lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 0 1 000 2 33 0000 0 1 8 666 00 00 77 0 11 1
lowQualScore : . . . ... . .. .... . . . ... .. .. .. . .. .
lowQualScore : 5 8 2 777 7 88 7777 3 0 9 666 55 99 55 3 22 3
consensus : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAN-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT--GGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
Reference ( gi|70267 ) : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70263 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70268 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70265 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70296 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70295 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70292 : ACGACGGACACCAA-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70290 : ACGACAGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70288 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70275 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGTCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70294 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--AAA-AAA
gi|70298 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGGACCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70293 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTT----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70289 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-T-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70269 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CAGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70303 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAA-AGCTT----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70302 : ATGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70309 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGCG-AGC--TAA-CAA
gi|70272 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CTGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70317 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AACTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAATAAA
gi|70286 : ACGAAGGACACTAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70316 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--T
gi|70283 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70270 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGCGAGCTTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70284 : ACAACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70273 : ACGACGAACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CAGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70307 : ACAACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GATG-AGC--TAA-AAA
gi|70259 : ACGATAGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCTTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70291 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-A-TTTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70276 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGATCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70255 : ACGATGGACGACAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70280 : ACGATGGACACCAG-TC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TATGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70281 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCATAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70299 : ATGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CAGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70266 : ACGAAGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70301 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CCGCT--C--A--GGTA-AGT--TAA-AAA
gi|70279 : ACGACGGACACAAG-GC-G---ATCACAAA-AGTTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGACT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70305 : ACGATGGACACCAG-GC-A---ATCACAAA-AACTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--AGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70304 : ACAATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TATGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TA
gi|70306 : ACAACGGACACAAG-GC-C---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAACCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70264 : ATGACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-ATTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70274 : ACGACAGACACGAG-GC-A---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAG-CTT-TCGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70315 : ATGACGGACACAGG-GT-G---ATCACAAA-ATCTC----AC-C-TGTAAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AA
gi|70236 : ACGACGGACAACAT-GC-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-
gi|70239 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAAC-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70238 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAAC-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70311 : ACAATGGATACAAG-GT-G---ATCATAAT-AGCTC----AC-C-T-TAAGCCTT-TGGCT--C--A--GGAA-AAC--TAA-AA
gi|70243 : ACAACAGACAACAT-GC-A---ATCAGAAC-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70240 : ACGACGGACAACAG-CC-A---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TAAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70234 : ACGACAGACAA-AG-GC-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGCT-TAA-AAA
gi|70300 : ATGATGGACACAGG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-CTTATGA--CTC-CTGCT--C--A--GGGG-AGT--TAA-AAA
gi|70237 : ACGATGGACACAAG-GC-G---ATCAGAAT-AACTC----AA-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-CAA
gi|70247 : ATGACGGACAGCAG-GT-GGCAATCAGAAT-AGCTC----AC-T-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GTTG-AGC--TAA-AAA
gi|70253 : ACAACAAACAACAG-GT-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TCAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70242 : ATGATAGACAACAG-GC-A---ATC-CGAATAGCTC----AT-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AGA
gi|70287 : ACGACGGACGAAAA-GT-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-T-TG--AGCCTA-AGGTT--C--A--GGTG-AGC--TAA-
gi|70257 : ATGACGGACACATG-GC-G---ATCAAAAT-AGCTC----A--C-TCTGAGCTTT---GCT--C--G--GGTG-AGC--CAATAAA
gi|70244 : ATGACGAACACAGG-AC-G---ATCAGAAT-AACTC----AT-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70246 : ACGACGGACATAGA-GT-G---ATTAAAAT-AGCTC-----T-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70285 : ACGACAGAGACTGA-GT-G---ATCAGAAT-AACTC----AC-C-T-TGAG--TT-T-GCT--C--A--GGCG-AGC--TAA-AA
gi|70249 : ATGACAGACACAGG-GT-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TAAGCTTT---GCC--C--A--GGTG-AGC--T
gi|70262 : ATGACGGATGACAG-GC-A---ATCAGAAT-AGCTC----AC-T-T-TGAGCTTT---ACT--C--A--GGTG-AGC--T
gi|70261 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAAC-AGCTC----AC-A-T-TCA-TATT-T-GCT--C--A--GGTG-AGC--TTA-AA
gi|70260 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAAC-AGCTC----AC-A-T-TCA-TATT-T-GCT--C--A--GGTG-AGC--TTA-AA
gi|70256 : ACGACGAACAA-AG-GTAG---ATCACAAT-AGCTC----AT-C-C-TGAGCTAT---GCT--C--A--GATG-AGC--TAA-AAA
gi|70297 : ACGATGGACAT-AG-GCCA---ATCAGAAG-ATCTC----AC-C-T-TGAGCCTT-ATGTT--C--A--GGTG-AGT--CAA-
gi|70277 : ACGACGGACACAAG-GC-A---ATCAGAAT-AGATC----AC-A-TA-AAGCTTT---GTT--C--A--GGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70245 : ATGACAGACAAAAA-AC-A---ATCAGAAT-AGTTC----CC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70254 : ACAATGGACACAAG-GC-A---ATCAGAAT-AACTC----AC-C--ACAAGCTTT---GCT--C--A--AGTG-AGC--TAA-GAA
gi|70252 : ACGATAAACACAGG-GT-G---GTCTGAAC-AGCTC----AT-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTT-AGC--TAA-AAA
gi|70250 : ACTACGGACAA-AGTGC-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTTTATG-----T--A--GGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70251 : ACGATGGACAC-AG-GCCG---ATCAGAAT-AATTC----AC-C-T-TAAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-A
gi|70282 : ACGACGGACAACCG-GC-G---ATCAGAAT-ATCTC----AC-A-T-TGAACTTT---GCT--C--A---GTGAAGC--TAA-
gi|70278 : ACAATGGACACAGG-GT-T---ATCGGAAT-AGCTC----AC-CTTGTG----TT-TTGCT--C--A--GGTG-A
gi|70393 : CGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GATG-AGC--TAA-AAA
gi|70394 : CGACGAACACCAG-GC-G---ATCAAAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGTCTT-TGGCT--C--A--GGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70402 : GACGGACAACAG-GC-G---ATCAGAAA-AGCTG----AC-C-T-TGAA--TT-TTGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-
gi|70399 : GACAGACAAAAG-GT-G---ATCAGAAT-AACTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70400 : GACGGACA-AAGTGC-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-T-T-TGAGCTTT---ACT--C--A--GGTG-AAT--TAA-AAA
gi|70407 : GACGGACAACAT-GT-G---ATTAAAAT-ATCTC----AC-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GTTG-AGCCATAA-AA
gi|70408 : GACAGAGAACGA-GC-A---ATTGGAAA-AGCTC----AC-C--ATAAGCTTT---GCT--C--A--GATG-AGC--TAA-AAA
gi|70403 : gattGATGGACACAGG-GT-G---ATCAGAAT-ATATT----AC-C-TG-GAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC---AA-AAA
gi|70406 : GATGGACAT--G-GT-G---ATGAGAAT-AGCTC----AC-TACATGAGATTT---GCT--C--A--GATG-AGC--TAA-AA
gi|70417 : ACGGACACAGG-GC-A---ATCAGAAT-AGCTCTGACAC-C-T-TAAG--TT-TTGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70418 : ATGGACACAGG-GC-A---ATCAGAAT-AGCTC----AC-T---TCAGCTTT---GCT--C--A--AGT
gi|70431 : GGACAACAG-GC-C---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TAAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70432 : GGACACAGG-GT-G---ATCAGAAT-AGCTC----AC-C-T-TGAGCTAT-T--CT--C--A--GGTA-AGC--TAA-CAA
gi|70436 : GACAACAG-GC-G---ATCA-AAA-AGCTC----AC-C-TGTGAGCCTT-CGGCT--C--A--GGTG-AGC--TGA-AAA
gi|70405 : GACACAAA-GT-G---ATCGGAAT-AACTC----GCAC-TG--AGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70438 : gatGACACGGG-GT-G---ATCAGAAT-AGTTC----AC-T-T-TAAGCTTT---GCA--C--A--GGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70419 : GATACAGG-GA-A---ATCAGAAT-AGCTC----AG-G-T-TGAGCTTT---ACT--C--A--GGTG-CGC--TAATAAA
gi|70308 : ataAG-CC-A---ATCAGAAT-ATCTC----AT-C-T-TAAACTTT---GCT--C--A--GGTG-AGT--TAA-AA
gi|70441 : acaacagaccataaaG-GC-G---ATCACAAT-AACTC----AC-C-TGTGAGCCTT-TGGCT--C--A--GGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70433 : acaaagG-GC-G---ATCACAAT-AACTC----AC-C-TGTCAGCCTT-CTGCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70437 : gaacaaagG-GC-A---ATCAAAAT-AGCTC----AA-C-T-TGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--T
gi|70443 : gacaaacttagG-GC-A---ATCAGAAT-AGCTC----AC-T-TTT-AGCTTT---GCT--C--A--GGTA-AGC--AAA-AAA
gi|70450 : aag-GC-G---ATCACAAT-TGCTC----AC-C-T-TGAGGTTT---ACT--C--A--GGTG-AAC--TAA-AA
gi|70444 : -GC-G---ATCAGAAT-AGTTC----AC-T-T-TGAGCTTT---ACT--C--A--GGTA-TGCT-TAA-AAA
gi|70314 : agtTCAGAAT-AGCTC----AC-A--ATGAGCTTT---GCT--C--A--GGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70259 : atggtgaatacaggggttCAAA-AGCTC----AC-A-GGTGAGCTTT-TG
gi|70281 : acgatagacaccaggcgatcaA-AGCTC----AC-C---TGAGCCAA-AGGCTCAC--A--GGTG-AGC--Tgctcaggtgagctaaaaa
gi|70263 : acgatggacaccaggcgatcataaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaa
gi|70268 : acgacggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCGA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70265 : acgacggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCGA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70296 : acgacggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70295 : acaacggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70292 : acgacggacaccaggtgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70290 : acgacggacaccaagcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70288 : acgacagacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70286 : acgacggacaccaggtgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70316 : acgaaggacactaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70283 : acgacggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--T
gi|70284 : acgatggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCGA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taataa
gi|70255 : acaacggacaccaggtgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCAA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70280 : acgatggacgacaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C---TGAGCCAA-AGGCT--CATA--GGTG-AGC--Taaaaa
gi|70266 : acgatggacaccagtcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCGA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70304 : acgaaggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C---TGAGCCAA-AGGCT--CATA--GGTG-AGC--Taataa
gi|70264 : acaatggacaccaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C---TGAGCCAA-AGGCT--C--AATGGTG-AGC--Ta
gi|70436 : atgacggacatcaggcgatcacaaa-AGCTC----AC-C-TG--AGCCGA-AGGCT--C--ACAGGTG-AGC--Taaaaa
gi|70287 : gacaacaggcgatcaaaa-AGCTC----AC-C-TG--AACCTT-AGGCT--C--A--AGTG-AGC--TAgaaaa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|70404 ): GATGGCAGACACAGGGTAATCAGAATAGCCCACCTTGAGCTCTGCTCAGTTGAGCTGAAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 1111
lowQualScore : 1 0 1 000 2 1 0000 0 0 2 0 0 1 0 3333 0 11 1
lowQualScore : . . . ... . . .... . . . . . . . .... . .. .
lowQualScore : 3 8 2 777 9 0 9999 4 8 5 8 4 3 4 9999 4 44 3
consensus : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
Reference ( family-172 ) : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70234 : ACGACAGACAA-AG-GC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGCT-TAA-AAA
gi|70236 : ACGACGGACAACAT-GC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70237 : ACGATGGACACAAG-GC-G---ATCAGAATAACTC----AA-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-CAA
gi|70238 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70239 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70240 : ACGACGGACAACAG-CC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70242 : ATGATAGACAACAG-GC-A---ATCCGAATAGCTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AGA
gi|70243 : ACAACAGACAACAT-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70244 : ATGACGAACACAGG-AC-G---ATCAGAATAACTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70245 : ATGACAGACAAAAA-AC-A---ATCAGAATAGTTC----CC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70246 : ACGACGGACATAGA-GT-G---ATTAAAATAGCTC-----T-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70247 : ATGACGGACAGCAG-GT-GGCAATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGTTG-AGC--TAA-AAA
gi|70249 : ATGACAGACACAGG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCCCAGGTG-AGC--T
gi|70250 : ACTACGGACAA-AGTGC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-A-TGT-AGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70251 : ACGATGGACAC-AG-GCCG---ATCAGAATAATTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-A
gi|70252 : ACGATAAACACAGG-GT-G---GTCTGAACAGCTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTT-AGC--TAA-AAA
gi|70253 : ACAACAAACAACAG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TCAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70254 : ACAATGGACACAAG-GC-A---ATCAGAATAACTC----AC-C--ACAAG-C-T-T-T-G--CTCAAGTG-AGC--TAA-GAA
gi|70255 : ACGATGGACGACAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70256 : ACGACGAACAA-AG-GTAG---ATCACAATAGCTC----AT-C-C-TGAG-C-T-A-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70257 : ATGACGGACACATG-GC-G---ATCAAAATAGCTC----A--C-TCTGAG-C-T-T-T---GCTCGGGTG-AGC--CAATAAA
gi|70259 : ACGATAGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-CTT-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70260 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAACAGCTC----AC-A-T-TCA--T-A-T-T-T-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AA
gi|70261 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAACAGCTC----AC-A-T-TCA--T-A-T-T-T-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AA
gi|70262 : ATGACGGATGACAG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTG-AGC--T
gi|70263 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70264 : ATGACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-ATTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70265 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70266 : ACGAAGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70267 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70268 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70269 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70270 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGCGAG-C-T-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70272 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCT-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70273 : ACGACGAACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70274 : ACGACAGACACGAG-GC-A---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-T-T-T-C-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70275 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAGTC-T-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70276 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAT-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70277 : ACGACGGACACAAG-GC-A---ATCAGAATAGATC----AC-A-TA-AAG-C-T-T-T---GTTCAGGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70278 : ACAATGGACACAGG-GT-T---ATCGGAATAGCTC----AC-C-T-TGTG-T-T-T-T---GCTCAGGTG-A
gi|70279 : ACGACGGACACAAG-GC-G---ATCACAAAAGTTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-ACTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70280 : ACGATGGACACCAG-TC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TATGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70281 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCATAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70282 : ACGACGGACAACCG-GC-G---ATCAGAATATCTC----AC-A-T-TGAA-C-T-T-T---GCTCA-GTGAAGC--TAA-
gi|70283 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70284 : ACAACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70285 : ACGACAGAGACTGA-GT-G---ATCAGAATAACTC----AC-C-T-TGAG-----T-T-T-GCTCAGGCG-AGC--TAA-AA
gi|70286 : ACGAAGGACACTAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70287 : ACGACGGACGAAAA-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-T---TGAG-C-C-TAA-G-GTTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70288 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70289 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-T-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70290 : ACGACAGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70291 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-A-TTTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70292 : ACGACGGACACCAA-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70293 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTT----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70294 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--AAA-AAA
gi|70295 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70296 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70297 : ACGATGGACAT-AG-GCCA---ATCAGAAGATCTC----AC-C-T-TGAG-C-C-T-T-ATGTTCAGGTG-AGT--CAA-
gi|70298 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGGA-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70299 : ATGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70300 : ATGATGGACACAGG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-CTTATGAC-T-C-C-T---GCTCAGGGG-AGT--TAA-AAA
gi|70301 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCC-GCTCAGGTA-AGT--TAA-AAA
gi|70302 : ATGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70303 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTT----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70304 : ACAATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TATGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TA
gi|70305 : ACGATGGACACCAG-GC-A---ATCACAAAAACTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAAGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70306 : ACAACGGACACAAG-GC-C---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAA-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70307 : ACAACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70308 : AG-CC-A---ATCAGAATATCTC----AT-C-T-TAAA-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGT--TAA-AA
gi|70309 : acaacagaccataaaACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGCG-AGC--TAA-CAA
gi|70311 : ACAATGGATACAAG-GT-G---ATCATAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-C-T-TTG-GCTCAGGAA-AAC--TAA-AA
gi|70314 : TCAGAATAGCTC----AC-A--ATGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70315 : atggtgaatacaggggttATGACGGACACAGG-GT-G---ATCACAAAATCTC----AC-C-TGTAAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AA
gi|70316 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--T
gi|70317 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAACTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAATAAA
gi|70393 : CGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70394 : CGACGAACACCAG-GC-G---ATCAAAAAAGCTC----AC-C-TGTGAGTC-T-T-T-G-GCTCAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70399 : GACAGACAAAAG-GT-G---ATCAGAATAACTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70400 : GACGGACA-AAGTGC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTG-AAT--TAA-AAA
gi|70402 : GACGGACAACAG-GC-G---ATCAGAAAAGCTG----AC-C-T-TGAA-T-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70403 : GATGGACACAGG-GT-G---ATCAGAATATATT----AC-C-TG-GAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC---AA-AAA
gi|70405 : GACACAAA-GT-G---ATCGGAATAACTC----GCAC-TG--AG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70406 : gatGATGGACAT--G-GT-G---ATGAGAATAGCTC----AC-TACATGAG-A-T-T-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AA
gi|70407 : GACGGACAACAT-GT-G---ATTAAAATATCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGTTG-AGCCATAA-AA
gi|70408 : GACAGAGAACGA-GC-A---ATTGGAAAAGCTC----AC-C--ATAAG-C-T-T-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70417 : gattACGGACACAGG-GC-A---ATCAGAATAGCTCTGACAC-C-T-TAAG-T-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70418 : ATGGACACAGG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T---TCAG-C-T-T-T---GCTCAAGT
gi|70419 : GATACAGG-GA-A---ATCAGAATAGCTC----AG-G-T-TGAG-C-T-T-T-A--CTCAGGTG-CGC--TAATAAA
gi|70431 : ataGGACAACAG-GC-C---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70432 : GGACACAGG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-TAT-T----CTCAGGTA-AGC--TAA-CAA
gi|70433 : G-GC-G---ATCACAATAACTC----AC-C-TGTCAG-C-C-T-TCT-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70436 : gaacaaagGACAACAG-GC-G---ATCA-AAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TGA-AAA
gi|70437 : G-GC-A---ATCAAAATAGCTC----AA-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--T
gi|70438 : gacaaacttagGACACGGG-GT-G---ATCAGAATAGTTC----AC-T-T-TAAG-C-T-T-T-G--CACAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70441 : G-GC-G---ATCACAATAACTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70443 : acaaagG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T-TTT-AG-C-T-T-T-G--CTCAGGTA-AGC--AAA-AAA
gi|70444 : aag-GC-G---ATCAGAATAGTTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTA-TGCT-TAA-AAA
gi|70450 : agt-GC-G---ATCACAATTGCTC----AC-C-T-TGAG-G-T-T-T---ACTCAGGTG-AAC--TAA-AA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|70404 ): GATGGCAGACACAGGGTAATCAGAATAGCCCACCTTGAGCTCTGCTCAGTTGAGCTGAAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 1111
lowQualScore : 1 0 1 000 1 1 0000 0 0 2 0 0 1 0 3333 0 11 1
lowQualScore : . . . ... . . .... . . . . . . . .... . .. .
lowQualScore : 3 8 2 777 0 4 9999 4 8 5 8 4 3 4 9999 4 44 3
consensus : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
Reference ( family-172 ) : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70234 : ACGACAGACAA-AG-GC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGCT-TAA-AAA
gi|70236 : ACGACGGACAACAT-GC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70237 : ACGATGGACACAAG-GC-G---ATCAGAATAACTC----AA-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-CAA
gi|70238 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70239 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70240 : ACGACGGACAACAG-CC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70242 : ATGATAGACAACAG-GC-A---ATCCGAATAGCTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AGA
gi|70243 : ACAACAGACAACAT-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70244 : ATGACGAACACAGG-AC-G---ATCAGAATAACTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70245 : ATGACAGACAAAAA-AC-A---ATCAGAATAGTTC----CC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70246 : ACGACGGACATAGA-GT-G---ATTAAAATAGCTC-----T-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70247 : ATGACGGACAGCAG-GT-GGCAATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGTTG-AGC--TAA-AAA
gi|70249 : ATGACAGACACAGG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCCCAGGTG-AGC--T
gi|70250 : ACTACGGACAA-AGTGC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-A-TGT-AGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70251 : ACGATGGACAC-AG-GCCG---ATCAGAATAATTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-A
gi|70252 : ACGATAAACACAGG-GT-G---GTCTGAACAGCTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTT-AGC--TAA-AAA
gi|70253 : ACAACAAACAACAG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TCAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70254 : ACAATGGACACAAG-GC-A---ATCAGAATAACTC----AC-C--ACAAG-C-T-T-T-G--CTCAAGTG-AGC--TAA-GAA
gi|70255 : ACGATGGACGACAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70256 : ACGACGAACAA-AG-GTAG---ATCACAATAGCTC----AT-C-C-TGAG-C-T-A-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70257 : ATGACGGACACATG-GC-G---ATCAAAATAGCTC----A--C-TCTGAG-C-T-T-T---GCTCGGGTG-AGC--CAATAAA
gi|70259 : ACGATAGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-CTT-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70260 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAACAGCTC----AC-A-T-TCA--T-A-T-T-T-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AA
gi|70261 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAACAGCTC----AC-A-T-TCA--T-A-T-T-T-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AA
gi|70262 : ATGACGGATGACAG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTG-AGC--T
gi|70263 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70264 : ATGACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-ATTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70265 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70266 : ACGAAGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70267 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70268 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70269 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70270 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGCGAG-C-T-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70272 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCT-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70273 : ACGACGAACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70274 : ACGACAGACACGAG-GC-A---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-T-T-T-C-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70275 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAGTC-T-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70276 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAT-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70277 : ACGACGGACACAAG-GC-A---ATCAGAATAGATC----AC-A-TA-AAG-C-T-T-T---GTTCAGGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70278 : ACAATGGACACAGG-GT-T---ATCGGAATAGCTC----AC-C-T-TGTG-T-T-T-T---GCTCAGGTG-A
gi|70279 : ACGACGGACACAAG-GC-G---ATCACAAAAGTTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-ACTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70280 : ACGATGGACACCAG-TC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TATGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70281 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCATAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70282 : ACGACGGACAACCG-GC-G---ATCAGAATATCTC----AC-A-T-TGAA-C-T-T-T---GCTCA-GTGAAGC--TAA-
gi|70283 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70284 : ACAACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70285 : ACGACAGAGACTGA-GT-G---ATCAGAATAACTC----AC-C-T-TGAG-----T-T-T-GCTCAGGCG-AGC--TAA-AA
gi|70286 : ACGAAGGACACTAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70287 : ACGACGGACGAAAA-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-T---TGAG-C-C-TAA-G-GTTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70288 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70289 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-T-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70290 : ACGACAGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70291 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-A-TTTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70292 : ACGACGGACACCAA-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70293 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTT----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70294 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--AAA-AAA
gi|70295 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70296 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70297 : ACGATGGACAT-AG-GCCA---ATCAGAAGATCTC----AC-C-T-TGAG-C-C-T-T-ATGTTCAGGTG-AGT--CAA-
gi|70298 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGGA-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70299 : ATGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70300 : ATGATGGACACAGG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-CTTATGAC-T-C-C-T---GCTCAGGGG-AGT--TAA-AAA
gi|70301 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCC-GCTCAGGTA-AGT--TAA-AAA
gi|70302 : ATGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70303 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTT----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70304 : ACAATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TATGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TA
gi|70305 : ACGATGGACACCAG-GC-A---ATCACAAAAACTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAAGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70306 : ACAACGGACACAAG-GC-C---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAA-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70307 : ACAACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70308 : AG-CC-A---ATCAGAATATCTC----AT-C-T-TAAA-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGT--TAA-AA
gi|70309 : acaacagaccataaaACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGCG-AGC--TAA-CAA
gi|70311 : ACAATGGATACAAG-GT-G---ATCATAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-C-T-TTG-GCTCAGGAA-AAC--TAA-AA
gi|70314 : TCAGAATAGCTC----AC-A--ATGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70315 : atggtgaatacaggggttATGACGGACACAGG-GT-G---ATCACAAAATCTC----AC-C-TGTAAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AA
gi|70316 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--T
gi|70317 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAACTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAATAAA
gi|70393 : CGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70394 : CGACGAACACCAG-GC-G---ATCAAAAAAGCTC----AC-C-TGTGAGTC-T-T-T-G-GCTCAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70399 : GACAGACAAAAG-GT-G---ATCAGAATAACTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70400 : GACGGACA-AAGTGC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTG-AAT--TAA-AAA
gi|70402 : GACGGACAACAG-GC-G---ATCAGAAAAGCTG----AC-C-T-TGAA-T-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70403 : GATGGACACAGG-GT-G---ATCAGAATATATT----AC-C-TG-GAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC---AA-AAA
gi|70405 : GACACAAA-GT-G---ATCGGAATAACTC----GCAC-TG--AG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70406 : gatGATGGACAT--G-GT-G---ATGAGAATAGCTC----AC-TACATGAG-A-T-T-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AA
gi|70407 : GACGGACAACAT-GT-G---ATTAAAATATCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGTTG-AGCCATAA-AA
gi|70408 : GACAGAGAACGA-GC-A---ATTGGAAAAGCTC----AC-C--ATAAG-C-T-T-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70417 : gattACGGACACAGG-GC-A---ATCAGAATAGCTCTGACAC-C-T-TAAG-T-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70418 : ATGGACACAGG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T---TCAG-C-T-T-T---GCTCAAGT
gi|70419 : GATACAGG-GA-A---ATCAGAATAGCTC----AG-G-T-TGAG-C-T-T-T-A--CTCAGGTG-CGC--TAATAAA
gi|70431 : ataGGACAACAG-GC-C---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70432 : GGACACAGG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-TAT-T----CTCAGGTA-AGC--TAA-CAA
gi|70433 : G-GC-G---ATCACAATAACTC----AC-C-TGTCAG-C-C-T-TCT-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70436 : gaacaaagGACAACAG-GC-G---ATCAAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TGA-AAA
gi|70437 : G-GC-A---ATCAAAATAGCTC----AA-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--T
gi|70438 : gacaaacttagGACACGGG-GT-G---ATCAGAATAGTTC----AC-T-T-TAAG-C-T-T-T-G--CACAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70441 : G-GC-G---ATCACAATAACTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70443 : acaaagG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T-TTT-AG-C-T-T-T-G--CTCAGGTA-AGC--AAA-AAA
gi|70444 : aag-GC-G---ATCAGAATAGTTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTA-TGCT-TAA-AAA
gi|70450 : agt-GC-G---ATCACAATTGCTC----AC-C-T-TGAG-G-T-T-T-A--CTCAGGTG-AAC--TAA-AA
blockSeqs : C C G T A T CGG CA T
blockSeqs : A A G T G T CGG T T
blockSeqs : C C G C C T CGG . T
blockSeqs : C . G C G T CAG . .
blockSeqs : C . G T G T CGG . .
blockSeqs : C . G T T T CTG . .
blockSeqs : C . G C G T CAG . .
blockSeqs : A . G T G T CGG . .
blockSeqs : A . G T G T CGA . .
blockSeqs : A . A T G T CGG . .
blockSeqs : C . G T G T CGG . .
blockSeqs : A . G T G T CGG . .
blockSeqs : A . G T G T ATG . .
blockSeqs : C . G T G T CAG . .
blockSeqs : A . G C G T CCG . .
blockSeqs : C . G T G T CGG . .
blockSeqs : A . G T G T TGG . .
blockSeqs : C . C A A T CTG . .
blockSeqs : A . C T G T CGG . .
blockSeqs : A . A T A T AT . .
blockSeqs : C . C A G T GG . .
blockSeqs : C . G C G T GG . .
blockSeqs : C . G C G T TG . .
blockSeqs : C . G T G T TG . .
blockSeqs : C . C A G T GG . .
blockSeqs : C . C A G T GG . .
blockSeqs : C . C A G A GG . .
blockSeqs : C . C A T T CG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : G . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . TG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : A . C A G . GG . .
blockSeqs : A . C A A . GG . .
blockSeqs : A . C A G . GG . .
blockSeqs : C . G T G . GG . .
blockSeqs : C . G T G . GG . .
blockSeqs : C . C A A . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . T A G . GG . .
blockSeqs : T . G T G . GG . .
blockSeqs : T . C A G . GG . .
blockSeqs : A . C A A . GG . .
blockSeqs : C . G T G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . G T G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A A . GG . .
blockSeqs : C . C A A . GG . .
blockSeqs : C . C A G . GG . .
blockSeqs : C . C A G . G . .
blockSeqs : A . C A G . G . .
blockSeqs : C . G G T . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : A . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : A . C A . . G . .
blockSeqs : A . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : C . G T . . G . .
blockSeqs : C . C A . . G . .
blockSeqs : C . T T . . G . .
blockSeqs : A . G T . . G . .
blockSeqs : A . C A . . G . .
blockSeqs : C . C A . . A . .
blockSeqs : A . C A . . G . .
blockSeqs : A . C A . . G . .
blockSeqs : C . A A . . G . .
blockSeqs : C . G T . . G . .
blockSeqs : A . G T . . G . .
blockSeqs : A . G A . . G . .
blockSeqs : A . G T . . G . .
blockSeqs : C . G T . . A . .
blockSeqs : A . G T . . G . .
blockSeqs : C . A T . . G . .
blockSeqs : G . G A . . G . .
blockSeqs : . . G T . . G . .
blockSeqs : . . G T . . G . .
blockSeqs : . . G T . . G . .
blockSeqs : . . G T . . G . .
blockSeqs : . . G T . . G . .
blockSeqs : . C T . . A .
blockSeqs : . A T . . G .
blockSeqs : . A T . . G .
blockSeqs : . G T . . G .
blockSeqs : . C T . . G .
blockSeqs : . G T . . A
blockSeqs : . G T . . A
blockSeqs : C . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
finalCons : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|70404 ): GATGGCAGACACAGGGTAATCAGAATAGCCCACCTTGAGCTCTGCTCAGTTGAGCTGAAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 1111
lowQualScore : 1 0 1 000 1 1 0000 0 0 2 0 0 1 0 3333 0 11 1
lowQualScore : . . . ... . . .... . . . . . . . .... . .. .
lowQualScore : 3 8 2 777 0 4 9999 4 8 5 8 4 3 4 9999 4 44 3
consensus : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
Reference ( family-172 ) : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCANAANAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70234 : ACGACAGACAA-AG-GC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGCT-TAA-AAA
gi|70236 : ACGACGGACAACAT-GC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70237 : ACGATGGACACAAG-GC-G---ATCAGAATAACTC----AA-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-CAA
gi|70238 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70239 : ACAACAGACAACAG-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70240 : ACGACGGACAACAG-CC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70242 : ATGATAGACAACAG-GC-A---ATCCGAATAGCTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AGA
gi|70243 : ACAACAGACAACAT-GC-A---ATCAGAACAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70244 : ATGACGAACACAGG-AC-G---ATCAGAATAACTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70245 : ATGACAGACAAAAA-AC-A---ATCAGAATAGTTC----CC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70246 : ACGACGGACATAGA-GT-G---ATTAAAATAGCTC-----T-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70247 : ATGACGGACAGCAG-GT-GGCAATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGTTG-AGC--TAA-AAA
gi|70249 : ATGACAGACACAGG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCCCAGGTG-AGC--T
gi|70250 : ACTACGGACAA-AGTGC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-A-TGT-AGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70251 : ACGATGGACAC-AG-GCCG---ATCAGAATAATTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-A
gi|70252 : ACGATAAACACAGG-GT-G---GTCTGAACAGCTC----AT-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTT-AGC--TAA-AAA
gi|70253 : ACAACAAACAACAG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TCAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70254 : ACAATGGACACAAG-GC-A---ATCAGAATAACTC----AC-C--ACAAG-C-T-T-T-G--CTCAAGTG-AGC--TAA-GAA
gi|70255 : ACGATGGACGACAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70256 : ACGACGAACAA-AG-GTAG---ATCACAATAGCTC----AT-C-C-TGAG-C-T-A-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70257 : ATGACGGACACATG-GC-G---ATCAAAATAGCTC----A--C-TCTGAG-C-T-T-T---GCTCGGGTG-AGC--CAATAAA
gi|70259 : ACGATAGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-CTT-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70260 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAACAGCTC----AC-A-T-TCA--T-A-T-T-T-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AA
gi|70261 : ACGACGGACACAGG-GC-G---ATCAGAACAGCTC----AC-A-T-TCA--T-A-T-T-T-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AA
gi|70262 : ATGACGGATGACAG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTG-AGC--T
gi|70263 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70264 : ATGACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-ATTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70265 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70266 : ACGAAGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70267 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70268 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70269 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70270 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGCGAG-C-T-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70272 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCT-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70273 : ACGACGAACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70274 : ACGACAGACACGAG-GC-A---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-T-T-T-C-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70275 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAGTC-T-T-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70276 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAT-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70277 : ACGACGGACACAAG-GC-A---ATCAGAATAGATC----AC-A-TA-AAG-C-T-T-T---GTTCAGGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70278 : ACAATGGACACAGG-GT-T---ATCGGAATAGCTC----AC-C-T-TGTG-T-T-T-T---GCTCAGGTG-A
gi|70279 : ACGACGGACACAAG-GC-G---ATCACAAAAGTTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-ACTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70280 : ACGATGGACACCAG-TC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TATGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70281 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCATAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TTA-AAA
gi|70282 : ACGACGGACAACCG-GC-G---ATCAGAATATCTC----AC-A-T-TGAA-C-T-T-T---GCTCA-GTGAAGC--TAA-
gi|70283 : ACGATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70284 : ACAACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70285 : ACGACAGAGACTGA-GT-G---ATCAGAATAACTC----AC-C-T-TGAG-----T-T-T-GCTCAGGCG-AGC--TAA-AA
gi|70286 : ACGAAGGACACTAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70287 : ACGACGGACGAAAA-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-T---TGAG-C-C-TAA-G-GTTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70288 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70289 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-T-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70290 : ACGACAGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70291 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-A-TTTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70292 : ACGACGGACACCAA-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70293 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTT----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70294 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--AAA-AAA
gi|70295 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70296 : ACAACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70297 : ACGATGGACAT-AG-GCCA---ATCAGAAGATCTC----AC-C-T-TGAG-C-C-T-T-ATGTTCAGGTG-AGT--CAA-
gi|70298 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGGA-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70299 : ATGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCA-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70300 : ATGATGGACACAGG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-CTTATGAC-T-C-C-T---GCTCAGGGG-AGT--TAA-AAA
gi|70301 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCC-GCTCAGGTA-AGT--TAA-AAA
gi|70302 : ATGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70303 : ACGACGGACACCAG-GT-G---ATCACAAAAGCTT----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70304 : ACAATGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TATGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TA
gi|70305 : ACGATGGACACCAG-GC-A---ATCACAAAAACTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAAGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70306 : ACAACGGACACAAG-GC-C---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAA-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70307 : ACAACGGACATCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70308 : AG-CC-A---ATCAGAATATCTC----AT-C-T-TAAA-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGT--TAA-AA
gi|70309 : acaacagaccataaaACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGCG-AGC--TAA-CAA
gi|70311 : ACAATGGATACAAG-GT-G---ATCATAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-C-T-TTG-GCTCAGGAA-AAC--TAA-AA
gi|70314 : TCAGAATAGCTC----AC-A--ATGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-TAA
gi|70315 : atggtgaatacaggggttATGACGGACACAGG-GT-G---ATCACAAAATCTC----AC-C-TGTAAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AA
gi|70316 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--T
gi|70317 : ACGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAACTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGC--TAATAAA
gi|70393 : CGACGGACACCAG-GC-G---ATCACAAAAGCTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70394 : CGACGAACACCAG-GC-G---ATCAAAAAAGCTC----AC-C-TGTGAGTC-T-T-T-G-GCTCAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70399 : GACAGACAAAAG-GT-G---ATCAGAATAACTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70400 : GACGGACA-AAGTGC-G---ATCAGAATAGCTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTG-AAT--TAA-AAA
gi|70402 : GACGGACAACAG-GC-G---ATCAGAAAAGCTG----AC-C-T-TGAA-T-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAA-
gi|70403 : GATGGACACAGG-GT-G---ATCAGAATATATT----AC-C-TG-GAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC---AA-AAA
gi|70405 : GACACAAA-GT-G---ATCGGAATAACTC----GCAC-TG--AG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70406 : gatGATGGACAT--G-GT-G---ATGAGAATAGCTC----AC-TACATGAG-A-T-T-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AA
gi|70407 : GACGGACAACAT-GT-G---ATTAAAATATCTC----AC-C-T-TGAG-C-T-T-T---GCTCAGTTG-AGCCATAA-AA
gi|70408 : GACAGAGAACGA-GC-A---ATTGGAAAAGCTC----AC-C--ATAAG-C-T-T-T-G--CTCAGATG-AGC--TAA-AAA
gi|70417 : gattACGGACACAGG-GC-A---ATCAGAATAGCTCTGACAC-C-T-TAAG-T-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70418 : ATGGACACAGG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T---TCAG-C-T-T-T---GCTCAAGT
gi|70419 : GATACAGG-GA-A---ATCAGAATAGCTC----AG-G-T-TGAG-C-T-T-T-A--CTCAGGTG-CGC--TAATAAA
gi|70431 : ataGGACAACAG-GC-C---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TAAG-C-T-T-T---GCTCAGGTG-AGC--TAT-AAA
gi|70432 : GGACACAGG-GT-G---ATCAGAATAGCTC----AC-C-T-TGAG-C-TAT-T----CTCAGGTA-AGC--TAA-CAA
gi|70433 : G-GC-G---ATCACAATAACTC----AC-C-TGTCAG-C-C-T-TCT-GCTCAGGTG-AGC--TAA-AAA
gi|70436 : gaacaaagGACAACAG-GC-G---ATCAAAA-AGCTC----AC-C-TGTGAG-C-C-T-TCG-GCTCAGGTG-AGC--TGA-AAA
gi|70437 : G-GC-A---ATCAAAATAGCTC----AA-C-T-TGAG-C-T-T-T-G--CTCAGGTG-AGC--T
gi|70438 : gacaaacttagGACACGGG-GT-G---ATCAGAATAGTTC----AC-T-T-TAAG-C-T-T-T-G--CACAGGTA-AGC--TAA-AAA
gi|70441 : G-GC-G---ATCACAATAACTC----AC-C-TGTGAG-C-CTT-T-G-GCTCAGGTG-AGT--TAA-AAA
gi|70443 : acaaagG-GC-A---ATCAGAATAGCTC----AC-T-TTT-AG-C-T-T-T-G--CTCAGGTA-AGC--AAA-AAA
gi|70444 : aag-GC-G---ATCAGAATAGTTC----AC-T-T-TGAG-C-T-T-T---ACTCAGGTA-TGCT-TAA-AAA
gi|70450 : agt-GC-G---ATCACAATTGCTC----AC-C-T-TGAG-G-T-T-T-A--CTCAGGTG-AAC--TAA-AA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|70404 ): GATGGCAGACACAGGGTAATCAGAATAGCCCACCTTGAGCTCTGCTCAGTTGAGCTGAAA