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Reference ( gi|15018 ) : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG---G---T---GC---CGT------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC---CTCTCACCG-CT-ATGGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-176 ) : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
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Reference ( family-176 ) : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
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gi|14895 : tttaacatttaaaccacaagaactctagttacgcttgaatacagcgtgaatgtctggtgtttaaaattataccgcaGGGTTCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TAAC-TT---CTAACCG-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---AC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14900 : aataattctcagatttataactttacagtctcagtctagatattaaaGGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AA-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14902 : tgtgcttgaatactggataacctataaaatagatcttgtgaaaaccagttaGGGTCCTC-TGTGATC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---A--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-AGTCG-T-TG-GTTCGAGTCT--T-GCT-C---AC-----T---C---A-A-A-A-A-A-A--ATTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14903 : taaacacagtatatttatgaattagatGGGTCCTC-ATTGGCC-GA-GTGGTC--CT---AG-A---C---G--C---TG---T------C---G-T--AAAACG--AG---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTGA-CGTTC-C-GG-GTTTCAGCCCAAC-GTA-C---ATGTAG-T---C---C-A-G-C-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAA
gi|14905 : tgaatacaaaataaaatgtgtttaaaataaagtttaaattatctgaacctttaTC-TGTGGCC-GA-GTGGCA--TA---AG-GTACT---G--C---CA---T------C---T-A--AT---G--AT---C--AT--TCAC-CT---TTCACTA-CTGA-GGTCA-T-GG-GTTTAAGTCA--A-GCT-CGGTGG-----T---C---C-A-A-A-G-A-C--GTTA-TG--TGATAAATTT
gi|14909 : aataaagtataaatatctaaatacaggtattgacgttattaaacaGGTCCTC-CGTGACC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---T--C---TG---T------C---T-TCTAAT--G--AC---C--AC--CTAC-CT---CTCACTG-TGGA-GGTTG-T-AG-ACCCGAGTCC--C-ACT-C---AG-----T---C---C-A-A-A-A-T-C--TC-------TGAGACAGTT
gi|14910 : gaatgtttgattgagctttaatGGGTCCTC-CATGGCC-TA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CT---A------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CC---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GCTGGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-C-A-C--ATTT-TG--TGAAAAAATTa
gi|14912 : aatgtttatgttattgatacacatcgatGGGTCCTT-CTTGACG-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---TG---T------C---T-C--AA---A--AG---C--AT--TGAC-CT---TTCACCG-CTAA-AGTTG-T-AG-GTTTGAGT-C--T-GCT-C---AC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTTt
gi|14914 : atgctgttgtttaaaatcagaacaGGGTCCTC-CGTGGCT-GA-GTGTTC--TA---AG-G---T---G--CTGTCG---T------C---T-A--AT---T--AC---C--AA--TTAT-CT---CTCACTG-CTGC-GGTCA-T-GG-GTTTGAGTCC--C-ACT-T---AG-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTTta
gi|14915 : tgtcatggtttatattttgaatacGGGTCCTC-CACTACC-GA-GTTGTC--TT---AG-A---T---G--C---TG---T------C---T-C--AT---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTTACTG-CTTA-AGTCG-T-AG-GTTCGAGTCT--C-CCC-T---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--ATTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14919 : tgtctgtatttataaacaaGGTTCTC-CGTGGCC-GA-GTTGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------T---T-C--AA---A--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CCGG-GGTCG-T-AG-GTTCAAGTCC--T-GCT-C---AC-----
gi|14920 : gtttgatgttttttttatatttctacGGGTTCTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------T---T-A--AA---G--AC---C--GC--TTAT-AT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAATCA--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-C-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTTggtggttcta
gi|14923 : tctgttttattacattatacGGGTCCAT-TATGGTT-GC-GTGGTC--AA---AG-G---T---G--C---TG---T------CA--T-CT-AAT--A--AC---C--AC--TTAC-CT---CTCCCTA-TTGA-AGTTC-T-GG-GTTCAGGCCC--A-GCT-T---GG-----T---C---C-A-A-A-A-C-C--TTTA-TA--TGAGCAAATT
gi|14925 : ggtcttttgattatttaacatataCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-A---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCA-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-G---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14926 : gtattttataagtatacaggtacacaGGGTCTTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AG---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGA-TCC--C-AAT-C---AC-----T---C---T-A-A-A-A-A-C--TTAA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14928 : gtgtcttttataagtttgaaGGGCCCTC-CGTGGTG-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--T---TG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTGC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--T-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTT-TG--TGAGAAAGTT
gi|14929 : tattttaacaattaaccagtGAGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTT--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTTG-T-AC-GTTCCAGTTA--A-GCT-C---AC-----T---C---C-A-A-A-A-A-CT-TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14931 : tgctttaaacctataaaGGTTCTC-CACGGCA-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---A--C---TG---T------CGT-C-C--AA---TT-AC---C--AC--TTAC-TT---TTCACCG-CTGG-GGTCA-T-GG-GTTTGAGACC--G-GTT-T---TG-----T---C---A-A-A-A-A-T-A--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14932 : tgtttcgatttactgtaaGGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--TA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14935 : tgtcttattgtaGGGCCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-A---------------G---T------C---T-C--AA---T--TT---C--AC--TTAC-TT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTTC--T-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-T-C--TTT--TG--TGAGAAAGTT
gi|14936 : gcttttaattatataaagGTCCTC-TGTGGCG-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--AT---A--AC--TTAC-TG---CTAACAG-TTAA-GGTCG-T-TG-GTTCAAATCC--C-GCT-C---GC-----T---T---C-A-A-A-A-A-C--TT---TG--TGAGAAAGTT
gi|14938 : gttttaatatttcatcaaggtGGGTCCTC-CATGGCC-GA-GTGGTC--TAC--AG-G---C---G--C---TG---T------C---T-C--AA---T--AC---C--AA--TTAC-CT---CTCACCG-TTAA-GGTCG-T-AG-GCTCGACTCT--C-ACT-C---GC-----T---C---T-A-A-A-A-A-C--GTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14939 : ttgtgatctatacaagaaGGGTCCTC-TGTGTCC-AA-GTAGTC--CA---AA-T---C---AGTC---CT---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACAA-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCTAGTCC--C-ACT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTC-TG--TGAGAAAGTTta
gi|14940 : ttttaaattataaagtattaGGTTCCTC-CATGGCC-GA-GTGGTC--TA---AA-G---C---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CGCACTG-CTAA-GGGTG-T-AG-GTTCGAGTCT--C-GCT-T---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14941 : tttttaattttgtgtgaaGGTTCTTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCGCAG-CTAATTGTTA-T-AG-GTTCAAGTCC--T-GCT-C---GC-----T---A---C-A-A-A-T-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14942 : ttttatattgtattgaatGGGTCCTC-CATGGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CT---T------C---G-C--AA---A--AG---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCAAGTCC--C-GCC-T---GC-----T---C---A-ATA-A-A-A-C--TTTA-TG--GGAGAAATTT
gi|14945 : tctttaatcaaacagctaGGGTTTTC-TGTGGCT-GA-GTTATC--TA---AA-G---T---G--C---TG---T------CAACT-T--AT---G--AT---C--AC--TTAC-C----------A-CTGA-GGTTG-T-GG-GTTCGAGCCC--A-GCT-G---AG-----T---T---T-G-A-A-A-A-C--CTTT-TG--TGAGAAA
gi|14946 : tttaaattggggcagatGGATCTTC-CAGGGCC-GA-GTGAAC--TA---AG-G---T---G--CTGTTG---T------C---T-A--AT---G--GC---C--AT--TTAC-TT---CTCACTG-CTGA-AGTCA-T-TG-G
gi|14957 : tttgttatactgGGGTCCTC-CATGGCA-GA-GTGGTC--TA---TG-G---C---G--A---TG---T------C---T-C--GA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-TTAT-AATTG-T-AG-GTTTGAGTCC--C-GCT-T---GG-----T---CA--A-A-A-A-A-A-A--ATTA-TG--TGAGAAATTT
gi|14958 : aatttcacaagGGGTCCTT-CATGGCC-GA-GTGGTC--TA---AA-G---C---G--C---TA---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCAATG-CTAG-GGTTG-T-AG-GTTTGAGTTC--C-GCT-C---GC-----T---C---T-A-A-A-A-A-C--TCTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14959 : aattagatcaaGGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--T---CA---T------C---T-T--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTTA-GGTTG-T-CG-GCT-AAATCC--G-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-T-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14965 : attaacaggttgGGGGCCTT-CGTAACC-GA-GTTGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTACGAGTCT--A-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-T-A-T--ATAA-TA--TGAGAAAta
gi|14966 : ttatatatatGGGCCCTC-CGTGACCTGA-GTGGTC--CA---AG-T---C---A--T---TG---T------A---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAAACT---CTCACTG-CTGA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCT--C-GCT-C---CG-----T---T---C-A-A-A-A-A-C--TTGA-TG--TGAGAAA
gi|14967 : ttatacaatagaGGATCCTC-CATGGCT-CA-GTGGTC--CA---CA-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTTG-T-AA-GTTTAAGTCC--C-ATT-C---AC-----T---C---C---A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGATAGTT
gi|14968 : ttataatacGGTTCCTA-CATGGTC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---A--C---TGATGT------C---T-A--AT---A--AC---C--AC--TTAC-CT---CTCGTTG-CCAA-GGTCG-A-GG-ATTTGTGCCC--A-GCT-T---GG-----T---------A-A-A-ATA-C--TTGA-TG--TGGGAAATTTt
gi|14973 : ttataaaatggtactaGGTTCTC-CATGGCT-GA-TTGGTT--TC---AG-A---CAATG--T---CG---T------A---T-A--AT---A--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTGA-TGTCA-T-GG-GTTCAAGCCC--C-GAT-T---G------T---C---C-A-A-A-A-A-TA-TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14974 : tatgcacaGTCCTC-TGTGGCA-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-AT---CTCACTG-CTAC-GGTTA-T-AA-GTTCAAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-T-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14975 : tataacaaaagtGTCTTC-CGTGGCT-GA-GTGGTC--TC---AG-G---C---C--C---TG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACTG-ATAA-GGTAG-T-AG-GTTCCAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---CAA-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAA
gi|14978 : tatagagttagtGGGTCTTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TG---AG-A---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTCA-T-AG-GTTTGAGTCC--T-GCT-C---AT-----T---C---T-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14979 : tacagaCCTT-CATGGCA-GA-GTGGTC--TA---AG-T---T---G--A---TG---T------TG--T-T--AAAC-G--AC---C--AC--ATAC-CG---CTCATCG-CTGA-GGTCG-T-GG-GTTTAAGCCT--A-GCT-A---GG-----T---------A-ATA-ATA-C--TTTT-TA--AGAGAA
gi|14980 : tacaaacggagtccGGGTCCTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CCAA-GTGCG-T-AG-GTTCAAGTCC--T-GCT-C---AC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGGGAAAGTT
gi|14981 : actaataGGATCCTC-CATGGCA-GA-GTGGTC--TT---AG-G---C---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAT-GGTCA-T-AG-GTCCGAGTCT--C-GCT-C---TC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14982 : acaaTCCTC-TGTGTGC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--CA---G--AT---C--ACAATCA---T---CTCACCG-CCAA-GGTCG-T-AG-GTACGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---T-G-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14983 : acaaagtgtGGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AC---C--AC--ATAC-TT---CTCACCA-CTAA-GATCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-ACT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-C-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14984 : acaaatagGGGTCCTC-CGTTGCC-AA-GTAGTC--TA---AG-G---C---G--C---CT---T------C---T-C--AA---G--AT---C--GC--TTAC-TT---CTCACTG-TCAA-GGTCG-T-AG-GTTCACGGCC--C-GCT-C---GC-----T---C---A-A-A-A-C-A-C--TTTT-TG--TGAGAAA
gi|14985 : acaaaaGGGTCCTC-TGCGACT-GA-GTAGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---T--AT---C--AC--TAAC-TT---CTCACTG-CTAA-GGTCG-T-AG-ATTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---T---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14989 : acaagGGGTCCTC-CGTCGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--T---CA---C------C---T-C--AA---T--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCATCG-CTAA-GGTCG-C-AG-GGTCGAGTCC--C-GCT-C---GA-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14992 : caaaaGAGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--CA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTTA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAA
gi|14993 : aaatGGTTTCTC-CGTTGCG-GA-GTGGTC--CA---AG-C---T---G--C---TG---TTGC---C---T-A--AT---G--AC---T--AT--TTAC-CT---CTCACTG-CCGA-GATCG-
gi|14996 : aaaGGGTCCTC-GGTGGCC-GA-GTTGTC--TA---AG-G---T---A--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-TT---CTCACCG-CTAA-AGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---A-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|14997 : aatGGGTCCTC-CGTTGCC-GA-ATGGTC--TA---AG-G---T---A--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTG-TG--TGAAAAA
gi|15000 : agtGGGTCCTT-CATGGTG-GAAGTGGTC--TA---AG-G---T---G--T---TG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-TG---CTCACTG-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-T---GA-----T---C---C-A-C-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15001 : tGGTCCTT-CGTA-CT-GA-ATTGTC--TT---AG-T---TTTTG--T---TG---T------C-----C--AAT--G--AT---A--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTGA-GGTCA-T-AG-GTTTGAATCC--C-ACT-C---AG-----T---C---C-A-A-A-A-A-G--TTTA-TG--TGGAAAA
gi|15006 : tGGGTCCTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---TG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTAG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---ACG----T---C---A-A-A-A-A-A-A--ATTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15007 : GGGTCCTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---TG-G---T---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-TT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTTGAGTCC--C-GCT-T---GCA----T---C---A-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAG-AAGTT
gi|15008 : GGGTCCTC-TGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---A--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AC---T--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---AG-----T---C---T-T-A-A-A-A-C--TTTA-TA--TGAGAAAGTTt
gi|15009 : GGGTCCTC-CATGGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTCG-A-AG-GTTCGAGTCC--C-GTT-T---AC-----T-------A-A-A-A-A-A-A--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15010 : TCCTC-CGTGGCC-GA-TTGGTC--TA---AG-G---T---G--T---CG---T------C---C-T--AA---G--AT---C--AC--TCAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGT-G-TCAG-GTTCGAGTCC--C-GAT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTTta
gi|15011 : ggttGGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--CA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTTa
gi|15012 : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15013 : GGTTTTC-TGTGGCT-GA-GTTATC--TA---AA-G---T---G--C---TG---T------CAACT-T--AT---G--AT---C--AC--TTAC-CA---CTTA---------GGTTG-T-GG-GTTCGAGCCA--A-GCT-C---AG-----T---T---T-G-A-A-A-A-C--CTTT-TG--TGAGAAA
gi|15014 : GGGTCCTC-TGTGGCT-AA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CA---T------C---T-C--AA---G--GC---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-AGTGG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-T---GT-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15015 : GGGTCCTC-TGTGGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--T---TG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTTC--T-GCT-C---AC-----T---G---C-A-G-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15016 : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC---------C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGGAAGTT
gi|15017 : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15018 : GGGTCCTC-CGTGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAT-GGTCG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15019 : GGGTCCTC-TGTGGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---T----T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTGA-GGTTG-T-AG-GTTCAAGTCC--T-GCT-T---GC-----T---C---C-T-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGATAAAATT
gi|15020 : GGGTCCTC-TGTGGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---G--C---T----T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTGA-GGTTG-T-AG-GTTCAAGTCC--T-GCT-T---GC-----T---C---C-T-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGATAAAATTt
gi|15021 : GGGTCCTT-CGTAGCC-GA-ATGGTC--TA---AG-G---C---T--C---TT---T------TG--T-T--AAT--G--GC---G--AC--TTAC-TT---CTCGCCG-CTAA-GGTCG-A-AG-GATTGAGCTC--C-GCT-C---GG-----T---C---C-A-A-A-A-T-C--ATTA-TG--TGAGAAAGTTt
gi|15043 : CCTC-CGTGGCC-GA-GCTGTC--TA---AA-T---C---G--C---CT---T------C---T-C--AA---G--AC---C--AC--TTAT-TT---CTCACCG-CAAA-GCTTG-T-AA-GTTCGAGTTC--A-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15046 : tcCCTC-CGCGGCT-GA-GTGGTC--TA---AA-G---C---G--T---GG---T------A---T-T--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACCG-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAA
gi|15047 : CCTC-AGTGACC-AA-GTGGTC--TA---AG-A---T---G--C---AT---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-TT---CTCACTG-CTAA-TGTTG-T-AG-GTTCAAGTCT--T-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-T--TT---TG--TGAGAAA
gi|15048 : CTTC-TGTGCCT-GA-GTGGTC--TT---AG-G---T---G--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTA-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCTTGTCC--C-CCT-T---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TT---TG--TGAGAAA
gi|15049 : CTTC-TGTGGCT-AA-GTGGTCAACA---AG-G---CT--A--T---TG---T------C---T-A--AT---G--AC---C--AC--TAAC-CT---TTCACTC-CCAA-GGTCA-T-GG-GTTTGAGCTC--T-GCT-T---GG-----T---T---G-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAA
gi|15050 : CTTC-CGTGGCC-GA-AT--CC--TT---AGTG---CT--G--T---CG---T------T---T-A--AT---G--AC---A--AA--GTAC-CT---CTCACTT-CTGA-GATCG-T-AG-GTTCAAGTTC--T-GCT-C---GG-----T---CA--A-A-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15061 : TC-CATTGCC-AA-GTGGTC--TA---AT-G---C---G--C---TG---T------CG--T-C--TA---GTAGC---C--AT--TTAC-CT---CTCACCG-CTTA-GGTTG-T-GG-ACTGGAGTCC--T-GTA-C---AG-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--ATTA-CG--TGAGAAAGTTa
gi|15063 : tTC-TGCTGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---A--C---TG---T------C---TTC--TA---A--CT---CCCAT--TTAC-CT---CTCACTG-CTGA-GGTTG-T-GG-GTTCAAGCCT--T-GCT-C---GG-----T---C---CAA-A-A-A-A-C--ATTA-TGTTTGAAAAAGTT
gi|15064 : TC-CATGGCC-GA-GTGGTC--TA---AG-G---C---A--C---CG---T------C---T-C--AA---G--AT---C--AT--TTAC-TT---CTCACCG-CTAA-GGATG-G-AG-GATCGAATCC--C-GCT-C---GC-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--TT---TG--TGAGAAAGTT
gi|15065 : TC-CGTGACC-GA-GTGGTC--TT---AG-A---C---G--T---TG---T------T---T-C--AA---T--AA---C--AC--TTAC-CT---CTCACCC-CTAA-GGTTG-T-AG-GTTCGAGTCC--C-GCT-C---TC-----C---C---T-G-A-A-A-A-C--AGTA-TG--TGAGAAAGTT
gi|15070 : C-TGCAGCC-AA-GTGCTC--CATGGAG-T---T---G--A---CG---T------C---T-A--AT---G--AC---C--AC--TTAC-CT---CTCATCA-CTGA-GGTTG-T-GG-GTTCGAGCTT--A-GCT-C---TG-----T---C---T-T-A-A-A-A-C--TTTA-TG--TGAGAAA
gi|15071 : GTGACA-CA-GTAGTC--TA---AG-G---T---G--C---TG---T------CA--T-CT-AAT--G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTGA-GGTTG-T-GG-ATTTGAGCCC--A-AAT-C---AG-----T---C---T-T-A-A-A-A-C--TTT------TGAGAAAGTT
gi|15072 : GCGACA-GA-GTGATC--TA---AT-G---T---G--C---TG---TTGTCGGC---T-A--AT---G--AC---C--AC--TTAC-CTTCTCTTACTG-CTAA-GCACA-T-CG-GTTTAATTAG--C-ACT-C---GG-----T---C---A-A-A-A-A-A-CCATCT--TG--TGAGAAAGTT
gi|15075 : TGGCA-GA-GTTGTC--CA---AG-G---T---G--T---TG---T------C---A-A--AT---A--AC---C--AC--TTAC-TT---CTCACTG-CCAA-AGTTG-T-CG-GTTC-ATTCCT-C-GGT-----GCGACAGT---C---C-A-A-A-A-T-C--ATTT-TG--TGAGGAA
gi|15078 : GGCT-GA-GTGGTC--TA---AG-G---T---G--C---CA---T------C---T-C--AAA--G--AT---C--AC--TTAC-CT---CTCACTG-CTAA-GGTTG-T-AT-GTTCAAGTCC--C-CCT-A---GC-----T---A---C-A-A-A-A-A-C--GTTT-TG--TGAGAAAGTT
gi|15079 : -GA-GTCGTC--CA---AG-G---C---G--T---TG---T------CA--T-C--AAAT-G--AC---C--AT--TTAC-TT---CACAGC--CTAT-G--CA-G-AGTGTTCAAGCCA--A-GCT-C---AC-----T---CAGTC-A-A-A-A-AAC--ATTAATG--TGAGAGA
gi|15082 : aAC-TT---CTCACCG-CTGA-AGTTG-T-CG-GTTCAATCTC--C-GTT-C---
gi|15085 : gtgttgttgccgaatgaacacaaG---T------C---T-T--AGAT-G--AC---C--AC--TTGC-CT---TTCGCTG-CTGA-GGTCA-T-GG-GTTCAAGCCC--T-GCT-C---TG-----T---C---C-A-A-A-A-A-C--AATT-TG--TGAGAAAATTcag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14885 ): ATATTTTAACATTTAAACTGCAAGAGCTCTATTTATGCTAAAATGCAGTATGAATGCCTGGTGTTTAGAATTATACAAATTGTTCCTTCTGTGGTAGAGTTGTCCATA
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