lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 11 0 11111 00 0 000 0 0 11 0 0 2 0 0 00 222222222 0
lowQualScore : . .. . ..... .. . ... . . .. . . . . . .. ......... .
lowQualScore : 4 44 4 00000 66 4 777 4 4 44 4 4 4 8 8 66 555555555 4
consensus : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
Reference ( gi|110724 ) : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110730 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110726 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TAA-GTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110738 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TAAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110727 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110747 : TAAACT--GAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TAAGGTC-T-AAGAATATTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110729 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TT-G---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110737 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-GTACGACCCC
gi|110740 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATATGACCCC
gi|110733 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTG-T-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110731 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGTATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110743 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGATTG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110736 : TAACCC-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110734 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110744 : TAAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110739 : TAAAGT-AGAT--A-T-----CTA--CGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCC
gi|110741 : TAAGCT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGACTG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110742 : TAAACG-AGAT--A-T-----GTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110745 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--TAAAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110765 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGATGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGA-TAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------GTTGGTGA-ATACATCCCC
gi|110748 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTT---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATAAGACCCC
gi|110746 : TAAACT-AGAT--A-T-----ACA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGTTA-ATATGACCCC
gi|110732 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------ATTGATGA-ATAGGACCCC
gi|110749 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGT-TCAAGTC-T-AAAAATATTTTC--AA-AATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110770 : TAAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGC-TAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATTCGATCC
gi|110750 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AACC-TCGAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GCTGGTGA-ATACGAACC
gi|110752 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAAAAGTCTC--AAAAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110751 : TAAACT-AGAT--C-T-----CTA--AGGTTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAATC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110753 : TAAACT-AAAA--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATCTTC--AAGAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110754 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTAGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATG---------GTTTGTAA-GTACGACCCC
gi|110759 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTTT--C-ATGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGATA-ATACGACCCC
gi|110756 : TACACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTT---C-AAGC-TCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGGATG---------GTTGGTGA-ATATGACCCC
gi|110755 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-TTGG---G-G-TTTT--C-AAGC-TCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110757 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-T--G---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110766 : TAAACT-AGAT--A-A-----CTA--AGGTCTAAA-TTTG---G-A-TTAT--C-AAGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACCACCCC
gi|110761 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTT--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAACC-T-AAGGATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110760 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATGTTATC--AAGAATG---------GTTGATGA-AAACCATCCC
gi|110758 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCT--AGGTTGAAC-TTTT---C-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-CTACGACCCC
gi|110762 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--CCAAGC-TCATGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATGTGACCCC
gi|110764 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGT-TCAAGTC-T-TAGACTATTCTC---AGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110763 : TAGACT-AAATT-A-C-----CCA--AGGTTGAAA-ATTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCTC
gi|110725 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTCT--T-AAGC-TCAAGTC-T-TAGAATATTTTC--AATAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110774 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAAATTTG---A-A-TTTT--C-AAGT-TTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAAAATG---------GTTGGTGA-AGACGGCCCC
gi|110773 : TACATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TT----C-AAGC-TTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACACC
gi|110776 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTTTTAGGTTGAAA-CTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-CTAAGTC-T-GAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCCC
gi|110768 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTG--AGGTTGTTT-TTTG---A-A-TTTT--C-ATGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110767 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCCGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAAACTATTCTC--AATAATG---------GTTGGTGG-ATACGACACC
gi|110769 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTCG---G---TTTT--A-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------ATTGGTGA-ATACTACCCC
gi|110771 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTCGAAA-TTTG---G-G-TTTT--C-AAGC-TCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGAATGGCTGGTGCAGCTGGTGA-ATATGGCCCC
gi|110777 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAGA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAAC-TTAAGCC-T-ATGAATAT------AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110791 : TAAACA-AGAT--A-T-----CTC--GGGTGGAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAGC-TGAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTAGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110775 : TAAACT-AGATGTA-T-----CTA--AGGTTGTAC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-GTACGATCCC
gi|110803 : TAAACT-TAAT--A-T-----CTT--AGATTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGG-TAAAGTC-A-AAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCTC
gi|110779 : TAAACA-AGAA--A-T-----CTA--AAGTTGAAG-TTTG---G-T-TTTT--C-AAGC-TTAAGTC-TTAAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110781 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATC-TTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110780 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATC-TTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110778 : TAAACT-AGGT--A-C-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-A--AATA---TC--AAGAATG---------ATTGGTGA-ATACGACCC
gi|110805 : TAAACT-GGCC--A-T-----CTT--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGC-TAAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAATACCC
gi|110786 : TGAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTCTT-AAGAATATTCTC--AGGAAAG---------GTTGGTGA-ATAAGACC
gi|110794 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-TTTG---A-A-TTAT--C-AAATGTAAA-TC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110790 : TACACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAA-TATA---A-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCCG--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAGGACCCC
gi|110782 : TAAACT-AGAT--A-T-----CAA--AAG-TGAAA-TTCA---G-A-TTTTA-C-AAGC-TCAAGTC-C-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGCCCCC
gi|110783 : TAAACT-AGATT-A-T-----ATA--AGGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAACTTATTCTC--AAGAATG---------GTCGGTGA-ATACGTCCC
gi|110784 : TAAACT-AGAT--G-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTT---G-G-TTTT--C-AAGC-TCAAGAC-T-AACACTTTTCTC--AAGAATG---------GTTAGTGA-ATACGACCCC
gi|110785 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTC--AGGTTAAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAAC-TCAAGTCTT-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACAGCC
gi|110787 : TGAACT-AGAT--A-T-----CGT--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAATC-T-AAGAATATTCTC--TTGATTG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110788 : TAAACG-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-GTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAAAATATTCTT--AAAAGTG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110789 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCA--AGGTTGATA-TATG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGACAG---------GTTGGTGA-ATAC
gi|110808 : TAAACT-AGAT--A-TGATATCTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAG-------TC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACGATCTC
gi|110793 : TGAACT-AGAT--A-T-----CTA--AAATTGAAG-TTTG---G-ATTTTT--C-AAGC-TCATGTC-T-AAGACTATTCTCCGAAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110792 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AAGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGC-TCAAATC-T-AAGAATATTGAC--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCC
gi|110797 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGATC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-TACAGTATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCCC
gi|110795 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAGGTT-A-AAGACTATTCTT--AAGAATGCCAT-----GTTGGTGA-ATACGACTCC
gi|110804 : TAAACT-GAAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTTT-C-AATC-TTAATTC-T-AAGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110800 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGC-TCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110799 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGC-TCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110798 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAGA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGT-TCAAAAC-T-AAGAATATTATC--AGGAAT----------GTTGGTGA-ATACCACCCC
gi|110801 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--ATGTTGAAA-TTCG---G-A-TGTT--T-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTTTC--AAGAACG---------TTTGGTGA-ACACGACC
gi|110807 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTGG---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGCC-A-ATGAATATTCTC--AAGAATG---------GGTGGTGACCTATAACCCC
gi|110806 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGC-TTACATC-C-AATAATATTCTC--GGGAATT---------GTTGGTGA-ATACGAC
gi|110802 : TAAACT-A-AT--GGT-----CTA--AGGTTGATT-TTTTTTCG-A-TTTT--C-TAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110852 : AAACT-AGAT--A-T-----TTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AATC-TCAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110848 : AAACT-TGAC--A-T-----CAA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TAA-GTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-AAACGATCCC
gi|110853 : AAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------TTTGGTAA-ATACGAC
gi|110859 : AACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGC-TTAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110860 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTG-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTAGTGA-ATACAGCCCC
gi|110866 : AACT-GGAC--A-T-----CTA--AGGTGGACA-TTTG---G-A-TTTTTTC-AAGT-TAAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110861 : AACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACG-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAAAATG---------GTTGATGA-GTACGACCCC
gi|110862 : AACTCAGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---GGA-TTTT--C-AAGT-TCAAGTC-T-TAGAATGTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAAGATCCC
gi|110863 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTT---C-AAGT-TCAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAAAATC---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110864 : AACT-GAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-TATC-CAA-GTC-T-ATGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110865 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--ACGCTGAAT-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTGTA--ATGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACCTC
gi|110875 : ACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGCGA-ATACGACCCC
gi|110879 : CT-ATAT--T-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-TTAAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110882 : T-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTTGTGA-AAATGACCCC
gi|110891 : AT--T-T-----CGA--AGGTTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110892 : AT--A-T-----ATA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TTAAGTA-T-AAGACTGTTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-TTACGACCCC
gi|110898 : --A-T-----GTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-TATAATATTCTA--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110912 : -----CTA--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGC-TCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110913 : -----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AGAC-TTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGGCCTC
Alignments
lowQualScore : 0 11 0 11111 00 0 000 0 0 11 0 0 0 00 222222222 0
lowQualScore : . .. . ..... .. . ... . . .. . . . .. ......... .
lowQualScore : 4 44 4 00000 66 4 777 4 4 33 4 8 8 55 444444444 4
consensus : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
Reference ( family-149 ) : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110724 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110725 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTCT--T-AAGCTCAAGTC-T-TAGAATATTTTC--AATAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110726 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCT-AAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110727 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110729 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TT-G---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110730 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110731 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGTATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110732 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------ATTGATGA-ATAGGACCCC
gi|110733 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTG-T-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110734 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110736 : TAACCC-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110737 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-GTACGACCCC
gi|110738 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110739 : TAAAGT-AGAT--A-T-----CTA--CGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCC
gi|110740 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATATGACCCC
gi|110741 : TAAGCT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGACTG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110742 : TAAACG-AGAT--A-T-----GTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110743 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGATTG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110744 : TAAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110745 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--TAAAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110746 : TAAACT-AGAT--A-T-----ACA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGTTA-ATATGACCCC
gi|110747 : TAAACT--GAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAGGTC-T-AAGAATATTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110748 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTT---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATAAGACCCC
gi|110749 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-AAAAATATTTTC--AA-AATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110750 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AACCTCGAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GCTGGTGA-ATACGAACC
gi|110751 : TAAACT-AGAT--C-T-----CTA--AGGTTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110752 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAAAAGTCTC--AAAAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110753 : TAAACT-AAAA--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATCTTC--AAGAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110754 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTAGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATG---------GTTTGTAA-GTACGACCCC
gi|110755 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-TTGG---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110756 : TACACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGGATG---------GTTGGTGA-ATATGACCCC
gi|110757 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-T--G---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110758 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCT--AGGTTGAAC-TTTT---C-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-CTACGACCCC
gi|110759 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTTT--C-ATGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGATA-ATACGACCCC
gi|110760 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATGTTATC--AAGAATG---------GTTGATGA-AAACCATCCC
gi|110761 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTT--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAACC-T-AAGGATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110762 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--CCAAGCTCATGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATGTGACCCC
gi|110763 : TAGACT-AAATT-A-C-----CCA--AGGTTGAAA-ATTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCTC
gi|110764 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-TAGACTATTCTC---AGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110765 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGATGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGATAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------GTTGGTGA-ATACATCCCC
gi|110766 : TAAACT-AGAT--A-A-----CTA--AGGTCTAAA-TTTG---G-A-TTAT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACCACCCC
gi|110767 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCCGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAAACTATTCTC--AATAATG---------GTTGGTGG-ATACGACACC
gi|110768 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTG--AGGTTGTTT-TTTG---A-A-TTTT--C-ATGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110769 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTCG---G---TTTT--A-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------ATTGGTGA-ATACTACCCC
gi|110770 : TAAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATTCGATCC
gi|110771 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTCGAAA-TTTG---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGAATGGCTGGTGCAGCTGGTGA-ATATGGCCCC
gi|110773 : TACATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TT----C-AAGCTTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACACC
gi|110774 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAAATTTG---A-A-TTTT--C-AAGTTTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAAAATG---------GTTGGTGA-AGACGGCCCC
gi|110775 : TAAACT-AGATGTA-T-----CTA--AGGTTGTAC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-GTACGATCCC
gi|110776 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTTTTAGGTTGAAA-CTTG---G-A-TTTT--C-AAGCCTAAGTC-T-GAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCCC
gi|110777 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAGA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAACTTAAGCC-T-ATGAATAT------AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110778 : TAAACT-AGGT--A-C-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-A--AATA---TC--AAGAATG---------ATTGGTGA-ATACGACCC
gi|110779 : TAAACA-AGAA--A-T-----CTA--AAGTTGAAG-TTTG---G-T-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-TTAAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110780 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATCTTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110781 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATCTTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110782 : TAAACT-AGAT--A-T-----CAA--AAG-TGAAA-TTCA---G-A-TTTTA-C-AAGCTCAAGTC-C-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGCCCCC
gi|110783 : TAAACT-AGATT-A-T-----ATA--AGGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAACTTATTCTC--AAGAATG---------GTCGGTGA-ATACGTCCC
gi|110784 : TAAACT-AGAT--G-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTT---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGAC-T-AACACTTTTCTC--AAGAATG---------GTTAGTGA-ATACGACCCC
gi|110785 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTC--AGGTTAAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAACTCAAGTCTT-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACAGCC
gi|110786 : TGAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTCTT-AAGAATATTCTC--AGGAAAG---------GTTGGTGA-ATAAGACC
gi|110787 : TGAACT-AGAT--A-T-----CGT--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTC--TTGATTG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110788 : TAAACG-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-GTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAAAATATTCTT--AAAAGTG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110789 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCA--AGGTTGATA-TATG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGACAG---------GTTGGTGA-ATAC
gi|110790 : TACACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAA-TATA---A-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCCG--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAGGACCCC
gi|110791 : TAAACA-AGAT--A-T-----CTC--GGGTGGAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAGCTGAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTAGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110792 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AAGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGCTCAAATC-T-AAGAATATTGAC--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCC
gi|110793 : TGAACT-AGAT--A-T-----CTA--AAATTGAAG-TTTG---G-ATTTTT--C-AAGCTCATGTC-T-AAGACTATTCTCCGAAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110794 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-TTTG---A-A-TTAT--C-AAATGTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110795 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAGGTT-A-AAGACTATTCTT--AAGAATGCCAT-----GTTGGTGA-ATACGACTCC
gi|110797 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGATC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-TACAGTATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCCC
gi|110798 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAGA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGTTCAAAAC-T-AAGAATATTATC--AGGAAT----------GTTGGTGA-ATACCACCCC
gi|110799 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110800 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110801 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--ATGTTGAAA-TTCG---G-A-TGTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTTTC--AAGAACG---------TTTGGTGA-ACACGACC
gi|110802 : TAAACT-A-AT--GGT-----CTA--AGGTTGATT-TTTTTTCG-A-TTTT--C-TAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110803 : TAAACT-TAAT--A-T-----CTT--AGATTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGGTAAAGTC-A-AAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCTC
gi|110804 : TAAACT-GAAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTTT-C-AATCTTAATTC-T-AAGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110805 : TAAACT-GGCC--A-T-----CTT--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTAAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAATACCC
gi|110806 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTTACATC-C-AATAATATTCTC--GGGAATT---------GTTGGTGA-ATACGAC
gi|110807 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTGG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGCC-A-ATGAATATTCTC--AAGAATG---------GGTGGTGACCTATAACCCC
gi|110808 : TAAACT-AGAT--A-TGATATCTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AA------GTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACGATCTC
gi|110848 : AAACT-TGAC--A-T-----CAA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCT-AAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-AAACGATCCC
gi|110852 : AAACT-AGAT--A-T-----TTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AATCTCAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110853 : AAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------TTTGGTAA-ATACGAC
gi|110859 : AACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGCTTAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110860 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTG-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTAGTGA-ATACAGCCCC
gi|110861 : AACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACG-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAAAATG---------GTTGATGA-GTACGACCCC
gi|110862 : AACTCAGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---GGA-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-TAGAATGTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAAGATCCC
gi|110863 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTT---C-AAGTTCAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAAAATC---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110864 : AACT-GAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-TATC-CAAGTC-T-ATGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110865 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--ACGCTGAAT-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTA--ATGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACCTC
gi|110866 : AACT-GGAC--A-T-----CTA--AGGTGGACA-TTTG---G-A-TTTTTTC-AAGTTAAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110875 : ACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGCGA-ATACGACCCC
gi|110879 : CT-ATAT--T-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-TTAAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110882 : T-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTTGTGA-AAATGACCCC
gi|110891 : AT--T-T-----CGA--AGGTTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110892 : AT--A-T-----ATA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTA-T-AAGACTGTTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-TTACGACCCC
gi|110898 : --A-T-----GTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-TATAATATTCTA--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110912 : -----CTA--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110913 : -----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AGACTTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGGCCTC
Alignments
lowQualScore : 0 11 0 11111 00 0 000 0 0 11 0 0 0 00 222222222 0
lowQualScore : . .. . ..... .. . ... . . .. . . . .. ......... .
lowQualScore : 4 44 4 00000 66 4 777 4 4 33 4 8 8 55 444444444 4
consensus : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
Reference ( family-149 ) : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110724 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110725 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTCT--T-AAGCTCAAGTC-T-TAGAATATTTTC--AATAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110726 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCT-AAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110727 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110729 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TT-G---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110730 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110731 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGTATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110732 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------ATTGATGA-ATAGGACCCC
gi|110733 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTG-T-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110734 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110736 : TAACCC-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110737 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-GTACGACCCC
gi|110738 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110739 : TAAAGT-AGAT--A-T-----CTA--CGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCC
gi|110740 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATATGACCCC
gi|110741 : TAAGCT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGACTG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110742 : TAAACG-AGAT--A-T-----GTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110743 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGATTG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110744 : TAAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110745 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--TAAAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110746 : TAAACT-AGAT--A-T-----ACA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGTTA-ATATGACCCC
gi|110747 : TAAACT--GAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAGGTC-T-AAGAATATTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110748 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTT---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATAAGACCCC
gi|110749 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-AAAAATATTTTC--AA-AATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110750 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AACCTCGAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GCTGGTGA-ATACGAACC
gi|110751 : TAAACT-AGAT--C-T-----CTA--AGGTTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110752 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAAAAGTCTC--AAAAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110753 : TAAACT-AAAA--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATCTTC--AAGAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110754 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTAGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATG---------GTTTGTAA-GTACGACCCC
gi|110755 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-TTGG---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110756 : TACACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGGATG---------GTTGGTGA-ATATGACCCC
gi|110757 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-T--G---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110758 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCT--AGGTTGAAC-TTTT---C-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-CTACGACCCC
gi|110759 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTTT--C-ATGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGATA-ATACGACCCC
gi|110760 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATGTTATC--AAGAATG---------GTTGATGA-AAACCATCCC
gi|110761 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTT--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAACC-T-AAGGATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110762 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--CCAAGCTCATGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATGTGACCCC
gi|110763 : TAGACT-AAATT-A-C-----CCA--AGGTTGAAA-ATTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCTC
gi|110764 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-TAGACTATTCTC---AGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110765 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGATGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGATAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------GTTGGTGA-ATACATCCCC
gi|110766 : TAAACT-AGAT--A-A-----CTA--AGGTCTAAA-TTTG---G-A-TTAT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACCACCCC
gi|110767 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCCGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAAACTATTCTC--AATAATG---------GTTGGTGG-ATACGACACC
gi|110768 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTG--AGGTTGTTT-TTTG---A-A-TTTT--C-ATGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110769 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTCG---G---TTTT--A-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------ATTGGTGA-ATACTACCCC
gi|110770 : TAAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATTCGATCC
gi|110771 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTCGAAA-TTTG---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGAATGGCTGGTGCAGCTGGTGA-ATATGGCCCC
gi|110773 : TACATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TT----C-AAGCTTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACACC
gi|110774 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAAATTTG---A-A-TTTT--C-AAGTTTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAAAATG---------GTTGGTGA-AGACGGCCCC
gi|110775 : TAAACT-AGATGTA-T-----CTA--AGGTTGTAC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-GTACGATCCC
gi|110776 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTTTTAGGTTGAAA-CTTG---G-A-TTTT--C-AAGCCTAAGTC-T-GAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCCC
gi|110777 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAGA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAACTTAAGCC-T-ATGAATAT------AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110778 : TAAACT-AGGT--A-C-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-A--AATA---TC--AAGAATG---------ATTGGTGA-ATACGACCC
gi|110779 : TAAACA-AGAA--A-T-----CTA--AAGTTGAAG-TTTG---G-T-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-TTAAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110780 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATCTTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110781 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATCTTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110782 : TAAACT-AGAT--A-T-----CAA--AAG-TGAAA-TTCA---G-A-TTTTA-C-AAGCTCAAGTC-C-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGCCCCC
gi|110783 : TAAACT-AGATT-A-T-----ATA--AGGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAACTTATTCTC--AAGAATG---------GTCGGTGA-ATACGTCCC
gi|110784 : TAAACT-AGAT--G-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTT---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGAC-T-AACACTTTTCTC--AAGAATG---------GTTAGTGA-ATACGACCCC
gi|110785 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTC--AGGTTAAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAACTCAAGTCTT-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACAGCC
gi|110786 : TGAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTCTT-AAGAATATTCTC--AGGAAAG---------GTTGGTGA-ATAAGACC
gi|110787 : TGAACT-AGAT--A-T-----CGT--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTC--TTGATTG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110788 : TAAACG-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-GTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAAAATATTCTT--AAAAGTG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110789 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCA--AGGTTGATA-TATG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGACAG---------GTTGGTGA-ATAC
gi|110790 : TACACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAA-TATA---A-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCCG--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAGGACCCC
gi|110791 : TAAACA-AGAT--A-T-----CTC--GGGTGGAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAGCTGAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTAGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110792 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AAGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGCTCAAATC-T-AAGAATATTGAC--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCC
gi|110793 : TGAACT-AGAT--A-T-----CTA--AAATTGAAG-TTTG---G-ATTTTT--C-AAGCTCATGTC-T-AAGACTATTCTCCGAAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110794 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-TTTG---A-A-TTAT--C-AAATGTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110795 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAGGTT-A-AAGACTATTCTT--AAGAATGCCAT-----GTTGGTGA-ATACGACTCC
gi|110797 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGATC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-TACAGTATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCCC
gi|110798 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAGA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGTTCAAAAC-T-AAGAATATTATC--AGGAAT----------GTTGGTGA-ATACCACCCC
gi|110799 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110800 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110801 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--ATGTTGAAA-TTCG---G-A-TGTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTTTC--AAGAACG---------TTTGGTGA-ACACGACC
gi|110802 : TAAACT-A-AT--GGT-----CTA--AGGTTGATT-TTTTTTCG-A-TTTT--C-TAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110803 : TAAACT-TAAT--A-T-----CTT--AGATTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGGTAAAGTC-A-AAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCTC
gi|110804 : TAAACT-GAAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTTT-C-AATCTTAATTC-T-AAGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110805 : TAAACT-GGCC--A-T-----CTT--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTAAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAATACCC
gi|110806 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTTACATC-C-AATAATATTCTC--GGGAATT---------GTTGGTGA-ATACGAC
gi|110807 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTGG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGCC-A-ATGAATATTCTC--AAGAATG---------GGTGGTGACCTATAACCCC
gi|110808 : TAAACT-AGAT--A-TGATATCTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AA------GTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACGATCTC
gi|110848 : AAACT-TGAC--A-T-----CAA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCT-AAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-AAACGATCCC
gi|110852 : AAACT-AGAT--A-T-----TTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AATCTCAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110853 : AAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------TTTGGTAA-ATACGAC
gi|110859 : AACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGCTTAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110860 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTG-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTAGTGA-ATACAGCCCC
gi|110861 : AACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACG-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAAAATG---------GTTGATGA-GTACGACCCC
gi|110862 : AACTCAGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---GGA-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-TAGAATGTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAAGATCCC
gi|110863 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTT---C-AAGTTCAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAAAATC---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110864 : AACT-GAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-TATC-CAAGTC-T-ATGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110865 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--ACGCTGAAT-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTA--ATGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACCTC
gi|110866 : AACT-GGAC--A-T-----CTA--AGGTGGACA-TTTG---G-A-TTTTTTC-AAGTTAAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110875 : ACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGCGA-ATACGACCCC
gi|110879 : CT-ATAT--T-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-TTAAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110882 : T-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTTGTGA-AAATGACCCC
gi|110891 : AT--T-T-----CGA--AGGTTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110892 : AT--A-T-----ATA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTA-T-AAGACTGTTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-TTACGACCCC
gi|110898 : --A-T-----GTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-TATAATATTCTA--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110912 : -----CTA--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110913 : -----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AGACTTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGGCCTC
blockSeqs : GT GATAT TT GCTGGTGCA
blockSeqs : T . A CCAT
blockSeqs : T . T .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
finalCons : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
Alignments
lowQualScore : 0 11 0 11111 00 0 000 0 0 11 0 0 0 00 222222222 0
lowQualScore : . .. . ..... .. . ... . . .. . . . .. ......... .
lowQualScore : 4 44 4 00000 66 4 777 4 4 33 4 8 8 55 444444444 4
consensus : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
Reference ( family-149 ) : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110724 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110725 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTCT--T-AAGCTCAAGTC-T-TAGAATATTTTC--AATAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110726 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCT-AAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110727 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110729 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TT-G---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110730 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110731 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGTATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110732 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------ATTGATGA-ATAGGACCCC
gi|110733 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTG-T-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110734 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110736 : TAACCC-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110737 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-GTACGACCCC
gi|110738 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATTTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110739 : TAAAGT-AGAT--A-T-----CTA--CGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCC
gi|110740 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATATGACCCC
gi|110741 : TAAGCT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGACTG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110742 : TAAACG-AGAT--A-T-----GTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110743 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGATTG---------GTTGGTGA-ATACGGCCCC
gi|110744 : TAAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110745 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--TAAAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110746 : TAAACT-AGAT--A-T-----ACA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGTTA-ATATGACCCC
gi|110747 : TAAACT--GAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTAAGGTC-T-AAGAATATTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110748 : TAAACT-GGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTT---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATAAGACCCC
gi|110749 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-AAAAATATTTTC--AA-AATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110750 : TAAATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AACCTCGAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GCTGGTGA-ATACGAACC
gi|110751 : TAAACT-AGAT--C-T-----CTA--AGGTTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110752 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAAAAGTCTC--AAAAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110753 : TAAACT-AAAA--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATCTTC--AAGAATA---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110754 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTAGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATG---------GTTTGTAA-GTACGACCCC
gi|110755 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-TTGG---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110756 : TACACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGGATG---------GTTGGTGA-ATATGACCCC
gi|110757 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-T--G---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110758 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCT--AGGTTGAAC-TTTT---C-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-CTACGACCCC
gi|110759 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GGGTTGAAA-TTTG---G-A-CTTT--C-ATGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------ATTGGATA-ATACGACCCC
gi|110760 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATGTTATC--AAGAATG---------GTTGATGA-AAACCATCCC
gi|110761 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTT--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAACC-T-AAGGATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110762 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTT--CCAAGCTCATGTC-T-AAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATGTGACCCC
gi|110763 : TAGACT-AAATT-A-C-----CCA--AGGTTGAAA-ATTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCTC
gi|110764 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAG-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-TAGACTATTCTC---AGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110765 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGATGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGATAAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------GTTGGTGA-ATACATCCCC
gi|110766 : TAAACT-AGAT--A-A-----CTA--AGGTCTAAA-TTTG---G-A-TTAT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACCACCCC
gi|110767 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCCGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAAACTATTCTC--AATAATG---------GTTGGTGG-ATACGACACC
gi|110768 : TAAACT-AAAT--A-T-----CTG--AGGTTGTTT-TTTG---A-A-TTTT--C-ATGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110769 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAAA-TTCG---G---TTTT--A-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAAAG---------ATTGGTGA-ATACTACCCC
gi|110770 : TAAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTAAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATTCGATCC
gi|110771 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTCGAAA-TTTG---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGTT-T-AAGAATATTCTC--AAGAATGGCTGGTGCAGCTGGTGA-ATATGGCCCC
gi|110773 : TACATT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TT----C-AAGCTTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACACC
gi|110774 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAAATTTG---A-A-TTTT--C-AAGTTTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAAAATG---------GTTGGTGA-AGACGGCCCC
gi|110775 : TAAACT-AGATGTA-T-----CTA--AGGTTGTAC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTC--AAGAATT---------GTTGGTGA-GTACGATCCC
gi|110776 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTTTTAGGTTGAAA-CTTG---G-A-TTTT--C-AAGCCTAAGTC-T-GAGAATATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGA-ATACGACCCC
gi|110777 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAGA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAACTTAAGCC-T-ATGAATAT------AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110778 : TAAACT-AGGT--A-C-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-A--AATA---TC--AAGAATG---------ATTGGTGA-ATACGACCC
gi|110779 : TAAACA-AGAA--A-T-----CTA--AAGTTGAAG-TTTG---G-T-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-TTAAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110780 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATCTTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110781 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTG---T-A-TTTT--T-AATCTTAAGTC-C-AAGAACATTCTC--AAAAATT---------GTTGGTAA-ATACGACCCC
gi|110782 : TAAACT-AGAT--A-T-----CAA--AAG-TGAAA-TTCA---G-A-TTTTA-C-AAGCTCAAGTC-C-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGCCCCC
gi|110783 : TAAACT-AGATT-A-T-----ATA--AGGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAACTTATTCTC--AAGAATG---------GTCGGTGA-ATACGTCCC
gi|110784 : TAAACT-AGAT--G-T-----CTA--AGGCTGAAA-TTTT---G-G-TTTT--C-AAGCTCAAGAC-T-AACACTTTTCTC--AAGAATG---------GTTAGTGA-ATACGACCCC
gi|110785 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTC--AGGTTAAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAACTCAAGTCTT-AAGAATATTTTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACAGCC
gi|110786 : TGAACT-AGAT--A-T-----ATA--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTCTT-AAGAATATTCTC--AGGAAAG---------GTTGGTGA-ATAAGACC
gi|110787 : TGAACT-AGAT--A-T-----CGT--AGGCTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAATC-T-AAGAATATTCTC--TTGATTG---------GTTGGTGA-ATACAACCCC
gi|110788 : TAAACG-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-GTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAAAATATTCTT--AAAAGTG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110789 : TAAACT-AGAT--A-T-----CCA--AGGTTGATA-TATG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGACAG---------GTTGGTGA-ATAC
gi|110790 : TACACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGAAA-TATA---A-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCCG--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAGGACCCC
gi|110791 : TAAACA-AGAT--A-T-----CTC--GGGTGGAAA-TTCG---G-A-TTTT--C-AAGCTGAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTAGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110792 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--AAGTTGGAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGCTCAAATC-T-AAGAATATTGAC--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCC
gi|110793 : TGAACT-AGAT--A-T-----CTA--AAATTGAAG-TTTG---G-ATTTTT--C-AAGCTCATGTC-T-AAGACTATTCTCCGAAGAGCG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110794 : TAAACT-TGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAT-TTTG---A-A-TTAT--C-AAATGTAAATC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGATCCC
gi|110795 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAGGTT-A-AAGACTATTCTT--AAGAATGCCAT-----GTTGGTGA-ATACGACTCC
gi|110797 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--GAGTTGATC-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-TACAGTATTCTT--AAGAATG---------GTTGATGC-ATACGACCCC
gi|110798 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTG--AGGTTGAGA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGTTCAAAAC-T-AAGAATATTATC--AGGAAT----------GTTGGTGA-ATACCACCCC
gi|110799 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110800 : TAAACT-ACAT--T-T-----CTA--AGGTTTAAA-ATTG---G-A-TTT---C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCCG--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110801 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTG--ATGTTGAAA-TTCG---G-A-TGTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTTTC--AAGAACG---------TTTGGTGA-ACACGACC
gi|110802 : TAAACT-A-AT--GGT-----CTA--AGGTTGATT-TTTTTTCG-A-TTTT--C-TAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110803 : TAAACT-TAAT--A-T-----CTT--AGATTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGGTAAAGTC-A-AAGAATATTCTC--GAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCTC
gi|110804 : TAAACT-GAAT--A-T-----CTA--ATGTTGAAA-TTTG---A-A-TTTTT-C-AATCTTAATTC-T-AAGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110805 : TAAACT-GGCC--A-T-----CTT--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTAAAGTC-T-AAGACTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAATACCC
gi|110806 : TAAACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTAAAA-TTTG---A-A-TTTT--C-AAGCTTACATC-C-AATAATATTCTC--GGGAATT---------GTTGGTGA-ATACGAC
gi|110807 : TAAACT-AGAC--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTGG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGCC-A-ATGAATATTCTC--AAGAATG---------GGTGGTGACCTATAACCCC
gi|110808 : TAAACT-AGAT--A-TGATATCTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AA------GTC-T-AAGAATACTCTC--AAGAATG---------TTTGGTGA-ATACGATCTC
gi|110848 : AAACT-TGAC--A-T-----CAA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCT-AAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-AAACGATCCC
gi|110852 : AAACT-AGAT--A-T-----TTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--T-AATCTCAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110853 : AAACT-AGAT--A-T-----TTT--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--A-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------TTTGGTAA-ATACGAC
gi|110859 : AACT-AAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-GAGCTTAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110860 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGCTGAAA-TCTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTG-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTAGTGA-ATACAGCCCC
gi|110861 : AACT-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGACG-TTTG---G-A-TTTT--T-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCCC--AAAAATG---------GTTGATGA-GTACGACCCC
gi|110862 : AACTCAGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---GGA-TTTT--C-AAGTTCAAGTC-T-TAGAATGTTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATAAGATCCC
gi|110863 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---A-A-TTT---C-AAGTTCAAGTC-T-AGGAATATTCTC--AAAAATC---------GTTGGTGA-ATACGACC
gi|110864 : AACT-GAAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-TATC-CAAGTC-T-ATGATTATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110865 : AACT-AGAT--A-T-----CTA--ACGCTGAAT-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTGTA--ATGAATG---------GTTGGTGA-ATATGACCTC
gi|110866 : AACT-GGAC--A-T-----CTA--AGGTGGACA-TTTG---G-A-TTTTTTC-AAGTTAAAGTC-T-AAGAATATTCTT--AAAAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110875 : ACT-AGAT--A-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGCGA-ATACGACCCC
gi|110879 : CT-ATAT--T-T-----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-TTAAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110882 : T-AGAT--A-T-----CTT--AGGTTGAAA-TTTA---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTTGTGA-AAATGACCCC
gi|110891 : AT--T-T-----CGA--AGGTTTAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGCC-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110892 : AT--A-T-----ATA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTTAAGTA-T-AAGACTGTTATC--AAGAATG---------GTTGGTGA-TTACGACCCC
gi|110898 : --A-T-----GTA--AGGTTAAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-TATAATATTCTA--AAGAATG---------GTTGGTGA-ATACGACCCC
gi|110912 : -----CTA--AAGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AAGCTCAAGTC-T-AAGAATATTCTC--AAGAACG---------GTTGGTGA-ATAAGACCCC
gi|110913 : -----CTA--AGGTTGAAA-TTTG---G-A-TTTT--C-AGACTTAAGTA-T-AAGAATATTCTC--AAGAATG---------GTTGGTAA-ATACGGCCTC