lowQualScore : 1111111111
lowQualScore : 00 222222222 0000 0 0 11 8888888888 0 000 00 2222 000 55 00 0 2
lowQualScore : .. ......... .... . . .. .......... . ... .. .... ... .. .. . .
lowQualScore : 66 555555555 9999 8 4 55 6666666666 4 777 66 7777 777 99 66 4 6
consensus : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAGG
Reference ( gi|144839 ) : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------C---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAAG
gi|144843 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TG---TC--AAAGCAATT----CCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAA-AAAGAACATTTAG
gi|144834 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AGAGCAATT----TCCTT---GATATTTGG-ACTTGA--ATAAC-AAAGAACATTTAGcta
gi|144851 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------T---G-TA---TC--AAAGCAATT----TTTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAA-AAAGAACATTTAataacattg
gi|144833 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------T---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ACTTGA--AAAAG-AAAGAACg
gi|144848 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---AC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAAAATTTAGttataggataacaatgacca
gi|144855 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG-AGActa
gi|144867 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------T---G-TA---TC--AAAGGAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAGCACTattaggtaa
gi|144849 : CACTTTAC--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AGAGAACATTT
gi|144845 : CATTTCAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAA-GAAGAGCATTTAGggactaa
gi|144857 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TT--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATACA-CAAGAATA-TTAAgt
gi|144846 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAGAA------A---T-TT---TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAgctatataaaataac
gi|144891 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------T---G-TA---TC--AAAGCAATT----TTCTT---AAAACTTGA-ACTGGA--TTAAG-AAAGAACATTTg
gi|144874 : CATTTTAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------G---G-TA---TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACATTT
gi|144838 : CATACTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA----------G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGGCATTTcggcta
gi|144906 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------T-----TA---TC--GAAGTAATT----TCTCT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAG-AATGAACATTTAAcggataacaatgatca
gi|144863 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---T---AAAGCAATT----TCCTT---GAAAGTTTG-ACCTGA--ATAAC-AAAGAACATTTAGtta
gi|144866 : CATTTGTT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--GAAGCAATT----TCATT---GAAATTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGACATTTAGcta
gi|144887 : CATTTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--CAAAA------T---G-TA---TC--AAAGCAATA----ACCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--ACAAG-AAAGAACATTTAGtta
gi|144841 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TT--AAAGCAATC----TGCAT---GAAATGTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAGctgtgcaatg
gi|144844 : CATTTTAT--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA----------G-TA---TT--AAGG-AATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAtta
gi|144835 : CATTTTAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TTTTT---GGAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAATATTgtatgacaatgacca
gi|144850 : CATTTTGT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----ACCAT---GAAGTTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATATTTgaggataacaatgacca
gi|144868 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---A-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTGA-CCTTCA--ATAGG-AAAGAGCATTTAG
gi|144873 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CCAAA------A---A-TA---TG--AAAGCAATT----TTCCT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AATGAACA-TTAActa
gi|144836 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTTT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-TTAAgctaa
gi|144853 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------AA--G-TA---TC--AAAGCAATT----ACCTT---TAACTTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATATTTAGgataa
gi|144883 : CATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CGAAA------A---G-TA---CC--GAAGCAATT----TTCTT---GCAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACACTcta
gi|144840 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAC------A---G-TA---TA--AAAGCAATT----TTCTT---AAAATTCGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATATT
gi|144886 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAACAATT----TCTTT---GAAGTTTGG-GCTTTA--ATAAG-AAAAAACATTTaatgataacaatgacca
gi|144892 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATTAC-AATGAACATTcggcaatg
gi|144878 : CATTTTAT--ATA---------TTG----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TT--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTTA-ACCTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAG
gi|144842 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAGA------A---G-TA---TC--AAAGAAACA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGAATATAAG-AAAAAACATTTAGtta
gi|144832 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-T-T--CAAAA------AA--G-CA---TC--AAAGCAATA----TCCTT---GACATTTGG-ACCTAA--ATAAG-AAAGAACATTTAGaaaacaatga
gi|144858 : CAGTTTAC--GGA---------TTT----T-C-T--CAAAA------C---G-CA---TT--AAAGTAATA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-TTAAataacaatgacca
gi|144895 : CATTTCAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TT--GAAGCAAGT----TCTTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAAgaaaacagtgac
gi|144885 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-TAT--CAAAA------G---A-TA---TC--ATAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTGGA--ATAAG-AAAG-ACATTTAG
gi|144854 : CATTTTAA--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTCGG-ACTCAA--ATAAG-GAAGACCACTCAG
gi|144896 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-T--CAAAA------A---G-TA---TA--AAAGCAATT----GCCTT---GAACTTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACACT
gi|144897 : CATTATAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA----------G-TA---TC--AAATCAATT----TCCAT---GAAATTTGC-ACTTGA--ATAAG-AAATAACATTTAGgttaggtaaaat
gi|144862 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAGGA----------A-TA---TT--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-TTTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAGtta
gi|144894 : CATTTTAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TT---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATCAA-TAAGAGCATTT
gi|144884 : CATTTTAT--ATG---------TTG----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAATGTGT-ACCTGA--ATAAG-AAAGATCATTTAGgg
gi|144872 : CATTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAACTTTT----TTCTT---AAAATTTGG-GCTTTA--ATGAG-AAAGAACTTTTAActa
gi|144861 : CATTTTAT--GTACCTGAATTTTCT----T-C-T--CAAAA------A---G-CA---TT--AAAGCAATT----TCCGT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACACTTAGataataatga
gi|144869 : CATTGTAT--AGA---------TTT----T-T-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---TAAATTTAA-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACATTCAGttatataaca
gi|144890 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAT------A---G-TT---CC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACATGA--ATAAG-AAATAACATATAGcta
gi|144875 : CATTTTAT--GTG---------TCT----T-C-T--CAAAA------A---A-TA---AC--AAAGTAATT----TCTTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATATTTAGcta
gi|144899 : CATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---C-TA---GT--GAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGT--ATAAG-TAAGAACATTTAGata
gi|144893 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TA--AAAGCAATT----TCATT---GTCATATGG-ACTTGA--AGAAG-AAAGAACATTTAGtta
gi|144882 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA------A---G-AA---TC--CAAGTAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATATTTttaa
gi|144877 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA------A---G-CA---CC--AAAGCAATT----TATTT---GAAATTTGA-ACTTGA--ATAAA-AAAGACCACTtggtta
gi|144902 : CACTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CTAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGT-ACTAGA--ATAAA-ATAGAACGTTTAG
gi|144852 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA------G---G-CT---TC--AAAGCAATT----TCTTT---AAAATTTTC-ACTTAA--ATAAGAAAAGAACATTTAGctacataaaataac
gi|144859 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------AAA-G-TT---CC--AAAGCAATT----TTCAT---GAAATTTAA-ACTTGG--ATAAG-AAAGAATATTTAA
gi|144898 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--CGAGTGATT----TCTTA---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-ACAGAATATTataacaataa
gi|144889 : CATTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CATAA------A---G-AA---TC--AAAGCAACT----TTCTT---GATATTTGA-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACGTTTAG
gi|144881 : CATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-AA---TC--AATGCAATT----TCCTT---TAAATTTAG-ATTTAA--ATGAG-AAAGAACAttaa
gi|144904 : CAGTTTAT--ATA---------ATT----T-C-T--CAAAT------A---A-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GATATTTAG-ACTTGA--ATGCG-AAAGAACATTTAG
gi|144870 : CATTTTAT--GTACGTA-----TTT----T-C-A--CAAAA------A---GGTG---TC--ACAGCAATT----TCTTT---AAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-AAAAAACATTTAGgta
gi|144903 : CATTATAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAAA------A---A-TG---AC--AAACCAATTAATTTCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTActacaa
gi|144880 : CATTTTAG--GTA---------TTT----T-T-TA-TAAAA------G---G-T----TT--AAGGCAATT----CCCTT---GAAATGTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAG
gi|144900 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A------A---ACAAAAAACAATT----TCCTT---GAAATTTGG-AAATGA--ATAAG-AAAGAACACT
gi|144888 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA------A---C-TA---CT--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTAAA--ATAAT-GAAGAGCTTTTAG
gi|144876 : CATTTGAT--ATA---------TTT----T-A-T--AAAAA------AAGAG-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAATTTTGG-ACTTAA--ATAAA-AGAGAACATTTtta
gi|144901 : CATTTAAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------AA--G-GA---TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATAT----CTTGA--ATAAG-AGAGAACATTTAG
gi|144864 : CGTTCTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CTAAA------A---G-TA---TC--AAAGC-ATT----TCTTTTTAGAAATTTGG-ACTTGA--AT-----AAGAACATTTActatataaaatga
gi|144905 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--AAGAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----CCCAT---GGAATTTTG-ACTTGA--ATCAG-AAAGAACAGTTtgataacaatgacca
gi|144837 : CATTTTAT--GTG---------TTT----G-C-T--TTAAA------A---G-CA---TC--AAAGAAATT----TCCTT---AAAATTTGG-ATTTGA--A-AAA-AAACAACAtggataa
gi|144980 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-GA---TC--AAAACAATT----TCCTT---GAAATTTCG-GCTTGA--ATAAG-AACGAACATTTAGacattaagataacaatgacca
gi|144981 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGG--ATAAG-AAGGAACATTTAtta
gi|144985 : ATTTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGTAATT----TCCTT---TAAATTTGG-ACTTGA--ACTAG-AAAGAACATTT
gi|144987 : ATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-GAAGTACATcggcta
gi|144975 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TG---TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTAG-CCTTTA--GTAAG-AAAGAGCATTTAG
gi|144989 : ATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA----C--AAAGCAATT----TCCTT---GACATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAAAAaaaacaatgacca
gi|144986 : ATCTTAT--ATA---------TCTAACAT-T-T--TAAA-----------G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAGacaaaaacattaaagatacaacaacaac
gi|144992 : ATTTAAC--GTA---------TCA----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGC--ATAAG-AAAAAACATTTAAtta
gi|144976 : ATTTTAT--GTA---------TTT------C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--AGAGCAATT----TCCTT----AAATTTGG-AC------ATAAG-AAAGAACATTTAacaataa
gi|144993 : ATTGCAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TG---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ATTTAA--ATAAG-AAAGAACGTTgaataacaatgacta
gi|144977 : ATGTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAAAAAACAC---A-CAACTTC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGA--ATTAG-AAAGAACATTTAG
gi|144988 : ATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CAAAA------A---A-CA---TC--AAAGCAATTA---TC--T---GAAATTTGG-ACTTAG--ATAAG-GAAAAACATTTAataacaatga
gi|144978 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-CA---TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAAC-TTTAAg
gi|144979 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-CA---TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-AATTAA--ATAAG-AAAGAAC-TTTAAtgataacaatgacc
gi|144982 : ATTTTAG--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA----------------------AAGTAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTAA--ATAAG-TAAGAACAGTTAGtgataacaatgacc
gi|144990 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TTACAAAA------A---G-CA---TT--AAAGCTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACATTTAAataacaatgacca
gi|144991 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TAACAAAA------A---G-CA---TT--AAAGTTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACATTTAAataatactgacca
gi|144984 : ATTTTATTCATA---------TTT----T-T-A--AAAAA------A---G-CA---TC--AAGGCAATA----TCCTT---GAAATTTTG-ATTTAA--ATACA-AAAATACATTCAGataatactgacca
gi|145009 : TTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TT--AAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAACATTTAataacactgacca
gi|145010 : TTTTAT--GCA---------TTT----T-T-T--TAAAA------A---G-TA---TC--AAAGACATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAGGAAC-TTTGAg
gi|145012 : TTGTAT--GTG---------TTT----T-C-T--CAAAT------A---G-TA---TC--CAGGAAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATTAG-AAAGAACATTTAGgctataacaat
gi|145011 : TTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---A-TA---AA--AAAGCATTT----TCATT---GAAATCTGG-ACTTAA--AGAAG-AAAGAACATTTAGcta
gi|145026 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---T-TG---TC--AAAGCAATT----GTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAA--AAAGAACATTT
gi|145023 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---A-TA---TC--AAAACAATT----TCCCT---GAAATTTGG-ACTTCA--ATAA--AAAGAGCATTTAtggcta
gi|145027 : TTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--AAAAA------A---G-TA---TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--AAAAG-AAAGAACGTCTAtgctataa
gi|145024 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA------A---G-TA---CC--AAATCAATT----TTCTT---AAAATTAGG-CCTTAA--AAAAA-AAAGAACTTTTAG
gi|145025 : TTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CTAAA------G---G-AA---TC--AAAGAAATT----GTCAT---GACATTT-A-GCTTGG--ATAAG-AAAGAACATTTAGataacacagacca
gi|145037 : TAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA------A---A-TA---TC--GAAGCAATT----TCATT---GTAATCTGGAATTTGT--ATGAG-AACGAACATTTAGataacaatgacca
gi|145041 : AT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA------C---A-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--GTAAG-AAGGAACAATTAataataatggcca
gi|145046 : --GTA---------TTT----C-C-T--GAAAA------A---G-TA---TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTTA--ATAAA-AAAGAACATTTAGgaaaaacaataacca
gi|145047 : ---------TTT----T-C-T--CAAAA------A---G-TA---TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACATTTAtta
Alignments
lowQualScore : 00 222222222 0000 0 0 11 0 222 0 111111111 00 2222 000 0 00 0 0 00
lowQualScore : .. ......... .... . . .. . ... . ......... .. .... ... . .. . . ..
lowQualScore : 66 555555555 9999 8 4 55 4 111 4 666666666 66 6666 777 4 55 4 4 66
consensus : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
Reference ( family-170 ) : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144832 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-T-T--CAAAA-AA--G-CA---------TC--AAAGCAATA----TCCTT---GACATTTGG-ACCTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144833 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ACTTGA--AAAAG-AAAGAACT-T--ATAGGataacaatgacca
gi|144834 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AGAGCAATT----TCCTT---GATATTTGG-ACTTGA--ATAAC-AAAGAACA-T--TTAGGataacaatgacca
gi|144835 : CATTTTAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTTTT---GGAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAATA-T--TGAGGataacattg
gi|144836 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTTT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TAAGGataacaatgacca
gi|144837 : CATTTTAT--GTG---------TTT----G-C-T--TTAAA-A---G-CA---------TC--AAAGAAATT----TCCTT---AAAATTTGG-ATTTGA--A-AAA-AAACAACA-ataa
gi|144838 : CATACTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGGCA-T--TTCGGacattaagataacaatgacca
gi|144839 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-C---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAAGataacaatgatca
gi|144840 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAC-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----TTCTT---AAAATTCGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--T
gi|144841 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATC----TGCAT---GAAATGTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGaatgataacaatgacca
gi|144842 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAGA-A---G-TA---------TC--AAAGAAACA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGAATATAAG-AAAAAACA-T--TTAGGtta
gi|144843 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TC--AAAGCAATT----CCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAA-AAAGAACA-T--TTAGGaaaacaatga
gi|144844 : CATTTTAT--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA-----G-TA---------TT--AAGG-AATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGcta
gi|144845 : CATTTCAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAA-GAAGAGCA-T--TTAGGtatgacaatgacca
gi|144846 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAGAA-A---T-TT---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGgt
gi|144848 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------AC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAAAA-T--TTAGG
gi|144849 : CACTTTAC--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AGAGAACA-T--TTGGcta
gi|144850 : CATTTTGT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----ACCAT---GAAGTTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--TTactaa
gi|144851 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAA-AAAGAACA-T--TTAG
gi|144852 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-G---G-CT---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---AAAATTTTC-ACTTAA--ATAAGAAAAGAACA-T--TTAGG
gi|144853 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAAAA---G-TA---------TC--AAAGCAATT----ACCTT---TAACTTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--TTAGG
gi|144854 : CATTTTAA--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTCGG-ACTCAA--ATAAG-GAAGACCA-C--TCAGGcta
gi|144855 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG---AGAA------TTAGG
gi|144857 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATACA-CAAGAATA-T--TAAGGtaa
gi|144858 : CAGTTTAC--GGA---------TTT----T-C-T--CAAAA-C---G-CA---------TT--AAAGTAATA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-T--TAAGGctatataaaataac
gi|144859 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-AAA-G-TT---------CC--AAAGCAATT----TTCAT---GAAATTTAA-ACTTGG--ATAAG-AAAGAATA-T--TTAAGaaaacagtgac
gi|144861 : CATTTTAT--GTACCTGAATTTTCT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGCAATT----TCCGT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACA-C--TTAGGataacaataa
gi|144862 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T---AAGG-A---A-TA---------TT--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-TTTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGttatataaca
gi|144863 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------T---AAAGCAATT----TCCTT---GAAAGTTTG-ACCTGA--ATAAC-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144864 : CGTTCTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CTAAA-A---G-TA---------TC--AAAGC-ATT----TCTTTTTAGAAATTTGG-ACTTGA--AT-----AAGAACA-T--TTActa
gi|144866 : CATTTGTT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCATT---GAAATTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGACA-T--TTAGGtgataacaatgacca
gi|144867 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGGAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAGCA-C--Ttta
gi|144868 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTGA-CCTTCA--ATAGG-AAAGAGCA-T--TTAGG
gi|144869 : CATTGTAT--AGA---------TTT----T-T-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---TAAATTTAA-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TCAGGcta
gi|144870 : CATTTTAT--GTACGTA-----TTT----T-C-A--CAAAA-A---GGTG---------TC--ACAGCAATT----TCTTT---AAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-AAAAAACA-T--TTAGGcta
gi|144872 : CATTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAACTTTT----TTCTT---AAAATTTGG-GCTTTA--ATGAG-AAAGAACT-T--TTAAGctacaa
gi|144873 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CCAAA-A---A-TA---------TG--AAAGCAATT----TTCCT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AATGAACA-T--TAAGGataataatga
gi|144874 : CATTTTAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-G---G-TA---------TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTCGGctaa
gi|144875 : CATTTTAT--GTG---------TCT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------AC--AAAGTAATT----TCTTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATA-T--TTAGGcta
gi|144876 : CATTTGAT--ATA---------TTT----T-A-T--AAAAA-AAGAG-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAATTTTGG-ACTTAA--ATAAA-AGAGAACA-T--TTata
gi|144877 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-CA---------CC--AAAGCAATT----TATTT---GAAATTTGA-ACTTGA--ATAAA-AAAGACCA-C--T
gi|144878 : CATTTTAT--ATA---------TTG----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTTA-ACCTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144880 : CATTTTAG--GTA---------TTT----T-T-TA-TAAAA-G---G-T----------TT--AAGGCAATT----CCCTT---GAAATGTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGtta
gi|144881 : CATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-AA---------TC--AATGCAATT----TCCTT---TAAATTTAG-ATTTAA--ATGAG-AAAGAACA-
gi|144882 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-AA---------TC--CAAGTAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATA-T--TTTGG
gi|144883 : CATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CGAAA-A---G-TA---------CC--GAAGCAATT----TTCTT---GCAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-C--Ttta
gi|144884 : CATTTTAT--ATG---------TTG----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAATGTGT-ACCTGA--ATAAG-AAAGATCA-T--TTAGG
gi|144885 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-TAT--CAAAA-G---A-TA---------TC--ATAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTGGA--ATAAG-AAAG-ACA-T--TTAGGcta
gi|144886 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAACAATT----TCTTT---GAAGTTTGG-GCTTTA--ATAAG-AAAAAACA-T--TTCGG
gi|144887 : CATTTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATA----ACCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--ACAAG-AAAGAACA-T--TTAGGcaatg
gi|144888 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---C-TA---------CT--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTAAA--ATAAT-GAAGAGCT-T--TTAGGctgtgcaatg
gi|144889 : CATTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CATAA-A---G-AA---------TC--AAAGCAACT----TTCTT---GATATTTGA-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACG-T--TTAGGtta
gi|144890 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAT-A---G-TT---------CC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACATGA--ATAAG-AAATAACA-T--ATAGGttaa
gi|144891 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTCTT---AAAACTTGA-ACTGGA--TTAAG-AAAGAACA-T--TTcta
gi|144892 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATTAC-AATGAACA-T--T
gi|144893 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----TCATT---GTCATATGG-ACTTGA--AGAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144894 : CATTTTAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TT---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATCAA-TAAGAGCA-T--TTGGttaa
gi|144895 : CATTTCAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--GAAGCAAGT----TCTTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAA
gi|144896 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-T--CAAAA-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----GCCTT---GAACTTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-CTGTTAGG
gi|144897 : CATTATAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----G-TA---------TC--AAATCAATT----TCCAT---GAAATTTGC-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-T--TTAGGtaaaat
gi|144898 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--CGAGTGATT----TCTTA---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-ACAGAATA-T--Ttta
gi|144899 : CATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---C-TA---------GT--GAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGT--ATAAG-TAAGAACA-T--TTAGG
gi|144900 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A------A---------ACAAAAAACAATT----TCCTT---GAAATTTGG-AAATGA--ATAAG-AAAGAACA-C--Ttta
gi|144901 : CATTTAAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-AA--G-GA---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATAT----CTTGA--ATAAG-AGAGAACA-T--TTAGG
gi|144902 : CACTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CTAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGT-ACTAGA--ATAAA-ATAGAACG-T--TTAGGctatataaaatga
gi|144903 : CATTATAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAAA-A---A-TG---------AC--AAACCAATTAATTTCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTActacataaaataac
gi|144904 : CAGTTTAT--ATA---------ATT----T-C-T--CAAAT-A---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GATATTTAG-ACTTGA--ATGCG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144905 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--AAGAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----CCCAT---GGAATTTTG-ACTTGA--ATCAG-AAAGAACAGT--TTGGgta
gi|144906 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----T-TA---------TC--GAAGTAATT----TCTCT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAG-AATGAACA-T--TTAAGataa
gi|144975 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTAG-CCTTTA--GTAAG-AAAGAGCA-T--TTAGGtta
gi|144976 : ATTTTAT--GTA---------TTT------C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AGAGCAATT----TCCTT----AAATTTGG-AC------ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGaaaacaatgacca
gi|144977 : ATGTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---A-AACACACAACTTC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGA--ATTAG-AAAGAACA-T--TTAGGaataacaatgacta
gi|144978 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAAC--T--TTAataacaatga
gi|144979 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-AATTAA--ATAAG-AAAGAAC--T--TTAatgataacaatgacc
gi|144980 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-GA---------TC--AAAACAATT----TCCTT---GAAATTTCG-GCTTGA--ATAAG-AACGAACA-T--TTAGGatgataacaatgacc
gi|144981 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGG--ATAAG-AAGGAACA-T--TTAtta
gi|144982 : ATTTTAG--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA-A----------------------AGTAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTAA--ATAAG-TAAGAACA-G--TTAGG
gi|144984 : ATTTTATTCATA---------TTT----T-T-A--AAAAA-A---G-CA---------TC--AAGGCAATA----TCCTT---GAAATTTTG-ATTTAA--ATACA-AAAATACA-T--TCAGGataacaatgacca
gi|144985 : ATTTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---TAAATTTGG-ACTTGA--ACTAG-AAAGAACA-T--TTCGGataacactgacca
gi|144986 : ATCTTAT--ATA---------TCTAACAT-T-T--TAAA------G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGcta
gi|144987 : ATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-GAAGTACA-T--tta
gi|144988 : ATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CAAAA-A---A-CA---------TC--AAAGCAATTA---TC--T---GAAATTTGG-ACTTAG--ATAAG-GAAAAACA-T--TTAG
gi|144989 : ATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA----------C--AAAGCAATT----TCCTT---GACATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAAAA
gi|144990 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TTACAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGCTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTAAGacaaaaacattaaagatacaacaacaac
gi|144991 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TAACAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGTTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTAAGataatactgacca
gi|144992 : ATTTAAC--GTA---------TCA----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGC--ATAAG-AAAAAACA-T--TTAAGataatactgacca
gi|144993 : ATTGCAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ATTTAA--ATAAG-AAAGAACG-T--Tacaataa
gi|145009 : TTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAACA-T--TTAG
gi|145010 : TTTTAT--GCA---------TTT----T-T-T--TAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGACATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAGGAACT-T--TGAGG
gi|145011 : TTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------AA--AAAGCATTT----TCATT---GAAATCTGG-ACTTAA--AGAAG-AAAGAACA-T--TTAGGctataacaat
gi|145012 : TTGTAT--GTG---------TTT----T-C-T--CAAAT-A---G-TA---------TC--CAGGAAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATTAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|145023 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------TC--AAAACAATT----TCCCT---GAAATTTGG-ACTTCA--ATAA--AAAGAGCA-T--TTActa
gi|145024 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-TA---------CC--AAATCAATT----TTCTT---AAAATTAGG-CCTTAA--AAAAA-AAAGAACT-T--TTAGGtgctataa
gi|145025 : TTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CTAAA-G---G-AA---------TC--AAAGAAATT----GTCAT---GACATTTAG--CTTGG--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGataacacagacca
gi|145026 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---T-TG---------TC--AAAGCAATT----GTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAA--AAAGAACA-T--TTTGGataacaatgacca
gi|145027 : TTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--AAAAG-AAAGAACG-T--CTActa
gi|145037 : TAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---A-TA---------TC--GAAGCAATT----TCATT---GTAATCTGGAATTTGT--ATGAG-AACGAACA-T--TTAGG
gi|145041 : AT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA-C---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--GTAAG-AAGGAACA-A--TTAGataataatggcca
gi|145046 : --GTA---------TTT----C-C-T--GAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTTA--ATAAA-AAAGAACA-T--TTAGGaaaaacaataacca
gi|145047 : ---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAtta
Alignments
lowQualScore : 00 222222222 0000 0 0 11 0 222 0 111111111 00 2222 000 0 00 0 0 00
lowQualScore : .. ......... .... . . .. . ... . ......... .. .... ... . .. . . ..
lowQualScore : 66 555555555 9999 8 4 55 4 111 4 666666666 66 6666 777 4 55 4 4 66
consensus : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
Reference ( family-170 ) : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144832 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-T-T--CAAAA-AA--G-CA---------TC--AAAGCAATA----TCCTT---GACATTTGG-ACCTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144833 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ACTTGA--AAAAG-AAAGAACT-T--ATAGGataacaatgacca
gi|144834 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AGAGCAATT----TCCTT---GATATTTGG-ACTTGA--ATAAC-AAAGAACA-T--TTAGGataacaatgacca
gi|144835 : CATTTTAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTTTT---GGAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAATA-T--TGAGGataacattg
gi|144836 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTTT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TAAGGataacaatgacca
gi|144837 : CATTTTAT--GTG---------TTT----G-C-T--TTAAA-A---G-CA---------TC--AAAGAAATT----TCCTT---AAAATTTGG-ATTTGA--A-AAA-AAACAACA-ataa
gi|144838 : CATACTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGGCA-T--TTCGGacattaagataacaatgacca
gi|144839 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-C---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAAGataacaatgatca
gi|144840 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAC-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----TTCTT---AAAATTCGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--T
gi|144841 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATC----TGCAT---GAAATGTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGaatgataacaatgacca
gi|144842 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAGA-A---G-TA---------TC--AAAGAAACA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGAATATAAG-AAAAAACA-T--TTAGGtta
gi|144843 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TC--AAAGCAATT----CCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAA-AAAGAACA-T--TTAGGaaaacaatga
gi|144844 : CATTTTAT--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA-----G-TA---------TT--AAGG-AATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGcta
gi|144845 : CATTTCAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAA-GAAGAGCA-T--TTAGGtatgacaatgacca
gi|144846 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAGAA-A---T-TT---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGgt
gi|144848 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------AC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAAAA-T--TTAGG
gi|144849 : CACTTTAC--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AGAGAACA-T--TTGGcta
gi|144850 : CATTTTGT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----ACCAT---GAAGTTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--TTactaa
gi|144851 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAA-AAAGAACA-T--TTAG
gi|144852 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-G---G-CT---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---AAAATTTTC-ACTTAA--ATAAGAAAAGAACA-T--TTAGG
gi|144853 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAAAA---G-TA---------TC--AAAGCAATT----ACCTT---TAACTTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--TTAGG
gi|144854 : CATTTTAA--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTCGG-ACTCAA--ATAAG-GAAGACCA-C--TCAGGcta
gi|144855 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG---AGAA------TTAGG
gi|144857 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATACA-CAAGAATA-T--TAAGGtaa
gi|144858 : CAGTTTAC--GGA---------TTT----T-C-T--CAAAA-C---G-CA---------TT--AAAGTAATA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-T--TAAGGctatataaaataac
gi|144859 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-AAA-G-TT---------CC--AAAGCAATT----TTCAT---GAAATTTAA-ACTTGG--ATAAG-AAAGAATA-T--TTAAGaaaacagtgac
gi|144861 : CATTTTAT--GTACCTGAATTTTCT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGCAATT----TCCGT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACA-C--TTAGGataacaataa
gi|144862 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T---AAGG-A---A-TA---------TT--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-TTTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGttatataaca
gi|144863 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------T---AAAGCAATT----TCCTT---GAAAGTTTG-ACCTGA--ATAAC-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144864 : CGTTCTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CTAAA-A---G-TA---------TC--AAAGC-ATT----TCTTTTTAGAAATTTGG-ACTTGA--AT-----AAGAACA-T--TTActa
gi|144866 : CATTTGTT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCATT---GAAATTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGACA-T--TTAGGtgataacaatgacca
gi|144867 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGGAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAGCA-C--Ttta
gi|144868 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTGA-CCTTCA--ATAGG-AAAGAGCA-T--TTAGG
gi|144869 : CATTGTAT--AGA---------TTT----T-T-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---TAAATTTAA-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TCAGGcta
gi|144870 : CATTTTAT--GTACGTA-----TTT----T-C-A--CAAAA-A---GGTG---------TC--ACAGCAATT----TCTTT---AAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-AAAAAACA-T--TTAGGcta
gi|144872 : CATTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAACTTTT----TTCTT---AAAATTTGG-GCTTTA--ATGAG-AAAGAACT-T--TTAAGctacaa
gi|144873 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CCAAA-A---A-TA---------TG--AAAGCAATT----TTCCT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AATGAACA-T--TAAGGataataatga
gi|144874 : CATTTTAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-G---G-TA---------TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTCGGctaa
gi|144875 : CATTTTAT--GTG---------TCT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------AC--AAAGTAATT----TCTTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATA-T--TTAGGcta
gi|144876 : CATTTGAT--ATA---------TTT----T-A-T--AAAAA-AAGAG-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAATTTTGG-ACTTAA--ATAAA-AGAGAACA-T--TTata
gi|144877 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-CA---------CC--AAAGCAATT----TATTT---GAAATTTGA-ACTTGA--ATAAA-AAAGACCA-C--T
gi|144878 : CATTTTAT--ATA---------TTG----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTTA-ACCTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144880 : CATTTTAG--GTA---------TTT----T-T-TA-TAAAA-G---G-T----------TT--AAGGCAATT----CCCTT---GAAATGTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGtta
gi|144881 : CATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-AA---------TC--AATGCAATT----TCCTT---TAAATTTAG-ATTTAA--ATGAG-AAAGAACA-
gi|144882 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-AA---------TC--CAAGTAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATA-T--TTTGG
gi|144883 : CATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CGAAA-A---G-TA---------CC--GAAGCAATT----TTCTT---GCAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-C--Ttta
gi|144884 : CATTTTAT--ATG---------TTG----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAATGTGT-ACCTGA--ATAAG-AAAGATCA-T--TTAGG
gi|144885 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-TAT--CAAAA-G---A-TA---------TC--ATAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTGGA--ATAAG-AAAG-ACA-T--TTAGGcta
gi|144886 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAACAATT----TCTTT---GAAGTTTGG-GCTTTA--ATAAG-AAAAAACA-T--TTCGG
gi|144887 : CATTTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATA----ACCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--ACAAG-AAAGAACA-T--TTAGGcaatg
gi|144888 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---C-TA---------CT--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTAAA--ATAAT-GAAGAGCT-T--TTAGGctgtgcaatg
gi|144889 : CATTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CATAA-A---G-AA---------TC--AAAGCAACT----TTCTT---GATATTTGA-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACG-T--TTAGGtta
gi|144890 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAT-A---G-TT---------CC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACATGA--ATAAG-AAATAACA-T--ATAGGttaa
gi|144891 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTCTT---AAAACTTGA-ACTGGA--TTAAG-AAAGAACA-T--TTcta
gi|144892 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATTAC-AATGAACA-T--T
gi|144893 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----TCATT---GTCATATGG-ACTTGA--AGAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144894 : CATTTTAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TT---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATCAA-TAAGAGCA-T--TTGGttaa
gi|144895 : CATTTCAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--GAAGCAAGT----TCTTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAA
gi|144896 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-T--CAAAA-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----GCCTT---GAACTTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-CTGTTAGG
gi|144897 : CATTATAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----G-TA---------TC--AAATCAATT----TCCAT---GAAATTTGC-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-T--TTAGGtaaaat
gi|144898 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--CGAGTGATT----TCTTA---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-ACAGAATA-T--Ttta
gi|144899 : CATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---C-TA---------GT--GAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGT--ATAAG-TAAGAACA-T--TTAGG
gi|144900 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A------A---------ACAAAAAACAATT----TCCTT---GAAATTTGG-AAATGA--ATAAG-AAAGAACA-C--Ttta
gi|144901 : CATTTAAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-AA--G-GA---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATAT----CTTGA--ATAAG-AGAGAACA-T--TTAGG
gi|144902 : CACTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CTAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGT-ACTAGA--ATAAA-ATAGAACG-T--TTAGGctatataaaatga
gi|144903 : CATTATAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAAA-A---A-TG---------AC--AAACCAATTAATTTCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTActacataaaataac
gi|144904 : CAGTTTAT--ATA---------ATT----T-C-T--CAAAT-A---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GATATTTAG-ACTTGA--ATGCG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144905 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--AAGAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----CCCAT---GGAATTTTG-ACTTGA--ATCAG-AAAGAACAGT--TTGGgta
gi|144906 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----T-TA---------TC--GAAGTAATT----TCTCT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAG-AATGAACA-T--TTAAGataa
gi|144975 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTAG-CCTTTA--GTAAG-AAAGAGCA-T--TTAGGtta
gi|144976 : ATTTTAT--GTA---------TTT------C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AGAGCAATT----TCCTT----AAATTTGG-AC------ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGaaaacaatgacca
gi|144977 : ATGTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---A-AACACACAACTTC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGA--ATTAG-AAAGAACA-T--TTAGGaataacaatgacta
gi|144978 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAAC--T--TTAataacaatga
gi|144979 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-AATTAA--ATAAG-AAAGAAC--T--TTAatgataacaatgacc
gi|144980 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-GA---------TC--AAAACAATT----TCCTT---GAAATTTCG-GCTTGA--ATAAG-AACGAACA-T--TTAGGatgataacaatgacc
gi|144981 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGG--ATAAG-AAGGAACA-T--TTAtta
gi|144982 : ATTTTAG--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA-A----------------------AGTAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTAA--ATAAG-TAAGAACA-G--TTAGG
gi|144984 : ATTTTATTCATA---------TTT----T-T-A--AAAAA-A---G-CA---------TC--AAGGCAATA----TCCTT---GAAATTTTG-ATTTAA--ATACA-AAAATACA-T--TCAGGataacaatgacca
gi|144985 : ATTTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---TAAATTTGG-ACTTGA--ACTAG-AAAGAACA-T--TTCGGataacactgacca
gi|144986 : ATCTTAT--ATA---------TCTAACAT-T-T--TAAA------G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGcta
gi|144987 : ATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-GAAGTACA-T--tta
gi|144988 : ATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CAAAA-A---A-CA---------TC--AAAGCAATTA---TC--T---GAAATTTGG-ACTTAG--ATAAG-GAAAAACA-T--TTAG
gi|144989 : ATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA----------C--AAAGCAATT----TCCTT---GACATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAAAA
gi|144990 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TTACAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGCTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTAAGacaaaaacattaaagatacaacaacaac
gi|144991 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TAACAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGTTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTAAGataatactgacca
gi|144992 : ATTTAAC--GTA---------TCA----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGC--ATAAG-AAAAAACA-T--TTAAGataatactgacca
gi|144993 : ATTGCAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ATTTAA--ATAAG-AAAGAACG-T--Tacaataa
gi|145009 : TTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAACA-T--TTAG
gi|145010 : TTTTAT--GCA---------TTT----T-T-T--TAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGACATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAGGAACT-T--TGAGG
gi|145011 : TTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------AA--AAAGCATTT----TCATT---GAAATCTGG-ACTTAA--AGAAG-AAAGAACA-T--TTAGGctataacaat
gi|145012 : TTGTAT--GTG---------TTT----T-C-T--CAAAT-A---G-TA---------TC--CAGGAAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATTAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|145023 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------TC--AAAACAATT----TCCCT---GAAATTTGG-ACTTCA--ATAA--AAAGAGCA-T--TTActa
gi|145024 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-TA---------CC--AAATCAATT----TTCTT---AAAATTAGG-CCTTAA--AAAAA-AAAGAACT-T--TTAGGtgctataa
gi|145025 : TTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CTAAA-G---G-AA---------TC--AAAGAAATT----GTCAT---GACATTTAG--CTTGG--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGataacacagacca
gi|145026 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---T-TG---------TC--AAAGCAATT----GTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAA--AAAGAACA-T--TTTGGataacaatgacca
gi|145027 : TTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--AAAAG-AAAGAACG-T--CTActa
gi|145037 : TAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---A-TA---------TC--GAAGCAATT----TCATT---GTAATCTGGAATTTGT--ATGAG-AACGAACA-T--TTAGG
gi|145041 : AT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA-C---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--GTAAG-AAGGAACA-A--TTAGataataatggcca
gi|145046 : --GTA---------TTT----C-C-T--GAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTTA--ATAAA-AAAGAACA-T--TTAGGaaaaacaataacca
gi|145047 : ---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAtta
blockSeqs : CCTGAATTT TA AGA CACACAACT AATT
blockSeqs : CGTA AA AA . ATG
blockSeqs : . A A . ATG
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : ***
originalCons : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
finalCons : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
Alignments
lowQualScore : 00 222222222 0000 0 0 11 0 222 0 111111111 00 2222 000 0 00 0 0 00
lowQualScore : .. ......... .... . . .. . ... . ......... .. .... ... . .. . . ..
lowQualScore : 66 555555555 9999 8 4 55 4 111 4 666666666 66 6666 777 4 55 4 4 66
consensus : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
Reference ( family-170 ) : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144832 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-T-T--CAAAA-AA--G-CA---------TC--AAAGCAATA----TCCTT---GACATTTGG-ACCTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144833 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ACTTGA--AAAAG-AAAGAACT-T--ATAGGataacaatgacca
gi|144834 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AGAGCAATT----TCCTT---GATATTTGG-ACTTGA--ATAAC-AAAGAACA-T--TTAGGataacaatgacca
gi|144835 : CATTTTAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTTTT---GGAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAATA-T--TGAGGataacattg
gi|144836 : CACTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTTT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TAAGGataacaatgacca
gi|144837 : CATTTTAT--GTG---------TTT----G-C-T--TTAAA-A---G-CA---------TC--AAAGAAATT----TCCTT---AAAATTTGG-ATTTGA--A-AAA-AAACAACA-ataa
gi|144838 : CATACTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGGCA-T--TTCGGacattaagataacaatgacca
gi|144839 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-C---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAAGataacaatgatca
gi|144840 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAC-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----TTCTT---AAAATTCGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--T
gi|144841 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATC----TGCAT---GAAATGTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGaatgataacaatgacca
gi|144842 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAGA-A---G-TA---------TC--AAAGAAACA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGAATATAAG-AAAAAACA-T--TTAGGtta
gi|144843 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TC--AAAGCAATT----CCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAA-AAAGAACA-T--TTAGGaaaacaatga
gi|144844 : CATTTTAT--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA-----G-TA---------TT--AAGG-AATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGcta
gi|144845 : CATTTCAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAA-GAAGAGCA-T--TTAGGtatgacaatgacca
gi|144846 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAGAA-A---T-TT---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGgt
gi|144848 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------AC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAAAA-T--TTAGG
gi|144849 : CACTTTAC--GTA---------TTT----TTC-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AGAGAACA-T--TTGGcta
gi|144850 : CATTTTGT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----ACCAT---GAAGTTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--TTactaa
gi|144851 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAA-AAAGAACA-T--TTAG
gi|144852 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-G---G-CT---------TC--AAAGCAATT----TCTTT---AAAATTTTC-ACTTAA--ATAAGAAAAGAACA-T--TTAGG
gi|144853 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAAAA---G-TA---------TC--AAAGCAATT----ACCTT---TAACTTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAATA-T--TTAGG
gi|144854 : CATTTTAA--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTCGG-ACTCAA--ATAAG-GAAGACCA-C--TCAGGcta
gi|144855 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--ATAAG---AGAA------TTAGG
gi|144857 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATACA-CAAGAATA-T--TAAGGtaa
gi|144858 : CAGTTTAC--GGA---------TTT----T-C-T--CAAAA-C---G-CA---------TT--AAAGTAATA----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-T--TAAGGctatataaaataac
gi|144859 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-AAA-G-TT---------CC--AAAGCAATT----TTCAT---GAAATTTAA-ACTTGG--ATAAG-AAAGAATA-T--TTAAGaaaacagtgac
gi|144861 : CATTTTAT--GTACCTGAATTTTCT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGCAATT----TCCGT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACA-C--TTAGGataacaataa
gi|144862 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T---AAGG-A---A-TA---------TT--AAAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-TTTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGttatataaca
gi|144863 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------T---AAAGCAATT----TCCTT---GAAAGTTTG-ACCTGA--ATAAC-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144864 : CGTTCTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CTAAA-A---G-TA---------TC--AAAGC-ATT----TCTTTTTAGAAATTTGG-ACTTGA--AT-----AAGAACA-T--TTActa
gi|144866 : CATTTGTT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCATT---GAAATTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGGACA-T--TTAGGtgataacaatgacca
gi|144867 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGGAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAGCA-C--Ttta
gi|144868 : CAGTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTGA-CCTTCA--ATAGG-AAAGAGCA-T--TTAGG
gi|144869 : CATTGTAT--AGA---------TTT----T-T-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---TAAATTTAA-ACTTAA--ATAAG-AAAGAACA-T--TCAGGcta
gi|144870 : CATTTTAT--GTACGTA-----TTT----T-C-A--CAAAA-A---GGTG---------TC--ACAGCAATT----TCTTT---AAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-AAAAAACA-T--TTAGGcta
gi|144872 : CATTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAACTTTT----TTCTT---AAAATTTGG-GCTTTA--ATGAG-AAAGAACT-T--TTAAGctacaa
gi|144873 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CCAAA-A---A-TA---------TG--AAAGCAATT----TTCCT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AATGAACA-T--TAAGGataataatga
gi|144874 : CATTTTAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-G---G-TA---------TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTCGGctaa
gi|144875 : CATTTTAT--GTG---------TCT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------AC--AAAGTAATT----TCTTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATA-T--TTAGGcta
gi|144876 : CATTTGAT--ATA---------TTT----T-A-T--AAAAA-AAGAG-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAATTTTGG-ACTTAA--ATAAA-AGAGAACA-T--TTata
gi|144877 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-CA---------CC--AAAGCAATT----TATTT---GAAATTTGA-ACTTGA--ATAAA-AAAGACCA-C--T
gi|144878 : CATTTTAT--ATA---------TTG----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTTA-ACCTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144880 : CATTTTAG--GTA---------TTT----T-T-TA-TAAAA-G---G-T----------TT--AAGGCAATT----CCCTT---GAAATGTAG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGtta
gi|144881 : CATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-AA---------TC--AATGCAATT----TCCTT---TAAATTTAG-ATTTAA--ATGAG-AAAGAACA-
gi|144882 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-AA---------TC--CAAGTAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAATA-T--TTTGG
gi|144883 : CATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CGAAA-A---G-TA---------CC--GAAGCAATT----TTCTT---GCAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-C--Ttta
gi|144884 : CATTTTAT--ATG---------TTG----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAATGTGT-ACCTGA--ATAAG-AAAGATCA-T--TTAGG
gi|144885 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-TAT--CAAAA-G---A-TA---------TC--ATAGCAATT----TCTTT---GAAATTTGG-ACTGGA--ATAAG-AAAG-ACA-T--TTAGGcta
gi|144886 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAACAATT----TCTTT---GAAGTTTGG-GCTTTA--ATAAG-AAAAAACA-T--TTCGG
gi|144887 : CATTTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATA----ACCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--ACAAG-AAAGAACA-T--TTAGGcaatg
gi|144888 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---C-TA---------CT--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTAAA--ATAAT-GAAGAGCT-T--TTAGGctgtgcaatg
gi|144889 : CATTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CATAA-A---G-AA---------TC--AAAGCAACT----TTCTT---GATATTTGA-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACG-T--TTAGGtta
gi|144890 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAT-A---G-TT---------CC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTTG-ACATGA--ATAAG-AAATAACA-T--ATAGGttaa
gi|144891 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-T---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TTCTT---AAAACTTGA-ACTGGA--TTAAG-AAAGAACA-T--TTcta
gi|144892 : CATCTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGA--ATTAC-AATGAACA-T--T
gi|144893 : CATTGTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----TCATT---GTCATATGG-ACTTGA--AGAAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144894 : CATTTTAT--TTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TT---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTAG-ACTTGA--ATCAA-TAAGAGCA-T--TTGGttaa
gi|144895 : CATTTCAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--GAAGCAAGT----TCTTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAA
gi|144896 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-T--CAAAA-A---G-TA---------TA--AAAGCAATT----GCCTT---GAACTTTCG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-CTGTTAGG
gi|144897 : CATTATAC--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----G-TA---------TC--AAATCAATT----TCCAT---GAAATTTGC-ACTTGA--ATAAG-AAATAACA-T--TTAGGtaaaat
gi|144898 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--CGAGTGATT----TCTTA---GAAATTTGG-ACTTAA--ATAAG-ACAGAATA-T--Ttta
gi|144899 : CATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---C-TA---------GT--GAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGT--ATAAG-TAAGAACA-T--TTAGG
gi|144900 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A------A---------ACAAAAAACAATT----TCCTT---GAAATTTGG-AAATGA--ATAAG-AAAGAACA-C--Ttta
gi|144901 : CATTTAAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-AA--G-GA---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATAT----CTTGA--ATAAG-AGAGAACA-T--TTAGG
gi|144902 : CACTTCAT--ATA---------TTT----T-C-T--CTAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGT-ACTAGA--ATAAA-ATAGAACG-T--TTAGGctatataaaatga
gi|144903 : CATTATAT--GTA---------TTT----T-C-T--GAAAA-A---A-TG---------AC--AAACCAATTAATTTCTTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTActacataaaataac
gi|144904 : CAGTTTAT--ATA---------ATT----T-C-T--CAAAT-A---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GATATTTAG-ACTTGA--ATGCG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|144905 : CATTTTAT---TA---------TTT----T-A-T--AAGAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----CCCAT---GGAATTTTG-ACTTGA--ATCAG-AAAGAACAGT--TTGGgta
gi|144906 : CATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-----T-TA---------TC--GAAGTAATT----TCTCT---GAAATTTGG-ACTTGA--CTAAG-AATGAACA-T--TTAAGataa
gi|144975 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TT--AAAGCAATT----TCCTT---AAAATTTAG-CCTTTA--GTAAG-AAAGAGCA-T--TTAGGtta
gi|144976 : ATTTTAT--GTA---------TTT------C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AGAGCAATT----TCCTT----AAATTTGG-AC------ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGaaaacaatgacca
gi|144977 : ATGTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---A-AACACACAACTTC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGA--ATTAG-AAAGAACA-T--TTAGGaataacaatgacta
gi|144978 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-ACTTAA--ATAAG-AAAGAAC--T--TTAataacaatga
gi|144979 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-CA---------TC--ACAGTAATCATG-TCCTT---GACATTTGT-AATTAA--ATAAG-AAAGAAC--T--TTAatgataacaatgacc
gi|144980 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-GA---------TC--AAAACAATT----TCCTT---GAAATTTCG-GCTTGA--ATAAG-AACGAACA-T--TTAGGatgataacaatgacc
gi|144981 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ACTTGG--ATAAG-AAGGAACA-T--TTAtta
gi|144982 : ATTTTAG--GTA---------TTT----T-C-C--CAAAA-A----------------------AGTAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTAA--ATAAG-TAAGAACA-G--TTAGG
gi|144984 : ATTTTATTCATA---------TTT----T-T-A--AAAAA-A---G-CA---------TC--AAGGCAATA----TCCTT---GAAATTTTG-ATTTAA--ATACA-AAAATACA-T--TCAGGataacaatgacca
gi|144985 : ATTTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---TAAATTTGG-ACTTGA--ACTAG-AAAGAACA-T--TTCGGataacactgacca
gi|144986 : ATCTTAT--ATA---------TCTAACAT-T-T--TAAA------G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGcta
gi|144987 : ATTTTAT--GCA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--CAAGCAATT----TTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-GAAGTACA-T--tta
gi|144988 : ATTTTAT--GTA---------TGT----T-C-T--CAAAA-A---A-CA---------TC--AAAGCAATTA---TC--T---GAAATTTGG-ACTTAG--ATAAG-GAAAAACA-T--TTAG
gi|144989 : ATTTTAT--ATA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA----------C--AAAGCAATT----TCCTT---GACATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAAAAA
gi|144990 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TTACAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGCTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTAAGacaaaaacattaaagatacaacaacaac
gi|144991 : ATTTTAT--GTA---------TTT----T-A-TAACAAAA-A---G-CA---------TT--AAAGTTGTA----TATTT---GAAATTTTG-ACTTGA--ATAAG-AAAACACA-T--TTAAGataatactgacca
gi|144992 : ATTTAAC--GTA---------TCA----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGTAATT----TCCTT---GAAAATTGG-ACTTGC--ATAAG-AAAAAACA-T--TTAAGataatactgacca
gi|144993 : ATTGCAT--GAA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TG---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAACTTTGG-ATTTAA--ATAAG-AAAGAACG-T--Tacaataa
gi|145009 : TTTTAT--GTA---------TAT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TT--AAAGCAATT----TCCAT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-ACAGAACA-T--TTAG
gi|145010 : TTTTAT--GCA---------TTT----T-T-T--TAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGACATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAAG-AAGGAACT-T--TGAGG
gi|145011 : TTTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------AA--AAAGCATTT----TCATT---GAAATCTGG-ACTTAA--AGAAG-AAAGAACA-T--TTAGGctataacaat
gi|145012 : TTGTAT--GTG---------TTT----T-C-T--CAAAT-A---G-TA---------TC--CAGGAAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ACTTAA--ATTAG-AAAGAACA-T--TTAGG
gi|145023 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---A-TA---------TC--AAAACAATT----TCCCT---GAAATTTGG-ACTTCA--ATAA--AAAGAGCA-T--TTActa
gi|145024 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--TAAAA-A---G-TA---------CC--AAATCAATT----TTCTT---AAAATTAGG-CCTTAA--AAAAA-AAAGAACT-T--TTAGGtgctataa
gi|145025 : TTTAT--GTA---------TTT----C-C-T--CTAAA-G---G-AA---------TC--AAAGAAATT----GTCAT---GACATTTAG--CTTGG--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAGGataacacagacca
gi|145026 : TTTAT--GTA---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---T-TG---------TC--AAAGCAATT----GTCTT---GAAATTTGG-ACTTGA--ATAA--AAAGAACA-T--TTTGGataacaatgacca
gi|145027 : TTTAC--GTA---------TTA----T-C-T--AAAAA-A---G-TA---------TC--ATAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTGA--AAAAG-AAAGAACG-T--CTActa
gi|145037 : TAT--GTA---------TTT----T-C-T--AAAAA-A---A-TA---------TC--GAAGCAATT----TCATT---GTAATCTGGAATTTGT--ATGAG-AACGAACA-T--TTAGG
gi|145041 : AT--GTA---------TTT----C-C-T--CAAAA-C---A-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-GCTTGA--GTAAG-AAGGAACA-A--TTAGataataatggcca
gi|145046 : --GTA---------TTT----C-C-T--GAAAA-A---G-TA---------TC--AAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGA-ATTTTA--ATAAA-AAAGAACA-T--TTAGGaaaaacaataacca
gi|145047 : ---------TTT----T-C-T--CAAAA-A---G-TA---------TC--GAAGCAATT----TCCTT---GAAATTTGG-ATTTGA--ATAAG-AAAGAACA-T--TTAtta