GACG-Atgt
gi|4447                       :    T-TGC-CC-TATT-GGTGCAAT-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-GCTTATTT-C--A-TA------T----ACTT---------GATGC-----------C-TTATTACAAC-AAC----TG-AACG-AT-TAtttgt
gi|4448                       :    T-CGC-TC-CATT-GATGCAAA-A-A-G--GT-AT-CAA--GTA-----C--CT-TCCTATTT-C--A--A---------ACACTT---------GATAT-----------C-TTATATCACT-TAT----GG-GAC
gi|4449                       :    T-CGC-CC-CGTT-GGAGCAAA-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TATTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-CT
gi|4450                       :    T-CGC-CT-AATT-GGTGCTAA-T-A-G--AT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTG-C--A-TA------C--ACACTT---------GGTAC-----------C-TAATTGCTAT-ACT----GG-AATG-AT-TA
gi|4453                       :     -CGA-CC-CATT-GGCGGAAT-A-T-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-CA------T--ACATTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACG-A
gi|4458                       :       GT-CT-TATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTGCTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTAT-----------G-TTATTGCACA-AAT----
gi|4459                       :        C-CC-CATT-GGTGCAAG-A-C-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-T--A-TA------T--ACACTT---------GATAC-----------A-TTATTGCACC-AAT----G
gi|4460                       :        C-CC-AATT-ATTGTAAA-A-A-G--GT-GC-CAA--GTG-----C--TT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------TGTAT-----------C-TCATTGTACT-CAT----GA-GGTG-A
gi|4462                       :         -CC-CATT-GATGCAAA-A-AAG--GT-TC-AAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTTT-AAT----GG-GACG-AA-T-TAT
gi|4464                       :         -CC-CATT-GCTGCAAA-AAA-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------CATAC-----------C-TTATTACTCT-TAT----GG-GATG-AA-T
gi|4465                       :         -CC-CATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--TTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------C--ACATAT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AGT----AA-G-CG-AA-gat
gi|4466                       :         -CC-CATT-GGTACAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--CTG-----C--TT-CTTTATT--C--A-TA------TGTATACTT---------AGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----GG-GACA-AA-T
gi|4473                       :           C-CATT-GGTGCCAA-A-A-A--GT-AC-CAA--CTG-----C--CT-TTTTATTT-C--A-TA------T--ATACTT---------GGTGC-----------C-TTATTGCAAC-AAT----GG-GACG-At
gi|4474                       :           C-CAAT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AT-CAA--TTG-----T--CT-TATTATTT-T--A-TA------T--ACACTA---------AGTAC-----------C-TTATTGCACT-TAT----GA-GACG-A
gi|4475                       :           C-CATT-AGTTCAAA-A-A-G--GT-GC-CAC--GTG-----T--CT-TCTTATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GACAC-----------T-TTATTGTTTT-AGC----GG-GACG-Atttgt
gi|4479                       :              ATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----A--CT-TCTAATTT-C--A-TA------T--ACACTT---------GGTAC-----------T-TTATTTTACT-AAT----GG-GACG-AA-T
gi|4480                       :              ATT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTATTT-C--A-TATACCTGT--ACACTT---------GGTAC-----------C-TTATTGCTCT-AAT----AG-GATG-GACTAta
gi|4482                       :               TT-GGTGCAAA-A-A-G--GT-AC-CAA--GTG-----C--CT-TCTTTTTT-C--A-TA------T--ACACTT---------AATAC-----------C-TTATTGCATT-AAT----GG-GACA-AA-