lowQualScore                  :                                                                                                     111                                                                                                                            
lowQualScore                  :    0  0  0 00  0    0    0        00 0 0 00 11 0 00   00 11  00 0 88888   2 111111 1111111 33 1111  777 00   1       11 0 000   222222   11 66 0 0 0 000  222 222 222222222222 11  0  11    11   0 55555 0 111 0 33333 0 0   00    
lowQualScore                  :    .  .  . ..  .    .    .        .. . . .. .. . ..   .. ..  .. . .....   . ...... ....... .. ....  ... ..   .       .. . ...   ......   .. .. . . . ...  ... ... ............ ..  .  ..    ..   . ..... . ... . ..... . .   ..    
lowQualScore                  :    4  4  4 66  4    4    4        66 4 4 66 00 4 66   66 00  66 4 66666   4 999999 9999999 99 4444  111 66   6       11 4 777   000000   00 44 4 4 8 777  999 888 777777777777 00  4  00    11   5 44444 5 555 5 00000 5 5   77    
consensus                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-N---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
Reference ( gi|103564 )       : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---A-GAT-T------T-------A--A----TAGC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--CT-C-A-A-A---AA-A-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103571                     : ATT-GT-TA-A--GT-CATA-ACAG-CTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-AGT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-ATGGGCC--A-G---CAG------GGG--CC-C-C-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-CC--ATTG--TAA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103570                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGGACCC-C-A-A-A---A--------G------------A--TA-AA--ATTG--TG--A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103577                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-ACAA-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGG--CC-T-T-A-A---AA-A-A---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAT--TCTT
gi|103576                     : ATT-GT-TT-T--AT-CATA-GCAG-TTAAGACT--G-G-G--T--C-C--TGT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--C--C-A-C-A---AA-A-GT--G------------A--TA-AA--GTTG--TGA-A-T---A-T---T-C-----A-A-TAA--TCTT
gi|103565                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTA--A--AG--G-A---A-GAT-T------T-------T--ATATCTATC-T--ATA-AGGGGTT--A-G---CAG------GGG--TC-C-A-A-A---AA-G-A---G------------A--TA-AA--ATTG--TAA-A-T---T-T---T-C-----A-T-AAA--TCTT
gi|103585                     : ATT-GC-TT-A--GA-TATA-ACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGC--CC-C-A-A-A---AA-A-----G------------A--TA-AA--ATTA--TGA-A-A---T-T---T-C-----G-A-AAT--TCTT
gi|103581                     : ATT-GT-GA-A--ATACATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-A--TTT--A--AA--G-G---T-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGGGTCC--A-G---CAG------TGG--CC-G-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-AT--T-T---T-T-----A-A-AAA--TTT
gi|103569                     : ATT-GC-TT-A--GT-CATA-GCAG-TTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGT--C--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATC-C--ATA-AGAGGTC--A-G---CAG------GGT--C--C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATCG--TG----A---T-TAG-T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103588                     : ATT-GC-TT-G--GT-TATA-ACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGGGACC--A-G---TA-------GGG--CC-C-A-A-A---AA-A-----G------------A--TA-AC--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAT--TCTT
gi|103599                     : ATT-GT-TT-A--GT-AACA-ACAG-TTCAGACC--A-G-G--G--C-C--TTT--A--AA--G-G---A-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AAGGGCC--A-A---CAG------GGG--TT-T-A-A-A---AA-G-A---G------------A--TA-TC--ATTG--CG--A-A---T-T---T-CG----A-A-AAG--TCTT
gi|103575                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATT-ACAG-TGGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTT--A--AA--A-G---G-GAT-T--------------A--A----TATA-A--ATA-AGGGGCC--A-G---TAG------GGG--CC-C-A-A-A---AC-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---T-T---T-C-----
gi|103591                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AATTG-G-------T-T------TGTATACCA--G----TACT-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------AGG--TT-A-A-A-T---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---T-G---T-C-----A-A-AAA--
gi|103578                     : ATT-TT-TT-T--GT-CATA-ACAG-TTGAGACA--G-G-A--T--A-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGGGGTC--A-G---CAG------GGG--CA-C-A-A-A---AA-G-G---G------------T--TA-AA--ACGG--TGATT-A---T-TAAAA-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103584                     : ATT-GT-TT-T--GT-AATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATC-A--ATA-AGGTGTC--A-G---CAA------GGG--CC-G-A-A-A---AAGA-G---G------------T--TA-AA--CTCG--TGA-A-T---T-T---T-A-----A-ACAAA--TCTT
gi|103626                     : ACT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAT-TTGAGACT--G-G-G--T--C-T--TTT--A--AA--G-G---A-TAT-T------A-------A--A----TACC-C--TTA-AGGCACC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-C---AG-G-G---G------------A--TG-AA--AGTA--TTA-A-A---T-T---T-------A-A-GAA--TCTT
gi|103614                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-GCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--G--AA--G-G---G-AAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AAGGACCAGA-G---CAG------GAA--CA-A-A-A-A---AA-A-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-A-----A-A-AAA--TCCT
gi|103613                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAA-TTGCGACT--G-G-G--T--T-T--TAT--A--AA--G-G---A-AAT-T------T-------G--A----TATC-C--ATA-AGGGACC--A-G---CA-------GGG--CC-C-A-A-A---TA-T-G---G------------A--TA-AA--ATTG--GGA-A-T---G-T---T-C-------A-ATA--TCTT
gi|103608                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C------------------------T-T------T-------A--A----TATC-T--ATA-AGGGGTC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-A---G------------G--TT-AA--ATTG--T-A-A-A---T-T---T-A-----A-A-AAA--
gi|103595                     : ATT-GT-TT-A--GT-CACA-ATGG-TTGAGACT--T-A-A--C--T-C--TTC--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATT-C--ATA-ATGGGCC--A-G---CAC------GGT--C--C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AT--ATTG--TGA-T-A---T-T---T-T-----A-A-AAA--CCTT
gi|103574                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATT-ACAG-TTGAGACT--G-A-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-AAT-T------T-------A--A----TA---C--ATGTAAGGGTC--A-G---CAG------GGT--CC-T-T-A-A---AA-G-G---A------------A--TA-AA--ATTA--TGA-A-T---T-T---C-T-----A-A-AAA--TATT
gi|103572                     : ATT-GC-TT-A--GT-CATA-ACAG-TCAAGACT--G-G-G--A--A-C--TT---A--AA--G-GGGGA-GGT-GGGAGGGT-------A--A----AATC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------AGG--TC-C-A-A-A---AA-G-G---C------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103617                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAA-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTC--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATT-C--ATA-AGGGGCC--C-A---CAA------GGG--CT-C-T-A-A---AA-G-G---G------------
gi|103582                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-ACAA-TTTAGACA--A-G-G--T--C-C--TTT--A--AT--G-G---A-GAA-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGG--CC-A-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTC--TAA-A-A---T-G---T-C-----A-A-AAT--TCTT
gi|103615                     : ACT-GT-TC-A--AT-CATA-ACAG-TTTTCACT--G-A-G--T--T-C---TT--A--AA--G-G---AGGAT-T------T-------G--A----TATC-C--ATA-AGGGACC--A-G---CA-------GGA--CT-C-A-A-A---AA-A-G---G------------A--TA-AA--AATA--TGA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAA--
gi|103579                     : ATT-GC-TT-A--AA-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---T-GAT-T------T-------G--A----TATA-TAAATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGG---T-C-C-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-------------A-A-A---T-T---T-T-----A-A-AAA--TCTT
gi|103592                     : ATT-TT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGTGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--T--AA--A-G---G-GAT-C------T-------T--A----TATT-C--ATA-AGGGATC--A-G---GAG------TGG--CC-C-A-A-A---AA-G-A---G------------G--TT-AA--ATTG--TGA-A-T---T-T---T-CA----A-A-AAA--TCTT
gi|103622                     : ATT-GT-TT-ATAGT-AAAA-ACAG-TTGAGACT--A-G-G--T--C-A--TT---A--AA--G-G-------T-TCCA---T-------A--A----TATC-C--ATA-ACAGGCC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-T---A------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-A---T-C-----A-T-AAA--TCTT
gi|103630                     : ATT-GT-TT-G--GT-CATA-ACAG-TGGATATT--C-T-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-T---G-GAT-T------T-------A--A----TATT-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--CC-T-A-A-A---AA-G-A---G------------G--T--AG--CTTA--TAA-A-A---T-T---T-C-----A-A-GAA--T
gi|103586                     : ATT-GT-TC-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G------T--T-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AAGGGTC--A-G---CAG------GGA--CC-C-A-A-A---AA-G-A---G------------C--TG-AA--
gi|103636                     : ATT-GT-GT-G--GC-CAC-------TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--TTTAT--G-G---A---T-T------T-------A--A----TATT-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--CT-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---T-T---C-T-----A-A-AAA--TGTT
gi|103568                     : ATT-GT-TT-A--GT-CTTT-GCAG-TTTGGACT--G-G-A-------C--TTT--A--AA--G-G---G-AAT-T------T-------A--A----TACA-C--GTG-AGGG-TC--A-G---CAG------GGG--TC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---T-T---C-T-----A-A-AAA--TCT
gi|103627                     : ACT-GT-TT-A--TC-CATA-AGAG-TTGAGACT--T-T-G--T--C-A--TTT--A--AA--G-A---G-GTT-T------T-------A--A----TATC-T--ATA-AAGAGCC--A-G---CAG------TGG--CC-C-A-A-A---AA-G-A---G------------A--TA-TA--ATTT--T---A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103633                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-GCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-AAT-T------TGA-----A--A----TAA-----ATA-AAGGACCAGA-G---CAG------GAA--CA-A-A-A-A---AA-A-A---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-------A-A-AAA--T
gi|103623                     : ATC-GT-TC-A--GT-CATA-ATAG-TCGAAGCT--G-G-G--T--C-C--TTC--A--AA--A-G---T-GAC-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGAGCCT--A-C---TA-------GGG--CTGC-A-A-A---AA-AGG---G------------A--TA-AA--ACTG--TGA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AA
gi|103606                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-ACAG-TGGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTT--A------------A-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GG----C-C-A-A-A---AA-A-A---A------------A--TA-AA--AATT--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TATT
gi|103635                     : ATT-GT-TT-G--GC-CATA-ACAC-TTGAGACA--G-G-G--T--C-T--TTTTTA--AT--G-G---A-A---T------T-------A--A----TATT-C--ATA-AGGGGTC--A-G---CAG------GGG--CT-C-A-G-A---AA-G-G---T------------A--AA-AT--ATTG--TG--A-A---T-T---C-T-----A-A-AAA--TGTT
gi|103589                     : ATT-AT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAAACT--T-T-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------T--A----TATC-C--ACA-AGAGGTC--A-G---CAG------GGG--TT-C-ATA-A---AG-A-G---G------------T--TA-AA--
gi|103604                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ATAG-CTGA-ACA--C-A-A--T--T-C--TTT--A--AA--G-T---G-TAA-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AAGGGCT--A-G---CAG------GGA--CT-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATGG--TGC-A-T---A-G---T-C-----A-A-AAA--TCTTt
gi|103624                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-AAAA-TTGTGACT--G-G-A--A--A-T--TTA--A--AA--G-G---G-GAT-T------A-------A--A----ACTC-C--ATA-AGGGGTC--A-G---CAA------GGG--TT-C---A-A---AA-G-G---G------------A--TA-TA--ACTG--TCA-G-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCT
gi|103612                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATC-ACAG-CTGAGGTT--G-A-G--A--C-T--TAT--A--AA--A-G-----TAT-T------T-------A--A----TATC-T--ATA-AAGGGCC--A-G---CAG------GGA--CC-C-A-A-C---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATGG--TGA-A-T---A-G---T-G-----A-A-AAA--TCTT
gi|103580                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-ACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-G--TTT------------------AT-T----------------------------------GGGAACC--A-G---CAG------GGG--CC-CAA-A-A---AA-A-G---G------------A--TA-AA--ATTA--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103609                     : ACT-GT-TT-A--GG-CGTA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----T-------AT-------CC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-A---G------------A--TA-AA--ATTC--TAA-A-
gi|103644                     : ATT-GT-TT-A--TT-TGGA-ACAG-TTGAGATT--G-G-G--C--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A----------C-T--AT-------CT--A-G---CAG------GGG--CT-C-A-C-A---AA-G-G---A------------A--TA-AA--ATTG--T-A-A-A---T-T---T-C-----A-A-
gi|103638                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATT-AAAG-TAGAGACT--T-G-G--T--C-C--TTT--G--AA--G-G---A-GAT-T------T-------A--A-----GGCAC--ATA-A-GGGTC--A-G---CAG------TGG--C--C-A-A-A---AT-A-----T------------A--TG-AA--AATG--TGA-A-A---T-T---C-T-----A-A-AAAATTCTT
gi|103625                     : ATT-GG-TT-G--GT-CATT-ACAT-TTTAGACT--G-G-A--T--C-A--TTC--A--AA--A-G---G-GAT-------------------A----TATC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAGCCTCCCCCT--CT-C-A-A-A---AA-A-A---G------------A--TA-AA--AGTG--TAA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103654                     : ATT-GT-TT-A--GA-CATG-ACAG-TTGAGATA--G-G-C--T--C-CTTTTT--A--AA--G-------GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AGACAAC--A-G---CAG------AGG--C--C-A-A-A---AA-A-A---G------------A--TT-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AA
gi|103583                     : ATT-GT-TA-A--GT-CATA-ACAA-AGGAGACT--T-G-G--T--C-T--TTT--A--AA--G-G---A-AAT-T------T-------T--A----TAAA-C--ATA-A-GGGTC--A-G---TAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-T---T------------A--TA-AT--AATG--GAA-A-A---T-T---T-CT----A-A-AAA--TC
gi|103611                     : ATT-GT-TA-A--GT-CGTA-ACAG-T-------------------C-C--TTT--A--AG--G-G-----GAT-T------T-------A--G----TATC-C--ATA-AGGGGTC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-C---G------------G--TT-AA--ATTG--TGA-G-T---T-T---T-C-----A-A-AAA--
gi|103566                     : ATT-GT-TT-A--GT-TATT-ACAG-TTGAGACT------------------TT--A--AA--A-A---G-GGT-T------T-------A--A----TA---C--ATGTAAGAGTC--A-G---CAG------AGG--TC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---T-T---C-T-----A-A-AAA--TCTT
gi|103603                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATT-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--G-A---TT--A--AA--G-G---G-AAT-T------T-------A--A----TA---C--ATGTAAAATTC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-G---A------------T--TA-AA--AATG--T-A-A-A---T-T---T-CT----A-A-AAA--GCTT
gi|103621                     : ATT-AA-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-TAT-T------T-------A--A----TATC-G--ATG-A-----------------------GGG--CC-C-C-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-CA--GTTG--TGA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AA
gi|103605                     : ATT-GT-TT-A--GT-CGTA-ACAA-CTGAGGCA--G-G-T--T--T-C--TTT--A--AA--G-G---A-TAA-T------T-------A--A----TATC-C--ATG-AAAGGTC--A-A---AAG------GGA--CT-C-A-A-A---AC-G-C---G------------G--TA-AT--ATTG--TGA-A-T---T-T---T-T-----A-A-AAA--
gi|103634                     : ATT-GT-TT-A--GT-AATA-ACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AC--A-G---T-GATCT------T-------ATGA----TCTC-C--ATA-AAGTTTC--A-G---CAG------GGG--TC-T-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TG-GA--ATTG--TGG-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAG--T
gi|103657                     : ATT-AT-TT-A--GT-CATA-GCTG-TTGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-TAG-T------A-------A--A----TACA-C--ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGG--C--C-A-A-A---AT-A-G---G------------A--TA-
gi|103637                     : ACT-GT-TT-A--GT-TAAA-ATAG-TTGAGAAT--G-T-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GTT-T------T-------A--A----TATC-A--GTA-AAGGGTC--A-G---CAG------GG----T-C-C-A-A---AA-A-G---G------------A--AA-GC--ATTG--TGC-A-------T---T-CTAATAA-A-AAA--TCTT
gi|103610                     : ATTAGT-TT-A--AT-TATA-ACAG-TTTTGACT--G-G-G--T--C-C--CTT--A--AA--G-G---T-GAT-T------T-------A--A----TATT-C--GTA-AGTGTCT--A-T---CAT------GCG--TC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--GA-AA--ATTC--TGA-ATA---T-T---T-------G-A-AAA--TCTT
gi|103594                     : ATT--T-TT-A--GT-CATA-ACGG-TGGAGAAT--A-G-A--T--C-C--TTT--C--AA--G-G---G-GAT-T------T-------T--A----TACA-C--ATA-A-TGGTC--A-G---TAGT-----GGG--CG-C-A-ATA---AA-G-G---G------------A--TG-AC--ATTG--TGA-A-T---T-T---C-T-----A-A-AAA--TCTT
gi|103567                     : ATT-TT-TT-A--GT-C-TGTACAG-TGGAGACT--G-G-G--G--C-A--TTT--A--AA--G-G---A-GAT-T------T-------A--A----TACA-C--ATA-AGAGTCT----G---TAG------GGG--TC-C-A-A-C---AA-G-G---G------------A--TA-AAT-ATT---CGA-A-T---T-T---C-T-----A-A-AAA--TCTT
gi|103631                     : ATT-GT-TT-G--GT-CATA-ACAG-TTGATATT--G-G----T--C-A--TTT--A--AA--A-G---C-GAT-T------T-------A--A----TATA-C--ATA-AGGGCCC--A-G---CAG------GCG--C--C-A-T-A---AA-A-GA--G------------A--TA-AA--A------AA-A-ATCTT-C---T-C-----A-A-AAA--
gi|103639                     : ATT-GT-TT-A--GT-AATA-ACAG-TTGGAACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AC--A-G---T-GATCT------T-------ATGA----TCTC-T--ATA-AAGTTTA--A-G---CAG------GGG--TC-T-A-A-A---AA-G-G---A------------A--TA-GA--ATTG--TGG-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAG--T
gi|103646                     : ATT-GT-TT-A--AT-CGCA-ACAG-TTAAGACT--G-G----T--C-C--TTC--A--AA--T-G---T-GAT-T------T-------T--A----TATC-T--ATA-AAGTGTT--A-A---TAG------GGG--CT-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--A
gi|103652                     : ATT-GT-TT-A--GT-CA-A-ACAG-ATACGACT--T-G-T--T--C-T--GTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGAGGTC--A-GAACTAGT-----GGC--CT-C-A-G-T---AG-A-----G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-C---T-A-----A-A-AAA--
gi|103597                     : ATT-GC-TT-A--AA-CACA-ACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AAGCACT--G-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-A-G---A------------A--AACAA--ATT
gi|103593                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATA-ATAG-TTGTGAC---A-G-G--T--C-C--TTT--A--AG--G-G-----GAT-T------T-------G--A----TATA-A--ATA-AAGGACC--A-G---CAG------GGG--CT-C-A-A-A---AA-A-----G------------A--TA-
gi|103620                     : ATT-GT-GA-A--GT-CATT-ACAG-TTGAGACA--GTG-G--T--T-G--ATT--A--AA--G-G---G-AAT-T------T-------A--A----TA---C--ATGTAAGGGAC--A-G---CAG------GGA--CC-C-A-A-A---AA-A-AAGAG------------A--TA-AA--ATTG--TGG-A-T---T-T---C-T-----A-A-CAA--TCTT
gi|103650                     : ATT-GT-TT-A--GT-AATA-ACAG-TTGGAACT--G-C-G--T--C-C--TTT--A--AC--A-G---T-GATCT------T-------ATGA----TCTC-C--ATA-AAGTTTC--A-G---CAG------GGG--TC-T-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TG-GA--ATTG--TG--G-A---T-T---T-T-----A-A-A
gi|103607                     : ATT-GT-TA-A--GT-CATA-GCAG-TTGAGCCC--A-G-A--AA-C-C--TTT--A--AA--G-G---G-TAT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-A--------A-G---CAG------GGG--CA-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATGG--TGA-A-T---A-G---T-C-----A-A-ACA--TATT
gi|103596                     : ACT-GT-TC-A--AC-CATA-ACAG-CTGAGTCT--G-A-GACTAGC-T--TTT--A--AA--G-G---G-ATT-T------T-------A--A----TGTC-C--ATA-AAGGGCC--A-G---CAG------GGA--CC-C-A-A-A---AA-G-A---A------------A--TA-AC--ATGG--T-A-A-A---TAG---T-A-----A-A-AAA--TCTT
gi|103628                     : ATT-GT-TT-A--GT-AATA-ACAG-TTAGAACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AC--A-G---T-GATCT------T-------ATGA----TCTT-C--ATA-AAGTTTA--A-G---CAG------GGG--TC-T-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TG-GA--ATTG--TGG-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAG--T
gi|103648                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-ACAG-TTCATAAA--G-A-G--T--C-T--TTT--A--AA--ATG---G-GAT-T------T-------G--A----TATC-C--ATA-AGGGGTC--A------------------------A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-CA--ATTG--TG--A-A---T-T---T-C-----C-A-TAA--TCTT
gi|103600                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-CCAA-TTGAGATT--A-G-T--C--T-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------T--A----TATC-T--ATA-AGAGACC--A-G---CAG------GGA--CC-C-A-A-T---AA-
gi|103641                     : ATT-GT-TT-A--GT-CATA-AAAT-TTGAGACT--T-G-A--T--T-C--TT---A--AT--T-G---G-TAT-T------T-------A--A----TATA-A--ATA-ACAGGTG--A-G---CAG------GGG--CT-C-A-A-A---TC-A-G---G------------A--TA-CT--ATTG--TGA-A-T---T-T---T-A-----A-A-AAA--TCCTg
gi|103653                     : ATT-GT-TT-A--GA-TATA-ACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--TC--A-G---T-GATCT------T-------ATGA----TCTC-C--ATA-AAGTTTC--A-G---CAG------GGG--TC-T-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TG-GA--ATTG--TGG-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAG--T
gi|103640                     : ATT-GT-TA-A--GT-CATA-ATAG-TTCAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-A---G-GAA-T------A-------A--A----TATC-A--ACA-AGGGACC--A-G---CAG------GGG---T-A-G-A-AGAGAA-G-G---G------------AT-TA-AT--GTTG--T
gi|103601                     : ATT-GT-AT-A--AC-CAGT-ACAG-TGTCGGCT--G-G-A--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TTCA-C--ATA-A-GAGTC--A-G---CAG------GGG--TC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--A
gi|103649                     : ATT-GT-TT-A--GT-AATT-ACAG-TAGAGATT--T-G-G--A--C-C--TTT--A--AA--A-G---A-GAT-T------T-------G--A----TACA-C--ATA-A-TGGTC--A-A---TAA------GAG--CC-C-T-G-A---AA-G-G---A------------A--TA-AA--G-TG--TG--A-A---T-T---T-C-----T-A-AAA--
gi|103655                     : ATT-GT-TT-A--GT-AATA-ACAGCTTGA-ACT--G-T-G--T--T-C--TTT--A--AC--A-G---T-GATCT------T-------ATGA----TCTC-C--ATA-AAGTTTC--A-G---CAG------GGG--TC-T-A-A-A---AA-G-G---A------------A--TG-GA--ATTG--TGG-A-T---A-T---T-C-----A-A-AAG--T
gi|103590                     : ATT-GC-TT-A--GA-CATT-GCAG-TTCATATA--A-G-G--T--C-C--TTT--G--AA--T-G---G-GAT-T------T-------GGCA----TAA-----ATA-AGGGACC--A-G---CAG------GGGC-CC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TC-AA--ATTG--T
gi|103642                     : ATT-AT-TT-T--AT-CATA-ACAG-TTGGAACT--G-G-A--T--G-C--TTT--A--AA--G-T---G-GAT-T------A-------A--A----TATT-C--AT--AGGGGTA--A-G---CAG------TGG--CA-G-A-A-A---AA-G-G---A------------A--TA-GT--AATG--T---A-A---T-T---TGT-----A-A-ATA--TC
gi|103658                     : ATT-GT-TG-A--GT-CATA-ACAA-TTGAGACT--G-T-G--T--T-C---TT--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--ATG--TATT-C--ATA-AG----C--ACG---CA------------CC-C-A-T-A---AA-A-GA--G------------A--TC-AA--A-----TGA-A-T---T-T---C-C-----A-A-AAA--TATT
gi|103699                     :  TT-GT-TTTA--AT-CATA-ACAG-TTGAGA-T--G-GTG--T--C-C--TT---A--AT--G-GTG-G-GGT-T------T-------A--A----TATC-C--ATA-AGGTGCC--A-G---TAG------GGG--CC-C-A-A-A---AT-C-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-C-T---C-T---T-C-----A-A-ATA--TCTT
gi|103703                     :  TT-GT-TC-A--GT-CATA-ACGG-TTAGGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-TAT-T------T-------G--A----TATT-C--ACA-AGTTGGC--A-G---CAG------GGG--C--C-A-ATA---AA-A-G---A------------T--TG-AA--ATTATTTGA-A-A-----T---T-G-----A-G-AAA--TTTT
gi|103700                     :  TT-GT-TA-A--GT-CAAA-ACAG-GTGAGACT--T-G-A--A--T-A--TTT--A--AA--G-G---G-AAT-T------T-------A--A----TATT-C--ATA-AGA---C----G---CAG------GGG--CT-C-A-A-A---AA-G-G---G------------T--TA-AA--TTTG--TGA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAT--TCCT
gi|103702                     :  TT-GT-TT-A--TT-CATA-ACAA-TTAGGACT--G-C-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-G---G-TAT-T------T-------G--A----TATT-C--ACA-AGTTGTC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-T-A---AA-A-G---A------------T--TG-AA--ATTAT-TTA-A-A---A-T---T-G-----A-G-AAA--TTTT
gi|103698                     :  TT-GT-TT-A--GT-CATT-ACAG-TTGAGACT--G-G-A--T--G-A--TTC--A--AG--G-G---A--AT-T------T-------G--A----TATA-T--GTA-A-AGGTC--A-G---CAT------GGG--TC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--AG-AA--ATTG--T-A-A-A---T-T---T-------A-A-AAC--TCTT
gi|103704                     :  TT-GT-TT-T--GG-CATA-ACAG-TTAAGACC--G------T--C-C--TTC--A--AA--T-G---T-GAT-T------T-------T--A----TATC-T--ATA-AAAGGTT--A-G---CAG------GG---CT-C-A-A-A---AA-G-G---A------------A--TA-AC--ATTG--TTG-A-T---T-T---T-C-----G-A-AAA--
gi|103710                     :   T-GTATT-A--GT-CATA-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TCT--A--AA--G-G---G-GAT-A------T-------A--A----TATC-C--ATA-ATATGTC--A-G---CA-------GGA--TT-C-T-A-A---AA-A-GA--G------------G--TC-AA--ATTG--TAA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAA--
gi|103712                     :   T-GT-TT-A--GT-CAAA-ACAG-TTGAGATTCAA-G-G--C--CAC--TTT--A--AA--G-G---T-GAT-T------G-------A--A----TACC-C--ATA-AGGGGCT--A-G---CAG------GGG--TC-C-G-A-A---AA-A-GT--G------------A--TA-AAGCACTG--TGA-A-T---T-C---T-A-----A-A-ACA--TTTT
gi|103717                     :   T-GT-TA-C--GT-CAAA-ATAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTT--A--AA--G-A---G-GAT-T------T-------A--A----TACC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--T--------A---AA-A-G---G------------AGTTA-AT--GTTG--T
gi|103713                     :   T-GT-TT-C--AT-CATA-ATAG-TTGAGATG--G-A-G--T--C-A--TTC--A--AA--A-G---A-TAT-T------T-------A--A----TATC-C--A-A-AGAAGCC--A-G---CAG------GGG--CC-C---G-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--GTTG--TG--A-A---T-T---T-C-----G-A-AAA--
gi|103716                     :   T-AT-TT-A--GA-CATT-ACAG-TTGTGACT--G-A-G--T--C-A--TTA--A--AA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATT-G--ATA-AGAGGCC--A-G---CAG------AAG--CT-C-A-A-A---AA-G-G---GATTTATAAGATCA--TA-AG--ATTG--TGA-A-C---T-T---T-C-----ACA-AAA--TTT
gi|103724                     :      T-TT-A--GT-CATA-AGAA-TTGAAACT--G-G-G--A--C-C--TTT--A--AA----A---A-GAT-T------T-------A--G----TATT-C--ATT-AAGGGTC--A-G---CTA------TGC--TC-C-A-A-A---AA-A-G---GGA----------A--TG-AA--ATAG--TAA-A-T---T-T---C-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103727                     :       -TT-A--GT-CATA-ACAG-TTTAAACT--G-G-A--T--T-T--TTT--T--AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATC-C--ATA-AGGTGTC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-T-G---G------------A--TA-AA--ATTT--TGA-A-A---T-T---T-T-----A-A-AAG--TATT
gi|103728                     :       -TC-A--GT-CATT-ACAG-ATGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGT--A--AC--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TATG-C--ATG-AGGGGCT--G-A---CAT------GTA--CC-T-A-A-A---AC-G-G---A------------A--TA-TA--ATTG--T-A-A-A---C-T---A-C-----A-A-ACA--TC
gi|103731                     :         T-A--GT-CATA-ACAG-TTGGGACA--G-G-G--T--C-A--TTT--A--TA--G-G---G-GAT-T------T-------A--A----TACC-C--ATA-AGGGGCC--A-G---CAG------GGG--CC-T-A-A-A---AA-G-G---T------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-T---G-T---T-C-----A-A-AA
gi|103738                     :                  ATA-ACAG-TTGAGACT--T-G-G--T--T-C--TTT--AG-AA--G-G---G-GAT-T------T-------G--A----TATC-C--ATA-AGGAGGC--A-G---CAG------GAG--CC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-A-----A-A-AAA--TCTTtttt
gi|103741                     :                    A-ACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--A-C--TTT--A--AA--A-GT--A-GAT-T------T-------T--A----TATC-C--ATA-GATAG-C--A-G---CAG------AGG---T-C-A-A-A---AA-AGG---G------------A--TA-AA--ATTT--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TCTT
gi|103747                     :                                          --T--C-C--TTT--A--AA--G-G---A-GAT-T------T-------A--A----TATC-C--TTA--GAGACC--A-G---CAG------AGA--CC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TG-AA--ATAG--TAA-A-T---T-T---T-C-----A-A-AAG--TCT
gi|103750                     :                                                     TT--A--AA--G-T---G-GAT-T------T-------G--A----TATA-A--GTA-AGGGACC--A-G---CAG------GGG--CC-C-A-A-A---AA-G-G---G------------A--TA-AA--ATTG--TGA-A-A---T-T---T-C-----A-A-AAA--TC





Alignments
lowQualScore                  :    0  0  0 00  0 0       0        00 0 0 00 11 0 00    0   0 11    2 2222222 1111111 33 00   11 00  0000 1 0     11 0 000 0  0   00 00  111111 11 0   000 0 00 222222222222 1111111  0  11    00  0  3333  111 1111 0 0 0   00    
lowQualScore                  :    .  .  . ..  . .       .        .. . . .. .. . ..    .   . ..    . ....... ....... .. ..   .. ..  .... . .     .. . ... .  .   .. ..  ...... .. .   ... . .. ............ .......  .  ..    ..  .  ....  ... .... . . .   ..    
lowQualScore                  :    4  4  4 66  4 4       4        66 4 4 66 00 4 66    4   4 00    8 0000000 3333333 33 55   77 55  8888 2 2     11 4 777 4  4   99 55  999999 33 4   777 4 66 555555555555 7777777  4  00    66  5  5555  444 0000 9 5 5   77    
consensus                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
Reference ( family-177 )      : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---NTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103564                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TAGC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---A-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103565                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTAA-AGG-A--AGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--ATCTATA-AGGGGTT--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-A--G------------A-------TA-AA--ATTG--TA-AA---TTT---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103566                     : ATT-GT-TT-A--GT-T-ATTACAG-TTGAGACT------------------TTA-AAA-A--GGGT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGAGTC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103567                     : ATT-TT-TT-A--GT-CTGTA-CAG-TGGAGACT--G-G-G--G--C-A--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TACA-C--AT----A-AGAGTCT----G---T-AG-GGG--T--CC------A--A-CAA---G-G--G------------A-------TA-AAT-ATT---CG-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103568                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-TTTGCAG-TTTGGACT--G-G-A-------C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-C--GT----G-AGGG-TC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--TCT
gi|103569                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATCG--TG-A-----TTAG-T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103570                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGACC--CC------A--A-AA---------G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA----TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103571                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAG-CTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------C--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-CC--ATTG--TA-AA---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103572                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAACAG-TCAAGACT--G-G-G--A--A-C--TTAA-AGG-G--GGAGGTGGGAGGGT-------A--A--AATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--C------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103574                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-A-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGGGTC--A-G---C-AG-GGT--C--CT------T--A-AAA---G-G--A------------A-------TA-AA--ATTA--TG-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--TATT
gi|103575                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TGGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAA-G--GGAT-T---------------A--A--TATA-A--AT----A-AGGGGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAC---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTT---T----C-
gi|103576                     : ATT-GT-TT-T--AT-C-ATAGCAG-TTAAGACT--G-G-G--T--C-C--TGTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------C--A-AAA---G-T--G------------A-------TA-AA--GTTG--TG-AA---TAT---T----C-A-A-TAA--TCTT
gi|103577                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------T--A-AAA---A-A--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103578                     : ATT-TT-TT-T--GT-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-A--T--A-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-G--G------------T-------TA-AA--ACGG--TG-AT---TAT---TAAAAC-A-A-AAA--TCTT
gi|103579                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------G--A--TATA-TAAAT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--CC---------A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--A--------------TT---T----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103580                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-G--TTT-----------AT-T-------------------------------------GGGAACC--A-G---C-AG-GGG--C--CCA-----A--A-AAA---A-G--G------------A-------TA-AA--ATTA--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103581                     : ATT-GT-GA-A--ATAC-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-A--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGTCC--A-G---C-AG-TGG--C--CG------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TGAAA---TTT---T----T-A-A-AAA--TTT
gi|103582                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTTAGACA--A-G-G--T--C-C--TTTA-ATG-G--AGAA-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTC--TA-AA---ATG---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103583                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAA-AGGAGACT--T-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--AAAT-T-------T-------T--A--TAAA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-T--T------------A-------TA-AT--AATG--GA-AA---ATT---T----CTA-A-AAA--TC
gi|103584                     : ATT-GT-TT-T--GT-A-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-A--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AA-GGG--C--CG------A--A-AAA---GAG--G------------T-------TA-AA--CTCG--TG-AA---TTT---T----A-A-ACAAA--TCTT
gi|103585                     : ATT-GC-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGC--C--CC------A--A-AAA-----A--G------------A-------TA-AA--ATTA--TG-AA---ATT---T----C-G-A-AAT--TCTT
gi|103586                     : ATT-GT-TC-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G------T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGTC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-A--G------------C-------TG-AA--
gi|103588                     : ATT-GC-TT-G--GT-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---T-A--GGG--C--CC------A--A-AAA-----A--G------------A-------TA-AC--ATTG--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103589                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAAACT--T-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AC----A-AGAGGTC--A-G---C-AG-GGG--T--TC------A--T-AAA---G-A--G------------G-------TT-AA--AT
gi|103590                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATTGCAG-TTCATATA--A-G-G--T--C-C--TTTG-AAT-G--GGAT-T-------T-------G--G--CATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGC-C--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TC-AA--ATTG--T
gi|103591                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAT-T--GG-T-T-------TGTATACCA--G--TACT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--TA------A--A-TAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTG---T----C-A-A-AAA--
gi|103592                     : ATT-TT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGTGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-AAA-G--GGAT-C-------T-------T--A--TATT-C--AT----A-AGGGATC--A-G---G-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-A--G------------G-------TT-AA--ATTG--TG-AA---TTT---T----CAA-A-AAA--TCTT
gi|103593                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAATAG-TTGTGAC---A-G-G--T--C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA-----A--G------------A-------TA-
gi|103594                     : ATT--T-TT-A--GT-C-ATAACGG-TGGAGAAT--A-G-A--T--C-C--TTTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-G---T-AGTGGG--C--GC------A--ATAAA---G-G--G------------A-------TG-AC--ATTG--TG-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103595                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ACAATGG-TTGAGACT--T-A-A--C--T-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-A--CGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AT--ATTG--TG-AT---ATT---T----T-A-A-AAA--CCTT
gi|103596                     : ACT-GT-TC-A--AC-C-ATAACAG-CTGAGTCT--G-A-GACTAGC-T--TTTA-AAG-G--GATT-T-------T-------A--A--TGTC-C--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-A--A------------A-------TA-AC--ATGG--TA-AA---TAG---T----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103597                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ACAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGCACT--G-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---A-G--A------------A-------AACAA--ATT
gi|103599                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ACAACAG-TTCAGACC--A-G-G--G--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCC--A-A---C-AG-GGG--T--TT------A--A-AAA---G-A--G------------A-------TA-TC--ATTG--CG-AA---TTT---C----G-A-A-AAG--TCTT
gi|103600                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATACCAA-TTGAGATT--A-G-T--C--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AGAGACC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-TAA---G-
gi|103601                     : ATT-GT-AT-A--AC-C-AGTACAG-TGTCGGCT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--T-TCAC--AT----A-A-GAGTC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--A
gi|103603                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--G-A--TT-A-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAAATTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-G--A------------T-------TA-AA--AATG--TA-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--GCTT
gi|103604                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAATAG-CTGA-ACA--C-A-A--T--T-C--TTTA-AAG-T--GTAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCT--A-G---C-AG-GGA--C--TC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATGG--TG-CA---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103605                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-GTAACAA-CTGAGGCA--G-G-T--T--T-C--TTTA-AAG-G--ATAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----G-AAAGGTC--A-A---A-AG-GGA--C--TC------A--A-AAC---G-C--G------------G-------TA-AT--ATTG--TG-AA---TTT---T----T-A-A-AAA--
gi|103606                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TGGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-A-------GAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GG------CC------A--A-AAA---A-A--A------------A-------TA-AA--AATT--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAA--TATT
gi|103607                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGCCC--A-G-A--AA-C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-A--------A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATGG--TG-AA---TAG---T----C-A-A-ACA--TATT
gi|103608                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-A---------------------------------TATC-T--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-A--G------------G-------TT-AA--ATTG--T--AA---ATT---T----A-A-A-AAA--
gi|103609                     : ACT-GT-TT-A--GG-C-GTAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TAT------------------CC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-A--G------------A-------TA-AA--ATTC--TA-AA---
gi|103610                     : ATTAGT-TT-A--AT-T-ATAACAG-TTTTGACT--G-G-G--T--C-C--CTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--GT----A-AGTGTCT--A-T---C-AT-GCG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------GA-AA--ATTC--TG-AA---TAT---T----T-G-A-AAA--TCTT
gi|103611                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-GTAACAG-T-------------------C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------A--G--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-C--G------------G-------TT-AA--ATTG--TG-AG---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103612                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATCACAG-CTGAGGTT--G-A-G--A--C-T--TATA-AAA-G--T-AT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-CAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATGG--TG-AA---TAG---T----G-A-A-AAA--TCTT
gi|103613                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGCGACT--G-G-G--T--T-T--TATA-AAG-G--AAAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGG--C--CC------A--A-ATA---T-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--GG-AA---TGT---T----C---A-ATA--TCTT
gi|103614                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103615                     : ACT-GT-TC-A--AT-C-ATAACAG-TTTTCACT--G-A-G--T--T-C--TTAA-AGG-A--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGA--C--TC------A--A-AAA---A-G--G------------A-------TA-AA--AATA--TG-AA---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103617                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--C-A---C-AA-GGG--C--TC------T--A-AAA---G-G--G------------
gi|103620                     : ATT-GT-GA-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACA--GTG-G--T--T-G--ATTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-T--GT----A-AGGGAC---A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAAAAAG-A--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-GA---TTT---C----T-A-A-CAA--TCTT
gi|103621                     : ATT-AA-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-G--AT----G-A-------------------GGG--C--CC------C--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-CA--GTTG--TG-AA---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103622                     : ATT-GT-TT-ATAGT-A-AAAACAG-TTGAGACT--A-G-G--T--C-A--TT-A-AAG-G-----T-TCCA----T-------A--A--TATC-C--AT----A-ACAGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-T--A------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATA---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103623                     : ATC-GT-TC-A--GT-C-ATAATAG-TCGAAGCT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAA-G--TGAC-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGCCT--A-C---T-A--GGG--CTGCA------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ACTG--TG-AA---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103624                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAA-TTGTGACT--G-G-A--A--A-T--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------A-------A--A--ACTC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AA-GGG--T--TC---------A-AAA---G-G--G------------A-------TA-TA--ACTG--TC-AG---ATT---T----C-A-A-AAA--TCT
gi|103625                     : ATT-GG-TT-G--GT-C-ATTACAT-TTTAGACT--G-G-A--T--C-A--TTCA-AAA-G--GGAT--------------------A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-CCT--C--CCCCTCTCA--A-AAA---A-A--G------------A-------TA-AA--AGTG--TA-AA---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103626                     : ACT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAT-TTGAGACT--G-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--ATAT-T-------A-------A--A--TACC-C--TT----A-AGGCACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-CAG---G-G--G------------A-------TG-AA--AGTA--TT-AA---ATT---T------A-A-GAA--TCTT
gi|103627                     : ACT-GT-TT-A--TC-C-ATAAGAG-TTGAGACT--T-T-G--T--C-A--TTTA-AAG-A--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGAGCC--A-G---C-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-A--G------------A-------TA-TA--ATTT--T---A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103628                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTAGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTT-C--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TG-GA--ATTG--TG-GA---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103630                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TGGATATT--C-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-A--G------------G-------T--AG--CTTA--TA-AA---ATT---T----C-A-A-GAA--T
gi|103631                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TTGATATT--G-G----T--C-A--TTTA-AAA-G--CGAT-T-------T-------A--A--TATA-C--AT----A-AGGGCCC--A-G---C-AG-GCG--C--CA------T--A-AAA---G-A--G------------A-------TA-AA--A------A-AAATCTTC---T----C-A-A-AAA--
gi|103633                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--AATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-A--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T------A-A-AAA--T
gi|103634                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TG-GA--ATTG--TG-GA---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103635                     : ATT-GT-TT-G--GC-C-ATAACAC-TTGAGACA--G-G-G--T--C-T--TTTT-TAA-T--GGAA-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--G-AAA---G-G--T------------A-------AA-AT--ATTG--TG-AA---TTC---T------A-A-AAA--TGTT
gi|103636                     : ATT-GT-GT-G--GC-C-AC------TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-TTA-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TTT---C----T-A-A-AAA--TGTT
gi|103637                     : ACT-GT-TT-A--GT-T-AAAATAG-TTGAGAAT--G-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-A--GT----A-AAGGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--A------------A--------A-GC--ATTG--TG-CA---TTCTAAT----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103638                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTAAAG-TAGAGACT--T-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--GGCA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---C-AG-TGG--C--C----------A-AAA---T-A--T------------A-------TG-AA--AATG--TG-AA---ATT---C----T-A-A-AAAATTCTT
gi|103639                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-T--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-G--A------------A-------TA-GA--ATTG--TG-GA---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103640                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAATAG-TTCAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAA-T-------A-------A--A--TATC-A--AC----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--AG------AAGA-GAA---G-G--G------------AT------TA-AT--GTTG--T
gi|103641                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAT-TTGAGACT--T-G-A--T--T-C--TT-A-ATT-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATA-A--AT----A-ACAGGTG--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-ATC---A-G--G------------A-------TA-CT--ATTG--TG-AA---TTT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103642                     : ATT-AT-TT-T--AT-C-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-A--T--G-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------A-------A--A--TATT-C--AT------AGGGGTA--A-G---C-AG-TGG--C--AG------A--A-AAA---G-G--A------------A-------TA-GT--AATG--T--AA---TTT---G----T-A-A-ATA--TC
gi|103644                     : ATT-GT-TT-A--TT-T-GGAACAG-TTGAGATT--G-G-G--C--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--C--TAT------------------CT--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--C-AAA---G-G--A------------A-------TA-AA--ATTG--T--AA---ATT---T----C-A-A-
gi|103646                     : ATT-GT-TT-A--AT-C-GCAACAG-TTAAGACT--G-G----T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAGTGTT--A-A---T-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--A
gi|103648                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTCATAAA--G-A-G--T--C-T--TTTA-AAATG--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A--------------------------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-CA--ATTG--TG-AA----TT---T----C-C-A-TAA--TCTT
gi|103649                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATTACAG-TAGAGATT--T-G-G--A--C-C--TTTA-AAA-G--AGAT-T-------T-------G--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-A---T-AA-GAG--C--CC------T--G-AAA---G-G--A------------A-------TA-AA--G-TG--TG-AA---TTT---C----T-A-A-AA
gi|103650                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TG-GA--ATTG--TG-GA---TTT---T----A-A-A-
gi|103652                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-A-AACAG-ATACGACT--T-G-T--T--C-T--GTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-GAACT-AG-TGG--C--CT------C--A-GTA---G-A--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATC---T----A-A-A-AAA--
gi|103653                     : ATT-GT-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-TCA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TG-GA--ATTG--TG-GA---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103654                     : ATT-GT-TT-A--GA-C-ATGACAG-TTGAGATA--G-G-C--T--C-CTTTTTA-AA-----GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGACAAC--A-G---C-AG-AGG-----CC------A--A-AAA---A-A--G------------A-------TT-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AA
gi|103655                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAGCTTGA-ACT--G-T-G--T--T-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-G--A------------A-------TG-GA--ATTG--TG-GA---TAT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103657                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAGCTG-TTGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAG-T-------A-------A--A--TACA-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG-----CC------A--A-AAT---A-G--G------------A-------TA-
gi|103658                     : ATT-GT-TG-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-T-G--T--T-C---TTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--ATGTATT-C--AT----A-AG----C--ACG---C-A-------C--CC------AT-A-AAA---G-A--G------------A-------TC-AA--A-----TG-AA---TTT---C----C-A-A-AAA--TATT
gi|103698                     :  TT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-A--T--G-A--TTC--AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-T--GT----A-A-AGGTC--A-G---C-AT-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------AG-AA--ATTG--TA-AA---TTT----------A-A-AAC--TCTT
gi|103699                     :  TT-GT-TTTA--AT-C-ATAACAG-TTGAGA-T--G-GTG--T--C-C--TT-A-ATG-GTGGGGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGTGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAT---C-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AC---TCT---T----C-A-A-ATA--TCTT
gi|103700                     :  TT-GT-TA-A--GT-C-AAAACAG-GTGAGACT--T-G-A--A--T-A--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-A--GAC-----G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-G--G------------T-------TA-AA--TTTG--TG-AA---TTT---T----C-A-A-AAT--TCCT
gi|103702                     :  TT-GT-TT-A--TT-C-ATAACAA-TTAGGACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------AT-A-AAA---G-ATTG------------AAATTATTTA-AA--ATTG--AG-AA---ATT---T----
gi|103703                     :  TT-GT-TC-A--GT-C-ATAACGG-TTAGGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGGC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--T-AAA---A-G--A------------T-------TG-AA--ATTATTTG-AA---A-T---T----G-A-G-AAA--TTTTt
gi|103704                     :  TT-GT-TT-T--GG-C-ATAACAG-TTAAGACC--G------T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAAGGTT--A-G---C-AG--GG--C--TC------A--A-AAA---G-G--A------------A-------TA-AC--ATTG--TT-GA---TTT---T----C-G-A-AAA--
gi|103710                     :   T-GTATT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TCTA-AAG-G--GGAT-A-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATATGTC--A-G---C-AG-GAT--T--CT------A--A-AAA---G-A--G------------G-------TC-AA--ATTG--TA-AA---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103712                     :   T-GT-TT-A--GT-C-AAAACAG-TTGAGATTCAA-G-G--C--CAC--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------G-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCT--A-G---C-AG-GGG--T--CCG-----A--A-AAA---G-T--G------------A-------TA-AAGCACTG--TG-AA---TTC---T----A-A-A-ACA--TTTT
gi|103713                     :   T-GT-TT-C--AT-C-ATAATAG-TTGAGATG--G-A-G--T--C-A--TTCA-AAA-G--ATAT-T-------T-------A--A--TATC-C--A-----A-AGAAGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC---------G-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--GTTG--TG-AA----TT---T----C-G-A-AAA--
gi|103716                     :   T-AT-TT-A--GA-C-ATTACAG-TTGTGACT--G-A-G--T--C-A--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-G--AT----A-AGAGGCC--A-G---C-AG-AAG--C--TC------A--A-AAA---G-G--GATTTATAAGATCA-------TA-AG--ATTG--TG-AA---CTT---T----C-ACA-AAA--TTT
gi|103717                     :   T-GT-TA-C--GT-C-AAAATAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG------T------A--A-AAG---G-A--G------------T-------TA-AT--GTTG--T
gi|103724                     :      T-TT-A--GT-C-ATAAGAA-TTGAAACT--G-G-G--A--C-C--TTTA-AA--A--AGAT-T-------T-------A--G--TATT-C--AT----T-AAGGGTC--A-G---CTAT-GCT--C--CA------A--A-AAA---G-G--GA-----------A-------TG-AA--ATAG--TA-AA---TTT---C----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103727                     :       -TT-A--GT-C-ATAACAG-TTTAAACT--G-G-A--T--T-T--TTTT-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---T-G--G------------A-------TA-AA--ATTT--TG-AA---ATT---T----T-A-A-AAG--TATT
gi|103728                     :       -TC-A--GT-C-ATTACAG-ATGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTA-ACG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATG-C--AT----G-AGGGGCT--G-A---C-AT-GTA--C--CT------A--A-AAC---G-G--A------------A-------TA-TA--ATTG--T--AA---ACT---A----C-A-A-ACA--TC
gi|103731                     :         T-A--GT-C-ATAACAG-TTGGGACA--G-G-G--T--C-A--TTTA-TAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-G--T------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---TGT---T----C-A-A-AA
gi|103738                     :                  -ATAACAG-TTGAGACT--T-G-G--T--T-C--TTTAGAAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGAGGC--A-G---C-AG-GAG--C--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T----A-A-A-AAA--TCTTtttt
gi|103741                     :                     AACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--A-C--TTTA-AAA-GT-AGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AT----A-GATAG-C--A-G---C-AG-AGG--T--CA------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTT--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103747                     :                                          --T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--TT----A--GAGACC--A-G---C-AG-AGA--C--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TG-AA--ATAG--TA-AA---TTT---T----C-A-A-AAG--TCT
gi|103750                     :                                                     TTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--GT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-G--G------------A-------TA-AA--ATTG--TG-AA---ATT---T----C-A-A-AAA--TC





Alignments
lowQualScore                  :    0  0  0 00  0 0       0        00 0 0 00 11 0 00    0   0 11    2 2222222 1111111 33 00   11 00  0000 1       11 0 000 0  0   00 00  111111 00 0   000 0  222222222222 0  0 0 11    00  0 0 1111  000 111111 0 0   00    
lowQualScore                  :    .  .  . ..  . .       .        .. . . .. .. . ..    .   . ..    . ....... ....... .. ..   .. ..  .... .       .. . ... .  .   .. ..  ...... .. .   ... .  ............ .  . . ..    ..  . . ....  ... ...... . .   ..    
lowQualScore                  :    4  4  4 66  4 4       4        66 4 4 66 00 4 66    4   4 00    8 0000000 3333333 33 55   77 55  8888 2       11 4 777 4  4   99 55  999999 99 4   777 4  555555555555 4  4 4 00    66  5 5 0000  888 555555 5 5   77    
consensus                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
Reference ( family-177 )      : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103564                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TAGC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103565                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTAA-AGG-A--AGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--ATCTATA-AGGGGTT--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103566                     : ATT-GT-TT-A--GT-T-ATTACAG-TTGAGACT------------------TTA-AAA-A--GGGT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGAGTC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103567                     : ATT-TT-TT-A--GT-CTGTA-CAG-TGGAGACT--G-G-G--G--C-A--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TACA-C--AT----A-AGAGTCT----G---T-AG-GGG--T--CC------A--A-CAA---G-GG------------A-TA-A-AT-ATT---CG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103568                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-TTTGCAG-TTTGGACT--G-G-A-------C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-C--GT----G-AGGG-TC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCT
gi|103569                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATCG--TG-A-T---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103570                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGACC--CC------A--A-AA-------G------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A----TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103571                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAG-CTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------C--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-C--ATTG--TA-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103572                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAACAG-TCAAGACT--G-G-G--A--A-C--TTAA-AGG-G--GGAGGTGGGAGGGT-------A--A--AATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-GC------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103574                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-A-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGGGTC--A-G---C-AG-GGT--C--CT------T--A-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TATT
gi|103575                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TGGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAA-G--GGAT-T---------------A--A--TATA-A--AT----A-AGGGGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAC---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-
gi|103576                     : ATT-GT-TT-T--AT-C-ATAGCAG-TTAAGACT--G-G-G--T--C-C--TGTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------C--A-AAA---G-TG------------A-TA-A-A--GTTG--TG-A-A---TAT---T----C-A-A-TAA--TCTT
gi|103577                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------T--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103578                     : ATT-TT-TT-T--GT-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-A--T--A-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-GG------------T-TA-A-A--ACGG--TG-A-T---TAT---TAAAAC-A-A-AAA--TCTT
gi|103579                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------G--A--TATA-TAAAT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--CC---------A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A---------------TT---T----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103580                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-G--TTT-----------AT-T-------------------------------------GGGAACC--A-G---C-AG-GGG--C--CCA-----A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103581                     : ATT-GT-GA-A--ATAC-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-A--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGTCC--A-G---C-AG-TGG--C--CG------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TGAA-A---TTT---T----T-A-A-AAA--TTT
gi|103582                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTTAGACA--A-G-G--T--C-C--TTTA-ATG-G--AGAA-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTC--TA-A-A---ATG---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103583                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAA-AGGAGACT--T-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--AAAT-T-------T-------T--A--TAAA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-TT------------A-TA-ATA--ATGG--AA-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TC
gi|103584                     : ATT-GT-TT-T--GT-A-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-A--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AA-GGG--C--CG------A--A-AAA---GAGG------------T-TA-A-A--CTCG--TG-A-A---TTT---T----A-A-ACAAA--TCTT
gi|103585                     : ATT-GC-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGC--C--CC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---ATT---T----C-G-A-AAT--TCTT
gi|103586                     : ATT-GT-TC-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G------T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGTC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------C-TG-A-A--
gi|103588                     : ATT-GC-TT-G--GT-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---T-A--GGG--C--CC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-A-C--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103589                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAAACT--T-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AC----A-AGAGGTC--A-G---C-AG-GGG--T--TC------A--T-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--AT
gi|103590                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATTGCAG-TTCATATA--A-G-G--T--C-C--TTTG-AAT-G--GGAT-T-------T-------G--G--CATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGC-C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TC-A-A--ATTG--T
gi|103591                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAT-T--GG-T-T-------TGTATACCA--G--TACT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--TA------A--A-TAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTG---T----C-A-A-AAA--
gi|103592                     : ATT-TT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGTGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-AAA-G--GGAT-C-------T-------T--A--TATT-C--AT----A-AGGGATC--A-G---G-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----CAA-A-AAA--TCTT
gi|103593                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAATAG-TTGTGAC---A-G-G--T--C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-
gi|103594                     : ATT--T-TT-A--GT-C-ATAACGG-TGGAGAAT--A-G-A--T--C-C--TTTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-G---T-AGTGGG--C--GC------A--ATAAA---G-GG------------A-TG-A-C--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103595                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ACAATGG-TTGAGACT--T-A-A--C--T-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-A--CGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-T--ATTG--TG-ATA---TTT---T------A-A-AAA--CCTT
gi|103596                     : ACT-GT-TC-A--AC-C-ATAACAG-CTGAGTCT--G-A-GACTAGC-T--TTTA-AAG-G--GATT-T-------T-------A--A--TGTC-C--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-AA------------A-TA-A-C--ATGG--TA-A-A---TAG---T----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103597                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ACAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGCACT--G-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---A-GA------------A-AACA-A--ATT
gi|103599                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ACAACAG-TTCAGACC--A-G-G--G--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCC--A-A---C-AG-GGG--T--TT------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-T-C--ATTG--CG-A-A---TTT---C----G-A-A-AAG--TCTT
gi|103600                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATACCAA-TTGAGATT--A-G-T--C--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AGAGACC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-TAA---G-
gi|103601                     : ATT-GT-AT-A--AC-C-AGTACAG-TGTCGGCT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--T-TCAC--AT----A-A-GAGTC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A
gi|103603                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--G-A--TT-A-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAAATTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GA------------T-TA-A-A--AATG--TA-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--GCTT
gi|103604                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAATAG-CTGA-ACA--C-A-A--T--T-C--TTTA-AAG-T--GTAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCT--A-G---C-AG-GGA--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-C-A---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103605                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-GTAACAA-CTGAGGCA--G-G-T--T--T-C--TTTA-AAG-G--ATAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----G-AAAGGTC--A-A---A-AG-GGA--C--TC------A--A-AAC---G-CG------------G-TA-A-T--ATTG--TG-A-A---TTT---T----T-A-A-AAA--
gi|103606                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TGGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-A-------GAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GG------CC------A--A-AAA---A-AA------------A-TA-A-A--AATT--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TATT
gi|103607                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGCCC--A-G-A--AA-C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-A--------A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-A-A---TAG---T----C-A-A-ACA--TATT
gi|103608                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-A---------------------------------TATC-T--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT----------A-A-AAA--
gi|103609                     : ACT-GT-TT-A--GG-C-GTAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TAT------------------CC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTC--TA-A-A---a
gi|103610                     : ATTAGT-TT-A--AT-T-ATAACAG-TTTTGACT--G-G-G--T--C-C--CTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--GT----A-AGTGTCT--A-T---C-AT-GCG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-GA-A-A--ATTC--TG-A-A---TAT---T----T-G-A-AAA--TCTT
gi|103611                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-GTAACAG-T-------------------C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------A--G--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-CG------------G-TT-A-A--ATTG--TG-A-G---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103612                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATCACAG-CTGAGGTT--G-A-G--A--C-T--TATA-AAA-G--T-AT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-CAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-A-A---TAG---T----G-A-A-AAA--TCTT
gi|103613                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGCGACT--G-G-G--T--T-T--TATA-AAG-G--AAAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGG--C--CC------A--A-ATA---T-GG------------A-TA-A-A--ATTG--GG-A-A---TGT---T----C---A-ATA--TCTT
gi|103614                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103615                     : ACT-GT-TC-A--AT-C-ATAACAG-TTTTCACT--G-A-G--T--T-C--TTAA-AGG-A--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGA--C--TC------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--AATA--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103617                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--C-A---C-AA-GGG--C--TC------T--A-AAA---G-GG------------
gi|103620                     : ATT-GT-GA-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACA--GTG-G--T--T-G--ATTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-T--GT----A-AGGGAC---A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAAAAAG-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-G-A---TTT---C----T-A-A-CAA--TCTT
gi|103621                     : ATT-AA-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-G--AT----G-A-------------------GGG--C--CC------C--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-A--GTTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103622                     : ATT-GT-TT-ATAGT-A-AAAACAG-TTGAGACT--A-G-G--T--C-A--TT-A-AAG-G-----T-TCCA----T-------A--A--TATC-C--AT----A-ACAGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-TA------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATA---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103623                     : ATC-GT-TC-A--GT-C-ATAATAG-TCGAAGCT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAA-G--TGAC-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGCCT--A-C---T-A--GGG--CTGCA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ACTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103624                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAA-TTGTGACT--G-G-A--A--A-T--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------A-------A--A--ACTC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AA-GGG--T--TC---------A-AAA---G-GG------------A-TA-T-A--ACTG--TC-A-G---ATT---T----C-A-A-AAA--TCT
gi|103625                     : ATT-GG-TT-G--GT-C-ATTACAT-TTTAGACT--G-G-A--T--C-A--TTCA-AAA-G--GGAT--------------------A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-CCT--C--CCCCTCTCA--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--AGTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103626                     : ACT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAT-TTGAGACT--G-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--ATAT-T-------A-------A--A--TACC-C--TT----A-AGGCACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-CAG---G-GG------------A-TG-A-A--AGTA--TT-A-A---ATT---T------A-A-GAA--TCTT
gi|103627                     : ACT-GT-TT-A--TC-C-ATAAGAG-TTGAGACT--T-T-G--T--C-A--TTTA-AAG-A--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGAGCC--A-G---C-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-T-A--ATTT--TA-A------TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103628                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTAGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTT-C--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103630                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TGGATATT--C-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-AG------------G-T--A-G--CTTA--TA-A-A---ATT---T----C-A-A-GAA--T
gi|103631                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TTGATATT--G-G----T--C-A--TTTA-AAA-G--CGAT-T-------T-------A--A--TATA-C--AT----A-AGGGCCC--A-G---C-AG-GCG--C--CA------T--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--A------A-A-AATCTTC---T----C-A-A-AAA--
gi|103633                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--AATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T------A-A-AAA--T
gi|103634                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103635                     : ATT-GT-TT-G--GC-C-ATAACAC-TTGAGACA--G-G-G--T--C-T--TTTT-TAA-T--GGAA-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--G-AAA---G-GT------------A-AA-A-T--ATTG--TG-A-A---TTC---T------A-A-AAA--TGTT
gi|103636                     : ATT-GT-GT-G--GC-C-AC------TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-TTA-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TGTT
gi|103637                     : ACT-GT-TT-A--GT-T-AAAATAG-TTGAGAAT--G-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-A--GT----A-AAGGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GA------------A--A-G-C--ATTG--TG-C-A---TTCTAAT----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103638                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTAAAG-TAGAGACT--T-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--GGCA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---C-AG-TGG--C--C----------A-AAA---T-AT------------A-TG-A-A--AATG--TG-A-A---ATT---C----T-A-A-AAAATTCTT
gi|103639                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-T--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103640                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAATAG-TTCAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAA-T-------A-------A--A--TATC-A--AC----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--AG------AAGA-GAA---G-GG------------ATTA-A-T--GTTG--T
gi|103641                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAT-TTGAGACT--T-G-A--T--T-C--TT-A-ATT-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATA-A--AT----A-ACAGGTG--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-ATC---A-GG------------A-TA-C-T--ATTG--TG-A-A---TTT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103642                     : ATT-AT-TT-T--AT-C-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-A--T--G-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------A-------A--A--TATT-C--AT------AGGGGTA--A-G---C-AG-TGG--C--AG------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-G-T--AATG--T--A-A---TTT---G----T-A-A-ATA--TC
gi|103644                     : ATT-GT-TT-A--TT-T-GGAACAG-TTGAGATT--G-G-G--C--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--C--TAT------------------CT--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--C-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--ATTG--TA-A-A----TT---T----C-A-A-
gi|103646                     : ATT-GT-TT-A--AT-C-GCAACAG-TTAAGACT--G-G----T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAGTGTT--A-A---T-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A
gi|103648                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTCATAAA--G-A-G--T--C-T--TTTA-AAATG--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A--------------------------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----C---A-TAA--TCTT
gi|103649                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATTACAG-TAGAGATT--T-G-G--A--C-C--TTTA-AAA-G--AGAT-T-------T-------G--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-A---T-AA-GAG--C--CC------T--G-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--G-TG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AA
gi|103650                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----A-A-A-
gi|103652                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-A-AACAG-ATACGACT--T-G-T--T--C-T--GTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-GAACT-AG-TGG--C--CT------C--A-GTA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATC---T----A-A-A-AAA--
gi|103653                     : ATT-GT-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-TCA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103654                     : ATT-GT-TT-A--GA-C-ATGACAG-TTGAGATA--G-G-C--T--C-CTTTTTA-AA-----GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGACAAC--A-G---C-AG-AGG-----CC------A--A-AAA---A-AG------------A-TT-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AA
gi|103655                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAGCTTGA-ACT--G-T-G--T--T-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GA------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TAT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103657                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAGCTG-TTGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAG-T-------A-------A--A--TACA-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG-----CC------A--A-AAT---A-GG------------A-TA-
gi|103658                     : ATT-GT-TG-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-T-G--T--T-C---TTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--ATGTATT-C--AT----A-AG----C--ACG---C-A-------C--CC------AT-A-AAA---G-AG------------A-TC-A-A--A-----TG-A-A---TTT---C----C-A-A-AAA--TATT
gi|103698                     :  TT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-A--T--G-A--TTCA-A-G-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-T--GT----A-AAGG-TC--A-G---C-AT-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-AG-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT----------A-A-AAC--TCTT
gi|103699                     :  TT-GT-TTTA--AT-C-ATAACAG-TTGAGA-T--G-GTG--T--C-C--TT-A-ATG-GTGGGGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGTGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAT---C-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-C---TCT---T----C-A-A-ATA--TCTT
gi|103700                     :  TT-GT-TA-A--GT-C-AAAACAG-GTGAGACT--T-G-A--A--T-A--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-A--GAC-----G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------T-TA-A-A--TTTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAT--TCCT
gi|103702                     :  TT-GT-TT-A--TT-C-ATAACAA-TTAGGACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--T-AAA---A-GA------------T-TG-A-A--ATT--------A---TTT------------A-AAA--T
gi|103703                     :  TT-GT-TC-A--GT-C-ATAACGG-TTAGGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGGC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--T-AAA---A-GA------------T-TG-A-A--ATTATTTG-A-A----AT---T----G-A-G-AAA--TTTTtgagaaatttt
gi|103704                     :  TT-GT-TT-T--GG-C-ATAACAG-TTAAGACC--G------T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAAGGTT--A-G---C-AG--GG--C--TC------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-A-C--ATTG--TT-G-A---TTT---T----C-G-A-AAA--
gi|103710                     :   T-GTATT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TCTA-AAG-G--GGAT-A-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATATGTC--A-G---C-AG-GAT--T--CT------A--A-AAA---G-AG------------G-TC-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103712                     :   T-GT-TT-A--GT-C-AAAACAG-TTGAGATTCAA-G-G--C--CAC--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------G-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCT--A-G---C-AG-GGG--T--CCG-----A--A-AAA---G-TG------------A-TA-A-AGCACTG--TG-A-A---TTC---T----A-A-A-ACA--TTTT
gi|103713                     :   T-GT-TT-C--AT-C-ATAATAG-TTGAGATG--G-A-G--T--C-A--TTCA-AAA-G--ATAT-T-------T-------A--A--TATC-C--A-----A-AGAAGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC---------G-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--GTTG--TG-A-A---TTT---C----G-A-A-AA
gi|103716                     :   T-AT-TT-A--GA-C-ATTACAG-TTGTGACT--G-A-G--T--C-A--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-G--AT----A-AGAGGCC--A-G---C-AG-AAG--C--TC------A--A-AAA---G-GGATTTATAAGATCA-TA-A-G--ATTG--TG-A-A---CTT---T----C-ACA-AAA--TTT
gi|103717                     :   T-GT-TA-C--GT-C-AAAATAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG------T------A--A-AAG---G-AG------------T-TA-A-T--GTTG--T
gi|103724                     :      T-TT-A--GT-C-ATAAGAA-TTGAAACT--G-G-G--A--C-C--TTTA-AA--A--AGAT-T-------T-------A--G--TATT-C--AT----T-AAGGGTC--A-G---CTAT-GCT--C--CA------A--A-AAA---G-GGA-----------A-TG-A-A--ATAG--TA-A-A---TTT---C----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103727                     :       -TT-A--GT-C-ATAACAG-TTTAAACT--G-G-A--T--T-T--TTTT-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---T-GG------------A-TA-A-A--ATTT--TG-A-A---ATT---T----T-A-A-AAG--TATT
gi|103728                     :       -TC-A--GT-C-ATTACAG-ATGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTA-ACG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATG-C--AT----G-AGGGGCT--G-A---C-AT-GTA--C--CT------A--A-AAC---G-GA------------A-TA-T-A--ATTG--TA-A-A----CT---A----C-A-A-ACA--TC
gi|103731                     :         T-A--GT-C-ATAACAG-TTGGGACA--G-G-G--T--C-A--TTTA-TAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-GT------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TGT---T----C-A-A-AA
gi|103738                     :                  -ATAACAG-TTGAGACT--T-G-G--T--T-C--TTTAGAAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGAGGC--A-G---C-AG-GAG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----A-A-A-AAA--TCTTtttt
gi|103741                     :                     AACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--A-C--TTTA-AAA-GT-AGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AT----A-GATAG-C--A-G---C-AG-AGG--T--CA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTT--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103747                     :                                          --T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--TT----A--GAGACC--A-G---C-AG-AGA--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-A-A--ATAG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAG--TCT
gi|103750                     :                                                     TTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--GT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TC





Alignments
lowQualScore                  :    0  0  0 00  0 0       0        00 0 0 00 11 0 00    0   0 11    2 2222222 1111111 33 00   11 00  0000 1       11 0 000 0  0   00 00  111111 00 0   000 0  222222222222 0  0 0 11    00  0 0 1111  000 111111 0 0   00    
lowQualScore                  :    .  .  . ..  . .       .        .. . . .. .. . ..    .   . ..    . ....... ....... .. ..   .. ..  .... .       .. . ... .  .   .. ..  ...... .. .   ... .  ............ .  . . ..    ..  . . ....  ... ...... . .   ..    
lowQualScore                  :    4  4  4 66  4 4       4        66 4 4 66 00 4 66    4   4 00    8 0000000 3333333 33 55   77 55  8888 2       11 4 777 4  4   99 55  999999 99 4   777 4  555555555555 4  4 4 00    66  5 5 0000  888 555555 5 5   77    
consensus                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
Reference ( family-177 )      : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103564                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TAGC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103565                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTAA-AGG-A--AGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--ATCTATA-AGGGGTT--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103566                     : ATT-GT-TT-A--GT-T-ATTACAG-TTGAGACT------------------TTA-AAA-A--GGGT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGAGTC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103567                     : ATT-TT-TT-A--GT-CTGTA-CAG-TGGAGACT--G-G-G--G--C-A--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TACA-C--AT----A-AGAGTCT----G---T-AG-GGG--T--CC------A--A-CAA---G-GG------------A-TA-A-AT-ATT---CG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103568                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-TTTGCAG-TTTGGACT--G-G-A-------C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-C--GT----G-AGGG-TC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCT
gi|103569                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATCG--TG-A-T---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103570                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGACC--CC------A--A-AA-------G------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A----TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103571                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAG-CTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------C--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-C--ATTG--TA-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103572                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAACAG-TCAAGACT--G-G-G--A--A-C--TTAA-AGG-G--GGAGGTGGGAGGGT-------A--A--AATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-GC------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103574                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-A-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGGGTC--A-G---C-AG-GGT--C--CT------T--A-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TATT
gi|103575                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TGGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAA-G--GGAT-T---------------A--A--TATA-A--AT----A-AGGGGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAC---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-
gi|103576                     : ATT-GT-TT-T--AT-C-ATAGCAG-TTAAGACT--G-G-G--T--C-C--TGTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------C--A-AAA---G-TG------------A-TA-A-A--GTTG--TG-A-A---TAT---T----C-A-A-TAA--TCTT
gi|103577                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------T--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103578                     : ATT-TT-TT-T--GT-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-A--T--A-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-GG------------T-TA-A-A--ACGG--TG-A-T---TAT---TAAAAC-A-A-AAA--TCTT
gi|103579                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------G--A--TATA-TAAAT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--CC---------A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A---------------TT---T----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103580                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-G--TTT-----------AT-T-------------------------------------GGGAACC--A-G---C-AG-GGG--C--CCA-----A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103581                     : ATT-GT-GA-A--ATAC-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-A--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGTCC--A-G---C-AG-TGG--C--CG------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TGAA-A---TTT---T----T-A-A-AAA--TTT
gi|103582                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTTAGACA--A-G-G--T--C-C--TTTA-ATG-G--AGAA-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTC--TA-A-A---ATG---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103583                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAA-AGGAGACT--T-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--AAAT-T-------T-------T--A--TAAA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-TT------------A-TA-ATA--ATGG--AA-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TC
gi|103584                     : ATT-GT-TT-T--GT-A-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-A--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AA-GGG--C--CG------A--A-AAA---GAGG------------T-TA-A-A--CTCG--TG-A-A---TTT---T----A-A-ACAAA--TCTT
gi|103585                     : ATT-GC-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGC--C--CC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---ATT---T----C-G-A-AAT--TCTT
gi|103586                     : ATT-GT-TC-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G------T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGTC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------C-TG-A-A--
gi|103588                     : ATT-GC-TT-G--GT-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---T-A--GGG--C--CC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-A-C--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103589                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAAACT--T-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AC----A-AGAGGTC--A-G---C-AG-GGG--T--TC------A--T-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--AT
gi|103590                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATTGCAG-TTCATATA--A-G-G--T--C-C--TTTG-AAT-G--GGAT-T-------T-------G--G--CATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGC-C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TC-A-A--ATTG--T
gi|103591                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAT-T--GG-T-T-------TGTATACCA--G--TACT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--TA------A--A-TAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTG---T----C-A-A-AAA--
gi|103592                     : ATT-TT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGTGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-AAA-G--GGAT-C-------T-------T--A--TATT-C--AT----A-AGGGATC--A-G---G-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----CAA-A-AAA--TCTT
gi|103593                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAATAG-TTGTGAC---A-G-G--T--C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-
gi|103594                     : ATT--T-TT-A--GT-C-ATAACGG-TGGAGAAT--A-G-A--T--C-C--TTTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-G---T-AGTGGG--C--GC------A--ATAAA---G-GG------------A-TG-A-C--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103595                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ACAATGG-TTGAGACT--T-A-A--C--T-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-A--CGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-T--ATTG--TG-ATA---TTT---T------A-A-AAA--CCTT
gi|103596                     : ACT-GT-TC-A--AC-C-ATAACAG-CTGAGTCT--G-A-GACTAGC-T--TTTA-AAG-G--GATT-T-------T-------A--A--TGTC-C--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-AA------------A-TA-A-C--ATGG--TA-A-A---TAG---T----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103597                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ACAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGCACT--G-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---A-GA------------A-AACA-A--ATT
gi|103599                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ACAACAG-TTCAGACC--A-G-G--G--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCC--A-A---C-AG-GGG--T--TT------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-T-C--ATTG--CG-A-A---TTT---C----G-A-A-AAG--TCTT
gi|103600                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATACCAA-TTGAGATT--A-G-T--C--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AGAGACC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-TAA---G-
gi|103601                     : ATT-GT-AT-A--AC-C-AGTACAG-TGTCGGCT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--T-TCAC--AT----A-A-GAGTC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A
gi|103603                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--G-A--TT-A-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAAATTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GA------------T-TA-A-A--AATG--TA-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--GCTT
gi|103604                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAATAG-CTGA-ACA--C-A-A--T--T-C--TTTA-AAG-T--GTAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCT--A-G---C-AG-GGA--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-C-A---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103605                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-GTAACAA-CTGAGGCA--G-G-T--T--T-C--TTTA-AAG-G--ATAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----G-AAAGGTC--A-A---A-AG-GGA--C--TC------A--A-AAC---G-CG------------G-TA-A-T--ATTG--TG-A-A---TTT---T----T-A-A-AAA--
gi|103606                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TGGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-A-------GAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GG------CC------A--A-AAA---A-AA------------A-TA-A-A--AATT--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TATT
gi|103607                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGCCC--A-G-A--AA-C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-A--------A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-A-A---TAG---T----C-A-A-ACA--TATT
gi|103608                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-A---------------------------------TATC-T--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT----------A-A-AAA--
gi|103609                     : ACT-GT-TT-A--GG-C-GTAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TAT------------------CC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTC--TA-A-A---a
gi|103610                     : ATTAGT-TT-A--AT-T-ATAACAG-TTTTGACT--G-G-G--T--C-C--CTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--GT----A-AGTGTCT--A-T---C-AT-GCG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-GA-A-A--ATTC--TG-A-A---TAT---T----T-G-A-AAA--TCTT
gi|103611                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-GTAACAG-T-------------------C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------A--G--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-CG------------G-TT-A-A--ATTG--TG-A-G---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103612                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATCACAG-CTGAGGTT--G-A-G--A--C-T--TATA-AAA-G--T-AT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-CAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-A-A---TAG---T----G-A-A-AAA--TCTT
gi|103613                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGCGACT--G-G-G--T--T-T--TATA-AAG-G--AAAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGG--C--CC------A--A-ATA---T-GG------------A-TA-A-A--ATTG--GG-A-A---TGT---T----C---A-ATA--TCTT
gi|103614                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103615                     : ACT-GT-TC-A--AT-C-ATAACAG-TTTTCACT--G-A-G--T--T-C--TTAA-AGG-A--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGA--C--TC------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--AATA--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103617                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--C-A---C-AA-GGG--C--TC------T--A-AAA---G-GG------------
gi|103620                     : ATT-GT-GA-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACA--GTG-G--T--T-G--ATTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-T--GT----A-AGGGAC---A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAAAAAG-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-G-A---TTT---C----T-A-A-CAA--TCTT
gi|103621                     : ATT-AA-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-G--AT----G-A-------------------GGG--C--CC------C--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-A--GTTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103622                     : ATT-GT-TT-ATAGT-A-AAAACAG-TTGAGACT--A-G-G--T--C-A--TT-A-AAG-G-----T-TCCA----T-------A--A--TATC-C--AT----A-ACAGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-TA------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATA---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103623                     : ATC-GT-TC-A--GT-C-ATAATAG-TCGAAGCT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAA-G--TGAC-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGCCT--A-C---T-A--GGG--CTGCA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ACTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103624                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAA-TTGTGACT--G-G-A--A--A-T--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------A-------A--A--ACTC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AA-GGG--T--TC---------A-AAA---G-GG------------A-TA-T-A--ACTG--TC-A-G---ATT---T----C-A-A-AAA--TCT
gi|103625                     : ATT-GG-TT-G--GT-C-ATTACAT-TTTAGACT--G-G-A--T--C-A--TTCA-AAA-G--GGAT--------------------A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-CCT--C--CCCCTCTCA--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--AGTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103626                     : ACT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAT-TTGAGACT--G-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--ATAT-T-------A-------A--A--TACC-C--TT----A-AGGCACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-CAG---G-GG------------A-TG-A-A--AGTA--TT-A-A---ATT---T------A-A-GAA--TCTT
gi|103627                     : ACT-GT-TT-A--TC-C-ATAAGAG-TTGAGACT--T-T-G--T--C-A--TTTA-AAG-A--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGAGCC--A-G---C-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-T-A--ATTT--TA-A------TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103628                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTAGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTT-C--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103630                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TGGATATT--C-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-AG------------G-T--A-G--CTTA--TA-A-A---ATT---T----C-A-A-GAA--T
gi|103631                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TTGATATT--G-G----T--C-A--TTTA-AAA-G--CGAT-T-------T-------A--A--TATA-C--AT----A-AGGGCCC--A-G---C-AG-GCG--C--CA------T--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--A------A-A-AATCTTC---T----C-A-A-AAA--
gi|103633                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--AATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T------A-A-AAA--T
gi|103634                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103635                     : ATT-GT-TT-G--GC-C-ATAACAC-TTGAGACA--G-G-G--T--C-T--TTTT-TAA-T--GGAA-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--G-AAA---G-GT------------A-AA-A-T--ATTG--TG-A-A---TTC---T------A-A-AAA--TGTT
gi|103636                     : ATT-GT-GT-G--GC-C-AC------TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-TTA-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TGTT
gi|103637                     : ACT-GT-TT-A--GT-T-AAAATAG-TTGAGAAT--G-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-A--GT----A-AAGGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GA------------A--A-G-C--ATTG--TG-C-A---TTCTAAT----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103638                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTAAAG-TAGAGACT--T-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--GGCA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---C-AG-TGG--C--C----------A-AAA---T-AT------------A-TG-A-A--AATG--TG-A-A---ATT---C----T-A-A-AAAATTCTT
gi|103639                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-T--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103640                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAATAG-TTCAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAA-T-------A-------A--A--TATC-A--AC----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--AG------AAGA-GAA---G-GG------------ATTA-A-T--GTTG--T
gi|103641                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAT-TTGAGACT--T-G-A--T--T-C--TT-A-ATT-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATA-A--AT----A-ACAGGTG--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-ATC---A-GG------------A-TA-C-T--ATTG--TG-A-A---TTT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103642                     : ATT-AT-TT-T--AT-C-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-A--T--G-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------A-------A--A--TATT-C--AT------AGGGGTA--A-G---C-AG-TGG--C--AG------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-G-T--AATG--T--A-A---TTT---G----T-A-A-ATA--TC
gi|103644                     : ATT-GT-TT-A--TT-T-GGAACAG-TTGAGATT--G-G-G--C--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--C--TAT------------------CT--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--C-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--ATTG--TA-A-A----TT---T----C-A-A-
gi|103646                     : ATT-GT-TT-A--AT-C-GCAACAG-TTAAGACT--G-G----T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAGTGTT--A-A---T-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A
gi|103648                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTCATAAA--G-A-G--T--C-T--TTTA-AAATG--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A--------------------------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----C---A-TAA--TCTT
gi|103649                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATTACAG-TAGAGATT--T-G-G--A--C-C--TTTA-AAA-G--AGAT-T-------T-------G--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-A---T-AA-GAG--C--CC------T--G-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--G-TG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AA
gi|103650                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----A-A-A-
gi|103652                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-A-AACAG-ATACGACT--T-G-T--T--C-T--GTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-GAACT-AG-TGG--C--CT------C--A-GTA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATC---T----A-A-A-AAA--
gi|103653                     : ATT-GT-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-TCA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103654                     : ATT-GT-TT-A--GA-C-ATGACAG-TTGAGATA--G-G-C--T--C-CTTTTTA-AA-----GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGACAAC--A-G---C-AG-AGG-----CC------A--A-AAA---A-AG------------A-TT-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AA
gi|103655                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAGCTTGA-ACT--G-T-G--T--T-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GA------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TAT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103657                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAGCTG-TTGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAG-T-------A-------A--A--TACA-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG-----CC------A--A-AAT---A-GG------------A-TA-
gi|103658                     : ATT-GT-TG-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-T-G--T--T-C---TTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--ATGTATT-C--AT----A-AG----C--ACG---C-A-------C--CC------AT-A-AAA---G-AG------------A-TC-A-A--A-----TG-A-A---TTT---C----C-A-A-AAA--TATT
gi|103698                     :  TT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-A--T--G-A--TTCA-A-G-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-T--GT----A-AAGG-TC--A-G---C-AT-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-AG-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT----------A-A-AAC--TCTT
gi|103699                     :  TT-GT-TTTA--AT-C-ATAACAG-TTGAGA-T--G-GTG--T--C-C--TT-A-ATG-GTGGGGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGTGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAT---C-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-C---TCT---T----C-A-A-ATA--TCTT
gi|103700                     :  TT-GT-TA-A--GT-C-AAAACAG-GTGAGACT--T-G-A--A--T-A--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-A--GAC-----G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------T-TA-A-A--TTTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAT--TCCT
gi|103702                     :  TT-GT-TT-A--TT-C-ATAACAA-TTAGGACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--T-AAA---A-GA------------T-TG-A-A--ATT--------A---TTT------------A-AAA--T
gi|103703                     :  TT-GT-TC-A--GT-C-ATAACGG-TTAGGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGGC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--T-AAA---A-GA------------T-TG-A-A--ATTATTTG-A-A----AT---T----G-A-G-AAA--TTTTtgagaaatttt
gi|103704                     :  TT-GT-TT-T--GG-C-ATAACAG-TTAAGACC--G------T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAAGGTT--A-G---C-AG--GG--C--TC------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-A-C--ATTG--TT-G-A---TTT---T----C-G-A-AAA--
gi|103710                     :   T-GTATT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TCTA-AAG-G--GGAT-A-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATATGTC--A-G---C-AG-GAT--T--CT------A--A-AAA---G-AG------------G-TC-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103712                     :   T-GT-TT-A--GT-C-AAAACAG-TTGAGATTCAA-G-G--C--CAC--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------G-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCT--A-G---C-AG-GGG--T--CCG-----A--A-AAA---G-TG------------A-TA-A-AGCACTG--TG-A-A---TTC---T----A-A-A-ACA--TTTT
gi|103713                     :   T-GT-TT-C--AT-C-ATAATAG-TTGAGATG--G-A-G--T--C-A--TTCA-AAA-G--ATAT-T-------T-------A--A--TATC-C--A-----A-AGAAGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC---------G-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--GTTG--TG-A-A---TTT---C----G-A-A-AA
gi|103716                     :   T-AT-TT-A--GA-C-ATTACAG-TTGTGACT--G-A-G--T--C-A--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-G--AT----A-AGAGGCC--A-G---C-AG-AAG--C--TC------A--A-AAA---G-GGATTTATAAGATCA-TA-A-G--ATTG--TG-A-A---CTT---T----C-ACA-AAA--TTT
gi|103717                     :   T-GT-TA-C--GT-C-AAAATAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG------T------A--A-AAG---G-AG------------T-TA-A-T--GTTG--T
gi|103724                     :      T-TT-A--GT-C-ATAAGAA-TTGAAACT--G-G-G--A--C-C--TTTA-AA--A--AGAT-T-------T-------A--G--TATT-C--AT----T-AAGGGTC--A-G---CTAT-GCT--C--CA------A--A-AAA---G-GGA-----------A-TG-A-A--ATAG--TA-A-A---TTT---C----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103727                     :       -TT-A--GT-C-ATAACAG-TTTAAACT--G-G-A--T--T-T--TTTT-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---T-GG------------A-TA-A-A--ATTT--TG-A-A---ATT---T----T-A-A-AAG--TATT
gi|103728                     :       -TC-A--GT-C-ATTACAG-ATGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTA-ACG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATG-C--AT----G-AGGGGCT--G-A---C-AT-GTA--C--CT------A--A-AAC---G-GA------------A-TA-T-A--ATTG--TA-A-A----CT---A----C-A-A-ACA--TC
gi|103731                     :         T-A--GT-C-ATAACAG-TTGGGACA--G-G-G--T--C-A--TTTA-TAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-GT------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TGT---T----C-A-A-AA
gi|103738                     :                  -ATAACAG-TTGAGACT--T-G-G--T--T-C--TTTAGAAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGAGGC--A-G---C-AG-GAG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----A-A-A-AAA--TCTTtttt
gi|103741                     :                     AACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--A-C--TTTA-AAA-GT-AGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AT----A-GATAG-C--A-G---C-AG-AGG--T--CA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTT--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103747                     :                                          --T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--TT----A--GAGACC--A-G---C-AG-AGA--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-A-A--ATAG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAG--TCT
gi|103750                     :                                                     TTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--GT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TC


blockSeqs                     :                                                                    G GGGAGGG GTATACC TG      CA          T       AG                     CCTCTC               ATTTATAAGATC                      ATCT      AAAAC 
blockSeqs                     :                                                                    C CCA     .       TG      C           T       AG                     A                    A                                 T         CA    
blockSeqs                     :                                                                    C .       .       TG      A           T       .                      G                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    C .       .       TG      A           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    C .       .       TG      C           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    C .       .       TG      A           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    C .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 A         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         G     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         G     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 A         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         G     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         G     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 C         T     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 T         A     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 A         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 T         C     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 A         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 .         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 .         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 .         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 .         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                 .         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       T           .       .                      .                    .                                 .         .     
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       G           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       C           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       A           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       .           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       .           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       .           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       .           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       .           .       .                      .                    .                                                 
blockSeqs                     :                                                                    . .       .       .       .           .       .                      .                                                                      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
finalCons                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT





Alignments
lowQualScore                  :    0  0  0 00  0 0       0        00 0 0 00 11 0 00    0   0 11    2 2222222 1111111 33 00   11 00  0000 1       11 0 000 0  0   00 00  111111 00 0   000 0  222222222222 0  0 0 11    00  0 0 1111  000 111111 0 0   00    
lowQualScore                  :    .  .  . ..  . .       .        .. . . .. .. . ..    .   . ..    . ....... ....... .. ..   .. ..  .... .       .. . ... .  .   .. ..  ...... .. .   ... .  ............ .  . . ..    ..  . . ....  ... ...... . .   ..    
lowQualScore                  :    4  4  4 66  4 4       4        66 4 4 66 00 4 66    4   4 00    8 0000000 3333333 33 55   77 55  8888 2       11 4 777 4  4   99 55  999999 99 4   777 4  555555555555 4  4 4 00    66  5 5 0000  888 555555 5 5   77    
consensus                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
Reference ( family-177 )      : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103564                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TAGC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103565                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTAA-AGG-A--AGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--ATCTATA-AGGGGTT--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103566                     : ATT-GT-TT-A--GT-T-ATTACAG-TTGAGACT------------------TTA-AAA-A--GGGT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGAGTC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103567                     : ATT-TT-TT-A--GT-CTGTA-CAG-TGGAGACT--G-G-G--G--C-A--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TACA-C--AT----A-AGAGTCT----G---T-AG-GGG--T--CC------A--A-CAA---G-GG------------A-TA-A-AT-ATT---CG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103568                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-TTTGCAG-TTTGGACT--G-G-A-------C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-C--GT----G-AGGG-TC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCT
gi|103569                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATCG--TG-A-T---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103570                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGACC--CC------A--A-AA-------G------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A----TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103571                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAG-CTGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------C--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-C--ATTG--TA-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103572                     : ATT-GC-TT-A--GT-C-ATAACAG-TCAAGACT--G-G-G--A--A-C--TTAA-AGG-G--GGAGGTGGGAGGGT-------A--A--AATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--CC------A--A-AAA---G-GC------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103574                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-A-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAGGGTC--A-G---C-AG-GGT--C--CT------T--A-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TATT
gi|103575                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TGGAGACT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAA-G--GGAT-T---------------A--A--TATA-A--AT----A-AGGGGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAC---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----C-
gi|103576                     : ATT-GT-TT-T--AT-C-ATAGCAG-TTAAGACT--G-G-G--T--C-C--TGTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------C--A-AAA---G-TG------------A-TA-A-A--GTTG--TG-A-A---TAT---T----C-A-A-TAA--TCTT
gi|103577                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------T--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103578                     : ATT-TT-TT-T--GT-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-A--T--A-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-GG------------T-TA-A-A--ACGG--TG-A-T---TAT---TAAAAC-A-A-AAA--TCTT
gi|103579                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------G--A--TATA-TAAAT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--CC---------A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A---------------TT---T----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103580                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-G--TTT-----------AT-T-------------------------------------GGGAACC--A-G---C-AG-GGG--C--CCA-----A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103581                     : ATT-GT-GA-A--ATAC-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-A--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGGTCC--A-G---C-AG-TGG--C--CG------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TGAA-A---TTT---T----T-A-A-AAA--TTT
gi|103582                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAA-TTTAGACA--A-G-G--T--C-C--TTTA-ATG-G--AGAA-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTC--TA-A-A---ATG---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103583                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAACAA-AGGAGACT--T-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--AAAT-T-------T-------T--A--TAAA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-TT------------A-TA-ATA--ATGG--AA-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TC
gi|103584                     : ATT-GT-TT-T--GT-A-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-A--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AA-GGG--C--CG------A--A-AAA---GAGG------------T-TA-A-A--CTCG--TG-A-A---TTT---T----A-A-ACAAA--TCTT
gi|103585                     : ATT-GC-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGC--C--CC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-A-A--ATTA--TG-A-A---ATT---T----C-G-A-AAT--TCTT
gi|103586                     : ATT-GT-TC-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G------T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGTC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------C-TG-A-A--
gi|103588                     : ATT-GC-TT-G--GT-T-ATAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---T-A--GGG--C--CC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-A-C--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAT--TCTT
gi|103589                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAAACT--T-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AC----A-AGAGGTC--A-G---C-AG-GGG--T--TC------A--T-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--AT
gi|103590                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATTGCAG-TTCATATA--A-G-G--T--C-C--TTTG-AAT-G--GGAT-T-------T-------G--G--CATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGGC-C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TC-A-A--ATTG--T
gi|103591                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAT-T--GG-T-T-------TGTATACCA--G--TACT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-AGG--T--TA------A--A-TAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTG---T----C-A-A-AAA--
gi|103592                     : ATT-TT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGTGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-AAA-G--GGAT-C-------T-------T--A--TATT-C--AT----A-AGGGATC--A-G---G-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---T----CAA-A-AAA--TCTT
gi|103593                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAATAG-TTGTGAC---A-G-G--T--C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA-----AG------------A-TA-
gi|103594                     : ATT--T-TT-A--GT-C-ATAACGG-TGGAGAAT--A-G-A--T--C-C--TTTC-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-G---T-AGTGGG--C--GC------A--ATAAA---G-GG------------A-TG-A-C--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TCTT
gi|103595                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ACAATGG-TTGAGACT--T-A-A--C--T-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-ATGGGCC--A-G---C-A--CGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-T--ATTG--TG-ATA---TTT---T------A-A-AAA--CCTT
gi|103596                     : ACT-GT-TC-A--AC-C-ATAACAG-CTGAGTCT--G-A-GACTAGC-T--TTTA-AAG-G--GATT-T-------T-------A--A--TGTC-C--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAA---G-AA------------A-TA-A-C--ATGG--TA-A-A---TAG---T----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103597                     : ATT-GC-TT-A--AA-C-ACAACAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGCACT--G-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---A-GA------------A-AACA-A--ATT
gi|103599                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ACAACAG-TTCAGACC--A-G-G--G--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCC--A-A---C-AG-GGG--T--TT------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-T-C--ATTG--CG-A-A---TTT---C----G-A-A-AAG--TCTT
gi|103600                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATACCAA-TTGAGATT--A-G-T--C--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AGAGACC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-TAA---G-
gi|103601                     : ATT-GT-AT-A--AC-C-AGTACAG-TGTCGGCT--G-G-A--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--T-TCAC--AT----A-A-GAGTC--A-G---C-AG-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A
gi|103603                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--G-A--TT-A-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TA---C--AT----GTAAAATTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GA------------T-TA-A-A--AATG--TA-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--GCTT
gi|103604                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAATAG-CTGA-ACA--C-A-A--T--T-C--TTTA-AAG-T--GTAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AAGGGCT--A-G---C-AG-GGA--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-C-A---TAG---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103605                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-GTAACAA-CTGAGGCA--G-G-T--T--T-C--TTTA-AAG-G--ATAA-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----G-AAAGGTC--A-A---A-AG-GGA--C--TC------A--A-AAC---G-CG------------G-TA-A-T--ATTG--TG-A-A---TTT---T----T-A-A-AAA--
gi|103606                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAACAG-TGGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-A-------GAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GG------CC------A--A-AAA---A-AA------------A-TA-A-A--AATT--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TATT
gi|103607                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAGCAG-TTGAGCCC--A-G-A--AA-C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-A--------A-G---C-AG-GGG--C--AC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-A-A---TAG---T----C-A-A-ACA--TATT
gi|103608                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-A---------------------------------TATC-T--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------G-TT-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT----------A-A-AAA--
gi|103609                     : ACT-GT-TT-A--GG-C-GTAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--T-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TAT------------------CC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTC--TA-A-A---a
gi|103610                     : ATTAGT-TT-A--AT-T-ATAACAG-TTTTGACT--G-G-G--T--C-C--CTTA-AAG-G--TGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--GT----A-AGTGTCT--A-T---C-AT-GCG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-GA-A-A--ATTC--TG-A-A---TAT---T----T-G-A-AAA--TCTT
gi|103611                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-GTAACAG-T-------------------C-C--TTTA-A-G-G--GGAT-T-------T-------A--G--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-CG------------G-TT-A-A--ATTG--TG-A-G---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103612                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATCACAG-CTGAGGTT--G-A-G--A--C-T--TATA-AAA-G--T-AT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGGGCC--A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-CAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATGG--TG-A-A---TAG---T----G-A-A-AAA--TCTT
gi|103613                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGCGACT--G-G-G--T--T-T--TATA-AAG-G--AAAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGG--C--CC------A--A-ATA---T-GG------------A-TA-A-A--ATTG--GG-A-A---TGT---T----C---A-ATA--TCTT
gi|103614                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103615                     : ACT-GT-TC-A--AT-C-ATAACAG-TTTTCACT--G-A-G--T--T-C--TTAA-AGG-A--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-A--GGA--C--TC------A--A-AAA---A-GG------------A-TA-A-A--AATA--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103617                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--C-A---C-AA-GGG--C--TC------T--A-AAA---G-GG------------
gi|103620                     : ATT-GT-GA-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACA--GTG-G--T--T-G--ATTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TACA-T--GT----A-AGGGAC---A-G---C-AG-GGA--C--CC------A--A-AAAAAAG-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-G-A---TTT---C----T-A-A-CAA--TCTT
gi|103621                     : ATT-AA-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATC-G--AT----G-A-------------------GGG--C--CC------C--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-A--GTTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103622                     : ATT-GT-TT-ATAGT-A-AAAACAG-TTGAGACT--A-G-G--T--C-A--TT-A-AAG-G-----T-TCCA----T-------A--A--TATC-C--AT----A-ACAGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-TA------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATA---T----C-A-T-AAA--TCTT
gi|103623                     : ATC-GT-TC-A--GT-C-ATAATAG-TCGAAGCT--G-G-G--T--C-C--TTCA-AAA-G--TGAC-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGCCT--A-C---T-A--GGG--CTGCA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ACTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AA
gi|103624                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAA-TTGTGACT--G-G-A--A--A-T--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------A-------A--A--ACTC-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AA-GGG--T--TC---------A-AAA---G-GG------------A-TA-T-A--ACTG--TC-A-G---ATT---T----C-A-A-AAA--TCT
gi|103625                     : ATT-GG-TT-G--GT-C-ATTACAT-TTTAGACT--G-G-A--T--C-A--TTCA-AAA-G--GGAT--------------------A--TATC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-CCT--C--CCCCTCTCA--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--AGTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103626                     : ACT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAT-TTGAGACT--G-G-G--T--C-T--TTTA-AAG-G--ATAT-T-------A-------A--A--TACC-C--TT----A-AGGCACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-CAG---G-GG------------A-TG-A-A--AGTA--TT-A-A---ATT---T------A-A-GAA--TCTT
gi|103627                     : ACT-GT-TT-A--TC-C-ATAAGAG-TTGAGACT--T-T-G--T--C-A--TTTA-AAG-A--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-T--AT----A-AAGAGCC--A-G---C-AG-TGG--C--CC------A--A-AAA---G-AG------------A-TA-T-A--ATTT--TA-A------TT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103628                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTAGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTT-C--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103630                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TGGATATT--C-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-AG------------G-T--A-G--CTTA--TA-A-A---ATT---T----C-A-A-GAA--T
gi|103631                     : ATT-GT-TT-G--GT-C-ATAACAG-TTGATATT--G-G----T--C-A--TTTA-AAA-G--CGAT-T-------T-------A--A--TATA-C--AT----A-AGGGCCC--A-G---C-AG-GCG--C--CA------T--A-AAA---G-AG------------A-TA-A-A--A------A-A-AATCTTC---T----C-A-A-AAA--
gi|103633                     : ATT-GC-TT-A--GA-C-ATAGCAG-TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------G--A--AATA-A--AT----A-AAGGACCAGA-G---C-AG-GAA--C--AA------A--A-AAA---A-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T------A-A-AAA--T
gi|103634                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103635                     : ATT-GT-TT-G--GC-C-ATAACAC-TTGAGACA--G-G-G--T--C-T--TTTT-TAA-T--GGAA-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGTC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--G-AAA---G-GT------------A-AA-A-T--ATTG--TG-A-A---TTC---T------A-A-AAA--TGTT
gi|103636                     : ATT-GT-GT-G--GC-C-AC------TTGAGACA--G-G-G--T--C-C--TTTT-TTA-T--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AAA--TGTT
gi|103637                     : ACT-GT-TT-A--GT-T-AAAATAG-TTGAGAAT--G-T-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GGTT-T-------T-------A--A--TATC-A--GT----A-AAGGGTC--A-G---C-A--GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GA------------A--A-G-C--ATTG--TG-C-A---TTCTAAT----A-A-A-AAA--TCTT
gi|103638                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATTAAAG-TAGAGACT--T-G-G--T--C-C--TTTG-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--GGCA-C--AT----A-A-GGGTC--A-G---C-AG-TGG--C--C----------A-AAA---T-AT------------A-TG-A-A--AATG--TG-A-A---ATT---C----T-A-A-AAAATTCTT
gi|103639                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-T--AT----A-AAGTTTA--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103640                     : ATT-GT-TA-A--GT-C-ATAATAG-TTCAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAA-T-------A-------A--A--TATC-A--AC----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--T--AG------AAGA-GAA---G-GG------------ATTA-A-T--GTTG--T
gi|103641                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAAAAT-TTGAGACT--T-G-A--T--T-C--TT-A-ATT-G--GTAT-T-------T-------A--A--TATA-A--AT----A-ACAGGTG--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-ATC---A-GG------------A-TA-C-T--ATTG--TG-A-A---TTT---T----A-A-A-AAA--TCCT
gi|103642                     : ATT-AT-TT-T--AT-C-ATAACAG-TTGGAACT--G-G-A--T--G-C--TTTA-AAG-T--GGAT-T-------A-------A--A--TATT-C--AT------AGGGGTA--A-G---C-AG-TGG--C--AG------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-G-T--AATG--T--A-A---TTT---G----T-A-A-ATA--TC
gi|103644                     : ATT-GT-TT-A--TT-T-GGAACAG-TTGAGATT--G-G-G--C--C-C--TTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--C--TAT------------------CT--A-G---C-AG-GGG--C--TC------A--C-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--ATTG--TA-A-A----TT---T----C-A-A-
gi|103646                     : ATT-GT-TT-A--AT-C-GCAACAG-TTAAGACT--G-G----T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAGTGTT--A-A---T-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--A
gi|103648                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-ATAACAG-TTCATAAA--G-A-G--T--C-T--TTTA-AAATG--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGGGTC--A--------------------------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-C-A--ATTG--TG-A-A---TTT---C----C---A-TAA--TCTT
gi|103649                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATTACAG-TAGAGATT--T-G-G--A--C-C--TTTA-AAA-G--AGAT-T-------T-------G--A--TACA-C--AT----A-A-TGGTC--A-A---T-AA-GAG--C--CC------T--G-AAA---G-GA------------A-TA-A-A--G-TG--TG-A-A---TTT---C----T-A-A-AA
gi|103650                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAG-TTGGAACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----A-A-A-
gi|103652                     : ATT-GT-TT-A--GT-C-A-AACAG-ATACGACT--T-G-T--T--C-T--GTTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGAGGTC--A-GAACT-AG-TGG--C--CT------C--A-GTA---G-AG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATC---T----A-A-A-AAA--
gi|103653                     : ATT-GT-TT-A--GA-T-ATAACAG-TTGGAAAT--G-G-G--T--C-C--TTTA-TCA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TTT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103654                     : ATT-GT-TT-A--GA-C-ATGACAG-TTGAGATA--G-G-C--T--C-CTTTTTA-AA-----GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--AT----A-AGACAAC--A-G---C-AG-AGG-----CC------A--A-AAA---A-AG------------A-TT-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AA
gi|103655                     : ATT-GT-TT-A--GT-A-ATAACAGCTTGA-ACT--G-T-G--T--T-C--TTTA-ACA-G--TGATCT-------T-------ATGA--TCTC-C--AT----A-AAGTTTC--A-G---C-AG-GGG--T--CT------A--A-AAA---G-GA------------A-TG-G-A--ATTG--TG-G-A---TAT---T----C-A-A-AAG--T
gi|103657                     : ATT-AT-TT-A--GT-C-ATAGCTG-TTGAGATA--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAG-T-------A-------A--A--TACA-C--AT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG-----CC------A--A-AAT---A-GG------------A-TA-
gi|103658                     : ATT-GT-TG-A--GT-C-ATAACAA-TTGAGACT--G-T-G--T--T-C---TTA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--ATGTATT-C--AT----A-AG----C--ACG---C-A-------C--CC------AT-A-AAA---G-AG------------A-TC-A-A--A-----TG-A-A---TTT---C----C-A-A-AAA--TATT
gi|103698                     :  TT-GT-TT-A--GT-C-ATTACAG-TTGAGACT--G-G-A--T--G-A--TTCA-A-G-G--GAAT-T-------T-------G--A--TATA-T--GT----A-AAGG-TC--A-G---C-AT-GGG--T--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-AG-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT----------A-A-AAC--TCTT
gi|103699                     :  TT-GT-TTTA--AT-C-ATAACAG-TTGAGA-T--G-GTG--T--C-C--TT-A-ATG-GTGGGGT-T-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-AGGTGCC--A-G---T-AG-GGG--C--CC------A--A-AAT---C-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-C---TCT---T----C-A-A-ATA--TCTT
gi|103700                     :  TT-GT-TA-A--GT-C-AAAACAG-GTGAGACT--T-G-A--A--T-A--TTTA-AAG-G--GAAT-T-------T-------A--A--TATT-C--AT----A-A--GAC-----G---C-AG-GGG--C--TC------A--A-AAA---G-GG------------T-TA-A-A--TTTG--TG-A-A---TTT---T----C-A-A-AAT--TCCT
gi|103702                     :  TT-GT-TT-A--TT-C-ATAACAA-TTAGGACT--G-C-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--T-AAA---A-GA------------T-TG-A-A--ATT--------A---TTT------------A-AAA--T
gi|103703                     :  TT-GT-TC-A--GT-C-ATAACGG-TTAGGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-G--GTAT-T-------T-------G--A--TATT-C--AC----A-AGTTGGC--A-G---C-AG-GGG--C--CA------A--T-AAA---A-GA------------T-TG-A-A--ATTATTTG-A-A----AT---T----G-A-G-AAA--TTTTtgagaaatttt
gi|103704                     :  TT-GT-TT-T--GG-C-ATAACAG-TTAAGACC--G------T--C-C--TTCA-AAT-G--TGAT-T-------T-------T--A--TATC-T--AT----A-AAAGGTT--A-G---C-AG--GG--C--TC------A--A-AAA---G-GA------------A-TA-A-C--ATTG--TT-G-A---TTT---T----C-G-A-AAA--
gi|103710                     :   T-GTATT-A--GT-C-ATAACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TCTA-AAG-G--GGAT-A-------T-------A--A--TATC-C--AT----A-ATATGTC--A-G---C-AG-GAT--T--CT------A--A-AAA---G-AG------------G-TC-A-A--ATTG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAA--
gi|103712                     :   T-GT-TT-A--GT-C-AAAACAG-TTGAGATTCAA-G-G--C--CAC--TTTA-AAG-G--TGAT-T-------G-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCT--A-G---C-AG-GGG--T--CCG-----A--A-AAA---G-TG------------A-TA-A-AGCACTG--TG-A-A---TTC---T----A-A-A-ACA--TTTT
gi|103713                     :   T-GT-TT-C--AT-C-ATAATAG-TTGAGATG--G-A-G--T--C-A--TTCA-AAA-G--ATAT-T-------T-------A--A--TATC-C--A-----A-AGAAGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CC---------G-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--GTTG--TG-A-A---TTT---C----G-A-A-AA
gi|103716                     :   T-AT-TT-A--GA-C-ATTACAG-TTGTGACT--G-A-G--T--C-A--TTAA-AAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATT-G--AT----A-AGAGGCC--A-G---C-AG-AAG--C--TC------A--A-AAA---G-GGATTTATAAGATCA-TA-A-G--ATTG--TG-A-A---CTT---T----C-ACA-AAA--TTT
gi|103717                     :   T-GT-TA-C--GT-C-AAAATAG-TTGAGACT--G-G-G--T--C-C--TTTA-AAG-A--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG------T------A--A-AAG---G-AG------------T-TA-A-T--GTTG--T
gi|103724                     :      T-TT-A--GT-C-ATAAGAA-TTGAAACT--G-G-G--A--C-C--TTTA-AA--A--AGAT-T-------T-------A--G--TATT-C--AT----T-AAGGGTC--A-G---CTAT-GCT--C--CA------A--A-AAA---G-GGA-----------A-TG-A-A--ATAG--TA-A-A---TTT---C----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103727                     :       -TT-A--GT-C-ATAACAG-TTTAAACT--G-G-A--T--T-T--TTTT-AAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGTGTC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---T-GG------------A-TA-A-A--ATTT--TG-A-A---ATT---T----T-A-A-AAG--TATT
gi|103728                     :       -TC-A--GT-C-ATTACAG-ATGAGACT--G-G-A--T--C-C--TGTA-ACG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TATG-C--AT----G-AGGGGCT--G-A---C-AT-GTA--C--CT------A--A-AAC---G-GA------------A-TA-T-A--ATTG--TA-A-A----CT---A----C-A-A-ACA--TC
gi|103731                     :         T-A--GT-C-ATAACAG-TTGGGACA--G-G-G--T--C-A--TTTA-TAG-G--GGAT-T-------T-------A--A--TACC-C--AT----A-AGGGGCC--A-G---C-AG-GGG--C--CT------A--A-AAA---G-GT------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---TGT---T----C-A-A-AA
gi|103738                     :                  -ATAACAG-TTGAGACT--T-G-G--T--T-C--TTTAGAAG-G--GGAT-T-------T-------G--A--TATC-C--AT----A-AGGAGGC--A-G---C-AG-GAG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----A-A-A-AAA--TCTTtttt
gi|103741                     :                     AACAG-TTGAGACT--G-G-G--T--A-C--TTTA-AAA-GT-AGAT-T-------T-------T--A--TATC-C--AT----A-GATAG-C--A-G---C-AG-AGG--T--CA------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTT--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TCTT
gi|103747                     :                                          --T--C-C--TTTA-AAG-G--AGAT-T-------T-------A--A--TATC-C--TT----A--GAGACC--A-G---C-AG-AGA--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TG-A-A--ATAG--TA-A-A---TTT---T----C-A-A-AAG--TCT
gi|103750                     :                                                     TTA-AAG-T--GGAT-T-------T-------G--A--TATA-A--GT----A-AGGGACC--A-G---C-AG-GGG--C--CC------A--A-AAA---G-GG------------A-TA-A-A--ATTG--TG-A-A---ATT---T----C-A-A-AAA--TC