lowQualScore                  :                                                                                                                 1                         1                                                                                                                                                 
lowQualScore                  :  3                                 3                                                                            6                         0    8           0                  888      66   8888    333  1 33   222 2 222222222 0 666666      11111  4  4    0000   0                       
lowQualScore                  :  .                                 .                                                                            .                         .    .           .                  ...      ..   ....    ...  . ..   ... . ......... . ......      .....  .  .    ....   .                       
lowQualScore                  :  0                                 0                                                                            0                         0    0           8                  888      44   0000    222  6 44   777 4 222222222 9 444444      00000  7  9    9999   4                       
consensus                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGT---TTATGAAAAACCC--TCTT---TA-A--TGA--AT-T--GA-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
Reference ( gi|130515 )       : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGT---TTATGAAAAACTC--TCTT---TA-A--TGA--AT-T--GA-A---T-TG-----GTTTAT-----ACCAACTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130516                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGT---TTATGAAAAACTC--TCTT---TA-A--TGA--AT-T--GA-A---T-TG-----GTTTAT-----ACCAACTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130517                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTTTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGT---TTATGAAAAACCC--TC-----------------T-T--GA-A---T-TG-----GTTTAT-----ACCAACTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130518                     : TGTACATAGTCATCAGGTTTTTGTAGGTATGCAACGGTTTAACCAGAACTAGATACCCATTATCTGTCATTATCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATATTTAA-CAATCAATACAAAGCTTCCGGGCTTTCTGT---TTATGACAAACCC--TCTT---TA-A--TGA--AT-T--GA-A---T-TG-----GTTTAT-----ACCAACTTAT----TTT-AGCTCGATTGTGAAGAAAGCTCT
gi|130519                     : TGTACATAGTCATCG--TTTTTTTAGATATTCAATGGTTTATCCAGGACTAGATACCTACTATCTGTCATTACCGCTCTGTCATATATTCTATGATTGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAAACAACCAATACAAAATTTCCGGCCTACCTGT---TTATGACAAACCT--TCTT---TA-A--TGA--AT-T--GA-A---T-TG-----GTTAAT-----ACCAACTTAT----TTT-AGCATGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130520                     : TGTACATAGTCATTTGTTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACTCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTA
gi|130522                     :                                                                                                                                             TAA-TAAT-AATACA---CTTATGGGACACATGCCAATT-TGGATAATTT--TTTTACCTA-ACTTTC--AT-TCTGA-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCAATCGGGATGAAAGCTC
gi|130528                     :                                                                                                                                                      tcacattaaaaTCTGCACTACATGC---TTA-GA----------TTT---TA-G--TAA--TT-C--TA-G---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTACGATGAAAGCTC
gi|130530                     :                                                                                                                                                                      GCTACCTTT---TTGT--------T--TCTT---T-----TGT--A-----GA-A---T-TT-----GTTTAT-----TTTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACT
gi|130533                     :                                                                                                                                                                              T---TTATTAAAAATTCAATATT---CA-A----A--ACCT--CA-T---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTAGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130532                     :                                                                                                                                                                                          AACT---TCCC---CA-G--TGA--AT-T--GA-----T-TA-----GTTTGT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130539                     :                                                                                                                                                                                    tttatcAGCCC--TGCT---TA-A--AGA--AA----GATA---T-TA-----GTTTAT-----ACTAAGTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130544                     :                                                                                                                                                                                               --TCTT---TG-T--TGA---T-T--AA-T---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130543                     :                                                                                                                                                                                               --TCTT---TG-T--TGA---T-T--AA-T---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130545                     :                                                                                                                                                                                               --TCTT---TACA--TCA--AT-----A-G---T-T--------TTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130546                     :                                                                                                                                                                                               --TTTC---TA-A--TAAGCAT-T--GA-ACTCT-TA-----ATTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGTTC
gi|130551                     :                                                                                                                                                                                                   TT---TA-A----G--AT-T--G------T-TA-----GTTTAT-----ACTTATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130553                     :                                                                                                                                                                                                   TT---TA-AG-TGG--AT-A--TA-T---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGTTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130552                     :                                                                                                                                                                                                   TT---TA-A--TAA-----T--AA-T---T-TA-----GTTCAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGTAATGAAAGCTC
gi|130556                     :                                                                                                                                                                                                    T---TA-C--TGA---T-T--AT-G---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130557                     :                                                                                                                                                                                                    T---TA-A----A--ATAT--GA-T---T-TA-----GTTCAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCTATTGCGATGAAAGCTC
gi|130559                     :                                                                                                                                                                                                     ---TG-A--TAA--AT-T--G------T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130560                     :                                                                                                                                                                                                     ---TA-A--TG----T-T--AG-T---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130561                     :                                                                                                                                                                                                     ---TA-A--TGA---T-T--TA-T---T-TA-----ATGTGT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130565                     :                                                                                                                                                                                                         A-A--TCA--AT-T--AA-A---TATG-----GTTTATTCTATACTAATTTAT----TTT-AGTTCGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130566                     :                                                                                                                                                                                                         A-A--TAA--AT-T--AA-T---C-TG-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----CTA-AGCTCGATTGCGAAGACAGCTC
gi|130570                     :                                                                                                                                                                                                          -A--TGA--AT-T--GA-A---T-TG-----GTTTAT-----ACCAACTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130576                     :                                                                                                                                                                                                            --TAA--AC-T--G------T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130577                     :                                                                                                                                                                                                            --TAA--AT-T--TG-G---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130578                     :                                                                                                                                                                                                            --TGA--AT-T--TG-A---C-TGCTTTCATTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130579                     :                                                                                                                                                                                                               GA--AT-T--AT-A---T-TATA---GTTTAC-----ACTAATTTAT----TTT-AGCCCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130582                     :                                                                                                                                                                                                                A--AT-T--TG-G---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130583                     :                                                                                                                                                                                                                A--AT-T--AC-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATGTAG----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130585                     :                                                                                                                                                                                                                 --AT-T--GA-A---T-TA-----GTTTAT-----AT--ACTTATATATTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130593                     :                                                                                                                                                                                                                    T-T--AA-A---T-TAA----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGTTTGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130596                     :                                                                                                                                                                                                                     -T--GT-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130599                     :                                                                                                                                                                                                                       --GA-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATATAT----TTT-AGCTTGTTTGCGATGAAAGCT
gi|130600                     :                                                                                                                                                                                                                       --GA-A---T-GG-----ATTT--------CTAACTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130601                     :                                                                                                                                                                                                                          A-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTTATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130602                     :                                                                                                                                                                                                                          A-A---T-CA-----GTTTTT-----ACTGATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130603                     :                                                                                                                                                                                                                          A-A---TATA-----GTTTAT-----ACTTATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGGAAGCTC
gi|130604                     :                                                                                                                                                                                                                          A-G---T-TA-----GTTTAT-----TCTAATATAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130605                     :                                                                                                                                                                                                                          A-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTCT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAA
gi|130537                     :                                                                                                                                                                                                                           -A---T-TA-----GTTTAT-----ACCAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130613                     :                                                                                                                                                                                                   aaatcatccataaagtgacaatag-A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130614                     :                                                                                                                                                                                                                           -A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTCAT----TTC-AGCTCGATTGCGACGAAAGCTC
gi|130615                     :                                                                                                                                                                                                                           -A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGACTACGATGAAAGCTC
gi|130616                     :                                                                                                                                                                                                                           -A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGTT
gi|130617                     :                                                                                                                                                                                                                           -A---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTCT----TTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130627                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130626                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACCAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130625                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACCAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130624                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TG-----GTTTAT-----ATTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130623                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130622                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130629                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130628                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130631                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTCAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130630                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130633                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130632                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----ATTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130635                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTGAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130634                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTGAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130637                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTTTAGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130636                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGATCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130638                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130640                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCT
gi|130639                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTT
gi|130641                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTGT----TTT-AGCTCGATTGTGATGAAAGCTC
gi|130642                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCGTGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130644                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TG-----GTTTAA-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCT
gi|130646                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAC----TTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130645                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTCAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAATCTC
gi|130651                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAA----TTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130650                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGCTC
gi|130649                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----TCTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130648                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTTATTTAT----TTT-AGTTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130647                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TG-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGTGAAGAAAGCTC
gi|130655                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130654                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTTGACTGTGATGAAAGCTC
gi|130653                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130656                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ATTAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130657                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGATATGAAAGCTC
gi|130659                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCACGATTGCGATGAATGCTC
gi|130658                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTTATTTAT----TTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130662                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTAAT-----ACAAATTTAT----TTT-AGCTCCATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130663                     :                                                                                                                                                                                                                             ---T-TA-----GTTTAT-----ACTACTTTAT----TTT-AGCTCAACTGCGATGAAAGCTC
gi|130721                     :                                                                                                                                                                                                                                 -TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130720                     :                                                                                                                                                                                                                                 -TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130723                     :                                                                                                                                                                                                                                 -TA-----GTTTAT-----ACTAATTCAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACTC
gi|130722                     :                                                                                                                                                                                                                                 -TA-----GTTTAT-----ACTAATTTAC----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130724                     :                                                                                                                                                                                                                                 -TA-----GTTTAT-----ATTAATTTAT----TTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130735                     :                                                                                                                                                                                                                                    -----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TAT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130736                     :                                                                                                                                                                                                                                    -----GTTTAT-----ACCAATTTAT----TTT-AGCTTGCTTACGATGAAAGCTC
gi|130737                     :                                                                                                                                                                                                                                    -----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCAATTGGGATGAAAGCTC
gi|130738                     :                                                                                                                                                                                                                                    -----GTTTAT-----ACTAATTTAT----TTT-AGCTCGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130749                     :                                                                                                                                                                                                                                          TTTAT-----ACCAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130750                     :                                                                                                                                                                                                                                          TTTAT-----ACAAATTTAT----TTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130763                     :                                                                                                                                                                                                                                           TTAT-----ACCAATTTAT----TTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130765                     :                                                                                                                                                                                                                                           TTAT-----ACTAATTTAT----TTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                 2                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         8  8                                    2        33      1 33   333 2   22222 0  11      11111 00            0                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 .                         .  .                                    .        ..      . ..   ... .   ..... .  ..      ..... ..            .                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         0  0                                    5        99      5 44   999 3   11111 9  00      00000 66            4                       
consensus                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TT-AACAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
Reference ( family-159 )      : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TT-AACAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130515                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TT-AACAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130516                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TT-AACAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130517                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTTTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TT-AACAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TC--------------T-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130518                     : TGTACATAGTCATCAGGTTTTTGTAGGTATGCAACGGTTTAACCAGAACTAGATACCCATTATCTGTCATTATCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATATTT-AACAATCAATACAAAGCTTCCGGGCTTTCTGTTTATGACAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGTGAAGAAAGCTCT
gi|130519                     : TGTACATAGTCATCG--TTTTTTTAGATATTCAATGGTTTATCCAGGACTAGATACCTACTATCTGTCATTACCGCTCTGTCATATATTCTATGATTGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAAACAACCAATACAAAATTTCCGGCCTACCTGTTTATGACAAACCT--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTAAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCATGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130520                     : TGTACATAGTCATTTGTTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACTCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTA
gi|130522                     :                                                                                                                                                                                                               -TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATCGGGATGAAAGCTC
gi|130528                     :                                                                                                                      tcacattaaaataataataatacacttatgggacacatgccaatttggataatttttttacctaactttcattcTTTA-G--TAA--TT-CTA-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTACGATGAAAGCTC
gi|130530                     :                                                                                                                                                  tctgcactacatgcttagatGCTACCTTTTTGT--------T--TCTTT-----TGT--A---GA-A---T-TT--GTTTAT-----T--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACT
gi|130532                     :                                                                                                                                                                              TTTATCAA----CT--TCCCCA-G--TGA--AT-TGA-----T-TA--GTTTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130533                     :                                                                                                                                                                              TTTATTAAAAATTCAATATTCA-A----A--ACCTCA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTAGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130537                     :                                                                                                                                                                                      AAATCA--TCCATA-AAGTGAC-AA-TAG-A---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130539                     :                                                                                                                                                                                       AGCCC--TGCTTA-A--AGA--AA--GATA---T-TA--GTTTAT-----A--CTAAGTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130543                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130544                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130545                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTACA--TCA--AT---A-G---T-T-----TTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130546                     :                                                                                                                                                                                            --TTTCTA-A--TAAGCAT-TGA-ACTCT-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGTTC
gi|130551                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A----G--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130552                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A--TAA-----TAA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTAATGAAAGCTC
gi|130553                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-AG-TGG--AT-ATA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130556                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-C--TGA---T-TAT-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130557                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-A----A--ATATGA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCTATTGCGATGAAAGCTC
gi|130559                     :                                                                                                                                                                                                  TG-A--TAA--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130560                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TG----T-TAG-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130561                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TGA---T-TTA-T---T-TA--ATGTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130565                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TCA--AT-TAA-A---TATG--GTTTATTCTATA--CTAATTTATTTT-AGTTCGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130566                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TAA--AT-TAA-T---C-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATCTA-AGCTCGATTGCGAAGACAGCTC
gi|130570                     :                                                                                                                                                                                                    -A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130576                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AC-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130577                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130578                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130579                     :                                                                                                                                                                                       tgaatttgactgctttcaGA--AT-TAT-A---T-TATAGTTTAC-----A--CTAATTTATTTT-AGCCCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130582                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130583                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TAC-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATGTAGTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130585                     :                                                                                                                                                                                                           --AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----ATACTTATATATTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130593                     :                                                                                                                                                                                                              T-TAA-A---T-TAA-GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130596                     :                                                                                                                                                                                                               -TGT-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130599                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATATATTTT-AGCTTGTTTGCGATGAAAGCT
gi|130600                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-GG--ATTT----------CTAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130601                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130602                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-CA--GTTTTT-----A--CTGATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130603                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---TATA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGGAAGCTC
gi|130604                     :                                                                                                                                                                                                                  A-G---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATATATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130605                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGCTCGATTGCGATGAAA
gi|130613                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130614                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTC-AGCTCGATTGCGACGAAAGCTC
gi|130615                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTACGATGAAAGCTC
gi|130616                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGTT
gi|130617                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130622                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130623                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130624                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130625                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130626                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130627                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130628                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130629                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130630                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130631                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130632                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130633                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130634                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130635                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130636                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGATCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130637                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTTTAGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130638                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130639                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTT
gi|130640                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCT
gi|130641                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTGTTTT-AGCTCGATTGTGATGAAAGCTC
gi|130642                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCGTGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130644                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAA-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCT
gi|130645                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAATCTC
gi|130646                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130647                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTGAAGAAAGCTC
gi|130648                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGTTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130649                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130650                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGCTC
gi|130651                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTAATTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130653                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130654                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTGTGATGAAAGCTC
gi|130655                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130656                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130657                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGATATGAAAGCTC
gi|130658                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130659                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCACGATTGCGATGAATGCTC
gi|130662                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTAAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCCATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130663                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTACTTTATTTT-AGCTCAACTGCGATGAAAGCTC
gi|130720                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130721                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130722                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130723                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACTC
gi|130724                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130735                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTAT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130736                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGCTTACGATGAAAGCTC
gi|130737                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGGGATGAAAGCTC
gi|130738                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130749                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130750                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130763                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130765                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                 1                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         8    8                                  2        33      1 33   333 2   22222 0  11      11111 00            0                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 .                         .    .                                  .        ..      . ..   ... .   ..... .  ..      ..... ..            .                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         0    0                                  5        99      5 44   999 3   11111 9  00      00000 66            4                       
consensus                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
Reference ( family-159 )      : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130515                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130516                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130517                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTTTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TC--------------T-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130518                     : TGTACATAGTCATCAGGTTTTTGTAGGTATGCAACGGTTTAACCAGAACTAGATACCCATTATCTGTCATTATCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATATTTAA-CAATCAATACAAAGCTTCCGGGCTTTCTGTTTATGACAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGTGAAGAAAGCTCT
gi|130519                     : TGTACATAGTCATCG--TTTTTTTAGATATTCAATGGTTTATCCAGGACTAGATACCTACTATCTGTCATTACCGCTCTGTCATATATTCTATGATTGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAAACAACCAATACAAAATTTCCGGCCTACCTGTTTATGACAAACCT--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTAAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCATGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130520                     : TGTACATAGTCATTTGTTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACTCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTA
gi|130522                     :                                                                                                                                                                                                               -TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATCGGGATGAAAGCTC
gi|130528                     :                                                                                                                      tcacattaaaataataataatacacttatgggacacatgccaatttggataatttttttacctaactttcattcTTTA-G--TAA--TT-CTA-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTACGATGAAAGCTC
gi|130530                     :                                                                                                                                                  tctgcactacatgcttagatGCTACCTTTTTGT--------T--TCTTT-----TGT--A---GA-A---T-TT--GTTTAT-----T--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACT
gi|130532                     :                                                                                                                                                                              TTTATCAA----CT--TCCCCA-G--TGA--AT-TGA-----T-TA--GTTTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130533                     :                                                                                                                                                                              TTTATTAAAAATTCAATATTCA-A----A--ACCTCA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTAGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130537                     :                                                                                                                                                                                      AAATCA--TCCATA-AAGTGAC-AA-TAG-A---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130539                     :                                                                                                                                                                                       AGCCC--TGCTTA-A--AGA--AA--GATA---T-TA--GTTTAT-----A--CTAAGTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130543                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130544                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130545                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTACA--TCA--AT---A-G---T-T-----TTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130546                     :                                                                                                                                                                                            --TTTCTA-A--TAAGCAT-TGA-ACTCT-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGTTC
gi|130551                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A----G--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130552                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A--TAA-----TAA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTAATGAAAGCTC
gi|130553                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-AG-TGG--AT-ATA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130556                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-C--TGA---T-TAT-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130557                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-A----A--ATATGA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCTATTGCGATGAAAGCTC
gi|130559                     :                                                                                                                                                                                                  TG-A--TAA--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130560                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TG----T-TAG-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130561                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TGA---T-TTA-T---T-TA--ATGTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130565                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TCA--AT-TAA-A---TATG--GTTTATTCTATA--CTAATTTATTTT-AGTTCGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130566                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TAA--AT-TAA-T---C-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATCTA-AGCTCGATTGCGAAGACAGCTC
gi|130570                     :                                                                                                                                                                                                    -A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130576                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AC-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130577                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130578                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130579                     :                                                                                                                                                                                       tgaatttgactgctttcaGA--AT-TAT-A---T-TATAGTTTAC-----A--CTAATTTATTTT-AGCCCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130582                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130583                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TAC-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATGTAGTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130585                     :                                                                                                                                                                                                           --AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----ATACTTATATATTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130593                     :                                                                                                                                                                                                              T-TAA-A---T-TAA-GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130596                     :                                                                                                                                                                                                               -TGT-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130599                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATATATTTT-AGCTTGTTTGCGATGAAAGCT
gi|130600                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-GG--ATTT----------CTAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130601                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130602                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-CA--GTTTTT-----A--CTGATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130603                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---TATA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGGAAGCTC
gi|130604                     :                                                                                                                                                                                                                  A-G---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATATATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130605                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGCTCGATTGCGATGAAA
gi|130613                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130614                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTC-AGCTCGATTGCGACGAAAGCTC
gi|130615                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTACGATGAAAGCTC
gi|130616                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGTT
gi|130617                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130622                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130623                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130624                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130625                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130626                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130627                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130628                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130629                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130630                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130631                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130632                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130633                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130634                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130635                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130636                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGATCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130637                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTTTAGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130638                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130639                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTT
gi|130640                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCT
gi|130641                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTGTTTT-AGCTCGATTGTGATGAAAGCTC
gi|130642                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCGTGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130644                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAA-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCT
gi|130645                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAATCTC
gi|130646                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130647                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTGAAGAAAGCTC
gi|130648                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGTTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130649                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130650                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGCTC
gi|130651                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTAATTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130653                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130654                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTGTGATGAAAGCTC
gi|130655                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130656                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130657                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGATATGAAAGCTC
gi|130658                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130659                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCACGATTGCGATGAATGCTC
gi|130662                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTAAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCCATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130663                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTACTTTATTTT-AGCTCAACTGCGATGAAAGCTC
gi|130720                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130721                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130722                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130723                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACTC
gi|130724                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130735                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTAT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130736                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGCTTACGATGAAAGCTC
gi|130737                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGGGATGAAAGCTC
gi|130738                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130749                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130750                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130763                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130765                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                 1                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         8    8                                  2        33      1 33   333 2   22222 0  11      11111 00            0                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 .                         .    .                                  .        ..      . ..   ... .   ..... .  ..      ..... ..            .                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         0    0                                  5        99      5 44   999 3   11111 9  00      00000 66            4                       
consensus                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
Reference ( family-159 )      : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130515                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130516                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130517                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTTTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TC--------------T-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130518                     : TGTACATAGTCATCAGGTTTTTGTAGGTATGCAACGGTTTAACCAGAACTAGATACCCATTATCTGTCATTATCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATATTTAA-CAATCAATACAAAGCTTCCGGGCTTTCTGTTTATGACAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGTGAAGAAAGCTCT
gi|130519                     : TGTACATAGTCATCG--TTTTTTTAGATATTCAATGGTTTATCCAGGACTAGATACCTACTATCTGTCATTACCGCTCTGTCATATATTCTATGATTGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAAACAACCAATACAAAATTTCCGGCCTACCTGTTTATGACAAACCT--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTAAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCATGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130520                     : TGTACATAGTCATTTGTTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACTCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTA
gi|130522                     :                                                                                                                                                                                                               -TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATCGGGATGAAAGCTC
gi|130528                     :                                                                                                                      tcacattaaaataataataatacacttatgggacacatgccaatttggataatttttttacctaactttcattcTTTA-G--TAA--TT-CTA-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTACGATGAAAGCTC
gi|130530                     :                                                                                                                                                  tctgcactacatgcttagatGCTACCTTTTTGT--------T--TCTTT-----TGT--A---GA-A---T-TT--GTTTAT-----T--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACT
gi|130532                     :                                                                                                                                                                              TTTATCAA----CT--TCCCCA-G--TGA--AT-TGA-----T-TA--GTTTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130533                     :                                                                                                                                                                              TTTATTAAAAATTCAATATTCA-A----A--ACCTCA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTAGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130537                     :                                                                                                                                                                                      AAATCA--TCCATA-AAGTGAC-AA-TAG-A---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130539                     :                                                                                                                                                                                       AGCCC--TGCTTA-A--AGA--AA--GATA---T-TA--GTTTAT-----A--CTAAGTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130543                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130544                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130545                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTACA--TCA--AT---A-G---T-T-----TTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130546                     :                                                                                                                                                                                            --TTTCTA-A--TAAGCAT-TGA-ACTCT-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGTTC
gi|130551                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A----G--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130552                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A--TAA-----TAA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTAATGAAAGCTC
gi|130553                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-AG-TGG--AT-ATA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130556                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-C--TGA---T-TAT-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130557                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-A----A--ATATGA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCTATTGCGATGAAAGCTC
gi|130559                     :                                                                                                                                                                                                  TG-A--TAA--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130560                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TG----T-TAG-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130561                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TGA---T-TTA-T---T-TA--ATGTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130565                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TCA--AT-TAA-A---TATG--GTTTATTCTATA--CTAATTTATTTT-AGTTCGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130566                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TAA--AT-TAA-T---C-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATCTA-AGCTCGATTGCGAAGACAGCTC
gi|130570                     :                                                                                                                                                                                                    -A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130576                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AC-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130577                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130578                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130579                     :                                                                                                                                                                                       tgaatttgactgctttcaGA--AT-TAT-A---T-TATAGTTTAC-----A--CTAATTTATTTT-AGCCCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130582                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130583                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TAC-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATGTAGTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130585                     :                                                                                                                                                                                                           --AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----ATACTTATATATTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130593                     :                                                                                                                                                                                                              T-TAA-A---T-TAA-GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130596                     :                                                                                                                                                                                                               -TGT-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130599                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATATATTTT-AGCTTGTTTGCGATGAAAGCT
gi|130600                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-GG--ATTT----------CTAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130601                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130602                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-CA--GTTTTT-----A--CTGATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130603                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---TATA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGGAAGCTC
gi|130604                     :                                                                                                                                                                                                                  A-G---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATATATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130605                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGCTCGATTGCGATGAAA
gi|130613                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130614                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTC-AGCTCGATTGCGACGAAAGCTC
gi|130615                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTACGATGAAAGCTC
gi|130616                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGTT
gi|130617                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130622                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130623                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130624                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130625                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130626                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130627                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130628                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130629                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130630                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130631                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130632                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130633                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130634                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130635                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130636                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGATCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130637                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTTTAGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130638                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130639                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTT
gi|130640                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCT
gi|130641                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTGTTTT-AGCTCGATTGTGATGAAAGCTC
gi|130642                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCGTGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130644                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAA-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCT
gi|130645                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAATCTC
gi|130646                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130647                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTGAAGAAAGCTC
gi|130648                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGTTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130649                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130650                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGCTC
gi|130651                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTAATTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130653                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130654                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTGTGATGAAAGCTC
gi|130655                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130656                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130657                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGATATGAAAGCTC
gi|130658                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130659                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCACGATTGCGATGAATGCTC
gi|130662                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTAAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCCATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130663                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTACTTTATTTT-AGCTCAACTGCGATGAAAGCTC
gi|130720                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130721                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130722                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130723                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACTC
gi|130724                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130735                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTAT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130736                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGCTTACGATGAAAGCTC
gi|130737                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGGGATGAAAGCTC
gi|130738                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130749                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130750                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130763                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130765                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC


blockSeqs                     :                                                                                                                 C                         T    A                                  G        AA      C AG   GCA C   ACTC     TA      TCTAT
blockSeqs                     :                                                                                                                 C                         .    .                                  G        .       . G    CA  A   TA       A       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                 .                         .    .                                  G        .       . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                 .                         .    .                                  G        .       . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                 .                                                                 C        .       . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                   T        .       . .    T   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                   .        .       . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .       . .    A   .   G        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .       . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .       . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .       . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .       . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .       . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   G        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   G        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   T        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    A   .   G        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    . .    .   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .   .   G        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           .   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           .   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           .   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           .   .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                               .   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   G        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   A        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   .        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   .        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   .        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   .        .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .       .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .    


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
finalCons                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                 1                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         8    8                                  2        33      1 33   333 2   22222 0  11      11111 00            0                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 .                         .    .                                  .        ..      . ..   ... .   ..... .  ..      ..... ..            .                       
lowQualScore                  :                                                                                                                 3                         0    0                                  5        99      5 44   999 3   11111 9  00      00000 66            4                       
consensus                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
Reference ( family-159 )      : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130515                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130516                     : TATACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATAGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCTGGGCTACCTGTTTATGAAAAACTC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130517                     : TGTACATAGTCATCGGGTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACCCATTATCTGTCATTGTCTTTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAA-CAATCAATACAAAACTTCCGGGCTACCTGTTTATGAAAAACCC--TC--------------T-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130518                     : TGTACATAGTCATCAGGTTTTTGTAGGTATGCAACGGTTTAACCAGAACTAGATACCCATTATCTGTCATTATCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATATTTAA-CAATCAATACAAAGCTTCCGGGCTTTCTGTTTATGACAAACCC--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTCGATTGTGAAGAAAGCTCT
gi|130519                     : TGTACATAGTCATCG--TTTTTTTAGATATTCAATGGTTTATCCAGGACTAGATACCTACTATCTGTCATTACCGCTCTGTCATATATTCTATGATTGAATGCAGTCAGATACATCTGTGTAGATGTTTAGTTTCATA-TTAAACAACCAATACAAAATTTCCGGCCTACCTGTTTATGACAAACCT--TCTTTA-A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTAAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCATGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130520                     : TGTACATAGTCATTTGTTTTTTGTAGATATGCAATGGTTTAACCAGGACTAGATACTCATTATCTGTCATTGTCTCTCTGCCATATGTTCTATTATAGAATGCAGTCAGATA-ATCCGTGTA
gi|130522                     :                                                                                                                                                                                                               -TGA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATCGGGATGAAAGCTC
gi|130528                     :                                                                                                                      tcacattaaaataataataatacacttatgggacacatgccaatttggataatttttttacctaactttcattcTTTA-G--TAA--TT-CTA-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTACGATGAAAGCTC
gi|130530                     :                                                                                                                                                  tctgcactacatgcttagatGCTACCTTTTTGT--------T--TCTTT-----TGT--A---GA-A---T-TT--GTTTAT-----T--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACT
gi|130532                     :                                                                                                                                                                              TTTATCAA----CT--TCCCCA-G--TGA--AT-TGA-----T-TA--GTTTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130533                     :                                                                                                                                                                              TTTATTAAAAATTCAATATTCA-A----A--ACCTCA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTAGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130537                     :                                                                                                                                                                                      AAATCA--TCCATA-AAGTGAC-AA-TAG-A---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130539                     :                                                                                                                                                                                       AGCCC--TGCTTA-A--AGA--AA--GATA---T-TA--GTTTAT-----A--CTAAGTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130543                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130544                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTG-T--TGA---T-TAA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGAGATGAAAGCTC
gi|130545                     :                                                                                                                                                                                            --TCTTTACA--TCA--AT---A-G---T-T-----TTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130546                     :                                                                                                                                                                                            --TTTCTA-A--TAAGCAT-TGA-ACTCT-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGTTC
gi|130551                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A----G--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130552                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-A--TAA-----TAA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTAATGAAAGCTC
gi|130553                     :                                                                                                                                                                                                TTTA-AG-TGG--AT-ATA-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130556                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-C--TGA---T-TAT-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130557                     :                                                                                                                                                                                                 TTA-A----A--ATATGA-T---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCTATTGCGATGAAAGCTC
gi|130559                     :                                                                                                                                                                                                  TG-A--TAA--AT-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130560                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TG----T-TAG-T---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130561                     :                                                                                                                                                                                                  TA-A--TGA---T-TTA-T---T-TA--ATGTGT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130565                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TCA--AT-TAA-A---TATG--GTTTATTCTATA--CTAATTTATTTT-AGTTCGATTGCGAAGAAAGCTC
gi|130566                     :                                                                                                                                                                                                   A-A--TAA--AT-TAA-T---C-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATCTA-AGCTCGATTGCGAAGACAGCTC
gi|130570                     :                                                                                                                                                                                                    -A--TGA--AT-TGA-A---T-TG--GTTTAT-----A--CCAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGAAGAAAGCTCT
gi|130576                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AC-TG------T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130577                     :                                                                                                                                                                                                      --TAA--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCAATGAAAGCTC
gi|130578                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130579                     :                                                                                                                                                                                       tgaatttgactgctttcaGA--AT-TAT-A---T-TATAGTTTAC-----A--CTAATTTATTTT-AGCCCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130582                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TTG-G---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130583                     :                                                                                                                                                                                                          A--AT-TAC-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATGTAGTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130585                     :                                                                                                                                                                                                           --AT-TGA-A---T-TA--GTTTAT-----ATACTTATATATTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130593                     :                                                                                                                                                                                                              T-TAA-A---T-TAA-GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGTTTGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130596                     :                                                                                                                                                                                                               -TGT-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130599                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATATATTTT-AGCTTGTTTGCGATGAAAGCT
gi|130600                     :                                                                                                                                                                                                                 GA-A---T-GG--ATTT----------CTAACTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130601                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130602                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-CA--GTTTTT-----A--CTGATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130603                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---TATA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGGAAGCTC
gi|130604                     :                                                                                                                                                                                                                  A-G---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATATATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130605                     :                                                                                                                                                                                                                  A-A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGCTCGATTGCGATGAAA
gi|130613                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130614                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTC-AGCTCGATTGCGACGAAAGCTC
gi|130615                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTACGATGAAAGCTC
gi|130616                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGAAGAAAGTT
gi|130617                     :                                                                                                                                                                                                                   -A---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTCTTTT-AGTTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130622                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130623                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130624                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130625                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130626                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130627                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130628                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130629                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCT
gi|130630                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGACTGCGATGAAAGCTC
gi|130631                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130632                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--ATTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130633                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130634                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130635                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTGAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130636                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGATCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130637                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTTTAGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130638                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130639                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTT
gi|130640                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAATGAAAGCT
gi|130641                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTGTTTT-AGCTCGATTGTGATGAAAGCTC
gi|130642                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCGTGATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130644                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAA-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCT
gi|130645                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTCAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAATCTC
gi|130646                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCTATGAAAGCTC
gi|130647                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TG--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGATTGTGAAGAAAGCTC
gi|130648                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTT-AGTTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130649                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----T--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130650                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGCAAAGAAAGCTC
gi|130651                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTAATTT-AGCTCGATTGCGATAAAAGCTC
gi|130653                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130654                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTTGACTGTGATGAAAGCTC
gi|130655                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGTGACAAAAGCTC
gi|130656                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTTGATTGCAATGAAAGCTC
gi|130657                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATTGATATGAAAGCTC
gi|130658                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTTATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130659                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCACGATTGCGATGAATGCTC
gi|130662                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTAAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCCATTGCGATGAAAGCTCT
gi|130663                     :                                                                                                                                                                                                                     ---T-TA--GTTTAT-----A--CTACTTTATTTT-AGCTCAACTGCGATGAAAGCTC
gi|130720                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130721                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130722                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTTACTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGTTC
gi|130723                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--CTAATTCATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAACTC
gi|130724                     :                                                                                                                                                                                                                         -TA--GTTTAT-----A--TTAATTTATTTT-AGCTCAATTGCGATGAAAGCTC
gi|130735                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTAT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130736                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGCTTACGATGAAAGCTC
gi|130737                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCAATTGGGATGAAAGCTC
gi|130738                     :                                                                                                                                                                                                                            --GTTTAT-----A--CTAATTTATTTT-AGCTCGATAGTGATGAAAGCTC
gi|130749                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130750                     :                                                                                                                                                                                                                               TTTAT-----A--CAAATTTATTTT-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130763                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CCAATTTATTTT-AGCTTGATTGCGATGAAAGCTC
gi|130765                     :                                                                                                                                                                                                                                TTAT-----A--CTAATTTATTTA-AGCTCGATTGCGATGAAAGCTC